ScoringMatrix	GOP	GEP	Lambda	Lambda error	C	C_error	P(length=0)	P(length=0) error	E(length)	E(length) error
1/-1	0	1								
1/-1	0	2	0.720	5.33E-04	0.975	6.38E-04	0.516	1.77E-03	5.07	7.30E-02
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1/-1	1	2	0.951	2.17E-04	0.999	3.65E-04	0.615	4.76E-04	1.86	1.94E-02
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Blosum45	10	2	0.123	8.09E-04	0.781	7.25E-03	0.314	9.67E-03	39.69	1.42E+00
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Blosum45	11	1								
Blosum45	11	2	0.152	7.09E-04	0.746	3.41E-03	0.373	9.32E-03	21.95	6.76E-01
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Blosum45	12	1								
Blosum45	12	2	0.173	4.12E-04	0.717	2.87E-03	0.420	5.36E-03	14.12	4.59E-01
Blosum45	12	3	0.198	8.88E-05	0.682	4.41E-04	0.480	2.87E-03	7.33	1.03E-01
Blosum45	12	4	0.209	1.07E-04	0.670	4.18E-04	0.508	1.64E-03	5.67	6.43E-02
Blosum45	13	1								
Blosum45	13	2	0.185	1.82E-04	0.698	7.54E-04	0.450	3.16E-03	10.31	1.11E-01
Blosum45	13	3	0.205	5.38E-05	0.671	3.91E-04	0.494	2.63E-03	6.41	7.57E-02
Blosum45	13	4	0.214	3.80E-05	0.659	2.46E-04	0.514	2.01E-03	4.93	3.19E-02
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Blosum45	14	2	0.195	8.67E-05	0.685	4.20E-04	0.473	2.99E-03	8.33	1.15E-01
Blosum45	14	3	0.211	6.74E-05	0.664	4.05E-04	0.506	2.36E-03	5.60	4.91E-02
Blosum45	14	4	0.217	4.15E-05	0.659	3.29E-04	0.523	1.39E-03	4.70	4.85E-02
Blosum45	15	1	0.158	9.34E-04	0.765	4.77E-03	0.396	5.38E-03	25.36	1.58E+00
Blosum45	15	2	0.203	5.30E-05	0.674	2.64E-04	0.490	2.00E-03	6.72	5.43E-02
Blosum45	15	3	0.215	4.02E-05	0.664	2.49E-04	0.517	1.25E-03	5.11	4.32E-02
Blosum45	15	4	0.220	3.95E-05	0.656	3.24E-04	0.529	1.47E-03	4.35	3.69E-02
Blosum45	16	1	0.176	4.91E-04	0.706	2.43E-03	0.429	5.43E-03	14.19	3.00E-01
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Blosum45	16	3	0.217	4.63E-05	0.660	3.02E-04	0.525	1.49E-03	4.73	4.83E-02
Blosum45	16	4	0.222	1.62E-05	0.653	1.33E-04	0.532	1.23E-03	4.16	3.36E-02
Blosum45	17	1	0.189	3.54E-04	0.690	1.65E-03	0.457	4.51E-03	10.83	1.88E-01
Blosum45	17	2	0.213	7.03E-05	0.662	4.17E-04	0.511	2.41E-03	5.39	4.90E-02
Blosum45	17	3	0.220	3.85E-05	0.655	2.66E-04	0.529	1.46E-03	4.39	3.73E-02
Blosum45	17	4	0.223	1.56E-05	0.650	1.45E-04	0.534	1.20E-03	4.00	2.58E-02
Blosum45	18	1	0.197	2.12E-04	0.679	1.03E-03	0.478	3.19E-03	8.69	1.25E-01
Blosum45	18	2	0.217	6.16E-05	0.661	4.28E-04	0.522	1.76E-03	4.91	4.65E-02
