Table 4.

The changes (increase or decrease) noted in gut microbiota of preDM and newDM in comparison to nonDM by microbial taxa and number of reporting studies. All findings are significant (p <0.050).

Taxa level	Increased in ≥ 3 papers		Increased in 2 papers		Increased in 1 paper		Decreased in 1 paper		Decreased in 2 papers		Decreased in ≥ 3 papers
	preDM	newDM	preDM	newDM	preDM	newDM	preDM	newDM	preDM	newDM	preDM	newDM
Phylum		Firmicutes (Bhute et al., 2017; Gaike et al., 2020; Nuli et al., 2019; Zhao et al., 2019)		Proteobacteria (Gaike et al., 2020; Zhao et al., 2019)	Actinobacteria (Nuli et al., 2019) Bacteroidetes (Lambeth et al., 2015) Firmicutes (Allin et al., 2018; Nuli et al., 2019) Saccharibacteria (Nuli et al., 2019)	Actinobacteria (Nuli et al., 2019) Saccharibacteria (Nuli et al., 2019)	Bacteroidetes (Nuli et al., 2019) Firmicutes (Lambeth et al., 2015) Proteobacteria (Nuli et al., 2019)	Verrucomicrobia (Gaike et al., 2020)	Verrucomicrobia (Egshatyan et al., 2016; Zhang et al., 2013)	Proteobacteria (Bhute et al., 2017; Nuli et al., 2019)		Bacteroidetes (Bhute et al., 2017; Gaike et al., 2020; Nuli et al., 2019; Zhao et al., 2019)
Class					Betaproteobacteria (Zhang et al., 2013) Deferribacteres (Nuli et al., 2019)	Betaproteobacteria (Zhang et al., 2013) Clostridia (Zhang et al., 2013) Deferribacteres (Nuli et al., 2019)	Betaproteobacteria (Chávez-Carbajal et al., 2020)	Bacteroidia (Li et al., 2020) Betaproteobacteria (Chávez-Carbajal et al., 2020)
Order					Clostridiales (Karlsson et al., 2013)	Clostridiales (Zhang et al., 2013) Selenomonadales (Li et al., 2020) Veillonellales (Li et al., 2020)	Burkholderiales (Chávez-Carbajal et al., 2020)	Acidaminococcales (Li et al., 2020) Burkholderiales (Chávez-Carbajal et al., 2020)		Bacteroidales (Li et al., 2020; Nuli et al., 2019)	Clostridiales (Allin et al., 2018; Karlsson et al., 2013; Nuli et al., 2019)
Family				Lachnospiraceae (Nuli et al., 2019; Zhang et al., 2013)	Comamonadaceae (Chávez-Carbajal et al., 2020) Pasteurellaceae (Nuli et al., 2019) Pseudonocardiaceae (Lambeth et al., 2015)	Ruminococcaceae (Nuli et al., 2019) Selenomonadaceae (Li et al., 2020)	Alcaligenaceae (Chávez-Carbajal et al., 2020) Clostridiaceae (Allin et al., 2018) Christensenellaceae (Allin et al., 2018) Porphyromonadaceae (Nuli et al., 2019) Rikenellaceae (Allin et al., 2018)	Acidaminococcaceae (Li et al., 2020) Alcaligenaceae (Chávez-Carbajal et al., 2020) Lachnospiraceae (Bhute et al., 2017) Porphyromonadaceae (Nuli et al., 2019) Prevotellaceae (Bhute et al., 2017) Ruminococcacea (Bhute et al., 2017)	Coriobacteriaceae (Karlsson et al., 2013; Nuli et al., 2019) Lachnospiraceae (Allin et al., 2018; Karlsson et al., 2013) Ruminococcaceae (Allin et al., 2018; Nuli et al., 2019)
