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. 2022 Dec 21;13(1):22. doi: 10.3390/nano13010022

Table 5.

Characteristics of interaction between piRNA and 3’UTR mRNA of MS genes.

Gene miRNA Start of Site, nt ΔG, kJ/mol ΔG/ΔGm, % Length, nt
ADAM17 piR-16315 3501 −149 89 30
piR-5295 3508 −146 85 31
piR-5301 3509 −149 92 30
piR-5300 3509 −144 92 30
piR-5303 3509 −142 89 30
piR-5294 3509 −140 85 30
piR-6236 3509 −146 91 30
piR-7637 3509 −153 95 30
piR-5358 3509 −144 88 30
AHI1 piR-16315 4455 −144 86 30
piR-5295 4461 −142 83 31
piR-5301 4462 −149 92 30
piR-5300 4462 −144 92 30
piR-5303 4462 −142 89 30
piR-5294 4462 −142 86 30
piR-6236 4462 −146 91 30
piR-7637 4462 −146 91 30
piR-5358 4462 −151 92 30
piR-6244 4494 −144 86 31
piR-5744 4494 −144 87 31
piR-7102 4500 −159 93 31
piR-7105 4499 −153 86 32
piR-7107 4499 −151 86 32
piR-1748 4542 −149 93 30
piR-6746 4623 −142 85 31
piR-3833 4645 −140 88 29
piR-13641 4662 −142 93 28
piR-13634 4663 −140 96 27
EVI5 piR-4815 3354 −142 84 31
piR-10936 3378 −144 85 31
piR-10886 3379 −142 84 30
piR-10885 3379 −140 85 30
piR-9994 3404 −153 91 30
piR-9059 3404 −168 100 30
piR-9036 3405 −142 88 29
piR-3586 3407 −163 93 32
piR-7244 3410 −153 96 29
piR-5505 3441 −149 89 30
piR-2344 3446 −151 93 30
piR-1254 3517 −144 83 32
piR-12623 3534 −144 88 30
piR-4112 3543 −140 90 29
piR-12340 3546 −140 90 28
piR-17617 3550 −134 87 29
piR-12397 3572 −142 92 28
piR-12346 3570 −146 85 31
piR-12399 3573 −155 97 28
piR-5505 3577 −142 85 30
piR-15405 3586 −155 94 30
piR-14239 3586 −149 91 30
piR-15404 3587 −149 93 29
piR-14625 3598 −146 91 30
piR-4815 4833 −146 86 31
piR-4816 4833 −142 83 31
piR-1254 4829 −157 90 32
piR-12623 4847 −151 92 30
piR-4112 4857 −140 90 29
piR-12340 4859 −144 93 28
piR-11421 4871 −144 86 30
piR-11245 4872 −142 92 29
piR-12346 4883 −144 84 31
piR-12399 4886 −144 91 28
piR-5505 4890 −140 84 30
piR-15405 4899 −146 88 30
piR-14239 4899 −140 86 30
piR-15404 4900 −140 88 29
piR-1248 5078 −142 91 29
piR-10873 5078 −144 88 30
piR-11596 5079 −142 88 30
piR-10936 5078 −153 90 31
piR-10886 5079 −157 93 30
piR-10885 5079 −142 86 30
piR-10873 5079 −153 94 30
piR-10935 5079 −146 90 30
piR-10934 5079 −144 91 30
piR-10933 5079 −140 88 30
piR-14091 5086 −132 89 28
piR-9994 5104 −153 91 30
piR-9059 5104 −161 96 30
piR-9036 5105 −149 92 29
piR-3586 5107 −168 95 32
piR-7244 5110 −151 95 29
piR-3587 5110 −142 91 29
piR-1254 5215 −157 90 32
piR-12623 5232 −144 88 30
piR-17617 5248 −130 85 29
piR-11421 5252 −140 84 30
piR-12346 5268 −144 84 31
piR-12399 5271 −142 89 28
piR-15405 5284 −151 91 30
piR-14239 5284 −144 88 30
piR-15404 5285 −149 93 29
piR-14625 5296 −149 92 30
piR-9460 6836 −144 87 31
piR-6746 6872 −142 85 31
piR-5744 6872 −140 85 31
piR-7107 6877 −146 83 32
piR-7102 6878 −140 81 31
IL12B piR-16315 1779 −144 86 30
piR-9460 1783 −144 87 31
piR-6746 1818 −146 87 31
piR-15278 1822 −153 91 31
piR-6105 1824 −144 84 31
piR-7102 1824 −140 81 31
piR-8561 1824 −140 81 32
piR-16315 2076 −140 84 30
piR-6236 2084 −144 89 30
piR-5744 2115 −140 85 31
piR-7107 2120 −149 84 32
piR-7102 2121 −142 83 31
piR-14883 2143 −146 86 31
piR-14884 2145 −136 85 29
piR-9460 2213 −149 90 31
piR-13123 2215 −146 91 30
piR-5363 2217 −140 90 29
piR-8226 2233 −142 88 29
piR-5744 2248 −146 88 31
piR-6746 2248 −151 90 31
piR-7107 2253 −146 83 32
piR-15278 2252 −142 85 31
piR-6105 2254 −144 84 31
piR-7102 2254 −146 85 31
piR-8561 2254 −151 88 32
piR-6092 2254 −140 82 31
piR-8561 2255 −149 86 32
piR-225 2296 −142 91 28
piR-14974 2304 −136 91 26
piR-16075 2310 −138 92 28
MLANA piR-1254 976 −151 87 32
piR-4815 980 −140 82 31
piR-13770 989 −142 93 28
piR-13714 998 −144 97 27
piR-1248 1005 −140 89 29
piR-11596 1006 −140 87 30
piR-10936 1005 −151 89 31
piR-10886 1006 −155 91 30
piR-10885 1006 −146 88 30
piR-10873 1006 −151 92 30
piR-10935 1006 −144 88 30
piR-10934 1006 −142 89 30
piR-10930 1006 −142 88 30
piR-15670 1013 −136 86 28
piR-9994 1031 −142 85 30
piR-9059 1031 −157 94 30
piR-3586 1034 −153 87 32
piR-7244 1037 −142 89 29
piR-5505 1068 −157 94 30
piR-2344 1073 −142 88 30
piR-15406 1077 −157 96 30
piR-1254 1142 −155 89 32
piR-12623 1159 −146 90 30
piR-12340 1171 −144 93 28
piR-17617 1175 −132 86 29
piR-11421 1183 −142 85 30
piR-12346 1195 −157 91 31
piR-12399 1198 −149 93 28
piR-15405 1211 −155 94 30
piR-14239 1211 −149 91 30
piR-15404 1212 −149 93 29
piR-14625 1223 −144 89 30