Blosum45	18	3	0.222	3.65E-05	0.652	3.50E-04	0.532	1.73E-03	4.22	4.12E-02
Blosum45	18	4	0.225	1.16E-05	0.648	9.87E-05	0.538	1.20E-03	3.86	3.86E-02
Blosum45	19	1	0.205	7.54E-05	0.672	5.47E-04	0.495	2.44E-03	7.02	6.68E-02
Blosum45	19	2	0.219	5.46E-05	0.657	5.14E-04	0.527	1.44E-03	4.64	4.64E-02
Blosum45	19	3	0.224	1.45E-05	0.651	1.60E-04	0.537	1.20E-03	3.97	2.94E-02
Blosum45	19	4	0.226	6.66E-06	0.647	7.39E-05	0.540	8.99E-04	3.62	1.71E-02
Blosum45	20	1	0.210	1.15E-04	0.663	6.77E-04	0.506	3.16E-03	6.13	7.10E-02
Blosum45	20	2	0.221	3.40E-05	0.655	2.48E-04	0.532	1.49E-03	4.38	4.21E-02
Blosum45	20	3	0.225	1.07E-05	0.648	1.03E-04	0.539	9.82E-04	3.83	2.19E-02
Blosum45	20	4	0.226	5.51E-06	0.645	7.12E-05	0.542	8.92E-04	3.56	1.66E-02
Blosum50	10	1								
Blosum50	10	2	0.141	3.67E-04	0.741	6.46E-03	0.369	4.20E-03	22.89	7.91E-01
Blosum50	10	3	0.186	1.24E-04	0.674	5.64E-04	0.476	2.91E-03	7.66	1.09E-01
Blosum50	10	4	0.204	8.04E-05	0.648	5.31E-04	0.518	2.66E-03	5.03	5.47E-02
Blosum50	11	1								
Blosum50	11	2	0.165	1.35E-04	0.703	5.42E-04	0.428	2.58E-03	12.80	1.66E-01
Blosum50	11	3	0.197	1.93E-04	0.662	1.10E-03	0.502	3.03E-03	6.00	7.49E-02
Blosum50	11	4	0.210	5.76E-05	0.640	5.26E-04	0.531	2.85E-03	4.41	4.84E-02
Blosum50	12	1								
Blosum50	12	2	0.182	8.14E-05	0.681	4.88E-04	0.466	2.75E-03	8.89	1.08E-01
Blosum50	12	3	0.205	9.10E-05	0.655	4.99E-04	0.526	1.62E-03	5.02	5.11E-02
Blosum50	12	4	0.215	5.69E-05	0.637	4.27E-04	0.547	1.62E-03	3.95	4.18E-02
Blosum50	13	1	0.115	6.15E-04	0.817	1.20E-02	0.315	6.15E-03	57.54	3.58E+00
Blosum50	13	2	0.193	9.80E-05	0.661	7.11E-04	0.493	1.73E-03	6.90	5.54E-02
Blosum50	13	3	0.211	5.77E-05	0.644	3.77E-04	0.539	1.68E-03	4.41	9.21E-02
Blosum50	13	4	0.218	2.98E-05	0.632	2.55E-04	0.556	1.36E-03	3.59	2.80E-02
Blosum50	14	1	0.150	3.71E-04	0.724	2.01E-03	0.388	4.40E-03	22.88	4.81E-01
Blosum50	14	2	0.202	9.85E-05	0.649	5.17E-04	0.513	2.73E-03	5.61	6.53E-02
Blosum50	14	3	0.215	4.26E-05	0.631	3.33E-04	0.544	2.02E-03	3.93	3.05E-02
Blosum50	14	4	0.221	2.29E-05	0.626	2.60E-04	0.561	1.52E-03	3.36	3.61E-02
Blosum50	15	1	0.169	2.34E-04	0.685	1.75E-03	0.438	2.71E-03	13.35	1.37E-01
Blosum50	15	2	0.209	6.06E-05	0.642	4.19E-04	0.529	2.91E-03	4.89	8.32E-02
Blosum50	15	3	0.219	2.15E-05	0.631	2.18E-04	0.555	1.31E-03	3.67	3.82E-02
Blosum50	15	4	0.224	2.33E-05	0.623	1.93E-04	0.566	1.33E-03	3.14	2.49E-02
