"Supplemental table 2: Statistic analyses performed with BAGEL (Townsend, 2004) for real-time measurement of expression of selected gene." "Error Model: Additive errors, estimating/constraining Coefficient of Variation terms" Constrained Coefficient of Variation: True Initial Mu[a|36] := 1.0000 Initial Coefficient of Variation[a|36] := 0.2000 Initial Mu[a|60] := 1.0000 Initial Coefficient of Variation[a|60] := 0.2000 Initial Mu[A|36] := 1.0000 Initial Coefficient of Variation[A|36] := 0.2000 Initial Mu[A|60] := 1.0000 Initial Coefficient of Variation[A|60] := 0.2000 Initial Mu[a|96] := 1.0000 Initial Coefficient of Variation[a|96] := 0.2000 Initial Mu[A|96] := 1.0000 Initial Coefficient of Variation[A|96] := 0.2000 Initial Mu step size: 0.50 Initial Variance/CV step size: 0.500 Burn in # generations: 20000 Period of sampling from the Markov chain: 20 Generations to be sampled: 10000 Full output of the chain: False Tuning depth maximum: 8 TF-1 to -4 are all C2H2 transcription factors Unique ID Common Name a|36 a|60 a|96 A|36 A|60 A|96 (-)97.5%[a|36] (-)97.5%[a|60] (-)97.5%[A|36] (-)97.5%[A|60] (-)97.5%[a|96] (-)97.5%[A|96] (+)97.5%[a|36] (+)97.5%[a|60] (+)97.5%[A|36] (+)97.5%[A|60] (+)97.5%[a|96] (+)97.5%[A|96] Coefficient of Variation[a|36] Coefficient of Variation[a|60] Coefficient of Variation[A|36] Coefficient of Variation[A|60] Coefficient of Variation[a|96] Coefficient of Variation[A|96] Coefficient of Variation(-)97.5%[a|36] Coefficient of Variation(-)97.5%[a|60] Coefficient of Variation(-)97.5%[A|36] Coefficient of Variation(-)97.5%[A|60] Coefficient of Variation(-)97.5%[a|96] Coefficient of Variation(-)97.5%[A|96] Coefficient of Variation(+)97.5%[a|36] Coefficient of Variation(+)97.5%[a|60] Coefficient of Variation(+)97.5%[A|36] Coefficient of Variation(+)97.5%[A|60] Coefficient of Variation(+)97.5%[a|96] Coefficient of Variation(+)97.5%[A|96] P(a|36>a|60) P(a|36>A|36) P(a|36>A|60) P(a|36>a|96) P(a|36>A|96) P(a|60>a|36) P(a|60>A|36) P(a|60>A|60) P(a|60>a|96) P(a|60>A|96) P(A|36>a|36) P(A|36>a|60) P(A|36>A|60) P(A|36>a|96) P(A|36>A|96) P(A|60>a|36) P(A|60>a|60) P(A|60>A|36) P(A|60>a|96) P(A|60>A|96) P(a|96>a|36) P(a|96>a|60) P(a|96>A|36) P(a|96>A|60) P(a|96>A|96) P(A|96>a|36) P(A|96>a|60) P(A|96>A|36) P(A|96>A|60) P(A|96>a|96) Mu Acceptance Ratio Coefficient of Variation Acceptance Ratio Acceptable? Ln Density of Likelihood NCU00104 HSP101 1.45708 2.47183 3.85314 1.04876 1 6.864 