Table 1.
Primers for qPCR.
| HGNC Gene Symbol | Forward Primer | Reverse Primer |
|---|---|---|
| GAPDH | 5′-AGCCACATCGCTCAGACAC-3′ | 5′-GCCCAATACGACCAAATCC-3′ |
| HMGCS1 | 5′-TTGTGCCCGAAGGAGGAAAC-3′ | 5′-CTGGCCCAAGCCAATGGTAT-3′ |
| PTGS2 | 5′-CTGATGATTGCCCGACTCCC-3′ | 5′-CGCAGTTTACGCTGTCTAGC-3′ |
| GTPBP4 | 5′-GAAAATTACGGTGGTGCCGTC-3′ | 5′-GCCCCAGAGCCAACTTGTA-3′ |
| EGR1 | 5′-CCCCGACTACCTGTTTCCAC-3′ | 5′-TGGGTTTGATGAGCTGGGAC-3′ |
| DUSP1 | 5′- CAGAGCCCCATTACGACCTC-3′ | 5′-TTGGTCCCGAATGTGCTGAG-3′ |
| KRT34 | 5′-TCAGAAGCAAGTACCAGACGGA-3′ | 5′-CTGACTCCTGGTCTCGTTCAG-3′ |
| NRG1 | 5′-CTGGTGATCGCTGCCAAAAC-3′ | 5′-GTAGGCCACCACACACATGA-3′ |
| CLCA2 | 5′-ACTGTGGGCAACGACACTATG-3′ | 5′-TTCAGGGTGTAAGTCCAGTGC-3′ |
| END1 | 5′-CTGCCTTTTCTCCCCGTTAAA-3′ | 5′-GGACTGGGAGTGGGTTTCTC-3′ |
| OXTR | 5′-TCCTGTACCCATCCAGCGA-3′ | 5′-TCCGCAGGCGAACCTAAAG-3′ |
| NPR3 | 5′-CTGAGTACTCGCACCTCACG-3′ | 5′-TCACTGCTCGCACACATGAT-3′ |
| LIPG | 5′-AGTTGTGGTTGACTGGCTCC-3′ | 5′-TGTGATTGCTGTGATTCGGC-3′ |
| ACSF2 | 5′-TTCAGTTCCCAGTAGCTTCACT-3′ | 5′-CTCCTTGAGTTGGGCAAAGGT-3′ |
| LOXL4 | 5′-TCTGCGGATCACATGGACTG-3′ | 5′-AAAGTTGGCACATGCGTAGC-3′ |
| HAS2 | 5′-TCCCGGTGAGACAGATGAGT-3′ | 5′-GGCTGGGTCAAGCATAGTGT-3′ |
| COL1A2 | 5′-TGTGGATACGCGGACTTTGT-3′ | 5′-CAGCAAAGTTCCCACCGAGA-3′ |
| CYBRD1 | 5′-AGGGCATCGCTTCTTTCAGGTTT-3′ | 5′-ACGAAAACACCTTCTGGCGG-3′ |
| ADA | 5′-GGAACCAGGCTGAACTGGTC-3′ | 5′-GCCGCTCTGTCTTGAGTATGT-3′ |
| SOD2 | 5′-CTGTTGGTGTCCAAGGCTCA-3′ | 5′-GTAGTAAGCGTGCTCCCACA-3′ |
| PTGER4 | 5′-CGCTCGTGGTGCGAGTATT-3′ | 5′-GGGAGATGAAGGAGCGAGAGT-3′ |
| GPX4 | 5′-GCCTTTGCCGCCTACTGA-3′ | 5′-CTTGGCGGAAAACTCGTGC-3′ |
| HMOX1 | 5′-TGCGTTCCTGCTCAACATCC-3′ | 5′-AGTGTAAGGACCCATCGGAGA-3′ |
| TGFB1 | 5′-TGGACATCAACGGGTTCACT-3′ | 5′-GAAGTTGGCATGGTAGCCCT-3′ |
| IL6 | 5′-TCCTTCTCCACAAACATGTAACAA-3′ | 5′-TCACCAGGCAAGTCTCCTCA -3′ |
| APOE | 5′-GGGGCCTCTAGAAAGAGCTGG-3′ | 5′-TAATCCCAAAAGCGACCCAGT-3′ |
| MSMO1 | 5′-GGTTCCGAGGTTGGAACACCT-3′ | 5′-TTCAAATCTCTGCAGACAGCCT-3′ |
| KISS1 | 5′-CCACTTTGGGGAGCCATTAGA-3′ | 5′-CAGTTGTAGTTCGGCAGGTC-3′ |
| NFE2L2 | 5′-TTCGGCTACGTTTCAGTCAC-3′ | 5′-TGTCCTGTTGCATACCGTCT-3′ |
Gene ID numbers: GAPDH #2597; HMGCS1 #3157; PTGS2 #5743; GTPBP4 #23560; EGR1 #1958; DUSP1 #1843; KRT34 #3885; NRG1 #3084; CLCA2 #9635; END1 #55823; OXTR #5021; NPR3 #4883; LIPG #9388; ACSF2 #80221; LOXL4 #84171; HAS2 #3037; COL1A2 #1278; CYBRD1 #79901; ADA #100; SOD2 #6648; PTGER4 #5734; GPX4 #2879; HMOX2 #3162; TGFB1 #7040; IL6 #3569; APOE #348; MSMO1 #6307; KISS1 #3814; NFE2L2 #4780.