Blosum50	16	1	0.185	1.20E-04	0.667	7.33E-04	0.475	2.99E-03	9.37	1.19E-01
Blosum50	16	2	0.214	4.45E-05	0.633	2.89E-04	0.541	2.64E-03	4.17	4.89E-02
Blosum50	16	3	0.222	2.84E-05	0.626	2.58E-04	0.562	1.47E-03	3.40	5.29E-02
Blosum50	16	4	0.225	1.87E-05	0.621	1.66E-04	0.570	1.27E-03	3.01	2.18E-02
Blosum50	17	1	0.196	1.64E-04	0.658	9.49E-04	0.499	2.80E-03	7.23	9.91E-02
Blosum50	17	2	0.218	3.58E-05	0.632	2.54E-04	0.554	1.34E-03	3.77	3.16E-02
Blosum50	17	3	0.224	2.35E-05	0.623	2.80E-04	0.568	1.48E-03	3.06	2.31E-02
Blosum50	17	4	0.227	1.03E-05	0.618	1.00E-04	0.573	1.13E-03	2.85	1.70E-02
Blosum50	18	1	0.205	1.27E-04	0.647	6.31E-04	0.520	3.32E-03	5.76	6.42E-02
Blosum50	18	2	0.221	2.98E-05	0.625	2.47E-04	0.557	2.16E-03	3.49	2.94E-02
Blosum50	18	3	0.226	1.38E-05	0.620	1.79E-04	0.570	1.30E-03	2.99	2.33E-02
Blosum50	18	4	0.228	8.11E-06	0.615	7.61E-05	0.574	9.32E-04	2.73	1.36E-02
Blosum50	19	1	0.211	5.74E-05	0.638	4.22E-04	0.535	2.90E-03	4.78	4.82E-02
Blosum50	19	2	0.223	3.39E-05	0.623	2.65E-04	0.565	1.62E-03	3.29	3.18E-02
Blosum50	19	3	0.227	7.55E-06	0.618	8.71E-05	0.574	9.68E-04	2.80	1.65E-02
Blosum50	19	4	0.229	5.69E-06	0.615	6.29E-05	0.576	9.23E-04	2.70	1.41E-02
Blosum50	20	1	0.216	4.83E-05	0.630	3.06E-04	0.546	2.59E-03	4.19	4.12E-02
Blosum50	20	2	0.225	2.09E-05	0.620	1.92E-04	0.569	1.28E-03	3.08	2.27E-02
Blosum50	20	3	0.228	7.21E-06	0.616	7.74E-05	0.575	9.52E-04	2.75	1.77E-02
Blosum50	20	4	0.229	3.23E-06	0.614	4.73E-05	0.578	7.65E-04	2.54	1.01E-02
Blosum62	6	1								
Blosum62	6	2	0.201	5.30E-04	0.740	2.38E-03	0.413	4.16E-03	14.34	2.74E-01
Blosum62	6	3	0.261	1.27E-04	0.679	4.40E-04	0.519	2.19E-03	5.27	5.84E-02
Blosum62	6	4	0.285	4.88E-05	0.657	2.32E-04	0.562	2.10E-03	3.53	3.02E-02
Blosum62	7	1								
Blosum62	7	2	0.239	3.53E-04	0.700	1.29E-03	0.483	2.72E-03	7.80	8.81E-02
Blosum62	7	3	0.278	4.62E-05	0.658	2.01E-04	0.552	2.07E-03	3.97	3.31E-02
Blosum62	7	4	0.294	3.94E-05	0.647	2.04E-04	0.577	1.96E-03	3.09	3.95E-02
Blosum62	8	1	0.145	8.44E-04	0.794	5.60E-03	0.304	9.75E-03	49.55	2.24E+00
Blosum62	8	2	0.264	8.41E-05	0.676	2.62E-04	0.525	2.26E-03	5.29	4.36E-02
Blosum62	8	3	0.289	8.40E-05	0.652	3.67E-04	0.570	2.82E-03	3.43	6.88E-02
Blosum62	8	4	0.301	2.50E-05	0.639	1.42E-04	0.589	2.03E-03	2.72	2.14E-02
Blosum62	9	1	0.206	5.29E-04	0.735	1.32E-03	0.423	5.39E-03	16.27	8.09E-01
Blosum62	9	2	0.280	7.90E-05	0.662	3.88E-04	0.555	2.37E-03	4.06	3.90E-02
