##fileformat=VCFv4.1
##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality">
##FILTER=<ID=my_snp_filter,Description="QD < 2.0 || FS > 60.0 || MQ < 40.0 || HaplotypeScore > 13.0 || MappingQualityRankSum < -12.5 || ReadPosRankSum < -8.0">
##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##GATKCommandLine=<ID=HaplotypeCaller,Version=2.7-2-g6bda569,Date="Mon Jan 13 14:03:37 CET 2014",Epoch=1389618217190,CommandLineOptions="analysis_type=HaplotypeCaller input_file=[Sample_BTR50_G.sorted.dedup.reassign.recal.bam] read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh37/Sequence/WholeGenomeFasta/genome.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=250 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 allow_bqsr_on_reduced_bams_despite_repeated_warnings=false validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=ALLOW_N_CIGAR_READS disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub graphOutput=null bamOutput=null bam_compression=null disable_bam_indexing=null generate_md5=null simplifyBAM=null bamWriterType=CALLED_HAPLOTYPES dbsnp=(RodBinding name= source=UNBOUND) comp=[] annotation=[ClippingRankSumTest, DepthPerSampleHC] excludeAnnotation=[SpanningDeletions, TandemRepeatAnnotator] heterozygosity=0.001 indel_heterozygosity=1.25E-4 genotyping_mode=DISCOVERY standard_min_confidence_threshold_for_calling=30.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=10.0 alleles=(RodBinding name= source=UNBOUND) max_alternate_alleles=6 input_prior=[] contamination_fraction_to_filter=0.0 contamination_fraction_per_sample_file=null p_nonref_model=EXACT_INDEPENDENT exactcallslog=null kmerSize=[10, 25] dontIncreaseKmerSizesForCycles=false numPruningSamples=1 dontRecoverDanglingTails=false emitRefConfidence=NONE GVCFGQBands=[1, 10, 20, 30, 40, 50] indelSizeToEliminateInRefModel=10 minPruning=2 gcpHMM=10 includeUmappedReads=false useAllelesTrigger=false useFilteredReadsForAnnotations=false phredScaledGlobalReadMismappingRate=45 maxNumHaplotypesInPopulation=128 mergeVariantsViaLD=false pair_hmm_implementation=LOGLESS_CACHING keepRG=null justDetermineActiveRegions=false dontGenotype=false errorCorrectKmers=false debug=false debugGraphTransformations=false useLowQualityBasesForAssembly=false dontTrimActiveRegions=false dontUseSoftClippedBases=false captureAssemblyFailureBAM=false allowCyclesInKmerGraphToGeneratePaths=false noFpga=false errorCorrectReads=false kmerLengthForReadErrorCorrection=25 minObservationsForKmerToBeSolid=20 maxDiscARExtension=25 maxGGAARExtension=300 paddingAroundIndels=150 paddingAroundSNPs=20 pcr_indel_model=CONSERVATIVE activityProfileOut=null activeRegionOut=null activeRegionIn=null activeRegionExtension=null forceActive=false activeRegionMaxSize=null bandPassSigma=null min_mapping_quality_score=20 filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine=<ID=SelectVariants,Version=2.7-2-g6bda569,Date="Tue Jan 14 08:35:24 CET 2014",Epoch=1389684924293,CommandLineOptions="analysis_type=SelectVariants input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh37/Sequence/WholeGenomeFasta/genome.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 allow_bqsr_on_reduced_bams_despite_repeated_warnings=false validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=Sample_BTR50_G_raw_variants.vcf) discordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) concordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sample_name=[] sample_expressions=null sample_file=null exclude_sample_name=[] exclude_sample_file=[] select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false restrictAllelesTo=ALL keepOriginalAC=false mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_fraction=0.0 remove_fraction_genotypes=0.0 selectTypeToInclude=[SNP] keepIDs=null fullyDecode=false forceGenotypesDecode=false justRead=false maxIndelSize=2147483647 ALLOW_NONOVERLAPPING_COMMAND_LINE_SAMPLES=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine=<ID=VariantFiltration,Version=2.7-2-g6bda569,Date="Tue Jan 14 08:53:49 CET 2014",Epoch=1389686029235,CommandLineOptions="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh37/Sequence/WholeGenomeFasta/genome.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 allow_bqsr_on_reduced_bams_despite_repeated_warnings=false validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=Sample_BTR50_G_snps.vcf) mask=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub no_cmdline_in_header=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub bcf=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VariantContextWriterStub filterExpression=[QD < 2.0 || FS > 60.0 || MQ < 40.0 || HaplotypeScore > 13.0 || MappingQualityRankSum < -12.5 || ReadPosRankSum < -8.0] filterName=[my_snp_filter] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskExtension=0 maskName=Mask filterNotInMask=false missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false invalidatePreviousFilters=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
##INFO=<ID=ClippingRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref number of hard clipped bases">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts (not necessarily the same as the AC), for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
##contig=<ID=1,length=249250621>
##contig=<ID=2,length=243199373>
##contig=<ID=3,length=198022430>
##contig=<ID=4,length=191154276>
##contig=<ID=5,length=180915260>
##contig=<ID=6,length=171115067>
##contig=<ID=7,length=159138663>
##contig=<ID=8,length=146364022>
##contig=<ID=9,length=141213431>
##contig=<ID=10,length=135534747>
##contig=<ID=11,length=135006516>
##contig=<ID=12,length=133851895>
##contig=<ID=13,length=115169878>
##contig=<ID=14,length=107349540>
##contig=<ID=15,length=102531392>
##contig=<ID=16,length=90354753>
##contig=<ID=17,length=81195210>
##contig=<ID=18,length=78077248>
##contig=<ID=19,length=59128983>
##contig=<ID=20,length=63025520>
##contig=<ID=21,length=48129895>
##contig=<ID=22,length=51304566>
##contig=<ID=X,length=155270560>
##contig=<ID=Y,length=59373566>
##contig=<ID=MT,length=16569>
##reference=file:///Homo_sapiens/Ensembl/GRCh37/Sequence/WholeGenomeFasta/genome.fa
##source=SelectVariants
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	BTR50
1	14930	.	A	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:142,0,193
1	20144	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,231
1	567242	.	G	A	2565.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-2.410;DP=61;FS=3.082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=32.67;ReadPosRankSum=2.369	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,59:61:99:2594,139,0
1	568319	.	A	G	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
1	568718	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	568752	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	570043	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	739142	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	780785	.	T	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:79,0,28
1	787399	.	G	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:225,0,141
1	790465	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,190
1	791191	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
1	792480	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	840753	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	841085	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	846338	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
1	846398	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	847250	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	851757	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	852758	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,134
1	856041	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:61:61,0,145
1	856099	.	T	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:266,18,0
1	856108	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
1	856329	.	C	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:70:179,0,70
1	856476	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	857728	.	T	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:341,27,0
1	858040	.	C	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:90:147,0,90
1	858051	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:94:185,0,94
1	859685	.	G	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
1	859690	.	C	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
1	859913	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
1	860461	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	860521	.	C	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
1	860854	.	T	C	146.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
1	861808	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	862124	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	863124	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	864002	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	864726	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	864938	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	866920	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	869303	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	877831	.	T	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
1	879676	.	G	A	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
1	879687	.	T	C	417.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:446,30,0
1	882033	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	888639	.	T	C	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
1	888659	.	T	C	915.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:944,69,0
1	889713	.	C	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	891021	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	892745	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	893631	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	896476	.	A	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
1	897325	.	G	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
1	897564	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	900505	.	G	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:360,27,0
1	900730	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
1	900972	.	T	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	901023	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	908823	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	909238	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,187
1	909419	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:154,0,31
1	909768	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.63	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:140,0,195
1	910473	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	910903	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
1	934099	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:84,6,0
1	934106	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	934130	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	935459	.	A	G	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.421;DP=18;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:167,0,441
1	935671	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:72,0,70
1	937688	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
1	940005	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	941334	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	941539	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	944564	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
1	945474	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	948692	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	948921	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
1	949235	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
1	949608	.	G	A	138.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:5:166,5,0
1	949654	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
1	955597	.	G	T	278.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:307,24,0
1	971367	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	972134	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	973336	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	973458	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	973668	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	974180	.	G	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	974199	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	974296	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	974355	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	974356	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	974494	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	974662	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	975133	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	975702	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	981931	.	A	G	1129.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1158,87,0
1	982444	.	A	G	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:24:331,24,0
1	982462	.	T	C	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:331,24,0
1	982513	.	T	C	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
1	982941	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	982994	.	T	C	969.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:998,69,0
1	987200	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	987670	.	T	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
1	988503	.	A	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
1	988932	.	G	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:117,0,66
1	990280	.	C	T	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.176	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:362,0,412
1	990380	.	C	T	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:257,0,248
1	990417	.	T	C	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.265;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.474;QD=17.44;ReadPosRankSum=2.154	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:377,0,363
1	990517	.	C	T	776.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.851;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.268;QD=22.85;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,21:34:99:805,0,455
1	990773	.	C	T	639.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-2.079;DP=33;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:668,0,541
1	990806	.	G	A	716.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.905;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,21:30:99:745,0,270
1	990984	.	G	A	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-1.436;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.282	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:495,0,477
1	998501	.	G	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,115
1	1001177	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,178
1	1002539	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,274
1	1002932	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,76
1	1006990	.	G	A	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.867;DP=19;FS=4.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:271,0,407
1	1007203	.	A	G	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:42:561,42,0
1	1007222	.	G	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:51:225,0,51
1	1009478	.	G	C	477.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.619;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:506,0,197
1	1017341	.	G	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-1.668;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,166
1	1017587	.	C	T	360.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-2.333;DP=14;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=25.77;ReadPosRankSum=2.192	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:389,0,134
1	1018551	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
1	1021346	.	A	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:51:193,0,51
1	1039817	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
1	1099342	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	1101003	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	1103542	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	1103958	.	T	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
1	1105238	.	T	C	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:247,0,140
1	1158631	.	A	G	709.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.063;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,20:42:99:738,0,817
1	1164009	.	C	G	688.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=-1.743;DP=36;FS=2.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=19.13;ReadPosRankSum=2.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:717,0,600
1	1234553	.	G	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:213,0,103
1	1239339	.	T	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
1	1239953	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
1	1241529	.	A	G	284.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:313,24,0
1	1241800	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	1241903	.	C	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
1	1242215	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
1	1242707	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	1247494	.	T	C	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
1	1249187	.	G	A	1158.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1187,81,0
1	1252180	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
1	1253365	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:54:54,0,278
1	1254136	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	1254436	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
1	1254443	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
1	1254841	.	C	G	1018.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1047,75,0
1	1262966	.	C	T	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:498,39,0
1	1263144	.	G	A	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:470,36,0
1	1263362	.	G	A	1030.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1059,75,0
1	1263457	.	T	C	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:528,39,0
1	1270359	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	1271175	.	A	G	722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:751,54,0
1	1277533	.	T	C	652.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:681,51,0
1	1278237	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	1284490	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
1	1286967	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	1287922	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	1288345	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	1288471	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	1292426	.	C	G	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
1	1310074	.	C	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	1310668	.	A	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
1	1312132	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	1314245	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	1344254	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
1	1344255	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
1	1345001	.	A	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.40;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:199,0,64
1	1431603	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	1463558	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	1469782	.	G	C	756.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=30.42;ReadPosRankSum=1.569	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:27:785,27,0
1	1534710	.	G	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,77
1	1549354	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	1551927	.	T	C	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:222,0,167
1	1553498	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,65
1	1553670	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	1555718	.	G	A	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:85:85,0,145
1	1558792	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
1	1559466	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	1560178	.	C	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-2.083;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:126,0,335
1	1561331	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	1572119	.	G	T	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=1.034;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.172	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:515,0,505
1	1594315	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	1595198	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
1	1596500	.	C	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.464;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:213,0,377
1	1596974	.	C	T	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
1	1597020	.	C	G	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.783;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:223,0,518
1	1599888	.	A	G	172.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.82;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:15:201,0,15
1	1602787	.	G	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	1635004	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,419
1	1647814	.	T	C	1162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.774;DP=41;FS=5.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.319	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,31:41:99:1191,0,296
1	1647871	.	T	C	845.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.484;DP=29;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=29.16;ReadPosRankSum=1.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,22:29:99:874,0,215
1	1650807	.	T	C	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=1.905;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.05;ReadPosRankSum=3.176	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:317,0,844
1	1650832	.	A	G	544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-1.503;DP=23;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=23.69;ReadPosRankSum=2.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:573,0,874
1	1650845	.	G	A	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=1.962;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,7:29:99:223,0,1523
1	1653046	.	T	A	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=1.919;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:383,0,343
1	1660726	.	T	C	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:213,0,796
1	1660735	.	T	C	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:213,0,796
1	1660957	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:40:81,0,40
1	1660958	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:40:81,0,40
1	1661104	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:55:55,0,265
1	1661298	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,409
1	1662428	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	1662895	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	1663851	.	G	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	1664019	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	1664124	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	1664434	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	1667419	.	A	C	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
1	1668168	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	1683900	.	G	A	524.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-1.331;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:553,0,270
1	1684169	.	C	G	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:431,0,291
1	1684472	.	C	T	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.746;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:415,0,438
1	1685213	.	C	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	1686040	.	G	T	801.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-1.027;DP=34;FS=11.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,22:34:99:830,0,419
1	1686962	.	C	T	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
1	1687482	.	G	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	1688192	.	A	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
1	1688384	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
1	1812688	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
1	1846461	.	C	T	112.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:140,12,0
1	1847856	.	G	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	1987993	.	T	C	514.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
1	1991014	.	A	G	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:62:266,0,62
1	2238237	.	A	T	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:88:88,0,187
1	2238727	.	G	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:139,0,248
1	2240006	.	T	C	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
1	2307916	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	2324008	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	2324336	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:54:227,0,54
1	2331620	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
1	2335676	.	A	G	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
1	2335969	.	C	G	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,112
1	2336210	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:146,0,151
1	2337032	.	C	T	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.858;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:243,0,351
1	2340200	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,109
1	2444414	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:96:190,0,96
1	2451298	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.35;ReadPosRankSum=-1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:135,0,142
1	2452569	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:116,0,263
1	2522204	.	G	T	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-1.283;DP=34;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.075	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:514,0,658
1	2522392	.	G	A	551.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.732;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.908	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:580,0,464
1	3383898	.	A	G	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:349,0,201
1	3387134	.	G	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:112,0,32
1	3388556	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	3389321	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
1	3389543	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	3389727	.	C	T	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.231;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:362,0,384
1	3394640	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
1	3394674	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	3395039	.	G	A	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:256,0,294
1	3395174	.	C	A	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.184;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:373,0,164
1	3395755	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	3397188	.	T	C	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
1	3397455	.	G	A	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:247,0,377
1	3397564	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:72,0,65
1	3404710	.	A	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:236,0,183
1	3404779	.	C	G	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=27.55;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:92:414,0,92
1	3405296	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,154
1	3406197	.	C	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:178,0,185
1	3406791	.	A	G	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.670;DP=21;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=20.23;ReadPosRankSum=-2.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:453,0,314
1	3407007	.	G	A	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=1.620;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:341,0,131
1	3407043	.	G	T	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:248,0,288
1	3408183	.	A	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:114,0,33
1	3409282	.	G	A	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:211,0,378
1	3410223	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	3410581	.	G	A	358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=1.466;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:387,0,277
1	3410644	.	A	G	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:163,0,295
1	3411038	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:144,0,259
1	3413153	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	3414105	.	C	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:158,0,128
1	3416449	.	C	A	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.163;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:218,0,382
1	3416758	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
1	3417131	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
1	3417960	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:118,0,75
1	3418171	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
1	3421897	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:274,0,254
1	3423633	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	3425867	.	C	A	56.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:85,0,26
1	3426693	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	3427485	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	3428160	.	T	G	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-1.122;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:235,0,374
1	3441382	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,114
1	3545612	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,189
1	3548136	.	T	C	386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:415,30,0
1	3552780	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
1	3696890	.	A	C	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.854;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=23.10;ReadPosRankSum=1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:421,0,205
1	3697137	.	G	T	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=1.025;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.137;QD=14.16;ReadPosRankSum=-1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:368,0,537
1	3730400	.	T	C	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=25.20;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:255,0,60
1	3733161	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	3753136	.	A	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=21.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:180,0,69
1	3755675	.	T	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
1	3773546	.	A	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:107,0,28
1	3773718	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
1	3781830	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
1	3789662	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	3807593	.	G	C	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
1	5945277	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
1	6158562	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	6159032	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	6160876	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	6160958	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	6258794	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	6259025	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	6259130	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
1	6260663	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
1	6278414	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	6281667	.	A	C	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.876;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:374,0,666
1	6281792	.	C	T	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-2.058;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=16.16;ReadPosRankSum=2.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:513,0,596
1	6282224	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:67,0,30
1	6282400	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,103
1	6282776	.	C	G	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.395;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:247,0,456
1	6283062	.	C	A	430.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:459,0,321
1	6283260	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,220
1	6283439	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	6283440	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	6284680	.	C	T	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=-0.323;DP=32;FS=10.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.399	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,14:32:99:474,0,646
1	6314822	.	T	C	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
1	6508171	.	G	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:143,0,69
1	6581877	.	G	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
1	6584024	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	6584101	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
1	6585539	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	6585804	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	6614535	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
1	6652718	.	G	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:133,0,348
1	6652745	.	G	A	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,171
1	6655053	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	6655113	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
1	6659505	.	G	A	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:269,0,140
1	6681744	.	C	T	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:422,33,0
1	6685284	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,179
1	6694574	.	G	A	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-1.097;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:204,0,284
1	6694634	.	C	G	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.126;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,10:27:99:315,0,620
1	6694927	.	C	T	338.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:367,0,316
1	6694980	.	G	A	1019.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.733;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.605	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,26:27:45:1048,45,0
1	6695123	.	C	T	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:619,45,0
1	6695244	.	A	G	457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:486,33,0
1	6695331	.	G	T	532.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.423;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:561,0,242
1	6704635	.	A	G	866.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:895,63,0
1	6706227	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:93:93,0,137
1	7797503	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
1	7829107	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	7829226	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	7832212	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
1	7832289	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	7836659	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	7840698	.	A	G	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-0.599;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:344,0,686
1	7840769	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.020;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:165,0,430
1	7840926	.	G	C	1353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1382,96,0
1	7870048	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	7904247	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	7904475	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	7904699	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	8021778	.	T	C	560.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,16:26:99:589,0,339
1	8072466	.	C	T	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:59:278,0,59
1	8303182	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	8303189	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	8412935	.	C	T	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:50:645,50,0
1	8412989	.	A	G	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
1	8418644	.	C	A	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:661,42,0
1	8418650	.	T	C	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:661,42,0
1	8419629	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	8421092	.	C	T	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:586,48,0
1	8421203	.	T	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
1	8422676	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
1	8616562	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,154
1	8928125	.	G	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:70,0,37
1	8930369	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	8930385	.	G	A	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
1	8931149	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,192
1	8931463	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	9160900	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,117
1	9161231	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
1	9161550	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,269
1	9161619	.	C	T	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:67:242,0,67
1	9161668	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-2.219;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,190
1	9162185	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,148
1	9163043	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,191
1	9163839	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,230
1	9164133	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,151
1	9164200	.	G	A	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:180,0,105
1	9169742	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	9209243	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,138
1	9209435	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
1	9210262	.	G	A	134.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:163,0,22
1	9251399	.	A	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	9294903	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:76,0,29
1	9307138	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=8;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,196
1	9322155	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:109,0,64
1	9323597	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,274
1	9325676	.	C	T	46.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:75,0,25
1	9327387	.	T	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:114,0,33
1	9328242	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,321
1	9328243	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,321
1	9427842	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:115,0,63
1	9427869	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
1	9428520	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
1	9428769	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	9633723	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	9670834	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	9673779	.	C	A	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
1	9883878	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
1	9908515	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
1	9986710	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
1	9987965	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:29:39,0,29
1	9988248	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
1	10003320	.	G	A	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:561,42,0
1	10043416	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	10047515	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	10363885	.	G	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:162,0,30
1	10366572	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,157
1	10368099	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
1	10421878	.	A	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.31;ReadPosRankSum=-1.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:176,0,254
1	10437778	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,171
1	10438687	.	C	T	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,148
1	10502710	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	10509703	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	10511544	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	10511589	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	10512056	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	10517422	.	T	A	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
1	10518052	.	T	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:90:90,0,406
1	10518596	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	10519090	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	10520751	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,200
1	10521238	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,181
1	10521254	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,231
1	10596341	.	C	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:140,0,252
1	10713765	.	T	C	388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:417,30,0
1	11079413	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	11081880	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	11086332	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
1	11086439	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	11087524	.	G	A	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
1	11119899	.	T	C	924.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:953,69,0
1	11131433	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	11132217	.	G	A	1742.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-1.652;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=33.95;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,42:43:91:1771,91,0
1	11132541	.	G	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	11136911	.	G	C	570.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.603;DP=30;FS=19.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=19.03;ReadPosRankSum=1.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:599,0,518
1	11141187	.	C	G	999.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1028,72,0
1	11205058	.	C	T	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
1	11288758	.	G	A	466.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,12:13:12:494,12,0
1	11301714	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
1	11322565	.	C	G	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
1	11355746	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	11714938	.	T	C	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
1	11714981	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	11721854	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:142,0,308
1	11810505	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,191
1	11810765	.	T	A	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:356,27,0
1	11846252	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	11846447	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	11847759	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
1	11848879	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
1	11849447	.	A	G	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
1	11850365	.	T	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	11854457	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	11856378	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=13.40;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:122,0,113
1	11883342	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	11884555	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	11979869	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,101
1	11979909	.	T	C	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
1	11980449	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
1	11981270	.	G	A	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
1	11982544	.	T	C	116.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:144,12,0
1	12009955	.	C	T	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:169,0,756
1	12009956	.	G	A	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:305,0,367
1	12010469	.	G	T	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.442;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:337,0,295
1	12026355	.	A	C	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=12.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:86:422,0,86
1	12040324	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	12040479	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
1	12065841	.	C	T	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.888;DP=34;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,10:34:99:297,0,921
1	12071680	.	A	G	1056.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1085,78,0
1	12072518	.	G	C	467.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=-2.515;DP=36;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,14:36:99:496,0,770
1	12072722	.	A	G	679.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.054;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=25.18;ReadPosRankSum=-1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,18:27:99:708,0,296
1	12082926	.	A	G	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
1	12401868	.	A	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:181,0,142
1	12567232	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	12638964	.	T	C	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
1	14024768	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	14105139	.	T	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
1	14105291	.	G	A	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-2.083;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:431,0,335
1	14105298	.	G	A	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.586;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=25.17;ReadPosRankSum=2.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:431,0,335
1	14105922	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:122,0,32
1	14109114	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:153,0,108
1	14111856	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	14153955	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	14153969	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	14220186	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	15444288	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	15447498	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	15480405	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
1	15541537	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
1	15546077	.	G	A	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:179,0,138
1	15546825	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
1	15755497	.	C	T	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:302,0,322
1	15755676	.	G	A	415.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=34.60;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:10:443,0,10
1	15897554	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,109
1	15936703	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
1	15988957	.	G	A	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
1	15993208	.	G	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,301
1	15993338	.	A	G	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
1	15993514	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:103,0,68
1	15993603	.	G	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,234
1	16042766	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:97:227,0,97
1	16044401	.	G	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:257,0,279
1	16096934	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	16112795	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	16154733	.	A	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:254,18,0
1	16154741	.	C	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
1	16335527	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	16451413	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	16456763	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,116
1	16464364	.	G	A	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:91:91,0,260
1	16555882	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:159,0,69
1	16556623	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	16556647	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
1	16557390	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,156
1	16574316	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
1	16577908	.	G	C	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:289,0,276
1	16641899	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:188,0,180
1	16643023	.	G	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,79
1	16778265	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	16786087	.	T	C	378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:407,30,0
1	16796944	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	16797122	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	16797756	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	16889014	.	C	A	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:184,0,139
1	16889138	.	T	C	833.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:862,60,0
1	16889158	.	A	C	675.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.352;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=32.18;ReadPosRankSum=-0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,18:21:69:704,0,69
1	16889502	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:158,0,137
1	16889513	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.474;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:79:79,0,577
1	16889566	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,200
1	16889985	.	T	C	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.136;DP=25;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:474,0,440
1	16890428	.	T	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-1.991;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:165,0,544
1	16890484	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.203;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:106,0,725
1	16890644	.	C	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:143,0,182
1	16890671	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,743
1	16890672	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,743
1	16901668	.	T	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:186,0,194
1	16902823	.	G	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.344	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:134,0,396
1	16907328	.	G	T	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:55:393,0,55
1	16909052	.	C	T	489.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:518,0,249
1	16918373	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:113,0,516
1	16920002	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:75,0,30
1	16921146	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=0.62;ReadPosRankSum=0.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,3:29:46:46,0,1008
1	16924589	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	16927039	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	16927379	.	T	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
1	16928622	.	C	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:74,0,73
1	16929751	.	G	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:153,0,107
1	16932051	.	T	A	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:180,0,139
1	16932495	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,77
1	16932510	.	G	A	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:80,0,26
1	16932536	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	16932783	.	G	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,71
1	16932863	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	16934178	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,193
1	16944809	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:187,0,64
1	16946562	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,75
1	16946854	.	A	G	205.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:234,18,0
1	16948473	.	C	T	136.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:165,0,26
1	16948474	.	C	G	136.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:26:165,0,26
1	16949940	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:100,0,185
1	16950708	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	16950783	.	T	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:102,0,28
1	16952060	.	A	G	101.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:130,0,22
1	16952481	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,110
1	16957446	.	T	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
1	16959612	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,105
1	16959826	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:114,0,75
1	16971866	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	17250836	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	17272769	.	G	A	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:93:93,0,229
1	17282573	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,109
1	17326767	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=1.524;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:261,0,254
1	17350143	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	17350238	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:124,9,0
1	17350243	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	17350943	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	17380497	.	G	T	940.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:969,72,0
1	17393709	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:18:258,18,0
1	17393889	.	A	G	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.212;DP=17;FS=17.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:327,0,256
1	17394048	.	T	A	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-1.196;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:288,0,461
1	17394374	.	C	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:137,0,316
1	17394613	.	T	C	1275.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:90:1304,90,0
1	17394623	.	C	T	1275.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:90:1304,90,0
1	17394775	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:253,0,450
1	17395281	.	T	C	650.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=1.301;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:679,0,462
1	17395480	.	G	A	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:460,0,441
1	17395521	.	G	A	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.966;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:331,0,686
1	17396703	.	T	C	678.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.361;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,18:26:99:707,0,257
1	17413121	.	A	C	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
1	17733564	.	T	G	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-1.350;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:282,0,444
1	17734933	.	C	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-0.453;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=8.30;ReadPosRankSum=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:161,0,424
1	17961345	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:155,0,29
1	17991052	.	T	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
1	18020298	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	18021444	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	18023365	.	C	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
1	18023509	.	T	C	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:487,36,0
1	18023690	.	A	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
1	18618092	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	18807897	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	18808292	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	19198064	.	T	G	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:216,0,330
1	19198100	.	C	G	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.701;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:300,0,647
1	19198141	.	T	C	733.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-0.567;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.075	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,21:47:99:762,0,988
1	19198414	.	G	A	807.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.754;DP=49;FS=13.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,22:49:99:836,0,2208
1	19198418	.	C	T	807.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.060;DP=48;FS=16.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.205	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,21:48:99:836,0,2208
1	19198576	.	A	G	727.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=-0.648;DP=45;FS=6.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.375	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,21:45:99:756,0,911
1	19198627	.	G	A	802.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=1.089;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.176	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,24:46:99:831,0,761
1	19198895	.	A	G	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.998;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,13:39:99:445,0,1031
1	19201623	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,72
1	19201956	.	A	G	802.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=-2.394;DP=48;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=16.72;ReadPosRankSum=2.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,23:48:99:831,0,940
1	19202896	.	G	A	764.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.416;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=16.27;ReadPosRankSum=2.207	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,22:47:99:793,0,918
1	19202917	.	T	C	806.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-0.742;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,20:48:99:835,0,2029
1	19202926	.	T	C	806.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-0.387;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.070	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,17:46:99:835,0,2029
1	19203997	.	C	G	433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.110;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:462,0,580
1	19204154	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	19204645	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	19214561	.	C	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,80
1	19215440	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	19215448	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
1	19215834	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	19282981	.	A	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
1	19543349	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,115
1	19543356	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,115
1	19578192	.	G	A	377.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:406,30,0
1	19586458	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,238
1	19586967	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	19587164	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	19588562	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	19589204	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	19619973	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	19625036	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
1	19636169	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	19652063	.	G	A	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=28.43;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:48:341,0,48
1	19658806	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,243
1	19658807	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,243
1	19658810	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,243
1	19670883	.	C	A	82.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.652;DP=51;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.061;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,6:51:99:111,0,1766
1	19674070	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	19953118	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	19984461	.	C	T	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:535,39,0
1	20008880	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	20020993	.	A	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
1	20020994	.	C	T	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
1	20097822	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,181
1	20097941	.	G	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,115
1	20236027	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:75,0,68
1	20238343	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	20301964	.	G	A	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:51:234,0,51
1	20370416	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	20966880	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	20976759	.	C	T	198.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:227,18,0
1	20977000	.	A	C	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=19.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:313,0,516
1	20977221	.	A	T	1306.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1335,93,0
1	20977365	.	C	G	1032.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1061,75,0
1	20977380	.	T	C	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.027;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:414,0,465
1	20977449	.	G	T	598.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.038;DP=32;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:627,0,566
1	20977599	.	C	G	422.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=1.813;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=21.14;ReadPosRankSum=-2.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:451,0,272
1	20977748	.	T	G	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:217,0,128
1	20978115	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	20978832	.	T	C	1379.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1408,99,0
1	20982631	.	G	A	877.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=-2.328;DP=54;FS=2.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,28:54:99:906,0,940
1	20987873	.	G	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
1	21081119	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,110
1	21081804	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,118
1	21082062	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	21082074	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	21087956	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	21101163	.	A	G	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
1	21101903	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,116
1	21109591	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	21111577	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	21113778	.	T	C	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,1:13:39:39,0,824
1	21113781	.	A	G	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=1.611;DP=12;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:39:39,0,824
1	21167404	.	A	G	720.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:749,51,0
1	21544269	.	C	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.053;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:164,0,457
1	21544791	.	T	C	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.959;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:317,0,447
1	21573855	.	G	A	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.741;DP=14;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:130,0,203
1	21671943	.	T	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,232
1	21671973	.	G	A	75.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:104,0,23
1	21750090	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:51:81,0,51
1	21750091	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:51:81,0,51
1	21750406	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	21795288	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
1	21797204	.	G	C	291.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:320,24,0
1	21798249	.	C	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
1	21806571	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
1	21940555	.	C	T	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.255	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:44:44,0,477
1	21943504	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	21948936	.	G	C	107.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:135,12,0
1	22050649	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	22051873	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	22054427	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	22149183	.	G	C	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
1	22149935	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	22206942	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	22207235	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	22214127	.	A	G	94.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:121,2,0
1	22217108	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	22352040	.	G	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,234
1	22352108	.	C	T	246.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:275,0,19
1	22352179	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	22352886	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	22353986	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	22353989	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
1	22354237	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,141
1	22354246	.	A	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:59:59,0,112
1	22356809	.	A	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,112
1	22356888	.	G	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:137,0,293
1	22356905	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,511
1	22357217	.	G	T	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=2.404;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=5.31;ReadPosRankSum=-2.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:92:92,0,361
1	22413874	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	22835677	.	A	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:192,0,66
1	22846709	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	22852715	.	G	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:110,0,68
1	22856601	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:153,0,64
1	23219493	.	T	C	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
1	23409538	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:66,0,36
1	23413027	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
1	23413707	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:114,0,28
1	23415102	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,197
1	23418153	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,143
1	23419374	.	G	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:139,0,180
1	23419383	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,399
1	23419855	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:56,0,73
1	23626401	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	23631625	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	23670803	.	G	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:73,0,28
1	23686246	.	C	T	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
1	23687827	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:120,0,72
1	23688178	.	A	G	388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:417,30,0
1	23688933	.	A	G	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=24.22;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:222,0,59
1	23689083	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,115
1	23694021	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	23696152	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
1	23707401	.	A	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	23707692	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	23708919	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	23710052	.	C	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	23751140	.	G	T	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
1	23755513	.	T	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
1	23755716	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
1	23756155	.	T	C	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
1	23884661	.	G	A	1141.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=1.155;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.95;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,29:30:46:1170,46,0
1	23884780	.	T	C	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=-0.236;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,12:38:99:411,0,975
1	23885230	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	23885498	.	T	C	1637.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1666,117,0
1	23885599	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
1	24012042	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	24021843	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	24022104	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	24055718	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	24077451	.	C	T	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.165	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:280,0,519
1	24083494	.	C	T	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.358;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:290,0,580
1	24105170	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:233,0,390
1	24114129	.	G	A	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:423,0,255
1	24121601	.	C	T	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:513,39,0
1	24128467	.	C	T	562.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:591,42,0
1	24134721	.	T	C	942.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:971,66,0
1	24180962	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,157
1	24286649	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	24286897	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	24286951	.	C	T	35.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
1	24288404	.	A	G	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.191;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:238,0,646
1	24288476	.	T	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=-0.933;DP=21;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:225,0,548
1	24289057	.	G	C	619.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.753;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=20.66;ReadPosRankSum=-0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:648,0,455
1	24291597	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	24292830	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	24294249	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	24294587	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:156,0,72
1	24294627	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,107
1	24296088	.	G	T	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:590,42,0
1	24297674	.	A	G	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:226,0,163
1	24300257	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	24301685	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
1	24301721	.	T	C	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
1	24302049	.	G	C	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
1	24302765	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
1	24305565	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	24305566	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	24421950	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	24482992	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	24746056	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=23.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:59:193,0,59
1	24785393	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:117,0,75
1	24796838	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	24861704	.	G	A	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:129,0,173
1	24863285	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:121,0,143
1	25168124	.	G	C	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:727,54,0
1	25169249	.	C	T	498.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.032;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:527,0,438
1	25169875	.	C	A	1064.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1093,75,0
1	25570081	.	T	C	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:266,0,213
1	25687742	.	C	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:126,0,466
1	25687901	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:165,0,498
1	25688276	.	A	G	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:327,0,277
1	25825781	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,111
1	25826328	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
1	25889632	.	T	C	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=11.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.943;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:287,0,281
1	25890189	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.509;DP=19;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:153,0,499
1	25891174	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	25891959	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	25892298	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	25892525	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	25894853	.	G	T	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.929;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:262,0,614
1	26128307	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
1	26131654	.	G	A	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=23.92;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:411,0,163
1	26138262	.	T	C	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:238,0,149
1	26138364	.	C	G	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:259,0,177
1	26144545	.	A	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:70,0,61
1	26144674	.	G	A	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:221,0,179
1	26146884	.	C	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:108,0,28
1	26148941	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	26158962	.	A	G	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:293,0,374
1	26228409	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,104
1	26286840	.	G	A	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:175,0,256
1	26448447	.	A	G	110.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:138,12,0
1	26448849	.	T	C	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
1	26449327	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	26449337	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
1	26449595	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	26449604	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,73
1	26449605	.	A	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,73
1	26450009	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	26450101	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	26455991	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	26496651	.	T	C	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:708,54,0
1	26497340	.	A	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
1	26603993	.	A	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:134,0,148
1	26609259	.	C	T	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:223,0,172
1	26610891	.	A	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:105,0,224
1	26786627	.	G	A	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:192,0,102
1	26797508	.	C	T	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.452;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:210,0,307
1	26801762	.	G	T	90.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.008;ClippingRankSum=-1.155;DP=48;FS=30.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,10:48:99:119,0,1191
1	26856462	.	T	G	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:569,42,0
1	26879920	.	T	C	918.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.829;DP=23;FS=5.166;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=28.07;ReadPosRankSum=1.432	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,22:23:59:947,59,0
1	26887592	.	T	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-1.324;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:306,0,227
1	26900708	.	G	A	439.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:468,0,250
1	26900735	.	C	G	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
1	26900805	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.056;DP=20;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:74:74,0,598
1	26900920	.	A	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:107,0,74
1	26901090	.	C	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:254,0,262
1	26901319	.	G	A	408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:437,0,165
1	27210721	.	T	C	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:240,0,453
1	27215784	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	27426796	.	T	C	510.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:539,39,0
1	27427041	.	T	C	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:522,36,0
1	27662235	.	G	T	636.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:665,48,0
1	27662666	.	A	G	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
1	27671271	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	27676925	.	G	A	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:617,45,0
1	27679797	.	A	G	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
1	27679954	.	G	A	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
1	27680292	.	A	G	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
1	27688633	.	G	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
1	27731972	.	C	T	547.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=11.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:576,0,334
1	27875824	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
1	27876482	.	C	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
1	28086955	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	28150462	.	C	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:115,0,112
1	28150601	.	A	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
1	28218100	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	28277564	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	28282292	.	T	C	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
1	28285534	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
1	28285632	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	28527011	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
1	28536211	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	28562676	.	A	G	1272.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1301,90,0
1	28563084	.	C	T	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
1	28564252	.	A	G	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
1	28564279	.	A	G	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
1	28566173	.	G	A	162.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
1	28566608	.	G	T	291.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:320,24,0
1	28566740	.	T	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
1	28567205	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	28570349	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	28571035	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	28572480	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	28661576	.	A	G	113.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:142,0,27
1	28662199	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,148
1	28825370	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
1	28825466	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,160
1	28826190	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:274,0,173
1	28836912	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,108
1	28838063	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,165
1	28838066	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,165
1	28866720	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	28931901	.	T	A	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:421,0,348
1	28969314	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	29044946	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	29063559	.	A	C	786.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:815,60,0
1	29309138	.	T	C	463.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=28.95;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:3:490,0,3
1	29443675	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
1	29443723	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
1	29445227	.	T	C	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
1	29445514	.	C	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
1	29445598	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:169,0,179
1	29475341	.	C	T	753.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.206;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=19.84;ReadPosRankSum=2.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:38:99:782,0,598
1	29475394	.	C	G	689.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.512;DP=38;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:718,0,628
1	29475648	.	T	G	1084.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1113,81,0
1	29497250	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:100,0,67
1	29499425	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	29500815	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	29500995	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	29507100	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	29508350	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:261,0,206
1	29529699	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
1	29542637	.	A	G	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
1	29549670	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	29631909	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	31198733	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
1	31342590	.	G	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,121
1	31344250	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:35:106,0,35
1	31344952	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:70,0,68
1	31345747	.	C	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:51:51,0,74
1	31346199	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:149,0,68
1	31347399	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
1	31351513	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	31408056	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	31408106	.	C	T	37.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:65,6,0
1	31426815	.	A	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:178,0,212
1	31736182	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	31740668	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	31761989	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
1	31837320	.	T	C	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.294	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:83:83,0,326
1	31838995	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	31886564	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:78,0,61
1	31887505	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,78
1	31894402	.	G	A	209.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:238,0,25
1	31895394	.	T	C	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:89:89,0,301
1	31895411	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,271
1	31895806	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:72,0,65
1	31895931	.	A	G	122.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:19:151,0,19
1	31898234	.	T	C	1139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.621;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,30:43:99:1168,0,437
1	31898279	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	31898463	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	31898536	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	31899684	.	A	T	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
1	31899704	.	C	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
1	31900337	.	C	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
1	31901459	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	31905730	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	31907102	.	A	G	1291.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1320,96,0
1	31907345	.	C	A	1365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.389;DP=47;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=29.06;ReadPosRankSum=-0.339	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,36:47:99:1394,0,347
1	31907457	.	A	C,G	336.29	PASS	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,5,6:11:99:452,246,231,207,0,190
1	31918879	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	31921534	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	31922187	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	31923734	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	31931399	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,153
1	31934728	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,122
1	31934737	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:81:81,0,122
1	31934741	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:81:81,0,122
1	31936527	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:76,0,29
1	32096265	.	A	G	981.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1010,72,0
1	32096815	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	32193647	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	32672932	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	32699227	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	32699816	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,114
1	32831543	.	C	T	1483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1512,105,0
1	32833104	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,199
1	33065947	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	33087437	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:65,0,33
1	33098047	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	33133968	.	T	C	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:447,33,0
1	33138516	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	33138943	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	33145448	.	C	T	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.002;DP=30;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,5:30:99:132,0,991
1	33145742	.	A	G	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=-1.472;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.321	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,10:41:99:318,0,1176
1	33146501	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,118
1	33147143	.	C	T	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
1	33147179	.	A	T	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:87:87,0,393
1	33150597	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	33150865	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	33150951	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
1	33235626	.	G	A	755.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-1.086;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:38:99:784,0,557
1	33240185	.	G	C	641.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.781;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:670,0,415
1	33284498	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	33323012	.	A	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:44:44,0,284
1	33324136	.	T	C	177.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:206,0,27
1	33360999	.	G	A	537.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.788;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,16:41:99:566,0,959
1	33611890	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
1	33644798	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	33644799	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	33646950	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
1	33724895	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	33765272	.	A	G	534.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:11:562,11,0
1	33765919	.	A	C	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=1.72;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:40:40,0,133
1	33789520	.	C	A	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
1	33789588	.	T	C	580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:609,45,0
1	33793682	.	A	G	48.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:76,9,0
1	33803148	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	35316497	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	35318368	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	35484995	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,264
1	35562965	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	35567194	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	35581813	.	A	G	45.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:74,0,27
1	36067784	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:100,0,310
1	36067817	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
1	36067886	.	T	C	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:92:314,0,92
1	36067925	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,306
1	36068184	.	T	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.839;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:197,0,294
1	36068210	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,476
1	36068237	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,330
1	36068370	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:120,0,33
1	36184975	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	36200234	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	36200390	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
1	36216835	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	36316571	.	A	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	36602943	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	36613704	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	36614713	.	C	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
1	36749148	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	36752152	.	C	T	786.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.714;DP=32;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=24.59;ReadPosRankSum=-0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,21:32:99:815,0,389
1	36752433	.	C	T	1388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1417,105,0
1	36754467	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	36754522	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	36766975	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	36770065	.	C	T	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.194;ClippingRankSum=-0.046;DP=19;FS=23.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:53:53,0,466
1	36770806	.	C	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
1	36773405	.	T	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,149
1	36785914	.	G	T	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:88:88,0,234
1	36787294	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	36787888	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,93
1	36789546	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:59,0,37
1	36792078	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	36792120	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,119
1	36794192	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	36807481	.	C	T	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:255,0,101
1	36863456	.	G	A	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.176	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:352,0,366
1	36924676	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:75,0,60
1	36924810	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:43:77,0,43
1	36927733	.	G	A	1587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1616,111,0
1	37263979	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,151
1	37266876	.	C	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:49:49,0,115
1	37284824	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	37325477	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:78,0,66
1	37921066	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	37921082	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	37921250	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	37949344	.	G	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:173,0,106
1	37959450	.	T	C	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:880,60,0
1	37959470	.	C	G	889.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:918,63,0
1	37959499	.	G	C	1046.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1075,75,0
1	38000185	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	38148123	.	T	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:96:96,0,685
1	38148124	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,685
1	38148765	.	A	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.933;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:175,0,324
1	38149076	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:190,0,153
1	38155841	.	A	T	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:98:98,0,110
1	38158258	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:96:96,0,194
1	38164724	.	C	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
1	38174185	.	G	T	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=-1.359;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:209,0,492
1	38174987	.	T	C	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.929;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:311,0,104
1	38268397	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,158
1	38268918	.	T	C	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=17.71;ReadPosRankSum=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:223,0,169
1	38276381	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	38338795	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	38397369	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
1	38423588	.	G	A	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:440,33,0
1	38423853	.	G	C	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:792,54,0
1	38434919	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	38446296	.	C	G	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:254,0,470
1	38446389	.	C	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:308,0,143
1	38449910	.	T	C	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:291,0,266
1	39303995	.	C	T	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
1	39304247	.	A	G	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:577,42,0
1	39304728	.	A	G	952.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:981,69,0
1	39457006	.	C	T	285.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:314,24,0
1	39458696	.	A	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	39460853	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	39470243	.	G	C	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.102;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:340,0,375
1	39470364	.	A	G	419.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.964;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:448,0,288
1	39748921	.	G	A	438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:467,33,0
1	39989327	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	39992808	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	39992878	.	T	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	40012184	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	40012347	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:60,0,37
1	40219065	.	C	T	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-0.876;DP=32;FS=11.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:423,0,740
1	40219280	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:99,0,103
1	40221464	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	40306898	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,262
1	40362461	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:69,0,37
1	40363054	.	G	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	40425409	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	40425474	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	40425481	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	40425557	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	40533266	.	T	G	1238.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1267,90,0
1	40533287	.	T	G	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:654,51,0
1	40533315	.	T	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:33:479,33,0
1	40533320	.	T	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:33:479,33,0
1	40533326	.	T	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:479,33,0
1	40533347	.	T	G	1269.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1298,90,0
1	40538101	.	G	A	652.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.191;DP=30;FS=16.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:681,0,426
1	40539076	.	C	T	785.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.455;DP=35;FS=10.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=22.45;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:814,0,498
1	40539228	.	G	C	765.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.811;DP=34;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,22:34:99:794,0,398
1	40539448	.	A	C	615.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.035;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:644,0,388
1	40553947	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	40601437	.	A	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,341
1	40722675	.	C	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:116,0,74
1	40726636	.	C	G	591.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.644;DP=30;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.229	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:620,0,518
1	40764964	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	40881041	.	C	G	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
1	40930368	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	40931003	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	40975260	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
1	40980731	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	41088427	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:73,0,37
1	41233031	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	41233213	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	41233227	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	41327873	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.758;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:115,0,440
1	41463065	.	G	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:119,0,66
1	41464134	.	G	A	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
1	41464437	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	41465606	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
1	41479864	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	41493111	.	A	G	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
1	41493749	.	G	A	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
1	41707766	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
1	41915030	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	41922249	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	41929252	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	41978566	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	41978825	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	41990795	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	42000654	.	A	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
1	42001444	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	42013018	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	42022792	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	42048745	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	42310165	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	42644770	.	C	T	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
1	42653928	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	42693597	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,239
1	42880516	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	42882116	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	42882118	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	42925688	.	T	G	722.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-1.067;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,20:34:99:751,0,488
1	43139659	.	T	A	37.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:66,0,28
1	43141065	.	A	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:112,0,34
1	43163546	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	43169007	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	43212111	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
1	43212431	.	A	G	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
1	43242837	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
1	43296173	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	43296195	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:77,0,69
1	43309548	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	43309842	.	G	C	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
1	43393372	.	G	C	340.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=1.124;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,12:43:99:369,0,1145
1	43408966	.	G	A	573.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-0.172;DP=41;FS=2.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:602,0,909
1	43424519	.	T	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:88:88,0,333
1	43424812	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:78,0,70
1	43438709	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	43444560	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	43738340	.	A	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	43748051	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	43748132	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	44021456	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	44049156	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,106
1	44049947	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,117
1	44050856	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,72
1	44051574	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,111
1	44051834	.	A	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
1	44052377	.	T	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:120,0,63
1	44059242	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:72,0,69
1	44063250	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	44068275	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:75:75,0,197
1	44071221	.	G	A	623.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-0.576;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,19:32:99:652,0,443
1	44083507	.	T	C	1337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.644;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=25.73;ReadPosRankSum=0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,36:52:99:1366,0,464
1	44083519	.	G	A	1110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-2.099;DP=50;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=22.22;ReadPosRankSum=2.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,31:50:99:1139,0,650
1	44084739	.	C	T	752.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=-0.802;DP=40;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,22:40:99:781,0,659
1	44086831	.	C	T	1177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.932;DP=47;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,31:47:99:1206,0,558
1	44137257	.	C	A	299.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:328,0,414
1	44163886	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	44413788	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	44414845	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	44415262	.	C	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:254,0,189
1	44415415	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:261,0,255
1	44415545	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:131,0,225
1	44415807	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,241
1	44427785	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	44438974	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	44453185	.	C	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	44458928	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	44460053	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	44462332	.	G	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,227
1	44464205	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
1	44464529	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
1	44466477	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:104,0,28
1	44467284	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,318
1	44476276	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	44490015	.	C	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:145,0,66
1	44681483	.	C	G	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:132,0,148
1	44682084	.	A	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	44820319	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	45468606	.	A	G	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
1	45468631	.	A	T	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:487,36,0
1	45469789	.	C	T	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.929;DP=13;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=25.44;ReadPosRankSum=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:359,0,137
1	45475566	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	45479874	.	G	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	45798555	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.26	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:51:51,0,500
1	45956700	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	45973928	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:144,0,67
1	45975856	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,116
1	45976147	.	G	A	248.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:277,21,0
1	45978675	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	46016687	.	T	C	760.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-1.129;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=20.56;ReadPosRankSum=1.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,22:37:99:789,0,491
1	46032974	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
1	46073489	.	G	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
1	46075664	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:155,0,64
1	46075724	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,79
1	46075780	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,108
1	46075804	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
1	46076462	.	A	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:51:51,0,195
1	46076467	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:70:165,0,70
1	46076468	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:70:165,0,70
1	46076533	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,143
1	46076642	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,136
1	46077428	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	46078630	.	A	G	125.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:154,0,22
1	46078854	.	A	G	1068.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1097,75,0
1	46079391	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	46079493	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	46081940	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	46126854	.	C	T	464.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-1.680;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:493,0,381
1	46269352	.	T	G	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:686,51,0
1	46466721	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
1	46476587	.	T	G	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
1	46493460	.	T	G	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
1	46496709	.	A	G	846.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:875,66,0
1	46498375	.	A	G	1349.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1378,96,0
1	46499526	.	A	G	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.424;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:292,0,461
1	46500251	.	G	A	390.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.810;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:419,0,368
1	46500993	.	A	G	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.119;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.060	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:307,0,510
1	46508769	.	A	G	1220.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1249,87,0
1	46521517	.	G	A	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:837,60,0
1	46521559	.	A	T	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:820,57,0
1	46598269	.	C	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
1	46598273	.	A	C	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:310,21,0
1	46655158	.	T	C	348.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:377,30,0
1	46746897	.	G	C	440.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.138;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:469,0,521
1	46768408	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	46806550	.	C	T	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
1	46807416	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	46809321	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	46810670	.	T	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
1	46818416	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	46818417	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	46827485	.	C	T	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
1	46827728	.	A	C	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
1	46827769	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
1	46827871	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
1	46828109	.	A	G	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
1	46828460	.	C	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
1	46828700	.	A	G	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
1	46828734	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	46829013	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	46830430	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	46830447	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	46871986	.	T	C	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
1	46877180	.	G	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
1	46879562	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	46879856	.	C	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
1	46882118	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	47027943	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	47040084	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
1	47056347	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	47058863	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	47059934	.	T	C	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
1	47074462	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,242
1	47074621	.	G	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
1	47074774	.	T	A	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
1	47078637	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	47099235	.	A	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
1	47099346	.	C	A	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
1	47099721	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	47101015	.	C	A	914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:943,66,0
1	47133811	.	T	C	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:129,0,153
1	47141718	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:181,0,278
1	47150609	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	47279175	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-1.749;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:188,0,228
1	47283505	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	47284526	.	C	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:59:139,0,59
1	47284572	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:143,0,203
1	47290684	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
1	47290919	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	47301212	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:117,0,69
1	47350815	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
1	47583415	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	47645846	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	47717189	.	A	G	653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:682,48,0
1	47842431	.	G	A	1722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1751,120,0
1	47842666	.	A	T	637.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:68:666,68,0
1	47842777	.	C	T	1502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1531,105,0
1	47844464	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	51738583	.	G	C	427.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:456,0,414
1	51750909	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:109,0,32
1	51753812	.	G	A	349.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.824;DP=22;FS=7.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.758	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:378,0,446
1	51871689	.	C	T	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.163;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:200,0,360
1	51873951	.	G	A	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-1.739;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:298,0,217
1	52266242	.	G	A	448.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.520;DP=28;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:477,0,563
1	52266272	.	C	T	614.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.103;DP=34;FS=7.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,17:34:99:643,0,622
1	52290984	.	T	G	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-1.293;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:424,0,534
1	52486377	.	G	T	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-1.083;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=14.41;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:374,0,533
1	52521062	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	52521776	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	52810541	.	C	T	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:194,0,28
1	52826724	.	A	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,157
1	52882406	.	A	G	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:394,0,213
1	52882970	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:158,0,66
1	52903256	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	53151362	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,239
1	53152178	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	53153044	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:146,0,64
1	53153432	.	T	C	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:257,0,226
1	53154108	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	53192187	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	53250650	.	G	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:153,0,72
1	53289547	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,157
1	53291434	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,312
1	53291435	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,312
1	53676477	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:46:46,0,353
1	53684525	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	53787633	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	53792651	.	A	C	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
1	53793511	.	T	C	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
1	54075104	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	54260374	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	54317697	.	T	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
1	54319408	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	54355105	.	A	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:192,0,104
1	54412181	.	T	C	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:275,0,297
1	54432019	.	G	A	455.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.688;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:484,0,268
1	54506514	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	54506515	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	54506518	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	54563039	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	54637417	.	G	A	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,136
1	54637915	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,154
1	54638334	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:116,0,67
1	54644859	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,292
1	54661234	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,172
1	54681920	.	G	C	1805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1834,129,0
1	54691465	.	C	T	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:292,0,155
1	54702225	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	55182300	.	T	A	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-1.448;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:310,0,252
1	55207754	.	C	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.263	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:281,0,261
1	55224751	.	C	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,114
1	55315351	.	T	C	504.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:533,36,0
1	55316082	.	A	C	2402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2431,169,0
1	55319902	.	A	G	2345.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2374,163,0
1	55327492	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	55354335	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	55457710	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	55529828	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	55532742	.	G	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
1	55541174	.	A	G	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
1	55553554	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	55553568	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	55553569	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	55638075	.	G	A	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
1	56592052	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	56592060	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	56592061	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	56592069	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	56961051	.	G	A	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
1	56961354	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	56961756	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	59004979	.	C	T	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
1	59011573	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	59011924	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	59012431	.	C	T	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
1	59120961	.	G	A	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
1	59121166	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	59121343	.	T	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
1	59121768	.	G	C	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
1	59122289	.	T	G	274.82	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:19:303,19,0
1	59122871	.	C	T	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
1	59124546	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	59124803	.	C	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
1	59125683	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
1	59129644	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	59137111	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	59137120	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	59137210	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	59142713	.	T	C	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
1	59147926	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	59148118	.	A	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
1	59153177	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	59153179	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	59155683	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	59247400	.	T	C	13.95	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:42,0,27
1	59248813	.	G	C	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:880,63,0
1	59249031	.	T	G	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:778,54,0
1	59249347	.	G	C	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
1	59844471	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	60019853	.	C	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:143,0,281
1	61585673	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	62148365	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	62232031	.	C	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
1	62261168	.	A	G	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:270,0,141
1	62330080	.	T	G	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
1	62516683	.	G	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,114
1	62579823	.	G	A	185.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:214,18,0
1	62579907	.	C	T	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:336,0,304
1	62615054	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	62674345	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	62674349	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	62674354	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
1	62902874	.	A	G	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:514,39,0
1	62914978	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:64,0,56
1	62916796	.	T	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:182,0,230
1	62919226	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
1	62919357	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	62960101	.	A	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:88:88,0,295
1	63001244	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,99
1	63153953	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:34:66,0,34
1	63330217	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
1	65296848	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,177
1	65297240	.	A	G	206.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:235,0,24
1	65297983	.	A	T	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:118,0,27
1	65298971	.	C	T	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:175,0,108
1	65299088	.	A	C	359.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-1.755;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:388,0,336
1	65303101	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
1	65303659	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:267,0,220
1	65310489	.	T	C	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.553;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:193,0,627
1	65335062	.	A	G	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-1.358;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:210,0,468
1	65897981	.	G	A	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:286,0,373
1	65898873	.	G	C	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:295,0,349
1	65898972	.	G	A	754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:783,54,0
1	65898996	.	C	T	440.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:469,0,243
1	65900357	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,144
1	67139712	.	A	C	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
1	67390468	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	67453035	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.652;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,170
1	67875104	.	C	A	25.90	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:2:52,0,2
1	67875203	.	C	T	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
1	68167491	.	C	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,107
1	68170010	.	T	A	43.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=9;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:111,0,162
1	68170255	.	C	A	439.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=9.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=25.87;ReadPosRankSum=0.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:468,0,171
1	68591104	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	68591253	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,312
1	68591405	.	G	A	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:672,48,0
1	68603586	.	C	T	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:290,0,306
1	68603731	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	68604773	.	G	A	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
1	68624878	.	C	T	509.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-1.432;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,14:27:99:538,0,495
1	68939908	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
1	70611208	.	A	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,109
1	70611347	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	70689677	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	70711236	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	70820008	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:150,0,69
1	71529401	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.336;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:181,0,183
1	71534309	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,117
1	71536574	.	G	C	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:243,0,454
1	74670172	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
1	74675245	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	75171751	.	T	C	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.936;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:248,0,269
1	75190452	.	C	T	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:529,39,0
1	75205344	.	A	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	75214193	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	75232213	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	75681511	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	76227022	.	A	G	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.566;DP=16;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:414,0,157
1	76252011	.	G	A	77.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
1	76255228	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:75,0,31
1	76257892	.	A	T	895.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:924,63,0
1	77166640	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	77557339	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,199
1	78029102	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	82421596	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	82457662	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	83708391	.	G	A	78.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:107,0,23
1	84670457	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	84701251	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
1	84761348	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	84762953	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	84944989	.	A	G	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.054;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:210,0,384
1	84967111	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	85031630	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	85113203	.	T	C	750.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:779,54,0
1	85113229	.	A	G	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
1	85145469	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	85462750	.	T	C	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
1	85624864	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	85641435	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	85643504	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	85666327	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
1	85721911	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
1	85732739	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:73,0,68
1	85732941	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:77,0,76
1	85785655	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,214
1	85787114	.	A	T	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
1	86046561	.	C	A	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
1	86813829	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	86820267	.	C	T	489.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-0.849;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=28.81;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:518,0,120
1	86821974	.	T	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
1	86838158	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:110,0,192
1	86892819	.	G	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
1	86900332	.	T	C	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.678;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,10:27:99:348,0,640
1	86900372	.	C	G	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:252,0,409
1	86913265	.	C	T	342.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.684;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:371,0,324
1	86920904	.	A	G	553.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:582,0,350
1	87170493	.	T	G	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:275,0,125
1	87208953	.	T	A	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:241,0,453
1	87209658	.	G	A	225.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.23;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:17:254,0,17
1	87212999	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.31;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:64:274,0,64
1	87328525	.	C	T	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:700,48,0
1	87328839	.	G	A	2182.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2211,151,0
1	87379986	.	T	C	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:33:488,33,0
1	87379996	.	G	T	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:488,33,0
1	87572444	.	C	G	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:123,0,24
1	87794519	.	C	G	84.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:112,12,0
1	87811835	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
1	87812402	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
1	89225976	.	T	C	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
1	89286673	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	89295765	.	C	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	89301123	.	C	T	381.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:410,30,0
1	89322982	.	G	A	745.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:774,54,0
1	89572057	.	A	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	89573262	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	89579941	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	89582690	.	G	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
1	89589147	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	89941526	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	89941533	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	90048248	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:113,0,58
1	90242991	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	90242998	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	90296863	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	90459744	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	90474120	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	90474301	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
1	91404256	.	C	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-1.668;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:194,0,182
1	91853111	.	A	C	3153.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:3182,223,0
1	91980447	.	A	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:149,0,224
1	91991268	.	T	A	59.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:87,9,0
1	91998097	.	G	T	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
1	92715207	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	92727140	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	92863103	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:76,0,69
1	92975493	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	92976023	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	92977275	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	93089823	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
1	93160902	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	93303451	.	G	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	93303865	.	A	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
1	93304272	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	93306317	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	93580581	.	G	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
1	93591046	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	93617546	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:62:152,0,62
1	93620393	.	G	A	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.847;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=22.56;ReadPosRankSum=1.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:502,0,274
1	93646620	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	93708124	.	A	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
1	93728758	.	T	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:104,0,67
1	93741025	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	93800039	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
1	93804177	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
1	93804783	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:78,0,70
1	93804952	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:114,0,30
1	93804987	.	C	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,146
1	93811569	.	A	G	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:286,0,156
1	93826178	.	A	T	144.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:98:182,0,98
1	93827300	.	T	C	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.42;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:50:275,0,50
1	93827456	.	T	A	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:265,0,300
1	93833101	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	94016849	.	C	T	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:340,0,291
1	94019561	.	G	A	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:294,0,458
1	94249540	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	94313296	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
1	94334954	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	94335194	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	94341267	.	A	G	409.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:438,0,361
1	94342564	.	C	A	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.766;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:340,0,311
1	94343023	.	A	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=19.61;ReadPosRankSum=-1.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:342,0,262
1	94343233	.	T	C	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:855,60,0
1	94344716	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:181,0,146
1	94354639	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,372
1	94374742	.	C	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:62:92,0,62
1	94471075	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	94474328	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
1	94637058	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	94639337	.	A	G	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
1	94639447	.	C	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
1	94643531	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
1	94930345	.	G	A	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.196;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=25.78;ReadPosRankSum=-0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:415,0,136
1	94983203	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:106,0,230
1	94995819	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:74,0,29
1	95658500	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,118
1	95703607	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	95709821	.	T	C	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
1	95709939	.	T	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:175,0,67
1	96913001	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,301
1	96913002	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,301
1	96914102	.	A	T	12.48	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:4:39,0,4
1	99127392	.	T	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
1	99225627	.	G	A	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
1	100316589	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	100388503	.	A	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
1	100388748	.	T	C	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
1	100489835	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:99,0,232
1	100489992	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
1	100489996	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	100490275	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
1	100502690	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	100547994	.	T	C	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
1	100575933	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
1	100590075	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	100598866	.	G	A	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
1	100598867	.	C	T	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
1	100611320	.	A	G	88.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:117,0,27
1	100611571	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	100611931	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
1	100656494	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	100661400	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:55:55,0,345
1	100672060	.	T	C	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
1	100730518	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	100731820	.	G	A	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
1	100745285	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	101338324	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	101338482	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	102347187	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	103043649	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	103043651	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	104076462	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,175
1	104096692	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,320
1	104107089	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	106930843	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	108113097	.	A	G	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:855,57,0
1	108113101	.	G	C	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:855,57,0
1	108113129	.	C	G	644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:673,45,0
1	108113131	.	C	T	644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:673,45,0
1	108113371	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	108113375	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	108113398	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	108113403	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	108113526	.	C	G	465.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:494,36,0
1	108113547	.	T	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
1	108113548	.	G	A	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
1	108113856	.	G	A	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
1	108113865	.	G	A	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:353,24,0
1	108115145	.	T	C	1134.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1163,81,0
1	108119772	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	108121985	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
1	108125913	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	108132879	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	108677973	.	A	C	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:215,0,147
1	108678732	.	T	C	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.323;DP=26;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:290,0,666
1	108713557	.	T	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:59:123,0,59
1	108713563	.	T	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:59:123,0,59
1	108713590	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	108719199	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	108721663	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
1	109203884	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
1	109289353	.	C	G	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:35:419,35,0
1	109321615	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	109323501	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	109474027	.	A	G	257.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:286,0,18
1	109474581	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:76,0,71
1	109607038	.	C	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,218
1	109637229	.	C	G	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:297,0,210
1	109639190	.	G	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,189
1	109656946	.	T	C	639.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-1.673;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,18:34:99:668,0,588
1	109704618	.	A	G	1343.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1372,96,0
1	109711263	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	109714403	.	C	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
1	109727475	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	109735298	.	T	C	959.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=1.069;DP=41;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=23.41;ReadPosRankSum=-1.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,26:41:99:988,0,504
1	109735416	.	A	C	659.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=1.733;DP=39;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,18:39:99:688,0,733
1	109737063	.	C	T	634.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-1.381;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:663,0,469
1	109737090	.	G	A	802.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=-2.262;DP=38;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,22:38:99:831,0,573
1	109737132	.	T	C	739.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.042;DP=48;FS=10.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,21:48:99:768,0,1020
1	109737172	.	C	T	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-0.765;DP=43;FS=6.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.013	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,14:43:99:472,0,1142
1	109740548	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:114,0,61
1	109742485	.	G	A	1086.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1115,78,0
1	109744359	.	T	C	91.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:120,0,23
1	109745330	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,74
1	109745618	.	T	C	1247.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:92:1276,92,0
1	109746679	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,103
1	109746688	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,353
1	109746806	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,116
1	109747060	.	G	A	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
1	109747635	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,179
1	109748547	.	C	T	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
1	109748675	.	T	C	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
1	109748940	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,99
1	109749071	.	T	C	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
1	109749093	.	A	T	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
1	109759037	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,97
1	109774026	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	109794252	.	T	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
1	109795026	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
1	109795107	.	G	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:179,0,182
1	109795438	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:56:111,0,56
1	109795608	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	109806834	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:61:181,0,61
1	109810544	.	C	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,145
1	109817192	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:159,0,31
1	109817245	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:108,0,73
1	109817590	.	G	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,161
1	109817838	.	T	C	206.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.45;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:10:234,0,10
1	109818263	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	109818306	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
1	109824250	.	G	A	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:307,0,209
1	109825360	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	109897100	.	T	C	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:220,0,230
1	109940503	.	G	C	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:81:205,0,81
1	110026989	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	110036815	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:72,0,37
1	110037483	.	C	A	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
1	110040310	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
1	110048436	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	110048527	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
1	110049215	.	C	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:51:51,0,120
1	110052061	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	110200360	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	110201699	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	110472728	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	110697285	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	110882444	.	A	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:174,0,127
1	110886773	.	G	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:101,0,106
1	110887075	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:77,0,65
1	110914285	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	110949857	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	111726213	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	111726869	.	G	A	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:525,39,0
1	112009109	.	C	T	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
1	112010638	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	112268284	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	112298582	.	A	G	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:97:296,0,97
1	112298829	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:158,0,64
1	112308953	.	T	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,273
1	112308972	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,271
1	112309123	.	C	A	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:364,0,165
1	112309331	.	T	C	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:223,0,170
1	112991698	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:110,0,31
1	112999227	.	G	A	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
1	113000565	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	113068577	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:155,0,30
1	113214097	.	G	A	519.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-1.679;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:548,0,235
1	113236681	.	C	T	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=1.109;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=16.77;ReadPosRankSum=-1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:263,0,212
1	113237171	.	A	G	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.201	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:268,0,248
1	113239382	.	G	A	692.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.876;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,19:27:99:721,0,238
1	113241052	.	T	C	480.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-1.623;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=25.30;ReadPosRankSum=1.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:509,0,173
1	113242122	.	T	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:117,0,68
1	113243048	.	C	T	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:276,0,408
1	113244433	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	113248365	.	A	G	148.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:177,15,0
1	113255389	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	113642851	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
1	113671013	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	113933278	.	C	A	105.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
1	113933482	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,139
1	114228200	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	114233871	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	114234690	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	114354654	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:76,0,66
1	114515717	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,180
1	114516302	.	C	T	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:175,0,305
1	114518400	.	C	T	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:52:52,0,405
1	114519351	.	T	G	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=18.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:337,0,278
1	114948281	.	A	G	696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:725,51,0
1	115110683	.	A	C	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:213,0,180
1	115249469	.	C	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:137,0,251
1	115249843	.	G	A	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.592;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=16.36;ReadPosRankSum=-1.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:339,0,375
1	115262124	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	115262590	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	115262845	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	115313051	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
1	116206423	.	G	A	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
1	116213909	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	116214279	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	116225180	.	A	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	116234313	.	A	G	502.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.205;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:531,0,355
1	116234416	.	G	A	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:266,0,213
1	116234505	.	A	G	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:134,0,216
1	116235277	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:139,0,220
1	116235749	.	G	T	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:297,0,294
1	116236351	.	T	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:117,0,72
1	116237023	.	G	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:138,0,227
1	116237496	.	T	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,115
1	116238478	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	116239841	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	116240199	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	117122130	.	T	C	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:169,0,378
1	117487710	.	A	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
1	117487711	.	T	A	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
1	117529458	.	G	A	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=1.960;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=22.75;ReadPosRankSum=-2.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:415,0,207
1	117529965	.	A	G	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:296,0,129
1	117530273	.	A	G	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
1	117530477	.	G	A	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
1	117530507	.	C	T	865.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:60:894,60,0
1	117530511	.	C	T	865.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:60:894,60,0
1	117531122	.	A	G	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.294	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:93:93,0,346
1	117531620	.	G	A	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.29;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:292,0,360
1	117531627	.	A	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,678
1	117531813	.	T	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
1	117531911	.	A	G	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
1	117532372	.	G	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
1	117532509	.	C	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,136
1	117532790	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,226
1	117532891	.	T	C	214.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:243,0,24
1	117602960	.	C	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:58:148,0,58
1	117617705	.	A	G	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.489;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:375,0,292
1	117618067	.	C	T	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:257,0,174
1	117631071	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,110
1	117656088	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,121
1	117663913	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
1	117686914	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,140
1	117687125	.	A	T	88.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:17:117,0,17
1	117688400	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
1	117910682	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,197
1	118065841	.	A	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.652;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:149,0,195
1	118067306	.	T	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
1	118068934	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,157
1	118069696	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:113,0,61
1	118165691	.	C	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
1	118167199	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	118169463	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	118383768	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	118482149	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:87:152,0,87
1	119574074	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
1	119575232	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,116
1	119700120	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	119713997	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	120148987	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	120148993	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	120148994	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	120254545	.	G	C	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:401,30,0
1	120270824	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,119
1	120271778	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
1	120272477	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
1	120274455	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	120275647	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	120276102	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	120280273	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	120284988	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	120285546	.	G	A	1305.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1334,96,0
1	120293367	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	120297451	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	120301432	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	120533209	.	A	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
1	120536008	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	120536913	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	120611964	.	G	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:45:45,0,436
1	120612006	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:117,0,290
1	120612034	.	T	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.269	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:50:50,0,596
1	120612154	.	C	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,538
1	120612163	.	C	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,538
1	120612168	.	C	T	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:86:86,0,290
1	120612194	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,146
1	121484951	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	121485214	.	G	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.454;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:199,0,1379
1	121485227	.	A	T	1303.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-2.012;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.863	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,15:17:22:1332,22,0
1	121485241	.	G	C	1303.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:22:1332,22,0
1	121485251	.	A	T	1303.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:22:1332,22,0
1	121485303	.	G	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-1.062;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=1.04;ReadPosRankSum=1.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:48:48,0,1345
1	121485308	.	T	C	32.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-1.062;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:61:61,0,777
1	121485376	.	C	A	54.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.283;DP=30;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:304,0,2138
1	121485379	.	C	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.307;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,7:31:99:222,0,2153
1	121485387	.	C	T	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.087;DP=22;FS=8.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:304,0,2367
1	121485398	.	A	G	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.567;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:49:49,0,1131
1	143458078	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	143458086	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	143465428	.	T	A	205.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:234,0,25
1	144014051	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,232
1	144014068	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:41:320,0,41
1	144481200	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,176
1	144593760	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:98:98,0,103
1	144593781	.	G	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,107
1	144593877	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,703
1	144593881	.	A	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,703
1	144598641	.	C	T	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:350,0,173
1	144598659	.	C	T	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:358,0,128
1	144598755	.	G	A	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=1.209;DP=23;FS=7.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:494,0,370
1	144852992	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	144873887	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
1	144879375	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	144912153	.	A	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:277,0,185
1	144921918	.	C	T	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:247,0,294
1	144930940	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:96:96,0,312
1	144931873	.	C	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,104
1	144932220	.	G	T	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
1	145013802	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	145099495	.	G	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
1	145103366	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	145103844	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	145103928	.	G	A	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.049;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,14:36:99:489,0,839
1	145103947	.	T	C	836.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:865,63,0
1	145109549	.	G	T	784.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:813,57,0
1	145109583	.	C	A	1093.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1122,78,0
1	145110238	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	145110367	.	C	A	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
1	145111114	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	145111545	.	C	T	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
1	145111839	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	145111873	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	145112287	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	145112313	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	145112414	.	T	C	1388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1417,99,0
1	145112428	.	C	T	1360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.149;DP=35;FS=3.399;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=24.94;ReadPosRankSum=0.149	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,34:35:62:1389,62,0
1	145112485	.	C	T	1927.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1956,135,0
1	145113684	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,111
1	145114600	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	145114628	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	145114779	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	145115556	.	A	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	145115810	.	A	G	1274.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1303,90,0
1	145116027	.	T	C	1207.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1236,87,0
1	145116311	.	G	T	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
1	145116319	.	G	T	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:15:199,15,0
1	145116429	.	A	G	801.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:830,57,0
1	145116679	.	T	C	1097.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1126,78,0
1	145116798	.	G	A	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:630,45,0
1	145116833	.	C	T	751.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:780,54,0
1	145116948	.	C	T	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
1	145117448	.	G	A	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
1	145117589	.	C	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
1	145117719	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	145117818	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
1	145118171	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	145273302	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,184
1	145273431	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,187
1	145277457	.	A	G	915.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:944,63,0
1	145277469	.	G	A	906.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:935,63,0
1	145277481	.	A	G	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
1	145281656	.	A	T	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,433
1	145284883	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	145289271	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	145291108	.	A	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	145292442	.	G	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:73,0,33
1	145292474	.	A	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,206
1	145292601	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,108
1	145293469	.	G	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,215
1	145293490	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,144
1	145311931	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	145368461	.	A	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,114
1	145368837	.	C	A	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:239,0,147
1	145369708	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,372
1	145369709	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:92:159,0,92
1	145438578	.	C	A	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:704,48,0
1	145440086	.	C	T	731.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=-1.851;DP=42;FS=31.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,20:42:99:760,0,832
1	145441620	.	T	C	2111.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2140,147,0
1	145442254	.	G	C	2858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2887,196,0
1	145442264	.	T	A	2858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2887,196,0
1	145510376	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
1	145511998	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	145512024	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,196
1	145512074	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	145512889	.	C	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:52:52,0,226
1	145513017	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
1	145513113	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:112,0,61
1	145585317	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	145586309	.	C	T	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
1	145586403	.	G	T	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
1	145588536	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	145651409	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	145688968	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	145689028	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
1	145689566	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,184
1	145689568	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,184
1	146215111	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,131
1	146215113	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,131
1	146215138	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,104
1	146554801	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	146629691	.	C	A	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:95:237,0,95
1	146649854	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	146651675	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	146714392	.	G	C	278.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:307,24,0
1	146733128	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	146751782	.	A	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
1	146767149	.	G	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	146767320	.	A	G	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
1	146767353	.	G	A	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
1	147091972	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	147092112	.	G	A	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:198,0,70
1	147096794	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
1	147096828	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	147107931	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	147119273	.	G	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:96:194,0,96
1	147121977	.	C	T	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
1	147124310	.	T	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,197
1	148009510	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.543;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:280,0,456
1	148556752	.	A	C	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:271,0,138
1	148592521	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	148756499	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	148946879	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	148946881	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	149089084	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	149093156	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	149093158	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	149093159	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	149106289	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	149118876	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	149118884	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	149262554	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	149288166	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	149815536	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:105,0,32
1	149817038	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
1	149820656	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	149871905	.	G	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:143,0,109
1	149906413	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:152,0,31
1	149943157	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,75
1	150019867	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	150039678	.	G	A	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
1	150195561	.	T	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,106
1	150281191	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,191
1	150300896	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=1.065;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:150,0,550
1	150319762	.	A	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:54:242,0,54
1	150321486	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
1	150429992	.	G	T	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:249,0,436
1	150445819	.	A	G	681.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.298;DP=22;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=30.99;ReadPosRankSum=-0.298	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:99:710,0,108
1	150446067	.	C	T	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
1	150447398	.	A	G	245.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:16:274,0,16
1	150447462	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:120,0,32
1	150448019	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	150448327	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,78
1	150484987	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
1	150493925	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150527292	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150527294	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150547747	.	G	A	1492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1521,108,0
1	150555987	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
1	150555999	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	150558446	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
1	150563483	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150564476	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	150574695	.	C	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	150586971	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	150591732	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	150593887	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150593888	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150593890	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	150595537	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
1	150597261	.	G	A	337.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.423;DP=11;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=30.69;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:7:365,0,7
1	150597890	.	G	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
1	150608894	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	150782797	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
1	150938616	.	G	A	1824.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1853,129,0
1	150939604	.	G	A	612.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-1.170;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,18:45:99:641,0,1012
1	150940625	.	T	G	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.902;DP=30;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.946	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,10:30:99:317,0,690
1	150955582	.	A	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:179,0,243
1	150958836	.	A	G	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.774;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.392	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:139,0,339
1	150968188	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	150968942	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	150969567	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
1	150969992	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	150970577	.	G	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
1	150975108	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
1	150976105	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	151006539	.	C	A	279.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:308,24,0
1	151024688	.	T	G	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
1	151026815	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	151028234	.	G	T	1774.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1803,126,0
1	151031476	.	T	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	151220596	.	T	C	562.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:591,42,0
1	151221509	.	G	C	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.220	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:280,0,230
1	151227371	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	151239051	.	T	C	715.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-2.051;DP=54;FS=10.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.188	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,22:54:99:744,0,1239
1	151254041	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	151259043	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:142,0,455
1	151259543	.	G	A	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:93:93,0,301
1	151260673	.	G	A	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:85:269,0,85
1	151288172	.	G	A	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:261,0,324
1	151288391	.	A	G	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
1	151313774	.	A	G	256.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.00;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:12:284,0,12
1	151314379	.	T	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
1	151316161	.	G	A	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:544,39,0
1	151337402	.	C	A	302.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.65;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:331,0,19
1	151373200	.	T	C	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
1	151374025	.	T	C	2341.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2370,163,0
1	151510026	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
1	151510874	.	G	C	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:196,0,25
1	151512895	.	A	G	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.58;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:48:324,0,48
1	151554503	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:93:152,0,93
1	151555701	.	C	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,224
1	151555741	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:140,0,303
1	151668295	.	A	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:94:94,0,220
1	151669442	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,190
1	151669555	.	C	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,108
1	151669997	.	C	A	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.813;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:219,0,217
1	151732369	.	A	C	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=1.036;DP=32;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.998	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,13:32:99:472,0,730
1	151733335	.	T	G	573.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.638;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:602,0,653
1	151735576	.	T	C	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:362,0,420
1	151742001	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,96
1	151746079	.	A	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
1	151746202	.	T	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:77,0,31
1	151746235	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,156
1	151746524	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	151778683	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	151790311	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	151816538	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	151827813	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	151847180	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
1	151847193	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	151966348	.	C	T	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
1	152957887	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	153582258	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	153583986	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	153584986	.	A	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
1	153585584	.	G	A	1453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1482,102,0
1	153587256	.	A	T	3064.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:3093,217,0
1	153587308	.	C	T	3057.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:3086,217,0
1	153588208	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
1	153588279	.	G	A	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
1	153596603	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	153602861	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	153604029	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
1	153604519	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
1	153612053	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
1	153612133	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	153612425	.	T	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
1	153613545	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	153613783	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	153616857	.	T	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
1	153617132	.	C	A	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
1	153618766	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	153634058	.	G	T	1106.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1135,78,0
1	153635425	.	G	A	419.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:448,33,0
1	153637404	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	153637617	.	G	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
1	153700841	.	A	G	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:629,45,0
1	153720364	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	153738555	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	153779412	.	A	G	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:136,0,268
1	153780298	.	C	T	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:232,0,100
1	153781888	.	G	A	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:223,0,432
1	153903883	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,118
1	153906397	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:94:94,0,151
1	153909069	.	G	C	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:235,0,332
1	153913699	.	T	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:143,0,147
1	153920286	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,172
1	153920564	.	A	G	456.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.607;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:485,0,509
1	153926078	.	T	C	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:211,0,436
1	153927052	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	153927270	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:81,0,27
1	153929365	.	G	C	51.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:15:80,0,15
1	153932212	.	G	C	957.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-0.431;DP=49;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,26:49:99:986,0,821
1	153934303	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:110,0,28
1	153940739	.	A	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=1.084;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.084	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:148,0,499
1	153941514	.	C	T	1489.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-1.706;DP=72;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=20.69;ReadPosRankSum=1.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,41:72:99:1518,0,1084
1	153943079	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,135
1	153954646	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:184,0,221
1	153955721	.	G	C	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.472;DP=35;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,9:35:99:286,0,1013
1	154129630	.	G	T	879.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=-1.971;DP=68;FS=6.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,25:68:99:908,0,1679
1	154179679	.	T	C	1008.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.956;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=21.02;ReadPosRankSum=-0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,27:48:99:1037,0,779
1	154222639	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	154235657	.	G	A	428.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.780;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,13:34:99:457,0,732
1	154242129	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:53:53,0,227
1	154243115	.	C	T	387.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:416,0,312
1	154243457	.	A	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,154
1	154245112	.	C	T	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:48:48,0,359
1	154245917	.	T	C	1089.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.896;DP=55;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=19.81;ReadPosRankSum=-1.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,32:55:99:1118,0,778
1	154316434	.	C	T	447.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=34.43;ReadPosRankSum=-0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:7:475,0,7
1	154320942	.	A	G	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.31;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:58:265,0,58
1	154321802	.	C	T	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-2.256;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=29.40;ReadPosRankSum=2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:43:381,0,43
1	154438084	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	154438880	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	154439865	.	T	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	154522248	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	154526414	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	154554659	.	G	A	513.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-2.819;DP=25;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=20.55;ReadPosRankSum=2.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:542,0,380
1	154556040	.	T	G	1547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1576,108,0
1	154561925	.	C	T	1581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1610,114,0
1	154572285	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	154572286	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	154573419	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	154574820	.	T	C	1360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1389,99,0
1	154575040	.	C	T	1644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1673,117,0
1	154600372	.	A	G	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
1	154904840	.	T	C	1239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.431;DP=43;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=28.83;ReadPosRankSum=0.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,32:43:99:1268,0,352
1	154909169	.	C	T	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.279;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.341	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:346,0,476
1	154909268	.	A	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:479,36,0
1	154917314	.	G	A	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
1	154919080	.	C	T	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:601,45,0
1	154919160	.	C	T	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:57:193,0,57
1	154938954	.	C	T	489.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.472;DP=24;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=20.41;ReadPosRankSum=1.291	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:518,0,299
1	154977929	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	154978308	.	G	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,110
1	154981708	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	154983539	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
1	154988957	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.872;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:274,0,622
1	154989595	.	T	C	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-1.736;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:321,0,461
1	155026871	.	G	T	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.474;DP=37;FS=7.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,6:37:99:148,0,1181
1	155026942	.	A	C	2025.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2054,150,0
1	155027278	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:76,0,62
1	155030557	.	A	C	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=1.183;DP=36;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,10:36:99:334,0,1032
1	155033317	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	155033572	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	155034791	.	C	A	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.122;DP=39;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,8:39:99:232,0,1183
1	155059851	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-0.234;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:190,0,470
1	155106054	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	155106227	.	A	T	1845.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1874,132,0
1	155143859	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,143
1	155143946	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
1	155158605	.	G	A	255.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:10:283,0,10
1	155171811	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
1	155193839	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	155193844	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	155194410	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	155285799	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,318
1	155285899	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,149
1	155286471	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,187
1	155287588	.	C	T	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
1	155294274	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	155306440	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:116,0,114
1	155408635	.	T	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
1	155704057	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,112
1	155706460	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,194
1	155868984	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	155874290	.	C	G	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=9.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:215,0,335
1	155880573	.	C	G	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
1	155885112	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
1	155904177	.	T	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
1	155983298	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	156011444	.	T	C	869.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:898,63,0
1	156021891	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	156042915	.	G	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
1	156120488	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	156146218	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,203
1	156165290	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	156165317	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	156168736	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	156180349	.	T	A	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:241,0,110
1	156181007	.	C	G	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=26.32;ReadPosRankSum=-0.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:423,0,126
1	156181530	.	A	G	378.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=21.04;ReadPosRankSum=-1.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:407,0,174
1	156181770	.	A	G	847.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-0.391;DP=26;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=32.61;ReadPosRankSum=0.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,22:26:90:876,0,90
1	156186275	.	A	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:99:120,0,159
1	156186279	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,159
1	156186287	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,159
1	156186327	.	T	C	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:118,0,24
1	156186349	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
1	156186369	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	156186522	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
1	156186563	.	T	G	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
1	156186596	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	156186604	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:179,12,0
1	156186606	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:179,12,0
1	156186615	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:179,12,0
1	156189626	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	156191149	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	156195205	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:73,0,35
1	156200445	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	156201920	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156202173	.	A	G	1319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-0.198;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=29.33;ReadPosRankSum=0.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,34:45:99:1348,0,340
1	156204653	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	156206718	.	T	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
1	156208216	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156208230	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156213257	.	G	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
1	156215562	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	156215899	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	156218642	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	156218910	.	C	G	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:727,51,0
1	156219450	.	A	G	1576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1605,111,0
1	156230346	.	G	C	73.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.564;DP=51;FS=7.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,6:51:99:102,0,1772
1	156231171	.	G	C	28.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-2.354;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=0.76;ReadPosRankSum=2.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,4:38:57:57,0,1325
1	156242806	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	156244058	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156251742	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	156255456	.	G	A	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=28.79;ReadPosRankSum=-0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:44:726,44,0
1	156255833	.	G	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	156256000	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
1	156260301	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
1	156262653	.	A	C	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
1	156263097	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	156263940	.	T	C	677.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:706,51,0
1	156264000	.	G	A	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:837,63,0
1	156305286	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	156307180	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	156354293	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
1	156434703	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	156436747	.	C	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.065;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:192,0,289
1	156439560	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	156442956	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	156446903	.	T	C	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:675,48,0
1	156448261	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	156450740	.	G	A	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:480,36,0
1	156469247	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156496188	.	A	G	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
1	156498673	.	T	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
1	156499969	.	T	C	599.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-1.062;DP=19;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=31.57;ReadPosRankSum=1.062	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,16:19:50:628,0,50
1	156505061	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	156506581	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	156519799	.	T	C	92.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:121,0,23
1	156526387	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,135
1	156526444	.	T	C	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
1	156531871	.	A	G	197.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:226,18,0
1	156532207	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156532733	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
1	156532977	.	T	C	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:746,51,0
1	156536221	.	G	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
1	156536251	.	T	C	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:480,33,0
1	156539154	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	156561651	.	G	C	1712.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1741,123,0
1	156562981	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	156563375	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	156563726	.	A	C	2428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2457,172,0
1	156563813	.	G	A	1074.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1103,75,0
1	156563852	.	C	T	1663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1692,117,0
1	156563898	.	T	C	1240.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1269,87,0
1	156563992	.	C	G	919.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:948,66,0
1	156564640	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-2.973;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=8.51;ReadPosRankSum=2.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:224,0,632
1	156564922	.	C	T	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.983;ClippingRankSum=-2.601;DP=34;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=15.85;ReadPosRankSum=2.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:567,0,708
1	156692678	.	T	C	386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:415,30,0
1	156693135	.	C	T	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-1.555;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:289,0,339
1	156698265	.	C	T	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
1	156703456	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	156705593	.	G	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
1	156706559	.	A	G	470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:499,36,0
1	156713512	.	C	T	2712.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2741,190,0
1	156718448	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	156760887	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
1	156904818	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,138
1	156905584	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:186,0,65
1	156907081	.	T	C	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,113
1	156909695	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,280
1	157014964	.	T	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,73
1	157680166	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	157680989	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
1	158424892	.	A	C	999.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-1.733;DP=25;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=30.82;ReadPosRankSum=1.595	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:65:1028,65,0
1	158424914	.	T	C	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
1	158424919	.	G	C	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:33:484,33,0
1	159398118	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	159409734	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	159409857	.	A	G	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
1	159412119	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	159897126	.	C	T	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-1.096;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:198,0,511
1	159950912	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
1	159951592	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	159953102	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	159953315	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
1	159996463	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
1	159996861	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
1	160000168	.	G	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-1.545;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:177,0,292
1	160064592	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:76,0,69
1	160178356	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	160187173	.	A	G	1255.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1284,90,0
1	160189500	.	C	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
1	160189772	.	G	C	360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:389,30,0
1	160246485	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	160247185	.	G	C	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:786,57,0
1	160248443	.	T	C	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.509;DP=28;FS=9.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:423,0,603
1	160278311	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	160303416	.	G	A	1905.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1934,135,0
1	160958050	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
1	160958196	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
1	160958884	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	160959962	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,69
1	160961955	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,124
1	160962022	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:71,0,66
1	160966351	.	T	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-1.604;DP=27;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:27:92:92,0,955
1	160966434	.	T	C	1137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.028;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=34.48;ReadPosRankSum=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,29:33:41:1166,0,41
1	160967816	.	T	C	384.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.246;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:413,0,527
1	160990875	.	T	C	490.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.892;DP=35;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:519,0,2018
1	160990876	.	C	A	490.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=-0.892;DP=35;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.498;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:519,0,2018
1	160990878	.	C	T	490.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-1.087;DP=36;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,14:36:99:519,0,2018
1	160992565	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:74,0,76
1	160996375	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
1	160997880	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	160997930	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
1	160997938	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:175,12,0
1	160998984	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,219
1	160999029	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:147,0,64
1	160999030	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,200
1	161001580	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:157,0,72
1	161003672	.	T	C	215.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:244,0,21
1	161003674	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,142
1	161003692	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:70:70,0,173
1	161008535	.	C	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
1	161044549	.	C	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
1	161045128	.	G	A	245.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:274,0,22
1	161045663	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	161047220	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	161056989	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	161068240	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
1	161088695	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:77,0,65
1	161101735	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	161141432	.	C	G	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.789;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=26.82;ReadPosRankSum=-0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:511,0,149
1	161172233	.	C	A	1186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.187;DP=39;FS=14.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=30.43;ReadPosRankSum=1.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,33:39:99:1215,0,122
1	161184091	.	A	G	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=2.014;DP=18;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=3.49;ReadPosRankSum=-2.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:91:91,0,574
1	161340704	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	161340706	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	161724249	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,104
1	161724376	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:96:155,0,96
1	161724527	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,318
1	161751741	.	A	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.805;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.735	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:193,0,643
1	161928327	.	A	G	896.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:925,66,0
1	161928568	.	G	A	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
1	161929761	.	C	T	195.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:224,18,0
1	161930476	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	161930730	.	A	G	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
1	161930908	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	161930954	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,160
1	161931167	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
1	161931260	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	161931538	.	G	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	161931802	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	161932324	.	A	G	153.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:182,15,0
1	161933066	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	162303416	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	162306415	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	162307897	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	162311983	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	162327810	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	162327978	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	162328724	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:75,0,69
1	162330190	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	162334100	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	162338397	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	162338853	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
1	162339579	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	162345091	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	162350294	.	C	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	162353726	.	T	C	693.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:722,51,0
1	162354525	.	A	G	685.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:714,51,0
1	162356324	.	G	T	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:610,42,0
1	162356392	.	G	C	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:573,42,0
1	162356487	.	G	T	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
1	162493009	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.327;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.327	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:115,0,541
1	162493123	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-0.537;DP=21;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:153,0,640
1	162493665	.	T	G	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:294,0,471
1	162497663	.	G	A	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-1.231;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:227,0,547
1	162498599	.	T	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:91:91,0,304
1	162498946	.	A	G	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-1.401;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:302,0,659
1	162763860	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	163279979	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	163306236	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	163307136	.	C	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
1	163309219	.	A	T	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:695,51,0
1	163309896	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	163316415	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	163322033	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	164528870	.	T	C	205.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:234,0,21
1	164529120	.	G	A	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.332;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:220,0,364
1	164649216	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	164649240	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	164788638	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	164818795	.	A	C	894.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=1.718;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=27.11;ReadPosRankSum=-2.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,24:33:99:923,0,302
1	164818907	.	C	T	1696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1725,123,0
1	164819621	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.098;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:188,0,175
1	164820162	.	A	G	600.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.289;DP=21;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,16:21:99:629,0,156
1	165600267	.	T	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	165619424	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	165624799	.	G	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-2.072;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.88;ReadPosRankSum=2.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:147,0,227
1	165652273	.	A	G	1612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1641,114,0
1	165860813	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	165862323	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	165867719	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
1	165868169	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:118,0,73
1	165869690	.	T	A	133.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=33.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:162,0,20
1	165869700	.	T	C	133.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:20:162,0,20
1	165870071	.	A	C	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
1	165873322	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	165878498	.	C	T	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.845;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:167,0,471
1	165879020	.	T	C	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
1	165879062	.	T	C	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:695,48,0
1	165880031	.	A	G	769.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:798,57,0
1	165880111	.	T	C	642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:671,51,0
1	166469628	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	166820104	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:154,0,65
1	166820731	.	G	T	155.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:184,0,22
1	166821633	.	C	T	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=24.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:65:226,0,65
1	166822183	.	G	A	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=23.56;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:311,0,134
1	166825837	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	166826655	.	C	T	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:56:322,0,56
1	166826773	.	C	T	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:232,0,160
1	166832809	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	167391498	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,119
1	167391904	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	167392216	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	167392558	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	167392702	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	167393635	.	G	A	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:98:223,0,98
1	167394491	.	C	T	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
1	167494622	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	167510837	.	T	C	1400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1429,99,0
1	167510996	.	G	A	1152.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1181,81,0
1	167512580	.	G	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	167513418	.	C	T	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
1	167789525	.	G	C	428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:457,33,0
1	167893759	.	G	A	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=1.826;DP=51;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,8:51:99:198,0,1705
1	167906239	.	A	C	674.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:703,51,0
1	167973976	.	C	T	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=1.008;DP=36;FS=3.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.731;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.970	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,8:36:99:229,0,1098
1	168051266	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:71,0,68
1	168163313	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	168169452	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:70:70,0,271
1	168205991	.	G	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,312
1	168220407	.	A	G	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:77:82,0,77
1	168220427	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,366
1	168220430	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,366
1	168232019	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	169101280	.	G	T	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;ClippingRankSum=2.426;DP=22;FS=38.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=1.08;ReadPosRankSum=-3.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:52:52,0,611
1	169293721	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	169356833	.	G	T	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:93:359,0,93
1	169435027	.	C	T	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
1	169436603	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	169440174	.	G	A	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
1	169442211	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:122,0,32
1	169455982	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
1	169456046	.	A	G	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
1	169457028	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,113
1	169460406	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	169460726	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	169765052	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	169768080	.	C	A	372.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=31.06;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:52:401,0,52
1	169802112	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	169818880	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	169819605	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:159,0,31
1	169820999	.	T	A	41.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.256;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:70:70,0,691
1	169821488	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	169823660	.	C	T	886.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=1.633;DP=30;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,24:30:99:915,0,167
1	169823718	.	T	C	627.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.078;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,17:22:99:656,0,148
1	169825419	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	169828601	.	T	A	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
1	169831203	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	169834216	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	169835401	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	169835950	.	A	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
1	169842292	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	169848367	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	169849227	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	169849236	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
1	169850374	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	169852094	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
1	169855286	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	169890574	.	T	A	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:629,48,0
1	169892284	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	169892661	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	169951997	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.474;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:76:76,0,591
1	170015904	.	C	T	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:40:40,0,304
1	170501385	.	A	C	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
1	170502320	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	170502517	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	170504019	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	170512277	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
1	170521376	.	G	A	296.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.98;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:325,0,18
1	171493999	.	C	G	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.251;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:217,0,436
1	171509327	.	G	A	589.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:618,45,0
1	171511039	.	C	G	923.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:952,66,0
1	171514731	.	C	G	940.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:969,69,0
1	171526570	.	G	A	1199.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1228,84,0
1	171526910	.	G	A	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=-1.144;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,8:28:99:221,0,723
1	171527322	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
1	171556165	.	G	C	1180.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1209,84,0
1	171558516	.	C	T	330.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:359,27,0
1	171559634	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
1	171560345	.	T	C	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.80;ReadPosRankSum=-1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:279,0,287
1	171560348	.	T	A	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:279,0,287
1	171561025	.	G	A	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.799;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=1.19;ReadPosRankSum=1.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:52:52,0,567
1	171561225	.	C	T	840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:869,60,0
1	171561250	.	G	A	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
1	171561307	.	A	G	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:604,42,0
1	171669823	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,76
1	171673236	.	G	A	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:45,0,37
1	171673272	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:76,0,71
1	171750854	.	C	G	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:331,0,212
1	171751051	.	A	G	710.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.732;DP=30;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,19:30:99:739,0,405
1	171751236	.	T	C	719.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.541;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=28.79;ReadPosRankSum=-0.095	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,19:25:99:748,0,182
1	171753612	.	C	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.367;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:182,0,674
1	171755071	.	A	G	1003.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-1.955;DP=32;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=31.37;ReadPosRankSum=1.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,26:32:99:1032,0,159
1	171755182	.	G	A	726.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.398;DP=27;FS=12.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,19:27:99:755,0,264
1	171763549	.	C	T	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-1.950;DP=17;FS=7.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:472,0,146
1	171764281	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	171764771	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	171765964	.	A	G	550.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=-0.527;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=22.03;ReadPosRankSum=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:579,0,335
1	171766564	.	C	T	380.74	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=34.61;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:6:408,0,6
1	171952491	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	171952499	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	171952500	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	172410967	.	G	A	1267.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1296,90,0
1	172411388	.	G	A	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-1.306;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:231,0,508
1	172411496	.	A	G	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:614,42,0
1	172502340	.	T	C	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
1	172502479	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
1	172547465	.	A	G	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
1	172559323	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	172718512	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	172718516	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	173765087	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,117
1	173765772	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,270
1	173765851	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
1	173766128	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,154
1	173766243	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
1	173766250	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,170
1	173795921	.	G	A	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=1.678;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:281,0,923
1	173818589	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	173827880	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:74,0,71
1	173827951	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:120,0,68
1	173830991	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
1	173832181	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
1	173835747	.	A	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=-1.297;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=2.16;ReadPosRankSum=1.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,4:29:91:91,0,1001
1	173864541	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	174969271	.	C	T	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-0.795;DP=58;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,9:58:99:205,0,1862
1	174983633	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.694;DP=19;FS=10.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:158,0,553
1	175126223	.	T	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,241
1	175126524	.	T	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-2.475;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=7.55;ReadPosRankSum=2.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:134,0,345
1	175126538	.	C	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:213,0,143
1	175126845	.	T	C	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-0.159;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:86:554,0,86
1	175127582	.	C	T	603.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.470;DP=22;FS=14.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.44;ReadPosRankSum=-0.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,17:22:99:632,0,147
1	175127616	.	C	T	521.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:550,0,309
1	175127771	.	C	T	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=-0.027;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:270,0,728
1	175128444	.	C	A	804.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.927;DP=25;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=32.19;ReadPosRankSum=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,21:25:98:833,0,98
1	175128536	.	G	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-1.257;DP=23;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:102,0,2141
1	175128537	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-1.356;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.891	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:99:102,0,2141
1	175128543	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-1.030;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.672	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:102,0,2141
1	175128711	.	C	A	607.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-1.645;DP=22;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,17:22:99:636,0,143
1	175128726	.	A	G	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=2.345;DP=23;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:189,0,676
1	175130204	.	G	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.711;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:136,0,758
1	175130276	.	G	A	1165.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1194,84,0
1	175161849	.	G	T	638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:667,48,0
1	175952208	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	176176029	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	176176119	.	A	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-2.239;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:48:48,0,301
1	178510497	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	178516901	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	178517591	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	179012947	.	C	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:57:57,0,169
1	179041398	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
1	179042092	.	A	G	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.97;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:196,0,66
1	179042227	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
1	179042300	.	C	A	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:206,0,222
1	179042316	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,194
1	179042981	.	G	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,234
1	179043539	.	T	G	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
1	179043553	.	G	A	168.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:197,0,23
1	179045473	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:142,0,179
1	179045500	.	C	A	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
1	179051300	.	T	C	155.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:184,15,0
1	179053227	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:72,0,29
1	179054692	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	179055020	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,193
1	179056670	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	179064875	.	A	G	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
1	179068851	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
1	179069429	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
1	179070120	.	C	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
1	179070334	.	C	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
1	179071756	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	179071918	.	G	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	179072966	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	179073039	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	179075755	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
1	179310262	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:118,0,65
1	179852074	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
1	179876988	.	C	G	672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:701,48,0
1	179887125	.	G	A	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:569,42,0
1	179887681	.	G	C	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
1	179887788	.	C	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	179989742	.	G	C	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
1	180138988	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	180140096	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	180140101	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	180140617	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	180145088	.	A	G	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:548,42,0
1	180146614	.	A	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
1	180161433	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	180162293	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	180163390	.	A	G	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.033;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:414,0,357
1	180167888	.	C	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:224,0,224
1	180169330	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,225
1	180171254	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	180172512	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	180239473	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	180239535	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
1	180243980	.	C	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:70,0,60
1	180246261	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	180246451	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:65,0,37
1	180847442	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	180854067	.	A	G	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
1	180854088	.	C	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,110
1	181021579	.	G	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:117,0,31
1	181024404	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,155
1	181057874	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:78:78,0,102
1	181058643	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
1	182352621	.	T	C	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-0.423;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:382,0,651
1	182353198	.	A	T	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:136,0,324
1	182356399	.	A	G	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-2.023;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:290,0,391
1	182360843	.	C	G	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
1	182542826	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	182551337	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
1	182569626	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	182850727	.	T	C	1329.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1358,93,0
1	183486859	.	G	A	863.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:892,63,0
1	183521283	.	C	T	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
1	183596136	.	A	G	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.671;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:343,0,432
1	183604905	.	A	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,134
1	183906829	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	184020945	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:160,0,212
1	184023529	.	A	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.140;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:198,0,453
1	184035476	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:78,0,70
1	184660205	.	T	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:60:114,0,60
1	184661642	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:91:151,0,91
1	184662181	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:115,0,70
1	184675814	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:112,0,76
1	184677464	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:189,0,133
1	185088697	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	185140790	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	185171869	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
1	185267114	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:229,0,100
1	185271129	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
1	185272594	.	T	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
1	186326240	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,102
1	186326241	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,102
1	186363119	.	C	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:174,0,154
1	186390303	.	A	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,188
1	191533032	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	191534993	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	192984818	.	G	C	206.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:235,0,21
1	193054088	.	C	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-1.408;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:182,0,227
1	193054485	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,159
1	193057207	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:140,0,154
1	197053373	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	197070521	.	C	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-0.850;DP=19;FS=5.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:122,0,564
1	197070776	.	C	T	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
1	197070815	.	T	C	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:585,42,0
1	197070901	.	A	G	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:647,48,0
1	197091537	.	A	T	645.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:674,51,0
1	197112533	.	G	A	668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:697,48,0
1	197124697	.	A	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,477
1	197126649	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
1	197127491	.	A	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
1	197128726	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
1	197141243	.	A	C	45.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:8:127,8,0
1	197141253	.	A	C	85.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:8:113,8,0
1	197473969	.	A	T	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
1	197474565	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	197474817	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	197475085	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
1	197475908	.	C	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
1	197477237	.	T	C	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:521,36,0
1	197479378	.	C	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
1	198246939	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	198288709	.	A	G	585.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.693;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.188;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,16:21:99:614,0,148
1	198291334	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,114
1	200521412	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	200522566	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	200534248	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
1	200558363	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
1	200589813	.	C	A	102.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:130,12,0
1	200618238	.	T	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
1	200624485	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	200627827	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	200874728	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	201104589	.	A	G	767.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:796,54,0
1	201108930	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	201112981	.	A	G	812.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:841,60,0
1	201252701	.	A	T	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
1	201285759	.	A	G	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
1	201286771	.	C	T	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:234,0,100
1	201295501	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
1	201295714	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	201296034	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:111,0,72
1	201296487	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
1	201299263	.	A	G	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
1	201299470	.	A	C	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
1	201299748	.	G	A	706.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:735,51,0
1	201299785	.	A	C	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
1	201299852	.	A	G	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:742,54,0
1	201299900	.	G	A	676.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:705,51,0
1	201300842	.	T	C	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:704,51,0
1	201300858	.	C	A	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:544,39,0
1	201301053	.	G	A	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:210,0,377
1	201301696	.	G	A	355.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.708;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:384,0,249
1	201301711	.	G	A	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.057;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.87;ReadPosRankSum=1.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:502,0,100
1	201301873	.	A	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:135,0,232
1	201301906	.	C	G	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=12.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:349,0,124
1	201334382	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:115,0,68
1	201348043	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	201348045	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	201355522	.	T	C	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1080,78,0
1	201355669	.	T	C	589.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.235;DP=28;FS=6.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.188	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:618,0,376
1	201355943	.	C	T	1056.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1085,78,0
1	201360281	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	201371360	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
1	201434740	.	G	A	658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:687,51,0
1	201453289	.	T	C	1381.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1410,99,0
1	201454605	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,109
1	201454923	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	201455910	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	201456799	.	G	T	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
1	201457054	.	A	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	201457214	.	T	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
1	201458694	.	G	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
1	201459958	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	201461313	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:109,0,61
1	201462010	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
1	201462035	.	A	C	111.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:139,12,0
1	201484898	.	A	G	80.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:25:109,0,25
1	201484908	.	A	G	80.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:109,0,25
1	201484973	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
1	201484981	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
1	201485012	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
1	201487539	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	201489565	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
1	201503774	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	201841476	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	201845575	.	C	A	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
1	201850057	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	201931219	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	201938995	.	C	T	782.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.021;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,21:31:99:811,0,325
1	201959490	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,77
1	201960091	.	A	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,164
1	201960535	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	201962324	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	201963570	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	201964147	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:75,0,30
1	201969082	.	G	A	1101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.664;DP=53;FS=4.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,32:53:99:1130,0,734
1	201970562	.	T	C	1048.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1077,75,0
1	201985731	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	202111779	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	202113835	.	T	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
1	202304868	.	T	C	1537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1566,108,0
1	202552302	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	202705455	.	G	C	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=-1.672;DP=22;FS=12.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=22.08;ReadPosRankSum=1.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:514,0,268
1	202710733	.	C	G	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-1.664;DP=25;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:226,0,695
1	202715284	.	G	A	374.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.131;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:403,0,422
1	202718202	.	G	A	347.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=19.32;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:376,0,259
1	202733238	.	C	T	620.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-3.058;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=22.17;ReadPosRankSum=2.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:649,0,371
1	202780663	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	202820077	.	C	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,154
1	202821711	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	202821936	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	202824457	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
1	202824561	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,137
1	202826538	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
1	202826647	.	A	G	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
1	202827191	.	G	A	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,363
1	202828841	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,73
1	202830160	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	202830219	.	A	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,114
1	202833428	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
1	202842935	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:74,0,65
1	202843127	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:103,0,30
1	202848587	.	G	A	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
1	202849606	.	C	T	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
1	202849723	.	G	A	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
1	202849770	.	T	C	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
1	202850862	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
1	202853474	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	202861566	.	A	G	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
1	202931839	.	G	A	38.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:67,0,24
1	202993198	.	C	A	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:93:93,0,234
1	202993848	.	G	A	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:94:207,0,94
1	203135325	.	A	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
1	203265028	.	T	A	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
1	203267770	.	T	A	181.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:209,8,0
1	203270955	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	203271080	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
1	203271090	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
1	203271930	.	G	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
1	203272059	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,111
1	203273366	.	A	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
1	203274302	.	G	C	210.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
1	203274324	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	203274536	.	C	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
1	203310307	.	C	G	204.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:233,0,25
1	203317162	.	C	T	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:464,36,0
1	203318731	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	203346283	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	203349171	.	G	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:99,0,32
1	203355157	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	203355167	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	203357609	.	C	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
1	203359240	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	203359501	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	203363349	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	203364478	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	203365232	.	A	G	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
1	203365453	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	203365456	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	203366357	.	T	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	203366863	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	203367776	.	T	C	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
1	203371989	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	203390725	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	203391662	.	T	C	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
1	203596318	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	203651927	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
1	203652040	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
1	203652140	.	C	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
1	203652141	.	G	A	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
1	203652444	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
1	203667409	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	203709034	.	A	G	217.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:246,0,22
1	203711457	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	203765717	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.372;DP=18;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:119,0,542
1	203766395	.	T	C	283.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:11:311,0,11
1	203766827	.	T	C	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:349,0,99
1	203770448	.	T	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,151
1	203771794	.	G	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
1	203771852	.	G	T	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:44:44,0,189
1	203823066	.	G	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=22.44;ReadPosRankSum=1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:320,0,177
1	203831261	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,118
1	203834715	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
1	203836747	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
1	203838209	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	203839273	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
1	203840037	.	C	A	80.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
1	204087735	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
1	204088725	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	204095825	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.124;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:120,0,624
1	204095920	.	G	T	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:322,0,495
1	204096630	.	T	C	723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:752,54,0
1	204110547	.	C	T	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.333;DP=42;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,13:42:99:434,0,1097
1	204112138	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
1	204114846	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	204164344	.	C	T	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
1	204190412	.	C	G	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.444;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:552,0,596
1	204190416	.	G	A	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.996;DP=18;FS=8.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=29.10;ReadPosRankSum=1.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:552,0,596
1	204190873	.	A	G	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:297,0,338
1	204191409	.	T	C	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=-1.448;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.040;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:309,0,244
1	204194585	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	204194727	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
1	204196047	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:116,0,61
1	204196327	.	A	C	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.42;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:55:275,0,55
1	204196482	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
1	204197007	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	204198209	.	A	G	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.92;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:379,0,215
1	204199614	.	C	T	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:167,0,335
1	204218714	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	204327442	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	204365993	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	204365997	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	204369875	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	204379617	.	T	C	1016.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1045,72,0
1	204392257	.	G	A	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:95:95,0,281
1	204403659	.	A	G	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:171,0,263
1	204419615	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	204425028	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:112,0,72
1	204438334	.	C	T	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
1	204438643	.	G	T	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
1	204439012	.	C	T	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:186,0,65
1	204506107	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	204522457	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	204522489	.	C	T	161.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:190,15,0
1	204525593	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,75
1	204525649	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,74
1	204526205	.	C	T	46.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:75,0,27
1	204586812	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	204588140	.	G	A	86.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:114,12,0
1	204591237	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	204990860	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	205055949	.	G	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
1	205056301	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
1	205056525	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
1	205111761	.	A	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,102
1	205116635	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	205130413	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	205272926	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:76,0,31
1	205580316	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
1	205589574	.	C	T	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:118,0,26
1	205683280	.	T	C	1550.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1579,108,0
1	205683355	.	T	G	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-1.879;DP=27;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:434,0,574
1	205737450	.	T	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
1	205737956	.	G	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
1	205738166	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
1	205738251	.	C	A	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:459,36,0
1	205738302	.	G	A	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:234,0,186
1	205739192	.	T	C	371.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:400,27,0
1	205739266	.	C	T	457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:486,36,0
1	205739396	.	T	G	608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:637,45,0
1	205744138	.	G	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:121,0,149
1	205744546	.	C	A	162.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,6:7:11:190,11,0
1	205759195	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,146
1	205759876	.	T	C	47.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:73,0,1
1	205767885	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:64,0,34
1	206603535	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	206634429	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	206634997	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	206635295	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	206637133	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	206647742	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	206651107	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:112,0,68
1	206773659	.	A	G	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
1	206902437	.	A	G	462.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.027;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:491,0,435
1	206905043	.	C	T	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=1.364;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=18.02;ReadPosRankSum=-2.233	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:587,0,558
1	207195779	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
1	207221409	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	207247076	.	G	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:109,0,34
1	207249855	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:79,0,32
1	207933577	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	207941191	.	G	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
1	207941539	.	A	G	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
1	207941741	.	C	T	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
1	207941927	.	A	G	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:521,36,0
1	207942447	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:68:68,0,335
1	207942456	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,335
1	207942472	.	A	G	177.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:9:205,0,9
1	207942476	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,130
1	207943158	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:39:70,0,39
1	207943276	.	A	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.34;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:70:230,0,70
1	207943285	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:98:98,0,261
1	207943325	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,140
1	207956795	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	207986987	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	208198161	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
1	209441028	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	209959872	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
1	209960922	.	A	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:105,0,195
1	209968684	.	C	A	573.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-1.406;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=21.25;ReadPosRankSum=1.308	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,16:27:99:602,0,342
1	210004199	.	C	G	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
1	210006603	.	C	T	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
1	210848224	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
1	211479826	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	211483257	.	A	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	211488076	.	A	G	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
1	211488538	.	C	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
1	211489187	.	T	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	211533027	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	211539632	.	G	A	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
1	211540932	.	G	A	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:360,27,0
1	211542290	.	C	A	280.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:309,24,0
1	211921767	.	C	T	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:432,33,0
1	211922355	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	212004100	.	C	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
1	212113995	.	G	A	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
1	212114662	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	212114663	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	212114666	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	212273639	.	C	T	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
1	212274413	.	A	C	676.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:705,51,0
1	212276353	.	A	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:52:52,0,363
1	212277107	.	T	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
1	212277304	.	C	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
1	212560327	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
1	212911836	.	T	C	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-0.812;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:440,0,598
1	212977720	.	G	C	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:128,0,218
1	213031158	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:77,0,33
1	213031350	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
1	213031948	.	G	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:92:97,0,92
1	213032568	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	213035573	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	213068595	.	C	T	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:129,0,468
1	213069258	.	T	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,117
1	213069783	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:186,0,153
1	213071051	.	G	A	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.53;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:63:285,0,63
1	213178340	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	213224719	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,101
1	213536974	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	213536976	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	213536984	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=0;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=0.00;MQ0=0	GT:GQ:PL	1/1:6:90,6,0
1	214492286	.	G	A	1509.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1538,105,0
1	214504604	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	214505282	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
1	214505716	.	T	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
1	214524613	.	T	C	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:77,0,26
1	214525603	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
1	214526332	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
1	214528880	.	A	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:118,0,31
1	214530228	.	T	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:74,0,35
1	214531239	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:112,0,59
1	214542819	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
1	214655943	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	214776607	.	C	G	232.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:261,0,19
1	214787130	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,238
1	214788288	.	C	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:240,0,337
1	214811244	.	C	G	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=28.91;ReadPosRankSum=-1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:94:404,0,94
1	214813487	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:188,0,236
1	214813782	.	A	G	497.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.307;DP=22;FS=12.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:526,0,273
1	214813941	.	C	G	519.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.485;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:548,0,227
1	214814125	.	G	A	425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-1.826;DP=18;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:454,0,203
1	214814571	.	C	T	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-2.141;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:266,0,288
1	214814582	.	G	A	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=2.176;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:308,0,269
1	214814733	.	T	G	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.251;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.69;ReadPosRankSum=-1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:431,0,210
1	214814778	.	G	A	544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:573,0,184
1	214814995	.	C	T	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.861;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:472,0,275
1	214815916	.	T	C	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.887;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:494,0,170
1	214816142	.	T	G	454.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=30.32;ReadPosRankSum=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:76:483,0,76
1	214816224	.	G	A	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-1.362;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:275,0,405
1	214816297	.	A	G	501.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=22.81;ReadPosRankSum=0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:530,0,284
1	214818215	.	G	A	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:99:489,0,196
1	214818223	.	T	A	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.667;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=28.80;ReadPosRankSum=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:489,0,196
1	214818846	.	A	G	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.705;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=22.17;ReadPosRankSum=1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:383,0,192
1	214818945	.	A	C	517.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-0.829;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=28.76;ReadPosRankSum=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:66:546,0,66
1	214819328	.	G	A	528.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=1.833;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=24.03;ReadPosRankSum=-1.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:557,0,237
1	214819587	.	A	G	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=-0.653;DP=17;FS=22.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:423,0,218
1	214819980	.	C	T	667.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.344;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:696,0,274
1	214820099	.	A	G	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.708;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:291,0,628
1	214820299	.	A	G	488.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:517,0,144
1	214820494	.	G	A	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:354,0,128
1	214820524	.	T	C	522.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-1.031;DP=20;FS=8.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:551,0,195
1	214826196	.	G	A	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=23.79;ReadPosRankSum=-0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:504,0,233
1	214830617	.	A	G	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=2.164;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=16.20;ReadPosRankSum=-2.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:336,0,337
1	214837110	.	C	G	397.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:426,0,162
1	215741053	.	T	G	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-2.392;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:256,0,111
1	215753355	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	215793834	.	G	A	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.955;DP=34;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:424,0,831
1	216677350	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	217604124	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,79
1	217754959	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	217947738	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	219371351	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	219373414	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	219380436	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	219381648	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
1	219382717	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	219383905	.	A	G	719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:748,51,0
1	219385985	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	219582658	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	219582663	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	220142023	.	C	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:182,0,236
1	220142070	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.75;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,224
1	220142612	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	220154768	.	C	T	349.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:378,0,285
1	220197625	.	G	T	662.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:691,48,0
1	220231263	.	T	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=22.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:162,0,68
1	220231275	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
1	220231330	.	T	C	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:56:237,0,56
1	220231484	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,304
1	220231487	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:100,0,279
1	220231959	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	220231971	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,182
1	220970028	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
1	220974589	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	220980191	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
1	220980545	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	220985677	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	220987155	.	A	G	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:480,33,0
1	221912361	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
1	221912808	.	T	C	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
1	222648443	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	222802006	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
1	222802376	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	222802926	.	C	T	232.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:261,21,0
1	222803204	.	A	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
1	222833601	.	T	C	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:356,27,0
1	222835930	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	222836733	.	T	C	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
1	222836894	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:66,0,29
1	223010442	.	G	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:73,0,37
1	223176275	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
1	223457025	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	223717484	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:118,0,66
1	223718462	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:197,0,61
1	223718518	.	C	A	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:184,0,174
1	223718651	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:144,0,111
1	223718670	.	G	A	166.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:195,0,23
1	223720573	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	223720971	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	223721316	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	223721696	.	C	T	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:121,0,25
1	223721756	.	G	A	207.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:236,0,22
1	223805231	.	T	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
1	223806211	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	223900408	.	C	G	684.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:713,51,0
1	223905532	.	G	A	821.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:850,66,0
1	223934720	.	G	A	1157.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1186,87,0
1	223963091	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.670;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,4:26:92:92,0,881
1	224085700	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	224335724	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	224346959	.	G	A	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
1	224347291	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
1	224347391	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	224347433	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	224348506	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	224348700	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	224348818	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
1	224348827	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
1	224348915	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	224373608	.	T	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
1	224415342	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,339
1	224495852	.	C	T	718.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:747,51,0
1	224517842	.	C	T	363.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:392,30,0
1	224518074	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	224518354	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	224545410	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	224547192	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	224547952	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	224564374	.	C	T	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
1	224565178	.	C	T	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
1	224573601	.	C	T	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:531,36,0
1	224575018	.	C	T	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
1	224575373	.	G	A	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
1	224575740	.	C	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:47:47,0,436
1	224621934	.	G	C	330.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:27:418,27,0
1	224644885	.	G	A	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
1	225259233	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	225259979	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	225262007	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
1	225263929	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	225264083	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	225266966	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	225269055	.	T	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	225270409	.	A	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	225565015	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
1	225595690	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	225599923	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	225604871	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	225607144	.	C	T	904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:933,66,0
1	225609884	.	A	G	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:630,48,0
1	225611661	.	C	T	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
1	225675459	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
1	225680980	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	225682560	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
1	225682868	.	G	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.212;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,5:35:99:118,0,1204
1	225965527	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	225973777	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	225974614	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:121,0,402
1	225974645	.	A	G	29.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=1.141;DP=23;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=1.29;ReadPosRankSum=-1.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:58:58,0,790
1	225974672	.	A	G	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.722;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,3:26:54:54,0,1813
1	225974674	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.065;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,5:26:99:146,0,826
1	225974735	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,151
1	225974746	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,170
1	225974748	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:159,0,170
1	225976010	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,122
1	225976051	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
1	225976193	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:78:78,0,83
1	225976198	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,83
1	226019633	.	T	C	1205.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1234,90,0
1	226027548	.	C	T	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.520;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:529,0,401
1	226031465	.	T	C	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
1	226040687	.	A	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
1	226047709	.	G	A	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:297,0,137
1	226049648	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
1	226050609	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	226050832	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	226052709	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	226054656	.	G	A	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:504,36,0
1	226054681	.	T	A	348.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:377,30,0
1	226056468	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	226056913	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
1	226057855	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	226067382	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	226067799	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	226067862	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	226068927	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	226171475	.	G	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,198
1	226171800	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	226332993	.	C	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.044;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:199,0,483
1	226419166	.	G	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
1	226543691	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	226548574	.	C	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.369;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,484
1	226570840	.	T	C	1839.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1868,138,0
1	226573364	.	A	G	2078.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2107,147,0
1	226595555	.	C	G	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.429;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,12:56:99:301,0,1704
1	226820500	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,111
1	226821139	.	T	A	404.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=28.91;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:85:433,0,85
1	226821306	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,278
1	226824606	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	226923264	.	G	A	442.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.917;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=31.63;ReadPosRankSum=1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:30:471,0,30
1	226923505	.	G	T	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
1	226923938	.	A	C	547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:576,42,0
1	226924642	.	C	T	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:47:47,0,343
1	227063671	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
1	227069677	.	T	C	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:586,45,0
1	227069737	.	C	T	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:41:521,41,0
1	227071525	.	C	T	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
1	227078592	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	227080459	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	227083550	.	C	T	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:636,51,0
1	227098666	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	227164716	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	227172290	.	C	T	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:53:277,0,53
1	227174210	.	T	C	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:434,0,132
1	227174787	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:96:96,0,322
1	227174902	.	G	A	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-2.520;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:130,0,272
1	227177731	.	A	T	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
1	227178127	.	A	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,104
1	227178700	.	A	G	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=26.16;ReadPosRankSum=2.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:95:316,0,95
1	227178713	.	C	T	122.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:151,0,21
1	227178948	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	227178962	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:87:155,0,87
1	227179037	.	G	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:189,0,28
1	227179054	.	G	A	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:318,0,100
1	227179358	.	T	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
1	227180947	.	A	C	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=1.106;DP=12;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=23.73;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:313,0,99
1	227180981	.	T	C	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:171,0,231
1	227181554	.	C	G	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:189,0,558
1	227181555	.	A	G	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:189,0,558
1	227181838	.	T	G	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=21.90;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:291,0,120
1	227181923	.	C	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:170,0,164
1	227182033	.	G	A	727.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:756,54,0
1	227182575	.	A	G	833.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:862,60,0
1	227210888	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
1	227216662	.	T	C	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:346,0,240
1	227216775	.	C	T	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.073;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:231,0,213
1	227505088	.	A	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
1	227848341	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,77
1	227920061	.	T	G	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.279;DP=23;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.884;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:351,0,567
1	227923081	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
1	227935762	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.503;DP=24;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:99:103,0,792
1	227957012	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	227970069	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
1	227970870	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	228107365	.	A	G	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
1	228107430	.	T	C	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
1	228107643	.	T	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:188,0,236
1	228108932	.	A	G	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:84:84,0,232
1	228109111	.	C	T	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:198,0,103
1	228113046	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:77,0,72
1	228113073	.	C	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:183,0,100
1	228113163	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	228118465	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	228118469	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	228122901	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	228124688	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	228126470	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
1	228127227	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	228160866	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	228278653	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	228278655	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	228279865	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,115
1	228283876	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
1	228289843	.	C	T	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=1.658;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=18.75;ReadPosRankSum=-1.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:347,0,187
1	228290619	.	C	T	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.582;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:314,0,529
1	228296373	.	G	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.22;ReadPosRankSum=-1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:110,0,200
1	228303066	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	228331499	.	G	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,117
1	228334088	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
1	228334436	.	G	A	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:262,0,102
1	228335707	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	228362682	.	G	A	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:271,0,200
1	228364605	.	T	C	92.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:121,0,23
1	228366495	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,117
1	228366526	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	228368862	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
1	228371098	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
1	228371754	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	228464276	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	228586629	.	C	G	85.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:114,0,27
1	228645063	.	A	G	358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:387,0,162
1	228675250	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-2.266;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:264,0,306
1	228675442	.	G	C	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.465;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:351,0,449
1	228679528	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	228681749	.	C	T	1849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1878,129,0
1	228682330	.	C	G	2215.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2244,154,0
1	228684825	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	228880115	.	G	A	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:46:307,0,46
1	228881201	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:156,0,70
1	229400716	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
1	229403622	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
1	229439639	.	T	A	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:220,0,223
1	229440190	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,158
1	229449441	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	229457208	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	229461024	.	C	T	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:172,0,187
1	229729769	.	C	T	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:310,0,341
1	229729777	.	C	T	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=28.18;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:310,0,341
1	229730452	.	G	A	165.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:194,0,22
1	229732291	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	229738170	.	T	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:193,0,130
1	229738236	.	G	A	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:534,42,0
1	229762054	.	T	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:152,0,64
1	229771551	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,191
1	229795330	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,100
1	230398102	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	230415293	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,171
1	230416038	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,112
1	230416399	.	G	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,100
1	230416744	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,139
1	230417408	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,116
1	230417557	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:70:81,0,70
1	230417560	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:70:81,0,70
1	230829139	.	A	G	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.331;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:259,0,309
1	230898494	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
1	230903350	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
1	230913434	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	230973407	.	G	T	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
1	230973655	.	G	C	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:136,0,300
1	230974774	.	T	C	916.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:945,66,0
1	230975454	.	A	G	703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:732,51,0
1	231042732	.	T	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:119,0,72
1	231159152	.	C	G	969.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:998,69,0
1	231377081	.	C	T	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:686,51,0
1	231401902	.	G	A	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
1	231468606	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:68,0,36
1	231470772	.	A	G	69.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:114,0,67
1	231472537	.	C	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,188
1	231489353	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
1	231658301	.	A	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,102
1	231664203	.	G	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
1	231698854	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
1	232650750	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	233086456	.	T	C	283.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.45;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:12:311,0,12
1	233122127	.	C	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
1	233153473	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	233431241	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:75,0,61
1	233833747	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	233834312	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	233834572	.	A	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:123,0,33
1	234509259	.	G	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,246
1	234529552	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,195
1	234740141	.	G	A	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
1	234740549	.	A	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,338
1	234740561	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:133,0,391
1	234740880	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
1	234740975	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:111,0,70
1	234741611	.	G	C	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:196,0,108
1	234743237	.	G	A	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=2.291;DP=38;FS=16.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=13.84;ReadPosRankSum=-2.144	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,16:38:99:554,0,812
1	234744480	.	G	A	378.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:407,0,319
1	234745009	.	A	G	231.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:260,21,0
1	234745468	.	G	A	162.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:16:191,0,16
1	235187316	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
1	235187340	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
1	235188306	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
1	235188342	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	235189321	.	C	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
1	235190411	.	A	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
1	235190683	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	235190735	.	G	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
1	235273179	.	G	A	1909.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1938,132,0
1	235273194	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-1.939;DP=44;FS=8.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=0.41;ReadPosRankSum=2.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,4:44:46:46,0,1543
1	235324298	.	T	C	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.252;DP=29;FS=11.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:307,0,682
1	235324545	.	T	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,256
1	235383188	.	A	G	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
1	235491903	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:131,0,206
1	235492546	.	T	G	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
1	235492972	.	T	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,143
1	235493804	.	G	A	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
1	235506918	.	G	C	602.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:631,45,0
1	235643100	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
1	235652513	.	T	C	403.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=33.62;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:8:431,0,8
1	235667690	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	236645670	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	236700823	.	T	C	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=18.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:224,0,421
1	236700857	.	C	T	736.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=2.322;DP=25;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=29.47;ReadPosRankSum=0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,19:25:99:765,0,186
1	236702209	.	C	T	495.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:524,0,304
1	236702210	.	A	G	495.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.057;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=29.16;ReadPosRankSum=-0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:524,0,304
1	236702374	.	G	A	754.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.700;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=29.03;ReadPosRankSum=1.430	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,20:26:99:783,0,141
1	236702447	.	T	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:75:120,0,75
1	236702450	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:120,0,75
1	236702517	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:73,0,28
1	236702552	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:77,0,140
1	236702714	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:78:78,0,119
1	236702722	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:78:78,0,119
1	236702728	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,119
1	236703190	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	236703198	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	236703734	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
1	236703767	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	236704813	.	A	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	236706425	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
1	236706467	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,114
1	236706780	.	C	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,110
1	236706862	.	G	C	646.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.194;DP=29;FS=4.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,20:27:99:675,0,227
1	236708316	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,78
1	236709439	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	236709485	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
1	236710326	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	236711323	.	T	C	676.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.620;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.032;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,18:27:99:705,0,308
1	236711586	.	G	A	590.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=27.89;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:12:618,12,0
1	236711810	.	A	G	462.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=1.642;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=27.22;ReadPosRankSum=-0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:491,0,126
1	236711882	.	G	T	838.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.057;DP=22;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=29.27;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,20:22:99:867,0,180
1	236711886	.	C	T	838.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=1.405;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=36.31;ReadPosRankSum=1.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:99:867,0,180
1	236711951	.	T	A	697.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.385;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=30.34;ReadPosRankSum=1.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,17:23:99:726,0,396
1	236711956	.	A	C	697.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.783;DP=23;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=30.34;ReadPosRankSum=2.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,18:23:99:726,0,396
1	236711981	.	C	T	715.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-1.148;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=32.53;ReadPosRankSum=0.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,19:22:56:744,0,56
1	236712857	.	C	T	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=1.071;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:75:552,0,75
1	236712989	.	A	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.926;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:142,0,431
1	236713556	.	G	A	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.602;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.57;ReadPosRankSum=-0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:514,0,162
1	236713828	.	G	A	398.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=24.92;ReadPosRankSum=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:427,0,174
1	236714064	.	A	C	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:212,0,262
1	236714335	.	C	T	214.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:243,0,21
1	236714384	.	G	A	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:161,0,29
1	236714747	.	T	C	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:271,0,211
1	236714916	.	T	C	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:266,0,231
1	236715517	.	T	C	337.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=33.79;ReadPosRankSum=-0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:14:366,0,14
1	236716959	.	C	T	356.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:385,0,167
1	236717926	.	T	C	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-2.000;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:382,0,336
1	236718620	.	T	C	330.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:16:359,0,16
1	236719135	.	T	C	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
1	236719193	.	A	G	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.361;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=29.78;ReadPosRankSum=-1.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:49:475,0,49
1	236721610	.	G	A	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:46:300,0,46
1	236721660	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,113
1	236721731	.	T	C	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
1	236724715	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	236739210	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	236739416	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	236744712	.	C	A	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
1	236746443	.	C	T	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:217,0,171
1	236748505	.	T	C	432.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.516;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=28.85;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:76:461,0,76
1	236749649	.	T	C	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.97;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:49:280,0,49
1	236755837	.	C	T	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=2.637;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:208,0,186
1	236758887	.	T	C	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
1	236761798	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	236767330	.	A	G	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=32.60;ReadPosRankSum=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:50:452,0,50
1	237048500	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
1	237056601	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
1	237056610	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	237058744	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,221
1	237058828	.	C	T	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
1	237061056	.	A	C	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
1	237062198	.	A	C	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:449,30,0
1	237062305	.	A	G	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
1	237062628	.	C	T	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:273,0,175
1	237063335	.	G	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
1	237064626	.	T	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
1	237065326	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
1	237065583	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	240925536	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	240925537	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	240925539	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
1	242011344	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	242011534	.	A	G	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:235,0,105
1	242017731	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	242030151	.	A	G	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.197;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=26.43;ReadPosRankSum=-0.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:504,0,153
1	242042301	.	G	A	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:837,60,0
1	242045275	.	C	T	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
1	242048006	.	T	C	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
1	242053042	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	242054237	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	242056303	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
1	242056311	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	242059707	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	243230580	.	C	A	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
1	243230582	.	G	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.881;DP=10;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:182,0,150
1	243391634	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	243481431	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,80
1	243493907	.	A	T	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:216,0,180
1	243579112	.	G	A	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:182,0,289
1	244219563	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	244585115	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	244585659	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	244615179	.	G	A	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-2.335;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:89:89,0,405
1	244869479	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:138,0,312
1	244871041	.	T	A	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-2.060;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:179,0,435
1	245000664	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	245003030	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	245005085	.	G	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:361,0,139
1	245005373	.	A	G	369.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:9:397,0,9
1	245005713	.	A	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=22.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:162,0,72
1	245005828	.	C	T	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.60;ReadPosRankSum=-1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:309,0,177
1	245005841	.	T	A	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:303,0,237
1	245006827	.	A	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:429,0,239
1	245012509	.	T	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:34:194,0,34
1	245013777	.	A	C	130.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:159,15,0
1	245013807	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,119
1	245245402	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=19.90;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:267,0,180
1	245251020	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
1	245254650	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	245281423	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	245912840	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,196
1	246021875	.	G	A	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:87:356,0,87
1	246021941	.	T	C	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-1.408;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:232,0,190
1	246426270	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	246460890	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	246470560	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	246486085	.	A	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
1	246670481	.	C	G	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
1	246712033	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
1	246714587	.	G	A	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1099,75,0
1	246715196	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
1	246717781	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
1	246718103	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	246720174	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	246720798	.	G	A	504.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:533,36,0
1	246725180	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
1	246755124	.	T	C	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,106
1	246810619	.	G	A	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:296,0,161
1	246829616	.	T	C	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
1	246829742	.	T	C	155.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:184,15,0
1	246829873	.	G	A	508.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:537,39,0
1	246830293	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
1	246830488	.	T	C	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
1	246831356	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:189,0,66
1	246922390	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.315;DP=23;FS=7.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.385	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:190,0,673
1	246930874	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,193
1	246931057	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
1	246950878	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
1	247048834	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=2.079;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:75:75,0,546
1	247090206	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	247095203	.	C	G	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-0.260;DP=29;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.260	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:126,0,861
1	247107152	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
1	247109014	.	G	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-2.637;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=2.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,301
1	247149918	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:156,0,31
1	247149996	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:121,0,33
1	247151557	.	A	G	347.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-2.293;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=19.32;ReadPosRankSum=2.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:376,0,183
1	247261608	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
1	247262152	.	C	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,321
1	247262783	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,170
1	247263719	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.764;DP=15;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,539
1	247264450	.	A	G	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.58;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:284,0,102
1	247267269	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:115,0,67
1	247309693	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:33:39,0,33
1	247309694	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:33:39,0,33
1	247309695	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:33:39,0,33
1	247332508	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
1	247337412	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,77
1	247338764	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	247339139	.	C	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:119,0,33
1	247339170	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:114,0,31
1	247339846	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247339847	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247339849	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247339853	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247340263	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
1	247340289	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247342999	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
1	247343994	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,78
1	247352621	.	T	C	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:337,0,265
1	247353355	.	G	A	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.957;DP=37;FS=11.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:410,0,947
1	247360087	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
1	247365848	.	T	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,263
1	247366284	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247366294	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247367342	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
1	247367535	.	C	T	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:79,0,26
1	247409018	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	247459503	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247462048	.	A	G	1155.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1184,81,0
1	247462273	.	A	G	1145.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1174,81,0
1	247463905	.	C	G	35.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=2.044;DP=30;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=1.19;ReadPosRankSum=-2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:64:64,0,1023
1	247465244	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	247465776	.	T	G	42.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:70,5,0
1	247466538	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247466744	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	247470703	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
1	247470836	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,123
1	247472114	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,160
1	247472575	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:144,0,107
1	247472605	.	C	T	203.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:232,0,21
1	247477068	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:63,0,31
1	247479335	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	247480880	.	C	G	56.19	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
1	247481583	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
1	247484065	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
1	247484614	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	247485932	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
1	247486213	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:66,0,33
1	247492634	.	C	G	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.664;DP=29;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:132,0,921
1	247497219	.	C	T	577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:606,42,0
1	247497527	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
1	247498567	.	G	A	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
1	247500399	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
1	247501489	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	247504922	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
1	247506845	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	247508017	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
1	247508452	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
1	247509402	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247512256	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
1	247519960	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247521847	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
1	247523330	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:74,0,35
1	247524100	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
1	247524795	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
1	247530238	.	T	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
1	247538686	.	C	T	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
1	247538751	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
1	247540218	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
1	249143646	.	G	T	240.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:17:269,0,17
1	249148399	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:120,0,57
2	45895	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
2	116528	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	236950	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	239416	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	240255	.	A	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
2	240630	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	259774	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	260594	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	263270	.	T	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
2	272051	.	C	T	456.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=-0.363;DP=26;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=17.57;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:485,0,369
2	273070	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	273621	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	276346	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	276908	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	276942	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	277995	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-0.441;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:81:81,0,509
2	671102	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	671939	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	674054	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	674781	.	G	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	674963	.	G	A	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
2	675831	.	G	T	606.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:635,45,0
2	676177	.	C	G	650.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:679,48,0
2	745269	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	747684	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1218477	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1218481	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1218487	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1218495	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1441549	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	1457364	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	1459334	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
2	1464486	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1469485	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1469675	.	C	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
2	1469946	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	1479557	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	1479566	.	T	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:171,12,0
2	1479570	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:171,12,0
2	1485858	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	1522180	.	A	C	84.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:113,0,27
2	1525529	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	1525558	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	1544147	.	A	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:114,0,69
2	1545110	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	1546327	.	C	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-2.219;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=16.42;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:176,0,135
2	1550463	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:121,0,33
2	1556818	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	1557927	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
2	1563390	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1567755	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1571112	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	1590361	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
2	1593314	.	C	T	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
2	1599173	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	1599463	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,226
2	1599850	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,170
2	1599854	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,170
2	1599855	.	C	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,170
2	1608130	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
2	1611692	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	1623608	.	G	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
2	1623765	.	T	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
2	1624679	.	T	C	203.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:232,0,23
2	1624712	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	1636053	.	A	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
2	1636553	.	C	A	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:816,60,0
2	1636904	.	C	T	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
2	1638496	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	1639880	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	1642369	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	1647171	.	T	C	764.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:793,60,0
2	1652822	.	T	G	1020.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1049,72,0
2	1654497	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	1657078	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	1669119	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	2640611	.	G	A	30.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:59,0,30
2	2642208	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	3192798	.	T	C	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
2	3193040	.	G	A	30.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.237;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:59:59,0,585
2	3200391	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	3203977	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	3207693	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	3209162	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	3383538	.	C	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
2	3391826	.	C	T	77.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:106,0,24
2	3392075	.	T	C	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.58;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:57:294,0,57
2	3392295	.	A	G	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=31.70;ReadPosRankSum=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:33:472,0,33
2	3451704	.	G	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:111,0,32
2	3454217	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	3454795	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	3457459	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	3459656	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:77,0,65
2	3459742	.	A	G	45.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:74,0,23
2	3464810	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	3469463	.	G	C	795.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:824,60,0
2	3469702	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
2	3469708	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
2	3470115	.	T	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:312,21,0
2	3470124	.	G	A	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
2	3470186	.	G	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
2	3470254	.	T	G	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
2	3470416	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	3470534	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	3471146	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	3471549	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	3471950	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	3472138	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
2	3472665	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	3473670	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	3473727	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	3474085	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	3475399	.	T	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	3475498	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
2	3476104	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	3476234	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	3476422	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	3477014	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	3477854	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	3478452	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	3479032	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	3480366	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	3480563	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	3480710	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	3481637	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	3481716	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
2	3481857	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	3482912	.	G	A	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
2	3483205	.	C	T	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:432,33,0
2	3483390	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	3487038	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	3498184	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	3502035	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
2	3502055	.	T	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:98:98,0,184
2	3502198	.	T	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,170
2	3502308	.	C	A	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-0.063;DP=31;FS=7.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,10:31:99:245,0,794
2	3502398	.	C	T	1010.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.534;DP=36;FS=3.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,27:36:99:1039,0,253
2	3502625	.	T	C	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=-0.653;DP=17;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=23.57;ReadPosRankSum=2.261	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:429,0,182
2	3502709	.	A	G	792.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.354;DP=35;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=22.65;ReadPosRankSum=1.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:821,0,482
2	3504687	.	A	G	1784.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1813,126,0
2	3579760	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
2	3587281	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	3589803	.	A	G	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
2	3589945	.	A	G	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:237,0,109
2	3592169	.	T	C	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:85:273,0,85
2	3592329	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:95:152,0,95
2	3606436	.	G	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:87:87,0,403
2	3606585	.	G	T	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=22.91;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:349,0,131
2	3607238	.	C	T	204.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:233,0,24
2	3622934	.	C	G	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.474;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:166,0,431
2	3626418	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	6078269	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
2	6078805	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	6079044	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	6087258	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	6087893	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	6109690	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
2	6111261	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
2	6111810	.	G	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
2	6112702	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,147
2	6113168	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	6117147	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	6117771	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	6119477	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	7137067	.	A	G	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
2	7154632	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	7164578	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
2	7181486	.	A	G	85.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:114,0,26
2	7181560	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	7182177	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	8708552	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	8813308	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	8823163	.	T	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:183,0,66
2	8837635	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	8863006	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
2	8870814	.	A	G	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:444,33,0
2	8872626	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	8885472	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	8993342	.	C	T	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=23.21;ReadPosRankSum=-1.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:330,0,138
2	8993505	.	A	C	420.96	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:5:448,0,5
2	8996163	.	T	A	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:88,0,30
2	8996323	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:280,0,236
2	8996326	.	C	T	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:280,0,236
2	8998624	.	A	G	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
2	8998871	.	T	C	415.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:444,0,126
2	9001492	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	9158031	.	T	C	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
2	9245531	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	9246593	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
2	9246648	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	9471279	.	T	C	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
2	9491017	.	C	T	958.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:987,69,0
2	9514917	.	C	T	709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:738,51,0
2	9544667	.	G	A	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.304;DP=20;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:336,0,407
2	9546030	.	C	T	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=1.653;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=23.38;ReadPosRankSum=-1.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:379,0,170
2	9547171	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	9547363	.	C	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
2	9548651	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	9554461	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	9580677	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.372;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.316	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,6:28:99:180,0,829
2	9616035	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	9617748	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	9619596	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	9629367	.	T	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
2	9630016	.	T	C	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
2	9630231	.	C	T	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
2	9633137	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	9634856	.	A	G	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
2	9637085	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	9638381	.	A	C	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
2	9639194	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
2	9729165	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	9739225	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	9770613	.	G	A	1408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=3.670;DP=58;FS=9.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=24.29;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,42:57:99:1437,0,426
2	9771200	.	C	G	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
2	10044999	.	C	G	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:90:227,0,90
2	10045014	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	10045024	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	10050947	.	T	C	95.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:122,2,0
2	10050960	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
2	10053610	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:67,0,37
2	10058846	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	10059770	.	G	T	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
2	10077293	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	10091952	.	G	A	586.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.553;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.332	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,16:22:99:615,0,195
2	10094992	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
2	10095185	.	T	C	666.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-1.301;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=26.67;ReadPosRankSum=1.301	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:695,0,211
2	10101468	.	A	G	926.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-1.582;DP=27;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=34.32;ReadPosRankSum=1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,24:27:43:955,0,43
2	10126330	.	G	A	843.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.280;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.178	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,22:29:99:872,0,223
2	10130973	.	T	G	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:200,0,26
2	10131078	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	10131094	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	10135681	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	10138209	.	C	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
2	10138214	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:73,6,0
2	10139764	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	10142073	.	T	C	570.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-1.198;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.269	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:599,0,235
2	10188649	.	A	T	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
2	10194192	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	10194487	.	T	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
2	10262920	.	T	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.297;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:99:120,0,1007
2	10335027	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
2	10537018	.	A	G	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-1.414;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:224,0,900
2	10548826	.	T	C	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:199,0,299
2	10560175	.	G	C	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.719;DP=32;FS=3.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:261,0,921
2	10566190	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
2	10566198	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
2	10567082	.	A	G	650.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:679,51,0
2	10711941	.	C	A	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
2	10717806	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.324;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:151,0,518
2	10822148	.	C	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:55:55,0,318
2	10908233	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	10908252	.	G	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
2	10942644	.	C	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=-2.008;DP=31;FS=35.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=2.64;ReadPosRankSum=2.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,7:31:99:110,0,858
2	11706693	.	T	C	710.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=-0.118;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,20:29:99:739,0,252
2	11721535	.	T	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
2	11722012	.	C	G	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
2	11722082	.	C	T	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
2	11722102	.	A	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
2	11722468	.	G	A	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
2	11722575	.	A	G	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
2	11723021	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
2	11723110	.	G	A	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
2	11723858	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	11724475	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	11724580	.	G	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
2	11724684	.	A	G	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
2	11725049	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	11725241	.	G	A	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
2	11727507	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	11727988	.	G	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	11729606	.	A	G	116.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:144,12,0
2	11731774	.	T	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
2	11731846	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
2	11733488	.	G	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
2	11734315	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	11734335	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	11734880	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
2	11734905	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	11734909	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	11736037	.	A	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
2	11738091	.	T	C	1520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1549,108,0
2	11744232	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	11744694	.	C	T	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
2	11752635	.	T	C	1403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1432,99,0
2	11762226	.	A	G	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:38,0,36
2	11765936	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
2	11774324	.	G	A	1686.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1715,120,0
2	11774913	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	11776550	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	11776675	.	C	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	11776789	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	11776824	.	A	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	11777304	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
2	11777484	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	11777757	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	11779162	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	11779603	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	11782310	.	C	T	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:529,36,0
2	11913845	.	G	C	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=22.70;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:346,0,155
2	11924293	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	11925165	.	C	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,311
2	11965541	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:117,0,65
2	11965814	.	C	T	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:44:44,0,431
2	12858444	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
2	15601441	.	C	T	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
2	15607842	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
2	15614404	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
2	15615910	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
2	15674686	.	T	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
2	15693578	.	C	T	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:169,0,151
2	15735648	.	T	C	1104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.991;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,29:38:99:1133,0,289
2	15746129	.	C	T	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=-1.065;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,11:36:99:347,0,944
2	15747393	.	C	T	1366.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1395,96,0
2	16086469	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	17845296	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
2	17846162	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=17.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,199
2	17884495	.	C	T	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:125,0,302
2	17897488	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.652;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=9.86;ReadPosRankSum=1.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:117,0,180
2	17938501	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	17942775	.	T	A	128.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:157,0,25
2	17954027	.	G	A	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
2	17958762	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	17962450	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=22.34;ReadPosRankSum=2.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:274,0,143
2	17962518	.	C	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:123,0,105
2	17965931	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
2	17966157	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	18112314	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:72,0,33
2	20098561	.	G	A	43.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:72,0,21
2	20240668	.	C	A	707.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.486;ClippingRankSum=-0.401;DP=63;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,21:63:99:736,0,1634
2	20402380	.	C	G	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=1.252;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=11.90;ReadPosRankSum=-1.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,19:53:99:659,0,1320
2	20403794	.	A	T	2301.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2330,169,0
2	20405673	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	20406003	.	G	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	20409484	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	20409638	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	20448561	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
2	20466011	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	20812204	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	20817673	.	G	A	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.34;ReadPosRankSum=-2.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:51:362,0,51
2	20817777	.	C	T	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-0.650;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:84:84,0,457
2	20818193	.	G	A	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=1.836;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.926	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:90:90,0,672
2	20818286	.	A	C	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.566;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:171,0,422
2	20818454	.	T	A	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.406;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,5:27:99:140,0,1722
2	20818458	.	G	A	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:99:140,0,1722
2	20818764	.	C	T	757.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=31.57;ReadPosRankSum=-1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:27:786,27,0
2	20822564	.	C	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
2	20823724	.	T	C	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1080,78,0
2	20824559	.	C	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.449;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:254,0,422
2	20838222	.	C	T	598.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.479;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,16:22:99:627,0,194
2	20838318	.	G	A	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=-0.167;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.167	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:186,0,705
2	20841993	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	20884973	.	A	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
2	20885321	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	20887892	.	G	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	20891887	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
2	23973799	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	24108652	.	T	C	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
2	24167425	.	G	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
2	24167469	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	24167473	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:84,6,0
2	24222942	.	A	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.098;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:192,0,184
2	24224134	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,104
2	24225621	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	24252417	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	24307681	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	24431184	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:68,0,29
2	24462883	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	24462915	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	24463398	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	24463445	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	24463987	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
2	24524958	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:154,0,64
2	24550958	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:71,0,66
2	24583198	.	T	A	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
2	24583398	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	24905927	.	G	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,109
2	24974945	.	T	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:51:51,0,116
2	24991569	.	C	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:57:57,0,154
2	25042622	.	A	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-0.757;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:231,0,1442
2	25042625	.	C	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-1.559;DP=25;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:231,0,1442
2	25045195	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:181,0,180
2	25259442	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	25259953	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	25260276	.	C	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
2	25377176	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
2	25378372	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
2	25379908	.	T	C	105.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
2	25452906	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:119,0,32
2	25473547	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	25655772	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:195,0,66
2	25961583	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:89:89,0,389
2	26150589	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	26150773	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	26151206	.	T	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
2	26151643	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	26177198	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,105
2	26203678	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	26204640	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	26205081	.	A	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	26257249	.	C	G	1681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1710,114,0
2	26257250	.	G	C	1681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1710,114,0
2	26306473	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	26358110	.	G	C	1080.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1109,78,0
2	26359315	.	G	A	1201.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1230,84,0
2	26413917	.	C	T	1202.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1231,84,0
2	26415897	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	26415912	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	26434022	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	26434605	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	26481446	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	26512957	.	G	C	1730.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1759,120,0
2	26590084	.	T	G	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=1.371;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:87:489,0,87
2	26607992	.	T	C	867.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:896,63,0
2	26612465	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-2.106;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:160,0,626
2	26613056	.	C	T	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
2	26613329	.	A	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,190
2	26613974	.	C	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
2	26616356	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,263
2	26616401	.	A	T	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
2	26616468	.	T	C	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.545;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:293,0,182
2	26617209	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,312
2	26618543	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.503;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:68:68,0,647
2	26952998	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,115
2	26990507	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	27001973	.	C	T	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:493,33,0
2	27003021	.	T	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:121,0,524
2	27004254	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
2	27016988	.	C	T	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:578,42,0
2	27171245	.	C	T	686.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=1.658;DP=21;FS=7.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=32.70;ReadPosRankSum=-1.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,18:21:69:715,0,69
2	27172069	.	T	C	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
2	27246285	.	C	T	165.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:194,15,0
2	27260469	.	G	A	520.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.139;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=27.41;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:549,0,165
2	27292651	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,141
2	27293150	.	G	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:147,0,127
2	27315252	.	G	A	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:87:356,0,87
2	27321887	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	27323385	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
2	27323468	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	27324036	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,100
2	27324724	.	G	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,195
2	27324751	.	G	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=5.21;ReadPosRankSum=-1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:96:96,0,321
2	27341771	.	C	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:133,0,101
2	27354173	.	C	A	1190.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1219,87,0
2	27356929	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	27422605	.	C	T	1638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1667,114,0
2	27424496	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	27424636	.	G	A	1246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.949;DP=44;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.840	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,33:44:99:1275,0,338
2	27426514	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	27426878	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
2	27428147	.	A	G	558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:587,42,0
2	27428295	.	A	G	1880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1909,132,0
2	27430781	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:229,0,139
2	27431413	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	27432547	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	27432597	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	27433062	.	A	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
2	27435250	.	A	G	1372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1401,99,0
2	27435374	.	G	A	306.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=21.91;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:335,0,167
2	27440785	.	C	T	716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:745,54,0
2	27460968	.	A	G	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:51:51,0,445
2	27461496	.	C	T	493.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.701;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.51;ReadPosRankSum=-0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:522,0,203
2	27462076	.	C	T	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:255,0,440
2	27541930	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	27544713	.	A	C	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
2	27550967	.	A	G	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=1.279;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:414,0,868
2	27599875	.	T	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=8.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:240,0,364
2	27600239	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
2	27604279	.	A	G	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.250;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,11:41:99:352,0,1098
2	27606098	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	27796526	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	27844601	.	T	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:107,0,67
2	27873326	.	C	G	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:327,0,366
2	27873415	.	G	A	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-2.500;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.25;ReadPosRankSum=2.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:204,0,476
2	27884878	.	C	T	586.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:615,42,0
2	27887034	.	C	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:56:56,0,221
2	28632191	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	28638358	.	G	C	982.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1011,72,0
2	28639641	.	C	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
2	29001691	.	A	G	1321.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1350,93,0
2	29023749	.	A	G	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.198;DP=30;FS=9.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,10:30:99:332,0,786
2	29025479	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,214
2	29092679	.	T	C	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:190,0,157
2	29092850	.	G	T	449.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-1.302;DP=17;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=26.46;ReadPosRankSum=1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:478,0,100
2	29135468	.	C	G	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:278,0,461
2	29149050	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	29152456	.	A	G	1193.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1222,84,0
2	29169612	.	T	C	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.334;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:309,0,706
2	29175207	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	30381505	.	T	C	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.670;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:307,0,436
2	30949634	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	30951486	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
2	30951984	.	T	C	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:79,0,27
2	30960671	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	30975961	.	G	T	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:55:201,0,55
2	30980940	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:115,0,67
2	31489727	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
2	31490659	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:75,0,71
2	31490716	.	C	G	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
2	31496678	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
2	32168123	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	32446613	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
2	32447718	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,110
2	32447868	.	A	G	662.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:691,48,0
2	32533662	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
2	32534838	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:111,0,67
2	32534891	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
2	32535568	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,116
2	32535797	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,343
2	32535836	.	A	G	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,105
2	32539236	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	32667182	.	G	C	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
2	32713706	.	A	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
2	32822957	.	G	A	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
2	32843295	.	A	T	145.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:19:286,19,0
2	32855615	.	A	G	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
2	32983526	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:111,0,66
2	33412077	.	G	A	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
2	33447202	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	33540248	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=20.10;ReadPosRankSum=-1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,104
2	33585796	.	T	C	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
2	33623720	.	A	G	316.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=31.69;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:15:345,0,15
2	33623734	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
2	33809294	.	A	G	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
2	33816585	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	36776271	.	C	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:97:97,0,196
2	36777825	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:76,0,69
2	36810586	.	T	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:132,0,480
2	37024713	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:111,0,33
2	37025076	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	37025114	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	37073809	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	37074951	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
2	37075397	.	T	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	37230734	.	C	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:199,0,28
2	37306343	.	G	A	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
2	37325780	.	A	G	132.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.48;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:8:160,0,8
2	37327244	.	A	G	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
2	37327662	.	T	C	254.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:283,0,22
2	37327669	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,398
2	37327684	.	A	C	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
2	37327806	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,179
2	37328016	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.98;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,317
2	37328034	.	T	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:143,0,237
2	37328075	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:45:45,0,400
2	37328097	.	T	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:137,0,393
2	37328362	.	G	T	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
2	37329214	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,227
2	37329261	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,241
2	37329347	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,150
2	37329534	.	A	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
2	37331119	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,189
2	37331171	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	37331627	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,266
2	37384097	.	G	T	47.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:73,0,1
2	37429526	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,130
2	37435306	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	37440614	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	37456032	.	C	T	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
2	37458711	.	G	A	201.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:15:230,0,15
2	37479756	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	37479862	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:49:157,0,49
2	37479959	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	37480249	.	A	G	252.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.61;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:17:281,0,17
2	37518045	.	G	C	93.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:122,0,20
2	38295994	.	G	A	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=29.06;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:55:377,0,55
2	38296890	.	T	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
2	38297170	.	C	A	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
2	38297515	.	G	T	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
2	38298139	.	T	C	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=-1.444;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=0.74;ReadPosRankSum=0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:39:39,0,527
2	38298150	.	A	G	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
2	38298203	.	C	G	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
2	38302177	.	C	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:117,0,64
2	38537579	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.470;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:151,0,677
2	39008468	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	39025555	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
2	39082344	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	39088323	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
2	39103053	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	39209426	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
2	39209514	.	T	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
2	39209820	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,179
2	39210391	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:75,0,71
2	39210398	.	A	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
2	39211121	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	39212637	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
2	39281730	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	39477170	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
2	39480215	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	39494197	.	C	T	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
2	39503691	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	39515384	.	G	A	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,352
2	39519942	.	C	T	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:43:43,0,272
2	39583446	.	A	G	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:654,45,0
2	39826849	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	42396722	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:101,0,68
2	42510018	.	A	G	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
2	42512638	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	42515388	.	A	G	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
2	42515437	.	A	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:231,0,230
2	42530331	.	C	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:194,0,180
2	42577806	.	T	A	47.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=2.013;DP=27;FS=17.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.785	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:27:76:76,0,1997
2	42577813	.	T	C	47.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=1.175;DP=30;FS=11.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,3:30:76:76,0,1997
2	42578149	.	A	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-2.044;DP=39;FS=8.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,6:39:99:142,0,1301
2	42981239	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	42981990	.	C	T	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
2	42983004	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
2	43451931	.	C	T	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.902;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:215,0,563
2	43801712	.	A	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:149,0,137
2	43805739	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,105
2	44004010	.	T	C	228.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:14:257,0,14
2	44033896	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	44036922	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	44114074	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	44119416	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	44161960	.	T	C	1065.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.277;DP=45;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.084	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,30:45:99:1094,0,515
2	44201376	.	T	C	749.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.472;DP=34;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,20:34:99:778,0,494
2	44209477	.	C	T	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.135;DP=22;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:321,0,501
2	44396235	.	T	G	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:523,39,0
2	44546016	.	C	T	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
2	44546741	.	T	C	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
2	44547131	.	A	G	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
2	44547574	.	G	A	849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:878,60,0
2	44547909	.	T	C	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
2	44548282	.	T	C	704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:733,51,0
2	45232686	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	45640334	.	T	C	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=26.97;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:244,0,64
2	46613523	.	G	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:194,0,101
2	46739157	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
