LOCUS helices 1570 bp DEFINITION helices 1570 bp, 1570 bases, 1ACF45C4 checksum. ORIGIN 1 -----AAAAA A-AAA--AAB BBBBBB--CC ---CCCC-C- -C-C---CCC 51 C-CCCCCC-C CCC------- --cccccccc c-cccc-c-- --cc-cc-c- 101 cccc----DD D-DDDDDEEE EE---FFFFF FFF--GGG-G GHHHHHH--- 151 ---------- ---------- ---------- ------hhhh -hhIII-II- 201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 251 ---------- ---------- -----iiii- i-JJ------ KKKKK----- 301 ---------- LLLLL----- ---------- ---------- ---------- 351 -LL------- ---------- ---------L -----LL--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --LL------ ---------- 451 ---LLL--LL LL-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------L LLLLLLL--- LL-------- -LL-LLLLL- 551 L-LL-LLLLL L--------- ---------- ---------- ---------- 601 ---------- ---------- --llllllll -lllllllll l--------- 651 -----lll-l lll-l-ll-l -------l-- ll-------- -----l---- 701 --------l- ---l---l-l ---l-l-l-- -lll--l--- l--------- 751 MMMM------ ---------- ---------- ---------M M-------mm 801 -mmmmNN--- NNN---NNN- NNNN------ ---------- ---------- 851 ----nnn-nn --nnn----n nnn------- ---------- ---------- 901 ---------k k-k---kkjj ggggg---ee eee---OOOO ---------- 951 ---------- ---------- ---------- -------PPP PP-PPP---- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- --QQQQ-QQQ ---------- ---------- 1101 ---------- ---------f f-ffffff-- ---qq-q-qq qq-------- 1151 ---------- ---------- -------ppp -ppppp---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- -------o-o 1251 oo-------- ---------- ---------- ---------- -----RRR-R 1301 R-RRR----- ---------- ----rrr-rr r--r-r---- -------bbb 1351 bbbb------ -SSSS-S--- SS--S---S- SSSS--SSSS SSSS--SSS- 1401 SSSS------ ---------- ---------- ---sssssss sssss--ss- 1451 -s-ss----- s-ss-s-s-- ----ss-s-- s--s-s---- ----dddddd 1501 dd-a--a-aa aa----aaaa a--------- ---TTTTTT- TTTTTTTT-- 1551 ------tttt tttttttttt // LOCUS T.neapolitana 1570 bp DEFINITION T.neapolitana 1570 bp, 1570 bases, D54B7339 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGA G-GGG--UAG GUGGUC-GCG ---GGGA-C- -G-C---A-- 51 ---------- -----CACU- ---------- -------C-- --GC-GUUC- 101 CCCGAGGAAA GUCCGGACUC -U--G----G AGC-GGGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGGAG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCU- C-GGA---CA GGGCC--AUA 301 GAGAAGAAGA CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------GA UGA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -------G-- -GGCAAG--- G-GUGGAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCAG--- CGU---CGG- G-GC------ ---------- ---------- 851 --AA-CC-CG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------UG G-CAA-CCCC CACCU---G- GAGCAAGGCC AAG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGGG GG----U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----UG-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UCC----- ---CC-C-UA ---------- 1151 ---------- ---------- -----UU--- -CCCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGU-G 1301 U-GCG----- --GUAA---- ----CGC-AC A--C-CCC-A GAUUGAUGAC 1351 CACCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAAUCCGGC 1501 UUAU--A-CC CC----UCUC CCGUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.maritima 1570 bp DEFINITION T.maritima 1570 bp, 1570 bases, 5923A52D checksum. ORIGIN 1 .....GGAGA G-GAG--CAG GCGGUC-GCG ---GGGG-C- -G-C---A-- 51 ---------- -----CACC- ---------- -------U-- --GC-GCUU- 101 CCCGAGGAAA GUCCGGACUC -U--G----G AGC-GGGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGGAG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCU- C-GGA---CA GGGCC--AUA 301 GAGAAGAAGA CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------GU UGA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -------G-- -GGCAAG--- G-GUGGAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCAG--- CGU---CGG- G-GC------ ---------- ---------- 851 --AA-CC-CG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------UG G-CAA-CCCC CACCU---G- GAGCAAGGCC AAG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGGG GG----U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----UG-GGU C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UCC----- ---CC-C-UA ---------- 1151 ---------- ---------- -----UU--- -CCCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGU-G 1301 U-GCG----- --GUAA---- ----CGC-AC A--C-CCC-A GAUUGAUGAC 1351 CGCCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAAUCCGGC 1501 UUAU--G-CU CC----UCUC CCGUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.commune 1570 bp DEFINITION T.commune 1570 bp, 1570 bases, 24FAF324 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGG-AGGA-C GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -GGAGG-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCCC- U-GGA---AA GGGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------C G----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CA------ ---------- 451 ---GAA--AG GA-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------UU UUU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------UC-C -------U-- UU-------- -----C---- 701 --------U- ---G---G-U ---G-C-G-- -GGCAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCGC--- ACC---AGG- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAC-CU --GGU---GG C--------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-CCCC CGUCC---G- GAGCAAGGCC AAAC------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGAGC C-----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---G-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------C C-CC------ ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- --GCUAA--- --GGCU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------C AGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UAA-GAA-G 1301 A-GGG----- --GUAA---- ----CCC-UC U--U-CUC-A GAGAAAUAAU 1351 CACC------ -GCCU-G--- GG--G---A- A--------- ---------- 1401 ---------- --------AA U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --UU-C-C-- ----CC-A-- G--G-U-Aac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS D.radiodurans 1570 bp DEFINITION D.radiodurans 1570 bp, 1570 bases, 1E4A2991 checksum. ORIGIN 1 GGAACGCGGG G-AAA--CUC CUGGUC-GCG ---CCUGAG- -C-C---GCU 51 ---------- -----UUUUU ---------- ----GG-U-- --GG-AC-A- 101 GGUGAGGAAA GUCCGGGCAC -CGCA----G GGCAAGGA-U GCC-AGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCU- -GGUCG-GC- 201 --GAG----- U-CGAGCGCC CGCCUG---- -AGCGCCGAG GG----CAGG 251 -CGGAAA--- -GC--GGC-- -GAA-GCCGA A-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAACCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AC------- ---------- ---------C -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AC------ ---------- 451 ---ACA--GG C--------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C CCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- -------G-C -------G-- CG-------- -----G---- 701 --------G- ---U---GCG ---G-G-U-- -GGUCAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- GUU---CCC- GGGA------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --AGC--GUC U--------- ---------- ---------- 901 ---------G G-UCA-ACCC CAUCC---G- GUGCAAGACC CGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ----CGUGCG GC-GA----- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -----G-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ---GUUU-GA -GCCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------C AGGA--UG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 UCCUG----- --GCAA---- ----CAG-GC G--U-CCC-A GACAGAUGAU 1351 CAGG------ -CUGC-C--- CU--G---G- GG-------- ---------- 1401 ---------- -------GAG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- C-CC-C-G-- ----GA-G-- C--A-G--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-CG-UU UC----CCCG UGCCAGCCAC U--GCCGCC- CCCCGCG--- 1551 CCCGC--CGC UGGGGGCGGU // LOCUS F.mortiferum 1570 bp DEFINITION F.mortiferum 1570 bp, 1570 bases, 16A723D0 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUU -Ccaa----g AGC-AAGA-G GGC-AGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCU- -GCUAA-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUUUA A-GGA---AA GCgCC--ACA 301 GAAAAUAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -A-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -------U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- UUC---UUU- AGgA------ ---------- ---------- 851 --AACUA-AA --GAA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UaA-ACCC CCUCU---G- GAGCAAGACU AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA AG----GUU- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA---G-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----AG--- -CUUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------A GGGU--AA-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-AAU-U 1301 A-UAA----- --GAGA---- ----UUA-UA A--U-UCU-A GAUAAAUAAU 1351 UAACAU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AUac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Fischerella-UTEX1829 1570 bp DEFINITION Fischerella-UTEX1829 1570, 1570 bases, 9B2308E9 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ggggaggaaa guccgggcUU CC--G-AAAG ACC-AAACUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCGCG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAAAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UU------- ---------- ---------C -----UU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UC------ ---------- 451 ---AGU--GA AC-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------A GUGAACA--- GU-------- -UA-UCAGU- 551 G-AA-CAGU- ---------- ---------- --------AA AUA------- 601 ---------- ---------- ----ACUGAU -AACUGAUAA C--------- 651 -----UGA-U AAC-U-GA-U -------A-- AC-------- -----U---- 701 --------G- ---A---A-A ---A-A-G-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGGGCG 801 -CACCAG--- CAA---CAC- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UG --UUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUU---GG AAGCAAGGC- GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- ------GGAA CU----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---AC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -AGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ------CACA UAUAAGA--G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 U-CUG----- --GUAA---- ----CAG-CC G--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 CGCC------ -CUCU-U--- A--------- ---------- ---------- 1401 ---------- --------AU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----UA-A-- G--A-G-Aac agaacccggc 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Pseudoanabaena-PCC6903 1570 bp DEFINITION Pseudoanabaena-PCC6903 15, 1570 bases, 684DDF0 checksum. ORIGIN 1 ...GAAAGAG U-AAG--CGA GCAGUU-GCG ---AAAU-U- -A-G---UCU 51 U-AAAGUAUA AU---GAAA- ---AUUUGCU U-UAAGUA-- --CG-GA-U- 101 UUUGAGGAAA GUCCGGGCUU CC-AA-GAAG AUC-AGGC-U GCU-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAGAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------A -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---U-U-A-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------U GUUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---GGU- C-GU------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-CU --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CAGUC---GG AAGCAAGGC- GA-------- 951 ---------- ---------- ---------- -----GAGGA AA-UAAG--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C---G-UUG C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G A-UCUUCA-- -AUAG-A-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ------CUUA -UUUCCGUG- -ACUUAACUG 1201 CGUUUAGUGC GCGAAAGCGU GGCAAGCGUA GUUAAGU--- ---GUGU--G 1251 CCGCA----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGU-A 1301 U-UUG----- --GUAA---- ----CAA-AU A--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 CGCU------ -AGGGCA--- GU--U---G- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UUA U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---C-A-A-- ----CU-C-- C--C-AAAAC AGAACCCGGC 1501 UUAU--GUCU UA----CUCU UUCU...... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Nostoc-PCC7107 1570 bp DEFINITION Nostoc-PCC7107 1570 bp, 1570 bases, 86F03529 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ggggaggaaa guccgggcUC CC--G-AAAG ACC-AAACUU GCU-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -AGUGC-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAGAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AA------- ---------- ---------A -----AC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AA------ ---------- 451 ---GUA--AA AA-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------G UAAAAAG--- CA-------- -AA-AAAGC- 551 A-AAAGAAA- ---------- ---------- -------CAA AAA------- 601 ---------- ---------- ----UUUCUU -UUUACUUUU G--------- 651 --C--CCU-U UAA-C-UU-U -------U-- GC-------- -----C---- 701 --------U- ---U---U-U ---U-U-U-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---CGU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-CG --UUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUU---GG GAGCAAGGC- CAG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA CU----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---AC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -AGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ------CGCG UAUGAGA--G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-U 1301 U-UUG----- --GUAA---- ----CAA-CC G--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 UGCC------ -AUCA-U--- GU--A---A- A--------- ---------- 1401 ---------- --------AU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --UU-U-A-- ----CA-UA- G--A-U-Aac agaacccggc 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Oscillatoria-PCC7515 1570 bp DEFINITION Oscillatoria-PCC7515 1570, 1570 bases, CF2D15C9 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ggggaggaaa guccgggcUC CC--A-AAAG GCC-AAGCUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCGCG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAUAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CU------- ---------- ---------C -----UA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GA------ ---------- 451 ---UAG--AA G--------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A UUU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- -------C-U -------C-- CU-------- -----G---- 701 --------U- ---U---U-A ---GUG-G-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---UGU- C-GU------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-CA --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CGGCU---GG GAGCAAGGU- CGG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA UC----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---UC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -AGUUCCGUC ---------- 1201 GCACU--AUA GGUAAAUCUA U--GGUGU-- ---------- UAGGUGU--A 1251 CCGCA----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGU-G 1301 U-CUG----- --GUAA---- ----CAG-GC A--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 UGCC------ -CUCU-U--- AA--C---U- G--------- ---------- 1401 ---------- -------GUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --CA-G-C-- ----UA-A-- G--G-G-Aac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Calothrix-PCC7601 1570 bp DEFINITION Calothrix-PCC7601 1570 bp, 1570 bases, A9AC9FE2 checksum. ORIGIN 1 AAGGAGAGAG U-AGGCGUAG GCGGUU-GCA ---GAUC-A- -G-U---C-- 51 ---------- -----ACAAA ---------- -------A-- --AC-UGAA- 101 UUUGAGGAAA GUCCGGGCUC CC--G-AAAG ACC-AAACUU GCU-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -AGUGC-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAGAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AA------- ---------- ---------U -----UA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GU------ ---------- 451 ---CAU--UA GU-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------C AUUUGUC--- AU-------- -UA-GUCAU- 551 U-UG-GA--- ---------- ---------- ---------A AAA------- 601 ---------- ---------- ------CACA -AAGGACAAA G--------- 651 -----GAC-A AAG-A-AC-A -------A-- AU-------- -----G---- 701 --------A- ---C---C-A ---AAU-U-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAA---CGU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-CG --UUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUU---GG GAGCAAGGC- GAA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA CU----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---AC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -AGUUCCGC- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- --------UA AAACAGA--G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 U-UUG----- --GUAA---- ----CAA-AC G--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 CGCC------ -CUCA-U--- GU--A---G- AGAA--GUUA ---------- 1401 ---------- -------CUU G--------- ---------- ----U--AA- 1451 -C-AU----- U-UC-U-A-- ----CA-UUC G--A-G-AAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-UA-CC AA----CUCU UUCCCUUUUU .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Dermocarpa-PCC7437 1570 bp DEFINITION Dermocarpa-PCC7437 1570 b, 1570 bases, 49DCE2CE checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ggggaggaaa guccgggcUC CC--G-AGAG ACC-AAACUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUAC-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAACAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------U 351 UUU------- ---------- ---------U -----UU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CA------ ---------- 451 ---GUC--AA CA-GU----- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ------AAAA AAAA------ 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- --A-C-UG-A -------U-- AA-------- -----U---- 701 --------U- ---G---G-A ---A-A-A-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCAG--- CAG---UAU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UA --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUU---GG GAGCAAGGU- CGA------- 951 ---------- ---------- ---------- ------AGGA AC----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A---U-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---UC-C-A- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -GUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ------GUUU UAGGUGA--A 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GAC-G 1301 U-UUG----- --GUAA---- ----CAG-CC A--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 UACC------ -CCCA-A--- UA--A---G- ACGU--AG-- ---------- 1401 ---------- -------UAU A--------- ---------- --------C- 1451 -U-AU----- G-UC-U-U-- --UAAC-U-- G--G-G-Aac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Synechocystis-PCC6803 1570 bp DEFINITION Synechocystis-PCC6803 157, 1570 bases, 231CBDBC checksum. ORIGIN 1 .....GAGAG U-UAG-GGAG GGAGUU-GCG ---GAUU-C- -C-U---G-- 51 ---------- ------UCA- ---------- -------C-- --AG-GGAA- 101 UCUGAGGAAA GUCCGGGCUU CC--C-AAAG GCC-AAACUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCGUG A-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAAAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 CUU------- ---------- ---------U -----UU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AG------ ---------- 451 ---AAA--AC AG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------C AACCAGUAAA CA-------- -GU-UAACA- 551 G-GG------ ---------- ---------- ---------U UU-------- 601 ---------- ---------- --------UU -CUGCUGACU A--------- 651 -----ACU-G GUA-A-CU-G -------A-- CC-------- -----A---- 701 --------C- ---U---G-A ---A-A-A-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---UAU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UA --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUU---GG AAGCAAGGU- CG-------- 951 ---------- ---------- ---------- ----GAGGGG CA----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---UC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -UGCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ----CAUGAU UGGUGGA--A 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGA-A 1301 U-UUG----- --GUAA---- ----CAA-AU U--U-CCC-A GAUAGAUAAC 1351 UCCC------ -CAAG-G--- GU--G---C- ---------- ---------- 1401 ---------- --------CU C--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---G-C-A-- ----UC-C-- U--G-G-AAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-GA-CU AA----CUCU CUUUUUUU.. