GO term;pairs hcc;pairs liv;mean hcc;stdev hcc;mean liv;stdev liv
acute-phase response;1;0;0.15;0.366347549;0.3;0.732695097
aerobic respiration;0;1;0;0;0;0
amino acid metabolism;1;0;0.35;0.489360485;0.7;0.801314709
anti-apoptosis;0;2;0.5;1.100239208;1.05;0.944513241
antigen presentation, endogenous antigen;2;0;0;0;0;0
antigen presentation, exogenous antigen;28;8;0.1;0.307793506;0.1;0.307793506
antigen processing, endogenous antigen via MHC class I;2;0;0.05;0.223606798;0;0
antigen processing, exogenous antigen via MHC class II;28;8;0.1;0.307793506;0.1;0.307793506
antimicrobial humoral response (sensu Vertebrata);3;1;0.3;0.923380517;0.55;0.825577947
apoptosis;5;5;4.8;2.504732363;7.35;5.060424363
ATP synthesis coupled proton transport;6;7;0.2;0.410391341;0.15;0.366347549
biological_process unknown;14;6;15.4;5.985948458;17.2;6.074970219
blood coagulation;12;2;1.05;1.050062655;1.3;1.341640786
carbohydrate metabolism;2;1;2.45;2.235479461;4.15;3.498495917
cartilage condensation;1;0;0;0;0;0
cation transport;0;1;0.2;0.523148364;0.2;0.410391341
cell adhesion;17;3;7.8;1.935812083;11.4;5.557356433
cell cycle;10;5;2.2;2.238420496;2.3;2.202868943
cell cycle arrest;4;0;0.45;0.510417786;1.15;2.033275812
cell growth;1;2;0.3;0.571240571;0.35;0.587142949
cell motility;8;4;1.8;2.261811105;1.65;1.565247584
cell proliferation;12;2;9.45;4.98919886;10.1;5.310367219
cell surface receptor linked signal transduction;3;4;1.85;1.725200217;1.85;1.598519051
cell-cell signaling;3;1;1.85;1.225818738;2.8;3.381061808
cellular defense response;1;0;0.2;0.410391341;0.2;0.410391341
ceramide metabolism;0;1;0;0;0;0
chemotaxis;2;2;0.95;1.431782106;1.2;1.794729125
cholesterol biosynthesis;1;0;0.15;0.366347549;0.1;0.307793506
cholesterol metabolism;2;0;0.2;0.410391341;0.25;0.716350399
chromatin modification;2;0;0.6;0.88257995;0.4;0.820782682
chromatin remodeling;2;0;0.1;0.307793506;0.15;0.366347549
chromosome organization and biogenesis (sensu Eukarya);28;13;0.4;0.88257995;1.05;1.538112309
complement activation, classical pathway;6;2;0.25;0.550119604;0.05;0.223606798
CTP biosynthesis;1;0;0;0;0;0
cytokinesis;7;0;1.15;1.089422831;1;1.076055174
cytoskeleton organization and biogenesis;1;1;0.15;0.366347549;0.4;0.753937035
defense response;1;0;0.35;0.74515982;0.65;0.988086934
development;4;6;10.55;4.006245125;15.15;7.527318667
DNA repair;1;3;0.85;0.87509398;0.75;1.019545823
DNA replication;18;2;1.45;1.820208201;1.45;1.35627198
DNA replication initiation;2;0;0.05;0.223606798;0;0
electron transport;15;35;7.4;4.296877691;9;4.611199182
endocytosis;1;1;0.45;0.510417786;0.15;0.489360485
energy pathways;5;10;0.95;1.050062655;1.35;1.843195166
ER to Golgi transport;0;4;0.3;0.571240571;0.35;0.670820393
exocytosis;1;0;0.05;0.223606798;0.05;0.223606798
fatty acid biosynthesis;1;0;0.3;0.470162346;0.3;0.470162346
fatty acid metabolism;3;1;0.65;0.988086934;0.55;0.944513241
G1 phase of mitotic cell cycle;1;0;0;0;0;0
gluconeogenesis;1;0;0;0;0.05;0.223606798
glycine biosynthesis;1;0;0;0;0;0
glycolysis;1;2;0.15;0.489360485;0.1;0.307793506
G-protein coupled receptor protein signaling pathway;0;2;1.25;1.164157703;1.15;1.755442664
GTP biosynthesis;1;0;0;0;0;0
heart development;1;0;0.1;0.307793506;0;0
heterophilic cell adhesion;3;0;0.15;0.489360485;0.35;0.670820393
immune response;133;31;10.35;4.727021985;10.5;3.720497986
inactivation of MAPK;0;2;0;0;0.15;0.366347549
induction of apoptosis;1;3;1.3;1.128576187;1.4;1.465390194
inflammatory response;4;0;1.6;1.729009452;1.65;1.663066287
intracellular protein transport;23;57;18.1;7.752079517;20.3;8.297748585
intracellular signaling cascade;7;11;8.95;3.966637181;8.45;4.477722635
intra-Golgi transport;0;2;0.1;0.307793506;0.05;0.223606798
