Table 4.

Variable sites present in the ITS1 core of An. farauti Rabaul males (m) and females (f)

Nucleotide position		3	4	44	4	5	5	5	55	6	6	6	7	8	9	1	1	1	1	11	11	1	1	1	1	1	1
		9	1	22	6	4	4	4	88	3	8	9	4	2	8	0	0	0	1	11	11	2	2	2	3	3	3
		4	4	89	6	4	6	8	67	8	3	2	3	4	0	0	0	0	2	88	88	3	3	9	0	6	7
																1	2	6	6	56	78	5	6	4	6	1	3
Sex	Clone
m	A1	T	G	−	A	T	C	G	−	T	T	G	G	T	T	T	A	A	C	GT	GT	G	G	T	C	−	−
m	A2	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	..	..	.	.	.	.	−	−
m	B1	.	.	−	.	.	G	A	−	.	.	A	.	A	A	.	.	.	A	..	..	A	.	.	A	C	A
m	C1	.	.	CA	.	.	.	.	−	C	.	A	.	.	.	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	C	A
m	D1	.	.	−	.	.	.	.	AC	.	A	A	A	.	A	A	G	T	.	−	−	.	A	C	A	T	C
m	D2	C	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	.	.	.	.	.	−	−	.	.	.	A	−	−
m	E1	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	.	.	.	.	.	..	..	.	.	.	A	−	−
m	F1	.	.	−	.	.	.	.	AC	.	.	A	.	A	.	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	C	A
m	F2	.	A	CA	T	A	G	A	−	.	A	A	.	.	.	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	C	A
m	F3	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	.	.	.	.	.	..	..	.	.	.	A	−	−
m	F4	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	A	.	.	.	.	..	..	.	.	.	A	−	−
f	A1	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	.	.	.	.	.	.	..	..	.	.	.	.	−	−
f	A2	.	.	−	.	.	.	.	−	.	A	A	.	.	.	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	−	−
f	B1	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	.	.	.	.	.	..	..	.	.	.	A	−	−
f	B2	.	A	CA	T	.	.	.	−	C	.	A	.	.	.	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	C	A
f	C1	.	A	CA	T	A	G	A	−	.	A	A	A	.	A	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	−	−
f	C2	.	A	CA	T	A	G	A	−	.	A	A	A	A	A	.	.	.	.	..	−	.	A	C	A	−	−
f	D1	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	.	.	.	G	.	.	..	−	.	.	.	A	−	−
f	E1	.	.	CA	.	.	.	.	−	C	.	A	.	A	A	.	.	.	.	−	−	.	A	.	A	C	A
f	E2	.	.	−	.	.	G	A	−	.	.	A	.	A	A	.	.	.	A	..	..	A	.	.	A	C	A
f	F1	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	A	.	.	.	.	−	−	A	.	.	A	−	−
f	F2	.	.	−	.	.	.	.	−	.	.	A	.	A	A	.	.	.	.	..	..	.	.	.	A	−	−
									**			*			+	+	+	+							+	+	+

Note: Nucleotide and gap (−) positions are shown above each column, with nucleotides identical to the top sequence encoded by a dot. Putative sex-specific variants (*) and variants found in a repeat (+) are shown. Individuals are coded A to F for each sex, followed by the clone number. Nucleotide positions correspond to the ITS1 alignment