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. 2001 Oct;21(19):6429–6439. doi: 10.1128/MCB.21.19.6429-6439.2001

TABLE 1.

Results of random mutagenesis of the SNR6 TATA box

Allele no. TATAAATAa Growthb Fxn. +5c Total U6d
Δ42 -------- +++ 0 0.27
101 C------- +++
102 G------- +++
103 -C------ +++
104 -G------ +++
105 --A----- +++ 0
106 --C----- +++
107 --G----- +++
108 ---G---- +++
109 ----T--- +++ 0.05
110 -----G-- +++
111 -----T-- +++
112 A-----A- +++
113 CC------ +++
114 CT------ +++
115 G---T--- +++ 0.06
116 G------C +++
117 -G----C- +++
118 --AC---- +++
119 --AG---- +++
120 --A---A- +++ 0.04 0.20
121 --G-G--- +++ 0.19 0.28
122 ---C--C- ++ 0.08 0.21
123 ---G--C- +++
124 ---T-C-- +++ 0.2
125 ---CG--- ++ 0.44 0.14
126 ----T-A- +++
127 -----C-T +++
128 -----TG- +++
129 CC---G-- +++
130 -C-G--C- ++ 0.29 0.21
131 -T-CG--- + 0.54 0.11
132 ---CTC-- +++ 0
133 AG-TT--- + 0.38 0.16
134 AC---G-C ++ 0 0.19
135 -C--TTA- +++
136 GCGC---- +++ 0.4e
137 ----CCGC +++
138 GCGCCCGC 0.01
a

Wild-type TATA box, where dashes indicate no change. 

b

In combination with the Δ42 mutation; see Fig. 2A. 

c

Fraction (Fxn.) of U6 RNA that initiates at the +5 position. 

d

Fraction of the wild-type yield of U6 RNA. 

e

See Eschenlauer et al. (8).