Table 5.
Non-synonymous SNVs causing potentially important alterations in NR1, including all that were found in the ferredoxin domains.
| Position Nucl. ref | 10 |
11 |
17 |
22 |
40/42 |
59 |
76 |
88 |
91 |
145 |
173 |
302 |
583 |
786 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| G | G | C | T | G-G | T | A | G | G | G | G | A | C | C | |
| Cultured samples, no clinical data available | ||||||||||||||
| P344 | A/C | G/A | A/G | A/G | C/T | |||||||||
| P387 | C/G | G/A | A/G | A/G | A/G | C/T | ||||||||
| P413 | C | |||||||||||||
| P424 | C | |||||||||||||
| P427 | C/G | G/A | A/G | A/G | C/T | |||||||||
| P433 | ||||||||||||||
| P458 | ||||||||||||||
| Fecal sample, no clinical data available | ||||||||||||||
| 0099 | A-A/G-G | A/G | G | C/T | ||||||||||
| Fecal samples, clinically susceptible | ||||||||||||||
| Ag30 | C | |||||||||||||
| VA | A | G | T | |||||||||||
| Ag15 | A/G | G | C/T | |||||||||||
| Fecal samples, clinically refractory | ||||||||||||||
| Ag10 | A/G | A | G | C/T | ||||||||||
| Ag13 | G/A | A/G | A/G | A/G | C/T | C/T | ||||||||
| Ag20 | A | |||||||||||||
| Ag22 |
C/T |
A/G |
A/G |
|||||||||||
| Amino acid change (codon position) | G > S (4) | G > A (4) | P > Q (6) | F > L (8) | V > I (14) | V > A (20) | M > V (26) | V > M (30) | D > N (31) | G > R (49) | S > N (57) | D > G (101) | Q >* (195) | K > R(264) |