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Synechococcus-MINOS1 1570 bp DEFINITION Synechococcus-MINOS1 1570, 1570 bases, 8CB7EDD2 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .uugaggaaa guccgggcUC CCGAA---UG GCC-AGGCUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCGUG A-GGA---GA GUGCC--ACA 301 GAAACAC--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------C-C ---G-G-CAC AGGCAAG--- G-GUGCAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---CAU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UG --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGCC---GG GAGCAAGGC- CC-------- 951 ---------- ---------- ---------- ------AGGG AC-------- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------G AU-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-CCA----- UUGAC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ------G--- -GUCCCGAC- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- -------AAC AGCG--C--G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-C 1301 A-CCG----- --GUAUA--- ----CGG-UG G--U-CCC-A GACAGAUGAU 1351 CAUCCAGA-- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------GAac agaacccggc 1501 uu........ .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Synechococcus-PCC7003 1570 bp DEFINITION Synechococcus-PCC7003 157, 1570 bases, F166B45C checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ggggaggaaa guccgggcAC -CACA----G GGC-UGGUU- GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAAUU-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAUGUAGA CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------G ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CGU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---C-C-U-- -GGUAAG--- G-GUGCAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 UCACCAG--- CAG---AGU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-CU --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CG-CUGAAG- GUGCAAGGCG AAGGU----- 951 ---------- ---------- ---------- ---AUAUCUC GA-G--AA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA---C-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-G- ---------- 1151 ---------- ---------- ------C--C -UCGAG---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- UUGCCGAU-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGG-U 1301 U-UGA----- --GUAA---- ----UCA-GG C--U-CCC-A GAGAGAUGGC 1351 GGUAAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------Aac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.hollandica 1570 bp DEFINITION P.hollandica 1570 bp, 1570 bases, 4EB2DCB1 checksum. ORIGIN 1 .GCGGAGAAG U-AGG-CGAG GCGGCU-GCG ---GAUU-C- -G-G---CGG 51 C--------- ------GAU- ---------- ---GCU-G-- -ACU-GA-A- 101 UUCGAGGAAA GUCCGGGCUU CCGAA---AG ACC-ACACUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAAAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CU------- ---------- ---------G -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CC------ ---------- 451 ---UUC--GG GG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------U UUCGGUG--- UG-------- -GU-GGGUCA 551 G-GC-UC--- ---------- ---------- ---------C UG-------- 601 ---------- ---------- ------GAGC -CGAACCGCU G--------- 651 ----UCCC-U GGA-A-UC-U --GUGAGU-- GA-------- -----A---- 701 --------G- ---G---G-C ---U-G-G-- -GGUAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---UAU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UG --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUG---GG ACGCAAGGU- CG-------- 951 ---------- ---------- ---------- -----GAGGA AC----U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A---G-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCU----- UUUUC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -GUUCCGUA- ---------C 1201 AGGGU--CAA UCUUCGGGUU G--GCGCUG- ---------- -CGGUGU--A 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGU-G 1301 U-CUG----- --GUAA---- ----CAG-GC A--U-UCG-A GAUAGAUAGC 1351 UGCC------ -CCUA-A--- GU--C---U- G--------- ---------- 1401 ---------- -------GAG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --CA-G-A-- ----UG-A-- G--G-G-AAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-GU-CC AA----CUUC UUCGUUUUC. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.nidulans 1570 bp DEFINITION A.nidulans 1570 bp, 1570 bases, 1301FCEF checksum. ORIGIN 1 GCGGGGAAAG G-AGGC-GAG GCAGUU-GCG ---GCUC-A- -G-G---C-- 51 ---------- -----UUCG- ---------- -------G-- --UUAUG-G- 101 GCUGAGGAAA GUCCGGGCUC CC--A-AAAG ACC-AGACUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCGUG A-GGA---GA GUGCC--ACA 301 GAAACAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------C- ---A---G-G ---CAC-A-- -GGUAAG--- G-GUGCAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAA---CAU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UG --UUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CGGUU---GG GAGCAAGGU- GG-------- 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CA----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-----GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G G-UCUUUU-- ---AC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -UGUUCCGU- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- -UUAUGG--A 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGU-G 1301 G-CUA----- --GUAA---- ----UAG-CC A--U-CCC-A GAGAGAUAAC 1351 AGCC------ -CUCU-G--- UC-------- ---------- ---------- 1401 ---------- --------UU C--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------G-- ----AC-A-- G--A-G-AAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-GU-CC UG----CUUU CCCUACUUUA UUU....... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.marinus 1570 bp DEFINITION P.marinus 1570 bp, 1570 bases, 938DA1F9 checksum. ORIGIN 1 .....GAAAG C-AGG-AGAG GUGAUC-GCA ---AUCG-A- -G-A---UUU 51 A-UCGCG--- -----UUUC- -------CGC A-AUAA-A-- -CUC-UC-G- 101 GUUGAGGAAA GUCCGGGCUC CCAGA---UG GUC-CAACUU GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACU-- ---------- ------CCC- -AGUGC-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCGUG A-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAACAC--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GA------- ---------- ---------U -----GU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- -CUC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A UA-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---A---G-C ---A-C-A-- -GGCAAG--- G-GUGCAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---UAU- C-GA------ ---------- ---------- 851 --GA-GG-UA --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------UG G-UAA-ACCC CGGUU---GG GUGCAAGGC- AA-------- 951 ---------- ---------- ---------- ------AGGU UU-------- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----UA-GGA U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G A-CCA--UUU UGC-C-UA-- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------U UUCCUAU--- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- UUAA--A--G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-U 1301 G-UUG----- --GAGA---- ----CAA-CA G--U-CCC-A GAUAGAUGAU 1351 CACC------ -CACU-A--- AC--C---A- ---------- ---------- 1401 ---------- -------AUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---U-G-G-- ----AU-A-- G--U-G-AAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-UU-CC UG----CUUU C......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.trachomatis 1570 bp DEFINITION C.trachomatis 1570 bp, 1570 bases, EFAF1F50 checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAACC-GCU ---GAAA-C- -C-A---GCU 51 U-UU------ -----UAA-- ---------- A-AAAG-A-- --UGAGU-A- 101 CCAGAGGAAA GUCCGGACUU -UAUA----A GAA-AAGA-U GCU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAU-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAC-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------A- ---A---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAA 751 UCUU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAGGAGU 801 -AAGA-G--- CUG---CUA- GGGA------ ---------- ---------- 851 --GACCU-AG --CAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------UU G-UAA-ACCC CAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A---U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CU------ --GCA-A-A- ---CAACCUU 1151 UC--UAAC-- GA-AAGGCA- ----CAG-GC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGA-G 1301 U-ACA----- --GUAA---- ----UGU-GC U--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CGCA-A--- GC--A---A- GAAC------ ---------- 1401 ---------- -------UUC C--------- ---------- ---------- 1451 ---GU----- U-CG-U-G-- ----CU-U-- GU-C-G--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAC-UC-GC UC----UUCC GAGCUU.... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.trachomatis-L1 1570 bp DEFINITION C.trachomatis-L1 1570 bp, 1570 bases, 19133750 checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAACC-GCU ---GAAA-C- -C-A---GCU 51 U-UU------ -----UAA-- ---------- A-AAAG-A-- --UGAGU-A- 101 CCAGAGGAAA GUCCGGACUU -UAUA----A GAA-AAGA-U GCU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAU-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAC-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------A- ---A---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAA 751 UCUU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAGGAGU 801 -AAGA-G--- CUG---CUA- GGGA------ ---------- ---------- 851 --AACCU-AG --CAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------UU G-UAA-ACCC CAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A---U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CU------ --GCA-A-A- ---CAACCUU 1151 UC--UAAC-- GA-AAGGCA- ----CAG-GC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGA-G 1301 U-ACA----- --GUAA---- ----UGU-GC U--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CGCA-A--- GC--A---A- GAAC------ ---------- 1401 ---------- -------UUC C--------- ---------- ---------- 1451 ---GU----- U-CG-U-G-- ----CU-U-- GU-C-G--ac agaaxccggc 1501 uuac-uc-gc uc........ .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.muridarum-MoPn 1570 bp DEFINITION C.muridarum-MoPn 1570 bp, 1570 bases, BEBBF622 checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAACC-GCU ---GAGC-C- -A-G---UUU 51 U--------- -----AGA-- ---------- ---AAA-A-- --CUGCG-UA 101 UCAGAGGAAA GUCCGGACUU -CGUA----A GAA-AAGA-U GCU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAU-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAU-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A UAU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------C- ---A---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAA 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAGGAGU 801 -AGGA-G--- CUG---CUA- GGGA------ ---------- ---------- 851 --GACCU-GG --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------UU G-UAA-ACCC CAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A---U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------C U-CU------ --GCA-A-A- --AUCCUUUC 1151 ----UAAU-- ---GAAAGG- --CAUAA-AC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGA-G 1301 U-ACA----- --GUAA---- ----UGU-GC U--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CACA-A--- GU--A---A- GAAU------ ---------- 1401 ---------- -------UUC UU-------- ---------- ---------- 1451 ---AU----- U-CG-U-A-- ----CU-U-- GU-U-G--ac agaaxccggc 1501 uuac-uc-gc uc........ .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.suis-S45 1570 bp DEFINITION C.suis-S45 1570 bp, 1570 bases, 39184980 checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAGCC-GCU ---GGAG-C- -A-G---UUU 51 ---------- -----GUUUA ---------- ----AA-G-- --CU-GA-UG 101 UCAGAGGAAA GUCCGGACUU -XAUA----A GAA-AAGA-U GCU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAU-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAC-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------A- ---A---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAA 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAAGAGU 801 -AGGA-G--- CUG---CUG- GGGA------ ---------- ---------- 851 --GACCC-GG --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------CU G-UAA-ACCC CAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-C--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------C U-CU------ --GCA-A-A- ----GAACCU 1151 CUC-UAAG-G GA-AGGUUC- -----AG-AC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GAA-G 1301 U-AUA----- --GUAA---- ----UGU-GC U--U-CCU-A GAUGAAUGGC 1351 UGCC------ -CGCA-G--- GC--A---A- GAAU------ ---------- 1401 ---------- -------UUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---AU----- U-CG-C-G-- ----CU-U-- GU-U-G--ac agaaxccggc 1501 uuac-uc-gc uc........ .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.felis-FP 1570 bp DEFINITION C.felis-FP 1570 bp, 1570 bases, 9D25E582 checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAACC-GCU ---UCCU-G- -U-A---UCU 51 ---------- -----CUAGU ---------- ----AG-A-- --UA-UG-G- 101 UAAGAGGAAA GUCUGGACUU -CAUA----A GAA-GAGA-U ACU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAC-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAC-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A AU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -----A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAU 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAAGAGU 801 -AGGA-G--- CUA---UUA- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUU-AA --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------GU G-CAA-ACCC UAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -----U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CU------ --GCA-U-A- ----AUGAGG 1151 AGC-UCU--G UU-CCUCAU- -----AA-AC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CACAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-A 1301 U-AUA----- --GUAA---- ----UAU-AU C--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CUCA-A--- GA--U---G- GU-------- ---------- 1401 ---------- -------CUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-CC-A-U-- ----CU-U-- GU-A-G--ac agaaxccggc 1501 uuac-uc-gc uc........ .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.psittaci 1570 bp DEFINITION C.psittaci 1570 bp, 1570 bases, 18B84B6D checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUU -CAUA----A GAA-AAGA-U ACU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAC-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAU-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G GUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------U- ---U---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAU 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A UUUUAAGAAU 801 -AGGA-G--- CUA---UUA- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUUAGG --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------GU G-CAA-ACCC UAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU----- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----UU-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CUG----- ---CA-U-AA ----UGAGGA 1151 AU--GGU--- AU-UCCUCA- ----UGA-AC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-A 1301 U-AUA----- --GUAA---- ----UAU-AU C--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CUCA-A--- GA--U---G- GG-------- ---------- 1401 ---------- -------UUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- C-UC-A-U-- ----CU-U-- GU-A-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.abortus-B577 1570 bp DEFINITION C.abortus-B577 1570 bp, 1570 bases, 50927FBF checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAACC-GCU ---UUUU-G- -U-A---CCU 51 U--------- -----AACU- ---------- ---AAG-G-- --UA-GA-U- 101 UAAGAGGAAA GUCUGGACUU -CAUA----A GAA-AAGA-U ACU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAC-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAU-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G GUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------U- ---U---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAU 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A UUUUAAGAAU 801 -AGGA-G--- CUA---UUA- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUU-AG --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------AU G-CAA-ACCC UAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -----U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CU------ --GCA-U-A- ---AUGAGAG 1151 GGA-GGG--U AU-CCCUCA- ----UGA-AC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-A 1301 U-AUA----- --GUAA---- ----UAU-AU C--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CUCA-A--- GA--U---G- AG-------- ---------- 1401 ---------- -------UUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- C-UC-A-U-- ----CU-U-- GU-A-G--ac agaaxccggc 1501 uuac-uc-gc uc........ .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.caviae 1570 bp DEFINITION C.caviae 1570 bp, 1570 bases, A43986FA checksum. ORIGIN 1 ....UCGGAA G-AGU--AAG GCAACC-GCU ---UUUU-A- -U-A---UCU 51 ---------- -----CUAGU U--------- ----AG-G-- --UA-UA-C- 101 UGAGAGGAAA GUCUGGACUU -CAUA----A GAA-GAGA-U ACU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAC-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAC-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G GUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------U- ---U---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAU 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAAGAGU 801 -AGGA-G--- CUA---UUA- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUU-AA --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------AU G-CAA-ACCC UAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-GU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -----U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CU------ --GCA-U-A- ----GUGAGG 1151 GAU-AGU--A UU-CCUCAU- -----AA-AC -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-G 1301 U-AUA----- --GUAA---- ----UAU-GC C--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CUCA-A--- GA--U---G- GU-------- ---------- 1401 ---------- -------CUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- U-CC-A-U-- ----CU-U-- GU-A-G--ac agaaxccggc 1501 uuac-uc-gc uc........ .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.pneumoniae-CWL029 1570 bp DEFINITION C.pneumoniae-CWL029 1570 , 1570 bases, 237FA4BD checksum. ORIGIN 1 ...AUCGGAA G-AGA--AAG GCAACC-GCU ---GUUU-A- -U-A---UUU 51 ---------- ----CUCAAA ---------- ----AA-A-- --UA-UA-A- 101 AGAGAGGAAA GUCUGGACUU -CAUA----A GAG-AAGA-U ACU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAU-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAC-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---U---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAU 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAGGAGU 801 -AGGA-G--- CCA---UUA- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUU-AA --UAG---GC ---------- ---------- ---------- 901 --------AU G-CAA-ACCC UAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA----AGC- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU---U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CU------ --GCA-A-A- ---UGUGAGA 1151 GG--AAUU-- CC-UCCCAU- ---AGGC--- -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CGAAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-A 1301 U-CUA----- --GUAA---- ----UAG-CU C--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CUUA-G--- GA--U---A- GUUC------ ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---GA----- G-CU-A-U-- ----CU-U-- AU-A-G--AC AGAACCCAGC 1501 UUAC-CC-UC UC----UUCC GAUAUUUUU. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.pecorum-iB1 1570 bp DEFINITION C.pecorum-iB1 1570 bp, 1570 bases, AF12715D checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... ...CGGACUU -UAUA----A GAA-AAGA-U ACU-GGA--- 151 ---------- ---GAAAC-- ---------- ------UCC- -AGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAACAU-U CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---U---U-U ---U-A-U-- -AGACAG--- G-CUGAAAAU 751 UCCU------ ---------- ---------- ---------A CUUUAGGAGU 801 -AGGA-G--- CUA---UUA- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUU-AA --UAG---AC ---------- ---------- ---------- 901 --------AU G-CAA-ACCC UAUCU---G- AAGCAAGA-- G--------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAA AA-A--GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------U UU---U-UUG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CU------ --GCA-A-A- --AUUGAGAA 1151 G---UUUU-- -C-UUCUCA- ---UAAG--U -UUUUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --CAUAA--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-A 1301 U-UUA----- --GAGA---- ----UAG-AU C--C-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGCC------ -CUCA-G--- GG--A---G- AC-------- ---------- 1401 ---------- -------GUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-UC-UAC-- ----CC-U-- GC-A-G--ac agaacccggc 1501 uuax...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.acanthamoebae 1570 bp DEFINITION P.acanthamoebae 1570 bp, 1570 bases, E14B588B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccggacUU -UAUA----G GAG-AGGA-U GCC-AGU--- 151 ---------- ---GAAAG-- ---------- ------ACU- -GGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACAA-A CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AA------- ---------- ---------C -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---C---U-U ---G-U-U-- -AGAUAG--- G-GUGAAAU- 751 GCCU------ ---------- ---------- ---------G CUUUAGGAGC 801 -AUGG-C--- CUU---AUC- UAGA------ ---------- ---------- 851 --GAAAU-UU --AGA--AAG ---------- ---------- ---------- 901 --------UG G-UAA-ACCC CAUCC---A- AAGCAAGAC- GG-------- 951 ---------- ---------- ---------- ----AAAUAA AG-------- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------C GA-UAC-AGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------C U-CC------ ---GC-U-GU G--------- 1151 ---------- ---------- ---------- -CUUUA---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- --GAAAA--G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-U 1301 U-UCG----- --GUGA---- ----CGG-CG C--C-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 UGCU------ -CGUC-U--- GC-------- ---------- ---------- 1401 ---------- --------UU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----GC-A-- G--A-CCGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.negevensis 1570 bp DEFINITION S.negevensis 1570 bp, 1570 bases, 7FD89E6F checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccggacUU -CGCA----G AAA-AAGG-U GCC-AGU--- 151 ---------- ---GAAAA-- ---------- ------ACU- -GGGGG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCUA C-GGA---AA GUGUA--ACA 301 GAAAACAA-A CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -AA------- ---------- ---------U -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UA------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---A---A-G ---A-U-U-- -AGACAG--- G-AUGAAAAU 751 GUCG------ ---------- ---------- ---------A GCUUAUGGCU 801 -CGAC-C--- UCU---UUG- UGGA------ ---------- ---------- 851 --AACAC-AA --GGA---CG ---------- ---------- ---------- 901 --------CU G-CAA-ACCC CACCU---G- AAGCAAGA-- ---------- 951 ---------- ---------- ---------- -------AAG AG-UUCGUU- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-----AGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-UC------ ---GC-U--- ---------- 1151 ---------- ---------- ----CAGGAA -CUCUU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---AGAG--- 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGA-U 1301 U-UUG----- --GUGA---- ----C..... .......... .......... 1351 .......... .......... .......... .......... .......... 1401 .......... .......... .......... .......... .......... 1451 .......... .......... .......... .......... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.agglomerulans 1570 bp DEFINITION E.agglomerulans 1570 bp, 1570 bases, 1027B89E checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUCC-- -----UUCG- ------GGGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GU- 201 --G------- ---------- ---------- ----UCAC-- ---------- 251 ---------- ---------- ---G-ACCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.acetobutylicum 1570 bp DEFINITION C.acetobutylicum 1570 bp, 1570 bases, 26E7AAA4 checksum. ORIGIN 1 .....CGAGU A-AGC--CAG ACAAUC-GCU ---GCUG-C- -A-------- 51 ---------- ------AUU- ---------- ---------- ---U-GC-A- 101 GGAGAGGAAA GUCCGAGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACU-- ---------- ------CCC- -GGUCA-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUUGA A-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAGAUAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------U ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UAU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---A-A-U-- -GGUAAG--- G-GUGGAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACCAG--- CGC---AUU- G-GC------ ---------- ---------- 851 --GA-CU-UU --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AU G-UAA-ACCC CAUCU---G- GAGCAAGAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA AG-C--GUU- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU--GG-AGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-U-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AGCA 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-AUC-U 1301 U-AUG----- --GUAA---- ----CAU-AA G--G-UCU-A GAUAGAUGAU 1351 UGUCGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AUAC AGAACUCGGC 1501 UUAC-AG-GU UU----AGUC GUCCAUUG.. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.sporogenes 1570 bp DEFINITION C.sporogenes 1570 bp, 1570 bases, 6F57B047 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAAUA-- ---------- ------CCC- -AGUGG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUUUA A-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAGAUAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------A ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---U-C-U-- -GGUAAG--- G-GUGGAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACCAG--- CGU---AUA- G-GU------ ---------- ---------- 851 --GA-CU-AU --ACG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AU G-UGA-ACCC CAUCU---G- GAGCAAGAUC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAG AG-C--A--- 1001 -----GGAAA --C------- ---------U UUG------- ---------- 1051 ---G------ UUUCC----- -A--GG-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CC ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CUCUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU-AGU-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-U 1301 A-UUG----- --GUAA---- ----CAA-UA G--G-CCU-A GAUAGAUGAU 1351 UGUCUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------Acac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.thermomarinus 1570 bp DEFINITION E.thermomarinus 1570 bp, 1570 bases, D7BA4F94 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CGCA----G GGC-AGGA-U GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAAUA-- ---------- ------CCC- -AGUGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCUA A-GGA---UA GUGCA--ACA 301 GAAAUAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UG------- ---------- ---------A -----CA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CU------ ---------- 451 ---UAA--UA UA-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------U GUAGC----- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- -------UAU AGAU------ 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 -------G-U UACCA-UA-U -------A-- UU-------- -----A---- 701 --------A- ---G---U-G ---C-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGGGAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACCAG--- CAG---CUA- G-GC------ ---------- ---------- 851 --GA-CU-AG --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CU G-UAA-ACCC CAUCU---G- GAGCAAGACC AAGU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----UAGGG AC----AUAA 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------A AA-GGU-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-AC C--------- 1151 ---------- ---------- ---------- -GUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- -------GGU UGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GCC-U 1301 A-UUG----- --GCGA---- ----CAA-UA G--G-CGU-A GAUAGAUGGC 1351 UGUCUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------ACac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.hermsii 1570 bp DEFINITION B.hermsii 1570 bp, 1570 bases, 83426535 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -C-AA-UAAG AGU-AUAA-U GCU-AGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCU- -AGGAG-UU- 201 ---------- ---------- ---------- -----UAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----AACU- UAAGA---GA GUGUC--ACA 301 GAAAAUU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACC-G--- CUU---AUU- UAGU------ ---------- ---------- 851 --GAUAA-AU --AAG---GU ---------- ---------- ---------- 901 ------CAAG A-UAA-ACCU CAUUA---G- GAGCAAAAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AAGCA AG-C------ 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---U-CCU ---------- ---------- 1101 ---------- ---------U A-GCUCUU-- ---AG-G-G- ---------- 1151 ---------- ---------- ----UAU--G -CUUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--GG-A 1251 UUGCA----- ---------- ---------- ---------- -UGA-UUU-U 1301 U-UCA----- --GUGA---- ----UGA-AA A--A-ACA-A GAUAGAUGAU 1351 GACAUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AUac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.burgdorferi 1570 bp DEFINITION B.burgdorferi 1570 bp, 1570 bases, 7DC90889 checksum. ORIGIN 1 .....AGCUG G-CAG--CUA GCCAUC-GCU ---UAGU-U- -U-U---A-- 51 ---------- -----UAAU- ---------- -------U-- --AA-AG-C- 101 UAAGAGGAAA GUCCGAGCUC -C-AA-UAAG AAC-AUAA-U GCU-AGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCU- -AGGGG-UU- 201 ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----AACC- UAAGA---AA GUGUC--GCA 301 GAAAAUU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------GU AAAA------ 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACC-G--- CUU---AUU- UAGC------ ---------- ---------- 851 --AAUAA-AU ACAGG----C ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG A-UAA-ACCU CAUUA---G- GAGCAAGAUC AAGU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AUGAA AG-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C--CC-UUU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CUU----- ---GA-G-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ----CAU--G -CUUAC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-UUU-U 1301 U-UUA----- --GCGA---- ----UAA-AA A--A-AUA-A GAGAGAUGAU 1351 GGCAUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------GUAC AGAACUCGGC 1501 UUAU-GG-GU GU----CAGC UUAAU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.pallidum 1570 bp DEFINITION T.pallidum 1570 bp, 1570 bases, DEBECCCB checksum. ORIGIN 1 ......AGAG A-ACU-GCAG AUAGUC-GCU ---GCGG-G- ---------- 51 ---------- -----UUU-- ---------- ---------- -----CU-C- 101 GCAGAGGAAA GUCCGGACUC -C--U--UCG GAA-AUGA-U GCU-AGU--- 151 ---------- ---UAAUU-- ---------- ------ACU- -AGGCA-GC- 201 --GGC----- U-CU------ ---------- ----CUGC-- ---------- 251 ---------- --A--GUG-- -C-C-GCUGA C-AGC---AA GCGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACC-G--- CGU---UUU- G-GC------ ---------- ---------- 851 --GA-CA-AA --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-GCCU CAUCA---G- GAGCAAGAUC GAG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGCA AA-------- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -------GGA UA-------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-CCGA---- ---UC-C--- ---------- 1151 ---------- ---------- ----UGU--- -UUUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-A 1251 UUGCA----- ---------- ---------- ---------- -UAA-AUU-U 1301 A-UAUA---- --GCGA---- ---UAUA-UA A--A-GUG-A GACAGAUGAU 1351 UAUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------UGAC AGAAUCCGGC 1501 UUAC--C-AG UU----CUCU -GUUUU.... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS L.weilii 1570 bp DEFINITION L.weilii 1570 bp, 1570 bases, 1ADAB812 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAC -C--A--GGA AAC-ACGG-G ACC-GGG--- 151 ---------- ---UAAUU-- ---------- ------CCC- -GGAAU-UU- 201 --UUU----- C-UUU-GAGA ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---UUUU--- -AG--AGA-- -A-A-GAAUA U-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAGGAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------G -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---A------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----U---- 701 --------U- ---C---G-G ---C-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-U--- UCG---AUU- UCGA------ ---------- ---------- 851 --GAGAG-AU --CGG---GA ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACCC UCCCG---G- GUGCAAUCUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GC-CU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---U-UGC ---------- ---------- 1101 ---------- ---------C G-UUUCC--- ---GC-A-G- ---------- 1151 ---------- ---------- --------GG -CUGC----- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 GAGCA----- ---------- ---------- ---------- AAGA-CUC-C 1301 G-AUC-G--- --GUAA---- ---CUUU-CG G--A-GCA-A GAUAAAUGAU 1351 CAUC------ -CAUC-U--- CU-------- ---------- ---------- 1401 ---------- --------UC A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------G-- ----GA-G-- A--G-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS L.borgpetersenii 1570 bp DEFINITION L.borgpetersenii 1570 bp, 1570 bases, 907CCFBF checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAC -C--A--GGA AAC-ACGG-G ACC-GGG--- 151 ---------- ---UAAUC-- ---------- ------CCC- -GGAGU-UU- 201 --UUU----- C-UUU-GAGA ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---UUUU--- -AG--GGA-- -A-A-AAAUA U-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAGGAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------G -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GA------ ---------- 451 ---A------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----U---- 701 --------U- ---C---G-G ---C-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-U--- UCG---AUU- UCGA------ ---------- ---------- 851 --GAGAG-AU --CGG---GA ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACCC UCCCG---G- GUGCAAUCUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GC-CU-U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---U-UGU ---------- ---------- 1101 ---------- ---------C G-UUUCC--- ---GC-A-G- ---------- 1151 ---------- ---------- --------GG -CUGU----- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 GAGCA----- ---------- ---------- ---------- AAGA-CUC-C 1301 G-AUC-G--- --GUAA---- ---CUUU-CG G--A-GCA-A GAUAAAUGAU 1351 CAUC------ -CAUC-U--- CU-------- ---------- ---------- 1401 ---------- --------UC A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------G-- ----GA-G-- A--G-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.prowazekii 1570 bp DEFINITION R.prowazekii 1570 bp, 1570 bases, 5EE3A684 checksum. ORIGIN 1 .....CUAAA U-GGU--CGU GCAGUU-GCG ---UGAU--- ---------- 51 ---------- -----GAUA- ---------- ---------- ------A-U- 101 CACGAGGAAA GUCCGGACUC -U--A-UAGA GGU-AUGG-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------UCC- -GGCAG-AG- 201 --UA------ ---------- ---------- ----UUAU-- ---------- 251 ---------- ---------- -U-A-CUUUA G-GGC---UA GUACC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GA------- ---------- ---------G ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---U-U-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------U GGUAAGAGCA 801 -CACC-G--- GUA---AGU- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAA-GU --UAC---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UUA-ACCC CACCA---A- GAGCAAGAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA UU-ACA---- 1001 -----GAAUU --UAAAU--- ---------A UUU------- ------AU-- 1051 U-UA------ AGUUC----- ----CU-GGG U--------- ---------- 1101 ---------- ---------U A-CCUCUA-- ---AU-C-GG ---------- 1151 ---------- ---------- -----AUUGU -AAUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGU-A 1301 A-ACG----- --GUAA---- ----CGU-UU A--U-CCU-A GAUAAAUAAC 1351 UGCA------ -AUGA-A--- U--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UAA U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----AU-U-- C--A-U--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAU-AG-AC CA----GAUG AGCAG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Wolbachia-sp 1570 bp DEFINITION Wolbachia-sp 1570 bp, 1570 bases, D8762986 checksum. ORIGIN 1 .....UAGGU G-GAA--UAA GUAGCU-GCU ---GUUG-U- -G-U------ 51 ---------- -----GAUAA ---------- ---------- --AC-AU-A- 101 GCAGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-AGGA AAA-AUAG-U GAC-GGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCC- -GCCGG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCCA G-UUA---UA GGGCU--ACA 301 GAAAAUU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------A -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------U-U ---U-U-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------U GGUAAGAGCA 801 -CACC-A--- UGG---CAA- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAU-UG --GUA---GU ---------- ---------- ---------- 901 -------CGA