2	46986416	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,149
2	46987300	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	47129502	.	G	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:182,0,259
2	47129944	.	G	A	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:358,0,172
2	47130527	.	G	A	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=23.65;ReadPosRankSum=-1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:383,0,161
2	47130850	.	A	G	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
2	47130925	.	A	C	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:280,0,132
2	47131335	.	C	A	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
2	47133681	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	47251469	.	G	C	437.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.424;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:466,0,125
2	47279003	.	G	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=1.27;ReadPosRankSum=1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:46:46,0,475
2	47301386	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
2	47301744	.	T	C	792.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:821,57,0
2	47302095	.	T	C	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
2	47302829	.	C	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
2	47395379	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
2	47398394	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	47399064	.	C	T	60.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:88,9,0
2	47399415	.	G	A	265.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:294,24,0
2	47399975	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	47400958	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,205
2	47401264	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	47402064	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	47403129	.	G	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	47601106	.	T	C	1124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=1.459;DP=48;FS=6.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=23.43;ReadPosRankSum=-1.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,30:48:99:1153,0,657
2	47708338	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	47751239	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	47757577	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	47763369	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	48010488	.	G	A	488.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:96:517,0,96
2	48023115	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.611;DP=20;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:152,0,579
2	48025764	.	C	T	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.130;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:287,0,595
2	48034817	.	A	G	359.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-1.606;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.67;ReadPosRankSum=2.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:60:388,0,60
2	48038331	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	48038944	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	48041377	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
2	48044772	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	48681868	.	C	G	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:130,0,258
2	48723516	.	C	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
2	48732944	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	48742306	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,198
2	48830067	.	C	T	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
2	48860247	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	48860252	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	48860253	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	54014303	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:188,0,112
2	54035447	.	A	G	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:83:83,0,333
2	54035508	.	G	C	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:90:429,0,90
2	54092984	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	54115904	.	A	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.054;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:211,0,380
2	54120025	.	A	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:181,0,293
2	54120820	.	G	A	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
2	54127041	.	C	T	593.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:622,42,0
2	54133744	.	T	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,211
2	54150237	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,135
2	54197829	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	54242407	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	54242408	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	54858193	.	G	C	975.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1004,72,0
2	54858253	.	G	T	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:727,51,0
2	54871519	.	C	T	805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:834,57,0
2	54888075	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	54888497	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	54888533	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	54889136	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
2	54889390	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	54891017	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	55200800	.	T	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	55201038	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	55202649	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
2	55203931	.	C	G	284.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:313,21,0
2	55204028	.	A	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	55204498	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	55204800	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	55205092	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	55205124	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	55207895	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	55460751	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	55461570	.	A	T	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
2	55461823	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	55490819	.	G	T	439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:468,33,0
2	55771161	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
2	55775724	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:152,0,30
2	55776793	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:392,0,565
2	55785301	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	55805440	.	T	C	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
2	55806284	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	55831128	.	C	T	26.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.256;DP=32;FS=9.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:55:55,0,1043
2	55843638	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
2	55846512	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	55861645	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
2	55872538	.	T	C	349.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.788;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:378,0,655
2	55900042	.	C	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:173,0,362
2	56402617	.	C	T	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:81,0,27
2	56402848	.	C	T	257.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:286,21,0
2	56403461	.	T	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
2	56406968	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	56407064	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	56409264	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	56411363	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	58316814	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:229,0,240
2	58362161	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	58388696	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,272
2	61154325	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
2	61167761	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:112,0,76
2	61175312	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61276263	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	61278052	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61304271	.	A	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:96:96,0,179
2	61315795	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	61316509	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	61347626	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61349515	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	61351187	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61351188	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61351189	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61368260	.	T	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:155,0,31
2	61369159	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:81,0,75
2	61369160	.	A	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:81,0,75
2	61370764	.	C	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,228
2	61370819	.	A	G	208.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:237,0,24
2	61372298	.	C	G	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:200,0,67
2	61385100	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,253
2	61385105	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,253
2	61404931	.	A	T	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:50:50,0,145
2	61405008	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,225
2	61405723	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.718;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:122,0,423
2	61405795	.	G	T	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
2	61405865	.	C	G	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:262,0,263
2	61415492	.	A	G	601.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.765;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:630,0,278
2	61416404	.	T	G	41.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
2	61417145	.	C	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
2	61450269	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:93:93,0,368
2	61483548	.	A	T	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.660;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:85:85,0,475
2	61522123	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
2	61575308	.	A	G	583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:612,42,0
2	61577435	.	T	C	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:49:49,0,394
2	61705663	.	C	T	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.979;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,9:31:99:291,0,805
2	61751642	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	61761774	.	A	G	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
2	61762023	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	61762161	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	61763207	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	61764140	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
2	61765074	.	G	A	1059.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.867;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=25.22;ReadPosRankSum=-1.114	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:56:1088,56,0
2	62066927	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
2	62100355	.	C	T	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.410;DP=55;FS=10.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,11:55:99:311,0,1669
2	62101344	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	62362995	.	T	C	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.049	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:244,0,384
2	62733189	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	63816672	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	64116589	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	64124722	.	C	A	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:141,0,158
2	64189566	.	A	G	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:84,0,58
2	64687665	.	C	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,109
2	64687777	.	G	T	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
2	64859679	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	64861515	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:69:69,0,95
2	64881017	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	64881018	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	65216647	.	C	G	703.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.528;DP=26;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=27.07;ReadPosRankSum=0.750	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,18:26:99:732,0,477
2	65216648	.	G	C	703.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.361;DP=26;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=27.07;ReadPosRankSum=0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,18:26:99:732,0,477
2	65216825	.	G	A	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.386;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,12:36:99:342,0,867
2	65217089	.	G	C	543.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.175;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:572,0,121
2	65219181	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	65234410	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	65245365	.	G	A	961.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.321;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,26:35:99:990,0,288
2	65250466	.	A	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=8.82	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,0:7:90:90,0,443
2	65296798	.	G	A	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=24.89;ReadPosRankSum=2.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:80:302,0,80
2	65298839	.	A	G	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:163,0,30
2	65299311	.	G	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,76
2	65299420	.	T	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
2	65311031	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
2	65311438	.	G	A	206.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:235,18,0
2	65313758	.	G	C	116.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:145,0,26
2	65496018	.	C	G	629.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.821;DP=31;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=20.32;ReadPosRankSum=1.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:658,0,476
2	65496144	.	A	G	249.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:278,0,19
2	65496187	.	G	A	1088.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.514;DP=38;FS=5.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=28.65;ReadPosRankSum=0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,28:38:99:1117,0,315
2	65496251	.	G	T	707.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.590;DP=28;FS=7.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.918	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:736,0,291
2	65496729	.	G	A	1608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1637,111,0
2	65497262	.	A	G	917.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.397;DP=34;FS=8.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,24:34:99:946,0,336
2	65497352	.	A	G	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
2	65497571	.	C	A	1390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1419,99,0
2	65498340	.	A	G	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:94:172,0,94
2	65539641	.	C	T	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
2	65540905	.	C	G	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
2	65561392	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
2	65569939	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	65570307	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	65571909	.	C	T	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-1.732;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=7.49;ReadPosRankSum=1.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:193,0,611
2	67637196	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	68360541	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
2	68360545	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
2	68360546	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
2	68360547	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
2	68360550	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	68406149	.	G	A	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
2	68406155	.	G	A	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
2	68479577	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=1.186;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:145,0,210
2	69741854	.	T	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
2	70033584	.	C	T	1240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.592;DP=40;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.012;QD=31.02;ReadPosRankSum=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,32:40:99:1269,0,219
2	70033795	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	70035482	.	C	G	52.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:81,0,21
2	70106679	.	T	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:108,0,70
2	70106832	.	T	C	262.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:291,0,22
2	70107409	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
2	70108256	.	T	A	204.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:233,0,24
2	70131584	.	G	A	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:235,0,106
2	70153436	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	70162534	.	T	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,121
2	70163316	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	70165966	.	G	A	97.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:126,0,22
2	70167197	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:60:118,0,60
2	70449201	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	70499042	.	A	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
2	70504926	.	A	G	805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:834,57,0
2	70504972	.	G	C	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
2	70506809	.	T	C	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:585,42,0
2	70676098	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	70677463	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:115,0,32
2	70677994	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:73,0,28
2	70882673	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	70882675	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	70882681	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	71157827	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:122,0,34
2	71163086	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,96
2	71168881	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	71174465	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:123,9,0
2	71174473	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	71180618	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	71304738	.	G	A	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.703;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:395,0,833
2	71339855	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	71347759	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	71351487	.	G	A	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
2	71357634	.	C	T	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	71417065	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	71633275	.	T	C	587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:616,42,0
2	71633389	.	C	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
2	71647809	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	72691018	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	73301618	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,189
2	73461483	.	C	A	1513.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1542,111,0
2	73477351	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	73478461	.	A	T	2310.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2339,160,0
2	73482673	.	G	A	160.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:189,0,26
2	73483057	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
2	73483769	.	G	A	144.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:173,15,0
2	73490412	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	73491514	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:78:93,0,78
2	73675669	.	T	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	73675844	.	C	T	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:116,0,27
2	73677833	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:111,0,34
2	73679990	.	T	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,77
2	73746923	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
2	73957124	.	A	G	649.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,17:21:99:678,0,109
2	74007136	.	T	C	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:139,0,235
2	74143826	.	C	T	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=0;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=0.00;MQ0=0	GT:GQ:PL	1/1:3:38,3,0
2	74143829	.	T	G	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
2	74173656	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	74174396	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	74179389	.	T	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
2	74185876	.	A	T	1019.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-2.052;DP=32;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=31.87;ReadPosRankSum=1.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,26:32:99:1048,0,163
2	74202422	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	74212147	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	74274165	.	C	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,181
2	74320691	.	G	A	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:46:46,0,266
2	74329151	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,295
2	74334462	.	G	A	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
2	74347576	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	74347594	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	74347666	.	T	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	74347792	.	G	C	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
2	74354544	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	74380436	.	C	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.371;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:199,0,532
2	74380447	.	C	T	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.307;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:203,0,492
2	74380989	.	A	G	874.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-2.286;DP=27;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=32.40;ReadPosRankSum=2.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,23:27:95:903,0,95
2	74381707	.	G	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.397;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,555
2	74383609	.	T	C	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.660;DP=35;FS=5.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,9:35:99:296,0,1028
2	74383630	.	G	A	772.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.534;DP=28;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=27.60;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,20:28:99:801,0,261
2	74405867	.	T	G	522.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.610;DP=27;FS=17.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:551,0,446
2	74405952	.	T	C	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.172;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:347,0,344
2	74441799	.	A	G	668.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.531;DP=42;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,19:42:99:697,0,860
2	74442407	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,104
2	74443312	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:89:89,0,321
2	74444431	.	A	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:233,0,151
2	74756548	.	G	C	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-0.082;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.245	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,13:42:99:436,0,1101
2	75060099	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	75061873	.	C	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
2	75099477	.	A	T	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=15.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:337,0,200
2	75101454	.	T	C	480.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-1.798;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=25.30;ReadPosRankSum=1.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:509,0,188
2	75107048	.	G	T	253.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.73;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:21:282,0,21
2	75113789	.	C	G	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=24.23;ReadPosRankSum=2.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:319,0,111
2	75115108	.	A	G	930.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:959,69,0
2	75118330	.	T	G	667.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.694;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=25.68;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,18:26:99:696,0,269
2	75118737	.	C	T	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=26.90;ReadPosRankSum=-0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:351,0,100
2	75118856	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:79:158,0,79
2	75734658	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	75734671	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	75734672	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	75734679	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	75734681	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	75759139	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	75882399	.	G	A	49.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-1.793;DP=33;FS=5.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,4:33:78:78,0,1137
2	75882576	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.124;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:157,0,639
2	75882855	.	A	G	18.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:47:47,0,278
2	75883276	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,297
2	75883390	.	G	T	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:302,0,264
2	75883878	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,98
2	75886643	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,111
2	75887579	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,138
2	75888160	.	A	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:121,0,30
2	75892111	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,77
2	75893853	.	A	C	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:83:83,0,106
2	75894229	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,122
2	75894237	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,122
2	75894244	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:81:81,0,122
2	75894362	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	75895233	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:126,9,0
2	75895978	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,77
2	75897939	.	A	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
2	75899863	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	75901668	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	75906972	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
2	75915035	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,104
2	75923413	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,110
2	78928962	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	84650707	.	A	G	794.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:823,57,0
2	84662933	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	84663824	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	84664944	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	84666227	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	84667546	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	84667864	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	85190325	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	85541083	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,162
2	85542686	.	G	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:122,0,28
2	85543064	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:115,0,33
2	85543222	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,112
2	85544904	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	85546052	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.396;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:119,0,498
2	85546192	.	C	T	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.934;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:381,0,544
2	85546373	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,163
2	85546615	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.508;DP=24;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:225,0,674
2	85546932	.	A	C	472.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.297;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.149	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,15:44:99:501,0,1102
2	85547073	.	G	A	49.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.745;DP=33;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,4:33:78:78,0,1162
2	85547376	.	C	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.950;DP=21;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.115	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:152,0,592
2	85547429	.	G	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=1.528;DP=23;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:137,0,717
2	85547757	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.298	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:113,0,684
2	85547963	.	C	T	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.326;DP=31;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.326	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,9:31:99:282,0,834
2	85548639	.	A	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.708;DP=23;FS=4.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:149,0,697
2	85549527	.	T	C	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.198;DP=34;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=10.73;ReadPosRankSum=-1.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:393,0,820
2	85549547	.	C	T	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.283;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:294,0,692
2	85553784	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.365;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:94:94,0,750
2	85554080	.	G	A	371.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.406;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:400,0,971
2	85569294	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
2	85572223	.	A	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	85572227	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:15:213,15,0
2	85572728	.	C	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,106
2	85573403	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	85615012	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	85622059	.	T	C	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
2	85764960	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	85764966	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	85764968	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	85765205	.	C	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	85766545	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	85769246	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	85769711	.	C	G	2467.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2496,172,0
2	85769975	.	A	G	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
2	85772548	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	85773061	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	85773368	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	85773376	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	85775198	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:57:57,0,81
2	85776621	.	T	C	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:41:41,0,284
2	85776648	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,242
2	85780131	.	G	A	507.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:536,39,0
2	85780536	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
2	85781318	.	T	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
2	85783128	.	T	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	85788738	.	C	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
2	85806068	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	85806266	.	C	T	2175.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2204,160,0
2	85807082	.	T	A	20.78	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:48,6,0
2	85808737	.	A	G	2558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2587,178,0
2	85808871	.	C	T	2835.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2864,199,0
2	85808982	.	T	C	2400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2429,172,0
2	85818886	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:187,0,228
2	85824039	.	G	A	1544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.729;DP=56;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=27.59;ReadPosRankSum=2.167	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,44:56:99:1573,0,352
2	85826132	.	G	A	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=-1.805;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:381,0,195
2	85826721	.	G	A	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:374,0,150
2	85834641	.	T	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:100,0,71
2	85981761	.	T	C	119.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:148,0,26
2	86015096	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	86015121	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	86076231	.	C	T	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
2	86248309	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,311
2	86249804	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,357
2	86249930	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,194
2	86252025	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
2	86252222	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:147,0,239
2	86253581	.	T	C	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:171,0,396
2	86254268	.	G	A	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-1.073;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:230,0,227
2	86259443	.	C	T	35.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-1.859;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:64:64,0,716
2	86315741	.	C	T	727.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:756,54,0
2	86317037	.	G	C	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:645,45,0
2	86354704	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
2	86362204	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	86363855	.	G	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
2	86365713	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	86365884	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
2	86366522	.	T	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
2	86366572	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	86367741	.	C	G	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
2	86368303	.	G	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:52:94,0,52
2	86368804	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	86371883	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-1.062;DP=34;FS=4.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,6:34:99:155,0,1113
2	86400824	.	G	A	693.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.131;DP=28;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:722,0,292
2	86433240	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.071;DP=24;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.284	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:142,0,754
2	86437898	.	C	T	719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:748,51,0
2	86438146	.	A	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.453;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:174,0,422
2	86438600	.	T	C	587.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.902;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=25.56;ReadPosRankSum=1.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:616,0,233
2	86440436	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	86441303	.	A	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,109
2	86447376	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	86449069	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	86449548	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	86453919	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	86454704	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	86456836	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
2	86478664	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	86478670	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	86481835	.	C	T	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:95:274,0,95
2	86683642	.	A	G	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
2	86691250	.	G	A	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
2	86730182	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	86731630	.	T	G	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:39:39,0,136
2	86756381	.	T	G	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-0.844;DP=47;FS=11.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,13:47:99:428,0,1295
2	86840351	.	C	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
2	86841879	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
2	86850022	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,193
2	86855977	.	A	G	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:118,0,26
2	86979093	.	G	A	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-1.937;DP=33;FS=1.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=4.21;ReadPosRankSum=2.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,6:33:99:167,0,1024
2	86979417	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	86998761	.	C	T	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.742;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,9:34:99:276,0,999
2	87002229	.	C	T	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:89:89,0,271
2	87002706	.	G	A	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:141,0,352
2	87003197	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,281
2	87131661	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	87303060	.	C	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:121,0,32
2	88471894	.	G	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
2	88472141	.	G	A	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
2	88472280	.	C	T	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
2	88472791	.	G	A	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:512,36,0
2	88485392	.	G	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
2	88485999	.	C	T	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
2	88487142	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	88874891	.	C	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,155
2	88895123	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
2	88913273	.	G	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:185,0,235
2	90146052	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	90149749	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
2	91813893	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
2	91815023	.	C	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
2	91815143	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:119,0,33
2	91825095	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:72,0,37
2	91843471	.	C	T	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.394;DP=18;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:165,0,512
2	91937125	.	G	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
2	92321516	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	95542376	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	95542377	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	95768994	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:236,0,150
2	95775761	.	G	A	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.305;ClippingRankSum=-1.552;DP=35;FS=11.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,10:35:99:269,0,958
2	95811118	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,78
2	95811605	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	95848018	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	95945830	.	G	T	293.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:322,24,0
2	95947085	.	A	G	709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:738,51,0
2	95955680	.	G	T	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=2.381;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=19.61;ReadPosRankSum=-2.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:440,0,336
2	95966744	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	95969027	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	96484355	.	G	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,155
2	96485691	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
2	96495414	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,67
2	96495454	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	96497017	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
2	96678384	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	96809331	.	T	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:91:91,0,273
2	96851119	.	C	A	828.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.183;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.500	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,32:34:43:857,43,0
2	96914741	.	A	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:176,0,68
2	96934504	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	96937296	.	G	C	762.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:791,54,0
2	96943473	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	96952833	.	A	G	1741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1770,123,0
2	97020049	.	T	C	1432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1461,102,0
2	97030247	.	T	C	1059.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1088,75,0
2	97036439	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	97427050	.	C	T	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-1.614;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:207,0,283
2	97427735	.	C	A	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:50:50,0,381
2	97428033	.	G	A	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:91:91,0,341
2	97469775	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	97491555	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,177
2	97492047	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	97492052	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
2	97492114	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
2	97492210	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	97496022	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	97526918	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:110,0,401
2	97538500	.	A	G	263.31	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.91;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,7:8:1:289,1,0
2	97538505	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,180
2	97619682	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	97756031	.	A	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=2.262;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,323
2	97877292	.	C	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
2	97915302	.	C	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,234
2	97915307	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:114,0,234
2	98164184	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
2	98165911	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	98206282	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:120,0,33
2	98206293	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
2	98272634	.	G	A	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.827;DP=31;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,7:31:99:215,0,945
2	98272734	.	A	G	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:909,63,0
2	98273290	.	C	T	110.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:18:139,0,18
2	98274527	.	G	C	1294.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1323,93,0
2	98277090	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.875;DP=31;FS=4.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,6:31:99:165,0,976
2	98373006	.	C	T	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:340,0,172
2	98409046	.	G	A	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:186,0,142
2	98611994	.	G	T	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
2	98612260	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:80:144,0,80
2	98612266	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:346,24,0
2	99221939	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	99438624	.	C	G	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:275,0,139
2	99450831	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	99720267	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	99720436	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	99735052	.	G	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	99767868	.	C	T	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
2	99768064	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
2	99768419	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	99768770	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
2	99770044	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	99771590	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	99774801	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	99779131	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	99800814	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	99812070	.	G	A	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
2	99812290	.	A	G	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.875;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.37;ReadPosRankSum=-2.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:46:46,0,432
2	99812429	.	A	G	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.826;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:41:41,0,563
2	99812815	.	A	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.938;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:86:86,0,613
2	99812817	.	A	G	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:42:42,0,660
2	99812843	.	A	G	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:93:310,0,93
2	99812857	.	A	G	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:48:48,0,231
2	99812897	.	A	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:154,0,73
2	99812978	.	A	G	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-2.032;DP=25;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:276,0,657
2	99812988	.	A	G	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.193;DP=28;FS=2.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:41:41,0,1630
2	99813003	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-1.001;DP=25;FS=4.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:98:98,0,812
2	99813614	.	T	C	886.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:915,63,0
2	99815146	.	T	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	99816862	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	99818972	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	99820777	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	99922399	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	99922401	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	99931276	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	100194833	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.779;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:197,0,227
2	100343557	.	C	T	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
2	100891976	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	100892018	.	G	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:133,0,352
2	100892516	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,91
2	100893113	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,104
2	100894491	.	C	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,267
2	100895081	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,178
2	100895872	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,187
2	100896871	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
2	100897214	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,72
2	100897674	.	T	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,219
2	100898634	.	G	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:58:58,0,296
2	100899665	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.835;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:135,0,300
2	100899676	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,136
2	100900304	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:133,0,190
2	100916306	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,409
2	100916315	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:99:103,0,409
2	100938481	.	C	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:59:59,0,90
2	101009600	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,153
2	101186088	.	C	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
2	101193457	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
2	101591304	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	101594191	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,114
2	101612615	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	101622728	.	C	T	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:128,0,289
2	101624471	.	T	C	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
2	101624889	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	101627925	.	C	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-1.932;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:189,0,223
2	101635989	.	T	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
2	101637009	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	101638828	.	C	T	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:86:318,0,86
2	101638888	.	A	G	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
2	101644855	.	G	A	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:131,0,317
2	101647894	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
2	101656726	.	T	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
2	101822432	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	101869588	.	G	T	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.035;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.176	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:323,0,298
2	101882663	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	101897325	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	101898412	.	G	C	1001.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1030,72,0
2	101899130	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	101901004	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	101902260	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	101904406	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
2	101925026	.	T	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:203,0,343
2	102314437	.	T	C	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
2	102508146	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:280,0,417
2	102794282	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	103301989	.	A	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
2	103302100	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:120,0,75
2	103302114	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,209
2	103302441	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
2	103306772	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
2	103307527	.	G	A	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:57:235,0,57
2	103307720	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
2	103308109	.	G	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	103308802	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	103325745	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:117,0,392
2	103325790	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,234
2	103326281	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:180,0,334
2	103327476	.	A	G	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
2	103331245	.	T	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
2	103332590	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	103333705	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	103431404	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	103432768	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,103
2	105705507	.	C	T	683.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=1.110;DP=34;FS=10.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=20.11;ReadPosRankSum=-1.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:712,0,559
2	105709023	.	T	C	1007.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1036,72,0
2	105713697	.	A	G	685.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=-0.455;DP=35;FS=11.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:714,0,479
2	105716266	.	A	G	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.996;DP=18;FS=13.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:252,0,425
2	105882061	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
2	105885961	.	T	C	727.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:756,54,0
2	105889349	.	G	A	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=-0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:249,0,448
2	105897003	.	G	A	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.708;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.34;ReadPosRankSum=-1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:318,0,102
2	105897740	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	105924510	.	A	G	300.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=25.06;ReadPosRankSum=-1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:91:329,0,91
2	105952528	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	105953061	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:112,0,32
2	105953909	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	106002889	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:76,0,65
2	106013147	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	106507641	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
2	106510184	.	C	T	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-1.929;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:353,0,138
2	106710108	.	C	T	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
2	106715342	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	106716529	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	106717274	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
2	106725928	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	106810727	.	A	G	122.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:150,12,0
2	109091479	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	109091555	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	109099572	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	109106381	.	A	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
2	109124512	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	109124522	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	109301398	.	C	A	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
2	109301841	.	G	A	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:440,33,0
2	109389463	.	G	A	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
2	109429146	.	T	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
2	109492907	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	109496641	.	G	C	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
2	109499037	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	109501687	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
2	110372192	.	A	G	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
2	110746204	.	G	C	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
2	111907691	.	T	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:203,0,342
2	112641909	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	112686988	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,116
2	112751928	.	G	A	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
2	112754943	.	C	T	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:238,0,131
2	112755001	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
2	112765973	.	A	G	609.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:638,45,0
2	112768177	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	112773153	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	112775546	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	112776726	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	112778389	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	112778441	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	112778509	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	112785775	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	112813066	.	G	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:56:56,0,170
2	112813163	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
2	113239878	.	C	T	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:95,0,106
2	113286562	.	A	G	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
2	113287329	.	C	G	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
2	113287964	.	A	G	631.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:660,48,0
2	113288580	.	G	A	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	113289701	.	T	G	722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:751,51,0
2	113308516	.	T	A	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
2	113309473	.	C	T	493.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=30.86;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:88:522,0,88
2	113334357	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
2	113338563	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	113346512	.	A	C	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
2	113412712	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
2	113414384	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	113494250	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	113494520	.	T	C	135.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:12:163,0,12
2	113495785	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	113498566	.	A	G	413.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:51:442,0,51
2	113513825	.	T	C	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:573,39,0
2	113548441	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	113875565	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	113875584	.	G	C	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
2	113887207	.	T	C	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
2	113891412	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:158,0,31
2	113916912	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	113922412	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	113922924	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	113926835	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	113940681	.	T	C	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
2	113940839	.	G	C	560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:589,42,0
2	113942903	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	113943470	.	A	G	830.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:859,60,0
2	113944460	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	113948915	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,118
2	113951924	.	C	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	113953401	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	113959452	.	A	G	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
2	113960152	.	C	G	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.445;DP=19;FS=24.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.115	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:284,0,414
2	113962819	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,110
2	113962835	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:77,0,31
2	114256759	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	114349178	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	114349926	.	T	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,278
2	114349928	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,278
2	114356085	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,213
2	114356087	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,213
2	114356088	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,213
2	114461986	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:75,0,31
2	114465172	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,75
2	114465355	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	114466099	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	114470778	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,226
2	114637231	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	114709419	.	G	A	795.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=-0.569;DP=57;FS=8.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=13.96;ReadPosRankSum=-1.252	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,22:48:99:824,0,990
2	114715533	.	G	A	501.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=-0.787;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,15:47:99:530,0,1229
2	118581833	.	A	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
2	118583940	.	C	T	980.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1009,69,0
2	118588640	.	C	T	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
2	118589843	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	118592086	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	118673663	.	T	C	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:351,0,143
2	118675578	.	C	T	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:82:263,0,82
2	118675743	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:193,0,103
2	118676836	.	T	C	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:254,0,294
2	118693673	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	118707674	.	G	T	43.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:72,0,26
2	118707742	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,112
2	118726836	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	118739286	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	118771663	.	A	G	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
2	118866963	.	C	T	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
2	119983609	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	119985983	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	120021785	.	T	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
2	120021917	.	C	A	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
2	120022382	.	C	A	264.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:22:293,22,0
2	120023188	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	120059921	.	C	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,111
2	120059988	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:118,0,75
2	120060082	.	T	C	627.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.492;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=34.88;ReadPosRankSum=-1.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,16:18:27:656,0,27
2	120078778	.	T	C	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:261,0,104
2	120125029	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	120125936	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	120437948	.	G	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
2	120438523	.	A	G	904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:933,66,0
2	120438696	.	A	G	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
2	120439230	.	C	G	754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:783,54,0
2	120439459	.	C	A	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
2	120739236	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
2	120862453	.	G	T	210.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
2	120863069	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	120864763	.	T	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
2	120975831	.	C	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	120977044	.	A	G	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
2	120978368	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	120979322	.	T	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
2	120980428	.	G	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
2	120980694	.	G	A	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:53:303,0,53
2	121026582	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	121035007	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	121050989	.	T	A	870.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:899,63,0
2	121052268	.	A	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	121108482	.	G	A	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.183;DP=39;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,9:39:99:244,0,1125
2	122090420	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	122090432	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	122097295	.	C	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,346
2	122492869	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	127826533	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,75
2	128018192	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
2	128057728	.	G	A	15.88	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:44:44,0,97
2	128060163	.	C	T	132.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:161,0,23
2	128061053	.	A	G	130.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:159,0,23
2	128062048	.	T	C	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:223,0,64
2	128063945	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	128079806	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,119
2	128145293	.	A	G	260.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:289,24,0
2	128146762	.	G	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
2	128220989	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
2	128243335	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	128460956	.	G	A	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
2	128461556	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:77,0,70
2	128601464	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:157,0,71
2	128601602	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,176
2	128602366	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	128603026	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:56:56,0,139
2	128603611	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	128619847	.	G	A	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=25.78;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:54:286,0,54
2	128620120	.	G	A	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.999;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:352,0,275
2	128621094	.	A	G	379.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=34.50;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:3:406,0,3
2	128622491	.	G	A	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:578,42,0
2	128757995	.	A	C	474.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=6.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=20.64;ReadPosRankSum=2.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:503,0,307
2	128849114	.	T	C	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
2	128870808	.	T	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
2	128878014	.	G	A	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
2	128934400	.	T	C	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
2	128939799	.	C	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:137,0,390
2	128939817	.	G	A	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:212,0,339
2	128947505	.	G	A	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:93:242,0,93
2	128949893	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:55:55,0,352
2	128952007	.	A	G	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:38,0,36
2	129023859	.	T	C	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.794;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:85:85,0,459
2	129076387	.	C	A	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,456
2	129076396	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:105,0,456
2	129090340	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	130748087	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	130748101	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
2	130783922	.	T	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,80
2	130783946	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:72,0,31
2	130789035	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	130794812	.	C	G	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-1.032;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,550
2	130795059	.	T	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
2	130808506	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
2	130809065	.	T	C	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:171,0,63
2	130809695	.	C	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
2	130809697	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,105
2	130809794	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,210
2	130809811	.	T	C	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,423
2	130810114	.	C	G	1078.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-0.094;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,30:33:29:1107,0,29
2	130811019	.	G	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,232
2	130813200	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	130813211	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,127
2	130813216	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,127
2	130813217	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,127
2	130813346	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
2	130813642	.	A	C	244.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:16:273,0,16
2	130813648	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,312
2	130813658	.	T	C	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:121,0,26
2	130815670	.	T	C	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
2	130815704	.	T	C	98.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	130815705	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	130815706	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	130815713	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	130815725	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,73
2	130816329	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,69
2	130816330	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,69
2	130817333	.	T	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:121,0,31
2	130817346	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:75,0,148
2	130817350	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,148
2	130817396	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,225
2	130817693	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:194,0,70
2	130817706	.	T	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,239
2	130818202	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	130818207	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	130818852	.	T	C	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:222,0,120
2	130818916	.	T	C	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:172,0,259
2	130820486	.	G	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:117,0,70
2	130823194	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,245
2	130829342	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,76
2	130915597	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
2	130916022	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:120,0,74
2	130916054	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,160
2	130916057	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,160
2	130916058	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,160
2	130916608	.	T	C	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:190,0,64
2	130916653	.	T	C	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=22.78;ReadPosRankSum=-1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:256,0,102
2	130916665	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,183
2	130916743	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,307
2	130916749	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=19.85;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,105
2	130917142	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.336;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=15.28;ReadPosRankSum=2.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:181,0,170
2	130917167	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,148
2	130943563	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,74
2	130988113	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	131131002	.	T	G	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=26.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:139,0,331
2	131206507	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	131213427	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	131213428	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	131428731	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	131432704	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	131432705	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	131432707	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	131837242	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	131967207	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
2	131967278	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
2	132027891	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
2	132029748	.	C	G	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
2	132029751	.	G	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:181,0,304
2	132034334	.	C	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
2	132034972	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-2.256;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=2.15;ReadPosRankSum=2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,390
2	132035227	.	G	A	32.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:58,0,1
2	132035629	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=-0.425;DP=15;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,502
2	132035658	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,351
2	132036015	.	G	A	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:230,0,108
2	132036896	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:32:39,0,32
2	132036903	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:32:39,0,32
2	132036904	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:32:39,0,32
2	132036939	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
2	132037094	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	132037572	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	132038887	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	132038910	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	132038913	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	132038957	.	A	G	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:84:84,0,607
2	132038964	.	A	G	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.65;ReadPosRankSum=-2.205	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:228,0,232
2	132039239	.	A	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=1.06;ReadPosRankSum=1.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:44:44,0,521
2	132039289	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=5;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:113,0,33
2	132039294	.	A	G	194.88	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:16:223,16,0
2	132039302	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:126,9,0
2	132039406	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
2	132040600	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	132040896	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,151
2	132040987	.	T	C	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
2	132042909	.	A	G	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:239,0,298
2	132042920	.	A	G	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:276,0,177
2	132043359	.	C	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:145,0,247
2	132057195	.	C	T	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
2	132057780	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	132057930	.	C	G	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:358,27,0
2	132058046	.	G	C	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
2	132058110	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	132058144	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
2	132059053	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
2	132060249	.	C	T	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
2	132121939	.	T	C	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
2	132230863	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	132232371	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
2	132270956	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,259
2	132270966	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,259
2	132271022	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,456
2	132271031	.	A	G	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:198,0,233
2	132271034	.	A	G	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:198,0,233
2	132271395	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.361;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,150
2	132271396	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,405
2	132271397	.	A	G	341.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:28:370,28,0
2	132271435	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-1.557;DP=14;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.311	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:74:74,0,566
2	132271439	.	A	G	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=29.25;ReadPosRankSum=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:98:350,0,98
2	132271532	.	A	G	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.28;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:57:321,0,57
2	132272119	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,77
2	132272471	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,185
2	132272509	.	A	G	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=9.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.187	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:46:46,0,476
2	132272543	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:81,0,32
2	132305813	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	132330736	.	T	C	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:118,0,26
2	132330763	.	T	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
2	132331375	.	A	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,75
2	132331556	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	132331768	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
2	132331871	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	132331901	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
2	132332237	.	A	G	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.80;ReadPosRankSum=-0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:97:312,0,97
2	132332446	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
2	132332647	.	C	T	113.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:142,0,22
2	132340915	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	132343077	.	G	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
2	132343339	.	G	A	206.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:235,18,0
2	132343364	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	132343822	.	C	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.85;ReadPosRankSum=2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,149
2	132343882	.	C	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:67:233,0,67
2	132344174	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	132344524	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
2	132344780	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	132345742	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	132347338	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	132347652	.	G	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
2	132348165	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	132348846	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	132349413	.	G	A	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
2	132349648	.	T	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-2.123;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=0.80;ReadPosRankSum=1.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:40:40,0,525
2	132359063	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	132359089	.	C	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
2	132369178	.	T	C	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
2	132369332	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	132384339	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
2	132384381	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	132386049	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	132388009	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	132388024	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	132390374	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	132390688	.	T	C	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
2	132390787	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
2	132391826	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
2	132391910	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:34:39,0,34
2	132392920	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	132393487	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	132393621	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,78
2	132393956	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	132393961	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
2	132394189	.	A	C	10.21	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:29:38,0,29
2	132394235	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
2	132394453	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,203
2	132394482	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:115,0,67
2	132396395	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
2	132397090	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	132399200	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	132405435	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:107,0,72
2	132405983	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	132407256	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	132408264	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	132408733	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,79
2	132410491	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	132411105	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,107
2	132411276	.	T	C	122.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:19:151,0,19
2	132411508	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,113
2	132412291	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
2	132413144	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	132415727	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	132416018	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	132416946	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	132420620	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	132426794	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	132443698	.	C	T	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
2	132480648	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	132511752	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	132513208	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	132515464	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	132555341	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	133011929	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
2	133011947	.	C	G	993.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:69:1022,69,0
2	133011953	.	T	C	993.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1022,69,0
2	133011994	.	T	C	1353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1382,93,0
2	133012007	.	T	C	722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:751,51,0
2	133012019	.	A	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
2	133012070	.	A	G	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
2	133012072	.	G	T	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
2	133012082	.	T	G	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:48:693,48,0
2	133012085	.	A	G	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:48:693,48,0
2	133012267	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	133012274	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	133012309	.	A	G	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:792,54,0
2	133012504	.	A	G	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
2	133012508	.	T	C	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:36:515,36,0
2	133012571	.	T	C	1888.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1917,132,0
2	133012612	.	T	C	1878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1907,129,0
2	133012655	.	A	G	955.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:984,72,0
2	133012674	.	A	G	1501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1530,102,0
2	133012680	.	A	G	1501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1530,102,0
2	133012688	.	A	G	1501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1530,102,0
2	133012691	.	T	C	1501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:99:1530,102,0
2	133012716	.	A	G	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
2	133012832	.	T	C	2485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:2514,172,0
2	133012839	.	T	C	2485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2514,172,0
2	133012930	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
2	133012945	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
2	133013144	.	A	G	980.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1009,69,0
2	133013175	.	T	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
2	133013183	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
2	133013189	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:405,27,0
2	133014828	.	A	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
2	133014847	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	133015136	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	133015140	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	133015141	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	133015147	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	133015204	.	A	C	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:396,27,0
2	133015212	.	A	G	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
2	133015267	.	A	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:30:436,30,0
2	133015274	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:30:436,30,0
2	133015278	.	C	T	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:30:436,30,0
2	133015283	.	G	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
2	133015302	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
2	133015303	.	C	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
2	133023157	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
2	133023159	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
2	133023165	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	133026731	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	133026734	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	133026757	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	133026767	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	133026796	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:70,0,67
2	133028465	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133028467	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133030579	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:172,12,0
2	133030586	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	133030600	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133030626	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	133030995	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	133032469	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133032477	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133032481	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133034636	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	133034644	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	133034652	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
2	133034653	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
2	133034697	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	133034700	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	133034703	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	133034705	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	133034729	.	C	T	150.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:179,15,0
2	133034747	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	133034778	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133034782	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133035031	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133035035	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133035055	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133035061	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133036029	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133036033	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133036041	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133036049	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	133036517	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
2	133036530	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	133036693	.	T	G	1231.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:84:1260,84,0
2	133036697	.	A	G	1231.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1260,84,0
2	133036704	.	T	C	1231.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1260,84,0
2	133036714	.	A	G	1231.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:84:1260,84,0
2	133036716	.	G	T	1231.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:84:1260,84,0
2	133038142	.	C	G	555.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:584,39,0
2	133038150	.	A	C	555.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:584,39,0
2	133038166	.	T	C	1412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1441,99,0
2	133038179	.	A	C	1572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:99:1601,108,0
2	133038180	.	G	C	1572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:99:1601,108,0
2	133038188	.	T	C	1572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:99:1601,108,0
2	133038217	.	T	G	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:765,51,0
2	133038221	.	C	T	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:765,51,0
2	133038225	.	T	C	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:51:765,51,0
2	133038228	.	C	T	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:51:765,51,0
2	133038472	.	A	G	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
2	133038473	.	T	C	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
2	133038476	.	T	C	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
2	133038491	.	T	C	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
2	133038494	.	T	C	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:30:443,30,0
2	133038686	.	A	G	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:659,45,0
2	133038693	.	A	T	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:45:659,45,0
2	133038760	.	A	G	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:575,39,0
2	133038764	.	T	C	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:575,39,0
2	133038786	.	C	G	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
2	133038789	.	C	G	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
2	133038925	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
2	133038936	.	T	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
2	133038946	.	C	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:307,21,0
2	133039048	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
2	133039061	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
2	133039063	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
2	133039087	.	A	G	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
2	133039090	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
2	133039101	.	A	G	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
2	133039105	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
2	133039128	.	A	G	321.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,8:9:17:350,17,0
2	133039132	.	T	C	321.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:17:350,17,0
2	133039135	.	G	T	321.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:17:350,17,0
2	133039137	.	A	G	321.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:17:350,17,0
2	133039156	.	T	C	2671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:2700,181,0
2	133039166	.	T	C	2671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:2700,181,0
2	133039171	.	C	G	2671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:2700,181,0
2	133039176	.	A	G	2671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:2700,181,0
2	133404223	.	C	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	133406024	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	135160755	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	135206934	.	C	T	330.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:359,27,0
2	135208077	.	A	G	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
2	135208213	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
2	135209142	.	G	A	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
2	135209154	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
2	135209591	.	C	T	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
2	135599381	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
2	135704656	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
2	135711516	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-1.156;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:181,0,416
2	135711657	.	G	A	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.791;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:169,0,461
2	135713703	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,113
2	136500597	.	A	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	136501840	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
2	136502792	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	136511575	.	A	G	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
2	136533373	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
2	136546110	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	136550109	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	138759649	.	C	T	378.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=1.823;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:407,0,333
2	138771760	.	A	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:236,0,147
2	138771918	.	A	T	383.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.065;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=25.58;ReadPosRankSum=-0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:412,0,129
2	138772694	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	138773229	.	G	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
2	138773638	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,79
2	138835633	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	139031841	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	139259222	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	139326879	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	139329256	.	C	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
2	141441340	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	148687731	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	148691256	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	148716830	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	150014702	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	150052608	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	150187137	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	150325416	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	150325840	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	150328912	.	T	C	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
2	150329726	.	G	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	150329806	.	T	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
2	150329973	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	150330248	.	T	C	165.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:194,15,0
2	150426362	.	T	C	998.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1027,72,0
2	150426399	.	A	G	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
2	150432976	.	C	T	1998.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2027,144,0
2	150443689	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	150443813	.	C	T	69.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
2	151325295	.	A	G	198.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:227,18,0
2	152127212	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,103
2	152138522	.	T	C	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:174,0,384
2	152173487	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	152266473	.	T	C	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:121,0,26
2	152311570	.	G	A	290.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.32;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:17:319,0,17
2	152320118	.	G	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,108
2	152322095	.	A	T	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:421,0,167
2	152329212	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	152331418	.	C	G	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=23.91;ReadPosRankSum=0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:339,0,136
2	152331999	.	G	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:162,0,72
2	152333304	.	C	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:155,0,71
2	152333773	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
2	152333812	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	152336428	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	152337822	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:76,0,30
2	152346979	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:70,0,37
2	152402077	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	152402080	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	152402083	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	152657055	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	152657849	.	T	A	423.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:452,33,0
2	152999995	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	153191866	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	153504552	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	153511027	.	T	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:183,0,174
2	153511786	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	153511976	.	A	G	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:256,0,126
2	153522793	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	153549814	.	G	C	162.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
2	153550338	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	153550668	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	153575826	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	153575972	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	156807910	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	156807912	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	156842823	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	156842824	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	156861553	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	156862613	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	156866251	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	156866472	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	156866619	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
2	156867536	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	156868034	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	156868429	.	C	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	156869365	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	156869742	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	156869839	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	156872779	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	156873262	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	156873709	.	C	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	156877774	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	157061941	.	G	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,146
2	157189011	.	G	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
2	157406249	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.219;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:193,0,509
2	157439857	.	A	G	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
2	157441664	.	G	C	592.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-0.727;DP=19;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=31.20;ReadPosRankSum=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,16:19:75:621,0,75
2	157442253	.	G	A	369.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:55:398,0,55
2	158626980	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
2	159440754	.	C	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:342,24,0
2	159440760	.	T	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
2	159440787	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
2	159513232	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	159518994	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:76,0,74
2	159523803	.	C	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:119,0,73
2	159523880	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	159525930	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:149,0,30
2	159537868	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
2	159954175	.	C	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,192
2	160019863	.	A	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
2	160035195	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.667;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:117,0,461
2	160035207	.	T	C	694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:723,51,0
2	160054932	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	160084473	.	A	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:197,0,28
2	160086653	.	C	T	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:99:204,0,149
2	160086654	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:99:204,0,149
2	160086692	.	A	G	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:198,0,70
2	160087535	.	T	G	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
2	160087815	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	160088793	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,197
2	160112881	.	G	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=1.386;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:104,0,276
2	160119416	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	160136337	.	G	A	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
2	160182302	.	C	T	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
2	160294842	.	A	G	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:195,0,28
2	160310246	.	A	G	134.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:163,0,20
2	160604452	.	C	T	720.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=1.501;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=31.34;ReadPosRankSum=-1.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,19:23:99:749,0,111
2	160604812	.	C	T	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.121;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,6:32:99:164,0,1006
2	160605268	.	T	C	1232.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1261,87,0
2	160621739	.	G	T	164.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:193,0,23
2	160622365	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
2	160622630	.	G	C	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:200,0,28
2	160623366	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:190,0,136
2	160623590	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:57:76,0,57
2	160623680	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:152,0,30
2	160626622	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	160957505	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	160957824	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	160957846	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	160958459	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	160958460	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	162059817	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	162092640	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
2	162165008	.	A	T	806.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:835,57,0
2	162258940	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	162259422	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	162357619	.	C	G	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
2	163124051	.	C	T	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
2	163128824	.	T	C	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
2	163201407	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	163351794	.	A	G	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:130,0,157
2	165551184	.	C	T	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:85:85,0,145
2	166605010	.	A	T	800.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.212;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=28.60;ReadPosRankSum=-0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,21:28:99:829,0,227
2	166614779	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
2	166730387	.	T	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
2	166770120	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:101,0,33
2	166773971	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,105
2	166788336	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
2	166797646	.	C	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:52:52,0,356
2	167437095	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	169103999	.	T	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:109,0,68
2	169279310	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	169283739	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	169284703	.	T	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	169629494	.	G	A	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.140;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:330,0,410
2	169630483	.	G	A	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:212,0,345
2	169630835	.	G	T	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-1.733;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:251,0,436
2	169688747	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	169720215	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	169721377	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	169727730	.	G	C	363.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:392,30,0
2	169997051	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
2	170010985	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	170032989	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	170103336	.	T	C	178.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:207,0,26
2	170103351	.	G	T	169.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:198,0,26
2	170115588	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:59,0,80
2	170218847	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	170403030	.	T	C	476.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.283;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:505,0,116
2	170403106	.	G	A	376.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:9:404,0,9
2	170411693	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,199
2	170416393	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	170429975	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
2	170441001	.	G	A	194.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:15:223,0,15
2	170492079	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	170493103	.	T	A	1073.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1102,75,0
2	170493863	.	A	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-1.632;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.893	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:125,0,421
2	170551205	.	C	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	170559264	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	170565248	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,79
2	170605981	.	C	T	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
2	170606724	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	170607064	.	C	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
2	170607330	.	T	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	170607704	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:101,0,281
2	170607750	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,214
2	170607826	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,157
2	170607841	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,195
2	170669911	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
2	170684224	.	C	T	115.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
2	170885930	.	C	A	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.097;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:214,0,291
2	170938659	.	G	A	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:195,0,65
2	170939135	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
2	170939368	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,146
2	170940022	.	G	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	170944215	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	171627676	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	171822466	.	C	T	1890.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1919,146,0
2	171849612	.	T	C	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=-0.368;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:307,0,287
2	171910313	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.436;DP=20;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:157,0,590
2	171981227	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	172178533	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	172179841	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:61:61,0,153
2	172180771	.	A	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
2	172188368	.	C	T	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
2	172193808	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	172216969	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
2	172339964	.	C	T	334.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:363,27,0
2	172946315	.	T	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:70,0,37
2	173030193	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	173030200	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	173030203	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	173352157	.	A	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,149
2	173369231	.	A	G	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.653;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:380,0,178
2	173461090	.	G	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:42:158,0,42
2	173461799	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,112
2	173461820	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:108,0,70
2	173463138	.	C	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,158
2	173940620	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	174090542	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	174091088	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	174128513	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	174228744	.	T	C	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:358,27,0
2	174229122	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
2	174229178	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	174229348	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	174232622	.	C	T	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=34.99;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:38:588,38,0
2	174772660	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:115,0,72
2	174781293	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	174946760	.	T	C	1005.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=1.811;DP=39;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=25.79;ReadPosRankSum=-1.719	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,27:39:99:1034,0,399
2	175174600	.	A	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
2	175252454	.	C	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,322
2	175289314	.	T	C	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:257,0,347
2	175292888	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
2	175294254	.	A	G	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:282,0,226
2	175294257	.	C	T	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:282,0,226
2	175294610	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,114
2	175300997	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
2	175943194	.	G	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
2	175952130	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	176015840	.	T	C	426.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.273;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=21.34;ReadPosRankSum=-1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:455,0,301
2	176041430	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
2	176041963	.	A	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
2	176043618	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	176046415	.	G	A	810.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.578;DP=21;FS=7.202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.083	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:53:839,53,0
2	176789478	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:154,0,98
2	176866948	.	G	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:49:49,0,167
2	176993129	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	177502508	.	C	A	162.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
2	177502520	.	G	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	177681769	.	A	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	177681782	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
2	177681805	.	A	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
2	177683633	.	A	G	371.89	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=33.81;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:2:398,0,2
2	177683754	.	C	T	282.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:311,24,0
2	178085137	.	G	A	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:837,57,0
2	178085827	.	C	T	941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:970,66,0
2	178087165	.	G	T	980.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1009,69,0
2	178087387	.	T	C	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:693,51,0
2	178087779	.	T	G	774.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:803,57,0
2	178088144	.	A	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
2	178088789	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	178414641	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	178417142	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	178480714	.	C	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	178481818	.	G	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
2	178482594	.	G	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
2	178977620	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	178993835	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	179306016	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	179310595	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:76,0,32
2	179368982	.	A	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	180047908	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
2	180809116	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	180809317	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	180810180	.	C	T	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
2	180810264	.	A	T	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
2	180835792	.	T	A	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
2	182780874	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-1.573;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:188,0,358
2	182781200	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:78,0,64
2	182794534	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	183584755	.	G	A	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.634;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.282	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:239,0,578
2	183593697	.	C	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.147;DP=30;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.226	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,7:30:99:213,0,889
2	183622547	.	T	G	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.121;DP=34;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,6:32:99:167,0,1018
2	183627504	.	A	G	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=-1.505;DP=23;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=7.51;ReadPosRankSum=2.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:201,0,669
2	183642628	.	C	T	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=9.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:262,0,374
2	183642878	.	G	A	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.031;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:127,0,473
2	183789649	.	C	A	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:605,42,0
2	183790072	.	A	G	1148.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1177,81,0
2	183792349	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	187361056	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	187364960	.	G	C	396.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.831;DP=31;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:425,0,703
2	187371503	.	G	T	38.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.907;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=1.11;ReadPosRankSum=0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,4:35:67:67,0,1241
2	187373146	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	187532417	.	G	A	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:746,51,0
2	187543636	.	G	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:90:90,0,358
2	189405995	.	G	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:133,0,294
2	189460553	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
2	189932831	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	189974958	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	190320810	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	190322547	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	190323177	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	190323530	.	A	G	720.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:749,51,0
2	190347630	.	T	G	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
2	190430177	.	A	G	1285.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:95:1314,95,0
2	190526205	.	C	T	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:83:83,0,185
2	190526224	.	C	T	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.355;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:375,0,304
2	190531426	.	G	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
2	190531615	.	T	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:137,0,348
2	190611980	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	190617643	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	190635826	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	190636014	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,80
2	190636411	.	C	G	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.780;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=17.93;ReadPosRankSum=2.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:333,0,282
2	190647919	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
2	190649316	.	G	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,115
2	190649487	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	190652679	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	190730049	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	191006821	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	191008125	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	191013045	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	191020013	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	191062951	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	191069434	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	191069476	.	C	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:49:49,0,314
2	191069689	.	T	A	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=24.74;ReadPosRankSum=-0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:424,0,171
2	191072288	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
2	191161622	.	T	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.377;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,10:27:99:361,0,634
2	191184475	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.283;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:120,0,477
2	191184524	.	C	T	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
2	191272784	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	191272946	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	191273150	.	C	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
2	191301368	.	A	G	516.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:545,39,0
2	191369852	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	191371649	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	191373775	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	191402685	.	A	C	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
2	191402698	.	A	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	191402702	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
2	191402775	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	191402778	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	191826382	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	191828203	.	A	T	217.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:47:283,0,47
2	191828205	.	C	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,7:7:48:253,0,48
2	191828596	.	A	G	225.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.23;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:254,0,20
2	191829412	.	C	G	214.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:243,0,25
2	191829777	.	C	T	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:353,0,176
2	191857196	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
2	192160875	.	C	T	1299.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1328,90,0
2	192250726	.	G	A	1017.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1046,72,0
2	192259669	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	192279327	.	T	C	1707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1736,120,0
2	192289938	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
2	196522286	.	A	G	187.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:216,18,0
2	196522885	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,109
2	196533393	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	196999136	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:176,12,0
2	196999139	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
2	196999237	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	197000455	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	197000907	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	197001673	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	197004439	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
2	197021276	.	T	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:337,27,0
2	197065221	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	198256261	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:45:45,0,319
2	198257795	.	T	C	1302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.193;DP=48;FS=9.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,34:48:99:1331,0,471
2	198262759	.	A	G	1608.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.512;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,41:55:99:1637,0,445
2	198265526	.	A	G	1432.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.794;ClippingRankSum=1.462;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=26.05;ReadPosRankSum=-1.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,37:55:99:1461,0,624
2	198283305	.	T	C	881.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-0.204;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,27:47:99:910,0,718
2	198352293	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
2	198354414	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	198356670	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
2	198356714	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,242
2	198359268	.	G	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,157
2	198359270	.	T	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,157
2	198361634	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,114
2	198362018	.	T	C	1583.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.294;DP=64;FS=3.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,41:64:99:1612,0,810
2	198365043	.	C	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:141,0,175
2	200681753	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	200792498	.	G	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
2	200792881	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	200794870	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	200795571	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:108,0,33
2	200802435	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	200820505	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	201253956	.	A	G	752.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:781,54,0
2	201371768	.	G	T	247.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:276,21,0
2	201436555	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:188,0,187
2	201437048	.	A	G	317.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:16:346,0,16
2	201437328	.	C	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,224
2	201437334	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
2	201441222	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	201686666	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	201708474	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	201708479	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	201717910	.	T	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:50:50,0,413
2	201755695	.	C	T	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
2	201768238	.	C	T	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.493;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:167,0,500
2	201839164	.	G	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:110,0,71
2	202025131	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	202025621	.	A	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:143,0,310
2	202028491	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:64,0,30
2	202031483	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:77,0,61
2	202151728	.	G	C	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.685;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:164,0,472
2	202152106	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,368
2	202152108	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,368
2	202242135	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:133,0,309
2	202242961	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:143,0,258
2	202245244	.	A	G	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-1.715;DP=24;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:201,0,663
2	202252539	.	G	A	403.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:50:432,0,50
2	202260049	.	G	A	1109.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1138,78,0
2	202264156	.	C	T	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=-0.731;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:282,0,769
2	202267172	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	202316114	.	C	T	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:230,0,139
2	202342802	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	202575821	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	202625615	.	C	T	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
2	202627504	.	A	G	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
2	202645669	.	T	C	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:76,0,27
2	203087703	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	203430456	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	203631359	.	G	A	20.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:49,0,35
2	203631556	.	G	A	76.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:105,0,24
2	203642155	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	204086859	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	204087037	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	204088522	.	G	A	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
2	204154552	.	C	T	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
2	204169264	.	A	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	204169274	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:171,12,0
2	204169830	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	204301296	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	204305093	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
2	204306356	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
2	204306452	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	204322298	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
2	205829991	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	205912403	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	206419646	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	206481573	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	206866405	.	C	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,239
2	206980474	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	206981471	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	206982093	.	C	T	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
2	206982295	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,196
2	206982546	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
2	206983315	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
2	206984632	.	C	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
2	206985727	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	206985925	.	G	T	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
2	206986020	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	206986233	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,189
2	206986246	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,151
2	206986418	.	T	C	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
2	206986628	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
2	206987015	.	A	G	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
2	206987270	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
2	206987505	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:190,0,103
2	206987561	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:112,0,71
2	206988573	.	C	A	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:515,39,0
2	207006676	.	T	C	1245.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1274,87,0
2	207008763	.	C	A	1259.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1288,90,0
2	207024107	.	G	C	700.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:729,57,0
2	207025444	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	207657153	.	T	C	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:46:322,0,46
2	207942894	.	C	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
2	208442254	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.953;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:69:69,0,661
2	208446367	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	208465778	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
2	208467150	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	208467997	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	208474281	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	208477852	.	G	A	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
2	208477956	.	C	T	608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:637,45,0
2	208478055	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:152,0,66
2	208481755	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	208481765	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
2	208619742	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,311
2	208619749	.	A	G	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:272,0,60
2	208831573	.	C	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	209104740	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	209108718	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
2	209108758	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	209112217	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	209120640	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
2	209179939	.	A	G	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:234,0,106
2	209184999	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	209190519	.	A	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:264,18,0
2	209190528	.	C	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:264,18,0
2	209190632	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	209190649	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
2	209191082	.	C	A	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
2	209191099	.	T	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
2	209214770	.	A	G	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
2	209215571	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,161
2	209215586	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	209220157	.	G	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	209220238	.	G	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
2	209220538	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	209220673	.	A	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
2	209221580	.	T	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
2	209221935	.	C	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
2	209353800	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
2	209359062	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	210885022	.	C	T	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.604;DP=21;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:330,0,467
2	210890698	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	211298180	.	T	G	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:205,0,434
2	211318591	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	212251864	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
2	213866353	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	213866714	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	213870678	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	214173996	.	A	G	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
2	215145548	.	A	G	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:842,57,0
2	215145555	.	T	C	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:57:842,57,0
2	215145558	.	C	T	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:57:842,57,0
2	215591356	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	215592290	.	C	G	520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:549,39,0
2	215592306	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:96:96,0,185
2	215592581	.	G	A	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:233,0,132
2	215592906	.	T	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:143,0,181
2	215593233	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
2	215632255	.	C	T	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:765,51,0
2	215632256	.	A	G	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:765,51,0
2	215645464	.	C	G	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
2	215674224	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,101
2	215674323	.	C	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
2	215674341	.	A	G	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
2	215674371	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,303
2	215674376	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:190,0,67
2	215797332	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:53:53,0,342
2	215820013	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:156,0,69
2	216211604	.	A	G	1430.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=-1.818;DP=52;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=27.51;ReadPosRankSum=1.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,37:52:99:1459,0,467
2	216216631	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	216217639	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
2	216221760	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	216232556	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	216248460	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	216249819	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	216255265	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	216262621	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	216263706	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	216807502	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	216807726	.	A	G	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:217,0,137
2	216807914	.	T	G	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
2	216808152	.	C	A	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:244,0,210
2	216808308	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,355
2	216808354	.	G	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=5.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,441
2	216808440	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	216808442	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	216809084	.	C	T	469.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.189;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=27.63;ReadPosRankSum=-1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:498,0,125
2	216878008	.	C	G	666.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.528;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,18:23:99:695,0,137
2	216903257	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
2	217012901	.	A	G	2023.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2052,141,0
2	217070766	.	G	A	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.674;DP=36;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.086;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:539,0,805
2	217071809	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
2	217072396	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	217072672	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
2	217074701	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	217076721	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	217077465	.	C	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
2	217080188	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
2	217084199	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	217366515	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,218
2	217366713	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:124,9,0
2	217366722	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:75,0,28
2	217366794	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
2	217366995	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
2	217368615	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	217369186	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:70,0,37
2	217373543	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	217378850	.	C	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:65,0,33
2	217380840	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
2	217381255	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
2	217381258	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
2	217381265	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:134,9,0
2	217381272	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
2	217381764	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,107
2	217383010	.	T	C	44.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:73,0,26
2	217383346	.	A	G	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:85,0,30
2	217383808	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
2	217384482	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
2	217385936	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
2	217386313	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	217387674	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	217389515	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	217389725	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
2	217391637	.	T	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:108,0,33
2	217408298	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	217449426	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
2	217541582	.	T	C	3092.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.047;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=33.69;ReadPosRankSum=1.217	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,73:74:99:3121,183,0
2	217547922	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
2	217549685	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:99,0,191
2	217550529	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	217551954	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
2	217554213	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	218674697	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
2	218745685	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:100,0,74
2	219066256	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	219100578	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	219100579	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	219100706	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
2	219101859	.	A	T	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
2	219115798	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	219129060	.	A	G	1651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1680,120,0
2	219139573	.	G	A	1830.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1859,129,0
2	219140047	.	G	C	589.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-0.382;DP=38;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:618,0,791
2	219140288	.	G	C	1817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1846,129,0
2	219142491	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	219144815	.	T	C	1334.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1363,96,0
2	219146868	.	T	C	1057.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1086,78,0
2	219146882	.	G	C	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:694,54,0
2	219209796	.	C	A	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=1.006;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:127,0,695
2	219210606	.	T	C	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=2.305;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=24.29;ReadPosRankSum=-2.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:587,0,225
2	219210781	.	G	A	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:420,0,224
2	219263792	.	T	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
2	219265094	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
2	219266108	.	C	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
2	219266423	.	C	A	1498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1527,108,0
2	219269729	.	G	T	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1263,87,0
2	219315215	.	C	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:190,0,70
2	219316421	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
2	219316786	.	T	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:242,0,62
2	219317248	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:158,0,69
2	219318563	.	C	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
2	219319657	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	219432953	.	G	C	86.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:115,0,23
2	219433357	.	A	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
2	219433597	.	G	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:97,0,97
2	219437596	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	219457731	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,165
2	219457741	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,207
2	219498759	.	T	G	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:76,0,26
2	219499875	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	219499897	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,110
2	219499939	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:115,0,33
2	219499975	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,72
2	219500093	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	219501133	.	G	A	68.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=13.66	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:1:94,0,1
2	219501328	.	G	A	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:97:226,0,97
2	219502132	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:74,0,70
2	219508372	.	A	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.933;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:178,0,343
2	219508988	.	T	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
2	219509618	.	C	A	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=20.77;ReadPosRankSum=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:319,0,165
2	219513782	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,214
2	219517949	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	219520405	.	C	T	124.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:153,0,21
2	219525335	.	C	T	333.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=33.31;ReadPosRankSum=-0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:11:361,0,11
2	219525582	.	A	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
2	219543277	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
2	219562675	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
2	219602499	.	G	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:110,0,33
2	219619766	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	219620566	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	219623504	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
2	219941063	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	220037097	.	C	T	1296.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1325,101,0
2	220037393	.	A	G	1375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1404,99,0
2	220037666	.	A	G	1069.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1098,75,0
2	220037756	.	A	G	1360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1389,96,0
2	220040330	.	A	G	1652.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.465;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=30.59;ReadPosRankSum=-1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,40:41:78:1681,78,0
2	220046975	.	C	A	1037.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1066,75,0
2	220047393	.	C	T	595.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:624,45,0
2	220048150	.	C	T	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:686,48,0
2	220049290	.	C	T	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
2	220082090	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	220083279	.	C	T	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
2	220083453	.	G	T	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
2	220083655	.	C	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
2	220084350	.	C	T	599.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:628,45,0
2	220084902	.	G	A	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:782,57,0
2	220085845	.	A	G	846.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:875,63,0
2	220094551	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,78
2	220113242	.	T	G	1174.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1203,84,0
2	220113384	.	G	A	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:650,48,0
2	220236662	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
2	220236969	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	220238496	.	G	A	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:513,39,0
2	220247558	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
2	220247641	.	T	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	220249908	.	T	C	289.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:318,24,0
2	220250147	.	A	G	1105.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1134,78,0
2	220250322	.	C	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=2.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	220369220	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	220404381	.	A	G	914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:943,66,0
2	220404648	.	C	T	790.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.023;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,22:31:99:819,0,293
2	220404726	.	G	A	585.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.087;DP=25;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.320	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:614,0,275
2	220405230	.	G	A	620.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.306;DP=17;FS=3.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.102	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:7:648,7,0
2	220405321	.	T	C	1084.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1113,81,0
2	220406239	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,195
2	220406722	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.263;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:320,0,531
2	220412256	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	220420172	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	220420553	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:73,0,33
2	220420785	.	G	A	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=1.325;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.325	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:322,0,280
2	220420956	.	A	G	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:645,45,0
2	220421479	.	A	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:95:192,0,95
2	220421639	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
2	220421686	.	A	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
2	220422400	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	220422774	.	A	G	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=14.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:228,0,113
2	220427347	.	G	T	979.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=-2.003;DP=30;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.66;ReadPosRankSum=1.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,25:30:99:1008,0,114
2	220427395	.	G	A	925.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.137;DP=39;FS=11.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=23.74;ReadPosRankSum=1.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,25:36:99:954,0,360
2	220427680	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,267
2	220427996	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	220430203	.	C	T	1352.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1381,96,0
2	220431595	.	G	T	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=1.305;DP=36;FS=5.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=9.05;ReadPosRankSum=-1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,11:36:99:354,0,945
2	220431919	.	A	G	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
2	220435034	.	A	G	1025.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1054,75,0
2	220435375	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:123,0,282
2	220462640	.	G	T	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
2	220466199	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	220473929	.	T	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.633;DP=11;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:122,0,233
2	220475584	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	220476443	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
2	220479312	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	220494118	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	220500423	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	220500426	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	220502367	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	220505265	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
2	220558192	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	220558193	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	222283504	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	222283514	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	222457343	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	222457347	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	222457469	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	222457477	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	222457478	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	222827154	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
2	223433371	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	223436607	.	C	T	1257.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1286,93,0
2	223765491	.	C	T	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:172,0,237
2	223804532	.	G	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	223807257	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:154,0,70
2	223807322	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,206
2	223807323	.	T	C	285.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:314,21,0
2	223807380	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	223808401	.	A	C	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
2	223808437	.	G	C	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
2	223808493	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,197
2	223809071	.	G	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
2	224569899	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	224615566	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	224615567	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	224619161	.	G	A	35.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
2	224620181	.	G	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,106
2	224620222	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:81:81,0,349
2	224740705	.	G	A	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
2	224741210	.	G	C	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:308,0,137
2	224741803	.	T	A	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
2	224741911	.	C	T	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:661,45,0
2	224741993	.	T	C	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:820,57,0
2	224742045	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
2	224742738	.	C	T	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
2	224743373	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-1.303;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:77:77,0,587
2	224765136	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	224765506	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
2	224765511	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	224765548	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	224831891	.	G	A	916.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:945,66,0
2	224832136	.	C	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,196
2	224832161	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,105
2	224840096	.	A	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	225347270	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	227860671	.	G	A	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:207,0,102
2	228177751	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	228189985	.	C	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:97:97,0,183
2	228190002	.	C	G	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:296,0,176
2	228190065	.	A	G	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:848,60,0
2	228194653	.	C	T	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
2	228205842	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	228205856	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	228209346	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	228210135	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	228211074	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	228213307	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	228213610	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	228216320	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	228221725	.	A	G	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.077;DP=35;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,10:35:99:316,0,956
2	228416498	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:67,0,35
2	228416712	.	A	G	1425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1454,102,0
2	228420193	.	A	T	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:92:92,0,136
2	228421572	.	C	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,232
2	228423393	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,159
2	228423689	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:154,0,72
2	228423771	.	C	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
2	228424408	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,117
2	228424730	.	C	T	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
2	229226303	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	229226305	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	230045542	.	C	G	5946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:5975,403,0
2	230045545	.	T	C	5946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:5975,403,0
2	230045554	.	G	C	5946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:5975,403,0
2	230045564	.	T	C	5946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:5975,403,0
2	230045568	.	T	C	5946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:5975,403,0
2	230045615	.	G	A	1476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1505,105,0
2	230723777	.	G	C	707.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-1.445;DP=26;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,19:26:99:736,0,219
2	230786840	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	230909590	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
2	230923147	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
2	230923302	.	A	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
2	230933515	.	C	T	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.634;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:248,0,514
2	231042276	.	A	G	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
2	231077110	.	C	T	414.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=34.52;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:10:442,0,10
2	231077676	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
2	231077725	.	A	G	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
2	231331896	.	G	A	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,308
2	231380748	.	C	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	231384947	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	231406680	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
2	231408095	.	C	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
2	231408347	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	231408948	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	231409114	.	G	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
2	231410149	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	231904333	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	231913056	.	C	T	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:297,0,109
2	231913395	.	G	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,106
2	231940280	.	G	C	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.347;DP=36;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,10:35:99:332,0,965
2	232035429	.	G	A	1335.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1364,99,0
2	232072912	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
2	232087474	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	232087475	.	T	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
2	232121087	.	G	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
2	232121117	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	232121120	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	232326417	.	C	T	2129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.454;DP=89;FS=9.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=23.93;ReadPosRankSum=-0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,56:89:99:2158,0,1160
2	232568692	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	232571214	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
2	232573292	.	T	C	2023.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2052,138,0
2	232573301	.	C	T	2023.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:2052,138,0
2	232574504	.	C	T	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
2	232574807	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	232577699	.	G	A	958.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-2.041;DP=29;FS=10.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=33.06;ReadPosRankSum=2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,26:29:33:987,0,33
2	232597475	.	T	C	737.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:766,57,0
2	233243981	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	233432633	.	A	T	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
2	233435104	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
2	233437917	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	233438268	.	A	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
2	233446568	.	G	A	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
2	233446725	.	T	C	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:661,45,0
2	233446821	.	A	G	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
2	233498431	.	T	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.678;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.285;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.577	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,5:33:99:106,0,1056
2	233498669	.	G	T	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-1.350;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,12:42:99:383,0,1116
2	233537125	.	A	G	2375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2404,169,0
2	233546985	.	T	C	2558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2587,178,0
2	233599904	.	A	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,215
2	233708806	.	A	G	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.177;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:332,0,328
2	233723182	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	233724536	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	233757697	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	234160345	.	T	G	169.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:198,0,26
2	234172915	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
2	234183368	.	A	G	249.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.22;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:278,0,22
2	234203543	.	T	C	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.833;DP=19;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:206,0,490
2	234203547	.	T	C	795.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:824,60,0
2	234203597	.	T	C	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:249,0,347
2	234203740	.	A	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.634;DP=23;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:151,0,657
2	234203876	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.091;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:236,0,684
2	234204113	.	T	C	705.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:734,51,0
2	234355898	.	G	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:117,0,71
2	234374541	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	234378902	.	T	C	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:727,51,0
2	234440032	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	234440649	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	234591339	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	234681676	.	A	G	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.128;DP=34;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,7:34:99:209,0,1037
2	234750542	.	G	C	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:744,51,0
2	234750831	.	T	C	1188.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1217,84,0
2	234756240	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	234757272	.	G	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
2	234759233	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
2	234759419	.	C	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
2	234760474	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
2	234760782	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	234761225	.	C	T	932.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:961,69,0
2	234774149	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	234775941	.	A	G	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
2	234776984	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
2	235402279	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,155
2	235402656	.	G	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,237
2	235403987	.	C	G	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-1.126;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:286,0,523
2	235476008	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	235476653	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	235516424	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	236820020	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	236820036	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	236957822	.	G	A	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:314,0,383
2	237032607	.	T	G	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=23.87;ReadPosRankSum=0.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:434,0,165
2	237032703	.	T	C	531.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=1.197;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=31.28;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:64:560,0,64
2	237032837	.	G	A	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:138,0,200
2	237033073	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
2	237033077	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	237035915	.	C	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
2	237036253	.	A	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
2	237036645	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,157
2	237037275	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	237037340	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	237039064	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
2	238394913	.	G	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-1.660;DP=15;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:87:87,0,419
2	238395394	.	T	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:141,0,187
2	238395429	.	T	C	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.628;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:297,0,291
2	238395479	.	T	A	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:261,0,197
2	238395813	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,112
2	238395871	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
2	238421033	.	C	T	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=1.113;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:202,0,550
2	238421349	.	A	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=1.002;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,5:30:99:119,0,953
2	238423791	.	T	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.002;DP=35;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,8:35:99:242,0,1061
2	238424987	.	G	A	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.718;DP=32;FS=1.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:237,0,894
2	238438346	.	T	C	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
2	238443226	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:141,0,320
2	238449107	.	A	G	866.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.425;DP=65;FS=6.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,25:65:99:895,0,1523
2	238456596	.	A	C	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:193,0,66
2	238456609	.	A	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:193,0,66
2	238457338	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
2	238457684	.	A	G	203.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:20:232,0,20
2	238458180	.	G	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,117
2	238458303	.	C	T	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:194,0,152
2	238458326	.	C	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:199,0,63
2	238458498	.	C	T	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:58:232,0,58
2	238458534	.	A	T	281.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:3:308,0,3
2	238458763	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	238458971	.	T	C	296.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:16:325,0,16
2	238459012	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:78:120,0,78
2	238459019	.	G	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:120,0,78
2	238460671	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:106,0,34
2	238461773	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:118,0,64
2	238462324	.	A	G	1807.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=-0.873;DP=58;FS=7.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,47:58:99:1836,0,320
2	238462725	.	G	A	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:35:204,0,35
2	238462782	.	T	C	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.64;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:39:277,0,39
2	238463202	.	A	T	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:47:268,0,47
2	238463399	.	T	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
2	238463408	.	C	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
2	238483164	.	T	C	299.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:328,0,284
2	238483331	.	G	C	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-0.341;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:472,0,333
2	238483475	.	T	C	618.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.762;DP=24;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,17:24:99:647,0,223
2	238483654	.	G	A	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.506;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.195	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:567,0,150
2	238483671	.	G	A	501.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=1.303;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:60:530,0,60
2	238483729	.	A	G	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.604;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:422,0,264
2	238484222	.	G	A	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:61:234,0,61
2	238484344	.	T	G	205.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:7:233,0,7
2	238484662	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
2	238485251	.	G	A	441.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.55;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:45:470,0,45
2	238485713	.	G	A	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=1.408;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=22.92;ReadPosRankSum=-1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:372,0,167
2	238486440	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:158,0,31
2	238487353	.	G	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	238487850	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:117,0,30
2	238491258	.	C	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:155,0,69
2	238492107	.	C	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,138
2	238492155	.	A	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
2	238493118	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
2	238493182	.	G	C	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
2	238494288	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:102,0,73
2	238494319	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
2	238494448	.	T	C	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:426,30,0
2	238494742	.	A	G	745.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:774,57,0
2	238499318	.	A	G	641.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:670,45,0
2	238499319	.	T	C	641.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:670,45,0
2	238499690	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
2	238500046	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	238500211	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
2	238500642	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
2	238668783	.	A	G	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.798;DP=39;FS=7.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,6:39:99:130,0,1327
2	238668802	.	A	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-2.105;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,3:31:40:40,0,1102
2	238669807	.	A	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:119,0,30
2	238672425	.	G	C	41.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=1.558;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:70:70,0,701
2	238672703	.	C	G	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.270;DP=48;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,11:48:99:332,0,1369
2	238672938	.	T	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:198,0,102
2	238673302	.	T	A	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=-1.380;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:249,0,533
2	238677614	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:92:145,0,92
2	238677841	.	C	T	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:171,0,146
2	238683813	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:61,0,35
2	238688244	.	A	G	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
2	238903399	.	G	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:147,0,145
2	239007264	.	C	A	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=12.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:91:91,0,247
2	239007534	.	A	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,108
2	239080571	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	239082976	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	239083301	.	G	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
2	239084294	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	239085145	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
2	239085687	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	239087092	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	239087912	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
2	239089684	.	G	A	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
2	239091081	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	239147036	.	C	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:63:236,0,63
2	239147129	.	T	C	517.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.046;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=27.25;ReadPosRankSum=-0.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:546,0,156
2	239147171	.	C	G	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.715;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=19.41;ReadPosRankSum=1.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:300,0,193
2	239153948	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
2	239165663	.	T	C	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
2	239229372	.	C	A	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
2	239237953	.	G	T	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.48;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:58:303,0,58
2	239307975	.	G	A	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
2	239308404	.	T	C	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
2	239335401	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	239335403	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	239335473	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	239355454	.	C	T	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
2	239356977	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	239469653	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
2	239472099	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	239972883	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
2	240000936	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	240323661	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	240897085	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
2	240898578	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,119
2	240946766	.	T	C	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=-0.468;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,9:45:99:268,0,1412
2	240952002	.	C	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,109
2	240952523	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,115
2	240953065	.	C	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:96,0,108
2	240954110	.	A	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:97:97,0,126
2	240961728	.	T	C	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-1.555;DP=39;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,7:39:99:190,0,1263
2	241388857	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	241390002	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:229,0,122
2	241390827	.	C	T	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.452;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:203,0,294
2	241391025	.	G	C	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
2	241392077	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,122
2	241392491	.	A	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.881;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,161
2	241393182	.	T	C	232.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.01;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:11:260,0,11
2	241393283	.	G	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:56:56,0,218
2	241393687	.	G	C	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=16.81;ReadPosRankSum=-1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:314,0,297
2	241393922	.	G	A	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-1.399;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.263	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:273,0,514
2	241395353	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:138,0,209
2	241395503	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
2	241395538	.	T	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:52:133,0,52
2	241397096	.	G	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,103
2	241397143	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,183
2	241398038	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:104,0,64
2	241401741	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:86:235,0,86
2	241403417	.	T	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,71
2	241404317	.	C	T	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=-0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:364,0,478
2	241405479	.	C	T	635.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.175;DP=26;FS=12.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=24.45;ReadPosRankSum=0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,17:23:99:664,0,171
2	241405528	.	A	G	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:700,51,0
2	241405608	.	A	G	447.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.854;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=18.66;ReadPosRankSum=1.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:476,0,373
2	241405864	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:181,0,61
2	241406187	.	G	A	334.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:363,0,260
2	241406649	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
2	241406701	.	G	C	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:175,0,302
2	241406725	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:261,0,277
2	241406853	.	G	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,190
2	241407115	.	C	T	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-1.148;DP=18;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.413	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:323,0,326
2	241415050	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	241415051	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	241415950	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	241417047	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
2	241419842	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	241447428	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
2	241453833	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	241465261	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
2	241510903	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	241511119	.	G	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:100,0,28
2	241517770	.	G	A	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:315,0,512
2	241523243	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:109,0,33
2	241537421	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:73:73,0,428
2	241538229	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:138,0,308
2	241654958	.	G	A	962.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.664;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=28.32;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,25:34:99:991,0,293
2	241666628	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
2	241667146	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	241667284	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
2	241670028	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
2	241672740	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
2	241674222	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
2	241683747	.	C	T	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:81:422,0,81
2	241683874	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
2	241684143	.	G	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:93:195,0,93
2	241684660	.	T	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:56:186,0,56
2	241685822	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
2	241707800	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	241713646	.	A	G	1176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.939;DP=40;FS=5.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=29.42;ReadPosRankSum=1.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,31:40:99:1205,0,238
2	241720086	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	241737603	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	241740907	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	241745721	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	241746355	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	241757349	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	241815856	.	G	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
2	241817516	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
2	241825926	.	T	C	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
2	241826138	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
2	241828034	.	A	G	463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:492,36,0
2	241835543	.	A	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
2	241835786	.	G	A	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
2	241835946	.	T	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
2	241836140	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	241979550	.	T	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
2	241982709	.	C	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	241983534	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	241991875	.	G	A	153.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:182,0,22
2	241995014	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242004866	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	242015413	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242015650	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
2	242018994	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	242028741	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
2	242031087	.	C	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,150
2	242033394	.	C	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
2	242033770	.	T	A	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
2	242034380	.	T	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
2	242053546	.	C	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
2	242053856	.	G	A	293.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:322,24,0
2	242062130	.	C	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
2	242065601	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	242066314	.	T	C	422.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:451,33,0
2	242072357	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=18.09;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:191,0,144
2	242072691	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
2	242072696	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242072698	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242072906	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242073060	.	T	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
2	242074139	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	242082480	.	A	C	187.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:216,18,0
2	242085602	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	242087346	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,105
2	242087891	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
2	242089573	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
2	242122277	.	G	A	578.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.562;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=24.12;ReadPosRankSum=1.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:607,0,259
2	242122391	.	T	C	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:605,45,0
2	242135702	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	242137372	.	C	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
2	242137702	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:156,0,72
2	242138334	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
2	242139052	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
2	242147445	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	242147462	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	242163827	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
2	242168976	.	T	C	522.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-2.493;DP=62;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=8.43;ReadPosRankSum=2.335	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,17:62:99:551,0,1739
2	242175746	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	242176429	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
2	242176706	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
2	242179134	.	G	A	1400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-2.040;DP=56;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=25.01;ReadPosRankSum=1.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,40:56:99:1429,0,480
2	242186039	.	G	A	175.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:204,0,19
2	242190195	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
2	242191063	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242191854	.	T	C	38.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:18:67,0,18
2	242191857	.	T	C	38.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:18:67,0,18
2	242192848	.	T	C	1877.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=1.574;DP=64;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=29.34;ReadPosRankSum=-1.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,48:64:99:1906,0,509
2	242203916	.	A	C	2691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2720,190,0
2	242210248	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:72:72,0,200
2	242210408	.	A	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
2	242210682	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242255378	.	G	A	426.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-1.109;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:455,0,222
2	242266963	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
2	242286747	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
2	242291391	.	T	C	489.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.951;DP=46;FS=6.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,15:45:99:518,0,1152
2	242291743	.	A	G	529.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=-0.558;DP=48;FS=4.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,16:48:99:558,0,1215
2	242292378	.	G	T	459.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-1.608;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,14:41:99:488,0,1034
2	242292516	.	G	C	563.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=-0.728;DP=46;FS=4.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,17:46:99:592,0,1114
2	242292944	.	G	C	1394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.063;DP=47;FS=13.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,36:47:99:1423,0,322
2	242293021	.	A	G	434.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-0.293;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,14:53:99:463,0,1522
2	242380991	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:100,0,155
2	242384581	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	242385340	.	A	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:56:56,0,135
2	242407588	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242426399	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
2	242434602	.	A	G	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.245;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.385	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:180,0,617
2	242436527	.	T	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
2	242439083	.	C	T	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:92:333,0,92
2	242501828	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,304
2	242509012	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242509013	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242510982	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	242511753	.	C	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:137,0,226
2	242512966	.	G	A	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.207;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.207	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:212,0,620
2	242515516	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
2	242516105	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
2	242517348	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
2	242517966	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
2	242518023	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:56:114,0,56
2	242572837	.	G	T	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=1.093;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.280	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,8:28:99:252,0,747
2	242572846	.	A	G	1176.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:84:1205,84,0
2	242573211	.	T	C	861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:890,63,0
2	242594106	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
2	242606080	.	G	A	384.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-1.070;DP=32;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:413,0,785
2	242606511	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
2	242607483	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	242607484	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	242608437	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:104,0,61
2	242609265	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
2	242609323	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:72,0,34
2	242610405	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,109
2	242610502	.	G	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:105,0,28
2	242610773	.	T	A	1179.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1208,84,0
2	242611050	.	C	G	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:228,0,177
2	242611287	.	G	A	120.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:149,0,20
2	242611934	.	T	C	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.420;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.161	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:554,0,229
2	242612342	.	G	T	604.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=-0.699;DP=24;FS=10.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,17:24:99:633,0,231
2	242612487	.	C	T	408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:437,0,118
2	242612755	.	G	A	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-1.684;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:326,0,292
2	242612784	.	T	G	567.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=-0.184;DP=22;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.364	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,16:22:99:596,0,198
2	242612909	.	A	G	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-2.219;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=26.73;ReadPosRankSum=2.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:87:349,0,87
2	242613089	.	A	G	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:356,0,164
2	242613133	.	T	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.28;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:281,0,99
2	242615462	.	T	C	1243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.860;DP=45;FS=13.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,33:45:99:1272,0,385
2	242615874	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
2	242616183	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
2	242618050	.	A	G	1136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.260;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,30:37:99:1165,0,175
2	242618347	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
2	242618415	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
2	242622326	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=7;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,109
2	242622692	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
2	242626822	.	G	A	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.34;ReadPosRankSum=1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:97:318,0,97
2	242629529	.	G	A	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:196,0,26
2	242630048	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
2	242642031	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:65,0,33
2	242642345	.	C	T	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:172,0,131
2	242643187	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	242660688	.	C	T	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:95:95,0,295
2	242662761	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
2	242664198	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
2	242664777	.	G	A	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
2	242665320	.	A	G	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.156;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:87:87,0,400
2	242666172	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,214
2	242666194	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,137
2	242667870	.	G	C	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:293,0,210
2	242667893	.	T	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,242
2	242667894	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,242
2	242668050	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
2	242668088	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,655
2	242668089	.	G	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,655
2	242668535	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,156
2	242674104	.	A	G	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:426,33,0
2	242674112	.	T	G	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:33:426,33,0
2	242674549	.	C	G	141.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:170,0,25
2	242674803	.	G	A	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:258,0,284
2	242678898	.	C	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
2	242685109	.	T	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:94:94,0,352
2	242686036	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:77,0,29
2	242688672	.	C	T	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=1.71;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:47:47,0,335
2	242688805	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:58:222,0,58
2	242691021	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:73,0,61
2	242692588	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,157
2	242707638	.	G	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:53:53,0,382
2	242708162	.	C	T	206.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:235,0,23
2	242711353	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:78,0,34
2	242711364	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:59:59,0,119
2	242711607	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
2	242749596	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
2	242916258	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
2	242923819	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	242923822	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
2	242929560	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:109,0,28
3	3170792	.	C	T	709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:738,51,0
3	3189279	.	A	G	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
3	3190451	.	G	A	696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:725,51,0
3	3191776	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	3192903	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
3	3192927	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
3	3193388	.	T	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
3	3193646	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	3193676	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	3194587	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	3198513	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	3841431	.	C	G	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
3	3842084	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	3845221	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	3886180	.	T	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
3	3886580	.	A	G	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:598,42,0
3	3887876	.	T	C	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
3	3889014	.	G	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
3	3889222	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	4040953	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	4358234	.	G	A	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:48:48,0,221
3	4358476	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	4403153	.	T	G	696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:725,51,0
3	4403357	.	A	C	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:48:647,48,0
3	4403537	.	C	T	951.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:980,69,0
3	4403767	.	A	G	669.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:698,48,0
3	4403817	.	T	A	861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:60:890,60,0
3	4403818	.	T	C	861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:890,60,0
3	4403837	.	A	G	954.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:983,69,0
3	4532960	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	4829732	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
3	4856234	.	G	A	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
3	5231684	.	T	G	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
3	5231826	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	5241309	.	C	A	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:325,24,0
3	5258078	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	5258431	.	G	A	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
3	5258985	.	T	C	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
3	5260130	.	A	C	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
3	5260299	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
3	8614542	.	G	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	8920207	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	8920281	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	8920505	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	8922643	.	G	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:140,0,317
3	8928891	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	9005078	.	C	T	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
3	9024949	.	T	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	9025094	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	9077896	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	9404877	.	G	A	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
3	9404924	.	G	C	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:672,48,0
3	9406836	.	T	C	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:529,39,0
3	9422210	.	T	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
3	9422978	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	9423083	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	9425743	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	9425911	.	G	A	710.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:739,51,0
3	9428270	.	G	A	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
3	9430763	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	9430868	.	T	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
3	9431009	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	9438060	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	9512245	.	G	A	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=1.416;DP=17;FS=9.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=0.65;ReadPosRankSum=-1.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,2:17:39:39,0,557
3	9516455	.	C	T	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
3	9802599	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	9805408	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
3	9859198	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	9859456	.	C	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
3	9859777	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	9860880	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	9861053	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	9867625	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
3	9870065	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	9870857	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	9871030	.	T	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
3	9877481	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
3	9932337	.	G	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
3	9934605	.	T	C	881.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:910,63,0
3	9935263	.	A	G	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
3	9946287	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	9951620	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
3	9951788	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
3	9952706	.	A	G	757.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=1.387;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=26.46;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:25:786,25,0
3	9953894	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
3	9954826	.	C	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	9955183	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	9955243	.	G	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
3	9956279	.	G	A	750.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:779,54,0
3	9957455	.	C	T	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:720,54,0
3	9957898	.	G	A	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
3	9960070	.	C	T	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
3	9960405	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
3	9960408	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	9960415	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	9961374	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	9961380	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	9970031	.	A	G	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:880,63,0
3	9970158	.	C	T	848.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:877,63,0
3	9973769	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	9975129	.	C	T	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-1.663;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.62;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:266,0,134
3	9976159	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
3	9976864	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	9984130	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	9985457	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	9990800	.	G	C	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
3	9991101	.	C	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
3	9991163	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	9991388	.	G	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
3	9996426	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	9999913	.	A	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
3	10003541	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	10004768	.	G	A	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
3	10005392	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	10005715	.	A	T	634.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:663,45,0
3	10028690	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
3	10029289	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	10029305	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	10035361	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	10035557	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	10035896	.	A	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	10037320	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	10037321	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	10038706	.	A	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
3	10039044	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
3	10039166	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	10041554	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	10044457	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
3	10045030	.	C	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
3	10045703	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
3	10045734	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	10046165	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
3	10046398	.	G	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
3	10046703	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	10047246	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	10047680	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
3	10047975	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	10048601	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
3	10048951	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	10057204	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
3	10059658	.	G	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:305,21,0
3	10059664	.	T	C	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:305,21,0
3	10065426	.	C	T	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
3	10067794	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
3	10067797	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
3	10067972	.	C	T	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
3	10085536	.	A	G	162.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:17:191,17,0
3	10131417	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	10135577	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	10136390	.	T	A	15.62	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
3	10138069	.	T	G	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
3	10143274	.	C	T	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
3	10157368	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	10161518	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	10168647	.	T	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
3	10168785	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	10168802	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
3	10187014	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	10187634	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	10192762	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	10193475	.	A	G	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.938;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:83:83,0,443
3	10193509	.	A	G	603.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:632,45,0
3	10194356	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,189
3	10194705	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,191
3	10194841	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=1.397;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:48:48,0,835
3	10195298	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	10195303	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	10253553	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	10253557	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	10253558	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	10253571	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	10290144	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	10302172	.	G	A	889.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:918,66,0
3	10321734	.	C	T	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
3	10343244	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	10356760	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	10869362	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
3	10885920	.	T	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
3	10916711	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
3	10966711	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	10967739	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	10975745	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
3	10976533	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	11643465	.	T	C	932.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:961,66,0
3	11880760	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
3	12329452	.	C	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
3	12526006	.	G	A	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
3	12544829	.	G	A	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:562,42,0
3	12552084	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	12560317	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	12878553	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	12939546	.	G	A	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
3	12940346	.	G	A	226.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:255,21,0
3	12942408	.	G	A	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
3	12943341	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	12945900	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
3	12962074	.	G	A	337.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=33.70;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:12:365,0,12
3	13063591	.	A	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
3	13368892	.	G	A	571.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:600,45,0
3	13369702	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
3	13374490	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
3	13374732	.	A	G	213.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,6:7:11:241,11,0
3	13375431	.	A	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
3	13376795	.	G	A	169.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:21:198,0,21
3	13379400	.	C	T	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
3	13383540	.	A	G	900.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:929,63,0
3	13385804	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	13387189	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	13388084	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	13390629	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	13390740	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	13395579	.	C	A	718.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:747,54,0
3	13399786	.	G	A	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:685,51,0
3	13407556	.	T	C	589.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:618,45,0
3	13418086	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	13421150	.	C	T	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:692,54,0
3	14154231	.	T	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
3	14166280	.	C	T	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
3	14177194	.	T	C	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
3	14179422	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	14179704	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	14180552	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
3	14180633	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	14183410	.	T	C	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
3	14183758	.	A	G	882.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:911,63,0
3	14184074	.	A	C	372.25	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:53:689,53,0
3	14184669	.	T	C	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
3	14184719	.	T	C	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
3	14186757	.	C	G	207.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:236,18,0
3	14186823	.	T	C	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:39:553,39,0
3	14186830	.	A	T	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:39:553,39,0
3	14187345	.	G	C	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
3	14187449	.	G	T	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
3	14187699	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	14188700	.	C	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
3	14189147	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
3	14189340	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	14197546	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	14197987	.	A	T	1014.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1043,72,0
3	14197998	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
3	14199887	.	G	A	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:447,33,0
3	14199908	.	C	T	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
3	14526538	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	14526656	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	14527363	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	14527939	.	C	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
3	14528004	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	14713526	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	14715782	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	14715887	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	14721074	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	14721266	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	14721633	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	14939471	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	14984719	.	C	G	1169.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1198,84,0
3	14985730	.	T	C	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
3	14985751	.	T	C	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
3	14986104	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:147,0,482
3	14986110	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=13.20;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:147,0,482
3	14986137	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:105,0,267
3	14986453	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,194
3	14987179	.	T	C	983.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1012,72,0
3	15084880	.	T	A	38.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	15090333	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:144,0,224
3	15091248	.	A	G	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
3	15096824	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	15113123	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	15113519	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	15113655	.	T	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:87:87,0,369
3	15113783	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	15114833	.	C	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,109
3	15115270	.	G	T	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:489,36,0
3	15247796	.	A	G	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:528,42,0
3	15294811	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	15295158	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	15297954	.	G	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
3	15299846	.	G	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
3	15300799	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
3	15301363	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	15305870	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	15311325	.	A	G	766.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:795,57,0
3	15314812	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	15373819	.	G	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:139,0,217
3	15374050	.	C	T	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
3	15423697	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
3	15423834	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	15427117	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	15451978	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
3	15469001	.	A	C	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
3	15469353	.	G	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:127,0,328
3	15482775	.	C	G	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
3	15483830	.	A	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
3	15492786	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	15492807	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	15643043	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
3	15688688	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	15692959	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
3	15717693	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	15717844	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	15737689	.	G	A	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:51:744,51,0
3	15737698	.	T	C	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:51:744,51,0
3	15900973	.	A	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
3	16300335	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	16301148	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	16305674	.	C	G	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
3	16312564	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	16347142	.	G	A	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
3	17686288	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	18465443	.	A	G	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
3	18466059	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	20020443	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	20212189	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
3	24138399	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	24163021	.	T	C	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
3	24163645	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	24163705	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
3	24163773	.	C	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
3	24163921	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
3	24163964	.	T	C	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
3	27424718	.	A	G	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
3	27525831	.	T	C	215.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:244,21,0
3	28370419	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	28371399	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	28390351	.	A	G	167.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:195,8,0
3	30686252	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	31661754	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	31668760	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	31678512	.	A	G	1446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1475,102,0
3	31678613	.	G	A	756.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:785,54,0
3	31712393	.	C	T	376.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:405,30,0
3	31725316	.	G	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
3	32154324	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	32154358	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
3	32181744	.	C	A	929.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:958,69,0
3	32189391	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	32189801	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	32195127	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	32195427	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	32197092	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	32205332	.	C	G	54.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:82,9,0
3	32207606	.	A	G	1141.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1170,81,0
3	32207732	.	C	T	867.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:60:896,60,0
3	32207737	.	A	T	867.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:60:896,60,0
3	32207907	.	T	C	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
3	32208431	.	A	G	1030.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1059,75,0
3	32208467	.	T	G	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
3	32208621	.	T	C	1016.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1045,72,0
3	32208874	.	C	T	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
3	32208875	.	T	G	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
3	32209230	.	T	C	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
3	32209750	.	T	C	729.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:758,54,0
3	32209927	.	A	G	1293.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1322,93,0
3	32278965	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	32279733	.	T	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
3	32280862	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	32523287	.	A	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
3	32523777	.	T	C	347.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=31.55;ReadPosRankSum=-0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:12:375,0,12
3	32533246	.	T	C	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:340,27,0
3	32815231	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	33055721	.	A	G	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
3	33138544	.	A	G	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:30:437,30,0
3	33138549	.	G	A	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:30:437,30,0
3	33185522	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	33185798	.	T	A	294.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,8:9:17:323,17,0
3	33187082	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	33434831	.	G	A	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
3	33458266	.	T	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
3	33494982	.	C	T	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:445,33,0
3	33495251	.	G	A	293.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:322,24,0
3	33539893	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	33879770	.	G	A	918.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:947,66,0
3	36907527	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	37030175	.	C	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	37030382	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	37030539	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,235
3	37095070	.	C	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
3	37110463	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	37218588	.	T	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	37221408	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	37366459	.	C	A	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
3	37368755	.	T	A	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:604,42,0
3	37407664	.	G	T	842.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:871,60,0
3	37477377	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	38406773	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	38408361	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	38413880	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	38454931	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
3	38455901	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
3	38458533	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	38458958	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
3	38460062	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	38525734	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	38527913	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	38537885	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
3	38567725	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	38569764	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	39149092	.	A	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
3	39180095	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	39180099	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	39183895	.	A	G	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
3	39184959	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
3	39185077	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
3	39185248	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
3	39186728	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	39377676	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	39433147	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	39436064	.	C	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:174,0,423
3	39438599	.	T	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
3	39448804	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	39554946	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	40251392	.	T	C	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
3	40498845	.	C	T	688.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:717,51,0
3	40498933	.	A	G	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
3	40499182	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
3	40503809	.	G	A	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:820,57,0
3	40504326	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	40505060	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	40505530	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,362
3	40505535	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,362
3	40505597	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,117
3	40505740	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
3	40505886	.	C	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
3	40506548	.	T	C	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
3	40507332	.	G	A	116.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.39;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:14:145,0,14
3	40507420	.	A	G	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:80,0,26
3	40519429	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
3	40577684	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
3	40577685	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	40580903	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	42253090	.	G	A	360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:389,30,0
3	42266621	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	42500125	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	42574806	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	42578026	.	A	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
3	42578303	.	T	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
3	42578323	.	T	C	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:534,36,0
3	42578335	.	T	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
3	42578509	.	G	A	564.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:593,42,0
3	42578768	.	G	A	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:571,39,0
3	42578862	.	C	T	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:521,42,0
3	42660567	.	G	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
3	42660862	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	43098226	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	43120835	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	43121559	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	43384139	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	43401396	.	T	C	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:76,0,24
3	43761441	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	44012249	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
3	44379864	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	44450226	.	A	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	44450564	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
3	44483206	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	44485822	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
3	44485914	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	44487545	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	44536595	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
3	44791398	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:65,0,31
3	44791553	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,116
3	44881909	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
3	44903434	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	44906746	.	A	G	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
3	44958773	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
3	44960561	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	44972309	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	45052775	.	G	C	923.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:952,69,0
3	45063549	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	45071538	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	45124169	.	T	C	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
3	45124351	.	C	T	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
3	45125720	.	T	G	240.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:269,27,0
3	45125850	.	T	C	461.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=29.60;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:0:487,0,0
3	45125920	.	A	T	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
3	45126215	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
3	45126558	.	C	T	592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:621,45,0
3	45127515	.	T	C	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
3	45430151	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
3	45527218	.	T	C	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:469,36,0
3	45533224	.	G	A	639.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:668,48,0
3	45559519	.	T	C	424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:453,33,0
3	45565554	.	A	G	529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:558,39,0
3	45583365	.	G	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,109
3	45589411	.	A	G	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
3	45589702	.	T	C	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
3	45636213	.	C	G	339.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:368,27,0
3	45637253	.	C	T	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
3	45637439	.	T	C	357.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:386,30,0
3	45712301	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	45720406	.	C	G	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
3	45721836	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:116,0,115
3	45722100	.	A	G	340.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=22.72;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:369,0,108
3	45722408	.	A	G	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:81,0,27
3	45722422	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	45730117	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	45761050	.	G	A	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:353,0,122
3	45959515	.	A	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	45960079	.	C	A	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
3	45960420	.	G	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
3	45960646	.	T	C	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
3	45960700	.	C	T	187.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:216,18,0
3	45961842	.	C	T	743.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:772,57,0
3	45962603	.	A	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
3	45962802	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
3	45968043	.	T	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
3	45996761	.	G	A	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:529,36,0
3	46007823	.	G	T	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
3	46007825	.	T	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
3	46008087	.	G	A	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
3	46009487	.	G	A	654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:683,51,0
3	46009864	.	C	G	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
3	46010007	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
3	46010077	.	C	T	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
3	46021218	.	G	T	270.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:299,24,0
3	46462170	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	46471978	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	46501213	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	46711507	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	46711563	.	G	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	46711850	.	A	G	62.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:90,9,0
3	46714797	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
3	46716523	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
3	46716597	.	A	G	206.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:235,18,0
3	46717065	.	C	G	355.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:384,30,0
3	46717492	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	46717931	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	46717957	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	46721211	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
3	46721519	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
3	46721662	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	46723551	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
3	46963502	.	T	C	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:531,36,0
3	46967040	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
3	47018214	.	T	C	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
3	47031237	.	C	G	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
3	47032342	.	C	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	47042161	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	47043538	.	C	T	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:658,48,0
3	47045739	.	C	G	895.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:924,66,0
3	47046842	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	47058057	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
3	47125385	.	G	A	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
3	47162661	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	47385585	.	C	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	47449058	.	T	C	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
3	47449580	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	47452087	.	G	A	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
3	47452786	.	G	A	462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:491,36,0
3	47459679	.	C	T	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:613,45,0
3	47462200	.	T	C	457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:486,36,0
3	47464122	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	47532235	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	47537364	.	C	T	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:619,45,0
3	47539751	.	T	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
3	47553930	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:30:39,0,30
3	47555142	.	C	A	284.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:313,21,0
3	47684450	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	47712202	.	T	C	809.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:838,57,0
3	47747913	.	C	G	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=1.073;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:324,0,575
3	47857575	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	47892579	.	G	C	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
3	47956424	.	C	T	1194.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1223,87,0
3	47958037	.	G	T	718.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:747,51,0
3	48199695	.	T	C	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
3	48229624	.	C	T	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
3	48297611	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	48309828	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
3	48312060	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	48312229	.	A	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
3	48312402	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
3	48335857	.	C	T	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
3	48337206	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	48342882	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
3	48343261	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	48476431	.	C	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
3	48503379	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
3	48507667	.	T	C	206.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:235,18,0
3	48610625	.	G	T	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
3	48702336	.	C	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	48727112	.	G	A	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
3	48730203	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
3	48749543	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	48786991	.	T	C	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:174,0,62
3	48787684	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
3	48972892	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	49047771	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,196
3	49048618	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	49048657	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	49048726	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:113,0,34
3	49052785	.	T	A	1104.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1133,81,0
3	49053219	.	A	G	1014.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.485;DP=25;FS=4.437;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=29.15;ReadPosRankSum=0.069	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:65:1043,65,0
3	49054692	.	T	C	1333.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1362,93,0
3	49070499	.	C	T	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
3	49084973	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	49135961	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	49145741	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
3	49156676	.	A	G	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
3	49162583	.	C	T	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
3	49200137	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	49315589	.	G	T	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=19.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:163,0,170
3	49360049	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	49360050	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	49360276	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	49412973	.	C	T	1544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.326;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.168;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.288	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,41:68:99:1573,0,964
3	49452957	.	A	T	127.27	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=11;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:1:243,0,1
3	49453505	.	T	C	1383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1412,99,0
3	49460910	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	49463700	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
3	49524778	.	G	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	49548008	.	C	G	1102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1131,78,0
3	49548233	.	C	G	832.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.667;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,22:34:99:861,0,436
3	49571462	.	G	T	995.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1024,78,0
3	49572894	.	T	C	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
3	49713753	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	49760039	.	T	C	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:575,39,0
3	49760477	.	G	A	926.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:955,66,0
3	49866392	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
3	49866584	.	T	G	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
3	49924940	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
3	49936102	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
3	49949071	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
3	50003586	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	50112706	.	C	A	1033.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1062,75,0
3	50132131	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	50139029	.	G	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:93,0,33
3	50150360	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,239
3	50192760	.	C	T	378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:407,30,0
3	50192826	.	C	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
3	50212512	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	50329826	.	A	G	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
3	50357869	.	A	C	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
3	50616685	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	50620015	.	G	A	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
3	50624115	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	50624872	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	50628537	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	50685642	.	A	G	654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:683,48,0
3	50686517	.	C	A	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
3	51432128	.	G	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,110
3	51697248	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,186
3	51697493	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	51978220	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
3	52290783	.	C	T	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:40:40,0,347
3	52336545	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	52492707	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	52510592	.	G	A	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
3	52510697	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	52515533	.	T	C	709.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=34.52;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:21:738,21,0
3	52516293	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	52523405	.	C	T	232.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:261,21,0
3	52524480	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	52524574	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	52524974	.	A	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	52567779	.	G	A	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
3	52580173	.	A	G	251.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
3	52637631	.	T	C	462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:491,36,0
3	52719816	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
3	52723783	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	52745087	.	T	C	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:356,27,0
3	52871236	.	C	G	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:186,15,0
3	52872264	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	52872311	.	C	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
3	52872874	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
3	52873017	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
3	52873039	.	T	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
3	52873568	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
3	52874099	.	T	C	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
3	52874446	.	C	T	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
3	52935048	.	G	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	53206630	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	53216051	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	53220215	.	G	A	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:571,42,0
3	53220569	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	53222761	.	C	T	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:480,33,0
3	53223927	.	C	G	745.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:774,54,0
3	53224002	.	T	C	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
3	53259371	.	G	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
3	53259608	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
3	53259850	.	C	T	1675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1704,120,0
3	53261019	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	53261677	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	53261733	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	53262000	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	53264485	.	A	G	2647.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2676,184,0
3	53267100	.	C	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
3	53267133	.	G	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
3	53267532	.	C	T	52.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	53268429	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	53269046	.	T	C	2998.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:3027,208,0
3	53269163	.	G	A	2177.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2206,159,0
3	53269679	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
3	53269735	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
3	53270062	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	53270169	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	53270222	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
3	53270344	.	T	C	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
3	53270424	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	53270849	.	G	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
3	53271040	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	53271047	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	53272067	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	53272314	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
3	53273965	.	A	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
3	53321002	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	53321631	.	A	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	53846741	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	53846924	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	53847062	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	53847408	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
3	53847794	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
3	53848672	.	G	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	53849510	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	53850005	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
3	53850209	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	53850855	.	A	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
3	53855738	.	G	C	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:690,51,0
3	53856653	.	C	T	696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:725,51,0
3	53857803	.	A	C	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:655,51,0
3	53897917	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:35:80,0,35
3	53897922	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:35:80,0,35
3	53897926	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.94	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:35:80,0,35
3	53897935	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
3	53898129	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:79,0,63
3	53900255	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,112
3	53901580	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
3	53910067	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,127
3	56454363	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	56454366	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	56597954	.	C	T	188.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
3	56627048	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	56627598	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	56628031	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	57125424	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	57125864	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	57542199	.	G	T	373.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:402,30,0
3	57567217	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	57612623	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	57742725	.	G	T	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
3	57743337	.	C	G	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:614,45,0
3	58110119	.	G	C	1096.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1125,78,0
3	58141791	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-1.281;DP=36;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=2.33;ReadPosRankSum=1.647	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,5:36:99:112,0,1203
3	58223543	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	58279672	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	58279771	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	58280061	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
3	58305079	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
3	58305199	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	58306946	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	58307644	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	58307885	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,147
3	58308214	.	G	A	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
3	58308519	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	58308769	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,139
3	58318677	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
3	58409126	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	58413465	.	G	C	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
3	58413662	.	G	A	961.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:990,69,0
3	58416538	.	T	C	1155.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1184,84,0
3	59035425	.	C	A	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
3	62109740	.	T	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
3	62229553	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	62280064	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	64079930	.	C	T	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
3	64079994	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
3	64082964	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
3	64083122	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	64133350	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	65340365	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	65340908	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	65980825	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	66287056	.	G	A	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
3	66419956	.	C	T	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
3	66430348	.	T	A	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
3	66430870	.	G	A	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
3	66433093	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	66433676	.	A	G	843.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:872,63,0
3	66433735	.	G	A	645.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:674,48,0
3	66550756	.	G	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:21:294,21,0
3	66550762	.	G	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:294,21,0
3	66551076	.	G	T	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:503,42,0
3	66665209	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	67424819	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	67425727	.	A	G	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
3	67425811	.	A	C	884.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:913,63,0
3	67425963	.	G	T	383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:412,30,0
3	67425983	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	67426125	.	C	T	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
3	67426281	.	T	C	1174.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1203,84,0
3	67426286	.	A	T	1174.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:84:1203,84,0
3	67426287	.	G	C	1174.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:84:1203,84,0
3	69082708	.	C	G	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
3	69110201	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	69153854	.	G	T	1585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1614,111,0
3	69154343	.	C	G	196.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:225,18,0
3	69220207	.	A	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
3	69220684	.	G	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
3	69230061	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
3	69230801	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	69245454	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	69246152	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	71241895	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	71241903	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	71730001	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	71730980	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	71731077	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	71733420	.	C	T	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
3	71803797	.	C	T	49.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:75,0,1
3	71929636	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	71929645	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	71929650	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	72426074	.	T	A	92.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:7:120,7,0
3	72426577	.	G	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
3	72426901	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
3	72495777	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	73100625	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	73111368	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	73111809	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	73112378	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	73115175	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
3	73115786	.	T	C	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
3	73116716	.	A	T	53.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
3	73433369	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
3	73433494	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
3	73453325	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	73673578	.	G	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
3	73697590	.	G	A	31.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:59,6,0
3	74413676	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	75688391	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	76483888	.	G	C	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:489,36,0
3	76483904	.	C	T	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
3	76483911	.	T	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:18:248,18,0
3	79067965	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
3	81643167	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
3	81698130	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
3	81810725	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
3	87295049	.	T	C	1369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1398,96,0
3	88101530	.	T	C	1066.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1095,75,0
3	88101551	.	G	A	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:846,60,0
3	88101694	.	G	T	662.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:691,48,0
3	88102757	.	G	A	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
3	88102808	.	C	T	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
3	88103602	.	C	A	373.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:402,27,0
3	88103932	.	G	A	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
3	88105264	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	88105818	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	88107850	.	T	G	198.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:227,18,0
3	88151823	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	88188420	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
3	88191144	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	88192423	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	88199179	.	T	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
3	88199298	.	T	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
3	88206392	.	G	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
3	88206531	.	A	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
3	88206966	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:179,0,268
3	89521900	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	93778900	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	93780109	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	93781615	.	G	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:104,0,59
3	93846810	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,77
3	96068344	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	96069500	.	A	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
3	96069826	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	96070078	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	97607290	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:92,0,34
3	97661229	.	G	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:51:51,0,119
3	97669935	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
3	97673268	.	A	C	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:989,72,0
3	98298600	.	C	T	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=20.23;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:271,0,185
3	98299052	.	A	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.929;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:142,0,293
3	98299198	.	C	G	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:202,0,69
3	98299365	.	T	G	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:352,0,205
3	98304403	.	G	A	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.124;DP=20;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:184,0,527
3	98304467	.	T	C	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
3	98516981	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	98518072	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:105,0,223
3	98519481	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-1.164;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:392,0,167
3	98619997	.	G	C	115.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:144,0,24
3	100073665	.	G	C	408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=-1.538;DP=39;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=10.48;ReadPosRankSum=2.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,13:38:99:437,0,994
3	100082857	.	C	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-1.327;DP=18;FS=16.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.327	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:123,0,541
3	100086861	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,120
3	100448183	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	101043906	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
3	101085413	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:151,0,111
3	101280710	.	C	T	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
3	101295824	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
3	101297747	.	C	G	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
3	101298182	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	101308846	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	101311905	.	T	C	416.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=34.73;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:6:444,6,0
3	101312043	.	G	A	550.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.362;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:579,0,682
3	101312147	.	A	G	635.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.632;DP=27;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=23.55;ReadPosRankSum=1.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:664,0,348
3	101385261	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
3	101389864	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	105086085	.	C	T	931.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=0.144;DP=40;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.116	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,27:40:99:960,0,456
3	105258861	.	A	G	1020.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.902;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,27:39:99:1049,0,396
3	105260496	.	G	A	586.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-0.948;DP=42;FS=9.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.974	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,17:42:99:615,0,926
3	105260596	.	T	C	1275.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1304,90,0
3	105270017	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,111
3	105377515	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
3	107526033	.	T	A	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:416,33,0
3	107526863	.	A	T	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:426,30,0
3	107529103	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:153,0,29
3	107765249	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,194
3	107765392	.	G	A	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:268,0,184
3	107771578	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
3	107809798	.	C	T	348.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:377,30,0
3	108260695	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	108265552	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	108268018	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	108268286	.	T	C	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
3	108403086	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
3	108413112	.	T	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	111704406	.	A	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:65,0,34
3	111828423	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
3	111836040	.	C	T	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:125,0,246
3	111836566	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,115
3	111852974	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
3	111853298	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:103,0,65
3	111855651	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	111919002	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
3	111919046	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	111919159	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	111921613	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	112280706	.	C	G	914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:943,66,0
3	112302861	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	112723341	.	G	A	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:141,0,141
3	112727184	.	A	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:304,0,334
3	112990314	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
3	112991959	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:71,0,34
3	112997554	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,104
3	113007603	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	113009188	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	113009189	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	113010303	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
3	113010466	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	113012974	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	113013191	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	113022870	.	T	C	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
3	113099461	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	113325585	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	113372047	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	113372048	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	113373930	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	113679725	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
3	113680090	.	C	T	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
3	113683374	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	118649060	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	118930884	.	G	A	514.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:543,42,0
3	118931389	.	C	T	366.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:395,30,0
3	118931669	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	118945796	.	G	C	642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:671,48,0
3	119150089	.	A	G	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:195,0,134
3	119150836	.	C	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.336;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:170,0,188
3	119151015	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,279
3	119151368	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	119219934	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,80
3	119222456	.	G	C	749.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.898;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,21:36:99:778,0,531
3	119393110	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	119395413	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	119542297	.	A	G	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:305,0,257
3	119544615	.	T	C	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:167,0,314
3	119748691	.	C	A	14.90	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:53,0,22
3	119832621	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	120043836	.	C	T	505.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.787;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=21.99;ReadPosRankSum=-1.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:534,0,323
3	120045068	.	T	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:149,0,29
3	120045282	.	C	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.230;DP=23;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.230	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:148,0,690
3	120045966	.	T	C	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:244,0,468
3	120048603	.	C	T	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:383,0,312
3	120049117	.	T	C	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:172,0,359
3	120049469	.	A	G	306.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=-0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.706	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:335,0,299
3	120067797	.	G	A	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:306,0,124
3	120068022	.	C	G	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.702;DP=18;FS=13.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.983	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:195,0,441
3	120113286	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,228
3	120113403	.	T	G	362.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=-0.462;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,11:23:99:391,0,431
3	120114128	.	A	C	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=1.658;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:207,0,425
3	120114859	.	C	A	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=24.14;ReadPosRankSum=0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:342,0,134
3	120114914	.	G	A	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:134,0,276
3	120114953	.	G	A	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:88:88,0,288
3	120115286	.	T	G	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-1.457;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=20.80;ReadPosRankSum=1.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:465,0,318
3	120169641	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	120320939	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	120360331	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	120362963	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	120371414	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	120389316	.	T	A	553.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.132;DP=32;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:582,0,573
3	120406886	.	G	C	162.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
3	120408170	.	A	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:152,0,139
3	120410020	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	120527541	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	121207613	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,194
3	121208833	.	G	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:178,0,191
3	121209771	.	G	A	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:81,0,25
3	121210572	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	121238749	.	G	A	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
3	121263720	.	C	A	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
3	121350593	.	C	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
3	121350966	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	121353254	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	121382204	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
3	121383297	.	G	A	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=-1.606;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:320,0,505
3	121383464	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	121412892	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=1.439;DP=24;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:274,0,628
3	121414061	.	C	T	499.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.037;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.112	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:528,0,245
3	121414217	.	C	A	469.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.760;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:498,0,293
3	121415720	.	T	C	627.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.961;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:656,0,283
3	121416623	.	G	C	300.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:329,0,285
3	121435621	.	T	C	991.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:69:1020,69,0
3	121435624	.	C	T	991.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:69:1020,69,0
3	121468794	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:106,0,70
3	121468885	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	121468926	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
3	121469225	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
3	121469415	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
3	121469417	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
3	121551289	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,75
3	121551311	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
3	121552036	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:76,0,74
3	121552052	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,74
3	121552066	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:63:80,0,63
3	121552072	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:63:80,0,63
3	121552073	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:63:80,0,63
3	121552759	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	121563355	.	T	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:183,0,243
3	121610395	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	121646641	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:75,0,71
3	121710969	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	121711763	.	G	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:139,0,113
3	121712051	.	A	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,244
3	122056432	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:71,0,36
3	122131777	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
3	122133830	.	T	G	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:262,0,106
3	122134889	.	T	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
3	122144783	.	A	G	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:364,0,423
3	122144952	.	G	T	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-2.150;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=11.49;ReadPosRankSum=2.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:281,0,545
3	122145810	.	T	A	1456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1485,102,0
3	122186188	.	C	T	1122.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1151,81,0
3	122259606	.	T	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:91:91,0,399
3	122274757	.	G	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:158,0,62
3	122278481	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
3	122293773	.	A	T	91.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:119,12,0
3	122437321	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,186
3	122446450	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	122447574	.	A	C	48.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:77,0,21
3	122447596	.	C	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
3	122448914	.	T	C	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:141,0,319
3	122463126	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	122545736	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,229
3	122600098	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	122600983	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	122605544	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	122606755	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	122855767	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	122862860	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:78,0,30
3	122863027	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	122864436	.	G	A	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:617,45,0
3	122868135	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	122880191	.	T	C	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.797;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=16.30;ReadPosRankSum=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:452,0,521
3	122990805	.	G	A	702.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:731,54,0
3	122991021	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	122991038	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	123210978	.	T	C	1168.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1197,93,0
3	123211064	.	G	T	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=1.604;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=23.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:514,0,230
3	123212043	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	123212694	.	A	C	994.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1023,69,0
3	123212933	.	T	C	1043.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1072,75,0
3	123215447	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	123215611	.	T	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	123217249	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	123217342	.	C	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:125,9,0
3	123217352	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	123222368	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	123349430	.	G	C	84.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:113,0,26
3	123349491	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
3	123648288	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:69,0,68
3	124351316	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	124351424	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	124385380	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	124393610	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	124458938	.	T	A	490.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.849;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:519,0,407
3	124462824	.	A	G	576.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.014;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,17:36:99:605,0,719
3	124462959	.	A	G	533.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.332;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:562,0,580
3	124463457	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,194
3	124465815	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
3	124494030	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	124515308	.	A	G	704.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=-1.196;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=22.73;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,19:31:99:733,0,416
3	124515498	.	T	C	747.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.271;DP=40;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,21:40:99:776,0,669
3	124515646	.	A	C	715.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.571;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:744,0,463
3	124789650	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	124837684	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
3	124839470	.	G	A	470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:499,36,0
3	124951821	.	C	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:170,0,345
3	125063307	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	125166035	.	G	C	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.174	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:247,0,305
3	125314016	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
3	125590994	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
3	125725455	.	G	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:155,0,68
3	125786879	.	T	C	688.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:717,51,0
3	126158929	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	126161439	.	A	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	126162151	.	T	C	121.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:150,0,27
3	126164257	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	126164512	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:160,0,31
3	126164782	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	126166911	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	126167565	.	G	C	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
3	126169091	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	126169230	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	126169472	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
3	126170695	.	T	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	126170965	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	126174271	.	G	A	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
3	126175401	.	G	A	118.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:146,12,0
3	126175627	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	126176112	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
3	126176952	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	126178390	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	126179492	.	G	A	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
3	126180047	.	C	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
3	126180088	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	126180121	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	126194076	.	T	C	353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:382,30,0
3	126194357	.	G	C	220.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:23:249,23,0
3	126317149	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	126329910	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	126346584	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	126367640	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	126708453	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,269
3	126723549	.	C	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.447;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:141,0,217
3	126726705	.	A	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=2.017;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.10;ReadPosRankSum=-2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:133,0,137
3	126731248	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	126735453	.	C	T	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:243,0,306
3	126737268	.	C	A	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:250,0,147
3	126742581	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	126753653	.	G	A	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:295,0,204
3	126754644	.	G	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:131,0,731
3	126754653	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:131,0,731
3	126755134	.	C	T	360.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:86:389,0,86
3	126755414	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:194,0,148
3	127292333	.	G	A	1254.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-1.223;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=29.93;ReadPosRankSum=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,33:34:60:1283,60,0
3	127408182	.	C	T	476.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.147;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,14:33:99:505,0,712
3	127408239	.	G	A	716.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.051;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,21:35:99:745,0,515
3	127408909	.	C	T	636.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-2.326;DP=42;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=15.16;ReadPosRankSum=2.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,18:42:99:665,0,929
3	127409116	.	T	G	730.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-1.550;DP=35;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,20:35:99:759,0,538
3	127409941	.	T	C	775.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.199;DP=37;FS=16.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.916;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:804,0,591
3	127410915	.	C	T	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-2.499;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=15.70;ReadPosRankSum=2.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:452,0,498
3	127411436	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
3	127431717	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	127432559	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
3	127432834	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
3	127432887	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	127433097	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	127435787	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	127435806	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	127437252	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	127438528	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	127449355	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	127771159	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	127780082	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	127784262	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
3	127983495	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	127993325	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	127994436	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	128152993	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,160
3	128199380	.	G	A	755.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.381;DP=28;FS=10.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,20:28:99:784,0,257
3	128199662	.	G	A	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:247,0,407
3	128201013	.	A	C	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
3	128204877	.	C	G	532.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.636;DP=29;FS=21.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.373	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:561,0,452
3	128215735	.	G	A	332.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:361,27,0
3	128218280	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
3	128226799	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	128232019	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	128232022	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	128338953	.	T	C	650.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-1.769;DP=38;FS=19.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:679,0,757
3	128339057	.	A	T	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.280;DP=21;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:133,0,298
3	128340110	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	128356852	.	C	T	1054.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.006;DP=67;FS=8.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,29:67:99:1083,0,1461
3	128594919	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:59,0,70
3	128598041	.	T	C	145.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:174,0,27
3	128600585	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
3	128603080	.	T	G	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:80,0,27
3	128614185	.	A	C	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-0.343;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:556,0,684
3	128625318	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	128627933	.	C	T	736.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.950;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.417;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,20:35:99:765,0,535
3	128637025	.	T	C	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
3	128638022	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	128638521	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	128642048	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
3	128806976	.	T	A	359.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:388,30,0
3	128887527	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	128890350	.	G	A	2530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2559,175,0
3	128912338	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	128920418	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
3	128921157	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	128921429	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	129035485	.	A	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
3	129099871	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129150144	.	T	A	11.08	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=2.77;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:49:49,0,78
3	129281980	.	C	T	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
3	129288102	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129324193	.	A	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
3	129367024	.	T	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
3	129368730	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	129368732	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	129546729	.	T	C	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
3	129666418	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	129666636	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	129666776	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
3	129666782	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	129667230	.	T	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	129667848	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	129667868	.	A	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
3	129668516	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	129668784	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	129670351	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	129670518	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129670601	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:129,9,0
3	129670605	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	129671425	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129677301	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	129677480	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	129677522	.	G	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
3	129677673	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	129678664	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	129679010	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
3	129679239	.	G	A	110.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:138,12,0
3	129679574	.	A	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	129679578	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:15:217,15,0
3	129680046	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129681056	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129681992	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	129682043	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	129687847	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129687988	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	129690192	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	129695954	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	129820702	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	129823614	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
3	129826031	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
3	129826100	.	C	T	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
3	129830064	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:103,0,31
3	129830086	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
3	130743652	.	C	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,246
3	130947435	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	131094397	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	131176922	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	131192114	.	T	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
3	131194961	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	131196294	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	131641158	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	131641177	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	131641179	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	132068831	.	C	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:162,0,67
3	132076150	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	132086825	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	132166250	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.615;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:74:74,0,627
3	132218623	.	G	T	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.174;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.232	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:377,0,457
3	132360883	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	132379065	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:138,0,67
3	132385190	.	C	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:62:119,0,62
3	132386151	.	C	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:189,0,66
3	132395811	.	G	T	433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:462,0,247
3	132397859	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	132398094	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
3	132400488	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:142,0,241
3	132401421	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	132401600	.	C	T	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:160,0,67
3	133077217	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
3	133096623	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
3	133098132	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	133110371	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	133292683	.	C	G	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-2.405;DP=29;FS=13.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=11.10;ReadPosRankSum=2.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:350,0,632
3	133306518	.	G	A	470.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.245	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:499,0,456
3	133307491	.	T	C	433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=1.781;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:462,0,706
3	133308725	.	T	C	496.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=-0.329;DP=38;FS=3.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,15:38:99:525,0,866
3	133329943	.	G	A	759.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-1.640;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=20.53;ReadPosRankSum=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:788,0,590
3	133338862	.	A	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
3	133368362	.	T	G	721.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=1.342;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=24.06;ReadPosRankSum=-1.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,20:30:99:750,0,351
3	133524717	.	G	C	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-1.232;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:341,0,392
3	133527169	.	G	T	43.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	133539988	.	C	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=11.38;ReadPosRankSum=2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,237
3	133543984	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	133544990	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:64:123,0,64
3	133544998	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:64:123,0,64
3	133876415	.	A	T	348.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=-2.311;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=15.85;ReadPosRankSum=2.012	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,15:17:26:377,0,26
3	133919909	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,116
3	133920075	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,109
3	133941320	.	C	T	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:303,0,326
3	134075326	.	G	C	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=1.198;DP=22;FS=4.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:232,0,581
3	134075522	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,209
3	134076154	.	G	T	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=10.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:172,0,382
3	134077470	.	C	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.537;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:230,0,316
3	134205227	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	134205231	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	134280395	.	T	A	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
3	134334125	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	135801154	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,72
3	135868204	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
3	135870731	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,308
3	135914476	.	G	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:90:133,0,90
3	135914715	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
3	136055459	.	T	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:97:97,0,196
3	136056861	.	T	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:132,0,327
3	136068136	.	G	A	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:237,0,141
3	136558645	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	136575871	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	137254633	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	137880505	.	C	T	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
3	137880695	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
3	137880743	.	G	A	777.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:806,57,0
3	137881084	.	C	G	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:341,0,175
3	137881265	.	T	A	642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:671,48,0
3	137893744	.	G	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:107,0,71
3	138213709	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
3	138244400	.	C	T	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:231,0,137
3	138255710	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:78,0,65
3	138289221	.	C	T	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:293,0,342
3	138327951	.	T	C	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
3	138329862	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:60:60,0,151
3	138544087	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	139074837	.	T	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:45:149,0,45
3	139075644	.	C	A	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
3	139075938	.	C	T	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=21.22;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:198,0,102
3	139082241	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	139099672	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	139104981	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
3	139108716	.	T	A	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:61:274,0,61
3	139153990	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	139163154	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,111
3	139163540	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
3	139194247	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:79,0,28
3	140167536	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	140178485	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	140281723	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	140290973	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	140689662	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,114
3	140695993	.	T	A	1139.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1168,84,0
3	140696799	.	C	T	1325.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1354,99,0
3	140696929	.	C	T	1124.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1153,81,0
3	140697729	.	C	T	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
3	140697941	.	C	A	938.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:967,66,0
3	140770584	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	140784929	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
3	140866728	.	C	A	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:78,0,27
3	140866848	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,111
3	140866849	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	141114293	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	141124607	.	T	C	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
3	141125705	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	141128804	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	141133450	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	141133960	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	141134577	.	G	C	42.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:71,0,22
3	141140366	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	141148419	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	141169982	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	141170661	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	141171190	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	141327474	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
3	141333835	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	141457998	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	141464146	.	G	A	775.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-1.373;DP=44;FS=11.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,22:44:99:804,0,787
3	141642726	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
3	141643266	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,115
3	141644192	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	141645272	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
3	141663683	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	141663752	.	A	G	116.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:144,12,0
3	141667690	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,134
3	141668922	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,146
3	141668938	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,114
3	141724328	.	T	C	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:255,0,360
3	141877084	.	T	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:198,0,67
3	141877407	.	T	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:76,0,72
3	141879796	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,235
3	141879810	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:116,0,76
3	141880005	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,121
3	141880830	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
3	141882459	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	141882655	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
3	141903595	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
3	141903905	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	142078759	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:78,0,70
3	142123841	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:188,0,186
3	142168331	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:233,0,150
3	142178144	.	C	T	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-1.733;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:294,0,283
3	142188337	.	A	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,143
3	142204728	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	142206070	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	142277575	.	A	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:107,0,72
3	142281612	.	A	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:59:193,0,59
3	142408606	.	G	A	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=1.120;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.72;ReadPosRankSum=-1.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:339,0,216
3	142742285	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
3	142744777	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
3	142745293	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
3	142745582	.	A	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
3	142752293	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	142756120	.	G	A	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.261;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.261	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:244,0,546
3	142776151	.	C	T	719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:748,51,0
3	142777508	.	C	A	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
3	142778666	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
3	143710268	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	145788467	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,224
3	146262344	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=-2.219;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=9.31;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:112,0,196
3	148727133	.	G	A	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=1.155;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:184,0,679
3	148745236	.	A	G	578.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-1.443;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:607,0,574
3	148748380	.	T	C	433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.558;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:462,0,534
3	148749621	.	T	C	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:298,0,366
3	148759325	.	T	C	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=22.08;ReadPosRankSum=-0.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:514,0,295
3	148766666	.	T	C	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:250,0,408
3	148786108	.	C	T	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:907,63,0
3	148872972	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,197
3	148872987	.	G	A	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:146,0,253
3	148890137	.	A	G	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:249,0,266
3	148890181	.	G	A	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:265,0,341
3	148974301	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
3	149014360	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	149017345	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	149037135	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,115
3	149037352	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	149039324	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	149039768	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
3	149041324	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	149042363	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	149045910	.	G	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
3	149046778	.	G	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	149046789	.	T	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	149050834	.	G	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	149055915	.	T	A	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
3	149056373	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	149056812	.	A	G	12.05	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=2.41;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:40:40,0,117
3	149057220	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
3	149057323	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	149058065	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
3	149058404	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	149058681	.	C	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
3	149058731	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	149059013	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
3	149060779	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	149061035	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,108
3	149061260	.	A	C	255.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:284,24,0
3	149061733	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	149062742	.	G	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
3	149064153	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	149066126	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	149066814	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	149066966	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	149068265	.	G	A	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
3	149070226	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	149072308	.	G	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
3	149077899	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	149077948	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	149079274	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	149080743	.	T	C	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
3	149081264	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	149082663	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	149084352	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	149087404	.	T	C	795.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:824,57,0
3	149090762	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	149095470	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:94:94,0,326
3	149100734	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	149101811	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	149105512	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	149105824	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	149105847	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	149114757	.	G	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
3	149235707	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
3	149236187	.	T	A	23.51	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
3	149236710	.	T	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
3	149237131	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
3	149237888	.	C	A	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
3	149530625	.	C	T	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
3	149629777	.	C	G	372.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:401,0,528
3	149685138	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	149686076	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	150128392	.	G	A	116.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:145,0,25
3	150181918	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	150259942	.	T	C	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.260;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:450,0,420
3	150283050	.	C	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,112
3	150283541	.	C	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:51:51,0,156
3	150285520	.	T	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.941;DP=29;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:361,0,747
3	150345664	.	A	G	1138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.691;DP=55;FS=10.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=20.70;ReadPosRankSum=-0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,32:55:99:1167,0,823
3	150346471	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,105
3	150347833	.	G	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:147,0,145
3	150448661	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	152168964	.	A	C	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
3	152170690	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	152181040	.	T	C	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:214,0,181
3	153755820	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	153839866	.	G	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
3	153839959	.	C	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:213,0,257
3	153839960	.	T	C	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:572,39,0
3	153840389	.	T	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,147
3	153973408	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,106
3	153973887	.	T	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
3	153973926	.	T	G	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
3	153990251	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	153991875	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	153992137	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
3	153992586	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	154018887	.	G	C	1267.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1296,90,0
3	154900690	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	155314034	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
3	155481097	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
3	155481609	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	155572129	.	C	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
3	155657576	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
3	155659901	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	155660810	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
3	155660899	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,249
3	155660900	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,249
3	155705801	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:107,0,32
3	155706071	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	155706075	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	156242091	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
3	156248791	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	156258319	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,300
3	156258817	.	T	C	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:293,0,430
3	156259279	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.394;DP=18;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:151,0,788
3	156259288	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:195,0,634
3	156259340	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,328
3	156259341	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:57:57,0,347
3	156259348	.	G	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:147,0,191
3	156259406	.	T	C	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:493,33,0
3	156259407	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:320,0,103
3	156259485	.	G	A	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.358;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:472,0,211
3	156260245	.	G	A	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.324;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=17.92;ReadPosRankSum=-1.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:297,0,255
3	156423811	.	A	G	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
3	156436921	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	156438708	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	156442951	.	C	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
3	156449447	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
3	156481537	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	156527410	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	156868450	.	T	C	374.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:88:403,0,88
3	156870059	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:111,0,73
3	156870816	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,113
3	156872076	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:122,0,28
3	156876574	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:157,0,28
3	156878389	.	C	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
3	156894563	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	156978676	.	G	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
3	156983414	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:111,0,32
3	157081324	.	A	G	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:55:267,0,55
3	158320703	.	C	A	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-2.165;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:294,0,327
3	158362391	.	C	T	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.376	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:202,0,340
3	158362441	.	T	C	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:340,0,217
3	158366900	.	G	A	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.259;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:366,0,547
3	158388780	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:189,0,327
3	158390395	.	A	T	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.076;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:415,0,320
3	158409262	.	C	T	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=1.736;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:286,0,478
3	158409482	.	C	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:183,0,220
3	158409947	.	T	A	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=-1.226;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:209,0,316
3	158410561	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	158411681	.	C	T	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:160,0,66
3	158411704	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:110,0,72
3	158413091	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	158413102	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	158428642	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,266
3	158450178	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:121,0,30
3	160124607	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,120
3	160141588	.	G	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-1.168;DP=42;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,6:42:99:138,0,1422
3	160141665	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	160209026	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	160213286	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
3	160214469	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
3	160217483	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
3	160279597	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	160283126	.	A	C	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-1.376;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=18.05;ReadPosRankSum=1.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:317,0,189
3	160285898	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:149,0,100
3	160657889	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	160657892	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	160787502	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	160789129	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:118,0,66
3	160789925	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	160790177	.	T	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:118,0,68
3	160791797	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
3	160793678	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,148
3	160795541	.	A	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:155,0,73
3	160796354	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,103
3	160802353	.	T	C	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:174,0,357
3	160802418	.	C	T	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:330,0,248
3	160803242	.	C	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-2.224;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=10.55;ReadPosRankSum=2.007	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:197,0,387
3	160823159	.	G	A	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:90,0,32
3	160939141	.	C	T	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.044;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:504,0,198
3	160951230	.	C	G	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.203;DP=41;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,6:41:99:127,0,1394
3	160968872	.	G	C	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=2.136;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=8.31;ReadPosRankSum=-2.282	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,10:35:99:319,0,953
3	160971518	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	160983768	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	161051793	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
3	161062631	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:147,0,71
3	161062724	.	A	G	1140.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1169,81,0
3	161062848	.	G	A	667.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-2.469;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=23.85;ReadPosRankSum=2.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:696,0,365
3	161063069	.	C	T	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.857;DP=41;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=0.51;ReadPosRankSum=-0.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,5:41:49:49,0,1336
3	161063504	.	T	C	1482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1511,105,0
3	161064540	.	A	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,105
3	161067350	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
3	161068014	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	161072054	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
3	161072346	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	161072763	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	161077270	.	G	A	136.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:165,0,21
3	161077630	.	A	G	1301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=-1.233;DP=56;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=23.25;ReadPosRankSum=1.149	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,34:56:99:1330,0,767
3	161089309	.	G	T	586.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,18:35:99:615,0,602
3	161089460	.	G	A	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.298;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:320,0,568
3	161090616	.	C	T	213.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:16:242,0,16
3	169492101	.	C	T	480.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.239;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=21.85;ReadPosRankSum=0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:509,0,276
3	169810055	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	169810060	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	170022495	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,147
3	170077713	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	170078232	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
3	170110529	.	T	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	170113481	.	G	A	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
3	170113601	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	170114078	.	A	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
3	170214021	.	G	T	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
3	170584064	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,200
3	170584074	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,200
3	170825905	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	171338237	.	T	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,154
3	171395468	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	171969077	.	C	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
3	172046861	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,151
3	172115640	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	172115902	.	G	A	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
3	172224075	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,140
3	172349882	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:142,0,108
3	172428508	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	172428782	.	T	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
3	172474087	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	172535116	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	172537668	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	172537850	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	172538350	.	C	T	1192.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1221,90,0
3	172546352	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
3	172546587	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	172546930	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	174578686	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	174814738	.	G	A	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
3	174814920	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
3	174951756	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	175165079	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
3	175345143	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	175473047	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	175521611	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	175523026	.	T	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
3	176739404	.	A	G	442.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=-0.821;DP=26;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:471,0,483
3	176739663	.	A	G	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=9.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:440,0,556
3	176739694	.	T	C	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:342,0,422
3	176745038	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	176878686	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:60,0,77
3	178738432	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
3	178739594	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	178742044	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
3	178742690	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
3	178785549	.	G	A	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
3	178866327	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
3	178916946	.	G	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,174
3	178952507	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	178957783	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	178968634	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	178970010	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	178977074	.	G	A	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:86,0,34
3	178977111	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:114,0,75
3	178978542	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,105
3	179040888	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:66,0,64
3	179051472	.	A	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:175,0,256
3	179054806	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	179090772	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	179091904	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	179091905	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	179092989	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	179096508	.	C	G	1325.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1354,93,0
3	179115229	.	T	C	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:196,0,27
3	179115259	.	C	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,149
3	179115501	.	A	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.072;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:139,0,226
3	179115627	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	179115635	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	179116285	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	179117242	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
3	179137273	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,154
3	179298999	.	C	T	1020.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.097;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.871	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,27:47:99:1049,0,712
3	179502736	.	T	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:111,0,71
3	179504309	.	C	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:189,0,68
3	179505864	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
3	180673936	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	180685993	.	G	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.459;DP=32;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,6:32:99:158,0,1018
3	180686365	.	T	A	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
3	180698128	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	180702240	.	C	T	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-2.363;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=17.30;ReadPosRankSum=2.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:305,0,286
3	182511351	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:111,0,99
3	182633469	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,116
3	182659953	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
3	182681740	.	C	T	728.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:757,54,0
3	182743969	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	182744005	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	182745131	.	A	G	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:78,0,26
3	182749041	.	T	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
3	182751130	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	182755209	.	T	G	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.238;DP=20;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=23.94;ReadPosRankSum=-0.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:507,0,240
3	182790249	.	G	A	632.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-0.204;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:661,0,283
3	183098347	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	183165599	.	G	A	264.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:293,24,0
3	183173177	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:143,0,236
3	183173326	.	G	C	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
3	183173644	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:155,0,31
3	183388870	.	G	A	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:89:89,0,352
3	183400219	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-2.017;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,144
3	183432983	.	C	T	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:83:420,0,83
3	183476685	.	G	A	385.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:414,30,0
3	183521133	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	183524349	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	183524379	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	183525519	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	183528442	.	C	T	464.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:7:492,0,7
3	183533964	.	T	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:422,33,0
3	183534170	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	183534487	.	G	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:36:540,36,0
3	183534494	.	G	T	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:36:540,36,0
3	183534538	.	T	C	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
3	183534913	.	A	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
3	183534976	.	G	A	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
3	183535094	.	C	T	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
3	183537759	.	A	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
3	183540387	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	183540485	.	T	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	183543291	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	183544102	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	183548217	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	183555999	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	183558402	.	C	G	716.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-1.247;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,20:42:99:745,0,846
3	183560195	.	A	G	582.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:611,0,270
3	183637845	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,162
3	183638506	.	C	T	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-2.154;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:349,0,340
3	183656380	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
3	183659677	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	183660585	.	G	A	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.380;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:161,0,524
3	183663506	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	183685534	.	A	G	428.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:457,0,680
3	183696402	.	A	G	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:284,0,262
3	183700928	.	A	G	355.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.049	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:384,0,265
3	183701147	.	G	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:140,0,308
3	183702275	.	A	G	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.349;DP=26;FS=9.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:395,0,565
3	183704068	.	G	A	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:285,0,525
3	183717885	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	183861064	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,151
3	183861243	.	A	G	533.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.054;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:562,0,691
3	183861750	.	A	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,233
3	183889207	.	C	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.455;DP=23;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.385	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:186,0,641
3	183889337	.	A	T	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.353;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:311,0,302
3	183892720	.	C	T	607.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=1.137;DP=43;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,19:43:99:636,0,866
3	183897168	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,78
3	183900338	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,79
3	183900680	.	G	C	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,224
3	183900729	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,178
3	183900836	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,183
3	183900969	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,120
3	183904868	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:50:100,0,50
3	183905103	.	G	C	52.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:81,0,23
3	183907879	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:44:73,0,44
3	183908002	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
3	183912225	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	183915168	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	183975365	.	C	T	1270.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1299,93,0
3	184026703	.	C	T	940.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.057;DP=45;FS=16.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,26:45:99:969,0,700
3	184037533	.	A	G	2120.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2149,157,0
3	184039666	.	A	G	758.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=2.000;DP=61;FS=11.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,24:61:99:787,0,1386
3	184063382	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:114,0,70
3	184063791	.	A	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:233,0,64
3	184065064	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	184081371	.	G	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
3	184082931	.	T	C	2151.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2180,151,0
3	184084846	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	184085058	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	184289152	.	A	G	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.495;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:393,0,134
3	184428903	.	T	G	668.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.487;DP=30;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:697,0,398
3	184429414	.	C	A	543.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.184;DP=28;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:572,0,410
3	184429718	.	A	G	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:567,0,600
3	184529990	.	C	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,309
3	184542344	.	C	G	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=13.60;ReadPosRankSum=1.288	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:273,0,372
3	184550501	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.931;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,314
3	184573555	.	C	T	338.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:367,0,328
3	184633247	.	A	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:162,0,304
3	184647413	.	T	C	634.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:663,45,0
3	184650653	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	184700426	.	C	T	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:239,0,421
3	184766301	.	T	C	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:339,0,207
3	184769911	.	C	T	562.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:591,42,0
3	184769941	.	T	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
3	184770380	.	C	T	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
3	184797711	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	184931618	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	184931623	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	184931624	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	185224119	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	185224948	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
3	185226396	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,110
3	185226492	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:73:73,0,230
3	185229464	.	T	C	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:196,0,62
3	185634594	.	T	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:81:81,0,311
3	185645209	.	G	C	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:221,0,187
3	185646406	.	A	T	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
3	185651469	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
3	185651553	.	T	C	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
3	185652184	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	185652510	.	G	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
3	185652947	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
3	185655454	.	A	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
3	185701182	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	185701202	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	185826740	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	186261018	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	186264215	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
3	186264292	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,113
3	186285074	.	C	T	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:82:167,0,82
3	186288565	.	A	G	779.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:808,57,0
3	186296304	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:76,0,64
3	186298644	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
3	186301703	.	A	G	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.205;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:495,0,479
3	186501854	.	C	T	73.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:101,9,0
3	186503435	.	G	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:185,0,107
3	186508528	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
3	186648411	.	C	T	45.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:74,0,22
3	186726277	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	186758930	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	186793729	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:145,0,201
3	186795216	.	A	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:177,0,293
3	186796130	.	G	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,155
3	187129948	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	187141209	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	187141211	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	187141213	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	187447032	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
3	187454731	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	187460099	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
3	188327461	.	C	T	257.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:23:286,23,0
3	188590446	.	A	G	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
3	188594213	.	G	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
3	188595672	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	188597556	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	188599369	.	G	A	371.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:400,27,0
3	188600154	.	A	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
3	188600755	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:75,0,35
3	188602844	.	G	A	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
3	188602952	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	188604445	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	188605426	.	A	G	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
3	188606740	.	G	A	46.37	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:84,9,0
3	189612336	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:64,0,33
3	190024057	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	190024103	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
3	190024188	.	G	A	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
3	191047242	.	C	T	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:88:88,0,169
3	191075902	.	C	T	434.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.923;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:463,0,465
3	191088204	.	A	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,148
3	191089680	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:159,0,72
3	191091119	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,177
3	191091320	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.47;ReadPosRankSum=-1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,155
3	191091344	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=18.09;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:191,0,148
3	191091359	.	G	A	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:63:228,0,63
3	191091942	.	C	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,108
3	191092256	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,281
3	191093053	.	T	C	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.518;DP=27;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:395,0,618
3	191093175	.	T	A	422.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.400;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:451,0,399
3	191093310	.	A	G	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.162;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.077;QD=17.94;ReadPosRankSum=-1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:405,0,376
3	191093919	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
3	191096051	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	191096603	.	C	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,106
3	191096616	.	T	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:43:78,0,43
3	191096734	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=9;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:87:150,0,87
3	191096765	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,208
3	191097415	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,153
3	191097538	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	191097966	.	T	C	461.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-2.013;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:490,0,256
3	191099510	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	191100561	.	C	A	501.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=-1.018;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:530,0,572
3	191110320	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,260
3	191110544	.	T	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,189
3	191111160	.	A	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:52:242,0,52
3	191112052	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	191112742	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	191113239	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	191114590	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	191115082	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	191861521	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	192232771	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	193153562	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	193209178	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
3	193334991	.	G	A	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=-0.773;DP=32;FS=15.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:552,0,596
3	193374964	.	T	C	447.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.992;DP=34;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.957	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,13:34:99:476,0,792
3	193386462	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	193412672	.	A	G	355.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.755;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:384,0,300
3	193412949	.	T	C	930.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:959,66,0
3	193413502	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:115,0,96
3	193413732	.	A	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.880;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:161,0,533
3	193414733	.	A	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:53:53,0,354
3	193414780	.	T	C	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:239,0,418
3	193548465	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	193854459	.	G	T	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.345;DP=42;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.459	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,11:42:99:351,0,1183
3	193854961	.	T	C	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:92:193,0,92
3	194124421	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,110
3	194124624	.	C	T	517.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.485;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.261	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:546,0,230
3	194125524	.	C	T	415.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.334;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:444,0,516
3	194127049	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
3	194140923	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	194207366	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:36:435,36,0
3	194207375	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:92:92,0,118
3	194217544	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	194218009	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	194219039	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	194219141	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
3	194222009	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	194310359	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
3	194310731	.	C	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,117
3	194337901	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	194342714	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	194353875	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
3	194360927	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
3	194361556	.	T	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:106,0,74
3	194361676	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:190,0,139
3	194361768	.	C	T	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:375,0,280
3	194361863	.	C	T	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
3	194362157	.	G	T	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:246,0,459
3	194362542	.	T	A	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=-1.273;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:267,0,450
3	194362620	.	T	G	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:347,0,252
3	194362721	.	G	A	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.513;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:247,0,349
3	194369885	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
3	194370994	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
3	194371437	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	194371496	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
3	194372719	.	G	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
3	194373832	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
3	194373833	.	G	A	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
3	194407020	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	194408704	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
3	194789163	.	T	C	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:250,0,263
3	194789191	.	G	A	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.945;DP=15;FS=13.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:214,0,333
3	194789663	.	T	C	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.978;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=21.94;ReadPosRankSum=-1.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:489,0,284
3	194790434	.	C	G	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=2.359;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:164,0,228
3	194899288	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
3	194900432	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	194996737	.	A	G	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
3	194999609	.	G	T	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
3	194999996	.	T	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
3	195004904	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195005422	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195269901	.	G	C	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.41;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:370,0,126
3	195270078	.	C	G	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:502,39,0
3	195342064	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	195342169	.	C	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
3	195343058	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
3	195343775	.	T	C	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
3	195344244	.	G	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
3	195347059	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	195348528	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:81,0,78
3	195348535	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:81,0,78
3	195354823	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195355301	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195364093	.	G	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
3	195366715	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:70,0,34
3	195374224	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195374234	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195404649	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
3	195408523	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
3	195410751	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
3	195412920	.	C	T	38.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:67,0,27
3	195413518	.	G	A	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
3	195413642	.	C	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,214
3	195414194	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
3	195414495	.	C	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:50:50,0,288
3	195414506	.	C	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:158,0,133
3	195414557	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:187,0,64
3	195414902	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,112
3	195415938	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	195416501	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
3	195417593	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:72,0,34
3	195418852	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195419469	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195420919	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	195420940	.	G	A	134.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:5:162,5,0
3	195421142	.	T	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:149,0,109
3	195421162	.	A	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:210,15,0
3	195421170	.	C	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:110,0,71
3	195421392	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
3	195423249	.	C	G	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:160,0,31
3	195424279	.	G	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:77:105,0,77
3	195424367	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	195424611	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
3	195424780	.	C	G	207.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:19:236,0,19
3	195424916	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:114,0,75
3	195425034	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:64,0,37
3	195425171	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,78
3	195425545	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
3	195425645	.	T	G	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=31.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:123,0,26
3	195425653	.	C	A	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:26:123,0,26
3	195425678	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
3	195425706	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	195425765	.	G	C	88.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:117,0,20
3	195431255	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
3	195431702	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
3	195432276	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
3	195434886	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	195435053	.	G	A	132.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.59;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:5:160,5,0
3	195435434	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
3	195435735	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,120
3	195436910	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:78,0,64
3	195436937	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	195437073	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
3	195437159	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
3	195437275	.	G	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
3	195438081	.	G	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,323
3	195438084	.	A	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,306
3	195438443	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
3	195438480	.	A	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
3	195438842	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
3	195438931	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	195438994	.	G	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
3	195439080	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195439119	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
3	195439624	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195440203	.	C	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,222
3	195441436	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
3	195441437	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
3	195441470	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:120,0,69
3	195441510	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:71,0,35
3	195441729	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	195441751	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
3	195441828	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	195441966	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,109
3	195442040	.	G	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,279
3	195442048	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,264
3	195442073	.	C	T	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
3	195442140	.	A	T	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
3	195442180	.	G	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:145,0,107
3	195442229	.	G	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:164,0,31
3	195442394	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
3	195442787	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195442891	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	195443667	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
3	195443910	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,160
3	195444260	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	195444469	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195444714	.	A	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
3	195444753	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195444819	.	T	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
3	195444884	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
3	195445171	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195447224	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:76,0,66
3	195448858	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
3	195448892	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	195449689	.	A	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
3	195450037	.	G	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:267,18,0
3	195450043	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
3	195453064	.	T	G	252.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:281,21,0
3	195453330	.	G	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:53:53,0,403
3	195458723	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:35:39,0,35
3	195459621	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
3	195459700	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	195466486	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195590875	.	A	G	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:351,0,278
3	195591723	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
3	195594589	.	C	T	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:206,0,187
3	195606770	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:117,0,76
3	195629084	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
3	195631462	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
3	195633548	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
3	195633617	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
3	195677762	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:74,0,69
3	195678501	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
3	195687379	.	C	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:73,0,72
3	195687806	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	195689069	.	T	C	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
3	195689376	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
3	195689994	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195690001	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	195697478	.	C	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:143,0,148
3	195698026	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
3	195701331	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.212;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:70:70,0,658
3	195708256	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	195710995	.	G	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:137,0,226
3	195776590	.	G	A	1040.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=-0.385;DP=56;FS=5.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,28:56:99:1069,0,1035
3	195776976	.	T	C	679.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-2.067;DP=44;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,19:43:99:708,0,913
3	195790022	.	A	T	59.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:87,9,0
3	195790737	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
3	195790811	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
3	195793395	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	195798258	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
