Supplemental Table 4.  European/Amerindian SNP AIMs with Minimum 50Kb InterMarker Distance. [This Table contains the composite data for the subset of EUR/AMI SNP AIMs with a minimum intermarker distance of 50 kb that were derived from the entire SNP set in Supplemental Table 1 (see text for details).]															
rs number	old rs number	Fst EUR/AMI	Chr	bp position	cM deCODE	Source	Allele 1	Allele 2	Strand	Fst EUR/Pima	Fst EUR/Mayan	Fst Pima/Mayan	EUR Frequency	AMI Frequency	Pima Frequency	Mayan Frequency	MAM Frequency	Reduced Set
rs6685064		0.81	1	1251215	2.07	317K	A	G	plus	0.81	0.83	-0.02	0.07	0.85	0.83	0.88	0.46	1
rs819980		0.51	1	1510967	2.29	317K	A	G	minus	0.45	0.61	0.02	0.91	0.43	0.50	0.35	0.67	1
rs2055204		0.32	1	2312823	2.94	317K	A	G	plus	0.34	0.27	0.04	0.52	0.97	1.00	0.94	0.81	1
rs3100865		0.41	1	2829264	3.36	317K	A	C	minus	0.47	0.35	0.02	0.73	0.21	0.15	0.27	0.42	1
rs2455144		0.33	1	3237889	3.70	317K	A	G	plus	0.31	0.29	0.00	0.46	0.01	0.00	0.02	0.29	1
rs4648505		0.31	1	3428453	3.85	317K	A	G	plus	0.36	0.28	-0.01	0.84	0.47	0.43	0.50	0.79	
rs6424090		0.59	1	3651834	4.13	100K	A	G	plus	0.62	0.66	-0.02	0.04	0.49	0.48	0.50	N.D.	1
rs2027548		0.50	1	3762669	4.45	317K	A	G	plus	0.52	0.59	-0.02	0.04	0.42	0.38	0.46	0.25	1
rs4654482		0.52	1	3921116	4.92	317K	A	G	minus	0.46	0.59	0.02	0.84	0.28	0.35	0.21	0.50	1
rs4391636		0.51	1	4041057	5.27	Perlegen	C	T	plus	0.47	0.36	0.02	0.48	0.00	0.00	0.02	N.D.	1
rs4654424		0.56	1	4191831	5.71	317K	A	G	plus	0.56	0.53	-0.01	0.74	0.08	0.07	0.10	0.63	1
rs1495239		0.54	1	4280447	5.97	317K	A	G	minus	0.54	0.61	-0.01	0.09	0.60	0.57	0.64	0.30	1
rs670296		0.34	1	4487343	6.55	317K	A	G	plus	0.32	0.32	-0.02	0.56	0.09	0.09	0.08	0.44	
rs1157688		0.45	1	4547140	6.69	317K	A	G	plus	0.41	0.48	-0.01	0.25	0.80	0.76	0.83	0.42	1
rs2071999		0.57	1	4683639	7.02	100K	A	C	plus	0.58	0.52	0.03	0.73	0.05	0.02	0.09	N.D.	1
rs6669905		0.41	1	4913086	7.67	317K	A	G	minus	0.39	0.37	0.00	0.46	0.99	1.00	0.98	0.69	1
rs1878774		0.36	1	5176875	8.33	Perlegen	A	G	plus	0.33	0.30	-0.01	0.49	0.91	0.90	0.91	N.D.	1
rs11260657		0.48	1	5416652	8.83	317K	A	G	plus	0.54	0.47	-0.01	0.11	0.60	0.63	0.56	0.38	1
rs973978		0.44	1	5657642	9.35	Perlegen, 100K	A	G	plus	0.44	0.35	0.00	0.63	0.12	0.11	0.16	N.D.	1
rs3789559		0.61	1	6039375	10.27	100K	A	G	plus	0.70	0.73	-0.03	0.01	0.33	0.33	0.31	N.D.	1
rs200454		0.56	1	6640140	11.91	100K	C	G	plus	0.56	0.54	-0.02	0.18	0.79	0.80	0.78	ND	1
rs429383		0.48	1	6695527	11.98	100K	A	G	plus	0.53	0.41	0.02	0.19	0.73	0.78	0.66	ND	1
rs4908427		0.55	1	6910492	12.09	317K	A	G	minus	0.53	0.60	0.00	0.86	0.29	0.33	0.25	0.60	1
rs1616122		0.55	1	7455851	13.30	Perlegen	C	T	plus	0.53	0.39	0.04	0.45	0.98	0.99	0.95	ND	
rs1193167		0.40	1	7524714	13.52	317K	A	G	minus	0.41	0.35	0.00	0.62	0.10	0.07	0.13	0.40	
rs161827		0.79	1	7916300	13.75	100K	C	T	plus	0.78	0.89	0.04	0.02	0.61	0.54	0.72	ND	1
rs4908736		0.64	1	8121477	13.91	317K	A	G	plus	0.59	0.70	0.04	0.86	0.19	0.26	0.13	0.58	1
rs389709		0.33	1	8254311	14.09	317K	A	G	minus	0.33	0.33	-0.02	0.79	0.37	0.37	0.38	0.75	
rs1751681		0.41	1	9067322	15.16	317K	A	G	minus	0.37	0.41	-0.02	0.61	0.07	0.09	0.05	0.39	1
rs1569422		0.33	1	9321710	15.49	317K	A	G	plus	0.30	0.40	-0.02	0.90	0.56	0.60	0.52	0.83	
rs12569008		0.38	1	9729985	15.94	317K	A	G	minus	0.34	0.50	0.01	0.05	0.36	0.30	0.42	0.25	
rs12128766		0.45	1	9871307	16.09	Perlegen	C	T	plus	0.42	0.31	0.02	0.57	1.00	1.00	0.98	ND	1
rs2128416		0.61	1	10634714	17.09	317K	A	G	minus	0.59	0.65	0.00	0.88	0.27	0.30	0.23	0.48	1
rs205488		0.62	1	10761401	17.54	317K	A	G	plus	0.65	0.60	-0.02	0.13	0.78	0.80	0.75	0.46	1
rs2982384		0.60	1	11336011	19.58	Perlegen	A	G	plus	0.56	0.45	0.02	0.57	0.00	0.00	0.02	ND	1
rs4427416		0.53	1	12049957	21.30	317K	A	G	minus	0.51	0.51	-0.02	0.67	0.02	0.02	0.02	0.29	1
rs3765337		0.45	1	12276865	21.33	317K	A	C	minus	0.59	0.43	0.01	0.96	0.58	0.52	0.65	0.69	
rs10492976		0.48	1	12393063	21.51	100K	A	G	plus	0.58	0.36	0.04	0.07	0.49	0.56	0.38	ND	1
