Table 1B.

The ratios of 12 non-unique mutations per gene.

Gene	A>C	A>G	A>T	C>A	C>G	C>T	G>A	G>C	G>T	T>A	T>C	T>G
Vpu	0.0734	0.1349	0.1156	0.0955	0.0325	0.0938	0.1273	0.0298	0.0770	0.0716	0.0647	0.0839
Tat	0.1428	0.1831	0.0362	0.1342	0.0571	0.1044	0.1108	0.0355	0.0179	0.0368	0.1183	0.0229
Vpr	0.0702	0.1467	0.0219	0.0326	0.0137	0.1701	0.2797	0.0248	0.0235	0.0469	0.1329	0.0370
Rev	0.1008	0.2157	0.0382	0.1201	0.0343	0.1049	0.1606	0.0346	0.0273	0.0168	0.1094	0.0374
Vif	0.0734	0.1983	0.0291	0.0801	0.0227	0.1483	0.2301	0.0075	0.0288	0.0452	0.0952	0.0413
Nef	0.0427	0.1800	0.0690	0.0805	0.0398	0.1028	0.2329	0.0399	0.0301	0.0554	0.0803	0.0466
Gag	0.0707	0.2179	0.0332	0.0667	0.0252	0.1307	0.2169	0.0273	0.0221	0.0372	0.1247	0.0273
Env	0.0748	0.1843	0.0598	0.0849	0.0302	0.0947	0.1913	0.0422	0.0432	0.0662	0.0902	0.0381
Gag-Pol	0.0572	0.2337	0.0345	0.0557	0.0186	0.1278	0.2394	0.0189	0.0154	0.0380	0.1406	0.0203

The bold values mean the mutation with the highest ratio. For each gene, mutation A>G has the highest ratio.