3	195800811	.	C	T	775.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.914;DP=56;FS=15.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,22:56:99:804,0,1305
3	195800911	.	C	A	585.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.583;DP=55;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,18:55:99:614,0,1407
3	195869856	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,104
3	195871183	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,147
3	195961685	.	A	G	982.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1011,69,0
3	195962244	.	G	T	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-2.261;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=23.57;ReadPosRankSum=2.261	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:429,0,209
3	195964298	.	A	G	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:565,42,0
3	195964672	.	G	A	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-1.710;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:213,0,897
3	195964673	.	A	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-1.535;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:213,0,897
3	195964687	.	C	T	592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:43:621,43,0
3	195965115	.	A	T	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
3	195965318	.	G	A	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.799;ClippingRankSum=-2.355;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:251,0,540
3	195965509	.	T	C	516.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=23.49;ReadPosRankSum=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:545,0,258
3	195974936	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	196075368	.	G	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,111
3	196076503	.	T	C	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:174,0,110
3	196076739	.	A	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:182,0,68
3	196078149	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,111
3	196078427	.	C	T	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
3	196078746	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,174
3	196087107	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	196195998	.	G	A	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:180,0,222
3	196196046	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,156
3	196197804	.	T	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
3	196198533	.	T	C	433.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:462,33,0
3	196199204	.	G	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:181,0,252
3	196280669	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,236
3	196281208	.	T	C	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:223,0,183
3	196294104	.	C	G	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
3	196295163	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
3	196312124	.	G	A	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:138,0,405
3	196314752	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
3	196435534	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
3	196439895	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	196458538	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	196461169	.	A	G	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:348,27,0
3	196461402	.	A	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
3	196461474	.	A	C	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
3	196466874	.	G	T	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:534,39,0
3	196556809	.	T	C	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:215,0,339
3	196556843	.	G	A	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.769;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,11:23:99:405,0,441
3	196639257	.	A	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:70,0,35
3	196641105	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	196645320	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
3	196662322	.	G	A	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
3	196662696	.	T	G	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=1.415;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:453,0,439
3	196663321	.	G	T	765.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.577;DP=27;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=28.36;ReadPosRankSum=1.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,20:27:99:794,0,213
3	196665124	.	T	C	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:159,0,68
3	196665296	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
3	196670092	.	C	A	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=1.339;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.987	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:247,0,1113
3	196689725	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	196729081	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:65,0,64
3	196769982	.	C	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:190,0,67
3	196771245	.	G	A	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:360,0,581
3	196806800	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	197024800	.	C	T	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
3	197232615	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
3	197233885	.	A	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
3	197234673	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
3	197234978	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
3	197235328	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
3	197236843	.	C	G	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-2.843;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=16.06;ReadPosRankSum=2.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:221,0,167
3	197237358	.	G	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,111
3	197238324	.	A	G	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:124,0,177
3	197241877	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,69
3	197242787	.	G	A	18.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:47:47,0,118
3	197246689	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:120,0,74
3	197246898	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,143
3	197248703	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,233
3	197252834	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,153
3	197260879	.	G	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
3	197261859	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
3	197264037	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:77,0,73
3	197264146	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
3	197264343	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,197
3	197265334	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,110
3	197267848	.	C	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
3	197269124	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,128
3	197269139	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,186
3	197269980	.	A	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
3	197310179	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
3	197312954	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	197313875	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
3	197315538	.	A	G	80.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
3	197317198	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
3	197327252	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
3	197339583	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,74
3	197339633	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
3	197341209	.	G	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:181,0,302
3	197357659	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
3	197367015	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,77
3	197368193	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:81,0,32
3	197478558	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
3	197482568	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
3	197495334	.	G	A	1079.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1108,78,0
3	197509098	.	A	G	1401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1430,99,0
3	197566254	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:117,0,161
3	197597044	.	C	T	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:253,0,219
3	197611048	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:145,0,216
3	197612220	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:123,0,68
3	197640324	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
3	197686513	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,106
3	197770049	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:77,0,73
4	53428	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	53498	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	54638	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	57088	.	T	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
4	57538	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	60303	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
4	60335	.	A	T	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
4	60400	.	G	A	250.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:279,0,22
4	60623	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
4	61232	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
4	61742	.	A	G	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
4	62745	.	G	A	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
4	62851	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
4	63024	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
4	63079	.	A	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
4	63081	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
4	63203	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	64378	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
4	64447	.	A	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
4	64956	.	G	A	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
4	65077	.	A	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
4	65239	.	G	A	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
4	65542	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	66350	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
4	66559	.	C	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
4	66656	.	T	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
4	66700	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	67028	.	C	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
4	67077	.	T	C	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:523,39,0
4	67801	.	C	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
4	67857	.	C	A	785.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:814,57,0
4	68527	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	68572	.	T	C	650.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:679,48,0
4	68603	.	T	G	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:708,48,0
4	87277	.	G	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
4	91969	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	127933	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:71,0,66
4	210398	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
4	331658	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
4	331666	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
4	331675	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:72:81,0,72
4	367199	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,223
4	367201	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,223
4	367206	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,223
4	367927	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
4	370946	.	G	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
4	371573	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	372198	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:71,0,31
4	372231	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	412329	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:64,0,29
4	419955	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
4	436296	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:189,0,208
4	668009	.	G	A	1115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.307;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,30:50:99:1144,0,736
4	725166	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	726322	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
4	746438	.	G	T	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
4	760888	.	C	T	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:289,0,246
4	762963	.	A	G	333.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=33.30;ReadPosRankSum=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:12:361,0,12
4	763407	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
4	770065	.	G	T	155.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:184,15,0
4	771471	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,117
4	773003	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,584
4	773004	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,584
4	773092	.	G	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:194,0,65
4	773297	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,109
4	778000	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
4	779899	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:75,0,29
4	780286	.	C	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:197,0,145
4	780883	.	A	C	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:212,0,323
4	782254	.	C	T	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:221,0,180
4	784833	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,120
4	843695	.	A	G	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.651;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:310,0,567
4	849494	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	849871	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	858941	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.619;DP=21;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:156,0,612
4	860192	.	A	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.652;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=16.53;ReadPosRankSum=-1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:177,0,117
4	860923	.	G	A	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.249;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:331,0,435
4	878048	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	887868	.	A	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,75
4	888499	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	888717	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
4	888937	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	891098	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:78,0,65
4	891150	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:58:58,0,116
4	951947	.	T	C	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:272,0,142
4	953698	.	A	C	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:221,0,185
4	953974	.	T	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
4	954247	.	G	T	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:246,0,245
4	954275	.	T	C	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=10.06;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:159,0,293
4	954277	.	T	C	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
4	954311	.	C	T	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:148,0,224
4	956047	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
4	959491	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	960081	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
4	961397	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-2.017;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,135
4	967191	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,103
4	974323	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
4	978388	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	979179	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
4	980464	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,118
4	980932	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:57:73,0,57
4	982347	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	982852	.	G	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:97:97,0,148
4	983060	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
4	983809	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
4	987276	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	987343	.	G	T	156.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:185,15,0
4	987704	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
4	988506	.	T	C	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
4	989163	.	T	C	76.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:105,0,27
4	989548	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:144,0,68
4	989699	.	T	C	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:243,0,60
4	989713	.	T	C	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.08	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,6:6:60:243,0,60
4	992763	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	994692	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
4	1003788	.	G	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,149
4	1018705	.	C	A	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-1.309;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:183,0,259
4	1019312	.	G	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-0.453;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:162,0,399
4	1019672	.	T	C	459.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:488,0,830
4	1019697	.	C	G	459.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:488,0,830
4	1147333	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	1151348	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	1161177	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:156,0,29
4	1161298	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
4	1161729	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	1164277	.	C	G	199.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:20:228,20,0
4	1165130	.	G	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
4	1165741	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	1167387	.	A	G	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
4	1169813	.	G	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
4	1171077	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
4	1171112	.	A	G	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
4	1185802	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	1188049	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
4	1193832	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	1196580	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
4	1205667	.	A	C	523.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.004;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=20.95;ReadPosRankSum=1.552	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:34:552,34,0
4	1210641	.	G	A	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:78,0,24
4	1213463	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	1217906	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
4	1218329	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
4	1225723	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	1225795	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	1227951	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	1228797	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:112,0,71
4	1235643	.	A	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
4	1236083	.	C	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:137,0,146
4	1236182	.	A	G	89.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:116,2,0
4	1236312	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=17.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:98:179,0,98
4	1236502	.	C	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:175,0,176
4	1236562	.	C	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:170,0,347
4	1237014	.	T	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:135,0,175
4	1237052	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
4	1237077	.	T	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,105
4	1238246	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:101,0,133
4	1238363	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
4	1238836	.	G	C	254.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.87;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,7:8:14:283,14,0
4	1238859	.	G	A	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:202,0,322
4	1239370	.	C	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:140,0,69
4	1240091	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
4	1240299	.	T	G	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:93:93,0,352
4	1240450	.	G	A	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
4	1240911	.	G	A	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
4	1240962	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:144,0,115
4	1241472	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:108,0,28
4	1241562	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:61,0,56
4	1243573	.	T	C	58.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:86,9,0
4	1243617	.	T	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
4	1244037	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,194
4	1244218	.	G	A	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:232,0,100
4	1244267	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:68:274,0,68
4	1244416	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
4	1244879	.	A	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:137,0,267
4	1245990	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:120,0,31
4	1248357	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	1254930	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	1319899	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
4	1324993	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	1330759	.	T	C	1478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1507,105,0
4	1330983	.	A	C	129.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:158,0,27
4	1331030	.	A	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:61,0,59
4	1333137	.	G	A	417.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-1.278;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:446,0,484
4	1343405	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
4	1349029	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,200
4	1363602	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	1366463	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	1369885	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,115
4	1374695	.	C	A	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
4	1377615	.	A	G	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
4	1380033	.	A	G	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
4	1381798	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
4	1385448	.	A	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
4	1386459	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	1386570	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:105,0,72
4	1386652	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
4	1387780	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	1388115	.	C	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
4	1388583	.	A	G	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
4	1694809	.	T	C	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.775;DP=29;FS=6.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:435,0,1271
4	1694816	.	A	G	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-0.666;DP=28;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:529,0,1057
4	1701317	.	G	A	540.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-2.437;DP=37;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,16:37:99:569,0,807
4	1718883	.	A	T	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=1.445;DP=19;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:269,0,409
4	1719572	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
4	1719620	.	T	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,238
4	1719633	.	A	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,289
4	1720312	.	G	T	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-1.473;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.36;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:418,0,160
4	1720757	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	1720794	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
4	1720824	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
4	1722959	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	1723265	.	A	G	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:394,27,0
4	1723279	.	T	C	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
4	1730215	.	C	G	476.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.312;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.062	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:505,0,606
4	1730254	.	A	G	667.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.624;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=19.64;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:696,0,530
4	1730299	.	A	G	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=-0.586;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,13:30:99:410,0,612
4	1731126	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:152,0,70
4	1731150	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
4	1731345	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:118,0,31
4	1737502	.	C	T	534.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.153;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:563,0,518
4	1737585	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	1739816	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:113,0,73
4	1739976	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	1741325	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,159
4	1742400	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	1742779	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	1742963	.	C	T	74.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:103,0,26
4	1743343	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	1745770	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	1746229	.	G	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:34:39,0,34
4	1746844	.	A	T	156.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:185,18,0
4	1803704	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:181,0,255
4	1805296	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	1809787	.	C	T	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
4	1815884	.	A	G	509.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:538,39,0
4	1815990	.	G	A	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
4	1818594	.	C	T	1187.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1216,84,0
4	1824364	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	1952301	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	1954945	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	1985587	.	G	A	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=1.724;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.192	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:350,0,533
4	2044128	.	C	T	377.73	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:53:793,53,0
4	2068337	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	2069310	.	G	A	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
4	2275835	.	G	A	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:77,0,24
4	2366262	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	2470956	.	G	A	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=1.960;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:210,0,432
4	2492191	.	T	C	417.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.487;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:446,0,612
4	2516903	.	C	T	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=1.356;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:196,0,381
4	2652492	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
4	2743999	.	A	G	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:566,42,0
4	2744087	.	G	A	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:434,0,202
4	2747475	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	2749069	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	2749075	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:130,9,0
4	2822467	.	G	T	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
4	2826400	.	T	C	922.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:951,66,0
4	2831383	.	T	G	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:586,42,0
4	2836195	.	C	A	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-2.454;DP=17;FS=20.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=17.34;ReadPosRankSum=2.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:323,0,287
4	2836628	.	C	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.779;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:213,0,218
4	2837763	.	G	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,183
4	2839438	.	G	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:68,0,66
4	2839659	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	2841240	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,104
4	2841388	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	2841434	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
4	2841553	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
4	2906285	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:67,0,35
4	2906527	.	C	T	779.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.046;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.138	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:808,0,597
4	2906707	.	G	T	595.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-1.197;DP=39;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.986;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,18:39:99:624,0,752
4	2906957	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,164
4	2909194	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
4	2912140	.	G	T	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:76,0,24
4	2916762	.	C	G	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.517;DP=37;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.983	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,15:35:99:556,0,768
4	2928125	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	2936680	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:142,0,144
4	2937485	.	T	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:95:143,0,95
4	2939018	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,77
4	2940164	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,182
4	2940265	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,333
4	2940358	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,358
4	2940365	.	T	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,620
4	2940371	.	T	C	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:96:313,0,96
4	2940397	.	T	C	410.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.453;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:439,0,176
4	2940430	.	T	C	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=-0.670;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:65:65,0,731
4	2940462	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.174;DP=19;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:71:71,0,637
4	2942539	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,310
4	2942541	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,310
4	2942685	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
4	2951804	.	A	G	652.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=1.164;DP=30;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=21.76;ReadPosRankSum=-1.334	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:681,0,427
4	2967262	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:66,0,56
4	3104390	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	3162056	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:179,0,332
4	3210589	.	C	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,345
4	3213832	.	G	A	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:178,0,108
4	3215835	.	T	C	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:172,0,262
4	3219613	.	A	C	580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:609,45,0
4	3227419	.	A	G	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:346,0,235
4	3234980	.	G	A	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:351,0,298
4	3242100	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
4	3242148	.	C	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:277,0,105
4	3243218	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,112
4	3243939	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,80
4	3318413	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,158
4	3319271	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,114
4	3369099	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	3417845	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,110
4	3430862	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	3433782	.	T	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,181
4	3447156	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	3473450	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	3475252	.	T	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
4	3480136	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
4	3485412	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
4	3495283	.	C	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
4	3495446	.	C	T	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:48:48,0,182
4	3495477	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
4	3495493	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,153
4	3496150	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,119
4	3496205	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	3512690	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	3513125	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	3514086	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	3514229	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:35:77,0,35
4	3514237	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.38	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:35:77,0,35
4	3514695	.	A	G	613.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-1.095;DP=32;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:642,0,536
4	3519434	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	3519537	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	3519881	.	C	T	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.639;DP=28;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.344	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,9:28:99:300,0,733
4	3765225	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	3767996	.	A	C	92.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:120,12,0
4	3770069	.	G	C	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:220,0,234
4	3943928	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	3944989	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,151
4	4237600	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:267,0,130
4	4245591	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	4249483	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	4249484	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	4249620	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	4249855	.	G	A	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:260,0,173
4	4249909	.	C	T	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:522,39,0
4	4276132	.	T	C	860.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:889,63,0
4	4291825	.	C	T	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=34.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:66:200,0,66
4	4291832	.	A	T	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:66:200,0,66
4	4304337	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	4304522	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	4322624	.	C	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
4	5301955	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	5301959	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	5743509	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
4	5743512	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
4	5749904	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,77
4	5749961	.	G	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,147
4	5812778	.	G	A	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:201,0,28
4	5813695	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:58:181,0,58
4	5813982	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:114,0,75
4	5815032	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	5815477	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:105,0,59
4	5819967	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
4	5828242	.	T	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:135,0,28
4	5828510	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,145
4	5829257	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,109
4	5829346	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,112
4	5830414	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	6293696	.	C	G	291.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:320,24,0
4	6293967	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	6294630	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
4	6294655	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	6294759	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	6295064	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	6295087	.	T	A	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
4	6295217	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
4	6295322	.	C	G	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
4	6295583	.	C	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
4	6296343	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	6302519	.	G	A	849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:878,63,0
4	6302707	.	C	T	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
4	6303022	.	C	T	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
4	6303354	.	G	A	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
4	6303955	.	G	A	701.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:730,54,0
4	6304087	.	A	G	735.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:764,54,0
4	6304242	.	T	C	709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:738,51,0
4	6304286	.	C	T	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
4	6304344	.	G	A	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
4	6304799	.	G	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
4	6304878	.	C	T	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
4	6323454	.	A	C	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.733;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.311	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:283,0,373
4	6323465	.	C	T	599.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:628,45,0
4	6323741	.	A	G	746.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:775,57,0
4	6323818	.	T	C	860.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:889,63,0
4	6324246	.	A	G	1032.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1061,75,0
4	6324647	.	G	A	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
4	6324785	.	T	C	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
4	6324803	.	T	C	700.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:729,51,0
4	6325018	.	A	T	1303.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1332,96,0
4	6325086	.	G	A	1649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1678,117,0
4	6333126	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:15:214,15,0
4	6333130	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:214,15,0
4	6333583	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	6334447	.	G	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	6334499	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	6380595	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:76,0,74
4	6381323	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	6594947	.	A	C	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.768;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=26.70;ReadPosRankSum=1.344	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:402,0,120
4	6600012	.	A	G	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,420
4	6606864	.	A	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:96:96,0,336
4	6610889	.	G	A	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:300,0,216
4	6619165	.	A	G	513.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:542,39,0
4	6619204	.	G	A	336.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:365,27,0
4	6620602	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	6620710	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
4	6620991	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
4	6621188	.	G	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
4	6621928	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	6622171	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	6622647	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	6623032	.	G	T	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
4	6623332	.	G	A	603.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:632,45,0
4	6644273	.	C	G	2647.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2676,187,0
4	6644391	.	G	A	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
4	6661252	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	6672607	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
4	6675519	.	A	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
4	6675780	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	6698667	.	T	C	1409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1438,99,0
4	6698706	.	A	C	1194.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1223,84,0
4	6709812	.	C	A	1230.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1259,87,0
4	6710263	.	C	G	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
4	6710555	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	6710561	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	6710702	.	A	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
4	6710735	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	6710739	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	6883514	.	A	G	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
4	6884329	.	T	C	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
4	6925237	.	C	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:158,0,69
4	6988165	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	7050610	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	7051632	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	7051661	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
4	7057037	.	C	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
4	7058137	.	G	A	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
4	7058473	.	T	C	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
4	7060959	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	7061219	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
4	7584328	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
4	7762356	.	G	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:185,0,65
4	7762570	.	G	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:35:153,0,35
4	7763047	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:118,0,72
4	7763161	.	T	C	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:238,0,110
4	7763304	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:185,0,216
4	7763405	.	T	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:132,0,142
4	7763584	.	A	G	294.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:323,0,18
4	7763605	.	T	C	251.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
4	7763761	.	A	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:142,0,151
4	7764516	.	C	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:69:153,0,69
4	7764821	.	C	T	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
4	7770723	.	G	T	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:90:90,0,265
4	7774565	.	T	G	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:206,0,182
4	7780582	.	C	T	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.312;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=23.91;ReadPosRankSum=-1.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:339,0,135
4	7802292	.	G	A	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=20.73;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:277,0,133
4	7845067	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,116
4	7857230	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,145
4	7968319	.	A	C	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=33.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:67:164,0,67
4	7968322	.	A	G	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:67:164,0,67
4	8031471	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	8221141	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
4	8228731	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
4	8229326	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	8229774	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
4	8242466	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:69,0,33
4	8364059	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
4	8364361	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	8366235	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
4	8366840	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
4	8388506	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	8389386	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:159,0,29
4	8394094	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:158,0,66
4	8453746	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,231
4	8454639	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	8491885	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	8498456	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	8869257	.	A	G	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
4	8869587	.	T	C	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
4	8873450	.	C	G	117.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:145,12,0
4	8873470	.	A	C	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
4	9047074	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	9052622	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	9153037	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
4	10072969	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	10090661	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	10094671	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	10098192	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	10118377	.	C	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-2.279;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=15.69;ReadPosRankSum=2.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:342,0,346
4	10443425	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,116
4	10446385	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	10447155	.	A	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:120,0,76
4	10447168	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
4	12642088	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,190
4	12642091	.	A	G	1102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:87:1131,87,0
4	12642145	.	T	C	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
4	13377045	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	13379171	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	13570943	.	T	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:155,0,64
4	13571901	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	15608551	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
4	15611017	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	15640168	.	C	T	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=1.484;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:336,0,450
4	15673395	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	15690233	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
4	15964501	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	16163265	.	C	G	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:237,0,109
4	16163694	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
4	16164489	.	G	A	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:273,0,140
4	17487713	.	A	T	53.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	17488064	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:30:435,30,0
4	17488072	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
4	17488244	.	G	A	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
4	17488286	.	T	G	668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:697,48,0
4	17488533	.	C	T	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
4	17488534	.	A	G	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
4	17586703	.	T	C	299.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.386;DP=21;FS=14.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=14.27;ReadPosRankSum=1.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:328,0,460
4	17587137	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	17625658	.	A	G	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:172,0,198
4	17626174	.	T	A	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:306,0,699
4	17626418	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,148
4	17627294	.	A	G	81.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:110,0,24
4	17627332	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:157,0,30
4	17627856	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
4	17630192	.	G	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,117
4	17630242	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	17632834	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
4	17632843	.	A	T	52.19	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
4	17632988	.	G	C	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:123,0,24
4	17634213	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
4	17798732	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
4	17802979	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,112
4	17803009	.	T	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=32.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:56:160,0,56
4	17803019	.	T	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=32.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:56:160,0,56
4	17818547	.	A	G	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
4	17845238	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	22396272	.	A	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
4	22400381	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
4	22410138	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	22779459	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	22779460	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	22779464	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	22779467	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	23815924	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	24524544	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	24536158	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	24801315	.	G	A	211.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:240,21,0
4	24801949	.	C	T	241.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.19;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:7:269,0,7
4	24801976	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
4	24807706	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	24807991	.	T	C	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
4	24809380	.	T	C	278.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:307,24,0
4	24809884	.	T	C	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
4	25253995	.	C	T	677.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:706,48,0
4	25278988	.	T	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:225,0,226
4	25279456	.	T	A	46.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:100,0,134
4	25279508	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:94:94,0,344
4	25280897	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,77
4	25363901	.	T	A	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
4	25370962	.	A	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
4	25371399	.	C	T	93.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:21:122,0,21
4	25415076	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	25417371	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	25419283	.	T	C	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.549;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:348,0,199
4	25709475	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	25749303	.	C	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,103
4	26417136	.	T	C	168.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:197,0,26
4	26423738	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	26435156	.	A	G	98.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:125,2,0
4	26673787	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	27004011	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
4	27021809	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	27022800	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	27022986	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	27025238	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:112,0,76
4	30725696	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	36068415	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:75,0,31
4	36069805	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
4	36081878	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	37592674	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
4	37593173	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,142
4	37612486	.	T	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
4	37863763	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	37866222	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:66,0,35
4	37903756	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
4	38119768	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
4	38689745	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	38692160	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	38702437	.	A	G	136.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:165,0,27
4	38879949	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,145
4	38937372	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,149
4	38945463	.	G	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,113
4	38945980	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
4	38946268	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:145,0,111
4	39116911	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	39122913	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	39289308	.	G	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
4	39302029	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
4	39454321	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	39455378	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
4	39456922	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	39457617	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:116,0,74
4	39458051	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
4	39460250	.	G	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:222,0,207
4	39500514	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,77
4	39501086	.	G	A	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
4	39501549	.	C	T	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:257,0,177
4	39528938	.	T	A	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:312,0,464
4	39528939	.	C	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:312,0,464
4	39528976	.	C	T	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=1.115;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:361,0,259
4	39529146	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,157
4	39548368	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
4	39549111	.	C	G	504.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.903;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=20.19;ReadPosRankSum=-1.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:533,0,415
4	39550228	.	C	A	1103.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1132,78,0
4	39550757	.	T	C	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.615;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:65:65,0,636
4	39550776	.	T	C	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.276;DP=24;FS=21.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:258,0,612
4	39550787	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.592;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:70:70,0,598
4	39551033	.	G	T	439.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-1.209;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.016;QD=19.12;ReadPosRankSum=1.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:468,0,355
4	39551176	.	G	C	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:239,0,106
4	39551179	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:104,0,402
4	39783729	.	C	T	1102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1131,84,0
4	39826793	.	G	C	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.119;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:337,0,350
4	39979283	.	G	A	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:339,0,266
4	39979484	.	G	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,105
4	40158562	.	C	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:197,0,65
4	40165007	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	40244347	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,102
4	40426677	.	G	A	539.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.512;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:568,0,458
4	40428010	.	T	C	1378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1407,105,0
4	40438576	.	A	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-1.437;DP=23;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=9.03;ReadPosRankSum=1.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:236,0,591
4	40440215	.	T	C	654.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.528;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.455	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,19:33:99:683,0,467
4	40440854	.	G	C	438.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=1.002;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:467,0,319
4	40754149	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	40754154	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	40810747	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	40938348	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
4	40938582	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	40944983	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	41015823	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
4	41015899	.	C	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
4	41672759	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,77
4	41673604	.	T	C	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-1.670;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:304,0,170
4	41700107	.	T	C	210.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:239,0,25
4	41700217	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,107
4	41700361	.	A	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:233,0,129
4	41843963	.	T	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
4	41956413	.	C	T	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-1.191;DP=12;FS=21.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:224,0,219
4	41959924	.	C	T	128.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:157,0,20
4	41960341	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:115,0,76
4	41986662	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	41992677	.	C	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:240,0,310
4	42003671	.	A	G	378.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=1.396;DP=25;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:407,0,528
4	42020142	.	A	G	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.883;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.391	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:330,0,428
4	42022464	.	C	A	513.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.455;DP=31;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.257	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:542,0,1211
4	42022466	.	C	T	492.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=-1.687;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:521,0,1255
4	42089177	.	G	A	347.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.054;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=21.74;ReadPosRankSum=-0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:376,0,217
4	42410946	.	C	T	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
4	42593568	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	44695941	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	44699484	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	44701446	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
4	44701750	.	A	C	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:444,33,0
4	44701764	.	T	G	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
4	44704757	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	44709695	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	47452883	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	47560002	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	47887536	.	T	C	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:52:191,0,52
4	47887991	.	G	A	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:281,0,135
4	47901476	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,181
4	47916139	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,114
4	47916346	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	48038379	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	48343550	.	C	T	297.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:326,24,0
4	48588742	.	C	T	118.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:146,12,0
4	48851937	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	48857036	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	48885089	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	49310266	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	49310273	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	49310295	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	49512345	.	T	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:177,12,0
4	49512354	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
4	49512372	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	49512910	.	A	G	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
4	49512912	.	G	A	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
4	52714511	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	52780048	.	G	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
4	52781759	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
4	53528730	.	A	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:199,0,63
4	53530394	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
4	53609876	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,118
4	53727450	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
4	53728524	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
4	53732586	.	T	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:121,0,30
4	53732611	.	T	G	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:124,0,66
4	53739856	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,78
4	54011603	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:56:56,0,224
4	54232110	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,79
4	54243905	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:320,0,363
4	54876132	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	56236328	.	C	T	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:305,0,171
4	56236579	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	56236804	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
4	56236837	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
4	56238263	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	56238899	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	56262374	.	A	G	807.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:71:836,71,0
4	56279875	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	56286613	.	A	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	56286717	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	56290220	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
4	56290558	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,73
4	56290573	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:74,0,72
4	56292101	.	A	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:312,0,530
4	56294628	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,113
4	56297762	.	C	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,197
4	56298194	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
4	56298300	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,144
4	56298414	.	C	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
4	56309992	.	A	G	290.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:319,24,0
4	56318772	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	56355598	.	A	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,110
4	56760271	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	57180563	.	G	C	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
4	57181629	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
4	57181632	.	G	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
4	57181995	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
4	57182647	.	G	A	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
4	57182758	.	C	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
4	57314905	.	A	C	858.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-1.484;DP=41;FS=2.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.036;QD=20.95;ReadPosRankSum=2.325	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,23:41:99:887,0,655
4	57326126	.	A	G	52.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=-0.033;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:81:81,0,1064
4	57326159	.	A	G	50.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.074;DP=44;FS=1.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,5:44:79:79,0,1629
4	57326291	.	A	G	594.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.427;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,18:47:99:623,0,1121
4	57326879	.	A	G	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.945;DP=48;FS=4.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=0.27;ReadPosRankSum=-1.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,5:48:41:41,0,1818
4	57327087	.	A	G	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.979;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:474,0,128
4	57328898	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:67,0,34
4	57774176	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	57796900	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:122,0,28
4	57798174	.	C	G	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.228;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:275,0,139
4	57798469	.	A	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:176,0,100
4	57798610	.	T	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,203
4	57829214	.	C	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
4	57830663	.	T	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:185,0,228
4	57843295	.	C	A	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:243,0,364
4	57843320	.	A	G	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:655,48,0
4	57875879	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	57876955	.	G	A	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.253;DP=32;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:435,0,773
4	57881715	.	G	A	738.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:767,0,469
4	57889677	.	C	T	853.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=-0.631;DP=50;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,24:50:99:882,0,992
4	68298747	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	68335971	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	68336579	.	A	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
4	68337435	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	68374597	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
4	68376067	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
4	68380215	.	G	A	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
4	68483491	.	T	G	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:248,0,431
4	68483763	.	C	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,646
4	68483772	.	C	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,646
4	68484094	.	G	A	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:308,0,249
4	68484199	.	A	G	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:287,0,350
4	68484396	.	G	A	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:337,0,321
4	68491819	.	A	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
4	68518208	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	68586315	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:63:156,0,63
4	68586335	.	T	C	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:201,0,239
4	68586336	.	A	G	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:201,0,239
4	68586450	.	C	A	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.58;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:134,0,216
4	68586509	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:144,0,223
4	69203551	.	A	T	801.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.42;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:50:830,50,0
4	70296734	.	T	C	2102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2131,147,0
4	70296752	.	T	C	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-2.293;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=0.87;ReadPosRankSum=2.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:41:41,0,435
4	71682404	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	71682527	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	71682868	.	G	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
4	71682884	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	71684416	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	71684458	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
4	71685092	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	71686246	.	C	G	920.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:949,69,0
4	71691743	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	71702684	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	71704965	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	71705262	.	A	G	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:778,57,0
4	71849697	.	C	T	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
4	71849888	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	71851676	.	A	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
4	71852410	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
4	71895260	.	C	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
4	73922899	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,178
4	73923058	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
4	73923449	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:144,0,67
4	73930552	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:56:197,0,56
4	73942678	.	C	T	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.267;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:331,0,498
4	73956736	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:191,0,230
4	73991006	.	T	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
4	74486052	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	74804019	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	74804029	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	75027249	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	75033628	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
4	75045934	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	75046310	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	75046465	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	75107255	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	75680724	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	75938236	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
4	76404071	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	76404583	.	T	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
4	76404759	.	C	A	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
4	76406846	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,267
4	76436453	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	76453149	.	C	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
4	76454850	.	G	T	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
4	76458378	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
4	76462628	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
4	76468170	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
4	76469054	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
4	76469838	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
4	76470627	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	76471880	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	76472354	.	G	C	47.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:76,0,23
4	76568481	.	A	T	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:49:49,0,153
4	76568785	.	A	C	1661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1690,117,0
4	76569553	.	A	G	1748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1777,123,0
4	76570708	.	C	G	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-0.883;DP=60;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,10:60:99:245,0,1976
4	76648290	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	76649924	.	C	G	1376.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1405,102,0
4	76718224	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,144
4	76720343	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	76788692	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	76791021	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	76792389	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:88,6,0
4	76792398	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	76797950	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	76803457	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	76807218	.	C	G	1846.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.575;DP=44;FS=3.212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.654	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,43:44:87:1875,87,0
4	76807270	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,82
4	76807288	.	A	G	98.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:125,2,0
4	76807302	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	76807304	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	76807313	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
4	76808310	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	76809386	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	76810856	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	76817412	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	76819485	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
4	76819499	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
4	76834545	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
4	76834568	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	76834757	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	76836137	.	A	G	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:765,54,0
4	76838070	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-1.944;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,696
4	76838071	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-1.944;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,696
4	76838707	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,510
4	76838739	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.236;DP=20;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:115,0,628
4	76839108	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	76839329	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
4	76839417	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:157,0,69
4	76840113	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
4	76846676	.	C	T	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
4	76857309	.	C	T	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=2.190;DP=36;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,4:36:66:66,0,1307
4	76878688	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.234;DP=42;FS=11.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,6:42:99:119,0,1449
4	76878716	.	G	C	1354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.871;DP=44;FS=12.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.411	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,36:44:99:1383,0,200
4	77036128	.	G	C	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:84:84,0,514
4	77038473	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
4	77081836	.	G	A	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-2.207;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.235	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:552,0,1780
4	77081837	.	C	A	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-2.151;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:552,0,1780
4	77110365	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	77124196	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
4	77134786	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=1.365;DP=33;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,8:33:99:235,0,912
4	77134870	.	G	A	668.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.320;DP=26;FS=4.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,22:26:78:697,0,78
4	77146751	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	77146871	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77146872	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77147191	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	77147795	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
4	77148055	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	77149335	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	77150642	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	77155507	.	T	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
4	77155588	.	G	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
4	77198986	.	C	T	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
4	77199904	.	A	G	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:71:203,0,71
4	77199913	.	G	A	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=33.88;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:71:203,0,71
4	77201487	.	C	T	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:340,0,129
4	77202310	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	77202404	.	A	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
4	77227485	.	A	G	422.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:451,33,0
4	77231294	.	A	C	740.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:769,54,0
4	77660162	.	G	C	876.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:905,63,0
4	77660731	.	C	G	970.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:999,72,0
4	77662248	.	G	A	729.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-1.734;DP=22;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=33.17;ReadPosRankSum=1.576	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:30:758,30,0
4	77816229	.	A	G	171.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:200,0,23
4	77816801	.	G	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,320
4	77818132	.	G	C	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
4	77818548	.	T	C	115.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:144,0,19
4	77819187	.	C	G	110.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:139,0,27
4	77830057	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	77831307	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77864017	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	77864113	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:35:39,0,35
4	77865764	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77866832	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
4	77867139	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	77867464	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
4	77868466	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
4	77871016	.	T	G	1578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1607,117,0
4	77882153	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	77897815	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77906479	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	77911522	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	77913313	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77915648	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	77915929	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77915934	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77916158	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	77916705	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	77917194	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
4	77920033	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
4	77938885	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	77957813	.	T	A	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=-0.628;DP=36;FS=5.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,8:36:99:176,0,970
4	77958130	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-0.368;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,7:37:99:191,0,1121
4	77958765	.	A	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.389;DP=30;FS=1.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.596	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,6:30:99:173,0,963
4	78083125	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	78090555	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,202
4	78637265	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	78638924	.	G	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:153,0,29
4	78685872	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
4	79238649	.	T	C	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:204,0,28
4	79464767	.	T	C	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
4	79464978	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	79527009	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	79529630	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	79531186	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	79531308	.	C	T	1788.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1817,126,0
4	79531553	.	C	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
4	80274716	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	80274719	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	80274724	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	80827062	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	80827798	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	80827799	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	80898808	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
4	80905990	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	82425542	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	83274208	.	C	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
4	83282432	.	T	G	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:85:85,0,112
4	83282543	.	A	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
4	83283766	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
4	83284549	.	G	A,C	135.53	PASS	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,2,4:6:69:239,158,152,82,0,69
4	83284926	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
4	83286473	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
4	83288006	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
4	83291640	.	A	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,112
4	83291836	.	T	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:122,0,34
4	83292134	.	T	C	74.37	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:11:144,11,0
4	83344744	.	T	C	1157.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1186,84,0
4	83404949	.	C	T	251.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
4	83405125	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
4	83405383	.	T	C	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
4	83407385	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
4	83551007	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	83551119	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
4	83551209	.	C	T	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
4	83551345	.	C	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
4	83751433	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	83755060	.	G	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
4	83756463	.	G	A	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
4	83788344	.	A	T	1048.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1077,75,0
4	83795806	.	T	C	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1099,78,0
4	83815518	.	C	T	770.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:799,57,0
4	83816232	.	A	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
4	83817816	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	83819464	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	83820170	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
4	83838262	.	G	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
4	83846511	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	84191031	.	A	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
4	84205008	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
4	84374624	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	84376743	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	84382763	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:44:69,0,44
4	85570364	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,99
4	85623626	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,150
4	85762385	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:180,0,109
4	85887427	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
4	86992371	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	87028479	.	C	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-2.148;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=14.98;ReadPosRankSum=2.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:178,0,184
4	87359774	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	87791704	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
4	87791733	.	G	C	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
4	87791746	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	87791758	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	87809020	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,80
4	87809387	.	G	T	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:325,24,0
4	87846131	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	87910255	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	88056925	.	A	G	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
4	88057353	.	G	A	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:173,0,256
4	88057481	.	G	A	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:87,0,30
4	88058472	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,116
4	88059242	.	A	G	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:136,0,191
4	88059415	.	G	A	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:174,0,291
4	88059697	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:99:158,0,104
4	88060025	.	C	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,192
4	88082177	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:57:190,0,57
4	88082526	.	T	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:92:92,0,292
4	88141632	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	88813353	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:60,0,33
4	88815408	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	88815412	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	88998083	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
4	89181841	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	89192792	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	89193640	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	89196821	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	89201884	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	89204093	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	89238776	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	89300241	.	C	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
4	89628242	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
4	89629066	.	T	C	137.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:166,0,27
4	89649491	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,77
4	89649659	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
4	89670155	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:74:139,0,74
4	90033240	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	91860898	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	95147399	.	C	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,143
4	95170839	.	G	A	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
4	95173779	.	T	C	236.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:265,21,0
4	95183000	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	95197520	.	C	T	284.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:313,24,0
4	95211610	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
4	95212185	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
4	95506842	.	G	A	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.591;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:429,0,531
4	95539267	.	G	A	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:837,63,0
4	95561459	.	A	G	425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:454,0,382
4	95585225	.	A	G	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=20.17;ReadPosRankSum=-1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:351,0,261
4	95585748	.	C	T	361.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.87;ReadPosRankSum=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,10:11:7:389,7,0
4	95586015	.	T	C	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
4	95586224	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
4	95586279	.	T	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:188,0,266
4	95586405	.	C	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,199
4	95586675	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,190
4	95587259	.	A	C	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:300,0,182
4	95587675	.	T	C	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:193,0,190
4	95588075	.	G	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
4	95588158	.	C	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.186;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:169,0,208
4	95588449	.	G	C	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:441,33,0
4	95588674	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,151
4	95588823	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,153
4	97824317	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	99801016	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	99808254	.	G	A	46.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:75,0,23
4	99992602	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.315;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:77:77,0,552
4	99992793	.	A	C	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:309,0,236
4	99992853	.	G	A	451.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.704;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:480,0,545
4	99993151	.	C	T	357.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-1.456;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.344;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:386,0,627
4	100589222	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	100589223	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	100589224	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	100589230	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	101944669	.	T	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,120
4	103183218	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,111
4	103183935	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:60,0,80
4	103500049	.	G	C	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:269,0,136
4	103514658	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,143
4	103552830	.	G	A	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:45:45,0,438
4	103611845	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
4	104017399	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:181,0,359
4	106394031	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	106394380	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:55:55,0,104
4	106407416	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	106407422	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	106474096	.	T	C	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
4	106580340	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:190,0,66
4	106600622	.	T	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:78,0,32
4	106630030	.	G	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
4	106767490	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
4	106891182	.	G	C	46.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:75,0,26
4	106938490	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	107157561	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,197
4	107168431	.	G	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
4	107238966	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	107239130	.	G	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,162
4	107242366	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	107924808	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	107924817	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	107924828	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	108535335	.	C	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-2.169;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:170,0,525
4	108575989	.	G	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.109;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:257,0,511
4	108641300	.	T	C	709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:738,54,0
4	108641317	.	G	A	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:359,0,198
4	108697915	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	108697922	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	108831871	.	G	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:138,0,322
4	108872588	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	108931039	.	T	C	1652.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1681,117,0
4	108944821	.	C	T	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
4	108944846	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	108945104	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	108945631	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
4	108946378	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
4	108948091	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	108951058	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	108951874	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	108953417	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
4	108954013	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
4	109089824	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	109573496	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	109573891	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	109575647	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	110581363	.	T	A	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1375,96,0
4	110613389	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	110737389	.	T	C	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:514,39,0
4	110969585	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	110971489	.	A	G	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
4	110972151	.	T	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,156
4	111117247	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	113066831	.	G	A	1089.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:95:1118,95,0
4	113185053	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
4	113198805	.	G	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,187
4	113351822	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,77
4	113352397	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	113352628	.	A	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
4	113353285	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
4	113359703	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
4	113484341	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
4	113486605	.	A	T	112.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:62:347,0,62
4	113554385	.	A	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
4	113578609	.	C	T	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:274,0,187
4	114372480	.	A	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
4	114372504	.	C	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
4	114374813	.	C	T	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.757;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.399	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:353,0,724
4	114377170	.	C	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:75,0,64
4	114377928	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
4	114392393	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	114682714	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:101,0,148
4	114682919	.	T	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:90:90,0,102
4	114822485	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	114822605	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	114823191	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
4	114864332	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
4	114892049	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:116,0,64
4	118395422	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	118395432	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	118496030	.	C	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
4	119047195	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	119187632	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
4	119200594	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	119401567	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
4	119401575	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	119552849	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
4	119552971	.	C	G	157.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:186,0,24
4	119631629	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,266
4	119631992	.	A	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
4	119632094	.	T	C	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
4	119634130	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	119634275	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	119634694	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	119636395	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	119736796	.	A	C	422.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-0.910;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:451,0,126
4	120187119	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	120214030	.	T	G	252.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:281,21,0
4	120215314	.	A	G	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
4	120215836	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	120219239	.	T	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:32:136,0,32
4	120328333	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	120328520	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	120371252	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	120375464	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	120375980	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	120376030	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	120376263	.	C	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.977;DP=12;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:186,0,591
4	120376266	.	C	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=1.092;DP=13;FS=23.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=12.14;ReadPosRankSum=2.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:186,0,591
4	120381341	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
4	120392443	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	120416788	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	120416872	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	120418838	.	C	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
4	120421809	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
4	120421969	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
4	120422636	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	120433982	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	120457682	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	120459674	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	120462861	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	120463409	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	120463856	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	120468370	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	120474859	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	120978974	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	120980087	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	120980212	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
4	120981214	.	T	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
4	120983954	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	120984077	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	121759300	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:65,0,33
4	122589283	.	G	A	684.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.277;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:713,0,543
4	122599447	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
4	122600369	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	122618046	.	A	C	1411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1440,105,0
4	122735868	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	122742217	.	T	C	1182.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1211,84,0
4	122745038	.	C	T	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
4	122781263	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	122781402	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	122791601	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	123145751	.	T	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
4	123192383	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	123229132	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
4	123814308	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
4	123825708	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	123825717	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	123825727	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	123838758	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
4	124602159	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	128807219	.	T	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,96
4	128814964	.	G	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,103
4	128995640	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:65,0,36
4	129012181	.	G	A	234.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:263,0,20
4	129012638	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,109
4	129043204	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
4	129100643	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
4	129190480	.	T	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
4	129924977	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	129961179	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	130030652	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	139140494	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	139937071	.	C	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
4	139975818	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	140217010	.	G	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:52:52,0,112
4	140222034	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
4	140310520	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,133
4	140395583	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,106
4	140429555	.	C	T	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-1.074;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:489,0,609
4	140430208	.	C	G	574.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=-0.962;DP=27;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,16:27:99:603,0,358
4	140430581	.	G	T	1067.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1096,75,0
4	140430625	.	A	C	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.537;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:248,0,342
4	140430746	.	T	C	1179.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1208,84,0
4	140453152	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	140453155	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	140453156	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	140625323	.	A	G	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
4	141457571	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	141473235	.	G	A	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
4	141543997	.	G	A	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
4	141598126	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:106,0,234
4	141600320	.	A	G	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
4	142945131	.	T	A	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:511,39,0
4	142945451	.	T	C	339.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:368,27,0
4	142947542	.	A	G	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-2.359;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:316,0,134
4	142947546	.	C	G	463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:492,33,0
4	142948125	.	A	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.48;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:103,0,257
4	143033778	.	T	C	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.154;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.277	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,11:23:99:410,0,449
4	143336602	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	143575740	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	144144223	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	144394201	.	A	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,75
4	144442735	.	C	T	784.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=-1.880;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,21:31:99:813,0,352
4	144467104	.	T	C	935.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:964,66,0
4	144474666	.	A	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:110,0,69
4	144474849	.	A	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:135,0,185
4	144655143	.	C	G	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
4	144711234	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	144734546	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	146049214	.	C	T	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:252,0,259
4	146056320	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
4	146403165	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	146479231	.	C	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,163
4	146682333	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:143,0,107
4	147108864	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	147176571	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	147176603	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
4	148557553	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
4	148594957	.	T	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,148
4	149357475	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	149849486	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
4	151177432	.	A	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
4	151199080	.	G	A	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:195,0,353
4	151207127	.	C	T	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:296,0,388
4	151236754	.	T	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.132;DP=19;FS=25.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:86:86,0,491
4	151719263	.	A	G	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:301,0,214
4	151910253	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
4	152024326	.	T	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
4	152041502	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
4	152588541	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	152589671	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	152590165	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,118
4	152590172	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,118
4	152590337	.	G	T	14.92	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:43,0,28
4	152591387	.	G	A	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
4	152682046	.	G	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:94:94,0,271
4	153549379	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	153832040	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
4	153859454	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	153896358	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	153897770	.	G	A	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
4	153898178	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	153899573	.	A	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
4	153899658	.	C	T	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
4	153900025	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
4	154387597	.	G	C	77.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:106,0,24
4	154478222	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
4	154479430	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
4	154519764	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,197
4	155456390	.	C	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
4	155456608	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
4	155457073	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,159
4	155457150	.	T	C	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:524,39,0
4	155457183	.	T	C	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
4	155457225	.	T	A	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
4	155457601	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
4	155458728	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	155459194	.	A	T	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:695,48,0
4	155461113	.	T	C	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:880,60,0
4	155467187	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	156617994	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,192
4	156632391	.	A	G	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
4	156644174	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	156652495	.	A	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:67:230,0,67
4	156652714	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	156652866	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:156,0,73
4	156654369	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,151
4	156655474	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
4	156655782	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,225
4	156657401	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,107
4	158065038	.	T	C	112.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:140,12,0
4	159045966	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	159046278	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
4	159046387	.	A	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
4	159048217	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
4	159076826	.	C	T	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
4	159092633	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
4	159092721	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,156
4	159175840	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	159176109	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	159185633	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	159588784	.	T	C	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
4	159588976	.	A	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,105
4	159601676	.	C	T	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:272,0,60
4	159630817	.	T	C	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=25.05;ReadPosRankSum=-0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:429,0,172
4	159631991	.	G	T	412.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=1.000;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:441,0,571
4	159644494	.	G	C	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-2.339;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:309,0,427
4	159644501	.	C	T	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:309,0,427
4	159826379	.	T	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:188,0,103
4	159826896	.	C	G	360.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=1.611;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=30.06;ReadPosRankSum=-2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:55:389,0,55
4	159827223	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	159827313	.	T	C	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:66:233,0,66
4	160277276	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,201
4	160570104	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
4	160578021	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	160584059	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	160584486	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
4	160584669	.	T	C	156.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:185,15,0
4	160585411	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	160585708	.	C	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
4	160585821	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
4	160586112	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	160586942	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
4	160587160	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	160587330	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	160588859	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	161263453	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	164033972	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
4	164048199	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	164048723	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:78,0,32
4	164049448	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	164085425	.	T	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
4	164087954	.	A	T	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:354,27,0
4	164245663	.	A	G	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
4	164250364	.	T	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
4	164250797	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	164252812	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	164428543	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	164435265	.	A	C	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.934;DP=27;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:264,0,552
4	164440581	.	T	C	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:220,0,338
4	164440743	.	T	A	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:258,0,99
4	165110763	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	165110770	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	165110771	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	165996447	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	165998104	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	165999305	.	G	A	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:611,45,0
4	166000195	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
4	166000263	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:144,0,242
4	166134237	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	166231868	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,281
4	166250224	.	G	A	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
4	166254953	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	169299528	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:118,0,72
4	169315760	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	169336662	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	169362623	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,119
4	169785081	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	169849237	.	G	A	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.133;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:167,0,348
4	169849389	.	C	G	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:235,0,176
4	169909593	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
4	169910101	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	169917245	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	169919092	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	169921737	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	169922504	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	169928842	.	G	T	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
4	169931268	.	G	A	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:466,33,0
4	169931274	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:119,0,281
4	169931288	.	T	C	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
4	170015488	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	170017508	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
4	170037572	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,146
4	170077789	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
4	170581570	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
4	170642246	.	A	G	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
4	170642834	.	G	T	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:605,45,0
4	170663235	.	C	T	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
4	170678993	.	T	C	285.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:314,24,0
4	174089238	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	174089426	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	174090004	.	G	A	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:217,0,265
4	174244521	.	C	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,245
4	174298456	.	A	T	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-0.155;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.078;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.279	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:366,0,496
4	174300605	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	175158508	.	G	A	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:263,0,168
4	175237408	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	175238310	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	175241128	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:75,0,68
4	175254461	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	175412477	.	C	T	67.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
4	177249533	.	A	G	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:268,0,145
4	177249681	.	A	G	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:294,0,176
4	177249756	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,113
4	177251544	.	G	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
4	177257723	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	178274565	.	A	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:137,0,105
4	178274694	.	T	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,137
4	178274750	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:65:236,0,65
4	178274835	.	A	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,190
4	178281754	.	G	A	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
4	178283798	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:74,0,73
4	178283967	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
4	178291257	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	178348653	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	178348816	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
4	178350067	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	178351803	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
4	178352679	.	T	G	290.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.31;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:319,0,19
4	178355880	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
4	178356930	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
4	178359960	.	G	C	1287.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1316,93,0
4	178360196	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	178740443	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	178740467	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	179131210	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	179131211	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	180979118	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	180980376	.	T	G	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
4	180980405	.	C	G	297.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=29.80;ReadPosRankSum=1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:13:326,0,13
4	183652175	.	T	C	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
4	183811513	.	C	T	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,389
4	183812046	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:116,0,495
4	183812351	.	C	T	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
4	183815688	.	A	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=1.898;DP=24;FS=5.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=2.87;ReadPosRankSum=-2.130	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:97:97,0,795
4	184203886	.	G	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:60:230,0,60
4	184238670	.	C	G	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:224,0,136
4	184382047	.	G	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
4	184426387	.	C	T	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
4	184433731	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
4	184600601	.	A	G	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.873;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:515,0,168
4	184612553	.	G	C	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.447;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:502,0,208
4	184629794	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
4	184631345	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
4	184632064	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	184640563	.	G	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
4	184640605	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	184640609	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
4	184641975	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
4	184642304	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,139
4	184939089	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
4	184942220	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	184942404	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	185214973	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:75,0,65
4	185215182	.	T	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
4	185395595	.	A	G	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
4	185587165	.	A	G	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
4	185609104	.	G	A	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
4	185609279	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
4	185609297	.	G	C	118.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:146,12,0
4	185610940	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	185620341	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
4	185622046	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
4	185622433	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	185622779	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
4	185653568	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
4	185677421	.	C	T	2061.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-1.732;DP=50;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=30.05;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,49:50:99:2090,141,0
4	185677952	.	G	A	1865.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1894,129,0
4	185678118	.	C	G	2498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2527,175,0
4	185688651	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
4	185696248	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
4	185697441	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
4	185701549	.	G	T	2192.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2221,157,0
4	185701813	.	A	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
4	185703355	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	185733208	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
4	185880796	.	A	G	177.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.64;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:206,0,17
4	185881047	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
4	185881242	.	C	T	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:128,0,69
4	185882107	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,113
4	185882219	.	C	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=21.47;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:200,0,101
4	185882454	.	T	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	185882561	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
4	185882953	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
4	185883427	.	G	C	107.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:13:136,0,13
4	185884206	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
4	185892056	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	185910325	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
4	186081915	.	G	A	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
4	186097045	.	C	T	1022.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1051,75,0
4	186321067	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
4	186322637	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
4	186347055	.	G	A	94.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:122,12,0
4	186347073	.	G	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
4	186347092	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
4	186379371	.	G	A	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
4	186379899	.	G	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,112
4	186380295	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:113,0,76
4	186380515	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:157,0,29
4	186380846	.	A	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:74,0,72
4	186381115	.	G	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:102,0,76
4	186429991	.	T	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
4	186433188	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
4	186434095	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	186440266	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
4	186440833	.	G	A	28.19	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
4	186441227	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
4	186456617	.	A	G	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:727,54,0
4	187077206	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
4	187133576	.	A	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
4	187509320	.	G	A	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
4	187509321	.	A	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
4	187516880	.	A	G	849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:878,63,0
4	187519206	.	C	G	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
4	187525020	.	A	C	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
4	187531022	.	A	G	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:212,0,172
4	187534363	.	G	A	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:514,39,0
4	187534375	.	A	G	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:207,0,369
4	187538942	.	T	G	284.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:313,21,0
4	187542755	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,141
4	187557893	.	T	C	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
4	187627792	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,157
4	187628398	.	C	G	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:314,0,267
4	187629140	.	G	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:183,0,65
4	187629497	.	G	A	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:93:235,0,93
4	187629538	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-2.205;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=16.40;ReadPosRankSum=1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:225,0,231
4	187629770	.	A	C	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:256,0,256
4	188140857	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
4	190729543	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	190730022	.	A	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
4	190731184	.	A	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
4	190731658	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
4	190883430	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
4	190883445	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	163205	.	G	C	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
5	163260	.	A	C	700.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.639;DP=19;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:47:729,47,0
5	163496	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,147
5	163896	.	C	A	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.25;ReadPosRankSum=1.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:273,0,140
5	164065	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:96:96,0,200
5	164143	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:142,0,120
5	164300	.	A	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:197,0,364
5	164455	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,333
5	164581	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,155
5	166715	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:73:73,0,396
5	168925	.	G	A	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:249,0,168
5	169301	.	A	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:147,0,234
5	169361	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:153,0,113
5	174106	.	G	A	535.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.122;DP=27;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:564,0,412
5	175071	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
5	179377	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
5	181660	.	T	G	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.236;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:316,0,464
5	181730	.	C	G	661.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-0.285;DP=32;FS=5.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,14:32:99:690,0,1406
5	181762	.	A	G	661.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.159;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.686;QD=26.47;ReadPosRankSum=1.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:690,0,1406
5	183134	.	A	G	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:294,0,499
5	183401	.	A	G	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=-1.131;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:507,0,593
5	183516	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.639;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,474
5	184106	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:69:69,0,340
5	184336	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.695;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:392,0,469
5	184393	.	C	T	338.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.305;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:367,0,590
5	184702	.	A	G	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=-0.046;DP=19;FS=14.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:160,0,553
5	184750	.	A	G	711.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.293;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=23.73;ReadPosRankSum=-1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:740,0,988
5	184760	.	A	G	711.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.136;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:740,0,988
5	188747	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	200310	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
5	200868	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	201541	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	201550	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	202023	.	A	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
5	202064	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	202282	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
5	204154	.	G	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
5	231111	.	T	C	724.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:753,51,0
5	242179	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
5	251712	.	C	T	99.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:127,12,0
5	271916	.	C	T	377.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-2.935;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,14:58:99:406,0,1654
5	301292	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	307825	.	C	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,308
5	308268	.	C	T	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
5	309060	.	A	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
5	309096	.	A	C	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
5	311478	.	T	C	2878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2907,205,0
5	312031	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	312804	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,216
5	313762	.	G	A	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
5	314011	.	G	A	288.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:317,24,0
5	314346	.	C	T	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:657,45,0
5	344218	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	360543	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	362569	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	366017	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	370782	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
5	374748	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
5	375096	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
5	375107	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	376668	.	G	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:56:123,0,56
5	376669	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:56:123,0,56
5	416293	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	420726	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	420898	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
5	422955	.	C	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
5	431212	.	T	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	432235	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
5	434981	.	G	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
5	435055	.	G	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	435560	.	C	T	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
5	435626	.	A	G	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:181,0,133
5	436665	.	A	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:194,0,104
5	438102	.	G	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
5	442675	.	C	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:55:55,0,276
5	443849	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	447779	.	C	A	546.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=-0.851;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:575,0,500
5	453567	.	G	A	1091.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1120,78,0
5	455696	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	456016	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	456915	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	458999	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	459003	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	459772	.	A	G	286.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:315,24,0
5	459793	.	T	C	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
5	460079	.	C	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
5	460135	.	A	G	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
5	460695	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,118
5	462734	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	464814	.	C	G	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:33:461,33,0
5	464823	.	T	C	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:33:461,33,0
5	468872	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	469961	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,201
5	470526	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
5	470760	.	G	A	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:572,39,0
5	471494	.	T	C	1572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1601,111,0
5	472951	.	T	C	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:611,45,0
5	473160	.	G	A	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:94:124,0,94
5	473368	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	473797	.	G	C	638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:667,48,0
5	473957	.	C	A	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:471,36,0
5	475104	.	A	G	645.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:674,48,0
5	475346	.	A	T	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:544,39,0
5	476530	.	C	G	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:649,48,0
5	476848	.	C	T	587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:616,45,0
5	476910	.	T	C	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
5	476969	.	C	T	461.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:490,33,0
5	477019	.	T	C	571.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:600,42,0
5	477175	.	G	T	635.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:664,48,0
5	477253	.	A	G	608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:637,45,0
5	477303	.	A	G	609.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:638,45,0
5	477317	.	C	T	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=28.06;ReadPosRankSum=-1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:54:393,0,54
5	477639	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
5	477719	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,115
5	477968	.	G	A	695.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:724,51,0
5	478440	.	G	A	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:41:522,41,0
5	478458	.	T	C	507.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:36:536,36,0
5	478466	.	T	C	507.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:36:536,36,0
5	478598	.	C	T	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
5	478655	.	G	A	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
5	478672	.	T	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,228
5	478874	.	A	G	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:298,0,269
5	479454	.	C	T	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:421,33,0
5	479473	.	C	T	457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:486,33,0
5	479540	.	A	G	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:440,33,0
5	479746	.	C	G	682.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:711,51,0
5	479905	.	A	C	788.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:817,57,0
5	480509	.	A	G	1145.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1174,84,0
5	640705	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:70:70,0,291
5	642419	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:51:107,0,51
5	642532	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,153
5	642829	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
5	643593	.	T	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
5	643728	.	G	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:146,0,110
5	660776	.	A	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:88:88,0,146
5	662030	.	G	C	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:166,0,111
5	662543	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,137
5	662632	.	C	T	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
5	662906	.	T	C	17.84	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:46,0,37
5	662955	.	T	C	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:141,0,242
5	664323	.	G	A	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
5	665280	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
5	668791	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
5	669063	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:59:59,0,106
5	670673	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	671791	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
5	672408	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
5	673408	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
5	674921	.	C	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
5	675303	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	675304	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	678062	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	692887	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
5	711319	.	C	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
5	711320	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
5	711875	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:155,0,68
5	712366	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	749458	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	749470	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	759750	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	762435	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	762465	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	767613	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	796221	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.391;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:76:76,0,2110
5	796229	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:76:76,0,2110
5	824214	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,154
5	833915	.	G	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:96:96,0,244
5	840342	.	A	G	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:272,0,144
5	852554	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:101,0,305
5	1038526	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	1051687	.	T	C	572.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-1.075;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:601,0,398
5	1052179	.	C	T	584.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.678;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:613,0,347
5	1052360	.	C	T	1017.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1046,78,0
5	1052829	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
5	1053074	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:119,0,32
5	1054262	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
5	1054315	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,109
5	1054439	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
5	1057023	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
5	1057782	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	1057960	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
5	1058134	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	1058387	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	1058472	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	1059525	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	1060011	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1060634	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
5	1060654	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	1066138	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
5	1076129	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
5	1078507	.	C	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
5	1078898	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	1081702	.	A	G	469.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.643;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=18.07;ReadPosRankSum=-1.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:498,0,426
5	1081767	.	C	T	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.938;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:507,0,547
5	1083509	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,79
5	1091373	.	A	G	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
5	1094670	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	1113982	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1114535	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1115398	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1116123	.	T	A	37.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:66,0,28
5	1121954	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
5	1129788	.	G	A	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:95:95,0,246
5	1317949	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
5	1320247	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,146
5	1325590	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,143
5	1325767	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,111
5	1325803	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,72
5	1330253	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	1330840	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,113
5	1333778	.	C	A	81.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:10:109,10,0
5	1461698	.	C	T	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-1.015;DP=38;FS=7.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,15:38:99:502,0,828
5	1462097	.	G	C	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=2.156;DP=57;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=3.12;ReadPosRankSum=-2.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,9:57:99:206,0,1832
5	1462727	.	A	T	2406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2435,169,0
5	1468011	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
5	1468170	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	1468989	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
5	1469437	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
5	1470069	.	G	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
5	1470450	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:114,0,30
5	1470578	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
5	1471109	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	1471388	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	1472699	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1472701	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1473071	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
5	1473560	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	1473977	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	1477310	.	C	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
5	1478711	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
5	1479678	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	1484992	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	1487663	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:39,0,36
5	1492559	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	1494909	.	C	T	1059.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-0.150;DP=46;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,30:46:99:1088,0,495
5	1494935	.	T	C	676.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.676;DP=39;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.070	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,21:39:99:705,0,590
5	1571249	.	C	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:54:54,0,171
5	1572318	.	C	T	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.656;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:289,0,438
5	1573151	.	C	T	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=2.072;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=17.88;ReadPosRankSum=-2.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:207,0,133
5	1577411	.	G	C	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
5	1578349	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:158,0,29
5	1579165	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1580464	.	G	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
5	1583285	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,151
5	1584411	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
5	1593264	.	C	T	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.246;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:84:84,0,442
5	1633942	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
5	1801689	.	A	C	124.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.97;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:18:153,0,18
5	1803326	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:118,0,30
5	1803564	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:113,0,59
5	1803748	.	T	C	123.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:152,0,25
5	1804134	.	C	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:140,0,139
5	1804931	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
5	1805554	.	T	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:203,0,28
5	1806653	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:97:224,0,97
5	1807682	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,113
5	1807912	.	A	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:149,0,56
5	1809228	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,117
5	1809320	.	A	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:153,0,66
5	1809542	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:116,0,76
5	1809674	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
5	1809713	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
5	1811318	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,121
5	1811479	.	A	C	49.52	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
5	1812426	.	A	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:177,0,140
5	1814146	.	G	A	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:116,0,24
5	1864538	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
5	1864689	.	A	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,82
5	1880891	.	C	T	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.993;DP=32;FS=11.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:375,0,729
5	1881733	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	1882386	.	C	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
5	1884111	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
5	1887417	.	C	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,83
5	1888283	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	2736789	.	T	A	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
5	2746229	.	C	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
5	2747127	.	A	G	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:617,42,0
5	2747435	.	T	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	2749011	.	C	T	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.532;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,6:28:99:166,0,818
5	2754432	.	T	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
5	2755485	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,114
5	2756850	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,194
5	3446025	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	3446026	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	5460569	.	C	T	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
5	5460619	.	G	C	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:493,36,0
5	5460696	.	G	A	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:260,0,233
5	5462148	.	G	A	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
5	5476676	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	6373100	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
5	6378614	.	G	C	850.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:879,72,0
5	6491532	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
5	6491757	.	T	C	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
5	6492191	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
5	6492287	.	A	G	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
5	6599940	.	C	T	1041.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.034;DP=46;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.172;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,28:46:99:1070,0,648
5	6600150	.	G	A	818.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.458;DP=53;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.314	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,23:53:99:847,0,1142
5	6601004	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	6601055	.	A	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,130
5	6601309	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
5	6602544	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,139
5	6604931	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:146,0,68
5	6608877	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	6608957	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
5	6609088	.	C	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
5	6609112	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:110,0,69
5	6612243	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	6621031	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	6624294	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	6633042	.	C	T	474.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.525;DP=44;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,16:44:99:503,0,962
5	6633222	.	C	T	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.532;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=27.40;ReadPosRankSum=-1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:49:357,0,49
5	6633779	.	C	G	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
5	6651970	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,119
5	6652009	.	G	A	380.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.457;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:409,0,137
5	6656210	.	G	A	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=17.07;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:216,0,191
5	6668842	.	C	T	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:636,45,0
5	6720191	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
5	6728460	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	6742168	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	6743381	.	A	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
5	6743423	.	T	C	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
5	6748659	.	T	C	368.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.811;DP=24;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:397,0,502
5	7859523	.	A	G	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
5	7862381	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
5	7866967	.	G	C	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
5	7868030	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	7870973	.	A	G	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:239,0,287
5	7871017	.	G	A	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:45:45,0,456
5	7878179	.	C	T	635.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:664,45,0
5	7890405	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	7897319	.	G	A	738.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:767,54,0
5	7898640	.	C	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
5	7899850	.	T	C	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
5	7900598	.	T	C	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:169,0,299
5	7900833	.	T	A	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
5	8460415	.	C	G	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:527,36,0
5	8461355	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
5	8461628	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	8462191	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
5	9036790	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	9037843	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	9038985	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	9040113	.	C	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
5	9040141	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	9041126	.	A	G	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:80,0,26
5	9041468	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	9041924	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
5	9122890	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,115
5	9136646	.	C	G	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:92:265,0,92
5	9154659	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	9380118	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:55:120,0,55
5	9421794	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	9544458	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	10213708	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	10227548	.	C	A	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
5	10239261	.	G	A	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:229,0,188
5	10250430	.	G	A	1228.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1257,93,0
5	10250443	.	T	C	1709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1738,120,0
5	10252119	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	10252178	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	10253537	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	10254117	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
5	10254817	.	A	G	3228.29	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:3256,223,0
5	10256161	.	T	C	2920.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2949,207,0
5	10259161	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
5	10259373	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	10259374	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	10259990	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	10261250	.	C	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	10261408	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	10261434	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
5	10261966	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	10262347	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
5	10262366	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
5	10262405	.	G	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
5	10263881	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	10264962	.	A	G	2927.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-1.732;DP=69;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=29.54;ReadPosRankSum=1.682	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,68:69:99:2956,172,0
5	10265076	.	C	T	1292.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1321,93,0
5	10265277	.	C	T	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-0.615;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:370,0,531
5	10265278	.	A	G	1023.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1052,72,0
5	10265462	.	G	A	873.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:902,63,0
5	10265488	.	A	G	982.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1011,69,0
5	10265719	.	C	G	1055.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1084,75,0
5	10266067	.	G	T	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
5	10275870	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
5	10278657	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	10279208	.	A	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	10279942	.	G	A	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-2.781;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=19.05;ReadPosRankSum=2.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:352,0,231
5	10282396	.	A	G	925.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=-1.507;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,25:48:99:954,0,856
5	10435564	.	G	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.478;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:116,0,532
5	10680526	.	C	T	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-1.425;DP=32;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,14:32:99:507,0,683
5	10680547	.	T	C	732.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,20:35:99:761,0,512
5	10760890	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	10761182	.	A	G	1240.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1269,96,0
5	14368975	.	C	T	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.234;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:210,0,449
5	14397238	.	T	C	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:129,0,229
5	14420027	.	A	C	642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:671,48,0
5	14435431	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	14435514	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	14449136	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
5	14508971	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.557;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:78:78,0,419
5	14509214	.	G	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:177,0,254
5	14509903	.	C	T	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:229,0,174
5	14509966	.	G	A	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:326,0,120
5	14693480	.	G	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
5	14695247	.	A	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
5	14751305	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:75,0,68
5	15938553	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:40:76,0,40
5	16478200	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,112
5	16670618	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
5	16673975	.	C	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-1.743;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:186,0,300
5	16680708	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	16681001	.	G	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	16769273	.	G	A	881.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:910,63,0
5	16794916	.	G	A	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:336,0,159
5	20302942	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	21026360	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	21026364	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	21292180	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	21469874	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
5	23792601	.	A	G	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
5	23793059	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	23948271	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	23979604	.	G	A	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
5	23980664	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
5	23980761	.	A	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	23991371	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	24168463	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	24176677	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	24191781	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	31053804	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	31054336	.	T	A	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
5	31401447	.	A	G	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
5	31428613	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	31461202	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	31498561	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	31515657	.	G	A	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.939;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:381,0,337
5	31532429	.	A	T	225.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:254,21,0
5	31538692	.	A	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,146
5	31553268	.	T	G	122.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=-0.361;DP=12;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.23;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:208,0,297
5	31553951	.	C	T	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:659,45,0
5	31553968	.	T	C	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.23;ReadPosRankSum=2.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:139,0,307
5	31554593	.	C	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.424;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:122,0,460
5	31554657	.	A	G	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:225,0,106
5	31556557	.	C	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
5	31645915	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	32058115	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
5	32077714	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	32109122	.	C	A	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
5	32125427	.	C	A	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
5	32229677	.	G	A	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
5	32360026	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	32382242	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:101,0,96
5	32384427	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	32385005	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	32385254	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
5	32400266	.	A	G	529.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.069;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=18.27;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:558,0,511
5	32403346	.	C	T	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1375,96,0
5	32594125	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	32595883	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	32602946	.	T	A	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:274,0,247
5	32788184	.	C	T	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.684;DP=17;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=17.22;ReadPosRankSum=1.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:321,0,289
5	32788369	.	G	A	512.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-1.962;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:541,0,343
5	32788696	.	G	A	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.196;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=27.05;ReadPosRankSum=-0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:434,0,137
5	32789392	.	G	A	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.566;DP=16;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:447,0,267
5	32789852	.	T	C	408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=-1.759;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=24.05;ReadPosRankSum=1.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:437,0,194
5	32790616	.	T	C	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.936;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:281,0,580
5	33989518	.	C	T	1000.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1029,72,0
5	33994116	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	33998883	.	A	G	1182.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1211,84,0
5	34004707	.	C	T	1232.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1261,87,0
5	34008100	.	C	T	560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:589,42,0
5	34048706	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:119,0,28
5	34048745	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	34048749	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
5	34052269	.	C	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
5	34053621	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	34056020	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
5	34175626	.	G	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.98;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:55:55,0,254
5	34454322	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	34811131	.	G	A	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.75;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:233,0,103
5	34824555	.	G	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-2.680;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=21.83;ReadPosRankSum=2.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:312,0,172
5	34831846	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,188
5	34906658	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,156
5	34906737	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
5	34907169	.	G	A	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
5	34951150	.	C	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
5	34952081	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
5	34953108	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
5	34956294	.	C	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
5	34957444	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
5	35045712	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	35048602	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	35059174	.	G	A	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=-0.519;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=21.72;ReadPosRankSum=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:593,0,828
5	35059177	.	G	C	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.301;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=22.59;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:593,0,828
5	35060054	.	C	G	371.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-1.401;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.972;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:400,0,579
5	35060067	.	C	G	450.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:479,0,449
5	35060319	.	C	T	565.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-0.943;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=19.51;ReadPosRankSum=1.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:594,0,469
5	35060501	.	C	T	828.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.018;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.994	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:857,0,1060
5	35060513	.	A	G	828.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.335;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:857,0,1060
5	35060731	.	T	C	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.858;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:243,0,532
5	35061731	.	T	C	458.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.875;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:487,0,549
5	35062618	.	C	T	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.807;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:276,0,589
5	35063292	.	A	T	541.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.298;DP=24;FS=13.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.298	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:570,0,314
5	35072380	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	35645214	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	35654711	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	36098822	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,144
5	36099755	.	A	T	152.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=21.72;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:12:180,0,12
5	36103905	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:193,0,150
5	36142648	.	A	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=19.61;ReadPosRankSum=-0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:342,0,259
5	36143392	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,192
5	36182760	.	A	G	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
5	36194007	.	T	A	467.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=-1.612;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:496,0,558
5	36207424	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	36223023	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	36224240	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	36241922	.	G	A	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:174,0,248
5	36241955	.	T	C	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:159,0,175
5	36241988	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	37006526	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.009;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:115,0,536
5	37036492	.	C	T	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:300,0,338
5	37044568	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=4.63;ReadPosRankSum=2.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:93:93,0,420
5	37105606	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
5	37122533	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,115
5	37290467	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,106
5	37294473	.	T	C	518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:547,39,0
5	37364443	.	C	T	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
5	37721865	.	G	A	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
5	38939339	.	G	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
5	38942090	.	T	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
5	38950776	.	G	A	231.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:260,21,0
5	38955796	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,119
5	40508305	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	40715361	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,162
5	40716153	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	40828478	.	T	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
5	40829311	.	C	T	196.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:225,18,0
5	40829801	.	C	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=23.39;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:28:75,0,28
5	40829970	.	T	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:30:80,0,30
5	40829975	.	C	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
5	40830052	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,228
5	40830927	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
5	40831202	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	40890354	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	40890355	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	41730229	.	C	T	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
5	41939044	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	42423905	.	A	G	80.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
5	42700005	.	G	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:165,0,320
5	42700044	.	A	G	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
5	42721080	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
5	42800808	.	C	T	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=-1.197;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:262,0,420
5	43039618	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
5	43039793	.	T	C	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
5	43045722	.	T	C	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
5	43047276	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	43048226	.	G	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
5	43051393	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
5	43051425	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:81,0,32
5	43052891	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	43053246	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	43053497	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	43054180	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:116,0,33
5	43054758	.	G	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
5	43055556	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
5	43058382	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
5	43060136	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	43062123	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	43066774	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
5	43071156	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
5	43094029	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	43175873	.	T	C	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
5	43175953	.	G	C	606.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,15:15:34:635,0,34
5	43175973	.	T	A	606.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:34:635,0,34
5	43288366	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	43289708	.	G	C	1989.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2018,138,0
5	43290700	.	T	A	2234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2263,157,0
5	43290728	.	C	A	506.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-0.964;DP=51;FS=2.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,16:51:99:535,0,1382
5	43293350	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	43297144	.	A	G	2893.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2922,204,0
5	43297764	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:92:92,0,379
5	43298515	.	C	T	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
5	43298557	.	C	T	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
5	43308690	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	43313531	.	C	T	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:449,33,0
5	43313570	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
5	43483844	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:111,0,28
5	43492978	.	G	A	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
5	43515010	.	G	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
5	43527135	.	A	C	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:855,60,0
5	43527883	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	43704542	.	C	G	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:695,51,0
5	44809162	.	G	C	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.113;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:347,0,348
5	44815669	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,438
5	44815675	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,438
5	44815771	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,196
5	44816354	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,231
5	44816984	.	G	A	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:171,0,165
5	44817309	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:100,0,194
5	44817919	.	G	A	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.468;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:289,0,225
5	44818181	.	A	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:194,0,109
5	44819646	.	T	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:106,0,70
5	44820850	.	G	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,73
5	44822283	.	A	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,114
5	44822617	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:78,0,63
5	44823134	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,109
5	44826718	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:113,0,65
5	44827680	.	G	C	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:65:245,0,65
5	44828203	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,112
5	46400374	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	46400377	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	46400384	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	46400386	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	49694583	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	49737127	.	A	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
5	52096889	.	C	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,402
5	52097780	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,226
5	52351413	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	52387150	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	52389455	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	52856504	.	G	C	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
5	52942083	.	A	C	1114.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1143,78,0
5	52942197	.	A	G	1293.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1322,93,0
5	53180890	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	53181731	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:155,0,98
5	53814052	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
5	53814394	.	T	C	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
5	53815066	.	C	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,226
5	53815240	.	G	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.302;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:108,0,503
5	53839580	.	C	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,155
5	54459961	.	A	G	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:504,39,0
5	54572163	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:53:53,0,173
5	54603249	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,313
5	54603822	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
5	54674296	.	A	G	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.718;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:356,0,370
5	54960609	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	54960673	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:120,0,72
5	54960687	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	54997223	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	55240858	.	G	A	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
5	56111751	.	G	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
5	56161787	.	G	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
5	56177443	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
5	56177743	.	G	A	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
5	56178217	.	A	C	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
5	56190531	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	56190986	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	56191200	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	56206073	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	56207123	.	T	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
5	56209735	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,160
5	56218029	.	C	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
5	56218551	.	C	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
5	56526783	.	G	A	768.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.214;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:50:797,50,0
5	56559238	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,283
5	57750267	.	A	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
5	57750350	.	C	G	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:313,0,293
5	57751443	.	A	G	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.482;DP=19;FS=2.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=24.83;ReadPosRankSum=-0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:500,0,212
5	57753116	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,226
5	57753149	.	A	G	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=1.356;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:392,0,207
5	57755703	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.615;DP=19;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.845;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:68:68,0,576
5	60039175	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	60827354	.	G	C	174.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:203,0,23
5	61649188	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,187
5	61685949	.	C	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:122,0,33
5	61686397	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:78,0,67
5	61772535	.	G	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
5	61923328	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:118,0,31
5	64023981	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
5	64064411	.	G	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:180,0,164
5	64064943	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:114,0,311
5	64097145	.	C	G	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:129,0,528
5	64851665	.	A	T	158.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:187,0,25
5	64858955	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	64863688	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	64875105	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:75,0,34
5	64881936	.	A	G	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
5	64885885	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	64886546	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:117,0,68
5	64920803	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	64951033	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	64956557	.	C	A	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:275,0,106
5	64961020	.	A	G	389.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=32.48;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:6:417,6,0
5	65018126	.	C	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
5	65108215	.	A	G	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.668;DP=24;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:307,0,490
5	65119875	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,190
5	65222207	.	C	G	143.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:172,15,0
5	65317181	.	C	T	729.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:758,54,0
5	65350044	.	A	G	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:201,0,330
5	67522722	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	67596088	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,192
5	68391550	.	G	T	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
5	68417643	.	C	T	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
5	68419054	.	A	T	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:540,39,0
5	68471247	.	G	A	1828.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1857,129,0
5	68484145	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	68531253	.	C	T	518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:547,39,0
5	68564085	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	68576744	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.441;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:81:81,0,554
5	68577720	.	T	G	14.05	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:16:42,0,16
5	68577791	.	T	C	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:219,0,100
5	68577894	.	T	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
5	68577994	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,136
5	68578428	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	68600699	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	68602746	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	68629715	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	68629722	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	68651275	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	68651276	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	68664647	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	68665736	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	68666912	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
5	68715310	.	C	T	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
5	68856116	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,152
5	69372613	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:72,0,34
5	70503941	.	C	A	134.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:163,0,26
5	70751818	.	T	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
5	70800475	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	70806711	.	C	G	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
5	70806958	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	70837295	.	A	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
5	70858194	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
5	70872042	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	70945075	.	A	G	1636.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1665,117,0
5	70952934	.	C	T	1065.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1094,75,0
5	70953280	.	G	T	904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=-1.734;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:39:933,39,0
5	70953930	.	G	C	1202.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1231,84,0
5	71146757	.	T	C	2104.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2133,150,0
5	71146882	.	T	C	3228.29	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:3256,223,0
5	71146889	.	A	G	3228.29	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:3256,223,0
5	71515616	.	A	G	829.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:858,60,0
5	71519664	.	C	T	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.423;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.846	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:205,0,581
5	71524163	.	A	T	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:361,0,484
5	71654855	.	G	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
5	72144005	.	C	T	518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:547,42,0
5	72165227	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	72184098	.	C	T	839.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:868,60,0
5	72202235	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	73072354	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	73142296	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	73144845	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
5	73179672	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
5	73237502	.	C	G	91.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:120,0,25
5	73924269	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,186
5	73930751	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
5	73931246	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,185
5	73933174	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	73934224	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	73981270	.	T	C	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=29.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.311	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:261,0,354
5	73992881	.	A	G	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.632;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:130,0,405
5	74046464	.	C	T	439.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.350;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:468,0,287
5	74062881	.	C	T	202.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:231,0,25
5	74063154	.	C	G	429.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=-1.605;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=17.19;ReadPosRankSum=2.040	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:458,0,455
5	74069863	.	A	G	722.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=-1.271;DP=33;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=21.90;ReadPosRankSum=1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,20:33:99:751,0,471
5	74076210	.	T	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:127,0,105
5	74652199	.	A	G	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.118;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:305,0,783
5	74656539	.	T	C	449.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.974;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.974	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:478,0,478
5	74895474	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
5	75003678	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:117,0,73
5	75375787	.	C	T	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
5	75923285	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	75923294	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	75923307	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	75948650	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	75960865	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	76115069	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
5	76343999	.	T	C	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=23.29;ReadPosRankSum=-1.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:331,0,129
5	76360212	.	C	T	176.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:205,0,24
5	76370605	.	T	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
5	76734084	.	C	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:254,0,138
5	77412011	.	A	G	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:360,0,101
5	77425028	.	A	T	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
5	77684726	.	G	A	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:270,0,232
5	77745855	.	T	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
5	77745857	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
5	77782447	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:71:71,0,218
5	77784738	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,149
5	78181477	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
5	78532658	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:70,0,35
5	78573790	.	A	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:59,0,36
5	78617534	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,77
5	78908793	.	C	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,228
5	78936938	.	T	C	309.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=30.92;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:10:337,0,10
5	78959740	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	78981550	.	G	T	508.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:537,36,0
5	78982188	.	T	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,149
5	79030045	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	79273042	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
5	79274595	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	79276149	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	79278596	.	T	C	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
5	79436186	.	A	G	199.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:228,18,0
5	79436459	.	G	A	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
5	79437329	.	G	A	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
5	79437439	.	C	T	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:544,39,0
5	79437621	.	A	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
5	79437669	.	C	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.68;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:145,0,110
5	79438179	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
5	79438312	.	G	C	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
5	79438417	.	C	T	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
5	79438705	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
5	79733079	.	T	C	285.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:314,21,0
5	79734297	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
5	79734409	.	G	A	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
5	79737407	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	79737412	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	79742353	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	79745469	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	79765676	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	79765681	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	79774171	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
5	79774906	.	T	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
5	79776217	.	A	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
5	79776887	.	G	C	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
5	79777777	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:147,0,56
5	79778376	.	G	A	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
5	79778441	.	G	A	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
5	79778741	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	79781073	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	79923329	.	T	C	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:344,0,290
5	79923334	.	T	C	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.079;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:38:38,0,906
5	79923385	.	A	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:306,0,223
5	79923430	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:52:52,0,269
5	79923826	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
5	79923912	.	T	C	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,482
5	79923919	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,516
5	79950508	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
5	79950512	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
5	79950781	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:109,0,72
5	80149981	.	A	G	417.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:446,30,0
5	80395918	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	81305835	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	81305851	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	81550043	.	G	A	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
5	81570394	.	G	A	428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:457,36,0
5	81570712	.	G	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
5	81571669	.	C	T	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
5	81571846	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
5	82350642	.	C	T	508.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:537,39,0
5	82352056	.	C	T	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
5	87495714	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	87568447	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	87576139	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	87581588	.	A	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	87705929	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	89703641	.	C	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:90:90,0,334
5	89769728	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	89812676	.	T	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:149,0,73
5	89943571	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	89988445	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	89988504	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	89989779	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	89990324	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	93018966	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:120,0,28
5	93562147	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	93562148	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	94799799	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,117
5	94799853	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,406
5	94799882	.	C	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,286
5	94800234	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,113
5	94826655	.	C	A	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:206,0,335
5	94861118	.	G	C	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.974;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:236,0,589
5	94876511	.	C	G	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:259,0,343
5	95084131	.	G	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:165,0,498
5	95091194	.	C	T	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.280;DP=19;FS=12.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:336,0,775
5	95091201	.	A	G	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:336,0,775
5	95109231	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	95124858	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
5	95125536	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
5	95129056	.	A	G	387.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.035;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:416,0,371
5	95129093	.	C	T	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:266,0,290
5	95131401	.	A	G	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
5	95145424	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:73,0,35
5	95152313	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
5	95236415	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	96086334	.	G	C	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:645,45,0
5	96100764	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	96109244	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	96109610	.	G	A	357.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:386,30,0
5	96109935	.	T	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
5	96110211	.	A	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	96111228	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	96118852	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	96118866	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	96120259	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	96121524	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:76,0,32
5	96124330	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	96126308	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
5	96139250	.	C	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
5	96391800	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
5	96391810	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	96392067	.	T	A	572.73	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:610,60,0
5	96498783	.	G	A	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
5	96503418	.	C	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:146,0,105
5	96503523	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
5	96512865	.	T	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
5	96512871	.	T	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:267,18,0
5	96513471	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	98130541	.	C	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,225
5	98131505	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:204,0,68
5	99382671	.	T	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
5	99387319	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	99387322	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	99387334	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	99387336	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	99387337	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	102201590	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:73,0,67
5	102365186	.	G	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:162,0,67
5	102440259	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
5	102537379	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,143
5	102538752	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,328
5	102596720	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
5	102600569	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	102606942	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
5	107006446	.	T	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
5	107006644	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	107196976	.	G	A	302.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.65;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:331,0,18
5	108713970	.	C	T	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
5	108713982	.	T	C	882.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:911,63,0
5	108714298	.	T	C	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
5	108719151	.	G	A	902.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:931,66,0
5	109110537	.	T	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,152
5	109181682	.	A	T	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,152
5	109202725	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,108
5	109203042	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,92
5	109204024	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:145,0,114
5	109204107	.	G	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,154
5	110090309	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	110099456	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
5	110100669	.	T	G	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
5	110463626	.	T	G	22.75	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,217
5	110463631	.	T	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,217
5	110834947	.	G	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:50:50,0,183
5	111065597	.	C	T	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
5	111499270	.	A	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:93:93,0,259
5	111530284	.	A	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:95:191,0,95
5	111545670	.	C	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:194,0,194
5	111754851	.	C	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,105
5	112176559	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	112203564	.	T	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,180
5	112204896	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	112212151	.	G	A	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,250
5	112212608	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=-0.361;DP=26;FS=16.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:253,0,701
5	112213071	.	G	T	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:293,0,448
5	112213805	.	C	G	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.054;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:390,0,839
5	112214093	.	C	T	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:288,0,461
5	112257908	.	T	C	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-0.247;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:382,0,679
5	112312676	.	T	C	186.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:215,18,0
5	112343544	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	112349070	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
5	112349379	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
5	112350707	.	G	A	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
5	112354519	.	T	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:132,0,107
5	112354898	.	C	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
5	112355668	.	C	G	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
5	112355908	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
5	112356649	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	112868693	.	C	A	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.599;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:292,0,110
5	112899702	.	A	G	174.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.14;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:203,0,19
5	112907748	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	112917278	.	T	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,180
5	112929013	.	T	A	328.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.89;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:16:357,0,16
5	112929694	.	G	A	93.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:22:122,0,22
5	112930092	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	112930565	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:153,0,111
5	114460580	.	C	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
5	114462355	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,74
5	114508588	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	114508952	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	114517643	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	114542108	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	114546906	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	114916090	.	G	A	43.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:72,0,27
5	114947114	.	T	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
5	114951080	.	T	G	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
5	114951140	.	T	G	668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:697,48,0
5	114951553	.	A	G	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
5	115164484	.	G	A	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:63:146,0,63
5	115165913	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	115166713	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
5	115171435	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	115173678	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	115176589	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	115177014	.	T	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
5	115177207	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:140,0,365
5	115635788	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	115642097	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	115748400	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	115805329	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	116790756	.	C	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
5	116810920	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	116816744	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
5	116821562	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	118172345	.	G	T	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
5	118173652	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
5	118174003	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	118175020	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
5	118175166	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	118175210	.	T	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
5	118176362	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:67,0,62
5	118484804	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:76,0,71
5	118583487	.	G	A	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
5	118728953	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	118811533	.	G	A	476.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.799;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.020;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,14:37:99:505,0,863
5	118847140	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:113,0,70
5	118860938	.	T	C	670.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.824;DP=36;FS=10.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:699,0,635
5	118861713	.	A	G	701.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.119;DP=31;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,19:30:99:730,0,392
5	118867938	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	118868096	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	121777891	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	121790168	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	121808363	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	122013114	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
5	122169448	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	122343870	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,142
5	122358419	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:114,0,31
5	122359190	.	G	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,278
5	122359640	.	T	C	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.832	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,12:38:99:395,0,982
5	122372402	.	G	C	117.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:146,0,21
5	122417136	.	G	C	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
5	122681279	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	122681834	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:114,0,28
5	122682348	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
5	122950330	.	G	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
5	122950911	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
5	122990803	.	T	C	985.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1014,72,0
5	122990814	.	T	C	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1080,72,0
5	122990816	.	A	G	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1080,72,0
5	125825079	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	125825322	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	125825932	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	125826191	.	T	C	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
5	125827230	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:156,0,30
5	125827916	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	125827921	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	125828803	.	A	G	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
5	125879931	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
5	125961494	.	A	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.583;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:211,0,219
5	125962084	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,155
5	126171999	.	T	C	1330.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1359,93,0
5	126172195	.	C	T	712.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.187;DP=19;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=29.26;ReadPosRankSum=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:18:741,18,0
5	126847107	.	A	G	77.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:104,2,0
5	126887569	.	G	A	515.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.661;DP=23;FS=6.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:544,0,300
5	126887959	.	C	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:152,0,142
5	126888369	.	A	G	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
5	126888609	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:112,0,72
5	126888661	.	C	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,153
5	126888693	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
5	126888773	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:101,0,118
5	126888852	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,159
5	126889181	.	T	C	219.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.717;DP=13;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:257,0,191
5	126889370	.	C	T	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:145,0,286
5	126889640	.	A	G	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-1.528;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:422,0,272
5	126889986	.	A	G	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:344,0,254
5	126890046	.	T	C	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-1.702;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:275,0,476
5	126890472	.	C	T	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:281,0,143
5	126890541	.	T	C	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:392,0,230
5	127302466	.	A	G	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
5	127352807	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	127352990	.	G	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:111,0,31
5	127358568	.	C	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:60,0,76
5	127512063	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	127512873	.	A	C	88.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:117,0,25
5	127522543	.	C	T	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:134,0,384
5	127524018	.	T	C	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:170,0,429
5	127524055	.	T	C	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=1.642;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:124,0,523
5	127524944	.	T	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.259;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:147,0,189
5	128371389	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	128430384	.	T	G	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
5	128430757	.	T	C	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=-0.271;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:408,0,588
5	128449644	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:142,0,139
5	129040056	.	A	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:120,0,28
5	129073197	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	130325624	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	130325626	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	130325633	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	130495683	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:155,0,73
5	130496139	.	C	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
5	130980027	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	131008194	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
5	131066725	.	C	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
5	131526190	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
5	131534381	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	131534499	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	131562900	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:104,0,170
5	131563501	.	C	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:211,0,176
5	131640813	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	131656997	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	131684175	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	131699867	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	131699958	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
5	131705458	.	C	G	17.84	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:46,0,31
5	131710399	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	131715570	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
5	131719999	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
5	131724950	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
5	131729118	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	131730807	.	T	C	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
5	131789516	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	131892979	.	G	A	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:513,39,0
5	132028858	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
5	132029491	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	132030667	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	132098242	.	A	G	1095.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1124,78,0
5	132150948	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	132160057	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
5	132161294	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
5	132207860	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	132215477	.	A	C	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:561,39,0
5	132216264	.	C	T	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:357,0,100
5	132222728	.	T	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:148,0,31
5	132232315	.	G	A	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:170,0,383
5	132334252	.	A	G	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:181,0,315
5	132437531	.	C	T	846.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-1.971;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=20.16;ReadPosRankSum=1.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,23:42:99:875,0,690
5	132440285	.	C	G	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=24.38;ReadPosRankSum=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:98:272,0,98
5	132441302	.	A	G	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:288,0,372
5	132534373	.	A	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
5	132556082	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	132559950	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	132561468	.	C	A	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:228,0,190
5	132576442	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	132631678	.	C	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
5	132652281	.	C	T	91.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:120,0,26
5	132728928	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	132729277	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	133307861	.	C	A	1081.73	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1119,116,0
5	133310248	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
5	133495562	.	T	C	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
5	133512384	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	133531028	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	133531449	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	133538129	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	133538600	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	133539491	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	133540726	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	133560931	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	133561589	.	G	C	2139.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2168,162,0
5	133563318	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	133887780	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:100,0,334
5	133912132	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	133915477	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
5	133915761	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
5	133916719	.	A	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:97:97,0,276
5	133937378	.	G	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,99
5	133939541	.	T	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
5	133942492	.	T	C	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:303,0,344
5	134076812	.	G	A	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-1.773;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:207,0,532
5	134223593	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:229,0,186
5	134235613	.	A	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
5	134260314	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
5	134260869	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	134262778	.	C	T	11.18	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:18:39,0,18
5	134364996	.	G	T	690.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.192;DP=49;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,21:49:99:719,0,1033
5	134367540	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:73,0,35
5	134368103	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	134611916	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	134692244	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	134761276	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	135178124	.	T	C	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
5	135178142	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
5	135212835	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
5	135392426	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
5	135514055	.	A	G	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:44:361,0,44
5	135514216	.	A	G	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:55:394,0,55
5	135514489	.	T	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:155,0,68
5	135515708	.	A	G	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:88:358,0,88
5	135515738	.	T	C	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=27.23;ReadPosRankSum=-1.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:355,0,101
5	135515975	.	T	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,189
5	135516188	.	T	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,115
5	135516203	.	T	C	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:62:287,0,62
5	135516282	.	G	A	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:56:242,0,56
5	135516707	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:162,0,358
5	135516836	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,223
5	135516919	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,227
5	135517150	.	T	C	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:298,0,326
5	135518242	.	G	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:197,0,143
5	137088049	.	T	C	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.999;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:233,0,704
5	137088224	.	A	C	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.290	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:402,0,496
5	137275115	.	G	A	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-1.359;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:402,0,258
5	137275199	.	T	C	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:236,0,225
5	137347498	.	G	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
5	137500665	.	G	A	556.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.766;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:585,0,435
5	137522945	.	C	T	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:130,0,388
5	137524130	.	G	C	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.000;QD=23.27;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:354,0,172
5	137652606	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	137667345	.	A	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:151,0,56
5	137682714	.	T	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.489;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:342,0,257
5	137683305	.	T	C	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:223,0,244
5	137684121	.	G	T	734.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:763,54,0
5	137708434	.	C	T	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.151;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:424,0,176
5	137717265	.	G	A	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
5	137733891	.	A	G	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:279,0,183
5	137754695	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=1.859;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.060;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:195,0,422
5	137771747	.	A	G	1068.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1097,75,0
5	137842787	.	A	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
5	137892170	.	G	A	543.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.288;DP=57;FS=8.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=9.54;ReadPosRankSum=1.893	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,17:57:99:572,0,1583
5	137895218	.	C	T	82.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:16:111,0,16
5	137911068	.	G	C	605.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-0.377;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:634,0,435
5	138185293	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	138281261	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
5	138378394	.	G	A	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.760;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=19.14;ReadPosRankSum=-1.216	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:411,0,331
5	138619224	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:156,0,30
5	138619469	.	G	C	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:78,0,25
5	138643062	.	T	A	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.289;DP=24;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:167,0,344
5	138665756	.	G	A	824.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-1.438;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=22.29;ReadPosRankSum=1.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,22:37:99:853,0,520
5	138666372	.	T	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:155,0,67
5	138728483	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
5	138728533	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
5	138730037	.	T	C	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
5	138730407	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,96
5	138731979	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
5	138732103	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	138733811	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	138734817	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	138765509	.	A	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
5	139042019	.	C	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
5	139055009	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
5	139936760	.	G	T	493.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=17.03;ReadPosRankSum=-0.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:522,0,447
5	139941228	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
5	139941318	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:72,0,69
5	139944826	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	139948616	.	T	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:135,0,193
5	140048267	.	T	C	674.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:703,51,0
5	140057535	.	G	A	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.877;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.094	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:436,0,468
5	140201420	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	140698156	.	T	C	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:837,57,0
5	140895071	.	G	C	698.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.473;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.603	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,19:30:99:727,0,384
5	141014494	.	T	C	430.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=1.358;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=23.93;ReadPosRankSum=-1.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:459,0,213
5	141019110	.	C	A	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.893;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:292,0,296
5	141019569	.	G	C	164.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:20:193,0,20
5	141019830	.	C	G	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:262,0,216
5	141242633	.	C	G	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
5	141309824	.	G	A	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:211,0,292
5	141337225	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	141338771	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	141343853	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	141348708	.	C	T	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
5	141367807	.	G	C	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
5	141367898	.	G	A	835.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:864,60,0
5	141368091	.	C	T	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
5	141380348	.	C	T	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:488,33,0
5	141380728	.	C	T	949.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:978,69,0
5	141391532	.	G	A	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.495;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:342,0,439
5	141488359	.	G	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:55:143,0,55
5	141531735	.	C	T	1193.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1222,84,0
5	141690524	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	141690819	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
5	141691011	.	C	T	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:76,0,24
5	141691371	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	142421415	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	142658156	.	C	A	46.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
5	142783013	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	143539785	.	T	C	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=1.448;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:303,0,268
5	145437574	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	145439647	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	145442572	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
5	145458052	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	145465914	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	145471702	.	T	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
5	145493265	.	A	T	60.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:88,9,0
5	145499996	.	C	T	953.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:982,69,0
5	145508340	.	A	G	1476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1505,108,0
5	145508636	.	T	C	1185.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1214,81,0
5	145508637	.	A	C	1185.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1214,81,0
5	145519821	.	G	A	1433.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1462,102,0
5	145519948	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	145521133	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
5	145521579	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	145522089	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
5	145523105	.	G	A	1113.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1142,78,0
5	145524513	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	145524514	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	145526608	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
5	145539996	.	T	G	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:989,69,0
5	145543972	.	G	A	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
5	145561004	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	145562143	.	G	A	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:686,48,0
5	145665917	.	T	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
5	145668041	.	C	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
5	145668298	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
5	145668725	.	A	G	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
5	145881983	.	G	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:117,0,32
5	145890028	.	A	G	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
5	145890455	.	C	T	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.144	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:348,0,294
5	148508860	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	148731218	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
5	148733364	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:94,0,31
5	148745136	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	148748728	.	G	A	374.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:27:403,27,0
5	148748736	.	A	G	374.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:27:403,27,0
5	148882195	.	C	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=24.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:199,0,61
5	148883634	.	T	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:143,0,98
5	148989122	.	C	T	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:221,0,219
5	149001551	.	A	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=-1.517;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:210,0,228
5	149001950	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	149002067	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	149008403	.	A	G	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.260;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:421,0,432
5	149008521	.	A	G	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.344;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:129,0,405
5	149012051	.	C	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,150
5	149012782	.	G	A	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:292,0,335
5	149013844	.	T	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,227
5	149112953	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	149212614	.	G	T	84.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:18:113,0,18
5	149229822	.	G	T	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:122,0,32
5	149230730	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	149230745	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
5	149230952	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
5	149231519	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:57:81,0,57
5	149231521	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:57:81,0,57
5	149231545	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
5	149231786	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:158,0,69
5	149232525	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:105,0,73
5	149233110	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
5	149233186	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,106
5	149234235	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	149234236	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	149234245	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:34:39,0,34
5	149360877	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	149363214	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
5	149363218	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	149363219	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	149374932	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:110,0,63
5	149380158	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,94
5	149380159	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,94
5	149389968	.	G	A	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:57:196,0,57
5	149409294	.	C	T	111.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:15:140,0,15
5	149432039	.	C	G	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.634;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:489,0,349
5	149432040	.	G	A	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.423;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:489,0,349
5	149432067	.	G	T	572.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.711;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=31.82;ReadPosRankSum=1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:72:601,0,72
5	149432613	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:115,0,65
5	149754991	.	C	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:254,0,337
5	149755340	.	G	T	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=-1.057;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:207,0,590
5	149755421	.	A	G	453.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.974;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:482,0,481
5	149772280	.	C	G	474.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.623;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=27.93;ReadPosRankSum=-1.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:503,0,124
5	149907533	.	T	G	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=3.183;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:184,0,290
5	149907602	.	A	G	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:303,0,384
5	149919739	.	G	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.129;DP=21;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:180,0,561
5	149919778	.	G	A	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-1.867;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:163,0,345
5	149935171	.	T	C	854.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:883,63,0
5	149935680	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.349;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:150,0,589
5	150136006	.	G	A	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:382,0,318
5	150409989	.	C	T	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.289;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:248,0,424
5	150410135	.	G	A	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:208,0,242
5	150410219	.	C	A	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-2.016;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:361,0,474
5	150425467	.	G	A	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:422,0,276
5	150436503	.	G	C	1119.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1148,84,0
5	150473584	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	150479387	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
5	150480520	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
5	150480925	.	C	G	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.132;DP=19;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:206,0,480
5	150487053	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	150489390	.	A	G	784.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.438;DP=48;FS=16.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,22:48:99:813,0,991
5	150518988	.	G	A	756.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=-1.258;DP=50;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,21:50:99:785,0,1126
5	150868241	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:68,0,37
5	150870603	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,265
5	151151544	.	A	G	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.643;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:359,0,336
5	151184701	.	C	T	981.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.817;DP=28;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,25:28:36:1010,0,36
5	151185433	.	T	C	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:228,0,169
5	151188158	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,155
5	151190104	.	G	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:188,0,221
5	153371405	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	153371463	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	153372525	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	153413390	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
5	153417959	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	153429169	.	A	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
5	153429187	.	T	A	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
5	153429459	.	T	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
5	153432733	.	T	C	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
5	153432970	.	C	T	737.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:766,54,0
5	153434018	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
5	153434407	.	A	G	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
5	153434443	.	A	G	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
5	153435527	.	G	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:230,0,177
5	153435738	.	G	A	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
5	153435838	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,204
5	153435863	.	G	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,158
5	153712867	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	153767845	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	153771730	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	153772081	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
5	153772207	.	G	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	153772854	.	A	G	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:77,0,26
5	153772868	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,85
5	153772869	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,85
5	153774120	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	153774521	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:73,0,71
5	153775403	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,101
5	153777218	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:121,0,31
5	153783753	.	C	T	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:339,0,387
5	153792490	.	C	T	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.833;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:280,0,493
5	153794222	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
5	153796875	.	A	G	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=21.85;ReadPosRankSum=-1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:356,0,222
5	153797049	.	G	A	296.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.074;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:325,0,545
5	153797277	.	C	T	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.821;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:275,0,365
5	153797880	.	C	T	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:296,0,400
5	153798368	.	G	C	522.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.954;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:551,0,500
5	153799165	.	T	C	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=1.172;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:375,0,385
5	153815419	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	153837482	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,157
5	153837908	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	153840472	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,116
5	154135652	.	G	A	435.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-2.397;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.81;ReadPosRankSum=2.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:464,0,192
5	154193735	.	A	G	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:873,63,0
5	154268902	.	C	T	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
5	154291409	.	C	T	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
5	154300940	.	A	C	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
5	154306972	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
5	156693562	.	C	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
5	156821217	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
5	157164962	.	T	C	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
5	157166649	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:115,0,97
5	157168770	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	157182897	.	C	A	32.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
5	157184780	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
5	157213497	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:186,0,153
5	157214187	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,194
5	159436161	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:185,0,99
5	159491520	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	159825190	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	159829058	.	A	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:140,0,221
5	159829672	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
5	162868910	.	T	G	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.482;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:207,0,515
5	162890953	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
5	167084522	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	167084527	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	167084532	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	167690217	.	A	G	86.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:115,0,23
5	167740009	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	167850748	.	A	G	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=2.156;DP=28;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=5.13;ReadPosRankSum=-2.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,6:28:99:172,0,821
5	167868779	.	A	G	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.384;DP=32;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,13:32:99:431,0,696
5	167868809	.	C	T	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.074;DP=34;FS=5.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,11:34:99:370,0,889
5	167891830	.	T	C	447.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-2.839;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=12.44;ReadPosRankSum=2.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,14:36:99:476,0,826
5	167978416	.	C	T	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.011;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:343,0,257
5	167980169	.	C	T	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.518;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:205,0,584
5	167980525	.	A	G	862.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:891,63,0
5	167983347	.	T	C	1114.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1143,84,0
5	167985613	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	167991954	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
5	167991958	.	C	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:147,0,62
5	168017079	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	168017080	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	168017081	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	168098463	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	169021610	.	C	T	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:778,54,0
5	169028481	.	T	C	830.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:859,60,0
5	169029086	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	169029660	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
5	169031150	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
5	169031218	.	G	T	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
5	170816401	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	170819122	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	170832637	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
5	170835866	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	171533656	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:119,0,28
5	171636926	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,272
5	171637153	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:189,0,274
5	171637734	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
5	171637960	.	G	C	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=1.780;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:301,0,358
5	171638165	.	T	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:97:97,0,261
5	171661180	.	C	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=-0.262;DP=20;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:143,0,602
5	171710717	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:108,0,64
5	171762100	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	171762777	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	171764158	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	172116576	.	G	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.80;ReadPosRankSum=-1.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:257,0,148
5	172116881	.	C	G	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:166,0,209
5	172116969	.	A	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:281,0,136
5	172117144	.	A	G	294.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:323,0,18
5	172196711	.	G	T	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
5	172327494	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	172344999	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	172349937	.	G	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,105
5	172352369	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
5	172353763	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,150
5	172354229	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:152,0,28
5	172354883	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
5	172355039	.	T	C	129.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:158,0,20
5	172355670	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:115,0,154
5	172355680	.	T	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:99:115,0,154
5	172358365	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	172360695	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.97;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:105,0,147
5	172361688	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,146
5	172395581	.	C	T	761.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=-2.110;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=27.21;ReadPosRankSum=1.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,20:28:99:790,0,269
5	172742792	.	C	A	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.775;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=25.40;ReadPosRankSum=2.115	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:587,0,235
5	172746086	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
5	172748359	.	G	C	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
5	172748540	.	T	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
5	172748571	.	G	C	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
5	172748679	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
5	172748739	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
5	172749522	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
5	172749695	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	173036786	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:71,0,36
5	173316729	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
5	173931151	.	C	T	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
5	173935749	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	173936213	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	173952510	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	173953328	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
5	173953424	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
5	173955422	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	174157096	.	A	G	687.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=6.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.735	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:44:716,44,0
5	174157711	.	A	G	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
5	174157732	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	174157762	.	G	C	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
5	174158470	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
5	174541795	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	174541820	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	174955015	.	C	T	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
5	174955746	.	G	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
5	175386586	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	175617224	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	175617229	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:80,6,0
5	175625929	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	175773287	.	T	C	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
5	175777423	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	175781410	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	175923354	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	175923587	.	A	G	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-0.170;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,7:34:99:209,0,1069
5	175935316	.	T	C	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:880,63,0
5	175935729	.	C	T	849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:878,60,0
5	175935735	.	A	G	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.196;DP=20;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:290,0,476
5	175936317	.	C	A	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-1.300;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:219,0,772
5	175936516	.	T	C	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:460,0,251
5	175954708	.	G	A	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.391;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=19.95;ReadPosRankSum=1.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:567,0,421
5	175955814	.	A	G	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:45:564,45,0
5	175956177	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:123,0,143
5	175956271	.	A	C	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
5	175960676	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:96,0,32
5	175968614	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
5	175969053	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
5	176024372	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
5	176024880	.	C	T	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.041;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=23.38;ReadPosRankSum=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:379,0,173
5	176025938	.	T	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
5	176080430	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:158,0,31
5	176080560	.	A	C	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
5	176082381	.	C	T	124.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:153,0,21
5	176082536	.	A	G	130.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:159,0,21
5	176083997	.	G	A	193.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:20:222,20,0
5	176084160	.	A	G	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
5	176084894	.	C	T	1352.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1381,96,0
5	176085168	.	A	G	1179.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1208,84,0
5	176085207	.	T	C	788.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:817,60,0
5	176085391	.	G	A	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:848,63,0
5	176085423	.	C	G	1189.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1218,84,0
5	176085470	.	A	G	1146.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1175,81,0
5	176378574	.	G	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-0.118;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:55:55,0,355
5	176492557	.	G	A	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:243,0,415
5	176516953	.	A	G	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.588;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:312,0,284
5	176517170	.	G	A	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.97;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:196,0,68
5	176517292	.	A	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,144
5	176517326	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,167
5	176517461	.	T	G	412.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-2.742;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=13.32;ReadPosRankSum=2.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:441,0,664
5	176517797	.	C	T	1232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.192;DP=45;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=27.39;ReadPosRankSum=-0.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,33:45:99:1261,0,401
5	176518784	.	C	T	752.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-1.292;DP=38;FS=16.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,21:38:99:781,0,617
5	176525029	.	G	C	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:514,0,314
5	176684147	.	C	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:88:88,0,440
5	176715855	.	C	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-1.629;DP=21;FS=8.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.571;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:274,0,481
5	176721198	.	T	C	799.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:828,57,0
5	176726002	.	T	C	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
5	176728400	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	176733616	.	T	C	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
5	176735187	.	G	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
5	176737720	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
5	176739218	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	176740244	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	176863519	.	G	C	912.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:941,66,0
5	176867943	.	A	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
5	176875956	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
5	176877624	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	176879211	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
5	176882958	.	C	T	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:125,0,326
5	176885178	.	A	G	1992.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2021,147,0
5	176885484	.	C	A	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=-0.384;DP=41;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=13.77;ReadPosRankSum=0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:593,0,917
5	176885499	.	T	C	1849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1878,129,0
5	176894756	.	C	T	2091.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2120,150,0
5	176912073	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
5	176914240	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
5	176916516	.	C	T	560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:589,42,0
5	176919607	.	C	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.524;DP=20;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:154,0,592
5	176929185	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	176929582	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	176930651	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	176937308	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
5	176938681	.	C	T	528.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.248;DP=14;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,13:14:15:557,15,0
5	176939735	.	A	G	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
5	176940384	.	G	A	894.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:923,69,0
5	176947153	.	C	T	613.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:642,45,0
5	176948717	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	176949322	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	176950794	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
5	176950879	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
5	176951276	.	A	G	593.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:622,42,0
5	176962422	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:74,0,35
5	176969625	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
5	176970435	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	176970803	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
5	176971073	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
5	176972620	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	176973151	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
5	176975140	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	177022652	.	A	G	2180.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2209,154,0
5	177023098	.	A	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:97,0,31
5	177030573	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:58:73,0,58
5	177031348	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:57:57,0,332
5	177033794	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
5	177033861	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
5	177035964	.	T	C	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.097;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.161	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:266,0,554
5	177037610	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:67,0,61
5	177037759	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:114,0,34
5	177038828	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
5	177043366	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
5	177050690	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	177375080	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
5	177377440	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
5	177378845	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:144,0,227
5	177384649	.	A	G	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.68;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:55:315,0,55
5	177386313	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	177386706	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	177390271	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
5	177391837	.	T	C	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
5	177391977	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	177398666	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:76,0,66
5	177402307	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	177405145	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	177409710	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
5	177412489	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	177482617	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:81,0,75
5	177482621	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:81,0,75
5	177482745	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,104
5	177547247	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	177549334	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:76,0,30
5	177549491	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
5	177551169	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,82
5	177551176	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,82
5	177551985	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
5	177552429	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:109,0,34
5	177570759	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	177575834	.	A	T	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.174	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:239,0,280
5	177577138	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
5	177634401	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	177658883	.	C	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
5	177658896	.	A	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,153
5	177658945	.	C	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
5	177659071	.	T	G	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:27:123,0,27
5	177659075	.	T	C	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:123,0,27
5	178049444	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	178156874	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
5	178157177	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
5	178157540	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
5	178157545	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
5	178157550	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	178157573	.	G	T	289.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:32:318,32,0
5	178294059	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:70:165,0,70
5	178294060	.	G	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:70:165,0,70
5	178310446	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
5	178311955	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
5	178311993	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	178313485	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	178313643	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	178313791	.	G	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
5	178340055	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
5	178360056	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
5	178507069	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	178507927	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
5	178979651	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
5	178986987	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	179033401	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
5	179034069	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
5	179034260	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
5	179041785	.	G	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.103;ClippingRankSum=-0.020;DP=33;FS=47.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=5.02;ReadPosRankSum=-3.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:194,0,738
5	179042971	.	A	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=1.638;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:147,0,112
5	179043041	.	C	G	254.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=32.92;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:283,0,23
5	179043075	.	T	C	254.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:23:283,0,23
5	179044292	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,121
5	179045142	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
5	179047143	.	G	A	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=-1.558;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=23.05;ReadPosRankSum=2.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:420,0,178
5	179047199	.	C	T	1171.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:84:1200,84,0
5	179047209	.	C	T	1171.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:84:1200,84,0
5	179049138	.	C	A	874.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:903,63,0
5	179049329	.	G	A	965.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:994,69,0
5	179049672	.	A	C	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:590,42,0
5	179049915	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	179049916	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
5	179050188	.	A	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
5	179051238	.	C	T	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
5	179054689	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	179056026	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	179056029	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:127,9,0
5	179126090	.	C	T	530.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.677;DP=50;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,18:50:99:559,0,1173
5	179156449	.	T	C	837.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.135;DP=70;FS=19.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,25:70:99:866,0,1765
5	179193970	.	C	T	47.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:76,0,22
5	179203933	.	A	G	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:82:82,0,387
5	179231248	.	T	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:135,0,360
5	179248774	.	A	C	193.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:12:221,0,12
5	179249099	.	T	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
5	179249110	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
5	179249433	.	T	C	170.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:199,0,26
5	179252537	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,74
5	179254247	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	179255970	.	G	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
5	179260153	.	C	T	1959.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-0.083;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=27.60;ReadPosRankSum=-0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,51:71:99:1988,0,654
5	179260213	.	G	A	1534.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-1.079;DP=76;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,43:76:99:1563,0,1154
5	179260478	.	C	G	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:65:218,0,65
5	179260494	.	G	A	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:230,0,62
5	179261001	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,155
5	179262108	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:105,0,138
5	179264731	.	T	C	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.516;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=29.78;ReadPosRankSum=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:88:475,0,88
5	179264915	.	G	T	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=29.34;ReadPosRankSum=-1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:54:351,0,54
5	179265261	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
5	179267949	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:100,0,156
5	179290154	.	G	C	648.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.437;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,18:39:99:677,0,798
5	179290845	.	T	G	1907.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1936,138,0
5	179295689	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:69,0,33
5	179297733	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	179297871	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
5	179305655	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:72,0,37
5	179309513	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	179409613	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:57:57,0,60
5	179417645	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	179425132	.	C	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:101,0,33
5	179498595	.	C	T	563.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,16:26:99:592,0,349
5	179661528	.	C	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,109
5	179661692	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:112,0,63
5	179662384	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:81:81,0,461
5	179662722	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
5	179663251	.	G	A	470.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-1.184;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,14:33:99:499,0,712
5	179670528	.	C	T	103.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:131,12,0
5	179673708	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,160
5	179678603	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
5	179684868	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	179688316	.	C	A	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
5	179721541	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
5	179721542	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
5	179721590	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,104
5	179991959	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
5	179996111	.	C	T	758.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:787,54,0
5	180001389	.	G	A	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:229,0,418
5	180002820	.	T	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.919;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:118,0,388
5	180004154	.	T	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=24.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:50:224,0,50
5	180004322	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:77,0,56
5	180004347	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:159,0,64
5	180218668	.	A	G	827.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:856,63,0
5	180235737	.	C	A	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:377,0,138
5	180258227	.	C	T	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=1.226;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.226	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:204,0,291
5	180258933	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
5	180262080	.	A	G	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.047;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:215,0,225
5	180272935	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
5	180273460	.	A	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
5	180274402	.	C	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
5	180274553	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
5	180274565	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
5	180276402	.	C	T	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
5	180278393	.	C	G	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
5	180287567	.	G	A	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
5	180287632	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
5	180287893	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
5	180288239	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
5	180650744	.	T	C	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:190,0,149
5	180651474	.	G	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:136,0,392
5	180661696	.	C	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:50:50,0,189
5	180666276	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:150,0,222
5	180668964	.	T	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:193,0,100
5	180669136	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:138,0,349
5	180670251	.	C	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,133
5	180680638	.	A	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:100,0,143
5	180681215	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
5	180686958	.	C	T	75.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:104,0,25
5	180687212	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,161
5	180687907	.	C	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
5	180690742	.	C	G	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
5	180708937	.	T	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
5	180711085	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
5	180711157	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
5	180711595	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
5	180713424	.	A	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
5	180713482	.	C	A	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
5	180714093	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
5	180714094	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
5	180714439	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
5	180717650	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
5	180717660	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:172,12,0
5	180812908	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	311938	.	C	T	403.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.156;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.311	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:88:432,0,88
6	349166	.	T	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
6	349343	.	T	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
6	350496	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
6	485586	.	C	T	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
6	485896	.	C	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
6	486193	.	G	A	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
6	763578	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	1692770	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	1742794	.	A	G	1095.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1124,81,0
6	2766144	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.456;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:44:44,0,347
6	2775431	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	2780961	.	A	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
6	2784571	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.104;DP=32;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:99:112,0,1003
6	2785659	.	G	A	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-0.917;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.121	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,5:25:99:130,0,768
6	2955802	.	T	C	637.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=-1.724;DP=22;FS=5.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,17:22:99:666,0,157
6	2958754	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	2959513	.	C	T	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-1.011;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=0.57;ReadPosRankSum=1.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,4:35:48:48,0,1237
6	2959974	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	2961069	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	2961142	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	2990373	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
6	3001354	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	3003914	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	3003915	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	3003917	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	3009944	.	A	G	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
6	3010390	.	C	T	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
6	3015790	.	A	G	706.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:735,51,0
6	3018174	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	3018459	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
6	3018704	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	3019654	.	T	C	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:480,33,0
6	3019927	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.056;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:78:78,0,645
6	3020415	.	A	G	511.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-0.509;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:540,0,137
6	3020430	.	C	G	524.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:81:553,0,81
6	3020444	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-2.267;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:152,0,520
6	3020689	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:45:77,0,45
6	3020765	.	G	A	244.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:273,0,22
6	3020792	.	G	A	491.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-1.444;DP=15;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:45:520,0,45
6	3020989	.	C	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
6	3021030	.	G	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
6	3021278	.	C	G	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:38:421,0,38
6	3021307	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,161
6	3021392	.	T	C	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.416;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=0.65;ReadPosRankSum=-0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,2:17:39:39,0,607
6	3021492	.	A	G	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
6	3022094	.	G	A	219.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.48;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:248,0,19
6	3022167	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:261,18,0
6	3022171	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:261,18,0
6	3022304	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	3022484	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,267
6	3022511	.	T	C	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
6	3022544	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,237
6	3022708	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:58:58,0,244
6	3022725	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.934;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,497
6	3023565	.	T	C	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:270,0,140
6	3023956	.	C	A	775.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:804,60,0
6	3077141	.	T	C	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:495,36,0
6	3114960	.	C	G	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
6	3138194	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	3152822	.	C	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.212;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:231,0,719
6	3153383	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:47:68,0,47
6	3259715	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	3260111	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
6	3261979	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
6	3261984	.	G	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:73,6,0
6	3262008	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3262415	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	3262811	.	C	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:115,0,63
6	3263491	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	3263830	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:119,0,71
6	3264101	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:36:120,0,36
6	3264288	.	A	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
6	3264487	.	T	C	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:619,45,0
6	3264502	.	G	C	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
6	3264526	.	C	T	514.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.992	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,13:14:32:543,0,32
6	3264527	.	T	C	514.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=28.95;ReadPosRankSum=-0.992	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,13:14:32:543,0,32
6	3264582	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	3264671	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
6	3264776	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
6	3265000	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	3265090	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
6	3265363	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
6	3265382	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	3265422	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3265426	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3265439	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	3266263	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
6	3266272	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:179,12,0
6	3266460	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
6	3266560	.	C	T	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
6	3266684	.	T	C	126.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.39;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:5:154,5,0
6	3266759	.	G	A	87.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:116,0,23
6	3266832	.	C	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
6	3266838	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
6	3266870	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
6	3266908	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:170,12,0
6	3266915	.	A	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:170,12,0
6	3267536	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3267557	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	3267615	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:82,6,0
6	3267618	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	3267710	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3270006	.	A	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:60:149,0,60
6	3270048	.	C	G	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
6	3270064	.	T	C	365.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:394,30,0
6	3270105	.	C	T	647.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:676,51,0
6	3270121	.	T	C	564.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:593,42,0
6	3270510	.	G	C	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
6	3271788	.	C	G	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
6	3272194	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.269;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:77:77,0,515
6	3284920	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
6	3287118	.	T	C	197.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:226,18,0
6	3292317	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3296898	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	3298568	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,80
6	3305408	.	A	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	3322602	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3322606	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	3727811	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	3991753	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	4016551	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	4021163	.	T	G	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
6	4021554	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	4044214	.	A	G	555.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.179;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:584,0,327
6	4063540	.	C	T	163.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:192,0,27
6	4064341	.	A	G	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
6	4115980	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,147
6	4343874	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	4942827	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	4943150	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	4948891	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
6	4952413	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	4995464	.	C	T	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:366,0,169
6	4998963	.	A	G	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:200,0,28
6	5043828	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	5045402	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
6	5109119	.	T	C	220.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.62;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:14:249,0,14
6	5109592	.	T	G	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
6	5260936	.	A	C	878.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=1.126;DP=27;FS=4.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=32.55;ReadPosRankSum=-1.399	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,23:27:96:907,0,96
6	5261292	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
6	5261681	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	5261845	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,129
6	5893162	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:120,0,32
6	6682662	.	A	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:73,0,35
6	7211818	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:149,0,113
6	7247248	.	T	C	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
6	7286019	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	7288297	.	G	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-1.659;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:200,0,636
6	7288544	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:78:78,0,533
6	7393452	.	C	T	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
6	7405508	.	G	A	380.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=31.73;ReadPosRankSum=-1.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:51:409,0,51
6	7563983	.	T	G	1807.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1836,126,0
6	7572262	.	A	G	1378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1407,96,0
6	7585967	.	G	C	1110.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:85:1139,85,0
6	7611618	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,117
6	7887914	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	7888328	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	7893287	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	8012812	.	A	G	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
6	8014990	.	T	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
6	8015129	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
6	8081021	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:119,0,64
6	8083494	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
6	8083899	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
6	8083978	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	8086636	.	A	G	90.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:119,0,20
6	8088625	.	C	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
6	8413890	.	A	G	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
6	8418800	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	8426373	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	8426951	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	8429197	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	8430049	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	8430577	.	A	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
6	8431818	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	8431838	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	8433499	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	8435295	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
6	8435901	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	8470489	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	8470537	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
6	8470549	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
6	10412188	.	T	C	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
6	10528794	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	10667123	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	10667124	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	10723449	.	A	C	1078.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-1.741;DP=38;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=28.39;ReadPosRankSum=0.260	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,32:38:99:1107,0,132
6	10724560	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	10731218	.	C	T	1317.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1346,93,0
6	10801388	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	11183896	.	T	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,121
6	11185257	.	A	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,267
6	11185533	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,357
6	11190626	.	A	G	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:52:52,0,379
6	11576933	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	11579664	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	11581595	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	11582632	.	A	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
6	12009211	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	12030957	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	12122645	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
6	12122773	.	T	C	177.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:206,0,24
6	12155510	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	12294258	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
6	12296255	.	G	T	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
6	13281753	.	A	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
6	13295536	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	13328651	.	G	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:45:45,0,278
6	13487231	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	13487631	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
6	13576708	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	13579828	.	A	C	213.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:242,21,0
6	13601528	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	13612803	.	C	T	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
6	13613311	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	13613783	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
6	13642999	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	13649762	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	13711279	.	A	G	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:504,42,0
6	13788407	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
6	13790812	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,349
6	13790822	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,112
6	14870670	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	14976622	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	14977206	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	15090035	.	C	G	198.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:227,0,25
6	15502083	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	15503575	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	15513482	.	G	A	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
6	16145325	.	A	G	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:168,0,491
6	16306202	.	A	G	57.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:85,9,0
6	16306359	.	C	G	123.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:152,0,25
6	16306751	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	16327615	.	A	G	199.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:228,18,0
6	17507670	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
6	17508824	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	17509670	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:116,0,75
6	17511947	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
6	17512054	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
6	17512506	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:39,0,38
6	17512547	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	17512642	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	17512830	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	17513954	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	17514637	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	17530551	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	17532973	.	A	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	17539418	.	G	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
6	17540443	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	17543302	.	A	G	674.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.757;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:703,0,202
6	17545255	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	17551377	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	17600619	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
6	17610090	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	17629004	.	T	C	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.046;DP=23;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:66:66,0,805
6	17629616	.	G	A	704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:733,51,0
6	17633061	.	C	T	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
6	17653814	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	17658333	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	17675246	.	T	C	754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:783,54,0
6	17722170	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	17759737	.	C	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,159
6	17759858	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,193
6	17760152	.	G	T	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:535,36,0
6	17764755	.	T	C	352.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.03;ReadPosRankSum=-1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:9:380,0,9
6	17770266	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	17781450	.	G	A	380.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=31.68;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:10:408,0,10
6	17788037	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:187,0,268
6	17794494	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:253,0,178
6	17815310	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	17834213	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,144
6	18139214	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
6	18161563	.	G	A	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
6	18215303	.	T	C	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
6	18225173	.	C	T	75.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-0.907;DP=38;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,5:38:99:104,0,1301
6	18237661	.	C	T	449.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.120;DP=54;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.062	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,15:54:99:478,0,1550
6	18264210	.	G	A	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=1.035;DP=34;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,8:34:99:244,0,961
6	18264658	.	G	A	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.224;DP=21;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:88:88,0,600
6	18387815	.	A	C	349.96	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=31.81;ReadPosRankSum=-0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:5:377,0,5
6	18399837	.	G	A	218.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:16:247,0,16
6	18457891	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	18465710	.	G	A	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
6	18466677	.	A	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
6	18467456	.	T	C	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:534,36,0
6	18467582	.	A	G	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
6	18467884	.	A	T	143	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:17:265,17,0
6	18468464	.	C	T	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
6	19837780	.	G	C	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.401;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:84:84,0,417
6	19840342	.	A	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:104,0,196
6	19841966	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	20492995	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,116
6	21201493	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,103
6	21231956	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
6	21595892	.	C	T	420.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.645;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:449,0,554
6	21596090	.	C	T	438.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.557;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=20.89;ReadPosRankSum=1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:467,0,255
6	24003022	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	24174955	.	G	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
6	24403196	.	T	C	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.054;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:374,0,172
6	24403455	.	C	T	795.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=-2.346;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=34.59;ReadPosRankSum=2.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,21:23:3:822,0,3
6	24405768	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	24418348	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.259;DP=25;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.037	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:99:100,0,819
6	24418786	.	T	C	696.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=7.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=34.84;ReadPosRankSum=-0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,18:20:31:725,0,31
6	24420778	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
6	24422082	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	24422918	.	A	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
6	24423424	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
6	24423824	.	C	T	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=-1.577;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:163,0,518
6	24424231	.	G	T	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:322,0,100
6	24424377	.	T	A	154.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:183,0,22
6	24424580	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
6	24424927	.	T	A	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:44:235,0,44
6	24425125	.	C	T	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:202,0,28
6	24425214	.	C	G	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
6	24425609	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	24425671	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
6	24425690	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	24426311	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	24430562	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	24500368	.	T	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
6	24503590	.	C	T	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
6	24534193	.	C	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:200,0,64
6	24535780	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
6	24650671	.	C	T	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
6	24650731	.	T	G	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:826,60,0
6	24650761	.	A	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,312
6	24653376	.	G	A	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:822,57,0
6	24653382	.	C	A	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:57:822,57,0
6	24661511	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
6	24698215	.	G	A	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.688;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.522	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:217,0,790
6	24702964	.	T	A	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
6	24705541	.	C	T	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.173;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=20.56;ReadPosRankSum=1.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:460,0,337
6	24721040	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.350;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:106,0,566
6	25081487	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	25084718	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	25086968	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
6	25087721	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	25099566	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	25100125	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	25106745	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
6	25106783	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	25435758	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
6	25605091	.	G	A	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
6	25701691	.	C	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
6	25701903	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	25986921	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	26056549	.	A	G	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:623,45,0
6	26114653	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26134672	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	26135498	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26135499	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26216701	.	G	A	126.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:155,0,27
6	26270530	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26271713	.	A	T	67.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
6	26278601	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	26279296	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26279553	.	T	C	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
6	26285560	.	A	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:83:342,0,83
6	26285683	.	T	C	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:223,0,219
6	26414373	.	G	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:157,0,67
6	26415062	.	C	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:96,0,29
6	26458226	.	G	A	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=24.40;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:321,0,136
6	26458265	.	T	C	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:60:233,0,60
6	26460254	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
6	26466389	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26466392	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	26525771	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
6	26546048	.	C	T	811.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:840,60,0
6	26597333	.	A	G	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:87:450,0,87
6	26597992	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	27064275	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
6	27114212	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.495;DP=25;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:190,0,685
6	27369873	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	27369892	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	27440542	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	27440545	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	27792221	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	27792228	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	28096280	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
6	28124603	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:76,0,74
6	28126260	.	A	T	18.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:47:47,0,187
6	28193786	.	T	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	28201138	.	A	G	172.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:201,0,26
6	28238969	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	28239681	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:117,0,73
6	28264692	.	C	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:197,0,67
6	28270047	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	28294550	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	28331127	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	28331128	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	28346769	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	28346945	.	G	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,111
6	28348158	.	T	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,200
6	28872446	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
6	28872630	.	T	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
6	28872841	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
6	28873060	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	28875502	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	28877770	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
6	28877773	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	28878112	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	28878214	.	G	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	28891458	.	T	C	898.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:927,66,0
6	28956541	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	29294876	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
6	29570841	.	A	G	281.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:310,0,19
6	29574722	.	G	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,142
6	29576096	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	29710380	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	29797436	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	29857347	.	T	C	472.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=36.27;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:51:501,0,51
6	29857353	.	T	G	472.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=32.35;ReadPosRankSum=-1.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:51:501,0,51
6	29857359	.	C	G	472.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=26.27;ReadPosRankSum=-1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:51:501,0,51
6	29857502	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	29857504	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	30002860	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
6	30035089	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-1.896;DP=18;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.777	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:81:81,0,615
6	30037990	.	C	T	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:530,36,0
6	30038352	.	A	G	161.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:190,0,17
6	30038942	.	C	T	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=24.10;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:221,0,59
6	30042955	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
6	30071279	.	T	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
6	30075641	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
6	30075843	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	30075864	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	30076016	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	30076018	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	30076064	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
6	30076425	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	30076426	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	30076660	.	G	A	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:239,0,59
6	30076755	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
6	30154199	.	T	C	28.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.524;DP=24;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.349	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:57:57,0,804
6	30155045	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	30160055	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	30166266	.	C	T	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=-0.966;DP=29;FS=6.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:288,0,743
6	30166935	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,448
6	30166945	.	A	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:192,0,231
6	30167294	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
6	30170906	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	30172513	.	A	C	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.754;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:66:66,0,682
6	30179164	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	30209195	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	30229222	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	30229234	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	30245870	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	30259657	.	G	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:121,0,440
6	30260982	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
6	30261657	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,148
6	30261658	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,148
6	30262512	.	A	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:40:40,0,547
6	30294151	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=10.10;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,158
6	30306553	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	30313340	.	G	C	1319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=-0.683;DP=49;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=26.93;ReadPosRankSum=1.703	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,34:49:99:1348,0,488
6	30314566	.	T	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-1.604;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:240,0,1427
6	30314567	.	C	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-2.028;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:240,0,1427
6	30314598	.	C	T	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:174,0,259
6	30457732	.	T	C	506.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=31.67;ReadPosRankSum=-1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,14:16:41:535,0,41
6	30458030	.	G	C	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.890;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,5:30:99:129,0,2027
6	30458040	.	C	T	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=1.703;DP=29;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.260	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:129,0,2027
6	30458051	.	G	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=2.569;DP=29;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.569	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:123,0,938
6	30458064	.	G	A	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.350;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:554,0,183
6	30519258	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
6	30521137	.	G	A	539.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-1.047;DP=20;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:568,0,150
6	30526845	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	30530245	.	T	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
6	30530496	.	T	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:178,0,153
6	30536071	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	30560861	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	30608893	.	T	C	63.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:7:91,7,0
6	30611676	.	C	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:73,0,59
6	30619899	.	A	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
6	30647005	.	C	G	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:64:247,0,64
6	30658239	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	30671989	.	G	C	675.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=30.97;ReadPosRankSum=1.542	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:15:704,15,0
6	30711805	.	C	G	786.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:815,57,0
6	31122315	.	G	C	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:262,0,328
6	31126790	.	A	G	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:52:52,0,371
6	31129642	.	A	C	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:47:47,0,469
6	31130502	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.168;DP=19;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.168	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:77:77,0,656
6	31130593	.	G	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:53:53,0,192
6	31236845	.	A	G	70.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.831;DP=63;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.229	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,6:63:99:99,0,4409
6	31236853	.	G	A	70.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=1.044;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.686	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,5:54:99:99,0,4409
6	31238230	.	G	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-2.758;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:63,6:69:44:44,0,7532
6	31238232	.	G	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-2.884;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.982	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,6:71:44:44,0,7532
6	31238234	.	G	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-2.842;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=0.22;ReadPosRankSum=1.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,6:71:44:44,0,7532
6	31238259	.	G	T	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-3.261;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=0.30;ReadPosRankSum=3.195	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,6:67:52:52,0,2472
6	31238930	.	A	T	53.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.418;DP=72;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,7:72:82:82,0,2492
6	31239101	.	G	T	63.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-2.811;DP=66;FS=3.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=0.97;ReadPosRankSum=1.958	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:59,7:66:92:92,0,4711
6	31239108	.	T	A	63.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-2.775;DP=64;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=1.00;ReadPosRankSum=-0.108	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,7:64:92:92,0,4711
6	31239430	.	C	T	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-2.134;DP=66;FS=13.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=3.72;ReadPosRankSum=2.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,11:66:99:274,0,2184
6	31239518	.	C	T	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.780;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=0.37;ReadPosRankSum=2.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,6:67:53:53,0,2277
6	31239802	.	C	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.536;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,4:42:48:48,0,1512
6	31239821	.	G	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.644;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,5:37:99:144,0,2439
6	31239827	.	C	T	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.265;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,4:31:99:144,0,2439
6	31239855	.	C	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,374
6	31239868	.	G	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,283
6	31239869	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,283
6	31321803	.	G	A	724.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.861;DP=22;FS=5.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=32.94;ReadPosRankSum=-0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,19:22:58:753,0,58
6	31323215	.	T	C	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=1.256;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=10.57;ReadPosRankSum=-2.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:208,0,388
6	31323233	.	A	G	388.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=1.970;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:417,0,476
6	31500226	.	C	A	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:126,0,462
6	31501413	.	A	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.776;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,8:44:99:197,0,1398
6	31501737	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.615;DP=36;FS=3.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.252	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,6:36:99:149,0,1182
6	31501817	.	T	A	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-2.010;DP=34;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,6:34:99:146,0,1113
6	31502767	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.379;DP=38;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,8:38:99:233,0,1169
6	31502861	.	A	G	52.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.580;DP=27;FS=2.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:27:81:81,0,934
6	31506624	.	T	C	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-1.552;DP=64;FS=6.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,13:64:99:366,0,1983
6	31509432	.	G	A	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:50:50,0,198
6	31525912	.	C	T	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
6	31526112	.	G	A	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:47:47,0,369
6	31594628	.	T	A	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=1.060;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.121	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,11:40:99:360,0,993
6	31595882	.	C	A	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=-0.381;DP=58;FS=14.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,10:58:99:262,0,1857
6	31601344	.	T	C	526.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-1.022;DP=47;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,16:47:99:555,0,1156
6	31604010	.	C	G	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=1.278;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,9:49:99:214,0,1528
6	31604044	.	T	G	1711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1740,120,0
6	31604894	.	C	T	1057.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-0.124;DP=37;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,28:37:99:1086,0,273
6	31610686	.	A	G	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.087;DP=24;FS=8.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:49:49,0,813
6	31619652	.	T	A	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,434
6	31627523	.	C	T	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:136,0,303
6	31637734	.	A	T	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=-1.342;DP=34;FS=9.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.228	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,10:34:99:333,0,901
6	31657413	.	T	C	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-1.426;DP=30;FS=12.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,6:30:99:163,0,910
6	31659620	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-1.095;DP=23;FS=5.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:76:76,0,741
6	31697957	.	C	G	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-2.693;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=8.35;ReadPosRankSum=2.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:237,0,686
6	31717063	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
6	31762843	.	G	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:177,0,759
6	31762844	.	G	T	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:177,0,759
6	31785228	.	G	C	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.329;DP=38;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,15:38:99:539,0,883
6	31826535	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
6	31860337	.	T	C	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.583;DP=30;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:264,0,757
6	31860341	.	T	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,0:1:99:264,0,757
6	31860342	.	A	G	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,0:1:99:264,0,757
6	31929014	.	A	C	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.289;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:202,0,507
6	31936668	.	T	C	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=1.422;DP=30;FS=7.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.343	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,7:30:99:219,0,909
6	32083175	.	C	T	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:228,0,273
6	32122386	.	C	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,133
6	32136547	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.693;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:78:78,0,564
6	32136838	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:101,0,751
6	32154254	.	G	C	208.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:237,0,25
6	32796685	.	A	G	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:87:87,0,340
6	32797297	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:56:120,0,56
6	32800224	.	C	A	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:171,0,136
6	32813214	.	G	A	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:479,33,0
6	32938199	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	32938208	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:85,6,0
6	32938291	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	32939894	.	G	T	522.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:551,39,0
6	32941191	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	32942302	.	G	A	1233.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1262,87,0
6	32944987	.	A	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
6	32945530	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	32946133	.	T	C	2009.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2038,141,0
6	32946328	.	G	C	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
6	32948607	.	C	T	1141.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1170,90,0
6	32948804	.	C	T	1072.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1101,75,0
6	33161661	.	A	G	35.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:64:64,0,608
6	33162082	.	T	A	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.138;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.360	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:217,0,694
6	33162215	.	A	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.639;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=1.42;ReadPosRankSum=-0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,457
6	33163451	.	G	A	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.330;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:312,0,617
6	33179689	.	C	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-1.511;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.216	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:183,0,563
6	33256984	.	C	T	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
6	33258443	.	G	A	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
6	33259585	.	T	C	1378.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-0.839;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=32.06;ReadPosRankSum=0.970	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,36:43:99:1407,0,175
6	33264454	.	C	T	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.071;DP=40;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,7:40:99:186,0,1301
6	33267672	.	A	G	916.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:945,69,0
6	33269770	.	G	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:185,0,69
6	33272541	.	A	T	130.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:159,15,0
6	33272855	.	G	C	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
6	33280309	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	33280629	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	33281842	.	G	T	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
6	33281843	.	A	T	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
6	33282002	.	C	T	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:434,36,0
6	33282628	.	C	T	425.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:5:453,5,0
6	33283766	.	T	C	683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:712,54,0
6	33288075	.	C	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
6	33288271	.	A	G	1305.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1334,93,0
6	33372690	.	G	A	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-1.152;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:291,0,944
6	33374913	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
6	33382288	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:94:94,0,389
6	33422545	.	C	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
6	33422976	.	T	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,252
6	33615030	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	33627320	.	G	C	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.508;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=18.12;ReadPosRankSum=-1.446	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:445,0,365
6	33651129	.	C	T	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-1.055;DP=21;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:65:65,0,642
6	33652880	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:79,0,29
6	33653111	.	T	C	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
6	33653448	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.667;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:116,0,465
6	33653486	.	G	A	553.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.549;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:582,0,269
6	33659472	.	C	G	39.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=1.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:68:68,0,678
6	33660371	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:71,0,61
6	33660411	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
6	33662667	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
6	33664730	.	T	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,236
6	33665020	.	T	A	294.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:323,0,18
6	33667199	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,136
6	33667965	.	G	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
6	33668618	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	33672059	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	33672747	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	33739261	.	A	G	29.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-0.861;DP=22;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:58:58,0,740
6	33740325	.	G	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-1.114;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:230,0,817
6	34026938	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	34039744	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
6	34212743	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:568,42,0
6	34213296	.	T	C	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:648,45,0
6	34214322	.	C	G	794.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:823,60,0
6	34218718	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	34237747	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	34237797	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	34252352	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
6	34393845	.	G	A	712.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:741,51,0
6	34501529	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
6	34502687	.	T	C	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
6	34505121	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	34517229	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
6	34517428	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
6	34517762	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	34519024	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
6	34520158	.	T	C	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
6	34521407	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
6	34523697	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	34557374	.	A	G	1136.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1165,84,0
6	34827067	.	G	A	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:174,0,181
6	34949607	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
6	35027927	.	T	C	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:544,45,0
6	35050506	.	G	A	366.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:395,30,0
6	35056443	.	A	G	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
6	35058117	.	A	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
6	35139871	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	35139875	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	35256934	.	C	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
6	35260503	.	C	T	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
6	35260530	.	C	T	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:653,48,0
6	35263555	.	A	G	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
6	35263677	.	T	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	35285720	.	A	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
6	35289446	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
6	35378778	.	C	T	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:352,27,0
6	35391787	.	C	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
6	35395010	.	C	T	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
6	35395618	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
6	35395795	.	G	C	196.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:225,18,0
6	35437347	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,280
6	35450431	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	35995749	.	C	G	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:284,0,250
6	35995910	.	C	G	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.356;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.968	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:213,0,235
6	36059910	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	36059928	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	36069350	.	C	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
6	36078180	.	C	T	693.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.604;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,19:25:99:722,0,173
6	36096357	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	36098333	.	T	C	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
6	36098410	.	A	C	1312.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1341,93,0
6	36103921	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	36107087	.	G	C	474.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.620;DP=38;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=12.49;ReadPosRankSum=2.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,14:38:99:503,0,913
6	36107172	.	G	A	1334.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-1.385;DP=44;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=30.34;ReadPosRankSum=1.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,36:44:99:1363,0,218
6	36108329	.	C	G	857.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:886,60,0
6	36108627	.	A	G	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.446;DP=23;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.257	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:91:91,0,873
6	36108633	.	A	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.115;DP=21;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:133,0,711
6	36109010	.	A	G	371.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:400,0,213
6	36109182	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:74:74,0,456
6	36109196	.	A	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:50:50,0,416
6	36109330	.	A	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,483
6	36109331	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=8.98;ReadPosRankSum=2.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:145,0,406
6	36109370	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:103,0,255
6	36109901	.	T	C	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:572,39,0
6	36117175	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	36191327	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	36192226	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	36197742	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
6	36198577	.	G	C	941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:970,69,0
6	36458794	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:107,0,68
6	36464481	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	36654351	.	T	C	828.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:857,60,0
6	36882353	.	A	G	440.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=29.38;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:70:469,0,70
6	36891644	.	T	C	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.066;DP=19;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=30.99;ReadPosRankSum=-0.199	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,17:19:28:617,0,28
6	36892221	.	A	G	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.86;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:180,0,147
6	36892571	.	C	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
6	36893083	.	A	G	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:222,0,149
6	36893619	.	A	T	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:212,0,147
6	36894441	.	G	A	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
6	36894677	.	T	C	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:45:650,45,0
6	36894685	.	G	A	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:45:650,45,0
6	36895835	.	C	T	409.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=31.52;ReadPosRankSum=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:42:438,0,42
6	36896437	.	T	G	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=22.65;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:300,0,118
6	36936771	.	A	G	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
6	36939279	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	36941651	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	36941719	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	36942481	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	36942928	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
6	36942979	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
6	36944495	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:77,0,32
6	37138220	.	C	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
6	37142422	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
6	37250112	.	A	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
6	37252210	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:72,0,31
6	37282199	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	37300149	.	C	T	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
6	37321807	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:72,0,29
6	37447994	.	C	G	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.355;DP=24;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:131,0,735
6	37450914	.	T	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.717;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.375	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:242,0,528
6	37603516	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	37603535	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	37607387	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	37610310	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	37610349	.	G	A	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
6	38138333	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	38138378	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	38139482	.	T	C	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
6	38139500	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	38139748	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
6	38139938	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
6	38139945	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
6	38140503	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	38140505	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	38140658	.	C	T	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
6	38140755	.	C	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
6	38141022	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
6	38142004	.	G	T	210.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:239,0,23
6	38143418	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	38650628	.	T	G	3003.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3032,211,0
6	38670837	.	G	A	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.044;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,11:43:99:347,0,1221
6	39157781	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	39158514	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
6	39873682	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
6	39926330	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,153
6	39926529	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	39926538	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	40360465	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,122
6	40842461	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
6	41514372	.	A	G	655.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.272;DP=25;FS=5.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.514	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:684,0,199
6	41514411	.	C	G	682.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-0.619;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.638;QD=23.54;ReadPosRankSum=1.904	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,19:29:99:711,0,318
6	41533573	.	G	A	814.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.063;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=32.58;ReadPosRankSum=-1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,18:20:99:843,0,183
6	41533579	.	C	A	814.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-1.257;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=34.37;ReadPosRankSum=1.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,19:23:99:843,0,183
6	41550172	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	41559861	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	41564026	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	41567121	.	C	T	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.303;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.384	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:289,0,898
6	41568064	.	G	A	663.88	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.639;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=34.94;ReadPosRankSum=-0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:16:692,16,0
6	41568906	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	41738889	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	41757836	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	41763621	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	41773576	.	G	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
6	41903007	.	T	C	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:88:88,0,504
6	41903782	.	A	C	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.887;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:168,0,908
6	41903783	.	G	A	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:168,0,908
6	42044945	.	G	A	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
6	42046079	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	42050620	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
6	42062761	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,119
6	42110228	.	C	A	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
6	42110263	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
6	42156924	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	42164452	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	42165841	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
6	42167888	.	A	G	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
6	42172866	.	T	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
6	42174478	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
6	42174558	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
6	42175405	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
6	42185564	.	A	C	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:544,39,0
6	42194636	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:115,0,71
6	42194666	.	T	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:119,0,67
6	42559926	.	G	A	243.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:21:272,0,21
6	42571346	.	A	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
6	42600319	.	A	G	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
6	42630579	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	42638830	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	42660822	.	G	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
6	42713618	.	A	G	805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:834,60,0
6	42753404	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	42754029	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
6	42754525	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
6	42756165	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	42756442	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	42756974	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
6	42758850	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	42855398	.	T	C	683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:712,48,0
6	42856029	.	A	G	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=1.842;DP=30;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=13.13;ReadPosRankSum=2.138	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:422,0,685
6	42856047	.	A	G	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.091;DP=28;FS=7.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:185,0,867
6	42856051	.	A	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.263;DP=28;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:27:88:88,0,1218
6	42856064	.	A	G	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.752;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,3:29:39:39,0,1146
6	42856110	.	A	G	511.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=30.18;ReadPosRankSum=-2.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:38:540,0,38
6	42856116	.	A	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.586;DP=16;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=8.86;ReadPosRankSum=1.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:170,0,504
6	42856176	.	A	G	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=3.076;DP=35;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,9:35:99:269,0,1130
6	42856917	.	A	G	468.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-0.218;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.298	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:497,0,622
6	42857031	.	A	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.445;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:232,0,651
6	42857206	.	C	T	82.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:110,12,0
6	42897074	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
6	42902508	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	42906384	.	G	T	1621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1650,114,0
6	42910666	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	42931261	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	42932200	.	G	T	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:765,51,0
6	42932202	.	C	T	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:765,51,0
6	42934500	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	42944773	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	42944850	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
6	42946490	.	C	A	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
6	42980218	.	G	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-0.186;DP=49;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,7:49:99:150,0,1696
6	42994133	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	42997493	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,227
6	42997538	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,178
6	42997547	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,99
6	42997578	.	A	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,305
6	43000214	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,238
6	43000233	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,152
6	43014298	.	T	C	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
6	43014299	.	T	C	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
6	43097766	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
6	43109751	.	G	A	926.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:955,72,0
6	43111445	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
6	43154091	.	C	G	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
6	43230970	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	43306346	.	A	G	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
6	43323852	.	C	A	127.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:156,0,27
6	43399837	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	43414216	.	T	C	90.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:119,0,24
6	43414234	.	G	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:118,0,30
6	43473884	.	A	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,193
6	43494319	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	43592829	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:46:46,0,409
6	43596814	.	C	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,169
6	43738350	.	C	G	726.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:755,54,0
6	43738977	.	C	T	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-1.484;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:134,0,576
6	43746949	.	T	C	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.58;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:56:314,0,56
6	43747371	.	C	T	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
6	43747450	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
6	43747577	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	43748357	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	43748795	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	43749163	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	43750587	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	43751037	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:119,0,32
6	43752536	.	C	T	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=1.528;DP=19;FS=14.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=25.57;ReadPosRankSum=-1.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:514,0,159
6	43753051	.	C	T	800.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=-2.245;DP=27;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=29.66;ReadPosRankSum=2.012	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,21:27:99:829,0,166
6	43753212	.	A	G	687.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=-1.700;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=28.66;ReadPosRankSum=1.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:716,0,175
6	44061934	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	44076414	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	44081510	.	C	T	706.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=2.068;DP=25;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=28.27;ReadPosRankSum=-2.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,19:25:99:735,0,188
6	44081718	.	G	A	1048.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-0.203;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,28:39:99:1077,0,333
6	44116993	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	44118612	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	44118911	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
6	44119125	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.60;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:58:225,0,58
6	44119145	.	T	C	255.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.42;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:284,0,19
6	44119338	.	C	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:89:192,0,89
6	44121214	.	A	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:73:81,0,73
6	44121216	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:73:81,0,73
6	44122879	.	C	A	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:424,0,105
6	44187386	.	C	T	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:472,36,0
6	44191920	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	44200325	.	A	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
6	44215784	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	44215785	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	44215786	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	44215960	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	44218120	.	A	G	1402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1431,96,0
6	44220076	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
6	44220889	.	C	T	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.354;DP=38;FS=7.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,11:38:99:364,0,1054
6	44266925	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	44267943	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	44268135	.	C	T	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
6	44268371	.	T	C	678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:707,51,0
6	44269193	.	C	T	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:55:355,0,55
6	44275011	.	T	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
6	46128269	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,120
6	46128794	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
6	46135984	.	G	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,235
6	47445540	.	C	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:173,0,70
6	47445789	.	A	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:352,27,0
6	47445927	.	T	A	257.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:286,21,0
6	47563692	.	C	T	703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:732,51,0
6	47594302	.	T	C	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:744,51,0
6	49454281	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	49459978	.	A	G	162.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
6	49460152	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	49460268	.	G	A	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:581,45,0
6	49518914	.	C	G	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:644,48,0
6	49520312	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
6	49521197	.	A	G	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
6	49522564	.	C	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
6	49522688	.	C	T	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
6	49522724	.	A	G	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
6	49522865	.	G	T	906.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:935,66,0
6	49522961	.	G	A	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
6	49523473	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
6	49523511	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	49524108	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	49524153	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	49524446	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	49524618	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
6	49525130	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	49525300	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	49525360	.	T	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
6	49525506	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
6	49527412	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:69,0,63
6	49528183	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	49529159	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	49701439	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	52129484	.	C	T	47.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=-0.925;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,5:44:76:76,0,1547
6	52131254	.	C	T	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
6	52137456	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
6	52142400	.	C	T	1108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.391;DP=44;FS=9.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=25.20;ReadPosRankSum=-0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,30:44:99:1137,0,473
6	52144081	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	52146272	.	C	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
6	52272033	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	52362390	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,150
6	52363365	.	G	A	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
6	52363615	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
6	52363759	.	A	G	292.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:16:321,0,16
6	52364270	.	G	A	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
6	52365336	.	T	G	85.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:114,0,23
6	52365988	.	G	A	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
6	52366431	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	52366762	.	G	A	419.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.794;DP=15;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:88:448,0,88
6	52367235	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
6	52367677	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,98
6	52441754	.	G	T	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:54:177,0,54
6	52529666	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	52529714	.	C	G	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
6	52529729	.	T	C	216.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:18:245,0,18
6	52529773	.	C	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
6	52529904	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
6	52531699	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	52531837	.	C	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	52531972	.	C	T	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
6	52532308	.	G	T	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.072;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:231,0,137
6	52532324	.	A	G	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
6	52532652	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	52532731	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	52533551	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	52546789	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	52547151	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	52548373	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	52548675	.	A	G	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:81,0,27
6	52842839	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,120
6	52951185	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	52951766	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	52962715	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
6	52963071	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
6	53134476	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	53152845	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
6	53153954	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	53157214	.	C	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
6	53157537	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
6	53157551	.	T	C	12.05	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:40:40,0,104
6	53158052	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,120
6	53158185	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:60,0,37
6	53159090	.	G	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:53:53,0,238
6	53213441	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
6	53366989	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	53762092	.	A	G	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=27.73;ReadPosRankSum=1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:75:361,0,75
6	53781660	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:66,0,31
6	53788361	.	A	G	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
6	54807006	.	T	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
6	54808029	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	54809493	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
6	54809589	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	54992905	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	54992907	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	56326765	.	G	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
6	56373536	.	C	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
6	56405725	.	T	C	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
6	56417282	.	C	T	183.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.57;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:211,8,0
6	56417545	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
6	56894384	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
6	57033235	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:145,0,277
6	57393125	.	A	G	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
6	57398154	.	T	C	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:30:429,30,0
6	57398157	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:30:429,30,0
6	57398163	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:30:429,30,0
6	57398201	.	T	C	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:479,33,0
6	57398226	.	T	G	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
6	57398264	.	A	G	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
6	57467100	.	G	C	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:578,39,0
6	57467175	.	A	G	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:535,36,0
6	57512510	.	T	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:355,27,0
6	57512565	.	T	C	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
6	57512678	.	G	A	334.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:363,27,0
6	57512711	.	G	A	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
6	57512775	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	57512779	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	57512893	.	C	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