rs6541030		0.64	1	12542444	21.75	317K	A	G	minus	0.71	0.66	-0.02	0.06	0.63	0.65	0.60	0.31	1
rs3013047		0.60	1	13575883	23.72	317K	A	G	plus	0.61	0.58	-0.02	0.19	0.85	0.87	0.83	0.52	1
rs760911		0.62	1	13963744	24.45	317K	A	G	minus	0.57	0.67	0.01	0.12	0.75	0.70	0.81	0.31	1
rs7414562		0.41	1	14105086	24.71	317K	A	G	plus	0.40	0.38	0.00	0.46	0.99	1.00	0.98	0.73	1
rs10754916		0.81	1	14339333	25.21	317K	A	G	plus	0.83	0.80	0.00	0.08	0.90	0.93	0.88	0.50	1
rs820671		0.63	1	14437577	25.44	317K	A	G	minus	0.69	0.61	-0.01	0.09	0.69	0.74	0.65	0.38	1
rs12733612		0.47	1	14571335	25.76	317K	A	G	minus	0.42	0.53	0.01	0.19	0.73	0.67	0.79	0.42	
rs732469		0.67	1	14838868	26.52	317K	A	G	minus	0.73	0.67	-0.01	0.93	0.30	0.26	0.33	0.67	1
rs2801178		0.52	1	14953518	26.97	317K	A	C	minus	0.50	0.53	-0.02	0.22	0.82	0.80	0.83	0.46	1
rs2253372		0.49	1	15469339	28.01	100K	A	G	plus	0.44	0.53	0.02	0.26	0.85	0.80	0.91	ND	1
rs1763613		0.33	1	16077215	29.09	317K	A	C	plus	0.42	0.27	0.02	0.16	0.57	0.63	0.50	0.31	1
rs1136348		0.43	1	16406733	29.68	317K	A	G	minus	0.35	0.54	0.03	0.17	0.68	0.59	0.76	0.63	1
rs10888046		0.56	1	17724424	32.08	317K	A	G	minus	0.57	0.52	0.02	0.72	0.05	0.02	0.08	0.44	1
rs597865		0.63	1	17957536	32.55	317K	A	G	plus	0.63	0.65	-0.02	0.14	0.80	0.78	0.81	0.57	1
rs1192586		0.48	1	18020204	32.68	317K	A	G	minus	0.51	0.43	0.01	0.72	0.13	0.09	0.17	0.25	1
rs11260965		0.54	1	18310707	33.57	Perlegen	C	G	plus	0.55	0.77	0.01	1.00	0.42	0.45	0.34	ND	1
rs1577608		0.32	1	18453708	34.19	317K	A	G	minus	0.33	0.40	-0.02	0.06	0.35	0.33	0.38	0.25	1
rs2236815		0.43	1	18795252	35.80	317K	A	G	plus	0.44	0.39	0.00	0.37	0.93	0.96	0.90	0.73	1
rs992660		0.43	1	19006547	37.24	317K	A	G	plus	0.40	0.42	-0.02	0.37	0.93	0.91	0.94	0.71	1
rs1009806		0.29	1	19245857	37.38	317K	A	G	minus	0.30	0.28	-0.02	0.71	0.29	0.28	0.30	0.44	
rs2273046		0.42	1	19311602	37.39	317K	A	G	plus	0.42	0.43	-0.02	0.79	0.28	0.28	0.27	0.42	1
rs1567102		0.39	1	20189779	38.61	317K	A	G	minus	0.31	0.53	0.04	0.08	0.46	0.37	0.54	0.33	1
rs4654848		0.53	1	20360901	38.99	Perlegen	A	G	plus	0.50	0.43	-0.01	0.59	0.05	0.05	0.05	ND	1
rs10799660		0.44	1	20760991	39.41	317K	A	G	plus	0.49	0.41	-0.01	0.16	0.66	0.70	0.63	0.44	1
rs6667242		0.36	1	21571872	40.32	317K	A	G	minus	0.51	0.26	0.05	0.90	0.53	0.43	0.63	0.71	
rs3767132		0.43	1	21752027	40.67	317K	A	G	plus	0.40	0.48	-0.01	0.16	0.65	0.61	0.69	0.35	
rs12117402		0.44	1	21925854	40.77	100K	C	T	plus	0.38	0.53	0.02	0.83	0.33	0.39	0.25	ND	1
rs10917067		0.41	1	22010599	40.82	Perlegen	A	G	plus	0.38	0.42	0.00	0.65	0.16	0.17	0.12	ND	
rs12042083		0.52	1	22218038	40.94	100K	A	G	plus	0.50	0.57	-0.02	0.18	0.76	0.73	0.80	ND	1
rs1316342		0.49	1	22425823	41.06	317K	A	C	plus	0.57	0.43	0.01	0.87	0.35	0.28	0.43	0.85	1
rs209724		0.43	1	22585767	41.15	100K	A	G	plus	0.45	0.37	0.01	0.36	0.92	0.95	0.88	ND	
rs882025		0.42	1	22795658	41.76	317K	A	G	minus	0.43	0.37	0.04	0.42	0.97	1.00	0.94	0.71	1
rs6670405		0.52	1	22934429	42.22	100K	C	T	plus	0.54	0.51	-0.03	0.12	0.64	0.66	0.63	ND	1
rs3753250		0.58	1	23415076	42.85	100K	C	T	plus	0.61	0.53	0.00	0.81	0.16	0.13	0.22	ND	1
rs1317329		0.46	1	23712143	43.02	317K	A	G	plus	0.54	0.38	0.05	0.21	0.75	0.83	0.67	0.58	
rs17184658		0.51	1	24275552	43.70	Perlegen	C	G	plus	0.49	0.35	0.05	0.49	0.01	0.00	0.03	ND	1
rs2272935		0.42	1	24530699	44.00	317K	A	G	plus	0.45	0.39	-0.01	0.25	0.78	0.80	0.75	0.58	
rs12058910		0.39	1	25078570	44.55	317K	A	G	minus	0.49	0.40	-0.01	0.05	0.38	0.41	0.35	0.13	
rs6692950		0.54	1	25192431	44.59	100K	A	G	plus	0.55	0.51	-0.01	0.24	0.88	0.90	0.84	ND	1
rs7543232		0.66	1	25612902	44.79	100K	A	G	plus	0.75	0.77	-0.02	0.01	0.38	0.38	0.38	ND	1
rs3819033		0.67	1	26192435	45.24	100K	C	T	plus	0.69	0.68	-0.03	0.91	0.26	0.25	0.28	ND	1
rs17162110		0.35	1	26407139	45.45	Perlegen	C	T	plus	0.35	0.51	0.00	0.04	0.47	0.45	0.52	ND	
rs11247594		0.67	1	26751559	45.87	317K	A	G	minus	0.68	0.63	0.04	0.21	0.97	1.00	0.94	0.56	1
rs12125221		0.55	1	27102059	46.37	317K	A	G	minus	0.63	0.56	-0.01	0.07	0.58	0.61	0.54	0.42	1
