Skip to main content
. 2023 Jan 4;19:2. doi: 10.1186/s12917-022-03549-1

Table 2.

Genetic distance of VP1 protein sequence of PTV-2 strains

Strains 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29
1 PTV2 HeNZ1 (OL944705)
2 PTV2 Sek 49/99(AF296110.1) 0.067a
3 PTV 2 CC2 (JF723985.1) 0.067 0.023
4 PTV 2 CC43 (JF724014.1) 0.063 0.027 0.035
5 PTV 2 CC44 (JF724015.1) 0.079 0.050 0.047 0.059
6 PTV 2 CC1 (JF723984.1) 0.071 0.027 0.004 0.039 0.050
7 PTV 2 CC59 (JF724022.1) 0.075 0.027 0.039 0.027 0.058 0.043
8 PTV 2 Vir 6793/83 (AF296108.1) 0.134 0.112 0.108 0.101 0.112 0.112 0.112
9 PTV 2 2-AK-III (AY392542.1) 0.138 0.087 0.100 0.101 0.100 0.104 0.104 0.055
10 PTV 2 12-PL (AY392541.1) 0.138 0.087 0.100 0.101 0.100 0.104 0.104 0.055 0.000
11 PTV 2 T80 (AF296087.1) 0.140 0.092 0.096 0.101 0.101 0.101 0.096 0.051 0.043 0.043
12 PTV 2 CC85 (JF724042.1) 0.142 0.134 0.125 0.135 0.138 0.129 0.138 0.116 0.100 0.100 0.101
13 PTV 2 Vir 480/87 (AF296109.1) 0.147 0.113 0.108 0.109 0.104 0.113 0.117 0.047 0.063 0.063 0.071 0.113
14 PTV 2 Stendal 2532(AY392537.1) 0.148 0.096 0.105 0.118 0.122 0.109 0.109 0.080 0.071 0.071 0.051 0.092 0.080
15 PTV 2 Vir 6711–12/83 (AF296107.1) 0.152 0.108 0.113 0.122 0.108 0.117 0.117 0.063 0.059 0.059 0.047 0.104 0.079 0.051
16 PTV 2 CC18 (JF723995.1) 0.153 0.135 0.135 0.140 0.131 0.140 0.135 0.076 0.105 0.105 0.105 0.140 0.084 0.131 0.101
17 PTV 2 CC26 (JF724002.1) 0.153 0.126 0.126 0.140 0.122 0.131 0.131 0.071 0.096 0.096 0.096 0.131 0.076 0.122 0.096 0.043
18 PTV 2 DS 183/93(AY392533.1) 0.157 0.113 0.117 0.126 0.130 0.122 0.126 0.105 0.075 0.075 0.080 0.035 0.105 0.084 0.084 0.148 0.131
19 PTV 2 JF613 (GU446660.1) 0.160 0.121 0.121 0.131 0.129 0.125 0.134 0.125 0.096 0.096 0.101 0.063 0.117 0.084 0.104 0.166 0.144 0.043
20 PTV 2 YC20 (MN094628.1) 0.160 0.134 0.125 0.135 0.129 0.129 0.138 0.079 0.096 0.096 0.096 0.067 0.075 0.113 0.108 0.118 0.101 0.059 0.075
21 PTV 2 HuN10 (MF170914.1) 0.160 0.121 0.129 0.131 0.142 0.134 0.134 0.121 0.083 0.083 0.096 0.067 0.121 0.092 0.092 0.171 0.153 0.043 0.043 0.087
22 PTV 2 HuN12 (MF170916.1) 0.160 0.121 0.129 0.131 0.142 0.134 0.134 0.121 0.083 0.083 0.096 0.071 0.121 0.084 0.092 0.166 0.148 0.047 0.039 0.091 0.019
23 PTV 2 HuN11 (MF170915.1) 0.160 0.121 0.129 0.131 0.142 0.134 0.134 0.121 0.083 0.083 0.096 0.067 0.121 0.092 0.092 0.171 0.153 0.043 0.043 0.087 0.000 0.019
24 PTV 2 HuN8 (MF170912.1) 0.160 0.121 0.129 0.131 0.142 0.134 0.134 0.121 0.083 0.083 0.096 0.071 0.121 0.084 0.092 0.166 0.148 0.047 0.039 0.091 0.019 0.000 0.019
25 PTV 2 HuN27(MF170931.1) 0.160 0.121 0.129 0.131 0.142 0.134 0.134 0.121 0.083 0.083 0.096 0.071 0.121 0.084 0.092 0.166 0.148 0.047 0.039 0.091 0.019 0.000 0.019 0.000
26 PTV 2 DS 756/93 (A63AY392534.1) 0.161 0.113 0.126 0.126 0.139 0.130 0.126 0.113 0.075 0.075 0.088 0.047 0.113 0.084 0.084 0.148 0.131 0.019 0.055 0.071 0.039 0.031 0.039 0.031 0.031
27 PTV 2 Vir 2018/87(GQ293229.1) 0.161 0.117 0.122 0.131 0.135 0.126 0.130 0.109 0.079 0.079 0.084 0.039 0.105 0.084 0.088 0.153 0.135 0.012 0.043 0.063 0.047 0.051 0.047 0.051 0.051 0.023
28 PTV 2 HuN7 (MF170911.1) 0.164 0.125 0.134 0.135 0.147 0.138 0.138 0.125 0.087 0.087 0.101 0.075 0.121 0.084 0.096 0.171 0.153 0.051 0.039 0.095 0.023 0.004 0.023 0.004 0.004 0.035 0.047
29 PTV 2 HuN30 (MF170934.1) 0.173 0.138 0.138 0.144 0.129 0.142 0.142 0.083 0.117 0.117 0.101 0.108 0.096 0.122 0.117 0.113 0.101 0.105 0.129 0.083 0.134 0.134 0.134 0.134 0.134 0.113 0.109 0.138

Note: The analysis included 29 amino acid sequences and was conducted using the Poisson correction model in MEGA 7. All positions containing gaps and missing data were eliminated. a: The genetic distances displayed in this table represent the number of base substitutions per site from between sequences