| Table S13: Tiling path of RMP contigs aligned against P. falciparum chromosome 11. | ||||||||||||||
| P. berghei (Pb), P. c. chabaudi (Pc) and P. y. yoelii (Py) contigs were aligned against P. falciparum (Pf) chromosome 11 and | ||||||||||||||
| combined into composite rodent malaria parasite (cRMP) contigs. The cRMP contigs were further linked by physical linkage | ||||||||||||||
| and PCR to form cRMP scaffolds. The tables also show gaps in the alignment (black lines), synteny breakpoints (violet bars), | ||||||||||||||
| cRMP telomeres (white bars), predicted centromeres (plum/black bars) and intrasyntenic P. falciparum-specific genes | ||||||||||||||
| (grey bars, subgroups as described in Hall et al.). Contigs, physical groups or PCR groups flanking inter- or intrasyntenic regions | ||||||||||||||
| are printed in bold. Unaligned P. y. yoelii contigs grouped with 1 or more contigs aligned along this P. falciparum chromosome | ||||||||||||||
| could represent as yet unidentified cRMP-specific indels. Some of these could be pinned to the maps and the size of these | ||||||||||||||
| potential cRMP-specific indels and their gene content based on the P. y. yoelii annotation are listed in the last columns. | ||||||||||||||
| Column headings are as follows: | ||||||||||||||
| Pf chr.: P. falciparum chromosome to which the RMP contigs are aligned | ||||||||||||||
| (#: PROmer analysis from this study; JC# and TK#: Carlton et al.; man#: manual BLAST analysis; colours refer to those used in Fig. 2 of the paper); | ||||||||||||||
| Pb Pc Py contig: names of the aligned RMP contigs; | ||||||||||||||
| Size: size (bp) of the aligned RMP contigs (regions of homology are shown for contigs interrupted by inter- or intrasyntenic regions); | ||||||||||||||
| +/-: orientation of the aligned RMP contigs; | ||||||||||||||
| Start contig & End contig: estimated start & end coordinates of alignment of the RMP contigs | ||||||||||||||
| based on the coordinates of PROmer hits and the size and orientation of contigs, inter- and intrasyntenic regions; | ||||||||||||||
| cRMP contig size: size of cRMP contigs based on the corrected coordinates of alignment; | ||||||||||||||
| Gap size to next cRMP contig: size of gaps (or indels) between neighbouring cRMP contigs; | ||||||||||||||
| Start cRMP contig & End cRMP contig: estimated start & end coordinates of alignment of the cRMP contigs (or indels); | ||||||||||||||
| Phys. group (Py): physical linkage of neighbouring P. y. yoelii contigs; | ||||||||||||||
| PCR group (Py): neighbouring P. y. yoelii contigs were linked previously or for this study by PCR; | ||||||||||||||
| PCR size (Py): size of the PCR product; | ||||||||||||||
| Pf gene: some P. falciparum gene names including all intra- and intersyntenic genes and genes flanking breakpoints in synteny or subtelomere linked ends; | ||||||||||||||
| RMP gene: orthologues of the above-mentioned P. falciparum genes. | ||||||||||||||
| Pf chr. | Pb Pc Py contig | Size | +/- | Start contig | End contig | cRMP contig size | Gap size to next cRMP contig | Start cRMP contig | End cRMP contig | Phys. group (Py) | PCR group (Py) | PCR size (Py) | Pf gene | RMP gene |
| Telomere | ||||||||||||||
| man9 | MALPY01076 | 15313 | - | 119979 | 135292 | 119979 | ||||||||
| man9 | PcContig6373 | 4670 | - | 134935 | 139605 | |||||||||
| 9 | Pb.c001903622.Contig1 | 3036 | + | 136062 | 139098 | |||||||||
| 9 | MALPY02461 | 3455 | + | 136406 | 139861 | PF11_0043 | PY06972 | |||||||
| 9 | PbContig282 | 3572 | + | 139340 | 143792 | |||||||||
| 9 | PcContig400 | 8995 | - | 139656 | 150693 | |||||||||
| 9 | MALPY03131 | 1957 | - | 140185 | 143042 | 330B | ||||||||
| 9 | MALPY00242 | 13994 | - | 142424 | 157070 | 330B | ||||||||
| 9 | Pb.c000501114.Contig1 | 8488 | + | 144643 | 153197 | |||||||||
| 9 | MALPY03443 | 1425 | - | 145097 | 146449 | |||||||||
| 9 | MALPY03375 | 440 | + | 145793 | 146230 | |||||||||
| 9 | Pc.c000003022.Contig1 | 1296 | - | 150756 | 152052 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505125.Contig1 | 2195 | - | 152195 | 154390 | |||||||||
| 9 | PbContig105 | 10089 | + | 152948 | 163926 | |||||||||
| 9 | Pc.c001707781.Contig1 | 1341 | - | 154399 | 155725 | |||||||||
| 9 | MALPY00530 | 6491 | + | 157171 | 164315 | 330B | ||||||||
| 9 | Pc.c000002648.Contig1 | 1163 | - | 157291 | 158460 | |||||||||
| 9 | Pb.c000201280.Contig1 | 1525 | + | 164277 | 165775 | |||||||||
| 9 | MALPY03117 | 1164 | - | 164358 | 165489 | 330B | 315 | |||||||
| 9 | Pb.c001702304.Contig1 | 638 | - | 164980 | 165624 | |||||||||
| 9 | MALPY00380 | 4099 | - | 165539 | 170382 | 59 | 315 | 600 | ||||||
| 9 | Pb.c000901816.Contig1 | 2398 | - | 165614 | 167934 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505684.Contig1 | 906 | + | 165687 | 166581 | |||||||||
| 9 | Pb.c001201610.Contig2 | 7846 | - | 168890 | 176933 | |||||||||
| 9 | Pc.c001304813.Contig1 | 648 | + | 170133 | 170775 | |||||||||
| 9 | MALPY00655 | 4528 | - | 170323 | 174860 | 59 | ||||||||
| 9 | Pc.c000603041.Contig1 | 1795 | + | 171915 | 173713 | |||||||||
| 9 | Pc.c001003342.Contig1 | 9099 | - | 174061 | 183241 | |||||||||
| 9 | MALPY00654 | 11507 | - | 174222 | 185553 | 59 | ||||||||
| 9 | Pb.c001402126.Contig1 | 1531 | - | 176791 | 178316 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904408.Contig1 | 2507 | - | 180233 | 182749 | |||||||||
| 9 | MALPY03036 | 770 | + | 182089 | 182830 | 86 | ||||||||
| 9 | Pb.c001904944.Contig1 | 979 | - | 182761 | 183740 | |||||||||
| 9 | MALPY03536 | 850 | - | 183696 | 184546 | 86 | 1500 | |||||||
| 9 | Pc.c000502450.Contig3 | 6566 | - | 185269 | 191863 | |||||||||
| 9 | MALPY01093 | 11049 | - | 187141 | 199636 | 86 | 1500 | |||||||
| 9 | Pb.c000701511.Contig1 | 2698 | + | 188552 | 191250 | |||||||||
| 9 | Pb.c000701512.Contig1 | 4888 | + | 192832 | 197906 | |||||||||
| 9 | PcContig257 | 7685 | - | 194328 | 202877 | |||||||||
| 9 | Pb.c000701439.Contig1 | 4700 | + | 198488 | 203212 | |||||||||
| 9 | MALPY00656 | 7568 | - | 200389 | 208106 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505609.Contig1 | 819 | - | 202964 | 203786 | 88127 | 3426 | 208106 | ||||||
| 9 | MALPY00788 | 2989 | + | 211532 | 215289 | 211532 | 124 | |||||||
| 9 | Pc.c001103678.Contig1 | 4835 | - | 212781 | 217634 | 6102 | 1739 | 217634 | ||||||
| 9 | MALPY03125 | 712 | + | 219373 | 220079 | 219373 | 124 | 3300 | PF11_0061 | n.a. | ||||
| man9 | PcContig1235 | 1547 | - | 219407 | 221524 | |||||||||
| 9 | MALPY03119 | 577 | + | 219596 | 220173 | 72 | ||||||||
| man9 | MALPY02709 | 3012 | + | 220766 | 223778 | 30 | ||||||||
| 9 | Pc.c000002072.Contig3 | 3488 | - | 222999 | 226487 | |||||||||
| 9 | MALPY03023 | 1731 | - | 223362 | 225093 | 30 | 72 | 3100 | ||||||
| 9 | PbContig37 | 4099 | + | 223580 | 227679 | 8306 | 407 | 227679 | ||||||
| 9 | Pb.c001702707.Contig1 | 7644 | + | 228086 | 235730 | 228086 | ||||||||
| 9 | MALPY01115 | 12557 | - | 231656 | 246929 | 101 | ||||||||
| 9 | Pc.c001304182.Contig1 | 3316 | - | 232066 | 235382 | |||||||||
| 9 | Pb.c000801705.Contig1 | 4001 | + | 236761 | 240762 | |||||||||
| 9 | Pc.c000803385.Contig1 | 1884 | - | 236767 | 238651 | |||||||||
| 9 | Pc.c000302925.Contig1 | 2232 | + | 244117 | 246349 | |||||||||
| 9 | PbContig161 | 3457 | + | 244713 | 248171 | |||||||||
| 9 | MALPY03401 | 221 | + | 245811 | 246046 | 53 | ||||||||
| 9 | MALPY00971 | 17011 | - | 245989 | 263465 | 101 | 53 | 300 | PF11_0070 | n.a. | ||||
| 9 | Pc.c001707994.Contig1 | 2656 | - | 247103 | 249883 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402154.Contig1 | 2678 | + | 248335 | 251092 | |||||||||