rs3813795		0.55	1	27363939	46.48	317K	A	G	minus	0.54	0.52	0.00	0.32	0.99	1.00	0.98	0.73	
rs11247770		0.43	1	28324035	47.16	Perlegen	A	G	plus	0.45	0.30	0.02	0.61	0.11	0.09	0.17	ND	
rs528265		0.46	1	28928511	47.64	Perlegen	C	T	plus	0.48	0.33	0.02	0.62	0.11	0.08	0.16	ND	1
rs2230678		0.40	1	29295957	47.94	317K	A	G	plus	0.37	0.44	-0.01	0.83	0.38	0.41	0.35	0.48	
rs9426415		0.49	1	29444843	48.06	Perlegen	C	T	plus	0.50	0.60	-0.01	0.93	0.37	0.38	0.34	ND	1
rs1359465		0.44	1	29576682	48.16	317K	A	G	plus	0.41	0.42	-0.02	0.38	0.94	0.93	0.94	0.58	1
rs746758		0.41	1	30205804	49.01	Perlegen	C	T	plus	0.41	0.27	0.02	0.51	0.95	0.96	0.91	ND	1
rs12035857		0.72	1	30409586	49.31	317K	A	G	minus	0.74	0.73	-0.02	0.92	0.22	0.22	0.23	0.69	1
rs642696		0.57	1	30547456	49.43	317K	A	G	minus	0.56	0.58	-0.02	0.82	0.18	0.20	0.17	0.31	1
rs10915128		0.39	1	30625505	49.77	317K	A	G	minus	0.40	0.34	0.04	0.45	0.97	1.00	0.94	0.67	
rs1188441		0.58	1	30839330	50.69	317K	A	G	plus	0.61	0.52	0.03	0.79	0.14	0.09	0.20	0.50	1
rs3862892		0.36	1	31858087	51.98	317K	A	G	plus	0.36	0.32	0.02	0.49	0.98	1.00	0.96	0.69	
rs626502		0.43	1	32056585	52.19	Perlegen	G	T	plus	0.42	0.29	0.01	0.52	0.96	0.97	0.93	ND	1
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rs484959		0.40	1	110078125	130.40	317K	A	G	minus	0.41	0.35	0.04	0.44	0.97	1.00	0.94	0.65	1
rs10494113		0.45	1	110396329	130.78	317K	A	G	plus	0.42	0.43	0.00	0.43	1.00	1.00	1.00	0.74	1
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rs7545852		0.69	1	163120049	166.84	Perlegen	A	G	plus	0.68	0.59	0.00	0.26	0.95	0.96	0.93	ND	1
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rs2041741		0.45	2	10464894	26.80	317K	A	G	minus	0.49	0.55	-0.01	0.03	0.37	0.35	0.40	0.27	1
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rs10495594		0.60	2	12280997	31.46	317K	A	G	minus	0.67	0.59	0.00	0.08	0.63	0.67	0.58	0.29	1
rs4669862		0.46	2	12671050	32.56	317K	A	G	plus	0.59	0.39	0.03	0.08	0.52	0.61	0.44	0.25	1
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rs6753194		0.54	2	39308108	64.14	317K	A	G	minus	0.56	0.57	-0.03	0.09	0.61	0.61	0.61	0.35	
rs1468902		0.47	2	39432405	64.23	100K	A	G	plus	0.48	0.52	-0.03	0.92	0.51	0.52	0.50	ND	
rs10170617		0.49	2	39552544	64.32	317K	A	G	minus	0.49	0.55	-0.02	0.09	0.55	0.52	0.58	0.29	
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rs1048783		0.54	2	207482659	204.38	317K	A	G	minus	0.54	0.51	-0.02	0.71	0.06	0.05	0.07	0.41	1
rs1990810		0.51	2	207723383	204.64	317K	A	G	minus	0.58	0.48	-0.01	0.12	0.65	0.70	0.60	0.38	1
rs1263625		0.42	2	207803139	204.72	317K	A	G	plus	0.52	0.35	0.02	0.15	0.62	0.70	0.54	0.42	
rs6435370		0.35	2	208004902	204.87	317K	A	G	minus	0.33	0.40	-0.01	0.86	0.47	0.50	0.44	0.73	
rs796280		0.49	2	208853697	205.27	100K	C	T	plus	0.51	0.47	-0.02	0.83	0.29	0.27	0.31	ND	1
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rs6742553		0.38	2	210515053	206.46	317K	A	G	minus	0.48	0.45	-0.02	0.98	0.72	0.72	0.73	0.85	
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rs2089976		0.50	3	18173860	38.40	Perlegen	C	G	plus	0.49	0.34	0.04	0.51	0.02	0.01	0.05	ND	1
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rs2929387		0.56	3	20037064	40.76	317K	A	G	plus	0.59	0.59	-0.02	0.90	0.35	0.35	0.35	0.73	1
rs9310613		0.35	3	20199774	40.97	317K	A	G	minus	0.37	0.29	0.02	0.41	0.89	0.93	0.85	0.58	1
rs7632125		0.66	3	21040939	42.03	317K	A	G	plus	0.71	0.65	-0.01	0.90	0.25	0.22	0.29	0.71	1
rs1605527		0.82	3	21351855	42.42	317K	A	G	minus	0.83	0.82	-0.02	0.07	0.88	0.89	0.88	0.35	1
rs1352139		0.63	3	21878730	43.09	317K	A	G	plus	0.67	0.65	-0.02	0.92	0.34	0.33	0.35	0.69	1
rs779170		0.51	3	22112444	43.27	317K	A	G	minus	0.50	0.48	-0.03	0.28	0.89	0.90	0.88	0.54	1
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rs4858429	rs7374714	0.38	3	22692880	43.70	317K	A	G	plus	0.40	0.39	-0.02	0.88	0.48	0.48	0.48	0.82	
rs711717		0.44	3	22985484	43.98	317K	A	G	minus	0.46	0.41	-0.01	0.27	0.82	0.85	0.79	0.35	
