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. 2022 Aug 17;10(8):1663. doi: 10.3390/microorganisms10081663

Table 1.

Primers used for the detection of ticks and associated Anaplasma spp.

Organism/Gene Sequence (5′-3′) Amplicon Size PCR Condition Ref.
Ticks/cox1 cox1 F, GGAACAATATATTTAATTTTTGG
cox1 R, ATCTATCCCTACTGTAAATATATG
801 bp 95 °C 5 min, 40× (95 °C 30 s, 55 °C 60 s, 72 °C 1 min), 72 °C 5 min [35]
Ticks/16S rRNA 16S+1, CCGGTCTGAACTCAGATCAAGT
16S−1, GCTCAATGATTTTTTAAATTGCTG
460 bp 95 °C 3 min, 40× (95 °C 30 s, 55 °C 60 s, 72 °C 1 min), 72 °C 7 min [36]
Anaplasma spp./16S rRNA Ehr-F2, AGAGTTTGATCCTGGCTCAG
Ehr-R, AGTTTGCCGGGACTTYTTCT
1100 bp 95 °C 3 min, 35× (95 °C 30 s, 50 °C 30 s, 72 °C 1 min), 72 °C 7 min [37]