6	57512969	.	G	C	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
6	57512999	.	C	G	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
6	57513126	.	C	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
6	57513182	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	57513221	.	C	T	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
6	57513317	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	61914280	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	61914288	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	63922500	.	A	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
6	64293010	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:98:98,0,262
6	66546646	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
6	68576569	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:131,9,0
6	68576579	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	68576614	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	70407465	.	A	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:156,0,505
6	71298639	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:119,0,155
6	71298642	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=22.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:99:119,0,155
6	71298929	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:106,0,63
6	71298968	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:79:81,0,79
6	71298969	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:79:81,0,79
6	71570641	.	A	G	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
6	71998778	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:69,0,68
6	72012751	.	G	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
6	72012881	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
6	72014050	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
6	72016302	.	G	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=17.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:188,0,111
6	72016407	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	72017853	.	T	C	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=24.53;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:58:249,0,58
6	74226245	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	74226318	.	T	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
6	74228006	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	74228049	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
6	74229258	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	74230528	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	74230859	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	74304013	.	T	C	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,354
6	75797302	.	C	T	830.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=1.599;DP=27;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=30.77;ReadPosRankSum=-0.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,22:26:88:859,0,88
6	75817880	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	75838382	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	75841722	.	A	T	914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:943,66,0
6	75948042	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	75953220	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	75961808	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	75962890	.	T	C	580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:609,42,0
6	75963248	.	G	C	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
6	75963751	.	C	T	1098.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1127,78,0
6	75963951	.	G	A	1222.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1251,87,0
6	75964642	.	A	G	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
6	75964688	.	T	C	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:531,36,0
6	75964976	.	C	T	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:873,63,0
6	76346146	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	76353052	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	76355729	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	76356861	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
6	76369054	.	A	G	770.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:799,57,0
6	76376552	.	G	A	28.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.096;DP=22;FS=11.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:57:57,0,752
6	76382863	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	76425288	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:50:50,0,393
6	76425594	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	76607280	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	76622917	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	76624741	.	C	T	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:82:82,0,563
6	76625079	.	T	C	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=1.269;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:507,0,319
6	76627276	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:112,0,67
6	77577369	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	77582809	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	77583817	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	77584009	.	C	T	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:200,0,24
6	77585017	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
6	77585156	.	C	G	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
6	79577796	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	79610356	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	79614653	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	79656562	.	A	T	856.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:60:885,60,0
6	79656570	.	G	A	856.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:60:885,60,0
6	79675701	.	A	G	602.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:631,45,0
6	79676579	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	79708000	.	A	C	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:426,30,0
6	79912189	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
6	79912869	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
6	79913956	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	79944355	.	T	G	1213.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1242,87,0
6	79957867	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	79984354	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	80018545	.	T	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
6	80411098	.	T	A	153.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:182,0,26
6	80412925	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:157,0,73
6	81040302	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	81040324	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	81053642	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	81053814	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	81053825	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	81053916	.	G	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
6	81054310	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
6	81054326	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
6	81054515	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	81054663	.	C	G	122.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:150,12,0
6	81054762	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	81054965	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
6	81055299	.	A	G	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
6	81055331	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
6	81055396	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
6	81055413	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	81055792	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	81055803	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	81065373	.	A	T	63.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
6	81176076	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	82456051	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	82933309	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.761;DP=21;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:104,0,682
6	83073446	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
6	83074365	.	C	T	1269.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1298,99,0
6	83075914	.	G	A	1866.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1895,132,0
6	83076791	.	T	C	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
6	83197587	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	83792261	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
6	83883706	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	83894382	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	83920884	.	A	G	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:617,42,0
6	83948730	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	84669951	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
6	86221771	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
6	86331887	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	86387888	.	G	T	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=-0.508;DP=50;FS=1.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,14:50:99:450,0,1369
6	86388109	.	G	C	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-1.032;DP=16;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=0.69;ReadPosRankSum=1.032	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:39:39,0,542
6	86388223	.	C	T	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.600;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:99:128,0,892
6	86388429	.	G	A	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:258,0,124
6	87934736	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	87941067	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	87967636	.	A	G	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:63:282,0,63
6	87968565	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
6	87969737	.	C	T	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
6	87970301	.	C	G	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
6	88051052	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	88110105	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	88125581	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
6	88128089	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	88219904	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
6	88221546	.	A	G	1025.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1054,75,0
6	88221892	.	T	G	759.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:788,54,0
6	88226641	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
6	88235949	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	88304762	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	88367082	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	88411768	.	A	G	636.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.582;DP=21;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=30.32;ReadPosRankSum=-0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,17:21:99:665,0,110
6	88411890	.	A	G	623.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.318;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=31.19;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,17:20:62:652,0,62
6	89793894	.	G	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,237
6	89874951	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	89965810	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	90075831	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	90315789	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	90344222	.	T	C	195.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:224,0,22
6	90344869	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
6	90345536	.	T	C	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.627;QD=18.37;ReadPosRankSum=-1.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:267,0,224
6	90345698	.	C	G	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-2.620;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=28.06;ReadPosRankSum=2.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:80:393,0,80
6	90347496	.	C	G	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.560;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:246,0,529
6	90347511	.	T	C	747.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.747;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.360	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,20:27:99:776,0,198
6	90362783	.	A	C	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-2.143;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=0.75;ReadPosRankSum=2.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:40:40,0,544
6	90371202	.	G	A	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
6	90390443	.	C	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,103
6	90402840	.	C	A	246.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:275,21,0
6	90418262	.	C	T	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
6	90448092	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
6	90455084	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	90459454	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
6	90565242	.	A	G	277.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:306,24,0
6	90577602	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,104
6	90582401	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	90583396	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
6	91223620	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
6	91224917	.	A	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
6	91225220	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
6	91239500	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	91249218	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	91249351	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	91249584	.	A	G	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
6	91252631	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	96025446	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:71,0,34
6	96054588	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	96054935	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	96056006	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
6	96651740	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	96652371	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	96653208	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	96653478	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	96654805	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	96654983	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	96655096	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	96655254	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:120,0,75
6	96656649	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	96657328	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
6	96658152	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	96658260	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	96658262	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	96658435	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	96658638	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	96659589	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
6	96660726	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	96661036	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	96661062	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	96662915	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
6	96663059	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	97244354	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	97337533	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	97338598	.	A	T	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
6	97338657	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	97339088	.	C	T	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
6	97613163	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
6	97626374	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
6	97677118	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
6	99317410	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,80
6	99317487	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	99317492	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	99375638	.	G	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:55:55,0,187
6	99726621	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	99739698	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	99739700	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	99771540	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:120,0,72
6	99817601	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
6	99819379	.	T	C	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:523,39,0
6	99850730	.	C	T	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=0.68;ReadPosRankSum=0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:38:38,0,866
6	99850829	.	G	C	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:790,54,0
6	99851977	.	T	C	222.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.85;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:251,0,22
6	99881061	.	G	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:164,0,30
6	99881639	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	99882077	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	99883226	.	T	C	213.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:16:242,0,16
6	99883704	.	T	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
6	99886008	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	99894086	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
6	99980522	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	100002493	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	100003307	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
6	100003591	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	100003593	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	101094554	.	A	G	364.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.14;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:7:392,0,7
6	101296389	.	G	A	208.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:237,0,22
6	101329173	.	A	C	232.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:261,0,18
6	106959424	.	A	G	242.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:271,0,22
6	106959961	.	A	G	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
6	106959999	.	C	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
6	106960039	.	G	A	320.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:13:349,0,13
6	106960447	.	G	A	384.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:44:413,0,44
6	106967185	.	A	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=-1.516;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:112,0,485
6	106980324	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	106981729	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	106981767	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
6	106982183	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	106987370	.	A	C	859.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:888,63,0
6	106992464	.	A	G	685.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:53:714,53,0
6	107001581	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	107002116	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	107002149	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	107009786	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	107016942	.	C	T	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.714;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=30.42;ReadPosRankSum=-0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,14:16:37:515,0,37
6	107017926	.	C	T	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.371;DP=28;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,3:28:47:47,0,1014
6	107076783	.	A	T	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:194,0,111
6	107113715	.	G	A	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
6	107113953	.	C	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,835
6	107113963	.	C	T	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:320,0,355
6	107113967	.	T	A	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:320,0,355
6	107350143	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	107352245	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	107361476	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	107362120	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
6	107388119	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,151
6	108189328	.	C	T	61.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:89,5,0
6	108189515	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	108190246	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	108191203	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	108191382	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
6	108191510	.	T	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
6	108210445	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	108279290	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
6	108363688	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	108364106	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
6	108364582	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:72,0,33
6	108364951	.	T	C	252.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:281,0,22
6	108365658	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
6	108374003	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	108385488	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,295
6	109002042	.	C	T	531.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=-0.786;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=26.59;ReadPosRankSum=0.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:560,0,162
6	109003321	.	T	C	605.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.236;DP=20;FS=12.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=30.29;ReadPosRankSum=-0.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,16:20:99:634,0,118
6	109202909	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	109322554	.	C	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,314
6	109646840	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	109688538	.	A	C	1394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1423,96,0
6	109688618	.	A	G	81.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.246;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:46,6:52:99:110,0,1875
6	109688731	.	C	A	2413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.732;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.673	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,57:58:99:2442,136,0
6	109689431	.	A	G	2908.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2937,199,0
6	109689554	.	C	G	618.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.778;DP=64;FS=7.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,19:64:99:647,0,1763
6	109689681	.	T	C	2290.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2319,160,0
6	109689907	.	G	T	2546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2575,178,0
6	109691328	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	109691944	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
6	109692188	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	109692727	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
6	109695309	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:109,0,34
6	109695548	.	G	A	203.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:232,18,0
6	109695985	.	G	A	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
6	109696751	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	109704138	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
6	109704386	.	C	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
6	109712737	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	109762600	.	A	C	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
6	109764535	.	G	T	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:514,39,0
6	109767930	.	G	T	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
6	109768295	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	109768713	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	109770808	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	109775366	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:110,0,31
6	109775436	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
6	109785214	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	109785946	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,158
6	109786157	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:190,0,66
6	109786980	.	T	C	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
6	109953266	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	110146303	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
6	110421361	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
6	110544421	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	110552576	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:70,0,30
6	110959008	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	110959010	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	110959017	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	111205405	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	111207944	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	111218322	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	111218772	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	111218773	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	111346806	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:138,0,733
6	111346808	.	G	A	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:138,0,733
6	111346843	.	G	A	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:178,0,224
6	111347522	.	T	C	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.408;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:191,0,236
6	111348022	.	A	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,265
6	111348554	.	C	T	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:136,0,221
6	111587266	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	111589293	.	A	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
6	111590094	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
6	111591055	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	111591671	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	111596544	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	111597439	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	111600809	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	111620935	.	C	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,193
6	111695073	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
6	111695268	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
6	111695887	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	111696257	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
6	111696852	.	T	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
6	111879579	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
6	111884228	.	G	A	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.912;DP=30;FS=7.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,7:30:99:213,0,908
6	111895914	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	111901453	.	G	T	651.98	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.964;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=35.44;ReadPosRankSum=0.964	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:13:680,13,0
6	113749009	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	114181663	.	G	A	978.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-1.173;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.936	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,32:44:99:1007,0,316
6	114183594	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
6	114183884	.	A	G	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:358,24,0
6	114269542	.	C	G	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:118,0,26
6	116254834	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	116258402	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	116263524	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	116565725	.	C	A	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=1.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:173,0,336
6	116566138	.	C	A	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
6	116566845	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	116572828	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,139
6	116575083	.	C	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:117,0,589
6	116579984	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
6	116598853	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.425;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.709	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:109,0,584
6	116720487	.	C	T	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
6	116773814	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	116773819	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	117869306	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:82,6,0
6	117869311	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	117923599	.	T	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
6	119134935	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	119135633	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,103
6	119136759	.	A	C	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:141,0,207
6	119137011	.	G	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:63:159,0,63
6	119216057	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	119229562	.	C	T	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,108
6	119499566	.	G	C	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
6	119500239	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
6	119500674	.	G	A	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:528,39,0
6	119509003	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	119510941	.	C	A	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:559,42,0
6	119533069	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	119558604	.	T	C	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
6	119558620	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	119558623	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	119558655	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	119558663	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	120583498	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
6	120583501	.	T	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
6	120583509	.	A	G	54.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:80,0,1
6	122765026	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-1.829;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:194,0,579
6	122765905	.	T	C	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=1.213;DP=25;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.125	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,3:25:54:54,0,867
6	122765948	.	A	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.414;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:191,0,746
6	122773119	.	T	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.214;DP=39;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,6:39:99:149,0,1271
6	123046922	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.213;DP=24;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:150,0,770
6	123109654	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	123124128	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	123124292	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
6	123126236	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	123126237	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	123933636	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	123933639	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	123933652	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	125284121	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:69,0,31
6	125289219	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	126070789	.	T	G	130.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:159,0,27
6	126081319	.	G	T	80.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:109,0,27
6	126210395	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	126278230	.	G	C	516.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.350;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,14:16:39:545,0,39
6	126299264	.	A	T	94.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:22:123,0,22
6	126300270	.	G	A	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.326	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:428,0,132
6	126300967	.	A	G	255.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:21:284,0,21
6	126602570	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	127597780	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	127606588	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
6	128291199	.	C	T	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=1.350;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,15:19:99:593,0,123
6	128319894	.	C	T	396.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=1.602;DP=31;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:425,0,722
6	128388799	.	G	T	494.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-0.898;DP=20;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=24.74;ReadPosRankSum=0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,16:20:69:523,0,69
6	128403745	.	A	G	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=-1.440;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=26.89;ReadPosRankSum=1.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:593,0,179
6	130374102	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	131790237	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	131790238	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	132212742	.	A	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,192
6	132213623	.	G	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
6	132214668	.	C	T	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,444
6	132215375	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
6	132779878	.	T	C	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:83:394,0,83
6	132779924	.	A	G	179.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:208,18,0
6	132780167	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-2.546;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=6.94;ReadPosRankSum=2.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:160,0,536
6	132780404	.	C	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:143,0,231
6	132780768	.	G	A	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
6	132781339	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:97:236,0,97
6	132781472	.	G	T	533.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=-0.693;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=31.40;ReadPosRankSum=-1.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:82:562,0,82
6	132781520	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:100,0,300
6	132793185	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	133594068	.	A	G	1289.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:90:1318,90,0
6	133594069	.	T	C	1289.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:90:1318,90,0
6	133594074	.	C	G	1289.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1318,90,0
6	133594108	.	A	G	1716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1745,117,0
6	133594112	.	T	C	1716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:99:1745,117,0
6	133594117	.	G	T	1716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:99:1745,117,0
6	133594120	.	G	A	472.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.658;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:501,0,323
6	133594123	.	A	G	1716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:99:1745,117,0
6	133594129	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:99:195,0,503
6	135623584	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	135624811	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
6	135625725	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	135627369	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	135787184	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,124
6	136599652	.	G	C	42.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.352;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:71:71,0,706
6	136660065	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	136663008	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
6	136663948	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
6	136682172	.	G	A	779.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:808,60,0
6	136689360	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	136690965	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	136692461	.	C	G	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
6	138027123	.	C	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
6	138412313	.	A	G	621.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=1.316;DP=61;FS=7.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,19:61:99:650,0,1660
6	138412612	.	A	G	483.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=1.096;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.168	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,15:45:99:512,0,1180
6	138412798	.	G	A	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.235;DP=51;FS=5.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.13;ReadPosRankSum=-2.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,9:51:99:239,0,1696
6	138412888	.	G	A	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.140;DP=39;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.172	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,11:39:99:366,0,1085
6	138413269	.	A	G	684.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=1.211;DP=66;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,21:66:99:713,0,1801
6	138413333	.	G	C	601.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.132;DP=67;FS=3.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,19:67:99:630,0,1895
6	138576744	.	G	C	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.62;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:78:310,0,78
6	138732578	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	138742249	.	C	T	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
6	138754323	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	139114113	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
6	139114163	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:76,0,74
6	139229872	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.403;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:106,0,659
6	139349921	.	G	C	673.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=-1.031;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=24.06;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:702,0,367
6	139357905	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	139357906	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	139487836	.	T	C	123.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:152,0,20
6	139500135	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
6	139501341	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	139695061	.	G	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=-1.032;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:158,0,597
6	142105967	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	142105980	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:215,15,0
6	142105984	.	A	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
6	142106027	.	A	G	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
6	142718801	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
6	142758631	.	A	G	210.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
6	143091769	.	G	A	131.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:160,0,21
6	143809013	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	143810909	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:114,0,74
6	143816859	.	C	T	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:324,0,169
6	143823112	.	G	A	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.464;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=21.55;ReadPosRankSum=-1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:373,0,210
6	143823157	.	T	C	502.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-1.221;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=27.93;ReadPosRankSum=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:531,0,109
6	144150609	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
6	144178868	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
6	144179349	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	144758799	.	A	G	117.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:146,0,22
6	144843212	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	146125793	.	A	T	134.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:163,0,25
6	146126419	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,72
6	146135803	.	G	A	122.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:151,0,27
6	146207465	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:155,0,28
6	146207563	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
6	146234644	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:77,0,66
6	148865257	.	A	G	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:434,33,0
6	148869517	.	C	T	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:196,0,99
6	148871389	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
6	149731476	.	C	G	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:181,0,166
6	149912307	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
6	149979836	.	A	T	25.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:54,0,23
6	149980727	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,118
6	149982417	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,122
6	150004779	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,183
6	150023075	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
6	150023348	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
6	150045998	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:140,0,260
6	150046415	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,214
6	150046432	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,216
6	150046545	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
6	150046673	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:116,0,30
6	150046686	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:153,0,111
6	150046734	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:140,0,280
6	150046736	.	T	C	341.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=34.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:16:370,0,16
6	150114745	.	G	A	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=-1.725;DP=46;FS=9.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,11:46:99:355,0,1371
6	150132092	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:162,0,349
6	150132319	.	A	T	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.990;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:278,0,521
6	150140810	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,112
6	150140886	.	G	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:188,0,68
6	150184882	.	G	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,109
6	150383213	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	150716689	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	150716696	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	150719710	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	150720494	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	150721229	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	150724064	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	151336739	.	C	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
6	151369124	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	151686905	.	C	T	737.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:766,54,0
6	151739818	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,106
6	151766822	.	C	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:114,0,620
6	151772119	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
6	151773206	.	C	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:147,0,190
6	151789868	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.320;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,12:39:99:392,0,1044
6	151859314	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
6	151894505	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
6	151913710	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	151936677	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,109
6	151939627	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,224
6	151939873	.	C	T	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:217,0,149
6	151941602	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,146
6	152067244	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	152075114	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
6	152084862	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	152129077	.	T	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
6	152201875	.	T	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
6	152265522	.	G	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
6	152420095	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-1.678;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:264,0,303
6	152421130	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.326;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.326	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:112,0,413
6	152422335	.	C	T	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
6	152423806	.	G	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
6	152453291	.	G	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:137,0,274
6	152501416	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,184
6	152532702	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,191
6	152540278	.	A	C	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:186,15,0
6	153296541	.	G	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=1.097;DP=22;FS=5.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:151,0,685
6	153304588	.	C	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,114
6	155635585	.	A	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,128
6	157713662	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
6	157797595	.	C	T	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
6	157801516	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	158088364	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	158244180	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	158330765	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.057;DP=17;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:118,0,515
6	158363896	.	C	T	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=-1.823;DP=20;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:241,0,517
6	158364714	.	A	G	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:93:93,0,287
6	158364760	.	A	G	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.839;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:215,0,276
6	158497717	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
6	158499302	.	G	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	158505088	.	A	G	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
6	158507981	.	G	A	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
6	158509750	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
6	158517451	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
6	158519008	.	T	C	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:447,30,0
6	158519155	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
6	158519189	.	C	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
6	158532187	.	A	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
6	158733310	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	158733562	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
6	158733717	.	C	T	13.92	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:41,6,0
6	158733887	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	158734275	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	158735087	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
6	158735090	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
6	158870081	.	A	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,141
6	158923434	.	G	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
6	158924088	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	158928806	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
6	158929489	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
6	158930217	.	C	T	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
6	158930744	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
6	158984733	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	158987803	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	159034334	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
6	159052471	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	159053343	.	G	C	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:209,0,177
6	159065758	.	C	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.718;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:125,0,409
6	159185563	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	159187331	.	A	C	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=-0.230;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=0.43;ReadPosRankSum=2.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:40:40,0,817
6	159187346	.	A	T	410.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.619;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:439,0,371
6	159187347	.	A	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-1.397;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:222,0,1014
6	159187355	.	A	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-1.524;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:222,0,1014
6	159188128	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	159192575	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	159192919	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	159193395	.	A	G	81.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:22:110,0,22
6	159194788	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	159195416	.	A	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:157,0,30
6	159195781	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
6	159240382	.	G	A	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:230,0,122
6	160100640	.	A	T	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
6	160101723	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,228
6	160101845	.	G	A	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
6	160101919	.	G	A	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:527,36,0
6	160113872	.	A	G	947.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:976,72,0
6	160144341	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
6	160148348	.	C	T	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.150;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=17.25;ReadPosRankSum=-2.431	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:287,0,238
6	160174456	.	T	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
6	160193465	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	160196343	.	A	G	1519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1548,108,0
6	160198395	.	G	A	1329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=-1.403;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=28.29;ReadPosRankSum=1.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,35:47:99:1358,0,384
6	160199687	.	T	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
6	160201295	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	160210061	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
6	160211421	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	160211424	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	160211554	.	T	G	702.82	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.734;DP=19;FS=9.777;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=36.69;ReadPosRankSum=1.552	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:19:731,19,0
6	160211636	.	G	A	733.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:762,54,0
6	160219337	.	G	A	901.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:930,63,0
6	160219601	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
6	160464289	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:135,0,378
6	160468278	.	A	G	369.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=28.44;ReadPosRankSum=-1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:86:398,0,86
6	160494409	.	A	G	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
6	160495055	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	160505199	.	C	G	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:721,54,0
6	161377557	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	161469774	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
6	161538250	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:154,0,69
6	165202917	.	T	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:101,0,29
6	165207387	.	T	C	206.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:235,0,24
6	166736362	.	C	T	549.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:578,0,315
6	166737132	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	166745394	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	166755975	.	T	C	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
6	166755979	.	A	C	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:397,27,0
6	166778679	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
6	166784543	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	166796433	.	C	A	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:81:173,0,81
6	166826021	.	C	T	131.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:160,0,27
6	166826255	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:75,0,63
6	166826304	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
6	166862233	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,162
6	167297599	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	167297613	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	167297699	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	167335677	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	167341774	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
6	167345404	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	167358233	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
6	167359558	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
6	167369650	.	G	A	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.176;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:289,0,245
6	167369897	.	C	A	494.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.646;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=21.51;ReadPosRankSum=1.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:523,0,259
6	167377645	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	167404187	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	167445566	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	167454097	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:77,0,67
6	168347714	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
6	168352105	.	G	A	409.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.369;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=29.27;ReadPosRankSum=-1.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:43:438,0,43
6	169785373	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	169789865	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	169795607	.	A	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:115,0,76
6	169820307	.	G	A	152.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:181,0,26
6	169824254	.	G	A	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:81,0,26
6	169824751	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
6	170055316	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	170058439	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	170102267	.	A	G	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:79,0,26
6	170108417	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,118
6	170108689	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,150
6	170108799	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:113,0,74
6	170152991	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	170176647	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,236
6	170176648	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,236
6	170344113	.	G	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
6	170344120	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:264,18,0
6	170347467	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	170348464	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
6	170348876	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	170463757	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	170463973	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
6	170464410	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
6	170464513	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	170466122	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
6	170466858	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
6	170467163	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
6	170467938	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
6	170469255	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
6	170475002	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
6	170475042	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
6	170475104	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
6	170475495	.	A	G	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
6	170475638	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
6	170591923	.	T	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,114
6	170627651	.	G	A	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:195,0,150
6	170703945	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:68,0,65
6	170714255	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,155
6	170714331	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
6	170858520	.	A	C	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
6	170859715	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:112,0,74
6	170862051	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
6	170862300	.	G	C	1257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.398;DP=45;FS=3.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=27.95;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,33:45:99:1286,0,382
6	170878793	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:151,0,71
6	170886531	.	T	C	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:411,0,333
6	170887693	.	G	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,156
6	170890384	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
6	170891856	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
7	147802	.	G	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
7	148439	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
7	154721	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	197535	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	208351	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	211000	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	211005	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	214489	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	286402	.	A	G	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=14.98;ReadPosRankSum=-2.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:253,0,224
7	290389	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	291912	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
7	295263	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
7	295867	.	C	T	449.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.546;DP=16;FS=9.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=28.11;ReadPosRankSum=-0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:478,0,127
7	299881	.	A	G	40.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.352;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:69:69,0,689
7	299976	.	G	A	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:228,0,373
7	299987	.	C	G	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:534,39,0
7	300512	.	G	A	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:402,0,493
7	300513	.	T	C	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.050;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:208,0,829
7	468644	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	475642	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	537959	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:41:227,0,41
7	558792	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,99
7	562872	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	589066	.	A	G	1010.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1039,72,0
7	592665	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	599362	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	601432	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	609916	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	611331	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
7	616816	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	618855	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	618938	.	A	G	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1080,78,0
7	758739	.	T	C	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:80,0,27
7	766168	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	778056	.	T	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:77,0,59
7	791755	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
7	805430	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	810219	.	T	C	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-1.501;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=16.38;ReadPosRankSum=1.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:323,0,308
7	814788	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.367	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:189,0,257
7	823067	.	G	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
7	825114	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
7	825429	.	A	G	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.530;DP=15;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:331,0,215
7	825786	.	T	C	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.429;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.347	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:379,0,300
7	857935	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	866089	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	869846	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	870021	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	881668	.	C	T	1274.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1303,93,0
7	890051	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	890284	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	906739	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
7	907392	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	911113	.	C	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
7	911507	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	912755	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	916678	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	916816	.	C	T	72.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:101,0,26
7	917226	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	917228	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	917639	.	C	T	88.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:117,0,23
7	918504	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
7	919933	.	A	G	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
7	920301	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,145
7	921344	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	921644	.	T	C	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
7	922558	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
7	923562	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:75,0,72
7	935805	.	T	C	737.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:766,54,0
7	940181	.	C	T	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
7	942734	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	953788	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	1004967	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
7	1005142	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,102
7	1005436	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,145
7	1006856	.	G	C	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:234,0,133
7	1007014	.	G	A	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:311,0,138
7	1007033	.	C	A	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=25.43;ReadPosRankSum=-1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:89:308,0,89
7	1016551	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
7	1018968	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	1019584	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:219,15,0
7	1019592	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:74,0,73
7	1020116	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:39,0,36
7	1020272	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	1021860	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	1023191	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	1023364	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:150,0,61
7	1024581	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1025642	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	1026074	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	1027229	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	1027286	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	1033330	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	1034574	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	1036241	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	1036634	.	C	T	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:80,0,24
7	1036799	.	G	A	918.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-1.329;DP=43;FS=11.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.403	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,26:43:99:947,0,613
7	1036944	.	G	C	686.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.376;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,20:49:99:715,0,1109
7	1037025	.	C	A	716.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-2.398;DP=43;FS=9.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.037	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,20:43:99:745,0,829
7	1045455	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
7	1064983	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:57:57,0,76
7	1065988	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	1066297	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
7	1067906	.	T	C	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.694;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:354,0,295
7	1087095	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
7	1087454	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	1098405	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:35:72,0,35
7	1098414	.	T	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:72,0,35
7	1131356	.	T	C	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
7	1131411	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:65,0,37
7	1132505	.	G	A	172.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:201,0,25
7	1132720	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	1151713	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	1151886	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	1195215	.	A	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=-0.680;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:144,0,429
7	1196344	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	1196974	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	1199632	.	T	C	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
7	1199787	.	C	A	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
7	1199790	.	G	C	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:39:562,39,0
7	1199791	.	G	C	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:39:562,39,0
7	1199804	.	C	T	291.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:320,24,0
7	1200641	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	1201266	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	1201307	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1201736	.	C	T	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
7	1201843	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	1202069	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:113,0,61
7	1203034	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1203237	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	1203745	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1203801	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
7	1203841	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
7	1203889	.	C	G	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
7	1203904	.	T	A	438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:467,33,0
7	1203957	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
7	1204225	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1204226	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1204295	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	1204354	.	T	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
7	1204368	.	G	A	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
7	1204442	.	C	T	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
7	1204504	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
7	1204599	.	A	C	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
7	1204647	.	T	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
7	1204700	.	C	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
7	1204894	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	1204926	.	C	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:159,12,0
7	1204932	.	G	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:159,12,0
7	1205210	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	1205338	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	1206417	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	1206786	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	1207937	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	1208968	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
7	1209013	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	1209027	.	T	G	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
7	1209342	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1209343	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	1479025	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	1481673	.	G	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:149,0,148
7	1481919	.	C	A	666.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=32.27;ReadPosRankSum=1.542	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:18:695,18,0
7	1484572	.	A	G	252.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:281,21,0
7	1495698	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	1498872	.	G	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:140,0,325
7	1504976	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
7	1571238	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	1574777	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	1575611	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	1575972	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	1576217	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
7	1576454	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	1576704	.	C	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
7	1580921	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
7	1581517	.	T	C	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:573,45,0
7	1582875	.	A	G	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
7	1583288	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
7	1583673	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
7	1583941	.	C	T	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
7	1583973	.	G	C	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
7	1584078	.	C	T	363.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:392,30,0
7	1584481	.	T	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
7	1584674	.	C	T	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:449,33,0
7	1584735	.	G	A	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
7	1584911	.	A	G	285.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:314,21,0
7	1585243	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
7	1585603	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
7	1586239	.	A	G	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
7	1586662	.	T	C	128.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:157,0,26
7	1587043	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
7	1588391	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
7	1588549	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	1588768	.	G	A	383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:412,30,0
7	1589056	.	G	A	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:27:398,27,0
7	1589083	.	G	A	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:27:398,27,0
7	1589417	.	T	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	1595068	.	G	A	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
7	1595839	.	A	G	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
7	1624795	.	G	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:159,0,28
7	1626835	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	1627862	.	C	G	85.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:114,0,24
7	1628183	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:112,0,32
7	1855252	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	2278399	.	A	G	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
7	2290727	.	G	A	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:95:95,0,191
7	2293509	.	G	A	383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:412,33,0
7	2293609	.	A	G	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
7	2302471	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	2303986	.	T	C	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:786,57,0
7	2394316	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
7	2394746	.	T	C	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=-0.449;DP=48;FS=6.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,18:47:99:593,0,1057
7	2394872	.	G	A	842.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.903;DP=69;FS=10.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,25:68:99:871,0,1575
7	2394991	.	C	T	838.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-1.048;DP=62;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,25:62:99:867,0,1342
7	2409035	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	2411768	.	G	A	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:54:202,0,54
7	2415696	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:120,0,61
7	2415771	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:122,0,66
7	2415797	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:153,0,72
7	2415948	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
7	2416682	.	C	G	918.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.345;DP=55;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.305	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,28:55:99:947,0,972
7	2419515	.	G	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,238
7	2474731	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,114
7	2486368	.	G	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,98
7	2486592	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	2486719	.	A	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:109,0,75
7	2492492	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
7	2498467	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	2554092	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	2559703	.	G	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:51:51,0,63
7	2564344	.	G	A	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-1.153;DP=42;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,17:42:99:539,0,945
7	2577691	.	C	G	662.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.620;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=21.38;ReadPosRankSum=-1.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:691,0,465
7	2577781	.	T	C	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.176;DP=27;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:617,0,364
7	2578237	.	T	C	560.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-2.269;DP=27;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:589,0,793
7	2578238	.	C	T	560.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-2.318;DP=27;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=20.77;ReadPosRankSum=2.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:589,0,793
7	2578434	.	G	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:117,0,32
7	2578455	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
7	2580070	.	T	C	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:175,0,218
7	2580275	.	A	G	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:298,0,220
7	2582584	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:108,0,67
7	2583165	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,99
7	2583328	.	C	T	505.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:534,0,382
7	2584523	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	2611878	.	T	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
7	2615701	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	2635067	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	2635438	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	2635770	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:75,0,34
7	2635811	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	2646351	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	2649704	.	T	G	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:139,0,342
7	2649777	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:180,0,345
7	2649819	.	C	T	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:345,0,138
7	2650076	.	G	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,154
7	2650223	.	G	C	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:354,0,133
7	2650926	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,141
7	2651168	.	T	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
7	2651421	.	G	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:90:90,0,173
7	2651639	.	A	G	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:86:183,0,86
7	2651921	.	C	T	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:475,36,0
7	2652630	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:253,0,134
7	2652838	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,231
7	2652877	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,177
7	2653028	.	G	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,195
7	2653602	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,118
7	2653792	.	C	A	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=11.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:125,0,295
7	2673066	.	C	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
7	2673288	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	2676204	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	2676754	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	2678169	.	G	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
7	2679654	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	2679770	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	2682232	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	2684603	.	C	G	138.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:166,8,0
7	2686059	.	T	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
7	2686210	.	C	G	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
7	2688190	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
7	2688869	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	2689011	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
7	2691736	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
7	2701826	.	G	A	876.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:905,63,0
7	2702193	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:224,0,262
7	2702282	.	C	T	688.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:717,51,0
7	2702816	.	A	G	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
7	2702875	.	T	C	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:604,45,0
7	2703464	.	G	A	842.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:871,60,0
7	2703652	.	T	C	1046.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1075,75,0
7	2703979	.	G	A	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
7	2740015	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	2742222	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	2751040	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	2752932	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
7	2755237	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	2762517	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
7	2765426	.	G	A	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:194,0,67
7	2766104	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	2767939	.	T	C	256.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.10;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:285,0,22
7	2768561	.	C	T	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:322,0,106
7	2768626	.	C	T	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.872;DP=20;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.536;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:474,0,238
7	2768864	.	T	C	383.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.131;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:412,0,413
7	2768897	.	C	T	497.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-0.046;DP=19;FS=17.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:526,0,151
7	2768935	.	G	T	464.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-1.736;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=21.13;ReadPosRankSum=-1.669	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:493,0,317
7	2875384	.	C	A	206.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:235,18,0
7	4804952	.	C	T	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=1.468;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:285,0,204
7	4809895	.	G	A	47.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:76,0,22
7	5013688	.	A	G	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.54;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:193,0,69
7	5036611	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,197
7	5036641	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
7	5036645	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,185
7	5036720	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,298
7	5036758	.	A	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
7	5036988	.	G	A	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:287,0,209
7	5037172	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	5037199	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	5037260	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
7	5037459	.	C	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,329
7	5042424	.	T	G	43.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	5042437	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	5054002	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	5096958	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:99,0,217
7	5105133	.	C	T	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.779;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:224,0,211
7	5106222	.	T	C	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:139,0,108
7	5106686	.	C	T	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:264,0,176
7	5107572	.	A	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:185,0,215
7	5107777	.	G	A	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:269,0,218
7	5107872	.	A	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:40:40,0,265
7	5108628	.	G	A	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:277,0,129
7	5108724	.	T	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,153
7	5108770	.	A	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
7	5254227	.	C	G	1684.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1713,117,0
7	5257573	.	G	A	532.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.747;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=17.76;ReadPosRankSum=-1.161	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:561,0,547
7	5264171	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	5264244	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	5265846	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	5322696	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:75,0,30
7	5342774	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,145
7	5343128	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,103
7	5343462	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	5346735	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
7	5347295	.	A	G	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1099,78,0
7	5347446	.	A	G	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:294,0,250
7	5347470	.	T	A	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.653;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=20.69;ReadPosRankSum=1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:380,0,194
7	5347749	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.267;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:156,0,329
7	5352949	.	G	C	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:289,0,199
7	5353253	.	G	T	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:210,0,139
7	5353344	.	G	A	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.910;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:282,0,346
7	5362340	.	C	T	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
7	5363163	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	5366033	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	5372406	.	G	T	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:164,0,254
7	5396715	.	T	C	868.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:897,66,0
7	5399044	.	C	G	1319.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1348,93,0
7	5410425	.	G	C	597.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=28.25;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:9:625,9,0
7	5427652	.	G	A	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=1.467;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=10.58;ReadPosRankSum=-1.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:261,0,502
7	5427720	.	A	G	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
7	5434107	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.139;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:160,0,547
7	5434135	.	A	G	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:629,45,0
7	5515624	.	T	G	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:310,0,180
7	5516293	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
7	5516940	.	C	T	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:249,0,329
7	5517221	.	T	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=19.68;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:225,0,146
7	5517285	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,135
7	5517311	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
7	5518268	.	T	A	81.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:110,0,25
7	5518331	.	A	G	457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:486,33,0
7	5518333	.	A	T	334.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=30.43;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:53:363,0,53
7	5519031	.	C	G	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:209,0,177
7	5519542	.	A	G	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
7	5520929	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:187,0,127
7	5521219	.	T	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:137,0,137
7	5540769	.	A	C	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.98;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:262,0,190
7	5541657	.	G	A	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.978;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:282,0,160
7	5567112	.	C	T	1846.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=-2.635;DP=84;FS=5.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.038;QD=21.99;ReadPosRankSum=2.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,48:84:99:1875,0,1316
7	5568261	.	G	C	807.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.711;DP=92;FS=6.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,25:92:99:836,0,2707
7	5568366	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:152,0,62
7	5568493	.	A	G	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
7	5569327	.	G	A	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:55:186,0,55
7	5862830	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	5862974	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	5889126	.	C	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:79,0,30
7	5950934	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	6026865	.	T	C	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.965;DP=14;FS=18.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:284,0,206
7	6036980	.	G	C	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
7	6048973	.	C	A	1094.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.124;DP=28;FS=8.451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=31.55;ReadPosRankSum=0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:74:1123,74,0
7	6055706	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	6062526	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,151
7	6062528	.	T	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
7	6062828	.	C	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,184
7	6066005	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:71,0,29
7	6066461	.	T	C	638.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.688;DP=53;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,20:53:99:667,0,1288
7	6069653	.	G	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
7	6070856	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
7	6185194	.	A	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:137,0,61
7	6189420	.	T	G	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:185,0,181
7	6189717	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:152,0,186
7	6189750	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,116
7	6189780	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,157
7	6194274	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:133,0,259
7	6202056	.	G	A	81.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:110,0,25
7	6204220	.	C	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:151,0,65
7	6204999	.	A	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	6370144	.	G	A	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.971;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.353	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:343,0,342
7	6370194	.	C	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:222,0,357
7	6370406	.	C	T	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:239,0,387
7	6432312	.	A	G	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
7	6434077	.	C	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:103,0,275
7	6455018	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	6462299	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	6505901	.	T	C	2378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2407,166,0
7	6510364	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	6511946	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	6512050	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	6521144	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	6523614	.	C	T	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.626;DP=61;FS=4.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,12:61:99:337,0,1865
7	6617247	.	C	G	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
7	6621277	.	G	A	936.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:965,66,0
7	6623553	.	A	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	6639953	.	G	A	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:648,48,0
7	6642043	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
7	6643664	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
7	6643700	.	A	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	6644672	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,157
7	6647738	.	T	C	428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:457,33,0
7	6655626	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	6656897	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	6662749	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
7	6663670	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
7	6678421	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:77,0,33
7	6679882	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	6679985	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
7	6680674	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:57,0,37
7	6692605	.	T	C	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=21.76;ReadPosRankSum=1.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:420,0,244
7	6694259	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,140
7	6694718	.	A	G	299.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.177;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:328,0,319
7	6728859	.	A	G	608.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.124;DP=21;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,16:21:99:637,0,155
7	6740746	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	6740763	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:74,0,30
7	6746098	.	C	A	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:254,0,99
7	6771552	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,143
7	6776956	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,110
7	6786731	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,112
7	6791527	.	G	A	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,176
7	6845516	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	6863385	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	6990551	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	7276954	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	7284890	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
7	7592177	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
7	7606539	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	7606606	.	G	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
7	7606852	.	C	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
7	7607261	.	A	G	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=15.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:310,0,128
7	7613039	.	C	T	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:89:89,0,392
7	7614345	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	7614586	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
7	7617318	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:71,0,35
7	7618152	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
7	7618720	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	7618730	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	7619523	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	7620125	.	A	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
7	7621051	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	7622820	.	G	T	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,423
7	7628579	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	7646651	.	G	T	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
7	7646687	.	A	G	708.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:737,51,0
7	7647188	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	7647714	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	7647875	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	7648608	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	7648951	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	7653076	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
7	7656631	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	7659030	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	7659502	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	7659855	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	7918051	.	G	C	248.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.00;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:12:276,0,12
7	7918592	.	C	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
7	7918642	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	8007509	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
7	8125964	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:114,0,69
7	8127710	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:119,0,33
7	8152979	.	C	G	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:335,27,0
7	8154153	.	C	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:140,0,71
7	8156375	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
7	8157887	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	8160102	.	G	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,76
7	8160668	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
7	8161222	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
7	8161819	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	8161981	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	8165007	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
7	8165008	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
7	8165121	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,150
7	8165803	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,78
7	8174078	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	8175787	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	8182087	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	8184961	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	8187823	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	8190060	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	8381670	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
7	8382943	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	8385264	.	T	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,198
7	8385683	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	8393910	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	8394248	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
7	8395720	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	8396706	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	8396913	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	8398567	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	8422236	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,111
7	8424851	.	C	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
7	8426346	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	8427272	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	9767450	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	10972639	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	10977205	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	10977212	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	11022230	.	A	G	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
7	11022564	.	G	A	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:656,48,0
7	12272001	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:94:94,0,319
7	12272865	.	T	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:110,0,65
7	12274220	.	A	G	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:275,0,145
7	12275508	.	T	C	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:184,0,148
7	12275818	.	A	G	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:223,0,222
7	12276045	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
7	12374771	.	T	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	12395813	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
7	12400837	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
7	12610594	.	A	G	233.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:262,21,0
7	12687998	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	12727826	.	G	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,199
7	12729269	.	C	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,70
7	16131260	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
7	16316822	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	16639615	.	A	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
7	16640197	.	T	C	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:193,0,335
7	16640201	.	G	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:152,0,421
7	16640300	.	A	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:148,0,30
7	16640358	.	T	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
7	16685870	.	C	T	1301.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1330,96,0
7	16740101	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
7	16742855	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
7	16821355	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,117
7	16822875	.	C	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:106,0,66
7	16823978	.	T	G	791.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.362;DP=48;FS=17.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,22:48:99:820,0,964
7	16832242	.	C	T	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:273,0,215
7	16835333	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:66,0,33
7	16844663	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.673;DP=16;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:77:77,0,489
7	16844681	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=-0.553;DP=21;FS=13.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:71:71,0,694
7	16886340	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	17384832	.	A	G	131.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:16:160,0,16
7	17831806	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
7	17854532	.	G	T	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
7	17920613	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	19038646	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	19038678	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	20178175	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	20180717	.	C	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
7	21552995	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	21940823	.	A	G	396.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-2.601;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=20.88;ReadPosRankSum=2.353	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:425,0,288
7	21941061	.	C	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.932;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,197
7	21956405	.	G	A	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:225,0,175
7	22158977	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:57:57,0,112
7	22551100	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	22551681	.	G	A	52.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:81,0,22
7	22551683	.	T	C	52.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:22:81,0,22
7	22852643	.	T	A	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,255
7	22858256	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	22862467	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
7	22982207	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	22982547	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
7	22983702	.	A	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
7	22983890	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	22984772	.	A	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,395
7	22984773	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,395
7	22984824	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	23196018	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	23197661	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	23240263	.	G	A	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,184
7	23296533	.	G	A	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=1.078;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,10:45:99:300,0,1427
7	23563617	.	A	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:79,0,30
7	23564625	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
7	23566896	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:77,0,69
7	23568653	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:101,0,110
7	23683779	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	25158964	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:114,0,97
7	25159184	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:152,0,67
7	25161970	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,106
7	25988899	.	T	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
7	25989520	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	26206020	.	G	A	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
7	26207755	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
7	26207939	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,74
7	26208025	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
7	26208736	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
7	26208805	.	C	T	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
7	26209061	.	G	A	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:649,51,0
7	26209206	.	C	A	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:325,24,0
7	26209500	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:51:51,0,383
7	26210306	.	C	A	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:527,36,0
7	26210557	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,224
7	26211623	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	26211703	.	T	A	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
7	26211782	.	G	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	26212182	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
7	26212471	.	T	G	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
7	26214327	.	G	T	677.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:706,48,0
7	26214419	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	26214420	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	26217450	.	T	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	26219274	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	26219777	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	26221303	.	A	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	26222222	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,78
7	26222350	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	26222966	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
7	26223294	.	A	G	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
7	26223431	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
7	26223606	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	26224128	.	G	A	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
7	26224760	.	G	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,183
7	26226137	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
7	26227115	.	C	T	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:211,0,265
7	26227687	.	A	G	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
7	26227777	.	A	C	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
7	26228080	.	T	C	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
7	26228509	.	C	T	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:708,48,0
7	26232367	.	T	C	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
7	26232396	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	26232627	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	26235637	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	26236778	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	26237609	.	A	C	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
7	26239086	.	G	C	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=25.31;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:64:256,0,64
7	26239650	.	G	A	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
7	26239762	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,227
7	26239782	.	G	T	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:92:92,0,142
7	26241669	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	26243983	.	T	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
7	26248965	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	26249739	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	26250940	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	26251843	.	C	T	839.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:60:868,60,0
7	26252166	.	G	A	2413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2442,169,0
7	27860762	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	27862910	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	27866231	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	27868956	.	A	G	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:249,0,329
7	27869782	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
7	27877537	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	28830097	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
7	28830101	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
7	28996220	.	G	A	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
7	28996944	.	T	C	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
7	28997765	.	C	G	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:475,36,0
7	28998663	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	28998699	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	29002006	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	29037917	.	C	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	29070209	.	G	A	194.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:223,18,0
7	29550205	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	29552247	.	C	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:149,0,30
7	29552463	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	29552777	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	29553339	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	29554284	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	29603199	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,144
7	29603280	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	29603815	.	G	A	647.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-1.715;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,17:23:99:676,0,183
7	29604255	.	G	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:188,0,143
7	29605156	.	T	C	166.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.83;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:195,0,24
7	29605481	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	29605549	.	G	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,188
7	29605975	.	C	G	1166.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1195,87,0
7	29606288	.	C	T	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.345;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:492,0,493
7	29606425	.	C	T	671.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.202;DP=42;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,19:42:99:700,0,855
7	29690262	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
7	29724685	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	29966141	.	T	C	643.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.687;DP=49;FS=11.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,19:49:99:672,0,1139
7	29974308	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	30122338	.	G	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,109
7	30175516	.	T	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:102,0,74
7	30180649	.	T	C	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,40
7	30189348	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	30199074	.	G	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:304,0,164
7	30408353	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,184
7	30410965	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
7	30411903	.	G	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,316
7	30538090	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	30538651	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	30540399	.	G	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	30540482	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
7	30541141	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	30541797	.	A	G	247.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:276,21,0
7	30543078	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
7	30543249	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
7	30543734	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
7	30543764	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	30544360	.	G	A	1851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1880,129,0
7	30545263	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	30545278	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	30552179	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	30560395	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	30562807	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	30562952	.	C	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	30573652	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	30577041	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	30583652	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	30588091	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	30599300	.	A	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
7	30600043	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	30600047	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	30612447	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	30612614	.	A	G	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
7	30616247	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	30616761	.	A	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	30617474	.	T	C	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:623,45,0
7	30617532	.	T	C	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
7	30625161	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	30625383	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	30625726	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	30626569	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	30634661	.	C	G	1882.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1911,144,0
7	30662237	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	30664982	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	30668882	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	30831082	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,75
7	32514958	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	32525791	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:165,0,30
7	32526066	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.452;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:222,0,315
7	32526181	.	C	T	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:380,0,208
7	32535378	.	C	T	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:240,0,408
7	32598630	.	T	A	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=20.51;ReadPosRankSum=1.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:418,0,288
7	32598656	.	C	T	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.246;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.655	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:421,0,377
7	32613020	.	A	G	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-1.039;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:326,0,521
7	32618737	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	32619577	.	T	C	120.25	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	32620845	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	32623477	.	C	G	442.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-0.415;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.230	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:471,0,547
7	32623796	.	C	T	336.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=30.62;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:53:365,0,53
7	32624811	.	C	T	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:247,0,208
7	32624954	.	T	C	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:654,48,0
7	32625099	.	C	T	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
7	32625431	.	G	A	712.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:741,54,0
7	32625526	.	T	G	754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:783,54,0
7	32626006	.	A	G	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
7	32626662	.	G	A	458.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.058;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.116	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:487,0,398
7	32793767	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	32797921	.	G	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,106
7	32894503	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	32908135	.	C	G	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
7	32908287	.	T	C	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
7	32908704	.	T	C	248.31	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,7:8:1:274,1,0
7	32961023	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	33044522	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,115
7	33045749	.	G	A	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.336;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:163,0,177
7	33056050	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	33057746	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	33060946	.	A	G	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:257,0,383
7	34968744	.	G	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,394
7	34969389	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,110
7	34970685	.	C	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,230
7	34970909	.	G	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,162
7	34979905	.	C	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,143
7	35672976	.	G	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:181,0,218
7	35674406	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	35709842	.	C	T	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=18.25;ReadPosRankSum=2.040	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:302,0,255
7	35732656	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	35734529	.	C	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:119,0,282
7	35735193	.	G	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
7	35735537	.	G	A	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
7	35735579	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
7	35737085	.	G	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
7	35940306	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
7	35945202	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	36193142	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
7	36320821	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:113,0,70
7	36338841	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:157,0,31
7	36340614	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
7	36364783	.	C	T	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:356,24,0
7	36438709	.	C	G	362.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.282;DP=28;FS=3.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:391,0,651
7	36445855	.	A	C	523.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.763;DP=34;FS=10.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:552,0,722
7	36445856	.	G	A	1420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1449,99,0
7	36446121	.	A	G	622.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=2.176;DP=30;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=20.76;ReadPosRankSum=-2.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:651,0,458
7	36448777	.	G	A	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
7	36455477	.	T	C	653.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=1.111;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,19:41:99:682,0,823
7	36481482	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
7	36481660	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	36483213	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
7	36492212	.	C	T	900.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.654;DP=36;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=25.02;ReadPosRankSum=0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,24:36:99:929,0,413
7	36492609	.	C	T	602.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.896;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,17:34:99:631,0,619
7	37183035	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	37183042	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	37183050	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	37183051	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	37988589	.	C	T	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
7	37990473	.	T	G	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
7	37990917	.	A	G	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
7	37991129	.	C	A	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
7	37991186	.	C	T	529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:558,39,0
7	37991389	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	38298453	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,107
7	38763060	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	38763074	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	38763151	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
7	38763202	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
7	38763212	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	38764286	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,117
7	38764676	.	C	T	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
7	38771446	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
7	38787057	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	38787243	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	38789213	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	38789904	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
7	38790552	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	38791112	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	39741164	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	39746466	.	T	C	1019.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1048,72,0
7	39821360	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:106,0,34
7	39990330	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,187
7	39990548	.	A	G	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
7	40027484	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.015;DP=23;FS=17.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.995;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:187,0,623
7	40097798	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
7	40127767	.	G	A	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.922;DP=17;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:214,0,350
7	40135669	.	T	C	54.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:80,0,1
7	42088222	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:50:73,0,50
7	42938042	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	42942126	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	42946707	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
7	42946711	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
7	42958847	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	42959831	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	42974827	.	A	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
7	42976135	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	42976197	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	42976789	.	A	G	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
7	42977091	.	G	A	1589.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1618,111,0
7	42977243	.	T	C	1272.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1301,90,0
7	43648574	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:54:78,0,54
7	43649141	.	A	G	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:280,0,105
7	43653076	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
7	43653316	.	G	A	73.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:102,0,26
7	43653759	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	43658789	.	G	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
7	43660819	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	43660893	.	T	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
7	43661151	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	43661476	.	T	A	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
7	43662089	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	43662443	.	G	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:74,0,63
7	43662893	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	43664198	.	A	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=4.13;ReadPosRankSum=-2.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:86:86,0,453
7	43664280	.	A	G	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
7	43664477	.	T	C	412.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=-1.055;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:441,0,211
7	43664625	.	G	T	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:383,0,167
7	43664785	.	C	T	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
7	43665136	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,107
7	43665500	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,200
7	43665808	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
7	43667576	.	C	T	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
7	43667786	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	43668087	.	C	T	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:80,0,27
7	43668744	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	43669666	.	A	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
7	43670323	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,189
7	43670562	.	T	C	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:89:89,0,207
7	43671232	.	C	T	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:770,54,0
7	43672955	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:81:81,0,421
7	43673051	.	C	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:138,0,69
7	43673232	.	A	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,108
7	43674711	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
7	43676520	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	43676850	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	43678997	.	T	C	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:577,39,0
7	43685287	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
7	43690243	.	C	T	1102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1131,81,0
7	43691408	.	C	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:112,0,34
7	43807429	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	43807431	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	43810764	.	G	A	1648.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1677,117,0
7	43846603	.	A	G	821.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=-1.120;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.438	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,22:36:99:850,0,473
7	43916138	.	C	G	840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:59:869,59,0
7	43916491	.	G	A	442.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.899;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:471,0,350
7	43916727	.	T	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:229,0,135
7	43917013	.	G	A	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:217,0,181
7	43917274	.	A	G	580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:609,45,0
7	43924298	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	44022213	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	44027348	.	A	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
7	44054352	.	T	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:185,0,218
7	44084292	.	C	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
7	44085131	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	44097696	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	44102863	.	T	G	105.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:134,15,0
7	44113478	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:120,0,244
7	44118394	.	C	G	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:98:200,0,98
7	44248435	.	C	T	212.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:241,0,21
7	44249685	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
7	44249865	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:222,0,175
7	44259871	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:179,0,149
7	44442296	.	A	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
7	44606098	.	C	T	552.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.158;DP=49;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.116	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,17:49:99:581,0,1156
7	44614297	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,176
7	44615161	.	A	G	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.08;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:259,0,103
7	44615186	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,157
7	44615988	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	44616145	.	G	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,109
7	44616535	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:118,0,69
7	44618448	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,197
7	44618599	.	T	A	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:212,0,398
7	44619302	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:140,0,109
7	44620463	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,107
7	44620836	.	C	A	813.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-1.020;DP=41;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,22:38:99:842,0,595
7	44748330	.	A	G	1118.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1147,81,0
7	44790988	.	G	A	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
7	44792541	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	44802401	.	A	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
7	44808017	.	G	A	910.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.734;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=30.24;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:40:939,40,0
7	44808091	.	T	G	1183.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1212,84,0
7	44809273	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:30:439,30,0
7	44809276	.	G	C	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:30:439,30,0
7	44809777	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	44810728	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	44810985	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	44812338	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	44812409	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	44836385	.	C	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-0.215;DP=41;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,10:38:99:304,0,1080
7	44837298	.	G	A	270.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.818;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:299,0,345
7	44837916	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	44838095	.	T	C	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
7	44839616	.	C	T	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
7	44840259	.	A	G	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
7	44840864	.	G	A	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
7	44841489	.	A	G	714.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=1.445;DP=26;FS=4.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=27.49;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,19:26:99:743,0,239
7	44841519	.	A	G	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=2.579;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:99:126,0,927
7	44841646	.	A	C	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-1.223;DP=38;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,11:38:99:372,0,1029
7	44841775	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-2.192;DP=14;FS=18.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=2.20;ReadPosRankSum=2.192	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:59:59,0,292
7	44841888	.	T	C	283.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:312,24,0
7	44841928	.	A	G	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=2.425;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:243,0,508
7	44842099	.	A	G	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.892;DP=30;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.841	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,6:30:99:166,0,906
7	44842421	.	A	G	1273.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1302,90,0
7	44866633	.	A	G	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=21.21;ReadPosRankSum=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:304,0,182
7	44866704	.	A	G	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:822,57,0
7	44866832	.	T	G	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.136;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:502,0,448
7	44867005	.	G	A	1329.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1358,93,0
7	44868067	.	C	T	496.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.528;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:525,0,541
7	44868102	.	A	G	1081.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1110,78,0
7	44868379	.	A	G	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
7	44868447	.	T	C	1144.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1173,81,0
7	44868971	.	G	A	427.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:456,0,248
7	44869276	.	A	G	1245.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1274,87,0
7	44869537	.	C	T	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:685,51,0
7	44870547	.	T	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.934;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:42:42,0,499
7	44870813	.	G	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
7	44870933	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,157
7	44871757	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,314
7	44871948	.	G	A	1048.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-1.733;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.600	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:68:1077,68,0
7	44872266	.	C	G	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
7	44872419	.	T	C	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:170,0,500
7	44872427	.	T	C	470.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.653;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=27.69;ReadPosRankSum=-1.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:499,0,197
7	44872437	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.403	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:104,0,1117
7	44872473	.	T	C	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.033;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:221,0,753
7	44872505	.	T	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.546;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:127,0,482
7	44872511	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,446
7	44872676	.	A	G	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
7	44872899	.	T	C	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.791;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:465,0,240
7	44872900	.	T	C	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=1.739;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:169,0,509
7	44872911	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=1.032;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:64:64,0,1411
7	44872970	.	T	C	242.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:271,0,19
7	44873125	.	C	A	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:167,0,127
7	44873374	.	C	T	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.131;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:408,0,418
7	44873444	.	C	G	1066.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1095,78,0
7	44874966	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	44882104	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	44917040	.	A	G	397.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:426,0,351
7	44918206	.	C	T	503.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:532,36,0
7	44919200	.	G	A	710.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:739,51,0
7	44920707	.	T	A	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=1.172;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.172	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:364,0,385
7	44921521	.	G	A	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.004;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.187	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:43:43,0,455
7	44923884	.	T	G	697.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-1.343;DP=32;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=21.81;ReadPosRankSum=1.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,19:32:99:726,0,413
7	44924627	.	A	C	554.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:583,42,0
7	45023302	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
7	45024413	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
7	45024876	.	A	G	197.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:226,18,0
7	45025542	.	C	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
7	45115773	.	T	C	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-1.892;DP=15;FS=15.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:288,0,196
7	45765234	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	45851392	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,151
7	45851393	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,151
7	45853815	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	45853819	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	45853820	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	45853822	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	45952254	.	T	A	487.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:516,0,119
7	45960645	.	G	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.68;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:67:180,0,67
7	47317046	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,109
7	47317510	.	G	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:137,0,256
7	47323456	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:141,0,187
7	47343083	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:71:101,0,71
7	47408029	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	47408974	.	T	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	47971575	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	47996232	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	48003665	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	48003767	.	G	A	284.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:313,24,0
7	48004962	.	C	T	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
7	50512284	.	T	C	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:534,39,0
7	50512857	.	C	T	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
7	50512929	.	C	A	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
7	50517271	.	G	A	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:657,48,0
7	50658964	.	C	A	702.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:731,51,0
7	50659193	.	C	T	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-2.119;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:334,0,315
7	50660438	.	T	C	867.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:896,63,0
7	50669964	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	50670077	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	50671350	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	50671481	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	50673029	.	T	C	982.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1011,69,0
7	50742180	.	C	T	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.67;ReadPosRankSum=-1.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:364,0,344
7	51084304	.	C	A	292.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:17:321,0,17
7	51084321	.	T	C	461.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:490,33,0
7	51093013	.	A	T	386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:415,30,0
7	51093448	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	51096117	.	G	A	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.634;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:239,0,586
7	51096974	.	C	T	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:658,45,0
7	51097063	.	T	G	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
7	55214348	.	C	T	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
7	55268976	.	C	T	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:140,0,255
7	55274084	.	T	C	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
7	55275482	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	55275602	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,224
7	55275910	.	C	T	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
7	55276010	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	55276280	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	55276441	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
7	55278852	.	C	A	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
7	55434730	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	55459563	.	A	G	547.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.987;DP=22;FS=8.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:576,0,235
7	55464423	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	55499058	.	A	G	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:837,57,0
7	55499591	.	C	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:189,0,149
7	55501248	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	55501275	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
7	55537497	.	C	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
7	55540132	.	G	A	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.78;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:236,0,148
7	55540707	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:119,0,71
7	55803794	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,264
7	55803803	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:101,0,192
7	55811442	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
7	56010754	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
7	56010924	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56012010	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
7	56019694	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	56022981	.	T	C	520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:549,39,0
7	56023486	.	T	C	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
7	56044722	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	56046421	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	56047832	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56063201	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	56064262	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	56065864	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
7	56067016	.	G	T	1814.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1843,129,0
7	56068980	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	56078333	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,121
7	56078965	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:92:92,0,335
7	56079444	.	G	A	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-0.833;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:289,0,474
7	56087465	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	56087474	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	56088786	.	A	T	46.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=1.848;DP=33;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.351	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,4:33:75:75,0,2313
7	56088789	.	G	A	46.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=1.487;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,3:32:75:75,0,2313
7	56088825	.	T	A	740.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=4.251;DP=50;FS=5.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,22:50:99:769,0,1054
7	56108571	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:74,0,72
7	56108839	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	56109834	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	56118995	.	A	G	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:351,0,217
7	56125757	.	A	G	984.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.057;DP=67;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,28:67:99:1013,0,1501
7	56126360	.	T	C	2791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2820,196,0
7	56128911	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
7	56130832	.	T	A	491.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.198;DP=44;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.074	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,15:44:99:520,0,1143
7	56136260	.	C	A	2074.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2103,147,0
7	56142519	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
7	56143081	.	A	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
7	56143609	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:115,0,131
7	56143617	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,1:3:99:115,0,131
7	56144079	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,134
7	56146004	.	G	A	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
7	56146737	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
7	56146956	.	T	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
7	56169419	.	C	T	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
7	56174115	.	A	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:197,0,162
7	56174118	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,162
7	56174140	.	G	T	1035.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1064,72,0
7	56558409	.	A	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
7	56558442	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56558449	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56558459	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56558460	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56558468	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56558909	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56558913	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56558948	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	56559358	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	56559446	.	C	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
7	56560300	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56560473	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56560477	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56560738	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	56560739	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	56560765	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56560775	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
7	56561499	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	56561909	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56561918	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56561919	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56561929	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562018	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562025	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562029	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562085	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562091	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562094	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562100	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562542	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562551	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	56562817	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	56563144	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56563146	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	56611138	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	56611147	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
7	56611152	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
7	57957932	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	57957934	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	57957937	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	57957945	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	57957946	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	62711217	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	62711222	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	63807415	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	63809218	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
7	63810219	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
7	63810359	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	63811373	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	63811744	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,75
7	63811804	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	63812551	.	G	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
7	63812774	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,156
7	63813888	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	63814288	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	63814487	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	63836903	.	A	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,152
7	63843623	.	A	G	93.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:14:122,0,14
7	63957640	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	63958543	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	63962679	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	63976549	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	63976556	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	63976580	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:101,0,32
7	63981188	.	C	T	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
7	63981425	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
7	63981559	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,217
7	63981563	.	A	G	330.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:359,27,0
7	64062895	.	A	G	122.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:150,12,0
7	64064839	.	G	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	64064856	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,75
7	64065490	.	T	C	63.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
7	64067357	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	64069112	.	G	A	149.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:178,15,0
7	64070900	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	64071382	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	64072452	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
7	64076602	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	64077711	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	64126536	.	G	C	133.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:162,0,27
7	64140347	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,112
7	64141291	.	A	G	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
7	64142030	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:78:78,0,155
7	64142620	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
7	64143207	.	A	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,200
7	64144329	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	64146378	.	C	T	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
7	64147015	.	A	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
7	64147169	.	C	T	291.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.42;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:320,0,19
7	64149621	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	64150010	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	64150267	.	A	G	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:129,0,30
7	64168806	.	T	C	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-1.453;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=13.98;ReadPosRankSum=1.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:168,0,186
7	64254901	.	T	C	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
7	64283692	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	64289545	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	64291333	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	64291976	.	G	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:52:52,0,260
7	64291991	.	T	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
7	64292966	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
7	64293042	.	C	T	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
7	64293492	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
7	64293538	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	64294252	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	64294296	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	64294832	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
7	64295621	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
7	64296070	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
7	64296339	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	64296793	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:157,0,31
7	64296966	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	64297500	.	C	A	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:179,0,147
7	64298145	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	64298329	.	C	T	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
7	64298346	.	C	T	281.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:310,24,0
7	64298377	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
7	64298404	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:53:53,0,69
7	64298845	.	C	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
7	64299150	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
7	64299217	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,137
7	64299327	.	C	T	64.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:93,0,24
7	64299350	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	64299415	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
7	64299440	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	64299813	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:120,0,69
7	64299838	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
7	64299943	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:261,18,0
7	64299946	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	64301262	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	64301276	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	64301713	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	64302081	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
7	64302244	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	64303065	.	T	G	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
7	64303484	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	64320010	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	64320673	.	A	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
7	64402396	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	64409606	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	64435489	.	A	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
7	64436700	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	64437406	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:114,0,32
7	64437820	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	64437832	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
7	64438667	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:117,0,72
7	64450556	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:115,0,33
7	64450713	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	64451699	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
7	64451963	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	64452830	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	64453635	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	64462326	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	64464495	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	64464998	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	64465502	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
7	64466687	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	64563772	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
7	64566150	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	64863392	.	C	T	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=1.408;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=23.58;ReadPosRankSum=-1.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:382,0,160
7	64864607	.	G	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:188,0,113
7	64864800	.	A	G	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=17.88;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:207,0,139
7	64864912	.	A	C	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:98:271,0,98
7	64865118	.	A	G	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:303,0,216
7	64865254	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,368
7	64865280	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=18.75;ReadPosRankSum=-1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:197,0,121
7	65198302	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	65215455	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
7	65215580	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	65216099	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	65217203	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65224223	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
7	65228507	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65230515	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65238652	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65238694	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:64,0,37
7	65278747	.	T	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
7	65421464	.	G	T	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=27.83;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:92:390,0,92
7	65424483	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
7	65425894	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.698;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:155,0,591
7	65441795	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,79
7	65552497	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65552614	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
7	65561877	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	65595217	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	65617595	.	T	C	664.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=2.350;DP=30;FS=7.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:693,0,393
7	65617628	.	A	G	539.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-2.491;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.816;QD=20.76;ReadPosRankSum=-1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:568,0,397
7	65617655	.	G	A	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.829;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:291,0,927
7	65617673	.	G	A	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.206;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,11:36:99:370,0,947
7	65617971	.	G	A	1456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1485,105,0
7	65618198	.	G	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=13.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:148,0,693
7	65618674	.	G	A	1303.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1332,99,0
7	65619104	.	G	A	1110.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1139,81,0
7	65619205	.	T	C	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
7	65619237	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.992;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:118,0,628
7	65619292	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:156,0,478
7	65619344	.	A	G	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.873;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:54:54,0,945
7	65620566	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:123,0,33
7	65620759	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
7	65621004	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65622029	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,160
7	65622846	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65622960	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	65623129	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
7	65625751	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	65844828	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,114
7	65849978	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
7	65864704	.	A	C	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
7	65993645	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	66010402	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	66010543	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,141
7	66019154	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:103,0,268
7	66019190	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
7	66038472	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	66044160	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	66105163	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	66105198	.	C	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	66105946	.	G	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,278
7	66106875	.	A	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
7	66107252	.	T	C	127.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:156,0,27
7	66118248	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	66118671	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	66119420	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	66119889	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	66121069	.	A	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	66122334	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	66132512	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	66147149	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	66147178	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
7	66180770	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,83
7	66180775	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,83
7	66204537	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	66205220	.	A	G	334.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.311	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:363,0,304
7	66205550	.	C	T	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-2.536;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:232,0,400
7	66205582	.	A	G	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:340,0,165
7	66276153	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,148
7	66366821	.	A	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,147
7	66367132	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
7	66420988	.	T	C	800.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=30.79;ReadPosRankSum=1.569	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:27:829,27,0
7	66421446	.	T	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,200
7	66774604	.	G	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.206;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:144,0,605
7	66785714	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:140,0,228
7	68527448	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	69063886	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	69063889	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	70251690	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	70251923	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	70255115	.	C	T	390.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=27.91;ReadPosRankSum=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:40:419,0,40
7	70942844	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	70946448	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	70946807	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	70958236	.	G	A	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
7	70958304	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
7	70973173	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	72307542	.	C	T	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
7	72417063	.	G	A	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.80;ReadPosRankSum=-1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:290,0,100
7	72422456	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	72483668	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
7	72711167	.	G	A	98.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:126,12,0
7	72717933	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:96:96,0,203
7	72854841	.	A	C	216.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-2.067;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:254,0,293
7	72856269	.	G	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:164,0,377
7	72856430	.	T	C	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:130,0,314
7	72891754	.	C	T	764.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-2.351;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=28.32;ReadPosRankSum=2.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,20:27:99:793,0,182
7	72971834	.	G	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=-0.700;DP=24;FS=4.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:164,0,658
7	72984780	.	T	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-2.149;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:203,0,489
7	73007943	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:120,0,76
7	73085983	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:74,0,35
7	73092568	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	73095032	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
7	73096993	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.324;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:157,0,542
7	73097238	.	G	A	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.793;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:415,0,164
7	73097654	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:131,0,354
7	73100487	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
7	73100724	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
7	73103958	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
7	73108924	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
7	73110832	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	73111504	.	A	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
7	73112026	.	T	G	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:51,6,0
7	73112027	.	G	A	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:51,6,0
7	73114389	.	C	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,291
7	73114440	.	G	C	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=21.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:176,0,68
7	73121591	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	73151220	.	G	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-1.528;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:160,0,536
7	73151644	.	A	G	570.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-1.621;DP=60;FS=2.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.653	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,18:60:99:599,0,1640
7	73184435	.	G	C	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-2.419;DP=32;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.31;ReadPosRankSum=2.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,10:32:99:294,0,741
7	73184534	.	T	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.318;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:173,0,698
7	73227317	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	73243139	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	73243786	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	73244214	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	73245103	.	C	T	110.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:138,12,0
7	73245519	.	T	C	2681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2710,187,0
7	73246461	.	A	G	2891.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2920,202,0
7	73246496	.	C	T	2490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2519,181,0
7	73246555	.	C	G	2933.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2962,204,0
7	73536368	.	C	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=-0.065;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:199,0,293
7	73581179	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	73581180	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	73818404	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	73969541	.	A	G	683.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.452;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=32.56;ReadPosRankSum=0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,18:21:66:712,0,66
7	74296521	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,193
7	74296673	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
7	74296674	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:73:116,0,73
7	74297101	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,126
7	74489486	.	T	C	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.178;DP=28;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,8:28:99:216,0,634
7	74867598	.	G	C	54.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:92:92,0,92
7	75051324	.	G	C	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-1.435;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:141,0,522
7	75115201	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	75157374	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
7	75166424	.	C	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.283;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,404
7	75513062	.	A	G	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:770,54,0
7	75518020	.	G	A	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.062;DP=37;FS=8.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,6:37:99:130,0,1228
7	75603594	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	75609677	.	A	G	1491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1520,108,0
7	75611149	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	75611355	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	75614082	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
7	75614863	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	75614864	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	75614953	.	T	C	1393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1422,107,0
7	75621827	.	A	G	1308.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1337,93,0
7	75628669	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	75629778	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	75630274	.	T	C	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
7	75659815	.	T	C	1248.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1277,90,0
7	75677016	.	G	A	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
7	75677430	.	C	G	1702.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1731,120,0
7	75677804	.	T	G	67.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
7	75703166	.	T	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
7	75732888	.	T	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
7	75930789	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	75930800	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	75957815	.	A	C	1599.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.444;DP=56;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=28.57;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,41:56:99:1628,0,489
7	75959188	.	G	A	2463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2492,172,0
7	75961647	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	76069902	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	76112060	.	C	T	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
7	76219946	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	76226411	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	76238044	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	76248315	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	76249895	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	76255491	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	76608143	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	76617060	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	76751252	.	C	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,112
7	77035392	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
7	77247821	.	G	A	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
7	77287787	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	77365770	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
7	77423574	.	G	A	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.538;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:319,0,625
7	80291590	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
7	80373309	.	T	C	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
7	80373322	.	A	C	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
7	80373426	.	C	A	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
7	80373704	.	A	G	724.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:753,51,0
7	80373728	.	T	C	941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:970,66,0
7	80374342	.	A	G	1271.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1300,90,0
7	80374438	.	T	C	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:909,63,0
7	80378148	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	80378319	.	G	C	866.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:895,63,0
7	80418689	.	A	G	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-1.273;DP=28;FS=7.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.167	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:185,0,814
7	80963115	.	A	G	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
7	80963119	.	G	C	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:45:662,45,0
7	80963122	.	A	G	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:45:662,45,0
7	80963123	.	A	C	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:45:662,45,0
7	82581859	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	82582846	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	83029438	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	83037751	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	86789426	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:65,0,37
7	86800351	.	A	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:125,0,385
7	86816767	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,185
7	86816786	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,223
7	86825635	.	G	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:183,0,273
7	86948364	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	87003066	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
7	87022596	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	87835469	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	89983808	.	T	G	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:269,0,214
7	89984409	.	A	G	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=10.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:321,0,183
7	90001496	.	G	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:173,0,309
7	90016387	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:113,0,68
7	90019373	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
7	90043314	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
7	90044945	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
7	90225928	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:107,0,75
7	90838617	.	A	G	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:325,24,0
7	90838866	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,142
7	90838869	.	G	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
7	90894102	.	C	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:66,0,35
7	91502407	.	C	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,195
7	91570398	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:53:53,0,103
7	91630620	.	G	T	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:55:326,0,55
7	91632306	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	91641928	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
7	91691601	.	C	T	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-1.096;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:289,0,255
7	91712698	.	A	G	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:201,0,62
7	91713972	.	C	T	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:260,0,106
7	91714911	.	C	T	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
7	91715609	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:138,0,154
7	91715662	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:114,0,186
7	91719608	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	91721581	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	91726927	.	A	C	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.412	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:333,0,215
7	91735299	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	91742602	.	A	G	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:271,0,179
7	91742728	.	C	G	753.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.274;DP=26;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,20:26:99:782,0,165
7	91743150	.	A	G	949.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.687;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.923	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,25:36:99:978,0,357
7	91779971	.	T	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
7	91872197	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	91874527	.	C	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:118,0,31
7	92028039	.	C	A	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:286,0,457
7	92029302	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,276
7	92087218	.	G	C	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:82:82,0,412
7	92131289	.	G	T	262.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:291,24,0
7	92135802	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	92219644	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:159,0,141
7	92236164	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	92239531	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	92243672	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:73,0,69
7	92818503	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	92970847	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:53:53,0,352
7	92985252	.	T	C	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:271,0,144
7	92989228	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	93188622	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	93623458	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,155
7	94158026	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	94180691	.	T	C	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:231,0,107
7	94185890	.	A	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,113
7	94186010	.	C	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:161,0,31
7	94186064	.	A	C	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.03;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:414,0,138
7	94186068	.	A	G	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=32.15;ReadPosRankSum=-1.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:99:414,0,138
7	94296769	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
7	94297814	.	G	A	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:447,30,0
7	94898811	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	94903420	.	G	A	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
7	94920480	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	94921543	.	C	A	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
7	94924538	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	95036897	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	95038449	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	95041915	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,146
7	95043152	.	T	C	118.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:147,0,25
7	95043850	.	T	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
7	97488569	.	A	T	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.109;DP=32;FS=3.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:246,0,844
7	97501731	.	G	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:132,0,414
7	97835885	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	97836764	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
7	97838327	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
7	97845456	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	97845743	.	A	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
7	97846435	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	97852443	.	C	T	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:93:136,0,93
7	97854393	.	G	A	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	97863145	.	G	A	328.74	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.87;ReadPosRankSum=-0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:6:356,0,6
7	97881868	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
7	97882891	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	97883069	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	97883220	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
7	97888085	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	97891460	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	97915224	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	97932014	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	98532861	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	98562666	.	G	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
7	98607370	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
7	98610595	.	T	C	412.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.516;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=25.80;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:441,0,112
7	98610684	.	C	T	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-2.180;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=23.73;ReadPosRankSum=2.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:313,0,122
7	98626536	.	C	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:68:254,0,68
7	98650051	.	G	C	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
7	98741441	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:69,0,31
7	98984399	.	C	T	995.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.031;DP=30;FS=8.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,26:30:78:1024,0,78
7	98992253	.	G	T	358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:94:387,0,94
7	99006763	.	T	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:90:90,0,216
7	99012885	.	G	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:119,0,28
7	99015791	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,70
7	99016683	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:106,0,73
7	99017281	.	G	A	420.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=26.30;ReadPosRankSum=-0.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:449,0,114
7	99032593	.	G	T	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:56:313,0,56
7	99047978	.	T	C	867.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-0.686;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=28.93;ReadPosRankSum=0.932	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,23:30:99:896,0,210
7	99050238	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	99054289	.	T	G	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:357,0,122
7	99056099	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:108,0,65
7	99060603	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,80
7	99070884	.	T	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:155,0,62
7	99070988	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
7	99072527	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	99072528	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	99075831	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:105,0,118
7	99081730	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	99130577	.	C	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
7	99130875	.	G	A	132.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:161,0,22
7	99310181	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	99632979	.	G	C	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-2.083;DP=13;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.67;ReadPosRankSum=2.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:141,0,457
7	99632982	.	T	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=27.73;ReadPosRankSum=0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:98:361,0,98
7	99633733	.	G	A	688.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.146;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=27.55;ReadPosRankSum=-0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:717,0,550
7	99633739	.	G	C	688.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.434;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=29.95;ReadPosRankSum=-0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:717,0,550
7	99635369	.	C	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
7	99635967	.	G	A	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:302,0,304
7	99637242	.	G	A	653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:682,48,0
7	99637759	.	C	G	40.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.256;DP=21;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:69:69,0,708
7	99637844	.	G	T	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
7	99654600	.	A	G	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
7	99654689	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	99663516	.	A	G	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
7	99668107	.	G	T	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
7	99673359	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	99677219	.	C	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.076;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:119,0,494
7	99689521	.	C	G	1016.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-0.937;DP=34;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.044;QD=29.90;ReadPosRankSum=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,27:34:99:1045,0,177
7	99689615	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-1.185;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:72:72,0,609
7	99690690	.	G	C	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.052;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,16:66:99:507,0,1921
7	99690747	.	T	C	453.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.835;DP=84;FS=2.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:67,17:84:99:482,0,2543
7	99693078	.	G	A	1433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.008;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,39:59:99:1462,0,652
7	99693337	.	T	C	218.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:247,21,0
7	99693552	.	G	A	697.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.753;DP=70;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,22:70:99:726,0,1844
7	99703958	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	99704796	.	A	T	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
7	99704827	.	A	G	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:997,69,0
7	99706303	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
7	99716236	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,103
7	99716242	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,233
7	99716901	.	C	G	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
7	99720994	.	A	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	99747130	.	G	A	1535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1564,108,0
7	99747378	.	G	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
7	99751017	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	99810643	.	T	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,109
7	99812089	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,148
7	99816179	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
7	99816509	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	99818420	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:112,0,75
7	99949714	.	C	A	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.529;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:66:66,0,635
7	100014711	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,116
7	100064719	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.155;DP=23;FS=7.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:188,0,677
7	100137085	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,154
7	100175473	.	T	C	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:161,0,415
7	100271521	.	T	C	1069.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1098,84,0
7	100278282	.	G	C	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
7	100278554	.	A	G	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:449,33,0
7	100278657	.	A	G	333.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=30.35;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,10:11:2:360,2,0
7	100281768	.	T	C	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:489,36,0
7	100286525	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-1.098;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:184,0,175
7	100400402	.	C	T	342.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.957;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=10.08;ReadPosRankSum=0.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,11:34:99:371,0,845
7	100410597	.	G	A	1339.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1368,102,0
7	100417459	.	C	A	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.845;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:256,0,606
7	100426882	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
7	100426883	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
7	100427484	.	T	C	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:38,0,36
7	100452814	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	100454239	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:112,0,66
7	100458049	.	A	G	235.82	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:19:264,19,0
7	100458093	.	C	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:53:146,0,53
7	100458795	.	T	C	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:394,0,123
7	100468284	.	A	G	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:410,0,329
7	100482026	.	T	C	1137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.017;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,30:39:99:1166,0,273
7	100486110	.	C	T	719.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.636;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.432	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,20:28:99:748,0,252
7	100486656	.	T	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
7	100731505	.	C	G	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=20.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:47:171,0,47
7	100731829	.	T	C	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
7	100732321	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:105,0,145
7	100735080	.	G	C	132.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:19:161,0,19
7	100739147	.	C	T	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:90:347,0,90
7	100740633	.	T	G	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=24.42;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:64:248,0,64
7	100740785	.	G	A	250.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:13:279,0,13
7	100803488	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,157
7	100803490	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,157
7	100804140	.	C	T	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-1.781;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=15.70;ReadPosRankSum=1.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:452,0,557
7	101892328	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
7	101892452	.	G	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
7	101892833	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
7	101895864	.	C	T	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
7	101896725	.	G	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
7	101897227	.	C	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
7	101897945	.	G	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	101897982	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
7	101898037	.	G	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
7	101900110	.	G	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	101900122	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
7	101916647	.	A	G	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:610,45,0
7	101927099	.	C	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
7	102031667	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	102066539	.	A	G	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
7	102066873	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.962;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:107,0,500
7	102089595	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
7	102098010	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:77:77,0,198
7	102108532	.	G	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,355
7	102112980	.	G	A	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:270,0,100
7	102113909	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:180,0,242
7	102115646	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	102119322	.	T	C	514.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.850;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,15:19:99:543,0,111
7	102185923	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	102279621	.	C	T	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:58:234,0,58
7	102427889	.	C	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:162,0,31
7	102449305	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
7	102735681	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	102741034	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
7	102741093	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
7	102742144	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
7	102742218	.	G	A	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
7	102763510	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
7	102782179	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
7	102902488	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
7	102985211	.	C	G	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:263,0,60
7	103028205	.	T	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
7	104622402	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	104624312	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,76
7	104635597	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	104643470	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
7	104653265	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
7	104717517	.	C	T	453.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:98:482,0,98
7	104966321	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	104966328	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	104966329	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	104966333	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	105097918	.	T	C	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:49:404,0,49
7	105139833	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
7	105140002	.	A	T	32.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:60,6,0
7	105205815	.	C	A	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:272,0,103
7	105401015	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	105662690	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,192
7	105890056	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
7	105896527	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	105898474	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	105901699	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	106842324	.	C	T	783.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=-2.227;DP=22;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=30.76;ReadPosRankSum=2.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,20:22:17:812,0,17
7	106848955	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	107002806	.	A	G	592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:621,42,0
7	107260778	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	107260856	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,101
7	107399213	.	C	T	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:250,0,292
7	107544208	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	107544531	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:66,0,37
7	107544742	.	T	C	136.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:165,0,25
7	107559722	.	A	T	584.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=-0.162;DP=28;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=20.88;ReadPosRankSum=2.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,18:27:99:622,0,307
7	107559911	.	G	A	540.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=-0.812;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.673	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:569,0,439
7	107560191	.	C	T	792.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.171;DP=26;FS=8.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=30.49;ReadPosRankSum=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,21:26:99:821,0,132
7	107561155	.	T	C	84.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:113,0,27
7	107564366	.	T	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:186,0,110
7	107569517	.	A	G	366.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=33.28;ReadPosRankSum=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:12:394,0,12
7	107580839	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
7	107581346	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
7	107581936	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	107583241	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	107585844	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	107593989	.	T	C	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
7	107603431	.	A	C	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:234,0,101
7	108039978	.	T	G	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-0.101;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:440,0,739
7	108091979	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	108091984	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	108155051	.	C	T	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,206
7	108202792	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:185,0,28
7	108203710	.	G	A	165.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:18:194,0,18
7	108204479	.	A	G	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
7	108212353	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	108213926	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	108214932	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
7	112096073	.	T	C	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.317;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,10:31:99:332,0,808
7	112099634	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
7	112100770	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,123
7	112115658	.	C	T	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.639;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:47:47,0,470
7	112116659	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,106
7	112116980	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
7	112406507	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,187
7	114619598	.	C	A	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
7	115850675	.	C	T	640.98	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=1.187;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=33.74;ReadPosRankSum=-1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:13:669,13,0
7	116345770	.	G	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
7	116435768	.	C	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
7	116436022	.	G	A	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
7	116436097	.	G	A	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
7	116437206	.	A	G	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
7	116437504	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
7	116437606	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
7	116438418	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	116558716	.	G	A	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
7	116860825	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	116862260	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	117351163	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	117824239	.	G	C	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.639;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:214,0,450
7	117825681	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
7	117832138	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.197;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:158,0,511
7	117832650	.	G	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=2.15;ReadPosRankSum=2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,396
7	117833054	.	T	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:119,0,67
7	117834049	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,319
7	117834763	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,206
7	117834770	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,206
7	117834974	.	A	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,73
7	117837852	.	T	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:56,0,76
7	120428607	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
7	120989679	.	A	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,329
7	121946082	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:114,0,30
7	121946188	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	121947456	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:114,0,70
7	121950026	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	121950273	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	121971560	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	121976675	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	122111507	.	G	A	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:187,0,266
7	122303321	.	C	T	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
7	123322716	.	T	A	218.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:247,24,0
7	123388732	.	G	A	805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:834,60,0
7	123390143	.	G	A	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
7	126998876	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	127006220	.	C	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
7	127006366	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	127006625	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	127009515	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	127032599	.	A	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,137
7	127032653	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	127720524	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
7	127721507	.	T	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-1.450;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,8:38:99:230,0,1196
7	127945566	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:102,0,65
7	127945648	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	127945900	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
7	127947975	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:67:165,0,67
7	127947979	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:67:165,0,67
7	127948453	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
7	127948604	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
7	127950724	.	C	T	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:132,0,880
7	127950725	.	G	A	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=1.776;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=24.38;ReadPosRankSum=-1.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:394,0,343
7	127979347	.	C	T	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.380;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.790;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:382,0,208
7	128034629	.	C	T	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.264;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,9:48:99:251,0,1535
7	128036754	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:43:70,0,43
7	128040699	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	128040752	.	C	T	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
7	128044162	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
7	128047147	.	C	A	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:511,39,0
7	128047412	.	C	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
7	128048194	.	T	C	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:611,45,0
7	128048977	.	G	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,296
7	128061718	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	128100038	.	G	A	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
7	128100102	.	A	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:133,0,264
7	128100434	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
7	128100708	.	C	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:189,0,66
7	128100793	.	A	G	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
7	128100854	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,135
7	128100990	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,157
7	128101135	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,191
7	128102892	.	G	A	177.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:206,0,22
7	128109915	.	G	C	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:201,0,68
7	128111525	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,75
7	128132132	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	128141638	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	128141865	.	T	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
7	128142023	.	A	T	150.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:17:179,17,0
7	128142333	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,197
7	128142588	.	G	A	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
7	128143054	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,231
7	128143235	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,283
7	128167089	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,176
7	128169884	.	C	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:133,0,137
7	128171136	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	128173720	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,148
7	128280069	.	C	T	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:88:88,0,234
7	128281256	.	G	A	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:266,0,256
7	128289004	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
7	128292780	.	G	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:165,0,162
7	128292839	.	G	A	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:168,0,221
7	128293288	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.189;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:75:75,0,719
7	128293294	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.396;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:116,0,664
7	128293316	.	A	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:47:47,0,509
7	128293499	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,168
7	128293881	.	G	C	128.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:157,0,27
7	128293894	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,230
7	128294406	.	G	A	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,106
7	128294760	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
7	128296052	.	T	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
7	128298600	.	T	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
7	128300843	.	G	A	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=18.28;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:211,0,142
7	128301721	.	T	C	284.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:313,21,0
7	128394606	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.231;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:142,0,536
7	128403795	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	128405354	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
7	128409580	.	T	A	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.535;DP=23;FS=18.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:321,0,526
7	128594725	.	C	T	472.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-1.858;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=26.26;ReadPosRankSum=1.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:501,0,122
7	128597804	.	C	T	52.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:19:81,0,19
7	128607384	.	G	A	680.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-0.454;DP=25;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=27.23;ReadPosRankSum=0.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:709,0,232
7	128641226	.	G	C	608.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-1.362;DP=21;FS=9.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.280	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,16:21:99:637,0,159
7	128694976	.	C	T	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:79:410,0,79
7	128767041	.	G	T	281.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:310,24,0
7	128845277	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
7	128846328	.	G	C	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
7	128852913	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
7	128853057	.	A	G	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
7	128856865	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	129045986	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	129068147	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,195
7	129125825	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	129251065	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
7	129371374	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	129396034	.	C	A	285.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.77;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:15:314,0,15
7	129396252	.	G	T	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:200,0,24
7	129422662	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	129472281	.	C	G	701.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:730,51,0
7	129473739	.	C	T	907.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:936,66,0
7	129485357	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	129592517	.	G	A	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-1.741;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:210,0,418
7	129658259	.	T	C	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
7	129663496	.	C	T	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.196;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:436,0,136
7	129664312	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:181,0,133
7	129771117	.	G	A	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.545;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.201	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:265,0,259
7	129771144	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=-2.855;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:108,0,346
7	129772824	.	C	T	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:275,0,146
7	129773720	.	G	A	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:521,36,0
7	129774080	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.910;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:122,0,470
7	129774204	.	G	A	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:83:83,0,391
7	129774714	.	C	T	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:212,0,256
7	129821500	.	C	T	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:196,0,65
7	130080812	.	T	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
7	130145589	.	A	G	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.396;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:513,0,241
7	131122761	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	131180918	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
7	131186424	.	C	T	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
7	131190696	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,284
7	131191609	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	131193863	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	131196062	.	C	T	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=30.15;ReadPosRankSum=-0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:38:390,0,38
7	131241085	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
7	131815118	.	C	T	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
7	132639435	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	132745225	.	T	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
7	133417709	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	133417720	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	133417725	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	133580447	.	G	A	541.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.185;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=30.10;ReadPosRankSum=-1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:79:570,0,79
7	133749889	.	C	G	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:428,0,299
7	133749964	.	G	A	347.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:376,0,254
7	133976232	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
7	134212611	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	134673231	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	134695063	.	T	G	10.32	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:2:36,2,0
7	134695066	.	T	G	10.32	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:2:36,2,0
7	134695069	.	T	G	10.32	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:2:36,2,0
7	134696228	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	134701856	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	134845313	.	T	G	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
7	134845415	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	134845432	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	134847528	.	A	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
7	134847819	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,302
7	134847888	.	C	T	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
7	134848322	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
7	134849213	.	G	A	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:647,48,0
7	134849280	.	T	A	695.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:724,51,0
7	134849577	.	A	C	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
7	134850465	.	C	T	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:582,39,0
7	134850469	.	A	G	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:582,39,0
7	134852399	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	134853085	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	134870201	.	T	C	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
7	134871775	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
7	134872003	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	134872276	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	134872968	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
7	134879830	.	G	A	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
7	134882118	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	134889141	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
7	135047703	.	T	C	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
7	135268646	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	135268657	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	135279315	.	A	C	551.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.549;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=23.99;ReadPosRankSum=0.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:580,0,262
7	135304273	.	G	C	760.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:789,54,0
7	135329690	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.045;DP=21;FS=5.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:115,0,675
7	135329978	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	135345886	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
7	135360958	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	135390437	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	137564501	.	C	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,140
7	137600690	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
7	138088462	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	138088884	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	138088889	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	138259919	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	138274187	.	T	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	138305806	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	138391130	.	C	T	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=29.78;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:61:326,0,61
7	138391207	.	G	A	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.78;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:246,0,102
7	138417718	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,443
7	138417791	.	A	G	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:251,0,472
7	138418910	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=1.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:158,0,543
7	138455988	.	A	G	821.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:850,60,0
7	138518056	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	138583840	.	C	A	748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:777,54,0
7	138588410	.	T	C	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=24.32;ReadPosRankSum=-0.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:393,0,172
7	138708849	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:154,0,31
7	138708946	.	G	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:121,0,30
7	138729795	.	A	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,219
7	138730025	.	T	C	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=16.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:58:323,0,58
7	138730361	.	T	C	202.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:231,0,24
7	138730417	.	G	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:140,0,102
7	138730938	.	T	A	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:47:47,0,391
7	138731398	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,155
7	138731687	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:190,0,152
7	138731810	.	T	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,146
7	138732107	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
7	138732274	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	138732457	.	G	A	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.48;ReadPosRankSum=1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:283,0,105
7	138732497	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,99
7	138740037	.	G	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:197,0,66
7	139026152	.	T	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-1.559;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:106,0,593
7	139044891	.	G	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.343;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.904;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,5:27:99:108,0,764
7	139102490	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.250;DP=19;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:120,0,597
7	139103071	.	G	A	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:266,0,312
7	139103578	.	G	T	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,472
7	139104141	.	G	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-1.223;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:99:99,0,816
7	139106169	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.97;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,146
7	139107660	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.517;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:190,0,781
7	139107739	.	T	A	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-2.404;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:327,0,502
7	139113628	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	139126859	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,117
7	139132585	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	139132833	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	139133279	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:50:50,0,136
7	139135562	.	C	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.185;DP=25;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.037	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:99:101,0,811
7	139136416	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-1.176;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.095	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:108,0,742
7	139136670	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.509;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.509	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:155,0,549
7	139136852	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	139136853	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	139136956	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:60:60,0,438
7	139136963	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,438
7	139137562	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.297;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:99:123,0,1084
7	139163618	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	139167934	.	T	G	756.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-1.061;DP=28;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=27.03;ReadPosRankSum=0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,21:28:99:785,0,206
7	139168063	.	G	A	577.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=32.11;ReadPosRankSum=1.349	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:14:606,14,0
7	139252780	.	T	C	1137.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1166,81,0
7	139359658	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
7	139415775	.	G	C	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:619,42,0
7	139478085	.	C	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:54,0,33
7	139478175	.	T	G	379.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:408,30,0
7	139478194	.	G	C	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:43:43,0,342
7	139496215	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
7	139504468	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	139653196	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	139723742	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:113,0,63
7	139724169	.	A	G	210.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:239,0,25
7	139740586	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	139785024	.	C	A	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:40:582,40,0
7	139786186	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	139787189	.	G	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
7	139797431	.	G	T	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
7	139801777	.	T	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
7	139878184	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
7	139878329	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
7	139878802	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	139878952	.	T	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
7	139930949	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	140034294	.	C	G	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:54:395,0,54
7	140051091	.	G	A	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:195,0,378
7	140426257	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	140702682	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	140703735	.	G	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:64,0,37
7	140706157	.	G	T	858.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-1.467;DP=27;FS=7.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=31.81;ReadPosRankSum=1.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,22:27:99:887,0,132
7	140772893	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:122,0,33
7	140772997	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	140774467	.	C	G	85.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:113,12,0
7	141177192	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	141353748	.	C	T	122.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:151,0,26
7	141358153	.	A	G	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:82:82,0,401
7	141360992	.	C	T	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.743;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:245,0,494
7	141362431	.	T	C	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
7	141411807	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	141475596	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:113,0,34
7	141483590	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
7	142374895	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	142374915	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	142573613	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
7	142583330	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
7	142986898	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	142988736	.	C	G	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.231;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:539,0,439
7	142997858	.	T	A	32.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
7	143088526	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
7	143088823	.	T	C	385.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:414,30,0
7	143093538	.	G	A	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
7	143097100	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	143105830	.	C	A	222.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:251,21,0
7	143582267	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	143591491	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	143599247	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:153,0,62
7	143878488	.	C	G	115.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
7	143952243	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
7	143953533	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	144077616	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:148,0,56
7	144462990	.	C	T	214.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:243,0,23
7	148112987	.	C	A	290.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.31;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:319,0,19
7	148113895	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	148114265	.	A	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=23.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:50:192,0,50
7	148114865	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
7	148116450	.	A	G	204.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:233,0,24
7	148117505	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	148117642	.	C	T	192.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:20:221,0,20
7	148394595	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148395124	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148395484	.	G	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
7	148427873	.	G	A	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
7	148705221	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	148725714	.	G	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	148765633	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:81,0,78
7	148765635	.	A	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:81,0,78
7	148766323	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	148779400	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	148780658	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	148780659	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	148801091	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
7	148801658	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:103,0,72
7	148851213	.	G	A	415.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:93:444,0,93
7	148877737	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:320,0,137
7	148878620	.	T	A	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=25.78;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:60:286,0,60
7	148879134	.	A	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
7	148896265	.	A	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
7	148903431	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	148905351	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
7	148908562	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148927635	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148927636	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148927640	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148927641	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148927647	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148952312	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,187
7	148960847	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	148963937	.	G	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:159,0,101
7	148989781	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	148991712	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,115
7	148993169	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,118
7	148994241	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,288
7	149152770	.	A	G	729.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:758,60,0
7	149152906	.	G	A	831.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:860,60,0
7	149170236	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,111
7	149191306	.	C	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:95,0,118
7	149241253	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
7	149314756	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
7	149318375	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:63,0,36
7	149427409	.	T	G	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
7	149433143	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	149462337	.	G	A	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:330,27,0
7	149462381	.	C	T	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=15.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:239,0,159
7	149462523	.	C	G	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:493,36,0
7	149462621	.	T	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:87:87,0,379
7	149464262	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	149464376	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	149464391	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	149464433	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
7	149464546	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	149465674	.	C	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
7	149468419	.	G	C	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
7	149559465	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,182
7	149562285	.	C	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,232
7	149563134	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,193
7	149564037	.	C	T	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:48:48,0,275
7	149566175	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,146
7	149576818	.	A	G	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.269;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,16:51:99:500,0,1282
7	149577161	.	T	C	623.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-1.242;DP=38;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:652,0,759
7	149577420	.	C	T	455.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-0.949;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,16:49:99:484,0,1259
7	149577591	.	A	C	607.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.923;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,18:43:99:636,0,957
7	149585300	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	149585379	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	150067445	.	C	A	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:527,39,0
7	150093701	.	A	C	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
7	150107958	.	C	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:62:165,0,62
7	150107959	.	C	T	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:62:165,0,62
7	150108536	.	A	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
7	150648198	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	150726920	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
7	150733025	.	T	A	828.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.793;DP=32;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.915	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,22:32:99:857,0,344
7	150734380	.	T	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:131,0,111
7	150734586	.	C	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:118,0,71
7	150736965	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	150739330	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	150742700	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	150743820	.	A	G	176.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:20:205,0,20
7	150744041	.	A	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:60:199,0,60
7	150747746	.	A	G	291.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.43;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:17:320,0,17
7	150761548	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	150762871	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
7	150763655	.	T	A	572.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.033;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.367	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:601,0,236
7	150765065	.	T	C	1070.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.427;DP=33;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=32.45;ReadPosRankSum=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,28:33:99:1099,0,114
7	150765918	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	150766738	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	150766799	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
7	150778524	.	G	A	515.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.039;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:544,0,182
7	150779427	.	C	A	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.633;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,10:37:99:318,0,1036
7	150783883	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:77,0,66
7	150825315	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	150826385	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	150909617	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	150910642	.	C	T	608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:637,45,0
7	150916228	.	G	A	1367.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1396,96,0
7	150921950	.	A	G	1207.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1236,93,0
7	150930965	.	C	T	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
7	150931268	.	C	G	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:880,63,0
7	150933258	.	T	C	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
7	150933283	.	G	A	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
7	150934162	.	G	C	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
7	150934975	.	C	G	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
7	151064064	.	C	T	409.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=34.12;ReadPosRankSum=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:8:437,0,8
7	151074296	.	A	G	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.98;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:49:298,0,49
7	151074479	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.591;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:151,0,485
7	151075308	.	A	G	586.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:615,42,0
7	151529275	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	151810476	.	A	G	678.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.043;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:99:707,0,103
7	151818777	.	T	C	1081.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1110,78,0
7	151830890	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	151873853	.	C	T	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.887;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:502,0,163
7	152064035	.	C	A	832.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:861,60,0
7	152064047	.	C	T	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:873,60,0
7	152064066	.	T	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
7	152064259	.	G	A	1073.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1102,75,0
7	152339108	.	C	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
7	152342903	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,202
7	152342992	.	T	C	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:95:95,0,374
7	152342999	.	T	C	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:51:318,0,51
7	152343446	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
7	152343700	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,111
7	152344662	.	G	A	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:132,0,345
7	152345228	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	152456909	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:56:56,0,163
7	152540119	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	152540375	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	153110885	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,200
7	155088093	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
7	155088115	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:85,6,0
7	155088118	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	155088170	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
7	155088371	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	155099855	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
7	155100455	.	A	C	922.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.644;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=26.36;ReadPosRankSum=-1.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,27:33:99:1032,0,166
7	155436997	.	C	T	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
7	155437475	.	T	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
7	155503920	.	A	T	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:331,27,0
7	155569983	.	G	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=2.546;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=8.37;ReadPosRankSum=-2.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:137,0,359
7	156265337	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
7	156475447	.	G	A	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:201,0,69
7	156476389	.	A	G	550.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.350;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:579,0,203
7	156743048	.	C	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,239
7	156757513	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	156762248	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,102
7	156762883	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,268
7	156763203	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	156763550	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,222
7	156764431	.	T	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,440
7	156764766	.	A	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.931;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,291
7	156764887	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,229
7	156764972	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
7	156794983	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	156798704	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
7	156801700	.	G	T	127.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:156,15,0
7	156803323	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:82:195,0,82
7	156931674	.	C	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
7	156931907	.	G	T	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
7	157000176	.	T	C	616.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.280;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=22.84;ReadPosRankSum=1.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:645,0,357
7	157025224	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	157047713	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	157060845	.	G	C	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.102;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,10:32:99:346,0,833
7	157061474	.	T	C	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.976;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,9:34:99:246,0,853
7	157061642	.	C	A	862.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:891,63,0
7	157087629	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
7	157163068	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	157163614	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
7	157164220	.	A	C	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:77,0,26
7	157165104	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:108,0,70
7	157165520	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	157168469	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
7	157172597	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	157173473	.	A	G	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
7	157177367	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
7	157201769	.	A	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
7	157204576	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
7	157208617	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	157209491	.	T	C	439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:468,33,0
7	157209551	.	C	T	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:870,63,0
7	157332150	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
7	157332172	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	157959911	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
7	158380436	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:75,0,31
7	158387980	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,126
7	158387982	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,126
7	158387985	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,126
7	158421098	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
7	158421132	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
7	158422859	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
7	158424127	.	C	T	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:122,0,34
7	158433732	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
7	158530244	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	158532706	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
7	158532898	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
7	158551985	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
7	158564966	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
7	158672476	.	C	G	297.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:326,24,0
7	158697365	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
7	158703448	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	158715219	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
7	158724789	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	158738611	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
7	158738634	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
7	158746601	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
7	158822058	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
7	158823084	.	T	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
7	158823717	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
7	158825472	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
7	158827326	.	G	A	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:582,42,0
7	158829966	.	G	A	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:431,33,0
7	158830849	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
7	158831706	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
7	158832638	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	31748	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	249675	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
8	261001	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	266791	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	402692	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	406963	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	422818	.	G	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
8	424663	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	426372	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	441776	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	494804	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	592274	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	593041	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
8	599773	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	601035	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	602374	.	C	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	603117	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
8	603416	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	604262	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	606696	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	607566	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
8	608386	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	608661	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	608864	.	C	G	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
8	617354	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	618728	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
8	623593	.	G	A	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
8	623906	.	C	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
8	1709593	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	1710632	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	1710977	.	A	C	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
8	1711275	.	T	C	379.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:408,30,0
8	1712049	.	C	T	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
8	1719396	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	1729217	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
8	1730351	.	C	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
8	1732580	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	1732756	.	C	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
8	1732791	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
8	1734452	.	C	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
8	1786710	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	1789188	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
8	1789190	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
8	1789199	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	1789254	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	1806229	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	1817690	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:175,12,0
8	1817695	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	1817936	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	1822267	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	1823659	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
8	1857591	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	1875985	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	1894758	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	1906630	.	G	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
8	6263306	.	T	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
8	6263307	.	T	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
8	6263465	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	6263807	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
8	6263816	.	G	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:15:213,15,0
8	6272399	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	6296550	.	G	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
8	6302183	.	G	C	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
8	6302418	.	A	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
8	6303025	.	G	A	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
8	6303434	.	T	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
8	6304730	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	6554615	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	6615663	.	A	G	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
8	8092025	.	G	A	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
8	8094726	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	8094763	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	8098079	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	8098577	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	8099618	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
8	8176554	.	C	T	337.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:366,27,0
8	8219182	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	8318667	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
8	8406190	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	8559508	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	8559663	.	A	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
8	8559898	.	G	A	77.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
8	8560602	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
8	8560909	.	G	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
8	8561536	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	8561537	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	8561552	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	8580453	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	8641145	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	8642480	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
8	8654984	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,121
8	8747894	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
8	8794403	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	8802794	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	8808388	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	8821515	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	8860620	.	T	C	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
8	8889064	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	8889846	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	8890041	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	8994512	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	8994936	.	A	T	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
8	8995166	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
8	8995387	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
8	8995755	.	T	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
8	8996273	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	8996294	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
8	8996695	.	A	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
8	8996936	.	T	A	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
8	8997096	.	C	T	80.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
8	8997415	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
8	8997614	.	C	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:339,24,0
8	8997623	.	G	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:339,24,0
8	8997798	.	C	G	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
8	8997877	.	C	T	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
8	8998262	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
8	8998263	.	T	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
8	9071636	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	9071637	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	9071649	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	9071650	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	9071654	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	9414049	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
8	9577940	.	T	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
8	9609331	.	G	A	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
8	11162496	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	11182704	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
8	11183505	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	11207508	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	11213881	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	11616571	.	A	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
8	11627621	.	G	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
8	11643915	.	G	A	201.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:230,18,0
8	11644647	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	11644648	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	11660916	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	11665217	.	G	A	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
8	11683653	.	T	C	2882.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2911,202,0
8	11689119	.	G	C	2671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2700,187,0
8	11689228	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	11691205	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	11691330	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	11695872	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	11696492	.	A	C	1162.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1191,84,0
8	11698337	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	11699707	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	11701096	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	11701198	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	11701842	.	A	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
8	11702006	.	A	T	812.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:841,57,0
8	11702204	.	G	A	719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:748,51,0
8	11706581	.	T	G	958.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:987,69,0
8	11710888	.	G	C	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
8	11710974	.	G	A	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:659,48,0
8	12580049	.	G	A	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
8	12607234	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	12607913	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	17087014	.	T	C	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
8	17089569	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
8	17100969	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	17154043	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
8	17154056	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	17424920	.	T	C	884.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:913,63,0
8	17425296	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
8	17486282	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	17503612	.	C	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
8	17509993	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	17511925	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	17513414	.	G	A	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:578,39,0
8	17611886	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
8	17612456	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
8	17612875	.	A	G	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
8	17666491	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	17796382	.	A	G	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:629,42,0
8	17796383	.	C	T	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:629,42,0
8	17814915	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
8	17819572	.	C	T	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
8	17885406	.	C	G	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:24:81,0,24
8	17885415	.	C	T	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:81,0,24
8	17913970	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
8	17914117	.	T	G	694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:723,51,0
8	17918934	.	A	G	1703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1732,122,0
8	17921358	.	G	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
8	17921533	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	17921666	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:133,9,0
8	17921673	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
8	17922396	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	17922414	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	17923142	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	17923147	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	17924654	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,417
8	17924656	.	A	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,417
8	18387374	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	18388177	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	18390023	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
8	18390691	.	T	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	18391174	.	T	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
8	18391332	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	19221700	.	G	A	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
8	19252486	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
8	19252602	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
8	19253507	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	19677915	.	G	A	571.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:600,42,0
8	19703639	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	20071770	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	21846586	.	G	C	886.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:915,63,0
8	21862551	.	A	G	1058.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1087,75,0
8	21863290	.	G	A	964.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:993,69,0
8	21947214	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	21954684	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
8	21960902	.	G	A	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
8	21961834	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
8	21962952	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	21964561	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
8	21964802	.	C	T	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
8	21965113	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	21984004	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	21984650	.	A	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:352,27,0
8	22105502	.	T	C	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:561,39,0
8	22108347	.	C	T	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
8	22108611	.	A	C	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
8	22113430	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	22277923	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:179,0,143
8	22279538	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
8	22286670	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,154
8	22286674	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,154
8	22428658	.	T	C	461.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:490,36,0
8	22428708	.	A	G	503.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:532,42,0
8	22432377	.	C	A	740.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:769,57,0
8	22442661	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
8	22603802	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	22606613	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
8	22613172	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
8	22615379	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	22845013	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	22864622	.	T	C	296.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:14:325,0,14
8	22875610	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
8	22877208	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
8	22886020	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
8	22926498	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	23045964	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
8	23046084	.	T	C	11.13	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:24:39,0,24
8	23046559	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:120,0,64
8	23046738	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	23049292	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
8	23049314	.	T	G	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
8	23058220	.	T	G	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
8	23082518	.	A	T	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
8	23082971	.	G	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
8	23083546	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
8	23088174	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	23088245	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
8	23152334	.	A	G	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
8	23288346	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	23423758	.	G	A	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
8	23426319	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	23426648	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	23426810	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	23431045	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	23432326	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
8	23432332	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	23432776	.	A	C	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
8	23538426	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	23538533	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	25182969	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
8	25203022	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	25269277	.	G	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
8	25270508	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
8	25271895	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
8	25272364	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
8	25287397	.	T	C	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
8	25296930	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	25305809	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	25316789	.	A	G	137.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:166,15,0
8	25323777	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
8	25364834	.	A	T	334.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:363,27,0
8	25364960	.	A	G	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
8	25367979	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
8	26240646	.	A	G	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:629,45,0
8	26269412	.	C	T	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
8	26269936	.	C	T	546.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=27.93;ReadPosRankSum=1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,14:15:0:572,0,0
8	26481771	.	T	C	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
8	26510792	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	26513525	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	26514316	.	C	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
8	26514779	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	26515472	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	27311703	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
8	27315876	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	27315900	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	27316117	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	27529060	.	T	C	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
8	27529926	.	T	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
8	27529987	.	T	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
8	27530376	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
8	27591849	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	27593215	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	27661085	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
8	27667793	.	C	T	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:596,45,0
8	27667969	.	C	G	1284.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1313,90,0
8	28203937	.	G	T	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
8	28204264	.	G	A	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
8	28286174	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	28384712	.	A	G	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
8	28421781	.	A	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
8	28422488	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
8	28429709	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	28910397	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	28913888	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	28920779	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	28927805	.	T	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
8	29005093	.	A	G	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
8	29196622	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	29197672	.	A	G	2284.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2313,163,0
8	29199062	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	29199284	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	29201085	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	29202050	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	29205853	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	29207714	.	C	T	1913.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:1942,159,0
8	29207845	.	C	T	1763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1792,129,0
8	29207872	.	G	A	2204.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2233,157,0
8	29208142	.	A	G	1642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1671,120,0
8	29387420	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	29400749	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	29401485	.	A	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
8	29460861	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	29920825	.	T	C	1163.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1192,87,0
8	29921883	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	29927300	.	C	G	1439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1468,102,0
8	29927321	.	A	G	1058.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1087,75,0
8	29940397	.	C	T	1631.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1660,120,0
8	29965403	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
8	29965519	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	29995207	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	29995368	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	30209452	.	A	G	285.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:314,21,0
8	30407991	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	30410538	.	C	T	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
8	30411498	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	30415984	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
8	30424915	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	30535906	.	T	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,421
8	30535953	.	T	C	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.822;DP=26;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.917;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:176,0,790
8	30536015	.	T	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=-0.595;DP=24;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=6.66;ReadPosRankSum=2.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:188,0,654
8	30536016	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.852;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:106,0,1433
8	30536078	.	T	C	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.564;DP=43;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,4:43:41:41,0,1534
8	30536603	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=-0.849;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:117,0,360
8	30596736	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	30608976	.	C	T	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
8	30623996	.	T	C	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
8	30657165	.	C	G	646.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.578;DP=39;FS=4.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,18:39:99:675,0,789
8	30921935	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
8	30930332	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	30930342	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	30973887	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
8	30977490	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	33356074	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
8	33358162	.	A	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
8	33358270	.	G	A	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
8	33369944	.	T	C	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
8	33369994	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	33416189	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
8	33416222	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	37447834	.	G	A	50.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	37455325	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	37554798	.	G	T	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:346,0,290
8	37556987	.	C	T	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
8	37717121	.	C	A	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:573,42,0
8	37718468	.	C	T	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:746,51,0
8	37728017	.	A	G	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:675,45,0
8	37728019	.	T	G	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:675,45,0
8	37730535	.	G	C	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=25.28;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:82:281,0,82
8	37985897	.	A	G	688.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:717,51,0
8	37998114	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
8	38033989	.	G	C	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
8	38068324	.	C	T	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
8	38069508	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	38095662	.	C	T	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
8	38118672	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:53:53,0,333
8	38126359	.	G	C	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
8	38127768	.	T	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
8	38129128	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	38130025	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	38130433	.	C	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
8	38158585	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
8	38175318	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,103
8	38269514	.	T	C	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
8	38401296	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
8	38408577	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	38644914	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
8	38677932	.	A	G	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
8	38681076	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	38684853	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
8	38707639	.	G	A	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:221,0,105
8	38707784	.	A	C	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
8	38827925	.	G	T	76.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
8	38831059	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	38854002	.	C	T	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
8	38961550	.	G	T	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
8	41097827	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	41367719	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	41368286	.	T	G	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
8	41398139	.	C	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	41399755	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	41400029	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
8	41400313	.	G	A	208.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:13:237,0,13
8	41400597	.	G	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
8	41400913	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
8	41400996	.	A	C	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
8	41401351	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:119,0,71
8	41401354	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:219,15,0
8	41402340	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
8	41480509	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	41789538	.	G	C	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
8	41794934	.	C	T	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:561,39,0
8	41906694	.	A	T	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
8	42177469	.	T	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
8	42183934	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	42188550	.	A	G	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
8	42692110	.	C	T	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
8	42876718	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
8	42877903	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	42879512	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	43048266	.	T	C	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
8	43054553	.	T	C	439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:468,33,0
8	43056513	.	T	C	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
8	46905862	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	48685818	.	G	C	1085.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1114,81,0
8	48797775	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	48885436	.	T	A	1503.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1532,105,0
8	48890109	.	A	G	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.315;DP=34;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:424,0,849
8	52348516	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	52730441	.	T	C	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
8	52730521	.	C	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
8	52730864	.	T	C	297.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:326,24,0
8	52747415	.	G	C	165.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:194,15,0
8	52747571	.	A	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
8	52748559	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	52748835	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	52749334	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	52757270	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	52757671	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
8	52770492	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	53586706	.	A	G	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.099;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=28.75;ReadPosRankSum=-1.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:93:402,0,93
8	54428908	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	54428996	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
8	54436111	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	54436293	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:78,0,56
8	55060345	.	C	G	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.474;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:374,0,374
8	56651746	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	56676535	.	C	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
8	56686035	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	56686224	.	T	C	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
8	56755282	.	C	G	1094.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:75:1123,75,0
8	56755284	.	T	C	1094.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:75:1123,75,0
8	56755291	.	C	T	1094.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1123,75,0
8	56755306	.	G	C	1081.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1110,75,0
8	56980080	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
8	56984977	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
8	56986146	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
8	57870847	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,238
8	57871462	.	G	A	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.896;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.685	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:161,0,459
8	57871922	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:53:53,0,353
8	57872143	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,150
8	57872679	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-2.589;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=5.90;ReadPosRankSum=2.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,352
8	57874064	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,121
8	57875588	.	G	A	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=-1.910;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.821	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:294,0,367
8	57906269	.	G	A	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:46:46,0,395
8	59060275	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
8	59329438	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,110
8	59362624	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
8	59512334	.	G	A	843.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:872,63,0
8	59516481	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	61101126	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:71,0,30
8	61101162	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
8	61101710	.	T	A	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:146,0,66
8	61166159	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	61178574	.	T	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
8	61193760	.	T	G	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
8	61193809	.	A	G	150.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:179,15,0
8	61193828	.	A	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
8	61193843	.	C	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
8	61533528	.	C	G	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-2.081;DP=26;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,7:26:99:227,0,763
8	61534428	.	A	G	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=1.215;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.174	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,9:32:99:276,0,883
8	61534895	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,178
8	61535125	.	C	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,114
8	61535417	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,114
8	62115581	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
8	62115587	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	62115634	.	A	G	49.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:20:78,0,20
8	62442372	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	62491459	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	62491462	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	62538132	.	A	C	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=9.52;ReadPosRankSum=-1.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:171,0,405
8	62545711	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	62557526	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	62562630	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	62566832	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	62571619	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	62576669	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	62626962	.	C	T	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-2.474;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=9.58;ReadPosRankSum=2.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,14:39:99:402,0,855
8	62627107	.	C	G	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.582;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.427	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:261,0,431
8	63972718	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	64080833	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
8	64124956	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
8	66516490	.	C	T	928.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:957,66,0
8	66546357	.	G	A	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
8	66643015	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	66643075	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,80
8	66643076	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,80
8	66646352	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
8	66654703	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
8	66692011	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:159,0,70
8	66754188	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,123
8	67369355	.	G	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
8	67371834	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	67380677	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	67587494	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	67587495	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	68347834	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	68347885	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
8	69218498	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	69218521	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	69218525	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	70042768	.	C	T	248.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:286,30,0
8	70602299	.	A	G	439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:468,36,0
8	70602341	.	A	G	471.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=35.22;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:3:498,0,3
8	71120213	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	71486085	.	A	C	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.927;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:420,0,917
8	71486086	.	G	A	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-1.177;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.013	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:420,0,917
8	71486568	.	G	C	628.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=-1.291;DP=40;FS=4.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,18:40:99:657,0,823
8	71489200	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:80,0,29
8	74205609	.	C	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
8	74206692	.	G	A	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
8	74209558	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.708;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:93:93,0,308
8	74235980	.	A	G	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
8	74236370	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	74463089	.	T	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
8	74463797	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
8	74527996	.	C	T	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:605,42,0
8	74702487	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	75148217	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,260
8	75148616	.	G	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
8	75262798	.	G	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
8	75274141	.	T	G	577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:606,42,0
8	75277399	.	A	G	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:504,36,0
8	75278457	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
8	75278816	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
8	75353344	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	76288988	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	76288990	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	76288996	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	77777735	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	77894770	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
8	77895865	.	A	G	776.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:805,57,0
8	79063266	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	79063268	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	79428627	.	G	C	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:88:265,0,88
8	79515381	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.537;DP=21;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:120,0,623
8	79516759	.	G	T	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:231,0,147
8	79631629	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:101,0,296
8	80864649	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	81399461	.	G	C	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:95:95,0,147
8	81541293	.	A	T	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
8	81545195	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,136
8	81551652	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,102
8	82570390	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,146
8	82611240	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
8	82613459	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	82614003	.	A	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.779;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:225,0,224
8	82614438	.	A	G	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-2.661;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=25.40;ReadPosRankSum=2.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:460,0,123
8	82614590	.	T	C	1019.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1048,72,0
8	82616537	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	82627395	.	A	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	82630714	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
8	82712153	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
8	82752291	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	86058003	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	86089787	.	C	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
8	86128621	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	86130623	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
8	86130628	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	86131463	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	86389403	.	T	C	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
8	87481757	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	87497116	.	G	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=-0.337;DP=30;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,6:30:99:155,0,950
8	87565326	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	87567031	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	87567193	.	C	T	995.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1024,69,0
8	87567305	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	87567706	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	87572663	.	C	T	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1080,72,0
8	87572665	.	A	T	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1080,72,0
8	90914272	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	90914865	.	A	C	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:63:222,0,63
8	90945833	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,154
8	90946056	.	A	G	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=26.27;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:396,0,125
8	90946601	.	T	G	432.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-1.550;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:461,0,368
8	90947269	.	C	G	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:217,0,208
8	90947537	.	C	T	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:234,0,150
8	90958422	.	T	C	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
8	90967711	.	A	G	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:873,60,0
8	90990479	.	C	G	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:736,54,0
8	90995019	.	C	T	746.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:775,54,0
8	91021403	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	91636373	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:105,0,244
8	92075904	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:155,0,64
8	92080407	.	C	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,110
8	92080575	.	G	A	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:129,0,271
8	92083424	.	A	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.171;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:173,0,433
8	93898651	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:112,0,654
8	94718164	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
8	94729046	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	94729211	.	C	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
8	94737399	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,161
8	95404060	.	C	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,197
8	95419698	.	A	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:178,0,303
8	95530753	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
8	95531419	.	T	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-0.350;DP=21;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:203,0,590
8	95538468	.	T	C	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=1.626;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:126,0,396
8	95541371	.	T	A	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.658;DP=19;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:203,0,503
8	95650860	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	95651239	.	T	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
8	95651573	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	95681424	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:98,0,34
8	95682296	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:59:150,0,59
8	95687335	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	95687480	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
8	95688026	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
8	95688802	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:34:39,0,34
8	95689400	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:70,0,34
8	95689681	.	T	G	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,39
8	95690579	.	T	C	928.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.857;DP=51;FS=8.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,26:51:99:957,0,912
8	95716732	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	95717861	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	95718314	.	T	C	1531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1560,108,0
8	95718448	.	T	C	1170.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1199,84,0
8	95718533	.	T	C	1625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1654,114,0
8	95718733	.	A	T	1283.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1312,90,0
8	95719327	.	A	C	1241.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1270,90,0
8	95719387	.	A	T	1640.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1669,122,0
8	95755684	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	95803634	.	A	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:143,0,283
8	95804605	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	95804750	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	95804960	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:71,0,35
8	95805028	.	A	G	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:42:42,0,300
8	95805038	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:58:58,0,276
8	95875676	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	95876963	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	95877787	.	T	C	997.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1026,72,0
8	95886551	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	95888307	.	C	T	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
8	95891113	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
8	95891356	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	95895702	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
8	95908067	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	95908078	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	95908117	.	G	T	101.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:129,12,0
8	95938422	.	C	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,900
8	95938426	.	G	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,1:13:48:48,0,900
8	95939594	.	C	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:110,0,191
8	95940800	.	A	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:308,0,223
8	95942244	.	G	A	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:207,0,335
8	95970239	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
8	95974373	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	95986340	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
8	95995524	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	96045441	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	96046094	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
8	96058218	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	96063730	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
8	96070181	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
8	96258302	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,111
8	97241096	.	T	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,109
8	97242849	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,106
8	97243720	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,75
8	97269738	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,196
8	97339512	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	97341406	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	97506436	.	G	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,310
8	97614661	.	T	A	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-1.830;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=20.29;ReadPosRankSum=2.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:495,0,351
8	97847358	.	G	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:87:182,0,87
8	98788033	.	G	C	562.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:591,42,0
8	98788044	.	G	C	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=1.213;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=0.99;ReadPosRankSum=-1.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,3:25:53:53,0,875
8	98788217	.	C	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=1.271;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.413	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,9:61:99:188,0,1964
8	98828315	.	C	G	554.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-1.082;DP=70;FS=17.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.230	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,18:70:99:583,0,2071
8	98863876	.	G	A	2343.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2372,166,0
8	98863930	.	T	C	1892.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1921,132,0
8	98864323	.	G	A	1099.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.844;DP=74;FS=3.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,31:74:99:1128,0,1635
8	98864522	.	C	G	76.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-1.081;DP=53;FS=4.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,6:53:99:105,0,1893
8	98864794	.	T	C	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
8	98943446	.	T	C	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:254,0,142
8	98943545	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,110
8	99006736	.	C	T	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:230,0,62
8	99006748	.	C	T	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:91:195,0,91
8	99017396	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
8	99017843	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	99030280	.	T	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:72:230,0,72
8	99034119	.	C	T	36.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:65,0,26
8	99048049	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,200
8	99048329	.	C	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:143,0,173
8	99055911	.	T	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=22.29;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:162,0,165
8	99055914	.	T	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=7;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:162,0,165
8	99055939	.	A	T	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,103
8	99056051	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:92:92,0,206
8	99057150	.	C	A	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:291,0,198
8	99057526	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,136
8	99057774	.	A	C	34.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=1.746;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=1.45;ReadPosRankSum=-2.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:63:63,0,1614
8	99057776	.	A	G	34.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=1.963;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.328	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:63:63,0,1614
8	99058393	.	A	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
8	99114970	.	A	C	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:222,0,239
8	99118654	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
8	99125906	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	99153088	.	A	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:242,0,60
8	99202208	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
8	99203508	.	C	T	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:232,0,105
8	100779200	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	100905903	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:80:80,0,507
8	101166134	.	C	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:236,0,133
8	101252680	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,197
8	101271291	.	C	T	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=1.251;DP=30;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=0.56;ReadPosRankSum=-1.373	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:45:45,0,976
8	101285074	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	101316044	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
8	101317666	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,119
8	101317715	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	101317952	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	101482851	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	101504739	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	101504743	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	101533868	.	A	G	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:198,0,149
8	101540153	.	A	G	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:345,0,300
8	101562197	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	101713499	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	101714780	.	A	G	52.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:123,0,33
8	101724907	.	C	T	801.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=-0.271;DP=74;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,24:74:99:830,0,1941
8	101726001	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
8	101726408	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	101934971	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
8	101937370	.	A	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
8	101961511	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
8	101961910	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,204
8	101962724	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
8	101962888	.	G	T	25.97	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=8.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:53,5,0
8	102133238	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
8	102180058	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	102422730	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
8	102488478	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	102488778	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	102494964	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	102501161	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	102504974	.	C	G	974.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1003,69,0
8	102505996	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	102506862	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	102507117	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	102507925	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
8	102512386	.	T	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	102518762	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	102667498	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	102670516	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	102679909	.	G	A	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:654,45,0
8	102680405	.	T	C	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
8	102680690	.	G	C	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=-0.271;DP=24;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:88:88,0,804
8	102701136	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	102701137	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	102899450	.	T	C	180.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:209,18,0
8	103220351	.	A	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
8	103238260	.	G	A	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:334,0,278
8	103251190	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	103255945	.	G	A	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
8	103424702	.	G	C	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:40:40,0,255
8	103661342	.	G	T	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.054;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:218,0,373
8	103662219	.	G	A	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=26.60;ReadPosRankSum=1.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:81:374,0,81
8	103663912	.	T	G	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.053;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:160,0,466
8	103838876	.	T	A	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=-0.083;DP=27;FS=6.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:225,0,812
8	103839164	.	A	T	242.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.053;DP=17;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:280,0,323
8	103840360	.	G	A	555.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-0.915;DP=25;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:584,0,370
8	103840572	.	A	T	850.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-0.793;DP=40;FS=4.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=21.27;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,23:40:99:879,0,592
8	103851052	.	T	C	841.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.258;DP=44;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.211	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,23:44:99:870,0,753
8	103876183	.	G	A	790.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.308;DP=46;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,23:46:99:819,0,783
8	103876325	.	G	A	533.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-1.564;DP=32;FS=9.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.112;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.526	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:562,0,581
8	104081085	.	G	C	837.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:866,60,0
8	104081226	.	A	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.313;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:308,0,172
8	104081996	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,119
8	104083786	.	G	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-2.177;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=19.70;ReadPosRankSum=2.285	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:304,0,219
8	104083888	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,152
8	104337096	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
8	104337367	.	A	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
8	104343822	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	104344790	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	104344838	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
8	104494448	.	A	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
8	104495301	.	A	G	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
8	104511409	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:114,0,31
8	104778752	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
8	105264616	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	107719089	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=1.575;DP=22;FS=10.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:103,0,725
8	107754473	.	G	A	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:205,0,334
8	107763828	.	A	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:147,0,270
8	107763928	.	A	G	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.48;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:263,0,102
8	109243959	.	C	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:63:155,0,63
8	109485946	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	110552577	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
8	110587894	.	T	C	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.969;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:240,0,600
8	110610789	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	110703781	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:78:78,0,328
8	115126715	.	A	C	29.15	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=5.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:164,15,0
8	115126738	.	G	T	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
8	115126756	.	A	T	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
8	115126757	.	T	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
8	115126764	.	A	T	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:24:360,24,0
8	115126766	.	C	T	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:24:360,24,0
8	116421434	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	116421479	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
8	116421936	.	A	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,151
8	116423424	.	T	C	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
8	116423490	.	A	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
8	116425860	.	A	G	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:251,0,133
8	116635942	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:55:154,0,55
8	117656781	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	117661127	.	C	G	108.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=-0.762;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,7:59:99:137,0,2071
8	117786658	.	T	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
8	117858389	.	G	A	2119.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2148,147,0
8	117860257	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	117864886	.	C	A	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.348;DP=54;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,9:54:99:209,0,1694
8	119202209	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	119202213	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	119204861	.	C	A	51.19	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:87,5,0
8	119205873	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	119206034	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	119207847	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
8	119207938	.	G	T	161.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:190,15,0
8	119209773	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	119391866	.	G	A	253.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.73;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:282,0,19
8	120790304	.	T	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:177,0,358
8	120803637	.	C	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-1.967;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:281,0,472
8	120847078	.	C	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:153,0,73
8	120847123	.	C	T	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:291,0,187
8	120847188	.	T	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:182,0,263
8	120940652	.	C	T	483.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.437;DP=28;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:512,0,514
8	121061879	.	G	A	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:408,0,324
8	121062077	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:92:92,0,353
8	121062976	.	C	T	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
8	121064449	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:154,0,31
8	121066060	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	121066109	.	A	G	129.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.96;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:22:158,0,22
8	121066470	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	121408195	.	T	C	922.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:951,66,0
8	121411377	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	121469775	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
8	121530190	.	A	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
8	123885700	.	G	A	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-1.652;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:186,0,143
8	123966085	.	G	A	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.429;DP=22;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:370,0,440
8	123966159	.	G	C	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-2.165;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:445,0,422
8	123985708	.	A	G	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-1.625;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:292,0,212
8	123985973	.	T	C	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:393,0,217
8	123986622	.	G	C	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:401,33,0
8	123986649	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,219
8	124027628	.	T	C	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:161,0,357
8	124251336	.	G	C	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.611;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:161,0,613
8	124266781	.	G	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,269
8	124461256	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	124462552	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	124464083	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	124464866	.	G	A	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
8	124503275	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	124780738	.	C	T	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:373,0,173
8	124780821	.	C	T	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.718;DP=15;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:128,0,360
8	124780858	.	C	T	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.965;DP=14;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:297,0,191
8	124817145	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	124818447	.	C	G	1148.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1177,81,0
8	124826791	.	T	C	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.088;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:344,0,310
8	124826804	.	G	T	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:740,54,0
8	124827003	.	G	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-1.096;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:200,0,501
8	124827049	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,321
8	125384436	.	C	G	205.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:234,18,0
8	125504522	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	125579973	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	125579990	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	125596033	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	125707569	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
8	126010805	.	G	C	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-1.954;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.892	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:362,0,443
8	126011126	.	C	T	507.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-1.036;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.318;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.263	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:536,0,547
8	126031471	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:76,0,69
8	126039749	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	126047864	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	126376699	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	126442934	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:140,0,246
8	126448789	.	G	A	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:300,0,142
8	127085877	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
8	128750139	.	T	A	106.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:135,0,27
8	128750212	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
8	128951805	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	129007207	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	129008290	.	T	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
8	129009401	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	129108823	.	C	T	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:327,0,296
8	129109820	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
8	129109830	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	129113373	.	C	T	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:201,0,173
8	129113456	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
8	131124559	.	T	C	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:179,0,305
8	132916459	.	T	C	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-2.161;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:206,0,415
8	132982824	.	A	G	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=1.369;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=9.55;ReadPosRankSum=-1.252	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:267,0,640
8	132999936	.	A	G	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:250,0,448
8	133023163	.	G	C	831.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:860,60,0
8	133023595	.	A	G	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
8	133024838	.	A	T	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
8	133025379	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:135,0,295
8	133025671	.	C	G	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:276,0,273
8	133836432	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	133844508	.	C	T	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:248,0,415
8	133846090	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	133848913	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:96:96,0,315
8	133858009	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	133860453	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,114
8	134250165	.	A	G	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:340,0,100
8	134255574	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	134468066	.	G	A	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=2.235;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:283,0,622
8	134468274	.	T	C	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.309;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:124,0,173
8	134468533	.	G	T	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:251,0,708
8	134468708	.	A	T	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:318,0,370
8	134468864	.	G	A	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-2.106;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.940;QD=20.51;ReadPosRankSum=1.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:418,0,286
8	134469208	.	C	G	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.144	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:284,0,327
8	134469277	.	T	A	641.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=-0.146;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.010;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:670,0,265
8	134469536	.	T	C	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=9.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.985;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:474,0,435
8	134470631	.	T	C	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.290;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,8:23:99:280,0,540
8	134471426	.	C	T	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:610,42,0
8	134474148	.	C	T	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:251,0,404
8	134488007	.	G	A	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-1.639;DP=18;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:206,0,460
8	134488549	.	T	C	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:199,0,178
8	134585189	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
8	135490539	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	135614705	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:72,0,32
8	135766931	.	A	G	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
8	135796966	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,108
8	135799478	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	135800970	.	G	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
8	135801331	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	135802518	.	C	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
8	135809634	.	C	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:73,0,66
8	135811616	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:77,0,67
8	136659426	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	140769384	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	141461062	.	G	A	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
8	141461185	.	A	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
8	141461266	.	A	G	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
8	141520581	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	141521506	.	G	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:188,0,107
8	141525465	.	T	C	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:267,0,245
8	141526038	.	T	C	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=30.75;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:49:428,0,49
8	141526231	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:94,0,63
8	141531032	.	A	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
8	141533818	.	A	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:277,0,176
8	141534198	.	A	G	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
8	141536017	.	T	A	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
8	141537406	.	T	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
8	141538846	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
8	141539699	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	141539848	.	T	G	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
8	141539854	.	T	G	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:36:498,36,0
8	141539923	.	C	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
8	141540187	.	T	A	87.37	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:10:136,10,0
8	141559358	.	G	A	423.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:452,33,0
8	141566311	.	C	T	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
8	141568622	.	G	A	609.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:638,45,0
8	141646887	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
8	142185718	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	142201544	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	142204326	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
8	142205237	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	142221032	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,119
8	142221361	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
8	142221414	.	G	A	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
8	142222374	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
8	142222445	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
8	142225990	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,115
8	142228809	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	142229891	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	142318275	.	G	A	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
8	142442080	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
8	142442204	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	142470264	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
8	142470267	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
8	143352206	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:194,0,392
8	143352445	.	G	T	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:134,0,376
8	143352528	.	A	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,104
8	143352805	.	T	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:210,0,244
8	143352978	.	T	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
8	143354555	.	A	T	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
8	143354963	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:138,0,235
8	143355746	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:102,0,32
8	143357038	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,289
8	143357486	.	C	T	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:90:90,0,222
8	143357960	.	T	C	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.38;ReadPosRankSum=2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:232,0,141
8	143358225	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,100
8	143358316	.	C	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:113,0,33
8	143361267	.	A	G	284.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.57;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:11:312,0,11
8	143361746	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	143742252	.	C	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,207
8	143749228	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	143749718	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
8	143751864	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
8	143784885	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	143785345	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	143786461	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	143786835	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	143788831	.	A	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	143808667	.	T	C	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
8	143808951	.	C	T	1719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1748,123,0
8	143809193	.	C	T	1130.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:89:1159,89,0
8	143810819	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	143834311	.	A	T	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
8	143838669	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	144063624	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
8	144063784	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	144091916	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	144103125	.	C	T	1555.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=-0.364;DP=73;FS=6.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=21.31;ReadPosRankSum=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,43:73:99:1584,0,1069
8	144103435	.	C	T	3108.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:3137,219,0
8	144104188	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
8	144108455	.	G	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
8	144108526	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	144110693	.	G	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
8	144110746	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
8	144113600	.	G	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
8	144120788	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	144329297	.	T	C	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
8	144329854	.	G	A	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
8	144330042	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	144330452	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	144332012	.	T	C	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
8	144332082	.	T	C	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:661,48,0
8	144333315	.	G	A	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
8	144333434	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	144339053	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
8	144341204	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
8	144341342	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
8	144341599	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	144342142	.	T	C	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
8	144342384	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
8	144342831	.	G	A	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
8	144343133	.	T	C	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
8	144344387	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
8	144346229	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	144346382	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	144346618	.	G	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
8	144348991	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	144349756	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
8	144350854	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	144351632	.	A	G	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:708,51,0
8	144352116	.	G	A	180.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:209,18,0
8	144352336	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
8	144352664	.	G	A	364.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:393,30,0
8	144353394	.	A	G	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
8	144355274	.	T	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
8	144355419	.	G	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
8	144355479	.	A	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
8	144356432	.	G	C	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:45:649,45,0
8	144356442	.	C	G	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:45:649,45,0
8	144357213	.	G	C	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
8	144357479	.	C	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
8	144357720	.	C	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
8	144357772	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
8	144357975	.	C	T	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
8	144357992	.	A	G	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:430,33,0
8	144358381	.	G	A	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:508,45,0
8	144372531	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144372652	.	G	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
8	144373244	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
8	144373718	.	G	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
8	144375503	.	C	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
8	144375815	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	144375859	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	144375884	.	C	G	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
8	144376167	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144376249	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144376250	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144376251	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144376492	.	G	A	77.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
8	144376938	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
8	144378184	.	C	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
8	144378868	.	A	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
8	144379252	.	C	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
8	144379689	.	G	A	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
8	144379934	.	C	T	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
8	144381744	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
8	144384201	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,114
8	144385803	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
8	144392368	.	G	A	299.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=19.98;ReadPosRankSum=2.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:328,0,154
8	144392602	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
8	144393025	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	144393459	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	144394845	.	A	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
8	144396396	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
8	144396620	.	C	T	39.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:68,0,27
8	144397044	.	T	C	126.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.37;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:17:155,0,17
8	144398029	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	144399885	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144399886	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144403449	.	G	A	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:202,0,117
8	144413416	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.170;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:116,0,485
8	144449191	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144449192	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144456679	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	144457328	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	144460569	.	G	A	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
8	144462169	.	A	G	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
8	144463267	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,298
8	144463686	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.993;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:261,0,239
8	144465285	.	C	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,269
8	144465385	.	G	C	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=-1.827;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:346,0,175
8	144465918	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,194
8	144520147	.	G	A	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-1.859;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:394,0,169
8	144520668	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,110
8	144555482	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	144574611	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	144620183	.	T	C	409.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.979;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=27.32;ReadPosRankSum=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:438,0,127
8	144621122	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:89:89,0,396
8	144623574	.	T	C	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:294,0,214
8	144648642	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
8	144648744	.	A	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
8	144649192	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
8	144649601	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	144649625	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
8	144650510	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	144650547	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144650550	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144650925	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	144651143	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144654249	.	G	A	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:248,18,0
8	144654255	.	A	G	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:18:248,18,0
8	144654693	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	144655315	.	A	C	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
8	144656187	.	C	T	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
8	144656344	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	144656754	.	T	C	96.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:124,12,0
8	144656765	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	144657269	.	G	C	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
8	144658711	.	G	A	1825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1854,129,0
8	144660189	.	A	G	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=1.191;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=22.61	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,14:16:99:390,0,426
8	144661982	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:107,0,280
8	144662353	.	G	A	3247.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:3276,226,0
8	144663661	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
8	144664319	.	C	G	260.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:289,24,0
8	144664594	.	C	T	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:694,48,0
8	144664624	.	C	T	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
8	144664808	.	C	T	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:260,18,0
8	144664818	.	C	T	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
8	144665569	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
8	144666641	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
8	144666895	.	A	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
8	144667755	.	C	T	358.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:387,30,0
8	144669392	.	G	A	1025.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1054,72,0
8	144669573	.	C	T	669.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:698,51,0
8	144669660	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.945;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:74:74,0,523
8	144670451	.	C	T	904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:933,75,0
8	144670640	.	C	T	857.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:886,66,0
8	144670950	.	C	T	986.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1015,72,0
8	144671244	.	C	A	1195.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1224,90,0
8	144671685	.	G	C	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-0.963;DP=27;FS=5.863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=25.26;ReadPosRankSum=0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,26:27:71:1099,71,0
8	144671922	.	G	A	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:719,57,0
8	144672035	.	C	T	388.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-1.537;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:417,0,529
8	144672541	.	T	C	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:575,39,0
8	144673042	.	A	C	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
8	144673722	.	C	A	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
8	144674082	.	C	A	1184.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1213,84,0
8	144674516	.	G	T	682.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:711,54,0
8	144674558	.	T	C	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
8	144674772	.	G	A	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:765,54,0
8	144675048	.	G	A	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:598,45,0
8	144676025	.	A	G	992.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1021,72,0
8	144676098	.	A	C	693.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:722,51,0
8	144676324	.	A	C	873.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:902,63,0
8	144676403	.	A	G	855.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:884,60,0
8	144676736	.	C	T	811.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:840,63,0
8	144676862	.	C	T	937.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:966,69,0
8	144677222	.	T	C	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
8	144677536	.	A	G	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
8	144677925	.	T	C	379.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:408,30,0
8	144677941	.	T	C	689.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:718,51,0
8	144681777	.	G	T	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
8	144682311	.	G	C	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
8	144683934	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
8	144683975	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
8	144684215	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
8	144684474	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	144688736	.	C	G	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:613,45,0
8	144694890	.	G	C	748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:777,57,0
8	144695867	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
8	144697041	.	A	G	1000.22	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=1.293;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=31.11;ReadPosRankSum=-1.472	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,26:28:4:1027,4,0
8	144697653	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	144697858	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
8	144718254	.	G	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
8	144718568	.	G	C	276.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:305,24,0
8	144723350	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	144724730	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
8	144725437	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
8	144729843	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	144732363	.	T	C	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
8	144732418	.	A	G	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:770,54,0
8	144735063	.	C	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:61:61,0,335
8	144735977	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
8	144737716	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,70
8	144775871	.	C	A	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
8	144776109	.	A	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
8	144776713	.	A	C	847.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:876,63,0
8	144777366	.	T	C	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
8	144777521	.	G	A	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
8	144806933	.	C	T	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.539;DP=30;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:554,0,545
8	144807010	.	A	G	1597.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1626,114,0
8	144807456	.	C	T	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:330,0,296
8	144807667	.	G	C	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:139,0,365
8	144807744	.	G	A	378.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.975;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:407,0,326
8	144807766	.	G	C	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.936;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:372,0,341
8	144808003	.	G	C	1284.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1313,90,0
8	144808747	.	G	A	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=1.161;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.234	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,13:33:99:436,0,685
8	144809268	.	C	T	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.473;DP=32;FS=5.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,15:32:99:502,0,598
8	144809804	.	G	A	1079.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1108,78,0
8	144811631	.	C	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,152
8	144812541	.	G	T	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.018;DP=38;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,8:38:99:238,0,1203
8	144813308	.	C	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
8	144813573	.	G	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:138,0,193
8	144814242	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,111
8	144814523	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=7.78;ReadPosRankSum=2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:106,0,227
8	144814762	.	A	G	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
8	144815518	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
8	144815577	.	G	C	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:35:226,0,35
8	144815612	.	C	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:90:90,0,109
8	144815663	.	C	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,97
8	144817486	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
8	144819345	.	C	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:156,0,30
8	144821083	.	C	T	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:98:98,0,258
8	144821345	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
8	144821438	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=21.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:188,0,130
8	144822037	.	G	T	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.413;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:296,0,318
8	144822591	.	C	T	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:294,0,211
8	144823000	.	G	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:159,0,134
8	144823003	.	G	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:159,0,134
8	144823419	.	G	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	144823948	.	A	T	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.395;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:353,0,474
8	144824898	.	A	C	1090.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1119,78,0
8	144825035	.	T	G	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.517;DP=25;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:465,0,417
8	144825272	.	A	G	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:323,0,244
8	144825290	.	T	C	358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:387,0,298
8	144826522	.	A	G	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.311;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,13:34:99:420,0,791
8	144826671	.	A	G	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.701;DP=31;FS=8.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:453,0,672
8	144827277	.	C	T	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-1.798;DP=28;FS=3.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.983	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:274,0,685
8	144827479	.	A	G	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.179;DP=24;FS=10.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.060	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:312,0,559
8	144827749	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	144828215	.	T	G	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=-0.265;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:339,0,371
8	144839027	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
8	144850834	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
8	144870701	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
8	144873666	.	G	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
8	144873779	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
8	144873997	.	A	C	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
8	144874554	.	T	C	1115.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1144,87,0
8	144875945	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
8	144877835	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144877957	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	144879265	.	A	G	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
8	144880732	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	144880924	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	144881966	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	144882423	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	144884600	.	C	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
8	144885580	.	A	G	1290.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.758;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=31.66;ReadPosRankSum=1.625	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,31:32:86:1319,86,0
8	144887712	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
8	144889172	.	A	G	1437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1466,102,0
8	144890873	.	A	T	892.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:921,66,0
8	144894496	.	G	A	1127.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1156,81,0
8	144900756	.	A	G	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
8	144901347	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	144902297	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
8	144902543	.	C	T	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
8	144902682	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
8	144907814	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
8	144910065	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	144910239	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	144912303	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	144917533	.	G	A	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,185
8	144917790	.	A	G	425.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:26:454,26,0
8	144932724	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	144933018	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
8	144933415	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	144936032	.	A	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
8	144939539	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
8	144940081	.	C	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
8	144940117	.	C	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
8	144940300	.	G	A	577.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-1.102;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:606,0,223
8	144941181	.	G	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,139
8	144941419	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,110
8	144942903	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
8	144944161	.	C	T	327.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=32.73;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:9:355,0,9
8	144944176	.	T	C	423.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:452,33,0
8	144945792	.	T	C	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
8	144946252	.	C	T	94.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:122,12,0
8	144946345	.	G	A	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
8	144946818	.	C	T	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
8	144947590	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
8	144989462	.	A	G	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:370,0,315
8	144990335	.	G	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.136;DP=25;FS=6.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:257,0,632
8	144990528	.	A	G	356.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:385,0,480
8	144991176	.	T	C	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.613;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=9.28;ReadPosRankSum=-0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,10:31:99:316,0,776
8	144992103	.	T	C	434.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-1.075;DP=35;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.144	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,13:35:99:463,0,846
8	144992862	.	A	G	454.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-1.704;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=16.24;ReadPosRankSum=1.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:483,0,488
8	144993324	.	C	T	377.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=-1.070;DP=32;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:406,0,743
8	144993377	.	A	G	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.356;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:381,0,525
8	144995494	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:88:142,0,88
8	144995736	.	G	A	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.959;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:306,0,432
8	144995964	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.033;DP=24;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.100	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:150,0,689
8	144996029	.	A	G	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:285,0,602
8	144996408	.	T	G	383.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.925;DP=37;FS=1.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=10.37;ReadPosRankSum=1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:412,0,931
8	144997656	.	C	T	444.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.386;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:473,0,414
8	144997927	.	G	A	556.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-2.577;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=19.88;ReadPosRankSum=2.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:585,0,409
8	144998169	.	C	T	532.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.315;DP=35;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:561,0,684
8	144998190	.	A	G	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.301;DP=30;FS=16.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,11:30:99:381,0,703
8	144999417	.	C	T	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-1.060;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:290,0,321
8	144999621	.	C	T	865.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.845;DP=34;FS=18.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=25.46;ReadPosRankSum=-0.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:894,0,1341
8	144999642	.	A	C	865.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.259;DP=37;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=23.40;ReadPosRankSum=0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,20:37:99:894,0,1341
8	144999684	.	A	G	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=1.506;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.232	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:392,0,311
8	145000321	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
8	145000740	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
8	145000898	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:69,0,37
8	145001031	.	T	C	508.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.059;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:537,0,603
8	145001372	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
8	145001588	.	C	T	483.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.546;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:512,0,548
8	145001784	.	A	G	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.449;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:383,0,207
8	145007187	.	G	A	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.277;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:357,0,391
8	145008560	.	A	G	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.701;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:311,0,579
8	145011204	.	A	G	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=-0.250;DP=25;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:361,0,577
8	145012206	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:47:152,0,47
8	145066886	.	A	G	2443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2472,171,0
8	145067467	.	G	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:213,0,392
8	145138477	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:106,0,346
8	145140864	.	C	A	567.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.554;DP=27;FS=15.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,16:27:99:596,0,364
8	145140933	.	G	C	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.757;DP=42;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.576	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,10:42:99:312,0,1266
8	145149823	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
8	145150101	.	T	G	2067.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2096,153,0
8	145150719	.	G	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,404
8	145150832	.	A	G	2569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2598,184,0
8	145150862	.	G	A	505.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-1.041;DP=62;FS=5.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,17:62:99:534,0,1685
8	145154257	.	C	G	524.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=1.670;DP=40;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,16:40:99:553,0,921
8	145158503	.	G	T	1118.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1147,84,0
8	145158607	.	G	A	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.903;DP=25;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.845	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:206,0,595
8	145159099	.	G	A	61.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:90,0,24
8	145160646	.	T	C	1939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1968,138,0
8	145161823	.	G	A	2496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2525,180,0
8	145161896	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
8	145167922	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
8	145215974	.	C	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.919;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:126,0,389
8	145223288	.	C	T	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:44:480,44,0
8	145223499	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
8	145230468	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	145268174	.	G	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
8	145314653	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
8	145515324	.	T	G	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.337;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:256,0,568
8	145516593	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
8	145531837	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
8	145533974	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,145
8	145536593	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:78,0,30
8	145538917	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:55:72,0,55
8	145539008	.	G	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,129
8	145550338	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
8	145550465	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:101,0,159
8	145580343	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=2.312;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:105,0,748
8	145581341	.	C	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-0.235;DP=22;FS=4.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.078	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:101,0,641
8	145581736	.	G	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.039;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:186,0,579
8	145649781	.	A	T	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
8	145653006	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	145657958	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,107
8	145658115	.	A	G	203.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:232,18,0
8	145658155	.	C	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:87:162,0,87
8	145658253	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:101,0,65
8	145658371	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:81,0,32
8	145661320	.	G	A	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.854;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:324,0,321
8	145661675	.	G	A	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-1.779;DP=27;FS=16.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=8.07;ReadPosRankSum=2.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:246,0,703
8	145663584	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
8	145663689	.	A	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,77
8	145665516	.	T	C	1400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1429,99,0
8	145665761	.	G	A	1305.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1334,93,0
8	145666664	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
8	145668042	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
8	145668443	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,260
8	145668481	.	C	T	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:91:91,0,218
8	145673133	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
8	145675038	.	G	C	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
8	145675164	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
8	145675491	.	G	T	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:855,60,0
8	145677011	.	T	C	447.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.589;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.279	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:476,0,344
8	145677089	.	G	A	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=20.20;ReadPosRankSum=2.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:513,0,359
8	145677418	.	C	G	356.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-1.903;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:385,0,247
8	145677469	.	A	G	603.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:632,45,0
8	145679080	.	C	T	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
8	145679385	.	T	C	354.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:383,30,0
8	145679400	.	A	G	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
8	145680929	.	T	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:178,0,69
8	145681713	.	G	T	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:199,0,173
8	145682115	.	C	T	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.513;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:251,0,386
8	145682375	.	T	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
8	145682514	.	T	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
8	145683220	.	G	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
8	145683403	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
8	145683455	.	T	C	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
8	145683512	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
8	145683916	.	C	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
8	145683936	.	C	G	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
8	145684031	.	C	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=14.89;ReadPosRankSum=-0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:192,0,173
8	145684443	.	C	T	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
8	145684678	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	145684679	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
8	145684963	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
8	145684976	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
8	145685396	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:79:79,0,162
8	145686261	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
8	145686313	.	C	T	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:211,0,172
8	145686505	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:153,0,69
8	145687118	.	C	G	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:571,39,0
8	145687373	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
8	145688155	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:80:80,0,281
8	145689915	.	G	A	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
8	145690308	.	C	T	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
8	145690348	.	G	A	583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:612,42,0
8	145690396	.	A	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
