Table 2.
Genetic distance of VP1 protein sequence of PTV-2 strains
| Strains | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | PTV2 HeNZ1 (OL944705) | |||||||||||||||||||||||||||||
| 2 | PTV2 Sek 49/99(AF296110.1) | 0.067a | ||||||||||||||||||||||||||||
| 3 | PTV 2 CC2 (JF723985.1) | 0.067 | 0.023 | |||||||||||||||||||||||||||
| 4 | PTV 2 CC43 (JF724014.1) | 0.063 | 0.027 | 0.035 | ||||||||||||||||||||||||||
| 5 | PTV 2 CC44 (JF724015.1) | 0.079 | 0.050 | 0.047 | 0.059 | |||||||||||||||||||||||||
| 6 | PTV 2 CC1 (JF723984.1) | 0.071 | 0.027 | 0.004 | 0.039 | 0.050 | ||||||||||||||||||||||||
| 7 | PTV 2 CC59 (JF724022.1) | 0.075 | 0.027 | 0.039 | 0.027 | 0.058 | 0.043 | |||||||||||||||||||||||
| 8 | PTV 2 Vir 6793/83 (AF296108.1) | 0.134 | 0.112 | 0.108 | 0.101 | 0.112 | 0.112 | 0.112 | ||||||||||||||||||||||
| 9 | PTV 2 2-AK-III (AY392542.1) | 0.138 | 0.087 | 0.100 | 0.101 | 0.100 | 0.104 | 0.104 | 0.055 | |||||||||||||||||||||
| 10 | PTV 2 12-PL (AY392541.1) | 0.138 | 0.087 | 0.100 | 0.101 | 0.100 | 0.104 | 0.104 | 0.055 | 0.000 | ||||||||||||||||||||
| 11 | PTV 2 T80 (AF296087.1) | 0.140 | 0.092 | 0.096 | 0.101 | 0.101 | 0.101 | 0.096 | 0.051 | 0.043 | 0.043 | |||||||||||||||||||
| 12 | PTV 2 CC85 (JF724042.1) | 0.142 | 0.134 | 0.125 | 0.135 | 0.138 | 0.129 | 0.138 | 0.116 | 0.100 | 0.100 | 0.101 | ||||||||||||||||||
| 13 | PTV 2 Vir 480/87 (AF296109.1) | 0.147 | 0.113 | 0.108 | 0.109 | 0.104 | 0.113 | 0.117 | 0.047 | 0.063 | 0.063 | 0.071 | 0.113 | |||||||||||||||||
| 14 | PTV 2 Stendal 2532(AY392537.1) | 0.148 | 0.096 | 0.105 | 0.118 | 0.122 | 0.109 | 0.109 | 0.080 | 0.071 | 0.071 | 0.051 | 0.092 | 0.080 | ||||||||||||||||
| 15 | PTV 2 Vir 6711–12/83 (AF296107.1) | 0.152 | 0.108 | 0.113 | 0.122 | 0.108 | 0.117 | 0.117 | 0.063 | 0.059 | 0.059 | 0.047 | 0.104 | 0.079 | 0.051 | |||||||||||||||
| 16 | PTV 2 CC18 (JF723995.1) | 0.153 | 0.135 | 0.135 | 0.140 | 0.131 | 0.140 | 0.135 | 0.076 | 0.105 | 0.105 | 0.105 | 0.140 | 0.084 | 0.131 | 0.101 | ||||||||||||||
| 17 | PTV 2 CC26 (JF724002.1) | 0.153 | 0.126 | 0.126 | 0.140 | 0.122 | 0.131 | 0.131 | 0.071 | 0.096 | 0.096 | 0.096 | 0.131 | 0.076 | 0.122 | 0.096 | 0.043 | |||||||||||||
| 18 | PTV 2 DS 183/93(AY392533.1) | 0.157 | 0.113 | 0.117 | 0.126 | 0.130 | 0.122 | 0.126 | 0.105 | 0.075 | 0.075 | 0.080 | 0.035 | 0.105 | 0.084 | 0.084 | 0.148 | 0.131 | ||||||||||||
| 19 | PTV 2 JF613 (GU446660.1) | 0.160 | 0.121 | 0.121 | 0.131 | 0.129 | 0.125 | 0.134 | 0.125 | 0.096 | 0.096 | 0.101 | 0.063 | 0.117 | 0.084 | 0.104 | 0.166 | 0.144 | 0.043 | |||||||||||