Genus/ Species	Escherichia (Diener et al., 2021) Esherichia coli (Ghaemi et al., 2020; Zhong et al., 2019) Streptoco-ccus (Allin et al., 2018) Streptoco-ccus mutans (Karlsson et al., 2013) Streptoco-ccus salivarius (Zhong et al., 2019) Streptococ-cus thermophilus (Allin et al., 2018)	Lactobacillus (Bhute et al., 2017; Chen et al., 2019; Gaike et al., 2020) Lactobacillus ruminis (Bhute et al., 2017)	Bacteroides fragilis (Ghaemi et al., 2020) Bacteroides uniformis (Allin et al., 2018) Blautia (Allin et al., 2018; Egshatyan et al., 2016) Blautia wexlerae (Allin et al., 2018) Clostridium boltae (Wu et al., 2020) Clostridium clostridioforme (Karlsson et al., 2013; Wu et al., 2020) Prevotella (Egshatyan et al., 2016; Zhang et al., 2013) Veillonella (Diener et al., 2021; Nuli et al., 2019)	Blautia (Egshatyan et al., 2016; Zhao et al., 2019) Collinsella (Zhang et al., 2013) Collinsella intestinalis (Zhong et al., 2019) Coprococcus 1 (Zhao et al., 2019) Coprococcus eutactus (Zhong et al., 2019) Eubacterium (Zhang et al., 2013) Eubacterium halii (Zhao et al., 2019) Prevotella (Egshatyan et al., 2016; Zhang et al., 2013)	Chloracidobacteria (Lambeth et al., 2015) Coprococcus comes (Allin et al., 2018) Dorea (Allin et al., 2018) Dorea longicatena (Allin et al., 2018) Eggerthella sp (Zhong et al., 2019) Faecalibacterium prausnitzii (Allin et al., 2018) Haemophilus (Nuli et al., 2019) Lachnospira (Ericson et al., 2020) Lactobacillus (Karlsson et al., 2013) Lactobacillus gasseri (Karlsson et al., 2013) Lactobacillus salivarius (Karlsson et al., 2013) Megamonas (Nuli et al., 2019) Megasphaera elsdenii (Zhong et al., 2019) Roseburia (Ericson et al., 2020) Ruminococcus (Allin et al., 2018) Ruminococcus gnavus (Allin et al., 2018) Ruminococcus torques (Allin et al., 2018) Serratia (Egshatyan et al., 2016) Sutterella (Allin et al., 2018)	Abiotrophia (Zhang et al., 2013) Bacteroides caccae (Zhong et al., 2019) Bacteroides finegoldii (Zhong et al., 2019) Cetobacterium (Nuli et al., 2019) Clostridium boltae (Wu et al., 2020) Clostridium clostridioforme (Wu et al., 2020) Dorea (Zhang et al., 2013) Escherichia (Diener et al., 2021) Faecalibacterium prausnitzii (Zhong et al., 2019) Lachnospira (Nuli et al., 2019) Megamonas (Li et al., 2020) Megamonas funiformis (Li et al., 2020) Megapshaera elsdenii (Zhong et al., 2019) Mucispirillum (Nuli et al., 2019) Peptostreptococcus (Zhang et al., 2013) Proteiniphilum (Nuli et al., 2019) Ruminococus (Zhang et al., 2013) Serratia (Egshatyan et al., 2016) Sporobacter (Zhang et al., 2013) Streptococcus (Bhute et al., 2017) Subdoligranulum (Zhang et al., 2013) Sutterella (Chávez-Carbajal et al., 2020) Tyzzerella (Nuli et al., 2019) Veillonella (Diener et al., 2021)	Anaerostipes (Diener et al., 2021) Anaerotruncus (Ericson et al., 2020) Barnesiella (Nuli et al., 2019) Bilophila (Allin et al., 2018) Clostridiales bacterium (Wu et al., 2020) Dialister invisus (Zhong et al., 2019) Dielma (Nuli et al., 2019) Dorea longicatena (Karlsson et al., 2013) Desulfurispirillum indicum (Karlsson