8	145690830	.	C	T	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
8	145692385	.	C	T	1222.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1251,99,0
8	145692812	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
8	145693720	.	A	G	1285.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1314,93,0
8	145703863	.	G	A	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.425;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.594	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:42:42,0,473
8	145710386	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
8	145723419	.	T	G	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-2.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=23.63;ReadPosRankSum=2.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:359,0,155
8	145724275	.	T	C	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-3.549;DP=32;FS=7.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,6:32:99:130,0,2393
8	145724973	.	C	G	163.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:192,0,24
8	145728735	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:110,0,30
8	145730330	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
8	145733234	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
8	145733811	.	G	A	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:234,0,145
8	145737373	.	C	T	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-0.162;DP=26;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.593	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:295,0,659
8	145737636	.	A	G	1211.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1240,87,0
8	145737816	.	C	T	548.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.908;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=22.87;ReadPosRankSum=2.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:577,0,308
8	145737864	.	A	C	638.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=1.101;DP=29;FS=6.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=22.03;ReadPosRankSum=0.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,18:29:99:667,0,386
8	145741702	.	C	G	461.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-1.006;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:490,0,431
8	145741765	.	G	A	374.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.215;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.154	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,11:23:99:403,0,447
8	145742514	.	A	G	774.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:803,57,0
8	145742879	.	T	C	296.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.096;DP=20;FS=19.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:325,0,348
8	145743701	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:103,0,34
8	145744429	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:119,0,68
8	145744618	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,254
8	145745182	.	T	C	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
8	145747485	.	C	G	688.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:717,51,0
8	145747597	.	G	A	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:646,54,0
8	145747628	.	T	C	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.855;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.67;ReadPosRankSum=2.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:310,0,256
8	145747920	.	T	G	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
8	145750138	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,250
8	145750506	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
8	145752467	.	A	T	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:216,0,254
8	145752900	.	C	T	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:306,0,428
8	145756170	.	G	A	339.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:368,27,0
8	145765664	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,104
8	145770299	.	C	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
8	145773779	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,144
8	145806262	.	C	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:170,0,248
8	145971666	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
8	145974196	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
8	145981347	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
8	145987790	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
8	146017032	.	C	T	102.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:130,12,0
8	146017782	.	C	T	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
8	146033730	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,106
8	146034379	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:64,0,33
8	146036234	.	A	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
8	146068594	.	T	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
8	146080120	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
8	146108091	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.368;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:142,0,159
8	146115367	.	A	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:233,0,102
8	146156247	.	C	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:116,0,72
8	146157339	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,232
8	146171437	.	A	G	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:167,0,266
8	146279735	.	A	C	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.664;DP=24;FS=7.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:421,0,434
8	146280802	.	C	T	1407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1436,99,0
9	475281	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	712060	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	712599	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
9	745413	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
9	2029199	.	G	A	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
9	2040625	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	2041588	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	2044721	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	2535913	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	2811505	.	G	A	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
9	2828765	.	C	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
9	4663679	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
9	4664829	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	4706214	.	C	T	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
9	4706366	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	4706961	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	4707896	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	4711440	.	T	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
9	4711947	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
9	4712269	.	C	A	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
9	4740456	.	A	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
9	4741165	.	C	T	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
9	4869232	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	6011330	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	6675434	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	6675436	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	6982099	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	6984236	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	7798518	.	G	C	1052.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1081,75,0
9	12775488	.	G	A	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
9	12775889	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
9	12777406	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
9	12777410	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	12822467	.	G	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
9	13105951	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
9	13105959	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	13106335	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
9	13112116	.	A	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
9	14313712	.	T	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
9	14611366	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	14611757	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	14612188	.	T	G	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
9	14612466	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	14612743	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	14615350	.	C	T	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
9	14615935	.	T	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
9	14616590	.	T	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
9	14616757	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	14617254	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	14617477	.	A	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
9	14618856	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
9	14618930	.	A	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
9	14646622	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	14693270	.	G	A	95.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:123,12,0
9	15461506	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	15461853	.	G	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
9	15464898	.	C	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
9	17051336	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	17051344	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	17051348	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	19346710	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
9	19372990	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
9	19452990	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	19453474	.	C	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
9	19454220	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	20483261	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	20483264	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	20483267	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	20658706	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	20716880	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
9	20866974	.	C	G	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
9	20953049	.	A	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
9	20988426	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
9	21331119	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	21862549	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
9	21968199	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	21988896	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	22154396	.	A	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
9	23536741	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	25677257	.	C	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
9	25677349	.	A	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
9	25677588	.	A	C	275.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:304,24,0
9	25677933	.	T	C	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:401,30,0
9	25677953	.	T	C	278.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:307,24,0
9	27567145	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
9	32455542	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	32456017	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
9	32542204	.	A	G	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
9	32542796	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
9	32982687	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	32995936	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	33026572	.	T	C	83.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=2.059;DP=49;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,6:49:99:112,0,1764
9	33027721	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	33055810	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	33113121	.	G	A	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:245,0,463
9	33113196	.	G	T	905.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:934,66,0
9	33113322	.	C	T	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.251;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.168	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,9:32:99:285,0,899
9	33126346	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	33264540	.	C	G	1460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1489,105,0
9	33289239	.	C	T	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
9	33289271	.	A	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
9	33289283	.	C	T	116.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:144,12,0
9	33290532	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
9	33461567	.	A	G	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:226,0,173
9	33462614	.	G	A	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-0.544;DP=25;FS=6.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,3:25:54:54,0,904
9	33473893	.	T	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,180
9	33583912	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	33917498	.	T	C	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.637;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,7:29:99:201,0,814
9	33921977	.	G	C	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:341,0,420
9	33923867	.	G	A	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.044;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:504,0,202
9	33927053	.	C	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.175;DP=23;FS=4.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.105	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:178,0,668
9	33927899	.	G	A	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:672,51,0
9	33933705	.	A	G	51.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:80,0,23
9	33941759	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:180,0,317
9	33996507	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	34017106	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:139,0,270
9	34037738	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	34087360	.	T	C	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.605;DP=27;FS=3.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.605	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,26:27:54:1099,54,0
9	34125258	.	C	G	610.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.632;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=33.93;ReadPosRankSum=0.351	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,16:18:33:639,0,33
9	34247328	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	34249204	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:109,0,32
9	34249354	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	34251943	.	G	C	509.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.124;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:538,0,364
9	34251952	.	G	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.849;DP=17;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:105,0,1082
9	34252127	.	T	C	755.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:784,54,0
9	34256347	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
9	34257095	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,146
9	34310927	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
9	34336266	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	34367516	.	A	G	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
9	34368389	.	C	T	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:174,0,148
9	34368984	.	G	T	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=21.46;ReadPosRankSum=-1.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:436,0,218
9	34370020	.	T	A	216.75	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:47:581,47,0
9	34371968	.	C	T	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:215,0,131
9	34372783	.	G	C	739.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:768,54,0
9	34372873	.	C	G	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
9	34372931	.	T	A	31.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.839;DP=19;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:60:60,0,551
9	34374507	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
9	34375899	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	34399002	.	C	A	702.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:731,51,0
9	34400581	.	C	T	584.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=-0.434;DP=23;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=25.42;ReadPosRankSum=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:613,0,198
9	34400605	.	G	A	30.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-1.890;DP=25;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:59:59,0,769
9	34405618	.	G	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
9	34406384	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
9	34485176	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:104,0,184
9	34503453	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
9	34635598	.	T	C	534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:563,39,0
9	34637690	.	T	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:86:211,0,86
9	34652330	.	A	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:44:44,0,264
9	34653019	.	T	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
9	34653020	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
9	34668546	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	34668555	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
9	34921380	.	A	T	342.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,11:11:39:371,0,39
9	34922679	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	34922712	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	34998003	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
9	35046394	.	C	T	17.84	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:46,0,35
9	35074917	.	T	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:48:48,0,341
9	35077441	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:78:78,0,500
9	35087632	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,189
9	35087700	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,167
9	35087701	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,167
9	35087810	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,284
9	35089048	.	A	C	2018.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2047,141,0
9	35100002	.	T	C	2070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2099,144,0
9	35100569	.	A	G	39.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:68,0,25
9	35107858	.	C	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
9	35609578	.	G	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:165,0,291
9	35657838	.	G	A	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:88:88,0,103
9	35659440	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:75,0,62
9	35659697	.	T	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
9	35660901	.	C	T	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-2.130;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:204,0,777
9	35660990	.	A	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.786;DP=20;FS=5.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=5.99;ReadPosRankSum=2.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:148,0,576
9	35661057	.	C	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-1.678;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:44:44,0,442
9	35697470	.	C	T	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
9	35705086	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	35748806	.	G	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=22.75;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:59:233,0,59
9	35749014	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
9	35754500	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.09;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:191,0,148
9	35755790	.	G	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,194
9	35757075	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,106
9	35757193	.	T	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:230,0,181
9	35757362	.	T	A	360.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:389,0,277
9	35860483	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:58,0,35
9	36199032	.	G	C	717.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.906;DP=60;FS=18.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,21:60:99:746,0,1523
9	36338022	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	36338955	.	C	T	84.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:112,12,0
9	36342886	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	36572982	.	C	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,181
9	36655648	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	36674842	.	C	T	939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:968,69,0
9	37086996	.	A	G	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:91:91,0,321
9	37087064	.	A	G	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.792;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:247,0,236
9	37088167	.	C	T	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
9	37089150	.	A	G	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.883;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:336,0,333
9	37089873	.	C	T	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
9	37422765	.	C	G	674.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.264;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,19:31:99:703,0,387
9	37426152	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
9	37429401	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
9	37429497	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	37429814	.	A	G	1086.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.055;DP=52;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,29:52:99:1115,0,826
9	37431399	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,110
9	37441808	.	A	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
9	37442090	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,159
9	37442190	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:152,0,161
9	37464106	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	37492679	.	G	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:110,0,185
9	37493588	.	C	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-1.202;DP=14;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:135,0,385
9	37500895	.	T	C	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:270,0,140
9	37503087	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:150,0,73
9	37503124	.	G	A	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
9	37503454	.	A	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:56:56,0,557
9	37503455	.	A	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:147,0,238
9	37503490	.	A	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:137,0,269
9	37504966	.	C	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
9	37506784	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:190,0,113
9	37506966	.	G	A	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:85,0,73
9	37507022	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
9	37507144	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:120,0,74
9	37507154	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:74:120,0,74
9	37510265	.	A	G	17.84	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:46,0,36
9	37512734	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	37775177	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:119,0,67
9	37775467	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
9	37779623	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
9	37888101	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,238
9	37974743	.	T	C	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.725;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:249,0,405
9	38068532	.	A	G	281.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:310,24,0
9	38395940	.	T	C	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
9	38396502	.	G	A	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
9	38397355	.	G	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:46:46,0,489
9	38398150	.	G	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,148
9	38542688	.	G	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:97,0,111
9	38542918	.	T	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
9	38547374	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
9	38550768	.	A	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
9	38553816	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
9	41954579	.	G	A	175.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:23:204,0,23
9	41962410	.	T	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:59:59,0,119
9	42253186	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	66494136	.	T	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
9	66525038	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
9	66798353	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	66798738	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
9	67334949	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	68728895	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,78
9	71227951	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	71396239	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	71396746	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	71650752	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	71688160	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	71835842	.	C	A	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.631;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:460,0,407
9	71843023	.	C	A	1019.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1048,78,0
9	71851877	.	G	A	805.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-1.061;DP=28;FS=11.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=28.78;ReadPosRankSum=1.379	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,21:28:99:834,0,224
9	71867861	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:150,0,98
9	72328979	.	A	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:151,0,30
9	72331806	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,119
9	72897434	.	G	A	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
9	72897440	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,162
9	72912914	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,113
9	72952122	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	73001318	.	C	G	280.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:309,24,0
9	73001489	.	T	C	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
9	73002648	.	C	G	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
9	73028766	.	T	C	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
9	74298720	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
9	74299640	.	G	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
9	74332970	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,235
9	74597973	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
9	74598418	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	74600635	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	74622979	.	T	G	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:78,0,27
9	74966576	.	C	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:158,0,30
9	74966632	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:96:152,0,96
9	74966637	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:96:152,0,96
9	74969864	.	T	C	879.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:908,63,0
9	74975492	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	74975711	.	T	C	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
9	74977980	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
9	74978805	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
9	74979966	.	G	A	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:480,36,0
9	75545882	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
9	76089602	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	76090334	.	G	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
9	77563087	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
9	77598195	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,79
9	77694555	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
9	79001829	.	G	A	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-1.794;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:229,0,297
9	79001904	.	C	A	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.058;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:256,0,297
9	79002026	.	G	A	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.611	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:51:51,0,354
9	79002061	.	T	C	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:226,0,178
9	79003516	.	C	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:281,0,263
9	79009106	.	A	C	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
9	79009139	.	A	G	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:238,0,177
9	79009204	.	C	T	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:171,0,179
9	79009366	.	G	A	38.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:67,0,26
9	79115844	.	A	C	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:81:392,0,81
9	79117751	.	A	G	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:318,0,323
9	79118329	.	G	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-1.002;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:200,0,351
9	79118661	.	A	G	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.634;DP=17;FS=8.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:244,0,364
9	79118903	.	A	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=15.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:94:94,0,312
9	79120475	.	A	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,112
9	79122990	.	A	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:67,0,34
9	79186750	.	G	T	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,14:14:99:411,0,395
9	79186765	.	C	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,13:14:99:429,0,433
9	79186820	.	A	C	1914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1943,135,0
9	79388324	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
9	79827791	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
9	79986057	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
9	79998112	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	80031946	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	80038192	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
9	80038196	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	80333407	.	G	A	714.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:743,51,0
9	80334981	.	A	G	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:488,33,0
9	80335076	.	C	T	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
9	80335274	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=-0.693;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:76:76,0,554
9	80335288	.	C	T	708.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:737,51,0
9	80519183	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	80868354	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	80889521	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
9	80912115	.	G	C	516.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=-1.287;DP=25;FS=11.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=20.67;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:545,0,388
9	80919756	.	T	G	1544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1573,111,0
9	80932887	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	80939879	.	T	G	23.75	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,67
9	80941761	.	A	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
9	80942264	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	80943271	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	84204605	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	84205860	.	G	A	807.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:836,60,0
9	84267147	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	84303291	.	C	T	155.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:16:184,0,16
9	84303442	.	G	A	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.701;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:308,0,326
9	85596037	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:139,0,275
9	85596321	.	T	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:242,0,62
9	85597132	.	C	T	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:191,0,193
9	85597245	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,226
9	85615107	.	C	T	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:234,0,164
9	85627408	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:264,0,251
9	85659677	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	85679726	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:67,0,35
9	86238086	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:104,0,65
9	86278817	.	C	A	823.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.103;DP=38;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.310	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,22:38:99:852,0,586
9	86284178	.	C	A	754.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-1.130;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.226	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:783,0,577
9	86322740	.	C	G	585.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.149;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,17:35:99:614,0,659
9	86354511	.	G	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,151
9	86593314	.	G	C	589.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-1.049;DP=55;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,18:55:99:618,0,1433
9	86595070	.	C	T	613.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.190;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,18:38:99:642,0,659
9	86595498	.	G	A	743.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.198;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,20:30:99:772,0,343
9	86595731	.	C	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:60:60,0,158
9	86595801	.	G	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,75
9	86617265	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
9	86618233	.	C	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
9	88514429	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	88514432	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	88879957	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,113
9	88903367	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	88913111	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	88959938	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,144
9	90588903	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	91002658	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,78
9	91002998	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,119
9	91068288	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:73,0,37
9	91068865	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
9	91090751	.	G	A	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.793;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.699;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:423,0,135
9	91610543	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	91619274	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
9	91619784	.	C	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:197,0,188
9	91927022	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:77,0,69
9	91934787	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	91978397	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
9	91990852	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	91992573	.	A	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,155
9	91997687	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	92010297	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	92010303	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	92010314	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	92010316	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	92017824	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,101
9	92020433	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
9	93606309	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,148
9	93660309	.	T	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
9	94795565	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	95076762	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,323
9	95602786	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	95780465	.	A	G	944.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:973,69,0
9	95821102	.	G	A	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:471,36,0
9	95847157	.	C	T	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.202;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=21.22;ReadPosRankSum=-1.269	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:495,0,322
9	95872216	.	T	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
9	95872744	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	95874428	.	G	A	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
9	95883958	.	A	T	1059.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1088,75,0
9	95884501	.	A	G	1983.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2012,138,0
9	95887320	.	G	T	2264.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2293,166,0
9	95891998	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	95892443	.	A	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	95893114	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	95893465	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:57:57,0,75
9	95894053	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	95895831	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	95997206	.	G	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:118,0,69
9	96051521	.	A	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
9	96064301	.	C	A	50.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:76,0,1
9	96067523	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	96068757	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	96073795	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	96079462	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	96079510	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	96209943	.	T	C	604.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.763;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.147	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:633,0,801
9	96238578	.	C	T	592.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-1.057;DP=32;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:621,0,532
9	96296103	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	96327118	.	T	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
9	96407983	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:233,0,99
9	96422420	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	96440051	.	C	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,146
9	96440328	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:186,0,139
9	96440728	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:99,0,147
9	96440808	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.938;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:78:78,0,453
9	97050508	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
9	97050509	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
9	97238538	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	97329822	.	A	G	83.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:112,0,25
9	97330626	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	97330693	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	97330754	.	C	A	52.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:19:81,0,19
9	97331834	.	A	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
9	97331863	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	97332375	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	97334118	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	97334160	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	97334433	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	97365720	.	T	C	952.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.916;DP=52;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,27:52:99:981,0,898
9	97368301	.	T	C	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
9	97369149	.	C	T	907.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-1.352;DP=46;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,24:46:99:936,0,1669
9	97369151	.	G	A	907.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-1.352;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,24:46:99:936,0,1669
9	97370624	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
9	97371722	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,146
9	97402557	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	97781813	.	G	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
9	97784009	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	97845908	.	T	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:120,0,30
9	97848014	.	G	C	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:200,0,26
9	97848522	.	G	A	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=23.90;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:315,0,136
9	97848684	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=1.237;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=10.12;ReadPosRankSum=-1.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:180,0,348
9	97849090	.	A	G	735.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.327;DP=42;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,21:42:99:764,0,768
9	97862118	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:75,0,64
9	97862701	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,108
9	98177352	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	98177868	.	T	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	98177956	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
9	98178345	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	98178382	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	99250445	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:68,0,35
9	99654034	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,128
9	99654035	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,128
9	99654044	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,128
9	99657252	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,302
9	100008390	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
9	100190780	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	100194406	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
9	100388197	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:120,0,33
9	100459578	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:56,0,76
9	100662379	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
9	100666931	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,172
9	100675816	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:78,0,66
9	100684764	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	100884564	.	C	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
9	100885142	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
9	100885292	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
9	100885706	.	T	C	164.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:20:193,0,20
9	100886825	.	A	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
9	100971348	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
9	101498560	.	C	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
9	101498564	.	C	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
9	101533220	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	101554218	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	101557017	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	101558609	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:70,0,31
9	101570336	.	A	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:142,0,178
9	102723692	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
9	102732237	.	T	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:98:98,0,239
9	102735865	.	A	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,138
9	103054951	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:72,0,64
9	103108553	.	G	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:119,0,69
9	103217387	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	104324202	.	C	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:149,0,155
9	104324545	.	G	A	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:291,0,252
9	105968100	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	106856633	.	C	T	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:91:133,0,91
9	106856691	.	T	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,413
9	106856692	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,413
9	106856952	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,117
9	106856972	.	G	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,120
9	106896809	.	G	A	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.883;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:343,0,338
9	106901877	.	A	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,159
9	107515214	.	G	A	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=1.116;DP=22;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.379	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:402,0,421
9	107521723	.	T	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:40:40,0,475
9	108149746	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
9	108152199	.	G	A	1168.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1197,84,0
9	108456888	.	A	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,111
9	108467982	.	C	G	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.528;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:424,0,379
9	110084328	.	C	T	1116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=1.078;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=20.30;ReadPosRankSum=-1.095	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,31:55:99:1145,0,899
9	111641825	.	G	A	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:393,0,236
9	111653574	.	C	G	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-1.377;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:380,0,298
9	111659483	.	T	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.538;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:77:77,0,515
9	111660851	.	C	T	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-1.222;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.471	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:307,0,228
9	111680865	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:158,0,31
9	111727670	.	C	G	448.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.910;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:477,0,128
9	111754702	.	T	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
9	111754705	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
9	111754724	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
9	111754730	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:157,12,0
9	111755008	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,224
9	111781495	.	G	A	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:290,0,156
9	111781779	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,194
9	111782670	.	G	A	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.799;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:244,0,324
9	111801285	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	111804495	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	111868885	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.421;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,143
9	111881856	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:148,0,160
9	111881927	.	T	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:242,0,371
9	111882167	.	G	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:90:185,0,90
9	111917941	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	112962942	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.124;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:151,0,622
9	112963504	.	A	G	992.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1021,69,0
9	112972044	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	112972472	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	113018755	.	T	C	544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.210;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,17:47:99:573,0,1144
9	114174415	.	T	C	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=1.021;DP=20;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:372,0,374
9	114184259	.	G	C	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:302,0,351
9	114190337	.	G	A	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.458;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:502,0,532
9	114195587	.	G	A	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:256,0,288
9	114359624	.	C	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.931	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:92:92,0,318
9	114401173	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	114563801	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	114659201	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,174
9	114681583	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
9	114694486	.	A	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:170,0,263
9	114695826	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,158
9	114696488	.	A	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:142,0,270
9	114981378	.	T	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.833;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:199,0,487
9	114985497	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:144,0,107
9	114985985	.	T	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,81
9	115140276	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	115141833	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	115141946	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
9	115233802	.	G	C	254.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:283,0,20
9	115235585	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	115446633	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,273
9	115446721	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,116
9	115446785	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:158,0,73
9	115447580	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:94:194,0,94
9	115447935	.	T	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:177,0,191
9	115448167	.	A	G	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=24.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:60:228,0,60
9	115448195	.	A	C	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:49:270,0,49
9	115448341	.	T	G	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:198,0,112
9	115449110	.	C	T	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:127,0,191
9	115449556	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,281
9	115634282	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	115635252	.	A	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:76,0,31
9	115924278	.	C	T	76.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:105,0,24
9	115925396	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	115927857	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:75,0,70
9	115928275	.	T	C	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
9	115931593	.	G	A	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.98;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:87:314,0,87
9	115933885	.	A	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,271
9	115933978	.	G	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:240,0,320
9	115933980	.	C	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:240,0,320
9	115941046	.	T	C	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.749;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:171,0,204
9	115950706	.	A	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:103,0,278
9	115950739	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,196
9	116025024	.	A	C	296.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:325,0,215
9	116026255	.	G	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=-2.424;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.29;ReadPosRankSum=2.281	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:227,0,247
9	116037697	.	T	C	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:168,0,185
9	116044998	.	A	G	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=1.232;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:358,0,431
9	116076786	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:81,0,26
9	116078371	.	A	T	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,40
9	116078468	.	C	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:135,0,30
9	116122954	.	A	G	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=15.39;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:336,0,396
9	116132275	.	G	A	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:54:318,0,54
9	116136198	.	C	T	453.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-1.743;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=22.69;ReadPosRankSum=1.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:482,0,231
9	116138136	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,242
9	116139063	.	G	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=1.098;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:178,0,195
9	116139164	.	G	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:112,0,144
9	116153900	.	A	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.036;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:230,0,139
9	116170559	.	G	A	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.131;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:418,0,422
9	116172667	.	T	C	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:77,0,25
9	116264875	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	116304304	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,76
9	116308709	.	G	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:123,0,33
9	116329708	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
9	116352373	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
9	116354390	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	116359270	.	G	A	390.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.854;DP=17;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:419,0,203
9	116359339	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-2.706;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:147,0,582
9	116813001	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	116813439	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	116814126	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:63,0,30
9	116815971	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	116816581	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	116816582	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	116816816	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	116817812	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	116967405	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
9	117166338	.	G	C	729.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:758,54,0
9	117169033	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.441;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:78:78,0,520
9	117174368	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
9	117179550	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
9	117181190	.	T	C	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:89:89,0,336
9	117182478	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:143,0,152
9	117182605	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,97
9	117185395	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,76
9	117185705	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.002;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:190,0,307
9	117186677	.	A	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.429;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:170,0,317
9	117187568	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:155,0,30
9	117187976	.	C	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,150
9	117188566	.	C	T	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
9	117190562	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	117196158	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	117266748	.	C	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:95:95,0,131
9	117267591	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,190
9	117360729	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,234
9	117383919	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	117383955	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	117384998	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
9	117386348	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	117792583	.	C	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:232,0,148
9	117797597	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,215
9	117804544	.	T	C	241.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:270,0,22
9	117812400	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
9	117846570	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:75,0,113
9	117846580	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:68,0,121
9	117848394	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
9	117849314	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,152
9	117853022	.	C	T	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:229,0,179
9	119187839	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	119462112	.	C	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
9	119463878	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	119495697	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
9	119854408	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
9	120053776	.	T	C	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
9	120599753	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	120600443	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	120600700	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	120620210	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	120632312	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	122194337	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	122194341	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	123156742	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
9	123156761	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	123162795	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
9	123170305	.	C	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:80,0,28
9	123170733	.	C	G	1246.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1275,90,0
9	123201866	.	C	T	53.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.484;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:82:82,0,1122
9	123202516	.	T	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
9	123202997	.	T	C	212.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:241,0,24
9	123291036	.	C	G	1004.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1033,72,0
9	123308276	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
9	123342259	.	C	A	735.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:764,54,0
9	123342275	.	A	G	762.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:791,57,0
9	123363533	.	T	C	1138.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1167,81,0
9	123521842	.	A	C	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.256;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,9:36:99:279,0,1060
9	123524182	.	C	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.796;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.327	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:118,0,533
9	123524632	.	T	A	82.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:111,0,24
9	123582697	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	123583192	.	A	G	1476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1505,105,0
9	123583889	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,194
9	123586737	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	123606101	.	G	A	1022.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1051,72,0
9	123610288	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
9	123618229	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
9	123618971	.	A	G	428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:457,33,0
9	123780005	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,76
9	123914874	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,112
9	124043467	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
9	124101563	.	C	T	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:653,51,0
9	124580405	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	124855211	.	C	T	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:50:270,0,50
9	124914613	.	C	T	452.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.622;DP=70;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,16:70:99:481,0,2108
9	125001985	.	C	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
9	125002246	.	G	A	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
9	125003196	.	T	A	804.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:833,57,0
9	125003528	.	A	G	760.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:789,54,0
9	125003679	.	G	A	1104.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1133,78,0
9	125004988	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	125042813	.	G	A	38.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.212;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:67:67,0,631
9	125092303	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,120
9	125231092	.	A	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
9	125371916	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	125609392	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:94:94,0,278
9	125609985	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=1.071;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:67:67,0,559
9	125616255	.	C	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.236;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:119,0,613
9	125673051	.	T	G	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=29.08;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:61:319,0,61
9	125678603	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
9	125680547	.	C	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:162,0,31
9	125683121	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	125691747	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	125703162	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	125832879	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
9	125833575	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	125833669	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
9	125844980	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	125848482	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	125858594	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	125859445	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	125861888	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	125866070	.	G	C	985.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:74:1014,74,0
9	125866772	.	C	G	1148.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1177,81,0
9	125875541	.	A	G	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
9	125880828	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	125881541	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
9	125920376	.	G	A	958.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:987,69,0
9	126144746	.	T	C	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:48:708,48,0
9	126144758	.	T	C	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:48:708,48,0
9	126520068	.	T	C	894.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-0.835;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,23:31:99:923,0,254
9	126689150	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	127020828	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	127046370	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,71
9	127051173	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
9	127052467	.	A	G	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
9	127053027	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
9	127054184	.	C	T	118.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:147,0,21
9	127069744	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
9	127093743	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	127101924	.	C	T	1313.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1342,93,0
9	127102939	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	127106540	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	127110354	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	127110457	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	127113660	.	A	G	1105.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1134,78,0
9	127116942	.	C	T	638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:667,51,0
9	127117346	.	G	A	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
9	127118386	.	T	C	794.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:823,57,0
9	127118550	.	G	A	1005.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1034,72,0
9	127119356	.	T	G	738.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:767,54,0
9	127177736	.	G	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
9	127622005	.	A	C	288.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:317,24,0
9	127622073	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
9	127632067	.	G	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
9	127634429	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:114,0,76
9	127635406	.	T	C	292.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:12:320,0,12
9	127635713	.	A	G	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:181,0,110
9	127638833	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	127639695	.	C	T	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=1.118;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=33.22;ReadPosRankSum=0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,15:17:36:593,0,36
9	127641038	.	T	C	349.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:378,30,0
9	127641764	.	G	A	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.085;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=30.72;ReadPosRankSum=-0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:40:489,0,40
9	127642231	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
9	127644882	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
9	127645241	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	127674200	.	A	C	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:719,54,0
9	127711321	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	127713478	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	127818276	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:56:56,0,153
9	127909069	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	127909622	.	G	C	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:139,0,233
9	127910307	.	T	G	463.31	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=30.74;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,12:13:1:489,1,0
9	127910498	.	G	T	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
9	127911031	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:140,0,304
9	127911135	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	127912316	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	127913157	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:149,0,28
9	127913764	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
9	127913837	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
9	127962916	.	G	A	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
9	127962972	.	G	A	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:250,0,102
9	127971767	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	127996046	.	A	G	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=1.295;DP=23;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.435	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:166,0,671
9	127998651	.	C	T	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.068;DP=34;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,11:34:99:368,0,854
9	128074807	.	T	C	818.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:847,57,0
9	128201098	.	A	G	1888.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1917,138,0
9	128305390	.	C	T	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.261;DP=39;FS=12.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,8:39:99:238,0,1233
9	128595436	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	128711455	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	128721295	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	128721311	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	128723559	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	128728459	.	A	G	425.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=32.74;ReadPosRankSum=-0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:7:453,0,7
9	129102840	.	G	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:147,0,148
9	129184309	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	129260212	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	129260235	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	129265612	.	C	A	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:93:99,0,93
9	129265715	.	C	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
9	129267150	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,108
9	129267975	.	A	G	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:38:38,0,225
9	129268204	.	T	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:55:55,0,358
9	129268676	.	C	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:135,0,198
9	129358771	.	C	G	49.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:20:78,0,20
9	129359578	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	129364976	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,167
9	129364981	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,165
9	129367398	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:92:92,0,192
9	129368801	.	C	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
9	129370955	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:75,0,66
9	129373064	.	A	G	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
9	129373235	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
9	129389710	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	129396408	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
9	129396434	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	129422023	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	129450978	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:76,0,64
9	129453229	.	A	G	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:494,0,750
9	129454714	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	129455587	.	G	C	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:404,0,290
9	129457752	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	129459314	.	C	T	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.329;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.094	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:360,0,608
9	129459438	.	G	A	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.747;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.293	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,14:33:99:489,0,689
9	129459478	.	C	T	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.194;DP=26;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:253,0,617
9	129459628	.	C	T	404.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.148;DP=30;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:433,0,688
9	129460914	.	A	G	718.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=-0.885;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:747,0,215
9	129461123	.	T	C	1266.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1295,87,0
9	129461124	.	G	C	691.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=1.354;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=23.85;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,19:29:99:720,0,327
9	129462501	.	G	T	520.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.385;DP=36;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=14.47;ReadPosRankSum=2.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:549,0,822
9	129462563	.	A	G	493.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.439;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=20.57;ReadPosRankSum=-0.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:522,0,335
9	129462594	.	T	C	665.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=1.633;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=27.74;ReadPosRankSum=-1.233	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:694,0,191
9	129462687	.	C	A	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.746;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:318,0,442
9	129462901	.	T	C	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=1.493;DP=24;FS=10.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:350,0,533
9	129595895	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,105
9	129948771	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	129952049	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	129960111	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
9	129962460	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	129966094	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	129966689	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	129978670	.	A	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
9	129979725	.	A	G	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
9	130094526	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130125963	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130126246	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	130128137	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	130129601	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	130132546	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	130144182	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	130151210	.	A	G	78.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:107,0,27
9	130163110	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	130163283	.	A	G	122.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:150,12,0
9	130163294	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,104
9	130163953	.	A	T	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
9	130164818	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	130168867	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
9	130242166	.	A	G	945.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:974,69,0
9	130255810	.	C	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
9	130259618	.	A	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	130289485	.	G	A	560.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.221;DP=63;FS=12.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,18:63:99:589,0,1726
9	130323485	.	G	T	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
9	130425777	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	130451891	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,252
9	130451892	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,252
9	130451955	.	C	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:160,0,31
9	130455501	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
9	130474534	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:114,0,71
9	130475011	.	T	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
9	130475442	.	A	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
9	130494667	.	G	A	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
9	130494791	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	130494811	.	T	C	244.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:273,21,0
9	130494957	.	T	C	1044.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1073,75,0
9	130495633	.	C	G	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
9	130495890	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	130496415	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
9	130552179	.	G	A	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.887;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:445,0,289
9	130554015	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
9	130565267	.	A	G	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:343,27,0
9	130567603	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,160
9	130567644	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
9	130567656	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130569970	.	G	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:222,0,140
9	130576075	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.995;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.208	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:153,0,708
9	130581723	.	A	G	63.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
9	130629582	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	130630639	.	A	G	1922.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1951,135,0
9	130647583	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	130648345	.	G	A	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
9	130648519	.	G	C	894.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:923,66,0
9	130648680	.	G	A	631.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:660,48,0
9	130698029	.	G	C	824.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-2.153;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,24:53:99:853,0,1067
9	130698043	.	A	G	771.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.135;DP=53;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,22:53:99:800,0,1208
9	130699917	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,103
9	130703565	.	A	G	680.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.042;DP=40;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.351	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,20:39:99:709,0,669
9	130703789	.	G	A	625.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=-1.535;DP=37;FS=14.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,18:37:99:654,0,643
9	130704975	.	T	C	668.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.926;DP=46;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.235	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,21:46:99:697,0,838
9	130705120	.	C	T	835.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-0.171;DP=41;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,23:41:99:864,0,629
9	130707081	.	A	G	990.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.061;DP=54;FS=11.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,28:54:99:1019,0,938
9	130710973	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,79
9	130713308	.	A	C	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:186,15,0
9	130713616	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:123,0,32
9	130714324	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,101
9	130714593	.	G	A	16.86	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:45:45,0,78
9	130742762	.	A	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.775;DP=22;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.282	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:198,0,500
9	130742834	.	T	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:192,0,111
9	130824594	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130829039	.	A	G	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
9	130860866	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
9	130864676	.	T	C	961.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:990,69,0
9	130870023	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=8.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:96:96,0,434
9	130870087	.	C	T	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.900;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:445,0,507
9	130871275	.	A	G	212.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:241,21,0
9	130873428	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
9	130876356	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130880637	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	130880829	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:106,0,73
9	130883511	.	C	T	2857.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2886,199,0
9	130888346	.	A	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
9	130888629	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130888768	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	130888946	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130889571	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	130890107	.	G	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:164,0,401
9	130890281	.	C	G	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:351,27,0
9	130922952	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	130924239	.	G	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
9	130924526	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	130924922	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
9	130940121	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	130940822	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
9	130947633	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	130965539	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	130987638	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	131031312	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
9	131050969	.	G	C	34.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.327;DP=36;FS=13.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.076	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,4:36:63:63,0,1254
9	131067694	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,435
9	131067751	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,317
9	131067755	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,466
9	131067806	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,275
9	131067832	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	131067923	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:55:55,0,310
9	131068061	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.934;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,611
9	131068067	.	C	T	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:38:38,0,522
9	131068107	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:96:96,0,355
9	131068857	.	T	C	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:280,0,106
9	131069050	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,396
9	131069052	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,396
9	131069123	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,158
9	131069755	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:99:180,0,1181
9	131069762	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:180,0,1181
9	131069765	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:180,0,1181
9	131069766	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:180,0,1181
9	131069980	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,154
9	131070387	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,731
9	131070397	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,731
9	131070645	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
9	131071114	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:120,0,66
9	131071533	.	T	C	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.200;DP=22;FS=6.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=1.67;ReadPosRankSum=2.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:65:65,0,748
9	131084628	.	C	A	511.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=-0.961;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:540,0,234
9	131085373	.	G	C	1460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1489,108,0
9	131088464	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:346,27,0
9	131089068	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,151
9	131089506	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:79,0,29
9	131089919	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,111
9	131089950	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=38.25;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:51:204,0,51
9	131089952	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=33.18;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:51:204,0,51
9	131089958	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:54:54,0,326
9	131090044	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,221
9	131092541	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
9	131092596	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:162,0,30
9	131093909	.	A	G	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=3.65;ReadPosRankSum=2.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:83:83,0,460
9	131094242	.	A	G	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.794;DP=15;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:83:83,0,464
9	131094269	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,483
9	131094270	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,494
9	131104768	.	G	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:53:53,0,198
9	131107536	.	C	T	85.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-1.227;DP=47;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.195	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,6:47:99:114,0,1532
9	131118398	.	A	G	163.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:192,0,17
9	131124005	.	C	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
9	131188402	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,205
9	131188444	.	A	G	195.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:10:223,0,10
9	131189410	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,161
9	131189411	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,161
9	131200607	.	T	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
9	131202100	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
9	131233436	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	131257669	.	C	T	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
9	131260563	.	T	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
9	131263450	.	T	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
9	131264003	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	131278248	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,79
9	131283276	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:67,0,36
9	131346218	.	A	C	1457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1486,105,0
9	131360750	.	C	T	2040.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2069,141,0
9	131367346	.	G	A	60.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.777;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,5:44:89:89,0,1506
9	131375701	.	A	G	1883.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1912,135,0
9	131379967	.	C	T	2743.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2772,196,0
9	131385873	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
9	131389194	.	G	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
9	131390648	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
9	131391785	.	T	C	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
9	131391986	.	C	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:96:178,0,96
9	131392553	.	G	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
9	131393319	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,306
9	131393324	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,306
9	131397479	.	G	A	3032.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3061,213,0
9	131398343	.	T	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
9	131398636	.	C	T	2630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2659,193,0
9	131401065	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	131403096	.	A	G	2760.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2789,195,0
9	131426306	.	G	T	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
9	131426309	.	T	C	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
9	131436836	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	131436838	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	131442990	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	131453331	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
9	131454120	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
9	131454369	.	T	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
9	131454818	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
9	131483551	.	T	A	801.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-2.309;DP=47;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=17.06;ReadPosRankSum=2.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,23:47:99:830,0,846
9	131483749	.	T	A	1917.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1946,138,0
9	131492637	.	T	G	994.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1023,72,0
9	131492850	.	T	C	950.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:979,69,0
9	131493140	.	G	A	369.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.301;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.411	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:398,0,530
9	131502106	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	131502112	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	131512831	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:67,0,35
9	131515547	.	G	T	1331.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1360,96,0
9	131555306	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	131555777	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	131557559	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	131558288	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	131570178	.	T	C	669.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:48:698,48,0
9	131570183	.	C	G	669.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:48:698,48,0
9	131571756	.	G	A	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:790,54,0
9	131572027	.	G	A	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
9	131580998	.	C	T	1311.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1340,99,0
9	131582625	.	G	A	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
9	131583170	.	T	C	583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:612,45,0
9	131584245	.	A	G	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
9	131585069	.	A	G	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
9	131586913	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	131586918	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	131588652	.	T	C	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:434,33,0
9	131670919	.	T	C	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
9	131679892	.	C	T	1056.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:75:1085,75,0
9	131679897	.	A	G	1056.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1085,75,0
9	131680177	.	G	T	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=9.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:92:405,0,92
9	131710847	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:71,0,36
9	131711513	.	G	C	414.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:443,0,301
9	131745285	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.538;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,6:46:99:121,0,1582
9	131765214	.	C	T	502.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.417;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,15:35:99:531,0,725
9	131856010	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	131857630	.	C	T	2427.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2456,171,0
9	131860901	.	G	T	2838.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-1.732;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=29.72;ReadPosRankSum=1.681	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,67:68:99:2867,171,0
9	131862073	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	131863573	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
9	131864950	.	C	T	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
9	131865027	.	C	T	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
9	131871144	.	A	G	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:870,60,0
9	131871249	.	A	C	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
9	131871435	.	A	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
9	131872975	.	A	C	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:820,63,0
9	131873638	.	T	G	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
9	131898880	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	131902313	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:187,0,144
9	131903881	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	131905177	.	T	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
9	131905814	.	T	C	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
9	131905854	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
9	131907510	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
9	131909085	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	131909736	.	C	T	1978.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.792;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,52:72:99:2007,0,626
9	131910227	.	G	C	1692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1721,117,0
9	131910414	.	C	T	2515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2544,175,0
9	131911135	.	G	C	1761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1790,126,0
9	131922232	.	C	A	52.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	131924974	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	131928290	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	131930494	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	131938913	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	131940019	.	G	A	1291.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1320,102,0
9	131940865	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	132085237	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	132106240	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	132256523	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	132256902	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	132259595	.	T	C	361.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:390,30,0
9	132260350	.	A	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:133,0,357
9	132265679	.	G	A	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-1.256;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:214,0,417
9	132268125	.	G	A	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:93:230,0,93
9	132268255	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,191
9	132269863	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:78,0,30
9	132270020	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
9	132270599	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,76
9	132271882	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
9	132272567	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	132273046	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,110
9	132273106	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:113,0,71
9	132273314	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	132273421	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:165,0,30
9	132275723	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	132390226	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
9	132394648	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	132395316	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
9	132395338	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
9	132396281	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	132396655	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	132397252	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,112
9	132399000	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,169
9	132399110	.	T	C	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:49:238,0,49
9	132399200	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:138,0,153
9	132399853	.	G	A	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.900;DP=26;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:372,0,499
9	132400480	.	G	A	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:286,0,371
9	132401089	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	132402908	.	C	G	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:648,45,0
9	132404304	.	C	G	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:425,33,0
9	132566666	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,74
9	132569442	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:73,0,71
9	132569553	.	C	T	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.739;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:344,0,377
9	132569750	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	132572629	.	T	G	68.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:67:198,0,67
9	132572793	.	A	C	456.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.276;DP=28;FS=11.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:485,0,519
9	132573290	.	C	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:304,0,300
9	132573536	.	G	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,111
9	132574862	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:107,0,31
9	132576060	.	C	A	551.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.864;DP=39;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.977	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,17:39:99:580,0,814
9	132578228	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
9	132578526	.	C	T	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
9	132578949	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
9	132579110	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	132579111	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	132580686	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,113
9	132585058	.	G	A	599.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-0.248;DP=35;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.997;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.413	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,17:35:99:628,0,685
9	132590083	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:74:106,0,74
9	132590159	.	T	C	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.710;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:217,0,281
9	132590352	.	A	G	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-1.464;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:219,0,739
9	132590353	.	G	T	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-1.859;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:219,0,739
9	132590431	.	C	G	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.308;DP=37;FS=5.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:410,0,959
9	132591509	.	A	G	661.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=-0.673;DP=43;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.281	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,19:43:99:690,0,796
9	132597021	.	C	T	544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.317;DP=40;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,16:40:99:573,0,887
9	132597449	.	C	A	641.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.382;DP=33;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,19:33:99:670,0,489
9	132597774	.	T	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.336;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:178,0,107
9	132599101	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	132616066	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	132620364	.	T	C	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
9	132623293	.	C	T	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:530,39,0
9	132623868	.	T	C	857.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:886,63,0
9	132626807	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
9	132627324	.	C	T	30.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
9	132631680	.	T	C	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
9	132632367	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
9	132637712	.	G	A	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:321,0,304
9	132643595	.	A	G	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:907,63,0
9	132649662	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
9	132649857	.	C	T	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
9	132650019	.	C	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
9	132650529	.	T	C	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
9	132651248	.	G	A	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
9	132651363	.	G	C	17.81	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=5.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:45,6,0
9	132652336	.	A	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
9	132652523	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
9	132655527	.	C	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
9	132655546	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
9	132655864	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	132657156	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	132657519	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
9	132657552	.	T	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,151
9	132657957	.	A	G	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
9	132658044	.	T	C	194.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:223,18,0
9	132662786	.	C	T	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.021;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:356,0,359
9	132672962	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	132681619	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	132686186	.	A	G	898.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:927,66,0
9	132872686	.	A	G	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:519,39,0
9	132891863	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	132898193	.	G	A	632.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=-1.170;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,18:37:99:661,0,667
9	132900076	.	T	C	866.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-0.956;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,23:35:99:895,0,399
9	132978951	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	132978952	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	132978967	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	132988709	.	T	G	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.612;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:324,0,321
9	132995768	.	G	A	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=-1.985;DP=16;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=0.87;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,513
9	132997775	.	C	T	571.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:600,42,0
9	132998140	.	C	T	115.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
9	132998359	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
9	132998680	.	G	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:94:94,0,219
9	133324400	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
9	133350082	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	133376800	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
9	133527416	.	T	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:37:63,0,37
9	133527435	.	G	A	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
9	133575247	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,157
9	133575273	.	A	G	45.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:74,0,25
9	133580354	.	A	G	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:52:52,0,358
9	133580454	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,107
9	133581143	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,156
9	133581233	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,80
9	133582267	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,191
9	133710804	.	T	C	545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:44:574,44,0
9	133761001	.	A	G	518.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.750;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,15:35:99:547,0,732
9	133762063	.	C	T	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.961;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:344,0,456
9	133787225	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:77,0,33
9	133805830	.	T	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
9	133808499	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
9	133808656	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	133996439	.	C	T	1336.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1365,99,0
9	133997543	.	C	G	963.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:992,72,0
9	133997961	.	C	G	1262.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1291,90,0
9	134016650	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	134017323	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	134018816	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	134020092	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:113,0,484
9	134021630	.	A	G	868.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:897,63,0
9	134269581	.	G	A	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:226,0,500
9	134275757	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	134294532	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	134306732	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
9	134308441	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	134308448	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	134323240	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	134334588	.	A	G	490.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=1.487;DP=50;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,16:50:99:519,0,1328
9	134346315	.	T	C	1548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1577,111,0
9	134350323	.	C	G	408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.260	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:437,0,440
9	134350458	.	C	T	649.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.667;DP=49;FS=4.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=13.26;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,19:49:99:678,0,1150
9	134350647	.	T	C	1601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1630,114,0
9	134351065	.	G	T	1325.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1354,102,0
9	134351343	.	C	T	1371.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1400,102,0
9	134351770	.	G	A	960.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=-0.695;DP=40;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=24.02;ReadPosRankSum=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,26:40:99:989,0,474
9	134358657	.	G	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
9	134359918	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	134360015	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	134361581	.	T	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
9	134361627	.	G	A	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
9	134362304	.	T	C	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
9	134365192	.	G	A	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:141,0,227
9	134365795	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
9	134366240	.	C	G	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
9	134369257	.	T	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:41:70,0,41
9	134371134	.	A	G	714.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.207;DP=45;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.012	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,21:43:99:743,0,809
9	134371980	.	G	A	660.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.237;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,19:33:99:689,0,507
9	134372232	.	C	T	589.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=1.133;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.314	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,17:44:99:618,0,994
9	134372290	.	A	G	678.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.379;DP=39;FS=7.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,20:39:99:707,0,707
9	134373770	.	G	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:736,51,0
9	134374601	.	C	G	1005.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1034,72,0
9	134374882	.	T	C	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.479;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,16:22:99:617,0,174
9	134382111	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	134382673	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	134383159	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	134384500	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
9	134384513	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	134385436	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	134385977	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	134386744	.	T	C	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
9	134387100	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	134387133	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	134387488	.	T	C	706.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:735,51,0
9	134394163	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	134394646	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	134397624	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	134398534	.	T	C	842.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:871,63,0
9	134398719	.	T	C	921.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:950,69,0
9	134398771	.	T	C	1128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:78:1157,78,0
9	134398778	.	A	G	1128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:78:1157,78,0
9	134398841	.	C	T	905.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:934,66,0
9	134398914	.	G	A	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:260,0,380
9	134398946	.	T	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=-2.436;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:135,0,631
9	134399356	.	A	G	1029.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1058,78,0
9	134401335	.	C	T	1470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1499,105,0
9	134402210	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	134404199	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
9	134405415	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:102,0,74
9	134424412	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	134424750	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	134425373	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	134427469	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	134433463	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
9	134434383	.	G	A	378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:407,30,0
9	134436562	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	134437242	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
9	134437528	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	134437728	.	C	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
9	134452371	.	A	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
9	134452681	.	G	A	1000.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1029,72,0
9	134453976	.	G	A	765.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:794,54,0
9	134465398	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
9	134468846	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	134469658	.	A	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
9	134471264	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	134493779	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	134495007	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	134755217	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	134757772	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	135139065	.	T	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.903;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:48:48,0,389
9	135139901	.	T	C	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:261,0,227
9	135143844	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	135165413	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	135172412	.	A	G	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:346,0,200
9	135173685	.	T	C	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-2.141;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:272,0,179
9	135202829	.	T	C	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:394,0,220
9	135203231	.	C	T	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-2.000;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:342,0,279
9	135203409	.	A	C	766.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:795,57,0
9	135203675	.	G	C	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-1.195;DP=21;FS=7.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.195	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:281,0,496
9	135206460	.	A	G	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:93:93,0,311
9	135251241	.	T	C	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
9	135263573	.	G	T	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
9	135273507	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	135273607	.	C	G	747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:776,54,0
9	135277130	.	C	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:257,0,227
9	135282188	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:135,0,131
9	135437812	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	135538050	.	C	T	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.270;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:44:402,0,44
9	135555341	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
9	135556010	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	135568632	.	C	A	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
9	135569741	.	A	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:304,0,100
9	135767943	.	C	T	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.170;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:489,0,120
9	135770115	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
9	135770134	.	G	A	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:60:307,0,60
9	135770300	.	G	A	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:97:344,0,97
9	135770347	.	A	C	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:60:241,0,60
9	135974079	.	G	C	1007.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1036,72,0
9	135974100	.	G	A	816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:845,60,0
9	135975356	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	135976552	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
9	135976679	.	C	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:56:56,0,115
9	135976826	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
9	136196756	.	C	G	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
9	136196982	.	T	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
9	136197834	.	G	A	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=1.00;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:42:42,0,479
9	136197971	.	T	G	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.032;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.766;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:286,0,429
9	136208044	.	C	T	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:253,0,443
9	136208193	.	T	C	772.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:801,60,0
9	136208483	.	C	T	577.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-1.236;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:606,0,212
9	136208711	.	G	T	635.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.699;DP=24;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,17:24:99:664,0,234
9	136209863	.	C	T	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:130,0,289
9	136210046	.	G	T	733.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:762,54,0
9	136210366	.	T	C	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:848,60,0
9	136213521	.	T	C	734.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:763,60,0
9	136219564	.	G	C	1304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.238;DP=48;FS=12.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=27.18;ReadPosRankSum=1.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,34:48:99:1333,0,476
9	136221557	.	A	G	911.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.779;DP=37;FS=17.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,24:37:99:940,0,446
9	136227260	.	A	G	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:880,63,0
9	136271734	.	G	A	432.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.347	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:461,0,284
9	136277480	.	A	G	922.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:951,66,0
9	136284234	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	136286122	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	136286131	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
9	136314952	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
9	136319589	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:156,0,155
9	136319670	.	C	T	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
9	136328657	.	T	C	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:790,54,0
9	136334598	.	T	C	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=1.848;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:300,0,505
9	136334910	.	T	C	824.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:853,60,0
9	136335058	.	T	C	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=-1.605;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:447,0,442
9	136335824	.	C	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:141,0,270
9	136628770	.	T	C	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.858;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:238,0,502
9	136643994	.	T	C	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.519;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:360,0,506
9	136647676	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
9	136647688	.	A	G	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
9	136650506	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	136651185	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
9	136651428	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	136651629	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	136890649	.	G	A	208.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:237,18,0
9	136891370	.	G	T	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:527,39,0
9	136892160	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:44:44,0,443
9	136892523	.	C	T	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
9	136895818	.	T	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:175,0,235
9	136896435	.	A	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=19.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.53;ReadPosRankSum=-2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:96:96,0,223
9	136898627	.	A	G	764.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:793,54,0
9	136904835	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	136907005	.	G	A	760.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:789,57,0
9	136908549	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	136912205	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:72,0,37
9	136913355	.	T	C	1039.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1068,78,0
9	136918662	.	C	A	433.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:462,33,0
9	136919985	.	A	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	136926136	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	137004432	.	G	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
9	137014230	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
9	137022235	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:109,0,31
9	137023364	.	C	A	419.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.245;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:448,0,474
9	137024067	.	C	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.116;DP=20;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:189,0,461
9	137024438	.	G	C	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.180;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:435,0,495
9	137248166	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	137259174	.	G	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:62,0,33
9	137296892	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
9	137321156	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	137322710	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,101
9	137330831	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:53:53,0,381
9	137332311	.	T	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,360
9	137533787	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	137982127	.	T	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
9	138012647	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,189
9	138355370	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
9	138357705	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	138364389	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	138364601	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	138378856	.	A	G	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:655,48,0
9	138379002	.	T	G	339.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:368,27,0
9	138394929	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
9	138396251	.	A	G	908.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.078;DP=46;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=19.76;ReadPosRankSum=-0.233	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,26:46:99:937,0,703
9	138700518	.	C	T	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=19.54;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:165,0,66
9	138702934	.	A	G	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:46:46,0,335
9	138805934	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	138812118	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	138825117	.	A	C	917.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:946,66,0
9	138837113	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	138837259	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	138838140	.	T	C	929.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:958,66,0
9	138898893	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
9	138899462	.	A	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
9	138899630	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
9	138901049	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,143
9	138901270	.	A	G	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
9	138901319	.	T	C	541.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:570,42,0
9	138902790	.	A	G	43.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:71,5,0
9	138903671	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
9	139008803	.	T	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:94:94,0,325
9	139010019	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	139098942	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:149,0,65
9	139099073	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,114
9	139099451	.	A	C	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
9	139117598	.	C	T	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
9	139126120	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	139137626	.	C	T	136.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:7:164,0,7
9	139252879	.	A	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.60;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:177,0,104
9	139253839	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,101
9	139259349	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
9	139270149	.	A	G	151.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:180,0,22
9	139271355	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:117,0,33
9	139271747	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	139272058	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,100
9	139272502	.	T	C	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:79:237,0,79
9	139273402	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,227
9	139275204	.	A	C	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:254,0,99
9	139275294	.	G	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:148,0,68
9	139280766	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	139327858	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
9	139327869	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	139356002	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	139360354	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:78,0,30
9	139364585	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:72,0,68
9	139376599	.	A	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
9	139443687	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	139443989	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	139566823	.	A	G	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
9	139567687	.	G	A	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=24.29;ReadPosRankSum=-1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:344,0,135
9	139567762	.	G	C	776.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:805,57,0
9	139568047	.	G	A	926.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:955,69,0
9	139579655	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	139613930	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	139614170	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,71
9	139614735	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:113,0,57
9	139616742	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
9	139620999	.	T	A	146.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:14:175,14,0
9	139621919	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	139622402	.	C	G	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:567,45,0
9	139622450	.	G	T	349.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=2.015;DP=29;FS=14.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.199	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:378,0,578
9	139622866	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	139623977	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
9	139686247	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
9	139686357	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
9	139690144	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
9	139690840	.	G	A	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
9	139694276	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	139696378	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,161
9	139696512	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,252
9	139696513	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,252
9	139696688	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
9	139702468	.	G	A	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:641,51,0
9	139721513	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	139724272	.	C	T	281.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:310,24,0
9	139726239	.	A	G	1176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.189;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=26.15;ReadPosRankSum=1.165	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,31:45:99:1205,0,466
9	139729748	.	T	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
9	139791684	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
9	139820421	.	G	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:121,0,458
9	139836362	.	G	A	388.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.280;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.271;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:417,0,286
9	139837138	.	G	A	1100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=1.848;DP=41;FS=3.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=26.85;ReadPosRankSum=3.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,29:41:99:1129,0,368
9	139837990	.	G	C	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:121,0,24
9	139838690	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:51:99,0,51
9	139840859	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	139887042	.	G	C	306.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-4.992;DP=51;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=6.02	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,14:51:99:335,0,4704
9	139901891	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
9	139902166	.	G	A	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:89:89,0,285
9	139902214	.	A	G	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:473,36,0
9	139902712	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
9	139904037	.	A	G	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.68;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:52:315,0,52
9	139904722	.	C	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.919;DP=14;FS=13.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:126,0,383
9	139906359	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.97;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:64:280,0,64
9	139912178	.	G	A	28.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.80	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:22:57,0,22
9	139912484	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	139913239	.	T	G	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
9	139933183	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
9	139934020	.	G	A	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-1.901;DP=30;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:307,0,811
9	139934107	.	G	A	767.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.812;DP=37;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:796,0,570
9	139935853	.	C	T	177.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:206,18,0
9	139937556	.	C	T	32.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.829;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:61:61,0,509
9	139937795	.	T	C	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:69:997,69,0
9	139937799	.	G	A	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:69:997,69,0
9	139938606	.	T	C	1600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1629,114,0
9	139938681	.	A	G	878.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=1.588;DP=29;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=30.30;ReadPosRankSum=-0.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,23:29:99:907,0,182
9	139938793	.	G	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.434;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.301	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:230,0,585
9	139939197	.	T	C	1052.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1081,75,0
9	139940193	.	C	G	200.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:23:229,23,0
9	139943112	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,176
9	139943549	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	139943998	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:72,0,67
9	139945051	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	139945363	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-1.312;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:106,0,321
9	139945677	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,120
9	139956954	.	T	C	403.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=1.524;DP=42;FS=3.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,13:42:99:432,0,1141
9	139957941	.	C	T	738.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-1.861;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.207	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:767,0,1216
9	139957955	.	G	A	738.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.177;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=24.63;ReadPosRankSum=2.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,21:30:99:767,0,1216
9	139958296	.	T	C	480.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.465;DP=43;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,16:43:99:509,0,968
9	139964447	.	G	C	531.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.063;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=31.28;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:99:560,0,143
9	139964450	.	C	T	531.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.004;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=33.60;ReadPosRankSum=-1.187	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:99:560,0,143
9	139973186	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	139973236	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
9	139973820	.	C	T	388.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=2.781;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=16.20;ReadPosRankSum=-2.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:417,0,400
9	139975108	.	T	C	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
9	139977195	.	T	C	1015.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1044,78,0
9	139981627	.	A	G	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:854,60,0
9	139996552	.	C	T	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:206,0,375
9	139996714	.	T	C	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:49:49,0,419
9	139997025	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.009;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:119,0,538
9	139997209	.	C	A	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:306,0,305
9	139997532	.	C	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:47:47,0,354
9	139998042	.	C	T	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=1.356;DP=17;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.332;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:168,0,372
9	140000115	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,302
9	140002501	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,78
9	140002989	.	T	C	655.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-0.921;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=22.61;ReadPosRankSum=1.011	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,18:29:99:684,0,377
9	140003427	.	A	G	590.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.594;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=23.63;ReadPosRankSum=0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,16:25:99:619,0,298
9	140003640	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
9	140006202	.	G	A	1156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=-0.710;DP=65;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,33:59:99:1185,0,854
9	140006425	.	C	G	1047.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.176;DP=45;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,28:45:99:1076,0,596
9	140008750	.	G	C	669.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.902;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.798	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,19:34:99:698,0,527
9	140008899	.	G	A	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
9	140012643	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:115,0,30
9	140015297	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:81:81,0,90
9	140015303	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,90
9	140015304	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,90
9	140015329	.	T	C	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:76,0,27
9	140023694	.	G	T	204.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:233,0,24
9	140023766	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:99,0,67
9	140024083	.	C	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:113,0,66
9	140060142	.	C	G	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:217,0,213
9	140064219	.	T	C	449.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.436;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.062	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:478,0,504
9	140070612	.	T	C	242.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:271,21,0
9	140070638	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
9	140078213	.	T	G	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.743;DP=28;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=0.40;ReadPosRankSum=-1.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,3:28:39:39,0,2896
9	140078214	.	C	A	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.609;DP=29;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=0.38;ReadPosRankSum=-1.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,3:29:39:39,0,2896
9	140078216	.	T	A	11.12	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.367;DP=31;FS=5.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=0.36;ReadPosRankSum=-1.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,3:31:39:39,0,2896
9	140098870	.	T	C	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.191;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=1.67;ReadPosRankSum=0.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:65:65,0,734
9	140101685	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	140101687	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
9	140101944	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	140102104	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	140106270	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
9	140106538	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
9	140106868	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:160,0,31
9	140107714	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
9	140107921	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
9	140110555	.	G	A	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.975;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:336,0,405
9	140112697	.	A	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=17.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:173,0,366
9	140113179	.	G	T	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:581,45,0
9	140118286	.	A	C	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
9	140120396	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
9	140122308	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
9	140129855	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	140130606	.	A	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
9	140163033	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	140164376	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	140164689	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	140167022	.	G	A	1526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1555,111,0
9	140167877	.	T	G	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
9	140168079	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	140195149	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,135
9	140195868	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,221
9	140196400	.	C	T	101.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:129,12,0
9	140204360	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
9	140205269	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:105,0,95
9	140206182	.	G	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
9	140211547	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	140213651	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
9	140214342	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
9	140216881	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,155
9	140216886	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,155
9	140238885	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
9	140243968	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:111,0,103
9	140247143	.	T	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
9	140250818	.	C	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
9	140252861	.	T	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
9	140262426	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
9	140268046	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=8;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:99,0,111
9	140281752	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	140287394	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,145
9	140318426	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	140319497	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
9	140320180	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
9	140320792	.	G	C	212.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.30;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:11:240,0,11
9	140321666	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
9	140321703	.	A	G	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:160,0,31
9	140322404	.	C	G	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:268,0,138
9	140322814	.	A	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,221
9	140323906	.	G	C	47.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:76,0,22
9	140325898	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,76
9	140328077	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,102
9	140353783	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
9	140357972	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
9	140361847	.	G	A	248.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.10;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:277,0,20
9	140372857	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:75,0,34
9	140373575	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
9	140374861	.	A	G	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
9	140380376	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	140385930	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
9	140504928	.	A	G	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.942;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:85:85,0,502
9	140505944	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,297
9	140510565	.	A	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:161,0,67
9	140510566	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,235
9	140510708	.	A	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:96:232,0,96
9	140510721	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,243
9	140515277	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
9	140629958	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
9	140682607	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
9	140696524	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
9	140709880	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
9	140718737	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
9	140721642	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
9	140721850	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	177393	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	182100	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	291533	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	292720	.	C	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.152;DP=26;FS=17.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:189,0,785
10	294953	.	A	G	884.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:913,63,0
10	323283	.	A	G	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:60:301,0,60
10	365540	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	429977	.	G	A	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
10	445061	.	C	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
10	459940	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	463246	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	856325	.	C	G	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
10	858394	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.041;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:112,0,543
10	1034216	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	1046712	.	G	A	586.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.206;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=27.94;ReadPosRankSum=-0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,16:21:99:615,0,155
10	1055866	.	A	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	1056310	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	1057407	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	1061354	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	1063441	.	T	G	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:54:792,54,0
10	1063447	.	A	G	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:54:792,54,0
10	1064940	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	1086116	.	C	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.995;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:126,0,727
10	1089616	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	1090366	.	C	T	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:200,0,26
10	1090684	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	1091195	.	G	A	92.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:121,0,23
10	1091308	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	1092138	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
10	1092195	.	G	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
10	1093992	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
10	1097688	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	1142208	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	1175939	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	2422321	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	2422322	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	3143643	.	A	C	946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:975,72,0
10	3146180	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	3150973	.	C	T	1275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-1.499;DP=39;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=32.71;ReadPosRankSum=0.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,33:39:99:1304,0,138
10	3155620	.	A	G	1939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1968,141,0
10	3157094	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	3157097	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	3158979	.	C	A	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.984;DP=40;FS=5.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,10:40:99:311,0,1184
10	3160847	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
10	3160913	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	3160917	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	3162486	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	3162563	.	G	T	94.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:122,6,0
10	3163283	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
10	3163452	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	3163509	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:128,9,0
10	3163512	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:128,9,0
10	3163521	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	3164274	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	3164304	.	C	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
10	3164543	.	G	C	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
10	3164554	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
10	3164719	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
10	3164892	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
10	3164951	.	A	C	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
10	3165705	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	3165710	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	3165849	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:33:123,0,33
10	3165854	.	C	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:33:123,0,33
10	3165858	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:33:123,0,33
10	3165870	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=32.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:158,0,30
10	3165972	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
10	3166088	.	G	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
10	3167465	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	3167983	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
10	3168106	.	G	A	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:81,0,27
10	3168729	.	A	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
10	3169024	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	3169045	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
10	3169139	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
10	3169750	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	3169771	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	3170194	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	3170256	.	A	G	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
10	3170364	.	G	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:211,15,0
10	3170371	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:211,15,0
10	3170372	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:211,15,0
10	3170743	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	3170919	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	3172121	.	C	T	61.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.759;DP=39;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=1.58;ReadPosRankSum=-0.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,6:39:90:90,0,1239
10	3178905	.	T	A	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:27:390,27,0
10	3178908	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,262
10	3180227	.	T	C	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.389;DP=40;FS=6.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,8:40:99:233,0,1254
10	3180298	.	C	T	1632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1661,114,0
10	3189380	.	C	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.500;DP=38;FS=11.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.781	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,6:38:99:147,0,1273
10	3200292	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.576;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,8:41:99:224,0,1306
10	3202065	.	T	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-1.191;DP=38;FS=5.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,11:38:99:361,0,1051
10	3206027	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.361;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:94:94,0,949
10	3207705	.	G	C	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.584;DP=38;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.137	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,9:38:99:270,0,1139
10	3208512	.	G	A	43.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.285;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=1.25;ReadPosRankSum=1.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,4:35:72:72,0,1215
10	3208557	.	A	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=1.946;DP=30;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.040	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,8:30:99:231,0,840
10	3819138	.	G	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=21.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:74:74,0,607
10	3819140	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=0.636;DP=14;FS=18.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=3.27;ReadPosRankSum=-1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:74:74,0,607
10	3819714	.	C	T	561.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.705;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:590,0,212
10	3820787	.	T	C	602.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.236;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=30.14;ReadPosRankSum=1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,16:20:99:631,0,112
10	3821327	.	A	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:114,0,633
10	3821561	.	G	A	751.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-1.909;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=27.84;ReadPosRankSum=1.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,20:27:99:780,0,181
10	5435918	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
10	5495218	.	T	C	1376.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1405,96,0
10	5496697	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
10	5498390	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
10	5499173	.	A	G	881.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-1.467;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=32.66;ReadPosRankSum=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,23:27:92:910,0,92
10	5499705	.	A	T	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
10	5500159	.	C	G	1101.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1130,78,0
10	5505523	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	5522332	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
10	5527203	.	A	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
10	5527836	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
10	5528593	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	5528594	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	5528964	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:32:39,0,32
10	5529207	.	G	T	130.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:159,0,25
10	5529432	.	G	A	50.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:20:79,0,20
10	5530395	.	G	A	175.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:204,0,17
10	5530775	.	G	A	161.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:20:190,0,20
10	5531392	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
10	5532352	.	G	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
10	5535554	.	A	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
10	5541181	.	T	C	616.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-0.836;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,17:39:99:645,0,1408
10	5541183	.	C	T	616.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.637;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,17:39:99:645,0,1408
10	5541230	.	T	C	675.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.791;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,19:41:99:704,0,804
10	5552573	.	A	C	135.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:18:164,0,18
10	5554422	.	T	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
10	5555412	.	T	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,114
10	5555701	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	5557041	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	5558349	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	5563929	.	G	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:156,0,67
10	5681038	.	C	T	403.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.457;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:432,0,129
10	5681348	.	T	C	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
10	5681390	.	A	G	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
10	5682070	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:96:96,0,306
10	5682641	.	C	T	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
10	5726837	.	G	A	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
10	5781628	.	T	G	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
10	5781969	.	A	T	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
10	5788608	.	G	C	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
10	5790420	.	T	C	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:820,60,0
10	5804531	.	G	A	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
10	5806873	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	5905231	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	5908685	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
10	5916140	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	5916143	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	5916926	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	5919947	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
10	5920121	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
10	5925971	.	C	A	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
10	5936425	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	5943728	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	5944233	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	5951605	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	5966192	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
10	6131627	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	6135386	.	A	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	6155870	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	6174578	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	6275223	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
10	6276574	.	T	C	69.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:76:110,0,76
10	7205266	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	7842938	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	7843542	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	7844253	.	G	A	336.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.627;DP=53;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,12:53:99:365,0,1651
10	7846152	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	7846569	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
10	7849688	.	T	C	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-1.736;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=0.95;ReadPosRankSum=1.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:54:54,0,953
10	8006798	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
10	8099177	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	8112143	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	8115362	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	8116503	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,289
10	8116598	.	G	A	653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:682,48,0
10	8599622	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	8599626	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	8599629	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	9015626	.	C	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
10	11504313	.	C	T	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
10	11531579	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
10	11789382	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
10	11789405	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
10	11797436	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
10	11797467	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	11904988	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	11913348	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	12056156	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,236
10	12111090	.	T	C	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:608,45,0
10	12131081	.	T	G	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:996,72,0
10	12134076	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	12143105	.	C	G	1653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1682,117,0
10	12148259	.	A	C	1100.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1129,78,0
10	12148286	.	T	C	1288.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1317,93,0
10	12149939	.	C	T	1014.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1043,72,0
10	12155667	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
10	12163741	.	A	T	827.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:856,60,0
10	12164385	.	A	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
10	12165801	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	12171740	.	G	A	215.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:244,21,0
10	12193644	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	12196316	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	12212186	.	T	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
10	12214260	.	C	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
10	12292344	.	A	G	1359.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1388,99,0
10	12292454	.	A	G	778.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=-1.239;DP=21;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=28.18;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:27:807,27,0
10	12867598	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	12872560	.	C	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
10	12877007	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	12940455	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
10	13142153	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	13142251	.	G	A	215.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:244,0,21
10	13151224	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:151,0,28
10	13166076	.	A	G	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
10	13239651	.	A	G	203.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:232,0,25
10	13251973	.	T	G	163.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
10	13252309	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
10	13337588	.	G	A	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
10	13341995	.	G	A	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:141,0,109
10	13375906	.	T	C	1643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1672,117,0
10	13382754	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	13387550	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	13388644	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	13675820	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	13677997	.	C	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:108,0,76
10	13678857	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	13679708	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
10	13680493	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	13680771	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	13681715	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	13687171	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
10	13688571	.	T	C	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:96:269,0,96
10	13694760	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
10	13697581	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	13708867	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	13735947	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,179
10	14561262	.	G	A	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:89:89,0,315
10	14561500	.	G	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
10	14561957	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.106;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:74:74,0,646
10	14563097	.	A	G	647.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:676,48,0
10	14569811	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
10	14889528	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
10	14909255	.	T	C	805.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=1.041;DP=30;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,21:30:99:834,0,300
10	14947979	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,79
10	14954532	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	15820830	.	C	T	255.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:284,0,22
10	16479007	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	16547058	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	16553718	.	G	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
10	16554254	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
10	16554373	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	16554409	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	16554723	.	A	T	182.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:211,14,0
10	16555041	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,108
10	16557560	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
10	16557868	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	16796919	.	C	A	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.980;DP=28;FS=8.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:99:129,0,903
10	16859335	.	C	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-1.198;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.282	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:232,0,582
10	17188514	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	17194314	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	17271400	.	G	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.784;DP=21;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:137,0,559
10	17360819	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
10	17362094	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	17449065	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:76,0,29
10	17450538	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
10	17453206	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:37:39,0,37
10	17453208	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:37:39,0,37
10	17453312	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	17460280	.	A	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
10	17659131	.	C	A	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:353,27,0
10	17659149	.	C	T	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
10	17684398	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	17756596	.	T	C	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=31.20;ReadPosRankSum=-0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:42:465,0,42
10	18802307	.	C	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
10	18940157	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	18964179	.	C	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:142,0,269
10	18964840	.	A	G	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:235,0,106
10	18966867	.	T	C	233.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:9:261,0,9
10	18966907	.	A	G	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=29.58;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:61:324,0,61
10	18967618	.	A	G	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:57:166,0,57
10	18967941	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
10	20506418	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
10	20569460	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	21073521	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,355
10	21074455	.	T	C	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=1.032;DP=19;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.362	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:288,0,377
10	21109504	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	21783634	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	21827796	.	G	A	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:575,39,0
10	21970077	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	22170854	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	22170855	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	22170858	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	22605398	.	C	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.111;DP=30;FS=9.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,5:30:99:109,0,929
10	22619439	.	G	A	417.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:446,33,0
10	22824416	.	G	A	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
10	22826093	.	A	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,188
10	22839628	.	T	C	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:54:368,0,54
10	23003226	.	A	G	151.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:180,0,22
10	23408278	.	C	T	1064.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=1.576;DP=34;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=31.32;ReadPosRankSum=-1.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,27:34:99:1093,0,211
10	23427670	.	G	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
10	23427683	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	24669877	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	24813454	.	G	A	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=21.06;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:302,0,132
10	24828744	.	T	G	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:163,0,31
10	24833137	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,296
10	25312689	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:121,0,32
10	25313818	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:108,0,34
10	25314538	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	25314637	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	26938398	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	26987306	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	27225000	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	27227681	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	27227955	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	27229571	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	27235571	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	27241780	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	27249299	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	27251225	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	27253167	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	27255176	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	27260630	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	27317840	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
10	27400861	.	G	A	1074.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1103,78,0
10	27417670	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	27444303	.	G	A	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
10	27444328	.	C	A	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
10	27444329	.	T	C	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
10	27444344	.	T	G	667.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:696,51,0
10	27456924	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	27459670	.	C	T	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
10	27469678	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	27474078	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	27475444	.	T	C	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:658,45,0
10	27475494	.	T	C	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:648,45,0
10	27475693	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
10	27477821	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	27484746	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
10	27508758	.	T	C	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:900,63,0
10	27535017	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	27638665	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	27827305	.	C	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=1.559;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.748	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:102,0,648
10	27827541	.	A	G	1343.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1372,96,0
10	27830433	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	28378758	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
10	28810747	.	A	C	353.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:7:381,0,7
10	28811187	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
10	28811191	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
10	28811200	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	28812059	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
10	28812066	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	28812473	.	C	T	685.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-1.500;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=28.57;ReadPosRankSum=2.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:714,0,177
10	28813672	.	G	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
10	28814292	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	28814615	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
10	28814618	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
10	28814655	.	T	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:59:160,0,59
10	28816329	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	28818536	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	28818701	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
10	28821089	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
10	28821444	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:89:104,0,89
10	28822373	.	A	C	1114.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1143,81,0
10	28909790	.	C	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,397
10	29431709	.	G	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
10	29698541	.	G	A	447.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.592;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:72:476,0,72
10	29711520	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
10	29711903	.	T	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
10	29713491	.	T	A	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
10	29713931	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	29714509	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
10	29715079	.	T	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
10	29715461	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
10	29720673	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	29720880	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	29747417	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
10	29754609	.	T	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:60:198,0,60
10	29757036	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	29757491	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	29783885	.	A	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:429,0,158
10	29839864	.	A	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
10	29840038	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,243
10	29973512	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
10	30626802	.	G	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
10	30628014	.	T	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
10	30629226	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.047;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:117,0,624
10	30728101	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:117,0,32
10	30740612	.	T	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
10	30749895	.	G	A	258.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:287,0,22
10	30998288	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	31006083	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	32094890	.	C	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,270
10	32298840	.	C	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:304,0,254
10	32345138	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.260;DP=29;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:107,0,856
10	33123774	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	33143396	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	33209266	.	G	T	1032.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.933;DP=38;FS=1.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,27:38:99:1061,0,355
10	33211227	.	T	G	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.221;DP=47;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,10:47:99:286,0,1424
10	33217110	.	G	A	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.377;DP=55;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.234	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,12:55:99:368,0,1732
10	33466519	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	33466843	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
10	33467108	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
10	33467312	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	33467321	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	33467650	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
10	33468014	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
10	33469181	.	A	G	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
10	33476141	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	33484829	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
10	33510663	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
10	33552696	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	34399069	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
10	34688287	.	G	A	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
10	34690769	.	G	A	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-1.369;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,458
10	35104026	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,191
10	35104190	.	G	T	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
10	35346814	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	35772387	.	C	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.238;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.238	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,5:25:99:143,0,809
10	35928224	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	37171383	.	T	C	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:76,0,27
10	37172539	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	37203202	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	37488689	.	G	C	653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:682,48,0
10	37505141	.	G	A	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.475;DP=20;FS=8.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:249,0,520
10	37505159	.	G	A	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.828;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=24.32;ReadPosRankSum=-0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:539,0,252
10	37505192	.	C	T	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-1.084;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:163,0,500
10	37511225	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
10	37525622	.	G	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.623;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:126,0,460
10	37527168	.	A	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:183,0,63
10	37570336	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
10	37581158	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	37582244	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	37584744	.	C	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
10	37584922	.	C	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:116,0,69
10	37588324	.	A	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
10	37588335	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
10	37589804	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	37589949	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:76,0,74
10	37590684	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	37592001	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	37593918	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:100,0,34
10	37595512	.	T	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
10	37595669	.	G	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:109,0,70
10	37595790	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:115,0,72
10	37597047	.	C	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:59,0,70
10	37597272	.	A	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,112
10	37598245	.	T	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
10	37635812	.	A	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,240
10	37635822	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,291
10	37639200	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	37642900	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
10	37644262	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
10	37659833	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	37659839	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
10	37722307	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	37730654	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	38110813	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	38118901	.	C	T	80.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:109,0,26
10	38146218	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:122,0,33
10	38343859	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:106,0,70
10	38345465	.	G	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,281
10	38345877	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,78
10	38346156	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:131,0,232
10	38346482	.	G	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,160
10	38347850	.	G	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,274
10	38383332	.	A	G	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
10	38383385	.	G	T	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
10	38407519	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
10	38667316	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	38739894	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	38740546	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	42398554	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	42398555	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	43012693	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
10	43013387	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	43047958	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	43087649	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	43087763	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	43089965	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	43104177	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	43595968	.	A	G	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:262,0,107
10	43597088	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
10	43601749	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	43603878	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
10	43604390	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
10	43606687	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:99,0,262
10	43613843	.	G	T	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
10	43622217	.	T	C	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
10	43622368	.	T	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
10	43624317	.	A	T	59.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:87,9,0
10	43624833	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,79
10	43625223	.	G	A	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
10	43679795	.	T	C	94.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:123,0,20
10	43679800	.	T	G	94.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:20:123,0,20
10	43881094	.	T	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,79
10	43881296	.	C	T	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.467;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:219,0,219
10	43883342	.	T	A	1487.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-1.458;DP=52;FS=4.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.500	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,39:52:99:1516,0,380
10	43883645	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	43894695	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
10	43895101	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	43896207	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
10	43903239	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
10	43903732	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
10	44103616	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
10	44112245	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:197,0,28
10	44141109	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	44868083	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
10	44868257	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	44873849	.	A	G	175.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:204,0,27
10	45499799	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
10	45952745	.	T	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	45953767	.	A	G	126.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:155,0,23
10	45958856	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	45958881	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	46222724	.	C	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:153,0,68
10	46739064	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	46951709	.	G	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
10	46951933	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	46952088	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	46952127	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	46965018	.	C	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:116,0,30
10	46967059	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	46967672	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
10	46968403	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	46968762	.	C	G	172.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:15:201,0,15
10	46968950	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
10	46970039	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	46970050	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:124,9,0
10	46970055	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:124,9,0
10	46970792	.	G	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
10	46971008	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	46971188	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	46971738	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	46971844	.	C	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	46972165	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:117,0,33
10	49644416	.	T	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
10	49654195	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	50645246	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	50652373	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	50662422	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
10	50681033	.	G	A	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
10	50724016	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
10	50732376	.	G	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,148
10	50740876	.	G	C	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
10	50942763	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
10	50943186	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	50960209	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	51633027	.	T	C	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
10	51726017	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	52094647	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	52103707	.	A	G	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
10	54076503	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,275
10	54732242	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	58118630	.	T	C	1477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1506,105,0
10	58119976	.	G	A	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
10	59952630	.	A	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
10	59954081	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	60047794	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	60145342	.	G	C	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.386;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:312,0,654
10	60155120	.	G	T	1047.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1076,78,0
10	60156166	.	A	G	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
10	60156584	.	G	A	284.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:313,21,0
10	60157339	.	C	T	93.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:121,12,0
10	60158385	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	60158446	.	T	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
10	60159859	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:155,0,69
10	60160455	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	60161172	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	60953902	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	60953903	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	61411547	.	T	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:56,0,73
10	61414011	.	G	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
10	61469538	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
10	61548986	.	G	A	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.227;DP=31;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.145	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:383,0,748
10	61549818	.	A	G	834.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:863,60,0
10	61550057	.	C	T	615.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.735;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=25.21;ReadPosRankSum=1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:12:643,12,0
10	61551428	.	T	C	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
10	61552692	.	G	T	1078.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1107,84,0
10	61552774	.	C	T	723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:64:752,64,0
10	61789272	.	G	A	1424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1453,102,0
10	61793384	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	61793520	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	61801112	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	61801121	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	61801142	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	61805819	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	61820489	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,183
10	61820514	.	A	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
10	61868716	.	C	A	617.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-1.331;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=22.88;ReadPosRankSum=1.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:646,0,323
10	61900356	.	A	C	187.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:216,21,0
10	62545777	.	G	A	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,109
10	62546314	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
10	62547124	.	G	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
10	62547569	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	62550719	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	62553763	.	A	G	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:87:393,0,87
10	62557044	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	62560418	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	63852965	.	C	G	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
10	63954188	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	63955526	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:119,0,71
10	63956100	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
10	63956232	.	T	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:110,0,76
10	63956403	.	G	A	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
10	63956698	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	63968460	.	C	A	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
10	63979105	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	63998526	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	63998755	.	T	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
10	64564892	.	G	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:137,0,280
10	64565011	.	G	A	568.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.702;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:597,0,213
10	64566357	.	C	G	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-1.555;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:301,0,375
10	64566572	.	T	C	248.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.10;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:277,0,18
10	64567364	.	C	T	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.479;DP=13;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.98;ReadPosRankSum=1.294	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:91:340,0,91
10	64567938	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	64914467	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:111,0,33
10	64932777	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	64932779	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	64945364	.	G	A	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:229,0,109
10	64966897	.	G	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:144,0,107
10	64967445	.	A	T	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
10	65281135	.	T	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
10	65281137	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
10	65382316	.	T	G	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.968;DP=14;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:219,0,302
10	69609880	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	69675050	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
10	69677060	.	C	T	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
10	69719074	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	69723729	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	69792599	.	G	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=1.734;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:44:44,0,477
10	70044031	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,76
10	70051928	.	A	G	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
10	70091923	.	T	C	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.277;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,8:37:99:218,0,1135
10	70093037	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	70095443	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
10	70097281	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
10	70098646	.	T	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	70102936	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	70103597	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	70104799	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	70105560	.	G	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
10	70174707	.	T	A	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
10	70241329	.	T	C	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:84:84,0,227
10	70242628	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
10	70278409	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,110
10	70280187	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	70281110	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
10	70281127	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:113,0,73
10	70281191	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	70281203	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,103
10	70281673	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:178,12,0
10	70281683	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
10	70281773	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,193
10	70281868	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
10	70281894	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	70282245	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,116
10	70282696	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	70282920	.	T	C	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
10	70283474	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:76,0,62
10	70284133	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,79
10	70392470	.	G	A	135.25	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:11:172,11,0
10	70481136	.	G	A	380.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:409,30,0
10	70502288	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.711;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:144,0,747
10	70518072	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,191
10	70518080	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:155,0,29
10	70518898	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	70518989	.	A	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:74:125,0,74
10	70618859	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	70696713	.	C	T	462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:491,33,0
10	70744679	.	A	G	575.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-2.369;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.99;ReadPosRankSum=2.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,15:18:70:604,0,70
10	70776587	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:95:267,0,95
10	70931474	.	C	T	842.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=1.045;DP=25;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=33.71;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,22:25:54:871,0,54
10	70931841	.	A	G	409.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=34.11;ReadPosRankSum=-0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:9:437,0,9
10	70954661	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	71142420	.	G	A	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.686;DP=62;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:50,12:62:99:323,0,1944
10	71145486	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	71145894	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	71149319	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	71154851	.	C	G	877.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=1.158;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,24:54:99:906,0,1154
10	71245617	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
10	71247293	.	C	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:152,0,30
10	71248824	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	71250698	.	T	C	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
10	71254815	.	C	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,117
10	71392557	.	C	T	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
10	71392692	.	T	C	745.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:774,54,0
10	71393025	.	A	G	1009.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1038,72,0
10	71855597	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,77
10	71856127	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
10	71857773	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	71897998	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:75,0,35
10	71898355	.	C	T	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
10	71900246	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	71903179	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:82,6,0
10	71903186	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	71903995	.	T	C	470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:499,36,0
10	71904306	.	G	A	419.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:448,33,0
10	71905569	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:72:72,0,361
10	71905695	.	A	G	371.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=21.87;ReadPosRankSum=-0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:400,0,156
10	71906150	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-1.164;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:147,0,367
10	71910630	.	G	A	1019.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=2.288;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=33.99;ReadPosRankSum=-0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,26:30:88:1048,0,88
10	71910663	.	C	T	767.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-0.400;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=34.90;ReadPosRankSum=2.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,20:22:0:793,0,0
10	71910888	.	C	T	701.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:730,51,0
10	71911014	.	C	T	300.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.43;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:16:329,0,16
10	71924167	.	C	T	166.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:195,0,27
10	71971032	.	A	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
10	71971554	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	71993094	.	T	G	638.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.117;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,24:36:99:667,0,266
10	72059091	.	G	A	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
10	72059506	.	G	C	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
10	72060035	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	72061079	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
10	72179746	.	C	T	997.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1026,72,0
10	72183697	.	T	G	887.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:916,63,0
10	72186319	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	72186524	.	T	C	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:531,36,0
10	72186794	.	G	C	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
10	72187983	.	G	A	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
10	72532037	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	72536697	.	C	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
10	72536779	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	72540248	.	T	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
10	72540948	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
10	72541064	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	72619205	.	C	T	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:820,57,0
10	72643671	.	C	T	1607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1636,117,0
10	72648336	.	C	T	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=28.29;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:45:396,0,45
10	73059827	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	73060277	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	73062149	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
10	73062488	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	73111408	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
10	73115941	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	73115942	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	73121913	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	73988264	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	73994762	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	73994765	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:126,9,0
10	73995138	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,103
10	74035041	.	T	A	948.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.732;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=29.65;ReadPosRankSum=-1.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,25:32:99:977,0,211
10	74035297	.	C	T	568.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.650;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,15:19:99:597,0,118
10	74094172	.	C	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,233
10	74094665	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
10	74127853	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.479;DP=18;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:155,0,1178
10	74127863	.	C	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.224;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.224	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:155,0,1178
10	74284719	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	74284729	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	74292273	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	74522959	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	74999821	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
10	75008815	.	T	C	31.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.754;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.151	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:60:60,0,1290
10	75008817	.	T	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=1.278;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:210,0,538
10	75008955	.	T	C	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:251,0,296
10	75009842	.	T	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:87:87,0,431
10	75013792	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:117,0,75
10	75135446	.	C	T	638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:667,48,0
10	75542586	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	75549486	.	C	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.286	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:173,0,346
10	75561916	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
10	75632760	.	C	T	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
10	75796132	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	75796133	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	75796137	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	75863750	.	C	T	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
10	75864372	.	G	C	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
10	75865065	.	G	A	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
10	75869065	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	75869938	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	75873639	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	75873892	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
10	75879511	.	T	A	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
10	75880636	.	C	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
10	75880653	.	C	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
10	75880754	.	C	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
10	75881347	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	75881676	.	G	A	786.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:815,57,0
10	75936611	.	C	T	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:512,42,0
10	76437114	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
10	76463440	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	76468851	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
10	76994243	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:114,0,97
10	78645453	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	79616605	.	T	C	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:586,42,0
10	79686353	.	A	C	14.91	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:43:43,0,92
10	79793688	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	80921864	.	A	G	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
10	81003146	.	A	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
10	81067480	.	C	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
10	81067965	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
10	81069268	.	G	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
10	81069413	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	81145266	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
10	81145642	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	81145701	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	81574438	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
10	81839472	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
10	81841692	.	G	T	800.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:829,57,0
10	81842321	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	81852059	.	G	A	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:535,36,0
10	81908573	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	81913561	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	81915136	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	81915185	.	C	A	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
10	81926339	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	81941007	.	C	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
10	82170034	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	82179747	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	82269779	.	C	T	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
10	82281978	.	T	C	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
10	82288283	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	85900047	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	86048061	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	86049343	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	86178811	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	86274302	.	C	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
10	86274654	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
10	86274732	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	86276233	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
10	86276596	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	88195650	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
10	88203068	.	T	C	554.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:583,42,0
10	88277457	.	C	T	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
10	88281344	.	C	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
10	88281346	.	A	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
10	88441223	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	88725309	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	88930249	.	A	T	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
10	88949406	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	88966937	.	T	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:76,0,68
10	89086421	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:159,0,28
10	89623901	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	89894332	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	90451614	.	T	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
10	90588154	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	90588161	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	90673024	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	90973492	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
10	91007339	.	C	T	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:661,48,0
10	91343565	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	91394107	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	91404448	.	C	G	332.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:361,27,0
10	91470834	.	A	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	91482767	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	91497631	.	T	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
10	91498127	.	T	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
10	91498254	.	A	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
10	91498318	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	91503660	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
10	91534524	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
10	91534527	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	91597426	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
10	91597627	.	C	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
10	91597636	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:213,15,0
10	91597919	.	T	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
10	91598174	.	G	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
10	91599896	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	92631778	.	G	A	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:721,54,0
10	93170250	.	C	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
10	93315155	.	C	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
10	93315271	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	93667635	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	93789267	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
10	93841227	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	94050988	.	C	G	999.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1028,72,0
10	94051175	.	C	T	804.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:833,63,0
10	94112156	.	G	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
10	94211106	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	94695617	.	C	T	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
10	94818382	.	A	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
10	94819053	.	C	T	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
10	95083039	.	C	T	720.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:749,51,0
10	95096861	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	95143896	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	95148835	.	T	C	957.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:986,69,0
10	95163809	.	G	T	700.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:729,51,0
10	95171198	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	95241999	.	A	C	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
10	95262981	.	A	G	888.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:917,63,0
10	95274890	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	95279506	.	A	T	1067.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1096,75,0
10	95663285	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	96163039	.	C	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
10	96294851	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	96313960	.	A	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
10	96343218	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
10	96343228	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	96362188	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	96362206	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	96362251	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	96364815	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	96365912	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
10	96367277	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	96370426	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	96370556	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:80,0,29
10	96371443	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
10	96371928	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	97365820	.	G	A	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
10	97366107	.	A	G	1189.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1218,84,0
10	97366364	.	C	T	1155.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1184,81,0
10	97392969	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	97423708	.	C	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
10	97630523	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
10	97631051	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
10	97631492	.	T	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	97632082	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
10	97632808	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	97633021	.	C	T	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:694,48,0
10	97635516	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	97660860	.	C	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
10	97666538	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	97803997	.	T	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
10	97911858	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	97920798	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	97923366	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	97923821	.	G	A	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
10	97924440	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	97925064	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	97961049	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	97990583	.	A	G	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
10	98279053	.	A	G	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
10	98280210	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	98289250	.	A	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	98561415	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	98561425	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	98561430	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	98592741	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	98723488	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	98808866	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	98984778	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
10	99092586	.	A	G	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:854,60,0
10	99094436	.	G	A	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:416,33,0
10	99129230	.	T	C	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
10	99139140	.	G	A	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
10	99160965	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
10	99205731	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
10	99220707	.	C	T	723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:752,57,0
10	99240758	.	G	C	680.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:709,48,0
10	99330813	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	99434274	.	G	A	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
10	99434760	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
10	99435006	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	99435487	.	A	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:348,27,0
10	99435629	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
10	99435730	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	99439541	.	G	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
10	99504630	.	G	T	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
10	99507869	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	99508142	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
10	99514789	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	99514818	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
10	99517355	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	99518384	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	99519097	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
10	99519305	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	99519424	.	G	A	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
10	99519753	.	G	A	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
10	99804291	.	A	G	217.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,6:6:9:245,0,9
10	99804294	.	G	A	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:49:128,0,49
10	99804309	.	G	A	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:49:128,0,49
10	99917316	.	T	C	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
10	99969475	.	A	C	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
10	99991408	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
10	100004360	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
10	100004441	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	100012739	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	100013438	.	C	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
10	100016274	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
10	100027770	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
10	100027812	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
10	100029202	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	100029875	.	G	A	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
10	100030768	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
10	100031394	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	100033482	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
10	100034296	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
10	100034840	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	100035666	.	C	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
10	100035827	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	100035831	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	100036209	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
10	100037507	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
10	100038734	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	100039417	.	G	A	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
10	100039430	.	A	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
10	100040099	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	100121078	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
10	100148091	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	100155898	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	100169387	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	100182171	.	C	T	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
10	100183774	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	100189138	.	A	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
10	100194602	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	100194829	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
10	101129296	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
10	101147720	.	C	T	229.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:258,21,0
10	101153590	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	101372043	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
10	101372411	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
10	101375581	.	A	G	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
10	101376357	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	101376898	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	101376976	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	101445591	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	101455367	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	101457155	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	101463181	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	101465708	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	101470118	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
10	101471695	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	101473218	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
10	101473663	.	T	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-0.238;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,530
10	101474499	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	101476905	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
10	101491236	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	101514161	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	101544447	.	A	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
10	101555717	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	101576960	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
10	101912064	.	T	C	672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:701,48,0
10	101977883	.	C	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
10	101992307	.	T	C	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.87;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:69:249,0,69
10	101992308	.	T	C	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.50;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:69:249,0,69
10	101992314	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,271
10	101992783	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,1:7:99:104,0,454
10	101992793	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:99:104,0,454
10	102010080	.	G	C	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-1.872;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:216,0,298
10	102107251	.	C	G	2259.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2288,157,0
10	102116311	.	A	C	2690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2719,189,0
10	102121579	.	A	G	1986.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2015,138,0
10	102121601	.	A	G	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.439;DP=43;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,4:43:46:46,0,1538
10	102121840	.	G	A	10.17	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-1.800;DP=59;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=0.17;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:54,5:59:47:47,0,2129
10	102145709	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	102246512	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
10	102295836	.	C	G	239.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:268,21,0
10	102756900	.	C	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
10	102759655	.	C	T	353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:382,33,0
10	102762256	.	C	T	1526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1555,114,0
10	102764239	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:120,0,28
10	102764511	.	G	A	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
10	102764785	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:57:57,0,194
10	102764900	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,189
10	102765331	.	C	G	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=-0.024;DP=27;FS=12.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:355,0,565
10	102767298	.	G	C	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.101;DP=39;FS=3.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,15:39:99:515,0,875
10	102797259	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	102824349	.	G	C	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:561,39,0
10	103124696	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
10	103285900	.	C	T	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
10	103338730	.	C	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:264,18,0
10	103338733	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
10	103339142	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
10	103340144	.	A	G	461.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:490,33,0
10	103340714	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	103342783	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	103343533	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	103344589	.	T	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
10	103458060	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	103545077	.	A	G	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:810,57,0
10	103555471	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	103571427	.	T	C	133.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:162,0,25
10	103605696	.	G	C	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:238,0,147
10	103874337	.	T	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
10	103892888	.	G	T	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
10	103905779	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	104136469	.	T	C	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:826,57,0
10	104159196	.	A	G	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
10	104160434	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
10	104162023	.	G	A	209.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.00;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:13:238,0,13
10	104184953	.	C	G	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:900,66,0
10	104188235	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	104215617	.	C	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
10	104236282	.	C	T	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
10	104239100	.	T	C	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:614,42,0
10	104239981	.	T	G	899.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:928,66,0
10	104389932	.	T	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
10	104391034	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
10	104391587	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
10	104392497	.	T	C	151.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:180,15,0
10	104404236	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,221
10	104499220	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	104573403	.	A	G	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
10	104574642	.	T	A	159.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:188,14,0
10	104660765	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	104660773	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	104938060	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:81,0,26
10	104953007	.	C	G	203.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:232,18,0
10	105636989	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	105639421	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	105640978	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
10	105657316	.	G	C	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
10	105677897	.	A	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
10	105758670	.	A	G	822.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=1.419;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:29:851,29,0
10	105763026	.	C	T	1243.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1272,87,0
10	105768271	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	105786298	.	C	T	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:529,36,0
10	105786543	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
10	106022789	.	C	A	1581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1610,111,0
10	106025258	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	106072527	.	T	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
10	107446740	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	107446747	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	111624660	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
10	112046150	.	T	C	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
10	112266822	.	G	A	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
10	112266823	.	C	T	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
10	112270675	.	A	C	205.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:234,18,0
10	112356331	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
10	112357518	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	112361870	.	A	G	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
10	112595719	.	G	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
10	112596282	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
10	112596840	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
10	112597289	.	G	A	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
10	112629911	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
10	112630024	.	C	T	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
10	112633918	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	112634542	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	112638028	.	T	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
10	112638858	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	112641053	.	A	G	1371.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1400,96,0
10	112643417	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
10	112663188	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	112670409	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	115490109	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
10	115542290	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	115881536	.	A	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
10	115883250	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
10	115889872	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	115910928	.	G	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
10	116191174	.	A	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
10	116191959	.	G	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
10	116192831	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	116193082	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
10	116193693	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
10	116193917	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	116194780	.	C	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
10	116195155	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	116195776	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	116307504	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
10	116335246	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
10	118031619	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
10	118035824	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
10	118453694	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	118646129	.	G	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
10	118651011	.	C	G	252.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:281,21,0
10	118651882	.	T	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
10	118656536	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
10	118656560	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:70,0,32
10	118657757	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
10	118660990	.	C	T	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
10	118665788	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	118667346	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	118668477	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	119038371	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
10	119042761	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
10	119768551	.	C	T	63.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
10	120069611	.	T	C	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
10	120792684	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	120792703	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	120828969	.	A	G	1292.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1321,96,0
10	120864412	.	T	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
10	120864858	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	120864868	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	120920588	.	T	C	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
10	120920948	.	A	C	92.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:120,12,0
10	120924874	.	G	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
10	120927793	.	G	C	1638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1667,114,0
10	120933324	.	G	A	1701.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1730,120,0
10	121587917	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
10	121588038	.	A	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
10	121588201	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	121589402	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	121647985	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
10	121679013	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
10	121700255	.	C	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
10	122622314	.	G	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,230
10	122635117	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	122649482	.	A	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
10	122663585	.	G	A	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
10	122665758	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	123501170	.	C	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
10	123502932	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
10	123596254	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
10	123673339	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	123716730	.	G	A	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
10	123845322	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	124183732	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
10	124650077	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	124745323	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	124752128	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	124768583	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
10	124806770	.	A	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
10	124815456	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	124815771	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	124817100	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	126107465	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	126172863	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
10	126310781	.	C	T	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
10	126311495	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	126517989	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
10	126673998	.	A	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
10	126674093	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
10	126674689	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	126676686	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
10	126676837	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	126702258	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
10	127482435	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	127484957	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	128591042	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
10	128591159	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	128592745	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	128926013	.	A	G	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
10	129145250	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	129204092	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
10	129204666	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	129249662	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	129899578	.	T	C	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
10	129899778	.	G	C	756.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:785,54,0
10	129900858	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
10	129901501	.	G	C	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
10	129901747	.	C	T	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
10	129901762	.	G	A	520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:549,39,0
10	129902281	.	G	A	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
10	129903016	.	T	C	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
10	129903465	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
10	129906980	.	C	T	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
10	129917560	.	T	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
10	131506283	.	C	T	699.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:728,51,0
10	131583538	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
10	131907568	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
10	131973554	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	131983221	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
10	131983329	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	133748993	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	133748996	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
10	133767445	.	A	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
10	133769482	.	G	C	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:41:522,41,0
10	133769568	.	G	A	564.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:593,42,0
10	133769848	.	C	G	291.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:320,24,0
10	133781449	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
10	133787021	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
10	133795391	.	A	C	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:550,42,0
10	133994198	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	133994201	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	133994208	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
10	134222228	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
10	134459388	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	135076523	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
10	135076596	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
10	135082810	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	135085426	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
10	135092590	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	135097434	.	A	G	862.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:891,60,0
10	135098672	.	G	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
10	135108945	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,107
10	135176091	.	G	A	780.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:809,57,0
10	135180430	.	A	G	2190.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2219,153,0
10	135184126	.	G	A	1526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1555,111,0
10	135186806	.	A	G	801.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:830,57,0
10	135204950	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
10	135233541	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
10	135234078	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	135234393	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
10	135271789	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
10	135273463	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
10	135276845	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
10	135277972	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
10	135280765	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
10	135306158	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
10	135343738	.	C	T	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
10	135351362	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
10	135455596	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	134929	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:74,0,69
11	201922	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	203235	.	A	G	853.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:882,60,0
11	203788	.	C	T	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
11	204062	.	T	C	907.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:936,66,0
11	204680	.	G	A	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:825,63,0
11	204986	.	C	A	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
11	205198	.	C	A	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
11	208213	.	C	T	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
11	211447	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	214544	.	C	T	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:997,69,0
11	215904	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
11	216056	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
11	233423	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
11	237087	.	A	G	1047.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1076,78,0
11	241523	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	243185	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	244167	.	C	T	913.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,18:18:99:942,0,1826
11	244171	.	T	C	913.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,17:17:99:942,0,1826
11	244197	.	T	C	668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:697,48,0
11	247906	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	291694	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	295445	.	A	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
11	384135	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	384140	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	392079	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	394897	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
11	395343	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	396406	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	396701	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
11	396915	.	C	T	1095.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1124,81,0
11	397331	.	G	C	1041.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1070,78,0
11	400109	.	A	G	1136.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1165,81,0
11	400633	.	C	A	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:648,48,0
11	403980	.	G	A	1165.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:89:1194,89,0
11	404317	.	C	T	1764.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1793,123,0
11	406043	.	G	A	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
11	406473	.	A	C	680.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:48:709,48,0
11	406483	.	T	C	680.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:48:709,48,0
11	419167	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	419906	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	420011	.	G	A	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
11	428385	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	428489	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
11	430339	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	433387	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	433867	.	G	A	259.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:26:288,26,0
11	489386	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	490003	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,180
11	493085	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	494942	.	G	C	1064.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1093,78,0
11	497784	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	497785	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	499059	.	C	T	1649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1678,117,0
11	499583	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	502013	.	G	A	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
11	502217	.	C	T	780.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:809,57,0
11	503993	.	G	A	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
11	504507	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	504636	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	505006	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	507670	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	509333	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	510980	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
11	511805	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	534242	.	A	G	1171.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1200,84,0
11	535098	.	T	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	556521	.	C	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
11	556857	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	557342	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	558884	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	559016	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	560448	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	562437	.	G	A	773.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:802,57,0
11	567189	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	575408	.	C	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
11	575800	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	587425	.	C	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
11	607175	.	G	A	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
11	609068	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
11	609353	.	G	A	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
11	610277	.	T	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
11	611919	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	612148	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	613022	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,83
11	613297	.	T	G	160.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
11	614318	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
11	614864	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	639374	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	699852	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	702097	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
11	703595	.	C	T	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
11	721931	.	C	T	790.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:819,60,0
11	722202	.	G	C	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:420,33,0
11	722709	.	C	T	985.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1014,69,0
11	726193	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	727310	.	T	C	771.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:800,60,0
11	762791	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	767750	.	C	T	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
11	768123	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
11	768383	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:78,0,64
11	769116	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:53:81,0,53
11	769117	.	T	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:53:81,0,53
11	769188	.	C	T	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
11	769489	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,105
11	772868	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	778153	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	778205	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,72
11	778290	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:116,0,71
11	782563	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	787679	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	792692	.	G	C	242.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:271,21,0
11	795366	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	797834	.	C	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	820127	.	T	G	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
11	820268	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	820754	.	T	C	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
11	824789	.	T	C	1007.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-1.476;DP=27;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=27.36;ReadPosRankSum=1.348	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,26:27:40:1036,40,0
11	825110	.	A	G	754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:783,54,0
11	827602	.	C	T	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
11	827713	.	A	T	349.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:378,30,0
11	827808	.	C	T	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
11	827993	.	T	C	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
11	828916	.	G	A	1424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1453,102,0
11	829539	.	A	G	1831.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1860,144,0
11	830487	.	C	T	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:873,63,0
11	830670	.	G	T	1236.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1265,93,0
11	830687	.	G	C	86.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-1.077;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,6:44:99:115,0,1424
11	831122	.	C	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
11	831809	.	T	G	1599.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1628,114,0
11	833898	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	834098	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:133,9,0
11	834108	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	834802	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	835065	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	835407	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	836971	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	837121	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	837582	.	G	A	2142.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2171,156,0
11	838419	.	A	G	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:45:659,45,0
11	838424	.	C	T	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:659,45,0
11	838542	.	C	T	2520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2549,178,0
11	838634	.	C	G	2246.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2275,163,0
11	838760	.	T	A	1374.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1403,99,0
11	839155	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	840023	.	A	T	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
11	840251	.	C	G	1543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1572,108,0
11	840319	.	C	T	1774.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1803,141,0
11	840363	.	C	T	2344.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2373,166,0
11	840477	.	A	G	2827.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2856,202,0
11	841983	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	842627	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	842630	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	842653	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	842682	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	842931	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	850170	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	862652	.	T	C	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
11	865447	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
11	866183	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	866665	.	C	A	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:430,33,0
11	869280	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
11	903070	.	G	C	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
11	985547	.	C	T	786.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:815,57,0
11	1003200	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	1004932	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	1008818	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	1010876	.	C	T	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
11	1014835	.	G	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	1015183	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	1015201	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	1015445	.	T	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	1016609	.	C	G	428.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=-1.710;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=9.12;ReadPosRankSum=2.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,14:47:99:457,0,1467
11	1016640	.	G	A	58.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-1.515;DP=42;FS=1.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=1.40;ReadPosRankSum=-1.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,5:42:87:87,0,1481
11	1016776	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,164
11	1016819	.	G	T	78.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.894;DP=43;FS=10.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,6:43:99:107,0,3147
11	1016834	.	G	A	1038.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-1.501;DP=63;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,28:63:99:1067,0,1829
11	1016869	.	A	T	2698.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-2.603;DP=52;FS=8.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=27.73;ReadPosRankSum=2.983	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,33:52:99:2727,0,568
11	1016894	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.192;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,13:32:99:392,0,3018
11	1016910	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.178;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,8:28:99:392,0,3018
11	1017029	.	T	G	506.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.432;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=10.78;ReadPosRankSum=2.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,17:47:99:535,0,2845
11	1017110	.	C	T	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.394;DP=46;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,18:46:99:617,0,3262
11	1017112	.	G	C	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=1.012;DP=48;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,18:48:99:617,0,3262
11	1017113	.	T	C	843.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=2.374;DP=49;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,23:49:99:872,0,810
11	1017173	.	G	A	430.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=1.436;DP=44;FS=2.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,15:44:99:459,0,2972
11	1017183	.	G	T	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.779;DP=38;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,10:38:99:303,0,1757
11	1017307	.	G	A	32.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-1.924;DP=42;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,7:42:61:61,0,3980
11	1017325	.	A	C	918.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.043;DP=56;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.863	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,26:56:99:947,0,1515
11	1017384	.	G	C	512.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.773;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,17:69:99:541,0,2563
11	1017498	.	C	G	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=3.433;DP=63;FS=7.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.834	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,10:63:99:235,0,2147
11	1017556	.	G	A	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.586;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=8.28;ReadPosRankSum=1.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,14:49:99:434,0,4751
11	1017566	.	G	A	74.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.564;DP=49;FS=3.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,6:49:99:103,0,2707
11	1017573	.	G	C	33.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.949;DP=47;FS=1.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.052	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,5:47:62:62,0,4846
11	1017575	.	C	T	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=1.046;DP=48;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,5:48:99:434,0,4751
11	1017773	.	G	A	834.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=-0.163;DP=61;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,14:61:99:863,0,3106
11	1017783	.	A	G	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=1.253;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,18:65:99:556,0,4672
11	1017789	.	A	C	48.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-1.998;DP=68;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=0.72;ReadPosRankSum=2.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,7:68:77:77,0,4059
11	1017845	.	C	G	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=-1.078;DP=52;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,13:52:99:395,0,1841
11	1017893	.	A	G	26.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=1.282;DP=55;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=0.49;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,6:55:55:55,0,3616
11	1017963	.	G	A	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-1.830;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=11.44;ReadPosRankSum=2.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,8:29:99:360,0,3280
11	1017968	.	T	A	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=-1.904;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:360,0,3280
11	1018001	.	A	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.559;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=3.44;ReadPosRankSum=2.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:97:97,0,1586
11	1018015	.	A	T	50.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=1.904;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=1.64;ReadPosRankSum=-1.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,3:31:79:79,0,1989
11	1018024	.	C	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=1.126;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:260,0,3569
11	1018025	.	C	A	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=1.308;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.430	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:260,0,3569
11	1018031	.	G	A	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=2.404;DP=26;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:260,0,3569
11	1018042	.	A	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.948;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=12.88;ReadPosRankSum=-1.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:99:260,0,3569
11	1018048	.	A	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.607	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:260,0,3569
11	1018116	.	T	G	1509.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;ClippingRankSum=1.291;DP=41;FS=19.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,21:41:99:1538,0,1892
11	1018138	.	T	C	1234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.463;DP=41;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:1263,0,3012
11	1018144	.	G	C	761.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.082;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,17:40:99:790,0,8264
11	1018169	.	C	G	761.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-1.411;DP=45;FS=6.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.596;QD=16.93;ReadPosRankSum=1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,16:45:99:790,0,8264
11	1018175	.	A	G	498.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=2.418;DP=44;FS=2.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,13:44:99:527,0,6900
11	1018182	.	G	T	498.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=3.198;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,11:44:99:527,0,6900
11	1018186	.	G	T	498.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=2.902;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=13.13;ReadPosRankSum=-2.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,6:38:99:527,0,6900
11	1018192	.	C	T	498.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=1.946;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=13.85;ReadPosRankSum=-2.347	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,3:36:99:527,0,6900
11	1018295	.	T	C	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.887;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:330,0,883
11	1018314	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=-2.015;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:106,0,1222
11	1018316	.	G	A	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.118;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:99:130,0,1223
11	1018374	.	T	A	1713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:99:1742,123,0
11	1018419	.	G	A	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-2.122;DP=20;FS=31.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=22.29;ReadPosRankSum=1.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:474,0,287
11	1018496	.	G	T	300.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=-3.871;DP=37;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,11:37:99:329,0,1009
11	1018523	.	A	G	682.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-2.186;DP=36;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=18.97;ReadPosRankSum=3.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:711,0,626
11	1019375	.	C	T	852.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:881,69,0
11	1026084	.	G	A	926.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:955,69,0
11	1030448	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	1213245	.	T	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	1213349	.	G	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:51:51,0,191
11	1213440	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:108,0,32
11	1213461	.	T	C,G	97.37	PASS	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,2,3:5:74:198,115,109,84,0,74
11	1213481	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:108,0,69
11	1220171	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	1221982	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	1221985	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	1250488	.	C	T	247.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:276,21,0
11	1252708	.	G	C	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
11	1253942	.	T	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
11	1255773	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	1268513	.	G	C	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
11	1269627	.	C	T	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:37:303,0,37
11	1271429	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
11	1272226	.	A	C	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
11	1272821	.	G	A	471.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:500,39,0
11	1272858	.	C	T	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:488,36,0
11	1501670	.	G	C	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
11	1502097	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	1857762	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
11	1998031	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	2002472	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	2006183	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	2011144	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	2016544	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,74
11	2016908	.	G	A	166.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:195,18,0
11	2190951	.	C	T	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
11	2209676	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	2229360	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	2229361	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	2233574	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	2245345	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	2400160	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	2404602	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	2424684	.	A	C	876.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:905,63,0
11	2663088	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	2696958	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	2924610	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	2929552	.	A	G	344.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:373,27,0
11	2931282	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	2931604	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:73,0,34
11	2931981	.	G	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	2933065	.	A	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	2936657	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	2942593	.	G	A	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
11	2950558	.	A	G	286.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:315,24,0
11	2966293	.	C	G	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:50:630,50,0
11	2969771	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	2973740	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	2973880	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	2974912	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	2996689	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	3010390	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
11	3028140	.	G	A	587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:616,42,0
11	3046298	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	3047448	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	3063961	.	T	G	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
11	3109426	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	3228068	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	3228078	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	3228082	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	3369057	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	3379996	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	3382069	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	3382215	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	3383962	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	3384550	.	A	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	3385876	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	3386412	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	3390006	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	3390173	.	A	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
11	3392098	.	C	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
11	3400334	.	A	G	257.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:286,21,0
11	3497089	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	3498270	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	3498875	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	3500483	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	3506168	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	3714489	.	C	T	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:546,42,0
11	3838953	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	3876433	.	A	G	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
11	3877074	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	4113395	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	4141132	.	C	A	999.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1028,72,0
11	4159457	.	A	G	1633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:99:1662,114,0
11	4159466	.	G	A	1633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:99:1662,114,0
11	4159764	.	A	T	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
11	4159929	.	C	A	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
11	4620713	.	T	C	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
11	4620861	.	C	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
11	4621485	.	C	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
11	5625847	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
11	5630412	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	5664974	.	T	C	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:654,45,0
11	5665225	.	A	G	630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:659,45,0
11	5692615	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	5693547	.	G	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
11	5700340	.	T	C	680.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:709,48,0
11	5701409	.	G	C	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
11	6237565	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:72,0,35
11	6238680	.	G	A	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=1.356;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=10.61;ReadPosRankSum=-1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:198,0,389
11	6243804	.	A	G	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
11	6412931	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:114,0,68
11	6415882	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.31;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:94:94,0,213
11	6452972	.	T	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,1:6:98:98,0,398
11	6452981	.	C	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,398
11	6498175	.	C	A	1095.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.518;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.320	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,30:56:99:1124,0,933
11	6510244	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
11	6513943	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,85
11	6513945	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,85
11	6549779	.	A	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
11	6549995	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:24:342,24,0
11	6550004	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
11	6550309	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	6555694	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	6556046	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	6564584	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	6564674	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	6579106	.	C	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:185,0,102
11	6585007	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=23.54;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:193,0,65
11	6585502	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
11	6587252	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:73,0,68
11	6588228	.	G	A	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:237,0,100
11	6593920	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	6595022	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	6617527	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	6618434	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	6622714	.	G	A	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
11	6628053	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:73,0,65
11	6628248	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:72,0,30
11	6628741	.	A	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:73,0,67
11	6629042	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:78,0,70
11	6629530	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	6630410	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,190
11	6631016	.	C	T	688.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.801;DP=51;FS=5.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,20:51:99:717,0,1153
11	6632450	.	C	T	691.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.499;DP=55;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=12.58;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,20:55:99:720,0,1316
11	6632857	.	A	T	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:226,0,168
11	6634149	.	C	T	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:275,0,145
11	6634189	.	G	A	306.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:335,0,184
11	6636900	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
11	6637518	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	6703892	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	7454937	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	7455552	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	7455553	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	7462765	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	7473121	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	7655334	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	7662732	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.447;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:181,0,242
11	7663887	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,119
11	7666653	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	7670440	.	A	G	911.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:940,69,0
11	7673015	.	G	A	607.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-0.604;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,17:32:99:636,0,565
11	7674461	.	C	T	270.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.966;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:299,0,773
11	7686493	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
11	7687715	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	8010282	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	8018946	.	C	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
11	8021226	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,146
11	8123499	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	8127495	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	8637191	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	8639200	.	T	C	49.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:14:78,0,14
11	8662516	.	T	C	89.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:116,2,0
11	8706628	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
11	8708527	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,122
11	8936464	.	T	C	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=1.919;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:332,0,382
11	8941079	.	G	A	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:326,0,326
11	8941197	.	T	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,114
11	8941215	.	A	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
11	8971998	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
11	8973299	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	8994655	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	9167399	.	T	C	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
11	9302261	.	A	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
11	9303121	.	A	G	758.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:787,54,0
11	9304120	.	T	C	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
11	9309405	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	9310169	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	9310584	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	9310585	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	9310672	.	T	C	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:163,0,31
11	9310812	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
11	9310982	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
11	9311128	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	9311172	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
11	9311843	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	9312836	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	9314585	.	C	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	9314727	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,191
11	9336071	.	A	G	602.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:631,48,0
11	9406349	.	T	C	1113.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1142,81,0
11	9537904	.	G	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:183,0,63
11	9595732	.	C	G	366.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:395,30,0
11	9599653	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:113,0,69
11	9599943	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	9601156	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:92,0,72
11	9749645	.	A	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.98;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,243
11	9754221	.	C	T	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-1.079;DP=28;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.983	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:322,0,694
11	9762274	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	9769562	.	C	G	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.437;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:447,0,525
11	9771457	.	C	T	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:343,0,375
11	9772972	.	T	C	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:220,0,347
11	9773568	.	T	C	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:261,0,220
11	9800450	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:159,0,71
11	9801451	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:104,0,110
11	9879838	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:105,0,138
11	10521749	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	10528125	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	10528483	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	10528521	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	10533952	.	T	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:185,0,231
11	10534866	.	C	T	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.919;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:133,0,386
11	10544852	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	10555589	.	A	G	623.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.226;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=23.10;ReadPosRankSum=1.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:652,0,353
11	10783885	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	10786142	.	C	T	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-1.352;DP=22;FS=13.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:368,0,447
11	10786175	.	C	T	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:84:511,0,84
11	10800519	.	C	G	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-1.653;DP=27;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.702	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:390,0,580
11	10820384	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	10821055	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
11	10822202	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
11	10822350	.	C	T	3092.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:3121,226,0
11	10823079	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	10826341	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	10827950	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	10843327	.	T	A	19.54	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
11	11292700	.	G	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.991;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:182,0,288
11	11863526	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	11913585	.	G	T	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:854,60,0
11	11976628	.	G	A	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
11	11977573	.	T	C	1140.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1169,81,0
11	12225946	.	T	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	12268298	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	12282297	.	C	T	77.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
11	12283928	.	C	T	120.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:149,0,21
11	12284741	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	12284925	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	12289881	.	C	T	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
11	12315891	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	12315915	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	12380947	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
11	12383555	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	12549761	.	C	G	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:259,0,192
11	12553981	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	12554621	.	T	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:162,0,30
11	12554678	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	12960926	.	T	A	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:83:83,0,427
11	12964882	.	A	G	175.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:204,0,25
11	13409798	.	A	T	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
11	13409843	.	C	T	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
11	13441126	.	A	G	731.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:760,54,0
11	13737851	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
11	13738006	.	G	T	162.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:191,0,19
11	13738231	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	13739556	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,225
11	13748209	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	13751505	.	A	G	941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:970,66,0
11	14510047	.	C	T	699.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.295;DP=51;FS=6.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,20:49:99:728,0,1138
11	14521354	.	C	A	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.765;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:396,0,594
11	14810762	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	14910234	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	14910801	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
11	16760244	.	T	G	1696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1725,120,0
11	16760724	.	T	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	16760796	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	16766106	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
11	16770613	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	16772832	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
11	16773500	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	16777342	.	G	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
11	16778787	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	16799582	.	T	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
11	16800105	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
11	16800290	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:77,0,33
11	16803174	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	16809573	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	17035718	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,105
11	17096211	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
11	17111272	.	A	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:231,0,146
11	17118687	.	T	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=16.64;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:178,0,153
11	17172133	.	T	C	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
11	17191019	.	A	G	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:164,0,247
11	17229500	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:62,0,61
11	17333663	.	G	A	1035.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1064,75,0
11	17393644	.	A	G	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
11	17394073	.	C	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
11	17395540	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
11	17396128	.	T	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
11	17396272	.	C	T	15.88	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:44:44,0,72
11	17399402	.	C	T	344.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:373,27,0
11	17399722	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	17400287	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	17402336	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:72,0,63
11	17408404	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
11	17408630	.	C	T	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
11	17409572	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	17419279	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	17981047	.	C	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
11	18104023	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	18105199	.	T	A	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.97;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:53:220,0,53
11	18108492	.	T	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=1.041;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:173,0,389
11	18108512	.	T	C	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:324,0,99
11	18117516	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	18300965	.	G	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,155
11	18343878	.	A	G	184.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:213,18,0
11	18344064	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:151,0,29
11	18387959	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,324
11	18388128	.	G	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.86;ReadPosRankSum=1.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:180,0,144
11	18421683	.	C	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,107
11	18433889	.	A	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
11	18491076	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	18512085	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	18512089	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	18512097	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	18551451	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,289
11	18553139	.	T	C	593.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:622,42,0
11	18613194	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	18627350	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	18628629	.	C	T	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,238
11	18628730	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,192
11	18629304	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
11	18633971	.	G	A	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
11	18636481	.	C	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:222,0,124
11	18720304	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	19184916	.	A	G	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-2.333;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=26.20;ReadPosRankSum=2.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:395,0,134
11	19275866	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	20404613	.	T	G	936.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:965,66,0
11	20404757	.	T	C	928.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:957,66,0
11	20409169	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	20529886	.	G	A	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:599,42,0
11	22214903	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	22242729	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	22645413	.	G	A	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
11	22645600	.	C	T	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
11	22646025	.	G	A	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
11	22837198	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	22842622	.	T	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
11	22843155	.	A	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:516,39,0
11	22843220	.	T	C	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
11	27315356	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
11	27360180	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	27362359	.	T	G	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
11	27388504	.	G	A	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
11	27388624	.	C	T	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
11	27388910	.	T	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
11	27390089	.	T	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
11	27409896	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	27494096	.	C	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
11	27517670	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	27910470	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	27910471	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	27910475	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	27910477	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	27911234	.	T	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
11	30344725	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:139,0,189
11	30358475	.	A	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
11	30432176	.	T	C	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:746,51,0
11	30432220	.	A	T	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:230,0,164
11	30459728	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	30608133	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,115
11	32123510	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	32124978	.	T	C	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:216,0,411
11	32126938	.	T	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.568;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:180,0,500
11	32878567	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
11	32947846	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	32954344	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
11	32956244	.	A	G	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
11	32956620	.	A	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-2.017;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=15.72;ReadPosRankSum=2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,137
11	32996805	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:151,0,193
11	33076191	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	33095845	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	33097876	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	33106616	.	C	T	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1099,75,0
11	33109501	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	33112903	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	33140229	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	33162009	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	33183017	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
11	33376095	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
11	33378209	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	33726222	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	33726980	.	A	G	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
11	33728614	.	T	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
11	33730060	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	33730261	.	G	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
11	33731406	.	C	T	1278.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1307,90,0
11	33757941	.	A	G	641.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:670,48,0
11	33763193	.	A	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
11	33766495	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
11	33766630	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
11	33792977	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	33793951	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	33881016	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	34073360	.	A	G	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:650,48,0
11	34122369	.	G	T	1427.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1456,99,0
11	34152939	.	T	C	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:526,39,0
11	34154641	.	C	T	809.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:838,63,0
11	34173661	.	C	A	205.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:234,18,0
11	34174296	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	34460541	.	T	C	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:248,0,455
11	34493801	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	34500687	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-1.650;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:108,0,557
11	34500798	.	T	A	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-0.680;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:167,0,409
11	34501166	.	T	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:134,0,360
11	34501596	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.849;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:117,0,503
11	34502042	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	34504659	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:159,0,31
11	34506338	.	T	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:77,0,76
11	34642668	.	A	G	270.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:299,24,0
11	34642728	.	A	T	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
11	34668143	.	C	T	414.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:443,0,367
11	34678435	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	34680598	.	C	A	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.537;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:331,0,538
11	34680634	.	G	A	840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:869,60,0
11	34681462	.	A	G	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.312;DP=28;FS=5.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.942;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:339,0,643
11	34681677	.	G	A	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:49:49,0,404
11	34681761	.	T	C	507.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.472;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=22.08;ReadPosRankSum=-0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:536,0,335
11	34682547	.	T	C	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
11	34682962	.	G	T	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.318;DP=17;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:168,0,459
11	34683578	.	G	A	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.123;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:279,0,490
11	34909926	.	T	G	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=-2.202;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=14.51;ReadPosRankSum=2.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:362,0,463
11	34937813	.	G	A	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:494,0,243
11	34937884	.	G	A	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:247,0,496
11	34937901	.	A	G	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:171,0,331
11	34938265	.	C	T	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:264,0,383
11	34938272	.	C	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:174,0,529
11	34991727	.	T	C	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:997,69,0
11	35006465	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	35014972	.	G	A	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
11	35015278	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	35016833	.	A	G	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.037;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:227,0,540
11	35017205	.	G	T	706.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:735,51,0
11	35017363	.	C	A	737.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:766,54,0
11	35212288	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
11	35226155	.	A	G	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
11	35229673	.	T	C	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
11	35251318	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
11	35829003	.	C	G	551.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=2.504;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=22.99;ReadPosRankSum=-2.326	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:580,0,335
11	35831433	.	G	A	353.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.423;DP=11;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=32.12;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,10:11:9:381,9,0
11	35831895	.	C	T	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
11	36103228	.	A	G	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.710;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:208,0,295
11	36251046	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,154
11	36253297	.	G	T	127.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:20:156,0,20
11	36616112	.	G	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,194
11	43358750	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
11	43465665	.	G	A	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.650;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:88:88,0,473
11	43466450	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	43472895	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	43496513	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	43502701	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
11	43702530	.	A	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.684;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:231,0,283
11	43877278	.	G	T	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-1.743;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:220,0,319
11	43877934	.	C	A	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=1.379;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=16.63;ReadPosRankSum=-1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:394,0,410
11	43878485	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	43879540	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	43880751	.	G	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
11	43883721	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	43884417	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	43884515	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	43885059	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	43885863	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	43886365	.	T	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
11	44117372	.	C	G	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:278,0,484
11	44252688	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	44267657	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	44637480	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	44640268	.	A	G	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.713;DP=35;FS=9.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,9:32:99:286,0,883
11	44640792	.	T	C	1767.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1796,123,0
11	44954597	.	G	A	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.916;DP=26;FS=16.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:281,0,631
11	44955114	.	C	T	340.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.491;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:369,0,399
11	44956121	.	C	T	1386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1415,99,0
11	44959924	.	G	A	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:76,0,27
11	44960689	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
11	44961840	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	44963585	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:77,0,32
11	44966438	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:117,0,66
11	44967703	.	A	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
11	44968350	.	G	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
11	44969896	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	44971854	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	45001490	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	45001880	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	45002010	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	45002012	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	45002498	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	45002551	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	45171042	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	45174126	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	45230443	.	T	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:160,0,66
11	45234877	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	45827350	.	A	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,143
11	45832935	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
11	45834044	.	C	T	125.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:154,15,0
11	45834198	.	T	C	159.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:188,15,0
11	45848271	.	A	G	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
11	45848275	.	T	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
11	45903613	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
11	45904477	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
11	45934633	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
11	45935384	.	A	G	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
11	45937267	.	C	T	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
11	45939427	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:58:58,0,107
11	45949201	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	45949534	.	C	T	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
11	46276888	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:80,0,32
11	46339011	.	G	A	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:346,0,440
11	46342834	.	A	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:127,0,241
11	46398916	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=-1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:146,0,261
11	46402852	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:107,0,65
11	46621140	.	T	C	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
11	46695414	.	T	C	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.054;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:201,0,367
11	46695483	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=1.286;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:68:68,0,614
11	46699227	.	T	C	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
11	46702920	.	T	C	866.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:895,63,0
11	46702930	.	C	T	866.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:63:895,63,0
11	46704439	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:112,0,75
11	46708602	.	A	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	47186424	.	C	A	961.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:990,72,0
11	47188411	.	C	T	309.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:338,0,407
11	47238522	.	T	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
11	47261043	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	47270255	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:111,0,75
11	47298360	.	G	A	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-1.929;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:138,0,329
11	47303275	.	T	C	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:174,0,283
11	47306628	.	G	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:151,0,67
11	47331116	.	T	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:736,51,0
11	47347162	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	47351320	.	T	C	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
11	47431703	.	A	G	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=7;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:160,0,65
11	47431728	.	A	G	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
11	47436531	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	47437202	.	C	T	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.656	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:269,0,214
11	47437403	.	C	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:213,0,211
11	47487740	.	G	A	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
11	47492173	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=12;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,306
11	47501989	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	47587062	.	G	A	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
11	47593945	.	A	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
11	47639456	.	T	G	594.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.031;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=24.78;ReadPosRankSum=0.459	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:623,0,256
11	47639525	.	T	G	580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:609,42,0
11	47640429	.	G	C	499.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.119;DP=38;FS=4.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,15:38:99:528,0,907
11	47748509	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
11	47748880	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:101,0,74
11	47751393	.	T	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
11	47753370	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:99,0,276
11	47772963	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	47834592	.	G	A	752.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:781,54,0
11	47857253	.	T	C	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.016;ClippingRankSum=1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:224,0,229
11	48145247	.	T	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:90:90,0,275
11	48188872	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:74:113,0,74
11	48189606	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
11	48190527	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	48190777	.	G	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:143,0,68
11	48191303	.	T	C	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
11	48191675	.	A	G	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
11	56587630	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	57070532	.	C	T	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.826	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,404
11	57072020	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:115,0,30
11	57076820	.	T	G	615.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.532;DP=37;FS=10.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.228	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,18:37:99:644,0,707
11	57081197	.	G	C	1387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1416,102,0
11	57463500	.	T	C	439.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.317;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.664	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:468,0,233
11	57468129	.	T	C	659.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=0.380;DP=31;FS=8.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=21.28;ReadPosRankSum=-0.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:688,0,383
11	57507983	.	C	T	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:46:264,0,46
11	57510294	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	57529429	.	A	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-1.153;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,10:34:99:342,0,930
11	57548881	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	57563991	.	C	T	508.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-1.470;DP=43;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.394	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,16:43:99:537,0,989
11	57571232	.	C	T	1659.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1688,117,0
11	57585662	.	C	T	843.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.087;DP=35;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.894;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,23:35:99:872,0,394
11	57593617	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	58008907	.	T	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
11	58010012	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
11	58010013	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
11	58010016	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	58302778	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	58318619	.	C	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
11	58871883	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	58898095	.	T	C	52.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:20:81,0,20
11	58898826	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,39
11	58898891	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,161
11	58898893	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,161
11	58911452	.	T	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,320
11	58914185	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,121
11	58914189	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,121
11	58914190	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,121
11	58914821	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,44
11	58914822	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,44
11	58914844	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,165
11	58914846	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:78:78,0,165
11	58914854	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,165
11	58914887	.	A	G	178.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:21:207,0,21
11	58914892	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:112,0,109
11	58939811	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
11	59568833	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.349;DP=32;FS=1.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:99:119,0,1042
11	59623433	.	G	A	3945.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,90:90:99:3974,271,0
11	59624536	.	A	T	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
11	59625689	.	G	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=2.15;ReadPosRankSum=-1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,400
11	59625812	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,108
11	59633493	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	59666919	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	60610065	.	G	A	684.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.192;DP=32;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,19:32:99:713,0,467
11	60614995	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	60617834	.	C	A	634.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-1.139;DP=35;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.205	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,18:35:99:663,0,626
11	60617942	.	G	A	398.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=1.538;DP=26;FS=18.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.744	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:427,0,465
11	60618134	.	A	G	451.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.021;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:480,0,560
11	60618269	.	G	A	1372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1401,96,0
11	60689445	.	T	C	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.445;DP=45;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,15:45:99:515,0,1106
11	60693219	.	G	A	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.506;DP=24;FS=10.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:396,0,463
11	60693815	.	C	T	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.792;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:237,0,497
11	60695301	.	C	A	1011.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-0.755;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=17.44;ReadPosRankSum=2.280	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,30:58:99:1040,0,977
11	60703076	.	C	T	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:242,0,416
11	60703777	.	G	A	1213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-2.055;DP=64;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=18.97;ReadPosRankSum=2.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,33:64:99:1242,0,1119
11	60899767	.	A	G	887.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-1.385;DP=38;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.400;QD=23.36;ReadPosRankSum=1.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,25:38:99:916,0,413
11	60914133	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	61081821	.	G	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.692;DP=63;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,8:63:99:162,0,2156
11	61106892	.	G	C	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:818,60,0
11	61108974	.	G	A	1177.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1206,84,0
11	61109675	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
11	61112802	.	C	T	1141.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1170,81,0
11	61116345	.	T	C	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:842,60,0
11	61119652	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,80
11	61126858	.	C	T	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
11	61128792	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	61134636	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	61135129	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
11	61165280	.	G	A	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-1.803;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.269	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:322,0,490
11	61165741	.	G	C	419.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=34.96;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:3:446,0,3
11	61173336	.	C	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:141,0,72
11	61173614	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	61179285	.	G	A	619.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.155;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,18:44:99:648,0,1009
11	61204361	.	A	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,103
11	61208885	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	61209133	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	61213920	.	T	C	481.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-1.464;DP=33;FS=13.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.211	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:510,0,648
11	61281373	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	61281430	.	G	A	52.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:78,0,1
11	61285325	.	C	T	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:311,0,154
11	61300704	.	G	C	428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:457,33,0
11	61302244	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,109
11	61303803	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
11	61306929	.	G	C	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
11	61312418	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	61316134	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	61316307	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	61318073	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	61318295	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
11	61371283	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	61392541	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	61487690	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	61496682	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	61513400	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	61514085	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	61557803	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
11	61557826	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
11	61564299	.	G	T	358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.157;DP=29;FS=6.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.112	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:387,0,693
11	61565908	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:151,0,30
11	61566727	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	61567753	.	C	A	443.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.409;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.535	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:472,0,318
11	61569306	.	C	G	549.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=-0.239;DP=36;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,16:36:99:578,0,754
11	61569830	.	C	T	476.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.298;DP=37;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.266	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,14:37:99:505,0,891
11	61571382	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
11	61579938	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
11	61581558	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
11	61581656	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	61582060	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	61582061	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	61582062	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	61616069	.	A	G	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:254,0,184
11	61616322	.	A	G	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:265,0,101
11	61617015	.	C	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,112
11	61617247	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,160
11	61617320	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,110
11	61617339	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:100,0,146
11	61617356	.	A	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,228
11	61617446	.	A	G	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:196,0,109
11	61617449	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,310
11	61617676	.	T	A	178.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:15:207,0,15
11	61618016	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,119
11	61618608	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,148
11	61618831	.	T	C	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-1.813;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:224,0,225
11	61619181	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
11	61619294	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,112
11	61619781	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=1.568;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:145,0,231
11	61619829	.	C	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,204
11	61621556	.	G	C	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:349,0,218
11	61621611	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,116
11	61622905	.	A	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
11	61623140	.	C	T	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=20.89;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:258,0,134
11	61624181	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,205
11	61624414	.	T	C	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:291,0,127
11	61624705	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	61624885	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	61628266	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,121
11	61628492	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
11	61629166	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,74
11	61630104	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:78,0,34
11	61631927	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
11	61641211	.	A	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
11	61644708	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	61658800	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:93:93,0,174
11	61664992	.	T	C	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=20.75;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:215,0,104
11	61665122	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:138,0,144
11	61723556	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	61724514	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	61734028	.	C	T	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
11	61895741	.	A	G	794.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:823,63,0
11	61897359	.	C	T	930.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:959,66,0
11	61898756	.	T	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
11	61900906	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	61906374	.	T	C	1003.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1032,72,0
11	61909620	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
11	61913196	.	G	T	1455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1484,105,0
11	61919515	.	C	G	747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:776,54,0
11	61921248	.	G	A	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
11	62040247	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	62105012	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	62292882	.	G	T	1705.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1734,120,0
11	62293948	.	G	A	1469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1498,105,0
11	62294044	.	G	A	635.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.879;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=23.55;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:664,0,324
11	62346131	.	C	T	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
11	62362780	.	C	T	552.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=-1.401;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:581,0,376
11	62369025	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:110,0,328
11	62380119	.	C	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
11	62384869	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
11	62401620	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
11	62401716	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	62430335	.	G	A	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
11	62437647	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	62438819	.	G	T	288.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:317,24,0
11	62439569	.	G	A	1071.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1100,84,0
11	62444798	.	T	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
11	62475253	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	62486209	.	C	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	62506638	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,117
11	62506990	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,117
11	62507282	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,146
11	62507324	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:60,0,63
11	62507363	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,107
11	62555059	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	62564009	.	T	C	784.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:813,57,0
11	63334984	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
11	63335890	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	63336025	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
11	63336290	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
11	63338526	.	C	T	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:686,48,0
11	63340072	.	G	A	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
11	63340111	.	T	A	706.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:735,51,0
11	63340431	.	T	A	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
11	63340599	.	T	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:92:92,0,301
11	63341096	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
11	63341807	.	G	T	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-2.607;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:130,0,466
11	63381847	.	A	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
11	63381976	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	63487386	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	63580005	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	63581174	.	G	A	56.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.519;DP=30;FS=5.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:85:85,0,919
11	63585804	.	C	A	452.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.756;DP=41;FS=30.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.234	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,14:41:99:481,0,986
11	63588669	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	63589573	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:153,0,31
11	63589668	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	63589723	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,115
11	63591861	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,153
11	63593387	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	63593846	.	G	C	163.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:192,0,19
11	63594656	.	C	T	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.709;DP=21;FS=2.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:238,0,500
11	63595072	.	C	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.859;DP=25;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.986	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:100,0,754
11	63674926	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
11	63676896	.	A	C	835.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-3.179;DP=28;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,23:28:99:864,0,982
11	63677932	.	C	T	1299.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1328,93,0
11	63681513	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	63714319	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:70,0,35
11	63720086	.	T	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	63722448	.	C	T	657.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.854;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=31.32;ReadPosRankSum=0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,18:21:50:686,0,50
11	63723238	.	A	G	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=2.781;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:350,0,227
11	63723281	.	G	A	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:128,0,355
11	63723945	.	A	G	1230.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1259,87,0
11	63724175	.	G	A	480.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=34.34;ReadPosRankSum=1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,13:14:6:508,6,0
11	63724300	.	C	T	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
11	63742553	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	63752979	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	63752982	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	63767186	.	A	G	536.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-2.073;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=18.51;ReadPosRankSum=2.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:565,0,500
11	63769144	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
11	63775566	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	63864328	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
11	63869062	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	63881353	.	T	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	63883169	.	C	A	534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:563,39,0
11	63883985	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
11	63884027	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	63884747	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	63889293	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
11	63905558	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	63906819	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	63908720	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:74,0,30
11	63910116	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	63917329	.	T	C	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
11	63943908	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
11	63951999	.	A	C	74.75	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:112,0,23
11	63991581	.	G	A	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.481;DP=44;FS=9.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.940;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,10:43:99:311,0,1273
11	63991801	.	T	C	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.209;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,12:42:99:395,0,1168
11	63992706	.	T	C	334.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:363,27,0
11	63993534	.	G	C	1222.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1251,90,0
11	63993579	.	C	G	458.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.797;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.260	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:487,0,410
11	63994692	.	T	C	136.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:165,0,21
11	63994696	.	T	C	136.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.20	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:21:165,0,21
11	63995302	.	C	G	123.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:152,0,25
11	63996507	.	G	A	170.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:199,0,23
11	63997329	.	A	G	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:93:1375,93,0
11	63997338	.	T	C	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:93:1375,93,0
11	64002238	.	T	C	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
11	64003843	.	G	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:68,0,66
11	64004692	.	C	T	594.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.468;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.405	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:98:623,0,98
11	64009879	.	G	A	507.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=1.411;DP=51;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,16:51:99:536,0,1345
11	64013406	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:100,0,34
11	64022459	.	A	G	1349.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1378,96,0
11	64023971	.	G	A	831.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=-0.544;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=27.73;ReadPosRankSum=0.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,24:30:99:860,0,171
11	64026144	.	G	A	509.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.708;DP=26;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,16:25:99:538,0,302
11	64026685	.	C	T	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.064;DP=24;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.28;ReadPosRankSum=-0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,17:24:99:659,0,228
11	64030944	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
11	64034866	.	G	A	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.374;DP=33;FS=6.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.242	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,7:33:99:203,0,953
11	64036688	.	C	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	64043021	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:77,0,63
11	64044284	.	C	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:104,0,70
11	64045645	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	64046641	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
11	64046885	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:118,0,76
11	64048323	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,77
11	64048645	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	64048912	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:153,0,71
11	64049021	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
11	64051823	.	C	T	598.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=1.144;DP=52;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,18:52:99:627,0,1343
11	64052306	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	64053049	.	G	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
11	64074887	.	G	C	56.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-1.922;DP=30;FS=5.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:85:85,0,984
11	64078581	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,186
11	64078706	.	G	A	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:62:268,0,62
11	64080424	.	A	G	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
11	64081445	.	G	A	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-0.171;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,8:36:99:245,0,1101
11	64082807	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	64085074	.	T	A	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
11	64085148	.	A	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:134,0,138
11	64085298	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:60:116,0,60
11	64085785	.	A	G	3298.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3327,241,0
11	64085938	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
11	64089216	.	C	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=1.014;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=2.87;ReadPosRankSum=-1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,6:41:99:146,0,1423
11	64136592	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	64532431	.	G	A	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-1.265;DP=40;FS=6.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,10:40:99:311,0,1175
11	64532579	.	C	A	1638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1667,114,0
11	64539635	.	G	C	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
11	64542901	.	T	C	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
11	64547762	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
11	64549889	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	64572018	.	T	C	1640.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1669,117,0
11	64572557	.	A	G	979.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1008,69,0
11	64578113	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	64591387	.	C	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.236;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:101,0,554
11	64591972	.	T	C	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:926,66,0
11	64594490	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	64595294	.	C	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=1.027;DP=14;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:260,0,252
11	64595940	.	G	T	686.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:715,51,0
11	64596916	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	64597506	.	T	C	1040.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1069,78,0
11	64598236	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	64599657	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	64601996	.	C	T	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.967;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:45:45,0,901
11	64611639	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	64620518	.	G	A	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:694,51,0
11	64621470	.	G	A	1071.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1100,81,0
11	64621573	.	G	A	586.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:615,42,0
11	64621856	.	A	G	1194.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1223,87,0
11	64622502	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	64622869	.	G	C	1711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.908;DP=42;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=32.53;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,41:42:82:1740,82,0
11	64623901	.	A	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
11	64624456	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	64624457	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	64625282	.	A	T	95.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:123,12,0
11	64625709	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	64626239	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
11	64626361	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	64626420	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	64645871	.	A	G	1322.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:98:1351,98,0
11	64663227	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:146,0,132
11	64675261	.	G	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-1.531;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,5:33:99:121,0,1090
11	64677293	.	G	C	901.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:930,69,0
11	64680819	.	G	A	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.650;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:83:83,0,455
11	64694781	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	64694782	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	64799998	.	T	C	1090.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-1.733;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=32.97;ReadPosRankSum=1.486	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:47:1119,47,0
11	64803351	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
11	64807294	.	G	A	1274.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1303,102,0
11	64807447	.	A	C	853.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:882,63,0
11	64807541	.	G	A	683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:712,51,0
11	64808647	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	64809090	.	T	G	1134.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1163,84,0
11	64809133	.	T	G	1120.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1149,84,0
11	64809167	.	A	G	1327.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1356,105,0
11	64809441	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	64810171	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	64845438	.	C	A	1564.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1593,117,0
11	64850513	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	64851305	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
11	64863861	.	G	A	40.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.881;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.334	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,4:36:69:69,0,2299
11	64863864	.	G	A	40.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=1.624;DP=32;FS=2.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:69:69,0,2299
11	64870331	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	64872689	.	A	G	51.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:80,0,23
11	64874262	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	64874379	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,147
11	64876390	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
11	64876740	.	C	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
11	64878661	.	T	C	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
11	64880090	.	G	C	1938.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1967,138,0
11	64880993	.	G	A	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=-0.416;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=0.31;ReadPosRankSum=-0.028	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,5:58:46:46,0,2105
11	64882789	.	C	T	2259.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2288,157,0
11	64884052	.	G	A	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
11	64885524	.	T	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
11	64891363	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	64895202	.	A	G	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
11	64896732	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
11	64898226	.	C	T	958.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:987,75,0
11	64908062	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	64921259	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	64948162	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,109
11	64950970	.	C	T	1345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=-1.842;DP=67;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=20.09;ReadPosRankSum=3.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,36:67:99:1374,0,1097
11	64951427	.	G	C	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
11	64957781	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	64984785	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	65004301	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	65030290	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	65030291	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	65030292	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	65050521	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:71:71,0,91
11	65050522	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:71:71,0,91
11	65050527	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:71:71,0,91
11	65064300	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
11	65072959	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,114
11	65115978	.	G	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	65120391	.	T	C	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:434,33,0
11	65139166	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	65139844	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	65141885	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	65144075	.	T	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
11	65146496	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	65149872	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	65161129	.	C	T	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
11	65178620	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	65179055	.	C	G	799.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:65:828,65,0
11	65179790	.	G	A	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:186,0,220
11	65180604	.	T	A	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:445,33,0
11	65180883	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
11	65185387	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	65190379	.	G	T	1487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1516,116,0
11	65191208	.	C	G	2401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2430,169,0
11	65195255	.	G	A	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
11	65196884	.	C	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
11	65196931	.	T	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
11	65197393	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	65199599	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	65203561	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,146
11	65210090	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,304
11	65210093	.	C	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,196
11	65211979	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,205
11	65212122	.	C	T	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:136,0,374
11	65212447	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,230
11	65267586	.	G	C	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.651;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:65,6:71:53:53,0,2633
11	65293819	.	G	A	747.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-1.317;DP=48;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.430	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,21:41:99:776,0,751
11	65319265	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
11	65335705	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
11	65349063	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	65380248	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	65380916	.	G	A	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-1.830;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:429,0,306
11	65383755	.	G	T	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:55:173,0,55
11	65383896	.	G	C	792.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:821,60,0
11	65385606	.	A	G	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
11	65386206	.	C	G	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-2.424;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:256,0,219
11	65387378	.	T	A	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=18.87;ReadPosRankSum=-1.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:349,0,286
11	65388689	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	65390485	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	65390688	.	G	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:61:123,0,61
11	65390689	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:61:123,0,61
11	65391051	.	T	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.614;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:111,0,617
11	65391137	.	T	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:55:308,0,55
11	65391208	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:63:81,0,63
11	65391210	.	T	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:63:81,0,63
11	65392695	.	C	T	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.053;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.048;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:296,0,306
11	65400888	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:75,0,34
11	65415028	.	T	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
11	65424061	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	65425167	.	C	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:111,0,95
11	65430620	.	G	A	36.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:65,0,22
11	65483981	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,73
11	65484569	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	65485218	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,194
11	65485337	.	A	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.779;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:232,0,223
11	65485727	.	T	G	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
11	65543827	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,224
11	65545201	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,77
11	65546857	.	A	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:148,0,110
11	65547333	.	G	A	145.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:174,0,22
11	65554597	.	G	A	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.38;ReadPosRankSum=2.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:232,0,125
11	65554680	.	C	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
11	65576470	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
11	65579600	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	65581638	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	65623347	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:108,0,72
11	65623519	.	G	A	2431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-2.561;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=26.43;ReadPosRankSum=2.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,62:92:99:2460,0,1013
11	65623739	.	A	G	311.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.19;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:15:340,0,15
11	65624490	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
11	65625237	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
11	65628334	.	G	A	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:182,0,339
11	65629932	.	T	C	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:264,0,723
11	65629934	.	G	C	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.049	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:264,0,723
11	65631167	.	C	T	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=1.589;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.795	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:336,0,313
11	65632262	.	G	T	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.952;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,12:26:99:429,0,524
11	65684855	.	A	G	678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:707,51,0
11	65684929	.	C	T	884.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:913,66,0
11	65685225	.	T	C	833.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:862,60,0
11	65685970	.	C	T	36.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:62,0,1
11	65686180	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	65732651	.	G	A	498.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.301;DP=25;FS=9.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.724;QD=19.95;ReadPosRankSum=-0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:527,0,388
11	65733393	.	C	T	533.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-2.165;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=19.06;ReadPosRankSum=2.211	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:562,0,465
11	65735174	.	G	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=1.801;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:361,0,605
11	65740334	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	65747194	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	65764130	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	65764383	.	C	T	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:214,0,148
11	65765551	.	C	T	635.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:664,51,0
11	65769295	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
11	65769456	.	A	T	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:252,0,222
11	65769780	.	T	G	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=2.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:302,0,263
11	65769809	.	G	C	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:721,51,0
11	65770413	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-1.663;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:144,0,250
11	65770545	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:155,0,72
11	65770658	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	65823293	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
11	65826704	.	G	A	1425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.805;DP=65;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=21.93;ReadPosRankSum=-0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,38:65:99:1454,0,937
11	65834178	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	65985000	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	66010917	.	C	T	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.380;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:352,0,203
11	66011280	.	T	C	497.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=1.157;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:526,0,534
11	66027358	.	C	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,39
11	66031660	.	C	T	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.550;DP=24;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:319,0,570
11	66031681	.	G	A	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-0.861;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:65:65,0,730
11	66033430	.	C	T	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-0.155;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:392,0,296
11	66040049	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:129,9,0
11	66040053	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	66041807	.	A	C	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:159,0,69
11	66042825	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=14.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,274
11	66042962	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:117,0,66
11	66043898	.	G	A	1198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-0.494;DP=70;FS=10.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.753	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,33:70:99:1227,0,1345
11	66048491	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	66054823	.	C	T	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
11	66056142	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	66056457	.	G	A	756.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-2.600;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,22:45:99:785,0,819
11	66099987	.	C	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
11	66100119	.	G	A	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:270,0,135
11	66100151	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,109
11	66100152	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
11	66107674	.	A	G	1516.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.890;DP=37;FS=3.129;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=34.10;ReadPosRankSum=1.545	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,36:37:99:1545,101,0
11	66108660	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	66109033	.	T	C	2128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2157,150,0
11	66126169	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	66128791	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	66129442	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	66130358	.	T	G	1388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1417,99,0
11	66130548	.	C	T	1721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1750,123,0
11	66130736	.	A	G	1222.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1251,87,0
11	66131149	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
11	66131906	.	A	G	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
11	66132124	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	66132151	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	66132286	.	T	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
11	66132414	.	G	T	235.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:273,27,0
11	66133082	.	T	C	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
11	66133311	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
11	66133336	.	A	G	257.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:286,21,0
11	66134144	.	A	G	428.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:457,33,0
11	66134252	.	T	C	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
11	66135179	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
11	66135614	.	A	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
11	66135898	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	66139187	.	G	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:56:56,0,226
11	66240882	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,174
11	66243148	.	C	T	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:59:298,0,59
11	66244454	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:229,0,247
11	66246337	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	66247696	.	G	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
11	66254085	.	G	T	455.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.643;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:484,0,349
11	66262806	.	T	C	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
11	66272142	.	A	G	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=1.753;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,10:39:99:291,0,1050
11	66272237	.	G	A	627.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.576;DP=40;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,20:39:99:656,0,689
11	66277035	.	G	A	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-0.952;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:452,0,476
11	66282095	.	G	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:51:51,0,200
11	66297363	.	C	T	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-1.226;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:224,0,294
11	66299515	.	A	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:242,0,322
11	66300348	.	A	G	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:164,0,236
11	66300463	.	G	A	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:91:274,0,91
11	66306355	.	A	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,151
11	66388302	.	T	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
11	66400452	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	66402576	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	66408033	.	C	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:197,0,70
11	66408071	.	G	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:194,0,28
11	66451184	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:120,0,70
11	66451563	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	66451982	.	T	C	93.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:122,0,27
11	66451984	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,136
11	66458980	.	G	A	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:287,0,168
11	66460527	.	C	T	522.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=-1.113;DP=20;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=26.14;ReadPosRankSum=1.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:551,0,180
11	66468469	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.977;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:186,0,251
11	66472274	.	T	C	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
11	66486143	.	T	C	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
11	66490797	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	66490803	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:88,6,0
11	66490898	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	66492281	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	66493421	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	66517833	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	66523904	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,77
11	66561057	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	66562248	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:119,0,70
11	66570507	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	66573002	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	66576008	.	T	A	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:116,0,27
11	66577897	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:112,0,75
11	66578480	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,115
11	66579290	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,195
11	66581830	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,142
11	66581859	.	A	G	100.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:8:128,8,0
11	66581869	.	A	G	56.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:84,5,0
11	66581986	.	A	G	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,40
11	66608521	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
11	66608686	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	66608991	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:115,0,69
11	66807522	.	G	C	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.404;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:82:82,0,506
11	66816507	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:156,0,28
11	66834252	.	C	T	593.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-2.210;DP=37;FS=9.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=16.05;ReadPosRankSum=2.149	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,17:37:99:622,0,730
11	66837965	.	T	C	1828.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1857,129,0
11	66898683	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	66995603	.	T	C	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:445,0,412
11	67012769	.	C	T	595.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-1.497;DP=46;FS=6.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,18:46:99:624,0,1053
11	67024534	.	C	T	580.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.504;DP=29;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:609,0,450
11	67034266	.	C	A	554.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=-2.055;DP=38;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:583,0,772
11	67034716	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:69,0,36
11	67038612	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:119,0,65
11	67060451	.	C	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
11	67063060	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
11	67065889	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:154,0,28
11	67066878	.	T	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:70:70,0,260
11	67068859	.	T	C	1205.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1234,90,0
11	67071584	.	C	G	157.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:185,8,0
11	67072421	.	G	A	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.771;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,9:47:99:245,0,1495
11	67075131	.	C	T	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.201;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:500,0,958
11	67076467	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,213
11	67076810	.	T	G	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:535,39,0
11	67100537	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	67160285	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:112,0,618
11	67160961	.	A	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:173,0,325
11	67164791	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.718;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:119,0,401
11	67166310	.	G	A	1141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.887;DP=61;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=3.080;QD=18.72;ReadPosRankSum=3.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,31:61:99:1170,0,1099
11	67196237	.	T	C	107.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:135,12,0
11	67198887	.	C	T	784.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-1.183;DP=40;FS=6.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.992	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,22:40:99:813,0,642
11	67199706	.	C	A	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
11	67200819	.	C	T	2004.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2033,144,0
11	67202156	.	C	T	1456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1485,113,0
11	67202847	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,359