rs3922891		0.42	3	23192342	44.31	317K	A	G	plus	0.43	0.40	-0.01	0.73	0.19	0.17	0.21	0.60	1
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rs6795094		0.48	3	23714860	45.13	Perlegen	C	T	plus	0.45	0.33	0.02	0.45	0.00	0.00	0.02	ND	1
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rs4148884		0.52	4	100423465	104.92	100K	A	G	plus	0.45	0.65	0.04	0.09	0.58	0.50	0.69	ND	1
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rs4532240		0.45	4	101378705	106.09	317K	A	C	minus	0.46	0.43	0.03	0.24	0.79	0.80	0.77	0.54	
rs4699792		0.75	4	101600202	106.21	317K	A	C	plus	0.74	0.79	0.00	0.08	0.82	0.78	0.85	0.52	1
rs2163882		0.70	4	101652255	106.24	317K	A	G	minus	0.67	0.75	0.02	0.10	0.80	0.74	0.85	0.50	1
rs10516466		0.69	4	101760008	106.31	100K	A	G	plus	0.66	0.75	0.01	0.90	0.22	0.27	0.16	ND	
rs981272		0.33	4	102008291	106.46	100K	A	G	plus	0.31	0.33	-0.03	0.55	0.08	0.09	0.06	ND	
rs2851045		0.60	4	102277628	106.62	317K	A	G	minus	0.67	0.57	-0.02	0.10	0.70	0.76	0.65	0.40	
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rs1157038		0.41	4	102497435	106.75	317K	A	C	plus	0.34	0.53	-0.03	0.09	0.48	0.40	0.56	0.28	
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rs4521383		0.52	4	181310070	177.77	317K	A	G	plus	0.46	0.60	0.03	0.15	0.70	0.63	0.77	0.35	1
rs1320083		0.32	4	181725763	178.45	317K	A	G	plus	0.31	0.37	-0.01	0.13	0.50	0.48	0.52	0.29	1
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rs12498419		0.45	4	182335073	180.23	317K	A	C	plus	0.41	0.45	-0.01	0.63	0.07	0.09	0.04	0.31	1
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rs4862968		0.36	4	190783119	204.72	317K	A	C	minus	0.45	0.28	0.03	0.21	0.66	0.74	0.58	0.42	1
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rs870347		0.75	5	6898035	18.42	317K	A	C	minus	0.76	0.83	0.01	0.96	0.31	0.37	0.25	0.60	1
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rs12652471		0.39	5	12794865	30.38	Perlegen	A	G	plus	0.47	0.43	0.04	0.01	0.44	0.49	0.32	ND	1
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rs2454884		0.46	5	15302929	34.42	Perlegen	A	G	plus	0.44	0.30	0.05	0.43	0.01	0.00	0.03	ND	1
rs6420027		0.54	5	15923300	34.95	317K	A	C	plus	0.58	0.52	-0.01	0.85	0.27	0.24	0.30	0.46	1
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rs1867723		0.57	5	16550102	36.03	317K	A	C	minus	0.56	0.54	-0.01	0.29	0.97	0.98	0.96	0.58	1
rs35004		0.36	5	16670903	36.27	317K	A	C	minus	0.30	0.35	0.03	0.50	0.02	0.05	0.00	0.28	1
rs10051930		0.58	5	16794099	36.83	317K	A	C	plus	0.64	0.56	-0.01	0.10	0.67	0.72	0.63	0.40	1
rs249116		0.37	5	17005807	37.87	317K	A	G	plus	0.44	0.29	0.03	0.29	0.78	0.85	0.71	0.60	
rs297191		0.32	5	17245161	38.08	317K	A	G	plus	0.31	0.27	0.02	0.54	0.98	1.00	0.96	0.85	
rs3733746		0.38	5	17494627	38.17	317K	A	G	minus	0.47	0.32	0.01	0.14	0.57	0.63	0.50	0.38	1
rs1912571		0.35	5	17558594	38.21	100K	C	G	plus	0.35	0.35	-0.02	0.24	0.70	0.70	0.70	ND	
rs6865140		0.41	5	17755558	38.36	317K	A	G	plus	0.34	0.48	0.03	0.20	0.68	0.61	0.75	0.52	1
rs3896348		0.40	5	18204313	38.69	317K	A	G	plus	0.40	0.44	-0.02	0.84	0.37	0.39	0.35	0.56	1
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rs10472159		0.44	5	18767817	39.10	317K	A	G	plus	0.45	0.50	-0.02	0.09	0.52	0.50	0.54	0.27	1
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rs10476736		0.69	5	97523185	109.79	317K	A	G	plus	0.76	0.69	0.00	0.93	0.29	0.24	0.33	0.71	1
rs1871190		0.39	5	97981619	110.13	317K	A	C	plus	0.41	0.35	-0.02	0.31	0.82	0.85	0.79	0.46	1
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rs2327138		0.59	6	9083263	21.67	Perlegen	A	G	plus	0.55	0.47	-0.01	0.41	0.98	0.98	0.98	ND	1
rs1206909		0.55	6	9495486	22.49	Perlegen	G	T	plus	0.56	0.43	0.01	0.34	0.92	0.94	0.88	ND	1
rs1207009		0.34	6	10220401	23.95	317K	A	G	minus	0.36	0.29	0.02	0.53	0.05	0.02	0.08	0.42	
rs9350203		0.38	6	10335181	24.21	317K	A	G	plus	0.45	0.33	0.00	0.81	0.35	0.30	0.41	0.76	1
rs303080		0.43	6	10554691	24.72	317K	A	G	plus	0.53	0.36	0.02	0.12	0.58	0.65	0.50	0.33	1
