. 2023 Feb 4;2023:6905216. doi: 10.1155/2023/6905216

Table 3.

Correlation analysis between PTTGs and biomarkers of immune cells in TIMER.

Description	Gene markers	PTTG1				PTTG2				PTTG3P
		None		Purity		None		Purity		None		Purity
		Cor	p	Cor	p	Cor	p	Cor	p	Cor	p	Cor	p
CD8+T cell	CD8A	-0.036	4.65E − 01	-0.034	5.11E − 01	0.131	∗	0.125	1.50E − 02	-0.016	7.53E − 01	-0.022	6.73E − 01
CD8+T cell	CD8B	0.019	6.94E − 01	0.031	5.54E − 01	0.107	2.90E − 02	0.111	3.01E − 02	0.026	5.96E − 01	0.021	6.78E − 01
T cell (general)	CD3D	-0.017	7.24E − 01	0.002	9.74E − 01	0.210	∗∗∗	0.211	∗∗∗	0.086	8.07E − 02	0.098	5.72E − 02
	CD3E	-0.080	1.05E − 01	-0.065	2.06E − 01	0.145	∗	0.138	∗	-0.036	4.71E − 01	-0.032	5.32E − 01
	CD2	-0.050	3.06E − 01	-0.042	4.12E − 01	0.213	∗∗∗	0.209	∗∗∗	0.091	6.34E − 02	0.101	5.02E − 02
B cell	CD19	-0.187	^∗∗	-0.185	∗∗	0.125	1.11E − 02	0.097	5.97E − 02	-0.034	4.90E − 01	-0.035	4.95E − 01
B cell	CD79A	-0.216	^∗∗∗	-0.215	∗∗∗	0.109	2.65E − 02	0.087	8.97E − 02	-0.037	4.47E − 01	-0.034	5.15E − 01
Monocyte	CD86	-0.036	4.68E − 01	-0.027	5.95E − 01	0.216	∗∗∗	0.224	∗∗∗	0.173	∗∗	0.188	∗∗
Monocyte	CD115(CSF1R)	-0.245	^∗∗∗	-0.251	∗∗∗	0.156	∗	0.152	∗	0.029	5.53E − 01	0.034	5.04E − 01
TAM	CCL2	-0.174	^∗∗	-0.175	∗∗	0.103	3.66E − 02	0.110	3.21E − 02	-0.017	7.26E − 01	-0.012	8.23E − 01
	CD68	-0.093	5.90E − 02	-0.095	6.37E − 02	-0.013	7.89E − 01	-0.034	5.11E − 01	0.029	5.50E − 01	0.033	5.20E − 01
	IL10	-0.095	5.20E − 02	-0.085	9.84E − 02	0.172	∗∗	0.169	∗∗	0.113	2.19E − 02	0.104	4.38E − 02
M1 macrophage	INOS (NOS2)	0.128	^∗	0.122	1.79E − 02	-0.005	9.15E − 01	-0.003	9.55E − 01	0.057	2.50E − 01	0.036	4.86E − 01
	IRF5	-0.159	^∗	-0.162	∗	-0.009	8.57E − 01	-0.020	6.92E − 01	-0.069	1.59E − 01	-0.072	1.61E − 01
	COX2 (PTGS2)	-0.068	1.69E − 01	-0.066	1.99E − 01	0.102	3.71E − 02	0.114	2.67E − 02	0.093	5.92E − 02	0.111	3.11E − 02
M2 macrophage	CD163	-0.134	^∗	-0.137	∗	0.201	∗∗∗	0.206	∗∗∗	0.108	2.72E − 02	0.125	1.51E − 02
	VSIG4	-0.130	^∗	-0.140	∗	0.174	∗∗	0.179	∗∗	0.103	3.58E − 02	0.111	3.01E − 02