G-UAA-CCAA CACUA---G- GAGCAAGAUU AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGAAG UA-GA-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U---U-AUG ---------- ---------- 1101 ---------- ---------U U-UUCCU--- ---CA-U-A- ---------- 1151 ---------- ---------- --------UC -UACUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AA-A 1251 UCGCA----- ---------- ---------- ---------- -UGC-GGU-A 1301 A-AUG----- --GUAA---- ----CAU-UU A--C-UCC-A GAUAAAUAGC 1351 UACAUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------AAC AGAACUCGGC 1501 UUAU--A-UU UC----ACCU AGGCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.crescentus 1570 bp DEFINITION C.crescentus 1570 bp, 1570 bases, B7793119 checksum. ORIGIN 1 .CGGACCAGA U-GAU--CGG GCGGUC-GCG ---UCGU-C- ---------- 51 ---------- -----UUCG- ---------- ---------- -----GA-C- 101 GCCGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-CGGU GAC-AAGG-C GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -ACCGG-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCCCA G-GGA---UA GCGCC--ACA 301 GAAAGCAA-A CCUCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------C -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U ACG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---G-G-C-- -GGGAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGG---ACC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAG-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-GCCC CGCCU---G- GAGCAAGACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--CGCG 1001 -----UCGGC ---------- ---------C UCGC------ ---------- 1051 ---------- GCCGA----- ---CUA-GGC C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CACUG--- ---GC-U-GA G--------- 1151 ---------- ---------- ------A--G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCG----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GCC-G 1301 U-CCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 CGUC------ -GCCG-U--- CU--C---C- CUGU--C--- ---------- 1401 ---------- -------UUC G--------- ---------- ---------- 1451 -G-AU----- G-GGCG-G-- ----GG-C-- G--G-A--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-AU CA----UCUG GUCCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.palustris 1570 bp DEFINITION R.palustris 1570 bp, 1570 bases, 4E96488D checksum. ORIGIN 1 .....UCAGU C-GGC--CGG ACGGCC-GCU ---CCGG-CA AGUG---CC- 51 ---------- -----GAAA- ---------- -----G-G-- --CC-GC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-UCGA CAU-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAACGA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------C -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UC------ GCAGCUUCGC 451 UGCUUC--GG CG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------C GGCAAGC--- C--------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- G--------- 651 -----GCU-C GCU-G-CG-C -------C-- AU-------- -----AACCC 701 GCAAGGGUG- ---A---A-G ---G-C-G-- -AGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---CGC- CGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGG-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAAACC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-AUC- 1001 -----GCGGA UAGUUCGCUG ---------C UCG------- --C-AGCGAU 1051 A-AC------ UCCGC----- -A---G-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------A U-GUCAG--- ---GC-U-C- ---------- 1151 ---------- ---------- --------GC -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 C-UGU----- --GCAA---- ----ACA-GU G--U-CCC-A GAGGAAUGGC 1351 CGUC------ -GCGC-A--- UC--G---C- CUCC------ ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---GG----- A-AG-C-G-- ----GU-G-- CCCU-C--aC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CG----GCUG A......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.eutrophus 1570 bp DEFINITION A.eutrophus 1570 bp, 1570 bases, E02FF553 checksum. ORIGIN 1 .....AAAGC A-GGC--CAG GCAACC-GCU ---GCCU-G- -C-A---CC- 51 ---------- -----GCAA- ---------- -----G-G-- --UG-CA-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGACUC -CACA----G GGC-AGGG-U GUU-GGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCC- -AUCCA-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGUGC G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUUG----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- 701 --------C- ---C---G-G ---C-G-G-- -GAA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CACCU---G- GAGCAAUCCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-AGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 GAGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-G 1301 G-CUG----- --GUAA---- ----CAG-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 UGUC------ -ACGC-A--- CC--G---U- UUGC--C--- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 -G-GC----- G-GG-C-G-- ----GG-G-- C--G-C--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CU----GCUU UGCUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.testosteroni 1570 bp DEFINITION C.testosteroni 1570 bp, 1570 bases, 31D20474 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUG -CAUA----G GGC-GGCG-U AGC-AGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCU- -GUCCA-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGUGA G-GAU---CA GAGCA--ACA 301 GAGACGA--G UCUGG----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------G -----GA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GU------ ---------- 451 ---GCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- GG-------- -----C---- 701 --------A- ---G---A-C ---C-A-A-- -CCA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 --------GG G-CAA-UCUC UACGC---G- CAGCAAUACC AAGU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA CA-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGG G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---CC-G-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UAGCA----- ---------- ---------- ---------- CCGA-GCC-A 1301 U-CAG----- --GCGA---- ----CUG-AU G--G-CCA-A GAUUAAUGGC 1351 GGUC------ -ACAU-G--- GC--G---G- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---C-C-G-- ----UU-G-- U--G-C--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.europaea 1570 bp DEFINITION N.europaea 1570 bp, 1570 bases, 5BE99594 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC C-GGU--CAG ACAGUC-GCU ---GCCU-G- ---------- 51 ---------- -----GUGA- ---------- ---------- ---C--A-G- 101 GGAGAGGAAA GUCCGGGCUC -CACA----G AGC-AGGA-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGCCG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGUGA G-GAA---CA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G CGUAU----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U AAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -UUA--C--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CAUCC---G- GAGCAAGAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GA-U--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GCA-C 1301 A-CGG----- --GUAA---- ----CUG-UA U--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CG----GCUU C......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.capsulatus 1570 bp DEFINITION R.capsulatus 1570 bp, 1570 bases, 3FC45E89 checksum. ORIGIN 1 .....GCGGA A-GAC--CGG AUGACC-GCG ---GCGG-C- -C-C---AUA 51 G-CUCCG--- -----UUUUU -------CGG A-UAGC-U-- --GG-GC-C- 101 UCCGAGGAAA GUCCGGACUC -C--A-UGAA GCA-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---AA GCGCC--ACA 301 GAGAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---C-G-G-- -GGUGAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGG---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAG-GA --CCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-GCCC CACCG---G- GAGCAACGCC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UG-CC-GC-- 1001 -----GCCGC --AACCG--- ---------G AAA------- ------CG-- 1051 G-GG-----G ACGGC----- -A---G-GGG A--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UUCG---- ---CC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----GA-GG -UGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CGGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-U 1301 G-CGG----- --GUGA---- ----CCG-CA G--A-CCC-A GAGGAAUGGU 1351 CAUC------ -CAGG-G--- G--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----CC-C-- C--G-G--AC AAAAUCCGGC 1501 UUAC-AG-GU CU----UCCG CGCGC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS R.rubrum 1570 bp DEFINITION R.rubrum 1570 bp, 1570 bases, 43A54F44 checksum. ORIGIN 1 .....CCAGU C-GGC--CGG AUGGCC-GCU ---CUCC-GU CA-U---CGU 51 C-CCCGGG-- -----CCACC ------CCCG AUGGAC-C-- --GU-CG-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -C--A-CGGG AAC-ACGG-U GCC-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -GGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCUA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------C -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------UA UAC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---G-C-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CCU---GCC- CGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGG-GG --AGG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGAUC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA CG-GC-AC-- 1001 -----GCCCC --GG------ ---------U UUU------- ---------- 1051 --CC------ GGGGC----- AA---G-CGG C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UU------ ---CC-G-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ----GCC-GC -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AGUA 1251 UCGCG----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 U-CCG----- --GUAA---- ----CGG-GC G--U-CCC-A GAUGAAUGGC 1351 CAUC------ -CCCG-U--- CG--U---C- GCGU--CCC- ---------- 1401 ---------- -------UUG C--------- ---------- -------GG- 1451 -G-AU----- A-CG-GCC-- ----GG-C-- GU-G-G--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CG----UCUG GCGGU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.bronchiseptica 1570 bp DEFINITION B.bronchiseptica 1570 bp, 1570 bases, B83A0660 checksum. ORIGIN 1 .....AGGGC A-GAU--CGG GCAAUC-GCG ---GGGG-A- -U-------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- ---A-UC-C- 101 UUCGAGGAAG GUCCGGACUC -CACA----G GGC-GGGA-U AGC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GUCCG-GC- 201 --GAC----- G-CUG-GCGG G--------- ----CUUG-- ---------- 251 --CCCGC--- -CG--GAA-- -A-A-GCCGA G-GAA---CA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUGU----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------U -----GAGGG CGCGCCUGGC 401 GCGCACCGGC ACGGCCAUCU CCGUGCCG-- --CG------ ---------- 451 ---CCG--UC CG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------CG-G -------G-- CG-------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-C ---A-U-G-- -ACA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-CAA-CC.. .......... .......... .......... 951 .......... .......... .......... .......... .......... 1001 .......... .......... .......... .......... .......... 1051 .......... .......... .......... .......... .......... 1101 .......... .......... .......... .......... .......... 1151 .......... .......... .......... .......... .......... 1201 .......... .......... .......... .......... .......... 1251 .......... .......... .......... .......... .......... 1301 .......... .......... .......... .......... .......... 1351 .......... .......... .......... .......... .......... 1401 .......... .......... .......... .......... .......... 1451 .......... .......... .......... .......... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.pertussis 1570 bp DEFINITION B.pertussis 1570 bp, 1570 bases, 672DE2CD checksum. ORIGIN 1 .....AGGGC A-GAU--CGG GCAAUC-GCG ---GGGG-A- -U-------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- ---A-UC-C- 101 UUCGAGGAAG GUCCGGACUC -CACA----G GGC-GGGA-U AGC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GUCCG-GC- 201 --GAC----- G-CUG-GCGG G--------- ----CUUG-- ---------- 251 --CCCGC--- -CG--GAA-- -A-A-GCCGA G-GAA---CA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G UCUGU----- ---------- ---------- ---------- 351 -CA------- ---------- ---------U -----GAGGG CGCGCCUGGC 401 GCGCACCGGC ACGGCCAUCU CCGUGCCG-- --CG------ ---------- 451 ---CCG--UC CG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------CG-G -------G-- CG-------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-C ---A-U-G-- -ACA--G--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-CAA-CCUC UAUCC---G- GAGCAACAUC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA UG-C--GUA- 1001 -----CGGCC ---------- ---------G UAA------- ---------- 1051 ---------- GGCCG---GG AA---G-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ --CGU-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----AA--G -CAUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UGGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCG-G 1301 U-CCA----- --GCAA---- ----UGG-UU C--G-CCA-A GAGGAAUGAU 1351 UGCC------ -CGCC-G--- GG-------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GAA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------C-- ----CC-G-- G--C-G-UAC AGAAUCCGGC 1501 CUAU-AG-AU CU----GCUC U......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.thioparus 1570 bp DEFINITION T.thioparus 1570 bp, 1570 bases, 3BAA44A0 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G AGC-AGGA-U GCC-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGACG-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGCGA G-GAA---UA GGGCC--ACA 301 GAGACGA--G CGUAU----- ---------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -UUA--C--- G-GUGAAAC- 751 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 801 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 851 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 901 -------GCG G-UAA-CCUC CAUCC---G- GAGCAACACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-AGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UGGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-G 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 UGCCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.meningitidis-Z2491 1570 bp DEFINITION N.meningitidis-Z2491 1570, 1570 bases, 48A5B0FB checksum. ORIGIN 1 .....CGGGA C-GGG--CAG ACAGUC-GCC ---GCGU-A- -U-C---GC- 51 ---------- -----GUAA- ---------- -----G-G-- --CA-UA-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CGCA----G GGU-AGAA-U GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGCG-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGCGA C-GGA---AA GUGGA--ACA 301 GAAAGCAAAA CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---C---A-G ---CAC-A-- -GGCAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGGGCG 801 -CACC-G--- CGC---AUU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAAUAU --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG C-CAA-ACCC CAUUC---G- GAGCAAGACC AAA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGAA CG-C--AA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCA-U 1301 A-CCG----- --GCAA---- ----CGG-UA U--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-CG-CC UG----UCCG GUGUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS X.fastidiosa 1570 bp DEFINITION X.fastidiosa 1570 bp, 1570 bases, 173380F8 checksum. ORIGIN 1 GCGGUGAAGU C-GGC--UGG GCAGUC-GCG ---UCAU-C- -C-------- 51 ---------- -----GAGA- ---------- ---------- ---G-GA-U- 101 GCCGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCU- -GGGCG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GUCGA C-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAGAU--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AA------- ---------- ------UAUU -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --U------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---A---G-G ---A-U-UC- -GGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGA---GUU- CGGU------ ---------- ---------- 851 --AACGG-AC --CG----GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-ACCC CACCU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCA-C 1301 C-GUG----- --GUGA---- ----CGC-GG U--G-CCU-A GAUGAAUGGC 1351 UGUUCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------UGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-AG-GC CG----ACUU CACCGCUUU. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.vinosum 1570 bp DEFINITION C.vinosum 1570 bp, 1570 bases, DC703A15 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU C-GGC--CAG ACAGUC-GCU ---UCCG-U- -C-------- 51 ---------- -----CUGGU ---------- ---------- ---G-AC-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GUCCA C-GGA---AA GUGCC--GCA 301 GAAAAGAU-A CCGCC----- ---------- ---------- --------GA 351 CCC------- ---------- ---------C -----GU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---A-C ---G-G-G-- AGGUAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---UGG- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAU-CA --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG AA-C--UC-- 1001 -----GCGGC ---------- ---------U UCG------- ---------- 1051 ---------- ACCGC----- -A-GCG-CGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CG U--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 U-GCG----- --GCGA---- ----CGC-AC G--U-CCC-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CG----ACUC CCUUC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.aeruginosa 1570 bp DEFINITION P.aeruginosa 1570 bp, 1570 bases, 30BAF47B checksum. ORIGIN 1 .....AGAGU C-GAU--UGG ACAGUC-GCU ---GUCG-C- -G-C------ 51 ---------- -----AAUA- ---------- ---------- --GC-GC-G- 101 GUGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A ACA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-CC- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUGC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-UU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 U-ACA----- --GUGA---- ----UGU-GC G--U-CCC-A GAGGAAUGGC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-AG-AU CG----ACUC UCCCA..