Blosum62	9	3	0.298	3.11E-05	0.643	1.56E-04	0.585	2.00E-03	2.87	2.43E-02
Blosum62	9	4	0.306	1.48E-05	0.637	1.64E-04	0.601	1.14E-03	2.50	2.48E-02
Blosum62	10	1	0.244	1.67E-04	0.692	6.35E-04	0.491	2.40E-03	8.37	8.66E-02
Blosum62	10	2	0.291	5.32E-05	0.648	2.49E-04	0.572	2.26E-03	3.37	2.80E-02
Blosum62	10	3	0.303	2.74E-05	0.640	1.66E-04	0.597	1.27E-03	2.62	1.93E-02
Blosum62	10	4	0.309	1.77E-05	0.633	1.34E-04	0.605	1.12E-03	2.37	2.32E-02
Blosum62	11	1	0.267	5.96E-05	0.669	2.62E-04	0.532	2.25E-03	5.53	5.19E-02
Blosum62	11	2	0.299	4.30E-05	0.645	2.65E-04	0.589	1.35E-03	2.96	3.21E-02
Blosum62	11	3	0.307	1.93E-05	0.635	1.42E-04	0.603	1.12E-03	2.43	1.60E-02
Blosum62	11	4	0.311	1.24E-05	0.631	9.50E-05	0.610	9.54E-04	2.19	1.25E-02
Blosum62	12	1	0.282	2.22E-04	0.658	7.53E-04	0.556	2.36E-03	4.41	4.57E-02
Blosum62	12	2	0.304	2.23E-05	0.638	1.89E-04	0.597	1.10E-03	2.65	2.31E-02
Blosum62	12	3	0.310	1.52E-05	0.632	1.36E-04	0.607	1.14E-03	2.29	1.75E-02
Blosum62	12	4	0.313	5.80E-06	0.629	5.23E-05	0.612	7.84E-04	2.08	1.02E-02
Blosum62	13	1	0.293	6.63E-05	0.647	3.25E-04	0.577	2.38E-03	3.48	3.10E-02
Blosum62	13	2	0.308	1.94E-05	0.635	1.24E-04	0.603	1.13E-03	2.46	2.04E-02
Blosum62	13	3	0.312	1.12E-05	0.628	8.92E-05	0.610	9.57E-04	2.18	1.21E-02
Blosum62	13	4	0.314	5.83E-06	0.628	5.43E-05	0.614	7.66E-04	2.04	9.24E-03
Blosum62	14	1	0.300	3.17E-05	0.644	1.70E-04	0.592	1.27E-03	3.03	2.84E-02
Blosum62	14	2	0.311	7.41E-06	0.632	6.39E-05	0.608	7.85E-04	2.21	1.01E-02
Blosum62	14	3	0.314	1.31E-05	0.626	1.33E-04	0.613	1.16E-03	2.14	1.39E-02
Blosum62	14	4	0.315	5.69E-06	0.627	5.39E-05	0.616	7.73E-04	1.98	8.98E-03
Blosum62	15	1	0.305	3.09E-05	0.637	2.86E-04	0.599	1.47E-03	2.74	2.54E-02
Blosum62	15	2	0.313	7.21E-06	0.630	5.74E-05	0.613	7.86E-04	2.11	9.23E-03
Blosum62	15	3	0.315	6.59E-06	0.626	5.35E-05	0.615	7.83E-04	2.01	9.11E-03
Blosum62	15	4	0.316	6.62E-06	0.626	5.15E-05	0.616	7.75E-04	1.96	8.90E-03
Blosum62	9.5	0.5								
Blosum80	6	1								
Blosum80	6	2	0.268	2.09E-04	0.644	8.45E-04	0.556	3.27E-03	4.03	4.91E-02
Blosum80	6	3	0.306	4.64E-05	0.602	2.56E-04	0.624	2.40E-03	2.16	1.89E-02
Blosum80	6	4	0.321	2.55E-05	0.590	1.42E-04	0.653	1.06E-03	1.67	1.25E-02
Blosum80	7	1	0.186	6.74E-04	0.742	4.96E-03	0.400	8.53E-03	19.38	9.99E-01
Blosum80	7	2	0.293	9.97E-05	0.616	4.95E-04	0.600	2.77E-03	2.83	3.57E-02
Blosum80	7	3	0.317	3.16E-05	0.590	2.39E-04	0.643	2.30E-03	1.82	2.29E-02