et al., 2013) Haemophilus parainfluenza (Zhong et al., 2019) Intestinimonas butyriciproducens (Wu et al., 2020) Klebsiella oxytoca (Wang et al., 2021) Lachnospira (Allin et al., 2018) Oscillibacter spp. (Wu et al., 2020) Pseudoflavonifractor spp. (Wu et al., 2020) Pyramidobacter piscolens (Karlsson et al., 2013) Ruminococcus (Nuli et al., 2019) Ruminiclostridium (Nuli et al., 2019) Sutterella (Nuli et al., 2019) Streptococcus (Zhang et al., 2013)	Anaerostipes (Diener et al., 2021) Alistipes sp. (Wu et al., 2020) Barnesiella (Nuli et al., 2019) Coprococcus sp. (Zhong et al., 2019) Dielma (Nuli et al., 2019) Megamonas (Zhang et al., 2013) Oscillibacter sp. (Wu et al., 2020) Phascolarctobacterium faecium (Li et al., 2020) Pseudoflavonifractor sp. (Wu et al., 2020) Ruminococcus (Gaike et al., 2020) Ruminoclostridium (Nuli et al., 2019) Streptococcus (Zhang et al., 2013)	Akkermansia muciniphila (Allin et al., 2018; Zhang et al., 2013) Alistipes (Karlsson et al., 2013) Alistipes obesi (Karlsson et al., 2013) Alistipes sp (Wu et al., 2020) Bacteroides (Allin et al., 2018) Bacteroides intestinalis (Karlsson et al., 2013) Blautia (Allin et al., 2018; Diener et al., 2021) Coprococcus (Allin et al., 2018) Coprococcus eutactus (Wu et al., 2020) Coprococcus sp. (Zhong et al., 2019) Eubacterium (Ericson et al., 2020) Eubacterium eligens (Karlsson et al., 2013) Flavonifractor (Nuli et al., 2019) Flavonifractor plautii (Wu et al., 2020) Roseburia (Karlsson et al., 2013) Roseburia hominis (Zhong et al., 2019)	Akkermansia (Gaike et al., 2020) Akkermansia muciniphila (Zhong et al., 2019) Bacteroides (Zhang et al., 2013; Zhao et al., 2019) Bacteroides uniformis (Li et al., 2020) Bacteroides stercoris (Li et al., 2020) Blautia (Diener et al., 2021; Gaike et al., 2020) Clostridium coccoides (Chen et al., 2019) Clostridium bartletti (Zhong et al., 2019) Clostridium hathewayi (Zhong et al., 2019) Clostridium leptum (Chen et al., 2019) Clostridium sp (Wu et al., 2020) Dialister invisus (Zhong et al., 2019) Dialister succinatiphilus (Li et al., 2020) Haemophilus (Zhang et al., 2013) Haemophilus parainfluenza (Zhang et al., 2013; Zhong et al., 2019) Faecalibacterium prausnitzii (Bhute et al., 2017; Zhang et al., 2013) Faecalibacterium sp (Wu et al., 2020) Roseburia (Zhang et al., 2013) Roseburia hominis (Zhong et al., 2019) Prevotella (Zhao et al., 2019) Prevotella copri (Bhute et al., 2017)	Clostridium (Allin et al., 2018; Karlsson et al., 2013) Clostridium botulinum (Karlsson et al., 2013) Clostridium beijerinckii (Karlsson et al., 2013) Clostridium hathewayi (Zhong et al., 2019) Clostridium sp (Karlsson et al., 2013; Wu et al., 2020) Clostridium thermocellum (Karlsson et al., 2013) Faecalibacterium prausnitzii (Allin et al., 2018; Ghaemi et al., 2020; Karlsson et al., 2013; Zhong et al., 2019) Faecalibacterium sp. (Wu et al., 2020)

All findings are significant (p < 0.05).