| 9 | Pc.c001707823.Contig1 | 1194 | - | 250021 | 251215 | |||||||||
| 9 | Pb.c001001701.Contig1 | 3431 | + | 252614 | 256038 | |||||||||
| 9 | Pc.c001708184.Contig1 | 566 | + | 253594 | 254160 | |||||||||
| 9 | PcContig9 | 5366 | + | 255222 | 260646 | |||||||||
| 9 | Pb.c001702837.Contig1 | 4735 | - | 259481 | 264532 | |||||||||
| 9 | PcContig529 | 1225 | + | 260819 | 262075 | |||||||||
| 9 | Pc.c000603530.Contig1 | 916 | + | 262164 | 263353 | |||||||||
| 9 | MALPY03051 | 846 | + | 263323 | 264169 | 36446 | 105 | 264532 | 53 | 600 | ||||
| 9 | MALPY01885 | 4480 | + | 264637 | 269244 | 264637 | 53 | 900 | ||||||
| 9 | Pb.c001602413.Contig1 | 3103 | + | 266959 | 270062 | |||||||||
| 9 | Pc.c001405401.Contig1 | 1046 | - | 267999 | 269393 | 5425 | 670 | 270062 | ||||||
| 9 | MALPY02211 | 4529 | - | 270732 | 275279 | 270732 | 274 | 53 | 900 | |||||
| 9 | Pc.c000302877.Contig1 | 3328 | - | 274093 | 277834 | |||||||||
| 9 | Pb.c001101862.Contig1 | 4198 | + | 274741 | 279175 | |||||||||
| 9 | MALPY02178 | 3780 | - | 275398 | 279471 | 274 | ||||||||
| 9 | Pc.c000803715.Contig1 | 624 | + | 277398 | 278022 | |||||||||
| 9 | PcContig44 | 6470 | + | 277654 | 284748 | |||||||||
| 9 | Pb.c001101863.Contig1 | 5241 | + | 279115 | 284805 | |||||||||
| 9 | MALPY00779 | 5487 | + | 279406 | 284987 | 14255 | 198 | 284987 | 274 | PF11_0079 | PY02790 | |||
| 9 | MALPY00780 | 2095 | + | 285185 | 287289 | 2104 | 1372 | 285185 | 287289 | 274 | PF11_0079 | PY02791 | ||
| GAP | 619 | 287283 | 287902 | PF11_0080 | ||||||||||
| 9 | MALPY02869 | 2371 | - | 288661 | 291026 | 288661 | 281 | PF11_0524 | PY07662 | |||||
| 9 | Pb.c001402211.Contig1 | 2053 | - | 289234 | 291287 | |||||||||
| 9 | MALPY01063 | 12825 | - | 291249 | 303443 | 482A | 281 | 800 | ||||||
| 9 | Pb.c000401204.Contig1 | 8730 | - | 291257 | 299688 | |||||||||
| 9 | PcContig162 | 5348 | - | 298330 | 303672 | |||||||||
| 9 | Pb.c001001784.Contig1 | 2144 | - | 299632 | 301794 | 15011 | 429 | 303672 | ||||||
| 9 | MALPY01535 | 6192 | - | 304101 | 310356 | 304101 | 482A | 278 | ||||||
| 9 | Pc.c000302992.Contig1 | 4180 | - | 305210 | 309354 | |||||||||
| 9 | Pb.c001202127.Contig1 | 4692 | + | 305807 | 310526 | 6425 | 3550 | 310526 | ||||||
| 9 | MALPY01118 | 6189 | + | 314076 | 320514 | 314076 | 278 | 2800 | ||||||
| 9 | PbContig41 | 5618 | - | 315045 | 320645 | |||||||||
| 9 | Pc.c001103722.Contig1 | 1629 | - | 315513 | 317145 | 6569 | 1836 | 320645 | ||||||
| 9 | MALPY02808 | 4113 | + | 322481 | 326635 | 4154 | 221 | 322481 | 326635 | 259 | ||||
| 9 | MALPY02505 | 6155 | + | 326856 | 333468 | 326856 | 259 | 1000 | ||||||
| 9 | Pb.c001201667.Contig1 | 4614 | + | 326906 | 332009 | 6612 | 7283 | 333468 | ||||||
| 9 | MALPY01924 | 7439 | - | 340751 | 348406 | 340751 | 501 | 259 | 6500 | |||||
| 9 | Pc.c000703238.Contig1 | 2039 | - | 341375 | 343414 | |||||||||
| 9 | Pb.c000401198.Contig1 | 5675 | - | 342155 | 348118 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703776.Contig1 | 610 | - | 343394 | 344028 | |||||||||
| 9 | Pc.c000302336.Contig1 | 5238 | - | 344429 | 349673 | |||||||||
| 9 | Pb.c002005838.Contig1 | 3117 | - | 349017 | 352152 | |||||||||
| 9 | MALPY00967 | 4242 | - | 349108 | 353356 | 501 | ||||||||
| 9 | PcContig635 | 4049 | + | 350995 | 355044 | |||||||||
| 9 | MALPY00246 | 5342 | - | 354829 | 360458 | 501 | 254 | |||||||
| 9 | Pb.c000301152.Contig1 | 4341 | + | 355959 | 360694 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505392.Contig1 | 4211 | + | 356833 | 361441 | 20690 | 145 | 361441 | ||||||
| 9 | Pb.c000201519.Contig1 | 12008 | - | 361586 | 373470 | 361586 | ||||||||
| 9 | MALPY01585 | 6679 | + | 362411 | 368631 | 96 | 254 | 1500 | ||||||
| 9 | Pc.c001203838.Contig1 | 1606 | + | 364176 | 365964 | |||||||||
| 9 | MALPY03300 | 740 | + | 365627 | 366409 | |||||||||
| 9 | MALPY03314 | 1075 | - | 365759 | 366855 | |||||||||
| 9 | Pc.c001103826.Contig1 | 1432 | + | 366203 | 367643 | |||||||||
| 9 | Pc.c001811772.Contig1 | 804 | + | 367582 | 368386 | |||||||||
| 9 | MALPY02576 | 5420 | - | 368705 | 374086 | 12500 | 623 | 374086 | 96 | |||||
| 9 | Pb.c002006978.Contig1 | 3215 | - | 374709 | 378032 | 374709 | ||||||||
| 9 | MALPY00765 | 3683 | - | 375131 | 378841 | 96 | 99 | |||||||
| 9 | Pc.c000302922.Contig1 | 2815 | - | 376113 | 379025 | 4316 | 357 | 379025 | ||||||
| 9 | PcContig46 | 3415 | - | 379382 | 382806 | 379382 | ||||||||
| 9 | MALPY02308 | 4365 | + | 380092 | 385410 | 547 | 99 | 1400 | ||||||
| 9 | Pc.c001103736.Contig1.1 | 639 | - | 380357 | 381002 | |||||||||
| 9 | PcContig339 | 3341 | + | 383897 | 387253 | |||||||||
| 9 | Pb.c001001991.Contig1 | 1046 | + | 384504 | 385550 | |||||||||
| JC9 | MALPY00191 | 6526 | + | 384807 | 391348 | 11966 | 2577 | 391348 | 547 | |||||
| 9 | MALPY02362 | 2550 | + | 393925 | 396475 | 393925 | ||||||||
| 9 | Pb.c000101409.Contig1 | 2136 | + | 394640 | 396776 | 2851 | 591 | 396776 | ||||||
| 9 | PbContig12 | 2414 | + | 397367 | 399769 | 397367 | ||||||||
| 9 | Pc.c000803347.Contig1 | 1960 | - | 398010 | 399976 | |||||||||
| 9 | MALPY01090 | 9974 | - | 398022 | 409272 | PF11_0110 | PY03703 (exon2) | |||||||
| 9 | Pb.c000401216.Contig1 | 7834 | - | 401851 | 409821 | |||||||||
| 9 | Pc.c000803832.Contig1 | 1355 | - | 402609 | 404149 | |||||||||
| 9 | Pc.c000002716.Contig1 | 4855 | - | 404425 | 409557 | 12454 | 1088 | 409821 | ||||||
| 9 | MALPY00471 | 24558 | - | 410909 | 436789 | 410909 | 332 | |||||||
| 9 | PbContig286 | 8691 | - | 412033 | 421870 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703417.Contig1 | 3324 | - | 415940 | 419483 | |||||||||
| 9 | MALPY03342 | 1028 | - | 419210 | 420346 | 267 | ||||||||
| 9 | PcContig432 | 4406 | - | 419903 | 424492 | |||||||||
| 9 | PbContig142 | 8541 | - | 422684 | 431074 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703819.Contig1 | 1093 | - | 425698 | 426791 | |||||||||
| 9 | MALPY03489 | 253 | + | 426721 | 426974 | 267 | 6500 | |||||||
| 9 | Pc.c000703818.Contig1 | 756 | - | 426858 | 427617 | |||||||||
| 9 | Pc.c001606304.Contig1 | 1195 | - | 429348 | 430537 | |||||||||
| 9 | PcContig83 | 6520 | + | 431117 | 437884 | |||||||||
| 9 | PbContig100 | 7179 | - | 431425 | 438800 | |||||||||
| 9 | Pc.c001708772.Contig1 | 673 | - | 434025 | 434698 | |||||||||
| 9 | MALPY00747 | 4523 | - | 437260 | 441774 | 332 | 69 | |||||||
| 9 | Pb.c001702823.Contig1 | 1033 | - | 439843 | 440888 | 30865 | 2413 | 441774 | ||||||
| 9 | Pb.c000501106.Contig1 | 12895 | + | 444187 | 457884 | 444187 | PF11_0126 | PB108643.00.0 | ||||||
| 9 | MALPY01097 | 7107 | + | 445426 | 452782 | 197 | 69 | 4000 | ||||||
| 9 | PcContig528 | 2017 | - | 445938 | 448054 | |||||||||
| 9 | MALPY03096 | 370 | + | 447931 | 448301 | |||||||||
| 9 | Pc.c001303489.Contig3 | 2709 | - | 452016 | 454693 | |||||||||
| 9 | MALPY03169 | 1044 | - | 453254 | 454250 | 197 | 229 | |||||||
| 9 | Pc.c001304215.Contig1 | 1901 | - | 455196 | 457106 | 13697 | 944 | 457884 | ||||||
| man9 | Pb.c000201297.Contig1 | 4988 | + | 458828 | 469387 | 458828 | ||||||||
| JC9 | MALPY03285 | 753 | - | 459746 | 460499 | 229 | 1300 | |||||||
| 9 | MALPY01580 | 5037 | - | 460976 | 466049 | 229 | 350 | |||||||
| 9 | Pb.c001803898.Contig1 | 1274 | + | 464419 | 465687 | |||||||||
| 9 | MALPY01878 | 4378 | + | 465819 | 470197 | |||||||||
| 9 | Pc.c001002723.Contig1 | 6158 | + | 466029 | 472283 | |||||||||
| 9 | MALPY01413 | 2497 | + | 472283 | 474732 | |||||||||
| 9 | MALPY03033 | 745 | + | 474516 | 475264 | |||||||||
| 9 | Pc.c000903287.Contig1 | 2709 | - | 475047 | 478029 | |||||||||
| 9 | MALPY01751 | 15962 | + | 475110 | 490791 | 426 | PF11_0135 | n.a. | ||||||
| 9 | Pb.c002112907.Contig1 | 636 | + | 475964 | 476600 | |||||||||