	MS4A4A	-0.182	^∗∗	-0.179	∗∗	0.227	∗∗∗	0.229	∗∗∗	0.140	∗	0.148	∗
Neutrophils	CD66b (CEACAM8)	0.056	2.58E − 01	0.057	2.70E − 01	0.189	∗∗	0.199	∗∗∗	0.280	∗∗∗	0.256	∗∗∗
	CD11b (ITGAM)	-0.217	^∗∗∗	-0.214	∗∗∗	0.143	∗	0.142	∗	0.028	5.76E − 01	0.039	4.54E − 01
	CCR7	-0.278	^∗∗∗	-0.273	∗∗∗	0.181	∗∗	0.180	∗∗	-0.005	9.13E − 01	-0.004	9.34E − 01
Natural killer cell	KIR2DL1	0.066	1.79E − 01	0.074	1.48E − 01	0.209	∗∗∗	0.219	∗∗∗	0.223	∗∗∗	0.201	∗∗∗
	KIR2DL3	0.047	3.38E − 01	0.054	2.97E − 01	0.296	∗∗∗	0.302	∗∗∗	0.323	∗∗∗	0.301	∗∗∗
	KIR2DL4	0.250	^∗∗∗	0.269	∗∗∗	0.148	∗	0.140	∗	0.178	∗∗	0.177	∗∗
	KIR3DL1	0.013	7.89E − 01	-0.007	8.89E − 01	0.159	∗	0.160	∗	0.138	∗	0.137	∗
	KIR3DL2	0.048	3.33E − 01	0.038	4.64E − 01	0.260	∗∗∗	0.264	∗∗∗	0.194	∗∗∗	0.173	∗∗
	KIR3DL3	0.114	1.98E − 02	0.116	2.36E − 02	0.082	9.49E − 02	0.070	1.71E − 01	0.171	∗∗	0.115	2.54E − 02
	KIR2DS4	0.086	8.05E − 02	0.096	6.09E − 02	0.189	∗∗	0.183	∗∗	0.166	∗∗	0.169	∗∗
Dendritic cell	HLA-DPB1	-0.125	1.07E − 02	-0.113	2.85E − 02	0.168	∗∗	0.165	∗	0.019	6.98E − 01	0.025	6.27E − 01
	HLA-DQB1	-0.035	4.77E − 01	-0.018	7.20E − 01	0.072	1.43E − 01	0.061	2.35E − 01	0.006	9.06E − 01	0.008	8.82E − 01
	HLA-DRA	-0.034	4.84E − 01	-0.017	7.35E − 01	0.187	∗∗	0.182	∗∗	0.079	1.06E − 01	0.090	7.98E − 02
	HLA-DPA1	-0.074	1.33E − 01	-0.060	2.43E − 01	0.166	∗∗	0.160	∗	0.052	2.90E − 01	0.057	2.70E − 01
	BCDA-1 (CD1C)	-0.394	^∗∗∗	-0.403	∗∗∗	0.185	∗∗	0.176	∗∗	0.000	9.92E − 01	0.000	9.98E − 01
	BDCA-4 (NRP1)	-0.296	^∗∗∗	-0.291	∗∗∗	0.193	∗∗∗	0.205	∗∗∗	0.015	7.64E − 01	0.029	5.72E − 01
	CD11c (ITGAX)	-0.140	^∗	-0.125	1.45E − 02	0.182	∗∗	0.181	∗∗	0.117	1.73E − 02	0.122	1.74E − 02
Th1	T-bet (TBX21)	-0.033	5.08E − 01	-0.034	5.08E − 01	0.136	∗	0.121	1.89E − 02	0.026	6.01E − 01	0.013	8.06E − 01
	STAT4	-0.172	^∗∗	-0.165	∗	0.286	∗∗∗	0.300	∗∗∗	0.134	∗	0.142	∗
	STAT1	0.245	^∗∗∗	0.244	∗∗∗	0.133	∗	0.121	1.88E − 02	0.127	∗	0.118	2.20E − 02
	IFN-γ (IFNG)	0.273	^∗∗∗	0.281	∗∗∗	0.171	∗∗	0.160	∗	0.174	∗∗	0.179	∗∗
