TABLE 3.
Genus | IS1 | IS3 | IS4 | IS5 | IS6 | IS21 | IS30 | IS66 | IS91 | IS110 | IS256 | IS605 | IS630 | IS982 | IS1380 | ISAs1 | ISL3 | NCYa | NDa | Total |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Acetobacter | 1 | 4 | 2 | 7 | ||||||||||||||||
Acinetobacter | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Actinobacillus | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Aeromonas | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Agrobacterium | 3 | 3 | 8 | 2 | 1 | 17 | ||||||||||||||
Anabaena | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 8 | ||||||||||||||
Bacillus | 2 | 11 | 4 | 4 | 1 | 2 | 24 | |||||||||||||
Bacteroides | 2 | 4 | 2 | 1 | 9 | |||||||||||||||
Bordetella | 5 | 1 | 6 | |||||||||||||||||
Bradyrhizobium | 1 | 1 | 5 | 7 | ||||||||||||||||
Brevibacterium | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Brucella | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Burkholderia | 2 | 1 | 1 | 5 | 1 | 6 | 16 | |||||||||||||
Caedibacter | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Calothrix | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Campylobacter | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Capnocytophaga | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Caulobacter | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Clavibacter | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Clostridium | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | ||||||||||||||
Corynebacterium | 1 | 2 | 3 | 6 | ||||||||||||||||
Coxiella | 3 | 3 | ||||||||||||||||||
Dichelobacter | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Enterobacter | 1 | 2 | 3 | |||||||||||||||||
Enterococcus | 4 | 2 | 1 | 2 | 9 | |||||||||||||||
Erwinia | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Escherichia | 10 | 13 | 6 | 5 | 3 | 5 | 4 | 7 | 1 | 54 | ||||||||||
Fremyella | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Fusobacterium | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Gluconobacter | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Haemophilus | 6 | 6 | ||||||||||||||||||
Halobacterium | 11 | 3 | 1 | 2 | 2 | 19 | ||||||||||||||
Haloferax | 3 | 3 | ||||||||||||||||||
Helicobacter | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Lactobacillus | 3 | 2 | 1 | 1 | 1 | 8 | ||||||||||||||
Lactococcus | 5 | 15 | 2 | 4 | 26 | |||||||||||||||
Leptospira | 2 | 2 | 4 | |||||||||||||||||
Leucaena | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Leuconostoc | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||||||||||
Methanobrevibacter | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Moraxella | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Mycobacterium | 5 | 1 | 1 | 1 | 2 | 4 | 9 | 1 | 1 | 25 | ||||||||||
Mycoplasma | 14 | 14 | ||||||||||||||||||
Neisseria | 1 | 2 | 1 | 4 | ||||||||||||||||
Nocardia | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Paracoccus | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Pediococcus | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Porphyromonas | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Proteus | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Pseudomonas | 3 | 4 | 5 | 1 | 1 | 2 | 2 | 5 | 3 | 26 | ||||||||||
Ralstonia | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||||||||||
Rhizobium | 5 | 2 | 2 | 1 | 4 | 3 | 2 | 1 | 20 | |||||||||||
Rhodococcus | 1 | 1 | 4 | 6 | ||||||||||||||||
Saccharopolyspora | 4 | 4 | ||||||||||||||||||
Salmonella | 2 | 5 | 5 | 1 | 13 | |||||||||||||||
Serratia | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Shigella | 4 | 5 | 1 | 1 | 1 | 12 | ||||||||||||||
Sphingomonas | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Spiroplasma | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Staphylococcus | 8 | 1 | 1 | 2 | 12 | |||||||||||||||
Streptococcus | 2 | 5 | 3 | 1 | 1 | 5 | 1 | 18 | ||||||||||||
Streptomyces | 1 | 4 | 1 | 3 | 1 | 10 | ||||||||||||||
Sulfolobus | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Synechococcus | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Synechocystis | 2 | 2 | 1 | 5 | ||||||||||||||||
Thermophilic | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Thermus | 1 | 2 | 3 | |||||||||||||||||
Thiobacillus | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Vibrio | 13 | 1 | 1 | 15 | ||||||||||||||||
Weeksella | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Xanthobacter | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Xanthomonas | 1 | 1 | 3 | 5 | 10 | |||||||||||||||
Yersinia | 2 | 4 | 1 | 1 | 1 | 9 | ||||||||||||||
Total | 14 | 82 | 41 | 68 | 45 | 21 | 19 | 12 | 8 | 20 | 33 | 25 | 12 | 7 | 6 | 12 | 21 | 21 | 33 | 500 |
NCY, not classified; ND, sequence not determined.