rs2295599		0.54	6	11069440	25.90	100K	A	C	plus	0.50	0.62	0.01	0.14	0.69	0.65	0.77	ND	1
rs9468414		0.65	6	11204827	26.21	317K	A	G	plus	0.71	0.59	0.04	0.13	0.80	0.87	0.73	0.48	1
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rs2076184		0.42	6	11831818	27.66	100K	C	T	plus	0.46	0.47	-0.02	0.96	0.65	0.65	0.66	ND	1
rs12199302		0.41	6	12517893	29.24	Perlegen	G	T	plus	0.36	0.30	-0.01	0.39	0.00	0.01	0.00	ND	1
rs2327564		0.41	6	12643553	29.53	317K	A	C	plus	0.50	0.43	-0.02	0.04	0.37	0.39	0.35	0.08	1
rs576893		0.39	6	12837251	29.97	Perlegen	C	T	plus	0.34	0.28	-0.01	0.64	1.00	0.99	1.00	ND	
rs4711958		0.54	6	13369609	30.71	Perlegen	C	T	plus	0.55	0.40	0.03	0.36	0.93	0.95	0.88	ND	1
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rs16882045		0.56	6	19432061	41.11	317K	A	G	minus	0.60	0.62	-0.02	0.05	0.53	0.52	0.54	0.31	1
rs13208362		0.35	6	19802267	41.45	317K	A	G	minus	0.35	0.41	-0.02	0.10	0.46	0.43	0.48	0.19	
rs12110662		0.43	6	20026778	41.65	Perlegen	A	G	plus	0.43	0.62	0.01	0.05	0.55	0.52	0.62	ND	
rs4712460		0.41	6	20290164	42.26	317K	A	G	plus	0.40	0.38	0.00	0.45	0.99	1.00	0.98	0.60	1
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rs12525557		0.74	6	22060680	44.59	Perlegen	C	G	plus	0.79	0.72	0.03	0.93	0.15	0.13	0.22	ND	1
rs9368392		0.65	6	22128881	44.79	317K	A	C	minus	0.71	0.62	0.01	0.89	0.25	0.20	0.30	0.65	
rs9356797		0.49	6	22265380	45.28	317K	A	C	minus	0.63	0.41	0.05	0.92	0.47	0.37	0.56	0.75	
rs9368428		0.66	6	22340087	45.41	Perlegen	A	G	plus	0.68	0.75	-0.01	0.96	0.26	0.26	0.26	ND	1
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rs2394990	rs3997987	0.43	6	31448538	51.30	317K	A	C	plus	0.43	0.40	-0.01	0.63	0.07	0.05	0.09	0.42	
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rs2966		0.49	6	33797498	52.98	Perlegen	C	T	plus	0.50	0.38	0.01	0.66	0.12	0.10	0.16	ND	
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rs4713770		0.61	6	34381954	54.35	Perlegen	A	T	plus	0.66	0.73	-0.01	0.01	0.65	0.66	0.63	ND	1
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rs104669		0.52	6	37462037	56.72	Perlegen	A	T	plus	0.53	0.42	0.00	0.67	0.10	0.09	0.14	ND	1
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rs12206324		0.52	6	38365813	57.27	Perlegen	C	T	plus	0.47	0.40	-0.01	0.49	0.00	0.01	0.00	ND	
rs9357272		0.37	6	38478330	57.35	Perlegen	A	G	plus	0.34	0.47	0.01	0.82	0.35	0.37	0.28	ND	
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rs761387		0.49	6	39154179	57.88	100K	C	T	plus	0.49	0.53	-0.03	0.10	0.55	0.54	0.57	ND	1
rs2758912		0.37	6	39383260	58.48	317K	A	G	plus	0.38	0.32	0.04	0.53	0.03	0.00	0.06	0.40	1
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rs3734557		0.50	6	40468443	60.19	317K	A	G	minus	0.47	0.47	0.00	0.38	1.00	1.00	1.00	0.69	1
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rs4722585		0.35	7	25956606	42.45	317K	A	G	plus	0.34	0.32	-0.02	0.54	0.05	0.04	0.06	0.23	
rs10499574		0.37	7	26122218	42.56	317K	A	G	minus	0.33	0.35	0.00	0.50	0.01	0.02	0.00	0.17	
rs10235248		0.38	7	26277599	42.68	317K	A	G	minus	0.37	0.38	-0.03	0.72	0.23	0.23	0.23	0.57	
rs4470906		0.39	7	27221413	43.37	317K	A	G	plus	0.41	0.41	-0.02	0.11	0.52	0.52	0.52	0.27	
rs10486567		0.58	7	27749803	43.98	317K	A	G	plus	0.51	0.63	0.04	0.19	0.83	0.76	0.90	0.46	1
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rs10486580		0.54	7	28053745	44.38	317K	A	G	minus	0.66	0.52	0.01	0.05	0.52	0.59	0.46	0.30	1
rs10951205		0.37	7	28631696	45.33	100K	A	G	plus	0.36	0.42	-0.03	0.14	0.54	0.52	0.56	ND	
rs2190531		0.38	7	28832966	45.84	317K	A	C	minus	0.46	0.34	-0.02	0.14	0.57	0.62	0.52	0.23	1
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rs4237080		0.35	8	34900051	54.35	317K	A	G	plus	0.40	0.34	-0.02	0.86	0.46	0.43	0.48	0.73	
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rs1077140		0.41	9	113961158	120.35	317K	A	G	minus	0.35	0.48	0.01	0.17	0.65	0.59	0.71	0.39	1
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rs2274595		0.46	9	114434497	121.19	317K	A	G	plus	0.50	0.50	-0.02	0.93	0.52	0.52	0.52	0.69	
