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. 2022 Jul 18;7(4):e00305-22. doi: 10.1128/msphere.00305-22

TABLE 2.

Primers

Primer name Sequencea
RBT5/F cgattcgatactaacgcaatcactatttttaatgatcctacttctatcccgaaaaag
RBT5/R aacgcgttgggagctctcccatatggtagtattagttattagtgatagttagtgaagaattag
OE backbone/F atatgggagagctcccaac
OE backbone/R tagtgattgcgttagtatcgaatc
Multipromoter UME6/F aaaaaagaattcttcgtaatatctatatagatatcttcatttaattttcttggttgtttgatattactttgttgtactttATCAAGCTTGCCTCGTCCCC
Multipromoter HGC1/F cccaaactatacttcccaataaaagatagaaactcgcttacaacaacacaatcctgaagattattaaatctctaattttcATCAAGCTTGCCTCGTCCCC
Multipromoter UME6/R ttcaactttattgtatcttctccataaggcgaatttggtgctgaagaagttgaatcgggtgtaaccatatgggtaatcatCGTTGGGAGCTCTCCCAATG
Multipromoter HGC1/R atgtttttgtatggatgttgttgttgttgtttttgttgtgaaattgattttggagttaatggtttagttatatttatcatCGTTGGGAGCTCTCCCAATG
CaCas9/for Atctcattagatttggaacttgtgggtt
CaCas9/rev Ttcgagcgtcccaaaaccttct
UME6p sgRNA/F caagaaaattatcaaattctgttttagagctagaaatagcaagttaaa
UME6p SNR52/R agaatttgataattttcttgcaaattaaaaatagtttacgcaagtc
HGC1p sgRNA/F gtgtgtatagtgtagtatccgtgttttagagctagaaatagcaagttaaa
HGC1p SNR52/R acggatactacactatacacaccaaattaaaaatagtttacgcaagtc
UME6 qRT/F tccactttaccattatccaagtctactc
UME6 qRT/R gtgttgataatgaatgaactaaatttgccc
HGC1 qRT/F caccaccacaaatgcattctca
HGC1 qRT/R atgaggtgcaggaagctgac
UME6p OE NAT1 TDH3/F gggaaaaaagaattcttcgtaatatctatatagatatcttcatttaattttcttggttgtttgatattactttgttgtacATCAAGCTTGCCTCGTCCCC
UME6p OE TDH3 NAT1/R ttcaactttattgtatcttctccataaggcgaatttggtgctgaagaagttgaatcgggtgtaaccatatgggtaatcatTGTTAATTAATTTGATTGTAAAGTTTGTTGATG
UME6p check up/F gagagttttaatcaattagaaaccaacagagg
UME6p check int/R cgaatgacaaagttaagtcaaaaattggacc
NAT1 check/R tcaatggtggatcaactggaacttc
HGC1 OE/F cccaaactatacttcccaataaaagatagaaactcgcttacaacaacacaatcctgaagattattaaatctctaattttcATCAAGCTTGCCTCGTCCCC
HGC1 OE/R atgtttttgtatggatgttgttgttgttgtttttgttgtgaaattgattttggagttaatggtttagttatatttatcatTGTTAATTAATTTGATTGTAAAGTTTGTTGATG
HGC1 check/F cttacattttagacgaccaacggatactaca
HGC1 check/R cttcgattgaaggatcatttaaagaccattctaaa
a

Nucleotides in bold uppercase letters are complementary to the pTH10 plasmid template.