	TNF-α (TNF)	0.026	5.92E − 01	0.036	4.90E − 01	0.006	8.96E − 01	-0.017	7.43E − 01	0.026	5.93E − 01	0.039	4.50E − 01
Th2	GATA3	-0.171	^∗∗	-0.160	∗	0.180	∗∗	0.188	∗∗	-0.004	9.35E − 01	-0.007	8.93E − 01
	STAT6	-0.206	^∗∗∗	-0.213	∗∗∗	0.014	7.78E − 01	0.012	8.21E − 01	-0.140	∗	-0.139	∗
	STAT5A	-0.201	^∗∗∗	-0.205	∗∗∗	0.170	∗∗	0.154	∗	-0.042	3.94E − 01	-0.042	4.12E − 01
	IL13	-0.003	9.57E − 01	-0.005	9.25E − 01	0.031	5.26E − 01	0.019	7.10E − 01	-0.041	4.04E − 01	-0.053	3.02E − 01
Tfh	BCL6	-0.371	^∗∗∗	-0.370	∗∗∗	0.157	∗	0.163	∗	-0.027	5.84E − 01	-0.012	8.19E − 01
Tfh	IL21	0.121	1.35E − 02	0.142	∗	0.193	∗∗∗	0.174	∗∗	0.160	∗	0.172	∗∗
Th17	STAT3	-0.231	^∗∗∗	-0.237	∗∗∗	0.114	1.99E − 02	0.104	4.22E − 02	-0.040	4.14E − 01	-0.035	4.97E − 01
Th17	IL17A	0.171	^∗∗	0.175	∗∗	-0.085	8.40E − 02	-0.112	2.90E − 02	0.051	3.01E − 01	0.056	2.73E − 01
Treg	FOXP3	0.012	8.00E − 01	0.022	6.74E − 01	0.035	4.75E − 01	0.017	7.36E − 01	-0.035	4.72E − 01	-0.047	3.61E − 01
	CCR8	-0.077	1.16E − 01	-0.080	1.20E − 01	0.182	∗∗	0.176	∗∗	0.124	1.14E − 02	0.125	1.51E − 02
	STAT5B	-0.362	^∗∗∗	-0.364	∗∗∗	0.156	∗	0.159	∗	-0.072	1.43E − 01	-0.072	1.64E − 01
	TGFβ (TGFB1)	-0.206	^∗∗∗	-0.192	^∗∗	0.042	3.96E − 01	0.042	4.12E − 01	-0.106	3.16E − 02	-0.104	4.22E − 02
T cell exhaustion	PD-1 (PDCD1)	0.061	2.17E − 01	0.072	1.63E − 01	0.058	2.39E − 01	0.042	4.19E − 01	-0.057	2.46E − 01	-0.069	1.82E − 01
	CTLA4	0.110	2.57E − 02	0.124	1.61E − 02	0.184	∗∗	0.177	∗∗	0.138	∗	0.147	∗
	LAG3	0.146	^∗	0.152	^∗	0.095	5.27E − 02	0.081	1.15E − 01	0.013	7.94E − 01	-0.001	9.82E − 01
	TIM-3 (HAVCR2)	-0.004	9.35E − 01	0.004	9.37E − 01	0.182	∗∗	0.181	∗∗	0.157	∗	0.158	∗
	GZMB	0.305	^∗∗∗	0.322	^∗∗∗	0.121	1.39E − 02	0.105	4.05E − 02	0.146	∗	0.147	∗

TAM: tumor-associated macrophage; Th: T helper cell; Tfh: follicular helper T cell; Treg: regulatory T cell. R value of Spearman's correlation coefficient; correlation with no modification; correlation after using the purity criterion. ^∗p < 0.01; ^∗∗p < 0.001; ^∗∗∗p < 0.0001.