0.33988 0.52455 0.22775 0.21484 0.76543 1.14137 0.43343 0.69417 0.3233 0.27084 0.89512 1.06214 0.20501 0.20501 0.20501 0.20501 0.20501 0.20501 0.06027 0.06027 0.06027 0.06027 0.06027 0.06027 0.11524 0.11524 0.11524 0.11524 0.11524 0.11524 0.001 0.9682 0.9776 0.0001 0 0.999 0.9999 0.9999 0.0052 0 0.0318 0.0001 0.6289 0 0 0.0224 0.0001 0.3711 0 0 0.9999 0.9948 1 1 0.0035 1 1 1 1 0.9965 0.29 0.21 TRUE 10.14387 NCU08480 HSF2 1 1.92844 1.2119 2.75298 1.87243 2.2893 0.20014 0.37132 0.48182 0.34012 0.25582 0.40928 0.24679 0.42251 0.5256 0.374 0.32785 0.44874 0.18596 0.18596 0.18596 0.18596 0.18596 0.18596 0.05506 0.05506 0.05506 0.05506 0.05506 0.05506 0.10605 0.10605 0.10605 0.10605 0.10605 0.10605 0.0002 0 0.0011 0.0965 0.0001 0.9998 0.0197 0.5801 0.9982 0.1405 1 0.9803 0.9921 1 0.8961 0.9989 0.4199 0.0079 0.9896 0.0736 0.9035 0.0018 0 0.0104 0.0006 0.9999 0.8595 0.1039 0.9264 0.9994 0.35 0.19 TRUE 5.19976 NCU02776 CDC6 1.56649 2.90217 1 43.99706 3.42349 1.04004 0.3754 0.73639 2.78865 0.75507 0.27262 0.24649 0.55116 1.24402 1.79373 1.12965 0.43899 0.33479 0.18665 0.18665 0.18665 0.18665 0.18665 0.18665 0.05731 0.05731 0.05731 0.05731 0.05731 0.05731 0.11312 0.11312 0.11312 0.11312 0.11312 0.11312 0.0003 0 0.0001 0.9948 0.9882 0.9997 0 0.1386 1 1 1 1 1 1 1 0.9999 0.8614 0 1 1 0.0052 0 0 0 0.4027 0.0118 0 0 0 0.5973 0.34 0.19 TRUE -7.84974 NCU03795 CDC12 1 1.92418 1.37528 3.02915 1.83016 1.46743 0.21393 0.40123 0.52662 0.34467 0.30016 0.29001 0.27294 0.45102 0.55583 0.41137 0.37514 0.34458 0.1966 0.1966 0.1966 0.1966 0.1966 0.1966 0.05763 0.05763 0.05763 0.05763 0.05763 0.05763 0.11048 0.11048 0.11048 0.11048 0.11048 0.11048 0.0003 0 0.0015 0.0297 0.0212 0.9997 0.0078 0.6256 0.9736 0.9336 1 0.9922 0.9985 0.9997 0.9998 0.9985 0.3744 0.0015 0.9393 0.9329 0.9703 0.0264 0.0003 0.0607 0.3334 0.9788 0.0664 0.0002 0.0671 0.6666 0.39 0.2 TRUE 1.38695 NCU08297 CDC3 1 2.07978 2.3147 3.10925 2.04095 2.52054 0.22287 0.43346 0.58957 0.40066 0.4877 0.47947 0.28258 0.51016 0.64094 0.47817 0.58505 0.55334 0.2023 0.2023 0.2023 0.2023 0.2023 0.2023 0.06011 0.06011 0.06011 0.06011 0.06011 0.06011 0.11545 0.11545 0.11545 0.11545 0.11545 0.11545 0 0 0.0007 0 0 1 0.0145 0.5565 0.2526 0.1428 1 0.9855 0.9939 0.9443 0.9162 0.9993 0.4435 0.0061 0.246 0.0858 1 0.7474 0.0557 0.754 0.2998 1 0.8572 0.0838 0.9142 0.7002 0.48 0.21 TRUE 4.98002 NCU05939 CDC4A 1.28142 1.41407 1.38345 2.77307 2.93488 1 0.26684 0.27635 0.49714 0.50257 