11	67205462	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	67207072	.	C	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:161,0,28
11	67207197	.	A	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:144,0,105
11	67213748	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	67257556	.	C	T	872.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.165;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.029	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,24:50:99:901,0,982
11	67257823	.	C	A	2125.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2154,151,0
11	67258391	.	A	G	1661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1690,120,0
11	67261538	.	C	G	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:171,0,219
11	67263767	.	A	G	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
11	67374581	.	T	C	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:204,0,204
11	67375162	.	T	C	927.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:956,66,0
11	67375184	.	T	G	907.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:936,66,0
11	67378229	.	T	G	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:614,42,0
11	67385125	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	67386311	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
11	67386378	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	67386825	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	67388296	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	67393764	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	67394895	.	C	T	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
11	67395634	.	C	T	591.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=-0.298;DP=52;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,18:52:99:620,0,1313
11	67395714	.	C	T	2672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=-1.732;DP=63;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.28;ReadPosRankSum=1.677	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,62:63:99:2701,180,0
11	67399173	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:113,0,28
11	67412771	.	G	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:188,0,101
11	67415054	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
11	67418178	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	67430264	.	A	G	3546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:3575,246,0
11	67430396	.	T	C	3139.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:3168,220,0
11	67430482	.	T	C	3222.65	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:3251,226,0
11	67430589	.	A	G	2971.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3000,211,0
11	67430762	.	T	C	3607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:3636,253,0
11	67431038	.	G	A	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
11	67431110	.	G	A	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
11	67432479	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
11	67432804	.	T	C	3067.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3096,214,0
11	67433421	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	67433869	.	C	T	3433.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3462,238,0
11	67434416	.	C	A	3254.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:3283,229,0
11	67434489	.	T	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=2.100;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.187	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,1173
11	67434490	.	G	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,1173
11	67434491	.	T	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:48:48,0,1173
11	67434921	.	G	C	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
11	67435351	.	T	C	438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:467,36,0
11	67435950	.	T	C	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
11	67435976	.	A	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-2.218;DP=22;FS=10.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:281,0,514
11	67436146	.	T	C	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-1.527;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:617,0,785
11	67436893	.	G	A	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-1.067;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,15:37:99:514,0,821
11	67437076	.	A	G	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.955;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:210,0,778
11	67437879	.	C	T	299.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=21.41;ReadPosRankSum=-1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:328,0,177
11	67438195	.	T	C	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-1.592;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.674	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:330,0,362
11	67438284	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.921;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.921	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:194,0,472
11	67438476	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.672;DP=21;FS=9.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:107,0,662
11	67439832	.	G	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:67:67,0,348
11	67440041	.	T	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.710;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:197,0,299
11	67440592	.	G	A	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:79,0,26
11	67440743	.	T	C	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-1.386;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:337,0,442
11	67440834	.	C	T	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.652;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,189
11	67441009	.	C	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.887;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:150,0,518
11	67441053	.	A	C	401.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.308	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:430,0,477
11	67441472	.	C	T	420.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-2.240;DP=19;FS=14.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:449,0,495
11	67441479	.	A	T	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.938;DP=20;FS=18.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:193,0,1038
11	67441553	.	C	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.776;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=9.38;ReadPosRankSum=-1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:169,0,389
11	67441809	.	T	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=16.52;ReadPosRankSum=-1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:210,0,144
11	67442043	.	A	C	2705.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2734,187,0
11	67558525	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	67559770	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
11	67560292	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
11	67560447	.	C	T	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
11	67560468	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	67564181	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:154,0,72
11	67564197	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	67565099	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	67565172	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
11	67565291	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	67565587	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	67758771	.	G	T	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:85:247,0,85
11	67758895	.	G	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,191
11	67795299	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:157,0,29
11	67795353	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:63,0,35
11	67801282	.	C	T	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:465,36,0
11	67801517	.	G	T	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:521,36,0
11	67810341	.	A	G	34.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:63,0,28
11	67813723	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,78
11	67813930	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	67814979	.	G	C	838.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:867,60,0
11	67816936	.	A	G	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=29.34;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:52:351,0,52
11	67820335	.	T	A	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
11	67821036	.	G	A	573.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-1.935;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=15.51;ReadPosRankSum=2.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,17:37:99:602,0,731
11	67821127	.	T	C	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.913;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:305,0,523
11	67828136	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	67830295	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
11	67854035	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	67924559	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,104
11	67930039	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	67933642	.	C	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,136
11	67957518	.	A	T	1093.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1122,78,0
11	68030015	.	C	T	1246.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-1.733;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=28.94;ReadPosRankSum=1.625	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,31:32:61:1275,61,0
11	68125309	.	C	G	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.512;DP=31;FS=7.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.024	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,8:29:99:265,0,802
11	68142742	.	G	A	206.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:235,18,0
11	68143256	.	C	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
11	68143719	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:103,0,72
11	68145773	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	68146090	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	68171013	.	T	C	1505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1534,108,0
11	68177510	.	C	T	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.098;DP=33;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.294	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,10:33:99:339,0,863
11	68192421	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68192690	.	G	A	534.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.835;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,16:23:99:563,0,223
11	68201295	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=-2.366;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:104,0,503
11	68209477	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
11	68209478	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
11	68314980	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	68353550	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
11	68376240	.	C	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,43
11	68376241	.	C	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,43
11	68378045	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	68381415	.	A	G	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:200,0,431
11	68381607	.	G	A	821.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-1.592;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=29.35;ReadPosRankSum=1.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,21:28:99:850,0,214
11	68382193	.	C	T	544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.366;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:573,0,401
11	68504907	.	C	T	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:177,0,150
11	68505064	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
11	68511137	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	68511691	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	68513466	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
11	68513906	.	A	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:97:97,0,153
11	68523195	.	G	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=23.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:135,0,719
11	68523197	.	C	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:135,0,719
11	68523202	.	G	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:135,0,719
11	68523468	.	T	C	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:260,0,394
11	68523472	.	T	C	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:174,0,473
11	68523910	.	T	C	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.244;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:440,0,618
11	68524053	.	G	A	758.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=-0.847;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,22:46:99:787,0,893
11	68529378	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	68530318	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	68534203	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68538939	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	68549340	.	A	G	1673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1702,117,0
11	68550148	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68561335	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	68566248	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	68659210	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	68671285	.	A	C	276.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:11:304,0,11
11	68671477	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	68678962	.	T	C	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
11	68696973	.	A	G	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:60:241,0,60
11	68698996	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	68700359	.	C	T	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
11	68700701	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	68703959	.	A	G	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:343,0,215
11	68704264	.	C	T	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-2.163;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=22.21;ReadPosRankSum=2.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:317,0,168
11	68705674	.	C	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:193,0,189
11	68707454	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:421,33,0
11	68707626	.	C	T	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=1.386;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:87:87,0,274
11	68713997	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	68714863	.	C	T	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
11	68715646	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	68746328	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68821862	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	68822739	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
11	68830707	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
11	68832449	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:115,0,30
11	68832505	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
11	68832730	.	C	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	68833521	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68833703	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	68833726	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	68834968	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	68840160	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:105,0,143
11	68851414	.	T	C	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
11	68851466	.	G	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,108
11	68855363	.	G	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:87:188,0,87
11	68855483	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:60:150,0,60
11	68855595	.	A	G	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:212,0,144
11	68856680	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	68857038	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68860634	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	68864364	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
11	68870775	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	68871950	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	68882314	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	68882321	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	69186904	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	69307444	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	69462838	.	G	C	388.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=-2.627;DP=66;FS=8.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=5.89;ReadPosRankSum=2.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,14:66:99:417,0,1958
11	69464793	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:143,0,106
11	69465681	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:99,0,168
11	69466115	.	C	A	775.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.350;DP=52;FS=12.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,23:52:99:804,0,1054
11	69466737	.	C	G	518.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.030;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=15.72;ReadPosRankSum=2.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,15:33:99:547,0,644
11	69466892	.	G	A	461.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=-0.308;DP=26;FS=6.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:490,0,462
11	69468705	.	C	T	453.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.767;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,14:37:99:482,0,872
11	69482091	.	C	A	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:414,0,266
11	69489163	.	C	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,149
11	69934085	.	G	A	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-0.577;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,10:27:99:342,0,549
11	69955875	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	70007311	.	A	G	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.104;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,11:26:99:390,0,556
11	70007392	.	A	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.634;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.007	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:240,0,559
11	70034454	.	G	C	1419.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1448,99,0
11	70049523	.	A	G	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:480,36,0
11	70053224	.	G	A	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-2.324;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.20;ReadPosRankSum=2.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:241,0,450
11	70116070	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:120,0,30
11	70314597	.	T	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
11	70316391	.	A	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.368;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:281,0,301
11	70318714	.	A	G	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
11	70327305	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,69
11	70419246	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	70425843	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
11	70434809	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	70452388	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	70455023	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	70458357	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	70475136	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	70482091	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
11	70491736	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	70492408	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	70520100	.	T	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
11	70666765	.	C	T	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:134,0,249
11	70801650	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,173
11	70812047	.	A	G	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
11	70902645	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	70935766	.	T	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:197,0,189
11	71018309	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	71143580	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	71143751	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	71144065	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	71145687	.	T	C	1678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1707,117,0
11	71145778	.	G	A	1819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1848,126,0
11	71145941	.	G	A	513.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.735;DP=41;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.601	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,16:41:99:542,0,890
11	71146577	.	G	A	659.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-1.593;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.564	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:688,0,576
11	71146691	.	A	G	1949.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1978,138,0
11	71146952	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	71147883	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	71148304	.	T	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
11	71149137	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	71149856	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	71152461	.	A	G	2067.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2096,144,0
11	71155153	.	A	G	2216.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2245,157,0
11	71155171	.	C	T	1191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-0.661;DP=55;FS=9.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,33:55:99:1220,0,757
11	71159429	.	G	A	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
11	71159764	.	T	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	71162785	.	A	G	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
11	71169547	.	G	C	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
11	71170905	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	71171003	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
11	71182185	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	71184678	.	A	C	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
11	71185479	.	T	C	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
11	71185518	.	T	C	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
11	71186476	.	G	A	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
11	71187294	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	71187679	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
11	71190162	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
11	71190632	.	A	G	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:529,39,0
11	71190893	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
11	71192602	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	71192851	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
11	71207205	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	71211654	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	71243244	.	C	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	71498591	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,222
11	71498601	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,222
11	71707465	.	T	C	317.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.79;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:15:346,0,15
11	71707489	.	T	C	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
11	71708013	.	G	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
11	71714078	.	T	C	595.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:624,42,0
11	71714526	.	G	C	950.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:979,66,0
11	71714528	.	T	G	950.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:66:979,66,0
11	71718911	.	T	A	388.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.10;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:24:417,0,24
11	71718912	.	C	A	388.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:24:417,0,24
11	71719403	.	T	C	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
11	71719619	.	G	T	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:356,24,0
11	71724114	.	C	G	909.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.144;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=37.84;ReadPosRankSum=-0.144	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:26:938,26,0
11	71773289	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	71778664	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	71796929	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	71797939	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	71797968	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	71799668	.	A	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	71802351	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:130,9,0
11	71802359	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	71804118	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	71804154	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	71936149	.	G	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.845;DP=35;FS=10.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,7:35:99:192,0,1052
11	71997657	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
11	71997658	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
11	71997783	.	T	C	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,39
11	72001594	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
11	72003767	.	C	A	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
11	72365669	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	72401101	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	72401295	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,98
11	72401813	.	T	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
11	72402389	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
11	72402794	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	72402944	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	72403388	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
11	72404003	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	72404958	.	A	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	72407770	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,113
11	72407884	.	C	T	190.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:219,18,0
11	72408055	.	G	C	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.205;DP=24;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.205	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:515,0,355
11	72415329	.	G	A	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:260,0,330
11	72432985	.	G	A	161.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:190,0,26
11	72433098	.	A	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:149,0,232
11	72453095	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:84:108,0,84
11	72458196	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	72462316	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	72463435	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:81:81,0,107
11	72463462	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
11	72464470	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:157,0,29
11	72465526	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,115
11	72465877	.	T	C	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.112;DP=66;FS=2.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,13:66:99:318,0,1879
11	72467013	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	72467875	.	G	T	153.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:181,12,0
11	72470653	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,224
11	72472336	.	G	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,117
11	72472584	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
11	72473262	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	72474004	.	G	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
11	72474571	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	72474839	.	A	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,228
11	72478247	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	72478644	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,109
11	72479681	.	T	C	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:237,0,143
11	72479692	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.881;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.53;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,173
11	72482226	.	C	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:118,0,66
11	72483092	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:117,0,68
11	72483550	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
11	72483880	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
11	72490592	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:117,0,74
11	72491906	.	C	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:53:53,0,239
11	72496148	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	72498479	.	G	A	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:530,36,0
11	72501220	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	72501277	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	72505061	.	C	G	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
11	72528973	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
11	72528999	.	A	G	209.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:19:238,0,19
11	72529793	.	G	A	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:605,42,0
11	72531472	.	T	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:433,33,0
11	72532133	.	A	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
11	72532569	.	G	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
11	72532621	.	T	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
11	72532708	.	C	T	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
11	72533711	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	72537801	.	G	A	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-2.270;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=1.75;ReadPosRankSum=2.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,435
11	72548596	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
11	72691440	.	T	C	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
11	72705522	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	72911495	.	C	G	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:62:264,0,62
11	72916051	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	72923913	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	72924188	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	72924420	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	72928925	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	72929447	.	T	C	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:636,48,0
11	72930096	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	72930806	.	G	A	36.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:8:64,8,0
11	72933201	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	72934914	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	72936349	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	72936702	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	72944121	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	72945341	.	C	T	1115.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1144,81,0
11	72946308	.	T	A	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=1.704;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.782	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,10:33:99:317,0,828
11	72947934	.	G	A	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
11	72948978	.	A	G	872.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:901,63,0
11	72949172	.	G	A	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
11	72949251	.	G	A	611.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.062;DP=19;FS=10.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,16:19:72:640,0,72
11	72949747	.	C	T	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:571,45,0
11	72950838	.	C	T	647.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:676,48,0
11	72952400	.	A	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:140,0,354
11	72952456	.	T	C	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:57:308,0,57
11	72953343	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	73007854	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
11	73039288	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	73113736	.	T	C	832.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=-0.178;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=32.03;ReadPosRankSum=-0.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,22:26:99:861,0,101
11	73114742	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.175;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:152,0,588
11	73388499	.	G	A	733.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-1.068;DP=66;FS=14.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,22:66:99:762,0,1689
11	73388589	.	C	G	1507.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-1.174;DP=51;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=29.56;ReadPosRankSum=1.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,41:51:99:1536,0,265
11	73389741	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	73471761	.	C	A	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.685;DP=52;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,10:52:99:255,0,1597
11	73471778	.	A	G	31.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.397;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=0.68;ReadPosRankSum=2.432	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,5:47:60:60,0,1494
11	73473460	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	73498933	.	T	G	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
11	73543621	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	73581672	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,251
11	73583170	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	73584721	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:120,0,70
11	73585109	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,74
11	73585173	.	A	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
11	73586112	.	C	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:53:53,0,225
11	73586550	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	73587833	.	C	T	1261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.304;DP=42;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=30.04;ReadPosRankSum=0.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,34:42:99:1290,0,211
11	73638858	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	73639711	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	73639712	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	73679892	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	73680128	.	T	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:156,0,28
11	73683507	.	G	C	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:79,0,27
11	73689104	.	G	A	2099.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-2.024;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=28.00;ReadPosRankSum=2.366	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,54:75:99:2128,0,665
11	73785326	.	T	C	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:228,0,143
11	73796917	.	C	T	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:61:234,0,61
11	73842337	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	74044557	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
11	74045742	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	74046861	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	74046975	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
11	74047683	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
11	74049569	.	A	G	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
11	74053547	.	C	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
11	74109342	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	74202919	.	G	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:117,0,31
11	74203004	.	G	A	128.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:11:156,0,11
11	74203308	.	T	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,111
11	74204727	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	74207856	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	74306494	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	74329615	.	T	C	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.721	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:251,0,403
11	74340196	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	74353371	.	G	T	743.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:772,54,0
11	74527143	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	74530032	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	74531176	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	74546905	.	G	A	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
11	74548261	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	74549391	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
11	74550956	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	74551025	.	C	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
11	74553074	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	74554147	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	74678586	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
11	74709215	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	74720573	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=5.14;ReadPosRankSum=-1.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:95:95,0,378
11	74725789	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
11	75110589	.	A	G	428.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=-0.995;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,14:27:99:457,0,461
11	75116487	.	C	G	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
11	75118158	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	75120008	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	75122421	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	75124132	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
11	75126350	.	G	A	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
11	75127406	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:107,0,68
11	75129007	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,155
11	75129169	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:116,0,65
11	75130248	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	75133765	.	G	A	401.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-1.090;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=28.70;ReadPosRankSum=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:95:430,0,95
11	75141762	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	75145952	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	75167704	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	75274150	.	G	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:71,0,36
11	75277628	.	A	G	751.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:780,54,0
11	75277757	.	C	G	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.973;DP=37;FS=12.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=6.70;ReadPosRankSum=-1.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,9:37:99:276,0,1097
11	75277992	.	C	T	670.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-2.058;DP=40;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:699,0,769
11	75279846	.	C	T	581.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-1.346;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,17:45:99:610,0,1035
11	75282882	.	G	A	582.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-0.578;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,17:44:99:611,0,1010
11	75283253	.	A	G	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.653;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:402,0,203
11	75283653	.	C	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.117;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,6:33:99:151,0,1044
11	75283684	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.118;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:75:75,0,587
11	76073431	.	A	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
11	76096070	.	C	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
11	76099512	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	76099514	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	76099527	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	76100619	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	76153279	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	76153481	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	76250905	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	76257215	.	T	C	873.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:902,63,0
11	76267331	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	76421195	.	A	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
11	76473138	.	A	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
11	76474537	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	76475488	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	76475729	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	76476030	.	C	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
11	76476280	.	C	T	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
11	76476429	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	76477244	.	A	G	587.98	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:13:616,13,0
11	76477867	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	76478854	.	C	T	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
11	76479205	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
11	76479810	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	76480570	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	76488545	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	76495076	.	C	T	93.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:121,12,0
11	76495129	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
11	76495560	.	C	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
11	76495879	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
11	76496737	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
11	76497432	.	G	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
11	76500830	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
11	76501451	.	G	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
11	76501557	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
11	76501705	.	T	C	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
11	76501857	.	T	C	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
11	76504698	.	G	A	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
11	76504732	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	76505202	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	76507692	.	T	A	2133.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2162,150,0
11	76508843	.	T	C	1939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1968,135,0
11	76513377	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	76732746	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
11	76736724	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	76824078	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	76901927	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	77033699	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:27:395,27,0
11	77033708	.	A	C	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:395,27,0
11	77327743	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	77373471	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	77597501	.	T	C	689.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:718,48,0
11	77597504	.	C	G	689.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:718,48,0
11	77597755	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	77780117	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:55:55,0,199
11	77814573	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	77822566	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	77825034	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
11	77840006	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	77843719	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	77843729	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	77843738	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	77852875	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	77865936	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	77882393	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	77920563	.	G	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
11	77920863	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	77920930	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
11	77921527	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	77924870	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	77925233	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	77925273	.	T	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	77925520	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	77926769	.	A	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
11	77927995	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	77930138	.	T	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
11	77936166	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	77937800	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	82794631	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:118,0,64
11	82796666	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	82961124	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
11	82962986	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	82966169	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	82968708	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
11	82968952	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	82973004	.	C	T	1117.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1146,78,0
11	82996986	.	A	C	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:778,57,0
11	85195025	.	A	C	2078.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2107,144,0
11	85195075	.	T	C	3719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:3748,256,0
11	85195154	.	A	T	3043.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:3072,219,0
11	85195185	.	T	C	3044.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:3073,210,0
11	85195190	.	C	G	3044.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:3073,210,0
11	85195191	.	A	G	3044.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:3073,210,0
11	85195226	.	T	C	884.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,25:25:99:913,0,659
11	85195232	.	A	G	884.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=-0.088;DP=38;FS=15.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=23.28;ReadPosRankSum=-3.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,17:38:99:913,0,659
11	85195279	.	C	T	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
11	85195280	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
11	85423200	.	G	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	85429074	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	85430397	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	85431413	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	85435730	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	85436352	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	85436394	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	85436500	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	85436868	.	G	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
11	85447611	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
11	85456703	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
11	85692061	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	85725937	.	C	T	1132.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1161,81,0
11	85780073	.	G	T	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
11	86520632	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
11	86520752	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
11	86621755	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
11	86632570	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	86632817	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	86657520	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
11	86660612	.	C	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
11	86660886	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	86711494	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	87013438	.	G	A	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
11	87026380	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	87037680	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	87847018	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
11	87908448	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
11	87908563	.	G	A	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:352,27,0
11	88045583	.	A	G	523.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:552,39,0
11	88070858	.	A	G	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
11	88171234	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	89922423	.	C	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
11	89925179	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	89927176	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	89928611	.	T	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	89929249	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	89929392	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	89933910	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	89934182	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	89935586	.	G	T	603.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:632,45,0
11	89939448	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	89939569	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	89940852	.	A	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
11	89941327	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
11	89942062	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	89942645	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	89942655	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	89942659	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	89943221	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	89943420	.	A	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
11	89944964	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	89945381	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	89956206	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	92879172	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
11	92880194	.	T	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
11	92881392	.	A	T	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
11	92931056	.	G	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
11	92931057	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
11	93212161	.	A	G	73.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:101,9,0
11	93212245	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	93425159	.	C	A	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
11	93456715	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	93462102	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	93463666	.	C	A	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
11	93464175	.	A	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	93466866	.	G	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
11	93468796	.	T	C	148.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:177,0,26
11	93476236	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
11	93476350	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,192
11	93476627	.	G	C	259.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:288,24,0
11	93476860	.	G	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
11	93478133	.	T	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
11	93478342	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	93481965	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	93491020	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	93498833	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	93499247	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	93517874	.	C	G	244.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:273,21,0
11	93517886	.	G	C	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
11	93531872	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	93792937	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	93792947	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:86,6,0
11	93800300	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	93802359	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	93862309	.	G	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:203,0,143
11	93862378	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,101
11	93862493	.	A	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
11	93918350	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
11	94150033	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	94150084	.	T	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
11	94150124	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
11	94150140	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	94150371	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	94150790	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	94231257	.	C	G	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
11	94533373	.	C	T	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
11	94542667	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	94800144	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	94802776	.	G	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
11	94802952	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	94863186	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	94863865	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	94864292	.	C	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
11	94865334	.	T	C	135.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:164,15,0
11	94865454	.	T	G	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
11	95503636	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	95512060	.	A	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
11	95554311	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	95555088	.	G	A	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
11	95560371	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	95560473	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	95560853	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	95564259	.	A	G	703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:732,51,0
11	95565288	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	95565789	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	95566886	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	95567905	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
11	95580926	.	G	A	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
11	95583895	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:55:55,0,271
11	95657111	.	T	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
11	96126361	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	100555858	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	100847050	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
11	100847069	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:155,0,66
11	100847484	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	100860599	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	100863319	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
11	100891754	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	100894166	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	100896345	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
11	100900766	.	A	G	629.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.502;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:658,0,427
11	100902994	.	T	C	1437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1466,102,0
11	100905027	.	C	T	51.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=-0.336;DP=30;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:80:80,0,1023
11	100905297	.	G	A	1250.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1279,90,0
11	100905709	.	T	G	884.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:913,63,0
11	100905733	.	A	T	856.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:885,63,0
11	100907998	.	C	T	989.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1018,69,0
11	100909186	.	C	T	572.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-2.356;DP=32;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.207	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:601,0,617
11	100909809	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
11	100909991	.	T	C	1528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1557,108,0
11	100910469	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	100910995	.	T	C	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
11	100911508	.	T	C	282.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:311,24,0
11	100911548	.	A	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
11	100911908	.	C	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:141,0,313
11	100912016	.	C	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
11	100912230	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	100912252	.	A	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
11	100912561	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	100913448	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
11	100913548	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	100913849	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	100913901	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	100914129	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	100915523	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	100922202	.	G	A	773.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.211;DP=37;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,21:37:99:802,0,588
11	100933412	.	C	A	1033.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.667;DP=37;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=27.94;ReadPosRankSum=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,27:37:99:1062,0,307
11	100969147	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	100991778	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	100993072	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	100993690	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	100994866	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
11	100996306	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,115
11	100998076	.	T	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:60:60,0,69
11	100998771	.	C	G	612.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-1.996;DP=29;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,19:29:99:641,0,328
11	101000501	.	A	G	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
11	101018888	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,321
11	101080125	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	101080126	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	101090720	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	101105935	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	101112147	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
11	101216460	.	A	G	11.13	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:26:39,0,26
11	101254930	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	101254992	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	101255874	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	101255918	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
11	101298366	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	101333529	.	C	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	101378569	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	101400552	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	101400772	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	101405879	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
11	101405885	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	101410162	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	101410756	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	101413951	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	101414781	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	101419488	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	101467821	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:75,0,35
11	101981277	.	T	C	1098.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1127,81,0
11	102043400	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	102045341	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	102045367	.	G	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
11	102045643	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	102047215	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:32:39,0,32
11	102055452	.	A	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	102080228	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	102082999	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	102083069	.	A	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
11	102083695	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	102090901	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	102091632	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	102094889	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
11	102095335	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	102096282	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
11	102096416	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
11	102097609	.	T	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
11	102098354	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	102099123	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	102099495	.	G	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	102101583	.	C	T	958.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-1.806;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=25.23;ReadPosRankSum=1.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,26:38:99:987,0,397
11	102101709	.	T	C	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.681;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:383,0,750
11	102101946	.	T	A	1633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1662,114,0
11	102103600	.	G	A	1116.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1145,78,0
11	102157890	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	102267934	.	C	T	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.955;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.608	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,10:49:99:295,0,1556
11	102268603	.	A	T	759.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.963;DP=44;FS=1.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,21:44:99:788,0,854
11	102666776	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	102666781	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	102767711	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	102767716	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	104358575	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	104358583	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	104819327	.	T	C	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
11	105879005	.	G	A	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
11	105950806	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
11	107374531	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
11	107420530	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	107779403	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	107879887	.	G	C	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
11	107917087	.	A	G	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
11	107977489	.	G	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
11	108044091	.	T	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	108183167	.	A	G	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
11	108237010	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	108380335	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	108384207	.	C	T	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
11	108464209	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	111162691	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	111164651	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	111165940	.	G	T	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
11	111166504	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	111167557	.	A	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
11	111167776	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
11	111167792	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	111168767	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
11	111171398	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	111172179	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
11	111172403	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	111173290	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	111595166	.	G	C	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
11	111597442	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	111598325	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	111724133	.	C	T	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
11	111795085	.	C	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
11	111892515	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	111892527	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
11	111896324	.	C	T	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:577,42,0
11	111908162	.	T	C	347.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:376,30,0
11	111916647	.	G	A	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
11	111933678	.	A	G	742.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:771,54,0
11	111934507	.	G	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
11	111955502	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	111956989	.	C	A	595.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:624,45,0
11	111964039	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
11	111966307	.	T	C	881.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:910,63,0
11	112014152	.	C	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	112065434	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	113194168	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	113197243	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	113235419	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	113256330	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	113669205	.	C	G	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
11	113670052	.	T	A	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
11	113679119	.	C	T	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
11	115044850	.	C	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	116648917	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	116654435	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	117039325	.	T	G	669.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:698,48,0
11	117039797	.	G	A	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
11	117053165	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
11	117067699	.	C	T	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
11	117068504	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
11	117068977	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	117069061	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
11	117070857	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	117070895	.	C	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
11	117071070	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	117071449	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	117071760	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	117071762	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	117071970	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	117086551	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	117094413	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	117094491	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	117156552	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
11	117157329	.	C	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
11	117157378	.	A	G	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
11	117159083	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,122
11	117159878	.	A	T	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
11	117160347	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
11	117252489	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	117267884	.	A	G	277.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:306,24,0
11	117281566	.	C	T	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
11	117282800	.	G	T	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
11	117283091	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	117283676	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
11	117771397	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	117771888	.	A	C	231.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:260,21,0
11	117772021	.	G	A	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:820,57,0
11	117780744	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	117780919	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	117781435	.	A	G	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
11	117988082	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	118098041	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
11	118099617	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
11	118100176	.	T	G	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
11	118100411	.	G	C	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
11	118107805	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
11	118110977	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
11	118125077	.	T	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
11	118125625	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
11	118125672	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	118267190	.	G	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-2.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:181,0,321
11	118267592	.	G	T	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:216,0,136
11	118272277	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:115,0,30
11	118393396	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	118405343	.	G	A	249.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:278,21,0
11	118502121	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	118618620	.	C	G	210.82	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:19:239,19,0
11	118618837	.	A	C	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:449,33,0
11	118619423	.	C	T	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
11	118620697	.	T	C	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:690,51,0
11	118621495	.	G	C	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:690,48,0
11	118622245	.	G	A	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
11	118622744	.	G	A	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:445,33,0
11	118625068	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	118772012	.	G	T	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=1.734;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,945
11	118772013	.	A	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.734;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.917	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,945
11	118796182	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
11	118796361	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	118796365	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	118796415	.	T	G	235.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:264,21,0
11	118796431	.	A	G	159.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:188,15,0
11	118862664	.	A	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	118875436	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	118875659	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
11	118875689	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	118875690	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	118880584	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
11	118880809	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,117
11	118889114	.	A	G	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
11	118897789	.	C	G	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=1.653;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:167,0,377
11	118900410	.	T	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
11	118901166	.	C	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
11	118901319	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	118915944	.	A	G	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:744,51,0
11	118919206	.	T	C	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:837,57,0
11	118921788	.	G	T	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.448;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:351,0,612
11	118925341	.	G	A	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:661,48,0
11	118927907	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	118947634	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
11	118955679	.	C	T	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:525,39,0
11	118962230	.	G	T	1237.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1266,90,0
11	118978319	.	C	T	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
11	118978411	.	G	C	231.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:260,21,0
11	118986630	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
11	118986659	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
11	118994357	.	T	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	118995325	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	119005088	.	C	T	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:617,42,0
11	119045374	.	C	T	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:196,0,68
11	119050906	.	G	A	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:337,27,0
11	119170607	.	C	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:114,0,57
11	119172406	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	119174147	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	119174576	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	119175075	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	119175422	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	119176398	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	119176499	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	119177139	.	T	G	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
11	119178050	.	C	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
11	119179678	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	119179679	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	119180316	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
11	119181170	.	T	C	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
11	119205735	.	T	C	771.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=4.559;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=34.08;ReadPosRankSum=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:32:800,32,0
11	119205830	.	A	G	718.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:747,51,0
11	119206375	.	G	A	577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:606,42,0
11	119600410	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
11	119603867	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	119999191	.	A	G	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
11	120099658	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
11	120100520	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
11	120100597	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	120203652	.	G	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
11	120337960	.	C	G	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=1.368;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.216	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:318,0,426
11	120959225	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	120959463	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	120959800	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
11	121178302	.	A	C	683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:712,51,0
11	121367626	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	121403229	.	T	C	246.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:275,21,0
11	121437819	.	C	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
11	121448090	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	121475922	.	T	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
11	121501238	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	121501755	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
11	121502450	.	A	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
11	121502745	.	C	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
11	121502768	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	121502894	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	123596055	.	C	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
11	123596703	.	A	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
11	123600475	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
11	123609932	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	123611063	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	124664976	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	124678334	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	124857708	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
11	124863136	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	124967487	.	T	A	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
11	124972208	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	124972518	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:86,6,0
11	124972522	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	124972691	.	T	C	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
11	125439423	.	T	C	1179.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1208,87,0
11	125479363	.	G	A	786.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:815,60,0
11	125479496	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	125479833	.	C	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	125480062	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	125480819	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	125480884	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
11	125512619	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	125525195	.	A	G	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
11	125526139	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,318
11	125760297	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	125766044	.	C	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
11	125766173	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
11	125766204	.	G	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
11	125766207	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
11	125830970	.	A	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
11	126045328	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
11	126072294	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
11	126072688	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
11	126076824	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
11	126078501	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	126130232	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	126133208	.	C	A	1096.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1125,78,0
11	126139100	.	T	C	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:652,48,0
11	126139313	.	T	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
11	126147713	.	C	G	974.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1003,72,0
11	126163691	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
11	126164349	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
11	126165757	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
11	126166577	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	126174164	.	C	T	562.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:591,45,0
11	126176578	.	G	A	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:700,48,0
11	126211520	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
11	126216485	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,181
11	126219028	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:75,0,129
11	126219036	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,129
11	126219092	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:80:81,0,80
11	126219093	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:80:81,0,80
11	126250774	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
11	126276368	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
11	128770474	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	128771271	.	T	C	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:116,0,25
11	128813031	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	128823766	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	128835758	.	C	T	421.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=33.37;ReadPosRankSum=-1.738	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:26:450,26,0
11	128842243	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	128842251	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
11	128868239	.	T	C	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
11	129106492	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	129150067	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
11	129321486	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,109
11	129771107	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
11	130008296	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	130009306	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
11	130029661	.	T	C	146.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
11	130029793	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-0.796;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:179,0,426
11	130068491	.	G	C	1421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1450,102,0
11	130077023	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	130080017	.	C	T	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:873,63,0
11	130080037	.	C	G	1102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1131,78,0
11	130080065	.	G	A	1330.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1359,96,0
11	130099496	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	130157642	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	130737281	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	130738848	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	130738946	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	130742630	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	130742812	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
11	130743926	.	T	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
11	130744473	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
11	130744490	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	130744670	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
11	130744977	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	130745045	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	130747231	.	C	G	606.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:635,45,0
11	130747386	.	C	G	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
11	130748131	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
11	130750642	.	A	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
11	130751308	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	130759987	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	130759994	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	130759995	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	130760562	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	130764526	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	130776613	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
11	130780015	.	C	T	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
11	130784754	.	C	G	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
11	130784971	.	C	G	286.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:315,24,0
11	130786345	.	C	A	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
11	131747183	.	A	G	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
11	131757209	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
11	131762953	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
11	133739799	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	133739801	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	133739808	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	133769699	.	A	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
11	133771179	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
11	133772854	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
11	133776948	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	133786824	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	133788992	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	133797581	.	A	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
11	133803138	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	133804390	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	133805585	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
11	133811396	.	T	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
11	133812299	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
11	133812526	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	133813168	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
11	133814191	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
11	134023728	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
11	134025501	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
11	134025568	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
11	134026088	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
11	134038892	.	G	A	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:46:285,0,46
11	134047243	.	T	C	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
11	134062764	.	C	T	765.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:794,57,0
11	134093257	.	A	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
11	134097161	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
11	134105030	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
11	134106675	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
11	134117015	.	T	C	850.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:879,63,0
11	134128313	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
11	134130174	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
11	134130189	.	C	T	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
12	78177	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	79868	.	G	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,146
12	79885	.	C	G	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:226,0,189
12	82332	.	G	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,270
12	82343	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:92:92,0,430
12	83011	.	T	C	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:246,0,133
12	83012	.	C	G	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:246,0,133
12	83263	.	C	T	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:272,0,145
12	83360	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,178
12	83560	.	G	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,191
12	83603	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,180
12	83750	.	C	T	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.581;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=14.27;ReadPosRankSum=-2.388	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:228,0,650
12	83757	.	G	C	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.092;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:228,0,650
12	83801	.	T	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:147,0,570
12	83802	.	G	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:147,0,570
12	83865	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:181,0,245
12	83979	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.28;ReadPosRankSum=-1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:101,0,236
12	84096	.	C	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:125,0,295
12	84205	.	C	T	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,395
12	84243	.	C	T	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.202;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:244,0,242
12	84286	.	G	T	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:306,0,702
12	84296	.	G	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:306,0,702
12	84343	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:147,0,176
12	84433	.	C	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,183
12	84552	.	G	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:181,0,207
12	84568	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,312
12	84668	.	T	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:87:87,0,1096
12	84674	.	T	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:87:87,0,1096
12	84676	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:320,0,270
12	84716	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,282
12	84755	.	T	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:147,0,195
12	84772	.	T	A	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:87:87,0,339
12	84856	.	G	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,104
12	84871	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=17.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,226
12	85105	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:78,0,68
12	90902	.	C	T	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-2.688;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=8.05;ReadPosRankSum=2.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:165,0,445
12	387464	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	388657	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
12	406292	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:149,0,185
12	427575	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,231
12	551295	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
12	671243	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:109,0,30
12	752679	.	C	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:66,0,37
12	862280	.	G	A	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:181,0,64
12	862989	.	T	C	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
12	939302	.	A	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.041;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:161,0,616
12	971291	.	C	T	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:297,0,321
12	987482	.	G	A	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.885;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.984	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,9:28:99:289,0,743
12	990912	.	A	C	937.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:966,66,0
12	994487	.	G	C	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:645,45,0
12	998365	.	G	T	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
12	1017197	.	C	T	1130.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1159,81,0
12	1019944	.	G	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
12	1020660	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	1021188	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	1021557	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
12	1022452	.	C	T	90.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:119,0,27
12	1025332	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
12	1100450	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	1100461	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
12	1137217	.	A	G	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:184,0,185
12	1601179	.	C	T	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=2.219;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.31;ReadPosRankSum=-2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,186
12	1601722	.	C	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:156,0,290
12	1604490	.	A	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,148
12	1895373	.	T	G	1325.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1354,93,0
12	1896880	.	C	T	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-0.157;DP=39;FS=17.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,8:39:99:240,0,1210
12	1896956	.	C	T	850.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.547;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,23:33:99:879,0,337
12	1954199	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	1995042	.	A	G	87.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:22:116,0,22
12	1995622	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	2950504	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	2951800	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	2951837	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	2960638	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:77,6,0
12	2960648	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
12	2964735	.	G	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:121,0,31
12	2965549	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
12	2965808	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	2965831	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
12	2966098	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:72,0,35
12	2968169	.	A	G	522.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.166;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.124	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:551,0,493
12	2968458	.	T	C	1438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1467,102,0
12	2968988	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:115,0,69
12	2977228	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	2980640	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	2994134	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
12	2997397	.	G	A	659.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.541;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:688,0,471
12	3043721	.	C	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,260
12	3049631	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,159
12	3056427	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	3124336	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	3129425	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	3150174	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,73
12	3150305	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
12	3150988	.	T	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	3151024	.	T	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
12	3151456	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
12	3152971	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,75
12	3153343	.	A	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:192,0,28
12	3153468	.	G	A	134.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:163,0,21
12	3364800	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	3369318	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	3393419	.	C	T	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
12	3393503	.	G	A	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:652,48,0
12	3425707	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	3425714	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	3427655	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	3427751	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	3427780	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	3428343	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	3437756	.	C	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
12	3439277	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	3716852	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
12	3720945	.	A	T	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
12	3721372	.	G	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
12	3722260	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
12	3722364	.	T	C	491.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=31.14;ReadPosRankSum=1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,13:14:7:519,7,0
12	3722489	.	C	T	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
12	3722575	.	A	G	134.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.26	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:20:163,0,20
12	3722577	.	A	G	134.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=8;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:163,0,20
12	3722804	.	C	T	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
12	3722833	.	A	G	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:39:564,39,0
12	3722841	.	G	A	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:564,39,0
12	3723673	.	C	T	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
12	3724583	.	T	C	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:176,0,178
12	3747430	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=15.88;ReadPosRankSum=-1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,191
12	3918872	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	3919669	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	3920052	.	G	C	158.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:187,0,27
12	4461485	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
12	4463204	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	4464458	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	4465901	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	4668862	.	C	T	735.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:764,54,0
12	4717794	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	4736631	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	4736677	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	4736690	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	4797002	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	5282667	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	5477030	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	5516194	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	5517865	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	5518528	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	5520555	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	5520560	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	5674754	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6421495	.	G	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
12	6427052	.	C	T	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
12	6433289	.	C	T	85.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:114,0,25
12	6440009	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6450945	.	T	C	1215.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1244,87,0
12	6457062	.	T	C	1639.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1668,117,0
12	6458274	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	6465970	.	A	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:148,0,99
12	6466657	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,244
12	6466658	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,244
12	6467446	.	C	A	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:85:85,0,231
12	6467961	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,119
12	6468515	.	T	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:173,0,110
12	6469671	.	G	T	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,189
12	6470260	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,154
12	6470761	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
12	6495275	.	C	A	387.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.357;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.790	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,13:40:99:416,0,992
12	6500105	.	T	G	355.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=-0.759;DP=41;FS=7.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,12:41:99:384,0,1165
12	6519170	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6519176	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6550091	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6552516	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6552743	.	C	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:395,27,0
12	6552751	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
12	6552797	.	A	G	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
12	6552835	.	A	G	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:426,30,0
12	6556686	.	T	A	117.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:146,0,27
12	6557192	.	A	T	494.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=0.472;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=21.51;ReadPosRankSum=-0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:523,0,335
12	6557819	.	T	C	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.079;DP=16;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:41:41,0,581
12	6558846	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	6558847	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	6558849	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	6560573	.	G	T	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:219,0,64
12	6562285	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=29.54;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:235,0,181
12	6562293	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:235,0,181
12	6562753	.	A	G	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
12	6562810	.	A	G	283.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:312,24,0
12	6562823	.	C	T	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.262;QD=23.16;ReadPosRankSum=-2.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:283,0,99
12	6562836	.	G	A	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:94:380,0,94
12	6569983	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	6570163	.	C	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
12	6570966	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	6571699	.	G	A	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
12	6572048	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
12	6572191	.	T	C	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
12	6572549	.	C	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
12	6572561	.	A	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
12	6573061	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:153,0,70
12	6573716	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,156
12	6573749	.	C	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:183,0,131
12	6575044	.	G	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
12	6579757	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
12	6602367	.	C	T	1057.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=-1.709;DP=35;FS=2.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=30.22;ReadPosRankSum=1.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,27:35:99:1086,0,193
12	6619284	.	C	G	721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:750,54,0
12	6619847	.	G	C	556.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=-0.882;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:585,0,392
12	6631169	.	C	A	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-0.556;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:373,0,535
12	6633543	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	6635274	.	G	A	448.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=1.179;DP=26;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:477,0,473
12	6637941	.	C	T	398.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-0.461;DP=38;FS=13.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,13:37:99:427,0,913
12	6639088	.	A	G	1002.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1031,72,0
12	6640976	.	A	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.057;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:63:63,0,473
12	6643991	.	C	G	613.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=-1.134;DP=67;FS=7.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=9.16;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,19:67:99:642,0,1885
12	6644256	.	T	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:61:61,0,120
12	6644696	.	T	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:64:161,0,64
12	6644722	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,109
12	6645565	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
12	6646320	.	T	C	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.532;DP=60;FS=8.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.428;QD=3.18;ReadPosRankSum=2.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,9:60:99:219,0,2102
12	6647109	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=1.079;DP=87;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:76,11:87:99:227,0,3092
12	6683287	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	6707526	.	G	A	1099.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.355;DP=45;FS=7.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=24.44;ReadPosRankSum=-0.233	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,31:45:99:1128,0,433
12	6709059	.	G	A	985.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.234;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=24.04;ReadPosRankSum=-0.234	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,27:41:99:1014,0,486
12	6711147	.	C	A	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:35:464,35,0
12	6715593	.	A	G	452.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.949;DP=20;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:481,0,170
12	6758921	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:81,0,24
12	6761893	.	G	A	739.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-2.750;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=24.66;ReadPosRankSum=2.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,20:30:99:768,0,337
12	6764831	.	G	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
12	6840209	.	G	A	654.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.787;DP=29;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=22.58;ReadPosRankSum=-0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,18:29:99:683,0,397
12	6840371	.	G	T	488.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.732;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.263	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:517,0,360
12	6862259	.	G	C	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.255;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:372,0,543
12	7047129	.	G	C	396.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-1.688;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:425,0,568
12	7047143	.	C	A	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.134;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:475,0,306
12	7051068	.	G	A	464.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.109;DP=21;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:493,0,292
12	7052973	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
12	7053022	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:96:225,0,96
12	7053085	.	A	G	366.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=28.21;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:98:395,0,98
12	7053149	.	A	C	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:353,0,162
12	7053362	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
12	7055860	.	T	C	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
12	7056733	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,111
12	7056765	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,230
12	7057437	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
12	7065635	.	T	C	731.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:760,54,0
12	7076236	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	7078028	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
12	7079215	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
12	7080212	.	T	C	959.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:65:988,65,0
12	7259929	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	7259938	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	7259939	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	7283134	.	T	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,117
12	7309471	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	7309473	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	7342343	.	C	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:178,0,100
12	7362960	.	G	A	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-1.709;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:210,0,332
12	7363574	.	C	G	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:222,0,265
12	8185853	.	A	C	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:179,0,141
12	8186361	.	G	A	189.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:218,0,25
12	8197424	.	C	G	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:82:270,0,82
12	8206167	.	A	G	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
12	8850706	.	G	T	295.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:14:324,0,14
12	8926011	.	T	C	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:702,51,0
12	8932201	.	T	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
12	9004512	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	9028872	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	9086898	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,107
12	9093001	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:104,0,200
12	9095268	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
12	9381254	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	9413442	.	C	T	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
12	9413457	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	9448920	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	9452017	.	C	A	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.881;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:187,0,129
12	9462709	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	9462984	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
12	9464133	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	9464748	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	9465134	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:120,0,33
12	9466099	.	C	T	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
12	9466194	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,613
12	9466195	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,613
12	9556999	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:177,12,0
12	9557014	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
12	9557020	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:177,12,0
12	9557029	.	T	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
12	9557062	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
12	9559047	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	9564220	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	9564727	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
12	9570798	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	9570971	.	G	A	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
12	9571599	.	C	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
12	9573424	.	G	A	118.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:147,14,0
12	9573724	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	9574002	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	9574042	.	C	A	483.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-2.293;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=32.25;ReadPosRankSum=2.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:35:512,0,35
12	9585328	.	C	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,238
12	9600752	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
12	9801373	.	A	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:99:277,0,213
12	9801382	.	T	C	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:126,0,560
12	9809178	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	9809197	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
12	9809721	.	G	T	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
12	9810000	.	C	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:158,0,71
12	9810451	.	A	T	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
12	9811308	.	A	G	54.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:80,0,1
12	9811948	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
12	9814071	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	9830698	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	9832421	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
12	9832822	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	9832980	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	9848883	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:68,0,36
12	9849275	.	C	T	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:196,0,27
12	10271055	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
12	10365574	.	C	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:236,0,159
12	10375302	.	C	A	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
12	10741246	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
12	10758334	.	A	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:122,0,33
12	10758703	.	A	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:233,0,185
12	10763236	.	G	C	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.354;DP=35;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:515,0,828
12	10782115	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	10852106	.	T	C	714.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.186;DP=27;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,19:27:99:743,0,262
12	10861760	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	10864204	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	10864699	.	G	A	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:80,0,27
12	10869062	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
12	10875895	.	T	G	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
12	10994816	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	10999708	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	11004051	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	11091693	.	T	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:74,0,35
12	11103588	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
12	11116545	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	11117159	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:73,0,72
12	11117432	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	11118418	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	11119119	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	11119137	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	11120139	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	11121417	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	11123728	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
12	11133907	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	11160459	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	11183406	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	11183421	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	11183427	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	11190553	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	11190571	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	11199734	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
12	11236974	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	11236987	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	11323848	.	G	A	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:255,0,835
12	11323851	.	A	G	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:255,0,835
12	11323939	.	G	C	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:344,0,174
12	11323994	.	G	A	450.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-0.866;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:479,0,173
12	11324176	.	C	A	706.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=1.328;DP=28;FS=10.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=25.24;ReadPosRankSum=-1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:735,0,315
12	11324344	.	C	T	648.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.379;DP=23;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=28.21;ReadPosRankSum=-0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,18:23:99:677,0,145
12	11324355	.	G	A	1033.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:72:1062,72,0
12	11324363	.	T	C	1033.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:72:1062,72,0
12	11324364	.	G	A	642.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-2.011;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=32.14;ReadPosRankSum=1.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,17:20:61:671,0,61
12	11324401	.	C	G	889.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:918,63,0
12	11324559	.	C	G	1232.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1261,87,0
12	11324750	.	G	A	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.298	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:313,0,571
12	11325000	.	G	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:162,0,61
12	11325804	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
12	11326071	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	11326315	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	11326842	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	11333542	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	11654074	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	11992168	.	G	A	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:196,0,24
12	12044195	.	T	C	225.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:254,21,0
12	12045264	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	12046813	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	12047416	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	12047429	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	12047618	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	12047773	.	G	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
12	12240199	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	12269365	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:133,0,158
12	12270290	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	12271739	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:93:151,0,93
12	12272054	.	T	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
12	12272466	.	C	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,149
12	12273437	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,262
12	12301898	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	12334006	.	G	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,178
12	12419719	.	G	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,145
12	12482448	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
12	12482803	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	12483275	.	G	A	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:661,45,0
12	12483713	.	A	G	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:530,36,0
12	12618715	.	T	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
12	12618897	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:116,0,63
12	12619047	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,149
12	12619236	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:80:81,0,80
12	12619237	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:80:81,0,80
12	12620172	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	12620746	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
12	12622940	.	G	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:60:146,0,60
12	12624580	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	12627410	.	G	A	486.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.247;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.247	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,14:32:99:515,0,648
12	12627658	.	C	G	679.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.142;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=28.32;ReadPosRankSum=2.275	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,19:24:99:708,0,136
12	12628219	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:122,0,526
12	12628565	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.482;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:261,0,346
12	12629542	.	T	C	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.986;ClippingRankSum=-1.902;DP=19;FS=13.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:208,0,440
12	12796872	.	T	C	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:235,0,171
12	12814818	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
12	12870695	.	T	C	1192.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1221,93,0
12	12967127	.	C	T	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.534;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.137	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:424,0,602
12	13097444	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	13097446	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	13128058	.	T	C	1378.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1407,96,0
12	13133333	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
12	13153773	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	13154077	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	13154790	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	13154911	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	13156016	.	C	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
12	13221606	.	T	C	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
12	13369196	.	C	T	245.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:274,0,18
12	14577892	.	A	T	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.08;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:269,0,102
12	14652172	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,352
12	14653867	.	C	T	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:198,0,61
12	14688644	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	14919997	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
12	14920235	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
12	14929872	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	14956331	.	C	T	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.616;DP=21;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:285,0,457
12	14956360	.	T	G	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.792;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:244,0,498
12	15034996	.	T	A	3097.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3126,214,0
12	15035081	.	T	C	740.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.121;DP=78;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,23:78:99:769,0,2109
12	15038788	.	C	T	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-1.192;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:276,0,945
12	15081897	.	A	C	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:657,45,0
12	15095558	.	C	G	605.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-1.735;DP=17;FS=3.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=30.54;ReadPosRankSum=1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:6:633,6,0
12	15103605	.	A	G	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:531,39,0
12	15773651	.	C	G	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
12	15808720	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
12	15808723	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:176,12,0
12	15809664	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	16185932	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	16500564	.	G	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:143,0,208
12	16502544	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	16505296	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	16505515	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	16505599	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	16510079	.	T	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	16513047	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	16513161	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	16594878	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	18918267	.	A	G	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
12	19713751	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	19795921	.	A	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
12	19795926	.	A	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
12	19795931	.	C	T	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
12	20704961	.	C	T	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
12	21621891	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,74
12	21623122	.	T	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=1.57;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:47:47,0,378
12	21634067	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	21654407	.	G	A	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:205,0,412
12	21654469	.	T	G	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:285,0,209
12	21654831	.	G	T	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:257,0,326
12	21663784	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	21669027	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:95:95,0,397
12	21669188	.	T	C	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:222,0,230
12	21669650	.	A	G	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
12	21669819	.	G	A	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
12	21669855	.	T	G	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:26:343,26,0
12	21669996	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,101
12	21670410	.	C	A	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:297,0,347
12	21797029	.	A	G	1314.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1343,93,0
12	22161988	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	22204158	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	22602796	.	A	G	606.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:635,45,0
12	22819523	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	22839736	.	G	A	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
12	25335457	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	25358650	.	A	T	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:84:84,0,391
12	25358828	.	T	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,250
12	25358943	.	T	C	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:125,0,217
12	25359328	.	A	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:64:64,0,219
12	25359841	.	T	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:135,0,279
12	25360138	.	T	C	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
12	25361091	.	T	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
12	25362217	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.538;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:79:79,0,516
12	25362465	.	G	A	470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:499,36,0
12	25362552	.	A	C	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:221,0,193
12	25368462	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
12	25538885	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	25957785	.	G	A	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
12	26222745	.	A	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	26223438	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	26225059	.	T	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
12	26225404	.	C	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
12	26384555	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:55:62,0,55
12	26490090	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	26490349	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.181;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.80;ReadPosRankSum=2.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:235,0,158
12	26491475	.	T	C	124.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:153,0,23
12	26491838	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,157
12	26732987	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:150,0,69
12	26733062	.	T	C	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:94:345,0,94
12	26784850	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:42:78,0,42
12	26809316	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
12	26810777	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
12	26810816	.	T	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,118
12	26810826	.	C	T	102.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=0;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=0.00;MQ0=0	GT:GQ:PL	1/1:8:130,8,0
12	26810829	.	C	G	102.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=0;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=0.00;MQ0=0	GT:GQ:PL	1/1:8:130,8,0
12	26835596	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,147
12	26868322	.	T	C	50.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:79,0,22
12	27064232	.	C	T	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.733;DP=18;FS=13.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=13.93;ReadPosRankSum=-1.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:279,0,378
12	27118613	.	C	A	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
12	27124739	.	C	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
12	27124876	.	T	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
12	27151680	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	27181513	.	T	G	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.779;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:202,0,221
12	27181799	.	G	A	353.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=34.06;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:10:20:382,20,0
12	27184709	.	G	T	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
12	27187635	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	27187636	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	27191710	.	T	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
12	27286542	.	C	G	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:63:237,0,63
12	27470866	.	G	A	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:527,36,0
12	27476545	.	A	G	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.228;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:423,0,326
12	27788021	.	G	A	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:163,0,380
12	27788786	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	27788795	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	27790064	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	27799082	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	27799083	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	27800746	.	G	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
12	27845924	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:149,0,228
12	27939007	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	27949224	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
12	27952620	.	T	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:233,0,62
12	27952633	.	C	T	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:64:271,0,64
12	27954507	.	T	C	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:650,45,0
12	27954972	.	G	A	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
12	27954975	.	C	T	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
12	27955296	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,143
12	27955841	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	28412372	.	G	A	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.811;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:210,0,269
12	28605426	.	G	A	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:555,42,0
12	29434340	.	C	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,116
12	29486415	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	29486745	.	T	C	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.993	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:301,0,246
12	29491368	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:190,0,28
12	29491528	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	29521193	.	A	G	772.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-1.120;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=24.93;ReadPosRankSum=0.232	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,21:31:99:801,0,343
12	29546119	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	30782301	.	A	G	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:222,0,371
12	30782402	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.54;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,157
12	30782492	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:146,0,247
12	30782535	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,179
12	30782598	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.40;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:189,0,261
12	30782646	.	A	C	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-0.452;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:205,0,305
12	30783184	.	C	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.194;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.130;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:187,0,299
12	30783546	.	G	T	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=1.709;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=12.12;ReadPosRankSum=-1.827	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:210,0,358
12	30823971	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,283
12	30862653	.	T	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,186
12	30868002	.	C	T	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
12	30881809	.	T	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
12	30906358	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
12	31167948	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	31167954	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	31226835	.	T	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,262
12	31226934	.	C	T	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-1.076;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:85:85,0,511
12	31237978	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=1.031;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:106,0,475
12	31242314	.	T	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
12	31242440	.	A	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:308,0,168
12	31242718	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,272
12	31242725	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:156,0,272
12	31247421	.	G	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
12	31249861	.	C	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.835	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:137,0,315
12	31253785	.	G	A	42.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:71,0,26
12	31254752	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	31256075	.	G	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:121,0,108
12	31256164	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
12	31257695	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:98:110,0,98
12	31272041	.	C	A	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
12	31821111	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	32125196	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	32127809	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	32127818	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	32134240	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	32134638	.	T	C	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
12	32134815	.	G	A	247.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:16:276,0,16
12	32134943	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
12	32135441	.	T	C	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
12	32137447	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:101,0,184
12	32137512	.	C	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,232
12	32138924	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	32139418	.	T	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
12	32144856	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	32146729	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	32552504	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	32552769	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
12	32735236	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,195
12	32764184	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	32854366	.	A	C	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=-1.699;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=9.24;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:176,0,411
12	32875406	.	A	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=20.04;ReadPosRankSum=-0.228	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:429,0,328
12	32890343	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	32890685	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	32890912	.	T	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,101
12	32896365	.	G	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.577;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,5:25:99:150,0,1457
12	32896366	.	A	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.853;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:150,0,1457
12	32896615	.	C	G	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:166,0,504
12	32897088	.	A	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:80:80,0,409
12	32897586	.	G	A	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:172,0,398
12	32908237	.	C	A	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.685;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:146,0,438
12	32908518	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.702;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:193,0,458
12	32944162	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,147
12	32944414	.	G	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,112
12	32944546	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:191,0,180
12	32945107	.	G	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:192,0,102
12	33047498	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	34175508	.	T	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
12	34180221	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
12	34372624	.	A	C	1513.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,38:38:99:1542,0,216
12	34372673	.	T	C	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=8.80	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,9:9:99:213,0,1576
12	34372675	.	G	A	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=8.80	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,9:9:99:213,0,1576
12	38715965	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	39687754	.	T	C	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:344,0,170
12	39687989	.	T	C	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-1.632;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.501	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:434,0,117
12	39710473	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	40150923	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	40151546	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
12	40152438	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	40152900	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
12	40499639	.	G	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:76,0,64
12	40713834	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	40713901	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	40922091	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	40922104	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	42476613	.	A	C	88.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:117,0,27
12	42478413	.	G	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	42479450	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
12	42481443	.	A	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,99
12	42481732	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
12	42719890	.	A	G	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=20.85;ReadPosRankSum=-0.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:341,0,207
12	42770408	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	42837131	.	T	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,107
12	42838807	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	42839836	.	A	C	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
12	42840714	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:227,0,171
12	42840978	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
12	44054718	.	C	T	46.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:75,0,27
12	44113147	.	C	G	216.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:245,0,21
12	44113667	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
12	44114311	.	A	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	44115989	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,173
12	44115990	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,173
12	44116028	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,102
12	44117161	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
12	44117710	.	C	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
12	44121790	.	T	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
12	44123336	.	A	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,119
12	44123795	.	C	T	174.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:203,0,24
12	44123962	.	A	G	167.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:196,0,19
12	44135219	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	44148259	.	T	C	134.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:163,0,27
12	44165430	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	44180295	.	G	A	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:227,0,190
12	44182312	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
12	44182706	.	A	G	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:227,0,62
12	44182951	.	T	C	134.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:163,0,24
12	44191625	.	G	A	368.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=33.46;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:11:396,0,11
12	45823268	.	T	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:61:320,0,61
12	45824364	.	A	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,274
12	45824702	.	G	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.652;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.42;ReadPosRankSum=-1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:131,0,163
12	45825090	.	G	A	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,333
12	45825318	.	G	A	24.75	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=3.54	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:49:78,0,49
12	46315438	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	46577071	.	G	A	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.125;DP=38;FS=3.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,8:38:99:228,0,1191
12	46577741	.	A	G	1266.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1295,90,0
12	46577921	.	G	T	685.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=-2.031;DP=40;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=17.14;ReadPosRankSum=2.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:714,0,782
12	46578072	.	G	T	1038.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.657;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=21.20;ReadPosRankSum=1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,28:49:99:1067,0,739
12	46578155	.	A	C	827.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.129;DP=52;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,23:52:99:856,0,1073
12	46578702	.	T	C	2592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2621,184,0
12	46579388	.	A	G	2051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2080,144,0
12	46579590	.	A	G	1542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1571,111,0
12	46579641	.	C	T	398.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.775;DP=34;FS=11.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=11.73;ReadPosRankSum=2.216	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,12:34:99:427,0,859
12	46580618	.	A	G	856.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=1.603;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=27.64;ReadPosRankSum=-1.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,23:31:99:885,0,269
12	46581573	.	T	G	182.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=-1.205;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=4.57;ReadPosRankSum=3.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:220,0,574
12	46582540	.	T	A	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-2.431;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=9.45;ReadPosRankSum=2.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:255,0,358
12	46585142	.	A	G	93.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:122,0,27
12	46585492	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.09;ReadPosRankSum=-1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:227,0,101
12	46588626	.	T	C	70.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:19:120,0,19
12	46589148	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,117
12	46589234	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
12	46589235	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
12	46662485	.	G	C	898.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:927,66,0
12	46665386	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	46752363	.	G	A	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:131,0,439
12	46754659	.	C	G	454.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-1.625;DP=39;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,14:39:99:483,0,941
12	46759017	.	T	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
12	46759057	.	G	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,119
12	46759136	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
12	46759788	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	46761127	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	46761324	.	C	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,138
12	46761829	.	T	G	217.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.01;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,6:7:11:245,11,0
12	46763686	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
12	46764973	.	G	A	1094.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.232;DP=52;FS=13.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=21.05;ReadPosRankSum=1.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,30:52:99:1123,0,788
12	46781634	.	T	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,284
12	46876292	.	T	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
12	46878277	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	47471037	.	A	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
12	47501815	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	48175093	.	A	G	1034.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1063,75,0
12	48175604	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
12	48176792	.	C	T	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
12	48176900	.	T	G	931.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:960,66,0
12	48177073	.	A	G	545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:574,39,0
12	48177238	.	A	G	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
12	48177299	.	G	A	863.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:892,63,0
12	48178127	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
12	48178194	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	48178465	.	T	C	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
12	48178513	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
12	48178909	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	48179044	.	C	G	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
12	48179589	.	G	A	296.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.817;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.776	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:325,0,372
12	48180022	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	48184793	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
12	48190044	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,201
12	48235555	.	T	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:80:80,0,381
12	48235738	.	C	T	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:260,0,311
12	48236550	.	G	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
12	48236623	.	G	T	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=10.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.000;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:334,0,169
12	48237967	.	T	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:242,0,443
12	48238092	.	G	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-2.270;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=1.75;ReadPosRankSum=2.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,413
12	48238221	.	G	T	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=30.07;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:46:359,0,46
12	48238757	.	A	G	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:134,0,318
12	48243963	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	48272895	.	A	G	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:527,39,0
12	48358279	.	C	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:164,0,29
12	48359527	.	G	A	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-1.504;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=30.32;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:35:483,35,0
12	48359676	.	G	T	1184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-1.442;DP=55;FS=12.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=21.54;ReadPosRankSum=1.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,32:55:99:1213,0,768
12	48360620	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:190,0,142
12	48361524	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,118
12	48362412	.	G	C	819.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.374;DP=54;FS=5.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,24:54:99:848,0,1135
12	48396505	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	48438408	.	C	T	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
12	48461635	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	48512285	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	48527186	.	C	T	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-1.189;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:127,0,502
12	48539659	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,270
12	48542266	.	G	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.82;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:188,0,69
12	48542347	.	C	T	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:257,0,179
12	48542415	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:186,0,189
12	48543584	.	G	C	347.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=1.485;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.84;ReadPosRankSum=-1.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:376,0,135
12	48551288	.	G	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:97,0,102
12	48732459	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:123,0,33
12	48734564	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,118
12	48734609	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
12	48735304	.	G	T	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
12	48736260	.	A	C	172.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:201,0,27
12	48736303	.	C	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
12	48736439	.	T	C	170.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:199,0,27
12	48737245	.	A	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:114,0,31
12	48951562	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
12	48951574	.	G	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
12	48951576	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
12	48951604	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	48951609	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	49048738	.	G	T	1271.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1300,90,0
12	49048985	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	49052758	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
12	49056663	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	49065727	.	T	C	714.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=-0.302;DP=36;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.048	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:743,0,597
12	49075983	.	C	G	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:321,0,329
12	49075984	.	T	G	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:321,0,329
12	49083271	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:94:94,0,278
12	49083394	.	G	T	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:605,42,0
12	49084434	.	G	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
12	49086963	.	G	A	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
12	49087656	.	G	C	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:175,0,131
12	49110582	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,79
12	49165642	.	C	T	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:297,0,357
12	49211913	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	49220032	.	C	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,152
12	49221622	.	G	A	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.021;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:347,0,355
12	49223719	.	C	T	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.517;DP=25;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,13:25:99:460,0,439
12	49230035	.	T	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-0.303;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,6:33:99:159,0,1078
12	49319036	.	A	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
12	49319270	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,192
12	49326687	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	49329695	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	49332012	.	A	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.194;DP=26;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=9.57;ReadPosRankSum=2.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:277,0,671
12	49332092	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.116;DP=24;FS=9.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.503	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:99:102,0,819
12	49332366	.	C	T	545.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.310;DP=51;FS=5.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.230	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,17:51:99:574,0,1307
12	49334762	.	G	C	1643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-1.040;DP=40;FS=3.716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=34.54;ReadPosRankSum=1.646	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,39:40:84:1672,84,0
12	49416944	.	T	C	117.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:146,0,25
12	49425978	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,143
12	49427652	.	C	T	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=1.766;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=16.21;ReadPosRankSum=-1.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:320,0,341
12	49434074	.	C	A	290.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=29.09;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:15:319,0,15
12	49438623	.	C	T	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:87:87,0,206
12	49444545	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,170
12	49495321	.	C	A	151.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:180,0,24
12	49667103	.	A	T	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
12	49718387	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
12	50028181	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,233
12	50230116	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
12	50231668	.	A	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:87,0,34
12	50383369	.	A	G	1091.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1120,78,0
12	50476158	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	50491630	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	50570519	.	G	A	467.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:496,36,0
12	50570610	.	T	C	938.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=31.29;ReadPosRankSum=1.281	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,22:23:59:967,59,0
12	50716452	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	50716958	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	50854214	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
12	50870145	.	G	A	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:690,48,0
12	50870429	.	A	C	527.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.579;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=26.25;ReadPosRankSum=-1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,14:15:1:553,0,1
12	50872654	.	G	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:148,0,225
12	50873545	.	G	T	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:189,0,130
12	51135275	.	T	C	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:694,48,0
12	51139279	.	A	G	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:48:405,0,48
12	51139692	.	T	G	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-2.017;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.85;ReadPosRankSum=2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:139,0,101
12	51139803	.	C	A	292.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.49;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:8:320,0,8
12	51139892	.	C	T	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=24.71;ReadPosRankSum=-1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:300,0,101
12	51140410	.	C	G	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
12	51141883	.	A	G	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:661,45,0
12	51157099	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	51160612	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	51214327	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	51324163	.	A	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:174,0,468
12	51324496	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-1.004;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,561
12	51324627	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.441;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:78:78,0,561
12	51324639	.	A	G	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.910;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:124,0,469
12	51373742	.	C	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
12	51374250	.	A	G	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
12	51374748	.	G	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
12	51375066	.	G	A	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
12	51380232	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
12	51381077	.	C	T	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
12	51442616	.	A	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
12	51443194	.	G	T	160.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
12	51443469	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	51445294	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	51445661	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	51447054	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
12	51448133	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	51448524	.	G	A	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
12	51448555	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
12	51452875	.	A	G	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
12	51453366	.	A	C	722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:751,51,0
12	51453637	.	G	T	1062.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1091,75,0
12	51453674	.	A	T	803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:57:832,57,0
12	51453682	.	G	A	803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:57:832,57,0
12	51457266	.	C	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:188,0,144
12	51475963	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	51487869	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
12	51487882	.	T	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
12	51488236	.	A	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
12	51636904	.	G	C	2361.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2390,166,0
12	51745690	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
12	51745822	.	T	C	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:358,27,0
12	51745834	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,307
12	51746264	.	G	A	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:166,0,362
12	51746694	.	T	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,255
12	51759305	.	C	T	524.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=-1.198;DP=22;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:553,0,171
12	51901390	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	51906045	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	52388891	.	A	G	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-2.062;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=12.25;ReadPosRankSum=2.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:212,0,352
12	52389993	.	A	G	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:48:48,0,85
12	52448157	.	G	A	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:91:91,0,313
12	52487371	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	52489312	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,115
12	52489794	.	G	C	210.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
12	52489832	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,113
12	52490725	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
12	52499302	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	52563166	.	A	C	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:209,0,241
12	52563719	.	C	A	833.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:862,60,0
12	52565322	.	G	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:66:225,0,66
12	52568912	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	52627007	.	C	T	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:431,33,0
12	52627215	.	A	G	2470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2499,183,0
12	52629679	.	A	G	779.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:808,57,0
12	52630866	.	C	T	598.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:627,45,0
12	52631242	.	C	T	266.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:295,27,0
12	52631313	.	A	G	4249.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,97:97:99:4278,292,0
12	52631607	.	A	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
12	52635360	.	G	A	3469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3498,241,0
12	52635443	.	T	C	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:744,51,0
12	52635560	.	A	T	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:512,36,0
12	52635979	.	A	C	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
12	52636447	.	A	G	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:786,57,0
12	52637687	.	C	T	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-0.111;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:196,0,598
12	52638680	.	C	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:145,0,218
12	52638988	.	C	T	1189.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1218,84,0
12	52639302	.	G	C	3070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,72:72:99:3099,217,0
12	52640277	.	C	T	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
12	52641128	.	C	A	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
12	52641253	.	C	T	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
12	52648624	.	C	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,110
12	52664990	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	52679937	.	C	G	522.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:551,42,0
12	52680008	.	T	C	391.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=32.61;ReadPosRankSum=-1.738	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:9:419,0,9
12	52702463	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	52702656	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	52739839	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
12	52741091	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	52744106	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	52744147	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
12	52744174	.	A	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
12	52746294	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	52746793	.	G	T	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
12	52747898	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	52748082	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	52748211	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	53200584	.	T	C	285.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:314,21,0
12	53202183	.	C	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,307
12	53205757	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=6;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,109
12	53207628	.	G	A	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:178,0,145
12	53295551	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	53298806	.	G	A	43.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.660;DP=22;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.149	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:72:72,0,686
12	53301058	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	53301059	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	53416119	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	53422604	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	53432936	.	A	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
12	53433486	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	53433709	.	C	G	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
12	53433788	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
12	53434105	.	C	A	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
12	53434995	.	C	G	1821.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1850,129,0
12	53436448	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	53436907	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
12	53437172	.	C	G	210.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
12	53437553	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
12	53437711	.	C	A	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
12	53437892	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
12	53439139	.	T	A	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
12	53439537	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
12	53439540	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
12	53440129	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	53440674	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
12	53441990	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	53442129	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	53442956	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	53445282	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	53445959	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	53459708	.	C	T	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.792;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.475	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:203,0,483
12	53565457	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	53570193	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:55:75,0,55
12	53572006	.	T	C	90.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:119,0,27
12	53572331	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
12	53572332	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
12	53572740	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	53572743	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	53572746	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	53572812	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	53572909	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:78,0,34
12	53573816	.	G	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:137,0,223
12	53574044	.	G	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,537
12	53574045	.	A	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,537
12	53574366	.	C	T	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=-1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:168,0,144
12	53574490	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:103,0,33
12	53574631	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:75,0,68
12	53574942	.	C	T	21.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
12	53575559	.	A	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:277,0,387
12	53581376	.	C	T	497.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.342;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:526,0,108
12	53582809	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,191
12	53583637	.	G	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:55:55,0,351
12	53586255	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	53605545	.	G	A	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=2.072;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=14.58;ReadPosRankSum=-2.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:174,0,150
12	53617829	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	53647373	.	T	C	349.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=9.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=26.91;ReadPosRankSum=1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:90:378,0,90
12	53662624	.	C	A	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
12	53670545	.	C	A	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:447,33,0
12	53681883	.	A	T	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:530,39,0
12	53682986	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,268
12	53686703	.	G	A	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:727,51,0
12	53687113	.	C	T	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.670;DP=13;FS=14.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=22.06;ReadPosRankSum=1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:315,0,178
12	53691041	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	53692955	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	53693532	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
12	53693533	.	A	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
12	53694489	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	53700848	.	C	T	363.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:392,30,0
12	53700860	.	A	G	148.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:20:177,0,20
12	53703021	.	G	A	972.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1001,69,0
12	53714496	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
12	53714509	.	T	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
12	53714993	.	C	T	105.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
12	53809151	.	C	A	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:84:84,0,379
12	53853102	.	C	T	1205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-1.078;DP=71;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,33:71:99:1234,0,1444
12	53861080	.	A	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:74:74,0,391
12	53868989	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,241
12	53894465	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
12	53907067	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,266
12	54356389	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
12	54357126	.	C	G	363.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:392,30,0
12	54357198	.	T	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
12	54358208	.	G	A	14.91	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:43:43,0,153
12	54360429	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	54360994	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	54361835	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	54365236	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	54367061	.	T	G	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
12	54370108	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	54372465	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	54376264	.	A	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
12	54383500	.	G	A	1219.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1248,90,0
12	54387377	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	54387810	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	54387947	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	54394497	.	C	T	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
12	54395054	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	54396971	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
12	54417576	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	54418143	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	54418166	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	54418857	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	54419910	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	54424123	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
12	54428532	.	C	T	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
12	54428747	.	G	A	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
12	54433011	.	G	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
12	54448106	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
12	54523693	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	54571165	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	54571197	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	54572119	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	54575458	.	T	C	364.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:393,30,0
12	54575800	.	C	A	788.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:817,57,0
12	54580936	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
12	54581064	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
12	54581102	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	54581614	.	T	C	822.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:851,60,0
12	54626752	.	T	C	667.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.028;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,18:26:99:696,0,261
12	54627090	.	C	T	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:270,0,160
12	54627857	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,241
12	54630517	.	C	T	742.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:771,54,0
12	54634283	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.575;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.57;ReadPosRankSum=-1.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:72:72,0,549
12	54634666	.	T	C	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:334,0,336
12	54645847	.	A	G	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.551;DP=28;FS=13.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.558	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:355,0,691
12	54651471	.	A	G	442.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-1.390;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=17.71;ReadPosRankSum=2.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:471,0,406
12	54670248	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	54680743	.	C	T	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-1.954;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:229,0,243
12	54765291	.	C	G	632.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=2.294;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=17.58;ReadPosRankSum=-2.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,18:36:99:661,0,686
12	54767812	.	G	A	681.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-2.082;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=21.31;ReadPosRankSum=1.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,20:32:99:710,0,395
12	54974803	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:76,0,74
12	54975837	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
12	55248357	.	G	T	2040.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2069,141,0
12	55249593	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
12	55250090	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
12	55250196	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	55250612	.	A	G	3651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:3680,256,0
12	56151291	.	T	C	837.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-0.215;DP=33;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,23:33:99:866,0,331
12	56217677	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	56220122	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	56225284	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	56295734	.	A	G	1333.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1362,96,0
12	56348028	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	56368078	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	56374277	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	56398454	.	G	C	638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:667,45,0
12	56435929	.	C	G	962.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:991,69,0
12	56436472	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	56523057	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	56596979	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	56598044	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
12	56601237	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	56647911	.	G	C	926.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:955,69,0
12	56649601	.	A	G	853.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:882,60,0
12	56722060	.	T	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
12	56814653	.	G	A	380.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.539;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,12:35:99:409,0,1773
12	56814656	.	A	G	780.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.270;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=22.96;ReadPosRankSum=1.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,22:34:99:809,0,939
12	56815922	.	C	T	620.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.558;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.207	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,17:33:99:649,0,587
12	56822378	.	T	A	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-1.898;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:529,0,550
12	56825311	.	C	T	420.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.121	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:449,0,499
12	56827694	.	C	G	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.791;DP=31;FS=6.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.385	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:423,0,719
12	56827974	.	C	T	814.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:843,60,0
12	56862886	.	T	C	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:685,48,0
12	56863769	.	T	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,362
12	56863770	.	G	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,362
12	56865056	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,72
12	56865338	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:121,0,32
12	56983252	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	56984606	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
12	56987991	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	56991476	.	G	A	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.780;DP=14;FS=10.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:262,0,276
12	57004268	.	G	A	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-2.965;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:411,0,183
12	57030026	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:45:194,0,45
12	57051546	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	57058149	.	A	G	724.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-1.150;DP=40;FS=4.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,20:40:99:753,0,772
12	57058609	.	C	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:123,0,32
12	57081517	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
12	57108203	.	A	G	980.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.960;DP=81;FS=4.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,29:81:99:1009,0,2023
12	57109792	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
12	57121936	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	57124391	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:59:59,0,201
12	57125109	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,197
12	57133140	.	T	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.822;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,471
12	57449810	.	C	T	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.557;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=4.55;ReadPosRankSum=-1.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:92:92,0,439
12	57453203	.	T	C	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.032;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:289,0,419
12	57461691	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
12	57606386	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	57929686	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,113
12	57930374	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	57934185	.	T	A	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
12	57985204	.	C	T	583.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-2.210;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=22.45;ReadPosRankSum=1.940	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,17:26:99:612,0,277
12	57994743	.	T	G	1080.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1109,78,0
12	57995089	.	T	C	1329.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1358,93,0
12	57998619	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,112
12	57999101	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,194
12	58112189	.	A	G	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.696;DP=41;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,18:41:99:659,0,865
12	58113125	.	A	G	156.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:185,15,0
12	58115271	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=-0.450;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:122,0,583
12	58141787	.	C	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:141,0,259
12	58142854	.	C	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
12	58149446	.	C	T	208.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:237,18,0
12	58153059	.	A	G	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:86:250,0,86
12	58161898	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
12	58162739	.	A	G	479.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:508,0,163
12	58166403	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
12	58169781	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	58174306	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:38:106,0,38
12	58175201	.	C	T	90.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:119,0,24
12	58176614	.	T	C	539.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=22.49;ReadPosRankSum=0.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:568,0,305
12	58177943	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
12	58215707	.	T	C	948.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:977,72,0
12	58217206	.	A	C	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.301;DP=31;FS=7.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=0.39;ReadPosRankSum=1.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,3:31:40:40,0,1109
12	58217221	.	G	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.910;DP=33;FS=17.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,6:33:99:147,0,2225
12	58217228	.	C	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.442;DP=31;FS=16.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.149	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,4:31:99:147,0,2225
12	58220841	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.233;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,4:29:99:118,0,2060
12	58220844	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-1.702;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,5:34:99:118,0,2060
12	58335626	.	A	T	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:270,0,188
12	58350631	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:181,0,216
12	58350803	.	C	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,107
12	59279660	.	A	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:77,0,68
12	62696599	.	C	T	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=1.849;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:95:95,0,342
12	62778065	.	A	G	742.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:771,54,0
12	62860717	.	G	A	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:198,0,167
12	62860871	.	G	A	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,342
12	62875067	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
12	62917838	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
12	62926398	.	G	A	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-1.001;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:167,0,463
12	62950235	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	62953181	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	62953182	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,79
12	62959137	.	A	G	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:345,0,218
12	62969668	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	62986620	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:160,0,419
12	62989922	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
12	63038638	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,107
12	63038698	.	C	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
12	63040234	.	A	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:105,0,141
12	63040272	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
12	63083521	.	G	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:97:188,0,97
12	64236156	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	64236157	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	64540960	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	64581982	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	64583473	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
12	64583512	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
12	64585731	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:117,0,31
12	64585977	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:79,0,32
12	64586213	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:78,0,66
12	64586309	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
12	64587633	.	C	A	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
12	64609562	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
12	64798118	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	64799995	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
12	64801863	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	64842854	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=22.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:162,0,109
12	64842855	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:99:162,0,109
12	64842864	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,235
12	64844068	.	A	G	73.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:10:101,10,0
12	64844071	.	A	G	73.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:10:101,10,0
12	64844149	.	A	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:178,0,180
12	64875787	.	T	A	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
12	65004316	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,86
12	65004387	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:98:99,0,98
12	65089285	.	T	C	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
12	65091031	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,279
12	65108160	.	G	C	937.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:966,69,0
12	65110141	.	G	A	1146.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.733;DP=30;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.617	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,29:30:53:1175,53,0
12	65110252	.	G	A	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=1.161;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.330	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:315,0,609
12	65146532	.	C	T	1119.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1148,81,0
12	65173570	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	65174387	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	65270150	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:159,0,28
12	65270436	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:55:55,0,309
12	65641985	.	C	T	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
12	65642033	.	C	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
12	66531149	.	T	C	383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:412,30,0
12	66531694	.	A	G	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
12	66533329	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	66538988	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	66546100	.	A	G	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.161;DP=39;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.366	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,14:39:99:492,0,951
12	66698895	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	66739539	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
12	66849062	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	67706466	.	G	A	669.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=-1.709;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.544	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,20:44:99:698,0,903
12	67706851	.	C	T	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.165;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.165	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:375,0,473
12	67707441	.	A	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,105
12	67708543	.	C	T	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
12	67709636	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,121
12	67742696	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
12	68048608	.	A	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:77,0,64
12	68052178	.	G	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:49:137,0,49
12	68054686	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:99,0,75
12	68055199	.	G	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-2.192;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.48;ReadPosRankSum=2.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:133,0,392
12	68055812	.	T	C	132.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:161,0,27
12	68057438	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:121,0,33
12	68707287	.	G	A	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
12	68708761	.	C	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
12	68720627	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	68724951	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	69014460	.	A	G	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
12	69202164	.	A	G	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:401,30,0
12	69235406	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
12	69237509	.	A	G	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.091;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.100;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,873
12	69237519	.	A	G	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.133;DP=15;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:206,0,355
12	69237534	.	A	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:175,0,450
12	69237558	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:98:98,0,236
12	69646914	.	G	A	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:907,63,0
12	69657145	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	69658330	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
12	69659299	.	A	G	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
12	69661131	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	69662929	.	A	T	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
12	69667075	.	T	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
12	69747177	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	69753512	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	69753595	.	C	T	571.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:600,42,0
12	69784265	.	A	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.234;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.301	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:211,0,638
12	69967862	.	G	A	650.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:679,48,0
12	69971474	.	G	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
12	69971500	.	C	T	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
12	69971713	.	C	T	279.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:308,24,0
12	69972381	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	69993501	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	70210842	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	70213775	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	70215086	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
12	70215515	.	G	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
12	70215960	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
12	71505569	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
12	71506581	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	71523134	.	A	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:118,0,68
12	71533534	.	C	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	72013832	.	A	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:161,0,31
12	72015050	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	72018028	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:169,0,292
12	72026160	.	T	C	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,208
12	72307616	.	A	G	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-1.197;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=14.04;ReadPosRankSum=1.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:295,0,397
12	72307637	.	C	G	335.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:364,0,407
12	74932159	.	G	C	1861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1890,132,0
12	74932565	.	T	C	1362.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1391,96,0
12	74933166	.	G	A	1580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1609,111,0
12	74934589	.	C	A	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.705	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:377,0,205
12	74934634	.	G	A	1230.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1259,84,0
12	74934637	.	T	C	1230.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:84:1259,84,0
12	74934743	.	G	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-1.313;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,8:36:99:225,0,1061
12	74934925	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.244;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,5:37:99:112,0,1211
12	75347372	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
12	75347378	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
12	75347380	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
12	75347391	.	A	G	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
12	75888955	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
12	75891253	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
12	75891714	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	75893388	.	T	A	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
12	75893404	.	C	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
12	75898442	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	75898532	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	75903679	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	76421254	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	76439734	.	C	T	35.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
12	76449900	.	T	C	803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:832,57,0
12	76451641	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	76451642	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	76453966	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:149,0,217
12	76455817	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:67,0,37
12	76460933	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	77222970	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	77223371	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
12	77224689	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	77225749	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	77227883	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	77228251	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
12	77231200	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:120,0,32
12	77231887	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	77232877	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	77233450	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
12	77233460	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	77233462	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	77238563	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	77245749	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
12	77245750	.	A	T	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
12	77419593	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,115
12	77821116	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	77821118	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	77821121	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	77821125	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	79990959	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,158
12	79996973	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	80189517	.	C	T	494.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=1.981;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=29.10;ReadPosRankSum=-1.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:523,0,126
12	80329244	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	80329859	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	80650752	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	82792787	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	83526911	.	T	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
12	83527465	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	83527548	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
12	83528215	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
12	85562725	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	85562733	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	88440676	.	G	C	463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:492,36,0
12	88449096	.	A	G	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
12	88505078	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	88547277	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
12	88592011	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,181
12	88592952	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	88593384	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	88887289	.	T	C	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
12	88888247	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
12	88889977	.	A	T	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
12	88890521	.	C	T	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:604,42,0
12	88890671	.	A	G	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
12	88905251	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	89714129	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	89714136	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	89714145	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:180,12,0
12	89743223	.	G	A	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
12	89756327	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	89915225	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:151,0,176
12	89916438	.	G	A	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,427
12	90004992	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,166
12	90494505	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
12	90504162	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	90505349	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	92539344	.	T	C	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
12	92539460	.	C	T	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=10.08;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:129,0,201
12	92539590	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
12	93167719	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:157,0,30
12	93181768	.	C	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:143,0,189
12	93258665	.	A	G	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:196,0,104
12	93477455	.	A	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
12	93687723	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	93894703	.	C	A	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
12	93894779	.	A	T	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:482,36,0
12	93895773	.	T	C	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.212;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=26.91;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:405,0,293
12	93895774	.	C	T	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:405,0,293
12	93947693	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
12	93965385	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
12	94243853	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,223
12	94853425	.	C	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,88
12	94943516	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	94943518	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	94943521	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	94964157	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:80:80,0,149
12	94965058	.	G	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
12	94972290	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
12	95471042	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,113
12	95473158	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	95693407	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	95694394	.	G	A	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:870,63,0
12	95694547	.	A	G	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=1.083;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:269,0,733
12	95696420	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
12	95702385	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	95703414	.	G	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:151,0,101
12	95879734	.	C	T	451.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:480,0,526
12	95906603	.	C	A	462.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-1.026;DP=26;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:491,0,497
12	96259992	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	97337407	.	C	T	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=15.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:273,0,184
12	97345955	.	A	G	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
12	97346924	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
12	98908547	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	98921739	.	G	T	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.440;DP=36;FS=3.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,7:36:99:201,0,1157
12	98928646	.	A	G	1161.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1190,81,0
12	98933834	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	98934105	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
12	98936974	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	98939172	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
12	98942824	.	A	G	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:132,0,220
12	98942885	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:229,0,135
12	98943033	.	A	G	794.82	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.908;DP=21;FS=4.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.413	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:19:823,19,0
12	98943078	.	A	G	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:582,42,0
12	98943096	.	A	G	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=15.25;ReadPosRankSum=2.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:257,0,408
12	98943102	.	A	G	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=2.041;DP=13;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:49:49,0,1180
12	98943103	.	A	G	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=1.875;DP=14;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:49:49,0,1180
12	98996731	.	A	G	213.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:242,0,23
12	99007623	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
12	99127431	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
12	99128811	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	100482774	.	C	G	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:219,0,140
12	100538679	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
12	100538685	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
12	100661218	.	G	C	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
12	100667049	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	100709420	.	C	T	762.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:791,54,0
12	100732327	.	C	T	642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:671,48,0
12	101017445	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
12	101019778	.	G	C	194.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:223,18,0
12	101683929	.	C	T	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
12	101685540	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,139
12	101685643	.	C	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:70,0,68
12	101732655	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:149,0,141
12	101750814	.	T	A	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:449,30,0
12	101779964	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
12	101787433	.	G	C	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:237,0,151
12	101789399	.	G	C	654.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.182;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.215	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,18:35:99:683,0,622
12	102117589	.	C	T	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.582;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:294,0,465
12	102120289	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	102158763	.	T	C	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:260,0,143
12	102165083	.	A	G	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
12	102315592	.	G	A	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:116,0,27
12	102315746	.	G	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,118
12	102317141	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:50:153,0,50
12	104169974	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	104170536	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	104324202	.	G	C	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.10;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:54:229,0,54
12	104336553	.	G	A	815.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=-0.960;DP=43;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=18.97;ReadPosRankSum=1.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,22:43:99:844,0,769
12	104359647	.	G	A	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
12	104512832	.	G	A	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:78,0,27
12	104680782	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	104907907	.	A	T	57.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:85,9,0
12	105152997	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	105153570	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	105199038	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
12	105380152	.	A	C	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:276,0,156
12	105407346	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	105482338	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	105546172	.	G	A	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:271,0,211
12	105549840	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	105561664	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,116
12	105561991	.	C	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,276
12	105562038	.	T	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=1.932;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:188,0,219
12	105567572	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:113,0,72
12	105567825	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:93:152,0,93
12	105568122	.	G	A	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:169,0,384
12	105568176	.	G	A	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.740;DP=21;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:202,0,582
12	105583877	.	G	A	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.333;DP=24;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:474,0,377
12	105589066	.	C	T	41.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:70:70,0,679
12	105600935	.	G	A	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-2.236;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.886	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:192,0,477
12	105625440	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:114,0,72
12	105626185	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	105626907	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	105627031	.	T	A	35.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:64,0,28
12	105627084	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
12	105628736	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	105629239	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	105629354	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	105629865	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	105765097	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	106633569	.	C	T	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DP=23;FS=13.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,13:22:99:418,0,298
12	106903321	.	T	C	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-1.208;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:290,0,299
12	107378845	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
12	107380905	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	107395106	.	A	G	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-1.096;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=16.58;ReadPosRankSum=1.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:277,0,206
12	107486912	.	C	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:47:55,0,47
12	107487069	.	C	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-1.453;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:143,0,174
12	107709150	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	107711218	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	107711934	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	107713511	.	G	C	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
12	108095116	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	108097970	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	108106915	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
12	108126854	.	T	C	637.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:666,48,0
12	108127778	.	C	T	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
12	108127965	.	A	G	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
12	108142496	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	108145022	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	108154752	.	G	A	362.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:391,30,0
12	108271514	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	108275985	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	108276710	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	108916677	.	T	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:157,0,31
12	108918146	.	C	T	355.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.919;DP=22;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:384,0,403
12	108923950	.	A	G	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.643;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:274,0,611
12	108954823	.	C	T	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:251,0,309
12	108954862	.	G	C	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:262,0,147
12	108956417	.	T	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.453;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:177,0,833
12	108956418	.	T	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.453;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:177,0,833
12	108956610	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:75,0,69
12	108961293	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	109039794	.	A	C	357.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:386,0,168
12	109039869	.	T	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:132,0,319
12	109180787	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:94:190,0,94
12	109511256	.	T	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
12	109525332	.	C	T	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:44:44,0,329
12	110289501	.	T	G	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:249,0,344
12	110719192	.	C	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:113,0,126
12	110771832	.	G	T	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-1.855;DP=45;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=0.33;ReadPosRankSum=-1.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,4:45:43:43,0,1583
12	110783241	.	G	A	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:134,0,111
12	110817630	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:111,0,34
12	110878812	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:72,0,56
12	110930637	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	110939421	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,195
12	110974890	.	T	C	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=25.60;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:361,0,127
12	111798553	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
12	111799681	.	T	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
12	111800059	.	T	C	175.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:24:204,0,24
12	111800258	.	G	A	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=-0.625;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.684;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:262,0,335
12	111901204	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	112037000	.	G	C	26.74	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,141
12	112438399	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	112438404	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	112578821	.	G	A	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.138;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:180,0,723
12	112638486	.	G	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,220
12	112944397	.	C	T	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.135;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.801	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:327,0,509
12	113348870	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	113376320	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	113376331	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	113376388	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
12	113381217	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	113386779	.	C	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
12	113403684	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	113408208	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	113408874	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	113409413	.	C	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
12	113409981	.	C	T	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
12	113410316	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	113410975	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	113604472	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
12	113629949	.	C	T	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:35:445,35,0
12	113718805	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	113724945	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
12	113734413	.	G	A	645.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.393;DP=25;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:674,0,235
12	113735742	.	G	C	455.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.057;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:484,0,129
12	113736097	.	G	A	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-1.642;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=27.75;ReadPosRankSum=-1.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:500,0,131
12	113736121	.	A	G	425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-1.552;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:49:454,0,49
12	113737225	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,118
12	113796566	.	A	C	160.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
12	113828951	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-1.783;DP=15;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.255	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,458
12	113828961	.	A	G	93.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.380;DP=15;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:133,0,311
12	113861388	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	114247473	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	114254860	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	114254995	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:148,0,108
12	114255320	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
12	114255322	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
12	114255756	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	114256924	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
12	114256994	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	114257635	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
12	114258394	.	T	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
12	114258486	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
12	114259395	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	114282496	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,311
12	114377885	.	G	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:135,0,249
12	114377899	.	G	C	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
12	115108907	.	T	C	1095.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1124,81,0
12	115110571	.	G	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
12	115111318	.	T	C	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
12	115121189	.	G	A	1405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1434,102,0
12	115130201	.	G	C	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
12	115132047	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	115164413	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	116398626	.	A	C	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:97:339,0,97
12	116933181	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,79
12	117014156	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	117014187	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	117099811	.	T	C	940.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:969,69,0
12	117111612	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	117115996	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	117118490	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	117118506	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	117120517	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	117121658	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	117125919	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	117129612	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	117136787	.	T	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
12	117136934	.	A	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.54;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:77:151,0,77
12	117136956	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:141,0,264
12	117136986	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,152
12	117137031	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,74
12	117137970	.	G	A	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
12	117138555	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:111,0,67
12	117138560	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:67:111,0,67
12	117138832	.	T	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	117139302	.	T	A	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
12	117140290	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:66,0,35
12	117140365	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,202
12	117140416	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	117140689	.	C	A	504.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:533,39,0
12	117140744	.	C	T	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:672,48,0
12	117142609	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,284
12	117142889	.	A	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:96:96,0,323
12	117143138	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
12	117150050	.	A	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:479,36,0
12	117150600	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
12	117152490	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	117153263	.	A	G	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
12	117159954	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	117163293	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
12	117164388	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	117175828	.	C	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
12	117175856	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
12	117217141	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	117290096	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
12	117290155	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	117442304	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
12	117442902	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	117443591	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
12	117462582	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	117463390	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
12	117464685	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	117465857	.	T	C	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:443,33,0
12	117465981	.	T	C	358.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:387,30,0
12	117467372	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
12	117467471	.	A	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:60:151,0,60
12	117467598	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,72
12	117468367	.	C	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
12	117468873	.	A	G	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
12	117469408	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
12	117582042	.	C	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=-0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:141,0,311
12	117628111	.	C	A	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:127,0,279
12	118454833	.	C	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
12	118455759	.	T	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
12	118469674	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,300
12	118469875	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,281
12	118470138	.	T	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
12	118477688	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	118502113	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:78:152,0,78
12	118502467	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:229,0,226
12	118502675	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
12	118503725	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
12	118508416	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	118508796	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	118509086	.	A	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
12	118509148	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:89,6,0
12	118509157	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	118509191	.	G	A	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:173,0,69
12	118551947	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	118554410	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:67,0,65
12	118555306	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,153
12	118555309	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,1:3:77:77,0,153
12	118555324	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	118571194	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	118571197	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	118571206	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	118682751	.	C	T	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:194,0,109
12	120105707	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	120119183	.	T	G	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:183,0,185
12	120124578	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,312
12	120156141	.	G	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:148,0,105
12	120171995	.	T	C	370.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.90;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:6:398,6,0
12	120189879	.	A	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=33.40;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:429,0,214
12	120189888	.	T	C	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=30.00;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:429,0,214
12	120534543	.	G	C	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.199;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,12:29:99:431,0,635
12	120538128	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	120575549	.	A	C	1345.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1374,99,0
12	120637430	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	120660435	.	C	A	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.837;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,13:30:99:452,0,661
12	120720279	.	C	T	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:58:191,0,58
12	120898943	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:79:79,0,347
12	120899011	.	A	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:144,0,98
12	120899075	.	A	G	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=29.52;ReadPosRankSum=-1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:50:353,0,50
12	120899076	.	A	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:40:40,0,513
12	120926319	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	120926448	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	120929774	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	120933946	.	T	G	1177.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1206,84,0
12	120961562	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	120965508	.	C	A	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
12	121000846	.	G	A	663.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.632;DP=39;FS=10.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.997	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,19:39:99:692,0,743
12	121006729	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	121010237	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	121011848	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	121013148	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	121014841	.	G	C	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
12	121017171	.	A	G	1220.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1249,87,0
12	121017439	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
12	121018422	.	T	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
12	121018862	.	C	T	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
12	121124991	.	G	A	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-0.591;DP=18;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=26.21;ReadPosRankSum=0.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:500,0,151
12	121126380	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:118,0,30
12	121131891	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	121133037	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	121135467	.	T	C	690.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=-1.683;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,19:31:99:719,0,420
12	121135508	.	G	A	696.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-0.344;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=24.03;ReadPosRankSum=-0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,19:29:99:725,0,353
12	121136309	.	T	C	614.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-1.004;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:643,0,458
12	121138350	.	G	T	1572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1601,111,0
12	121158814	.	C	T	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.336;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:243,0,544
12	121159380	.	T	C	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-1.833;DP=20;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:587,0,152
12	121160092	.	C	T	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:95:393,0,95
12	121201167	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,119
12	121202362	.	T	C	342.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.18;ReadPosRankSum=-0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:13:371,0,13
12	121202664	.	A	C	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.796;DP=18;FS=9.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=23.26;ReadPosRankSum=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:447,0,205
12	121341849	.	A	G	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
12	121442199	.	T	A	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:274,0,183
12	121454257	.	T	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:136,0,260
12	121660787	.	T	C	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:782,57,0
12	121666646	.	A	G	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.717;DP=27;FS=6.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:267,0,747
12	121669145	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	121669611	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:74,0,32
12	121669769	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
12	121681536	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
12	121681687	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	121682051	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	121683249	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:119,0,30
12	121685188	.	T	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
12	121687315	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
12	121687412	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
12	121691096	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:253,0,392
12	121701681	.	G	A	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.866	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:225,0,130
12	121712077	.	T	A	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.439	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:330,0,124
12	121755561	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,78
12	121769779	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:81,0,26
12	121770321	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	121770768	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	121878659	.	C	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,342
12	121880520	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:222,0,425
12	121881848	.	G	A	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-1.195;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:408,0,547
12	121882819	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	121905065	.	C	T	74.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:18:103,0,18
12	122079441	.	T	C	1302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.282;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,34:48:99:1331,0,454
12	122079668	.	A	G	735.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.603;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.409	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,20:32:99:764,0,406
12	122080228	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:264,0,137
12	122193430	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
12	122195964	.	A	G	135.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:164,0,26
12	122214547	.	G	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:149,0,168
12	122215580	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:115,0,76
12	122215626	.	C	A	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:199,0,28
12	122216892	.	A	G	116.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:145,0,26
12	122216936	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
12	122217901	.	A	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
12	122218489	.	C	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,112
12	122233495	.	G	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,106
12	122234089	.	T	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:111,0,97
12	122243905	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:184,0,247
12	122248582	.	C	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:177,0,308
12	122261456	.	G	A	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.97;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:196,0,66
12	122268696	.	C	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,224
12	122269182	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:91:280,0,91
12	122326812	.	T	C	1040.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1069,78,0
12	122338113	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	122353796	.	A	G	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-2.347;DP=43;FS=9.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:343,0,834
12	122458637	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	122459374	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	122498601	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,145
12	122516897	.	G	A	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:47:177,0,47
12	122616240	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	122623000	.	T	C	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:175,0,347
12	122624350	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	122626809	.	C	T	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:248,0,218
12	122626842	.	G	A	214.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:243,0,411
12	122627371	.	G	A	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:307,0,298
12	122628219	.	T	C	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:381,0,209
12	122628516	.	A	T	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:234,0,105
12	122628921	.	G	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:91:91,0,253
12	122629864	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.452;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:190,0,292
12	122629875	.	A	G	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,308
12	122630009	.	G	T	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:197,0,70
12	122630285	.	G	A	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:278,0,141
12	122630653	.	G	C	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.968;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:204,0,289
12	122630909	.	G	A	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:623,42,0
12	122630915	.	C	T	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:42:623,42,0
12	122631208	.	G	T	344.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:373,27,0
12	122631481	.	C	T	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=2.424;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=13.37;ReadPosRankSum=-2.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:202,0,258
12	122631752	.	T	C	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=1.186;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=18.16;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:228,0,179
12	122691738	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	122714373	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,100
12	122724495	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	122724496	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	122807369	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	122812503	.	G	C	1077.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1106,78,0
12	122817580	.	A	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.513;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:242,0,380
12	122970156	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	122972669	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	122972670	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	122989412	.	G	A	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
12	122990042	.	A	G	833.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-0.746;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=32.07;ReadPosRankSum=0.675	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,22:26:99:862,0,102
12	122997121	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	123004306	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:233,0,101
12	123030788	.	G	T	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=1.452;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=23.43;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:450,0,216
12	123076778	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	123077485	.	T	A	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.98;ReadPosRankSum=-1.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:93:93,0,367
12	123080084	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	123087442	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
12	123102921	.	T	G	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.664;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:445,0,408
12	123105143	.	C	T	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.591;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:205,0,340
12	123170855	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123170857	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123191491	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	123200354	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	123200693	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	123200768	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	123211216	.	T	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:42:42,0,376
12	123211270	.	T	C	133.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:162,0,27
12	123211327	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
12	123211401	.	A	G	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:203,0,68
12	123211817	.	A	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
12	123212087	.	T	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:182,0,216
12	123212291	.	T	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:127,0,190
12	123212740	.	A	G	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:273,0,104
12	123213236	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
12	123215410	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
12	123242758	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:78,0,30
12	123243998	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,396
12	123244000	.	A	G	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:180,0,136
12	123253789	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:76:76,0,116
12	123254699	.	C	A	874.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:903,63,0
12	123333065	.	C	T	852.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:881,63,0
12	123334075	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	123338287	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	123339344	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
12	123341833	.	G	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
12	123341863	.	G	C	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
12	123342229	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	123344910	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	123345509	.	G	T	917.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-1.155;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,24:35:99:946,0,353
12	123346971	.	G	A	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
12	123350204	.	C	T	1180.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1209,84,0
12	123354406	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,70
12	123354545	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123357011	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	123361501	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	123364198	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123460719	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	123460823	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
12	123460962	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	123464279	.	T	C	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
12	123466111	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
12	123467044	.	G	C	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-1.146;DP=61;FS=5.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,21:61:99:659,0,1565
12	123471402	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123476586	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
12	123637752	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123638580	.	T	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	123638930	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	123640664	.	C	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
12	123640853	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
12	123641200	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
12	123645803	.	G	A	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
12	123689521	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	123723668	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123733799	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
12	123736345	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:103,0,34
12	123738876	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
12	123741776	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
12	123742061	.	G	A	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
12	123742093	.	T	G	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
12	123743445	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123743447	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123743674	.	T	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
12	123799974	.	A	G	1066.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1095,75,0
12	123810873	.	G	A	659.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:688,48,0
12	123849272	.	C	G	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:572,42,0
12	123850168	.	A	G	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
12	123871632	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	123871717	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	123877312	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	123943586	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:113,0,68
12	123945112	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,85
12	123945122	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,85
12	123948148	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
12	124007339	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:108,0,32
12	124008073	.	A	G	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.479;DP=22;FS=2.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:202,0,623
12	124010729	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
12	124010731	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
12	124011253	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,110
12	124011667	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:69,0,67
12	124012247	.	A	T	13	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:28:41,0,28
12	124012823	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124012824	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124014179	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	124014244	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
12	124014251	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:72:78,0,72
12	124014382	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:67:117,0,67
12	124014390	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.19	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:67:117,0,67
12	124014986	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
12	124015833	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124017850	.	G	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:137,0,261
12	124069213	.	T	C	2404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2433,169,0
12	124069614	.	T	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:115,0,32
12	124082863	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	124082922	.	A	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,161
12	124089793	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	124091539	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	124097766	.	A	G	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:224,0,252
12	124102889	.	C	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,235
12	124102893	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,235
12	124104049	.	A	G	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.708;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.878	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:314,0,634
12	124104686	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:123,0,564
12	124105328	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:99:109,0,318
12	124105336	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,318
12	124105839	.	T	C	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-2.324;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,10:34:99:333,0,912
12	124105848	.	A	G	1445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1474,102,0
12	124105908	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.285;DP=30;FS=8.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,6:30:99:165,0,940
12	124105925	.	G	A	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.189;DP=33;FS=10.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,8:33:99:255,0,933
12	124105948	.	C	T	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.468;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=13.14;ReadPosRankSum=1.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,16:41:99:567,0,940
12	124106171	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.979;DP=22;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:114,0,725
12	124106768	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:73,0,70
12	124107015	.	G	A	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
12	124109598	.	C	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:56:56,0,186
12	124109884	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,105
12	124109944	.	T	C	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.182;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:52:52,0,394
12	124109988	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
12	124110122	.	A	T	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
12	124134656	.	C	T	37.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:65,6,0
12	124135608	.	C	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
12	124138346	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	124141749	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124144395	.	A	G	909.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:938,66,0
12	124145697	.	T	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
12	124179417	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
12	124192415	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
12	124192728	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	124197099	.	C	T	135.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:164,15,0
12	124229166	.	G	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:51:51,0,239
12	124406798	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
12	124410657	.	T	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
12	124414098	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	124415453	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124417184	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	124418674	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	124419062	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	124419728	.	C	T	60.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:88,9,0
12	124421453	.	T	C	733.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:762,54,0
12	124423817	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	124427306	.	T	A	577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:606,45,0
12	124429279	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	124430014	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	124430612	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	124433905	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124435788	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	124437668	.	T	A	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
12	124446728	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	124447339	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:82,6,0
12	124447346	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
12	124447841	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	124450929	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	124451504	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	124477499	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	124489142	.	G	C	523.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:552,39,0
12	124489162	.	A	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
12	124496316	.	A	G	1938.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1967,138,0
12	124497218	.	G	A	414.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.321;DP=49;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.100	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,14:49:99:443,0,1284
12	124499542	.	G	A	374.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.441;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,12:39:99:403,0,1059
12	124499839	.	C	T	514.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DP=34;FS=5.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,15:34:99:543,0,688
12	124572235	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	124820705	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
12	124821523	.	G	C	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-1.489;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:125,0,609
12	124829234	.	C	T	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:421,0,257
12	124829255	.	A	G	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:557,45,0
12	124841675	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	124842462	.	T	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
12	124842887	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	124843025	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	124843298	.	C	T	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
12	124843895	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	124843958	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	124844053	.	G	A	126.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.37;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:17:155,0,17
12	124844238	.	C	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:113,0,33
12	124844290	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:114,0,34
12	124844921	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:138,0,224
12	124845280	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
12	124845436	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	124845590	.	C	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
12	124856618	.	A	G	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:241,0,318
12	124856660	.	T	A	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.140;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.328	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:445,0,160
12	124857234	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	124857274	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
12	124957627	.	C	T	383.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.189;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=22.57;ReadPosRankSum=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:412,0,110
12	124979811	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.636;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:119,0,377
12	124979833	.	C	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.050;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=9.75;ReadPosRankSum=-0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:194,0,383
12	125167349	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	125261839	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	125264018	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	125265201	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	125269799	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	125284748	.	A	G	795.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:824,60,0
12	125397750	.	A	G	941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:970,66,0
12	125398517	.	G	A	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
12	125398911	.	C	T	337.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:366,27,0
12	125399068	.	C	T	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
12	125399150	.	G	A	814.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.088;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,22:42:99:843,0,757
12	125399197	.	A	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,370
12	125399198	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,370
12	125399202	.	T	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,370
12	125431990	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,150
12	125434580	.	C	T	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
12	125434716	.	G	A	477.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:67:506,0,67
12	125437019	.	T	C	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
12	125437967	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	125437974	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
12	125438039	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	125438516	.	T	C	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:672,45,0
12	125438523	.	C	T	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:45:672,45,0
12	125448960	.	C	T	396.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:425,0,105
12	125450985	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	125467158	.	C	T	672.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.352;DP=21;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=32.04;ReadPosRankSum=1.357	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,18:21:55:701,0,55
12	125510104	.	G	A	1095.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1124,81,0
12	125510427	.	A	G	506.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.908;DP=24;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:535,0,357
12	125510718	.	A	G	783.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=1.358;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=26.13;ReadPosRankSum=-1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,21:30:99:812,0,299
12	125510954	.	A	G	526.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-1.443;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=26.34;ReadPosRankSum=-1.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:555,0,200
12	125511184	.	T	C	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=1.943;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.208	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:292,0,307
12	125511207	.	A	G	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-0.968;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:223,0,287
12	125511942	.	A	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:86:86,0,398
12	125511958	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,481
12	125511960	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,481
12	125511961	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,481
12	125512101	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:50:50,0,394
12	125512165	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.623;DP=17;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:101,0,466
12	125512507	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,139
12	125512540	.	A	G	35.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.383;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.574	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:64:64,0,743
12	125512598	.	G	C	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.253;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=23.13;ReadPosRankSum=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:514,0,290
12	125512925	.	A	T	751.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-0.025;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.076	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,20:28:99:780,0,257
12	125513179	.	T	C	618.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.773;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.318;QD=34.38;ReadPosRankSum=-0.632	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,16:18:32:647,0,32
12	125513238	.	C	A	334.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:363,0,211
12	125513459	.	A	G	573.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.050;DP=19;FS=10.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=30.20;ReadPosRankSum=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,15:19:99:602,0,118
12	125513870	.	G	A	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:43:43,0,499
12	125515001	.	G	A	1110.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1139,81,0
12	125515197	.	C	G	653.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.599;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=23.35;ReadPosRankSum=-0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,18:28:99:682,0,344
12	125607627	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	125627187	.	C	T	384.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=32.06;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:0:410,0,0
12	126467876	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
12	127650538	.	A	G	996.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1025,69,0
12	127650639	.	A	G	1496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1525,108,0
12	127650662	.	T	C	658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:687,48,0
12	127650669	.	A	G	658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:48:687,48,0
12	127650675	.	G	C	658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:48:687,48,0
12	129278207	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,230
12	129278864	.	A	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=23.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:199,0,395
12	129280105	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	129295390	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:67,0,35
12	129298735	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	129301183	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	131274843	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
12	131276448	.	G	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
12	131286807	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	131287482	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
12	131306314	.	C	G	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:78,0,27
12	131717581	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
12	132195674	.	A	C	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:614,45,0
12	132237848	.	T	C	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:438,33,0
12	132240010	.	G	A	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=17.57;ReadPosRankSum=1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:362,0,312
12	132241229	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	132263758	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
12	132266334	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
12	132268844	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	132270458	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	132271113	.	T	C	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:909,63,0
12	132311656	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
12	132312988	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:156,0,267
12	132313110	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:70:115,0,70
12	132313113	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=21.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:115,0,70
12	132317190	.	C	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
12	132317582	.	G	A	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
12	132317741	.	G	T	118.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:147,15,0
12	132319869	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	132325239	.	G	A	1080.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1109,84,0
12	132329207	.	C	T	223.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:252,21,0
12	132329444	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
12	132330602	.	G	T	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
12	132330735	.	C	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
12	132330811	.	C	G	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
12	132330941	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:81:81,0,81
12	132330945	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
12	132330946	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
12	132330947	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
12	132331373	.	C	T	194.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:223,18,0
12	132331547	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,334
12	132331580	.	C	G	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:48:278,0,48
12	132331847	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:116,0,32
12	132332107	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
12	132332683	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
12	132332821	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,342
12	132333178	.	G	C	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:36:525,36,0
12	132333188	.	T	C	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:36:525,36,0
12	132333589	.	T	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:344,27,0
12	132334142	.	T	C	249.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:278,21,0
12	132335963	.	T	G	409.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-1.022;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:438,0,335
12	132335965	.	T	C	831.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:860,60,0
12	132336900	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	132337570	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	132380823	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
12	132381696	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	132383375	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
12	132384834	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
12	132388500	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
12	132391106	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
12	132396603	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-1.386;DP=26;FS=9.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,4:26:99:101,0,855
12	132399386	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	132401566	.	C	T	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.489;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.952	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:305,0,664
12	132402020	.	T	C	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.289;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:414,0,277
12	132402044	.	C	A	391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.578;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.465	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:420,0,231
12	132402197	.	C	G	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:94:189,0,94
12	132402874	.	T	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:119,0,30
12	132403161	.	A	G	1011.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1040,75,0
12	132403654	.	T	G	244.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:273,21,0
12	132404259	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	132405198	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	132405523	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
12	132406275	.	A	C	1027.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1056,75,0
12	132407008	.	T	C	459.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.241;DP=29;FS=5.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,13:29:99:488,0,588
12	132407089	.	A	G	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.029;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:436,0,455
12	132407175	.	A	G	931.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:960,66,0
12	132419533	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	132421341	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
12	132422135	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:77,0,62
12	132422807	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,77
12	132422934	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,203
12	132423493	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,162
12	132424700	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,72
12	132427735	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
12	132427909	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
12	132504639	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:93:93,0,235
12	132562126	.	G	A	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-0.954;DP=24;FS=14.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:445,0,275
12	132609679	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	132621624	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:120,0,32
12	132621754	.	G	A	111.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:140,0,27
12	132622162	.	G	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,136
12	132622848	.	C	T	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,509
12	132623186	.	C	T	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:59:128,0,59
12	132623574	.	C	T	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-1.083;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:90:90,0,457
12	132623730	.	C	T	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.334;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:301,0,676
12	132624219	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.31;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:139,0,187
12	132624434	.	T	C	504.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.231;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=26.57;ReadPosRankSum=-1.294	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:533,0,144
12	132624660	.	C	T	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:179,0,678
12	132624987	.	C	G	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.716;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:392,0,587
12	132625432	.	C	T	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:307,0,212
12	132625501	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.095;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:180,0,674
12	132625850	.	C	T	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=-1.039;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:318,0,522
12	132626425	.	G	A	645.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.638;DP=22;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=29.35;ReadPosRankSum=1.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:99:674,0,107
12	132626474	.	C	T	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:130,0,350
12	132626855	.	C	T	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:295,0,448
12	132626907	.	C	T	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:288,0,230
12	132627321	.	C	G	338.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=16.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.021	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:367,0,320
12	132627360	.	C	T	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.747;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:350,0,434
12	132627377	.	C	T	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.102;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:321,0,512
12	132627637	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
12	132627855	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
12	132627865	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	132627877	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
12	132628736	.	C	G	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:92:291,0,92
12	132632910	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	132635989	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	133018970	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
12	133021157	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	133067343	.	A	G	201.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:230,21,0
12	133086533	.	G	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:57:57,0,143
12	133087707	.	C	G	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:228,0,64
12	133088165	.	G	A	365.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:394,0,135
12	133088255	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	133088370	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
12	133117489	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	133125871	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:106,0,28
12	133133808	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	133135433	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
12	133136791	.	G	T	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=2.074;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=15.60;ReadPosRankSum=-2.281	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:231,0,230
12	133137400	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
12	133139130	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
12	133140140	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	133142411	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
12	133144867	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	133145152	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
12	133145929	.	A	C	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
12	133146416	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,117
12	133148266	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
12	133155311	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
12	133155424	.	G	A	37.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:65,6,0
12	133155907	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,143
12	133156451	.	T	C	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
12	133159155	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	133159733	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-1.134;DP=27;FS=6.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:184,0,725
12	133159846	.	C	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-0.839;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:170,0,239
12	133160238	.	G	C	340.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=28.40;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:39:369,0,39
12	133199786	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	133200748	.	T	C	1004.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1033,72,0
12	133201947	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
12	133202004	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,115
12	133203297	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	133204412	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	133206307	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	133207412	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	133208979	.	T	C	891.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:920,66,0
12	133212582	.	G	A	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.708;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:435,0,562
12	133217851	.	C	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:299,21,0
12	133217872	.	G	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:21:299,21,0
12	133219831	.	T	C	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.178;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.320	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:450,0,336
12	133222747	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
12	133224132	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
12	133236000	.	C	T	543.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.571;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:572,0,388
12	133238035	.	C	G	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-2.148;DP=10;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:139,0,164
12	133238076	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,120
12	133249139	.	T	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:153,0,72
12	133253995	.	G	A	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=-2.391;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=13.34;ReadPosRankSum=2.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:255,0,332
12	133257837	.	C	A	270.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.545;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:299,0,160
12	133264332	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,201
12	133286894	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	133294333	.	C	T	1194.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1223,100,0
12	133297904	.	A	G	429.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.144;DP=35;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,13:35:99:458,0,862
12	133297966	.	A	G	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=1.180;DP=38;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,10:37:99:327,0,1055
12	133298095	.	A	G	49.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.712;DP=32;FS=9.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:78:78,0,1088
12	133298121	.	A	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.122;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=3.29;ReadPosRankSum=1.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:104,0,738
12	133298215	.	C	A	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
12	133298217	.	C	G	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
12	133298339	.	A	G	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=2.409;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:334,0,513
12	133298349	.	A	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.112;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:151,0,958
12	133298409	.	G	A	552.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.373;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,15:17:31:581,0,31
12	133298773	.	A	G	956.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:985,69,0
12	133303973	.	C	G	835.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:864,60,0
12	133306710	.	C	T	739.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:768,54,0
12	133309419	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
12	133311888	.	C	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
12	133312853	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
12	133313168	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	133313237	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	133313789	.	C	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
12	133318660	.	T	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:112,0,30
12	133331364	.	G	A	716.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.737;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=34.13;ReadPosRankSum=1.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,19:21:25:745,0,25
12	133334519	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	133334975	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:64,0,33
12	133335430	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
12	133336032	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
12	133336372	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
12	133336384	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
12	133338927	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
12	133346564	.	T	C	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:212,0,319
12	133349175	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	133349325	.	C	T	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:292,0,126
12	133349620	.	C	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
12	133359692	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	133359770	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	133360530	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
12	133376309	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	133384864	.	G	A	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:846,60,0
12	133389998	.	T	C	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-2.176;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:166,0,536
12	133393323	.	C	T	368.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=20.49;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:397,0,244
12	133399677	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	133399746	.	C	T	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
12	133400854	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
12	133404805	.	C	G	251.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,6:6:20:280,0,20
12	133404812	.	G	A	251.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:280,0,20
12	133405069	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
12	133412337	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	133417362	.	C	T	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
12	133417789	.	A	G	558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:587,42,0
12	133418069	.	C	T	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:553,42,0
12	133423695	.	A	G	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:465,36,0
12	133433173	.	T	C	998.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1027,72,0
12	133435716	.	T	G	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1080,75,0
12	133498358	.	T	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:118,0,28
12	133498521	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,158
12	133498857	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	133500611	.	G	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:151,0,109
12	133500806	.	G	A	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:161,0,30
12	133501081	.	A	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:122,0,32
12	133501212	.	A	G	134.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:163,0,27
12	133501738	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:158,0,29
12	133518838	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
12	133541359	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	133563254	.	T	C	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
12	133563333	.	C	G	144.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:173,15,0
12	133601770	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	133602250	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	133602266	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
12	133614396	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	133614397	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
12	133614816	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
12	133616843	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	133616904	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	133617038	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,154
12	133617991	.	G	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-1.231;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.828;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,7:21:99:240,0,472
12	133618022	.	G	A	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.648;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:246,0,418
12	133625276	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
12	133628217	.	A	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,120
12	133628220	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
12	133630931	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
12	133631459	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
12	133633459	.	A	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
12	133634450	.	A	C	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
12	133635613	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
12	133635970	.	G	C	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
12	133637089	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:95:188,0,95
12	133637760	.	A	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
12	133637875	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
12	133637953	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:78,0,65
12	133638829	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
12	133639351	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
12	133639605	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	133657066	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
12	133682655	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
12	133683261	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
12	133683280	.	A	T	123.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:152,15,0
12	133683628	.	A	T	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:658,45,0
12	133684321	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
12	133690434	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:74,0,71
12	133692329	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
12	133692764	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
12	133706994	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
12	133712437	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	133713440	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
12	133713921	.	C	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
12	133715587	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
12	133717204	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
12	133717224	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
12	133720563	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
12	133720865	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
12	133778796	.	C	T	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
12	133785252	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
12	133786289	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	19272254	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	19272264	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	19272286	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	19775753	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	20244612	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	20247075	.	A	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:97:97,0,261
13	20247171	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
13	20253097	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	20258009	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	20356941	.	T	A	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:826,57,0
13	20398669	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	20398742	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	20437753	.	G	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
13	20532968	.	C	G	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
13	20595466	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
13	20599887	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
13	20978006	.	A	G	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
13	21182862	.	C	G	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
13	21273755	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	21277192	.	T	C	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
13	21296121	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
13	21547317	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	21548026	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
13	21720956	.	C	T	2152.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2181,151,0
13	21722190	.	C	G	1195.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1224,84,0
13	21722557	.	A	G	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
13	21722643	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	21728012	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	21728134	.	G	A	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
13	21728320	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
13	21728483	.	C	T	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
13	21728687	.	T	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
13	21729064	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
13	21732094	.	C	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
13	21740113	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	21877479	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
13	21947766	.	C	T	654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:683,48,0
13	21947955	.	C	G	703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:732,51,0
13	21948502	.	T	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.779;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:225,0,223
13	21948570	.	T	C	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-2.302;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:38:38,0,933
13	21948576	.	T	C	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-1.356;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:228,0,294
13	21948988	.	C	T	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
13	21949047	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:59:150,0,59
13	21949093	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.567;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:80:80,0,537
13	21949107	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.189;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:75:75,0,616
13	21949161	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,212
13	21949361	.	T	C	520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:549,39,0
13	21951162	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	22067945	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	22070622	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
13	22070911	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	22076829	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	22178258	.	C	T	694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:723,60,0
13	23500823	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	23507382	.	G	A	119.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
13	23510632	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	24249957	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	24290621	.	T	C	1917.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1946,135,0
13	24291878	.	T	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
13	24291972	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
13	24292701	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
13	24293859	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	24294077	.	A	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
13	24294105	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	24294158	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
13	24294903	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	24295757	.	T	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
13	24295793	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	24296067	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
13	24296112	.	T	C	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:356,24,0
13	24296450	.	C	A	285.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:314,21,0
13	24296841	.	A	T	58.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:86,9,0
13	24296862	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	24296980	.	A	G	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
13	24301897	.	T	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
13	24301943	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
13	24306049	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	24307910	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	24309450	.	T	C	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
13	24309739	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
13	24310051	.	A	C	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
13	24310052	.	C	A	17.57	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=8.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
13	24408374	.	C	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
13	24411772	.	T	C	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:790,54,0
13	24853751	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	24875790	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	24876029	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	24876652	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	24876752	.	T	C	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:573,42,0
13	24877151	.	A	G	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
13	24877179	.	G	A	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
13	24877308	.	A	G	482.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:511,36,0
13	24877442	.	G	A	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:36:519,36,0
13	24877445	.	T	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:36:519,36,0
13	24877550	.	G	C	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:474,36,0
13	24878200	.	G	A	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
13	25006548	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	25008588	.	A	G	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
13	25008630	.	A	G	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:648,45,0
13	25009099	.	A	C	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
13	25020863	.	G	A	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
13	25021245	.	A	G	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
13	25027744	.	A	G	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
13	25029218	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
13	25052261	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	25075859	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	25460242	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
13	25460428	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	25464566	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
13	25464638	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	25472136	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	25691022	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
13	25693092	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
13	25693242	.	G	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
13	25693460	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	25821603	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
13	25823207	.	T	A	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
13	25831888	.	T	C	534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:563,42,0
13	25876011	.	G	A	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:702,51,0
13	25891636	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	25891637	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	25892031	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	25892114	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
13	25906925	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
13	25913798	.	G	A	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
13	26619547	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
13	26619877	.	A	G	188.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
13	26624935	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
13	26977389	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	26978304	.	G	A	272.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:301,0,385
13	27250823	.	T	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
13	27260589	.	A	G	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
13	27260831	.	C	T	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
13	27261195	.	T	C	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
13	27261557	.	G	A	319.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.99;ReadPosRankSum=-1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:15:348,0,15
13	27644553	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
13	27645539	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	27825753	.	G	C	602.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:631,45,0
13	27825902	.	T	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
13	27827811	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	27829310	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	27831438	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	28005747	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	28005748	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	28007765	.	A	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
13	28007891	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
13	28009851	.	G	A	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:360,27,0
13	28009920	.	G	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
13	28011594	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
13	28011963	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
13	28013748	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	28016236	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	28017722	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	28024694	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	28033756	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	28155920	.	C	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
13	28224258	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
13	28241287	.	G	A	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:401,30,0
13	28850567	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
13	28867010	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
13	28867180	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	28867258	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
13	29246923	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	29271966	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	29296413	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	29296427	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	29881790	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	30084173	.	G	A	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
13	30084535	.	A	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
13	30085083	.	C	G	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
13	30086225	.	T	G	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
13	30086745	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
13	30086927	.	T	C	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
13	30087146	.	A	G	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:721,51,0
13	30087778	.	T	A	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
13	30088049	.	T	A	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
13	30089092	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	30091819	.	G	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
13	30098622	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
13	30340094	.	G	A	652.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:681,48,0
13	30340585	.	T	C	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
13	30341030	.	A	G	1328.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1357,93,0
13	30778558	.	A	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
13	30828248	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	31031504	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	31031510	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	31031713	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	31031884	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	31032074	.	C	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
13	31036681	.	A	G	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
13	31039986	.	T	C	462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:491,33,0
13	31040048	.	C	T	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
13	31187244	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	31187246	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	31195630	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	31231806	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	31233063	.	G	A	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
13	31710355	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	31718552	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	31726112	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
13	31728256	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
13	31728391	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
13	31735759	.	G	A	1743.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1772,135,0
13	31891746	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
13	31903834	.	G	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
13	32911888	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	32913055	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	32914236	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
13	32915005	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	32949382	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	32973439	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	32974022	.	C	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
13	33014487	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	33085469	.	T	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
13	33097483	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
13	33098929	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,238
13	33099028	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,139
13	33099315	.	C	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
13	33099321	.	C	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:21:305,21,0
13	33099347	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	33099775	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:114,0,76
13	33100260	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	33100353	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
13	33101731	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
13	33104376	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	33105016	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	33106182	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	33232435	.	A	G	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
13	33349341	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
13	33351016	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	33678065	.	T	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:360,27,0
13	33678505	.	C	T	143.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:172,15,0
13	33679940	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	33689738	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	33697862	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	33697875	.	A	T	99.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:127,12,0
13	33703656	.	T	C	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
13	34431682	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	34929044	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	34933021	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	34935717	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	34949034	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	34963506	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	35109257	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
13	35112902	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	35146615	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	35150657	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	35156016	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	36877978	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	36886469	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
13	37575766	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	37577725	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
13	37579480	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	37580139	.	G	A	807.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:836,60,0
13	37583831	.	G	A	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:572,42,0
13	37585665	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	37597960	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	37598113	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
13	37598961	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	37600199	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	38931144	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	38932949	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	38935375	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
13	38936310	.	A	G	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:654,48,0
13	39262057	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
13	39263714	.	T	C	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
13	39454771	.	G	C	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
13	39620707	.	C	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	39622075	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
13	40229891	.	G	A	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:630,45,0
13	40229957	.	T	A	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
13	40325310	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	40329722	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	41328056	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	41382711	.	A	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
13	41383851	.	T	A	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
13	41384156	.	A	G	424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:453,33,0
13	41445442	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	41445470	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	41445625	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:63,0,34
13	41446652	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	41448137	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	41448345	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
13	41448995	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	41448999	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	41449146	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	41449308	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
13	41449329	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
13	41449352	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
13	41450468	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	41451166	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	41452567	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
13	41453256	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	41453700	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
13	41454305	.	A	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
13	41454404	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	41454936	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	41454996	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
13	41455034	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
13	41455125	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	41455661	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	41467686	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	41506721	.	C	T	631.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:660,45,0
13	41506884	.	A	G	522.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:551,39,0
13	41515286	.	T	A	1024.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1053,72,0
13	41533052	.	T	C	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:989,69,0
13	41635057	.	G	A	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:316,24,0
13	41705495	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	41706800	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
13	41834744	.	C	T	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
13	41837155	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	41837220	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	42141770	.	A	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
13	42764564	.	C	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
13	42804170	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
13	42805248	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
13	42808599	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	42809741	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
13	42812593	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
13	42814315	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
13	42816145	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	43630713	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	43631089	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	43635700	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	43635730	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	43636417	.	A	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
13	43639845	.	A	C	1484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1513,108,0
13	43681427	.	G	A	678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:707,51,0
13	43684965	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
13	43788031	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
13	44410669	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	44975763	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
13	44975899	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
13	44976684	.	C	T	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
13	44977216	.	T	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
13	44978574	.	G	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
13	45008585	.	C	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=-1.008;DP=28;FS=31.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:115,0,732
13	45011748	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	45563464	.	G	C	195.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:224,18,0
13	45603775	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	45910554	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	45911171	.	T	C	1946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1975,135,0
13	45911932	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
13	45948847	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	45953363	.	C	T	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
13	45953950	.	C	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
13	45955542	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	45955851	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	45961619	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
13	45961825	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	45962201	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	45968140	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
13	45985608	.	T	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
13	46034478	.	A	G	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
13	46067593	.	G	A	498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:527,36,0
13	46091540	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	46103935	.	A	G	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
13	46107177	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	46107928	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	46108853	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
13	46108854	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
13	46549923	.	C	G	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=1.333;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=14.38;ReadPosRankSum=-1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:359,0,463
13	46700642	.	G	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
13	46708291	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	47260054	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	47308109	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
13	47325150	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
13	48517289	.	A	G	1085.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1114,78,0
13	48547467	.	A	T	599.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:628,45,0
13	48594336	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
13	48619942	.	G	A	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:358,24,0
13	48624890	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	48630137	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	48666138	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	48901617	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	49030367	.	G	A	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:43:43,0,407
13	49345537	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	49883314	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
13	49883444	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
13	50008301	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
13	50018822	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
13	50038840	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	50057996	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	50060188	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	50061650	.	A	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
13	50062327	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
13	50067246	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	50093984	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
13	50237568	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	50241903	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	50275515	.	C	T	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
13	50296115	.	C	T	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:684,54,0
13	50487313	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
13	50488111	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
13	50565473	.	T	C	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:79,0,27
13	50569152	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:117,0,75
13	50569403	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
13	50570046	.	C	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
13	50573450	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	50750277	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	52334619	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	52340750	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
13	52507110	.	G	C	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
13	52507148	.	G	A	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
13	52515354	.	A	G	755.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:784,60,0
13	52515363	.	A	T	755.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:60:784,60,0
13	52519273	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,155
13	52519377	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	52520471	.	C	T	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:654,48,0
13	52523808	.	C	T	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
13	52524488	.	T	C	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
13	52536114	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	52544778	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:189,0,213
13	52585548	.	G	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:353,27,0
13	52597888	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	52598799	.	G	A	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
13	52603775	.	C	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
13	52605675	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
13	52607169	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	52767366	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	52987477	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	52987739	.	A	T	52.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
13	52988350	.	C	T	423.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:452,33,0
13	52989863	.	C	T	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
13	52998697	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	53035665	.	T	A	1052.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1081,75,0
13	53035783	.	T	C	926.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:955,66,0
13	53035925	.	A	G	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:855,60,0
13	53040070	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	53041388	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	53050479	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
13	53191674	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	53196163	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	53214492	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	53262175	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
13	53273634	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
13	60240571	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	60348009	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	64497767	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	64499371	.	A	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
13	64548970	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	64548982	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	64549179	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	64550396	.	G	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
13	64555068	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	64557062	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	64561782	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
13	64569588	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	64572477	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	64574407	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	64577541	.	C	T	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:429,33,0
13	64635938	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	64651624	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	64651735	.	T	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
13	64652990	.	A	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
13	64653089	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	64758618	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	67800935	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	73282735	.	T	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
13	73283057	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
13	73283184	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
13	73284411	.	A	T	678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:707,48,0
13	73301728	.	T	C	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
13	73329358	.	G	A	371.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:400,30,0
13	73343039	.	C	T	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:572,39,0
13	73349359	.	G	C	773.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:802,60,0
13	73356410	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	73650112	.	C	A	373.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:402,27,0
13	73650117	.	G	A	373.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:402,27,0
13	74263054	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	75860804	.	C	A	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
13	75884216	.	C	T	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
13	75936519	.	C	G	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:524,39,0
13	76056165	.	T	C	150.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:179,15,0
13	76109285	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
13	76123678	.	G	A	268.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:297,24,0
13	76423248	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
13	76427347	.	C	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
13	76427403	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:179,12,0
13	76427410	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
13	77570352	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	77573660	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
13	77574983	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	77575137	.	A	G	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
13	77575396	.	G	A	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
13	77579675	.	G	A	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
13	77579749	.	T	C	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:744,51,0
13	77579863	.	C	T	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:36:534,36,0
13	77579867	.	C	T	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:36:534,36,0
13	77579878	.	A	T	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:36:534,36,0
13	77579879	.	A	T	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:36:534,36,0
13	77579894	.	C	T	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:36:534,36,0
13	77579932	.	C	T	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
13	77579996	.	C	A	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:39:577,39,0
13	77580016	.	T	A	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:39:577,39,0
13	77580017	.	T	A	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:39:577,39,0
13	77580018	.	T	A	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:39:577,39,0
13	77580732	.	T	C	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
13	77583516	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	77584029	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	77597078	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	77597080	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	79886566	.	C	T	370.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:399,27,0
13	79886677	.	G	A	293.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:322,24,0
13	79887411	.	A	T	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
13	79888511	.	T	C	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
13	79889306	.	C	A	93.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:120,2,0
13	79889326	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
13	79891169	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	79891482	.	C	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	79891646	.	A	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
13	79891901	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
13	79892722	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	79894736	.	C	T	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
13	79909660	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	79916904	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,150
13	79929183	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	79929326	.	G	A	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
13	79940811	.	T	C	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
13	79996152	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	80126768	.	G	A	620.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-2.178;DP=18;FS=3.214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=34.45;ReadPosRankSum=2.178	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,16:18:10:648,10,0
13	80127458	.	A	G	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:581,39,0
13	80129328	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	81942026	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	82264679	.	T	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:73,0,33
13	82264949	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:33:76,0,33
13	86365079	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	86365578	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	86367009	.	C	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
13	86367877	.	T	C	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
13	86369120	.	C	T	941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:970,69,0
13	86373456	.	A	G	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:578,42,0
13	92005137	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	92005469	.	C	A	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
13	95055724	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
13	95059304	.	G	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
13	95264604	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	95279505	.	T	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
13	95280923	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	95281129	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	95281296	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	95660822	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	95660823	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	95672950	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	95858978	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
13	95858996	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	95861804	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	96444210	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	96444211	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	96446126	.	A	G	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
13	96506664	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
13	96540204	.	T	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
13	96638636	.	A	C	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
13	98117164	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
13	98119524	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
13	98795631	.	C	T	269.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:298,27,0
13	98899984	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	99030589	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
13	99031615	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	99034456	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	99035116	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	99035774	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99036838	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
13	99047988	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	99048026	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
13	99048206	.	C	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
13	99048887	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
13	99049532	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
13	99051780	.	T	A	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
13	99052514	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
13	99052958	.	T	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
13	99053268	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
13	99058572	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
13	99058749	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
13	99095651	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	99095674	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99095675	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99101426	.	G	C	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
13	99101583	.	C	A	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:493,39,0
13	99101869	.	G	C	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
13	99102449	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	99105302	.	G	A	794.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:823,57,0
13	99105395	.	G	A	764.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:793,57,0
13	99106979	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	99109319	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99112680	.	C	T	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:573,39,0
13	99739742	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99739744	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99977752	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	99983357	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	99988491	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	100036873	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	100518580	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
13	100727849	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,39
13	100729363	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	100731312	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
13	100888122	.	A	G	532.53	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.810;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=28.87;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:3:559,3,0
13	101167935	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
13	101176229	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
13	101176250	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	101256563	.	T	A	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
13	101287340	.	C	T	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
13	101287365	.	T	C	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
13	101287651	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	101289998	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	101294267	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	101327452	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	103454369	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	103455595	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	103493180	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
13	103493487	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
13	103493825	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
13	103498198	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	103499700	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
13	103501256	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	103504517	.	T	C	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
13	103527849	.	G	C	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
13	103527930	.	G	C	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
13	107145463	.	G	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
13	108863591	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
13	110408608	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	111164955	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
13	111165079	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	111176393	.	A	G	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
13	111216902	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	111297952	.	C	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
13	111313674	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
13	111315489	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
13	111315506	.	A	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
13	111316043	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	111316061	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	111318794	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	111318831	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	111319754	.	T	C	1146.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1175,84,0
13	111340342	.	G	A	971.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1000,69,0
13	111368316	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
13	111372392	.	T	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
13	111373368	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	111531264	.	C	T	704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:733,51,0
13	111531483	.	G	A	881.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:910,63,0
13	111531885	.	C	A	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
13	111532673	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	111533338	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
13	111535439	.	T	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
13	111549458	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
13	111549722	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:174,12,0
13	111549730	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
13	111549790	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
13	111550791	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
13	111551995	.	C	T	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
13	111552119	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	111552341	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,164
13	111552387	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:120,0,31
13	111554225	.	T	A	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
13	111556343	.	A	T	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
13	111557167	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	111557169	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
13	111858103	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	111859628	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
13	113199732	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	113199876	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	113201725	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
13	113246033	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113508839	.	G	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
13	113527967	.	G	A	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
13	113530725	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
13	113530905	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113531019	.	T	C	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
13	113531713	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
13	113536132	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	113536627	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
13	113537311	.	C	T	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
13	113539523	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
13	113540004	.	T	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
13	113584074	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113622383	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	113623255	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
13	113632109	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	113634510	.	G	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
13	113635131	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
13	113635963	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
13	113637009	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	113637010	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	113639099	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
13	113639133	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
13	113639175	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
13	113639207	.	T	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
13	113639536	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
13	113639869	.	A	G	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:287,21,0
13	113639872	.	A	G	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:287,21,0
13	113648400	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
13	113651481	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
13	113673742	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
13	113673945	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
13	113713051	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
13	113716630	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
13	113716633	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	113717538	.	C	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
13	113735390	.	T	C	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
13	113739518	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
13	113744139	.	G	A	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
13	113744669	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
13	113744874	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
13	113745611	.	T	G	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
13	113745961	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113745962	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113745964	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113746250	.	A	G	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
13	113746693	.	G	A	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:347,24,0
13	113746710	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	113747124	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
13	113747135	.	T	C	288.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:317,24,0
13	113747511	.	C	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
13	113748083	.	G	C	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
13	113748690	.	C	T	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:447,30,0
13	113749097	.	C	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
13	113749645	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
13	113750133	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
13	113750408	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
13	113751275	.	C	G	944.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:973,72,0
13	113751341	.	G	A	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:721,54,0
13	113751470	.	T	C	883.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:912,63,0
13	113751776	.	G	C	1012.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1041,75,0
13	113752901	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113760415	.	G	A	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
13	113763788	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
13	113763926	.	G	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
13	113764649	.	T	G	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
13	113819921	.	T	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
13	113824136	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
13	113828412	.	C	T	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
13	113828901	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
13	113830781	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
13	113831963	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
13	113836519	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
13	113837871	.	C	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
13	113838015	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	113844545	.	A	T	28.41	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:8:56,8,0
13	113862801	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	113877753	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	113877758	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
13	113877760	.	T	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
13	113877766	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
13	113878182	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
13	113887032	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
13	113887173	.	C	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
13	113889474	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
13	113891075	.	G	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
13	113910611	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	113910857	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	113913829	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
13	113917767	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	113951722	.	C	T	1270.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1299,102,0
13	113965176	.	C	A	2344.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2373,169,0
13	113977378	.	C	A	1661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1690,117,0
13	113977566	.	A	T	999.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1028,75,0
13	113978969	.	G	A	212.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:23:294,23,0
13	113987041	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	114012782	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	114013264	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
13	114013645	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
13	114013996	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
13	114013999	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:83,6,0
13	114014057	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
13	114014329	.	C	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
13	114292538	.	C	G	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
13	114427940	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
13	114634827	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
13	114780764	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
13	114796972	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
13	114799856	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
13	114800031	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
13	115000465	.	T	C	123.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:11:151,11,0
13	115000719	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
13	115002305	.	G	A	956.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:985,69,0
13	115004914	.	C	T	911.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:940,66,0
13	115004935	.	T	C	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
13	115008038	.	A	G	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
13	115008388	.	T	C	142.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:5:170,5,0
13	115010330	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
13	115025398	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
13	115047305	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
13	115047700	.	A	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
13	115049716	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,99
13	115059765	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
13	115086637	.	G	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
14	19035283	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	19042518	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	19042534	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	19045285	.	G	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
14	19046121	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	19046546	.	T	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	19861214	.	A	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
14	19863326	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	19886608	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	20729618	.	T	C	47.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:76,0,21
14	20731130	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	20731855	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:58,0,36
14	20737852	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	20738989	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	20743269	.	T	C	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
14	20755287	.	C	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=23.53;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:240,0,109
14	20755342	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	20755381	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	20756405	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	20764585	.	A	C	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:300,0,184
14	20770036	.	T	C	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:790,54,0
14	20784718	.	G	T	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.548;DP=43;FS=13.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,8:39:99:213,0,1216
14	20824181	.	T	C	1357.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1386,99,0
14	20834437	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:117,0,64
14	20834461	.	T	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:160,0,70
14	20834467	.	T	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
14	20834817	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
14	20835060	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,222
14	20836173	.	C	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,230
14	20837701	.	G	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=1.804;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:77:77,0,467
14	20847202	.	A	G	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:295,0,306
14	20850093	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:153,0,285
14	20852029	.	A	G	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:134,0,263
14	20852770	.	G	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:96:96,0,177
14	20852817	.	G	A	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=14.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:179,0,318
14	20854734	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
14	20863677	.	C	A	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:475,36,0
14	20871846	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	20916958	.	T	C	895.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-0.737;DP=34;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.019	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,24:34:99:924,0,322
14	20916987	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	20917442	.	A	T	330.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:359,27,0
14	20917665	.	T	C	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.222;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:288,0,214
14	20917744	.	C	T	172.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:201,0,24
14	20918113	.	A	G	249.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:278,0,22
14	20918208	.	T	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
14	20918598	.	A	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
14	20919188	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:124,9,0
14	20919192	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
14	20919551	.	C	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:162,0,28
14	20920043	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	20920250	.	T	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.530;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:306,0,211
14	20920340	.	A	G	245.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:21:274,0,21
14	20923149	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	20940515	.	C	T	1317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-1.979;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=29.95;ReadPosRankSum=1.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,35:44:99:1346,0,255
14	20940606	.	G	A	1410.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.163;DP=47;FS=3.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=30.02;ReadPosRankSum=-0.389	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,36:47:99:1439,0,338
14	20940626	.	C	T	1203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=1.038;DP=46;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,32:46:99:1232,0,450
14	21168055	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
14	21168084	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
14	21460902	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
14	21461090	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	21461502	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	21461904	.	T	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
14	21461909	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
14	21461912	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
14	21485506	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,350
14	21549893	.	G	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:135,0,71
14	21551058	.	G	A	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:96:180,0,96
14	21551069	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:158,0,61
14	21560765	.	G	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,317
14	21571119	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	21571208	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	21656380	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	21669601	.	T	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:162,0,68
14	21669922	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	21675738	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	21677694	.	T	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:131,0,399
14	21733923	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	21820029	.	A	C	1504.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1533,105,0
14	21826900	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	21829404	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	21831052	.	T	C	1639.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1668,117,0
14	21847761	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	21871653	.	C	T	583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:612,45,0
14	21899631	.	C	T	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.639;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.84;ReadPosRankSum=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:44:474,0,44
14	21928910	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,76
14	21938784	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	21939621	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	21940730	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	21941837	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
14	21960816	.	T	C	1276.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1305,90,0
14	21960969	.	G	A	1311.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1340,96,0
14	21971578	.	G	A	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-0.438;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.292	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,9:36:99:270,0,1087
14	23033990	.	T	C	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.555;DP=60;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:52,8:60:99:170,0,2067
14	23034026	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.265;DP=55;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,7:55:99:144,0,1922
14	23044002	.	G	T	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.569;DP=52;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,10:52:99:284,0,3581
14	23044004	.	C	T	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.835;DP=54;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,10:54:99:284,0,3581
14	23058084	.	A	G	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.370;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:231,0,918
14	23078810	.	A	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.478;DP=20;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:120,0,546
14	23080602	.	G	A	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.222;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:283,0,213
14	23080679	.	A	G	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:504,39,0
14	23081223	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
14	23236524	.	C	T	2296.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2325,165,0
14	23237593	.	G	A	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
14	23237835	.	C	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
14	23239512	.	A	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:122,0,297
14	23241027	.	C	G	545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:574,39,0
14	23299135	.	G	T	624.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.233;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=20.83;ReadPosRankSum=2.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:653,0,423
14	23299286	.	T	C	1937.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.217;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=29.55;ReadPosRankSum=-1.372	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,47:48:99:1966,99,0
14	23300095	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	23300194	.	G	A	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:127,0,316
14	23302266	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,201
14	23302585	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	23303641	.	A	C	650.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:679,48,0
14	23304094	.	G	A	130.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.16;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:159,0,25
14	23347628	.	A	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	23347793	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
14	23362628	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	23363537	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	23371465	.	C	T	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.639;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,10:35:99:318,0,973
14	23371780	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	23374435	.	G	A	796.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-1.120;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.444	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,21:31:99:825,0,344
14	23374862	.	C	T	953.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.859;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=27.25;ReadPosRankSum=1.366	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,25:34:99:982,0,301
14	23388326	.	A	C	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:334,0,210
14	23401142	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	23419036	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
14	23426182	.	C	A	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:207,0,259
14	23441179	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.945;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:68:68,0,571
14	23441476	.	T	C	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=21.55;ReadPosRankSum=0.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:567,0,336
14	23442114	.	T	C	711.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-1.164;DP=21;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,17:20:99:740,0,197
14	23442115	.	T	C	711.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.635;DP=21;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,17:20:99:740,0,197
14	23442122	.	T	C	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.491;DP=26;FS=10.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:175,0,1049
14	23442148	.	T	C	26.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.529;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.376	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:55:55,0,1611
14	23442149	.	T	C	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.347;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:292,0,449
14	23442150	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.139;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:152,0,1042
14	23451712	.	G	A	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:245,0,204
14	23452128	.	C	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:51:51,0,141
14	23458416	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	23459156	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,76
14	23464335	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	23467664	.	G	A	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:131,0,336
14	23502339	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,118
14	23530622	.	T	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.658;DP=36;FS=4.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,6:36:99:157,0,1137
14	23533758	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=7.53;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:96:96,0,215
14	23536833	.	C	G	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-1.164;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=9.58;ReadPosRankSum=1.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:172,0,365
14	23549319	.	A	G	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.037;DP=36;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,9:36:99:272,0,1051
14	23549379	.	C	G	996.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1025,72,0
14	23549380	.	G	A	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.460	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:259,0,696
14	23549785	.	T	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=1.050;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,6:29:99:177,0,892
14	23565012	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,142
14	23565603	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
14	23567761	.	A	G	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:40:40,0,448
14	23567774	.	T	A	332.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:7:360,0,7
14	23567974	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=11.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,153
14	23567991	.	C	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,201
14	23568018	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:116,0,64
14	23596320	.	A	G	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=-0.426;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:85:85,0,791
14	23598952	.	A	G	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.553;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.712	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:348,0,598
14	23652708	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	23768869	.	G	A	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.97;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:196,0,109
14	23769357	.	A	G	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:50:418,0,50
14	23777374	.	A	G	1146.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1175,87,0
14	23778698	.	A	G	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=22.72;ReadPosRankSum=1.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:460,0,235
14	23779634	.	C	G	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
14	23791222	.	T	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:49:186,0,49
14	23943918	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	23944505	.	G	A	860.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-1.167;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=30.74;ReadPosRankSum=-0.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,21:28:99:889,0,476
14	23944514	.	C	A	860.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.033;DP=27;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=31.88;ReadPosRankSum=-1.233	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:889,0,476
14	24033070	.	C	T	432.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.395;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:461,0,121
14	24036397	.	C	A	101.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=-1.399;DP=62;FS=5.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,9:62:99:130,0,2083
14	24081622	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	24081624	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	24107034	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:77,0,71
14	24120270	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	24166268	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
14	24167914	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
14	24410556	.	C	T	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
14	24550224	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
14	24551994	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,177
14	24567498	.	A	C	1193.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1222,93,0
14	24569734	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	24614361	.	T	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
14	24630091	.	A	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.75;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:62:260,0,62
14	24647957	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	24654489	.	T	C	729.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-2.757;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=25.16;ReadPosRankSum=2.806	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,21:29:99:758,0,253
14	24660498	.	G	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
14	24664013	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.151;DP=38;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.339	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,7:38:99:181,0,1224
14	24664609	.	T	C	619.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.320;DP=25;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:648,0,269
14	24665007	.	T	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
14	24667051	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:60:188,0,60
14	24672221	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	24673121	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	24673627	.	G	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:106,0,34
14	24673655	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	24673975	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	24674425	.	T	G	155.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:184,15,0
14	24675569	.	A	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:176,0,28
14	24679877	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.584;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,7:48:99:159,0,1643
14	24681887	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
14	24761690	.	C	T	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
14	24762882	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	24763948	.	T	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	24765063	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
14	24765622	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
14	24765684	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	24768952	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	24771137	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	24771256	.	T	C	1143.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1172,81,0
14	24774617	.	C	T	1158.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1187,81,0
14	24775846	.	C	T	974.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1003,72,0
14	24776344	.	T	C	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:907,63,0
14	24776401	.	C	A	1064.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1093,78,0
14	24777411	.	A	C	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:525,39,0
14	24777591	.	C	G	900.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:929,69,0
14	24779594	.	T	G	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
14	24786293	.	T	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	24786976	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
14	24843620	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	24845841	.	T	C	118.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:146,12,0
14	24846757	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	24887462	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	24888029	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
14	24899194	.	C	T	439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:468,33,0
14	24901249	.	A	C	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:477,36,0
14	24901276	.	G	T	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
14	24903245	.	C	T	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
14	24903964	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
14	24905123	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
14	24905533	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	24905548	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
14	24907288	.	G	A	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:822,57,0
14	24907859	.	C	T	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.159;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:554,0,115
14	24908266	.	C	T	609.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:638,45,0
14	24908870	.	T	C	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:45:672,45,0
14	24908875	.	G	A	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:672,45,0
14	24909072	.	T	C	1188.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1217,87,0
14	24909281	.	C	T	1754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1783,123,0
