TABLE 1.
Straina |
vacA type
|
iceA type | Allele group
|
Clinical diagnosisc | ||
---|---|---|---|---|---|---|
s | m | babA | babB | |||
J99 | s1b | m1 | 2 | AD2 | BD2 | DU |
96-74 | s1b | m1 | 1 | AD2 | BD2 | DU |
97-141 | s1b | m1 | 1 | AD2 | BD2 | Gastritis |
84-183 | s1b | m1 | 2 | AD2 | BD3 | NA |
96-71 | s1a | m1 | 2 | AD1 | BD2 | DU |
95-76b | s2 | m2 | 2 | AD1 | BD2 | Gastritis |
98-292 | s1b | m2 | 1 | AD1 | BD3 | NA |
97-503 | s2 | m2 | 2 | AD1 | BD3 | Gastritis |
95-56b | s2 | m2 | 2 | AD2 | BD2 | Gastritis |
96-68 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD2 | Gastritis |
98-454 | s2 | m2 | 2 | AD3 | BD2 | NA |
97-5 | s1b | m2 | 1 | AD3 | BD3 | Gastritis |
90-40 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD1 | NA |
97-147b | s2 | m2 | 1 | AD5 | BD2 | NA |
97-780 | s2 | m2 | 2 | AD3 | BD2 | NA |
95-97 | s1b | m1 | 2 | AD3 | BD2 | Gastritis |
26695 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD3 | Gastritis |
96-28 | s1b | m2 | 2 | AD3 | BD2 | DU |
CCUG17875 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD3 | NA |
95-23 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD2 | NA |
95-10 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD1 | NA |
88-28 | s1a | m2 | 2 | AD3 | BD3 | NA |
98-10 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD1 | GU |
98-16 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD2 | GU |
98-24 | s1a | m1 | 2 | AD2 | BD1 | DU, GU |
98-18 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD3 | GU |
96-10 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD2 | DU |
98-22 | s1a | m1 | 2 | AD3 | BD3 | Gastritis |
98-26 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD2 | GU |
98-32 | s1a | m1 | 2 | AD3 | BD3 | DU, GU |
98-30 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD2 | GU |
98-14 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD1 | DU |
98-12 | s1a | m1 | 1 | AD4 | BD1 | DU |
97-793 | s1a | m1 | 1 | AD2 | BD2 | Gastritis |
97-776 | s1a | m2 | 1 | AD2 | BD2 | Gastritis |
98-60 | s1a | m1 | 1 | AD4 | BD2 | Gastritis |
98-344 | s1c | m2 | 2 | AD3 | BD2 | Gastritis |
98-77 | s1a | m1 | 1 | AD3 | BD2 | Gastritis |
97-679 | s1a | m1 | 2 | AD4 | BD2 | Gastritis |
97-723 | s1a | m2 | 2 | AD4 | BD3 | Gastritis |
97-687 | s1a | m1 | 2 | AD3 | BD2 | Gastritis |
98-53 | s1a | m2 | 2 | AD3 | BD2 | Gastritis |
The geographic location of strains is outlined in Fig. 4.
cagA-negative strain.
NA, not available; DU, duodenal ulcer; GU, gastric ulcer.