0.31803 0.19901 0.32368 0.35625 0.54632 0.53656 0.39076 0.24098 0.19409 0.19409 0.19409 0.19409 0.19409 0.19409 0.0576 0.0576 0.0576 0.0576 0.0576 0.0576 0.10822 0.10822 0.10822 0.10822 0.10822 0.10822 0.2498 0 0.0005 0.3203 0.9246 0.7502 0.0003 0.0003 0.5577 0.9757 1 0.9997 0.3426 0.9997 1 0.9995 0.9997 0.6574 0.9988 1 0.6797 0.4423 0.0003 0.0012 0.9739 0.0754 0.0243 0 0 0.0261 0.45 0.2 TRUE -0.5613 NCU06483 CDC4B 1 1.06089 1.3381 2.58126 2.0458 1.42807 0.2261 0.24298 0.48904 0.39926 0.3121 0.28751 0.28006 0.29164 0.51244 0.43721 0.38426 0.33676 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.06143 0.06143 0.06143 0.06143 0.06143 0.06143 0.11478 0.11478 0.11478 0.11478 0.11478 0.11478 0.3564 0 0.0013 0.0491 0.0328 0.6436 0 0.0007 0.0889 0.0567 1 1 0.9275 0.9989 0.9989 0.9987 0.9993 0.0725 0.9825 0.9848 0.9509 0.9111 0.0011 0.0175 0.352 0.9672 0.9433 0.0011 0.0152 0.648 0.49 0.21 TRUE 1.62819 NCU04179 TF-1 (C2H2) 1 3.88942 5.11979 1.43205 7.23046 4.5636 0.26526 0.92328 0.35193 1.32377 1.2054 0.99656 0.3359 1.01659 0.43139 1.57192 1.35847 1.10896 0.22258 0.22258 0.22258 0.22258 0.22258 0.22258 0.06508 0.06508 0.06508 0.06508 0.06508 0.06508 0.12186 0.12186 0.12186 0.12186 0.12186 0.12186 0 0.0281 0 0 0 1 1 0.0007 0.0719 0.2112 0.9719 0 0 0 0 1 0.9993 1 0.9503 0.9959 1 0.9281 1 0.0497 0.7389 1 0.7888 1 0.0041 0.2611 0.42 0.22 TRUE 11.26657 NCU08807 TF-2 (cre-1 repressor) 1 1.97594 9.66492 2.71426 8.48387 34.61137 0.27147 0.53218 0.63872 1.82412 2.42764 4.1273 0.38878 0.76473 0.88617 2.33321 3.14318 3.70187 0.21419 0.21419 0.21419 0.21419 0.21419 0.21419 0.06496 0.06496 0.06496 0.06496 0.06496 0.06496 0.12125 0.12125 0.12125 0.12125 0.12125 0.12125 0.0002 0.0001 0 0 0 0.9998 0.0571 0 0 0 0.9999 0.9429 0 0 0 1 1 1 0.2474 0 1 1 1 0.7526 0 1 1 1 1 1 0.26 0.22 TRUE 26.34827 NCU03184 TF-3 (C2H2) 1 1.96219 2.54686 2.75611 3.84971 4.6085 0.25592 0.45673 0.6142 0.75903 0.62491 0.90587 0.3365 0.60868 0.70197 0.8297 0.81481 0.91178 0.21971 0.21971 0.21971 0.21971 0.21971 0.21971 0.06479 0.06479 0.06479 0.06479 0.06479 0.06479 0.12348 0.12348 0.12348 0.12348 0.12348 0.12348 0.0003 0 0 0 0 0.9997 0.0507 0.0012 0.0776 0.0008 1 0.9493 0.0226 0.6542 0.0027 1 0.9988 0.9774 0.9738 0.1293 1 0.9224 0.3458 0.0262 0.0046 1 0.9992 0.9973 0.8707 0.9954 0.48 0.22 TRUE 8.85429 NCU03043 TF-4 (fle like) 1 2.00537 2.42309 1.44965 2.05071 4.78246 0.23269 0.43493 0.30653 0.41042 0.5305 0.81685 0.2975 0.53902 0.38234 