Table 2.
Library construction primers, where X = 0.2 G + 0.2 A + 0.5 T + 0.1 C, Y = 0.4 A + 0.2 T + 0.4 C and Z = 0.1 G + 0.9 C
| Primer name | Primer sequence |
|---|---|
| H1 | CCTCTGCAATTTCTGGCTTC [XYZ] NTT [XYZ][XYZ] ACT [XYZ] ATAGACTGGGTGCGTCAGG |
| H2 | CTGGAATGGGTTGCAAGGATT [XYZ] CCT [XYZ][XYZ] GGT [XYZ] ACT [XYZ] TATGCCGATAGCGTCAAGGG |
| H3.6 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.7 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.8 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.9 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.10 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.11 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.12 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.13 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.14 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.15 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.16 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.17 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.18 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] [XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.19 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] [XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |
| H3.20 | GCCGTCTATTATACTGKCCGC [XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ][XYZ] [XYZ][XYZ][XYZ] GSTNTKGACTACCGGGGTCAAG |