TABLE 2.

Primers used in this study

Use and primer	Sequence (5′–3′)
qPCR
rrsH-5′	AGGCCTTCGGGTTGTAAAGT
rrsH-3′	ATTCCGATTAACGCTTGCAC
ssrA-5′	TGATGACGTCGGCTTTTTGC
ssrA-3′	TTGTGCTGGTAAACGTGTGC
ssrB-5′	AGCGGCATTGCAAACAGTAG
ssrB-3′	TCGCGCAAAGTAAGCAGTTG
ssaB-5′	TGTGACACTACTGCTTGCAG
ssaB-3′	ACCGTTTAACCATCCCCCATC
sseA-5′	TCAACAGCTTGCTGAAAGGG
sseA-3′	TTAAATCCTTCTCGGCCTCCTG
ssaG-5′	TGGATATGCTCTCCCACATGG
ssaG-3′	CTGCTGTAAGGCAAATTGCG
sifA-5′	TGGAAAGCGCAAGAAAAGGC
sifA-3′	GGTGTAAAATGCGCGTTGTC
sseJ-5′	AGGAACACGCCGATAAGTTG
sseJ-3′	TGCAAGACCAAAAGCTTCCG
pipB-5′	ACCGCTGCAATTCTATTCGG
pipB-3′	CGGCTCCTGTTAATGCTTTCG
EMSA
cpxP-5′	CATGACGGCAGCGGTAACTA
cpxP-3′	GTTTTGCTGTTGCTCGCTCC
ssaG-5′	GTAGTTTGGGACTACAGCCTC
ssaG-3′	CAATAACCGTTAGCGCTGG
−302/−55-5′	TTCGGCCCTGATATCCTGAA
−302/−55-3′	ATGTCAATGCTGAAAATGTAATTGTGA
+240/+478-5′	ACAACAATAATTATTTGGCTGCTATCT
+240/+478-3′	CCGACAGATAGATGCCGGC
+1/+119-5′	CATCGCCATCTTATTAAAAAGTAAT
+1/+119-3′	CTATCGCAGTACATATAGTTTCA
−55/+1-5′	TAAAAACTTACAATTTGAAAAATTAT
−55/+1-3′	GTAAAAACATCGTAACAGTTTATT
+119/+240-5′	GTGATCAAGTGCCAAAGATT
+119/+240-3′	TTAATAAAAATAAAAAAGTTAGCC