Table 7.

MMGBSA Average binding free energy based on trajectories

Ligand	EphB4 (apo) ΔGbind kcal/mol	With EphB2 (apo) ΔGbind kcal/mol)	EphB4 (ATP bound) ΔGbind (kcal/mol)	EphB2 (ATP bound) ΔGbind kcal/mol)
TNYLFSPNGPIA (original)	− 54.75	− 40.30	− 56.82	− 146.27
SNYLFSPNGPIA (mut1)	− 56.56	− 42.61	− 46.06	− 153.38
Gallate-SNYLFSPNGPIA	− 75.24	− 59.49	− 60.70	− 165.96
Gallate-TNYLFSPNGPIA	− 62.62	− 67.37	− 47.59	− 150.84
Sinapate-SNYLFSPNGPIA	− 73.98	− 94.1	− 69.27	− 163.478
Sinapate-TNYLFSPNGPIA	− 97.10	− 64.56	− 81.36	− 146.79
Coumarate-SNYLFSPNGPIA	− 55.59	− 59.02	− 53.54	− 143.99
Coumarate-TNYLFSPNGPIA	− 66.88	− 76.87	− 45.03	− 167.11