| 9 | Pb.c001803374.Contig1 | 2076 | + | 476674 | 479038 | |||||||||
| 9 | MALPY03167 | 195 | - | 477504 | 477699 | |||||||||
| 9 | Pb.c001301846.Contig1 | 2672 | - | 483522 | 486206 | |||||||||
| 9 | MALPY01825 | 6364 | + | 490646 | 497010 | 426 | ||||||||
| 9 | Pb.c002112096.Contig1 | 2034 | - | 491978 | 494012 | 38182 | 1505 | 497010 | ||||||
| 9 | MALPY02352 | 6386 | - | 498515 | 505030 | 498515 | 299 | |||||||
| 9 | Pb.c001201983.Contig1 | 848 | + | 501549 | 502397 | |||||||||
| 9 | Pb.c000001343.Contig2 | 7187 | + | 502389 | 510819 | |||||||||
| 9 | Pc.c000803721.Contig1 | 5079 | - | 506243 | 511322 | |||||||||
| 9 | MALPY01787 | 6025 | + | 506276 | 512301 | 13786 | 1503 | 512301 | 299 | |||||
| 9 | MALPY01215 | 7064 | + | 513804 | 521062 | 513804 | 299 | PF11_0140 | PY04043 (exon1-2) | |||||
| 9 | Pb.c000301400.Contig1 | 2872 | - | 514736 | 517581 | |||||||||
| 9 | PcContig101 | 2529 | - | 515726 | 518252 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301346.Contig1 | 8508 | - | 517531 | 526165 | |||||||||
| 9 | PcContig8 | 3754 | - | 518743 | 522511 | |||||||||
| 9 | MALPY00196 | 30629 | - | 520976 | 551585 | 299 | ||||||||
| 9 | Pc.c001405169.Contig1 | 1275 | - | 522381 | 523632 | |||||||||
| 9 | Pc.c001303500.Contig2 | 4687 | - | 523992 | 528638 | |||||||||
| 9 | Pb.c001702797.Contig1 | 3275 | - | 526379 | 529323 | |||||||||
| 9 | Pb.c000201551.Contig1 | 4919 | - | 529443 | 534365 | |||||||||
| 9 | PcContig733 | 3134 | - | 531351 | 534476 | |||||||||
| 9 | Pb.c000101063.Contig1 | 8283 | + | 533543 | 542488 | |||||||||
| 9 | Pc.c000402713.Contig1 | 3324 | - | 535810 | 539646 | |||||||||
| 9 | Pc.c000602326.Contig2 | 4954 | + | 544313 | 549267 | |||||||||
| 9 | MALPY00826 | 6003 | - | 551453 | 557562 | 204 | ||||||||
| 9 | Pb.c001401702.Contig1 | 6786 | + | 552220 | 558923 | |||||||||
| 9 | Pc.c001605884.Contig1 | 564 | - | 553474 | 554038 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204447.Contig1 | 658 | + | 553779 | 554392 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204120.Contig1 | 3914 | - | 555110 | 559077 | |||||||||
| man9 | MALPY00211A | 6997 - 27430 | - | 557073 | 577890 | 204 | 47 | PF11_0160 | PY00784 | |||||
| man9 | PbContig10A | 1 - 17943 | + | 558648 | 577890 | |||||||||
| 9 | Pc.c001405274.Contig1 | 1013 | + | 565647 | 566756 | |||||||||
| 9 | Pc.c001404747.Contig1 | 1798 | + | 568165 | 569917 | |||||||||
| 9 | Pc.c001003700.Contig1 | 1280 | - | 575398 | 576751 | 64086 | 4052 | 577890 | ||||||
| Expanded | 1448 | 578864 | 580312 | PF11_0161 | ||||||||||
| man9 | MALPY00211B | 1 - 6315 | - | 581942 | 588896 | 581942 | 204 | 47 | PF11_0162 | PY00783 | ||||
| man9 | PbContig10B | 18831 - 25041 | + | 581942 | 588950 | |||||||||
| 9 | Pc.c001304222.Contig1 | 3970 | - | 585617 | 589447 | 7505 | 7104 | 589447 | ||||||
| Expanded | 5073 | 589744 | 594817 | PF11_0165 - PF11_0166 | ||||||||||
| 9 | MALPY00592 | 28459 | - | 596551 | 629022 | 596551 | 47 | 500 | ||||||
| 9 | Pb.c001802851.Contig1 | 2415 | - | 597596 | 600011 | |||||||||
| 9 | Pc.c001304159.Contig1 | 1873 | - | 597961 | 599903 | |||||||||
| 9 | PbContig124 | 2871 | + | 600142 | 603037 | |||||||||
| 9 | Pc.c000403319.Contig1 | 1523 | - | 601174 | 602667 | |||||||||
| 9 | Pb.c000601553.Contig1 | 3885 | + | 603673 | 608305 | |||||||||
| 9 | PcContig5 | 1983 | - | 603784 | 605767 | |||||||||
| 9 | Pc.c001203885.Contig1 | 2790 | - | 607792 | 610564 | |||||||||
| 9 | Pb.c002006861.Contig1 | 593 | + | 608657 | 609274 | |||||||||
| 9 | Pb.c002006862.Contig1 | 1651 | + | 609836 | 611574 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402106.Contig1 | 4420 | + | 613172 | 617628 | |||||||||
| 9 | Pb.c000501120.Contig1 | 6084 | - | 617702 | 624827 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505777.Contig1 | 421 | + | 622110 | 622531 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505709.Contig1 | 822 | + | 624599 | 625640 | |||||||||
| 9 | Pb.c000601221.Contig2 | 6420 | - | 624864 | 631755 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204464.Contig1 | 616 | + | 625683 | 626299 | |||||||||
| 9 | Pc.c000803777.Contig1 | 739 | - | 626436 | 627172 | |||||||||
| 9 | MALPY01700 | 9493 | - | 627655 | 637630 | |||||||||
| 9 | Pc.c000603502.Contig1 | 1346 | + | 627926 | 629284 | |||||||||
| 9 | PcContig627 | 3781 | + | 629031 | 632821 | |||||||||
| 9 | Pc.c001003439.Contig1 | 2436 | - | 633687 | 636120 | |||||||||
| 9 | PbContig86 | 3898 | + | 633750 | 637648 | 41097 | 3227 | 637648 | ||||||
| 9 | MALPY01152 | 5108 | + | 640875 | 645926 | 640875 | ||||||||
| 9 | Pc.c001812704.Contig1 | 734 | - | 645053 | 645796 | 5051 | 1322 | 645926 | ||||||
| 9 | MALPY01338 | 7525 | - | 647248 | 654513 | 647248 | 711 | |||||||
| 9 | Pc.c001003303.Contig1 | 3258 | - | 647982 | 650676 | |||||||||
| 9 | Pb.c002006801.Contig1 | 1505 | - | 649762 | 651288 | |||||||||
| 9 | PcContig353 | 1951 | - | 650557 | 652499 | 7265 | 967 | 654513 | ||||||
| 9 | MALPY02113 | 8813 | + | 655480 | 664706 | 655480 | 711 | |||||||
| 9 | Pb.c000301343.Contig1 | 8067 | + | 660737 | 669964 | |||||||||
| 9 | Pc.c000303524.Contig1 | 1571 | + | 662345 | 664518 | |||||||||
| 9 | PcContig147 | 7362 | + | 664740 | 672923 | |||||||||
| 9 | MALPY01280 | 4644 | - | 664875 | 669962 | 711 | 65 | |||||||
| man9 | MALPY01648A | 1 - 9887 | + | 670252 | 680895 | 157B | 65 | 1600 | PF11_0185 | PY05215 | ||||
| 9 | Pb.c002112134.Contig1 | 1442 | + | 671177 | 672586 | |||||||||
| 9 | Pc.c001304789.Contig1 | 620 | - | 672544 | 673332 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505838.Contig1 | 595 | + | 672590 | 673353 | |||||||||
| 9 | Pc.c000303404.Contig1 | 696 | + | 672648 | 673512 | |||||||||
| 9 | Pb.c000801700.Contig1 | 3740 | - | 672865 | 676992 | |||||||||
| 9 | MALPY03330 | 842 | + | 673019 | 673837 | 65 | 1200 | |||||||
| 9 | Pc.c000703343.Contig1 | 5026 | + | 673578 | 678859 | 25415 | 3954 | 680895 | ||||||
| Insert | 756 | 681474 | 682230 | PF11_0186 | ||||||||||
| 9 | Pb.c001702343.Contig2 | 5925 | + | 684849 | 689699 | 684849 | ||||||||
| 9 | Pc.c001304923.Contig1 | 1443 | + | 684849 | 684921 | |||||||||
| man9 | MALPY01648B | 10826 - 14663 | + | 684849 | 689231 | 157B | (65) | PF11_0187 | PY05216 | |||||
| 9 | PcContig47 | 3936 | + | 685003 | 689475 | 4850 | 782 | 689699 | ||||||
| 9 | MALPY01274 | 7299 | - | 690481 | 698702 | 690481 | 157B | 65 | 1400 | |||||
| 9 | Pc.c000402952.Contig1 | 4375 | - | 691645 | 696694 | |||||||||
| 9 | Pb.c001202318.Contig1 | 1082 | + | 692280 | 693419 | |||||||||
| 9 | Pb.c001102214.Contig1 | 1137 | + | 693680 | 694913 | |||||||||
| 9 | Pb.c000801735.Contig1 | 2603 | + | 695422 | 698258 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204528.Contig1 | 1074 | - | 697176 | 698250 | |||||||||
| man9 | MALPY01327 | 2262 | - | 698536 | 700798 | 345 | ||||||||
| 9 | Pb.c000301154.Contig2 | 10441 | + | 698751 | 708935 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505815.Contig1 | 1010 | - | 700458 | 701468 | |||||||||
| 9 | MALPY00243 | 10748 | + | 700916 | 711069 | 345 | 65 | 4300 | ||||||
| 9 | Pc.c000903728.Contig1 | 1631 | - | 701778 | 703424 | |||||||||
| 9 | PcContig757 | 4826 | - | 703062 | 707906 | |||||||||
| 9 | Pb.c000401503.Contig1 | 2446 | + | 711045 | 713675 | |||||||||
| 9 | PcContig306 | 2922 | - | 711656 | 714817 | |||||||||
| 9 | MALPY01437 | 13630 | + | 712218 | 726272 | 65 | 1700 | |||||||
| 9 | PcContig649 | 6188 | - | 717508 | 724129 | |||||||||
| 9 | Pb.c001001757.Contig1 | 5040 | - | 719362 | 724393 | |||||||||
| 9 | MALPY03065 | 267 | + | 723140 | 723404 | 35791 | 1899 | 726272 | 137 | |||||
| 9 | MALPY01916 | 2273 | + | 728171 | 730480 | 728171 | 388 | 137 | 1800 | |||||
