TABLE 4.
Phage classification by electron microscopic (EM) morphology, DNA hybridization, and PCR
| Phage | EM | DNA hybridizationa
|
PCRa
|
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 φkc5a | A2 φkc12a | B1 φkc39 | B2 φkc7a | A1 φkc5a | A2 φkc12a | B1 φkc39 | B2 φTL76 | ||
| U.S. phages | |||||||||
| φkc5a | A1 | + | − | − | − | + | − | + | − |
| φkc6a, -bb | − | − | + | − | − | − | + | − | |
| φkc7a, -b, -cb | B2 | − | − | − | + | + | − | + | − |
| φkc12a | A2 | − | + | − | − | − | + | + | − |
| φkc13b | − | − | + | − | − | − | + | − | |
| φkc19b | − | + | − | − | − | + | − | − | |
| φkc31 | B1 | − | − | + | − | − | − | + | − |
| φkc39 | B1 | − | − | + | − | − | − | + | − |
| φkc58ab | + | − | − | + | − | − | − | − | |
| φkc59ab | + | − | − | + | + | − | − | − | |
| φkc60ab | + | − | − | + | + | − | − | − | |
| φkc102bb | − | − | + | − | − | − | + | − | |
| φkc109ab | − | − | − | + | − | − | − | − | |
| φkc148b | − | − | + | − | − | − | + | − | |
| φkc149b | − | − | + | − | − | − | + | − | |
| Turkish phages | |||||||||
| φkc21T | A1 | + | − | − | − | + | − | + | − |
| φkc23T | B1 | − | − | − | − | − | − | + | − |
| φkc26T | + | − | − | − | + | − | − | − | |
| φTL16 | − | − | + | − | − | − | − | − | |
| φTL32 | + | − | + | − | + | − | + | − | |
| φTL33a | A1 | + | − | − | − | − | − | − | − |
| φTL34 | B2 | − | − | − | + | − | − | + | + |
| φTL56b | A1 | + | − | − | − | + | − | − | − |
| φTL74c | B2 | − | − | − | + | − | − | + | − |
| φTL75a | − | − | − | + | − | − | − | + | |
| φTL76 | B2 | − | − | − | + | − | − | − | + |
| φTL87b | + | − | − | − | + | − | − | − | |
| φTL102b | A1 | + | − | − | + | + | − | − | − |
| φTL109a, -cb | − | − | − | + | − | − | − | − | |
| φTL110b | + | − | − | − | + | − | − | − | |
| φTL122b | B1 | − | − | + | − | − | − | + | − |
| φTL125 | B2 | − | − | − | + | − | − | − | − |
| φTL138 | + | − | − | − | + | − | − | − | |
| φTL139a, -cb | + | − | − | − | + | − | − | − | |
| φTL141 | B2 | − | − | − | + | + | − | − | − |
a
Phages that showed negative results included φkc36b, φkc38, φkc48, φkc55a, φkc58b, φkc72, φkc74, φTL25a, φTL35, φTL39b, φTL56c, φTL59c, φTL61a, φTL61b, φTL65, φTL72, φTL109c, φTL113, and φTL134.
b
Hybridization was performed with the lysogenic Lactobacillus chromosomal DNA.