| 20 | PTV 2 YC20 (MN094628.1) | 0.160 | 0.134 | 0.125 | 0.135 | 0.129 | 0.129 | 0.138 | 0.079 | 0.096 | 0.096 | 0.096 | 0.067 | 0.075 | 0.113 | 0.108 | 0.118 | 0.101 | 0.059 | 0.075 | ||||||||||
| 21 | PTV 2 HuN10 (MF170914.1) | 0.160 | 0.121 | 0.129 | 0.131 | 0.142 | 0.134 | 0.134 | 0.121 | 0.083 | 0.083 | 0.096 | 0.067 | 0.121 | 0.092 | 0.092 | 0.171 | 0.153 | 0.043 | 0.043 | 0.087 | |||||||||
| 22 | PTV 2 HuN12 (MF170916.1) | 0.160 | 0.121 | 0.129 | 0.131 | 0.142 | 0.134 | 0.134 | 0.121 | 0.083 | 0.083 | 0.096 | 0.071 | 0.121 | 0.084 | 0.092 | 0.166 | 0.148 | 0.047 | 0.039 | 0.091 | 0.019 | ||||||||
| 23 | PTV 2 HuN11 (MF170915.1) | 0.160 | 0.121 | 0.129 | 0.131 | 0.142 | 0.134 | 0.134 | 0.121 | 0.083 | 0.083 | 0.096 | 0.067 | 0.121 | 0.092 | 0.092 | 0.171 | 0.153 | 0.043 | 0.043 | 0.087 | 0.000 | 0.019 | |||||||
| 24 | PTV 2 HuN8 (MF170912.1) | 0.160 | 0.121 | 0.129 | 0.131 | 0.142 | 0.134 | 0.134 | 0.121 | 0.083 | 0.083 | 0.096 | 0.071 | 0.121 | 0.084 | 0.092 | 0.166 | 0.148 | 0.047 | 0.039 | 0.091 | 0.019 | 0.000 | 0.019 | ||||||
| 25 | PTV 2 HuN27(MF170931.1) | 0.160 | 0.121 | 0.129 | 0.131 | 0.142 | 0.134 | 0.134 | 0.121 | 0.083 | 0.083 | 0.096 | 0.071 | 0.121 | 0.084 | 0.092 | 0.166 | 0.148 | 0.047 | 0.039 | 0.091 | 0.019 | 0.000 | 0.019 | 0.000 | |||||
| 26 | PTV 2 DS 756/93 (A63AY392534.1) | 0.161 | 0.113 | 0.126 | 0.126 | 0.139 | 0.130 | 0.126 | 0.113 | 0.075 | 0.075 | 0.088 | 0.047 | 0.113 | 0.084 | 0.084 | 0.148 | 0.131 | 0.019 | 0.055 | 0.071 | 0.039 | 0.031 | 0.039 | 0.031 | 0.031 | ||||
| 27 | PTV 2 Vir 2018/87(GQ293229.1) | 0.161 | 0.117 | 0.122 | 0.131 | 0.135 | 0.126 | 0.130 | 0.109 | 0.079 | 0.079 | 0.084 | 0.039 | 0.105 | 0.084 | 0.088 | 0.153 | 0.135 | 0.012 | 0.043 | 0.063 | 0.047 | 0.051 | 0.047 | 0.051 | 0.051 | 0.023 | |||
| 28 | PTV 2 HuN7 (MF170911.1) | 0.164 | 0.125 | 0.134 | 0.135 | 0.147 | 0.138 | 0.138 | 0.125 | 0.087 | 0.087 | 0.101 | 0.075 | 0.121 | 0.084 | 0.096 | 0.171 | 0.153 | 0.051 | 0.039 | 0.095 | 0.023 | 0.004 | 0.023 | 0.004 | 0.004 | 0.035 | 0.047 | ||
| 29 | PTV 2 HuN30 (MF170934.1) | 0.173 | 0.138 | 0.138 | 0.144 | 0.129 | 0.142 | 0.142 | 0.083 | 0.117 | 0.117 | 0.101 | 0.108 | 0.096 | 0.122 | 0.117 | 0.113 | 0.101 | 0.105 | 0.129 | 0.083 | 0.134 | 0.134 | 0.134 | 0.134 | 0.134 | 0.113 | 0.109 | 0.138 |
Note: The analysis included 29 amino acid sequences and was conducted using the Poisson correction model in MEGA 7. All positions containing gaps and missing data were eliminated. a: The genetic distances displayed in this table represent the number of base substitutions per site from between sequences