Blosum80	7	4	0.328	1.98E-05	0.582	1.49E-04	0.666	1.11E-03	1.48	1.03E-02
Blosum80	8	1	0.243	3.58E-04	0.671	1.43E-03	0.509	3.65E-03	7.29	1.36E-01
Blosum80	8	2	0.309	5.30E-05	0.599	3.24E-04	0.627	2.32E-03	2.16	2.01E-02
Blosum80	8	3	0.325	2.15E-05	0.586	1.62E-04	0.661	1.06E-03	1.59	1.21E-02
Blosum80	8	4	0.332	1.50E-05	0.574	9.09E-05	0.670	1.72E-03	1.34	7.75E-03
Blosum80	9	1	0.277	7.72E-05	0.627	3.61E-04	0.572	2.41E-03	4.19	1.54E-01
Blosum80	9	2	0.319	3.46E-05	0.587	1.50E-04	0.646	2.15E-03	1.82	1.83E-02
Blosum80	9	3	0.330	1.44E-05	0.576	8.56E-05	0.666	1.67E-03	1.42	8.71E-03
Blosum80	9	4	0.336	1.03E-05	0.573	8.75E-05	0.678	9.08E-04	1.28	8.65E-03
Blosum80	10	1	0.300	8.97E-05	0.609	4.16E-04	0.611	3.16E-03	2.81	3.63E-02
Blosum80	10	2	0.327	2.66E-05	0.585	2.49E-04	0.663	1.28E-03	1.60	3.12E-02
Blosum80	10	3	0.334	1.10E-05	0.574	8.61E-05	0.675	9.19E-04	1.32	8.23E-03
Blosum80	10	4	0.338	9.33E-06	0.571	8.52E-05	0.681	8.75E-04	1.23	7.00E-03
Blosum80	11	1	0.313	5.70E-05	0.593	3.18E-04	0.636	2.10E-03	2.18	1.88E-02
Blosum80	11	2	0.331	3.15E-05	0.578	2.54E-04	0.671	1.32E-03	1.45	1.28E-02
Blosum80	11	3	0.337	7.81E-06	0.570	4.90E-05	0.680	7.08E-04	1.22	5.74E-03
Blosum80	11	4	0.339	4.40E-06	0.569	5.53E-05	0.683	7.16E-04	1.16	8.35E-03
Blosum80	12	1	0.323	3.64E-05	0.588	2.46E-04	0.657	1.31E-03	1.80	1.74E-02
Blosum80	12	2	0.335	1.02E-05	0.572	1.09E-04	0.676	8.86E-04	1.31	8.00E-03
Blosum80	12	3	0.339	6.18E-06	0.569	5.06E-05	0.683	7.15E-04	1.18	5.68E-03
Blosum80	12	4	0.340	5.15E-06	0.567	4.97E-05	0.685	7.11E-04	1.13	5.54E-03
Blosum80	13	1	0.329	2.21E-05	0.578	1.30E-04	0.664	2.02E-03	1.58	1.17E-02
Blosum80	13	2	0.337	6.51E-06	0.571	5.28E-05	0.680	7.20E-04	1.23	6.15E-03
Blosum80	13	3	0.340	6.65E-06	0.567	5.00E-05	0.684	7.09E-04	1.15	5.10E-03
Blosum80	13	4	0.341	5.16E-06	0.565	4.84E-05	0.686	7.04E-04	1.11	4.81E-03
Blosum80	14	1	0.333	1.45E-05	0.575	1.04E-04	0.674	8.63E-04	1.41	8.34E-03
Blosum80	14	2	0.339	7.46E-06	0.568	6.13E-05	0.683	7.22E-04	1.17	5.48E-03
Blosum80	14	3	0.341	5.62E-06	0.567	5.99E-05	0.686	7.10E-04	1.12	5.32E-03
Blosum80	14	4	0.342	5.60E-06	0.567	5.47E-05	0.688	7.19E-04	1.09	4.78E-03
Blosum80	15	1	0.336	6.49E-06	0.572	5.63E-05	0.678	7.06E-04	1.28	6.07E-03
Blosum80	15	2	0.340	6.14E-06	0.567	5.59E-05	0.685	7.03E-04	1.14	5.33E-03
Blosum80	15	3	0.341	5.64E-06	0.565	5.82E-05	0.687	7.17E-04	1.10	4.96E-03
Blosum80	15	4	0.342	5.58E-06	0.565	5.71E-05	0.688	7.19E-04	1.08	4.96E-03