Figura 4.

Análisis filogenético de secuencias de ARN ribosómico 16S para Diadema y Echinothrix spp.

Un árbol de consenso de máxima verosimilitud de secuencias genéticas parciales para 19 secuencias de Diadema y Echinothrix spp. más Eucidaris tribuloides como un grupo externo. Se extrajo una sección del mitogenoma para E. diadema (KX385836), D. setosum (KX385835), D. antillarum (10.02.2022) y E. tribuloides (ETRI 00-1) que correspondía al gen 16S generando un alineamiento inicial. Para ello, las secuencias específicas del gen E. calamaris 16S se alinearon con todo el mitogenoma de E. tribuloides y E. diadema. Luego, las secuencias específicas del gen D. setosum y D. savignyi para 16S se alinearon con todo el mitogenoma de E. tribuloides y D. antillarum. Por último, las secuencias específicas del gen D. setosum enumeradas en el árbol se alinearon con todo el mitogenoma de E. tribuloides y D. setosum. El resto del mitogenoma de cada especie se recortó para reflejar solo la porción perteneciente a la secuencia del gen 16S. Por lo tanto, los taxones en el árbol llamado Diadema antillarum mtDNA 10.02.2022, Echinothrix diadema KX385836=NC 033523, Diadema setosum KX38535=NC 033522 y Eucidaris tribuloides aislado ETRI 00-1 MH614961=NC 050252 incluir solo las secuencias del gen 16S. Las longitudes de las ramas se igualan y no incluyen los tiempos de divergencia evolutiva. Los valores de soporte de Bootstrap se incluyen en las ramas del árbol.