Supplementary material for Overbeek et al. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96(6), 2896-2901.

Pyrimidine Biosynthesis

Possible functional coupling between ORFs

View complete organism names

Functional Couplings 

AA 

DR 

CY 

PG 

ST 

PN 

BS 

CA 

EF 

ML 

MT 

NG 

NM 

PA 

EC 

YP 

AG 

TH 

PF 

PH 

SS 

6.3.5.5 pyrAA

--- 

--- 

-

 

-

 

-

 

--- 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

--- 

--- 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

--- 

-

 

6.3.5.5 pyrAB

-

 

--- 

--- 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

--- 

--- 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

--- 

-

 

2.1.3.2 pyrB

-

 

-

 

--- 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

-

 

--- 

-

 

-

 

--- 

2.1.3.2 pyrI

--- 

--- 

--- 

-

 

--- 

--- 

--- 

-

 

--- 

--- 

--- 

-

 

-

 

--- 

-

 

-

 

-

 

--- 

-

 

-

 

--- 

3.5.2.3 pyrC

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

-

 

--- 

-

 

-

 

-

 

--- 

--- 

-

 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

4.1.1.23 pyrF

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

-

 

--- 

--- 

-

 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

PYRIMIDINE OPERON 
REGULATORY PROTEIN 
PYRR 

--- 

-

 

-

 

--- 

--- 

-

 

-

 

--- 

-

 

--- 

-

 

--- 

--- 

-

 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 

--- 


Connection Matrix at 0.4 Clustering 

6.3.5.5 

6.3.5.5(2) 

2.1.3.2 

2.1.3.2(2) 

3.5.2.3 

4.1.1.23 

PYRIMIDINE 


OPERON REGULATORY 
PROTEIN PYRR 

6.3.5.5 

--- 

20.5 

1.63 

0.76 

0.02 

1.46 

6.3.5.5(2) 

20.5 

--- 

3.00 

0.76 

0.02 

1.23 

2.1.3.2 

1.63 

3.00 

--- 

10.8 

2.55 

0.43 

3.17 

2.1.3.2(2) 

10.8 

--- 

3.5.2.3 

0.76 

0.76 

2.55 

--- 

1.50 

4.1.1.23 

0.02 

0.02 

0.43 

--- 

PYRIMIDINE OPERON 
REGULATORY PROTEIN 
PYRR 

1.46 

1.23 

3.17 

1.50 

---