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.macrocytogenes123 1570 bp DEFINITION A.macrocytogenes123 1570 , 1570 bases, 7268617D checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-UCA----- --GCGA---- ----UGG-CC G--U-CGU-A GAGGAAUGGC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.paspali 1570 bp DEFINITION A.paspali 1570 bp, 1570 bases, 6046C547 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.vinlandii-CA 1570 bp DEFINITION A.vinlandii-CA 1570 bp, 1570 bases, E38BFC8B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGCCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.salinestris-184 1570 bp DEFINITION A.salinestris-184 1570 bp, 1570 bases, E48DBDC4 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GUGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.chroococcum 1570 bp DEFINITION A.chroococcum 1570 bp, 1570 bases, D50A406C checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGU------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-UC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAAcccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.stutzeri 1570 bp DEFINITION P.stutzeri 1570 bp, 1570 bases, 7E807E0B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-AAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-A 1301 G-UCA----- --GUGA---- ----UGG-CU G--U-CGU-A GAGGAAUGGC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAAcccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.putida 1570 bp DEFINITION P.putida 1570 bp, 1570 bases, 8E9E63B4 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------A -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---U-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGU UC-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- CA--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-UC ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAACC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-G 1301 U-CCA----- --GUGA---- ----UGG-CC G--U-CGU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAAcccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.azotoformans 1570 bp DEFINITION P.azotoformans 1570 bp, 1570 bases, 56E93F6A checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggCUC -CAUA----G GGC-GAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------A -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---U-G-C-- CGGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGU CC-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GGACC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GAU-G 1301 U-CCA----- --GUGA---- ----UGG-CC A--U-CGU-A GACGAAUGAC 1351 UGUUCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAAcccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.fluorescens 1570 bp DEFINITION P.fluorescens 1570 bp, 1570 bases, E519C036 checksum. ORIGIN 1 .....AGAGU C-GAU--UGG ACAGUC-GCU ---GCCC-U- -C-U---AU- 51 ---------- -----GAAA- ---------- -----A-U-- -UAG-GG-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-GAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------A -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---U-G-CC- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UAG G-UAA-ACCC CACUU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGU UC-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAACC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GAU-G 1301 U-CCA----- --GUGA---- ----UGG-CC A--U-CGU-A GACGAAUGAC 1351 UGUUCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-AG-AU CG----ACUC UCCAC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.putrefaciens 1570 bp DEFINITION S.putrefaciens 1570 bp, 1570 bases, 108EB32D checksum. ORIGIN 1 .....CGAGU U-GGC--CAG ACAGUC-GCC ---GCGU-U- -C-------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- ---G-AA-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUU -CAAA----G AGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGCG-GU- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----ACCGA C-GAC---AA GUGCA--ACA 301 GAGAGGAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------C -----AU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---U---A-A ---G-G-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- UGC---GGC- UAGC------ ---------- ---------- 851 --AAUAGUCC --GUA---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG G-UAA-ACUC CACCC---G- AAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGU UC-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-G-UU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAACC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-U 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CA G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGGACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CA----ACUC AACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS V.cholera 1570 bp DEFINITION V.cholera 1570 bp, 1570 bases, 955AD49A checksum. ORIGIN 1 ....AGUUGA C-UGG--GUA GUCGCU-GCC ---UUAU-U- -G-A---CGU 51 C-CCUUGG-C ----CUAUC- -----GCCAG GGAGACUG-- --AU-AA-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G AGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---AA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UC------ ---------- 451 ---UCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- GG-------- -----A---- 701 --------U- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- UGC---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUA---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCC UC-C--AC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A-UAG-CGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-G-UU A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAGGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GUGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAGGAAUGGC 1351 UACU------ -ACCG-C--- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- -----G-C-- G--G-A--AC AGAACCCGGC 1501 UUAU-AC-GU CG----ACUC CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS E.coli 1570 bp DEFINITION E.coli 1570 bp, 1570 bases, 7EA13351 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUC--- -----UUCG- -------GGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.typhi 1570 bp DEFINITION S.typhi 1570 bp, 1570 bases, 54240685 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCU---- -----UUCG- --------GG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ---GGAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CA------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CAC....... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS L.adecarboxylata 1570 bp DEFINITION L.adecarboxylata 1570 bp, 1570 bases, A79ED2E6 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-G-- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- ------CCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CA------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUAAUGACU 1351 GUUCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaanccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS K.pneumoniae 1570 bp DEFINITION K.pneumoniae 1570 bp, 1570 bases, 8BB37144 checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -G-U---CGU 51 CGUCCUCC-- -----UUCG- ------GGGG G-AGAC-G-- -GGC-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGGG-GU- 201 --G------- ---------- ---------- ----UCAC-- ---------- 251 ---------- ---------- ---G-ACCCA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUCC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AA--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----GUUU CACCU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.marcescens 1570 bp DEFINITION S.marcescens 1570 bp, 1570 bases, B8EFD2BA checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU U-GAC--CAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -A-U---UGC 51 CGUCCUC--- -----UUCG- -------GGG G-AGAC-A-- -GAU-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---UA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GU CA----ACUC CCUC...... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.liquefaciens 1570 bp DEFINITION S.liquefaciens 1570 bp, 1570 bases, 5E08FAEF checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---UA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------C- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GAC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Y.pestis 1570 bp DEFINITION Y.pestis 1570 bp, 1570 bases, 90317278 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU U-GAC--UAG ACAGUC-GCC ---GCUU-C- -A-C---UGC 51 CGUCCCU--- -----UUCG- -------GGG G-AGAC-A-- -GGU-GG-A- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---AA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CA------ ---------- 451 ---C------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- 701 --------U- ---G---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UAC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGA----- --GCGA---- ----UUG-CU G--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-CG-GU CA----ACUC CAC....... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Buchnera-APS 1570 bp DEFINITION Buchnera-APS 1570 bp, 1570 bases, 50E8619E checksum. ORIGIN 1 ..UGAAGUUG A-CUA--AAA ACAGUC-GCU ---GUUU-A- -G-U---UU- 51 ---------- -----UUAA- ---------- -------A-- -AAU-UA-A- 101 AAAGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G AGC-AGGG-U GCC-AGA--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------UCU- -GGAAA-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCUUA U-GAC---UA GUGCA--ACA 301 GAAAAUAA-A CCACC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------U -----UU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---UA----- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- AUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- -U-------- -----A---- 701 --------U- ---A---A-A --AA-U-A-- UGGCCAG--- G-GUGAAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------U GGUAAGAGCA 801 -CACC-G--- CAU---AAU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAAUUC --AUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAAGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AUAGG AU-A--AAUU 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------U UU--UG-UAC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-A-CU ---------- 1151 ---------- ---------- ---UCUU--A -AACCU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-AUU-A 1301 G-UAA----- --GUGA---- ----UUG-CU A--A-UCU-A GAUGAAUGAC 1351 UGUUAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------AAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AC-GA GU----CAAC UUCAAUAAC. .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.vulgaris 1570 bp DEFINITION P.vulgaris 1570 bp, 1570 bases, A2A39153 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GCC-AGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---AA GUGCA--GCA 301 GAGAGUAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------C- ---A---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAC---AGC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUU --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AAG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AU--GG-UGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-A-UU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-A 1301 G-CGC----- --GCAA---- ----GUU-CU G--G-CCU-A GAUGAAUGGU 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacacggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.shigelloides 1570 bp DEFINITION P.shigelloides 1570 bp, 1570 bases, F972DEF6 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGCG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCGA C-GAC---UA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---UG----- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- UUU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- -C-------- -----A---- 701 --------C- ---A---G-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GAC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAGUUC --GUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-UAA-ACUC CACCC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG UU-C--AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GG-UGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-A-UU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AACCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-A 1301 G-UGC----- --GCGA---- ----GUG-CU G--G-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.aerogenes 1570 bp DEFINITION P.aerogenes 1570 bp, 1570 bases, 10A6AA98 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUA -CAUA----G GGC-AGAG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GAC---CA GUGCA--GCA 301 GAGAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------G 351 AUG------- ---------- ---------G -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A AUU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---A-G --AU-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---GCG- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACACGUC --AUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-UAA-ACUC CACUC---G- UAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA UC-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--CG-AGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-U-UG ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -GAUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCG-U 1301 A-UGU----- --GUAA---- ----AUG-UA C--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS H.influenza 1570 bp DEFINITION H.influenza 1570 bp, 1570 bases, D4766E2B checksum. ORIGIN 1 .....CGAGU U-GGU--UAG ACAAUC-GCU ---GGUU-U- -A-U---UGA 51 AGCCCUUAAC CGUA-UUUA- -UACGACCUA GUGGGACA-- -AGU-AA-A- 101 CGAGAGGAAA GUCCGAGCUA -CACA----G GGC-AGAG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGGCG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCGA C-GAC---CA GUGCA--ACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GU------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -----A-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- UGC---CGU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAACGU --GCA---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-UAA-ACUC CACUC---G- UAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAA CU-C--A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--UG-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -AGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCG-G 1301 C-AGA----- --GUAA---- ----UUU-GU C--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 UGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACUCGGC 1501 UUAU-CG-AC CA----ACUC AAAAC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.limicola 1570 bp DEFINITION C.limicola 1570 bp, 1570 bases, 6686FB9C checksum. ORIGIN 1 .....AAACC GCAAG--UGU GCAGUC-GCU ---GUAU-G- -G-C------ 51 ---------- -----UUGAC ---------- ---------- --GC-UG-U- 101 GCAGAGGAAA GUCCGAACUU -CACA----G GGC-AGGGU- GCCGGUCGAG 151 AAC------- ----CUG--- ---------- GUUCAAGGCC -GGGGG-CA- 201 --GCG----- G-U------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- -----ACC-- -GUC-UGUCA C-AGA---GA GUGCA--ACA 301 GAAAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-C ---C-G-G-- -AGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- GUG---CGU- CAGC------ ---------- ---------- 851 --AAUGC-CG --UAC---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AU G-AAA-ACCU C-CCC---G- AAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AUGGA AG-C------ 1001 -----UUUUU --CC------ ---------G CAA------- ---------- 1051 --GG------ AAAGA----- -A---G-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ----AAC--G -UUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCA----- ---------- ---------- ---------- -U-------- 1301 ---------- ---------- ---------- -------C-A GAUAAAUGAC 1351 UGCA------ -GCUU-C--- AU--C---A- ---------- ---------- 1401 ---------- -------CUC GA-------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---U-G-A-- ----UG-A-- U--U-C--AC AGAAUUCGGC 1501 UUAC-AG-CU UC----GGUU UCAGC..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.tepidum 1570 bp DEFINITION C.tepidum 1570 bp, 1570 bases, A5AAB6AC checksum. ORIGIN 1 .....aaacc gcaag--ugu gcagUC-GCU ---GUAU-G- -G-U------ 51 ---------- ------AUA- ---------- ---------- --AC-CA-U- 101 GCAGAGGAAA GUCCGAACUU -CACA----G GGC-AGGGU- GCCGGUCGAG 151 AAC------- ---GUUU--- ---------- GUUCAAGACC -GGGGG-CA- 201 --GCG----- G-C------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- -----GCU-- -GUC-UGUCA C-AGA---GA GUGCA--ACA 301 GAAAGCAA-A CCGCU----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------A-C ---C-G-G-- -AGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGGG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- GCA---GGU- CAGC------ ---------- ---------- 851 --AAUGC-CC --UGC---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AU G-AAA-ACCU C-CCC---G- AAGCAAGGCC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AAGGA AG-CA----- 1001 -----UUUCC --U------- ---------G CAA------- ---------- 1051 ---G------ GGAAG----- AA---G-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----AA-UG -UUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCA----- ---------- ---------- ---------- -U-------- 1301 ---------- ---------- ---------- -------C-A GAUAAAUGGC 1351 UGCA------ -ACAU-C--- AC--U---A- ---------- ---------- 1401 ---------- -------CUU GA-------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---U-G-G-- ----UG-A-- U--G-G--AC AGAAUUCGGc 1501 uuac-ag-cu uc----gguu u......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS B.thetaiotaomicron 1570 bp DEFINITION B.thetaiotaomicron 1570 b, 1570 bases, 148BFB13 checksum. ORIGIN 1 .....GCAGU U-GGC--CGG UCUGUC-GCG ---UGCG-C- -G-------- 51 ---------- ------UUU- ---------- ---------- --C--GU-G- 101 CAGGAGGAAA GUCCGGGCAA -CACA----G AGC-AUCC-U ACU-UCC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GAA- -AGCUG-UC- 201 --C------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- ---G-GGUA- G-AG----UA ACGUA--GAA 301 GAAAAUA--A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------U -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --U------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---G-G ---A-G-A-- -GGUAAG--- G-GUGAGAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -UACCAG--- CAG---CAU- G-GU------ ---------- ---------- 851 --GA-CA-UG --UGG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------GU A-C---GUCU UAGGA---G- UUGUAAGGUC AUGU------ 951 ---------- ---------- ---------- ----AAACCG GC-GU-UA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UG--AG-AGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-CC ---------- 1151 ---------- ---------- --------AU -GUCGG---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------A GGGU--AG-A 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AAA-GUG-U 1301 C-GUG----- --GUGA---- ----CAC-GC C--A-CUC-A GAUAAAUGAC 1351 AGGC------ -ACCU-U--- AU-------- ---------- ---------- 1401 ---------- --------UA U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -------A-- ----UA-A-- G--G-U--AC AGAACUCGGC 1501 UUAU-AG-GC UG----ACUG CUUUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.gingivalis 1570 bp DEFINITION P.gingivalis 1570 bp, 1570 bases, 786A9DD3 checksum. ORIGIN 1 ......CAGC A-GAU--CGG UCUGUC-GCU ---CACU-C- -U-------- 51 ---------- -----UUCG- ---------- ---------- ---A-GA-G- 101 UGGGAGGAAC GUCCGGGCAA -CGCA----G AGC-ACCA-U CCU-UCC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GGA- -AGUUA-CU- 201 --C------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- ---G-GGUA- A-AG----GA GCGUA--GAA 301 GAGAAUG--A CCGCC----- ---------- ---------- --------AU 351 UUU------- ---------- ---------C -----CA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UGAG---- ---------- 451 ---UUG--UC UG-UGC---- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- -GU-A-CG-G -------A-- CU-------- -----A---- 701 --------C- ---G---U-G ---G-A-G-- -GGUAAG--- G-GUGAGAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -UACCGG--- AUG---CAG- CGGU------ ---------- ---------- 851 --GACGC-UG --CAU---GC C--------- ---------- ---------- 901 --------GU A-C---GUCU GAUGG---G- UUGUAAGAUC AUGU------ 951 ---------- ---------- ---------- ----AUACCG GC-G--CAU- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------G UA---G-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----GA--U -GCCGG---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------G GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-A 1301 U-GCG----- --GUGA---- ----CGC-AC