| 9 | Pc.c001304263.Contig1 | 1772 | - | 730001 | 731986 | |||||||||
| 9 | MALPY01915 | 8344 | - | 730894 | 739918 | 388 | 137 | 1800 | ||||||
| 9 | Pb.c000801685.Contig1 | 6220 | - | 731457 | 738768 | |||||||||
| 9 | PcContig447 | 3783 | - | 733138 | 737085 | |||||||||
| 9 | Pc.c000403264.Contig1 | 2334 | - | 737235 | 739527 | 11747 | 2471 | 739918 | ||||||
| TK9 | MALPY01385 | 2409 | + | 742389 | 744386 | 1997 | 620 | 742389 | 744386 | 18 | PF11_0204 | PY04520 | ||
| No Seq. | 602 | 744468 | 745070 | PF11_0205 | ||||||||||
| 9 | PcContig507 | 6809 | + | 745006 | 752097 | 745006 | ||||||||
| 9 | MALPY00857 | 9655 | - | 747327 | 756895 | 18 | 137 | 4000 | PF11_0206 | PY03021 | ||||
| 9 | Pb.c000601543.Contig1 | 3859 | + | 748011 | 751858 | |||||||||
| 9 | Pb.c000901737.Contig1 | 7852 | - | 755352 | 763590 | |||||||||
| 9 | MALPY03008 | 1228 | - | 758586 | 759808 | 18 | ||||||||
| 9 | PcContig791 | 2135 | - | 758645 | 760851 | |||||||||
| 9 | MALPY03209 | 405 | + | 759731 | 760136 | 133 | ||||||||
| 9 | MALPY03082 | 1092 | - | 759786 | 760878 | 18 | ||||||||
| man9 | MALPY00240A | 1 - 4727 | + | 761195 | 766074 | 18 | 133 | 1800 | PF11_0210 | PY00890 | ||||
| man9 | Pc.c000202660.Contig1A | 5081 - 8025 | - | 762850 | 766074 | |||||||||
| 9 | Pb.c000701587.Contig1 | 3191 | - | 764225 | 766074 | 21068 | 4079 | 766074 | ||||||
| Insert | 1348 | 766866 | 768214 | PF11_0211 | ||||||||||
| man9 | MALPY00240AB | 5700 - 16868 | + | 770153 | 781410 | 770153 | 18 | 133 | 1800 | PF11_0212 | PY00891 | |||
| man9 | Pc.c000202660.Contig1B | 1 - 3485 | - | 770153 | 774384 | |||||||||
| 9 | Pb.c000701777.Contig1 | 890 | - | 770409 | 771299 | |||||||||
| 9 | Pb.c000801832.Contig1 | 3456 | - | 772216 | 775739 | 11257 | 2365 | 781410 | ||||||
| man9 | MALPY00553 | 2362 | - | 783775 | 786356 | 2581 | 702 | 783775 | 786356 | 1213 | PF11_0214 | n.a. | ||
| 9 | MALPY01041 | 11057 | + | 787058 | 798412 | 787058 | 1213 | 133 | 3000 | |||||
| 9 | PbContig7 | 3264 | + | 789619 | 793009 | |||||||||
| 9 | Pc.c001103109.Contig1 | 3049 | + | 789890 | 793134 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402170.Contig1 | 1501 | + | 795969 | 797452 | |||||||||
| 9 | Pc.c000303487.Contig1 | 1035 | - | 796587 | 797622 | |||||||||
| 9 | Pb.c001502063.Contig1 | 3392 | + | 797638 | 801016 | |||||||||
| 9 | MALPY02365 | 2284 | + | 798977 | 801264 | 14206 | 783 | 801264 | ||||||
| 9 | MALPY02632 | 3652 | - | 802047 | 805722 | 3675 | 1382 | 802047 | 805722 | 236 | ||||
| 9 | MALPY01178 | 5242 | - | 807104 | 812655 | 807104 | 580 | 236 | 1200 | |||||
| 9 | Pc.c001812313.Contig1 | 622 | - | 807411 | 808033 | |||||||||
| 9 | Pb.c000801708.Contig1 | 2716 | - | 807577 | 810600 | |||||||||
| 9 | Pc.c000603496.Contig1 | 857 | - | 808356 | 809315 | |||||||||
| 9 | Pc.c000503589.Contig1 | 711 | - | 809448 | 810165 | |||||||||
| 9 | Pc.c001203918.Contig1 | 1601 | - | 810772 | 812421 | |||||||||
| 9 | Pb.c000601601.Contig1 | 1979 | - | 811373 | 813397 | |||||||||
| TK9 | MALPY01345 | 2463 | + | 813125 | 815097 | 7993 | 1885 | 815097 | 580 | |||||
| 9 | MALPY02015 | 8423 | + | 816982 | 826272 | 816982 | 168 | PF11_0226 | PY06052 | |||||
| 9 | Pb.c000101378.Contig1 | 1259 | + | 817335 | 818624 | |||||||||
| 9 | Pb.c000101604.Contig1 | 1576 | + | 818843 | 820419 | |||||||||
| 9 | MALPY03081 | 126 | - | 819496 | 819622 | 9290 | 5670 | 826272 | 168 | 1400 | ||||
| Centromere | ||||||||||||||
| 9 | MALPY02459 | 7664 | - | 831942 | 839731 | 831942 | 424 | 168 | 2000 | PF11_0227 | PY06967 | |||
| 9 | Pb.c001402188.Contig1 | 3011 | + | 832086 | 835097 | |||||||||
| 9 | Pc.c000202733.Contig1 | 2947 | - | 832745 | 835909 | |||||||||
| 9 | Pc.c000203132.Contig1 | 1022 | - | 835799 | 836827 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904424.Contig1 | 1287 | + | 838139 | 839429 | |||||||||
| 9 | MALPY01802 | 3320 | - | 839434 | 842754 | 424 | ||||||||
| 9 | Pb.c001001725.Contig1 | 2981 | + | 839501 | 842482 | 10812 | 612 | 842754 | ||||||
| 9 | MALPY03041 | 921 | - | 843366 | 844305 | 939 | 1323 | 843366 | 844305 | |||||
| 9 | Pb.c001301890.Contig1 | 8858 | - | 845628 | 854527 | 845628 | ||||||||
| 9 | MALPY00923 | 14665 | - | 848444 | 864244 | 473 | ||||||||
| 9 | Pc.c000503451.Contig1 | 668 | - | 850527 | 851210 | |||||||||
| 9 | Pb.c001101841.Contig1 | 3462 | - | 855314 | 858952 | |||||||||
| 9 | Pc.c001404838.Contig1 | 3595 | + | 858030 | 861567 | |||||||||
| 9 | Pb.c000101384.Contig1 | 3843 | - | 858948 | 862956 | |||||||||
| 9 | Pb.c001803395.Contig1 | 2036 | - | 863036 | 865072 | |||||||||
| TK9 | MALPY02053 | 3104 | - | 864421 | 867465 | 21837 | 1224 | 867465 | 473 | |||||
| 9 | MALPY01286 | 6027 | + | 868689 | 874801 | 868689 | 473 | |||||||
| 9 | Pb.c001502085.Contig2 | 8081 | - | 868801 | 877086 | |||||||||
| 9 | Pc.c001813118.Contig1 | 2496 | - | 872915 | 875454 | |||||||||
| 9 | MALPY00022 | 20677 | - | 874991 | 897092 | 473 | ||||||||
| 9 | Pc.c001812187.Contig1 | 1703 | - | 876383 | 878059 | |||||||||
| 9 | MALPY03466 | 775 | - | 876444 | 877222 | |||||||||
| 9 | MALPY03527 | 502 | - | 876544 | 877049 | |||||||||
| 9 | Pb.c000201527.Contig1 | 7596 | - | 877130 | 884868 | |||||||||
| 9 | Pc.c001812431.Contig1 | 833 | - | 880499 | 881332 | |||||||||
| 9 | Pc.c001811707.Contig1 | 1848 | - | 881696 | 883496 | |||||||||
| 9 | PbContig201 | 12685 | - | 885972 | 899883 | |||||||||
| 9 | Pc.c001405283.Contig1 | 627 | + | 887178 | 887805 | |||||||||
| 9 | Pc.c001405284.Contig1 | 1608 | + | 887761 | 889738 | |||||||||
| 9 | MALPY03130 | 374 | - | 889986 | 890360 | 32 | ||||||||
| 9 | Pc.c000303426.Contig1 | 3156 | + | 890069 | 893261 | 31194 | 4700 | 899883 | ||||||
| 9 | MALPY00006 | 9214 | + | 904583 | 914832 | 904583 | 32 | 400 | ||||||
| 9 | Pb.c000401537.Contig1 | 2163 | + | 905475 | 907635 | |||||||||
| 9 | PcContig534 | 5018 | - | 906576 | 912708 | |||||||||
| 9 | Pb.c001001686.Contig1 | 5382 | + | 908665 | 914977 | 10394 | 491 | 914977 | ||||||
| 9 | Pc.c000903256.Contig1 | 2260 | - | 915468 | 917542 | 915468 | ||||||||
| 9 | MALPY02125 | 5481 | - | 915808 | 921618 | 32 | 350 | |||||||
| 9 | Pb.c001301734.Contig1 | 4851 | - | 915873 | 921177 | |||||||||
| 9 | Pc.c001304268.Contig1 | 1998 | - | 918390 | 920343 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703384.Contig1 | 2851 | - | 920526 | 923447 | |||||||||
| 9 | Pb.c001301918.Contig1 | 3095 | - | 921146 | 924227 | |||||||||
| 9 | MALPY01333 | 3755 | - | 921951 | 925680 | 84 | ||||||||
| 9 | Pb.c000100759.Contig1 | 13186 | - | 924881 | 938877 | |||||||||
| 9 | MALPY00386 | 5039 | + | 926270 | 931348 | 84 | ||||||||
| 9 | Pc.c000703302.Contig1 | 1866 | + | 927584 | 929525 | |||||||||
| 9 | MALPY00387 | 7358 | - | 932543 | 939390 | 84 | ||||||||
| 9 | Pc.c001606400.Contig1 | 854 | + | 933899 | 934759 | |||||||||
| 9 | Pc.c001002762.Contig2 | 3413 | + | 934814 | 937867 | 23922 | 214 | 939390 | ||||||
| 9 | Pc.c000302944.Contig1 | 3458 | + | 939604 | 943303 | 939604 | ||||||||
| 9 | MALPY00887 | 3021 | + | 939804 | 942887 | 84 | 231 | |||||||
| 9 | Pb.c001001813.Contig1 | 3531 | + | 940110 | 943592 | |||||||||
| 9 | MALPY03102 | 604 | - | 942732 | 943345 | 3988 | 1069 | 943592 | 231 | 750 | ||||
| 9 | MALPY02488 | 2091 | + | 944661 | 946878 | 944661 | 281 | 231 | 6500 | |||||
| 9 | Pb.c000201535.Contig1 | 2448 | + | 945337 | 948059 | |||||||||
| 9 | MALPY03084 | 983 | - | 946206 | 947233 | |||||||||
| 9 | Pc.c001707846.Contig1 | 831 | + | 946626 | 947457 | |||||||||
| 9 | MALPY03099 | 553 | - | 946977 | 947587 | |||||||||
| 9 | MALPY00305 | 5737 | - | 947140 | 953206 | 281 | 197 | |||||||
