Table 3. Volumetric assessment of Foxg1^MUT/WT mice using MRI.

Animals were assessed at ~48 wks of life, n = 6 for each genotype. p-values that were below threshold for Bonferroni multiple testing correction are shown in bold.

ROI	Group	Mean-no WBV	SD-no WBV	p-value no WBV	Mean-WBV Corrected	SD-WBV Corrected	p-value#
Whole Brain Volume (WBV)	WT	150.8333	4.92875	* .00662	--	--	--
	HET	138.1869	7.2541
	Total	144.5101	8.86447
Lateral Ventricle	WT	1.65265	0.20841	* .00578	0.01095	0.0013	0.02207
	HET	1.27545	0.05663		0.00925	0.00057
	Total	1.46405	0.24496		0.0101	0.00131
Intraventricular Foramen	WT	0.0039	0.00306	0.14837	0.00003	0.00002	0.1668
	HET	0.00173	0.00093		0.00001	0.00001
	Total	0.00282	0.00243		0.00002	0.00002
Hippocampus	WT	6.47802	0.18381	* .00371	0.04297	0.00126	0.70867
	HET	5.90553	0.29944		0.04274	0.00066
	Total	6.19178	0.38144		0.04286	0.00096
Olfactory System	WT	24.58858	1.01571	* .00226	0.16316	0.0084	0.63568
	HET	22.28573	0.94077		0.16136	0.00275
	Total	23.43716	1.52235		0.16226	0.00603
Basal Ganglia	WT	9.13177	0.58828	* .00425	0.0605	0.0024	0.0478
	HET	7.98298	0.47336		0.05777	0.00167
	Total	8.55738	0.78681		0.05914	0.00243
Olfactory Nerve	WT	0.00073	0.00054	0.55723	0	0	0.76566
	HET	0.00057	0.0004		0	0
	Total	0.00065	0.00046		0	0
Corpus Callosum	WT	12.3984	0.42803	* .00174	0.08221	0.00148	*.00109
	HET	10.65882	0.79888		0.07707	0.00219
	Total	11.52861	1.09485		0.07964	0.00322
Anterior Commissure Olfactory Limb	WT	0.64525	0.04162	0.09611	0.00428	0.00029	0.79429
	HET	0.58655	0.06466		0.00424	0.00029
	Total	0.6159	0.06023		0.00426	0.00028
Lateral Olfactory Tract	WT	1.36563	0.08943	0.04843	0.00907	0.00079	0.45808
	HET	1.20957	0.13989		0.00874	0.0007
	Total	1.2876	0.13846		0.0089	0.00073
Internal Capsule	WT	3.91435	0.19739	* .00437	0.02594	0.00058	0.01408
	HET	3.46397	0.22565		0.02505	0.00043
	Total	3.68916	0.31012		0.0255	0.00067
Anterior Commissure Temp Limb	WT	0.47452	0.00716	0.27234	0.00315	0.00007	* .00121
	HET	0.46288	0.02247		0.00335	0.00008
	Total	0.4687	0.01702		0.00325	0.00013
Stria Terminalis	WT	0.00108	0.00091	0.47036	0.00001	0.00001	0.35297
	HET	0.00142	0.00058		0.00001	0
	Total	0.00125	0.00075		0.00001	0.00001
Amygdala	WT	0.8005	0.02179	* .00066	0.00531	0.00012	* .00292
	HET	0.6532	0.05519		0.00473	0.00029
	Total	0.72685	0.08671		0.00502	0.00037
Hypothalamus	WT	9.64162	0.3497	0.14864	0.06392	0.001	0.00811
	HET	9.25945	0.47951		0.06703	0.00189
	Total	9.45053	0.44714		0.06548	0.00217
Thalamus	WT	18.01777	0.67212	* .00630	0.11945	0.00207	0.27956
	HET	16.30582	0.97022		0.11798	0.00238
	Total	17.16179	1.19688		0.11872	0.00226
Fasciculus Retroflexus	WT	0.07788	0.00882	0.09664	0.00052	0.00005	0.79877
	HET	0.07015	0.00471		0.00051	0.00004
	Total	0.07402	0.00786		0.00051	0.00004
Stria Medullaris	WT	0.29677	0.01387	0.02382	0.00197	0.00006	0.39622
	HET	0.26662	0.02284		0.00193	0.00009
	Total	0.28169	0.02392		0.00195	0.00008
Midbrain	WT	14.497	0.67974	* .00619	0.0961	0.00265	0.84772
	HET	13.31745	0.38658		0.09656	0.00508
	Total	13.90723	0.81081		0.09633	0.00387
Hindbrain	WT	0.00082	0.00056	0.67908	0.00001	0	0.79939
	HET	0.00068	0.00052		0	0
	Total	0.00075	0.00052		0.00001	0
Pons	WT	26.39558	1.07066	0.07458	0.17496	0.00172	* .00049
	HET	25.12625	1.1367		0.1819	0.00262
	Total	25.76092	1.2441		0.17843	0.00419
Medulla	WT	14.43622	1.172	0.32998	0.09564	0.0059	0.49559
	HET	13.6141	1.56915		0.09827	0.00693
	Total	14.02516	1.38848		0.09696	0.00629
Fornix System	WT	4.49635	0.24178	0.07291	0.02981	0.00136	0.41149
	HET	4.20985	0.25323		0.03048	0.00133
	Total	4.3531	0.27947		0.03015	0.00133
Pituitary	WT	1.51792	0.2617	0.94945	0.01005	0.00158	0.3395
	HET	1.52813	0.28226		0.01102	0.00176
	Total	1.52303	0.25956		0.01053	0.00167

^#controlling for WBV

*FDR corrected, p < .05.