G--G-CCA-A GAUAAAUGAC 1351 AGAC------ -GCUC-U--- GG--C---U- A--------- ---------- 1401 ---------- -------CGU G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --UG-G-C-- ----CGUG-- A--G-U--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-AU CU----GCUG CUUUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS F.yabuuchiae 1570 bp DEFINITION F.yabuuchiae 1570 bp, 1570 bases, A477D8D checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccggacAA -CACA----G AGC-AACU-C ACU-UCC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GGA- -AGGCU-CC- 201 --GU------ ---------- ---------- ----UCAG-- ---------- 251 ---------- ---------- -G-C-GGAGA C-AGC---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UU------- ---------- ---------G -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-A ---U-G-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 CGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACGGU--- AUU---GCA- UGGC------ ---------- ---------- 851 --GACAU-GG --AUU----A C--------- ---------- ---------- 901 ---------G G-UAA-ACCU UGAGU---G- UUGAAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGUU AC-GAAAC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAA-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-C-UU C---UUUUAC 1151 ----UUCG-- ---GUAAGA- -------UUC -GUAAU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGAU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GUC-U 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGG-CA G--A-UCU-A GAUAAAUGAU 1351 AGAA------ -AACC-G--- A--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----UC-G-- G--UGU--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.jejuni 1570 bp DEFINITION C.jejuni 1570 bp, 1570 bases, 2916348C checksum. ORIGIN 1 ......AAGC A-UAG--UAA AUGCUC-GC- ---UUCU--- ---------- 51 ---------- -----UUUU- ---------- ---------- --------A- 101 GGAGAGGAAA GUCCGAGCUG -C--U-AAAG ACA-AACA-U UCC-AUC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GAU- -GGCUA-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCUAA G-GGA---UA GUGCA--ACA 301 GAAAGAAA-A CUACC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AC------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -----G-U-- -GGAAAA--- G-GUGAAAC- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAAAGCC 801 -CACCAG--- CGA---UUU- UGGU------ ---------- ---------- 851 --AACAA-UU --UCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AU G-UAA-ACCC AAUGU---G- CAGCAAGAAG ---------- 951 ---------- ---------- ---------- -------GGA UG-G--U--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -------UAG C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CU------ ---UU-G--- ---------- 1151 ---------- ---------- -----UU--U -UAACC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- -------C-U 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-UUU-U 1301 G-UUU----- --GCAA---- ----AAA-CA A--A-ACU-A GAUAAAUGAG 1351 CAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AGAC AGAACUCGGC 1501 UUAU-CG-CU AU----GCUU -UUU...... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS H.pylori-26695 1570 bp DEFINITION H.pylori-26695 1570 bp, 1570 bases, B3CEF69A checksum. ORIGIN 1 ......CGCA U-UAG--AAG AUGGUC-GCU ---AUU---- ---------- 51 ---------- -----UUAG- ---------- ---------- --------A- 101 AUAGAGGAAA GUCCGGGCUA -C--A--UUA GAC-AAAA-U UCC-AUC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GAU- -GGCUA-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCUAA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -U-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UUA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- -------A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-A--- GAG---CUA- AAGC------ ---------- ---------- 851 --AAUUU-AG --CUU---GU ---------- ---------- ---------- 901 ------UUGG G-CAA-ACCC AAUUU---G- UAGCAAGAAG CGCA------ 951 ---------- ---------- ---------- ----UGGUAA ------G--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U-------- ---------- ---------- 1101 ---------- ---------C U-AAA----- ---------- ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- ---UUG---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- AUACACGC-U 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGA-A 1301 U-AUU----- --GCAA---- ----AAU-AU U--U-CCC-A GAUAAAUGGC 1351 CAUCCAU--- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------UGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU--U-CU AA----UGCU -CAA...... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS D.desulfuricans 1570 bp DEFINITION D.desulfuricans 1570 bp, 1570 bases, 7D4002AC checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU C-GGA--CGG AUCGUC-GCC ---GCGG-G- -G-------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- ---C-UC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAAA----G GGC-AGAA-C GCU-GGA--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------UCC- -AGGGA-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCUC- C-GGA---CA GCGCC--ACA 301 GAAAGCAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- AUG---CCG- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAC-GG --CAU---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-CAU-ACCC CGUUC---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA AG-G------ 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----CG-GCC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-C-CG ---------- 1151 ---------- ---------- ----AAG--C -CUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-U 1301 G-UGG----- --GCAA---- ----CCG-CA C--U-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 GGUC------ -ACAC-G--- CG--G----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----C-C-- ----GU-G-- U--G-G--AC AGAACCCGGC 1501 UUAC-AG-UC CG----ACUC CCGCA..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS D.vulgaris 1570 bp DEFINITION D.vulgaris 1570 bp, 1570 bases, E7172F51 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU C-GGA--CAG GUCGUC-GUC ---GCGG-G- -U-C------ 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- --GA-CC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUU -CACA----G GGC-AGGA-C GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -AGGGG-GA- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----UCUC- C-GGA---GA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------C -----G---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------C ---G-C-G-- -GGUUAG--- G-GUGAAACA 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCAG--- UUG---CGGG UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAU-CG --CAA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-AAA-ACCC CGUCC---G- AAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG AG-CG-C--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-AAG-GUC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GA-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGG-U 1301 G-CAG----- --GUAA---- ----CUG-CA C--U-CCU-A GAGGAAUGAC 1351 GACC------ -CCCC----- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- -------G-- G--G-G--AC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-UC CG----ACUC CCACU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS G.sulfurreducens 1570 bp DEFINITION G.sulfurreducens 1570 bp, 1570 bases, F249AE5C checksum. ORIGIN 1 .....GAAGC A-GAA--CAG AUGGCC-GCC ---CUUC-G- ---------- 51 ---------- -----CGUG- ---------- ---------- -----CG-G- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CACA----G GGC-AUGG-U GCU-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -AGCGG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCCA G-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAGAGAAG-U CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACCGG--- GUU---CGG- CGGU------ ---------- ---------- 851 --GACGU-CG --GAU---GC C--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCA---G- GAGCAAGGCC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA AG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-AAG-GAU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CG ---------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-C 1301 G-UCG----- --GUAA---- ----CGG-CG G--U-CCC-A GAGGAAUGGU 1351 CAUC------ -GCCC-G--- CC--A---A- GGG------- ---------- 1401 ---------- -------GUA A--------- ---------- ---------- 1451 ----C----- C-CG-C-G-- ----GC-G-- G--G-A--AC AGAACCCGGC 1501 UUAU--G-GG CU----GCUU CGACCA.... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.xanthus 1570 bp DEFINITION M.xanthus 1570 bp, 1570 bases, 5488EB08 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAGA----G GGC-AGGG-U GCU-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -AGUCG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCGC A-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------U -----UC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G AAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---G-G ---G-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGU---CCG- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUC-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------UCG G-UAA-ACCC CGCCU---G- GAGCAAGAGC CAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGAG CG-C------ 1001 -----GUCCU CGCC------ ---------G UAC------- ---------- 1051 --GG------ AGGAC----- -A--GG-GAU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CC ---------- 1151 ---------- ---------- -----AU--G -CGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-C 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------G AUGA-GGC-C 1301 C-CUGG---- --GCAA---- ---CCAG-GG C--C-CUU-A GAUGAAUGUU 1351 CACC------ -GCCC-A--- UC--C---C- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GAA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---G-G-G-- ----GU-G-- G--G-A--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.maris 1570 bp DEFINITION P.maris 1570 bp, 1570 bases, F43D8F35 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-ACGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -ACCGU-CC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GGACA G-GGA---AA GUGCA--ACA 301 GAAAGUAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --AG------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------C- ---U---G-G ---C-C-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---ACC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GU --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCG---G- GUGCAAGACC AAG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGGG AG----CA-- 1001 -----GUUCU --GG------ ---------U UCG------- ---------- 1051 --CC------ AGAAC----- --ACGG-AUC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GA-U-CC GU-------- 1151 ---------- ---------- --UACGA--- -CUUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--CG-G 1251 UCGCG----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-U 1301 G-CAG----- --GCAA---- ----CUG-CG G--U-CCC-A GAUAAAUGGC 1351 CACUCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.staleyi 1570 bp DEFINITION P.staleyi 1570 bp, 1570 bases, CFB1EBC2 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GAC-AGGG-U GGU-CGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCG- -ACCGG-UC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GAUCA G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------U -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---GCA--UG AG-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------C C--------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- -------CCC GUCAA----- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- --G-G-UU-U -------GAU UG-------- -----U---- 701 --------C- ---U---G-C ---AUG-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAG---UCG- AGGC------ ---------- ---------- 851 --GACUC-GG --CUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CGCCC---G- GAGCAAGACC AAG------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGAG AG----CAU- 1001 -----GUUGU --CGGU---- --------GU CACA------ -------G-- 1051 C-CG------ ACAGC----- --CGGA-AUC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-UC------ ---GG-U-UU CG-------- 1151 ---------- ---------- --UAUGA--- -CUCUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCC----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCU-A 1301 G-CGA----- --GCAA---- ----UUG-CU A--G-CCU-A GAGAAAUGGU 1351 CGUC------ -AGAC-G--- UU--U---U- CGA------- ---------- 1401 ---------- -------UCC G--------- ---------- ---------- 1451 ----U----- C-GA-A-G-- ----AG-C-- C--C-A--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS V.spinosum 1570 bp DEFINITION V.spinosum 1570 bp, 1570 bases, 5124EA68 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAC -C--U--CAG GGC-AGUG-U GCCGUGU--- 151 ---------- ---GAAA--- ---------- ------ACGC -GGGGG-CU- 201 --GGC----- G-GC------ ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- --G--CUU-- -C-C-GGUCA C-GGA---AA GUGUC--ACA 301 GAAAACAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------G -----G---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G CAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------C ---U-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACC-G--- CUC---CGA- CUGA------ ---------- ---------- 851 --AAGGA-AG --GAG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG A-CAA-ACCC CACAC---G- GUGCAAGAC- AGAA------ 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGGG G-----AA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--CG-GCC C--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CCUG---- ---GC-C-G- --CACUGACU 1151 CC--GCAA-- GG-AGUUGG- --GAUAA--- --CCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU-AUUAG 1251 UCGCACCUCG C--------G CAAA------ ---GCGGGG- -----AGC-A 1301 C-GGGGC--- --GCAA---G C---CCC-GG G--C-U---A GAGAAAUGAC 1351 CGCC------ -ACCU-U--- UU--G---C- G--------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --CG-C-G-- ----GG-A-- G--G-C--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.aurantiacus 1570 bp DEFINITION C.aurantiacus 1570 bp, 1570 bases, C5FF6EA checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G AGC-AGGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAACAG-A CUGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------U -----U---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------A ---G-C-C-- -GGUGAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G AGUAAGUGCC 801 -CACC-G--- CGU---CAU- CGGU------ ---------- ---------- 851 --GACGG-UG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACCU---G- GAGCAAGGCC AAGA-AGAC- 951 -C-------- -GUGA----- -----GGUCG ------CGGA CG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU-GAG-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-UG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUCU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCGCAGCC ---------- GAAA------ ----GGCUG- --GA-GGA-C 1301 A-CCA----- --GCAA---- ----UGG-UG U--U-CAC-A GAUGGAUGAU 1351 CACC------ -GGCC-C--- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GGC G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- -----G-G-- G--C-U--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS H.aurantiacus 1570 bp DEFINITION H.aurantiacus 1570 bp, 1570 bases, 9D7E4FCB checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CAUA----G GGC-GAAG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAAUG-- ---------- ------CCU- -GGGAG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAACAG-A CUGUC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------U -----U---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------A ---G-C-C-- -GGUGAG--- G-GUGAAAC- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACC-G--- CGU---CAU- CGGU------ ---------- ---------- 851 --GACGG-UG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-CAA-ACCC CACCU---G- GAGCAGGGCC AAGA-AGAC- 951 -C-------- -GUGA----- -----GGUCG ------CGGA CG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU-GAG-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-U-UG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUUC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CUGCGCAGCC ---------- GAAA------ ----GGCUG- --GA-GGA-C 1301 A-CCA----- --GCAA---- ----UGG-UG U--U-CAC-A GAUGGAUGAU 1351 CACC------ -GGCC-C--- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GGC G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- -----G-G-- G--C-U--ac agaauccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.ferrooxidans 1570 bp DEFINITION A.ferrooxidans 1570 bp, 1570 bases, ABCDE561 checksum. ORIGIN 1 .....GGAGU G-GGC--CAG GCGACC-GCC ---GCGG-A- ---------- 51 ---------- -----GCAA- ---------- ---------- -----UC-C- 101 GGGGAGGAAA GUCCGGGCUC -CAUA----G GGC-AAGG-C GCC-GGU--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -GGGGG-GC- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----GCCUA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAUAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------A 351 AGC------- ---------- ---------G -----C---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------G UAA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CAU---UUC- CGGU------ ---------- ---------- 851 --AACGG-AA --AUG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AGG G-AAA-ACCC CGCCU---G- GAGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCG UG-C--GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--AC-CGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-G-GU ---------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CACGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-U 1301 G-UGC----- --GUAA---- ----GUG-CA G--G-CCU-A GAGGAAUGGU 1351 CGUCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGAC AGAACCCGGC 1501 UUAU-CG-GC CC----ACUC CAAUU..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.luteus 1570 bp DEFINITION M.luteus 1570 bp, 1570 bases, 80F92418 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAC -CGCA----G AGC-AGGA-U GGU-GGA--- 151 ---------- ---CAACA-- ---------- ------UCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGC---CA GUGCC--ACA 301 GAGAGAAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------C -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C GCU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------G- ---C---G-C ---G-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGG---CCC- CGGU------ ---------- ---------- 851 --GACGG-GG --CCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CAUCC---G- GUGCAAGGCC GAA------- 951 ---------- ---------- ---------- -----CAGGA CG-C--GUC- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- AC-GAG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CC A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GCC-C 1301 G-CCA----- --GCGA---- ----UGG-CG G--G-CCC-A GAUGGAUGGC 1351 CGUC------ -ACCU-C--- GC--G---C- GGG------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ----C----- G-CG-C-G-- ----CG-A-- G--G-C--ac agaauccggc 1501 uuac...