14	24909362	.	T	C	1786.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1815,129,0
14	24909475	.	C	G	1842.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1871,132,0
14	24909731	.	C	T	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
14	24910210	.	C	A	1021.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1050,78,0
14	24910846	.	C	T	241.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:270,24,0
14	24910876	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
14	24910973	.	T	G	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1080,72,0
14	24910974	.	T	A	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1080,72,0
14	24911116	.	C	T	514.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
14	24911169	.	C	T	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
14	24911764	.	G	A	928.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:957,69,0
14	24911852	.	C	G	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:488,36,0
14	24912679	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	24912697	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
14	24913761	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,197
14	24913829	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
14	24913933	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
14	24913967	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	24914008	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	24914129	.	G	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
14	24914227	.	G	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
14	24914431	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	24914681	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	24914727	.	A	G	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:27:401,27,0
14	24914730	.	T	G	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:401,27,0
14	24914739	.	C	A	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
14	24914802	.	C	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
14	24943476	.	G	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:87:87,0,654
14	24943485	.	A	G	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:270,0,224
14	24943573	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	24943817	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	24943842	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	24944121	.	G	A	270.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.87;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,7:8:14:299,14,0
14	24944645	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:163,12,0
14	24944652	.	C	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
14	24944695	.	C	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:115,0,32
14	24944766	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
14	24945136	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
14	24945147	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	24945188	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	24945243	.	C	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
14	24945301	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
14	24945331	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	24945506	.	T	C	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:531,39,0
14	24945750	.	T	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
14	24945976	.	C	G	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
14	24946009	.	A	T	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
14	24946078	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
14	24946244	.	C	T	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
14	24946259	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
14	24946297	.	T	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
14	24946349	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	24946351	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	30045978	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	31359024	.	A	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:151,0,29
14	31494988	.	G	A	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=29.07;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:57:348,0,57
14	31562792	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,286
14	31562794	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,286
14	31562802	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,286
14	31563119	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,80
14	31563122	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,80
14	31563591	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:77,0,69
14	31563651	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,196
14	31563840	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:58:58,0,487
14	31563846	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,1:7:58:58,0,487
14	31564279	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,114
14	31564650	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,115
14	31564700	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:94:146,0,94
14	31564722	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:146,0,111
14	31564752	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,158
14	31564808	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,367
14	31564822	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,232
14	31564834	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,115
14	31564887	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,229
14	31565040	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,184
14	31565144	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:141,0,148
14	31565160	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:51:76,0,51
14	31565171	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:52:59,0,52
14	31565206	.	A	G	156.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=31.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:19:185,0,19
14	31565211	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,253
14	31565212	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,253
14	31582380	.	A	G	959.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:988,69,0
14	31762081	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.445;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.842;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:225,0,627
14	31819047	.	C	T	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
14	31819913	.	A	G	701.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:730,51,0
14	31864485	.	G	C	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:690,48,0
14	32328508	.	G	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	32617020	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
14	32625852	.	G	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
14	32737640	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:67,0,37
14	32737654	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
14	33420086	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	34394467	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
14	34394886	.	G	A	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:645,45,0
14	34985645	.	G	A	1281.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1310,90,0
14	34985658	.	C	T	739.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.798;DP=32;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.343;QD=23.12;ReadPosRankSum=-0.642	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,20:32:99:768,0,434
14	34993863	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	34993982	.	G	C	638.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.106;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:667,0,433
14	35032169	.	C	T	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=-0.373;DP=35;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,11:35:99:339,0,891
14	35062312	.	C	T	1869.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1898,129,0
14	35222242	.	T	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.102;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,5:25:99:139,0,758
14	35222372	.	C	T	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.615;DP=19;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:66:66,0,688
14	35343629	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	35345352	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	35419013	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
14	35452302	.	G	A	1012.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1041,72,0
14	35495699	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	35496717	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	35497011	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	35516099	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	35551875	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
14	35554376	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	35735967	.	A	G	1178.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1207,84,0
14	35745022	.	C	T	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
14	35745642	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
14	35746288	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
14	35746750	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	35747817	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
14	35871217	.	G	A	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-1.828;DP=33;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,7:33:99:179,0,1004
14	36011424	.	A	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	36158828	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
14	36768276	.	T	C	906.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:935,66,0
14	36770813	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	36781859	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	36782888	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	36782984	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	36787226	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
14	36789729	.	T	G	1008.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1037,72,0
14	36789775	.	A	T	769.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:798,60,0
14	36789795	.	G	A	728.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:757,54,0
14	36812308	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	37135752	.	C	T	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.20;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:273,0,60
14	37146211	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,273
14	37147341	.	G	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
14	37148385	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	37148386	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	37641880	.	C	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
14	38019142	.	G	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
14	38021388	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	38022603	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	38023549	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	38023556	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	38025427	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
14	38026328	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	38026755	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
14	38030512	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	38045304	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	38059035	.	C	G	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:130,0,348
14	38061742	.	C	T	2195.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2224,174,0
14	38063120	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
14	38063562	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
14	38064215	.	G	C	1301.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1330,96,0
14	38065813	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	38200436	.	T	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
14	38208687	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
14	38209809	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	38210202	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	38211364	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	38212354	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	38212499	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	38266074	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
14	38268230	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	38277469	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	38293720	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	39517925	.	T	C	1055.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1084,75,0
14	39556185	.	G	C	1312.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1341,93,0
14	39612007	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
14	39620494	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	39628669	.	C	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,190
14	39639530	.	T	G	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
14	39642840	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	39650234	.	A	T	1776.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1805,126,0
14	39736680	.	T	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
14	39818145	.	G	A	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
14	45586348	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
14	45601738	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
14	45673130	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,198
14	45676794	.	T	C	75.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:104,0,27
14	45700409	.	C	T	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-2.607;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:130,0,422
14	45952120	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	50042201	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	50042966	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	50044392	.	T	C	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:650,45,0
14	50053073	.	C	G	669.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-1.645;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:698,0,555
14	50065332	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
14	50065359	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	50065717	.	G	C	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:694,48,0
14	50074502	.	A	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:122,0,291
14	50074520	.	C	T	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
14	50074760	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:81:81,0,109
14	50085571	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	50086640	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	50092134	.	A	T	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=9.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:83,0,73
14	50092902	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	50100386	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:810,60,0
14	50100683	.	C	G	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
14	50101370	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,112
14	50104412	.	C	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
14	50105746	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
14	50111833	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	50112067	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	50113382	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	50113915	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	50131846	.	G	T	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
14	50234884	.	T	G	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
14	50251369	.	A	G	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
14	50252496	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	50252861	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	50298962	.	T	A	721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:750,51,0
14	50319499	.	G	T	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
14	50575808	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:70,0,34
14	50575839	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
14	50616878	.	G	A	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
14	50711656	.	C	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:192,0,188
14	50712569	.	A	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
14	50712942	.	G	A	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
14	50713268	.	T	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:58:58,0,73
14	50713368	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,192
14	50713679	.	T	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
14	50791269	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
14	50793384	.	T	A	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:183,0,129
14	50794040	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	50795068	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
14	50919371	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	51057727	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
14	51101514	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
14	51101641	.	G	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
14	51111485	.	T	C	364.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:50:393,0,50
14	51130528	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	51204996	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.110;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:110,0,430
14	51224374	.	T	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:68,0,37
14	51225132	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	51237701	.	A	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
14	51239067	.	C	G	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
14	51262101	.	A	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	51265734	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
14	51716467	.	G	A	750.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:779,54,0
14	51722682	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,198
14	51722826	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	52117892	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	52156623	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,280
14	52182081	.	T	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
14	52186966	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:84:114,0,84
14	53107085	.	T	C	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
14	53109716	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
14	53185412	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:67,0,30
14	53197042	.	G	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:131,0,246
14	53242354	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-1.185;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:78:78,0,537
14	53242478	.	T	C	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.650;DP=15;FS=10.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:90:90,0,472
14	53242488	.	T	C	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.453;DP=16;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:164,0,418
14	53242568	.	T	C	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.480;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,427
14	53242849	.	C	T	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=1.027;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:248,0,250
14	53243412	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,265
14	53243438	.	T	C	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-1.614;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:82:82,0,504
14	53324891	.	A	C	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
14	53325090	.	C	T	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
14	53345378	.	G	A	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
14	53505135	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
14	53619463	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
14	53619544	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,117
14	54375228	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	54413001	.	G	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
14	54943816	.	T	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.979;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:131,0,431
14	55036863	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	55255673	.	C	T	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
14	55257590	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	55259203	.	T	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
14	55369502	.	A	G	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
14	55406123	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	55406549	.	A	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:142,0,110
14	55512273	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
14	55513848	.	G	C	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:266,0,103
14	55515068	.	G	T	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:143,0,280
14	55520000	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	55533610	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,131
14	55534466	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,74
14	55535774	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,180
14	55552500	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
14	55552629	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,157
14	55553404	.	G	A	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:50:50,0,117
14	56018645	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	56025783	.	C	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
14	56079039	.	A	T	762.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-1.344;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=26.30;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,20:29:99:791,0,312
14	56131144	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	57048044	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
14	57099859	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
14	57698313	.	C	T	911.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:940,66,0
14	57759392	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	57860688	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	57876265	.	G	A	672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:701,51,0
14	57876575	.	T	C	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:487,33,0
14	57876842	.	T	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
14	57881075	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	58563694	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	58666882	.	A	G	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:291,0,160
14	58732748	.	G	A	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-1.739;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=24.63;ReadPosRankSum=1.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:447,0,158
14	58733401	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:117,0,426
14	58733854	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:80:80,0,201
14	58737402	.	C	T	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:356,24,0
14	58737766	.	A	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
14	58739537	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	58752112	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	58752478	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	58761129	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	58768333	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:180,0,258
14	58838668	.	A	G	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:180,0,61
14	58838701	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
14	58839339	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	58893791	.	T	G	686.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:715,51,0
14	58893813	.	G	C	683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:712,57,0
14	58917454	.	G	A	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
14	58937416	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
14	58953746	.	C	G	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
14	59655461	.	C	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.893	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:115,0,430
14	59789727	.	G	A	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
14	59797235	.	A	G	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:926,66,0
14	59826703	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	59827074	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	59827968	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	59835972	.	A	C	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:657,48,0
14	59941972	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	59969219	.	A	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
14	59970779	.	A	G	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.131;DP=22;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.066	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:415,0,396
14	59971168	.	T	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
14	59971611	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	59971638	.	A	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	60558684	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
14	60558742	.	C	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:108,0,71
14	60559060	.	G	T	285.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:314,24,0
14	60559072	.	A	G	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
14	60574539	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	60581863	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
14	60581935	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
14	60582053	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	60716016	.	C	G	84.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:26:113,0,26
14	60745330	.	T	C	111.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:139,12,0
14	60765245	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
14	61112667	.	G	C	289.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:318,24,0
14	61124940	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	61176485	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
14	61177674	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	61177779	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	61178027	.	C	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	61180657	.	T	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,241
14	61438306	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	61440183	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	61440631	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	61441188	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
14	61443754	.	A	T	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
14	61445967	.	A	G	678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:707,48,0
14	61449328	.	T	A	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
14	61509924	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	61520070	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	61537316	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
14	61745292	.	G	A	719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:748,51,0
14	61745417	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:156,0,71
14	61747644	.	A	G	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:278,0,203
14	61766016	.	G	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
14	61768916	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	61789318	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	61857969	.	A	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:170,0,106
14	61997226	.	C	T	330.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:359,27,0
14	62207575	.	G	A	506.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=-0.720;DP=44;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,16:44:99:535,0,1097
14	62210505	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	62213848	.	T	C	1304.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1333,93,0
14	63838879	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:116,0,72
14	63839740	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	63839870	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	63840466	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
14	63841891	.	A	G	361.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.489;ClippingRankSum=-1.220;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=21.28;ReadPosRankSum=1.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:390,0,232
14	63842235	.	T	C	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:219,0,231
14	64491695	.	T	C	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
14	64494278	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
14	64496749	.	C	T	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
14	64497930	.	G	A	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
14	64498037	.	G	A	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
14	64519035	.	A	G	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
14	64519455	.	A	G	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
14	64522674	.	G	C	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
14	64522843	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
14	64612845	.	C	T	726.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:755,54,0
14	64612858	.	C	A	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:636,45,0
14	64637147	.	C	A	705.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:734,51,0
14	64656855	.	T	C	556.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.161;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=24.21;ReadPosRankSum=-0.226	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:585,0,258
14	64692630	.	G	C	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:854,60,0
14	64692825	.	G	A	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:617,42,0
14	64692906	.	T	A	177.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:39:239,0,39
14	64826021	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	64826024	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	64851477	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	64852905	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	64882380	.	A	G	670.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-1.014;DP=36;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.824	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,19:36:99:699,0,592
14	64908845	.	G	A	1540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1569,111,0
14	64969038	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
14	64970462	.	G	A	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
14	64975679	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	64988830	.	C	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:224,0,263
14	65000038	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	65065746	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	65497353	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	66028446	.	A	G	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.560;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:556,0,236
14	66209190	.	C	G	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:93:392,0,93
14	67937892	.	A	C	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:598,42,0
14	67938078	.	A	G	776.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:805,57,0
14	67938472	.	C	A	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
14	67938638	.	G	A	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
14	67938818	.	G	A	565.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:594,42,0
14	67939483	.	T	C	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
14	68031052	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
14	68032364	.	C	G	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=21.88;ReadPosRankSum=-1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:85:247,0,85
14	68032874	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:70,0,34
14	68034304	.	A	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
14	68035879	.	A	G	188.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:217,0,25
14	68036445	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:41:118,0,41
14	68036464	.	C	G	129.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:158,0,27
14	68042496	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
14	68042574	.	A	G	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=1.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:89:383,0,89
14	68045935	.	G	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
14	68053802	.	T	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.733;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:162,0,340
14	68053977	.	A	C	653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:682,48,0
14	68055613	.	C	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
14	68055884	.	A	G	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.910;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:428,0,132
14	68059834	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
14	68060574	.	G	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,176
14	68066979	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
14	68115001	.	A	G	250.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:279,0,19
14	68116881	.	T	G	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:225,0,263
14	68117491	.	G	A	345.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.640;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:374,0,790
14	68213413	.	G	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
14	68213571	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
14	68213744	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	68213792	.	A	G	166.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:21:195,0,21
14	68215764	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	68234539	.	T	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
14	68263036	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	68263039	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
14	68264867	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
14	68589978	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	68715167	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	68715171	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	69007232	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	69074016	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	69255644	.	A	C	1577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:99:1606,112,0
14	69255652	.	G	T	1577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:99:1606,112,0
14	69255660	.	G	C	1577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:99:1606,112,0
14	69257858	.	C	T	516.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:545,39,0
14	69258841	.	C	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
14	69262441	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
14	69521345	.	G	A	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:129,0,324
14	69658733	.	T	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
14	69704553	.	G	T	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.110;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:421,0,104
14	69709373	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:119,0,32
14	69710257	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	69819101	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	69864980	.	G	A	397.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.398;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.353	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,16:36:99:426,0,590
14	69926959	.	G	A	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:127,0,450
14	69928307	.	G	T	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:95:95,0,279
14	69928943	.	A	G	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=18.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:244,0,417
14	69997585	.	A	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:70,0,33
14	70149434	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	70171418	.	T	C	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.549	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:247,0,455
14	70178337	.	T	C	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:654,45,0
14	70178981	.	G	A	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
14	70180412	.	T	G	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=-1.299;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:290,0,257
14	70180778	.	C	G	636.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:665,45,0
14	70793004	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.509;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:140,0,548
14	70826458	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	70833768	.	G	T	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:522,36,0
14	70833819	.	C	G	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:183,0,106
14	70835246	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:100,0,168
14	70835925	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,204
14	70835964	.	A	C	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:561,39,0
14	70836635	.	T	C	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:65:237,0,65
14	70836753	.	C	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,178
14	70837256	.	C	A	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:58:317,0,58
14	71108942	.	G	A	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
14	71109153	.	C	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
14	71138716	.	A	C	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:132,0,346
14	71138730	.	C	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:181,0,258
14	71139279	.	G	T	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:85:85,0,226
14	71140209	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
14	71189916	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
14	71191423	.	C	T	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:190,0,64
14	71193303	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
14	71194153	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:113,0,34
14	71199452	.	G	A	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=1.881;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.53;ReadPosRankSum=-1.881	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:168,0,155
14	71202650	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	71444788	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
14	71754245	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	71754260	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	71754262	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	71788468	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	73422350	.	T	G	368.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.985;DP=24;FS=9.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,11:24:99:397,0,471
14	73428660	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	73436805	.	G	C	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:63:234,0,63
14	73525265	.	A	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,105
14	73689778	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	73743205	.	G	C	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.340;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:161,0,431
14	73748498	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:74,0,29
14	73958375	.	T	C	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:199,0,247
14	73958812	.	T	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=1.491;DP=26;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.491	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:188,0,707
14	74035671	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:186,0,235
14	74058832	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,176
14	74061968	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.454;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:152,0,626
14	74164491	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	74166590	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
14	74179765	.	A	C	66.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.531;ClippingRankSum=-0.089;DP=35;FS=75.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.195	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,11:35:95:95,0,901
14	74181044	.	T	C	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:636,48,0
14	74184192	.	A	G	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
14	74184530	.	A	G	207.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:236,0,25
14	74184539	.	A	C	207.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,6:6:25:236,0,25
14	74184889	.	G	C	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
14	74184917	.	A	G	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.84;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:334,0,143
14	74185345	.	C	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:56:56,0,183
14	74196686	.	T	C	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
14	74203789	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-1.678;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:253,0,280
14	74205878	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:185,0,264
14	74206481	.	T	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
14	74206847	.	A	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:137,0,222
14	74253818	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:96,0,113
14	74318714	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,75
14	74399291	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
14	74433129	.	C	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,263
14	74454813	.	C	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,230
14	74514674	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
14	74525411	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,117
14	74526942	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,193
14	74527203	.	G	A	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
14	74537194	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	74666225	.	T	C	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:93:93,0,406
14	74666641	.	A	G	282.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.43;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:311,0,18
14	74666800	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:101,0,145
14	74666824	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,187
14	74752902	.	A	C	405.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:50:434,0,50
14	74753278	.	T	C	228.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:257,21,0
14	74763371	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
14	74940602	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	74940612	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	74962275	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	74962670	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	75128316	.	A	C	233.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.791;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.220	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:271,0,603
14	75128425	.	G	A	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.910;DP=18;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:297,0,356
14	75130235	.	T	G	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:654,45,0
14	75202372	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,305
14	75202373	.	A	G	256.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:21:285,0,21
14	75202532	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=4.34;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:89:89,0,427
14	75203004	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:98:98,0,277
14	75230345	.	G	C	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:55:343,0,55
14	75276428	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.296;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:152,0,491
14	75279395	.	T	A	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:47:582,47,0
14	75288518	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	75290018	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	75291531	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	75293374	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	75293386	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	75377555	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	75378331	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
14	75386576	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
14	75388183	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
14	75388803	.	G	A	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
14	75389074	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
14	75476071	.	G	C	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
14	75483812	.	T	C	687.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:716,51,0
14	75513883	.	T	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
14	75520065	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	75549370	.	T	C	779.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:808,57,0
14	75550584	.	G	T	665.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:694,48,0
14	75551254	.	C	T	1061.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1090,75,0
14	75561152	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	75574087	.	C	T	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:672,48,0
14	75590822	.	G	A	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
14	75599647	.	A	G	1140.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1169,81,0
14	75600697	.	C	T	714.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:743,51,0
14	75894945	.	C	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:53:53,0,111
14	75936517	.	T	C	648.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:677,48,0
14	75937022	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
14	76045362	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,100
14	76045858	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,151
14	76113002	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	76156609	.	C	T	365.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:394,30,0
14	76249778	.	G	A	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=27.29;ReadPosRankSum=0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:94:383,0,94
14	76426723	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
14	76427780	.	T	A	63.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
14	76447850	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,109
14	76541672	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
14	76645095	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:78,0,28
14	76662902	.	A	G	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
14	76663551	.	A	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
14	76663838	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
14	76663938	.	A	T	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
14	76666256	.	A	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:122,0,33
14	76668356	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:79,0,34
14	76669658	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	76671382	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:114,0,59
14	76672627	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
14	76673400	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	76673409	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
14	76673412	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
14	76675540	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	76676827	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,197
14	76676900	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	76677057	.	T	C	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
14	76679102	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	76680234	.	G	C	44.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:73,0,25
14	76696207	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
14	76716853	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	77123311	.	A	G	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
14	77123458	.	A	G	176.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:205,0,27
14	77124640	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:76,0,65
14	77248479	.	G	A	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.468;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:307,0,212
14	77254836	.	A	C	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:53:279,0,53
14	77275630	.	C	A	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:95:95,0,224
14	77492891	.	G	A	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
14	77494682	.	G	A	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:577,42,0
14	77495344	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	77581042	.	A	G	622.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:651,45,0
14	77581481	.	C	A	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
14	77582362	.	C	T	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
14	77582483	.	G	T	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
14	77582643	.	T	C	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
14	77688982	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	77697967	.	A	G	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:358,27,0
14	77703057	.	A	G	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
14	77720113	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:51:155,0,51
14	77720303	.	T	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:118,0,30
14	77721374	.	T	C	128.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:15:157,0,15
14	77722148	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
14	77723469	.	C	A	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:279,0,403
14	77723470	.	C	A	250.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:279,0,403
14	77723972	.	G	T	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,421
14	77787088	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:114,0,29
14	77788908	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	77793207	.	G	A	654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:683,48,0
14	77794283	.	T	C	851.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:880,63,0
14	77804842	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
14	77805376	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
14	77886081	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	77893276	.	G	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
14	77893431	.	A	G	541.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:570,39,0
14	77926011	.	C	T	2782.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2811,193,0
14	77928525	.	A	G	1906.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1935,132,0
14	77930181	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	77930188	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	77932111	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	77932619	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
14	77933986	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	77935520	.	G	A	1877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1906,135,0
14	77973982	.	T	C	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
14	77974181	.	C	A	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
14	77974990	.	C	T	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:573,39,0
14	77975015	.	A	T	457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:486,33,0
14	77975103	.	T	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
14	77975431	.	G	A	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:43:43,0,372
14	77976325	.	T	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
14	78028803	.	A	G	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
14	78174473	.	A	C	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.417;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.228	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:318,0,526
14	78184566	.	C	A	760.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:789,54,0
14	78195782	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	78197365	.	C	T	1417.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1446,102,0
14	78230967	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	79533514	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	79533521	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	79533525	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	80330132	.	G	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
14	81016077	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	81620453	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	81737076	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
14	81941413	.	A	G	562.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.047;DP=20;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=28.14;ReadPosRankSum=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:591,0,155
14	81942059	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.318;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:74:74,0,612
14	88237810	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	88237822	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	88399801	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,117
14	88399950	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:107,0,66
14	88400087	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	88400353	.	C	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:182,0,132
14	88401213	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
14	88407875	.	T	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
14	88407888	.	A	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:154,0,31
14	88411947	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
14	88450770	.	G	A	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:105,0,71
14	88852031	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	88852166	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,157
14	88862529	.	G	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:200,0,28
14	88935925	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	88938652	.	A	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:161,0,29
14	89040245	.	A	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
14	89040317	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:73,0,30
14	89078927	.	A	G	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:623,42,0
14	89291398	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	90261928	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	90262313	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	90262421	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
14	90262535	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
14	90262939	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
14	90263525	.	C	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
14	90341434	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
14	90341445	.	T	C	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
14	90724566	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	90724803	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	90729427	.	G	A	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
14	90729565	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	90730265	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	90730851	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	90730911	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	90730943	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	90734190	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	90734378	.	G	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
14	90736477	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,103
14	90739446	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
14	90741015	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	90741612	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
14	90742295	.	T	C	251.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
14	90743250	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
14	90743876	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	90743967	.	G	A	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:192,0,99
14	90744546	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,225
14	90752908	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	90756760	.	A	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:261,0,179
14	90758454	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	90767607	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,217
14	90863489	.	G	A	2878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2907,223,0
14	90863870	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:75,0,31
14	90864418	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	90864547	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	90864608	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	90864848	.	C	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,110
14	90865283	.	T	C	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
14	90865462	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
14	90865627	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,111
14	90866346	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,116
14	90869110	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:77,0,72
14	90873412	.	C	G	456.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.313;DP=55;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,15:55:99:485,0,1601
14	91007618	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	91123575	.	T	C	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
14	91161862	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
14	91315986	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	91636395	.	C	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:312,0,374
14	91671124	.	G	A	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.768;DP=23;FS=11.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:237,0,643
14	91681921	.	G	A	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.78;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:266,0,101
14	91682712	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
14	91683743	.	C	T	107.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:135,12,0
14	91683928	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,103
14	91683929	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,103
14	91683932	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,103
14	91684625	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,230
14	91685039	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	91686177	.	C	A	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
14	91686302	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:119,0,32
14	91686554	.	G	A	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:233,0,99
14	91687291	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,116
14	91688568	.	G	T	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:160,0,28
14	91688644	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,157
14	91691354	.	T	C	672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:701,51,0
14	91691471	.	G	A	467.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.465;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.527	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:496,0,368
14	91738577	.	A	G	747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:776,54,0
14	91738696	.	T	G	836.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.569;DP=21;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.404	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:53:865,53,0
14	91739081	.	A	G	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:778,54,0
14	91751808	.	G	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:153,0,72
14	91752509	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	91760657	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.896;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:145,0,266
14	91773568	.	T	C	605.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:634,45,0
14	91776434	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	91845290	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	91884116	.	C	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	91925027	.	G	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.700;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.343;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:183,0,783
14	91948043	.	T	C	634.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-1.563;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=24.41;ReadPosRankSum=0.431	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,17:26:99:663,0,313
14	91990729	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92022452	.	G	A	22.52	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:61,6,0
14	92025310	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	92026454	.	C	T	40.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:69,0,21
14	92027036	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	92029579	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92029580	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92031976	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	92034309	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92041075	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	92041294	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
14	92041890	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	92042108	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	92043743	.	C	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	92044671	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
14	92045326	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,105
14	92045735	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	92046520	.	A	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
14	92046733	.	C	A	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:105,0,74
14	92068281	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	92069482	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	92074408	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92074432	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	92084004	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
14	92088016	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	92207247	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92207255	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	92223171	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
14	92226416	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	92228760	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:72,0,34
14	92241459	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	92245396	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
14	92246165	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
14	92247477	.	A	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,195
14	92248464	.	C	T	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:50:50,0,376
14	92249126	.	G	A	899.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:928,63,0
14	92250636	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:50:50,0,224
14	92251363	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	92251479	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,249
14	92268615	.	T	A,G	1021.29	PASS	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,6,24:30:99:1191,947,931,247,0,175
14	92302561	.	A	G	328.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:357,30,0
14	92465749	.	C	T	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:47:47,0,474
14	92527977	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	93170993	.	C	T	251.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:11:279,0,11
14	93178191	.	A	G	348.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:377,30,0
14	93199080	.	C	T	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=20.92;ReadPosRankSum=-0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:342,0,211
14	93264546	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	93276654	.	T	C	713.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.197;DP=28;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:742,0,301
14	93406702	.	A	G	2279.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2308,160,0
14	93406789	.	G	T	650.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-2.291;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.328	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,19:53:99:679,0,1289
14	93407062	.	A	G	1855.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1884,129,0
14	93407248	.	A	G	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.288;DP=59;FS=3.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.617	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,18:59:99:529,0,1487
14	93407301	.	C	A	1024.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.463;ClippingRankSum=-0.318;DP=51;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,31:51:99:1053,0,710
14	93407481	.	T	C	2429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2458,169,0
14	93407486	.	C	T	2429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2458,169,0
14	93407535	.	G	A	666.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.256;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,19:49:99:695,0,1136
14	93407771	.	G	A	1060.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-1.533;DP=46;FS=2.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=23.06;ReadPosRankSum=1.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,28:45:99:1089,0,581
14	93429511	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	93482709	.	A	G	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:78,0,26
14	93610421	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	93649383	.	C	T	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
14	93649501	.	A	G	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.553;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.645	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:460,0,576
14	93693422	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=6.88;ReadPosRankSum=-1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:97:97,0,269
14	93693604	.	T	G	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.517;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.414	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:307,0,629
14	93707741	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,261
14	93707752	.	G	A	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:99,0,113
14	93707909	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,245
14	93755562	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	94522004	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
14	94524216	.	T	C	1392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1421,99,0
14	94847262	.	T	A	422.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=0.462;DP=26;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:451,0,487
14	94856914	.	G	A	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=23.25;ReadPosRankSum=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:377,0,177
14	94857010	.	C	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
14	95554142	.	T	C	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=1.466;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,342
14	95555205	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
14	95556669	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,198
14	95651434	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,111
14	95672964	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	95674971	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	95674983	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	96000090	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:93:111,0,93
14	96000890	.	G	A	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
14	96005965	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	96010589	.	G	A	1096.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1125,78,0
14	96010866	.	A	G	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:561,39,0
14	96010929	.	G	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-3.016;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.954	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:257,0,188
14	96555526	.	C	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:137,0,318
14	96556846	.	C	T	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
14	96556914	.	T	C	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
14	96557121	.	T	C	840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:869,60,0
14	96557792	.	T	C	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:465,0,314
14	96557873	.	G	T	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
14	96558235	.	T	C	799.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:828,57,0
14	96558881	.	C	G	887.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:916,63,0
14	96559723	.	G	A	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
14	96559791	.	C	T	562.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:591,42,0
14	96560092	.	G	A	164.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:192,8,0
14	96705694	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	96707457	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
14	96708667	.	T	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
14	96708782	.	A	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:95:150,0,95
14	96730142	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
14	96747986	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
14	96748288	.	T	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
14	96748610	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
14	96748876	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
14	96748991	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
14	96749759	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
14	96749846	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	96750033	.	A	G	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:81,0,24
14	96751010	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
14	96751794	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,343
14	96771959	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
14	96777468	.	G	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:147,0,236
14	96781912	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
14	96795029	.	A	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:176,0,342
14	96797724	.	G	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
14	96829290	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
14	96846092	.	G	A	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
14	96852071	.	T	C	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-0.267;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:321,0,505
14	96853454	.	C	T	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:531,36,0
14	97299853	.	A	G	290.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:82:319,0,82
14	97321689	.	C	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-1.333;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.400	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:162,0,352
14	97379289	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	97401097	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	97428262	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	98424651	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	98435678	.	G	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:97:97,0,239
14	98435696	.	T	C	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
14	98444369	.	T	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
14	99439260	.	C	T	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
14	99876216	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	99971280	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	99979155	.	T	C	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
14	99980087	.	C	G	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=25.65;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:90:336,0,90
14	99981105	.	G	C	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:214,0,236
14	99989216	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	99989442	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	99990389	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	99990931	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	99991597	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	99991636	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	99991745	.	A	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
14	99991803	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	99991966	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	99991985	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	99992700	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
14	100069742	.	G	A	177.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:206,18,0
14	100074000	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
14	100380948	.	T	C	147.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:176,15,0
14	100389944	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:70,0,37
14	100407381	.	T	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
14	100594958	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
14	100599164	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
14	100599437	.	G	T	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
14	100600803	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
14	100606678	.	G	T	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:460,36,0
14	100607360	.	T	C	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
14	100608274	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
14	100608652	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
14	100611105	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
14	100615665	.	T	C	1128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1157,84,0
14	100618492	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	100625902	.	C	T	800.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:829,60,0
14	100705277	.	G	T	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:283,0,246
14	100742355	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
14	100743421	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
14	100747202	.	T	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
14	100748192	.	G	A	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
14	100748623	.	C	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
14	100748844	.	A	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
14	100758502	.	G	A	1353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1382,96,0
14	100759046	.	C	A	743.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-1.796;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=23.99;ReadPosRankSum=1.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,20:31:99:772,0,368
14	100759738	.	A	C	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.258;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:284,0,292
14	100759965	.	A	G	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
14	100760272	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:80:116,0,80
14	100762654	.	T	C	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.070;DP=18;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=0.57;ReadPosRankSum=0.773	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,2:18:38:38,0,1272
14	100762658	.	T	C	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.070;DP=18;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=0.57;ReadPosRankSum=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,2:18:38:38,0,1272
14	100762714	.	T	C	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=16.74;ReadPosRankSum=-1.943	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:296,0,296
14	100762740	.	A	G	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:127,0,343
14	100763954	.	G	T	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:304,0,535
14	100764387	.	T	C	580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:609,42,0
14	100764549	.	A	G	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
14	100764601	.	G	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:136,0,276
14	100764639	.	G	A	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
14	100764756	.	G	A	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:258,0,295
14	100764839	.	T	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:475,36,0
14	100766996	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:56:56,0,205
14	100767044	.	C	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,113
14	100769938	.	G	A	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:160,0,31
14	100772672	.	G	C	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=9.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:277,0,749
14	100808845	.	G	A	895.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:924,66,0
14	100836681	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	100847523	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	100847707	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,79
14	100847930	.	A	G	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:160,0,71
14	100996312	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
14	102414825	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	102415595	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
14	102415822	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	102507065	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	102518365	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	102547105	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	102547218	.	G	A	716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:745,51,0
14	102548224	.	T	C	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	102548384	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
14	102549231	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
14	102549262	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
14	102550803	.	G	A	1685.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1714,117,0
14	102552773	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	102552775	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	102568296	.	G	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
14	102568367	.	T	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
14	102684388	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
14	102687133	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	102786558	.	C	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
14	102790626	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:79:81,0,79
14	102790627	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:79:81,0,79
14	102808330	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,168
14	102810628	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
14	102814698	.	A	G	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:822,60,0
14	102814945	.	G	A	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.732;DP=25;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=25.23;ReadPosRankSum=-0.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,19:25:99:659,0,190
14	102815042	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.425	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,6:31:99:157,0,987
14	102901201	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,156
14	102916165	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,196
14	102964654	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	102970509	.	C	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,325
14	102971036	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:68,0,67
14	102971050	.	T	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:119,0,58
14	102974999	.	T	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-1.855;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=11.83;ReadPosRankSum=-1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:182,0,304
14	103059220	.	G	A	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
14	103188738	.	C	T	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=-2.279;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:327,0,405
14	103193028	.	G	A	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.597;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:341,0,165
14	103375594	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	103398891	.	C	T	810.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:839,66,0
14	103399448	.	T	C	710.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:739,51,0
14	103404159	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	103408900	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
14	103440473	.	G	C	648.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.167;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=27.03;ReadPosRankSum=-0.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:677,0,181
14	103523598	.	T	C	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
14	103524343	.	G	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
14	103589842	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
14	103602278	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:145,0,108
14	103603569	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:120,0,33
14	103801574	.	G	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	103807969	.	T	C	1661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1690,117,0
14	103809152	.	C	T	612.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.976;DP=51;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,18:51:99:641,0,1295
14	103931519	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	103931520	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
14	103934488	.	T	C	1243.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1272,93,0
14	103954727	.	A	G	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
14	103955495	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	103956570	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
14	103967820	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	103969799	.	T	C	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
14	103996396	.	G	A	1267.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1296,90,0
14	104001517	.	G	A	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-2.070;DP=28;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,6:27:99:177,0,768
14	104022944	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
14	104023704	.	C	T	648.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:677,48,0
14	104024408	.	T	C	270.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.428	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:299,0,256
14	104029378	.	C	G	1008.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:80:1037,80,0
14	104057098	.	G	C	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:211,0,107
14	104095701	.	A	C	1317.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1346,102,0
14	104095769	.	G	T	1003.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1032,81,0
14	104146361	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
14	104147353	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
14	104147861	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:152,0,68
14	104148339	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
14	104148941	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
14	104149475	.	A	G	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
14	104149569	.	C	T	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:433,33,0
14	104152352	.	C	G	1449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1478,102,0
14	104155640	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	104162263	.	G	A	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:360,27,0
14	104162377	.	A	G	233.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:262,21,0
14	104162723	.	G	A	758.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:787,54,0
14	104162810	.	C	G	417.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:446,30,0
14	104163282	.	G	A	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
14	104163901	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
14	104165753	.	G	A	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
14	104167545	.	G	A	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
14	104167564	.	A	G	463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:492,36,0
14	104170341	.	A	C	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
14	104172807	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	104179314	.	T	C	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:586,42,0
14	104184322	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
14	104186876	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	104193024	.	G	A	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
14	104194196	.	C	G	1905.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1934,138,0
14	104194278	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
14	104381502	.	T	C	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-0.875;DP=51;FS=5.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,13:51:99:424,0,1533
14	104585114	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
14	104619938	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
14	104641726	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,223
14	104641792	.	C	T	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
14	104642341	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	104642422	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,237
14	104646717	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,146
14	105167807	.	C	T	1103.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1132,81,0
14	105173831	.	G	T	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-1.586;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:392,0,158
14	105179043	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
14	105179194	.	T	C	1371.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1400,99,0
14	105180565	.	T	C	1396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1425,102,0
14	105180706	.	A	C,G	1393.29	PASS	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/2:0,31,9:40:99:1596,337,242,1259,0,1236
14	105181848	.	A	G	173.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,5:5:24:202,0,24
14	105181851	.	C	T	173.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=34.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:202,0,24
14	105183749	.	A	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
14	105184088	.	G	C	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=29.18;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:30:320,0,30
14	105184313	.	G	A	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:93:304,0,93
14	105184463	.	T	C	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,105
14	105184689	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	105184838	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,190
14	105185567	.	G	A	458.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.446;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,15:44:99:487,0,1082
14	105185666	.	G	T	927.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-0.194;DP=42;FS=9.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,26:42:99:956,0,484
14	105186333	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:77,0,68
14	105188049	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	105195525	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
14	105225246	.	C	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
14	105247366	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
14	105253009	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	105255814	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
14	105256581	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	105257719	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	105258892	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	105258893	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	105259126	.	G	A	161.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:190,0,27
14	105262041	.	C	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
14	105262042	.	G	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
14	105267579	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
14	105268228	.	G	A	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
14	105269779	.	T	C	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
14	105282158	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	105309608	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	105323300	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
14	105323654	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	105329758	.	G	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
14	105330871	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	105335049	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	105335710	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
14	105336751	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
14	105337803	.	C	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
14	105338424	.	T	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:104,0,107
14	105338458	.	C	T	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:325,24,0
14	105338524	.	T	C	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
14	105339284	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
14	105339968	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
14	105340130	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
14	105340643	.	C	T	268.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:297,24,0
14	105341100	.	T	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
14	105341110	.	A	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:344,24,0
14	105344111	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	105344157	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	105344293	.	C	T	611.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:640,45,0
14	105344419	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	105344533	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
14	105344761	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	105349388	.	A	C	642.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:671,48,0
14	105350355	.	A	G	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:617,45,0
14	105350799	.	C	T	740.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:769,54,0
14	105350868	.	C	T	931.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:71:960,71,0
14	105351673	.	C	T	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
14	105354293	.	A	G	971.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1000,72,0
14	105354545	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
14	105355549	.	C	T	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
14	105356137	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	105358315	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
14	105359306	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	105361934	.	T	C	1320.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1349,93,0
14	105457771	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
14	105460429	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
14	105461067	.	C	T	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
14	105474840	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
14	105476065	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
14	105476658	.	T	C	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
14	105476853	.	C	T	909.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:938,69,0
14	105477349	.	G	C	728.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:757,54,0
14	105478102	.	G	A	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:907,63,0
14	105478881	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
14	105479490	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	105480102	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	105480641	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
14	105481988	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	105486138	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	105608403	.	A	G	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
14	105609335	.	A	G	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
14	105611282	.	A	G	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
14	105611742	.	C	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
14	105613278	.	A	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
14	105617042	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
14	105623498	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
14	105623512	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	105633544	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	105636587	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
14	105640076	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
14	105640460	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
14	105642138	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
14	105644382	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
14	105645187	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
14	105675701	.	C	A	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.713;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=4.34;ReadPosRankSum=1.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:89:89,0,406
14	105676048	.	G	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=1.222;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:151,0,593
14	105678266	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:113,0,75
14	105689526	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:120,0,69
14	105691474	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	105713449	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:56:225,0,56
14	105713973	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,156
14	105715327	.	A	C	248.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=24.88;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:44:277,0,44
14	105715515	.	C	T	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.939;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.508	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:424,0,374
14	105716034	.	C	T	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.245;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:440,0,496
14	105717279	.	T	C	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.962;DP=17;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:89:460,0,89
14	105836446	.	G	C	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
14	105836460	.	C	A	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
14	105847348	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-1.220;DP=28;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:222,0,771
14	105851374	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:89:188,0,89
14	105885987	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
14	105913520	.	C	T	117.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:145,12,0
14	105915194	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
14	105916420	.	C	T	1278.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:98:1307,98,0
14	105921682	.	T	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
14	105921946	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
14	105922231	.	C	T	333.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:362,27,0
14	105922376	.	G	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
14	105923063	.	C	G	198.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:227,18,0
14	105923941	.	A	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
14	105924071	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:52:52,0,237
14	105925205	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	105930406	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.087;DP=29;FS=4.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:120,0,952
14	105931079	.	C	G	357.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.173;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:386,0,596
14	105931183	.	C	T	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.367	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:313,0,348
14	105932474	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	105933283	.	C	A	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:40:40,0,427
14	105935041	.	A	G	709.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:738,54,0
14	105935123	.	A	G	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
14	105935721	.	A	G	364.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:393,30,0
14	105935824	.	G	A	1843.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:1872,141,0
14	105936064	.	A	G	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
14	105943679	.	G	A	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
14	105949586	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
14	105953595	.	T	C	2116.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2145,153,0
14	105961529	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
14	105962057	.	G	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
14	105962234	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
14	105962369	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
14	105962659	.	G	A	115.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
14	105962964	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
14	105963944	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	105963945	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
14	105965372	.	G	A	412.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:441,0,411
14	105965818	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
14	105965829	.	A	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
14	105965830	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
14	106654408	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20563878	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	20566117	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20566346	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	20566347	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	20566354	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	20566378	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,146
15	20566379	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,146
15	20567165	.	T	C	109.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:10:137,10,0
15	20567174	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.15;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:79,0,75
15	20567226	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20567296	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
15	20567645	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	20569967	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20570384	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	20571466	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
15	20572942	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	20580164	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	20581327	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20595308	.	G	C	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
15	20597990	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20603546	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	20603948	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
15	20604347	.	A	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
15	20626033	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	21926752	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
15	21935791	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	21937097	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	21937528	.	G	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
15	21937536	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
15	21937592	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	21938163	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
15	21938182	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	21940989	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	21941219	.	C	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
15	22514288	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	22514290	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	22514311	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	22514313	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	22514329	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	22514331	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	22514462	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	22514464	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	22514476	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	22541631	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
15	22543390	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	22546441	.	G	C	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
15	22546658	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
15	22574658	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	22576190	.	G	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	22579116	.	C	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	22582902	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	22588898	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	22939192	.	G	A	1978.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2007,144,0
15	22993143	.	C	T	468.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=1.850;DP=56;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,15:56:99:497,0,1603
15	23001452	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	23001691	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	23001783	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	23001884	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	23002683	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
15	23021113	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	23046848	.	T	C	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:39:581,39,0
15	23046855	.	G	T	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:39:581,39,0
15	23046902	.	T	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
15	23047857	.	G	A	811.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:840,57,0
15	23048542	.	A	G	545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:574,39,0
15	23052632	.	T	C	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
15	23053725	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	23054987	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	23680221	.	G	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
15	23680449	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	23680758	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
15	23681197	.	G	A	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
15	24532849	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	24646621	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	24779652	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	24785661	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	24788629	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	25227876	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	25229454	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	25235289	.	C	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
15	25239647	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
15	25242284	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	25279909	.	C	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
15	25332718	.	T	C	818.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:847,60,0
15	25364551	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	25364795	.	C	T	340.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:369,30,0
15	25365030	.	C	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
15	25596988	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	25912339	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	28356859	.	C	T	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:614,45,0
15	28358394	.	G	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:92:92,0,321
15	28359258	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	28363189	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	28364312	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
15	28364796	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	28517089	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	28518102	.	C	T	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:176,0,246
15	28835848	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	28835849	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	29079167	.	C	T	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
15	29079181	.	A	G	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
15	29111950	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	29395378	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
15	29395379	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
15	29395418	.	G	A	105.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:133,12,0
15	29396088	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
15	29400958	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	29405523	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	29406546	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	29410073	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	29412629	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
15	29412668	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	29413377	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	29413378	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	29414546	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	29415560	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	29418573	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	29418574	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	29979162	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
15	29980501	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	29984448	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	29993037	.	C	T	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-1.733;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=10.15;ReadPosRankSum=1.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:211,0,469
15	29997079	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
15	30008856	.	C	A	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
15	30008889	.	G	A	415.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=1.599;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:444,0,309
15	30023300	.	T	A	150.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:179,18,0
15	30023301	.	T	A	156.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:225,18,0
15	30023309	.	G	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
15	30023315	.	C	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:113,9,0
15	30114413	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,151
15	31031998	.	A	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
15	31048764	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:108,0,33
15	31050610	.	G	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
15	31056470	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	31057144	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
15	31058693	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	31060115	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:155,0,71
15	31064685	.	A	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
15	31216225	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	31219788	.	A	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:114,0,32
15	31231190	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
15	31232581	.	A	C	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:61:266,0,61
15	31233220	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
15	31234579	.	C	T	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
15	31234932	.	C	T	232.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:261,21,0
15	31234981	.	G	A	416.89	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=34.74;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:2:443,0,2
15	31235005	.	G	C	413.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.678;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=31.83;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:48:442,0,48
15	31665443	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,165
15	31667796	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:184,0,184
15	31668706	.	G	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.874;ClippingRankSum=-0.054;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:144,0,399
15	32812840	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	32812854	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	32820880	.	C	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:76:117,0,76
15	32930154	.	G	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=10.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:138,0,267
15	32931904	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	32931921	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
15	33058304	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	33058523	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
15	33058588	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	33058921	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	33058963	.	C	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
15	33060601	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	33061916	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	33062339	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	33062392	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	33062472	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	33062878	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
15	33063226	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	33063603	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
15	33063809	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	33063813	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	33064555	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	33064556	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	33064574	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	33064577	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	33064654	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	33065632	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
15	33954652	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	34111108	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	34111113	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	34113536	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	34146922	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	34158266	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	34375691	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	34426502	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	34427815	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
15	34433347	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	34439926	.	C	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
15	34440103	.	G	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
15	34524995	.	G	T	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
15	34525035	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	34528948	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	34671438	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	34672806	.	C	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
15	34673722	.	C	T	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
15	34727642	.	C	G	336.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:365,27,0
15	35145553	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	35147345	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	35148102	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	35149008	.	C	T	505.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,13:14:7:533,7,0
15	35272234	.	C	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
15	35950437	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	36871957	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
15	38365002	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	38544590	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
15	38643574	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	38751084	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	38751440	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	38751450	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	38751452	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	39873321	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
15	39879717	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
15	39879722	.	G	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:15:224,15,0
15	39880358	.	C	T	148.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:177,15,0
15	39880822	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
15	39887848	.	G	A	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
15	39910052	.	C	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
15	40226495	.	T	C	577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:606,42,0
15	40325829	.	T	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
15	40327690	.	A	T	45.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:88,9,0
15	40328575	.	G	C	2747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2776,207,0
15	40330564	.	C	T	1702.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.127;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=28.01;ReadPosRankSum=1.648	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,40:41:82:1731,82,0
15	40330629	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	40345952	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
15	40352933	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	40380207	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	40380818	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	40380933	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
15	40383347	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	40383779	.	A	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	40453307	.	A	G	798.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:827,60,0
15	40477831	.	G	A	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:848,60,0
15	40493176	.	C	T	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-2.391;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:258,0,360
15	40568823	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
15	40583458	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	40624128	.	G	A	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:598,42,0
15	40624774	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	40625206	.	C	A	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
15	40627845	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
15	40675695	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	40687855	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:40:78,0,40
15	40689545	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:68,0,37
15	40845597	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
15	40845952	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
15	40855210	.	T	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
15	40898643	.	G	C	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
15	40903684	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	40913840	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	40915190	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
15	40916237	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
15	40954956	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,144
15	40955069	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	40981343	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	40985066	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,150
15	40985940	.	T	A	60.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:88,5,0
15	40985945	.	T	A	60.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:88,5,0
15	40986074	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,74
15	40986237	.	T	A	112.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:140,12,0
15	40986505	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,101
15	40987565	.	G	T	583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:612,45,0
15	41063244	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
15	41069340	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	41099349	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	41100358	.	C	T	55.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:83,9,0
15	41101124	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	41101145	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
15	41103293	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41105658	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	41105926	.	T	G	772.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:801,57,0
15	41132310	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41139165	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41146581	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
15	41148199	.	C	T	1630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1659,117,0
15	41149161	.	G	C	1723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1752,120,0
15	41149679	.	A	G	1457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1486,111,0
15	41149765	.	A	G	823.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:852,63,0
15	41172894	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41271447	.	A	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
15	41271718	.	C	T	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
15	41568390	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41573347	.	G	A	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
15	41574051	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
15	41576241	.	C	T	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
15	41590030	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41590033	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	41591342	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=-2.359;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:190,0,220
15	41591475	.	G	A	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:604,45,0
15	41596779	.	T	G	251.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
15	41597647	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:45:45,0,356
15	41597680	.	C	A	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
15	41598448	.	T	G	685.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:714,48,0
15	41601316	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	41679717	.	C	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:339,27,0
15	41773741	.	G	T	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:702,51,0
15	41774423	.	A	G	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
15	41809530	.	T	C	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
15	41815516	.	G	C	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
15	41819716	.	C	T	385.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:414,30,0
15	41821752	.	T	C	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
15	41857303	.	T	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
15	41991315	.	A	T	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
15	42026764	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
15	42041712	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
15	42059521	.	A	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
15	42105918	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	42109223	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	42118651	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
15	42122617	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	42123267	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
15	42133885	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	42133886	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	42135988	.	C	T	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
15	42136199	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	42138456	.	G	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:349,27,0
15	42140166	.	G	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
15	42188591	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	42190692	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	42191067	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	42191519	.	G	A	522.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:551,39,0
15	42191909	.	C	G	785.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:814,57,0
15	42192040	.	T	C	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
15	42211486	.	A	G	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:700,51,0
15	42411434	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	42433382	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	42434254	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	42439376	.	G	A	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:337,27,0
15	42476133	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	42518824	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	42521188	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	42522010	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	42524065	.	T	C	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
15	42524399	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
15	42528007	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	42570718	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
15	42575963	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	42579948	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
15	42694944	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	42707102	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:44:44,0,301
15	42859235	.	T	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
15	43236612	.	C	T	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
15	43237203	.	T	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
15	43246903	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
15	43444131	.	C	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-1.303;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.902	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:230,0,617
15	43444666	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	43445305	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	43452961	.	C	T	28.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.685;DP=26;FS=6.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.846;QD=1.11;ReadPosRankSum=1.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,3:26:57:57,0,924
15	43463013	.	G	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:109,0,34
15	43465864	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
15	43478113	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	43478511	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	44038463	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	44038899	.	C	T	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:778,54,0
15	44063859	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	44084282	.	A	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
15	44084705	.	G	A	354.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.21;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:9:382,0,9
15	44091351	.	A	T	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
15	44094017	.	C	G	342.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.189;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:371,0,368
15	44120559	.	T	G	734.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:763,54,0
15	45024679	.	G	A	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
15	45024889	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
15	45695445	.	C	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
15	45775125	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
15	45927294	.	C	T	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.148	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:334,0,326
15	46126261	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	46126274	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	47421812	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	47421814	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	47421816	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	47421838	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	47421839	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	48443699	.	T	C	1131.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1160,81,0
15	48460927	.	C	T	734.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:763,54,0
15	49170427	.	G	A	461.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-1.802;DP=34;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:490,0,784
15	49282165	.	T	G	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:534,36,0
15	49622324	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	49936238	.	T	C	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
15	50642916	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	50647450	.	C	T	187.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:216,18,0
15	50647924	.	G	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,116
15	50648339	.	T	C	193.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:222,18,0
15	50648940	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	50649361	.	T	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
15	50649601	.	G	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	50649739	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,99
15	50649827	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,107
15	50650923	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	50652820	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
15	50652949	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,121
15	50654075	.	C	T	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
15	50655171	.	C	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
15	50655675	.	A	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:86:86,0,197
15	50655681	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:106,0,226
15	50655711	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,1:7:66:66,0,706
15	50655715	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,706
15	50655721	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,706
15	50655724	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,706
15	50655765	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,104
15	50656121	.	A	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
15	50656449	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
15	50656614	.	T	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:47:47,0,429
15	50656895	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	50657465	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
15	50658044	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:74,0,62
15	50658612	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,303
15	50659159	.	A	G	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:85:85,0,196
15	50660163	.	T	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
15	50660988	.	G	A	120.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:149,0,22
15	50661034	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,158
15	50662311	.	A	C	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
15	50663030	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
15	50773755	.	G	A	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
15	50853571	.	A	G	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
15	50867082	.	G	A	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
15	50878630	.	G	A	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
15	50888568	.	A	G	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
15	50994814	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	50995132	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	50998144	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	51217361	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	51295934	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	51296407	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
15	51741056	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	51751435	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	51829812	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	52204574	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:111,0,31
15	52204604	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	52283068	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	52283074	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	52357227	.	C	T	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
15	52413316	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	52484950	.	A	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
15	52485024	.	G	T	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
15	52504507	.	C	T	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
15	52524579	.	T	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	52526268	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	52527542	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
15	52531941	.	A	G	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
15	52534344	.	G	A	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:610,45,0
15	52539673	.	C	T	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:629,45,0
15	52541221	.	G	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
15	52541543	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	52542004	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	52543181	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	52543209	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	52556429	.	A	G	930.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:959,66,0
15	52587880	.	C	T	219.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:248,21,0
15	52601220	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	52689526	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
15	52689631	.	T	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
15	52840418	.	A	G	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
15	52842337	.	G	A	892.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:921,66,0
15	52853448	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	52878719	.	G	A	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
15	52879821	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	52881317	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	52883285	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
15	52897478	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	52901166	.	T	C	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
15	52901433	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	52901638	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
15	52901977	.	G	A	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
15	52970993	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
15	55489065	.	G	A	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:810,57,0
15	55489104	.	A	G	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
15	55496043	.	T	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
15	55497691	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	55611126	.	T	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
15	55652719	.	A	G	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
15	55652845	.	A	G	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
15	55653031	.	A	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
15	55722872	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	56119559	.	G	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
15	56120132	.	G	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
15	56122741	.	A	C	212.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.41;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:18:241,0,18
15	56152729	.	T	C	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
15	56152872	.	C	T	565.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:594,45,0
15	56364956	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	56364959	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:180,12,0
15	56365947	.	G	T	858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:887,60,0
15	56383798	.	C	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
15	56384639	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	56386577	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	56387931	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
15	56725200	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	56739063	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	56923536	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	56929776	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	56929889	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	56992844	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	57731335	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	57731728	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	57967219	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	58000981	.	C	T	975.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1004,69,0
15	58001341	.	G	A	667.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:696,48,0
15	58001403	.	C	T	118.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:147,14,0
15	59147037	.	A	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	59147413	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	59149400	.	G	A	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
15	59151333	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	59152402	.	G	T	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
15	59153303	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	59153808	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	59153844	.	C	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
15	59192593	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	59347929	.	C	A	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
15	59368410	.	C	G	107.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:135,12,0
15	59373794	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	59374116	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	59510189	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	59664963	.	G	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
15	59951547	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	59952216	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	59952382	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	59953314	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	59953631	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	59954552	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	59954569	.	T	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	59955668	.	A	C	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
15	59963488	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
15	59967774	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	59970298	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	59981515	.	A	G	204.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:233,18,0
15	60643115	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	60715643	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	60715800	.	T	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
15	60734697	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
15	60742063	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	60771289	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
15	60789798	.	G	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
15	60820809	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	62259637	.	C	T	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
15	62361288	.	G	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	63047793	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	63111739	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
15	63127983	.	G	A	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
15	63131117	.	T	A	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
15	63132158	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	63135810	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	63135978	.	A	G	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
15	63337532	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	63349096	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	63351840	.	C	A	2309.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-1.732;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=31.89;ReadPosRankSum=1.669	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,54:55:99:2338,131,0
15	63353760	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	63355339	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	63356496	.	C	T	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:204,0,345
15	63357852	.	T	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
15	63359564	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	63360446	.	G	C	676.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:705,48,0
15	63360564	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
15	63360847	.	T	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
15	63361262	.	G	C	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
15	63363402	.	G	A	368.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-2.256;DP=12;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=30.73;ReadPosRankSum=2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:55:397,0,55
15	63363654	.	A	G	2340.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2369,163,0
15	63363901	.	C	T	2220.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2249,154,0
15	63414083	.	A	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
15	63433766	.	G	A	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
15	63434110	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
15	63557048	.	T	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	63605954	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	63606341	.	T	C	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
15	63607091	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
15	63607247	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	63608411	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	63609213	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	63609759	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
15	63610876	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	63615764	.	C	T	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
15	63616673	.	G	A	1229.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1258,87,0
15	63618110	.	A	C	912.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:941,66,0
15	63618393	.	C	T	1520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1549,111,0
15	63623247	.	C	A	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
15	63623463	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
15	63627439	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	63630313	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	63630576	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	63674171	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
15	63753377	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	63864205	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	63886593	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	63922752	.	T	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
15	63937209	.	C	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
15	63950887	.	G	A	241.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:270,21,0
15	63954029	.	C	T	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
15	63988357	.	C	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
15	64365021	.	A	G	853.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:882,60,0
15	64367270	.	A	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
15	64375734	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	64418397	.	G	A	998.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:86:1027,86,0
15	64430732	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	64430739	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	64458405	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	64460979	.	G	A	200.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:229,0,24
15	64461098	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
15	64653957	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
15	64653984	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	64654614	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	64656825	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	64661937	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	64664289	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
15	64710827	.	T	C	676.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:705,48,0
15	64737225	.	G	A	455.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:484,33,0
15	64915106	.	C	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
15	64975763	.	C	G	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
15	65108504	.	A	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
15	65110391	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	65112468	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	65112567	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	65243351	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
15	65251882	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	65251883	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	65282191	.	G	A	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:535,45,0
15	65282219	.	C	G	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:586,42,0
15	65738545	.	G	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:112,0,32
15	65822823	.	C	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
15	65828137	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	65877174	.	C	T	698.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:727,51,0
15	65952890	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	65994733	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	66623230	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	66629403	.	C	A	374.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:403,27,0
15	66644521	.	C	G	892.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:921,66,0
15	66672083	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	66672116	.	A	G	177.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:206,0,25
15	66678991	.	A	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	67001710	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	67358478	.	G	A	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
15	67457335	.	A	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
15	67471035	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
15	67486775	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	67493586	.	G	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
15	67494304	.	T	G	792.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:821,57,0
15	67498175	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	67811407	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
15	67813162	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
15	67817878	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	68490957	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	68494759	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
15	68498268	.	T	G	279.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:308,24,0
15	68506157	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	68506978	.	T	G	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
15	68521889	.	C	T	772.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:801,60,0
15	68583175	.	T	C	1089.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1118,78,0
15	69071995	.	T	G	42.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.621;ClippingRankSum=-0.152;DP=26;FS=34.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=1.64;ReadPosRankSum=0.152	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:71:71,0,746
15	69088873	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	69093943	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	69114271	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	69489098	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:77,0,73
15	69559218	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
15	69562088	.	A	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
15	69564343	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	69696370	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	69728949	.	A	G	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
15	69732736	.	C	T	939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:968,66,0
15	69740350	.	A	G	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
15	69854337	.	G	A	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
15	69856094	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
15	69863143	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	69863144	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	69863490	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	69863680	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	70340511	.	G	A	343.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:372,30,0
15	70350457	.	C	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
15	70351788	.	T	C	788.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:817,57,0
15	70352968	.	C	G	806.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:835,60,0
15	70358855	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	70960068	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	70991925	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	71125093	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
15	71125204	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	71382685	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	71400381	.	G	A	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.764;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:42:42,0,509
15	71403871	.	C	G	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-1.517;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:218,0,222
15	71404056	.	C	G	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-1.991;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:181,0,316
15	71457458	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	71507565	.	G	A	145.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:174,15,0
15	71602052	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	72040774	.	C	T	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
15	72070929	.	G	A	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
15	72071236	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
15	72072497	.	C	T	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:335,27,0
15	72073189	.	G	A	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:445,33,0
15	72073939	.	C	G	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
15	72074505	.	A	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
15	72191073	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	72191266	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
15	72410349	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72432583	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	72433144	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	72454729	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	72492779	.	C	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
15	72493664	.	C	G	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.505;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:87:87,0,470
15	72497576	.	T	C	747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:776,57,0
15	72523689	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
15	72535738	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	72536695	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	72540180	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72546765	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72556799	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72559326	.	T	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
15	72564492	.	C	T	290.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:319,24,0
15	72578072	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72631102	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72633931	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	72635829	.	A	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	72635903	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	72638128	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
15	72638892	.	T	C	1703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1732,120,0
15	72873727	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	72875842	.	A	G	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
15	72882087	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	72893374	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	72922694	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
15	73023937	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
15	73027478	.	T	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:186,0,177
15	73044575	.	G	A	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:414,0,274
15	73050593	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
15	73050820	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,192
15	73051093	.	G	A	134.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:17:163,0,17
15	73051219	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
15	73052431	.	A	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,108
15	73067234	.	T	C	721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:750,51,0
15	73541513	.	A	G	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=19.60;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:98:185,0,98
15	73564881	.	C	T	430.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=26.92;ReadPosRankSum=2.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:459,0,120
15	73596823	.	T	C	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:95:95,0,277
15	74005600	.	C	T	215.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-2.154;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=6.74;ReadPosRankSum=2.111	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:244,0,922
15	74032783	.	A	G	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:196,0,227
15	74043523	.	A	G	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
15	74044197	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
15	74044906	.	T	C	119.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:148,0,27
15	74044966	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:114,0,32
15	74211548	.	C	T	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.48;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:51:323,0,51
15	74211717	.	T	C	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
15	74212297	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
15	74275676	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:121,0,30
15	74277795	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
15	74328116	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
15	74328141	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	74328576	.	A	G	141.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:170,15,0
15	74891402	.	C	T	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
15	74898757	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	74898758	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	74931833	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
15	75017176	.	C	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	75095483	.	T	C	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
15	75130573	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-2.221;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=4.34	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,6:26:99:141,0,3520
15	75131661	.	A	G	1400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1429,102,0
15	75131959	.	A	G	1336.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1365,96,0
15	75135447	.	T	C	388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:417,30,0
15	75136257	.	A	C	810.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:60:839,60,0
15	75136261	.	C	G	810.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:60:839,60,0
15	75136694	.	T	C	890.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.432;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.131	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,22:23:27:919,27,0
15	75183935	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
15	75184084	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	75189930	.	A	G	751.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:780,54,0
15	75190690	.	A	G	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
15	75193004	.	T	C	956.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:985,69,0
15	75194490	.	C	T	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:846,60,0
15	75212225	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	75212357	.	A	G	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
15	75247156	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	75307148	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
15	75498548	.	A	G	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
15	75499602	.	C	A	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
15	75499619	.	T	C	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
15	75499861	.	G	A	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:401,30,0
15	75503147	.	G	A	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
15	75504347	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
15	75631839	.	A	C	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
15	75634759	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	75640129	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:66,0,29
15	75643665	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	75645217	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:66:66,0,213
15	75645225	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,213
15	75645696	.	A	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.08;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:59:240,0,59
15	75645702	.	A	G	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.01;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:59:240,0,59
15	75646086	.	A	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,150
15	75650836	.	G	A	534.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.873;DP=20;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=26.74;ReadPosRankSum=0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:563,0,157
15	75931777	.	C	T	1651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1680,117,0
15	75950602	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,190
15	75950733	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,158
15	75952613	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
15	76177237	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	76182596	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	76186644	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	76191802	.	G	A	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:736,54,0
15	76191852	.	T	C	799.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:828,57,0
15	76191966	.	T	C	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:611,42,0
15	76224967	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
15	76230154	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	76231541	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	76232422	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	76232982	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	76233840	.	C	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
15	76234092	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	76483342	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
15	76484130	.	G	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	76488174	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	76488621	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
15	76491885	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	76492601	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
15	76507838	.	C	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
15	76508684	.	T	A	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
15	76521798	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
15	76629609	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	76630303	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
15	76631027	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	76631571	.	T	C	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
15	76994111	.	T	C	201.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:230,18,0
15	77231158	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	77241568	.	T	C	895.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:71:924,71,0
15	77241751	.	T	C	1107.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1136,78,0
15	77271976	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	77271977	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	77271983	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	77272012	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	77344793	.	T	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,150
15	77757863	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	77776562	.	A	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,270
15	77907139	.	C	T	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:69,6,0
15	77907145	.	G	A	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
15	78287476	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
15	78292820	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	78293128	.	C	T	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
15	78441769	.	T	C	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:870,60,0
15	78457242	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
15	78462518	.	C	T	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
15	78557005	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	78557720	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	78558170	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
15	78558509	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	78558857	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	78559118	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	78559767	.	T	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
15	78559937	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
15	78560409	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
15	78561427	.	C	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
15	78561891	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
15	78562179	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
15	78565478	.	C	T	1136.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1165,81,0
15	78567570	.	T	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
15	78567675	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	78570875	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
15	78573088	.	T	C	885.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:914,66,0
15	78573619	.	C	T	60.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.389;DP=38;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,5:38:89:89,0,1300
15	78578659	.	T	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
15	78583818	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	78585898	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	78730591	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	78758677	.	G	C	840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:869,60,0
15	78780104	.	T	C	1186.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1215,84,0
15	78789488	.	C	T	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:700,48,0
15	78791050	.	G	A	834.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:863,60,0
15	78791732	.	G	A	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
15	78792398	.	T	C	504.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:533,39,0
15	78792697	.	A	G	450.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.004;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=32.20;ReadPosRankSum=-1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:48:479,0,48
15	78792971	.	C	T	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:686,48,0
15	78793001	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
15	78832792	.	G	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
15	78833223	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	79214215	.	C	T	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
15	79217690	.	G	C	606.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:635,45,0
15	79237247	.	C	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
15	79237324	.	C	A	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
15	79269669	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	79603489	.	C	T	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:586,42,0
15	79603510	.	G	A	572.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-2.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=30.15;ReadPosRankSum=1.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,15:19:99:601,0,100
15	79606137	.	G	A	1751.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1780,123,0
15	79607191	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	79608170	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	79608258	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	79609258	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	79611344	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
15	79612472	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
15	79613400	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	79614206	.	T	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	79614418	.	A	G	2369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2398,172,0
15	79615054	.	C	T	772.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.235;DP=46;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,21:46:99:801,0,964
15	79641562	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	79705666	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
15	80205361	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
15	80214565	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,218
15	80214566	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,218
15	80420525	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
15	80420966	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	80428743	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	80428883	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	80987675	.	G	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:106,0,58
15	80987812	.	T	C	257.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:286,24,0
15	81047003	.	C	T	815.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=-0.633;DP=30;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=27.19;ReadPosRankSum=0.539	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,22:30:99:844,0,259
15	81047404	.	T	C	647.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=-0.638;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=29.44;ReadPosRankSum=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:98:676,0,98
15	81047829	.	C	A	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=25.14;ReadPosRankSum=1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:355,0,129
15	81240669	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
15	81240817	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
15	81270420	.	G	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
15	81603399	.	C	T	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
15	81643978	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	81709471	.	A	G	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
15	81933604	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	82335444	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
15	82443939	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:264,0,374
15	82444437	.	A	G	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:354,27,0
15	83360332	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	83360374	.	T	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
15	83511149	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
15	83512067	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	83590345	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	83663882	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
15	83663941	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	83674161	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:39,0,38
15	83680287	.	A	G	364.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:393,30,0
15	83685440	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:89:89,0,372
15	83685773	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.193;DP=27;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.424	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:50:50,0,951
15	83686759	.	T	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.216;DP=22;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.364	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:198,0,639
15	83735926	.	C	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,390
15	84867631	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	84951415	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	85165390	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:73,0,31
15	85174755	.	C	T	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
15	85185045	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:53:113,0,53
15	85186637	.	G	C	701.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:730,51,0
15	85186837	.	T	C	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
15	85188994	.	T	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:736,51,0
15	85190470	.	G	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	85197253	.	T	C	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
15	85198606	.	C	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
15	85200754	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	85259454	.	A	T	204.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:233,21,0
15	85334839	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	85348172	.	G	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
15	85409367	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	85411941	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	85412320	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	85412455	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
15	85415036	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
15	85415044	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	85415720	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
15	85640282	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	86122654	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
15	86122916	.	T	C	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
15	86123019	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
15	86123364	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
15	86123833	.	T	C	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
15	86123924	.	C	T	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
15	86123988	.	G	A	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
15	86124419	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	86124555	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
15	86124946	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
15	86124968	.	G	A	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
15	86125031	.	G	A	69.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
15	86285227	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	86287910	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
15	86288267	.	A	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	86288518	.	G	C	257.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:286,0,19
15	86288673	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
15	86288733	.	C	G	205.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:234,18,0
15	86289363	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	86291269	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	86291455	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
15	86302735	.	A	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
15	86302853	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
15	86310020	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	86313048	.	T	C	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
15	89169703	.	C	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
15	89169858	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
15	89172558	.	G	C	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:444,33,0
15	89173035	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	89173657	.	A	T	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
15	89173732	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
15	89174048	.	T	C	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
15	89174748	.	G	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
15	89175173	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
15	89175174	.	C	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
15	89175426	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
15	89194350	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	89195368	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,190
15	89195526	.	A	G	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
15	89678896	.	G	T	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
15	89738583	.	G	A	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:529,39,0
15	89740373	.	G	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
15	89740384	.	T	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
15	89740469	.	T	C	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
15	89740616	.	G	A	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
15	89743080	.	C	A	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:347,27,0
15	89744004	.	C	T	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
15	89744476	.	G	T	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
15	89804043	.	C	T	688.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:717,51,0
15	89836228	.	G	C	764.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:793,54,0
15	89838236	.	G	A	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
15	89844860	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
15	89851438	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	89853468	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	89858602	.	T	C	1024.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1053,78,0
15	89860786	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	89864763	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	89877527	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	89921969	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	89929934	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	89931148	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
15	89938586	.	A	C	807.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:836,60,0
15	89939528	.	T	G	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:675,48,0
15	90126121	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	90128966	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
15	90138670	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
15	90168108	.	C	T	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
15	90174824	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
15	90175375	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	90175490	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	90176073	.	C	A	178.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:207,18,0
15	90176432	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	90195712	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
15	90195967	.	C	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
15	90225743	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
15	90226947	.	C	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
15	90250479	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	90293776	.	A	C	354.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:383,30,0
15	90373873	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	90374257	.	C	A	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
15	90375419	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,197
15	90375448	.	G	A	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:250,18,0
15	90375458	.	C	T	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
15	90375568	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
15	90376459	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
15	90418413	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	90439960	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	90440595	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,101
15	90441168	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
15	90441568	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	90441569	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	90441597	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	90441870	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
15	90441937	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
15	90442388	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	90443140	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
15	90443720	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	90443747	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	90444214	.	A	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
15	90444639	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
15	90444681	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	90456179	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	90631247	.	G	A	160.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
15	91043765	.	C	G	915.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:944,66,0
15	91044408	.	T	A	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
15	91045419	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
15	91083353	.	G	A	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
15	91138290	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
15	91139098	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	91141302	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
15	91145265	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	91152345	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
15	91352158	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
15	91425232	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
15	91426560	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
15	91456215	.	C	G	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-1.102;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:380,0,338
15	91500123	.	C	T	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
15	91504898	.	C	T	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
15	91511536	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:66,0,36
15	91524841	.	G	T	1520.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1549,111,0
15	92708268	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	93116868	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	93147787	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	93151858	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
15	93161501	.	G	T	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
15	93165596	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
15	93182422	.	C	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
15	93198671	.	A	G	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:332,27,0
15	93198784	.	A	G	239.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:268,21,0
15	93341085	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	93341108	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
15	93438609	.	G	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
15	93439224	.	T	G	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
15	93441267	.	G	A	472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:501,36,0
15	93441907	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
15	93455974	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:109,0,31
15	93464509	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
15	93467354	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
15	93510603	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
15	93521604	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
15	93539666	.	A	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
15	93557954	.	G	C	381.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:410,30,0
15	93567864	.	A	C	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
15	93570241	.	T	C	641.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:45:670,45,0
15	93570250	.	C	T	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:218,0,273
15	94352246	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
15	94712095	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
15	96873212	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	96876611	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	96878294	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	98512431	.	C	T	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
15	98515221	.	A	C	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
15	99478225	.	G	A	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
15	99493176	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
15	99496340	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	99496859	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	99499434	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	99504129	.	G	A	231.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:260,24,0
15	99504437	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
15	99505129	.	C	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
15	99505316	.	C	T	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
15	99505423	.	G	T	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
15	99506942	.	C	T	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
15	99928356	.	T	A	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
15	100184905	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	100254444	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	100255814	.	A	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
15	100269796	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
15	100272414	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
15	100512079	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	100513117	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
15	100513707	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
15	100513722	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
15	100513725	.	C	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
15	100514494	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
15	100596831	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
15	100597091	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	100597291	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	100801698	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	100821467	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
15	100885828	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
15	100889496	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
15	101094130	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
15	101094352	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
15	101095919	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:81,0,77
15	101095925	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:81,0,77
15	101096383	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,78
15	101109677	.	C	A	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
15	101109794	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
15	101109893	.	C	A	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
15	101110302	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	101112342	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
15	101113139	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
15	101113950	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
15	101114418	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	101170921	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
15	101189896	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
15	101190032	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
15	101455840	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
15	101562793	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
15	101591923	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
15	101716583	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
15	101717065	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
15	101717680	.	G	T	388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:417,30,0
15	101717888	.	C	T	798.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:827,60,0
15	101722467	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
15	101728381	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
15	102144086	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	102173789	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
15	102182183	.	A	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
15	102192548	.	A	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:332,27,0
15	102264476	.	C	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
16	87270	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:29:39,0,29
16	87272	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:29:39,0,29
16	97354	.	A	G	413.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=1.046;DP=38;FS=18.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,13:38:99:442,0,966
16	103517	.	A	C	1137.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1166,81,0
16	103923	.	C	G	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-1.127;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=15.06;ReadPosRankSum=1.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,15:31:99:495,0,508
16	105320	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
16	105325	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	105444	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	107275	.	T	G	1668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1697,117,0
16	108585	.	T	C	794.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:823,57,0
16	110165	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
16	110925	.	T	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:354,27,0
16	112376	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
16	113970	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	114535	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	115072	.	A	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:121,0,30
16	115657	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	125462	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	128179	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	133946	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	134441	.	C	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
16	134457	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	134745	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	136142	.	C	T	584.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=28.55;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:9:612,9,0
16	136258	.	A	G	785.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:814,57,0
16	151218	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	152220	.	G	A	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
16	237810	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:75,0,64
16	240280	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	242770	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	284833	.	T	G	257.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:286,21,0
16	304514	.	C	T	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=-1.678;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:252,0,257
16	324052	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
16	324403	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	324479	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
16	330446	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
16	330678	.	G	A	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
16	334732	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	337691	.	C	T	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:342,0,275
16	337750	.	C	G	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:605,42,0
16	350846	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	357140	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
16	358322	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	358773	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	359567	.	G	A	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,39
16	359953	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	367174	.	G	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
16	369413	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	396264	.	A	G	901.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.734;DP=24;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=32.10;ReadPosRankSum=1.445	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:62:930,62,0
16	397044	.	G	T	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=1.247;DP=16;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=11.80;ReadPosRankSum=-1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:217,0,377
16	402397	.	C	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=14.68;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:86:131,0,86
16	402427	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	418882	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
16	419092	.	A	G	1681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1710,117,0
16	419154	.	G	A	511.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.602;DP=39;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,15:39:99:540,0,919
16	420140	.	G	A	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.630;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.11;ReadPosRankSum=-1.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:381,0,512
16	420179	.	G	A	577.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-1.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:606,0,257
16	420907	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
16	426432	.	T	C	784.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:813,57,0
16	426476	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	427479	.	T	C	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:639,48,0
16	427516	.	T	C	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:515,39,0
16	427784	.	G	A	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:443,33,0
16	427820	.	C	T	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
16	427999	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	428001	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	429198	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
16	429951	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	448132	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,159
16	449659	.	G	A	1508.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.966;ClippingRankSum=-1.570;DP=62;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=24.33;ReadPosRankSum=1.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,39:61:99:1537,0,714
16	450309	.	C	T	1812.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-2.751;DP=64;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=28.32;ReadPosRankSum=2.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,47:64:99:1841,0,536
16	455646	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	456701	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,280
16	457226	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,259
16	476096	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	542029	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	542727	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
16	543166	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,229
16	543176	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:106,0,148
16	546045	.	C	T	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,39
16	548658	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:115,0,72
16	548676	.	A	G	127.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:156,0,20
16	548955	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	549310	.	G	A	259.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:288,24,0
16	549677	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,153
16	549678	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,153
16	570557	.	T	C	1104.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1133,81,0
16	575519	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:69,0,66
16	584038	.	T	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.08;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:99,0,261
16	584772	.	C	G	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
16	588054	.	C	G	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
16	590249	.	G	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:44:44,0,231
16	591586	.	T	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:149,0,146
16	591691	.	A	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:308,0,101
16	591727	.	C	A	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.581;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:217,0,310
16	592174	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:54:222,0,54
16	593277	.	T	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
16	593853	.	T	G	160.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:15:189,0,15
16	594002	.	T	C	271.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:11:299,0,11
16	596442	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,143
16	596605	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,176
16	601129	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
16	602313	.	C	A	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:357,0,277
16	603471	.	A	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=1.096;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:170,0,435
16	603884	.	C	G	470.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.823;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=23.54;ReadPosRankSum=-1.823	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:499,0,245
16	604283	.	G	T	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:262,0,153
16	604554	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,112
16	624114	.	A	G	381.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:410,0,282
16	624424	.	C	T	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:280,0,327
16	624713	.	C	T	422.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-2.161;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=24.87;ReadPosRankSum=2.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:451,0,161
16	630367	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
16	630902	.	C	G	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=-0.626;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.297	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:465,0,328
16	631924	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:112,0,68
16	632051	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:117,0,65
16	632073	.	C	T	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:98:218,0,98
16	632115	.	G	A	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=33.70;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:99:475,0,163
16	632138	.	C	T	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=34.01;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:475,0,163
16	632180	.	G	C	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=28.38;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:312,0,145
16	632198	.	T	A	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:99:312,0,145
16	632225	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:69:156,0,69
16	632231	.	G	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:69:156,0,69
16	632283	.	G	A	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:366,0,194
16	632728	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,354
16	632736	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,354
16	632767	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,150
16	633125	.	T	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:230,0,183
16	633353	.	T	C	535.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.648;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.512	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:564,0,571
16	633354	.	G	A	535.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.717;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:564,0,571
16	633706	.	C	T	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.971	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:460,0,317
16	633843	.	A	G	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.609;DP=18;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=26.93;ReadPosRankSum=0.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:513,0,507
16	633851	.	T	C	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-1.273;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=24.24;ReadPosRankSum=1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:513,0,507
16	638264	.	C	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:116,0,31
16	638323	.	T	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
16	638486	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:53:154,0,53
16	644393	.	G	A	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
16	651113	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	651115	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	672799	.	T	C	34.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:63,0,27
16	674424	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	677854	.	G	T	220.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:249,0,297
16	678020	.	G	A	641.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=-1.575;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=29.17;ReadPosRankSum=1.490	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:96:670,0,96
16	685813	.	T	C	121.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:150,0,19
16	701956	.	G	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:48:48,0,343
16	714878	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	714886	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	716512	.	C	T	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:242,0,187
16	718514	.	C	G	1443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1472,111,0
16	720839	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
16	727971	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:103,0,74
16	731988	.	C	T	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.399;DP=30;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.305	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,8:30:99:237,0,829
16	732343	.	C	G	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.690;DP=62;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.698	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,7:28:99:219,0,819
16	733187	.	C	G	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.481;DP=25;FS=10.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:308,0,602
16	734842	.	C	T	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:203,0,351
16	770546	.	C	T	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
16	770558	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	800821	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,77
16	802234	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	835298	.	C	T	665.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.938;DP=25;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:694,0,229
16	837857	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	838358	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,113
16	839084	.	A	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=21.38;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:87:242,0,87
16	839262	.	A	G	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:590,42,0
16	840378	.	A	G	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:285,0,290
16	840769	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.017;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=-2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,143
16	841625	.	A	G	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.568	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:213,0,133
16	841710	.	C	G	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:268,0,203
16	841966	.	C	T	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:215,0,106
16	842450	.	C	T	462.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.784;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:491,0,179
16	849890	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	849894	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	850465	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	899974	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	905559	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	929711	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:154,0,98
16	941234	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
16	1004554	.	C	T	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:173,0,108
16	1020874	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:62:108,0,62
16	1260481	.	T	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:736,51,0
16	1261219	.	A	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.636;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=28.63;ReadPosRankSum=-1.344	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:429,0,291
16	1261222	.	A	G	400.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=30.83;ReadPosRankSum=-1.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:429,0,291
16	1261282	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
16	1262855	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	1263469	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1264895	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
16	1267656	.	C	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
16	1268494	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:96:156,0,96
16	1268542	.	G	A	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=-0.984;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.521	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:242,0,294
16	1269003	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,239
16	1269029	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:153,0,151
16	1269422	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	1270055	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.546;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:117,0,437
16	1270162	.	G	A	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=20.05;ReadPosRankSum=1.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:349,0,190
16	1270349	.	T	C	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
16	1270875	.	G	A	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:177,0,278
16	1271189	.	G	A	347.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.049	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:376,0,249
16	1271348	.	G	A	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:184,0,257
16	1272038	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	1359217	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
16	1362038	.	A	C	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
16	1362187	.	C	T	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
16	1362199	.	G	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
16	1362796	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:50:50,0,195
16	1362819	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	1363742	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	1364767	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1365210	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1365935	.	C	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
16	1365967	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
16	1366048	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1366070	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	1366308	.	T	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
16	1367650	.	C	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
16	1368517	.	C	T	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
16	1369073	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	1369176	.	G	A	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
16	1369250	.	C	G	51.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:79,9,0
16	1369730	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
16	1369926	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	1370614	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	1370630	.	A	G	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
16	1370729	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	1371246	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	1371295	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	1372676	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1373593	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1373919	.	G	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
16	1374163	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1374656	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	1374818	.	A	G	1548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1577,111,0
16	1375263	.	T	G	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
16	1375563	.	G	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
16	1375914	.	A	G	273.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:302,24,0
16	1375937	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,181
16	1375960	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
16	1376386	.	G	C	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
16	1376510	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	1403598	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	1404726	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	1405664	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	1407441	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	1409864	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
16	1410364	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,76
16	1414661	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
16	1414830	.	C	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:142,0,184
16	1414887	.	A	G	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
16	1415331	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	1416129	.	C	G	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.583;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:212,0,206
16	1416910	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:81,0,77
16	1416913	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:81,0,77
16	1418241	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	1419321	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
16	1419947	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	1420487	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	1421797	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	1421858	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	1426050	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1426587	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
16	1426994	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	1470583	.	C	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,162
16	1484473	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1486875	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:71,0,30
16	1488646	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	1495745	.	G	A	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
16	1495746	.	G	A	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
16	1498197	.	A	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:147,0,29
16	1501375	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1503879	.	T	A	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.880;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:354,0,407
16	1506543	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	1510132	.	G	A	165.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:194,0,19
16	1510284	.	A	G	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:184,0,143
16	1510567	.	T	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,154
16	1545448	.	A	G	638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:667,48,0
16	1547477	.	T	C	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.567;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:81:513,0,81
16	1555589	.	A	G	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.796;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=27.82;ReadPosRankSum=-1.115	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:529,0,119
16	1556500	.	A	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:97:145,0,97
16	1556639	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,223
16	1558915	.	C	T	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:38:38,0,40
16	1559965	.	T	C	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=1.582;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.890;QD=21.19;ReadPosRankSum=-1.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:452,0,247
16	1560111	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.318	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:233,0,324
16	1560194	.	G	A	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.833;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.833	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:511,0,199
16	1560886	.	A	G	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:116,0,25
16	1561446	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1569405	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	1724693	.	G	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
16	1812972	.	G	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.779;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=13.65;ReadPosRankSum=0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:192,0,202
16	1814391	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-1.423;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:151,0,424
16	1817397	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	1818503	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:187,0,142
16	1819020	.	A	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:105,0,58
16	1819021	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
16	1819250	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,159
16	1819433	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:224,0,143
16	1819835	.	T	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
16	1820341	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	1820992	.	T	A	335.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=-3.947;DP=74;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=4.54;ReadPosRankSum=3.651	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,16:53:99:373,0,832
16	1822159	.	T	C	785.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.661;DP=59;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.707	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,23:59:99:814,0,1348
16	1823024	.	G	T	499.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.415;DP=43;FS=6.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,16:43:99:528,0,998
16	1823444	.	C	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=2.219;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=14.31;ReadPosRankSum=-2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:157,0,135
16	1824115	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	1825768	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
16	1826302	.	G	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,140
16	1826377	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
16	1827522	.	T	G	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-1.635;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:164,0,264
16	1827836	.	T	C	1448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1477,102,0
16	1828839	.	A	G	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:183,0,264
16	1830098	.	G	C	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:203,0,309
16	1830437	.	G	A	822.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:851,60,0
16	1830551	.	C	G	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.323;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:221,0,314
16	1830621	.	T	C	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:41:560,41,0
16	1831653	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1834857	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,151
16	1834882	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1834891	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1835231	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	1835393	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	1836255	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1836796	.	C	A	525.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.670;DP=30;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=17.53;ReadPosRankSum=1.088	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,17:30:99:554,0,457
16	1837406	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,99
16	1838037	.	C	G	550.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.529;DP=55;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,18:55:99:579,0,1428
16	1838375	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	1838640	.	T	C	1596.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1625,117,0
16	1838836	.	C	G	879.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=-0.819;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,24:43:99:908,0,650
16	1839023	.	G	A	1337.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1366,96,0
16	1839134	.	T	C	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:653,54,0
16	1858888	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	1859150	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
16	1859153	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
16	1877698	.	C	G	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.146;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.205	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:358,0,535
16	1877913	.	C	G	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.959	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:324,0,464
16	2013314	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
16	2014031	.	C	G	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
16	2014283	.	A	G	169.96	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:5:197,0,5
16	2014424	.	C	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:111,0,96
16	2014979	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	2015121	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:53:146,0,53
16	2015432	.	C	T	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:175,0,275
16	2022074	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:102,0,30
16	2025206	.	A	C	550.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-0.611;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=27.54;ReadPosRankSum=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,15:20:99:579,0,129
16	2025411	.	G	C	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-2.279;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:330,0,394
16	2025602	.	A	G	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=12.65;ReadPosRankSum=1.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:218,0,316
16	2026292	.	T	C	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:283,0,531
16	2026891	.	T	C	460.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.664;DP=20;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=23.04;ReadPosRankSum=1.585	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:489,0,236
16	2028402	.	A	C	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:313,0,244
16	2029083	.	G	A	164.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:193,0,17
16	2029152	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,73
16	2029723	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:69,0,64
16	2035907	.	T	C	599.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.099;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,17:31:99:628,0,481
16	2035999	.	C	T	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-1.462;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:428,0,568
16	2036937	.	G	C	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:184,0,144
16	2037108	.	A	G	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.533;QD=18.31;ReadPosRankSum=-1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:248,0,182
16	2047811	.	T	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:98:98,0,362
16	2047891	.	C	A	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=1.479;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:460,0,242
16	2048826	.	C	G	428.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-2.452;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=20.42;ReadPosRankSum=0.462	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:457,0,317
16	2049640	.	A	G	552.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.142;DP=25;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=22.11;ReadPosRankSum=-0.028	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,16:25:99:581,0,299
16	2050346	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:67,0,65
16	2052340	.	G	A	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.498;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:346,0,538
16	2059209	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	2059674	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
16	2059698	.	T	G	15.43	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:1:41,1,0
16	2059708	.	T	G	21.99	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:5:49,5,0
16	2059710	.	T	G	21.99	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:5:49,5,0
16	2076931	.	C	G	907.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:936,69,0
16	2080541	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	2080571	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	2081503	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	2081880	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,78
16	2081968	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
16	2083155	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	2084214	.	C	T	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
16	2084816	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	2084997	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
16	2085295	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
16	2085997	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
16	2114644	.	T	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:116,0,66
16	2152939	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,198
16	2155909	.	T	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:96:96,0,339
16	2203456	.	T	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
16	2204835	.	T	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
16	2256461	.	C	G	42.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-3.568;DP=36;FS=4.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=1.19	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,5:36:71:71,0,3151
16	2259191	.	T	C	969.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:998,72,0
16	2260567	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	2260612	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
16	2260935	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
16	2262066	.	A	G	251.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:280,21,0
16	2262113	.	G	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
16	2263146	.	A	G	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
16	2263516	.	A	G	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:675,48,0
16	2264766	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:116,0,348
16	2276664	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	2280277	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	2280318	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	2281151	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	2281829	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
16	2282256	.	G	A	374.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:403,30,0
16	2285357	.	C	T	679.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=30.27;ReadPosRankSum=-0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:22:708,22,0
16	2288888	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	2331430	.	A	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
16	2338363	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	2356312	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:29:81,0,29
16	2356320	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
16	2369592	.	C	T	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,106
16	2488211	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	2496760	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	2497564	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
16	2500604	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	2506130	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	2510603	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
16	2514270	.	G	C	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:178,0,135
16	2647876	.	C	T	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.18;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:58:320,0,58
16	2648918	.	C	T	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.883;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.883	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:316,0,285
16	2651603	.	A	G	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-0.065;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:220,0,295
16	2716299	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,106
16	2723350	.	C	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
16	2802684	.	T	C	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:778,60,0
16	2803994	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
16	2810863	.	C	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
16	2812890	.	A	G	2276.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2305,160,0
16	2812939	.	C	A	1065.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.017;DP=51;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,29:51:99:1094,0,784
16	2814162	.	G	A	1790.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1819,129,0
16	2814874	.	G	C	60.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.587;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.511	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,5:43:89:89,0,1516
16	2815237	.	A	C	1618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1647,114,0
16	2818161	.	T	C	1766.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1795,129,0
16	2818704	.	T	G	699.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:728,54,0
16	2821153	.	G	C	967.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.304;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,26:34:99:996,0,229
16	2822836	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	2823139	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	2823266	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	2823768	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	2823923	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	2824540	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	2824930	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	2824984	.	T	C	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
16	2880870	.	G	C	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:136,0,62
16	2881675	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	2882197	.	G	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:79:79,0,117
16	2882267	.	G	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
16	2888797	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	2903047	.	G	C	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:51:719,51,0
16	2903068	.	A	C	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:51:719,51,0
16	2903081	.	G	A	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:51:719,51,0
16	2906934	.	G	A	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
16	2909681	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	2911725	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	2933280	.	G	C	425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.545;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:454,0,193
16	2945248	.	G	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.076;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.178	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,7:29:99:198,0,845
16	2949248	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=-2.237;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.60;ReadPosRankSum=2.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:140,0,335
16	2949676	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
16	2950185	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
16	2950833	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	2950834	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	2962038	.	C	G	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
16	2962066	.	T	C	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:30:426,30,0
16	2962071	.	G	A	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:30:426,30,0
16	2962102	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
16	2962104	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
16	2964283	.	G	A	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
16	2979640	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
16	2985684	.	G	A	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
16	2986323	.	T	C	166.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:195,0,22
16	2998938	.	G	A	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:290,0,128
16	2999218	.	C	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:54:54,0,191
16	2999298	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
16	3016885	.	A	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
16	3020860	.	C	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:479,33,0
16	3021116	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
16	3022016	.	G	A	490.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.375;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:519,0,283
16	3022261	.	C	T	957.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:986,69,0
16	3023025	.	G	A	579.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.153;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,18:51:99:608,0,1298
16	3027296	.	A	C	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
16	3043884	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	3049424	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	3050121	.	T	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=2.292;DP=19;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=2.15;ReadPosRankSum=-2.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:69:69,0,1900
16	3050122	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=2.329;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=2.04;ReadPosRankSum=-1.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:69:69,0,1900
16	3050125	.	T	G	40.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=2.392;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=-1.913	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:69:69,0,1900
16	3050133	.	G	C	838.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:867,63,0
16	3050597	.	T	C	719.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:748,51,0
16	3051123	.	T	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
16	3051279	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.159;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=4.93;ReadPosRankSum=2.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:117,0,484
16	3051358	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	3054413	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	3054551	.	T	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
16	3056563	.	A	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
16	3056584	.	G	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
16	3075810	.	G	C	453.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.615;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:482,0,460
16	3075999	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
16	3077867	.	G	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
16	3078066	.	G	C	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.409;QD=22.04;ReadPosRankSum=1.310	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:447,0,218
16	3079685	.	T	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
16	3082327	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
16	3082339	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	3082478	.	T	C	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
16	3083590	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,109
16	3083686	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
16	3083974	.	A	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
16	3084055	.	G	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
16	3084109	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
16	3084556	.	T	C	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:38,0,36
16	3084744	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
16	3085085	.	G	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
16	3085335	.	G	C	622.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:651,45,0
16	3085375	.	G	A	346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:32:375,32,0
16	3085924	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	3086447	.	C	G	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
16	3124620	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	3163138	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	3165425	.	A	G	356.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.354;DP=14;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:385,0,125
16	3181592	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	3181963	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
16	3181996	.	G	A	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:199,0,68
16	3191356	.	G	A	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
16	3192651	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:113,0,59
16	3336561	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	3339435	.	G	C	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=8.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:344,0,261
16	3340845	.	C	T	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.88;ReadPosRankSum=2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:217,0,143
16	3350639	.	A	G	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:163,0,31
16	3355565	.	C	T	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
16	3359124	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
16	3365733	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
16	3367229	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:105,0,71
16	3432594	.	T	A	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:125,0,235
16	3452193	.	T	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:91:96,0,91
16	3483475	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	3486285	.	C	A	47.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:76,0,27
16	3533577	.	C	G	943.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:972,69,0
16	3534451	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	3534892	.	G	A	975.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1004,75,0
16	3535116	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	3535540	.	G	A	1013.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1042,75,0
16	3536020	.	C	T	369.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:398,0,352
16	3536444	.	C	T	874.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-1.733;DP=25;FS=4.949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=34.99;ReadPosRankSum=1.595	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:39:903,39,0
16	3536872	.	G	A	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
16	3624856	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	3624861	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	3639139	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:66,0,35
16	3698111	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	3708337	.	A	G	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
16	3708553	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
16	3709805	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
16	3709868	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:78,0,34
16	3710537	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	3710804	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	3710805	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	3710896	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,101
16	3711017	.	A	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,105
16	3711656	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,183
16	3714413	.	G	A	64.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=2.244;DP=37;FS=8.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=1.75;ReadPosRankSum=-2.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,5:37:93:93,0,1247
16	3718492	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	3721773	.	G	C	571.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-1.574;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,17:48:99:600,0,1196
16	3724465	.	G	C	1212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.955;DP=53;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=22.88;ReadPosRankSum=2.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,32:53:99:1241,0,761
16	3724857	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
16	3728517	.	C	T	101.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:129,12,0
16	3728584	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	3733077	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	3775717	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	4013467	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:114,0,30
16	4014282	.	C	G	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:154,0,29
16	4014978	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	4015313	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=22.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:162,0,162
16	4015316	.	A	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:162,0,162
16	4015729	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	4016676	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,78
16	4027605	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.937;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,125
16	4043091	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	4165432	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
16	4165980	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	4193457	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
16	4296785	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:76,0,31
16	4307646	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:119,0,71
16	4310468	.	C	G	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:145,0,145
16	4386814	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	4395241	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	4431202	.	A	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
16	4432029	.	A	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:84:143,0,84
16	4435163	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
16	4436445	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	4445327	.	C	T	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:522,39,0
16	4476089	.	T	C	684.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-2.500;DP=39;FS=6.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,20:38:99:713,0,663
16	4484396	.	A	T	1601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1630,120,0
16	4488191	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	4491061	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	4491190	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	4496973	.	T	A	530.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-0.090;DP=33;FS=14.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,17:33:99:559,0,563
16	4506232	.	G	A	1658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1687,123,0
16	4510426	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
16	4512245	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,144
16	4515145	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	4515334	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	4516092	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	4518754	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
16	4518948	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	4519140	.	C	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
16	4519439	.	G	A	576.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=-0.181;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,18:48:99:605,0,1115
16	4519548	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	4524443	.	C	G	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=1.530;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:440,0,412
16	4526292	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	4560301	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:157,0,31
16	4659302	.	T	C	777.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:806,57,0
16	4659408	.	G	T	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1080,78,0
16	4660342	.	C	T	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
16	4661832	.	A	G	175.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:204,0,22
16	4661860	.	T	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:80,0,58
16	4663105	.	C	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	4663131	.	A	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
16	4664833	.	T	G	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:514,42,0
16	4666537	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	4674954	.	C	G	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
16	4734590	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	4738388	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	4739514	.	T	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:87:87,0,311
16	4740208	.	T	G	149.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,109
16	4740441	.	G	C	535.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:99:564,0,266
16	4740444	.	C	T	535.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.493;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=29.76;ReadPosRankSum=2.070	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:564,0,266
16	4740477	.	T	C	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:500,0,317
16	4740602	.	T	C	309.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=-0.035;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:338,0,404
16	4748825	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,150
16	4749915	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	4801419	.	A	G	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.73;ReadPosRankSum=1.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:96:289,0,96
16	4801723	.	G	A	101.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:17:130,0,17
16	4801939	.	G	T	138.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:166,8,0
16	4802370	.	C	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,115
16	4815608	.	A	G	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
16	4846068	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:60,0,63
16	4846336	.	G	A	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
16	4846854	.	C	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,70
16	4847169	.	G	A	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=-1.441;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:404,0,480
16	4847317	.	C	T	469.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=1.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=22.37;ReadPosRankSum=-1.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:498,0,280
16	4847524	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	4848996	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
16	4849471	.	A	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:107,0,67
16	4853092	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:147,0,66
16	4853816	.	G	A	640.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.941;DP=28;FS=20.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=22.88;ReadPosRankSum=1.129	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:669,0,376
16	4855279	.	A	G	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.348;DP=28;FS=17.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.998	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:436,0,602
16	4861709	.	G	C	1358.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1387,96,0
16	4867908	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	4872760	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,77
16	4898120	.	C	G	103.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:131,12,0
16	4928339	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
16	4929168	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
16	4930100	.	C	T	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:296,0,385
16	4931100	.	A	C	462.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.099;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,13:18:99:491,0,153
16	4931513	.	C	T	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-2.088;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:379,0,266
16	4931651	.	C	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:222,0,104
16	4931677	.	T	A	611.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:640,48,0
16	4931704	.	C	T	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
16	4931958	.	C	T	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=26.48;ReadPosRankSum=-0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:97:346,0,97
16	4932560	.	T	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,75
16	4932659	.	G	A	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
16	4932929	.	A	G	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.854;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.055	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:205,0,425
16	4933301	.	A	T	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
16	4933939	.	G	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.929;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:133,0,341
16	4934549	.	G	A	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=1.00;ReadPosRankSum=-1.875	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:41:41,0,348
16	4934564	.	C	G	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.660;DP=15;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.794	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:83:83,0,463
16	4935146	.	C	T	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:258,0,60
16	4935636	.	G	A	415.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-2.208;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=24.46;ReadPosRankSum=2.208	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:94:444,0,94
16	4938160	.	T	G	852.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:881,66,0
16	4940809	.	A	G	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
16	4941662	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	4942099	.	C	T	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-1.098;DP=10;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:187,0,198
16	4944518	.	C	G	277.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:306,24,0
16	5074952	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
16	5075246	.	C	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
16	5075542	.	G	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:55:191,0,55
16	5078841	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	5083483	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	5132579	.	C	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:44:44,0,216
16	5134446	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
16	5135956	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	5135979	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	5139186	.	G	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
16	5139217	.	C	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
16	5147308	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
16	8722629	.	G	C	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.60;ReadPosRankSum=2.074	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:257,0,206
16	8723633	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	8723777	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
16	8724274	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8724671	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	8724795	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	8724935	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	8725482	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	8725498	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8726058	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	8726673	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	8727683	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8728105	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	8728116	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	8733071	.	A	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
16	8736028	.	T	C	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
16	8737295	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8737509	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8738427	.	T	C	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
16	8738499	.	G	A	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
16	8738579	.	A	G	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:522,36,0
16	8738641	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
16	8739166	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8739273	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8739283	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	8739340	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
16	8739360	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,117
16	8739388	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
16	8739400	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
16	8739784	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	8739822	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	8739954	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	8740015	.	A	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
16	8740418	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	8740881	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
16	8741827	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	8743687	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8743694	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8744010	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	8744085	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8744086	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8844389	.	C	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=1.002;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:312,0,202
16	8867626	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	8873913	.	A	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
16	8875529	.	G	T	247.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:276,0,206
16	8875545	.	G	C	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.400;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:167,0,342
16	8875763	.	T	C	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.429;DP=15;FS=9.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.164	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:167,0,365
16	8875799	.	G	A	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:164,0,273
16	8875858	.	A	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=7.84;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:138,0,738
16	8875861	.	A	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:138,0,738
16	8876202	.	C	G	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=1.586;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:421,0,162
16	8876277	.	G	C	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:292,0,383
16	8876418	.	G	A	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.884	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:342,0,209
16	8876692	.	C	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:135,0,190
16	8876880	.	T	A	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:97:188,0,97
16	8877220	.	T	C	643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:672,48,0
16	8877401	.	G	A	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.52;ReadPosRankSum=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:428,0,205
16	8877854	.	C	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:204,0,64
16	8889533	.	T	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:197,0,259
16	8889628	.	T	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:173,0,214
16	8901732	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	8902064	.	A	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	8902411	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	8902870	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	8904214	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8904215	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8940216	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	8940422	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	8940572	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	8940704	.	A	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	8941818	.	A	C	382.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-1.313;DP=22;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.788	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:411,0,418
16	8941857	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:264,0,346
16	8941934	.	C	A	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:320,0,128
16	8942473	.	G	C	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1263,90,0
16	8942679	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.420;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.360	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:92:92,0,893
16	8943277	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	8943844	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
16	8944593	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	8947036	.	T	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-1.009;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:198,0,500
16	8947077	.	G	A	628.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.714;DP=17;FS=3.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=29.32;ReadPosRankSum=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:9:656,9,0
16	8947128	.	G	T	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.472;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:258,0,702
16	8947251	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=-0.693;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.197	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:67:67,0,554
16	8947502	.	G	C	903.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:932,66,0
16	8947724	.	T	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
16	8948473	.	A	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,102
16	8948974	.	T	C	1318.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1347,93,0
16	8950273	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	8952113	.	C	A	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
16	8952248	.	A	G	1391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1420,99,0
16	8952524	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:110,0,72
16	8953081	.	C	G	890.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-1.617;DP=41;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=21.73;ReadPosRankSum=1.644	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,25:41:99:919,0,511
16	8953700	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	8953944	.	G	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:116,0,30
16	8954000	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	9010091	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	9010213	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	9199036	.	T	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.652;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,126
16	9199213	.	C	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,111
16	9199776	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,151
16	9199852	.	C	T	148.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.73;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:8:176,8,0
16	9200322	.	A	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,120
16	9200547	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:59,0,35
16	9200910	.	T	C	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:95:95,0,232
16	9201191	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	9201970	.	G	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:73,0,70
16	9203871	.	A	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:179,0,103
16	9203899	.	G	A	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:201,0,69
16	9204748	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,114
16	9204805	.	G	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:113,0,33
16	9205363	.	T	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:192,0,107
16	9212959	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
16	9212987	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
16	9213441	.	T	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	10544360	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	10559835	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	10623304	.	G	A	926.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.655;DP=41;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=22.60;ReadPosRankSum=1.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,25:41:99:955,0,572
16	10623332	.	C	T	839.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.877;DP=42;FS=6.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.165	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,24:42:99:868,0,649
16	10623531	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:53:53,0,358
16	10624989	.	G	T	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.688	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:285,0,512
16	10625174	.	T	C	864.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.781;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=29.82;ReadPosRankSum=-0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,23:29:99:893,0,169
16	10625460	.	T	C	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:49:49,0,426
16	10625997	.	G	A	555.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.519;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,15:26:99:584,0,397
16	10626070	.	G	A	587.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.115;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.153	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,19:32:99:616,0,362
16	10626122	.	G	C	471.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.153;DP=29;FS=21.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:500,0,539
16	10637468	.	G	A	1140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.038;DP=44;FS=2.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=25.93;ReadPosRankSum=-0.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,30:44:99:1169,0,480
16	10856340	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	10856350	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	11023208	.	T	C	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:792,54,0
16	11034933	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	11291127	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	11431919	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
16	11433811	.	C	A	19.54	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:56,6,0
16	11439496	.	G	A	781.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.413;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.908	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:20:810,20,0
16	11440404	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	11442082	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	11444572	.	A	C	1011.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1040,75,0
16	11444726	.	C	T	1518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1547,108,0
16	11445040	.	G	A	1393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1422,99,0
16	11445596	.	C	T	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
16	11466021	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	11642242	.	T	C	289.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.338;DP=39;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.402	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,10:39:99:318,0,1145
16	11647433	.	G	A	1466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.199;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=27.16;ReadPosRankSum=-0.161	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,38:54:99:1495,0,519
16	11647492	.	T	C	639.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-1.519;DP=50;FS=8.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.280	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,19:50:99:668,0,1193
16	11769948	.	C	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=1.087;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:183,0,371
16	11769963	.	C	T	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.111;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:282,0,362
16	11770777	.	A	G	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.699;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=24.61;ReadPosRankSum=1.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:422,0,157
16	11771094	.	C	G	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-2.153;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.838	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:296,0,285
16	11771353	.	C	A	502.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.796;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=27.93;ReadPosRankSum=0.478	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:531,0,103
16	11773662	.	C	G	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:321,0,250
16	11836508	.	G	A	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:267,0,139
16	11852354	.	A	C	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=1.00;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:41:41,0,432
16	11928473	.	C	T	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:522,36,0
16	11928736	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,260
16	11928846	.	T	C	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:212,0,180
16	11928924	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,238
16	11928951	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,170
16	11930337	.	C	A	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:488,33,0
16	11934176	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	11934594	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	11940390	.	T	C	1436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1465,102,0
16	11956920	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	11963815	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.237;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:77:77,0,576
16	11965390	.	C	G	225.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:254,21,0
16	11967772	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	11976414	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	11981487	.	G	A	2011.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-1.732;DP=51;FS=4.065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=26.30;ReadPosRankSum=1.664	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,50:51:99:2040,118,0
16	11993973	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
16	11994655	.	G	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
16	12004450	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	12009279	.	A	G	1421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:99:1450,114,0
16	12009304	.	C	A	1421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:99:1450,114,0
16	12009614	.	G	A	1943.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:1972,150,0
16	12009781	.	G	A	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
16	12647595	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	12653960	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	12662670	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,153
16	12662826	.	A	G	95.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:20:124,0,20
16	12662912	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:108,0,71
16	12663377	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
16	12663464	.	T	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	12663786	.	G	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
16	12664063	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
16	12664137	.	G	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
16	12664246	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
16	12665175	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
16	12665244	.	G	T	156.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:185,15,0
16	12666103	.	G	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
16	12666389	.	G	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:114,0,69
16	12666461	.	C	G	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
16	12666468	.	G	A	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:269,18,0
16	12667267	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,135
16	12667334	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:75,0,34
16	12667589	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
16	12667908	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	12757209	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	12758246	.	G	C	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
16	12758783	.	C	A	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:126,0,227
16	12758966	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
16	14029033	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:114,0,34
16	14041958	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:62:154,0,62
16	14045399	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:78,0,74
16	14530619	.	C	G	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.893	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:285,0,290
16	14742400	.	T	G	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=-1.427;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,8:25:99:280,0,622
16	14755808	.	G	A	303.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:332,0,462
16	14989420	.	C	T	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=2.020;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.16;ReadPosRankSum=-2.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,10:24:99:344,0,501
16	15095675	.	C	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=1.350;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:44:44,0,977
16	15117299	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	15127534	.	T	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,234
16	15127535	.	C	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,234
16	15127986	.	T	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:134,0,236
16	15129970	.	A	G	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.548;DP=39;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.548	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,8:39:99:228,0,1202
16	15130351	.	G	C	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=2.850;DP=36;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.329	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,9:36:99:286,0,1057
16	15130594	.	A	G	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.447;DP=40;FS=2.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,15:40:99:504,0,968
16	15131076	.	G	A	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=1.314;DP=52;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,12:52:99:368,0,1575
16	15131962	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-1.246;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:165,0,429
16	15131974	.	G	T	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:254,0,296
16	15133889	.	T	G	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-1.902;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=12.15;ReadPosRankSum=2.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:247,0,422
16	15221957	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:55:55,0,311
16	15227151	.	G	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:99,0,111
16	15471120	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	15785049	.	C	T	467.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=-0.135;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:87:496,0,87
16	15794385	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	15795472	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	15818141	.	A	C	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
16	15818310	.	G	A	603.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:632,45,0
16	15960226	.	T	C	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.219;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:206,0,508
16	16139714	.	T	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:186,0,305
16	16162039	.	C	T	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,102
16	16198834	.	C	G	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
16	16199255	.	A	G	97.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:124,2,0
16	16235681	.	C	T	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:177,0,232
16	16235939	.	G	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
16	16236523	.	T	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	16468294	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	18802238	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	18802246	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	18804411	.	T	C	828.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.583;DP=53;FS=3.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,23:53:99:857,0,1123
16	18816600	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:98:98,0,345
16	18816938	.	C	G	268.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.625;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=19.20;ReadPosRankSum=1.625	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:297,0,193
16	18817560	.	T	C	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:305,0,181
16	18817962	.	T	G	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-1.791;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=18.38;ReadPosRankSum=1.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:304,0,245
16	18821413	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
16	18821993	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
16	18823379	.	T	C	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:846,60,0
16	18839362	.	T	C	468.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=23.44;ReadPosRankSum=2.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:497,0,195
16	18843040	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	18847416	.	G	A	474.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.921;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:503,0,190
16	18853744	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:181,0,302
16	18861335	.	A	G	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:604,42,0
16	18937508	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,191
16	19079037	.	G	A	73.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:102,0,23
16	19083221	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	19089562	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
16	19090721	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,133
16	19093440	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	19236181	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	19250894	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	19258522	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	19270499	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	19277480	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	19277493	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	19278625	.	G	A	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:205,0,205
16	19278812	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,112
16	19279108	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,196
16	19279464	.	T	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,190
16	19421929	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
16	19422019	.	A	C	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
16	19509333	.	C	T	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
16	19509600	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
16	19514141	.	A	G	1168.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1197,84,0
16	19514483	.	C	T	1479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1508,105,0
16	19547747	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	19548116	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:54,0,37
16	19548290	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	19563548	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:106,0,69
16	19680546	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	19717485	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
16	19874187	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	19874188	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	19874193	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	20634775	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	20745255	.	A	C	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:226,0,186
16	20745277	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:236,0,183
16	20745451	.	T	C	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=24.54;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:68:200,0,68
16	20746321	.	T	C	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=1.591;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.591	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:348,0,210
16	20753123	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:70,0,30
16	20808020	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.685;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:146,0,452
16	20810067	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,104
16	20811681	.	C	T	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=-2.678;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=17.49;ReadPosRankSum=2.363	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:308,0,282
16	20816783	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:76,0,60
16	20855309	.	A	G	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:182,0,147
16	20860897	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	21189950	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	21190853	.	A	C	1044.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1073,75,0
16	21191611	.	T	C	291.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:320,24,0
16	21272591	.	G	C	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
16	21312460	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	21416252	.	C	T	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.85;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:66:211,0,66
16	21531609	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:75,0,35
16	21879705	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:78,0,66
16	21989878	.	C	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:185,0,103
16	21990760	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,133
16	21999124	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	22269867	.	A	G	608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:637,45,0
16	22296860	.	A	G	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:87:280,0,87
16	22341464	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
16	22345191	.	G	A	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
16	23079353	.	T	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
16	23400054	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,224
16	23400194	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,195
16	23400494	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	23477213	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:106,0,34
16	23477734	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=-0.867;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:267,0,365
16	23489711	.	C	G	521.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,14:20:99:550,0,197
16	23504993	.	C	T	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.31;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:283,0,60
16	23521750	.	T	C	290.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:319,24,0
16	23521780	.	C	T	209.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:238,0,22
16	23534098	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,192
16	23534249	.	G	C	252.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.60;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:281,0,22
16	23535680	.	A	C	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:494,0,115
16	23536684	.	T	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=19.84;ReadPosRankSum=-1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:306,0,214
16	23546561	.	G	C	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:294,0,178
16	23563501	.	C	T	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:366,0,323
16	23582153	.	G	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.680;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.793	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:165,0,433
16	23583073	.	G	A	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-1.445;DP=22;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:392,0,407
16	23583111	.	T	C	476.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.801;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,14:27:99:505,0,448
16	23585061	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:810,57,0
16	23677006	.	A	G	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.892;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:402,0,936
16	23680286	.	A	G	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-1.868;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:272,0,604
16	23681165	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:72,0,70
16	23684636	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,78
16	23685712	.	C	T	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:50:302,0,50
16	23701538	.	A	G	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=1.656;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:219,0,251
16	24550930	.	A	G	421.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.290	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:26:450,26,0
16	24556663	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	24759131	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	24804070	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	24968214	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	25276056	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	27145450	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	27145453	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	27145454	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	27145457	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	27278333	.	C	A	159.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:188,15,0
16	27278356	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
16	27278364	.	C	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:315,21,0
16	27278365	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:315,21,0
16	27373872	.	A	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:118,0,68
16	27373915	.	G	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,199
16	27374180	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,142
16	27375542	.	G	A	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
16	27375787	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	27772901	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
16	28109784	.	G	A	625.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=-1.486;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=25.03;ReadPosRankSum=1.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:654,0,239
16	28118973	.	G	A	499.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-1.034;DP=28;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:528,0,501
16	28164909	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	28180037	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
16	28332539	.	C	T	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=1.133;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:269,0,285
16	28333411	.	G	A	506.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.372;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:535,0,117
16	28334234	.	G	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=7;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,106
16	28491075	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:104,0,106
16	28506872	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:113,0,65
16	28507644	.	C	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:54:111,0,54
16	28508048	.	A	G	90.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:119,0,23
16	28508716	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	28509509	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	28603796	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	28616665	.	C	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
16	28617057	.	G	A	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-1.652;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:127,0,188
16	28617128	.	T	C	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:317,0,180
16	28617514	.	C	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:52:52,0,139
16	28617729	.	T	C	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:85:85,0,145
16	28617813	.	A	G	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-1.749;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:215,0,176
16	28617885	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,366
16	28617888	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,366
16	28617890	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,366
16	28617971	.	T	C	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:159,0,185
16	28617974	.	T	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:159,0,185
16	28617993	.	C	A	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:131,0,137
16	28618011	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,296
16	28618018	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:67:67,0,296
16	28618636	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:72,0,33
16	28620470	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
16	28621311	.	T	C	558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:587,45,0
16	28629472	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	28836205	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	28842311	.	A	G	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1375,96,0
16	28843118	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,73
16	28844068	.	T	A	89.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:118,0,24
16	28855522	.	G	C	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:157,0,65
16	28857645	.	A	G	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-0.715;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=19.77;ReadPosRankSum=0.865	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:305,0,209
16	28883241	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:100,0,141
16	28921809	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	28929672	.	A	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
16	28966447	.	A	G	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,111
16	28966464	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
16	28968564	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	28968782	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	28977020	.	G	A	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,205
16	28977713	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:73,0,72
16	28978081	.	C	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:96:96,0,148
16	28995757	.	C	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:135,0,185
16	29706379	.	C	T	280.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.387;DP=41;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,12:41:99:309,0,1048
16	29706444	.	C	T	823.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.515;DP=37;FS=5.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.183	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,26:37:99:852,0,312
16	29707246	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
16	29707690	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,269
16	29708350	.	A	G	1561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1590,120,0
16	29709777	.	C	T	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,190
16	29791561	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	29791721	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	29811319	.	C	T	1579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1608,111,0
16	29812996	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
16	29814234	.	G	A	1633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1662,114,0
16	29817998	.	C	T	263.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:292,27,0
16	29818875	.	G	A	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.887;DP=18;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:105,0,392
16	29821744	.	G	A	2271.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2300,160,0
16	29823202	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	29826538	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	29832873	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
16	29839044	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
16	29845721	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,150
16	29845723	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,150
16	29869748	.	G	C	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=25.37;ReadPosRankSum=-0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:358,0,139
16	29908433	.	C	G	207.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:236,18,0
16	29918034	.	T	C	362.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.868;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:83:391,0,83
16	29922011	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,119
16	29929212	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
16	29930750	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	29930753	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	29930754	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	29930767	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	29931065	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	29934240	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:118,0,33
16	29938906	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
16	29941593	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,71
16	29984341	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:59:59,0,225
16	30011542	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:58:58,0,80
16	30014811	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.281;DP=18;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=6.82;ReadPosRankSum=-1.281	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:151,0,445
16	30125840	.	G	C	637.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:666,48,0
16	30132145	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	30198151	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
16	30199780	.	C	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,138
16	30257158	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
16	30364071	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,238
16	30364805	.	C	T	332.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.479;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,11:34:99:361,0,892
16	30366570	.	G	C	346.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.122	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:375,0,329
16	30367820	.	A	G	284.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:313,24,0
16	30368510	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,276
16	30369532	.	C	T	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.635;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:216,0,597
16	30376486	.	T	C	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.269;DP=16;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:84:84,0,501
16	30380486	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	30408765	.	C	T	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:223,0,182
16	30409241	.	A	G	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:223,0,141
16	30409699	.	C	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=-2.588;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=12.81;ReadPosRankSum=2.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:182,0,211
16	30410445	.	C	T	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
16	30457035	.	G	A	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.780;DP=40;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,13:40:99:422,0,981
16	30542830	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,272
16	30724070	.	G	T	515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:544,39,0
16	30734963	.	C	A	710.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:64:739,64,0
16	30762640	.	C	T	351.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:380,30,0
16	30766247	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	30773822	.	T	C	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
16	30779716	.	A	G	558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:587,42,0
16	30780828	.	A	G	1018.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1047,72,0
16	30783977	.	G	A	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
16	30785802	.	G	C	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-1.452;DP=34;FS=7.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:511,0,756
16	30786715	.	T	C	77.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
16	30791463	.	T	C	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
16	30792445	.	T	C	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
16	30928531	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,176
16	30928750	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	30928756	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	30928970	.	A	G	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:411,30,0
16	30929636	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	30930983	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	30931756	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
16	30931968	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:236,0,64
16	30932016	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,119
16	30932699	.	T	C	153.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:182,0,25
16	30934075	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	30960507	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	30964940	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
16	30977799	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	30995528	.	A	G	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
16	30995669	.	T	C	462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:491,36,0
16	30996871	.	C	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
16	30996872	.	G	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
16	30999142	.	A	G	686.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:715,51,0
16	30999462	.	T	C	820.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:849,60,0
16	31075175	.	G	A	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
16	31075708	.	C	G	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:426,30,0
16	31085470	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
16	31088347	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
16	31088625	.	A	G	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
16	31093892	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	31121793	.	G	A	812.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:841,60,0
16	31133055	.	T	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
16	31133410	.	C	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
16	31134712	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:99:110,0,423
16	31134718	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:99:110,0,423
16	31134727	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,423
16	31134851	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,113
16	31141826	.	A	G	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:578,45,0
16	31141880	.	A	G	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
16	31141993	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	31142381	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	31145219	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
16	31145880	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	31191482	.	A	G	532.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:561,42,0
16	31192089	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	31194461	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,121
16	31195279	.	C	T	2723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2752,193,0
16	31199399	.	G	T	1027.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1056,72,0
16	31203446	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	31463648	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	31471105	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,128
16	31476186	.	C	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
16	31677184	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	31719727	.	G	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
16	31720486	.	A	C	278.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:307,24,0
16	31720636	.	T	C	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
16	31721064	.	T	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	31721493	.	G	A	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
16	31722952	.	A	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
16	31733088	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	31770723	.	T	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
16	31798628	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	31818244	.	C	G	992.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1021,69,0
16	31926619	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	32192670	.	C	T	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:21:309,21,0
16	32192671	.	G	A	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:21:309,21,0
16	32192676	.	G	A	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
16	33953798	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33953800	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33953809	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33953816	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33955802	.	C	A	159.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:188,18,0
16	33963086	.	A	G	1933.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1962,132,0
16	33963106	.	T	C	1933.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:99:1962,132,0
16	33963108	.	A	G	1933.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:99:1962,132,0
16	33963175	.	C	G	2202.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2231,154,0
16	33963202	.	A	G	3832.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:3861,268,0
16	33963210	.	A	G	3832.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:99:3861,268,0
16	33963211	.	T	C	3832.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:99:3861,268,0
16	33963224	.	T	C	3832.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:3861,268,0
16	33963248	.	T	C	3832.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:3861,268,0
16	33963279	.	T	C	2477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:2506,168,0
16	33963289	.	A	G	2477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:2506,168,0
16	33963329	.	T	C	2148.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-1.659;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=32.04;ReadPosRankSum=1.511	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,46:47:99:2177,141,0
16	33963332	.	A	G	2148.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2177,141,0
16	33963395	.	A	T	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
16	33963396	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
16	33963490	.	T	C	1996.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:2025,135,0
16	33963563	.	G	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.60	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:51:51,0,2364
16	33963571	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.60	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:51:51,0,2364
16	33963591	.	T	C	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:99:383,0,2335
16	33963595	.	A	G	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:99:383,0,2335
16	33963597	.	C	T	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:99:383,0,2335
16	33963599	.	T	C	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,1:1:99:383,0,2335
16	33963605	.	T	C	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,10:10:99:383,0,2335
16	33963624	.	T	C	811.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,22:22:99:840,0,2307
16	33963636	.	A	G	820.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.46	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,22:22:99:849,0,2307
16	33963637	.	A	G	820.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,22:22:99:849,0,2307
16	33963708	.	G	A	610.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,17:17:99:639,0,2322
16	33963709	.	T	C	610.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.77	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,17:17:99:639,0,2322
16	33963752	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.872;DP=29;FS=22.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:187,0,6864
16	33963758	.	T	C	866.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,22:22:99:895,0,5077
16	33963765	.	A	C	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,10:10:99:492,0,5481
16	33963766	.	A	C	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.98	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,10:10:99:492,0,5481
16	33963769	.	C	A	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,10:10:99:492,0,5481
16	33963775	.	G	C	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:99:492,0,5481
16	33963912	.	T	C	2005.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2034,150,0
16	33963961	.	C	G	424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:453,36,0
16	33964017	.	A	G	1310.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1339,90,0
16	33964082	.	T	C	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:57:837,57,0
16	33964091	.	T	C	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:837,57,0
16	33964108	.	G	C	1078.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1107,75,0
16	33964134	.	G	C	1623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1652,111,0
16	33964143	.	T	C	1623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:99:1652,111,0
16	33964895	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33964910	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33964959	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
16	33964975	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:179,12,0
16	33965447	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	33965452	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	33965453	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	33965456	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	33965554	.	A	G	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:585,39,0
16	33965560	.	T	A	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
16	33965561	.	T	C	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
16	33965589	.	G	A	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
16	33965591	.	A	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
16	33965593	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
16	33965626	.	A	G	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
16	33965627	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:810,54,0
16	33965639	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:55:55,0,133
16	33965872	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33965875	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33965885	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33965887	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	33965942	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	33965948	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	33965952	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	34384239	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	34830330	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
16	34830370	.	A	G	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:700,48,0
16	34830385	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
16	46406957	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
16	46615362	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
16	46655210	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:355,27,0
16	46692501	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
16	46692836	.	T	C	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
16	46693345	.	G	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
16	46693540	.	A	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
16	46696284	.	G	A	2126.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2155,147,0
16	46728587	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	46728952	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	46729271	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	46731413	.	T	C	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-1.665;DP=33;FS=7.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,12:33:99:422,0,833
16	46963340	.	G	A	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.42;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:45:275,0,45
16	46963405	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:66,0,30
16	47538714	.	A	G	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:87:1263,87,0
16	47538719	.	A	G	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:87:1263,87,0
16	47538723	.	C	G	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:87:1263,87,0
16	47538725	.	T	C	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:87:1263,87,0
16	47538729	.	T	C	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1263,87,0
16	47538759	.	C	G	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1845,123,0
16	47538761	.	T	C	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1845,123,0
16	47538767	.	T	C	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1845,123,0
16	47538775	.	T	C	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:99:1845,123,0
16	47538781	.	A	G	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:99:1845,123,0
16	47538816	.	C	G	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
16	47538819	.	G	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
16	47538835	.	T	C	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
16	47538844	.	A	G	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
16	47538851	.	G	A	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:33:495,33,0
16	47538859	.	T	G	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:33:495,33,0
16	47539141	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:127,9,0
16	47539142	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:127,9,0
16	47539150	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	47539167	.	G	A	592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:38:621,38,0
16	47539171	.	C	T	592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.302;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=26.81;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:38:621,38,0
16	47539183	.	C	A	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:57:825,57,0
16	47539189	.	T	G	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
16	47539207	.	T	C	390.89	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=29.48;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:2:417,0,2
16	47539213	.	A	G	390.89	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,9:9:2:417,0,2
16	47539220	.	T	C	390.89	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:2:417,0,2
16	47539225	.	A	G	390.89	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:2:417,0,2
16	47735030	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	48122582	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	48201432	.	T	C	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.860;DP=30;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.045	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:246,0,774
16	48227862	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.673;DP=16;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:80:80,0,512
16	48230734	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	48248918	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.07;ReadPosRankSum=2.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,352
16	48256602	.	T	C	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.335;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=3.84;ReadPosRankSum=2.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:82:82,0,422
16	48261871	.	G	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-0.186;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.261	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:138,0,612
16	48265777	.	C	T	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:89:89,0,312
16	48281252	.	C	T	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
16	48281253	.	C	G	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
16	48281257	.	A	T	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
16	48281274	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	48281323	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	48372461	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	48385957	.	T	C	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.343	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:359,0,631
16	48386264	.	A	G	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:263,0,305
16	48387175	.	A	G	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:131,0,330
16	48387201	.	A	G	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,487
16	48387278	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:99:99,0,566
16	48387286	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:99:99,0,566
16	48387296	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:99,0,566
16	48387354	.	A	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.400;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:177,0,355
16	48394626	.	C	T	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=2.219;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=17.75;ReadPosRankSum=-2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:188,0,147
16	48572817	.	G	A	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:78,0,26
16	48573428	.	A	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
16	48574040	.	T	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	48574637	.	A	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	48574869	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	48575878	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	48578101	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	48593065	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	50069772	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:157,0,72
16	50100253	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	50106594	.	T	C	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:227,0,271
16	50139285	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
16	50139483	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,322
16	50139515	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.648;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:204,0,346
16	50139526	.	A	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.650;DP=15;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:88:88,0,478
16	50139563	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,180
16	50139799	.	T	C	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
16	50140135	.	C	G	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
16	50263762	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
16	50354273	.	C	G	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.445;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.699	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:236,0,664
16	50745583	.	T	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
16	50766886	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	52577835	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	52580247	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	53189941	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,137
16	53341748	.	T	G	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
16	53360682	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
16	53481010	.	A	G	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-2.859;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:167,0,510
16	53488749	.	G	C	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.536;DP=24;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:278,0,530
16	53499725	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,144
16	53503934	.	G	A	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.345;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.345	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,14:28:99:502,0,1042
16	53503943	.	C	G	473.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.082;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:502,0,1042
16	53504721	.	T	C	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-1.992;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.66;ReadPosRankSum=2.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:294,0,477
16	53524308	.	G	C	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=-1.437;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.969	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:245,0,608
16	54147935	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:68,0,36
16	54148007	.	C	T	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:232,0,230
16	54148189	.	G	T	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:61:271,0,61
16	54318102	.	C	T	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
16	54318172	.	C	A	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:261,0,213
16	54318528	.	A	G	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:792,57,0
16	54319994	.	G	C	212.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:241,21,0
16	54320267	.	C	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,325
16	54321499	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	54325223	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
16	54327852	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	54328574	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	54341451	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	54886126	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	54886298	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	54886479	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	54886668	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:115,0,30
16	54887581	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	54967096	.	C	A	583.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.525;DP=23;FS=18.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.385	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,17:23:99:612,0,160
16	54967957	.	A	C	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=34.52;ReadPosRankSum=-1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:59:408,0,59
16	54967959	.	A	C	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=34.52;ReadPosRankSum=-0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:59:408,0,59
16	54968239	.	A	G	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:67:242,0,67
16	56395610	.	G	A	276.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:305,0,180
16	56396486	.	C	T	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=0.836;DP=28;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.885	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,9:28:99:306,0,748
16	56465425	.	C	T	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-1.228;DP=23;FS=20.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:315,0,542
16	56510299	.	A	C	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,181
16	56510601	.	C	T	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-1.215;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:265,0,301
16	56510845	.	C	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=2.607;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.67;ReadPosRankSum=-2.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:119,0,473
16	56548501	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
16	56643343	.	G	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,113
16	56855496	.	C	G	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:255,0,511
16	56873495	.	C	T	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.272	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:219,0,397
16	56966071	.	T	G	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:253,0,129
16	57171233	.	C	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
16	57183424	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	57187719	.	C	T	1060.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1089,75,0
16	57212650	.	A	G	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
16	57217531	.	T	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:115,0,34
16	57219861	.	T	G	112.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:10:140,10,0
16	57272963	.	T	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:57:57,0,143
16	57417134	.	G	T	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,298
16	57418725	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:88:114,0,88
16	57481305	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	57495026	.	T	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:736,51,0
16	57499902	.	T	C	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.162;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:440,0,628
16	57506801	.	C	T	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:175,0,307
16	57562804	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	57655792	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
16	57676421	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	57682937	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	57686303	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
16	57689385	.	C	G	560.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.652;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:589,0,538
16	57689883	.	T	C	911.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.487;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=23.38;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,24:39:99:940,0,536
16	57693498	.	T	C	617.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-1.041;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.996	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,17:29:99:646,0,437
16	57697532	.	T	G	598.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.693;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.047	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,18:40:99:627,0,814
16	57697568	.	C	A	217.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-1.110;DP=32;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:246,0,896
16	57697795	.	C	T	724.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.939;DP=36;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.716	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:753,0,556
16	57698501	.	G	A	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.437;DP=34;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:513,0,758
16	57698714	.	C	A	504.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.591;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:533,0,420
16	57784022	.	C	T	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
16	57786711	.	C	T	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
16	57792688	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,116
16	57795394	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
16	57805176	.	A	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
16	57806798	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	57815144	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:81,0,77
16	57815145	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:77:81,0,77
16	57816109	.	C	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
16	57816694	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	57819991	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	57821503	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	58028860	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	58030053	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
16	58030192	.	A	C	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
16	58030401	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	58030634	.	C	T	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
16	58032026	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:106,0,32
16	58034420	.	C	T	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
16	58049569	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	58050912	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	58054671	.	G	C	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:782,57,0
16	58054888	.	C	T	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
16	58079165	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:149,0,65
16	58080009	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.349;DP=20;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:157,0,558
16	58080215	.	G	C	404.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:433,0,129
16	58191966	.	C	T	461.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:490,36,0
16	58194326	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,115
16	58194926	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,302
16	58195632	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,230
16	58196965	.	T	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:174,0,177
16	58540595	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	58542664	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	58544295	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	58544640	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	58545426	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	58549014	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:118,0,30
16	58549932	.	T	C	872.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:901,63,0
16	58550484	.	G	A	576.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.146;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=19.89;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,18:29:99:605,0,334
16	58551360	.	C	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:60:190,0,60
16	58552228	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
16	58552921	.	G	A	752.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:781,54,0
16	58552959	.	A	G	184.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-2.062;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.530	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:213,0,315
16	58553164	.	A	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
16	58553348	.	T	C	174.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:203,0,19
16	58553777	.	G	A	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:177,0,289
16	58554141	.	G	T	285.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:314,27,0
16	58554780	.	C	T	433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-1.061;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:462,0,696
16	58560322	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	58573851	.	T	C	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-1.813;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:359,0,440
16	58575489	.	G	A	532.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-1.414;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=21.31;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:561,0,352
16	58577421	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
16	58587737	.	C	T	456.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.364;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,13:27:99:485,0,516
16	58699690	.	C	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
16	58699834	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
16	58700352	.	A	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
16	58741367	.	A	G	1841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1870,132,0
16	58743454	.	A	C	2106.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2135,147,0
16	58750604	.	G	A	541.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.504;DP=15;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=30.06;ReadPosRankSum=-1.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:2:568,2,0
16	58750869	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	58752466	.	C	T	1088.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-2.952;DP=45;FS=9.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=24.19;ReadPosRankSum=2.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,29:45:99:1117,0,566
16	58757668	.	A	C	1736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1765,123,0
16	58757683	.	A	G	1323.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1352,93,0
16	61089497	.	A	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,125
16	61089505	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,125
16	61089512	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:78:78,0,125
16	66326681	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	66329697	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	66646591	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:74,0,76
16	66649321	.	G	A	615.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-1.249;DP=30;FS=8.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=20.53;ReadPosRankSum=1.037	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,18:30:99:644,0,421
16	66758203	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
16	66759454	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	66759682	.	C	A	67.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
16	66764678	.	A	G	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:196,0,26
16	66764809	.	G	T	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=15.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:263,0,267
16	66765067	.	G	A	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:233,0,181
16	66765837	.	G	C	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:269,0,101
16	66766913	.	C	T	279.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:308,0,168
16	66767459	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,161
16	66767632	.	A	T	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:366,0,201
16	66767659	.	G	C	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=1.061;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=24.13;ReadPosRankSum=-1.344	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:366,0,136
16	66767796	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:188,0,186
16	66843433	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
16	66921601	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
16	66921636	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,107
16	66923332	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
16	66924072	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,108
16	67039645	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:35:39,0,35
16	67197675	.	C	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-2.520;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.520	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:140,0,255
16	67233266	.	A	C	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=1.562;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.562	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:257,0,311
16	67466435	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	67715585	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,73
16	67715862	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:76,0,31
16	67864356	.	C	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.767;DP=24;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.767	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,6:24:99:183,0,702
16	68056276	.	A	G	388.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.854;DP=17;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=22.87;ReadPosRankSum=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:417,0,209
16	68057096	.	T	C	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
16	68261347	.	C	G	36.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.658;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:65:65,0,726
16	68294800	.	C	G	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:132,0,155
16	68317963	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	68331890	.	G	A	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.807;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:87:87,0,513
16	68332747	.	G	A	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.031;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:258,0,573
16	68337948	.	T	C	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:134,0,197
16	68344696	.	C	T	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,116
16	68344945	.	G	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,191
16	68387373	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:57:57,0,254
16	68389772	.	C	T	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:293,0,413
16	68394307	.	G	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:153,0,30
16	68564124	.	G	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
16	68564186	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
16	68573287	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	68573295	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	68593844	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	68596689	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	68598007	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	68598938	.	G	A	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
16	68599668	.	C	T	373.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:402,30,0
16	68600440	.	A	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
16	68600855	.	G	T	220.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.50;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:3:247,0,3
16	68713730	.	G	A	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
16	68713823	.	C	A	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
16	68721470	.	T	C	358.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.57;ReadPosRankSum=-1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:9:386,0,9
16	68721533	.	G	C	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:487,33,0
16	68725783	.	G	A	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
16	68727069	.	C	T	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
16	68727130	.	A	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	68727239	.	A	T	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
16	68728938	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	68728976	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	68729785	.	C	A	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
16	68732457	.	G	T	586.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:615,42,0
16	68857441	.	T	C	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=1.984;DP=54;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=7.53;ReadPosRankSum=-1.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,14:54:99:435,0,1580
16	68869449	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
16	68870627	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,75
16	68930941	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	68930944	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	68930945	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	69177268	.	C	T	623.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-0.705;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,18:33:99:652,0,544
16	69337443	.	G	A	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:92:179,0,92
16	69338861	.	G	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:55:55,0,161
16	69341781	.	A	G	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
16	69354963	.	A	G	837.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=1.894;DP=35;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.859;QD=23.94;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,23:35:99:866,0,410
16	69355155	.	G	A	397.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.211;ClippingRankSum=0.954;DP=32;FS=3.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,12:32:99:426,0,726
16	69355960	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,145
16	69356612	.	C	G	309.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=23.83;ReadPosRankSum=-1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:338,0,139
16	69356694	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,397
16	69356695	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,397
16	69357167	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=2.21;ReadPosRankSum=-1.659	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:68:68,0,584
16	69357264	.	G	A	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:137,0,68
16	69357895	.	G	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,111
16	69358868	.	G	C	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.159;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:184,0,728
16	69359976	.	C	G	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=22.38;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:252,0,101
16	69360904	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
16	69361681	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
16	69363734	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
16	69364030	.	G	A	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-1.780;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=17.28;ReadPosRankSum=1.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:322,0,245
16	69364443	.	A	G	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.919;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:340,0,127
16	69366986	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
16	69368484	.	G	C	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.702;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.609	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:205,0,474
16	69373414	.	T	C	372.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:401,0,123
16	69375658	.	G	A	428.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-1.076;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:86:457,0,86
16	69375841	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,149
16	69376150	.	A	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.570;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=8.72;ReadPosRankSum=-0.745	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:194,0,507
16	69376686	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,221
16	69400207	.	T	G	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:122,0,31
16	69493004	.	A	C	616.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.776;DP=45;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=13.71;ReadPosRankSum=-0.035	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,18:45:99:645,0,1003
16	69494953	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,107
16	69497203	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.028;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:224,0,776
16	69497228	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=-0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:120,0,574
16	69497248	.	T	G	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
16	69499495	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:76,0,67
16	69544113	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	69730426	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:114,0,63
16	69730555	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,144
16	69733009	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,179
16	69733460	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
16	69743760	.	A	G	555.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.850;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.376	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:584,0,545
16	69764748	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	69776416	.	T	C	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.074;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,10:42:99:298,0,1219
16	69782855	.	C	T	612.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.517;DP=28;FS=9.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=21.88;ReadPosRankSum=-0.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:641,0,362
16	69784491	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	69960605	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
16	69970329	.	A	G	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.597;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:212,0,343
16	69973825	.	G	A	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=17.73;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:241,0,138
16	69974448	.	C	A	105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:134,0,392
16	69974546	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,316
16	69974659	.	G	A	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:96:175,0,96
16	69975360	.	G	A	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:208,0,244
16	70012572	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,100
16	70014622	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.876;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:141,0,185
16	70014699	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	70026694	.	T	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,272
16	70030073	.	C	T	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:225,0,262
16	70112326	.	C	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
16	70191237	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:37:65,0,37
16	70191333	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,153
16	70196186	.	T	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,157
16	70253727	.	A	C	20.53	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	70286550	.	T	A	962.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=1.255;DP=57;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.711	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,27:57:99:991,0,1130
16	70286631	.	T	A	890.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.619;DP=57;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.040	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,25:57:99:919,0,1235
16	70290340	.	T	C	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:143,0,108
16	70303580	.	G	A	1016.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.350;DP=65;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,29:65:99:1045,0,1388
16	70304236	.	C	T	719.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-1.628;DP=53;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,21:53:99:748,0,1250
16	70351202	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	70412849	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	70514828	.	A	C	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.676;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:507,0,564
16	70516075	.	C	T	526.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.433;ClippingRankSum=-0.385;DP=37;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:555,0,786
16	70546234	.	G	A	1077.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1106,78,0
16	70548297	.	G	A	1599.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1628,111,0
16	70584258	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	70584390	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	70584391	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	70602221	.	C	T	1157.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1186,81,0
16	70606517	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
16	70606555	.	C	G	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
16	70608266	.	T	C	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:356,24,0
16	70610223	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	70611232	.	C	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
16	70696367	.	C	T	980.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1009,69,0
16	70700214	.	A	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
16	70703776	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	70703818	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	70704455	.	T	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
16	70704475	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:73,0,31
16	70710858	.	C	T	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.577;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,14:34:99:495,0,749
16	70713047	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
16	70714584	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	70719775	.	G	T	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:221,0,183
16	70722940	.	A	C	129.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:158,0,23
16	70723294	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	70723404	.	A	G	126.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.36;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:155,0,24
16	70723925	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	70724432	.	A	C	123.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
16	70725141	.	A	C	235.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:264,0,19
16	70725326	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,190
16	70725589	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
16	70726795	.	C	A	585.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.953;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=24.41;ReadPosRankSum=-1.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,17:24:99:614,0,227
16	70732761	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	70733138	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	70733141	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	70735913	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	70736752	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:72,0,62
16	70738820	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	70750912	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	70756066	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	70759723	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	70783213	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	70820217	.	C	T	417.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:446,0,409
16	71316812	.	A	G	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
16	71319581	.	T	C	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.171;DP=22;FS=7.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.375	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:274,0,529
16	71319646	.	G	A	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
16	71319890	.	C	T	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
16	71319986	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	71320078	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	71320690	.	C	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
16	71322305	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	71323027	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	71509685	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	71660115	.	G	C	896.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:925,66,0
16	71660310	.	G	A	1204.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1233,90,0
16	71665985	.	A	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
16	71667131	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	71668634	.	T	G	650.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:679,48,0
16	71668800	.	G	A	708.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:737,51,0
16	71672762	.	T	C	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
16	71674882	.	C	G	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
16	71675136	.	G	A	565.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:594,42,0
16	71675230	.	C	A	536.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:565,39,0
16	71675440	.	A	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
16	71678932	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	71679057	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	71679204	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
16	71680002	.	C	T	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
16	71681515	.	A	G	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
16	71681582	.	C	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
16	71714119	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	71764834	.	C	T	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
16	71765416	.	G	T	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
16	71792208	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	71801594	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	71884034	.	C	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:95:95,0,399
16	71885423	.	A	G	738.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:767,57,0
16	71886530	.	T	A	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
16	71889173	.	C	T	640.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:669,48,0
16	71890489	.	C	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
16	71902142	.	C	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
16	71928850	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	71957753	.	T	C	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
16	71959727	.	A	G	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
16	71961535	.	A	C	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:909,63,0
16	72049621	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	72050885	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	72052891	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	72058881	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	72059149	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	72059556	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	72120062	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
16	72130203	.	C	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
16	72130815	.	C	A	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:617,45,0
16	72135014	.	T	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:736,54,0
16	72137561	.	G	A	739.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:768,54,0
16	72138112	.	G	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
16	72138235	.	C	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,147
16	72139184	.	C	A	716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:745,57,0
16	72146441	.	C	G	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:588,45,0
16	72146570	.	T	C	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
16	72827758	.	T	C	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
16	72832135	.	T	A	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
16	74332629	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:77,0,72
16	74349043	.	G	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,78
16	74350013	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	74350016	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	74356355	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	74359219	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	74360317	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
16	74398007	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	74425548	.	A	G	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
16	74474160	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	74482053	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,99
16	74482653	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
16	74483287	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,147
16	74483288	.	A	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,147
16	74483499	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
16	74483649	.	A	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,111
16	74484969	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
16	74485722	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,173
16	74485808	.	C	T	250.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:279,0,20
16	74486189	.	T	C	293.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=2.327;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:322,0,384
16	74486265	.	C	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:69:69,0,665
16	74537591	.	C	T	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=1.056;DP=19;FS=9.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=22.20;ReadPosRankSum=-1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:450,0,253
16	74655848	.	G	A	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
16	74656407	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,150
16	74656949	.	G	T	534.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.602;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=28.15;ReadPosRankSum=-0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:563,0,163
16	74657421	.	T	C	962.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:991,69,0
16	74657485	.	A	T	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.69;ReadPosRankSum=1.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:346,0,286
16	74664698	.	A	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:230,0,261
16	74664743	.	T	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-1.359;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:210,0,522
16	74664810	.	A	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.478;DP=18;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:123,0,549
16	74670458	.	C	T	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-1.943;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:306,0,293
16	74685589	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	74695079	.	G	T	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:569,39,0
16	74698057	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	74698525	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=5;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
16	74747024	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,292
16	74747451	.	C	G	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.772	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:289,0,269
16	74750405	.	G	A	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
16	74762468	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	74944512	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	74944573	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	74945092	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
16	75018874	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,184
16	75033297	.	C	T	187.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:216,0,22
16	75263024	.	T	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,148
16	75269267	.	A	G	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-0.108;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:316,0,599
16	75269534	.	C	T	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.694;DP=26;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.636	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,7:26:99:212,0,737
16	75276295	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	75327916	.	A	G	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=-0.021;DP=30;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,14:30:99:511,0,608
16	75477714	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
16	75478447	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:159,0,66
16	75479322	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=31.68;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:99:151,0,142
16	75479331	.	T	C	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:151,0,142
16	75479434	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
16	75479907	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,115
16	75480066	.	C	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:115,0,65
16	75480608	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,101
16	75481185	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,151
16	75481215	.	C	T	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
16	75485431	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
16	75498253	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:70:81,0,70
16	75675609	.	T	C	438.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=1.418;DP=33;FS=3.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,13:33:99:467,0,739
16	75691149	.	C	T	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.836	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:337,0,419
16	77228629	.	A	G	290.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:319,24,0
16	77233394	.	A	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:472,36,0
16	77235896	.	A	G	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
16	78153071	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	78153157	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	79245956	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	79245961	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	80632586	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:123,0,233
16	80634178	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
16	80635000	.	C	T	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.336;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:173,0,187
16	80635032	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:54:113,0,54
16	80651109	.	T	C	10.21	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:26:38,0,26
16	80718879	.	A	G	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=15.98;ReadPosRankSum=-1.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:188,0,175
16	81025372	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	81025490	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	81025506	.	T	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	81039234	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	81040492	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	81050965	.	A	T	1241.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1270,87,0
16	81061827	.	G	A	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
16	81063244	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,152
16	81063245	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,152
16	81063537	.	C	T	336.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-1.852;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.852	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:365,0,360
16	81064234	.	A	G	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.967;DP=12;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=1.90;ReadPosRankSum=-1.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:51:51,0,391
16	81064336	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,119
16	81064439	.	A	G	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=2.161;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=10.99;ReadPosRankSum=-2.161	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:215,0,808
16	81064440	.	A	G	267.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=1.684;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:296,0,344
16	81064574	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:103,0,65
16	81074201	.	T	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
16	81074737	.	G	A	116.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:144,12,0
16	81077915	.	T	C	534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:563,39,0
16	81079241	.	C	T	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
16	81079399	.	G	A	778.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:807,57,0
16	81079641	.	G	A	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
16	81079681	.	A	G	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
16	81080366	.	T	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
16	81094760	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	81095091	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	81095363	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	81115951	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	81120812	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	81411448	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
16	81412168	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,78
16	81420955	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,114
16	81421278	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
16	81421484	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,146
16	81421590	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	81422309	.	C	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
16	81422980	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	81424117	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,153
16	81745097	.	T	C	208.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:237,18,0
16	82169385	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	82181934	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	82181977	.	T	C	660.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:689,48,0
16	82183403	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
16	82187124	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
16	82187134	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	82189803	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
16	82203742	.	T	C	864.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:893,63,0
16	82203758	.	C	T	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:63:907,63,0
16	82203768	.	G	T	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:63:907,63,0
16	82203786	.	C	G	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
16	83826766	.	C	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:77:94,0,77
16	83828488	.	A	G	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
16	83828544	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	83830876	.	A	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,116
16	83846041	.	A	G	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.136;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.136	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:435,0,476
16	83973956	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	83986885	.	C	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:90:90,0,939
16	83986888	.	G	A	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.938;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:90:90,0,939
16	83997156	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	83999261	.	C	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-2.237;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.06;ReadPosRankSum=2.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:133,0,329
16	83999653	.	A	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.709;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:211,0,326
16	84091056	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	84093062	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	84093453	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84093931	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	84095147	.	A	G	373.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:402,30,0
16	84095254	.	G	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
16	84095451	.	C	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
16	84096577	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
16	84127393	.	C	T	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.509;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,16:32:99:587,0,604
16	84135453	.	A	T	769.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:798,54,0
16	84135493	.	A	G	815.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:844,60,0
16	84135515	.	C	T	1008.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1037,75,0
16	84217062	.	C	T	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:333,27,0
16	84402275	.	G	C	236.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:265,24,0
16	84432591	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	84434309	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84434314	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84435436	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
16	84436533	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	84444349	.	A	C	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
16	84464312	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84484762	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	84485573	.	C	A	733.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:762,57,0
16	84488238	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	84493675	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84494020	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	84494252	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
16	84494275	.	C	T	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.968;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:226,0,300
16	84497924	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	84498304	.	G	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,162
16	84498722	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,342
16	84498781	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:74,0,72
16	84507093	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	84511388	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84511396	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84512328	.	C	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
16	84513299	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	84513397	.	A	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,231
16	84516309	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
16	84520325	.	T	C	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:63:272,0,63
16	84520396	.	A	G	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
16	84520537	.	T	C	278.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:307,24,0
16	84522897	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:58:78,0,58
16	84599530	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
16	84599866	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
16	84599970	.	C	T	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.05;ReadPosRankSum=1.867	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:337,0,177
16	84600021	.	T	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
16	84600347	.	T	C	77.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:106,0,24
16	84651656	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	84695280	.	A	G	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:220,0,252
16	84695490	.	C	T	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.376	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:257,0,348
16	84696052	.	A	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:139,0,263
16	84696102	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,159
16	84696116	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=5.86;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:81:81,0,230
16	84696385	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:157,0,30
16	84697439	.	A	T	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=12.89;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:170,0,230
16	84697706	.	G	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:107,0,232
16	84698186	.	C	T	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:60:285,0,60
16	84698208	.	C	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:187,0,139
16	84698394	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,79
16	84698732	.	A	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:145,0,272
16	84698808	.	T	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,105
16	84778762	.	C	T	336.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.038;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:365,0,379
16	84779248	.	T	G	508.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=-1.636;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.525	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:537,0,355
16	84795035	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	84796603	.	A	G	517.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=2.052;DP=22;FS=17.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=23.53;ReadPosRankSum=-1.082	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:546,0,245
16	84808824	.	C	G	818.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:847,60,0
16	84883102	.	C	T	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
16	84940479	.	T	C	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
16	84942638	.	T	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:109,0,116
16	85009752	.	T	C	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.795;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.541	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:173,0,754
16	85021058	.	T	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,70
16	85023855	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	85126661	.	C	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
16	85418210	.	C	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
16	85418319	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	85448947	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:79,0,29
16	85476439	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	85481912	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	85490558	.	C	T	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
16	85494040	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	85494497	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	85494776	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	85498187	.	G	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
16	85522120	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	85523316	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	85523673	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	85523857	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	85524240	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	85524329	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	85559274	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	85562380	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
16	85680103	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	85682471	.	C	T	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:427,33,0
16	85682618	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,182
16	85683171	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,112
16	85683205	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
16	85683210	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:180,12,0
16	85683408	.	G	T	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:174,0,220
16	85683705	.	G	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
16	85683911	.	T	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
16	85684385	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
16	85685120	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:110,0,182
16	85685140	.	C	T	116.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:16:145,0,16
16	85685217	.	G	T	471.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:500,42,0
16	85685756	.	T	C	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
16	85686145	.	G	A	204.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:20:233,0,20
16	85686648	.	A	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:103,0,108
16	85687921	.	G	A	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-1.308;DP=38;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=0.63;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,4:38:52:52,0,1261
16	85691294	.	A	G	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
16	85691936	.	C	T	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
16	85692598	.	T	C	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
16	85694130	.	A	G	372.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:401,30,0
16	85697769	.	T	C	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
16	85698079	.	T	G	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:237,0,106
16	85700360	.	G	A	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:201,0,131
16	85700481	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,220
16	85701586	.	C	T	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
16	85706047	.	A	C	1704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1733,120,0
16	85706564	.	G	A	529.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.322;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.138	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:558,0,461
16	85706633	.	T	C	766.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.430;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=23.24;ReadPosRankSum=-3.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,21:33:99:795,0,429
16	85707367	.	G	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.796;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.690	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:119,0,482
16	85708665	.	T	A	423.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-0.964;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.810	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:452,0,278
16	85708846	.	C	A	502.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.411;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=20.11;ReadPosRankSum=-1.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,14:25:99:531,0,401
16	85709316	.	A	G	317.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.914	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:346,0,292
16	85709610	.	G	A	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:290,0,338
16	85711411	.	C	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.990;DP=22;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:281,0,524
16	85711502	.	T	C	553.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.423;DP=22;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.410;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.211	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,15:22:99:582,0,233
16	85711860	.	C	T	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.571;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:445,0,483
16	85722557	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,466
16	85722560	.	C	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:144,0,466
16	85732989	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	85741257	.	C	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:229,0,181
16	85742551	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	85813231	.	A	C	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:870,60,0
16	85814995	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	85815097	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	85816971	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	85817250	.	T	C	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
16	85821974	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	85835818	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
16	85836083	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	85836112	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
16	85836149	.	G	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
16	85836510	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
16	85836744	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
16	85836851	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	85837118	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	85837218	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	85837424	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	85837787	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	85837939	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
16	85838653	.	T	C	3684.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:3713,256,0
16	85838916	.	A	G	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
16	85839140	.	T	C	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
16	85839186	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	85839211	.	G	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
16	85839543	.	C	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
16	85839708	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
16	85839772	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
16	85839822	.	G	T	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
16	85839834	.	G	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
