TABLE I. Comparison of results between culture, real-time polymerase chain reaction (qPCR) and sequencing tests for Non-tuberculous mycobacteria (NTMs).

Sample nº	NTM culture	qPCR	Sequencing
1	M. kansasii	+	M. kansasii
2	M. fortuitum	+	M. fortuitum
3	M. szulgai	+	M. szulgai
4	M. malmoense	+	M. malmoense
5	M. abscessus	+	M. abscessus
6	M. marinum	+	M. marinum
7	M. peregrinum	+	M. peregrinum
8	M. chelonae	+	M. chelonae
9	M. gordonae	+	M. gordonae
10	M. chitae	+	M. chitae
11	M. avium	+	M. avium

+: positive (16S target detection).