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rs12412175		0.57	10	130757875	165.80	317K	A	G	minus	0.58	0.66	-0.01	0.95	0.48	0.52	0.44	0.73	1
rs1554224		0.37	10	131047436	166.86	317K	A	G	plus	0.34	0.37	-0.02	0.62	0.12	0.13	0.10	0.40	1
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rs2631506		0.35	11	24805400	41.32	317K	A	G	plus	0.45	0.27	0.02	0.84	0.42	0.35	0.50	0.60	1
rs2217032		0.36	11	25166558	41.92	317K	A	G	plus	0.35	0.32	0.00	0.51	0.99	1.00	0.98	0.89	1
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rs627761		0.45	11	125330918	132.30	317K	A	G	minus	0.43	0.54	-0.01	0.93	0.52	0.57	0.48	0.80	1
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rs10141764		0.61	14	33235057	35.31	317K	A	C	minus	0.60	0.57	0.02	0.73	0.02	0.00	0.04	0.33	1
rs1244367		0.42	14	33765460	36.72	317K	A	C	plus	0.43	0.40	-0.02	0.74	0.21	0.20	0.23	0.48	
rs1958589		0.54	14	33914127	37.33	317K	A	G	minus	0.56	0.55	-0.02	0.86	0.29	0.28	0.29	0.65	1
rs11156846		0.45	14	34045635	37.54	317K	A	C	minus	0.44	0.43	-0.02	0.70	0.14	0.13	0.15	0.40	1
rs9671535		0.54	14	34186040	37.77	317K	A	G	plus	0.55	0.57	-0.02	0.11	0.66	0.65	0.67	0.42	
rs8015303		0.43	14	34316223	37.97	317K	A	G	plus	0.38	0.54	0.01	0.92	0.52	0.59	0.46	0.72	
rs6571690		0.43	14	34441448	38.12	317K	A	G	plus	0.37	0.54	0.02	0.10	0.53	0.46	0.60	0.31	
rs2415259		0.57	14	34639546	38.12	100K	C	T	plus	0.61	0.54	-0.01	0.88	0.32	0.28	0.37	ND	1
rs2277459		0.63	14	34831343	38.13	100K	C	T	plus	0.59	0.78	0.03	0.97	0.54	0.61	0.44	ND	1
rs13313403		0.37	14	34978971	38.13	317K	A	G	minus	0.42	0.31	0.02	0.29	0.77	0.83	0.72	0.55	
rs439354		0.47	14	35493790	38.77	317K	A	G	plus	0.53	0.46	-0.01	0.11	0.60	0.63	0.56	0.33	
rs1834855		0.37	14	35710389	39.05	100K	A	G	plus	0.35	0.38	-0.03	0.32	0.83	0.81	0.84	ND	
rs2076735		0.58	14	36057471	39.49	317K	A	G	plus	0.63	0.63	-0.02	0.06	0.56	0.57	0.56	0.25	1
rs4477602		0.56	14	36221406	39.69	100K	A	G	plus	0.60	0.58	-0.02	0.07	0.55	0.56	0.53	ND	1
rs1956513		0.44	14	36789768	40.49	317K	A	G	plus	0.58	0.39	0.02	0.95	0.57	0.50	0.65	0.75	1
rs1952790		0.38	14	37412427	41.45	317K	A	G	minus	0.32	0.39	0.05	0.54	0.03	0.07	0.00	0.23	1
rs4901767		0.41	14	37821647	41.93	317K	A	G	minus	0.41	0.40	-0.03	0.26	0.78	0.78	0.77	0.46	
rs17108058		0.58	14	37968354	42.03	Perlegen	C	T	plus	0.59	0.50	0.00	0.24	0.87	0.88	0.83	ND	1
rs1449720		0.35	14	38165318	42.16	317K	A	G	minus	0.36	0.32	-0.01	0.61	0.13	0.11	0.15	0.44	
rs10483546		0.45	14	38411596	42.33	317K	A	C	minus	0.50	0.44	-0.01	0.12	0.59	0.61	0.56	0.52	1
rs10138910		0.45	14	39379247	42.73	317K	A	G	minus	0.58	0.44	0.00	0.04	0.40	0.45	0.35	0.23	
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rs1782173		0.45	14	40755865	43.30	317K	A	G	plus	0.47	0.46	-0.02	0.18	0.69	0.70	0.69	0.33	
rs7141179		0.56	14	40883002	43.34	317K	A	G	plus	0.53	0.57	-0.02	0.78	0.13	0.15	0.11	0.48	
rs1447578		0.61	14	41204684	43.40	317K	A	G	plus	0.59	0.65	0.00	0.14	0.78	0.74	0.81	0.40	1
rs8008661		0.29	14	41318772	43.42	317K	A	G	minus	0.33	0.28	-0.02	0.17	0.54	0.57	0.52	0.40	
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rs10138430		0.37	14	43070677	43.96	317K	A	G	plus	0.31	0.41	0.02	0.38	0.89	0.84	0.95	0.70	
rs7144284		0.44	14	43502902	44.12	Perlegen	C	T	plus	0.42	0.69	0.04	0.03	0.52	0.48	0.64	ND	
rs11845717		0.57	14	43692067	44.19	Perlegen	C	T	plus	0.58	0.48	0.00	0.25	0.87	0.89	0.83	ND	
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rs17115288		0.37	14	44098618	44.35	317K	A	G	minus	0.47	0.31	0.01	0.89	0.50	0.43	0.56	0.73	
rs4274352		0.34	14	45098690	44.75	317K	A	G	plus	0.33	0.31	-0.02	0.47	0.95	0.96	0.94	0.79	
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rs12878898		0.51	14	45900434	45.06	Perlegen	A	G	plus	0.48	0.36	0.02	0.48	0.01	0.00	0.02	ND	1
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rs1552741		0.58	14	46414182	45.26	317K	A	G	minus	0.57	0.60	-0.03	0.18	0.82	0.80	0.84	0.40	1