| 9 | PcContig550 | 4770 | - | 950955 | 956965 | 12304 | 696 | 956965 | ||||||
| JC9 | MALPY01659 | 3941 | + | 957661 | 961605 | 957661 | 197 | 4000 | ||||||
| 9 | Pc.c000602861.Contig1 | 3462 | + | 958752 | 962214 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904830.Contig1 | 753 | - | 961778 | 962497 | |||||||||
| 9 | MALPY00219 | 12207 | - | 961852 | 976798 | 219 | 197 | 1400 | ||||||
| 9 | Pc.c000903318.Contig1 | 4818 | + | 964425 | 971699 | |||||||||
| 9 | Pc.c000903368.Contig1 | 5448 | + | 974262 | 979710 | |||||||||
| 9 | Pb.c000101302.Contig1 | 5012 | - | 974520 | 979526 | |||||||||
| 9 | MALPY01017 | 7567 | + | 978903 | 986921 | 219 | ||||||||
| 9 | Pb.c001702336.Contig1 | 2328 | - | 980027 | 982369 | |||||||||
| 9 | Pc.c000802656.Contig1 | 6474 | - | 981056 | 987732 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301426.Contig1 | 2416 | + | 982586 | 985011 | |||||||||
| man9 | MALPY02754 | 2388 | - | 986113 | 988501 | 30840 | 535 | 988501 | 219 | |||||
| 9 | MALPY02239 | 6760 | - | 989036 | 996919 | 989036 | 219 | 92 | ||||||
| 9 | Pb.c002007800.Contig1 | 634 | + | 989492 | 990318 | |||||||||
| 9 | Pc.c001707794.Contig1 | 1142 | + | 990022 | 991287 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402177.Contig1 | 4646 | + | 990778 | 996417 | |||||||||
| 9 | Pc.c001707802.Contig1 | 1457 | + | 991435 | 992997 | |||||||||
| 9 | Pc.c000302983.Contig1 | 2432 | + | 994129 | 996639 | 7883 | 32 | 996919 | ||||||
| 9 | Pc.c000602916.Contig1 | 4294 | + | 996951 | 1001210 | 996951 | ||||||||
| 9 | Pb.c002007072.Contig1 | 1882 | + | 997313 | 999204 | |||||||||
| 9 | MALPY00078 | 11183 | + | 997604 | 1008894 | 265 | 92 | 1200 | ||||||
| 9 | Pb.c002007062.Contig1 | 1810 | + | 999138 | 1000927 | |||||||||
| 9 | Pb.c001702871.Contig1 | 1223 | - | 1001757 | 1002959 | |||||||||
| 9 | Pb.c001702921.Contig1 | 1346 | - | 1002854 | 1004089 | |||||||||
| 9 | Pc.c001606390.Contig1 | 1209 | + | 1003382 | 1004472 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904326.Contig1 | 3777 | - | 1004421 | 1008314 | |||||||||
| 9 | Pc.c000402246.Contig3 | 6365 | + | 1005669 | 1012840 | |||||||||
| 9 | MALPY03316 | 285 | - | 1006927 | 1007221 | 194 | ||||||||
| 9 | Pb.c000101292.Contig1 | 4948 | - | 1008863 | 1014183 | |||||||||
| 9 | MALPY02455 | 5273 | - | 1009024 | 1014669 | 265 | 194 | 2000 | ||||||
| 9 | Pc.c000703232.Contig1 | 1539 | + | 1012944 | 1014483 | |||||||||
| 9 | MALPY02197 | 5072 | - | 1013892 | 1018961 | 265 | ||||||||
| 9 | Pb.c001402085.Contig1 | 2231 | + | 1014973 | 1017258 | |||||||||
| 9 | Pc.c000903485.Contig1 | 2328 | + | 1015253 | 1017614 | |||||||||
| 9 | Pb.c000501453.Contig1 | 4186 | + | 1018113 | 1022324 | |||||||||
| 9 | Pc.c001104100.Contig1 | 2455 | + | 1019310 | 1021816 | |||||||||
| 9 | MALPY02785 | 2253 | + | 1019412 | 1021695 | 25373 | 2983 | 1022324 | 265 | 156 | ||||
| 9 | MALPY03077 | 228 | + | 1025307 | 1025526 | 219 | 3791 | 1025307 | 1025526 | 156 | 3000 | |||
| 9 | MALPY01946 | 4497 | + | 1029317 | 1033865 | 1029317 | 499 | 156 | 2200 | |||||
| 9 | Pc.c001103797.Contig1 | 1433 | - | 1031658 | 1033103 | 4548 | 362 | 1033865 | ||||||
| TK9 | MALPY01542 | 8505 | - | 1034227 | 1036515 | 2288 | 1469 | 1034227 | 1036515 | 499 | ||||
| 9 | Pc.c000402944.Contig1 | 1529 | - | 1037984 | 1039504 | 1520 | 4120 | 1037984 | 1039504 | |||||
| 9 | MALPY00584 | 10092 | - | 1043624 | 1053702 | 1043624 | 24 | |||||||
| 9 | Pb.c000201234.Contig1 | 2521 | + | 1045567 | 1048094 | |||||||||
| 9 | Pc.c000002554.Contig1 | 2177 | + | 1046742 | 1048898 | |||||||||
| 9 | Pb.c000901880.Contig1 | 3651 | + | 1048448 | 1052099 | |||||||||
| 9 | Pc.c000503501.Contig1 | 992 | + | 1050496 | 1051488 | |||||||||
| 9 | PcContig327 | 5943 | + | 1052921 | 1058852 | |||||||||
| 9 | MALPY01776 | 3377 | + | 1056045 | 1059395 | 24 | 1600 | |||||||
| 9 | Pb.c001302124.Contig1 | 1279 | - | 1056850 | 1058096 | |||||||||
| 9 | PbContig4 | 3973 | - | 1057847 | 1061874 | |||||||||
| 9 | MALPY01905 | 3989 | - | 1060274 | 1064109 | 20485 | 1440 | 1064109 | 24 | 2000 | ||||
| TK9 | MALPY01033 | 2767 | + | 1065549 | 1067789 | 2240 | 517 | 1065549 | 1067789 | 102 | ||||
| 9 | MALPY01032 | 9084 | + | 1068306 | 1077494 | 1068306 | 102 | 24 | 5000 | |||||
| 9 | Pb.c001302021.Contig1 | 6089 | - | 1068381 | 1074836 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204064.Contig1 | 1721 | - | 1068671 | 1070392 | |||||||||
| 9 | PcContig264 | 4531 | - | 1072354 | 1076855 | 9188 | 2026 | 1077494 | ||||||
| 9 | Pc.c001003886.Contig1 | 4912 | - | 1079520 | 1084636 | 1079520 | ||||||||
| 9 | MALPY00593 | 2804 | + | 1079814 | 1082606 | 102 | ||||||||
| 9 | Pb.c001402090.Contig1 | 2108 | - | 1080350 | 1082428 | |||||||||
| 9 | MALPY00762 | 11724 | + | 1083164 | 1094939 | |||||||||
| 9 | Pc.c000002104.Contig2 | 3436 | - | 1084726 | 1088156 | |||||||||
| 9 | Pb.c002006878.Contig1 | 2120 | + | 1084936 | 1086897 | |||||||||
| 9 | Pc.c000102673.Contig1 | 8644 | - | 1090435 | 1099906 | |||||||||
| 9 | Pb.c000501196.Contig1 | 6388 | + | 1091828 | 1098580 | |||||||||
| 9 | MALPY03160 | 922 | - | 1092172 | 1093094 | 325 | ||||||||
| 9 | MALPY01949 | 9951 | + | 1093751 | 1104033 | 122 | 325 | 1000 | ||||||
| 9 | Pb.c000801671.Contig1 | 6227 | + | 1098820 | 1105739 | |||||||||
| 9 | Pc.c001203899.Contig1 | 1616 | - | 1101914 | 1103530 | |||||||||
| 9 | MALPY03575 | 705 | + | 1102604 | 1103259 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703907.Contig1 | 928 | - | 1104239 | 1105167 | |||||||||
| 9 | MALPY01002 | 4579 | + | 1104641 | 1108758 | 122 | ||||||||
| 9 | Pc.c000703367.Contig1 | 1217 | - | 1104882 | 1106216 | |||||||||
| 9 | Pb.c000001773.Contig1 | 2302 | - | 1106003 | 1107763 | |||||||||
| 9 | MALPY01003 | 3957 | - | 1107685 | 1111642 | 32122 | 2470 | 1111642 | 122 | 119 | PF11_0298 | PY03470 | ||
| No Seq. | 672 | 1113512 | 1114184 | PF11_0299 | ||||||||||
| 9 | MALPY00801 | 2003 | + | 1114112 | 1116112 | 1114112 | 119 | 1500 | PF11_0300 | PY02856 | ||||
| 9 | Pb.c001301825.Contig1 | 1953 | + | 1115298 | 1117477 | |||||||||
| 9 | MALPY03059 | 215 | - | 1116370 | 1116585 | 119 | 500 | |||||||
| 9 | MALPY01556 | 9004 | - | 1117360 | 1126331 | 428 | 119 | 1400 | PF11_0301 | PY04977/PY04976 | ||||
| 9 | Pb.c001101558.Contig1 | 4672 | + | 1117595 | 1122288 | RMP Insert | PY04975//PY04972 | |||||||
| 9 | Pc.c000402910.Contig1 | 3737 | - | 1118661 | 1122372 | 6451 | hypothetical proteins | |||||||
| JC9 | MALPY00609 | 4444 | 428 | bp | PY02215/PY02216 | |||||||||
| 9 | MALPY02438 | 8937 | - | 1122880 | 1131677 | 119 | 3000 | hypothetical proteins | ||||||
| 9 | Pb.c000801822.Contig1 | 4084 | + | 1123190 | 1127339 | PF11_0302 | PY06924 | |||||||
| 9 | Pc.c000802664.Contig2 | 3052 | + | 1125086 | 1128197 | |||||||||
| 9 | Pb.c001803455.Contig1 | 3618 | + | 1127569 | 1130827 | |||||||||
| 9 | PcContig51 | 3826 | + | 1128484 | 1131983 | 17871 | 437 | 1131983 | ||||||
| 9 | MALPY01832 | 9192 | - | 1132420 | 1141291 | 1132420 | 119 | 1000 | ||||||
| 9 | Pb.c001702331.Contig1 | 3411 | + | 1135211 | 1138619 | |||||||||
| 9 | Pc.c000402782.Contig1 | 2855 | + | 1135345 | 1138188 | |||||||||
| 9 | Pc.c000503453.Contig1 | 918 | - | 1139216 | 1140047 | |||||||||
| 9 | Pb.c001301492.Contig2 | 5716 | - | 1140015 | 1145743 | |||||||||
| 9 | MALPY03301 | 1033 | + | 1142272 | 1143305 | 313 | 119 | 1200 | ||||||
| 9 | MALPY01632 | 7224 | + | 1143815 | 1151042 | 313 | 25 | |||||||
| 9 | Pc.c000603075.Contig1 | 1787 | + | 1145562 | 1147337 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904327.Contig1 | 1922 | - | 1146518 | 1148446 | 18622 | 1654 | 1151042 | ||||||
| 9 | MALPY00586 | 7757 | + | 1152696 | 1160627 | 1152696 | 199 | 25 | 1400 | |||||