lipid metabolism;3;0;1.2;1.196486083;2.7;1.976173868
lipid transport;3;0;0.35;0.670820393;0.45;0.686332741
male gonad development;0;1;0;0;0;0
metabolism;33;10;9.45;3.363503812;8.95;4.019361039
microtubule-based movement;2;1;0;0;0.05;0.223606798
mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone;0;1;0;0;0.15;0.366347549
mitochondrial transport;0;1;0;0;0;0
mitosis;6;0;0.7;0.864504726;1;0.794719414
morphogenesis;0;1;0.45;0.944513241;0.5;0.688247202
mRNA processing;2;4;0.75;1.069923755;0.8;1.056309365
mRNA-nucleus export;0;1;0;0;0.05;0.223606798
muscle development;2;0;0.65;0.933302004;0.6;1.095445115
negative regulation of cell cycle;1;1;0.2;0.410391341;0.65;0.812727701
negative regulation of cell growth;0;1;0.3;0.470162346;0.15;0.366347549
negative regulation of cell proliferation;10;2;1.95;1.276302225;2.25;2.336776908
negative regulation of tyrosine phosphorylation of Stat3 protein;0;1;0;0;0;0
neurogenesis;2;3;1.45;1.099042646;2.55;2.064104241
N-linked glycosylation;0;2;0.45;0.944513241;0.45;0.604805319
nuclear mRNA splicing, via spliceosome;9;20;1.7;1.417930293;2;1.973508764
nucleoside triphosphate biosynthesis;1;0;0.05;0.223606798;0;0
nucleosome assembly;29;14;0.15;0.366347549;0.55;0.604805319
positive regulation of cell proliferation;4;1;0.7;0.656946685;0.95;1.145931017
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade;0;5;2.55;1.986136159;2.9;1.618966532
protein amino acid dephosphorylation;1;5;2.1;1.774082417;3.6;3.362330019
protein amino acid phosphorylation;31;21;37.7;8.808488729;43.15;14.64770505
protein biosynthesis;86;39;8.35;5.163383224;7.45;4.223680111
protein complex assembly;5;2;0.95;1.276302225;1.3;2.054520049
protein folding;0;1;0.65;0.812727701;0.4;0.753937035
proteolysis and peptidolysis;14;4;4.15;2.852053738;4.45;3.3478194
proton transport;6;7;0.3;0.470162346;0.1;0.307793506
Ras protein signal transduction;0;1;0;0;0.05;0.223606798
regulation of blood pressure;1;0;0.15;0.366347549;0.05;0.223606798
regulation of cell adhesion;0;1;0.15;0.366347549;0.15;0.366347549
regulation of cell cycle;3;8;2.35;1.496487115;2.65;2.30045762
regulation of cell differentiation;0;1;0;0;0.05;0.223606798
regulation of DNA replication;0;1;0.05;0.223606798;0;0
regulation of growth;0;1;0.05;0.223606798;0.05;0.223606798
regulation of mitosis;0;1;0;0;0;0
regulation of transcription;0;1;0.05;0.223606798;0.15;0.366347549
regulation of transcription from Pol II promoter;1;3;3.55;2.187885304;5.15;2.888725816
regulation of transcription, DNA-dependent;42;52;86.55;16.30135609;88.7;26.37203463
regulation of translation;0;3;0.2;0.695852374;0.2;0.410391341
regulation of translational initiation;2;1;0.05;0.223606798;0.25;0.444261658
regulation of Wnt receptor signaling pathway;0;1;0.05;0.223606798;0.1;0.447213595
response to organic substance;1;1;0.1;0.307793506;0.1;0.447213595
response to stress;0;1;0.75;0.910465468;0.55;0.944513241
response to wounding;1;0;0;0;0;0
Rho protein signal transduction;1;0;0.05;0.223606798;0.2;0.410391341
RNA processing;0;2;0.45;0.759154655;0.55;0.998683344
RNA splicing;6;34;2.25;1.517442447;2.65;1.843195166
second-messenger-mediated signaling;0;1;0.05;0.223606798;0;0
signal transduction;30;17;24.7;8.131161631;31.65;12.74558747
small GTPase mediated signal transduction;4;5;1.35;1.460893742;1.15;1.268027893
sodium ion transport;1;0;0.1;0.307793506;0.15;0.366347549
transcription;2;2;1.55;1.234376041;1.5;2.013114895
transcription from Pol II promoter;1;1;0.2;0.410391341;0.75;1.118033989
transport;2;4;4.45;2.502104377;3.95;2.742933505
ubiquitin cycle;1;10;2.05;1.538112309;2.3;2.735728518
ubiquitin-dependent protein catabolism;1;4;0.8;1.00524938;0.35;0.489360485
UTP biosynthesis;1;0;0.05;0.223606798;0;0