Table 2.
Selected T-cell epitopes common for both MHC molecules predicted from B-cell epitopic regions
| Sl No | Sequence | MHC-I allele | MHC-II allele | Position |
|---|---|---|---|---|
| 1 | FNILIILII |
HLA-A2.1 HLA-B*5101 HLA-B*5102 HLA-B*5201 HLA-B*5301 HLA-B*5401 HLA-B*51 HLA-Cw*0602 MHC-Db MHC-Kd MHC-Kk |
DRB1_0101 DRB1_0102 DRB1_0401 |
3–11 |
| 2 | FYFNGGNPA |
HLA-B*5301 HLA-B*5401 HLA-B*51 HLA-Cw*0401 MHC-Kd |
DRB1_0101 DRB1_0102 DRB1_0401 DRB1_0426 |
51–59 |
| 3 | FTQSLTQCV |
HLA-A*0201 HLA-A2.1 HLA-B*2702 HLA-B*3501 HLA-B*5301 HLA-B*51 HLA-B*5801 HLA-B61 MHC-Db revised MHC-Ld |
DRB1_0401 DRB1_0421 DRB1_0426 DRB1_0701 DRB1_0703 |
116–124 |
| 4 | FIYTQSISQ |
HLA-A3 HLA-B*2702 HLA-B*2705 HLA-B*5301 HLA-B*5401 HLA-B*51 HLA-B*5801 HLA-B62 MHC-Kb |
DRB1_0305 DRB1_0401 DRB1_0402 DRB1_0405 DRB1_0408 DRB1_0701 DRB1_0703 DRB1_0804 DRB1_1101 DRB1_1307 DRB1_1321 DRB5_0101 DRB5_0105 DRB1_0817 |
214–222 |
| 5 | MVPGPNSKC |
HLA-A*0205 HLA-A3 HLA-B*3501 HLA-B*5101 HLA-B*5102 HLA-B*5103 HLA-B*51 HLA-B61 HLA-B7 HLA-B*0702 MHC-Ld |
DRB1_0306 DRB1_0307 DRB1_0308 DRB1_0311 DRB1_0402 DRB1_0404 DRB1_0423 DRB1_1107 DRB1_1501 DRB1_1506 |
266–274 |
| 6 | VVDDGTSTN |
HLA-B*3701 HLA-B*4403 HLA-B61 MHC-Kk |
DRB1_0301 DRB1_0306 DRB1_0307 DRB1_0308 DRB1_0311 DRB1_0410 DRB1_1107 DRB1_0401 DRB1_0421 |
376–384 |
| 7 | FAKFLSMSL |
HLA-B*5101 HLA-B*5102 HLA-B*5103 HLA-B*5301 HLA-B*5401 HLA-B*51 HLA-B*5801 HLA-B60 HLA-B7 HLA-B*0702 HLA-B8 |
DRB1_0308 DRB1_0311 DRB1_0410 DRB1_1107 DRB1_0401 |
444–452 |
| 8 | FYFNGGNPS |
HLA-B*5401 HLA-B*51 HLA-Cw*0401 MHC-Kd |
DRB1_0101 DRB1_0305 DRB1_0401 DRB1_0421 DRB1_0426 DRB1_0813 DRB1_1114 DRB1_1120 DRB1_1302 DRB1_1323 |
230–238 |