| 9 | Pb.c001803313.Contig1 | 11925 | - | 1153257 | 1165623 | |||||||||
| 9 | Pc.c001404772.Contig1 | 2500 | - | 1160275 | 1162775 | |||||||||
| 9 | MALPY00181 | 16600 | - | 1160857 | 1178909 | 199 | ||||||||
| 9 | Pc.c000803322.Contig1 | 5672 | - | 1163134 | 1168770 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301445.Contig1 | 1138 | - | 1165800 | 1166902 | |||||||||
| 9 | PbContig55 | 7222 | - | 1169484 | 1177695 | |||||||||
| 9 | PcContig643 | 7103 | - | 1173004 | 1180380 | 27684 | 668 | 1180380 | ||||||
| 9 | MALPY02199 | 3082 | + | 1181048 | 1184094 | 1181048 | 13 | |||||||
| 9 | Pc.c001404685.Contig1 | 3486 | - | 1183749 | 1187233 | |||||||||
| 9 | Pb.c002005814.Contig1 | 3566 | + | 1183780 | 1187343 | |||||||||
| 9 | MALPY00307 | 7616 | + | 1184186 | 1191799 | 10751 | 3822 | 1191799 | 13 | 1200 | ||||
| 9 | MALPY02027 | 9474 | - | 1195621 | 1206570 | 1195621 | 263 | 13 | 3500 | |||||
| 9 | Pc.c000002687.Contig1 | 2756 | - | 1204834 | 1207605 | |||||||||
| TK9 | MALPY02611 | 2938 | - | 1206609 | 1209472 | 13851 | 12063 | 1209472 | 263 | PF11_0325 | PY07227 | |||
| Insert | 8291 | 1213434 | 1221725 | PF11_0326 | ||||||||||
| 9 | Pb.c001402059.Contig1 | 7218 | - | 1221535 | 1229810 | 1221535 | ||||||||
| 9 | MALPY01253 | 5143 | + | 1222515 | 1228717 | 13 | 4000 | PF11_0327 | PY04188 | |||||
| 9 | Pc.c000502426.Contig1 | 2458 | + | 1223742 | 1226434 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505080.Contig1 | 1432 | - | 1228388 | 1229817 | 8282 | 2749 | 1229817 | ||||||
| TK9 | MALPY02274 | 2691 | + | 1232566 | 1235191 | 2625 | 630 | 1232566 | 1235191 | 120 | ||||
| 9 | MALPY01066 | 10614 | - | 1235821 | 1246765 | 1235821 | 120 | 13 | 5000 | |||||
| 9 | Pb.c001001409.Contig3 | 5292 | + | 1236395 | 1241602 | |||||||||
| 9 | Pc.c000103097.Contig1 | 1162 | + | 1237733 | 1238907 | |||||||||
| 9 | PcContig705 | 6376 | + | 1238876 | 1245960 | |||||||||
| 9 | Pb.c001202132.Contig1 | 2955 | + | 1244314 | 1247423 | |||||||||
| 9 | MALPY03444 | 824 | + | 1245183 | 1246010 | 205 | ||||||||
| 9 | MALPY02633 | 2154 | + | 1245936 | 1248213 | 120 | 205 | 700 | ||||||
| 9 | Pc.c000803376.Contig1 | 4064 | - | 1245962 | 1250549 | |||||||||
| 9 | MALPY02590 | 6204 | - | 1249521 | 1256975 | 896 | 205 | 1400 | PF11_0333 | PY07196 | ||||
| 9 | Pc.c001606637.Contig1 | 614 | - | 1253860 | 1254474 | PY06646/PY06647 | ||||||||
| 9 | PcContig755 | 1800 | - | 1254461 | 1256261 | hypothetical proteins | ||||||||
| 9 | Pb.c000001711.Contig1 | 2864 | + | 1254615 | 1257479 | 21658 | 580 | 1257479 | PY06649 | |||||
| JC9 | MALPY02282 | 2436 | 896 | putative yir3 protein | ||||||||||
| JC9 | MALPY02284 | 2737 | 896 | RMP Insert? | PY07342/PY07343 | |||||||||
| JC9 | MALPY02677 | 3131 | 896 | putative yir4 protein/ | ||||||||||
| 9 | Pc.c001103850.Contig1 | 2172 | - | 1258059 | 1260315 | 2256 | 467 | 1258059 | 1260315 | hypothetical protein | ||||
| 9 | MALPY01963 | 9567 | - | 1260782 | 1271367 | 1260782 | 205 | 2800 | PF11_0334 | PY05954 | ||||
| 9 | Pb.c000401517.Contig1 | 1902 | + | 1262621 | 1264536 | |||||||||
| 9 | Pb.c002112205.Contig1 | 895 | - | 1265180 | 1266067 | |||||||||
| 9 | Pb.c000901434.Contig1 | 2793 | - | 1267476 | 1270260 | |||||||||
| 9 | Pc.c001203870.Contig1 | 1299 | + | 1270168 | 1271467 | |||||||||
| 9 | Pb.c000901783.Contig1 | 4418 | - | 1270528 | 1274946 | PF11_0340 | (PB100408.00.0) | |||||||
| 9 | MALPY00275 | 9444 | + | 1272299 | 1281826 | 773 | 205 | 1500 | PF11_0342 | PY01035 | ||||
| 9 | Pb.c001001715.Contig1 | 3952 | - | 1275942 | 1280054 | PY01036 | ||||||||
| 9 | PcContig145 | 3164 | - | 1277272 | 1280617 | 21044 | 2498 | 1281826 | hypothetical protein | |||||
| JC9 | MALPY00882 | 2224 | 773 | RMP Insert? | PY03105 | |||||||||
| 9 | MALPY00214 | 3841 | + | 1284324 | 1288162 | 1284324 | 205 | 1000 | hypothetical protein | |||||
| 9 | Pb.c001301913.Contig1 | 6440 | + | 1286185 | 1293295 | PF11_0343 | PY00797 | |||||||
| 9 | MALPY00425 | 4801 | + | 1290029 | 1294292 | 205 | 1700 | |||||||
| 9 | Pc.c001404757.Contig1 | 1128 | + | 1293061 | 1294189 | |||||||||
| 9 | Pb.c001502846.Contig1 | 951 | + | 1294233 | 1295184 | 10860 | 3259 | 1295184 | ||||||
| TK9 | MALPY00069 | 4733 | - | 1298443 | 1303224 | 1298443 | 910B | |||||||
| 9 | Pc.c000202797.Contig1 | 11236 | - | 1301894 | 1313393 | |||||||||
| 9 | Pb.c001702730.Contig1 | 4294 | + | 1305929 | 1310454 | |||||||||
| 9 | MALPY01681 | 8664 | - | 1306020 | 1314707 | 910B | 205 | 4500 | ||||||
| 9 | Pb.c001803670.Contig1 | 2093 | + | 1310783 | 1312861 | |||||||||
| 9 | Pb.c001802788.Contig1 | 1638 | - | 1311240 | 1312863 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402156.Contig1 | 2125 | - | 1312429 | 1314638 | |||||||||
| 9 | Pc.c000402788.Contig1 | 1531 | - | 1312961 | 1314525 | 16264 | 1001 | 1314707 | ||||||
| 9 | Pb.c001803362.Contig1 | 1838 | - | 1315708 | 1317546 | 1315708 | ||||||||
| 9 | PcContig465 | 1542 | - | 1315867 | 1317409 | |||||||||
| 9 | MALPY03291 | 1630 | + | 1316299 | 1317914 | |||||||||
| 9 | MALPY02466 | 5427 | - | 1316327 | 1321822 | 358 | 205 | 2000 | ||||||
| 9 | Pc.c001708477.Contig1 | 583 | - | 1317635 | 1318218 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301490.Contig1 | 936 | + | 1317765 | 1318701 | |||||||||
| 9 | PcContig65 | 1925 | - | 1318378 | 1320417 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301171.Contig2 | 7074 | + | 1318655 | 1325649 | |||||||||
| 9 | Pc.c001003371.Contig1 | 2786 | + | 1321009 | 1323804 | |||||||||
| 9 | MALPY00526 | 19188 | + | 1321768 | 1340944 | 358 | 261 | |||||||
| 9 | Pb.c001201698.Contig1 | 5503 | + | 1334435 | 1339929 | |||||||||
| 9 | Pc.c000202822.Contig1 | 4677 | + | 1336859 | 1341552 | 25844 | 1181 | 1341552 | ||||||
| man9 | Pb.c000501195.Contig2A | 4650 - 14799 | + | 1342733 | 1346307 | 1342733 | PF11_0356 | PB000424.02.0 | ||||||
| 9 | MALPY01868 | 3092 | - | 1343683 | 1346307 | 226 | 261 | 1500 | ||||||
| 9 | Pc.c001304296.Contig1 | 1412 | + | 1344939 | 1346307 | 3574 | 9968 | 1346307 | ||||||
| Insert | 5168 | 1347532 | 1352700 | PF11_0357 | ||||||||||
| 9 | MALPY01567 | 6363 | - | 1356275 | 1361470 | 1356275 | 226 | 326 | ||||||
| 9 | Pc.c000402780.Contig1 | 1575 | + | 1356275 | 1356929 | |||||||||
| man9 | Pb.c000501195.Contig2B | 1 - 3196 | + | 1356275 | 1368335 | PF11_0358 | PB000426.02.0 | |||||||
| 9 | MALPY03361 | 217 | + | 1356440 | 1356654 | 326 | 3000 | |||||||
| 9 | Pc.c000602849.Contig1 | 6229 | + | 1357109 | 1365089 | |||||||||
| 9 | MALPY03341 | 446 | - | 1357691 | 1358122 | |||||||||
| 9 | MALPY00132 | 7294 | + | 1363277 | 1370550 | 14275 | 326 | 1370550 | PF11_0361 | n.a. | ||||
| man9 | MALPY00553 | 10433 | - | 1370876 | 1380543 | 9667 | 2703 | 1370876 | 1380543 | PF11_0363 | PY01993 | |||
| GAP | 737 | 1381289 | 1382026 | PF11_0364 | ||||||||||
| 9 | PbContig259 | 8705 | - | 1383246 | 1392824 | 1383246 | PF11_0365 | PY03003 | ||||||
| 9 | MALPY00851 | 15028 | + | 1384059 | 1399323 | |||||||||
| 9 | MALPY02992 | 623 | + | 1384652 | 1385275 | |||||||||
| 9 | Pc.c001103701.Contig1 | 3218 | + | 1388272 | 1391472 | |||||||||
| 9 | Pc.c000102666.Contig1 | 1472 | + | 1392208 | 1393668 | |||||||||
| 9 | PbContig257 | 4851 | - | 1392405 | 1397175 | |||||||||
| 9 | Pc.c001811692.Contig1 | 1053 | + | 1394933 | 1395986 | |||||||||
| 9 | Pc.c001812284.Contig1 | 787 | + | 1396182 | 1396910 | 16077 | 1556 | 1399323 | ||||||
| 9 | MALPY00321 | 25736 | + | 1400879 | 1427067 | 1400879 | 347 | |||||||
| 9 | Pb.c001502024.Contig1.1 | 7517 | - | 1408870 | 1416263 | |||||||||
| 9 | PcContig585 | 7263 | - | 1417902 | 1425445 | |||||||||
| 9 | PbContig405 | 7316 | - | 1419125 | 1426700 | 26188 | 1115 | 1427067 | ||||||
