TABLE 4.
Comparison of MLST to other typing methods
Straina | emm type | MLST-ST | ET based on MLEE | RAPD profile |
---|---|---|---|---|
MGAS166 | 1 | 28 | 1 | |
MGAS307 | 1 | 28 | 1 | |
MGAS302 | 1 | 28 | 15 | |
MGAS283 | 1 | 28 | 25 | |
MGAS2127 | 1 | 28 | 1D | |
MGAS2110 | 1 | 91 | 1B | |
MGAS2120 | 1 | 92 | 1C | |
MGAS2125 | 1 | 92 | 1C | |
MGAS2109 | 1 | 93 | 1F | |
MGAS2144 | 1 | 93 | 1F | |
MGAS2226 | 1 | 93 | 1F | |
MGAS2123 | 1 | 94 | 1F | |
MGAS327 | 2 | 55 | 4 | |
MGAS286 | 2 | 55 | 6 | |
MGAS157 | 3 | 15 | 2 | |
MGAS159 | 3 | 15 | 2 | |
MGAS268 | 3 | 15 | 2 | |
MGAS277 | 3 | 15 | 20 | |
MGAS254 | 5 | 99 | 28 | |
MGAS258 | 5 | 99 | 28 | |
MGAS300 | 18 | 42 | 20 | |
1RP232 | 19 | 65 | 45 | |
MGAS330 | 22 | 46 | 23 | |
MGAS339 | 22 | 46 | 23 | |
MGAS275 | 22 | 46 | 24 | |
1RP284 | 24 | 70 | 45 | |
D316 | 25 | 54 | 55 | |
MGAS255 | 28 | 52 | 10 | |
MGAS325 | 28 | 52 | 10 | |
D470 | 29 | 65 | 46 | |
MGAS323 | 50/62 | 2 | 9 | |
MGAS324 | 50/62 | 2 | 9 | |
MGAS264 | 75 | 49 | 18 | |
86-809 | 75 | 49 | 59 | |
MGAS261 | 77 | 35 | 4 | |
MGAS331 | 77 | 63 | 13 | |
MGAS2017 | 89 | 77 | 67 | |
MGAS2018 | 89 | 77 | 67 | |
CT95-120 | 1 | 28 | 1 | |
CT95-111 | 1 | 28 | 1 | |
CT95-131 | 1 | 28 | 1 | |
CT95-132 | 1 | 28 | 1 | |
CT95-180 | 1 | 28 | 1 | |
CT95-133 | 3 | 15 | 2 | |
CT95-145 | 3 | 15 | 3 | |
CT95-204 | 3 | 15 | 4 | |
CT95-117 | 3 | 15 | 5 | |
CT95-119 | 3 | 15 | 5 | |
CT95-186 | 3 | 15 | 8 | |
CT95-200 | 3 | 18 | 5 | |
CT95-155 | 11 | 20 | 19 | |
CT95-126 | 11 | 20 | 19 | |
CT95-154 | 75 | 49 | 21 | |
CT95-171 | 75 | 49 | 22 | |
CT95-159 | 77 | 63 | 15 | |
CT95-176 | 89 | 77 | 15 |