rs1539221		0.43	14	46494540	45.29	317K	A	C	plus	0.41	0.44	-0.02	0.25	0.78	0.76	0.79	0.42	
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rs4143912		0.58	14	47123909	45.48	Perlegen	A	G	plus	0.57	0.43	0.02	0.61	0.03	0.02	0.07	ND	1
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rs1613715		0.55	14	47841003	45.74	317K	A	G	minus	0.57	0.57	-0.02	0.12	0.67	0.67	0.67	0.34	
rs11844714		0.41	14	48070976	45.84	317K	A	G	plus	0.42	0.42	-0.02	0.16	0.64	0.64	0.64	0.33	
rs959681		0.47	14	48287181	45.93	100K	A	G	plus	0.42	0.58	0.02	0.89	0.44	0.50	0.36	ND	
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rs12436454		0.39	14	49076076	46.32	317K	A	G	minus	0.37	0.40	-0.02	0.71	0.19	0.21	0.18	0.24	
rs4144571		0.42	14	49596908	46.92	100K	C	G	plus	0.42	0.38	0.01	0.42	0.99	1.00	0.97	ND	1
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rs1890706		0.50	14	50477330	48.22	317K	A	G	plus	0.47	0.49	-0.02	0.33	0.95	0.93	0.96	0.72	1
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rs12590186		0.76	14	53292038	51.36	317K	A	G	minus	0.77	0.79	-0.02	0.06	0.78	0.76	0.79	0.33	1
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rs17719756		0.41	14	56524192	57.59	317K	A	G	minus	0.39	0.39	0.00	0.47	1.00	1.00	1.00	0.65	1
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rs7150530		0.37	14	57738622	59.13	317K	A	C	plus	0.38	0.32	0.04	0.53	0.03	0.00	0.06	0.27	1
rs735714		0.41	14	58215898	59.60	317K	A	G	plus	0.54	0.35	0.02	0.07	0.45	0.52	0.38	0.21	1
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rs8016509		0.37	14	58735496	60.07	Perlegen	A	G	plus	0.38	0.45	-0.01	0.11	0.59	0.58	0.60	ND	
rs393170		0.54	14	59688357	60.26	317K	A	G	minus	0.61	0.53	-0.01	0.09	0.60	0.64	0.56	0.17	1
rs2020892		0.44	14	60348437	60.67	317K	A	G	plus	0.45	0.42	-0.02	0.72	0.17	0.15	0.19	0.50	1
rs12435428		0.62	14	60754091	60.98	317K	A	G	minus	0.72	0.60	0.02	0.07	0.63	0.70	0.56	0.31	1
rs718028		0.40	14	60893979	61.09	317K	A	G	minus	0.34	0.48	0.01	0.15	0.61	0.54	0.67	0.31	
rs810087		0.62	14	61091632	61.24	317K	A	G	plus	0.60	0.64	-0.01	0.15	0.81	0.78	0.83	0.42	1
rs10137051		0.44	14	61326088	61.42	100K	G	T	plus	0.52	0.37	0.01	0.93	0.55	0.50	0.63	ND	1
rs11158369		0.52	14	61525700	61.57	317K	A	C	minus	0.54	0.46	0.02	0.29	0.92	0.96	0.88	0.60	1
rs1806517		0.43	14	61778735	61.77	317K	A	G	minus	0.53	0.48	-0.01	0.03	0.35	0.37	0.33	0.15	
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rs12432865		0.54	14	96693346	106.52	317K	A	G	plus	0.61	0.50	0.01	0.14	0.72	0.78	0.67	0.21	
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rs2510527		0.47	21	30499077	31.82	317K	A	G	minus	0.52	0.52	-0.02	0.05	0.46	0.45	0.46	0.23	
rs2832837		0.41	21	30659580	31.99	317K	A	G	minus	0.50	0.42	-0.02	0.94	0.57	0.54	0.60	0.77	
rs2833138		0.71	21	31149663	32.52	317K	A	G	plus	0.73	0.67	0.01	0.85	0.08	0.04	0.13	0.38	1
rs2096491		0.53	21	31340922	32.80	317K	A	G	plus	0.49	0.65	0.02	0.06	0.53	0.46	0.60	0.35	1
rs558059		0.50	21	31732770	33.37	317K	A	C	minus	0.50	0.44	0.04	0.35	0.97	1.00	0.94	0.58	
rs2070424		0.59	21	31961191	33.69	100K	A	G	plus	0.67	0.53	0.01	0.95	0.48	0.42	0.56	ND	1
rs2833489		0.57	21	32012629	33.77	317K	A	G	plus	0.70	0.53	0.03	0.04	0.52	0.61	0.44	0.31	1
rs2833516		0.34	21	32093320	33.88	317K	A	G	plus	0.35	0.34	-0.02	0.23	0.67	0.67	0.67	0.41	
rs9982597		0.46	21	32201437	34.04	317K	A	G	minus	0.44	0.44	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	0.33	
rs2833695		0.37	21	32476002	34.86	317K	A	G	minus	0.40	0.32	-0.01	0.70	0.21	0.17	0.25	0.48	1
rs8134971		0.58	21	32622297	35.32	Perlegen	C	T	plus	0.60	0.63	-0.01	0.10	0.75	0.75	0.74	ND	1
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rs7283689		0.41	21	33398039	37.34	317K	A	G	plus	0.48	0.35	0.01	0.79	0.30	0.24	0.35	0.63	1
rs2246647		0.44	21	34089899	38.37	317K	A	G	minus	0.48	0.41	-0.01	0.80	0.28	0.24	0.31	0.48	1
rs8129269		0.56	21	34505780	39.14	317K	A	G	plus	0.59	0.56	-0.02	0.13	0.70	0.72	0.69	0.42	1
