TABLE 2.
Phenotypic detection of ESBL and AmpC among carbapenemase-producing Enterobacterales clinical isolates using the standard and modified confirmatory ESBL/AmpC testsa
| Phenotypic confirmatory test |
ESBL detection |
AmpC detection |
||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Standard |
Modified |
Standard |
Modified |
|||||||||||||||
| Genotype |
No. (%) | Sensitivity % | Specificity % | Inconclusive (%) | No. (%) | Sensitivity % | Specificity % | Inconclusive (%) | No. (%) | Sensitivity % | Specificity % | Inconclusive (%) | No. (%) | Sensitivity % | Specificity % | Inconclusive (%) | ||
| Carbapenemase(s) | ESBL/AmpC | No. | ||||||||||||||||
| KPC (n = 45) | ESBL pos/AmpC neg | 22 | 21 (95.5%) | 95.5 | 22 (100%) | 100 | 0 (0) | 100 | 10/22 (45.5) | |||||||||
| ESBL pos/pAmpC pos | 1 | 1 (100%) | 100 | 1 (100%) | 100 | 0 (0) | 0 | 1/1 (100) | ||||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 19 | 1 (5.3) | 94.7 | 1 (5.3) | 94.7 | 0 (0) | 100 | 4/19 (21) | ||||||||||
| ESBL neg/gAmpC pos | 3 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | |||||||||||||
| KPC/OXA-48-type (n = 2) | ESBL pos/AmpC neg | 1 | 0 (0) | 0 | 1 (100) | 100 | 0 (0) | 100 | 1/1 (100) | |||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 1 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 1/1 (100) | ||||||||||
| All KPC (n = 47) | ESBL pos/AmpC neg | 23 | 21 (91.3) | 91.3 | 23 (100) | 100 | 0 (0) | 100 | 11/23 (47.8) | |||||||||
| ESBL pos/pAmpC pos | 1 | 1 (100%) | 100 | 1 | 100 | 0 (0) | 1/1 (100) | |||||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 20 | 1 (5) | 95 | 1 (5) | 95 | 0 (0) | 100 | 5/20 (25) | ||||||||||
| ESBL neg/gAmpC pos | 3 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | |||||||||||||
| Overall positive results | 22/24 (91.7) | 91.7 | 24/24 (100) | 100 | 0/1 (0) | 0 | ||||||||||||
| Overall negative results | 22/23 (95.7) | 95.7 | 22/23 (95.7) | 95.7 | 27/43 (62.8) | 62.8 | 17/43 (39.5) | |||||||||||
| Overall inconclusive | 17/44 (38.6) | |||||||||||||||||
| IMP (n = 3) | ESBL neg/AmpC neg | 3 | 1 (33.3) | 66.7 | 0 (0) | 100 | 3/3 (100) | 0 (0) | 100 | |||||||||
| NDM (n = 49) | ESBL pos/AmpC neg | 18 | 4 (23.5) | 23.5 | 1/18 (5.5) | 18 (100) | 100 | 0 (0) | - | 100 | 16/18 (88.8) | 0 (0) | 100 | 2/18 (11.1) | ||||
| ESBL pos/gAmpC pos | 4 | 2 (50) | 50 | 4 (100) | 100 | |||||||||||||
| ESBL pos/pAmpC pos | 9 | 1 (10) | 10 | 1/9 (11.1) | 9 (100) | 100 | 9/9 (100) | 1 (14.3) | 14.3 | 2/9 (22.2) | ||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 11 | 3 (27.3) | 72.7 | 0 (0) | 100 | 11/11 (100) | 0 (0) | 100 | 1/11 (9) | |||||||||
| ESBL neg/gAmpC pos | 2 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | |||||||||||||
| ESBL neg/pAmpC pos | 5 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 5/5 (100) | 2 (100) | 100 | 3/5 (60) | |||||||||
| NDM/OXA-48-type (n = 6) | ESBL pos/AmpC neg | 2 | 0 (0) | 0 | 2 (100) | 100 | 2/2 (100) | 0 (0) | 100 | |||||||||
| ESBL pos/pAmpC pos | 2 | 0 (0) | 0 | 1 (50) | 50 | 2/2 (100) | 0 (0) | 0 | 1/2 (50) | |||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 1 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 1/1 (100) | 0 (0) | 100 | 1/1 (100) | |||||||||
| ESBL neg/gAmpC pos | 1 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | |||||||||||||
| VIM (n = 12) | ESBL pos/gAmpC pos | 4 | 0 (0) | 0 | 4 (100) | 100 | ||||||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 4 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | - | 100 | 3/4 (75) | 0 (0) | 100 | |||||||
| ESBL neg/gAmpC pos | 3 | 1 (33.3) | 66.7 | 0 (0) | 100 | |||||||||||||
| ESBL neg/pAmpC pos | 1 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 1/1 (100) | 1 (100) | 100 | ||||||||||
| VIM/OXA-48-type (n = 1) | ESBL pos/AmpC neg | 1 | 0 (0) | 0 | 0 (0) | 0 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | ||||||||
| All MBL (n = 71) | ESBL pos/AmpC neg | 21 | 4 (20) | 20 | 1/21 (4.8) | 20 (95.2) | 95.2 | 0 (0) | 100 | 18/21 (85.7) | 0 (0) | 100 | 2/21 (9.5) | |||||
| ESBL pos/gAmpC pos | 8 | 2 (25) | 25 | 8 (100) | 100 | |||||||||||||
| ESBL pos/pAmpC pos | 11 | 1 (10) | 10 | 1/10 (10) | 10 (90.1) | 90.1 | 11/11 (100) | 1 (12.5) | 12.5 | 3/11 (27.3) | ||||||||
| ESBL neg/AmpC neg | 19 | 4 (21) | 79 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 18/19 (94.7) | 0 (0) | 100 | 2/19 (10.5) | |||||||
| ESBL neg/gAmpC pos | 6 | 1 (16.6) | 83.4 | 0 (0) | 100 | |||||||||||||
| ESBL neg/pAmpC pos | 6 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 6/6 (100) | 3 (100) | 100 | 3/6 (50) | |||||||||
| Overall positive results | 7/40 (17.5) | 17.5 | 2/40 (0.5) | 38/40 (95) | 95 | 0/17 (0) | 0 | 17/17 (100) | 4/17 (23.5) | 23.5 | 6/17 (35.3) | |||||||
| Overall negative results | 26/31 (83.9) | 83.9 | 31/31 (100) | 100 | 4/40 (10) | 10 | 36/40 (90) | 36/40 (90) | 90 | 4/40 (10) | ||||||||
| Overall inconclusive | 2/71 (2.8) | 53/57 (93) | 10/57 (17.5) | |||||||||||||||
| NDM/KPC (n = 2) | ESBL neg/AmpC neg | 2 | 0 (0) | 100 | 0 (0) | 100 | 0/2 (0) | 0 | 2/2 (100) | 0 (0) | - | 100 | 1/2 (50) | |||||
| VIM/KPC (n = 1) | ESBL pos/gAmpC pos | 1 | 0 (0) | 0 | 1 (100) | 100 | ||||||||||||
| All MBL/KPC (n = 3) | Overall positive results | 0/1 (0) | 0 | 1/1 (100) | 100 | |||||||||||||
| Overall negative results | 2/2 (100) | 100 | 2/2 (100) | 100 | 100 | 0/2 | 0 | 1/2 (50) | 50 | |||||||||
| Overall inconclusive | 2/2 (100) | 1/2 (50) | ||||||||||||||||
a
No., number, gAmpC, genomic AmpC; pAmpC, plasmidic AmpC.