| 9 | MALPY01993 | 8135 | + | 1428182 | 1436288 | 1428182 | 1348 | 347 | 700 | |||||
| 9 | Pc.c001505587.Contig1 | 617 | - | 1429699 | 1430327 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402091.Contig1 | 2251 | + | 1430645 | 1432829 | |||||||||
| 9 | Pc.c001812519.Contig1 | 901 | - | 1430651 | 1431446 | 8106 | 2199 | 1436288 | ||||||
| 9 | MALPY01872 | 13244 | + | 1438487 | 1451760 | 1438487 | 1348 | 265 | ||||||
| 9 | Pc.c000002109.Contig3 | 5936 | + | 1439570 | 1445506 | 13273 | 1082 | 1451760 | ||||||
| 9 | MALPY00319 | 17087 | - | 1452842 | 1470634 | 1452842 | 159 | 265 | 700 | |||||
| 9 | Pb.c000101348.Contig1 | 2905 | + | 1452973 | 1455935 | |||||||||
| 9 | Pc.c000503493.Contig1 | 1193 | - | 1454997 | 1456185 | |||||||||
| 9 | Pc.c000402840.Contig1 | 5065 | - | 1457098 | 1462467 | |||||||||
| 9 | PbContig160 | 7061 | + | 1458614 | 1464939 | |||||||||
| 9 | Pc.c001104336.Contig1.1 | 332 | - | 1463639 | 1463971 | |||||||||
| 9 | Pb.c001401800.Contig2 | 7425 | + | 1465769 | 1473795 | |||||||||
| 9 | Pc.c000002115.Contig2 | 4294 | + | 1466750 | 1471654 | |||||||||
| 9 | MALPY00670 | 8881 | - | 1469491 | 1479051 | 159 | ||||||||
| 9 | PcContig544 | 4424 | + | 1472208 | 1476650 | |||||||||
| 9 | Pb.c000901745.Contig1 | 1615 | + | 1474598 | 1476261 | 26209 | 737 | 1479051 | ||||||
| TK9 | MALPY01575 | 3974 | + | 1479788 | 1483310 | 3522 | 987 | 1479788 | 1483310 | 159 | ||||
| 9 | MALPY02179 | 11861 | - | 1484297 | 1497155 | 1484297 | 159 | 312 | ||||||
| 9 | Pb.c000401193.Contig1 | 5593 | + | 1490941 | 1496537 | |||||||||
| 9 | Pc.c001605948.Contig1 | 1965 | + | 1493894 | 1495862 | |||||||||
| 9 | PbContig99 | 6944 | - | 1496963 | 1504296 | |||||||||
| 9 | MALPY01360 | 4714 | - | 1497562 | 1502557 | 707 | 312 | 1400 | ||||||
| 9 | MALPY03264 | 640 | - | 1499059 | 1499690 | 202 | ||||||||
| 9 | Pc.c001405298.Contig1 | 995 | + | 1499144 | 1500139 | |||||||||
| 9 | Pc.c001405373.Contig1 | 983 | + | 1500280 | 1501524 | |||||||||
| 9 | Pc.c001813169.Contig1 | 774 | + | 1501516 | 1502290 | |||||||||
| 9 | MALPY01363 | 10072 | - | 1502802 | 1513630 | 707 | 202 | 3000 | ||||||
| 9 | MALPY03376 | 763 | - | 1503975 | 1504738 | 163 | ||||||||
| 9 | Pb.c000301447.Contig1 | 4809 | + | 1504308 | 1509843 | |||||||||
| JC9 | MALPY03221 | 766 | + | 1505464 | 1506233 | 163 | 1300 | |||||||
| 9 | Pc.c001304759.Contig1 | 626 | - | 1507972 | 1508514 | 29333 | 176 | 1513630 | ||||||
| 9 | MALPY02393 | 8445 | - | 1513806 | 1522692 | 1513806 | 45 | 163 | 6500 | |||||
| 9 | Pc.c001405208.Contig1 | 1630 | + | 1514041 | 1515671 | |||||||||
| 9 | Pb.c001502569.Contig1 | 3858 | - | 1514616 | 1518885 | |||||||||
| 9 | Pc.c000903914.Contig1 | 1010 | + | 1515693 | 1516703 | |||||||||
| 9 | Pc.c001606274.Contig1 | 674 | + | 1517135 | 1517772 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505160.Contig1 | 1194 | + | 1517804 | 1518995 | 8886 | 317 | 1522692 | ||||||
| TK9 | MALPY00750 | 4465 | - | 1523009 | 1527697 | 4688 | 1803 | 1523009 | 1527697 | 45 | ||||
| 9 | Pb.c001101518.Contig1 | 6552 | - | 1529500 | 1535973 | 1529500 | ||||||||
| 9 | MALPY02594 | 2859 | - | 1530162 | 1533044 | 6473 | 5664 | 1535973 | 163 | 6500 | ||||
| 9 | Pb.c001001649.Contig1 | 9895 | - | 1541637 | 1551652 | 1541637 | ||||||||
| 9 | MALPY01928 | 11069 | - | 1542010 | 1553196 | 163 | 4000 | |||||||
| 9 | PcContig119 | 3823 | + | 1547642 | 1551595 | |||||||||
| 9 | MALPY03544 | 794 | - | 1548035 | 1548856 | 5 | ||||||||
| 9 | Pb.c001301779.Contig1 | 4841 | - | 1552123 | 1557336 | |||||||||
| 9 | MALPY00208 | 8340 | - | 1553430 | 1562588 | 5 | 4300 | |||||||
| 9 | Pc.c001304778.Contig1 | 1070 | - | 1557360 | 1558331 | |||||||||
| 9 | Pb.c000801792.Contig1 | 4004 | - | 1557411 | 1561885 | |||||||||
| 9 | Pc.c001812240.Contig1 | 1002 | - | 1559744 | 1560749 | 20951 | 8604 | 1562588 | ||||||
| 9 | MALPY00570 | 12667 | + | 1571192 | 1583770 | 1571192 | 5 | 4300 | ||||||
| 9 | Pb.c000301467.Contig1 | 4507 | - | 1571529 | 1576473 | |||||||||
| 9 | Pc.c000402897.Contig1 | 1686 | + | 1572409 | 1574077 | |||||||||
| 9 | Pc.c001203861.Contig1 | 2415 | + | 1574245 | 1576959 | |||||||||
| 9 | Pb.c000401466.Contig1 | 8150 | + | 1577340 | 1585469 | |||||||||
| 9 | Pc.c001103718.Contig1 | 1901 | - | 1580106 | 1581986 | |||||||||
| 9 | PcContig376 | 6866 | - | 1581875 | 1589246 | |||||||||
| JC9 | MALPY03031 | 803 | + | 1585031 | 1585834 | 5 | 2100 | |||||||
| 9 | Pb.c000601501.Contig1 | 3667 | + | 1585603 | 1589535 | |||||||||
| 9 | MALPY01728 | 4226 | - | 1586134 | 1591140 | |||||||||
| 9 | MALPY00199 | 4880 | - | 1590851 | 1595789 | 88 | ||||||||
| 9 | PcContig561 | 3377 | - | 1591054 | 1594464 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301476.Contig1 | 4190 | + | 1591470 | 1595663 | |||||||||
| 9 | Pc.c000503099.Contig1 | 9776 | - | 1595674 | 1607090 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301372.Contig1 | 11870 | + | 1595715 | 1609593 | |||||||||
| 9 | MALPY03037 | 713 | + | 1595837 | 1596559 | 88 | 200 | |||||||
| 9 | MALPY00148 | 11338 | - | 1598146 | 1609962 | 356 | 88 | 1200 | ||||||
| 9 | PcContig516 | 1019 | - | 1607331 | 1608452 | |||||||||
| 9 | PcContig127 | 2913 | - | 1608639 | 1611709 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904920.Contig1 | 1218 | + | 1609893 | 1611087 | |||||||||
| 9 | MALPY01481 | 8945 | + | 1610330 | 1619272 | 48080 | 538 | 1619272 | 356 | 172 | PF11_0417 | PY04791 - PY04790 | ||
| TK9 | MALPY01357 | 3071 | - | 1619810 | 1622632 | 1619810 | 356 | |||||||
| 9 | Pb.c000401513.Contig1 | 7202 | - | 1621419 | 1628636 | |||||||||
| 9 | Pc.c001103046.Contig2 | 5437 | + | 1623059 | 1628496 | |||||||||
| 9 | MALPY01065 | 4760 | + | 1623721 | 1628493 | 8826 | 2485 | 1628636 | 172 | 4100 | ||||
| 9 | MALPY01773 | 6602 | - | 1631121 | 1638063 | 1631121 | 172 | 1700 | ||||||
| 9 | Pb.c001301889.Contig1 | 2860 | + | 1632458 | 1635648 | |||||||||
| 9 | PcContig422 | 2505 | + | 1632871 | 1635376 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204061.Contig1 | 5563 | + | 1635955 | 1641742 | |||||||||
| 9 | Pb.c001602469.Contig1 | 1998 | - | 1636166 | 1638257 | |||||||||
| 9 | Pb.c000301437.Contig1 | 2286 | - | 1638366 | 1640640 | 10621 | 8613 | 1641742 | ||||||
| 9 | Pb.c000301436.Contig1 | 7190 | + | 1650355 | 1657640 | 1650355 | ||||||||
| 9 | PcContig58 | 5635 | - | 1652368 | 1658193 | |||||||||
| 9 | MALPY03042 | 849 | - | 1653753 | 1654602 | 96 | ||||||||
| 9 | MALPY02097 | 3995 | + | 1654845 | 1658830 | 8475 | 4260 | 1658830 | 96 | 800 | PF11_0424 | PY06250 | ||
| No Seq. | 3147 | 1660531 | 1663678 | PF11_0425 - PF11_0426 | ||||||||||
| 9 | MALPY00254 | 2945 | + | 1663090 | 1666009 | 2919 | 332 | 1663090 | 1666009 | 96 | 4500 | PF11_0427 | PY00944 | |
| 9 | Pc.c001204021.Contig1 | 1389 | + | 1666341 | 1667730 | 1666341 | ||||||||
| 9 | MALPY00982 | 5770 | - | 1667583 | 1672843 | 96 | 1800 | |||||||
| 9 | Pc.c000101999.Contig1 | 3263 | + | 1668461 | 1671760 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402179.Contig1 | 1952 | - | 1668963 | 1670782 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402178.Contig1 | 718 | - | 1670865 | 1671574 | |||||||||
| 9 | Pb.c001101900.Contig1 | 2760 | + | 1671625 | 1674433 | |||||||||
| 9 | MALPY01028 | 10099 | + | 1672233 | 1683007 | 940 | 96 | 800 | ||||||
| 9 | Pc.c000903507.Contig1 | 1582 | + | 1675238 | 1676796 | |||||||||
| 9 | Pb.c001101543.Contig1 | 3763 | + | 1681040 | 1685098 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505622.Contig1 | 589 | + | 1682187 | 1682776 | |||||||||
| 9 | MALPY00767 | 4713 | + | 1683015 | 1687842 | 940 | 101 | |||||||
| 9 | Pc.c000603029.Contig1 | 3299 | + | 1683555 | 1686854 | 21501 | 730 | 1687842 | ||||||
