Appendix 1—table 12. Coordinated episodic selection in concordantly evolving pairs predicted for the phylogeny reconstructed by USHER.
site 1 | site 2 | #nonseq. pairs | zscore | lower pvalue | upper pvalue | lower pvalue adj. | upper pvalue adj. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
12 | 346 | 1296 | 0,461 | 0,29 | 0,71 | 1 | 0,9263 |
12 | 899 | 883 | 0,705 | 0,245 | 0,755 | 1 | 0,9551 |
13 | 152 | 3955 | –0,731 | 0,75 | 0,25 | 1 | 0,4597 |
20 | 190 | 2357 | –0,372 | 0,6525 | 0,3475 | 1 | 0,5826 |
20 | 417 | 3184 | 0,692 | 0,225 | 0,775 | 1 | 0,9551 |
26 | 190 | 3876 | 0,993 | 0,1425 | 0,8575 | 0,8835 | 0,9975 |
26 | 655 | 10663,5 | 2,486 | 0,01 | 0,99 | 0,1425 | 1 |
54 | 690 | 923 | –1,288 | 0,9175 | 0,0825 | 1 | 0,1959 |
62 | 251 | 95 | 0,51 | 0,2875 | 0,7125 | 1 | 0,9263 |
67 | 96 | 2027 | 0,462 | 0,285 | 0,715 | 1 | 0,9263 |
69 | 70 | 2241 | 2,982 | 0 | 1 | 0,0713 | 1 |
69 | 144 | 967 | 2,582 | 0,01 | 0,99 | 0,1425 | 1 |
70 | 144 | 833 | 2,303 | 0,02 | 0,98 | 0,1832 | 1 |
76 | 490 | 1801 | 0,766 | 0,2125 | 0,7875 | 1 | 0,9551 |
80 | 215 | 13261,5 | –2,369 | 0,995 | 0,005 | 1 | 0,0204 |
80 | 950 | 6321 | –1,417 | 0,9325 | 0,0675 | 1 | 0,1749 |
152 | 252 | 1142 | 0,042 | 0,4875 | 0,5125 | 1 | 0,8063 |
189 | 360 | 43 | 0,188 | 0,395 | 0,605 | 1 | 0,8621 |
189 | 772 | 109 | –0,85 | 0,785 | 0,215 | 1 | 0,4226 |
190 | 417 | 2157,5 | –0,741 | 0,7725 | 0,2275 | 1 | 0,4323 |
215 | 1167 | 2031 | –1,602 | 0,9525 | 0,0475 | 1 | 0,1425 |
255 | 256 | 2126 | –1,048 | 0,845 | 0,155 | 1 | 0,3398 |
255 | 260 | 1285 | –2,55 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
256 | 258 | 645 | –1,441 | 0,9375 | 0,0625 | 1 | 0,1696 |
256 | 260 | 872 | –1,368 | 0,9275 | 0,0725 | 1 | 0,1797 |
259 | 260 | 435 | –2,326 | 0,9925 | 0,0075 | 1 | 0,0267 |
259 | 261 | 778 | –1,861 | 0,99 | 0,01 | 1 | 0,0335 |
357 | 360 | 30,5 | –1,517 | 0,95 | 0,05 | 1 | 0,1425 |
359 | 360 | 38 | –0,549 | 0,6725 | 0,3275 | 1 | 0,5657 |
360 | 772 | 39 | –0,674 | 0,7225 | 0,2775 | 1 | 0,4943 |
439 | 440 | 2456,5 | –2,577 | 0,9925 | 0,0075 | 1 | 0,0267 |
439 | 441 | 1061 | –2,935 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
439 | 444 | 1143,5 | –3,434 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
440 | 441 | 1555,5 | –2,671 | 0,995 | 0,005 | 1 | 0,0204 |
440 | 442 | 897 | –2,686 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
440 | 444 | 1675,5 | –2,976 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
441 | 442 | 387 | –4,065 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
441 | 443 | 440 | –3,437 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
441 | 444 | 721,5 | –4,488 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
441 | 445 | 596 | –2,144 | 0,9825 | 0,0175 | 1 | 0,0554 |
442 | 443 | 253 | –3,58 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
442 | 444 | 416 | –4,346 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
443 | 444 | 472 | –4,301 | 1 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
444 | 445 | 640 | –2,502 | 0,9975 | 0,0025 | 1 | 0,0119 |
501 | 570 | 21489 | 3,943 | 0 | 1 | 0,0713 | 1 |
501 | 1118 | 21300 | 1,398 | 0,08 | 0,92 | 0,57 | 1 |
570 | 681 | 26547,5 | 2,15 | 0,015 | 0,985 | 0,171 | 1 |
570 | 1118 | 13096,5 | 1,926 | 0,0225 | 0,9775 | 0,1832 | 1 |
572 | 1181 | 511 | –0,81 | 0,785 | 0,215 | 1 | 0,4226 |
583 | 1237 | 3077 | –0,998 | 0,8325 | 0,1675 | 1 | 0,3536 |
681 | 716 | 27238 | –1,029 | 0,8575 | 0,1425 | 1 | 0,3249 |
681 | 1118 | 26316 | 0,042 | 0,475 | 0,525 | 1 | 0,8063 |
716 | 982 | 10836,5 | 0,057 | 0,4625 | 0,5375 | 1 | 0,8063 |
716 | 1118 | 13434,5 | –0,024 | 0,5175 | 0,4825 | 1 | 0,7858 |
859 | 950 | 4892 | 0,429 | 0,3125 | 0,6875 | 1 | 0,9263 |
982 | 1118 | 10470,5 | 0,258 | 0,3975 | 0,6025 | 1 | 0,8621 |
1027 | 1176 | 4023,5 | 0,98 | 0,155 | 0,845 | 0,8835 | 0,9975 |