Supplementary material for de Souza et al. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97 (23), 12690-12693.

Table 1. Transcribed regions of human chromosome 22 identified by ORESTES


Validation criteria :

1 = overlap with one or more ESTs from the public databases;
2 = splicing;
3 = positive ESTScan score;
4 = presence of least two ORESTES from different libraries.



HCGP cluster ID

Validation criterion

Genbank IDStart position of HCGP cluster on chr22Start and finish position of GenBank Seq. on chr22
15386AP000522.2.mRNA344373424934830
256901 46977  
271741 50403  
42874AP000523.2.mRNA729787275973765
34379AP000523.2.mRNA732557275973765
44119AP000523.2.mRNA734857275973765
194931 75889  
4751 104140  
67841 108970  
152801 120937  
11748AP000526.1.mRNA121951121460122336
768013 147308  
635303 224209  
33015AP000532.1305276298997308445
4728AP000532.1306384298997308445
16968AP000532.3318279317951319186
317301 319223  
120781 340557  
215651 342540  
5678AP000533.1358237358026358959
34704AP000533.2368209366770369031
25743AP000534.1377481377207379177
67295AP000534.2.mRNA387943387117387981
576263 413070  
31085AP000544.1.mRNA840850840595841297
42393AP000547.1.mRNA943586938730945063
42393AP000547.1.mRNA944817938730945063
192991 983464  
43320AP000547.6103071010305131030827
543203 1038248  
31299AP000365.2.mRNA108187410811401082015
12368AP000365.1.mRNA109289810891301095061
69301 1108251  
768563 1275009  
785723 1276626  
390934 1291521  
57491 1292385  
51821 1292626  
276171 1293092  
14658AC006548.11129480712938711296202
825323 1322877  
220691 1474275  
213851 1497654  
48248AC006946.3.mRNA153484115207681546015
10911AC006946.3.mRNA153742615207681546015
51521 1546844  
620973 1547818  
208871 1550427  
269271 1550739  
676863 1593264  
252831 1850320  
269621 2025027  
43156AC006285.6.mRNA203263020266062061830
78698AC006285.6.mRNA203289620266062061830
57912AC006285.6.mRNA204425320266062061830
17639AC006285.6.mRNA204764720266062061830
609143 2084664  
14603AC006285.5.mRNA212341921176712136859
357841 2139073  
88231 2161778  
278491 2162140  
188701 2162402  
917452 2446291  
48861 2451404  
39891 2452021  
83001 2452650  
792221 2455768  
155931 2456314  
477433 2525882  
1829AC008132.1264269526413182660487
6318AC008132.1264931326413182660487
406281 2662006  
277591 2701810  
36344AC008132.3270248427020992703300
42327AC008132.2271530527147582715813
1346AC008132.2271552827147582715813
5118AC008103.2.mRNA272496727220252726296
21908AC008103.4.mRNA277815927736802779352
22016AC008103.4.mRNA277815927736802779352
14390AC008103.4.mRNA277894327736802779352
2162AC000095.2.mRNA278041827425412803245
716AC008103.1278049727804482798458
14197AC008103.1278391127804482798458
14320AC008103.1278391127804482798458
35065AC008103.1278391127804482798458
83399AC008103.1278474527804482798458
22901AC000095.1.mRNA280555827912192877283
27687AC007326.1286112228530552861787
8137AC000095.1.mRNA286429827912192877283
7480AC000095.3.mRNA288613828852902887296
61611 2904564  
60691 2904889  
438351 2906177  
578323 2954065  
38637AC004463.2.mRNA304315630428523046020
35653AC004463.1.mRNA304800430467493158944
56171AC004463.1.mRNA310701330467493158944
44181AC004463.1.mRNA312588430467493158944

Next