TABLE 2.
Comparison of the LEE1, LEE2, LEE3, tir, and LEE4 promoter regions among EPEC, EHEC, and RDEC-1a
| Gene or operon | Strain | Sequence
|
Position in LEE |
|---|---|---|---|
| −35 Spacer −10 +1 | |||
| LEE1 | EPEC | TTG TTGACA TTTAATGATAATGTAT TTTACA CATTAGAAA | 3916 |
| EHEC | ••• •••••• •••••••••••••••• •••••• ••••••••• | 40348cb | |
| RDEC-1 | ••• •••••• ••••••••••••••g• •••••• •••••tgc• | 4351 | |
| LEE2 | EPEC | TGC TTGAAA AAGCGTATTGGATAATA TATACA GTATATGTAC | 14766 |
| EHEC | ••• •••••• ••••••••••••••••• ••••t• •••••••••• | 29498c | |
| RDEC-1 | ••• •••••• ••••••••••••••••• ••••t• •••••••••• | 15218 | |
| LEE3 | EPEC | TAG TTGCAA TGTACATAAAGTACATA TACTGT ATATATTATCC | 14789 |
| EHEC | ••• •••••• ••••••••••••••••• •••••• ••••••••••• | 29475c | |
| RDEC-1 | ••• •••••• ••••••••••••••••• ••••a• ••••••••••• | 15241 | |
| tir | EPEC | TGC TTGCAT CAAAAATTATACTGTGA TTTATT TGGTTTATGC | 22446 |
| EHEC | •-• •••••• •••••••c•••t••••• •••••• ••••cg•••t | 21735c | |
| RDEC-1 | •-• •••••• •••••••c•g••••••• •••••• ••••cg•••t | 22993 | |
| LEE4 | EPEC | TGG TTGAAC AATGAGAAAAAATATGG TGAACT TACATCGTCT | 29169 |
| EHEC | ••• •••••• ••••••••••••••••• •••••• •••••••••• | 14934c | |
| RDEC-1 | ••• •••••• ••••••••••••••••• •••••• ••••••aa•• | 29698 | |
| Consensus | TTGACA 17 bp TATAAT |
a
Alignment of promoter regions among the LEEs from E2348/69, EDL933, and RDEC-1. Identical and different nucleotides are indicated by dots and lower case characters, respectively. Dashes indicate absent nucleotides.
b
c, complementary strand.