Supplementary Table 4: RAD-seq genotypes of FY4 x Sigma-1278b (pilot) progeny strains in 3 and 4-spore tetrads (including imputed markers and inferred genotypes of missing spores)
#Allele calls:0=no data;1=Parent 1;2=Parent 2; 3,4,5=mixed (equal support, P1>P2, P2>P1);6=2:2 segregation inference Parent 1; 7=2:2 segregation inference Parent 2; 8=linkage inference Parent 1; 9=linkage inference Parent 1																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																																									
#Strain	Tetrad	Total_Reads	Consensus_Barcode	Consensus_Count	Total_Barcode_Count	No_Barcodes	Deep_Markers (>10-fold read depth)	Mixed_Deep	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr01	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr02	chr03	chr03	chr03	chr03	chr03	chr03	chr03	chr03	chr03	chr03	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr04	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr05	chr06	chr06	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr07	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr08	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr09	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr10	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr11	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr12	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr13	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr14	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr15	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16	chr16
#									8425	8464	43691	50432	51321	51371	52310	61451	73490	78346	78392	80554	103068	112136	113132	172280	180103	180134	182380	39405	39435	44047	70246	142364	192289	228581	341451	345172	350323	358049	367209	414046	438423	657562	657582	677110	678648	679168	689912	788441	43513	43528	51405	59465	230047	233245	234883	252425	258276	274530	199393	251506	263790	295469	304549	304677	324926	339115	351207	351214	351250	351862	354130	383227	383229	383874	409196	444672	445993	446016	464138	504540	504869	505795	512370	523418	523433	524270	524294	525868	525877	525883	526354	526357	551284	551290	553976	558325	680244	680252	760456	820541	848977	858496	870200	885734	890632	910905	917034	938759	1006510	1009143	1009163	1071771	1111239	1111246	1137538	1189463	1460932	1498235	1517502	1517708	15022	43744	43746	63934	119169	193011	193624	197415	199099	203996	207241	212373	227640	237481	240731	244404	256376	286966	286967	296063	464736	464776	206552	206706	5754	10242	10243	11565	13009	14981	16997	20250	27799	45537	54455	54468	420974	422059	423778	426211	480161	482042	508419	523348	560083	785199	786491	800164	804950	871790	874582	874608	918971	1003183	1006061	76481	76534	85085	106822	106864	111182	114144	128904	131549	140026	140065	152121	159848	169617	169868	179026	179572	190024	190064	191348	191643	291318	32753	32809	44632	48693	48699	57890	72757	72762	72784	157808	215257	316151	319106	321421	322620	322623	326249	337321	341595	354945	359494	367929	386447	393829	419999	25563	31774	31779	31798	31824	35680	44980	47473	99851	118419	131968	143991	239866	301601	301613	543064	543075	552529	563528	564092	634727	634739	644161	653755	664824	136700	143865	176335	214047	216898	216902	229432	230640	244570	260129	327893	328424	332553	354092	368071	375750	383133	383136	386153	478973	574927	602166	607403	610106	624837	656331	656583	656640	32690	32702	105985	119276	232935	233743	237225	271300	313848	331041	331044	331984	332157	332566	345771	346407	353484	356647	364406	368698	376222	379914	383695	390963	407477	447261	493918	504507	529736	530015	555750	555795	558900	558945	559511	565625	568114	764796	788350	811433	814256	816162	816279	816285	876714	924847	930668	935974	948733	952187	964450	1022290	1025801	1039504	26166	26170	28854	31110	58825	58847	72351	78538	80403	88266	94190	100551	103812	117294	129083	132552	133117	136477	144771	176890	219326	308167	387028	391407	391419	438893	440668	442916	447319	449317	453366	519240	528910	528919	534586	535619	554314	554323	554339	563219	563933	567013	581966	583556	598520	601436	669658	674192	706063	706072	706735	817301	819393	826214	19943	122147	128908	130860	200616	204725	207991	218831	280722	281700	284616	284733	286433	436888	436906	456086	635688	687661	735440	737900	745867	756837	757207	195051	195072	205799	248560	248578	273332	357029	357367	357437	380309	380728	380751	390445	390482	437491	445216	466090	467149	485749	487663	495702	514397	514400	516244	516246	516336	516351	516539	537181	556870	557722	566165	567085	601702	643604	672196	764062	765690	796340	819348	829348	836249	859971	926531	930118	940041	954219	954231	981230	981233	981273	983849	983852	1005779	1007511	1017296	1035275	1037757	1038675	20774	20793	101962	106450	110058	140739	141900	141903	146533	156772	157700	451247	457330	459228	459273	723593	750456	750462	802039	813738	818815	818826	825571	841449
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