Table 4.
Reference | [17] | [58] | [151] | [78] | [79] | [52] | [53] | [54] | [59] | [152] | [56] | [57] | [155] | [55] | [159] | [77] | Total | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
↑ | ↓ | |||||||||||||||||
α-diversity | ||||||||||||||||||
Richness | - | N | - | ↓ | - | - | - | ↓ | - | ↓ | N | N | ↓ | - | N | - | 0 | 4 |
Diversity | - | N | - | N | - | - | - | ↓ | - | ↓ | N | N | - | - | N | - | 0 | 2 |
β-diversity | S | - | - | N | - | - | - | S | S | S | N | N | S | - | N | - | S = 5 | |
Phylum | ||||||||||||||||||
Bacteroidetes | ↑ | ↓ | ↓ | ↓ | ↑ | ↑ | 3 | 3 | ||||||||||
Verrucomicrobia | ↓ | ↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||
Firmicutes | ↑ | ↑ | ↑ | ↑ | ↑ | ↑ | 6 | 0 | ||||||||||
Proteobacteria | ↑ | ↓ | 1 | 1 | ||||||||||||||
Actinomycetes | ↑ | ↑ | 2 | 0 | ||||||||||||||
Cyanobacteria | ↑ | 1 | ||||||||||||||||
Deferribacteres | ↑ | 1 | ||||||||||||||||
Genus | ||||||||||||||||||
Bifidobacterium | ↓ | ↓ | 0 | 2 | ||||||||||||||
Bacteroides | ↓ | ↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||
Parabacteroides | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Lactobacillu | ↓ | ↑ | ↓ | ↑ | 2 | 2 | ||||||||||||
Prevotella | ↓ | 0 | 1 | |||||||||||||||
Turicibacter | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Akkermansia | ↓ | 0 | 1 | |||||||||||||||
Adlercreutzia | ↓ | 0 | 1 | |||||||||||||||
Barnesiella | ↓ | 0 | 1 | |||||||||||||||
Rhodococcus | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Lawsonia | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Allobaculum | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Enterobacteria | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Acetobacteria | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Species | ||||||||||||||||||
Clostridium leptum | ↓ | 0 | 1 | |||||||||||||||
Clostridium cocleatum | ↑ | 1 | 0 | |||||||||||||||
Bacteroides ovatus | ↓ | 0 | 1 |
Abbreviations: “↑”—higher α-diversity or bacteria are more abundant; “↓”—Lower α-diversity or bacteria are less abundant; S—significant difference found in β-diversity.