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS I.calvum 1570 bp DEFINITION I.calvum 1570 bp, 1570 bases, 863210A9 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G GGC-AGGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---CAACA-- ---------- ------GCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAACAAA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AA------- ---------- ---------C -----UG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---C-A ---G-U-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---GCC- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUG-GA --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGCCC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCG CA-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-ACC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-U-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 GCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-G 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CCG-A GAUGGAUGGC 1351 CGUC------ -GCCG-C--- GU--C---A- CCG------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ----C----- G-GA-G-A-- ----UG-C-- G--G-A.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.tumescens 1570 bp DEFINITION T.tumescens 1570 bp, 1570 bases, 6A6D585E checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G GGC-AGGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---CAACA-- ---------- ------GCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------C -----UG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CG-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---C-A ---G-C-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---UCC- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUG-GA --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGUCC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCG UG-U--GCA- 1001 -----CGGCG --CC------ ---------U UCG------- ---------- 1051 --GG------ CGUCG----- AG-GAG-ACC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-U-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CGCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 ACGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GCC-G 1301 G-CCA----- --GCAA---- ----UGG-UC G--G-CCC-A GAUGGAUGGC 1351 CGUC------ -GCCG-C--- GC--C---A- CCG------- ---------- 1401 ---------- -------GUA A--------- ---------- ---------- 1451 ----C----- G-GG-G-G-- ----CG-C-- G--G-A.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.luteus 1570 bp DEFINITION T.luteus 1570 bp, 1570 bases, 7BA621B2 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CAUA----G GGC-AGGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---CAACA-- ---------- ------GCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------C -----UG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------C-A ---G-C-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---UCC- GGGC------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GA --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGUCC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCG CA-U--GCAC 1001 -----GACGC ---------- ---------C UCG------- ---------- 1051 ---------- GCGUC----A GG-GAG-ACC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-U-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 ACGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-G 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGG-CC G--G-CCG-A GAUGGAUGAC 1351 CGUC------ -ACUG-C--- AC--CAACG- UCG------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ----C----- G-AC-G-G-- ----UG-C-- G--G-G.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.polymorpha 1570 bp DEFINITION S.polymorpha 1570 bp, 1570 bases, 7A0D7658 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .C--ACGGAA ACC-ACGG-U GCC-GGA--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------UCC- -GGCGG-CU- 201 --UCG----- G--------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ------CC-- -G-G-AGUCA G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAGCAGA- CCGCCAAAGG C--------- ---------- ---------- 351 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------G ---C-C-C-- -GGC--GAAA G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACC-G--- CGC---GGA- CGGC------ ---------- ---------- 851 --AACGG-AC --GCG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGGUC GAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGA UG-G--CAA- 1001 -----GAG-- ---------- ---------G UGA------- ---------- 1051 ---------- --CUC----- -A---G-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G GU-UuCCG-- ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----CG--C -CGUCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--UG-A 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCG-U 1301 C-CGG----- --GCAA---- ----CCG-GC C--G-CCU-A GAGGAAUGAU 1351 CGCC------ -CAUC-CCC- U--------- ---------- ---------- 1401 ---------- ------GUCA AA-------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----A-G-- ----GG-G-- U--G-G.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.phosphovorus-JCM9380 1570 bp DEFINITION M.phosphovorus-JCM9380 15, 1570 bases, 76C941CB checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACC----G AGC-AGGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAGCAAA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----AG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CC------ ---------- 451 ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U ACG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- 701 --------G- ---G---C-A ---C-G-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CAU---CCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --AUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-CAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGAUC AAGAAGGAU- 951 -GCC------ -CCCG----- ---GGCAUCC -----GCGGG AG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -UCGAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-C-CG AG-------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCA----- ---------- ---------- ---------- -CCA-GGC-G 1301 G-UCG----- --GCAA---- ----CGG-CC G--U-CGC-A GAUGGAUGAU 1351 CGCC------ -ACUC-G--- GG--C----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------UUC G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----G-C-- ----CC-G-- A--G-C.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS P.innocua 1570 bp DEFINITION P.innocua 1570 bp, 1570 bases, B0710C00 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G AGC-AGGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGC---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CC------- ---------- ---------G -----AU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---GCC--GG ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------C -------C-- GA-------- -----C---- 701 --------G- ---U---G-C ---C-G-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCGG--- CAC---CGU- GAGC------ ---------- ---------- 851 --GAUCA-CG --GUG---GC C--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCA GG-C------ 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -----G-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-C- ---------- 1151 ---------- ---------- -----UU--G -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GGC-C 1301 G-UCA----- --GCAA---- ----UGA-CG G--U-CCG-A GAUGGAUGAC 1351 CGUCCCA--- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CG.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.jensenii 1570 bp DEFINITION N.jensenii 1570 bp, 1570 bases, B6C51D3B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CGCA----G AGC-AAGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---CAACA-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------U -----CU--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CU------ ---------- 451 ---CCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------UU CAUU------ 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- CG-------- -----G---- 701 --------G- ---A---A-G ---A-G-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGU---GUC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCU---G- GAGCAAGAUC AAGAAGCCG- 951 -UUCC--UC- -UUCG--GA- --GGAACGGU -----GCGCA CA-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCC----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-U 1301 G-UCG----- --GCAA---- ----CGG-CA G--C-CCU-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -AACC-G--- GG--G---C- CAC------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ----G----- A-AA-C-C-- ----CC-G-- G--C-G-A.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.plantarum 1570 bp DEFINITION N.plantarum 1570 bp, 1570 bases, 6628E91E checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G AGC-AGGG-C GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UCC------ ---------- -CGAAUCCAG CGCCACCGGA CGAC------ 401 ----GGA--- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---------- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G AGCAAGAGAC 801 -CACCAG--- CAU---GCC- GGGC------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GC --GUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-CAA-ACCC CGCCC---G- GAGCAAGAUC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCA CA-C--GCA- 1001 -----GGU-- ---------- ---------U CCG------- ---------- 1051 ---------- --ACC----- GG-AAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GGC-C 1301 G-UCG----- --GCAA---- ----CGG-CG G--U-CGU-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CCUC-C--- UC--C---C- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GCA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---G-G-G-- ----CG-G-- A--G-G.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.albus 1570 bp DEFINITION N.albus 1570 bp, 1570 bases, BF3BBDD2 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G GAC-AGGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------U -----AC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CCA------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---G-U ---A-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCAG--- UCC---UCG- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAC-GA --GGA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCG UA-C--GA-- 1001 -----CGGUG ---------- --------UU AGUU------ ---------- 1051 ---------- CACUG----- GG--AG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GGC-C 1301 A-UCG----- --GCAA---- ----CGA-UG G--U-CCG-A GAUGGAUGGU 1351 CGCCGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CU.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.luteus 1570 bp DEFINITION N.luteus 1570 bp, 1570 bases, 3E10524B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G GAC-AGGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GC------- ---------- ---------U -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CU------ ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CC-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 --------A- ---G---G-U ---A-G-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCAG--- UCC---UCG- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAC-GA --GGA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCA UG-C--GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- CC-GAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G U-CC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CAUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GAC-C 1301 A-UCG----- --GCAA---- ----CGA-UG G--C-CCG-A GAUGGAUGAU 1351 CGCCGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------UC.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.fulvus-KCTC9580 1570 bp DEFINITION N.fulvus-KCTC9580 1570 bp, 1570 bases, 29D1F8B8 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CGAA----G GGC-AGCG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------A 351 GCG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --UG------ ---------- 451 ---AGC--GA AU-------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U CCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ------GU-U -------C-- GC-------- ----CU---- 701 --------C- ---A---GGU ---G-C-G-- -GGUGAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CUC---CGC- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUG-CG --GAG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACGU---G- GAGCAAGGCC AAGAAGGAC- 951 -GGCG--G-- -GCAA---C- --CACCGUCC -----GCGCG AG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CUCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GGC-U 1301 G-CCG----- --GCAA---- ----CGG-CA G--C-CCU-A GAUAGAUGAU 1351 CGCCAG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------C.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Nocardiodes-NSP41 1570 bp DEFINITION Nocardiodes-NSP41 1570 bp, 1570 bases, 9DDE56E9 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G AGC-AGGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CGU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---G-G ---C-G-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGCAAGAGCC 801 -CACCAG--- UGC---GCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GC --GCA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-CAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCA CA-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-U 1301 G-UCG----- --GCAA---- ----CGG-CA G--C-CCU-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CCCU-C--- G--------- ---------- ---------- 1401 ---------- -------GAG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ----CG-A-- G--G-G.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS N.simplex 1570 bp DEFINITION N.simplex 1570 bp, 1570 bases, 75CA0B05 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G AGC-AGGG-U GGU-GGG--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------CCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UC------- ---------- ---------C -----GG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------C-C ---G-G-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGCAAGAGCC 801 -CACCAG--- UGC---GCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GC --GCA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-CAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGACC AGAC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGCA CA-C--GA-- 1001 -----CGGC- ---------- ---------C UCG------- ---------- 1051 ---------- -GCCG----- -A-GAG-GGU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------A C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UGUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GGC-U 1301 G-CCG----- --GCAA---- ----CGG-CA G--U-CCU-A GAUGGAUGGU 1351 CGCCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- -------G.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.fastidiosum 1570 bp DEFINITION A.fastidiosum 1570 bp, 1570 bases, FFCFBCFE checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G AGCAACGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -ACCCA-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGUGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAUCAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------A 351 GCG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GC------ ---------- 451 ---CGC--UC ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------G -------A-- GC-------- -----A---- 701 --------G- ---C---G-G ---UGC-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACCAG--- CGC---UCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC AAGA-GAGUC 951 GCGUG-GCGC -UUCG-GCGG UGCACGGCUU -----GCGCU GA-------- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----CG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-C-CG ---------- 1151 ---------- ---------- ----AUG--- -UCAGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UUGCA----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-G 1301 U-CCA----- --GCAA---- ----UGG-GC G--U-CCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCCCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CG.. .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS A.erythreum 1570 bp DEFINITION A.erythreum 1570 bp, 1570 bases, 19D95739 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 .......... .......... .CACA----G AGC-ACGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---CAACA-- ---------- ------GCC- -ACCCA-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGUGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAGA- CCGCC----- ---------- ---------- ---------A 351 GCG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CC------ ---------- 451 ---GCG--GC C--------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- -------G-G -------C-- CA-------- -----C---- 701 --------G- ---G---G-G ---UGC-G-- -GGCAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACCAG--- CGA---CGU- CGGC------ ---------- ---------- 851 --GACGG-CG --UCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCG---G- GAGCAAGACC AAGA-GGGC- 951 -GC------- -UCCG----- ----GCGCCU -----GCGCU GA-------- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- ----CG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GU-C-CG ---------- 1151 ---------- ---------- ----ACG--- -UCAGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-A 1301 C-GCA----- --GCAA---- ----UGC-GU G--A-CCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CCCC-A--- GC--C----- ---------- ---------- 1401 ---------- -------CUC G--------- ---------- ---------- 1451 ---------- -----G-G-- ----CC-G-- G--G-G.... .......... 1501 .......... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.lividans 1570 bp DEFINITION S.lividans 1570 bp, 1570 bases, 9F09E60D checksum. ORIGIN 1 .....CGAGC C-GGG--CGG GCGGCC-GCG ---UGGA-G- -U-C---CC- 51 ---------- -----UCAC- ---------- -----G-G-- --GA-CU-U- 101 CCCGAGGAAC GUCCGGGCUC -CACA----G GGC-AGGG-U GAU-GGC--- 151 ---------- ---UAaCG-- ---------- ------gCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------A -----GG--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---C-C ---C-C-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- UGC---CCA- GGGC------ ---------- ---------- 851 --GACCU-GG --GCA---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGUC AAGA-AGGA- 951 -AGCG----- CCCCGG---- --UGCUUCCU -----GCGCG GA-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GGC-C 1301 G-GUG----- --GCAA---- ----CGC-CG G--U-CCU-A GAUGGAUGGC 1351 CGUC------ -GCCG-A--- CG--G---GA CCC------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ----G----- G-CC-C-C-- ----GU-C-- G--G-A--AC AGAACCCGGC 1501 GUAC-AG-CC CG----ACUC GUCUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.bikiniensis 1570 bp DEFINITION S.bikiniensis 1570 bp, 1570 bases, F59AFE02 checksum. ORIGIN 1 .....CGAGC C-GGG--CGG GCGGCC-GCG ---UGGG-G- -G-U---C-- 51 ---------- -----UUCG- ---------- -------G-- --AC-CU-C- 101 CCCGAGGAAC GUCCGGGCUC -CACA----G AGC-AGGG-U GGU-GGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCC- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -GG------- ---------- ---------G -----GA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---G---U-C ---C-U-C-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---CUG- AGGC------ ---------- ---------- 851 --GACUC-AG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACUC---G- GAGCAAGGUC AAGA-GGGG- 951 -ACAC----- -CCCG----- --GUGUCCCU -----GCGCG GA-U--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UCCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-A 1251 CCGCA----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-C 1301 G-GCG----- --GCAA---- ----CGC-CG G--C-CCU-A GAUGGAUGGC 1351 CGUCG----- -CCCC-GA-- CG--A---C- C--------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- --GG-U-C-- ----CC-G-- G--G-G--AC AGAACCCGGC 1501 GUAC-AG-CC CG----ACUC GUCUG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS C.diphtheriae 1570 bp DEFINITION C.diphtheriae 1570 bp, 1570 bases, 435DCE14 checksum. ORIGIN 1 .....UGAGC C-GGC--UGG GCGAUC-GCG ---ACUU-U- -G-C---GUA 51 C-CACAU--- ----GCGAUG A------ACA U-GGUGGC-- --GC-AA-G- 101 GACGAGGAAA GUCCGGACUC -CACA----G AGC-ACGG-U GAU-UGU--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------ACA- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGC---AA GUGCA--ACA 301 GAAAGUAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -UA------- ---------- ---------G -----AA--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------U-U ---C-U-A-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CGA---GGU- AGGU------ ---------- ---------- 851 --GACUA-CC --UCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-UAA-ACCC CACUG---G- GAGCAAGGC- AUUA-GGGC- 951 -GUAC-CGUC GUUUCAGACG --GUAUGUCU -----GCACG AA-C--GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU-GAA-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-UG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -UUCGU---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--A--G 1251 CUGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-G 1301 G-CCA----- --GUGA---- ----UGG-UU U-CG-UCC-A GAUGGAUGAU 1351 CGCC------ -GCUG-A--- UC--U---C- CG-------- ---------- 1401 ---------- ------CUUG U--------- ---------- ---------- 1451 ---------- C-GG-G-G-- ----GU-G-- A--G-U--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAU-AU-GC UG----GCUC AUUCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.tuberculosis 1570 bp DEFINITION M.tuberculosis 1570 bp, 1570 bases, 50C99FD4 checksum. ORIGIN 1 .CGGAUGAGU U-GGC--UGG GCGGCC-GCG ---GCUC-G- -C-G---UAG 51 G-GCUUG--U G---UGGAUU -----CACGA GGUUCA-G-- --CGUCG-A- 101 GUCGAGGAAA GUCCGGACUU -CACA----G AGC-AGGG-U GAU-UGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCA- -AUCCG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CGU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-G-U-- -GGCAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAU---UCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-CAA-ACCC CACCC---G- AAGCAAGGCC AAGAAGGCC- 951 -GCAC----- CGAAA----- --GUGCGGCC -----GCGCA GG-C--GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU-GAG-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-A 1301 C-CCG----- --GUAA---- ----CGG-UG U--G-UCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -GCCG-U--- GC--C---G- CCGU--UAGC ---------- 1401 ---------- -------UUG ---------- ---------- ----G--CU- 1451 -g-GU----- G-GC-G-G-- ----CG-C-- G--G-A--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CA----ACUC GUCCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.bovis 1570 bp DEFINITION M.bovis 1570 bp, 1570 bases, DE270D0C checksum. ORIGIN 1 .CGGACGAGU U-GGC--UGG GCGGCC-GCG ---GCUU-G- -U-G---UGG 51 A-UUC----- -----ACGA- ---------- GGUUCA-G-- --CGUCG-A- 101 GUCGAGGAAA GUCCGGACUU -CACA----G AGC-AGGG-U GAU-UGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCA- -AUCCG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CGU------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-G-U-- -GGCAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAU---UCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------AG G-CAA-ACCC CACCC---G- AAGCAAGGCC AAGAAGGCC- 951 -GCAC----- CGAAA----- --GUGCGGCC -----GCGCA GG-C--GC-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UU-GAG-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-A 1301 C-CCG----- --GUAA---- ----CGG-UG U--G-UCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -GCCG-U--- GC--C---G- CCGU--UAG- ---------- 1401 ---------- -------CUU G--------- ---------- -------GC- 1451 -U-GU----- G-GC-G-G-- ----CG-C-- G--G-A--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CA----ACUC GUCCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.leprae 1570 bp DEFINITION M.leprae 1570 bp, 1570 bases, 6563C703 checksum. ORIGIN 1 .CGGACGAGU U-GGC--UGG GCGGCC-GCG ---GCUC-G- -U-G---UCG 51 G-UCU----- -----GAAA- ---------G G-CCCG-G-- --UAACG-A- 101 GUCGAGGAAA GUCCGGACUU -CACA----G AGC-AGGG-U GAU-UGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCA- -AUCCG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCGC G-GGA---UA GUGCC--ACA 301 GAAAACAA-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AU------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CGC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-G-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAU---CCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --AUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------UG G-UAA-ACCC CACCC---G- AAGCAAGGUC AAGAAGGCU- 951 -GCAC----- UACAA----- --GUGCGGCC -----GCGCA GG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- UC-GAG-AGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-A 1301 C-CCG----- --GCAA---- ----CGG-UG U--G-UCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -GCCG-C--- GC--C---A- CCGU--AGGC ---------- 1401 ---------- -------AAU ---------- ---------- ----G--CC- 1451 -u-GC----- G-UU-G-G-- ----CG-G-- G--G-A--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAU-AG-GC CA----ACUC GCCCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS M.avium 1570 bp DEFINITION M.avium 1570 bp, 1570 bases, 651496BF checksum. ORIGIN 1 .CGGACGAGU U-GGC--CGG GCGGCC-GCG ---GCUC-G- ---------- 51 ---------- -----UAUCC ---------- ---------- -----CG-A- 101 GUCGAGGAAA GUCCGGACUU -CACA----G AGC-AGGG-U GAU-UGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCA- -AUCCG-AG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CUCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AC------- ---------- ---------C ---------- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------CU CGC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------- ---G-G-U-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCAG--- CAC---CCC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GUG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-CAA-ACCC CACCC---G- AAGCAAGGCC AAGAAGGCC- 951 -GUGC----- CGCCG----- --GCACGGCC -----GCGCA GG-C--GU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- CC-GAG-GGU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-UC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- ---------G -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GGC-A 1301 C-CCG----- --GUGA---- ----CGG-UG U--G-UCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -GCCG-C--- GC--C---G- CCGG------ ---------- 1401 ---------- -------UUU U--------- ---------- ---------- 1451 ---CC----- G-GC-G-G-- ----CG-C-- G--G-A--AC AGAAUCCGGC 1501 UUAC-AG-GC CA----ACUC GUCCG..... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS Saccharomonospora-K180 1570 bp DEFINITION Saccharomonospora-K180 15, 1570 bases, 44061106 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GGU-UGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCA- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A CC-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-G ---C-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---CUC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAGA-GGGA- 951 -GCC------ -GUGA----- ---GGUUCCU -----GCGCA GG-CG-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-GAG-GGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-U 1301 G-CCG----- --GCGA---- ----CGG-CA G--G-CCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CAUC-G--- UC--C---G- CC-------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-GC-G-G-- ----AC-G-- U--G-G--ac agaacccggc 1501 guag...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.cyanea-K168T 1570 bp DEFINITION S.cyanea-K168T 1570 bp, 1570 bases, B21A34AB checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GGU-UGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCA- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------UU AAC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-G ---U-C-G-- -GAUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---CUC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAGA-GGGA- 951 -GCC------ -GCGA----- ---GGCUCCU -----GCGCA GG-CG-AU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-GAG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -CGA-GCC-U 1301 G-UCG----- --GCGA---- ----CGG-CA G--G-CCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CAUC-G--- CC--C---G- CC-------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-GC-G-G-- ----GC-G-- U--G-G--ac agaacccggc 1501 uuag...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.azurea-K161T 1570 bp DEFINITION S.azurea-K161T 1570 bp, 1570 bases, BDE272DE checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GGU-UGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCA- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAGAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------GU CUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-G ---C-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---CUC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAGA-GGGA- 951 -GCC------ -GCGA----- ---GGCUCCU -----GCGCA GG-CG-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-GAG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -GGA-GCC-U 1301 G-UCG----- --GCGA---- ----CGG-CA G--G-CCA-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CAGC-G--- UC--C---G- CC-------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-GC-G-G-- ----GC-G-- U--G-G--ac agaacccggc 1501 guag...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.glauca-K194 1570 bp DEFINITION S.glauca-K194 1570 bp, 1570 bases, BD6D5952 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GGU-UGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCA- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---CA GUGCC--ACA 301 GAAAACAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --G------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------A CAG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---C---G-G ---C-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---CUC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC AAGA-GGAA- 951 -GCC------ -CUCG----- ---GGCUUCU -----GCGCA GG-CG-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -C-GAG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCCGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -AGA-GCC-U 1301 G-UCG----- --GCGA---- ----CGG-CA G--G-CCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CAUC-G--- UC--C---G- CC-------- ---------- 1401 ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-GC-G-G-- ----GC-G-- U--G-G--au agaacccggc 1501 guag...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS S.viridis-K191 1570 bp DEFINITION S.viridis-K191 1570 bp, 1570 bases, D916893B checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcUC -CACA----G GGC-AGGG-U GGU-UGC--- 151 ---------- ---UAACA-- ---------- ------GCA- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAGCAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----CC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- --------AC CUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- -------G-G ---C-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAG- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G UGUAAGAGAC 801 -CACCAG--- CGC---CUC- GGGU------ ---------- ---------- 851 --GACCG-GG --GCG---GC U--------- ---------- ---------- 901 --------CG G-UAA-ACCC CACCC---G- GAGCAAGGCC AGAA-GGGA- 951 -GCC------ AUUGC----- ---GGCUCCU -----GCGCA GG-CG-UU-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U-GAG-GGC G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GU-C-CG A--------- 1151 ---------- ---------- --------UG -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU--AG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GCC-U 1301 G-UCG----- --GCGA---- ----CGG-CA G--G-CCC-A GAUGGAUGGU 1351 CGCC------ -CAGC-G--- CUG-C---G- CC-------- ---------- 1401 ---------- -------GUA A--------- ---------- ---------- 1451 ---------- G-GC-G-G-- ----GC-G-- U--G-G--ac agaauccggc 1501 guag...... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.album 1570 bp DEFINITION T.album 1570 bp, 1570 bases, 71C180CE checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAC -CGCA----G GGC-AGGG-U GGU-CGG--- 151 ---------- ---GAAA--- ---------- ------CCG- -ACCCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GAAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGC G-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAACGAC-A CCGCC----- ---------- ---------- --------UA 351 AGC------- ---------- ---------G -----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --GG------ ---------- 451 ---GAC--CG ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C ACG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------U -------G-A GU-------- -----C---- 701 --------U- ---C---G-C ---C-G-C-- CGGCAAG--- G-GUGAAAU- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------C GGUAAGAGCG 801 -CACCGG--- CAG---CGU- G-GU------ ---------- ---------- 851 --GA-CA-CG --CUG---GC C--------- ---------- ---------- 901 --------GG G-CAA-ACCC CACCC---G- GUGCAAGGCC AAGC------ 951 ---------- ---------- ---------- ------AGGG GC----GA-- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -U--GA-CGC U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GC-C-GA ---------- 1151 ---------- ---------- ---------- -GCCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- AGGU--AG-G 1251 CCGCAGGGCU C--------- CUCG------ ---GAGCCC- -----CGU-C 1301 C-GCGGUGGU CCCCAGGGAC UCGGCGC-GG G--C-G---A GAUGGAUGGC 1351 UGCUCU---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------CGac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS L.ferrooxidans-MK 1570 bp DEFINITION L.ferrooxidans-MK 1570 bp, 1570 bases, 80E196D6 checksum. ORIGIN 1 .......... .......... .......... .......... .......... 51 .......... .......... .......... .......... .......... 101 ...gaggaaa guccgggcAC -CAAA----G GGC-AAGG-C GCU-GGG--- 151 ---------- ---UAACU-- ---------- ------CCC- -AGUCC-CG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUGA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CGGGA A-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAAAAGAU-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -CG------- ---------- ---------G -----A---- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 451 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------U UCG------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 701 ---------- ---------U ---U-C-G-- -GGUAAG--- G-GUGAAAA- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------A GGUAAGAGCU 801 -CACC-G--- CGG---ACC- UGGU------ ---------- ---------- 851 --GACAG-GG --ACG---GC ---------- ---------- ---------- 901 -------AUG G-UAA-ACCC CGCCU---G- GUGCAAGACC AAAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGGG GG-C--GC-- 1001 -----UCCC- ---------- ---------G AAA------- -------G-- 1051 G-GA------ ---------U AA---G-AUU G--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-U-C- ---------- 1151 ---------- ---------- ----AAG--G -CUCCC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGU-AAG-G 1251 UCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GUG-C 1301 A-AGG----- --GUAA---- ----CCU-UG C--A-UCU-A GAGUAAUGGU 1351 CACC------ -CUGC-C--- UU--C---C- U--------- ---------- 1401 ---------- -------UUA G--------- ---------- ---------- 1451 ----G----- G--G-A-A-- ----GG-U-- A--U-G--ac agaacccggc 1501 uua....... .......... .......... .......... .......... 1551 .......... .......... // LOCUS T.thermophilus 1570 bp DEFINITION T.thermophilus 1570 bp, 1570 bases, 4591E2A3 checksum. ORIGIN 1 UGGCCCGGGA C-GAG--GGC GCGGUC-GCG ---CCGA-G- -G-G------ 51 ---------- ----CCGAAC ---------- ---------- --CC-CU-CG 101 GGUGAGGAAA GUCCGGGCAC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGG--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------CCU- -GGGCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GUAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAAGAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------C G----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---GGG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UUC------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- CC-------- -----C---- 701 --------C- ---G---G-U ---G-C-G-- -GGCAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGCG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCGC--- CUG---GCC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAG-GC --CGG---GG C--------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-ACCC CACCC---G- GUGCAAGGCC CGGU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG----G--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--GG-GCU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-C-CC ---------- 1151 ---------- ---------- GAGAGAA--- -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGA-UGG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-C 1301 G-GUG----- --GCGA---- ----CAC-CG G--U-CCC-A GAGAGAUGAC 1351 CGCGGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AAAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-GC-CU CG----UCCC GGAGG----- ---CGCCCG- A--------- 1551 -GCGU----- ---UCGGGCG // LOCUS T.aquaticus 1570 bp DEFINITION T.aquaticus 1570 bp, 1570 bases, FA01CC30 checksum. ORIGIN 1 UGCCCCAGGA U-AGG--GGU GCGGUC-GCG ---CCCG-G- -G-G---G-- 51 ---------- ----ACUUCC ---------- -------C-- --CC-CU-G- 101 GGUGAGGAAA GUCCGGGCAC -CAUA----G GGC-AGGG-U GCC-AGC--- 151 ---------- ---UAACG-- ---------- ------GCU- -GGGCG-GG- 201 ---------- ---------- ---------- ----GCAA-- ---------- 251 ---------- ---------- -----CCCGA C-GGA---AA GUGCC--ACA 301 GAGAAGAG-A CCGCC----- ---------- ---------- ---------- 351 -AG------- ---------- ---------C G----GC--- ---------- 401 ---------- ---------- ---------- --CG------ ---------- 451 ---GGG---- ---------- ---------- ---------- ---------- 501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 551 ---------- ---------- ---------- ---------C UU-------- 601 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 651 ---------- ---------- ---------- CC-------- -----C---- 701 --------C- ---G---G-U ---G-C-G-- -GGCAAG--- G-GUGAAAC- 751 GGUG------ ---------- ---------- ---------G GGUAAGAGCC 801 -CACCGC--- CUG---GCC- UGGC------ ---------- ---------- 851 --AACAG-GC --UGG---GG C--------- ---------- ---------- 901 -------ACG G-CAA-ACCC CACCC---G- GUGCAAGGCC CGAU------ 951 ---------- ---------- ---------- -----AGGCA GG----A--- 1001 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1051 ---------- ---------- -A--GG-GCU U--------- ---------- 1101 ---------- ---------G C-CC------ ---GG-C-CC ---------- 1151 ---------- ---------- GUUAGAA--- -CCUGC---- ---------- 1201 ---------- ---------- ---------- ---------- GGGA-UGG-G 1251 CCGCU----- ---------- ---------- ---------- -UGA-GGC-C 1301 G-GUG----- --GCGA---- ----CAC-CG G--U-CCC-A GAGAGAUGAC 1351 CGCGUA---- ---------- ---------- ---------- ---------- 1401 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 1451 ---------- ---------- ---------- ------AAAC AGAACCCGGC 1501 UUAC-GC-CC UA----UCCU GGGGA----- ---CCCCGA- GC-------- 1551 -GCAG----- --GCUCGGGG //