rs2268258		0.58	21	34819638	39.89	317K	A	C	plus	0.58	0.65	-0.02	0.06	0.57	0.53	0.60	0.17	1
rs2268274		0.47	21	34906333	40.12	317K	A	G	minus	0.52	0.54	-0.02	0.95	0.55	0.57	0.54	0.88	1
rs2248720		0.37	21	35154026	40.79	317K	A	C	plus	0.35	0.35	-0.02	0.52	0.02	0.02	0.02	0.33	1
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rs2835760		0.41	21	37765824	45.18	317K	A	G	plus	0.43	0.42	-0.02	0.85	0.39	0.39	0.40	0.63	1
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rs2836263		0.37	21	38562172	47.27	317K	A	C	plus	0.45	0.34	0.00	0.12	0.53	0.57	0.48	0.14	
rs460049		0.49	21	38921086	47.96	317K	A	G	minus	0.46	0.57	0.00	0.91	0.43	0.48	0.39	0.61	1
rs2836627		0.40	21	38981162	48.07	317K	A	G	minus	0.33	0.46	0.02	0.22	0.71	0.65	0.77	0.42	1
rs457705		0.50	21	39113301	48.32	100K	G	T	plus	0.56	0.41	0.03	0.83	0.28	0.22	0.38	ND	1
rs2836920		0.46	21	39434788	48.99	Perlegen	G	T	plus	0.42	0.31	0.02	0.42	0.00	0.00	0.02	ND	1
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rs4239805		0.42	21	39827681	49.90	317K	A	C	plus	0.37	0.44	0.00	0.32	0.86	0.83	0.90	0.67	1
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rs2837365		0.56	21	40301608	52.08	317K	A	G	minus	0.55	0.52	0.02	0.69	0.02	0.00	0.04	0.27	1
rs2837572		0.37	21	40631259	52.94	317K	A	G	minus	0.32	0.37	0.02	0.48	0.98	0.96	1.00	0.69	1
rs2837694		0.46	21	40832507	53.47	317K	A	G	plus	0.47	0.46	-0.02	0.83	0.31	0.30	0.31	0.60	1
rs2837774		0.39	21	40962525	53.80	100K	C	T	plus	0.39	0.35	0.01	0.45	0.99	1.00	0.97	ND	
rs2837852		0.60	21	41127921	54.30	317K	A	G	minus	0.57	0.60	-0.02	0.75	0.05	0.07	0.04	0.42	1
rs9979043		0.63	21	41385350	55.22	Perlegen	C	T	plus	0.60	0.54	-0.01	0.33	0.96	0.96	0.97	ND	1
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rs378528		0.49	21	43325524	63.00	317K	A	G	minus	0.50	0.47	-0.02	0.22	0.79	0.80	0.77	0.50	1
rs914195		0.42	21	43469341	63.32	317K	A	G	minus	0.46	0.39	-0.01	0.23	0.75	0.78	0.71	0.48	1
rs573283		0.49	21	43612690	63.64	317K	A	G	minus	0.44	0.51	0.00	0.27	0.86	0.83	0.90	0.58	1
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rs4819077		0.41	21	45616852	71.96	317K	A	C	minus	0.46	0.36	0.01	0.22	0.71	0.76	0.67	0.30	1
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rs11704365		0.34	22	21831380	16.63	Perlegen	A	C	plus	0.41	0.33	0.03	0.95	0.54	0.50	0.64	ND	1
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rs133203		0.34	22	24082340	22.20	317K	A	G	minus	0.37	0.28	0.03	0.46	0.94	0.98	0.90	0.56	1
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rs7292381		0.39	22	25519587	27.08	317K	A	G	plus	0.36	0.39	-0.02	0.61	0.10	0.11	0.08	0.33	1
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rs4820751	rs5762078	0.52	22	26065153	29.69	317K	A	G	plus	0.59	0.54	-0.02	0.94	0.48	0.46	0.50	0.69	1
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rs17300660		0.35	X	7901086	15.39	Perlegen	C	T	plus	0.30	0.29	-0.01	0.59	0.96	0.95	0.98	ND	1
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rs2239408		0.55	X	9397991	17.89	317K	A	G	minus	0.63	0.48	0.04	0.85	0.25	0.17	0.33	0.33	
rs11095519		0.67	X	9517109	18.12	100K	A	G	plus	0.63	0.73	0.00	0.11	0.76	0.70	0.83	ND	1
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rs12851319		0.60	X	9926794	18.89	317K	A	C	plus	0.65	0.62	-0.03	0.08	0.64	0.65	0.63	0.44	1
rs2193644		0.40	X	10152468	19.31	317K	A	C	plus	0.42	0.37	-0.02	0.70	0.18	0.15	0.21	0.40	1
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rs12849245		0.36	X	133742017	137.08	Perlegen	A	G	plus	0.31	0.25	-0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	ND	
rs7880536		0.31	X	134357869	138.55	317K	A	G	minus	0.34	0.38	-0.03	0.95	0.68	0.70	0.67	0.73	1
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rs12556784		0.40	X	135412529	139.52	317K	A	G	plus	0.38	0.42	-0.03	0.79	0.30	0.32	0.28	0.52	1
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rs4843987		0.40	X	148287690	170.07	317K	A	G	minus	0.34	0.41	0.05	0.44	0.97	0.93	1.00	0.75	1
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