| 9 | MALPY01761 | 10940 | + | 1688572 | 1700585 | 1688572 | 101 | 2000 | ||||||
| 9 | Pc.c000002575.Contig1 | 2943 | - | 1689575 | 1692518 | |||||||||
| 9 | Pb.c000101352.Contig1 | 2220 | + | 1690594 | 1692813 | |||||||||
| 9 | Pb.c000101559.Contig1 | 2850 | + | 1693077 | 1695927 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904335.Contig1 | 1444 | + | 1696529 | 1698009 | |||||||||
| 9 | Pb.c002007516.Contig1 | 2841 | + | 1699014 | 1701807 | 13235 | 950 | 1701807 | ||||||
| 9 | PbContig242 | 10666 | + | 1702757 | 1714043 | 1702757 | ||||||||
| 9 | MALPY01863 | 2725 | - | 1704113 | 1706725 | 101 | 4000 | |||||||
| 9 | Pc.c001505048.Contig1 | 1373 | + | 1704320 | 1705587 | |||||||||
| 9 | Pc.c000602350.Contig1 | 5279 | + | 1706543 | 1711816 | |||||||||
| 9 | MALPY03229 | 810 | - | 1707383 | 1708199 | 170 | ||||||||
| 9 | MALPY01228 | 5419 | + | 1708764 | 1714080 | 11323 | 1380 | 1714080 | 481 | 170 | 1000 | |||
| 9 | MALPY01227 | 2764 | + | 1715460 | 1718223 | 1715460 | 481 | |||||||
| 9 | Pb.c001502005.Contig1 | 3860 | - | 1715655 | 1719588 | |||||||||
| 9 | Pc.c001708959.Contig1 | 981 | - | 1717550 | 1718615 | 4128 | 5443 | 1719588 | ||||||
| 9 | MALPY00542 | 11949 | + | 1725031 | 1737940 | 1725031 | 162 | 9 | ||||||
| 9 | PcContig572 | 1926 | - | 1727053 | 1728979 | |||||||||
| 9 | Pb.c001301851.Contig1 | 4114 | - | 1727375 | 1731648 | |||||||||
| 9 | PcContig453 | 2295 | - | 1728929 | 1731227 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703911.Contig1 | 5410 | - | 1731889 | 1737769 | |||||||||
| 9 | Pb.c001502548.Contig1 | 1565 | - | 1732303 | 1734043 | |||||||||
| man9 | PbContig6164 | 2330 | + | 1737761 | 1742587 | 162 | ||||||||
| man9 | MALPY00719 | 3937 | - | 1740531 | 1744468 | 162 | ||||||||
| 9 | Pb.c001101908.Contig1 | 3553 | - | 1742878 | 1746416 | |||||||||
| 9 | MALPY00718 | 7385 | - | 1744405 | 1752411 | 162 | 9 | 4100 | ||||||
| 9 | PbContig15 | 7148 | - | 1746424 | 1754892 | |||||||||
| 9 | PcContig730 | 1826 | - | 1746578 | 1748407 | |||||||||
| 9 | PcContig300 | 6258 | - | 1748717 | 1756131 | |||||||||
| 9 | MALPY02454 | 4064 | + | 1752794 | 1756861 | 193 | ||||||||
| 9 | Pb.c001803389.Contig1 | 1741 | + | 1755906 | 1757895 | |||||||||
| 9 | Pc.c000903430.Contig1 | 1766 | - | 1756581 | 1758347 | 33316 | 775 | 1758347 | ||||||
| 9 | MALPY00083 | 8225 | - | 1759122 | 1767236 | 1759122 | 55 | 193 | 800 | |||||
| 9 | Pb.c000201531.Contig1 | 2710 | - | 1764351 | 1766986 | |||||||||
| 9 | PcContig343 | 2173 | - | 1765173 | 1767282 | 8160 | 50 | 1767282 | ||||||
| 9 | MALPY01001 | 3050 | + | 1767332 | 1770500 | 1767332 | 55 | |||||||
| 9 | Pb.c002113501.Contig1 | 791 | - | 1767628 | 1768437 | 3168 | 448 | 1770500 | ||||||
| 9 | MALPY00195 | 26275 | - | 1770948 | 1800450 | 1770948 | 55 | |||||||
| 9 | PcContig236 | 3694 | - | 1772249 | 1776181 | |||||||||
| 9 | PcContig589 | 5851 | - | 1776751 | 1782623 | |||||||||
| 9 | MALPY03546 | 849 | + | 1782925 | 1783774 | |||||||||
| 9 | Pb.c001803883.Contig1 | 1646 | + | 1782988 | 1784634 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204407.Contig1 | 904 | - | 1783008 | 1783912 | |||||||||
| 9 | Pc.c000803276.Contig1 | 4560 | - | 1787837 | 1792358 | |||||||||
| 9 | Pb.c001402137.Contig1 | 3744 | + | 1789300 | 1793053 | |||||||||
| 9 | Pb.c000401203.Contig1 | 7263 | + | 1793546 | 1800836 | |||||||||
| 9 | PcContig779 | 7519 | - | 1796164 | 1803712 | |||||||||
| 9 | MALPY02857 | 2939 | + | 1799255 | 1802194 | 32764 | 31 | 1803712 | 55 | |||||
| 9 | MALPY02230 | 4756 | - | 1803743 | 1808368 | 1803743 | 55 | |||||||
| 9 | Pb.c001904443.Contig1 | 2406 | - | 1804989 | 1807413 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505144.Contig1 | 2926 | - | 1806104 | 1809069 | |||||||||
| 9 | MALPY02631 | 2483 | - | 1807110 | 1809593 | 55 | 234 | |||||||
| 9 | Pb.c001602537.Contig1 | 1758 | - | 1807499 | 1809254 | 5850 | 260 | 1809593 | ||||||
| 9 | MALPY00714 | 13200 | + | 1809853 | 1822427 | 1809853 | 756 | 234 | 2500 | PF11_0471 | PY02596 - PY02597 | |||
| 9 | Pb.c001904492.Contig1 | 1992 | + | 1811217 | 1813212 | PF11_0472 | n.a. | |||||||
| 9 | Pc.c000803399.Contig1 | 1139 | - | 1811311 | 1812450 | |||||||||
| 9 | Pb.c002113027.Contig1 | 626 | + | 1814213 | 1814839 | |||||||||
| 9 | Pc.c000202696.Contig1 | 2924 | - | 1815919 | 1818831 | |||||||||
| 9 | Pb.c001502520.Contig1 | 3674 | + | 1817124 | 1820729 | |||||||||
| 9 | Pc.c001708671.Contig1 | 754 | - | 1818936 | 1819693 | 12574 | 582 | 1822427 | ||||||
| TK9 | MALPY01016 | 2916 | + | 1823009 | 1824364 | 1355 | 1230 | 1823009 | 1824364 | 756 | PF11_0473 | PY03510 | ||
| GAP | 737 | 1381289 | 1382026 | PF11_0474 - PF11_0475 | ||||||||||
| man9 | MALPY02860 | 2362 | + | 1825594 | 1827994 | 2400 | 2822 | 1825594 | 1827994 | PF11_0476 | PY07650 - PY07651 | |||
| 9 | MALPY01664 | 7839 | - | 1830816 | 1839011 | 1830816 | 4 | |||||||
| 9 | Pc.c001104083.Contig1 | 2390 | + | 1832778 | 1835121 | |||||||||
| 9 | Pb.c002006906.Contig1 | 1984 | - | 1833018 | 1835065 | |||||||||
| JC9 | MALPY03025 | 469 | + | 1834851 | 1835329 | |||||||||
| 9 | Pb.c001904377.Contig1 | 4815 | + | 1835781 | 1840622 | |||||||||
| 9 | PcContig654 | 2320 | - | 1836444 | 1838758 | |||||||||
| 9 | MALPY00868 | 11426 | - | 1838764 | 1851736 | 4 | 145 | |||||||
| 9 | Pb.c001702766.Contig1 | 3180 | + | 1841525 | 1844705 | |||||||||
| 9 | PcContig457 | 1269 | - | 1847766 | 1849035 | |||||||||
| 9 | PbContig390 | 4058 | + | 1848308 | 1852385 | 21569 | 1788 | 1852385 | ||||||
| 9 | MALPY00932 | 9721 | - | 1854173 | 1863824 | 1854173 | 46B | 145 | 2100 | |||||
| 9 | Pb.c001702888.Contig1 | 1468 | + | 1855278 | 1856740 | |||||||||
| 9 | Pb.c001301869.Contig1 | 2439 | + | 1861972 | 1864414 | |||||||||
| 9 | MALPY01173 | 4359 | + | 1862279 | 1866641 | 46B | ||||||||
| 9 | Pc.c000903245.Contig1 | 2636 | + | 1862722 | 1865361 | 12468 | 2006 | 1866641 | ||||||
| 9 | MALPY00664 | 11591 | + | 1868647 | 1880446 | 1868647 | 46B | |||||||
| 9 | Pb.c001101889.Contig1 | 5378 | - | 1870079 | 1875415 | |||||||||
| 9 | Pc.c000403369.Contig1 | 1513 | - | 1873924 | 1875437 | |||||||||
| 9 | Pc.c001204025.Contig1 | 1205 | - | 1875823 | 1877049 | |||||||||
| 9 | Pc.c000903884.Contig1 | 958 | - | 1877576 | 1878534 | 11799 | 1155 | 1880446 | ||||||
| 9 | Pb.c000701593.Contig1 | 2304 | + | 1881601 | 1884010 | 1881601 | ||||||||
| 9 | MALPY00663 | 10939 | - | 1881776 | 1892517 | 46B | ||||||||
| 9 | Pc.c001813365.Contig1 | 583 | + | 1882849 | 1883426 | |||||||||
| 9 | PbContig150 | 24068 | + | 1884641 | 1910511 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505122.Contig1 | 3338 | + | 1885015 | 1888564 | |||||||||
| 9 | Pc.c001708763.Contig1 | 608 | + | 1885347 | 1885955 | |||||||||
| 9 | MALPY01975 | 14166 | - | 1892799 | 1908627 | 46B | PF11_0488 | PY05975 | ||||||
| 9 | Pc.c000803792.Contig1 | 1024 | - | 1893429 | 1894443 | |||||||||
| 9 | PcContig474 | 997 | - | 1894415 | 1895412 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703973.Contig1 | 1522 | - | 1896185 | 1897698 | |||||||||
| 9 | Pc.c000703298.Contig1 | 1678 | - | 1897899 | 1899612 | |||||||||
| 9 | Pc.c001303495.Contig1 | 2209 | - | 1900603 | 1902812 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505025.Contig1 | 1144 | + | 1903330 | 1904481 | |||||||||
| 9 | PcContig382 | 2621 | + | 1905482 | 1908103 | |||||||||
| 9 | Pc.c001505400.Contig1 | 737 | + | 1908130 | 1908879 | |||||||||
| 9 | MALPY01537 | 15956 | + | 1908534 | 1924511 | 42910 | 1924511 | 46B | PF11_0488 | PY04928 | ||||
| JC4/9 | MALPY02465 | 3479 | 46A/B | |||||||||||
| JC4/9 | MALPY02599 | 3919 | 46A/B | |||||||||||
| Telomere | ||||||||||||||