0.49847 0.65027 0.8253 0.20952 0.20952 0.20952 0.20952 0.20952 0.20952 0.06169 0.06169 0.06169 0.06169 0.06169 0.06169 0.11304 0.11304 0.11304 0.11304 0.11304 0.11304 0.0003 0.0191 0.0008 0 0 0.9997 0.9598 0.438 0.1241 0 0.9809 0.0402 0.0142 0.0073 0 0.9992 0.562 0.9858 0.1872 0 1 0.8759 0.9927 0.8128 0.0004 1 1 1 1 0.9996 0.46 0.21 TRUE 9.95038 NCU00041 STE18 1.15697 1.29572 1.62816 1 1.2914 3.13649 0.18799 0.20255 0.15534 0.18343 0.24772 0.40351 0.22202 0.23821 0.16717 0.21827 0.26938 0.40698 0.1438 0.1438 0.1438 0.1438 0.1438 0.1438 0.04283 0.04283 0.04283 0.04283 0.04283 0.04283 0.08312 0.08312 0.08312 0.08312 0.08312 0.08312 0.1418 0.902 0.1832 0.0031 0 0.8582 0.9753 0.5137 0.0264 0 0.098 0.0247 0.0138 0.0008 0 0.8168 0.4863 0.9862 0.0407 0 0.9969 0.9736 0.9992 0.9593 0 1 1 1 1 1 0.37 0.5 TRUE 13.84156 NCU00622 TEA1 13.71649 24.93675 4.6413 37.3266 14.89497 1 2.81392 4.90597 6.01005 3.02769 1.12307 0.23327 3.24642 5.44604 6.42426 3.34304 1.55677 0.31929 0.19665 0.19665 0.19665 0.19665 0.19665 0.19665 0.05986 0.05986 0.05986 0.05986 0.05986 0.05986 0.11003 0.11003 0.11003 0.11003 0.11003 0.11003 0.0006 0 0.3097 1 1 0.9994 0.0133 0.9979 1 1 1 0.9867 1 1 1 0.6903 0.0021 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0.32 0.22 TRUE -20.17271 NCU10997 CON8 2.83071 169.7828 207.16814 1 161.58373 719.6569 0.76 42.50641 0.23918 34.09498 51.27324 99.55342 1.1333 56.59101 0.33753 46.96135 63.27902 84.67305 0.21313 0.21313 0.21313 0.21313 0.21313 0.21313 0.06462 0.06462 0.06462 0.06462 0.06462 0.06462 0.12856 0.12856 0.12856 0.12856 0.12856 0.12856 0 1 0 0 0 1 1 0.6088 0.1282 0 0 0 0 0 0 1 0.3912 1 0.1059 0 1 0.8718 1 0.8941 0 1 1 1 1 1 0.22 0.24 TRUE 43.58878 NCU07325 CON10 16.32115 7.83187 8.95186 1.60238 1 3.57777 3.18211 1.83709 0.45348 0.28455 2.36984 1.00493 3.14673 2.10308 0.72603 0.41559 2.88542 1.5838 0.25594 0.25594 0.25594 0.25594 0.25594 0.25594 0.07364 0.07364 0.07364 0.07364 0.07364 0.07364 0.14009 0.14009 0.14009 0.14009 0.14009 0.14009 1 1 1 0.995 1 0 1 1 0.2619 0.9985 0 0 0.9903 0 0 0 0 0.0097 0 0 0.005 0.7381 1 1 0.9997 0 0.0015 1 1 0.0003 0.38 0.28 TRUE -14.88789 NCU03753 CCG-1 1 39.98183 51.02058 1.01107 34.71775 36.85072 0.25762 8.42958 0.23751 7.11786 9.99368 7.6742 0.32757 8.75948 0.33456 8.11134 10.84728 8.68109 0.20725 0.20725 0.20725 0.20725 0.20725 0.20725 0.06179 0.06179 0.06179 0.06179 0.06179 0.06179 0.11705 0.11705 0.11705 0.11705 0.11705 0.11705 0 0.4764 0 0 0 1 1 0.804 0.0758 0.6786 0.5236 0 0 0 0 1 0.196 1 0.0224 0.3513 1 0.9242 1 0.9776 0.9635 1 0.3214 1 0.6487 0.0365 0.28 0.23 TRUE 29.18039 NCU08457 CCG-2 12.73149 3.17568 1 8.88244 4.91672 7.82532 2.36501 0.71434 1.66606 1.00989 0.24565 1.63366 2.48039 0.94003 1.87159 1.20927 0.3289 1.93112 0.20465 0.20465 0.20465 0.20465 0.20465 0.20465 0.05992 0.05992 0.05992 0.05992 0.05992 0.05992 0.11793 0.11793 0.11793 0.11793 0.11793 0.11793 1 0.9807 0.9999 1 0.9927 0 0 0.0081 1 0 0.0193 1 0.9999 1 0.7944 0.0001 0.9919 0.0001 1 0.0032 0 0 0 0 0 0.0073 1 0.2056 0.9968 1 0.39 0.23 TRUE -6.77116 NCU02500 CCG-4 2.6491 1 2883.63116 27.99548 86.03973 2141.28471 1.48826 0.5551 16.81056 52.13977 1313.17844 884.92128 651.62783 112.67751 695.67042 1341.07993 489.80795 682.05884 0.50463 0.50463 0.50463 0.50463 0.50463 0.50463 0.1804 0.1804 0.1804 0.1804 0.1804 0.1804 0.50587 0.50587 0.50587 0.50587 0.50587 0.50587 0.9925 0.0433 0 0 0 0.0075 0.0037 0 0 0 0.9567 0.9963 0.0023 0 0 1 1 0.9977 0.0069 0.0498 1 1 1 0.9931 0.862 1 1 1 0.9502 0.138 0.45 0.47 TRUE 53.46932 NCU00138 PRE1 1 2.29907 13.0758 1.88964 7.99981 5.46234 0.23305 0.50234 0.42526 1.6616 2.3705 1.09271 0.30224 0.61695 0.54996 1.90909 2.36993 1.28459 0.19698 0.19698 0.19698 0.19698 0.19698 0.19698 0.0595 0.0595 0.0595 0.0595 0.0595 0.0595 0.11356 0.11356 0.11356 0.11356 0.11356 0.11356 0 0.0005 0 0 0 1 0.8659 0 0 0 0.9995 0.1341 0 0 0 1 1 1 0.0105 0.9902 1 1 1 0.9895 1 1 1 1 0.0098 0 0.37 0.22 TRUE 17.40331 NCU05758 PRE2 1 1.04533 2.04575 1.14344 1.28465 1.43747 0.22261 0.23087 0.24453 0.28366 0.42404 0.28877 0.27598 0.27401 0.28671 0.32095 0.48619 0.32657 0.21025 0.21025 0.21025 0.21025 0.21025 0.21025 0.06197 0.06197 0.06197 0.06197 0.06197 0.06197 0.11998 0.11998 0.11998 0.11998 0.11998 0.11998 0.392 0.2159 0.1027 0.0003 0.0335 0.608 0.3109 0.1192 0.0003 0.0467 0.7841 0.6891 0.231 0.0037 0.0749 0.8973 0.8808 0.769 0.012 0.2278 0.9997 0.9997 0.9963 0.988 0.9754 0.9665 0.9533 0.9251 0.7722 0.0246 0.4 0.24 TRUE 3.20891 NCU04316 PPG2 1 54.74524 13.60599 2.93042 4.0584 39.79244 0.23809 9.06225 0.70674 0.89689 3.22413 7.66117 0.36199 8.52071 1.05616 1.22243 3.89837 8.56129 0.21047 0.21047 0.21047 0.21047 0.21047 0.21047 0.06265 0.06265 0.06265 0.06265 0.06265 0.06265 0.11938 0.11938 0.11938 0.11938 0.11938 0.11938 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0.9566 1 0 0.0282 0 0 1 0 0.9718 0 0 1 0 1 1 0 1 0.0434 1 1 1 0.24 0.24 TRUE 19.33167