16	86564267	.	A	T	33.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:61,6,0
16	86564671	.	G	T	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:210,0,222
16	86565486	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:117,0,65
16	86565537	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,198
16	86565826	.	C	G	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
16	86566039	.	C	T	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:321,0,400
16	86566042	.	G	A	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:321,0,400
16	86567270	.	G	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
16	86569258	.	A	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
16	86575737	.	C	T	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=22.89;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:56:280,0,56
16	86575992	.	G	T	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
16	86577374	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
16	86579223	.	C	A	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:90,0,33
16	86579287	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	86579457	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	86585905	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	87356367	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	87364184	.	T	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=1.031;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:110,0,467
16	87420382	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
16	87426028	.	T	C	667.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:696,51,0
16	87436764	.	A	G	1288.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1317,90,0
16	87437098	.	A	G	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:870,63,0
16	87445270	.	T	C	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
16	87526248	.	C	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:57:57,0,117
16	87680277	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	87680278	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	87723838	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	87732340	.	C	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
16	87733993	.	T	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:177,0,102
16	87736160	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	87742129	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:111,0,31
16	87744491	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	87761710	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	87761711	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	87763084	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,69
16	87764267	.	A	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
16	87767025	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	87768317	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	87779246	.	C	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
16	87788833	.	G	T	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:124,0,369
16	87788864	.	G	A	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.309	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:263,0,189
16	87789715	.	G	A	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
16	87796043	.	C	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
16	87835808	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
16	87864475	.	G	C	1512.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.352;ClippingRankSum=-2.492;DP=62;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=24.40;ReadPosRankSum=2.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,39:62:99:1541,0,768
16	87865022	.	C	T	695.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=-0.493;DP=60;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,26:58:99:724,0,1103
16	87865201	.	T	A	758.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.101;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.534	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,22:45:99:787,0,804
16	87865294	.	C	T	885.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.824;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.125	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,25:50:99:914,0,901
16	87866138	.	G	C	808.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-2.550;DP=50;FS=2.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=16.18;ReadPosRankSum=2.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,23:50:99:837,0,1020
16	87868527	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
16	87869711	.	C	T	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
16	87871714	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	87872488	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
16	87872718	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	87873247	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	87876631	.	C	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:103,0,72
16	87876859	.	T	C	112.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:140,12,0
16	87878476	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:70,0,34
16	87878822	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	87878964	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	87879163	.	C	T	51.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:17:80,0,17
16	87879392	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
16	87879486	.	G	A	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:97,0,34
16	87879522	.	G	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
16	87882209	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
16	87902684	.	G	T	1008.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=-2.010;DP=49;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.869	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,28:49:99:1037,0,708
16	88017809	.	C	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,190
16	88052161	.	C	A	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:630,48,0
16	88053863	.	A	T	90.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:118,12,0
16	88054446	.	A	G	35.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
16	88058751	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88105725	.	G	A	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:175,0,215
16	88109227	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	88110422	.	C	G	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:142,0,205
16	88226602	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88552370	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	88601481	.	C	T	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
16	88627727	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	88630804	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88644005	.	A	G	1142.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1171,84,0
16	88695332	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88695338	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88709712	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
16	88709737	.	C	T	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:425,33,0
16	88709828	.	A	G	353.22	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=29.44;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:4:380,0,4
16	88710833	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:81,0,29
16	88711466	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
16	88713236	.	A	G	1826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1855,132,0
16	88716394	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88717386	.	T	C	798.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:827,60,0
16	88718552	.	G	A	492.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-2.059;DP=45;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=10.95;ReadPosRankSum=2.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,15:45:99:521,0,1134
16	88718812	.	T	C	1070.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.472;DP=52;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,30:52:99:1099,0,755
16	88718865	.	C	T	978.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.409;DP=50;FS=4.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.608;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.311	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,27:50:99:1007,0,820
16	88721012	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:74,0,36
16	88722946	.	C	T	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
16	88723042	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:111,0,65
16	88723629	.	C	T	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:226,0,172
16	88724347	.	G	T	734.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.761;DP=45;FS=11.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.602	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,22:45:99:763,0,821
16	88725798	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	88726280	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:72,0,33
16	88726726	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
16	88727226	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
16	88727307	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	88728903	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	88739978	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	88741504	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	88743872	.	G	T	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
16	88744470	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
16	88744756	.	A	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:35:76,0,35
16	88744762	.	C	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:35:76,0,35
16	88763151	.	G	A	244.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-1.929;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.774	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:273,0,124
16	88763561	.	T	C	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
16	88766395	.	A	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
16	88767769	.	G	C	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:73:436,0,73
16	88768682	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
16	88769704	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	88770314	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:114,0,33
16	88770621	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	88772746	.	C	T	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:165,0,102
16	88779739	.	A	G	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:746,54,0
16	88780175	.	G	A	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=1.286;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:373,0,165
16	88781040	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.749;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:169,0,234
16	88781073	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,105
16	88781125	.	T	C	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
16	88781850	.	C	T	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=1.356;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.464	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:204,0,374
16	88783449	.	C	G	1314.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1343,93,0
16	88783521	.	T	C	1081.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:86:1110,86,0
16	88783738	.	A	G	852.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:881,60,0
16	88783903	.	A	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:50:50,0,319
16	88784334	.	A	G	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:180,0,301
16	88784964	.	A	G	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:598,42,0
16	88785072	.	G	C	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
16	88785126	.	A	G	543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:572,39,0
16	88785206	.	C	T	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=2.007;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:300,0,221
16	88785242	.	A	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:182,0,219
16	88785244	.	T	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:183,0,226
16	88787388	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	88787704	.	G	C	856.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:885,63,0
16	88792047	.	A	G	622.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:50:651,50,0
16	88794403	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	88797110	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:105,0,33
16	88799238	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	88799338	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
16	88799417	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
16	88800785	.	C	T	544.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.367;DP=24;FS=8.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.100	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:573,0,188
16	88800814	.	G	A	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-1.473;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.002	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:342,0,208
16	88800913	.	C	T	357.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.263;DP=22;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:386,0,411
16	88802573	.	G	A	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=19.31;ReadPosRankSum=2.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:453,0,364
16	88802748	.	C	T	348.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=1.755;DP=19;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=18.36;ReadPosRankSum=-1.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:377,0,340
16	88803124	.	T	C	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.264;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:139,0,470
16	88803195	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	88803557	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88803982	.	C	G	338.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.537;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:367,0,247
16	88804734	.	A	G	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:590,42,0
16	88808743	.	A	G	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
16	88820135	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	88820301	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
16	88830604	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	88830605	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	88872145	.	T	C	835.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:864,60,0
16	88872229	.	A	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.806;DP=26;FS=6.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,8:26:99:260,0,691
16	88872511	.	T	C	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:855,63,0
16	88874632	.	C	G	1070.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1099,81,0
16	88874778	.	C	T	644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:673,48,0
16	88875478	.	C	T	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
16	88876666	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
16	88877429	.	G	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
16	88880195	.	T	C	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
16	88880236	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88880480	.	A	G	153.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:182,15,0
16	88880811	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	88880965	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	88884466	.	C	T	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:348,27,0
16	88902183	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
16	88910824	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	88911061	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	88925112	.	A	G	32.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.187;DP=34;FS=2.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,4:34:61:61,0,1172
16	88925567	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88928290	.	A	G	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
16	88928417	.	C	T	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:480,36,0
16	88928996	.	C	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=1.517;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:100,0,200
16	88942318	.	C	T	116.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:145,0,26
16	88950472	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	88951594	.	C	T	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:176,0,212
16	88961887	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	89167094	.	T	C	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
16	89167140	.	G	C	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:431,33,0
16	89167395	.	C	T	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:339,24,0
16	89167404	.	T	C	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:24:339,24,0
16	89167431	.	G	C	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
16	89167443	.	T	C	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
16	89167458	.	C	A	417.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:446,33,0
16	89180883	.	G	A	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
16	89217173	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
16	89221179	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	89293271	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
16	89293614	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
16	89294184	.	G	A	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
16	89294381	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
16	89294439	.	G	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	89294511	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
16	89294697	.	C	T	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
16	89298567	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	89346175	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,93
16	89350038	.	G	A	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:463,39,0
16	89350178	.	G	A	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
16	89354347	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
16	89355278	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
16	89359421	.	C	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
16	89360965	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
16	89361613	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	89366932	.	G	A	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
16	89369295	.	A	G	124.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
16	89369869	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
16	89370677	.	C	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
16	89371407	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
16	89379936	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
16	89455306	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	89558705	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	89571815	.	C	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
16	89581771	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,108
16	89582379	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,224
16	89582444	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
16	89582684	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
16	89583578	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:109,0,68
16	89585400	.	A	T	39.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
16	89585627	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
16	89587287	.	T	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:74,0,72
16	89587438	.	C	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	89587579	.	C	T	236.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:265,0,19
16	89587871	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	89587968	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	89588004	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
16	89588488	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
16	89589408	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
16	89590243	.	G	A	211.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:240,0,25
16	89595509	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
16	89595516	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	89595723	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
16	89596106	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
16	89603586	.	A	G	210.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:239,0,24
16	89607679	.	G	A	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:227,0,147
16	89608235	.	A	G	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.635;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:271,0,189
16	89608342	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,260
16	89608702	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,147
16	89609241	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
16	89628073	.	G	A	2207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=-0.383;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,58:88:99:2236,0,1037
16	89630376	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:50:50,0,397
16	89710378	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
16	89711120	.	C	T	551.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-2.113;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=22.99;ReadPosRankSum=2.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:580,0,250
16	89713174	.	C	T	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
16	89724572	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	89727595	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	89736352	.	G	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
16	89753971	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
16	89754023	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:52:153,0,52
16	89754046	.	A	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:179,0,28
16	89754255	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	89755903	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
16	89756473	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	89756768	.	T	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
16	89760492	.	C	G	392.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=1.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=21.82;ReadPosRankSum=-1.177	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:421,0,238
16	89760552	.	T	C	687.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:716,51,0
16	89762647	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:78:78,0,472
16	89762921	.	T	C	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
16	89763045	.	C	T	541.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:570,42,0
16	89763263	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
16	89764549	.	G	A	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:184,0,153
16	89768056	.	C	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:117,0,136
16	89773676	.	T	C	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
16	89774411	.	T	C	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
16	89777761	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.141;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:236,0,443
16	89782768	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	89782989	.	A	G	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:690,51,0
16	89783187	.	C	T	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
16	89783663	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	89784521	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	89784992	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	89785010	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
16	89785820	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:107,0,30
16	89786855	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	89787040	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
16	89789311	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
16	89789506	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
16	89796569	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:120,0,72
16	89796756	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
16	89797337	.	C	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
16	89798516	.	G	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
16	89799079	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
16	89800135	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
16	89800163	.	C	T	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=21.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:55:182,0,55
16	89805261	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:118,0,72
16	89807114	.	G	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:158,0,28
16	89836507	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
16	89838185	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.311;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:75:75,0,429
16	89875710	.	A	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:116,0,74
16	89883007	.	A	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:97,0,101
16	89884917	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,69
16	89929537	.	G	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:69:69,0,301
16	89929545	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,301
16	89937645	.	G	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:108,0,34
16	89952344	.	C	T	530.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-1.246;DP=32;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=16.59;ReadPosRankSum=2.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,15:32:99:559,0,612
16	89960124	.	C	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:113,0,69
16	89977745	.	C	T	342.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.599;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.458	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:371,0,372
16	89979562	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
16	89979959	.	G	A	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:41:41,0,433
16	89979988	.	G	C	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=26.58;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:52:294,0,52
16	89980316	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,115
16	89980482	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:111,0,95
16	89982272	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:96:96,0,281
16	89983221	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:61:61,0,154
16	89984370	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,307
16	89984604	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:100,0,263
16	89984739	.	A	G	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.847	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:260,0,331
16	89985177	.	C	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:158,0,133
16	89985222	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=1.929;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,333
16	89986144	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:107,0,57
16	89998794	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
16	90000925	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
16	90002290	.	T	C	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-1.124;DP=50;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,11:50:99:326,0,1472
16	90015960	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:60:187,0,60
16	90029417	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
16	90032862	.	G	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
16	90037246	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
16	90037828	.	G	A	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:298,0,209
16	90051461	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:69,0,33
16	90053254	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,147
16	90054998	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
16	90055018	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
16	90061266	.	G	A	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=28.71;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:49:344,0,49
16	90062479	.	G	A	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:155,0,151
16	90066936	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	90102835	.	A	G	168.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:197,0,22
16	90107097	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
16	90109711	.	A	G	202.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:231,18,0
16	90110950	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:60:60,0,150
16	90233610	.	G	A	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
16	90234090	.	C	T	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:56:368,0,56
16	90234966	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:78,0,65
16	90234979	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.38	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:65:65,0,65
17	62484	.	T	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
17	62526	.	T	C	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
17	63098	.	A	G	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
17	63117	.	T	C	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
17	63683	.	G	A	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
17	80772	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	81242	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	82935	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	83597	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	430379	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	434249	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	906268	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	907315	.	C	T	807.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:836,60,0
17	908229	.	G	A	894.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:923,63,0
17	908529	.	A	G	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
17	909867	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	1359363	.	T	G	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:926,66,0
17	1368823	.	G	A	1445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1474,105,0
17	1371473	.	C	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
17	1373518	.	T	C	1736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1765,126,0
17	1373612	.	C	T	1822.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1851,135,0
17	1377943	.	A	G	1792.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1821,129,0
17	1384066	.	A	G	1422.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1451,111,0
17	1398270	.	G	A	373.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:402,30,0
17	1419853	.	C	A	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
17	1478460	.	G	A	302.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:331,24,0
17	1478712	.	G	T	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
17	1489314	.	G	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,107
17	1522044	.	A	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:18:255,18,0
17	1522048	.	G	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
17	1609787	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	1609788	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	1611433	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	1616093	.	G	A	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
17	1630208	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	1630395	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	1630584	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
17	1636934	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	1637074	.	A	G	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
17	1637302	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
17	1639458	.	A	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
17	1641276	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
17	1703543	.	G	C	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
17	1731268	.	T	C	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
17	1733092	.	T	A	98.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:126,12,0
17	1733139	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	1733399	.	A	G	1361.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1390,99,0
17	1795180	.	T	C	1061.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1090,75,0
17	1800600	.	C	T	1466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1495,111,0
17	1800849	.	C	G	904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:933,69,0
17	1800886	.	G	A	1203.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1232,87,0
17	1800932	.	T	C	705.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:734,51,0
17	1800949	.	C	G	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:792,54,0
17	1801263	.	T	C	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
17	1839272	.	A	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
17	1839674	.	G	C	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:607,45,0
17	1840468	.	C	T	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
17	1873543	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	1873549	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	1941152	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	1941768	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	1942430	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
17	1943880	.	C	G	1272.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:87:1301,87,0
17	1943888	.	T	C	1272.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:87:1301,87,0
17	1945225	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	1945746	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	1963961	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
17	1964018	.	G	A	236.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:265,21,0
17	1964397	.	A	T	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
17	2091765	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
17	2097483	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	2186100	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
17	2203348	.	T	C	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
17	2277668	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	2278392	.	G	C	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
17	2278609	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	2278644	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
17	2280934	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	2284005	.	A	G	1034.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1063,75,0
17	2291863	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	2293420	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	2320070	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
17	2320651	.	T	C	286.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:315,24,0
17	2321253	.	A	G	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
17	2322598	.	C	T	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
17	2322776	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
17	2323449	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:57:235,0,57
17	2324048	.	C	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,220
17	2580265	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	2584111	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	2586229	.	A	G	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:695,48,0
17	2586671	.	G	C	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-2.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.928	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:370,0,382
17	2593600	.	C	G	1160.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1189,90,0
17	2595495	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	2595964	.	G	A	1410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1439,99,0
17	2599134	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	2600186	.	G	A	1457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=-1.405;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=33.51;ReadPosRankSum=1.340	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,36:38:94:1486,94,0
17	2929392	.	G	A	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
17	2929674	.	T	C	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
17	2930339	.	G	A	373.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:402,27,0
17	2931933	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	2940583	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
17	2940720	.	C	A	196.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:225,18,0
17	2940759	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	3469766	.	T	C	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
17	3469853	.	A	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
17	3472181	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	3481342	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	3493200	.	C	G	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
17	3514028	.	G	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
17	3540042	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
17	3555986	.	T	C	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
17	3557594	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	3559823	.	G	A	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
17	3561396	.	C	T	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
17	3561842	.	C	T	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
17	3561956	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	3564068	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	3564073	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	3564084	.	T	C	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
17	3564218	.	T	C	236.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:265,21,0
17	3564235	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
17	3564290	.	T	C	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
17	3564294	.	T	C	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:39:568,39,0
17	3564378	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
17	3564401	.	T	G	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
17	3564687	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	3564688	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	3564779	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	3565103	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	3566209	.	G	C	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:394,27,0
17	3566213	.	G	A	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
17	3566642	.	A	G	2118.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2147,157,0
17	3604035	.	A	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
17	3626816	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	3707723	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	3712344	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	3718933	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	3726827	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	3775916	.	T	C	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
17	3779277	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	3781054	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	3796257	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	3827502	.	T	G	1402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1431,99,0
17	3828091	.	G	A	1649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1678,117,0
17	3830151	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:83,6,0
17	3830155	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	3835849	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	3844787	.	C	G	1583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1612,117,0
17	3845656	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	3845927	.	A	G	1880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1909,132,0
17	3846802	.	A	G	1812.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1841,129,0
17	3848013	.	A	C	1661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1690,120,0
17	3855988	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	3857498	.	C	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
17	3859936	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
17	3860464	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
17	3861050	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	3866476	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	3867571	.	A	G	1079.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1108,84,0
17	3867938	.	T	C	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
17	4046101	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
17	4046270	.	T	C	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
17	4060482	.	G	T	149.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:17:178,17,0
17	4067900	.	T	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:510,39,0
17	4069171	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
17	4070015	.	A	G	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
17	4088291	.	C	T	651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:680,48,0
17	4172943	.	C	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
17	4179295	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4180874	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4358460	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4358461	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4358466	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4383964	.	G	A	232.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:261,21,0
17	4384298	.	G	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
17	4384787	.	G	A	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
17	4385099	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	4385503	.	C	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
17	4385616	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
17	4398786	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	4398815	.	G	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	4430021	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	4440907	.	A	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
17	4441885	.	C	G	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
17	4442640	.	A	T	109.22	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:4:136,0,4
17	4445559	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	4455500	.	T	C	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
17	4463023	.	G	A	188.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
17	4497160	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	4559545	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4575283	.	A	G	1147.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1176,84,0
17	4579638	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4580137	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	4615089	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	4615098	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	4621773	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	4622638	.	C	T	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:721,51,0
17	4636664	.	T	C	693.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:722,51,0
17	4637016	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	4637396	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	4638484	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
17	4638563	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	4638737	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	4641755	.	C	T	146.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
17	4642787	.	C	A	159.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:188,15,0
17	4690038	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	4693170	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	4693508	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	4699552	.	G	A	1377.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1406,108,0
17	4710486	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	4718776	.	G	A	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
17	4720469	.	C	T	534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:563,39,0
17	4744388	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	4785847	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	4799546	.	A	T	589.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=34.68;ReadPosRankSum=-0.714	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,16:17:7:617,7,0
17	4801286	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	4801288	.	A	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	4833478	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	4838802	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	4839149	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
17	4848450	.	A	G	528.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:557,39,0
17	4849635	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	4849774	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
17	4851072	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	4851860	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:57:57,0,125
17	4854480	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	4856580	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
17	4875566	.	T	C	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
17	4883818	.	C	G	351.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:380,30,0
17	4893357	.	G	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
17	4926882	.	A	G	1325.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1354,96,0
17	4928349	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,186
17	4928368	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,107
17	4928835	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,158
17	4929640	.	C	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
17	4929954	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,112
17	4930421	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,120
17	4930635	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	4930721	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	4930987	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
17	4931018	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
17	4931019	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,82
17	4996970	.	C	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	4997787	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	4997926	.	C	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
17	4998030	.	G	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	4999207	.	G	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
17	5017493	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	5085156	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
17	5095388	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	5126768	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
17	5185664	.	T	C	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
17	5243828	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	5246669	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	5264916	.	C	T	980.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1009,72,0
17	5287946	.	C	G	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
17	5326162	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	5327401	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	5327450	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	5390998	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	5391206	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	5391690	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:112,0,33
17	5392173	.	A	C	649.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:678,48,0
17	5393524	.	A	G	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
17	6353679	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	6355419	.	G	A	380.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:409,30,0
17	6364753	.	A	G	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
17	6481776	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	6481933	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
17	6482668	.	G	C	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
17	6483046	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	6485682	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	6486641	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	6493198	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	6495780	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
17	6511781	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
17	6515387	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	6515454	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	6531648	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
17	6538984	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	6544248	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	6544275	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
17	6546457	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	6546921	.	C	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	6547004	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	6547653	.	G	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
17	6547766	.	G	C	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
17	6548168	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	6549653	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	6551620	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	6899221	.	G	A	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
17	6899731	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	6902179	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	6903266	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	6917703	.	C	T	1803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1832,132,0
17	6917798	.	T	C	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:690,48,0
17	6942108	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	6943266	.	G	A	217.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:246,21,0
17	6943959	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	7124506	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
17	7129840	.	T	C	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:870,66,0
17	7132556	.	C	T	774.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:803,57,0
17	7133162	.	G	A	949.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:978,72,0
17	7154534	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	7155056	.	T	C	279.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.00;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:12:307,0,12
17	7162451	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	7163739	.	A	G	1995.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2024,144,0
17	7164563	.	C	T	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
17	7192091	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	7213560	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	7213694	.	C	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	7213892	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
17	7215449	.	A	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=23.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=10.68;ReadPosRankSum=-2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:135,0,326
17	7215450	.	A	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=23.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=10.68;ReadPosRankSum=-2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:135,0,326
17	7215536	.	T	C	1163.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1192,81,0
17	7219230	.	A	G	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
17	7221544	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=-2.620;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=3.37	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:72:72,0,1301
17	7221707	.	G	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	7226957	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
17	7254602	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	7257876	.	T	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:80:80,0,120
17	7257878	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:80:80,0,120
17	7286326	.	T	A	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
17	7292685	.	A	G	560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:589,42,0
17	7293148	.	G	A	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:41:41,0,432
17	7293715	.	C	T	645.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:674,48,0
17	7297452	.	A	G	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
17	7318396	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	7318935	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	7321858	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	7340283	.	G	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,67
17	7371932	.	C	T	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
17	7387352	.	G	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
17	7400137	.	T	C	896.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:925,66,0
17	7400815	.	T	C	983.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1012,75,0
17	7404107	.	T	C	1239.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1268,90,0
17	7404991	.	T	C	1244.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1273,90,0
17	7412212	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	7416683	.	A	G	1434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1463,102,0
17	7417086	.	G	A	1484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-1.733;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=33.98;ReadPosRankSum=1.641	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,37:38:76:1513,76,0
17	7417551	.	T	C	889.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:918,66,0
17	7417663	.	C	T	1099.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1128,78,0
17	7462969	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	7474539	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	7477938	.	G	C	1986.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2015,138,0
17	7479217	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	7577085	.	C	T	1212.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1241,87,0
17	7579472	.	G	C	1287.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1316,99,0
17	7754993	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
17	7757596	.	C	T	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
17	7764597	.	A	G	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
17	7805684	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:76,0,28
17	7835690	.	C	T	103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:132,0,322
17	7942434	.	A	G	1130.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1159,87,0
17	7942901	.	C	G	1225.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1254,93,0
17	7947113	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	7951410	.	G	T	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:201,0,185
17	7961115	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	7962160	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	7963356	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	7965108	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	7965180	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	7965613	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	7968360	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
17	7968368	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	7969262	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
17	7970759	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8002922	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8002928	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8046772	.	C	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
17	8062583	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	8064083	.	T	G	641.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:670,48,0
17	8076802	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	8078765	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	8092694	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	8101224	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8108331	.	A	G	1399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:99:1428,99,0
17	8108339	.	G	A	1399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:99:1428,99,0
17	8135061	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
17	8198419	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	8257795	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
17	8265776	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	8276636	.	A	G	50.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:78,9,0
17	8279324	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	8280162	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	8281645	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
17	8282211	.	A	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
17	8284344	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	8285398	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	8286136	.	T	A	711.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-1.214;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=32.04;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:25:740,25,0
17	8339307	.	G	A	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
17	8363624	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	8365302	.	C	T	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
17	8366129	.	T	C	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
17	8366232	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8368590	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	8369760	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	8371021	.	C	T	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
17	8378265	.	T	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
17	8378693	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8378694	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	8383199	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	8424270	.	G	A	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
17	9064163	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	9132400	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	9132402	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	9143911	.	C	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:110,0,31
17	9144330	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:153,0,30
17	9144885	.	C	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:77,0,69
17	9145392	.	C	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	9145686	.	C	G	404.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=31.14;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:43:433,0,43
17	9145836	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	9145968	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
17	9146018	.	T	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
17	9146651	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:120,0,70
17	9153174	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	9153861	.	G	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
17	9384793	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	9395231	.	G	A	979.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1008,72,0
17	9471711	.	T	G	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:493,36,0
17	10541741	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	10576264	.	T	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	10576547	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
17	10578034	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	10578441	.	A	G	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
17	10578792	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	10578976	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	10579404	.	T	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	10581894	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	10581938	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	10582000	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
17	10583589	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	10583714	.	G	C	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
17	10584116	.	C	T	933.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:962,72,0
17	10698734	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	10698754	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	11898686	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	12894200	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	12895815	.	C	T	1020.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1049,72,0
17	12895855	.	A	T	966.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:995,69,0
17	12895929	.	G	A	1334.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1363,96,0
17	12895984	.	G	C	1072.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1101,78,0
17	12913490	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	13684348	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	13980350	.	G	A	383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:412,30,0
17	14095550	.	G	A	80.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
17	14110438	.	T	A	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:144,0,28
17	14132544	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	15133657	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	15421624	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	15532147	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	15554561	.	C	A	1135.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1164,84,0
17	15559995	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	15586889	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	15611495	.	T	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
17	15881151	.	C	G	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:506,36,0
17	15903602	.	C	A	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
17	15924370	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	15927223	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	15945946	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	16252856	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	16253229	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:43:74,0,43
17	16254662	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	16286762	.	C	T	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
17	16286908	.	C	T	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
17	16342833	.	T	C	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
17	16344600	.	T	C	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
17	16346484	.	T	C	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
17	16346757	.	A	C	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
17	16347325	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	16359955	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	16365329	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	16391456	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	16392840	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	16397082	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	16945791	.	G	C	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
17	17045733	.	G	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	17046024	.	C	A	1402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1431,102,0
17	17062241	.	C	G	685.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.867;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=34.29;ReadPosRankSum=-1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:50:714,50,0
17	17069105	.	G	A	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
17	17084648	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
17	17087880	.	T	G	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
17	17090267	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
17	17092263	.	C	T	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
17	17094539	.	T	G	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
17	17095487	.	G	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
17	17104714	.	C	T	211.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:18:240,0,18
17	17105256	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	17105615	.	G	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	17105682	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
17	17115566	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	17116412	.	A	G	544.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:573,42,0
17	17127471	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	17131869	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	17132202	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	17132333	.	C	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
17	17132618	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	17133121	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	17134528	.	T	G	103.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:8:131,8,0
17	17135008	.	G	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
17	17140297	.	G	A	237.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:266,24,0
17	17168164	.	G	A	923.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:952,66,0
17	17179481	.	G	A	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
17	17286858	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
17	17396464	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	17421572	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	17696531	.	G	C	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
17	17696755	.	C	A	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:426,33,0
17	17709372	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	17715101	.	G	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
17	17752809	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	17763157	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:67,0,37
17	17812306	.	T	C	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
17	17971553	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	18003648	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	18011140	.	C	T	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
17	18088094	.	C	T	891.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:920,66,0
17	18111793	.	C	T	725.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:754,54,0
17	18111868	.	G	A	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:695,48,0
17	18112130	.	C	T	949.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.289;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:62:978,62,0
17	18112675	.	C	T	848.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:877,63,0
17	18112845	.	G	A	668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:697,48,0
17	18148485	.	G	A	1284.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1313,93,0
17	18167505	.	T	C	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
17	18173655	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	18176134	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,204
17	18176423	.	C	T	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
17	18177715	.	G	A	340.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:369,30,0
17	18208334	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	18218804	.	T	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
17	18219835	.	T	C	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=29.48;ReadPosRankSum=1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,13:14:32:548,32,0
17	18220770	.	G	A	264.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:293,24,0
17	18221010	.	A	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
17	18225228	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	18226699	.	G	A	596.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:625,45,0
17	18227101	.	G	A	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
17	18227272	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
17	18230380	.	T	G	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
17	18554918	.	G	A	882.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:911,63,0
17	18554954	.	A	G	1100.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1129,78,0
17	18702220	.	T	C	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
17	19199379	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	19225424	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	19232078	.	T	C	613.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:642,45,0
17	19234475	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
17	19235832	.	C	T	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
17	19355688	.	A	C	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
17	19559095	.	C	T	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
17	19559623	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	19580494	.	A	G	1027.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1056,72,0
17	19675104	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	19677749	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
17	19678475	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	19713740	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	19729495	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
17	19771220	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	19808445	.	T	C	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
17	19812541	.	T	C	577.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:606,42,0
17	19861458	.	C	T	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
17	20691261	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	20902959	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	20903776	.	T	C	1668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1697,117,0
17	20904231	.	T	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
17	20904451	.	A	G	1272.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1301,90,0
17	20904669	.	A	G	1082.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1111,78,0
17	20905084	.	C	A	1545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1574,111,0
17	20906257	.	A	G	863.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.901;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=34.55;ReadPosRankSum=1.595	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:65:892,65,0
17	20909210	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	20909288	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	20911204	.	G	T	1723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1752,120,0
17	20916590	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	20917818	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	20922702	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	20924523	.	G	A	1309.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1338,93,0
17	21087963	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	22018669	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	22020733	.	G	A	2253.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2282,154,0
17	22020741	.	T	C	2253.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:2282,154,0
17	22020752	.	T	C	956.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:985,66,0
17	22020755	.	G	C	956.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:66:985,66,0
17	22026493	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	22026494	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	22026497	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	26206414	.	C	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:117,0,32
17	26519204	.	C	T	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:271,0,139
17	26653988	.	C	T	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.367;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.449	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:331,0,323
17	26654532	.	C	T	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=1.525;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:345,0,565
17	26670627	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,78
17	26676135	.	C	T	983.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.809;DP=40;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=24.59;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,27:40:99:1012,0,434
17	26684394	.	T	G	2039.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2068,144,0
17	26684449	.	G	C	1045.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1074,78,0
17	26688663	.	G	A	615.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.075;DP=27;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.234;QD=22.81;ReadPosRankSum=-0.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:644,0,328
17	26689641	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	26721791	.	C	A	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
17	26721895	.	G	A	126.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:155,0,27
17	26722728	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	26723613	.	G	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,188
17	26723666	.	A	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,140
17	26723733	.	A	G	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
17	26725265	.	G	A	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:263,0,99
17	26725744	.	T	C	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:91:236,0,91
17	26726670	.	G	A	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:48:48,0,313
17	26874314	.	G	A	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.179;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:310,0,567
17	26934191	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:70,0,69
17	26935511	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:152,0,29
17	26955421	.	C	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-2.102;DP=40;FS=6.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=2.82;ReadPosRankSum=2.746	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,6:40:99:141,0,1360
17	26992367	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	27000391	.	A	G	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
17	27064863	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:54:54,0,101
17	27074489	.	G	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
17	27074565	.	G	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
17	27076232	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.520;DP=20;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:115,0,616
17	27086601	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:100,0,182
17	27185827	.	C	T	1802.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1831,126,0
17	27187636	.	G	T	1638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1667,117,0
17	27187789	.	C	T	1563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1592,111,0
17	27206528	.	C	T	675.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.100;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.367	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,18:24:99:704,0,186
17	27207453	.	G	A	1466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1495,105,0
17	27208326	.	C	T	917.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-1.665;DP=41;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,26:41:99:946,0,513
17	27221147	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	27222988	.	G	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	27401511	.	A	G	359.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.776;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:388,0,157
17	27434115	.	C	A	292.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:15:321,0,15
17	27438469	.	G	A	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.965	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:252,0,162
17	27441077	.	C	G	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:175,0,132
17	27444030	.	T	C	205.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:234,0,24
17	27455736	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	27455746	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	27585310	.	G	C	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,7:20:99:233,0,504
17	27835138	.	C	T	586.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.671;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=34.52;ReadPosRankSum=1.565	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,15:17:31:615,0,31
17	27872122	.	G	A	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:129,0,361
17	27876294	.	G	T	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-1.620;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:162,0,539
17	27895528	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:119,0,69
17	27935546	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	27941511	.	C	T	135.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.381;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.381	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:164,0,302
17	27955416	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,185
17	27955540	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	27955761	.	G	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
17	27957545	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:116,0,31
17	27959903	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
17	28576076	.	T	C	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-1.395;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:250,0,462
17	28612448	.	G	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=1.273;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.395	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:117,0,488
17	28750667	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-1.120;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:103,0,617
17	28793317	.	T	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.239;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=23.15;ReadPosRankSum=-1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:306,0,139
17	28794020	.	A	G	403.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=1.501;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.024;QD=26.92;ReadPosRankSum=-1.763	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:432,0,132
17	28852288	.	G	T	265.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:294,0,344
17	28852710	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,153
17	28885015	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	29096936	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,318
17	29120023	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,75
17	29121104	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,114
17	29220954	.	G	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,152
17	29422861	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	29483108	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,180
17	29508775	.	G	A	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:685,48,0
17	29704002	.	T	C	613.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:642,45,0
17	29707884	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	29812580	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	29859016	.	G	A	824.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.337;DP=30;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=27.49;ReadPosRankSum=1.477	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,22:30:99:853,0,246
17	29859506	.	G	T	887.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.642;DP=26;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=34.14;ReadPosRankSum=-0.963	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,23:26:58:916,0,58
17	29860652	.	C	A	145.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:174,0,22
17	29861523	.	C	T	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:59:307,0,59
17	29863370	.	G	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:61:194,0,61
17	29863723	.	C	A	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:283,0,137
17	29863879	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:97:267,0,97
17	29864006	.	A	G	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:97:233,0,97
17	29886356	.	C	G	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
17	30183857	.	T	C	471.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:500,36,0
17	30190083	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	30206393	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	30206426	.	T	C	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
17	30325305	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	30326471	.	G	A	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,432
17	30549791	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	30689370	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	30689814	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	30696292	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	30700674	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
17	30705346	.	G	C	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:86:86,0,265
17	30707655	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
17	30808930	.	G	C	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=-0.876;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.832;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.770	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:251,0,736
17	30809455	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	30814340	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	30820176	.	T	C	921.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:950,66,0
17	30820194	.	C	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-0.417;DP=19;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.880	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:151,0,542
17	30820431	.	A	T	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=-0.313;DP=22;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.097	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:133,0,651
17	30820506	.	T	G	1076.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1105,78,0
17	30821302	.	C	A	466.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.396;DP=17;FS=10.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,13:17:99:495,0,122
17	30821384	.	T	C	748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:777,57,0
17	31065388	.	G	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.745;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:210,0,513
17	31204005	.	G	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:55:131,0,55
17	31204172	.	A	G	255.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:284,21,0
17	31258657	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	32366889	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	33269648	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
17	33288882	.	T	G	620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:649,45,0
17	33289937	.	A	T	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:142,0,113
17	33307586	.	G	A	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:233,0,173
17	33331575	.	C	T	372.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.340;DP=16;FS=9.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:401,0,123
17	33332629	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:115,0,72
17	33464864	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=1.422;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:72:72,0,574
17	33469279	.	G	C	281.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:310,24,0
17	33478128	.	T	G	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:790,66,0
17	33478140	.	A	G	1380.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1409,116,0
17	33478187	.	A	G	2606.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2635,181,0
17	33478216	.	T	C	1819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1848,129,0
17	33478229	.	A	T	1599.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1628,114,0
17	33478303	.	A	C	2683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2712,190,0
17	33478323	.	T	C	3156.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.549;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=29.06;ReadPosRankSum=1.690	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,81:82:99:3185,208,0
17	33478344	.	T	G	2334.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2363,166,0
17	33478356	.	A	G	2334.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:99:2363,166,0
17	33569114	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
17	33570441	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	33591987	.	T	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	33592591	.	C	T	681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:710,48,0
17	33593379	.	C	G	723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:51:752,51,0
17	33593387	.	T	G	723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:51:752,51,0
17	33594320	.	A	C	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
17	33594891	.	G	A	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:327,27,0
17	33594958	.	A	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:135,0,323
17	33595842	.	T	G	565.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:594,42,0
17	33596157	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	33596183	.	C	T	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
17	33596897	.	G	A	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:690,48,0
17	33597682	.	C	T	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
17	33700162	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	33701490	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	33896273	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
17	33905468	.	A	G	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
17	33998802	.	G	C	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
17	34034059	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	34153383	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:77:77,0,112
17	34154219	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:76,0,29
17	34157655	.	A	G	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
17	34158726	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
17	34159657	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,186
17	34159889	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,281
17	34160178	.	G	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:54:54,0,245
17	34160764	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,265
17	34233871	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
17	34240599	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
17	34252537	.	A	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,114
17	34257050	.	C	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
17	34842521	.	A	G	119.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:148,0,27
17	34853966	.	G	T	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:330,27,0
17	34854280	.	G	A	519.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.160;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,15:36:99:548,0,807
17	34860087	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
17	34866915	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,162
17	34867037	.	C	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:192,0,190
17	34867929	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	34869150	.	C	A	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
17	34869155	.	G	A	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-2.113;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=5.06;ReadPosRankSum=2.282	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:94:94,0,376
17	34870708	.	A	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
17	34886130	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	34886848	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
17	34887212	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:75,0,35
17	34888733	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	34900836	.	G	C	159.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=-1.129;DP=21;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:188,0,587
17	34900847	.	A	C	295.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:324,0,223
17	34931726	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,72
17	34931766	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	34942595	.	G	A	517.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-1.480;DP=35;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.315	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,18:35:99:642,0,599
17	34942750	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	34944593	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,241
17	34949361	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:104,0,185
17	34949598	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:80,0,28
17	34950239	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	34950837	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
17	34953993	.	G	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,112
17	34959459	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	34959861	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	34986690	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	35306312	.	G	C	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:997,69,0
17	35311514	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	35478362	.	T	C	2165.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2194,153,0
17	35609866	.	C	T	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=-3.189;DP=49;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=4.65;ReadPosRankSum=2.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,9:49:99:256,0,1587
17	35696804	.	G	A	1727.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1756,123,0
17	35725997	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	35758055	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	35766026	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	35771468	.	C	T	1246.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1275,90,0
17	35821758	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
17	35821931	.	G	C	76.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
17	35822206	.	C	G	44.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.883;DP=32;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:73:73,0,1063
17	35837752	.	A	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:53:53,0,358
17	35838015	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-1.096;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.096	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:187,0,461
17	35839021	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:60,0,37
17	35839066	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:116,0,63
17	35870833	.	G	A	1821.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.736;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.513	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,47:56:99:1850,0,205
17	35874936	.	A	G	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
17	35874989	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	35877106	.	T	C	412.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.890;DP=18;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=22.93;ReadPosRankSum=1.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:441,0,206
17	35877145	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,179
17	35877155	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:99:108,0,179
17	35877278	.	T	C	23.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:52:52,0,394
17	35877662	.	T	A	1258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-2.466;DP=37;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=34.02;ReadPosRankSum=2.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,32:37:98:1287,0,98
17	35878893	.	G	A	1887.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=-1.161;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=33.30;ReadPosRankSum=1.212	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,46:48:70:1916,70,0
17	35881902	.	G	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,79
17	35885092	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	35902225	.	C	G	824.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=-0.786;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=34.37;ReadPosRankSum=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,21:24:49:853,0,49
17	35970749	.	C	T	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:96:96,0,272
17	35971590	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:28:39,0,28
17	35971923	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:102,0,322
17	35971949	.	T	C	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:100,0,321
17	35972372	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:122,0,466
17	35972394	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,315
17	35972411	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,222
17	35982314	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	35984410	.	T	C	1529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1558,108,0
17	35988672	.	C	T	1859.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1888,129,0
17	36349241	.	A	G	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:736,51,0
17	36350511	.	T	C	948.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:66:977,66,0
17	36350517	.	T	A	948.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:66:977,66,0
17	36351254	.	C	T	907.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=-0.164;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.543;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,24:28:90:936,0,90
17	36354446	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	36476883	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,160
17	36514648	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	36552190	.	A	G	966.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.225;DP=31;FS=6.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=31.19;ReadPosRankSum=1.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,25:31:99:995,0,165
17	36552456	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	36557538	.	C	T	1407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1436,102,0
17	36558137	.	G	A	1496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1525,108,0
17	36558251	.	C	T	799.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:53:828,53,0
17	36558609	.	A	G	1182.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1211,90,0
17	36690831	.	C	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
17	36691097	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,221
17	36691245	.	T	C	163.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:192,0,17
17	36691636	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:73,0,72
17	36691645	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	36691654	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:177,12,0
17	36691715	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
17	36693679	.	T	G	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
17	36698586	.	G	A	675.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=-0.778;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=27.03;ReadPosRankSum=0.704	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,21:25:99:704,0,103
17	36699322	.	A	G	452.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:481,33,0
17	36700347	.	C	T	429.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:35:458,0,35
17	36700376	.	C	G	380.22	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.290;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=31.69;ReadPosRankSum=0.579	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:4:407,0,4
17	36700865	.	C	G	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
17	36701784	.	A	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
17	36702761	.	C	A	776.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.817;DP=27;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=28.77;ReadPosRankSum=0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,22:26:88:805,0,88
17	36704829	.	G	A	1425.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-1.130;DP=40;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=35.13;ReadPosRankSum=0.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,37:40:13:1454,0,13
17	36706177	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	36708648	.	A	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
17	36710513	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:158,0,70
17	36714003	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	36721604	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	36726167	.	A	G	166.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:195,0,23
17	36727411	.	C	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
17	36728059	.	C	G	385.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:414,30,0
17	36729831	.	G	C	261.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:7:289,0,7
17	36730373	.	C	T	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
17	36741092	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	36743015	.	T	C	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
17	36743771	.	T	A	129.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:158,0,25
17	36744673	.	A	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
17	36745605	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
17	36746077	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:76,0,34
17	36746920	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	36748686	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	36753832	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	36830459	.	G	A	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:83:288,0,83
17	36830727	.	G	A	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
17	36831078	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,111
17	36861983	.	T	C	1981.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2010,141,0
17	36863875	.	A	G	428.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.187;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=30.57;ReadPosRankSum=1.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:12:456,0,12
17	36864995	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:158,0,70
17	36873149	.	C	T	1593.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-0.225;DP=44;FS=9.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=32.05;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,40:44:46:1622,0,46
17	36875315	.	G	A	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-2.270;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,410
17	36879668	.	T	C	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:121,0,28
17	36881472	.	C	T	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:86:313,0,86
17	36882021	.	G	C	2060.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.609;DP=57;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=32.37;ReadPosRankSum=1.640	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,53:57:1:2086,0,1
17	36882595	.	T	A	1358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.519;DP=46;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,36:46:99:1387,0,282
17	36883953	.	C	T	326.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=32.62;ReadPosRankSum=1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:10:354,0,10
17	36887875	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	36887970	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	36889559	.	C	T	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.452;DP=91;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.038	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:79,12:91:99:256,0,3202
17	36890949	.	T	C	1482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-1.488;DP=45;FS=13.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=32.95;ReadPosRankSum=1.769	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,38:45:99:1511,0,167
17	36891019	.	G	A	2138.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2167,151,0
17	36893652	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:157,0,65
17	36894105	.	C	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,264
17	36894839	.	G	A	2901.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.583;DP=79;FS=6.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=32.94;ReadPosRankSum=0.547	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,73:79:12:2929,0,12
17	36895206	.	A	G	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
17	36897107	.	A	G	353.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.09;ReadPosRankSum=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:12:381,0,12
17	36899713	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,277
17	36900437	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	36900882	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,159
17	36903382	.	C	T	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=26.98;ReadPosRankSum=0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:41:352,0,41
17	36907407	.	C	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,186
17	36909499	.	A	T	175.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=-2.979;DP=96;FS=7.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=1.83;ReadPosRankSum=2.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:85,11:96:99:204,0,3475
17	36913703	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,250
17	36914092	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,105
17	36914877	.	C	T	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
17	36915630	.	A	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
17	36916433	.	C	G	190.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:219,18,0
17	36918350	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	36918551	.	G	T	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=23.40;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:192,0,66
17	36919332	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
17	36919659	.	C	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
17	36920050	.	C	T	341.74	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=34.17;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:6:369,0,6
17	36922510	.	G	A	2005.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.057;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.029	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,51:56:59:2034,0,59
17	36922839	.	C	G	1855.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-1.629;DP=56;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=33.14;ReadPosRankSum=1.497	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,50:56:95:1884,0,95
17	36925388	.	C	T	2027.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-1.098;DP=58;FS=9.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=34.96;ReadPosRankSum=1.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,51:58:99:2056,0,131
17	36925483	.	C	T	1871.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-1.502;DP=53;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,47:53:96:1900,0,96
17	36925750	.	G	A	45.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.259;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.458	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,5:41:74:74,0,1433
17	36926731	.	T	G	2115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=-0.227;DP=71;FS=5.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.145	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,55:71:99:2144,0,502
17	36926767	.	G	A	2391.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=1.434;DP=69;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=34.66;ReadPosRankSum=0.864	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,60:69:99:2420,0,178
17	36932915	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	36933372	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
17	36933414	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,77
17	36937185	.	A	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	36938080	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	36942396	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	36945256	.	T	C	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
17	36948564	.	T	C	43.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:72,0,23
17	36950673	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	36954001	.	T	C	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
17	37005493	.	T	C	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:610,45,0
17	37005839	.	T	C	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.656;DP=27;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=0.38;ReadPosRankSum=-0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:38:38,0,954
17	37007003	.	A	T	397.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,10:11:23:426,23,0
17	37007119	.	T	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
17	37026387	.	C	T	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.418;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=0.39;ReadPosRankSum=-0.418	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,5:54:49:49,0,1843
17	37050083	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	37052131	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
17	37053165	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37053992	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37054458	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	37054884	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	37055815	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
17	37060134	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	37060601	.	T	G	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
17	37061038	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	37063471	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	37064348	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	37064942	.	C	T	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
17	37065008	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	37065515	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:116,0,32
17	37066450	.	A	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
17	37066824	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	37067839	.	G	A	208.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:237,0,25
17	37068460	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
17	37068491	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
17	37068935	.	G	T	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
17	37069394	.	A	G	135.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.66;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:14:164,0,14
17	37070658	.	A	G	2767.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.406;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=29.44;ReadPosRankSum=-1.112	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,72:94:99:2796,0,652
17	37070737	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	37070988	.	A	T	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:571,39,0
17	37070994	.	A	G	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:571,39,0
17	37071189	.	C	T	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
17	37071995	.	T	C	827.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:856,60,0
17	37073182	.	G	A	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
17	37073532	.	G	A	252.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.60;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:281,0,18
17	37075506	.	G	A	2793.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-1.981;DP=74;FS=1.922;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.981	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,69:74:18:2822,18,0
17	37076331	.	G	A	2105.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-1.130;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=35.01;ReadPosRankSum=1.167	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,52:55:40:2134,40,0
17	37078880	.	C	T	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
17	37079255	.	T	G	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
17	37080317	.	G	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	37082081	.	A	C	644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:673,48,0
17	37083464	.	G	A	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
17	37213307	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	37219800	.	G	A	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:81,0,25
17	37219801	.	T	G	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:25:81,0,25
17	37226399	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	37228765	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
17	37236697	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	37245462	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
17	37248862	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
17	37250175	.	T	C	190.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:219,18,0
17	37251315	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	37251422	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37351285	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	37357034	.	C	T	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-1.504;DP=27;FS=5.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=0.92;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:53:53,0,916
17	37365699	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	37366988	.	C	T	1322.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1351,96,0
17	37367206	.	G	T	1472.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1501,105,0
17	37367542	.	C	T	35.31	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=5.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:1:61,1,0
17	37368414	.	G	A	782.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:811,57,0
17	37369017	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	37369416	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	37409625	.	A	G	1016.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-1.733;DP=26;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=30.84;ReadPosRankSum=1.600	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:46:1045,46,0
17	37409801	.	G	A	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
17	37410503	.	T	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:109,0,179
17	37410892	.	C	G	792.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:821,57,0
17	37412382	.	T	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:42:42,0,497
17	37412491	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,141
17	37412492	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:75:75,0,141
17	37412829	.	C	T	746.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:775,54,0
17	37414842	.	C	T	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:526,39,0
17	37414885	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
17	37416104	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
17	37428118	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	37453780	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	37461161	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
17	37461643	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	37503204	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37557517	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37559589	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	37561613	.	A	G	2003.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-0.405;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.211	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,51:55:8:2031,0,8
17	37563567	.	G	A	1499.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=1.050;DP=42;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=28.02;ReadPosRankSum=-1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,38:42:20:1528,0,20
17	37576163	.	A	G	2196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-2.426;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=34.87;ReadPosRankSum=0.403	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,55:63:99:2225,0,162
17	37596434	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	37597185	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	37604153	.	T	A	1915.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-1.665;DP=56;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.116	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,48:52:20:1944,0,20
17	37607528	.	G	A	252.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.51;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:11:280,0,11
17	37682657	.	A	G	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
17	37683153	.	T	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
17	37684500	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	37685401	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	37686378	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	37687968	.	A	G	672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:701,54,0
17	37689772	.	T	G	687.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.819;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=34.39;ReadPosRankSum=-0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,18:20:31:716,0,31
17	37699378	.	T	G	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
17	37699729	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	37704712	.	T	C	995.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1024,72,0
17	37707592	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
17	37708841	.	T	C	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
17	37715551	.	G	T	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
17	37717377	.	T	A	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
17	37721279	.	G	T	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:598,42,0
17	37723291	.	G	A	54.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.752;DP=45;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=1.22;ReadPosRankSum=1.860	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,5:45:83:83,0,1617
17	37725404	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	37725807	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	37727950	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
17	37752005	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	37794351	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	37795828	.	G	T	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
17	37801823	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	37804858	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	37805834	.	A	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	37806389	.	G	C	212.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.42;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:14:241,0,14
17	37806789	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
17	37806920	.	A	G	52.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:19:81,0,19
17	37806995	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:114,0,29
17	37807698	.	A	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	37808759	.	T	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	37810604	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:169,0,271
17	37810771	.	A	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:50:50,0,170
17	37811023	.	G	A	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
17	37811487	.	A	G	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:104,0,72
17	37811508	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
17	37811532	.	A	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,194
17	37812983	.	G	A	162.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.14;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:191,0,19
17	37813214	.	A	G	484.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=34.58;ReadPosRankSum=-0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,13:14:11:512,11,0
17	37825089	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
17	37826249	.	A	G	975.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=1.561;DP=28;FS=7.579;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=34.85;ReadPosRankSum=-1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,26:28:2:1002,2,0
17	37828072	.	C	T	2316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-1.375;DP=68;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=34.07;ReadPosRankSum=1.430	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,59:68:99:2345,0,175
17	37828496	.	T	C	2805.53	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-0.258;DP=74;FS=4.420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=27.49;ReadPosRankSum=0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,69:74:3:2832,3,0
17	37828745	.	A	G	2376.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.317;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,58:61:50:2405,50,0
17	37828787	.	G	A	2560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=-1.186;DP=69;FS=2.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=31.74;ReadPosRankSum=2.411	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,64:68:44:2589,44,0
17	37829129	.	A	G	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
17	37830900	.	A	G	2721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.438;DP=72;FS=2.100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.069	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,68:72:38:2750,38,0
17	37831035	.	A	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,114
17	37832093	.	T	C	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=32.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:99:289,0,122
17	37832103	.	C	A	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:99:289,0,122
17	37832315	.	T	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	37832366	.	G	A	202.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:231,0,22
17	37832386	.	G	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
17	37832488	.	C	A	454.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=34.99;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,12:13:2:481,2,0
17	37835331	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:44:44,0,463
17	37835336	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.003	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:46:46,0,433
17	37837789	.	T	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:51:51,0,191
17	37837897	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,298
17	37837900	.	T	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:156,0,110
17	37838200	.	G	A	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
17	37839493	.	T	C	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
17	37840265	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
17	37840318	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	37853048	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	37853118	.	A	G	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
17	37854507	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	37855331	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37858678	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	37859083	.	G	C	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
17	37860837	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	37862966	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	37866005	.	C	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
17	37867647	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	37869406	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,227
17	37869420	.	A	G	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,415
17	37869990	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	37870378	.	G	A	197.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:226,0,25
17	37874339	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,120
17	37876179	.	C	G	1107.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=-0.540;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,28:30:1:1133,0,1
17	37876835	.	A	G	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.630;DP=22;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.473	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:31:810,31,0
17	37877221	.	G	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.26;ReadPosRankSum=1.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:123,0,564
17	37877412	.	G	A	656.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=30.57;ReadPosRankSum=0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:12:684,12,0
17	37878113	.	C	T	638.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=34.09;ReadPosRankSum=-0.771	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:8:666,8,0
17	37878311	.	A	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:125,0,292
17	37878371	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:169,0,360
17	37878574	.	A	G	426.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.579;DP=20;FS=11.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:455,0,280
17	37878635	.	A	G	308.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.857;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:337,0,369
17	37878696	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.361;DP=28;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:89:89,0,943
17	37879030	.	A	G	725.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.300;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,19:21:20:754,0,20
17	37885332	.	G	A	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:645,48,0
17	37886065	.	C	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:56:56,0,234
17	37891229	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	37891235	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
17	37891407	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,150
17	37892370	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	37892697	.	T	A	172.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:201,0,26
17	37894463	.	A	C	125.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:154,0,24
17	37895379	.	T	C	198.88	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:16:227,16,0
17	37898210	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
17	37898249	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	37898543	.	T	C	2856.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2885,199,0
17	37898909	.	A	C	1955.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.701;DP=51;FS=10.704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=25.94;ReadPosRankSum=0.701	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:3,48:51:31:1984,31,0
17	37899092	.	G	A	1573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-1.644;DP=39;FS=3.869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.555	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,38:39:72:1602,72,0
17	37915547	.	T	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-0.085;DP=13;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:94:94,0,380
17	37917186	.	T	C	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.648	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:219,0,341
17	37917311	.	T	C	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=1.614;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.614	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:215,0,273
17	37917633	.	T	C	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:571,39,0
17	37917735	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-1.783;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=1.06;ReadPosRankSum=1.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:44:44,0,494
17	37918230	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.135;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:80:80,0,547
17	37918231	.	T	C	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.508;DP=17;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=0.76;ReadPosRankSum=-0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:41:41,0,644
17	37918244	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=1.050;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:108,0,573
17	37920169	.	T	C	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:236,0,387
17	37920204	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:55:55,0,366
17	37920205	.	T	C	345.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=34.52;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:10:373,0,10
17	37920552	.	T	C	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:93:93,0,445
17	37921194	.	T	C	699.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:728,51,0
17	37921742	.	C	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
17	37921899	.	C	T	676.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:705,48,0
17	38063753	.	T	C	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,398
17	38067476	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=1.37;ReadPosRankSum=1.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:46:46,0,410
17	38068043	.	T	C	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
17	38068382	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	38068514	.	T	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
17	38069076	.	G	A	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	38069809	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	38069949	.	C	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
17	38070071	.	C	T	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
17	38072173	.	G	T	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
17	38072245	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	38072247	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	38073968	.	G	C	692.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:721,51,0
17	38074031	.	T	C	1332.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1361,96,0
17	38074046	.	G	A	1424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1453,102,0
17	38074518	.	C	T	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:654,48,0
17	38075016	.	T	C	335.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:364,36,0
17	38075214	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.717	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:187,0,189
17	38075426	.	G	A	904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:933,66,0
17	38075867	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.063;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:72:72,0,696
17	38075873	.	T	C	439.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=29.32;ReadPosRankSum=-0.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:468,0,119
17	38075885	.	T	C	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=1.356;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:88:88,0,781
17	38076015	.	T	C	330.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:359,24,0
17	38076017	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.10;ReadPosRankSum=-1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:189,0,110
17	38076027	.	T	C	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:358,24,0
17	38077464	.	C	T	2915.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2944,202,0
17	38077938	.	C	T	2003.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-1.781;DP=56;FS=8.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=34.81;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,51:56:45:2032,0,45
17	38082807	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	38137033	.	A	G	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
17	38137364	.	G	A	3172.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-2.148;DP=86;FS=2.086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=32.93;ReadPosRankSum=2.189	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:4,81:85:99:3201,101,0
17	38137623	.	C	T	664.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=24.60;ReadPosRankSum=1.542	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:15:693,15,0
17	38138995	.	G	C	176.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:205,0,27
17	38139024	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	38142677	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	38142978	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	38143548	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
17	38146154	.	T	C	4167.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,95:95:99:4196,286,0
17	38146567	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:112,0,111
17	38146929	.	T	C	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
17	38146966	.	C	A	589.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:618,45,0
17	38147293	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	38147829	.	C	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,178
17	38148031	.	A	G	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=1.401;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:93:93,0,397
17	38148042	.	T	C	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
17	38148151	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,244
17	38148157	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,244
17	38148210	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	38148687	.	C	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,274
17	38149033	.	G	A	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
17	38149236	.	T	C	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
17	38149258	.	T	G	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
17	38149350	.	C	G	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
17	38149724	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	38149727	.	C	T	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	38150236	.	C	T	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
17	38150492	.	T	C	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
17	38150613	.	C	A	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
17	38151014	.	C	T	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:553,42,0
17	38151960	.	A	G	1321.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1350,93,0
17	38152304	.	A	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
17	38153554	.	G	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	38154084	.	G	C	2453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2482,174,0
17	38175866	.	G	A	3212.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:3241,223,0
17	38176476	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	38177432	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	38181261	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:46:46,0,435
17	38182081	.	A	G	644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:673,48,0
17	38182844	.	T	C	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
17	38186106	.	C	T	2957.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2986,205,0
17	38188844	.	A	G	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
17	38189793	.	T	C	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:837,60,0
17	38271303	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	38492246	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	38519291	.	C	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
17	38545193	.	C	T	1271.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-0.866;DP=32;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.625	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,31:32:61:1300,61,0
17	38545367	.	C	T	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.435;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=21.28;ReadPosRankSum=1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,14:24:99:539,0,359
17	38782286	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	38797242	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	38797409	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	38798073	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	38804561	.	A	C	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:358,27,0
17	38974612	.	T	C	1860.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1889,132,0
17	38975328	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	38990834	.	G	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
17	38991032	.	T	A	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
17	38991052	.	T	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	38991053	.	T	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	39659913	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	39661689	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	39670912	.	G	C	958.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:987,69,0
17	39671045	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	39674641	.	T	C	1379.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1408,99,0
17	39676091	.	C	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	39676412	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:132,9,0
17	39676420	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	39678440	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	39678697	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	39679804	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	39679913	.	G	A	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.484;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.389	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,8:43:99:220,0,1319
17	39680796	.	T	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
17	39680935	.	A	G	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:521,36,0
17	39681475	.	A	G	1103.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1132,78,0
17	39682032	.	T	G	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:619,48,0
17	39682603	.	G	T	747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:776,54,0
17	39684321	.	G	C	3388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:3417,256,0
17	39684410	.	G	A	3226.07	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=1.386;DP=80;FS=3.233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=30.06;ReadPosRankSum=-1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,79:80:99:3254,195,0
17	39684839	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
17	39685304	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
17	39686192	.	A	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
17	39686705	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
17	39687632	.	C	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	39688477	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	39691099	.	C	T	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
17	39691412	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
17	39691789	.	G	A	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
17	39767744	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:117,0,71
17	39911771	.	A	G	1776.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1805,129,0
17	39912145	.	T	A	2703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2732,193,0
17	39925925	.	A	G	2110.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2139,147,0
17	39925932	.	G	T	2110.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:99:2139,147,0
17	39939430	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	39939661	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	39942919	.	T	C	1462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1491,105,0
17	39959189	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	39967442	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	39987130	.	T	C	1485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1514,108,0
17	40004910	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	40005173	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	40005327	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
17	40005639	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	40005650	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	40007365	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
17	40023467	.	A	C	2140.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2169,154,0
17	40024023	.	A	T	2337.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2366,166,0
17	40026345	.	T	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
17	40027171	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	40048613	.	A	G	2151.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2180,151,0
17	40049973	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	40051987	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	40052321	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	40052642	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
17	40052842	.	G	A	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
17	40065774	.	T	G	1880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1909,135,0
17	40120771	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	40169519	.	G	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
17	40197657	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	40197716	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	40199649	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	40266939	.	G	A	847.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:876,63,0
17	40269810	.	C	T	565.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.977;DP=30;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.975	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:594,0,504
17	40466092	.	G	A	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
17	40490777	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=1.526;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.113	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:187,0,535
17	40632729	.	C	T	425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:454,33,0
17	40672517	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	40673057	.	G	C	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.533	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:177,0,314
17	40689455	.	T	C	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:522,39,0
17	40703353	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,80
17	40813959	.	C	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:60:154,0,60
17	41104750	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	41116234	.	G	A	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
17	41133071	.	T	C	766.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:795,57,0
17	41144892	.	T	C	821.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:850,60,0
17	41145296	.	G	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
17	41145527	.	C	T	613.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:642,45,0
17	41145634	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
17	41150471	.	G	C	332.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:361,24,0
17	41150521	.	C	T	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
17	41150983	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	41151743	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	41165878	.	C	T	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
17	41166417	.	G	A	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
17	41174025	.	A	C	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
17	41197274	.	C	A	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
17	41223094	.	T	C	365.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:394,27,0
17	41234470	.	A	G	518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:547,39,0
17	41244000	.	T	C	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
17	41244435	.	T	C	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
17	41244936	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
17	41245237	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
17	41245466	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	41245471	.	C	T	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	41283377	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	41286822	.	T	G	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
17	41291779	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	41292323	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	41301709	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	41302750	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
17	41302940	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	41303071	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
17	41304463	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	41361960	.	A	G	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
17	41362272	.	C	G	878.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:907,63,0
17	41362721	.	C	T	891.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:920,66,0
17	41424395	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	41425893	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	41435192	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	41435437	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	41436680	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:80,0,32
17	41436830	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,76
17	41436853	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:68,0,37
17	41437398	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	41437713	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	41438609	.	G	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	41438619	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	41438620	.	C	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	41438626	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	41444247	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	41466288	.	G	A	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
17	41601268	.	T	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.423;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:89:89,0,399
17	41843979	.	C	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
17	41844689	.	C	T	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
17	41845235	.	C	A	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
17	41845403	.	C	T	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
17	41845451	.	G	A	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
17	41845527	.	C	A	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
17	41846508	.	A	G	919.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:948,66,0
17	41846964	.	T	C	243.22	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.02;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,8:9:4:270,4,0
17	41884850	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	41885206	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	42085972	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	42088853	.	G	A	742.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:771,54,0
17	42099488	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	42124429	.	A	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	42150586	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	42255933	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	42257016	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	42257017	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	42264962	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
17	42267418	.	G	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
17	42268274	.	C	T	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
17	42268751	.	C	T	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:46:46,0,354
17	42283171	.	A	G	550.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-2.311;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=32.40;ReadPosRankSum=2.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,15:17:18:579,0,18
17	42401666	.	C	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
17	42475983	.	G	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
17	42744238	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	42786170	.	G	A	337.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:366,27,0
17	42827673	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:79,0,28
17	42950117	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	43003484	.	T	C	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:792,57,0
17	43009797	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	43009886	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	43011908	.	G	A	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
17	43042245	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	43100831	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	43101281	.	A	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
17	43101382	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	43101586	.	T	C	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
17	43120500	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	43128906	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	43171154	.	C	T	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
17	43181287	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	43183420	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
17	43195699	.	G	A	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
17	43221285	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	43228189	.	G	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	43319770	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	43340936	.	G	A	273.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:26:302,26,0
17	43344073	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	43346980	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	43507008	.	G	C	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
17	43582965	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	43583373	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:85:116,0,85
17	43653398	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	43662028	.	A	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:44:44,0,205
17	44064851	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	44105385	.	A	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:33:479,33,0
17	44105395	.	A	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:33:479,33,0
17	44110271	.	G	A	65.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:7:93,7,0
17	44144993	.	C	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	44270594	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	44626660	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	44819565	.	C	T	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
17	44828931	.	G	A	842.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:871,63,0
17	45000529	.	G	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
17	45000547	.	G	C	548.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:577,42,0
17	45008570	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
17	45013271	.	T	C	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
17	45016427	.	T	C	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
17	45017193	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	45017241	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	45017859	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
17	45024745	.	G	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
17	45026333	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	45026366	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	45026911	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
17	45027119	.	A	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	45033310	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	45034002	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
17	45037334	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	45037857	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	45053997	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	45088882	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	45090707	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	45095678	.	G	A	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
17	45133652	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	45133664	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	45196190	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
17	45671270	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	45671321	.	G	T	158.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:187,0,27
17	45760349	.	T	C	1101.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1130,78,0
17	45760429	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
17	45760433	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
17	45789206	.	C	G	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
17	45884846	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	45885687	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
17	45889248	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	45896478	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	45901480	.	C	T	721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:750,54,0
17	45915788	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	46020698	.	C	T	284.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:313,24,0
17	46022330	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	46026156	.	A	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
17	46028844	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
17	46029089	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	46029432	.	T	G	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
17	46030042	.	C	T	1661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1690,120,0
17	46031715	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
17	46033693	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	46033982	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
17	46034105	.	T	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
17	46034247	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
17	46035180	.	G	A	876.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:905,63,0
17	46137585	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:146,0,29
17	46147945	.	G	A	955.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:984,69,0
17	46178674	.	G	A	1134.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1163,84,0
17	46185014	.	C	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
17	46198876	.	G	C	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
17	46200009	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:56:56,0,117
17	46205070	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	46673723	.	T	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	46673724	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	46688256	.	T	C	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
17	46699516	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	46699669	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	46803538	.	C	T	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
17	46922224	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,116
17	46939658	.	C	G	1505.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.384;DP=45;FS=4.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=33.46;ReadPosRankSum=-0.284	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,39:45:99:1534,0,125
17	46941419	.	G	T	31.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:69,0,63
17	46941519	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,321
17	46941678	.	A	G	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:53:53,0,476
17	46942681	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
17	46943210	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:78,0,34
17	46945933	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	46946646	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,164
17	46948555	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,120
17	46948709	.	C	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
17	46948885	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	46949729	.	A	G	85.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:114,0,27
17	46969711	.	A	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	46970259	.	T	C	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=-0.898;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,9:34:99:255,0,819
17	46970509	.	G	A	278.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:307,0,18
17	46970836	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
17	46971139	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,75
17	46972865	.	C	T	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:94:94,0,667
17	46986616	.	C	T	251.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:19:280,0,19
17	46987665	.	G	A	255.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:16:284,0,16
17	46988044	.	G	A	657.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:686,48,0
17	46989154	.	A	G	184.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:213,0,23
17	46993370	.	G	A	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:45:45,0,273
17	47000251	.	C	T	31.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.055;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,6:67:60:60,0,2464
17	47002275	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	47005193	.	A	G	108.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.329;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,8:65:99:137,0,2267
17	47005509	.	T	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=1.506;DP=69;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,9:69:99:179,0,2388
17	47005588	.	C	T	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=-1.086;DP=66;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,15:66:99:453,0,1915
17	47006493	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,242
17	47007963	.	C	T	2469.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=-2.104;DP=74;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=33.38;ReadPosRankSum=-0.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,62:74:99:2498,0,307
17	47008546	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	47009835	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.948;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:73:73,0,590
17	47010034	.	G	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:104,0,270
17	47012167	.	T	C	54.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-0.063;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:83:83,0,551
17	47012925	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
17	47014675	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	47014754	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	47016694	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	47017193	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
17	47022413	.	A	G	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:450,33,0
17	47022727	.	C	G	426.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:10:454,0,10
17	47140999	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	47210429	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	47210506	.	C	A	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
17	47234117	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	47241604	.	T	C	993.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1022,72,0
17	47247506	.	T	C	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:487,33,0
17	47248346	.	G	T	448.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=34.50;ReadPosRankSum=0.134	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:7:476,0,7
17	47249130	.	T	C	299.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.32;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:328,0,18
17	47253514	.	C	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	47300823	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	47367536	.	T	G	1008.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1037,72,0
17	47368946	.	G	A	429.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:458,33,0
17	47369099	.	A	G	559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:588,42,0
17	47369302	.	A	G	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:267,0,102
17	47371037	.	A	G	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:72:91,0,72
17	47371065	.	A	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,296
17	47373417	.	T	C	142.96	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:5:170,5,0
17	47375308	.	C	T	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:89:89,0,444
17	47392718	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	47393605	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	47481514	.	T	C	1324.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1353,96,0
17	47676982	.	G	A	57.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-1.856;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,4:31:86:86,0,1027
17	47678578	.	A	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
17	47783663	.	C	T	1429.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.502;DP=54;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.900	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,38:54:99:1458,0,512
17	47888852	.	A	G	2065.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2094,147,0
17	47988676	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	47989235	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	47989648	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	47989987	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	47992951	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	47993097	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	47993110	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	48046775	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	48067439	.	G	A	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
17	48067953	.	T	C	1002.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1031,72,0
17	48068720	.	T	A	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:906,63,0
17	48072546	.	C	T	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:85:85,0,434
17	48155640	.	G	T	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.135;DP=30;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,6:29:99:169,0,882
17	48155909	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	48159622	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	48161756	.	A	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	48164361	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	48165064	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	48167298	.	A	G	1139.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1168,81,0
17	48172779	.	A	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,5:18:99:144,0,466
17	48183471	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	48186942	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	48187884	.	C	T	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:247,0,305
17	48211533	.	T	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.194;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.426	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:86:86,0,640
17	48216972	.	G	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	48226964	.	C	G	79.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.951;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,6:48:99:108,0,1586
17	48227658	.	C	A	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=1.658;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=0.49;ReadPosRankSum=-1.658	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:38:38,0,596
17	48265495	.	T	C	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
17	48268223	.	A	G	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
17	48363134	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	48423955	.	G	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	48424944	.	A	G	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
17	48425967	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	48427191	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
17	48427982	.	C	G	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
17	48428319	.	A	G	355.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:384,30,0
17	48428623	.	G	C	456.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:485,33,0
17	48432245	.	G	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=-1.533;DP=37;FS=1.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=2.24;ReadPosRankSum=2.155	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,5:37:99:111,0,1254
17	48432681	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	48433179	.	G	C	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-1.387;DP=26;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,7:26:99:216,0,717
17	48437456	.	C	G	1318.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1347,96,0
17	48438055	.	G	T	750.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:779,54,0
17	48443452	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
17	48445699	.	C	T	510.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:539,39,0
17	48451951	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	48452776	.	A	C	1376.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1405,96,0
17	48457567	.	G	A	352.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:381,30,0
17	48460745	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	48460750	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:180,12,0
17	48471597	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	48509965	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	48524120	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	48528151	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	48537135	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	48539997	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
17	48541443	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	48541491	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	48541707	.	G	A	597.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:626,45,0
17	48542572	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	48543391	.	A	C	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
17	48545596	.	G	A	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
17	48546793	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	48547433	.	T	C	418.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:447,33,0
17	48548601	.	T	C	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.635	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:179,0,255
17	48549167	.	A	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
17	48549457	.	C	T	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
17	48549791	.	C	G	1638.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1667,126,0
17	48552455	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	48556629	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
17	48556757	.	T	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
17	48557326	.	G	A	1202.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1231,90,0
17	48557348	.	T	C	1275.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1304,90,0
17	48610098	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
17	48610272	.	G	C	2384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2413,166,0
17	48610937	.	A	G	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
17	48612885	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:74:74,0,513
17	48612958	.	T	C	433.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:462,36,0
17	48613837	.	A	G	2052.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2081,144,0
17	48616114	.	C	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
17	48617829	.	G	A	287.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:29:316,29,0
17	48617906	.	A	G	557.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:40:586,40,0
17	48618106	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	48619249	.	C	A	1542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1571,123,0
17	48620517	.	G	A	462.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:491,36,0
17	48620538	.	G	A	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:93:93,0,385
17	48625543	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	48628242	.	C	T	415.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.201;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,14:51:99:444,0,1457
17	48629458	.	A	G	2409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2438,169,0
17	48715154	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	48715271	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	48719615	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	48719848	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:138,0,69
17	48722582	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
17	48722587	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	48724037	.	A	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:111,0,74
17	48724830	.	C	T	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:158,0,28
17	48726050	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	48726132	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	48738266	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	48739543	.	T	C	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.520;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:259,0,105
17	48740116	.	T	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	48746135	.	C	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
17	48749743	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	48762778	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	48762985	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	48765891	.	T	C	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:59:229,0,59
17	48770959	.	A	G	40.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=-0.831;DP=36;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.378	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,4:36:69:69,0,1256
17	48771135	.	G	T	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:657,48,0
17	48778298	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	48784349	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	48785165	.	C	T	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
17	48796552	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	48801509	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	48814822	.	C	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.948;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:70:70,0,580
17	48815953	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	48816485	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	48819356	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	48824922	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,120
17	48830549	.	G	A	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
17	48831284	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
17	48832437	.	G	T	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
17	48833258	.	G	A	767.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:796,54,0
17	48939677	.	G	A	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:182,0,344
17	48940422	.	T	C	766.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.306;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,22:52:99:795,0,1150
17	48943628	.	C	T	577.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-0.304;DP=41;FS=6.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.807	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,17:41:99:606,0,853
17	49043348	.	C	T	579.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.391;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=30.51;ReadPosRankSum=0.391	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,16:19:68:608,0,68
17	49073719	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	49231627	.	G	A	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:311,0,142
17	49243804	.	A	T	390.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-0.606;DP=47;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.654	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,13:47:99:419,0,1190
17	49246345	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
17	49246495	.	G	A	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
17	49255974	.	C	G	622.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:651,45,0
17	49256694	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,237
17	49350802	.	A	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.910;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=5.42;ReadPosRankSum=2.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:115,0,487
17	49509687	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	51089638	.	C	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
17	51089892	.	C	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
17	51090693	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	51091068	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	51111510	.	A	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
17	51120277	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	51120278	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	51226836	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	51228816	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
17	51229953	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	51232247	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	51289757	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	52007129	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	52010286	.	C	A	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
17	52922498	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	52949524	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	52969522	.	G	A	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
17	52975937	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	52985470	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,79
17	52993346	.	G	A	202.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:231,18,0
17	53000097	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	53000329	.	G	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:97,0,32
17	53014955	.	G	C	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.747;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:228,0,781
17	53017037	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,277
17	53017134	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,103
17	53020296	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	53024029	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	53024171	.	C	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,214
17	53030631	.	A	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.86;ReadPosRankSum=-2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,201
17	53030673	.	T	G	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=1.27;ReadPosRankSum=1.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:46:46,0,395
17	53032451	.	C	T	823.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:852,60,0
17	53033878	.	A	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:51:51,0,184
17	53036777	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:55:55,0,278
17	53037053	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,39
17	53076799	.	G	A	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
17	53158492	.	G	A	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:65:235,0,65
17	53242304	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	53242391	.	A	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	53247131	.	G	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
17	53247610	.	C	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	53497765	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	53850034	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:78,0,30
17	53851071	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
17	53851078	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	53851228	.	C	T	1202.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1231,84,0
17	53853045	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	53854141	.	T	C	922.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:951,66,0
17	54967404	.	T	C	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
17	54967528	.	A	G	733.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:762,54,0
17	54970181	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	54976337	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	54978794	.	G	A	571.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:600,45,0
17	55027850	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:46:46,0,352
17	55079471	.	T	C	537.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.835;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=22.41;ReadPosRankSum=-1.073	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:566,0,328
17	55183203	.	T	C	425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.497;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.682	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,13:33:99:454,0,716
17	55183716	.	T	C	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.190;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,16:34:99:587,0,668
17	55184680	.	T	G	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:55:235,0,55
17	55184769	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:156,0,72
17	55193178	.	C	T	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:78,0,27
17	55197802	.	C	A	821.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:850,60,0
17	55197914	.	G	C	684.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:713,51,0
17	55199271	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	55695203	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	55699059	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	55699560	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	55702257	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	55704465	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	55708632	.	A	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
17	55709380	.	A	G	210.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:239,18,0
17	55709699	.	G	A	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
17	55710036	.	T	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:46:46,0,326
17	55756756	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	55757381	.	A	C	681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:710,48,0
17	55912509	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	55915634	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	55916165	.	G	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	55916641	.	G	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
17	55939460	.	G	T	1248.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1277,93,0
17	55944566	.	G	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:91:91,0,378
17	55945355	.	G	C	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-0.477;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:307,0,554
17	55950064	.	C	T	510.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.646;DP=35;FS=5.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,16:35:99:539,0,691
17	55954560	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	55954975	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
17	55955424	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	55963079	.	A	G	401.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.680;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.680	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:430,0,169
17	55963223	.	T	C	349.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:378,0,236
17	56032953	.	G	A	45.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:74,0,24
17	56054598	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	56079077	.	C	T	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-2.388;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:212,0,447
17	56079430	.	C	A	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.818	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:321,0,287
17	56083934	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	56085922	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	56160842	.	T	C	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:323,27,0
17	56162496	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	56168371	.	G	A	2099.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2128,144,0
17	56168713	.	G	C	759.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:788,54,0
17	56169763	.	A	G	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
17	56169892	.	C	G	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:53:700,53,0
17	56170595	.	C	T	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:619,45,0
17	56173203	.	A	G	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
17	56174489	.	G	A	369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:398,30,0
17	56174500	.	G	A	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
17	56176203	.	A	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
17	56176372	.	T	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	56176545	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	56236341	.	C	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
17	56398006	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	56423114	.	C	T	745.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.317;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,20:35:99:774,0,544
17	56424710	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
17	56431525	.	A	G	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.024;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:292,0,758
17	56431549	.	A	G	722.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=-0.723;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.062	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,20:31:99:751,0,386
17	56438301	.	G	A	536.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-1.130;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:565,0,283
17	56443545	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	56448297	.	C	T	409.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-1.369;DP=31;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.615	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:438,0,552
17	56462783	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
17	56493374	.	A	T	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:263,0,257
17	56554097	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
17	56584508	.	T	C	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.071;DP=31;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=5.70;ReadPosRankSum=-2.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,7:31:99:205,0,955
17	56604811	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	56636854	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:148,0,109
17	56659018	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	56660269	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:68:76,0,68
17	56660279	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:68:76,0,68
17	56676368	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:95:181,0,95
17	56690848	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,272
17	56709034	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:74,0,30
17	56736490	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	56783255	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	56802059	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	56802141	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	56802458	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
17	57076104	.	T	A	1209.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1238,87,0
17	57141280	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
17	57141285	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:72:81,0,72
17	57166002	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	57166016	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
17	57184162	.	A	C	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
17	57185807	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	57187729	.	G	A	1590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1619,111,0
17	57187795	.	C	T	1425.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1454,99,0
17	57188405	.	G	T	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=1.363;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=1.11;ReadPosRankSum=-1.523	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,4:34:66:66,0,1184
17	57201717	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	57202927	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	57204632	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	57276563	.	G	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
17	57279070	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=1.528;DP=23;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=2.21;ReadPosRankSum=-1.379	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:79:79,0,665
17	57279167	.	A	G	31.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-1.003;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=0.86;ReadPosRankSum=1.443	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,4:37:60:60,0,1744
17	57279171	.	A	G	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.314;DP=43;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=0.35;ReadPosRankSum=0.188	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,4:43:43:43,0,1957
17	57279320	.	A	G	1224.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1253,87,0
17	57280769	.	A	G	401.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:430,0,242
17	57280770	.	A	G	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.453	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:252,0,657
17	57280848	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-2.100;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,483
17	57281021	.	A	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=1.504;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:47:47,0,940
17	57281378	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-1.955;DP=32;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.004;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.907	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,6:32:99:154,0,1026
17	57287454	.	A	G	1190.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.693;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,29:30:45:1219,45,0
17	57291841	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,150
17	57474923	.	G	A	425.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=32.74;ReadPosRankSum=-0.935	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:7:453,0,7
17	57475540	.	G	T	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
17	57475896	.	G	A	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-1.444;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=32.18;ReadPosRankSum=1.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:36:511,0,36
17	57476653	.	T	C	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=24.81;ReadPosRankSum=-0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:99:326,0,102
17	57476714	.	A	G	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-2.793;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.831	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:183,0,595
17	57476717	.	C	A	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=-3.067;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:183,0,595
17	57477235	.	T	G	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:162,0,30
17	57477273	.	T	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
17	57477616	.	G	A	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
17	57478069	.	C	G	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.68;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:48:315,0,48
17	57478253	.	A	C	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:58:278,0,58
17	57695992	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	57696251	.	G	A	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
17	57696773	.	G	A	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
17	57696827	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
17	57698736	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	57744674	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	57764178	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	57766975	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	57767650	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
17	57769998	.	A	G	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
17	57772814	.	C	T	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
17	57776475	.	T	C	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
17	57776597	.	T	G	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
17	57778128	.	A	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
17	57778339	.	A	C	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
17	57779678	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	57779721	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	57780223	.	C	A	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
17	57782925	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
17	57783069	.	A	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
17	57783103	.	T	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:162,0,117
17	57783104	.	T	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:162,0,117
17	57783105	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,283
17	57783160	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=23.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:195,0,66
17	57783934	.	A	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
17	57784486	.	C	A	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
17	57814696	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	57951937	.	C	T	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.765;DP=22;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:66:66,0,733
17	58036499	.	A	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
17	58036845	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	58040564	.	G	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.722;DP=26;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,3:26:44:44,0,919
17	58184540	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	58207412	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	58209154	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	58255190	.	G	T	481.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=32.12;ReadPosRankSum=1.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:34:510,0,34
17	58524194	.	G	A	1144.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1173,81,0
17	58786625	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	59251715	.	T	C	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
17	59265918	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	59286880	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	59309932	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	59320309	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	59463239	.	A	G	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
17	59463843	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	59464069	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	59464100	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	59466701	.	T	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	59466888	.	G	T	91.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:120,0,27
17	59468621	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	59470055	.	A	C	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
17	59471082	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	59473365	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	59476415	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
17	59484316	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	59485555	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
17	59760174	.	G	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,153
17	59760499	.	A	G	174.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:203,0,25
17	59760996	.	A	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:191,0,189
17	59763347	.	A	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:159,0,29
17	59763465	.	T	C	124.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:153,0,27
17	59886057	.	G	A	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,189
17	59943559	.	T	C	237.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:266,21,0
17	59955426	.	T	G	161.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:190,15,0
17	60043884	.	G	A	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
17	60142971	.	G	A	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=28.25;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:56:339,0,56
17	60503817	.	G	C	431.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=1.196;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=21.59;ReadPosRankSum=-1.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:460,0,285
17	60526547	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:149,0,139
17	60528066	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,236
17	60554208	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
17	60554275	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	61888461	.	G	A	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:746,51,0
17	61905035	.	G	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:49:49,0,235
17	61910167	.	G	A	1579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1608,111,0
17	61913368	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:71,0,30
17	62119389	.	T	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
17	62119555	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	62119601	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	62119860	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
17	62120341	.	A	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	62120733	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
17	62120748	.	A	G	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
17	62120843	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
17	62121480	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	62233179	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	62236864	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	62480105	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
17	62485822	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
17	62533195	.	C	G	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.830	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:252,0,387
17	62538846	.	C	G	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:112,0,69
17	62754722	.	G	C	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:303,0,100
17	62777798	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:67,0,30
17	63007095	.	G	A	785.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:814,57,0
17	63009293	.	C	G	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.257;DP=33;FS=7.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,6:33:99:159,0,1058
17	63097399	.	A	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
17	63106862	.	C	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	64298367	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	64801021	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	64878924	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	64882423	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	64882425	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	64882692	.	G	A	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
17	64882726	.	C	T	204.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:233,18,0
17	64883133	.	G	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
17	64883293	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	64884871	.	G	A	76.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:104,9,0
17	64885451	.	C	A	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
17	64886434	.	T	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
17	64887115	.	T	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
17	64887517	.	C	A	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
17	64955343	.	C	T	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
17	64957344	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	64958987	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	64959667	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	65016683	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
17	65022159	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	65023417	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	65026011	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	65026515	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	65026886	.	C	T	745.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.917;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,20:25:99:774,0,134
17	65027740	.	G	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=1.966;DP=27;FS=4.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=3.66;ReadPosRankSum=-2.029	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,5:27:99:127,0,837
17	65066879	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,116
17	65104666	.	T	G	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-1.083;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:84:84,0,464
17	65104743	.	G	A	235.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:264,21,0
17	65172787	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,118
17	65173494	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	65182445	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
17	65203189	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	65212042	.	C	T	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:235,0,142
17	65334725	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:51:51,0,405
17	65334802	.	T	C	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:303,0,102
17	65334885	.	T	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:145,0,273
17	65334886	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,602
17	65335352	.	T	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:98:98,0,178
17	65335454	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,458
17	65335459	.	T	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.38;ReadPosRankSum=-2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:92:92,0,368
17	65336527	.	G	A	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:227,0,149
17	65336989	.	G	T	501.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.510;DP=37;FS=21.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.108	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,15:37:99:530,0,835
17	65373979	.	C	G	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:646,48,0
17	65690263	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	65734514	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
17	65739627	.	A	G	1065.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1094,75,0
17	65941230	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	65973086	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	65976049	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	65978851	.	T	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
17	65979141	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
17	65988049	.	T	C	370.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:399,0,121
17	65989048	.	T	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
17	66031900	.	T	C	985.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.581;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,26:40:99:1014,0,487
17	66038556	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	66039350	.	A	G	467.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=-0.444;DP=53;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.563	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,15:53:99:496,0,1463
17	66122765	.	C	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:54:54,0,368
17	66122977	.	C	A	162.18	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.03;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:10:190,0,10
17	66123432	.	T	G	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:657,48,0
17	66124885	.	C	G	324.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:353,0,306
17	66125507	.	A	G	291.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.52;ReadPosRankSum=1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:90:320,0,90
17	66126843	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	66128565	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	66129015	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	66131329	.	A	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,107
17	66140357	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	66244578	.	T	C	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-0.035;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.175	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:170,0,643
17	66246416	.	A	G	1317.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1346,93,0
17	66263767	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,177
17	66364749	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,133
17	66364804	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
17	66424923	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	66425140	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	66449122	.	G	A	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.42;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:221,0,103
17	66508243	.	C	A	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:333,27,0
17	66526810	.	T	G	410.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.070;DP=28;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=14.67;ReadPosRankSum=-0.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:439,0,627
17	66528778	.	C	G	1191.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1220,84,0
17	67273882	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	70120551	.	A	C	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
17	70121339	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	70122108	.	G	A	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
17	70943990	.	T	C	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:636,45,0
17	71192873	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
17	71196809	.	A	G	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
17	71197748	.	G	A	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
17	71201956	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	71205036	.	T	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
17	71205854	.	A	G	386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:415,30,0
17	71232687	.	T	C	373.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:402,27,0
17	71232804	.	C	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	71232807	.	T	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
17	71232881	.	G	C	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
17	71233130	.	A	G	156.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:185,15,0
17	71233736	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	71238433	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
17	71244166	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
17	71244630	.	C	T	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
17	71279839	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	71279856	.	C	T	441.53	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=33.96;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,12:13:3:468,3,0
17	71280075	.	T	C	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
17	71280213	.	G	A	628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:657,45,0
17	71333534	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	71410891	.	C	T	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
17	71745976	.	A	G	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
17	72443192	.	G	T	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:520,42,0
17	72443287	.	C	G	889.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:918,66,0
17	72446608	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	72744798	.	G	C	1131.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1160,87,0
17	72745164	.	T	G	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.794;ClippingRankSum=4.485;DP=61;FS=54.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=2.87;ReadPosRankSum=-3.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,14:61:99:203,0,3570
17	72745167	.	A	G	174.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.230;ClippingRankSum=2.563;DP=55;FS=29.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=3.18;ReadPosRankSum=-3.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,7:55:99:203,0,3570
17	72761242	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	72762646	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	72762791	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	72762793	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	72762901	.	A	T	16.29	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=5.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:104,9,0
17	72765215	.	C	T	2225.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2254,157,0
17	72766993	.	G	A	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:700,48,0
17	72767435	.	T	C	1185.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1214,84,0
17	72767565	.	A	G	912.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:941,66,0
17	72768970	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	72769334	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	72772698	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	72834071	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	72947061	.	T	C	1144.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1173,81,0
17	72948369	.	A	G	1915.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1944,138,0
17	72950817	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	72950826	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	72950927	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	72952017	.	A	G	1771.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1800,126,0
17	72956124	.	G	A	1479.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.158;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=31.81;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,32:33:99:1508,0,393
17	72983888	.	A	C	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:464,33,0
17	73001686	.	G	A	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.754;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=23.99;ReadPosRankSum=0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:436,0,213
17	73089852	.	T	C	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
17	73095003	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	73096951	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	73101204	.	C	A	242.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:271,21,0
17	73102411	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	73110279	.	C	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
17	73125173	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
17	73125774	.	C	T	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
17	73127024	.	C	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=18.72	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:178,0,127
17	73127683	.	T	C	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:690,51,0
17	73133629	.	T	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
17	73137187	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	73215073	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	73222847	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	73223674	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	73230856	.	C	T	1097.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1126,78,0
17	73236605	.	C	A	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
17	73238208	.	T	C	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
17	73240559	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	73257830	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
17	73257986	.	C	T	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:854,63,0
17	73258479	.	C	T	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
17	73262293	.	T	C	979.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1008,72,0
17	73267169	.	A	C	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
17	73267534	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	73268801	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	73269258	.	G	C	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
17	73269530	.	A	G	293.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:322,24,0
17	73269676	.	C	T	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
17	73270159	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	73279624	.	A	G	577.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.651;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:11:605,11,0
17	73285461	.	A	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
17	73315368	.	C	T	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:926,66,0
17	73483314	.	A	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
17	73488794	.	C	T	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:926,69,0
17	73489220	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	73489567	.	C	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
17	73495677	.	C	T	388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:417,33,0
17	73495692	.	C	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
17	73498483	.	T	C	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:347,24,0
17	73498623	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
17	73499697	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	73503735	.	C	T	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:173,0,138
17	73505411	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	73510012	.	A	T	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
17	73510303	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	73512653	.	G	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
17	73517536	.	G	A	1167.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1196,84,0
17	73518203	.	G	C	1308.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1337,93,0
17	73518284	.	G	C	1082.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1111,78,0
17	73519413	.	C	T	758.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:787,57,0
17	73543178	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	73543189	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	73543191	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	73545541	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	73546001	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	73546324	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	73547367	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	73552185	.	G	A	1226.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1255,90,0
17	73586358	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	73588027	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	73588058	.	G	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	73588067	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:134,9,0
17	73614968	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	73625430	.	G	A	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
17	73625478	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
17	73625629	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	73627565	.	A	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
17	73663246	.	G	A	43.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:72,0,27
17	73747796	.	A	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	73753661	.	C	T	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
17	73796002	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	73812909	.	A	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
17	73816026	.	A	G	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
17	73890024	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	73940307	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
17	73940875	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,75
17	73940888	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,112
17	73940918	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	73975471	.	C	T	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
17	73987652	.	C	T	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
17	73996887	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	73997474	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
17	74003463	.	G	A	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:518,42,0
17	74003805	.	G	A	674.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:703,48,0
17	74003846	.	G	A	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
17	74005476	.	G	A	596.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:625,45,0
17	74005611	.	G	A	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:483,39,0
17	74006872	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	74012859	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	74014619	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	74077497	.	G	C	547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:576,42,0
17	74079077	.	G	A	929.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:958,69,0
17	74081216	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	74084428	.	C	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	74084441	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	74084449	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
17	74086186	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	74086633	.	C	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
17	74086924	.	G	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
17	74087663	.	C	G	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
17	74087827	.	T	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
17	74087996	.	G	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
17	74088351	.	G	A	155.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:184,0,27
17	74088718	.	C	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
17	74089311	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
17	74089543	.	A	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
17	74090261	.	C	T	332.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:361,27,0
17	74090326	.	T	C	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:514,39,0
17	74090385	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	74261677	.	T	C	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
17	74265531	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	74267010	.	T	C	1227.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1256,87,0
17	74381567	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	74383678	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	74385591	.	C	A	30.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
17	74466592	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	74466901	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	74467135	.	G	A	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
17	74475024	.	G	A	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
17	74488856	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	74494948	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	74494952	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	74494958	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	74558057	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	74559287	.	T	C	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:685,48,0
17	74560381	.	G	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	74560383	.	T	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	74561213	.	A	G	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:480,33,0
17	74564021	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	74566135	.	T	C	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
17	74566274	.	A	G	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
17	74566524	.	G	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
17	74566530	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
17	74567042	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	74567143	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	74567268	.	C	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
17	74568165	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
17	74568303	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
17	74568411	.	T	C	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
17	74568507	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
17	74570245	.	T	C	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
17	74570408	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	74571148	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	74571287	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
17	74571927	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	74574103	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	74574243	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	74575914	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	74577040	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	74577247	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	74577483	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	74577593	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	74578740	.	T	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	74581914	.	C	G	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:528,39,0
17	74581945	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	74581946	.	A	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	74582025	.	G	C	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
17	74716759	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	74728082	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	74728938	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	74730843	.	T	C	1997.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2026,138,0
17	74732507	.	A	G	2074.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2103,150,0
17	74733099	.	G	A	1771.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,44:44:99:1800,132,0
17	74733403	.	G	A	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
17	74945155	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	74945157	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	74945947	.	T	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
17	75085260	.	C	G	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
17	75088462	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	75090826	.	A	G	35.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
17	75158337	.	A	G	721.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:750,51,0
17	75190846	.	A	C	165.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:194,15,0
17	75210574	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	75398498	.	C	T	1751.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1780,126,0
17	75424726	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	75478481	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
17	75478694	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	75479439	.	T	C	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
17	75479713	.	A	G	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
17	75479720	.	C	G	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:310,21,0
17	75480081	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
17	75480105	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
17	75480239	.	T	G	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
17	75480319	.	C	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
17	75481485	.	A	G	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
17	75481955	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	75482247	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
17	75482378	.	G	A	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
17	75482852	.	T	G	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
17	75483020	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	75484073	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	75485875	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	75486219	.	G	C	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
17	75488254	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	75489216	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	75489542	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:126,9,0
17	75489548	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:126,9,0
17	75489643	.	G	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	75491256	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	75494269	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	75494705	.	A	G	1275.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1304,93,0
17	75494746	.	A	G	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:639,48,0
17	75494780	.	A	T	522.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:38:551,38,0
17	75495065	.	T	C	1643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1672,114,0
17	75495397	.	T	C	1505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.091;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.182	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,37:38:72:1534,72,0
17	75495840	.	T	C	1722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1751,123,0
17	75496342	.	T	C	1190.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1219,84,0
17	75496361	.	A	G	1295.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1324,93,0
17	76106972	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
17	76117361	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	76117971	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	76121558	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	76165048	.	G	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
17	76165074	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	76169116	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
17	76170735	.	C	T	1507.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1536,111,0
17	76172104	.	T	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	76173175	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	76175824	.	C	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	76178037	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	76178748	.	T	C	2075.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2104,150,0
17	76183043	.	A	G	1216.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1245,87,0
17	76189675	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	76203600	.	T	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
17	76215597	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	76219591	.	G	A	1215.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1244,87,0
17	76220145	.	G	T	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=24.18;ReadPosRankSum=-1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:66:270,0,66
17	76220206	.	T	C	1316.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1345,93,0
17	76220718	.	C	T	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-1.467;DP=22;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:291,0,534
17	76221370	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
17	76221462	.	C	T	77.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:7:105,7,0
17	76353793	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	76353910	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	76417516	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
17	76417883	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	76420373	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	76424348	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	76970879	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:355,27,0
17	77079884	.	G	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
17	77753442	.	G	A	159.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:188,15,0
17	77754073	.	C	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
17	77754778	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	77754779	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	77760470	.	C	T	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
17	77768443	.	C	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,115
17	77792279	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	77809823	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	77809998	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	77855113	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	77906736	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
17	77906892	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	77907009	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	77907696	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	77908321	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	77908532	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
17	77908865	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	77909085	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	77909438	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	77909626	.	G	A	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
17	77910046	.	G	A	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:342,27,0
17	77910156	.	C	T	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
17	77910257	.	A	C	463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:492,33,0
17	77910262	.	C	G	463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:492,33,0
17	77910297	.	A	G	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
17	77910313	.	T	C	717.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:746,51,0
17	77910716	.	T	C	133.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,4:5:6:161,6,0
17	77910932	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
17	77910974	.	T	G	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
17	77911605	.	T	C	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
17	77912051	.	C	G	459.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:488,36,0
17	77914561	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
17	77984141	.	C	T	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
17	78012936	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	78012939	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	78013724	.	G	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
17	78015681	.	T	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	78017801	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	78171944	.	G	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
17	78175483	.	T	C	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
17	78178170	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	78178182	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	78178189	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
17	78178830	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	78178893	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
17	78181592	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	78182375	.	T	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
17	78184993	.	T	C	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
17	78185105	.	T	C	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
17	78185527	.	T	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
17	78185642	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
17	78187884	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
17	78188963	.	G	A	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
17	78197805	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	78219628	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	78223096	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:83,6,0
17	78223103	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	78223238	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	78223303	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	78226801	.	C	A	582.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:611,45,0
17	78227090	.	A	T	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:146,0,153
17	78290310	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	78293469	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	78293641	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	78298938	.	A	G	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
17	78302157	.	C	A	356.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:385,27,0
17	78305871	.	G	A	428.31	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=32.79;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,11:12:1:454,1,0
17	78306102	.	G	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
17	78306280	.	A	G	677.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:706,51,0
17	78306308	.	C	G	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:704,51,0
17	78311508	.	G	A	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:792,57,0
17	78319136	.	G	A	734.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:763,54,0
17	78319380	.	G	C	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
17	78321171	.	C	T	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:172,0,256
17	78321444	.	C	G	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:200,0,382
17	78327358	.	G	A	847.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:876,63,0
17	78335056	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	78339009	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	78354661	.	C	T	770.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:799,57,0
17	78365895	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	78390195	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
17	78392391	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	78410522	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	78518780	.	C	T	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
17	78820329	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
17	78865546	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
17	78938204	.	G	C	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
17	78939414	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
17	78973474	.	T	C	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
17	78973768	.	T	C	366.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:395,30,0
17	78973901	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	78974165	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	79009061	.	C	T	782.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:811,57,0
17	79066007	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	79082862	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	79084072	.	T	G	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
17	79085335	.	C	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
17	79087537	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
17	79170576	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
17	79173224	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	79196604	.	T	A	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
17	79202455	.	C	T	371.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:400,27,0
17	79202465	.	A	G	371.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:400,27,0
17	79205736	.	G	A	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
17	79208604	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	79215574	.	C	T	131.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:160,15,0
17	79222834	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	79268733	.	T	C	292.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:321,24,0
17	79285991	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	79301831	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	79313267	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	79319618	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	79363851	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	79364251	.	G	A	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
17	79364300	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	79365166	.	A	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
17	79369827	.	A	C	73.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:101,9,0
17	79370700	.	C	G	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
17	79409189	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	79419025	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
17	79424516	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	79431843	.	G	A	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
17	79432429	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	79433106	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	79478007	.	G	A	3026.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=-0.688;DP=73;FS=3.318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=29.52;ReadPosRankSum=1.685	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,72:73:99:3055,183,0
17	79478019	.	G	A	2928.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.635;DP=71;FS=3.327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=28.19;ReadPosRankSum=1.488	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,70:71:99:2957,172,0
17	79479469	.	A	C	247.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:276,21,0
17	79479808	.	C	T	740.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:769,57,0
17	79494851	.	G	A	165.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:194,15,0
17	79499884	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	79505420	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	79505768	.	A	G	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
17	79505883	.	T	G	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
17	79506626	.	G	A	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
17	79506761	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	79506811	.	A	G	161.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:190,15,0
17	79506890	.	T	C	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
17	79507170	.	T	C	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
17	79508263	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
17	79508400	.	T	C	890.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:919,66,0
17	79508484	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
17	79508506	.	G	T	184.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:213,18,0
17	79508732	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	79511135	.	A	G	523.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:552,39,0
17	79513126	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	79514129	.	G	A	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:614,45,0
17	79514832	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	79515075	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
17	79515509	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
17	79515660	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	79524790	.	T	A	1134.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1163,81,0
17	79525118	.	T	G	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
17	79525862	.	A	G	1194.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1223,84,0
17	79525948	.	G	C	1093.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1122,81,0
17	79526402	.	G	C	1568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1597,111,0
17	79527500	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	79527611	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=5.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.888	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:51:51,0,906
17	79527621	.	T	C	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:51:51,0,906
17	79527624	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=2.07;ReadPosRankSum=-2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:53:53,0,577
17	79527657	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,277
17	79528211	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,151
17	79528824	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,225
17	79529136	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
17	79529558	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:102,0,232
17	79529950	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,146
17	79530985	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,274
17	79531020	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,261
17	79531050	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,226
17	79539073	.	C	A	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1375,101,0
17	79580457	.	C	A	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:989,69,0
17	79617788	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	79622899	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	79632363	.	C	T	1098.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.743;DP=28;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.495	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:44:1127,44,0
17	79634033	.	C	T	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
17	79635511	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
17	79637349	.	T	C	974.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:1003,69,0
17	79637367	.	C	G	1159.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1188,84,0
17	79638447	.	T	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	79639310	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	79639550	.	G	A	1182.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1211,84,0
17	79639708	.	C	T	911.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:940,66,0
17	79639874	.	G	C	872.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:901,66,0
17	79640049	.	A	C	1214.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1243,87,0
17	79640219	.	A	G	762.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:791,57,0
17	79640563	.	G	A	836.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:865,63,0
17	79644204	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	79644312	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	79648527	.	A	G	760.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:789,54,0
17	79649561	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	79652149	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
17	79652165	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	79652265	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	79652487	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
17	79653259	.	C	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
17	79659342	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	79659427	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	79659627	.	G	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
17	79662067	.	A	G	1006.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1035,75,0
17	79662749	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	79663880	.	T	C	1029.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1058,75,0
17	79663931	.	T	C	1185.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1214,84,0
17	79664426	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:176,12,0
17	79664443	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:176,12,0
17	79666512	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
17	79668135	.	G	T	1207.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1236,90,0
17	79668226	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	79668552	.	C	T	1419.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1448,108,0
17	79668664	.	C	T	1223.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1252,90,0
17	79670273	.	T	C	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
17	79671714	.	T	C	2628.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2657,184,0
17	79675868	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	79676011	.	C	G	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
17	79677251	.	T	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
17	79677583	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	79677750	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
17	79677817	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
17	79679848	.	G	C	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
17	79680353	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
17	79680674	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	79681370	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	79682558	.	T	C	1369.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1398,99,0
17	79685586	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,240
17	79686552	.	G	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
17	79686665	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	79687218	.	G	A	2192.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2221,163,0
17	79687687	.	G	A	1457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1486,105,0
17	79687853	.	C	A	1235.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:94:1264,94,0
17	79688396	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	79767921	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	79780692	.	T	C	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.039;DP=36;FS=4.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.879	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,7:36:99:196,0,1083
17	79781023	.	G	A	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.639;DP=34;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.809	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,7:34:99:200,0,1064
17	79787383	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	79814623	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,234
17	79816926	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	79819166	.	G	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	79821966	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	79825897	.	A	G	2206.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2235,160,0
17	79845850	.	G	A	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:166,0,204
17	79864084	.	G	A	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:46:46,0,423
17	79872129	.	A	G	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
17	79872241	.	A	G	1293.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1322,96,0
17	79872929	.	C	T	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
17	79878742	.	G	A	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
17	79879861	.	A	C	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
17	79891147	.	T	C	2469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2498,178,0
17	79892314	.	C	A	58.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-0.065;DP=57;FS=15.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,6:57:87:87,0,2042
17	79893962	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	79935459	.	C	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,134
17	79935941	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	79954544	.	T	A	903.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:68:932,68,0
17	79958142	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	79958532	.	G	A	46.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:75,0,24
17	79959703	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	79961140	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
17	79961177	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:73,0,37
17	79971290	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
17	80006825	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
17	80008676	.	A	C	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
17	80013235	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	80016452	.	C	A	477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:506,39,0
17	80017898	.	G	A	3017.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3046,214,0
17	80051183	.	A	G	2922.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:2951,214,0
17	80052073	.	A	G	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
17	80053166	.	C	T	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
17	80054375	.	C	A	153.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:17:182,17,0
17	80055325	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
17	80056066	.	A	G	1755.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1784,129,0
17	80058857	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	80058901	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	80059011	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	80059332	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	80059596	.	T	C	1390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1419,108,0
17	80059758	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	80063004	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80066714	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
17	80068129	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
17	80072049	.	A	G	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
17	80074316	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	80074516	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80077850	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	80080047	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	80082886	.	T	C	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
17	80083524	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
17	80083527	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
17	80083534	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	80083807	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80083809	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80083816	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80085633	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
17	80085703	.	G	T	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
17	80086386	.	C	T	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:39:585,39,0
17	80086389	.	C	T	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:585,39,0
17	80086395	.	T	C	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:39:585,39,0
17	80100928	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	80107822	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	80110159	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	80110255	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
17	80111392	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	80111895	.	G	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
17	80205713	.	A	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:479,33,0
17	80279891	.	G	A	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
17	80293136	.	A	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:67,0,37
17	80293425	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,114
17	80297396	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,162
17	80347528	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,107
17	80356187	.	G	A	503.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:532,36,0
17	80404326	.	G	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
17	80407950	.	G	T	190.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:219,18,0
17	80447648	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:60:60,0,200
17	80477649	.	C	G	56.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:84,9,0
17	80484953	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80529972	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	80530134	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	80530279	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	80530347	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	80545076	.	A	G	1335.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1364,93,0
17	80545156	.	A	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
17	80545327	.	T	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
17	80546876	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
17	80548043	.	G	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
17	80551319	.	T	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
17	80552712	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,154
17	80552796	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,261
17	80552802	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,228
17	80552817	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,273
17	80553059	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
17	80553220	.	C	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
17	80553399	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
17	80554788	.	C	A	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
17	80555477	.	T	C	149.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:178,15,0
17	80556236	.	G	A	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
17	80559272	.	C	T	1234.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1263,90,0
17	80560307	.	A	T	883.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:912,63,0
17	80560421	.	T	C	812.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:841,60,0
17	80560500	.	G	T	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:411,33,0
17	80561324	.	T	C	633.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:662,45,0
17	80561616	.	C	T	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
17	80561753	.	G	A	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
17	80562265	.	A	T	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:559,39,0
17	80572628	.	A	G	1043.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1072,75,0
17	80573272	.	A	G	1631.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1660,117,0
17	80574082	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80574090	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80574315	.	G	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	80585033	.	T	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	80586111	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
17	80588575	.	C	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
17	80615040	.	A	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
17	80615290	.	C	T	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
17	80619080	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80674643	.	C	G	681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:710,51,0
17	80683759	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
17	80684784	.	G	A	1199.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1228,87,0
17	80685126	.	T	C	1247.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1276,90,0
17	80685426	.	A	G	1694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1723,120,0
17	80685655	.	A	G	1126.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:78:1155,78,0
17	80685660	.	G	A	1126.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:78:1155,78,0
17	80687971	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	80695538	.	G	A	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
17	80696133	.	A	G	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
17	80696410	.	A	C	1083.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1112,78,0
17	80708607	.	C	T	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
17	80780507	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	80788465	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	80788492	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
17	80796236	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	80833377	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	80863857	.	T	C	1099.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1128,78,0
17	80866427	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
17	80866729	.	G	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
17	80873674	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
17	80873798	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
17	80874102	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	80875626	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
17	80875839	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
17	80876180	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80876280	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
17	80876413	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
17	80877112	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	80877120	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
17	80877432	.	T	A	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
17	80887451	.	A	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
17	80888164	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
17	80890638	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
17	80891135	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
17	80895933	.	A	G	1560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1589,108,0
17	80899281	.	G	A	1543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1572,108,0
17	80901002	.	C	T	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
17	80901036	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
17	80901750	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
17	80904844	.	C	T	108.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:13:137,0,13
17	80908110	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
17	80908501	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
17	80910061	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
17	80923156	.	C	G	53.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
17	80969550	.	G	A	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
17	80992932	.	A	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
17	81037715	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
17	81043039	.	A	G	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
18	112535	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	115408	.	G	T	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
18	158915	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	158917	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	198057	.	C	T	387.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.909;DP=52;FS=6.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.338	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,13:52:99:416,0,1552
18	208222	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	211865	.	G	A	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=14.29;ReadPosRankSum=2.140	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,10:23:99:357,0,460
18	212756	.	A	C	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
18	252559	.	G	A	750.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:779,60,0
18	260140	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	261903	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	272770	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	319935	.	T	C	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:136,0,311
18	334758	.	T	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
18	334994	.	A	G	360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:389,30,0
18	400133	.	C	T	348.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:377,27,0
18	675787	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
18	690734	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:72:72,0,182
18	692402	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:76,0,75
18	692561	.	T	C	170.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:199,0,22
18	708710	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
18	709232	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	711559	.	G	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
18	712037	.	G	A	89.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:21:118,0,21
18	722308	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.630;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:96:96,0,815
18	722402	.	T	C	230.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.461	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:259,0,188
18	724612	.	A	G	1141.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1170,81,0
18	1509191	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
18	1566468	.	G	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,106
18	1649767	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	1658064	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
18	1836235	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	2539016	.	C	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
18	2547500	.	G	T	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
18	2571196	.	T	G	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:149,0,195
18	2571233	.	T	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=32.79;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:91:185,0,91
18	2571241	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:91:185,0,91
18	2571253	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:70:190,0,70
18	2616457	.	G	C	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.857;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.939	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:373,0,343
18	2656248	.	G	C	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
18	2707619	.	G	A	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:268,0,147
18	2712967	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	2736762	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	2740714	.	A	G	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.295;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:214,0,341
18	2750477	.	A	G	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.78;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:59:306,0,59
18	2778382	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	2800915	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	2917152	.	T	C	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
18	2919606	.	A	T	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
18	3248264	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,182
18	3251992	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	3251994	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	3252731	.	T	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
18	3252899	.	A	G	76.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:104,9,0
18	3252924	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:67,0,28
18	3253048	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	3254460	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	3256112	.	A	G	913.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.217;DP=39;FS=17.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.419	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,24:39:99:942,0,554
18	3262193	.	T	C	568.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=-1.556;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,17:50:99:597,0,1258
18	3262472	.	G	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
18	3262490	.	A	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
18	3265232	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	3270764	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	3276398	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	3294785	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
18	3450465	.	C	G	53.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.092;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:82:82,0,1026
18	5238208	.	C	T	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
18	5238412	.	C	A	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:131,0,152
18	5238442	.	G	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
18	5238828	.	C	T	195.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:20:224,0,20
18	5239319	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	5241755	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
18	5244173	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
18	5290174	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
18	5290198	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
18	5290282	.	A	G	207.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:236,18,0
18	5292030	.	A	G	284.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:313,21,0
18	8069868	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:69,0,28
18	8611363	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	8630950	.	G	A	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,79
18	8632196	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,289
18	8632197	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,289
18	8638029	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:75,0,30
18	8784612	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	8811971	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	8825192	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:120,0,71
18	8826083	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	9103764	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	9109484	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	9110316	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	9117867	.	T	C	1753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1782,126,0
18	9132371	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	9135887	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
18	9255982	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
18	9399821	.	G	A	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,9:16:99:323,0,250
18	9399830	.	C	T	720.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:51:749,51,0
18	9400422	.	T	C	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=2.051;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.79;ReadPosRankSum=-2.051	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:404,0,326
18	9400575	.	T	A	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
18	9400701	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.962;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:120,0,527
18	9401746	.	C	A	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-1.333;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:183,0,339
18	9402174	.	A	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:53:53,0,331
18	9536249	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:69:78,0,69
18	9536251	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
18	9536315	.	C	A	280.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:309,24,0
18	9536691	.	G	A	420.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.366;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:449,0,563
18	9537835	.	G	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:74,0,70
18	9562042	.	C	T	558.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.268;DP=30;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,16:30:99:587,0,512
18	9914910	.	C	G	97.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:125,12,0
18	9955849	.	T	C	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.073;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:230,0,219
18	9955960	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
18	10727804	.	T	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	10727908	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	11852182	.	C	T	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=-0.098;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,10:33:99:333,0,910
18	11853053	.	A	G	625.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:654,45,0
18	11853731	.	A	G	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
18	11884670	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
18	12012738	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	12013182	.	A	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:77,0,76
18	12028247	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,356
18	12028249	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,356
18	12028580	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:40:78,0,40
18	12031270	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
18	12031271	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
18	12308243	.	T	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	12308245	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	12318452	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	12331306	.	C	T	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:121,0,25
18	12348285	.	T	C	1946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1975,135,0
18	12351342	.	C	T	1673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1702,123,0
18	12424702	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	12431210	.	A	G	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
18	12431342	.	C	A	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
18	12431428	.	A	G	447.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:476,33,0
18	12431506	.	T	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
18	12447303	.	C	A	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.367;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:265,0,181
18	12448430	.	C	A	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:210,0,341
18	12492074	.	G	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
18	12658045	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:142,0,72
18	12670956	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
18	12672512	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	12702705	.	G	C	85.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:16:114,0,16
18	12703067	.	A	G	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.880;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,10:21:99:356,0,421
18	12718593	.	A	G	676.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.027;DP=40;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:705,0,787
18	12722888	.	C	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
18	12787247	.	T	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
18	12788787	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
18	12789556	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:54:116,0,54
18	12789645	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
18	12820137	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
18	12832918	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	12832919	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	12984144	.	C	A	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:909,63,0
18	12985600	.	A	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
18	12986000	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	12991393	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
18	12998929	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	13001512	.	G	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
18	13001523	.	G	A	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
18	13056333	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
18	13056495	.	G	A	78.96	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.79;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:5:106,0,5
18	13068132	.	T	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
18	13069782	.	C	T	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
18	13095609	.	T	C	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
18	13116432	.	G	T	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
18	13127442	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
18	13493086	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	13665589	.	A	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
18	13665686	.	A	C	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
18	13666156	.	A	G	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:818,60,0
18	13667040	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	13745167	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	13754720	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
18	13756604	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
18	13759816	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	13759820	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	13760290	.	T	C	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.89;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:236,0,179
18	13760954	.	T	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.133;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:147,0,189
18	13761926	.	G	T	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.749	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:175,0,224
18	13762011	.	C	A	336.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:365,27,0
18	13763114	.	T	C	334.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:363,0,166
18	13763204	.	C	T	404.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-2.475;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=16.19;ReadPosRankSum=2.366	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:433,0,456
18	13763638	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,157
18	13763653	.	G	A	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
18	13764016	.	A	T	543.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.855;ClippingRankSum=-1.244;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.391	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,15:27:99:572,0,392
18	14105016	.	C	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
18	14730419	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
18	14730566	.	G	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
18	14735785	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	14735786	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	14767225	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	14848820	.	C	T	339.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:368,27,0
18	14860853	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	14931868	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	14931873	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	14931874	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	14937620	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	15403439	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	19153494	.	C	T	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
18	19446993	.	G	C	497.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:526,36,0
18	19448174	.	G	A	720.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:749,51,0
18	19780858	.	G	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
18	20478677	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	20577669	.	G	A	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.582;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:348,0,584
18	20715521	.	T	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:109,0,33
18	20803125	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	20873871	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	20873880	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	20877468	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,228
18	20953720	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
18	21049202	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	21057450	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	21100240	.	C	T	605.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:634,45,0
18	21101456	.	C	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	21103909	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	21109250	.	T	C	613.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:642,48,0
18	21112608	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:57:57,0,116
18	21120444	.	T	C	763.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:792,54,0
18	21124945	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
18	21140432	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,238
18	21534701	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	21534703	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	21710321	.	C	T	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
18	21714791	.	C	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
18	21714934	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
18	21715084	.	A	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
18	21715162	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
18	21734836	.	A	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
18	21740353	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
18	21740878	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	21740923	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	22020543	.	C	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:232,0,177
18	23597811	.	T	C	1187.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1216,84,0
18	23598160	.	A	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.253	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:267,0,485
18	23617858	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
18	23749166	.	A	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,112
18	23749607	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
18	23873463	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:120,0,28
18	24035399	.	A	G	542.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:571,39,0
18	24119079	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	24125684	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
18	24125857	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	24125865	.	C	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	24129577	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	25032551	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	25032562	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	25032568	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	28640424	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	28641158	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	28673565	.	T	C	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.194;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:221,0,302
18	28681939	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,395
18	29104698	.	C	T	362.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.876;DP=29;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:391,0,717
18	29126592	.	C	T	315.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.038;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:344,0,350
18	29126670	.	T	C	362.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=2.112;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:391,0,588
18	29128045	.	G	A	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:103,0,282
18	29128572	.	T	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:98:98,0,336
18	29305268	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	29306169	.	C	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:75:123,0,75
18	29306178	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:75:123,0,75
18	29410479	.	T	A	146.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:175,0,398
18	29487567	.	C	A	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-0.361;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:195,0,143
18	29497573	.	A	G	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
18	29511455	.	G	T	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=1.408;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:217,0,193
18	29711261	.	A	C	292.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:321,0,19
18	32720601	.	G	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
18	32821141	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	32822382	.	G	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
18	32823015	.	T	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:58,0,37
18	32823757	.	A	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
18	32823905	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	32824285	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	32826088	.	A	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
18	32826636	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	32826661	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	32827221	.	A	G	419.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:448,33,0
18	32829253	.	G	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,278
18	32831386	.	G	A	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
18	32832583	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
18	32843189	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	32863518	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	32886720	.	C	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:143,0,224
18	32887914	.	A	G	209.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:238,18,0
18	32887933	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
18	32888090	.	C	A	33.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=5;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:13:62,0,13
18	32888546	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	32916219	.	A	G	1310.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1339,90,0
18	32917644	.	T	C	931.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:960,66,0
18	32918398	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
18	32918639	.	G	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
18	32921195	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
18	32922402	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	32923824	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	32924410	.	G	A	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
18	33048554	.	C	T	547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:576,42,0
18	33578439	.	T	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
18	33647254	.	A	C	1104.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1133,81,0
18	33694120	.	G	A	564.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=1.337;DP=48;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=11.77;ReadPosRankSum=-1.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,17:48:99:593,0,1203
18	33706614	.	C	G	2005.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2034,141,0
18	33709217	.	G	A	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.591;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.540	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:292,0,675
18	33718326	.	A	C	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=1.775;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.775	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:87:87,0,388
18	33725931	.	G	A	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=-1.868;DP=24;FS=21.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,8:24:99:254,0,619
18	33744677	.	T	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:94:94,0,157
18	33744766	.	T	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
18	33744951	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
18	33748206	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	33749871	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
18	33750046	.	C	T	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-1.096;DP=19;FS=8.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=9.04;ReadPosRankSum=-1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:200,0,518
18	33750155	.	C	G	394.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-1.197;DP=21;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.619	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:423,0,287
18	33755573	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
18	33757050	.	G	A	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
18	33759017	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:120,0,34
18	33760150	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:107,0,185
18	33779821	.	C	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
18	33779855	.	C	T	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
18	33779896	.	A	G	216.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,6:7:11:244,11,0
18	33780020	.	A	G	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
18	33785093	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
18	33785185	.	A	G	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
18	33831189	.	C	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:109,0,153
18	33848581	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-2.017;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:155,0,142
18	33849868	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	34324091	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	34375487	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	34376565	.	C	T	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=-1.312;DP=30;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:313,0,824
18	34378022	.	G	A	86.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:115,0,24
18	34398914	.	C	T	1153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-1.373;DP=44;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,30:44:99:1182,0,451
18	34408969	.	C	G	34.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
18	36060702	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	36060703	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	36060707	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	37380133	.	C	T	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
18	42533130	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
18	43184458	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	43187560	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	43190600	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	43322024	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	43323903	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	43380836	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,78
18	43432292	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,104
18	43481075	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:104,0,190
18	43490602	.	G	A	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-1.408;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.186	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:153,0,227
18	43497716	.	G	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:136,0,267
18	43652203	.	G	A	121.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:150,0,25
18	43672929	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	43678035	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
18	43802169	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	43843736	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	43844658	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
18	43844734	.	T	G	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:196,0,27
18	43845177	.	A	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.185	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:92:92,0,353
18	43845269	.	C	T	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
18	44391821	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,122
18	44396246	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
18	44584658	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	44635048	.	C	T	586.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:615,42,0
18	44671127	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
18	44682023	.	A	G	421.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=28.12;ReadPosRankSum=0.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:89:450,0,89
18	45367484	.	A	G	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:355,27,0
18	45553818	.	G	T	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.512;DP=22;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.877;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:270,0,533
18	45711740	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
18	46284587	.	T	C	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
18	46284611	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:93:93,0,303
18	46285145	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
18	46286390	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	46385948	.	A	G	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:357,27,0
18	46387889	.	A	G	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
18	46388853	.	C	T	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:105,0,74
18	46389411	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:118,0,71
18	46447617	.	A	G	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:91:131,0,91
18	46477521	.	A	C	255.74	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:6:283,0,6
18	46478020	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,105
18	46564313	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	46568690	.	C	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,68
18	46915978	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
18	47015320	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
18	47340292	.	G	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:116,0,30
18	47350601	.	T	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
18	47351862	.	C	T	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,295
18	47352533	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,159
18	47385799	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	47416413	.	G	A	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
18	47455923	.	C	T	950.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.333;DP=26;FS=3.736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=32.15;ReadPosRankSum=1.600	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:48:979,48,0
18	47563299	.	T	C	1147.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1176,81,0
18	47566647	.	A	G	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.668;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=10.66;ReadPosRankSum=0.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,11:33:99:380,0,848
18	47793434	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:59:156,0,59
18	47795629	.	C	A	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
18	47798812	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:79,0,30
18	47800179	.	G	C	358.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-2.546;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=23.92;ReadPosRankSum=2.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:387,0,106
18	47810351	.	A	G	805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:834,57,0
18	47811875	.	A	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
18	47901516	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
18	47911438	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
18	48405479	.	C	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:219,15,0
18	48405481	.	C	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:219,15,0
18	48405489	.	T	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
18	48552453	.	G	A	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
18	48554169	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	48577091	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
18	48579646	.	G	A	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
18	48609968	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
18	48610831	.	A	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
18	48723217	.	C	T	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:335,24,0
18	51680221	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	51797231	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:120,0,66
18	51797332	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,117
18	51820805	.	G	A	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
18	52557242	.	C	T	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:42:617,42,0
18	52557248	.	G	A	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:42:617,42,0
18	52557316	.	T	C	987.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1016,72,0
18	52558243	.	T	G	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:252,0,184
18	52558666	.	G	A	585.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:614,45,0
18	52559294	.	G	A	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-1.317;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.220	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:241,0,375
18	52559460	.	C	A	34.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.320;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.411	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:63:63,0,771
18	52560493	.	G	T	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:529,36,0
18	52561009	.	C	A	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
18	52561446	.	A	G	840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:869,63,0
18	54270044	.	A	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
18	54448778	.	G	A	277.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:306,24,0
18	54694550	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:65:114,0,65
18	54696407	.	T	C	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
18	55144432	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	55145377	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
18	55145765	.	G	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
18	55145906	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
18	55146453	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	55146682	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	55146845	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	55149010	.	A	G	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
18	55149707	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	55149769	.	G	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
18	55152973	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,152
18	55155380	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
18	55156135	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	55221648	.	T	C	1109.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1138,81,0
18	55240455	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	55240505	.	C	T	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=2.147;DP=24;FS=10.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.87;ReadPosRankSum=-2.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,9:24:99:313,0,559
18	55258243	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
18	55268486	.	A	C	1346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1375,93,0
18	55269777	.	G	A	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:98,0,65
18	55274159	.	T	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
18	55289076	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:63:109,0,63
18	55313997	.	C	T	725.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.995;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.706;QD=30.24;ReadPosRankSum=-0.995	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,19:24:99:754,0,153
18	55314211	.	T	C	745.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=-1.386;DP=30;FS=8.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,20:30:99:774,0,305
18	55314820	.	C	A	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.162;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=24.26;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,17:26:99:659,0,325
18	55316084	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	55317676	.	C	T	1598.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1627,119,0
18	55322502	.	C	T	707.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-1.082;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=25.28;ReadPosRankSum=1.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:736,0,312
18	55326040	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	55331356	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	55333745	.	A	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
18	55362532	.	T	G	1438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1467,105,0
18	55470310	.	G	A	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:218,0,432
18	55711618	.	T	G	318.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:347,27,0
18	55711867	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.057;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:107,0,444
18	55712639	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
18	55714622	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	55760115	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	55760132	.	C	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
18	56004003	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:74,0,68
18	56004036	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:77,0,34
18	56006316	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:121,0,32
18	56066416	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
18	56067045	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
18	56587311	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	59319631	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	59478110	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	59480576	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	59483508	.	G	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:71:81,0,71
18	59483514	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:71:81,0,71
18	59714756	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
18	59768375	.	A	G	487.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-1.646;DP=18;FS=9.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.389;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:516,0,114
18	59774037	.	C	T	356.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=-0.416;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:385,0,357
18	59780393	.	T	A	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:254,0,440
18	59780424	.	A	G	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=1.122;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.87;ReadPosRankSum=2.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:383,0,236
18	59810563	.	A	G	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=15.12;ReadPosRankSum=-2.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:255,0,296
18	59814268	.	G	A	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.201	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:268,0,255
18	59814324	.	G	C	747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:776,54,0
18	59854886	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,138
18	59898482	.	G	A	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.065;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:219,0,279
18	59942707	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,165
18	59942709	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,165
18	59946568	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
18	59947118	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	59973693	.	G	C	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:162,0,67
18	60189815	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	60191428	.	G	A	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
18	60192428	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	60203227	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	60231851	.	A	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:334,27,0
18	60244856	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
18	60642814	.	G	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:87:187,0,87
18	60794654	.	C	T	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
18	60983961	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
18	60986549	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
18	60995261	.	G	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
18	60995525	.	C	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,282
18	61022791	.	C	T	229.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:258,0,219
18	61171679	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	66356095	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
18	67992279	.	G	A	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:172,0,223
18	67996410	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:73,0,35
18	68015376	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	71823296	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	71825719	.	A	G	726.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-3.873;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=27.95;ReadPosRankSum=3.815	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,19:26:99:755,0,203
18	71825961	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,157
18	71923723	.	A	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
18	71925567	.	G	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:105,0,31
18	71926100	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
18	71929542	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	71959075	.	G	A	1073.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.468;DP=56;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.440;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,30:56:99:1102,0,907
18	72185238	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	72187612	.	C	T	1515.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1544,108,0
18	72188251	.	C	T	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:855,57,0
18	72188252	.	A	G	826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:855,57,0
18	72260158	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
18	72260399	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
18	72260569	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
18	72260704	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
18	72263680	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	72263799	.	G	C	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
18	72264397	.	A	C	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:309,21,0
18	72264406	.	A	G	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:309,21,0
18	72264473	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
18	72265649	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	72343008	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	72344223	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
18	72345890	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	72776121	.	G	A	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
18	72776666	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	72909321	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	72909505	.	C	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
18	72909795	.	T	C	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:479,33,0
18	72910687	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	72910994	.	C	A	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
18	72912469	.	C	T	805.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:834,57,0
18	72914280	.	G	A	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:770,57,0
18	72915939	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	72915964	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
18	72923288	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,115
18	72923346	.	C	A	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:165,0,31
18	74532424	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
18	74532425	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
18	74611127	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
18	74671768	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,309
18	74680208	.	C	T	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:180,0,171
18	74680259	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
18	74680369	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
18	74680470	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
18	74680653	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
18	74680756	.	C	T	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
18	74725069	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	74844599	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	76873288	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,102
18	77067183	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
18	77126279	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
18	77128145	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
18	77129563	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	77132016	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
18	77132090	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	77138035	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	77170542	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
18	77227476	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
18	77246406	.	T	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
18	77437805	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
18	77437993	.	A	G	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
18	77438688	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	77438956	.	A	G	104.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:10:132,10,0
18	77439258	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	77440128	.	T	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
18	77473086	.	G	A	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:263,0,286
18	77474921	.	G	A	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:174,0,297
18	77491454	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
18	77493028	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
18	77494328	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	77513721	.	T	C	734.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:763,57,0
18	77514333	.	G	A	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=24.60;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:60:225,0,60
18	77663394	.	G	A	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=21.20;ReadPosRankSum=-0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:431,0,222
18	77663863	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:95:95,0,302
18	77663896	.	A	G	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
18	77663940	.	G	A	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=2.205;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:218,0,207
18	77728045	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
18	77728135	.	G	T	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:520,39,0
18	77728221	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
18	77729549	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	77730197	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
18	77733273	.	C	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
18	77736735	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
18	77737397	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
18	77738025	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	77745640	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
18	77746623	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
18	77748525	.	A	C	908.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:937,66,0
18	77795232	.	A	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:161,0,31
18	77795985	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
18	77796239	.	G	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
18	77796386	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
18	77796574	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
18	77797321	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
18	77798033	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
18	77805856	.	A	C	487.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.180;DP=26;FS=9.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:516,0,447
18	77805949	.	A	C	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.317;DP=32;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.397	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,11:32:99:373,0,804
18	77806509	.	A	G	79.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
18	77807211	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,152
18	77807228	.	C	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,112
18	77808712	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
18	77809003	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	77813395	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	77818479	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:66,0,37
18	77818865	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
18	77824850	.	C	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
18	77827475	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
18	77830659	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
18	77838970	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
18	77867319	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,118
18	77891039	.	T	A	262.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.21;ReadPosRankSum=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:291,0,154
18	77893683	.	A	G	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.022	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:379,0,273
18	77894416	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:53:53,0,387
18	77894844	.	G	A	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:252,0,182
18	77895192	.	G	A	399.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=-1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.811	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:428,0,191
18	77897584	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.774;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.157	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:135,0,345
18	77897605	.	G	A	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:87:87,0,315
18	77897719	.	C	G	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:498,36,0
18	77910899	.	G	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
18	77912269	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
18	77915698	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
18	77916382	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,159
18	77916478	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:53:65,0,53
18	77917264	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
18	77924271	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
18	77927112	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
18	77927866	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	77927876	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
18	77937866	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
18	77937877	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
18	77951053	.	G	A	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:116,0,33
19	246048	.	C	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	302350	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	302351	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	416664	.	C	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
19	417014	.	A	C	722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:751,54,0
19	422238	.	G	T	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
19	422625	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
19	440655	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	441111	.	T	C	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
19	441163	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	441195	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	441718	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
19	453105	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	453127	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	456440	.	C	T	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
19	457789	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	536681	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	537694	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	538930	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	538994	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	539250	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	539266	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	539812	.	C	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
19	539817	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:261,18,0
19	541685	.	C	T	1053.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1082,78,0
19	567467	.	A	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
19	603832	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	613307	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
19	613898	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	614967	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	622336	.	T	G	129.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
19	649110	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	656701	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	680378	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	680845	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	683221	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
19	731144	.	A	G	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:464,36,0
19	748084	.	A	G	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
19	757241	.	G	A	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:909,63,0
19	803220	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	810479	.	G	A	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
19	811991	.	C	T	1260.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1289,90,0
19	871970	.	C	G	419.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.196;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:448,0,129
19	880066	.	G	A	903.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:932,66,0
19	885818	.	A	G	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.208;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.069	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,24:25:52:989,52,0
19	896644	.	C	G	679.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=30.90;ReadPosRankSum=-0.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,18:22:74:708,0,74
19	896740	.	C	G	749.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:778,54,0
19	897215	.	C	T	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:848,60,0
19	899444	.	C	T	1014.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1043,72,0
19	901026	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	929678	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	929753	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	965043	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	971933	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	971949	.	G	A	98.37	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	975405	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	984533	.	T	C	863.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:892,63,0
19	984554	.	C	G	775.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:804,57,0
19	990281	.	G	A	994.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1023,78,0
19	990394	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	993313	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	1009883	.	A	G	1212.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1241,90,0
19	1010691	.	A	G	1132.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1161,87,0
19	1012379	.	C	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
19	1012381	.	T	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
19	1012416	.	G	A	160.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
19	1014398	.	A	G	1350.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1379,96,0
19	1016718	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	1017782	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	1036444	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	1037986	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
19	1038222	.	C	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	1038445	.	C	T	422.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:451,33,0
19	1038862	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:133,9,0
19	1038871	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	1038893	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	1042809	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	1043103	.	G	A	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
19	1047002	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
19	1051214	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	1056492	.	G	C	239.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:268,21,0
19	1062598	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	1063443	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	1064193	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	1065018	.	G	T	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
19	1065044	.	C	T	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
19	1085966	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
19	1086314	.	T	C	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
19	1086352	.	C	A	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
19	1086787	.	C	T	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
19	1088078	.	G	T	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
19	1088285	.	T	C	1252.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1281,90,0
19	1088639	.	G	C	1947.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1976,138,0
19	1094004	.	G	A	1439.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1468,108,0
19	1095336	.	C	T	681.73	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:52:719,52,0
19	1106615	.	T	C	2991.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3020,211,0
19	1109213	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	1110829	.	G	A	1094.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1123,81,0
19	1113701	.	G	A	694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:723,54,0
19	1113976	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	1119019	.	C	T	1109.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1138,78,0
19	1119963	.	A	G	1153.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1182,81,0
19	1120272	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	1120329	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	1121780	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	1122147	.	G	A	985.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1014,72,0
19	1162930	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	1167158	.	A	G	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
19	1170823	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	1219129	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	1222316	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	1222443	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	1224286	.	G	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	1225054	.	T	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	1226004	.	C	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
19	1228191	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	1228974	.	A	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	1230137	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	1230677	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	1231142	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
19	1233597	.	G	A	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
19	1242048	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
19	1271274	.	C	T	52.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-4.514;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=0.93	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:49,8:57:81:81,0,5695
19	1271529	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=2.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	1272040	.	T	C	2424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2453,178,0
19	1274539	.	T	C	203.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:232,18,0
19	1274601	.	C	T	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:35:442,35,0
19	1275088	.	T	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	1275368	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	1275987	.	C	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	1277275	.	G	C	1300.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1329,96,0
19	1357082	.	T	C	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:531,36,0
19	1358726	.	C	T	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
19	1360575	.	G	A	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
19	1370675	.	C	G	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
19	1372441	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
19	1373755	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	1376198	.	C	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	1376723	.	G	A	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
19	1377158	.	C	T	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
19	1377173	.	A	G	192.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:221,18,0
19	1386889	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	1388538	.	C	T	1125.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.777;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=27.29;ReadPosRankSum=1.614	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,28:29:53:1154,53,0
19	1411165	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	1415875	.	C	T	114.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:142,12,0
19	1423199	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	1424888	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	1425448	.	C	T	295.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:324,24,0
19	1427260	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
19	1432577	.	A	C	59.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.920;ClippingRankSum=1.504;DP=32;FS=56.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,7:32:88:88,0,945
19	1433103	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	1434135	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
19	1434842	.	C	T	1850.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1879,147,0
19	1438865	.	C	T	2584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2613,192,0
19	1458177	.	G	A	241.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:270,0,18
19	1474800	.	C	T	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.194;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.249	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,7:27:99:216,0,737
19	1497731	.	G	A	370.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=30.90;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:51:399,0,51
19	1577609	.	T	C	1338.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1367,96,0
19	1587591	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,188
19	1587613	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,115
19	1589832	.	C	G	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:189,0,28
19	1590495	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:75,0,70
19	1612825	.	C	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,160
19	1638933	.	G	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	1642221	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	1643921	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	1801384	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	1801401	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	1821637	.	A	G	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:450,33,0
19	1824671	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	1837320	.	C	T	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	1848243	.	A	G	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
19	1853667	.	C	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
19	1854151	.	G	C	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
19	1876009	.	T	C	191.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:220,18,0
19	1877727	.	G	T	386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:415,30,0
19	1880372	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	1880950	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	1881919	.	A	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
19	1881920	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
19	1882762	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	1883433	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	1883654	.	G	A	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:440,33,0
19	1883951	.	T	C	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
19	1884552	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	1915118	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	1915988	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	1920289	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	1920342	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	1922599	.	T	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
19	1922939	.	C	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
19	1924653	.	C	A	795.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:824,60,0
19	1955703	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	1955721	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	1955725	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:84,6,0
19	1979386	.	C	T	1246.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1275,90,0
19	1981197	.	G	A	751.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:780,60,0
19	1985918	.	A	G	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:837,60,0
19	1987279	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	1989867	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	1990825	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	1997363	.	A	G	1495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1524,108,0
19	2037846	.	A	C	605.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,22:23:31:803,31,0
19	2038819	.	G	A	1398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1427,102,0
19	2042886	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	2050823	.	G	T	824.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:853,60,0
19	2109157	.	T	C	1162.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1191,81,0
19	2109812	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	2110746	.	G	A	1560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1589,111,0
19	2111649	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
19	2111661	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	2114175	.	T	C	858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:887,63,0
19	2116649	.	A	G	1446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1475,105,0
19	2118692	.	C	T	1563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1592,114,0
19	2136113	.	C	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	2136680	.	G	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	2151515	.	G	A	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
19	2198240	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	2241327	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	2246403	.	G	A	193.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.70;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:16:222,0,16
19	2249477	.	G	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	2271181	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	2271741	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	2324384	.	A	G	222.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:251,21,0
19	2324458	.	G	A	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	2324847	.	A	G	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
19	2325172	.	A	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
19	2325297	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	2325360	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	2326897	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	2326902	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	2328281	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
19	2336527	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	2336934	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	2337920	.	T	C	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
19	2338171	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	2338601	.	C	G	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
19	2339693	.	A	G	199.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:228,18,0
19	2339702	.	C	T	199.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:228,18,0
19	2341047	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	2341060	.	T	C	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
19	2342806	.	C	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
19	2343630	.	G	A	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
19	2352639	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	2353368	.	G	A	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:487,33,0
19	2353372	.	T	C	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:487,33,0
19	2353464	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2353466	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2353736	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
19	2419225	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	2423277	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2423279	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2425294	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	2426545	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	2426828	.	G	C	2052.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2081,153,0
19	2427737	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
19	2427815	.	A	G	445.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:474,33,0
19	2430232	.	T	C	712.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:741,51,0
19	2430637	.	C	G	1525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1554,108,0
19	2433890	.	A	G	1337.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1366,96,0
19	2441710	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	2459088	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	2714771	.	T	C	37.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:65,6,0
19	2728577	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2732986	.	T	C	587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:616,48,0
19	2733250	.	C	T	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:623,45,0
19	2754792	.	G	A	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:445,33,0
19	2754810	.	C	T	264.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:293,24,0
19	2754890	.	A	G	681.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:710,54,0
19	2754978	.	T	C	1063.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1092,75,0
19	2755311	.	C	G	264.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.489;DP=27;FS=9.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:293,0,671
19	2755339	.	G	A	846.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:875,69,0
19	2756183	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2762585	.	A	C	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:989,69,0
19	2767192	.	G	T	1000.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1029,75,0
19	2769367	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2769368	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	2803227	.	C	T	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
19	2803623	.	A	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
19	2806574	.	A	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
19	2809672	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	2810248	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	2812153	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
19	2813000	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	2815372	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	2819965	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	2824413	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	2853566	.	A	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
19	2917186	.	T	C	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
19	2917612	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
19	2926928	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
19	2934282	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	2950180	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	3020678	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	3020691	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	3053802	.	T	C	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
19	3054567	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	3055307	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	3055671	.	G	A	957.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=-2.218;DP=76;FS=12.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,28:75:99:986,0,1816
19	3057220	.	T	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
19	3057228	.	A	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
19	3059967	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	3099029	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	3113176	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	3114966	.	C	T	1152.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1181,81,0
19	3121609	.	T	C	800.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:829,60,0
19	3122655	.	A	G	490.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:519,36,0
19	3122941	.	T	C	162.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:191,18,0
19	3123169	.	T	C	607.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:636,45,0
19	3123635	.	C	T	970.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:999,75,0
19	3186085	.	G	T	529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:558,39,0
19	3187386	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	3194595	.	T	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	3196122	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	3208350	.	A	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
19	3208418	.	T	C	621.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:650,48,0
19	3208430	.	T	C	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:658,48,0
19	3208827	.	A	G	898.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:927,66,0
19	3208890	.	T	C	978.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.733;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=29.53;ReadPosRankSum=1.467	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:48:1007,48,0
19	3209483	.	T	G	437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:466,33,0
19	3355041	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	3361995	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	3469002	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	3531929	.	G	T	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.488	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:186,0,367
19	3539444	.	T	G	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:425,33,0
19	3540955	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:70,0,31
19	3611428	.	C	T	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
19	3611765	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
19	3611972	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
19	3613346	.	G	A	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
19	3613596	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
19	3613762	.	G	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
19	3614403	.	T	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
19	3614850	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	3615407	.	G	A	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
19	3615434	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	3618489	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	3618688	.	A	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	3622535	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	3631036	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	3631569	.	C	G	578.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:607,42,0
19	3631694	.	G	A	514.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:543,39,0
19	3634019	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	3636770	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	3637395	.	T	C	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
19	3638041	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	3653525	.	C	T	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:700,51,0
19	3730041	.	C	T	787.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:816,57,0
19	3738649	.	A	C	812.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:841,60,0
19	3738971	.	A	G	769.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:798,57,0
19	3749971	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	3750615	.	T	C	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:48:695,48,0
19	3750622	.	A	C	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:48:695,48,0
19	3750690	.	A	C	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:512,36,0
19	3752874	.	A	G	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
19	3753325	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	3753328	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	3753769	.	C	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
19	3755846	.	G	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
19	3782754	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	3785223	.	T	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
19	3958890	.	G	A	990.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1019,75,0
19	3962369	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	3967005	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	3977486	.	A	G	3431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,80:80:99:3460,241,0
19	3979408	.	A	G	3385.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3414,238,0
19	4028783	.	C	T	587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:616,45,0
19	4033462	.	T	C	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
19	4035208	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
19	4039056	.	G	C	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
19	4044424	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	4045518	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	4056346	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	4094775	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	4102449	.	G	A	1415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1444,99,0
19	4174398	.	C	G	375.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:404,30,0
19	4174950	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	4180836	.	C	T	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
19	4357555	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	4442999	.	T	G	619.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:648,48,0
19	4444856	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	4448843	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
19	4449410	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	4449808	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
19	4450325	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:220,15,0
19	4450330	.	C	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	4453235	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	4454000	.	G	A	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:44:518,44,0
19	4454827	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	4507716	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	4655166	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	4794257	.	T	G	614.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:643,45,0
19	4795289	.	G	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	4795342	.	G	A	602.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:631,45,0
19	4818378	.	T	C	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
19	4847713	.	A	G	1196.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1225,87,0
19	4847874	.	A	G	981.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1010,72,0
19	4852106	.	A	G	1157.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1186,84,0
19	4852137	.	C	T	1103.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1132,81,0
19	4867650	.	T	G	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
19	4867690	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	4909629	.	C	G	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
19	4910924	.	C	T	731.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:760,54,0
19	4961790	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	4961791	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	4961793	.	A	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	5041178	.	T	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
19	5135392	.	A	G	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:482,36,0
19	5205718	.	C	T	631.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:660,48,0
19	5206775	.	A	G	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:790,60,0
19	5211335	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	5214697	.	A	G	944.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:973,69,0
19	5232706	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	5233024	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
19	5233693	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	5236166	.	C	T	327.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:356,24,0
19	5238169	.	C	T	215.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:244,21,0
19	5273571	.	T	G	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:590,42,0
19	5708720	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	5711930	.	C	T	1996.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-1.594;DP=50;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=26.83;ReadPosRankSum=1.594	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,49:50:99:2025,105,0
19	5895550	.	C	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
19	5909780	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	5909832	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
19	5912840	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,125
19	5915594	.	A	G	668.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:697,51,0
19	5934233	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	6216777	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	6219388	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	6414646	.	A	G	997.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1026,75,0
19	6415443	.	T	C	1527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1556,111,0
19	6731057	.	T	C	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:702,51,0
19	6731766	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	6737481	.	T	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
19	6737509	.	G	A	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
19	6751279	.	A	G	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
19	6751281	.	C	T	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
19	6751293	.	T	G	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
19	6752434	.	T	C	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
19	6754188	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	6755007	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
19	7115573	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	7116963	.	T	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
19	7293898	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	7535843	.	G	A	300.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.43;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,8:9:17:329,17,0
19	7547074	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	7555910	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	7583552	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	7605566	.	C	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
19	7623011	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	7623584	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
19	7679731	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	7681351	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	7682112	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	7685843	.	G	A	861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:890,63,0
19	7913974	.	T	C	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
19	7916620	.	A	G	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
19	7928462	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	7928788	.	A	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
19	7935716	.	G	A	57.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:84,2,0
19	7936208	.	A	G	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
19	7963914	.	A	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
19	7986638	.	C	G	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
19	7992976	.	T	C	1120.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1149,81,0
19	7995016	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	7995481	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
19	8033574	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	8321937	.	C	T	1331.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1360,96,0
19	8323309	.	C	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	8324824	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	8324825	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	8326244	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
19	8326866	.	C	T	858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:887,66,0
19	8326944	.	G	A	1231.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1260,87,0
19	8326999	.	C	T	461.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:41:490,41,0
19	8327161	.	A	G	451.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=34.71;ReadPosRankSum=1.470	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,12:13:9:479,9,0
19	8327244	.	G	A	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
19	8327968	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:81,0,31
19	8367033	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	8370120	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	8386701	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	8467574	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	8468337	.	C	T	1175.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1204,84,0
19	8468800	.	C	T	892.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:921,66,0
19	8479158	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	8479520	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	8480457	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	8503574	.	A	G	966.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:995,69,0
19	8503621	.	T	G	264.85	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:17:293,17,0
19	8523006	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	8527971	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	8528277	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	8532707	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	8551094	.	T	C	2040.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2069,144,0
19	8553400	.	G	A	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
19	8553630	.	C	T	2023.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2052,153,0
19	8576307	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	8578035	.	T	C	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
19	8920984	.	T	C	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
19	8921033	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
19	8934829	.	T	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
19	8934831	.	G	A	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
19	8934907	.	C	T	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
19	8942045	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	9267663	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	9402877	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	9490428	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	9492370	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	9520062	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	9523724	.	A	G	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
19	9524185	.	A	G	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
19	9529783	.	G	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
19	9531116	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	9638223	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	9757898	.	C	T	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:91,0,34
19	9951916	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	9964823	.	A	G	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
19	9968139	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:104,0,273
19	9968434	.	C	T	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:90:310,0,90
19	10221151	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,80
19	10221855	.	C	T	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-1.429;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.266	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:366,0,314
19	10222195	.	A	G	338.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:367,27,0
19	10222558	.	G	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	10222835	.	T	A	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-0.710;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.710	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:225,0,309
19	10222862	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,180
19	10223296	.	G	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,140
19	10224131	.	T	G	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:190,0,63
19	10224526	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:109,0,74
19	10224548	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	10225777	.	A	G	783.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.338;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=20.10;ReadPosRankSum=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,21:39:99:812,0,663
19	10227010	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
19	10227123	.	C	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:142,0,185
19	10227149	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,253
19	10229297	.	C	A	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:191,0,142
19	10251747	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	10265312	.	T	C	1949.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1978,138,0
19	10265593	.	G	T	2112.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2141,147,0
19	10275787	.	A	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	10275788	.	A	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	10275847	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
19	10368050	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	10370133	.	G	A	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
19	10370654	.	A	G	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:926,66,0
19	10415781	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:102,0,154
19	10419130	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
19	10420982	.	G	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=9.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.091	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,7:18:99:242,0,418
19	10426512	.	C	T	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
19	10432919	.	T	C	78.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	10444603	.	C	G	488.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.900;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.797	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,14:26:99:517,0,434
19	10445165	.	C	A	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:163,0,204
19	10462513	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	10462672	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,131
19	10463480	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:71,0,31
19	10464687	.	A	G	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
19	10467565	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
19	10469975	.	A	C	269.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.048;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.358;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:298,0,348
19	10475652	.	C	A	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=1.615;DP=22;FS=4.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=19.31;ReadPosRankSum=-1.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:453,0,363
19	10477206	.	G	A	552.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.234;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,16:33:99:581,0,651
19	10668452	.	A	G	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:311,0,5351
19	10669444	.	A	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:96,0,72
19	10676343	.	A	T	49.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:19:78,0,19
19	10676423	.	G	A	632.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.101;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,18:31:99:661,0,464
19	10679240	.	C	G	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:180,0,172
19	10683477	.	A	G	484.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=24.24;ReadPosRankSum=0.317	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:513,0,231
19	10738639	.	C	T	817.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=1.445;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=18.17;ReadPosRankSum=-1.217	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,24:45:99:846,0,776
19	10742170	.	A	G	598.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.607;DP=48;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,18:48:99:627,0,1149
19	10747235	.	C	G	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-1.077;DP=43;FS=12.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.139	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,8:43:99:221,0,1377
19	10749236	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:62,0,31
19	10752968	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
19	10754400	.	A	G	909.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=1.411;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=19.78;ReadPosRankSum=-1.389	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,25:46:99:938,0,786
19	10754905	.	G	T	539.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.443;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.814	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,16:39:99:568,0,862
19	10755103	.	T	C	1118.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1147,81,0
19	10764203	.	G	T	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:206,0,251
19	10793749	.	A	G	93.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:122,0,25
19	10794630	.	G	T	948.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.598;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=14.82;ReadPosRankSum=1.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,27:64:99:977,0,1432
19	10794793	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,109
19	10801185	.	G	A	458.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=-0.269;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.230	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,13:32:99:487,0,724
19	10802792	.	A	G	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.247;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.337	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:380,0,672
19	10819967	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,77
19	10820076	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
19	10821853	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	10915031	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,74
19	10915925	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:75,0,70
19	10917866	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	10939792	.	T	C	659.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.219;DP=55;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,20:55:99:688,0,1326
19	11029295	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
19	11034039	.	T	A	559.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-0.301;DP=36;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.237	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,18:36:99:588,0,535
19	11040806	.	A	G	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-2.287;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.018	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:87:87,0,527
19	11041193	.	A	G	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
19	11041446	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,224
19	11041538	.	T	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,119
19	11042743	.	G	A	139.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:168,0,152
19	11043297	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:76,0,36
19	11105608	.	T	C	739.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=1.451;DP=56;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,22:56:99:768,0,1306
19	11146499	.	T	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:149,0,72
19	11147694	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
19	11151330	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,116
19	11170839	.	T	C	420.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.212;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,14:53:99:449,0,1515
19	11210912	.	C	T	636.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.623;DP=40;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.325	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,19:40:99:665,0,760
19	11218096	.	C	G	96.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-2.322;DP=48;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=2.02;ReadPosRankSum=2.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,6:48:99:125,0,1688
19	11224265	.	A	G	696.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.082;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.840;QD=17.87;ReadPosRankSum=1.250	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,20:39:99:725,0,682
19	11227602	.	C	T	846.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.254;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,23:43:99:875,0,713
19	11230881	.	T	C	715.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.462;DP=36;FS=7.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.022;QD=19.88;ReadPosRankSum=1.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,20:36:99:744,0,563
19	11233941	.	A	G	1559.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1588,114,0
19	11237296	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	11238473	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	11242044	.	G	A	834.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.383;DP=41;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,23:40:99:863,0,618
19	11242307	.	G	C	1590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1619,117,0
19	11242496	.	G	A	492.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.536;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.290;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.734	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:521,0,638
19	11242658	.	T	C	1530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1559,108,0
19	11242765	.	A	G	663.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=-1.176;DP=35;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=18.96;ReadPosRankSum=1.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,19:35:99:692,0,588
19	11243445	.	A	G	1146.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1175,81,0
19	11243502	.	T	C	436.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.369;DP=28;FS=5.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.046	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:465,0,558
19	11243592	.	G	T	260.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.161;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.115	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,10:29:99:289,0,728
19	11243735	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-0.124;DP=21;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:149,0,610
19	11256285	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	11256672	.	T	C	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,316
19	11256887	.	T	C	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
19	11256982	.	G	A	738.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:767,54,0
19	11257018	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
19	11258123	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
19	11275934	.	G	T	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
19	11276254	.	C	T	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
19	11276256	.	T	C	487.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:516,36,0
19	11276744	.	G	A	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
19	11277232	.	G	A	605.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:634,45,0
19	11319491	.	G	A	909.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:938,66,0
19	11326119	.	A	G	1128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:78:1157,78,0
19	11326125	.	C	T	1128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:78:1157,78,0
19	11326629	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	11327608	.	T	C	814.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:843,60,0
19	11327626	.	A	G	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
19	11341680	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
19	11354342	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=-2.599;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=4.29;ReadPosRankSum=2.504	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:114,0,588
19	11358799	.	G	A	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:854,60,0
19	11363146	.	A	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
19	11433801	.	C	A	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=1.461;DP=25;FS=29.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=0.48;ReadPosRankSum=-1.732	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,5:25:40:40,0,625
19	11444131	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	11465316	.	G	C	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.068	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:254,0,263
19	11466151	.	T	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,185
19	11505116	.	C	G	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.877;DP=38;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.343	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,8:38:99:225,0,1125
19	11512356	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:50:50,0,142
19	11512494	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:55:55,0,276
19	11526759	.	G	A	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-1.669;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.870	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:310,0,492
19	11526765	.	G	T	927.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:66:956,66,0
19	11528348	.	A	G	118.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:146,12,0
19	11529958	.	C	T	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:275,0,319
19	11557697	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	11559158	.	A	G	252.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:46:281,0,46
19	11559489	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
19	11560427	.	A	G	336.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=1.681;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.681	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:365,0,448
19	11560716	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.849;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:110,0,502
19	11560866	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
19	11561101	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,422
19	11561102	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,422
19	11561171	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,308
19	11561629	.	T	C	536.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-1.323;DP=28;FS=3.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=19.17;ReadPosRankSum=1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:565,0,404
19	11598483	.	T	C	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:84,0,34
19	11616807	.	A	G	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.365;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=19.41;ReadPosRankSum=1.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:300,0,207
19	11664068	.	A	G	671.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-0.829;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.492	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,19:39:99:700,0,725
19	11725413	.	G	A	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-2.152;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.813	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:166,0,427
19	11729197	.	T	C	277.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.158;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:306,0,309
19	11729705	.	A	G	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.295;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=21.12;ReadPosRankSum=-0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:345,0,224
19	11763010	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	11764496	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	11766722	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	11769935	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:112,0,73
19	11770666	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:74,0,70
19	11771320	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	11805668	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
19	11832283	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:99,0,70
19	11891003	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	11892935	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,164
19	11893862	.	C	T	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:79:153,0,79
19	11894535	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	11935492	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	11937662	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,74
19	11939779	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	11943697	.	G	A	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
19	11943823	.	G	A	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,114
19	11945146	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,116
19	11945798	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,198
19	12040004	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	12050456	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
19	12079240	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	12132168	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	12147528	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	12147529	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	12186148	.	T	C	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:181,0,186
19	12186225	.	C	G	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:172,0,360
19	12186732	.	A	G	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:128,0,405
19	12186857	.	G	C	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=23.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:60:193,0,60
19	12186921	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,485
19	12186922	.	G	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,485
19	12187861	.	T	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.053;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:165,0,464
19	12188266	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:204,0,66
19	12188317	.	G	A	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.387;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.932;QD=17.52;ReadPosRankSum=-2.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:221,0,176
19	12189379	.	C	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:93:93,0,106
19	12189707	.	T	C	366.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:395,27,0
19	12190641	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,111
19	12191564	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
19	12191833	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,279
19	12253327	.	C	T	142.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:171,0,24
19	12256358	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	12256912	.	C	T	202.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:231,0,25
19	12259323	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	12265133	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	12304700	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	12348397	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,137
19	12353830	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,161
19	12355506	.	C	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:161,0,31
19	12357023	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	12382017	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
19	12383090	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
19	12384580	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:116,0,111
19	12400588	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,68
19	12400596	.	G	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:139,0,31
19	12405552	.	T	C	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:184,0,106
19	12541532	.	C	A	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,119
19	12541547	.	T	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,156
19	12572300	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	12741524	.	T	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,117
19	12788969	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	12790147	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	12811045	.	T	C	632.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-1.700;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=18.08;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,18:35:99:661,0,639
19	12811379	.	T	C	368.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.268;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.145	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,11:31:99:397,0,795
19	12834685	.	G	C	189.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:218,0,259
19	12857086	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,73
19	12876278	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	12876964	.	G	C	1107.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1136,84,0
19	12884775	.	C	G	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:194,0,179
19	12911340	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	13054781	.	G	T	1803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1832,126,0
19	13249244	.	A	G	930.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:959,72,0
19	13250340	.	T	A	985.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:69:1014,69,0
19	13262322	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	13263055	.	C	G	376.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:405,30,0
19	13263510	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	13842660	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	13843002	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	13858096	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	13859267	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
19	13868117	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	13870153	.	C	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:107,0,106
19	13870227	.	C	T	170.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:199,0,22
19	13871236	.	G	A	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
19	13871486	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:110,0,109
19	13871554	.	T	C	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=14.08;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:169,0,184
19	13871732	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:58:58,0,209
19	13871851	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=23.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:75:75,0,104
19	13871858	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,104
19	13872240	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	13874258	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	13875162	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	13877762	.	T	C	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:450,33,0
19	13877932	.	C	T	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:92:271,0,92
19	13878016	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,312
19	13878063	.	A	G	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
19	13878243	.	A	G	408.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.401;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=29.20;ReadPosRankSum=1.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:76:437,0,76
19	13878480	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:73:73,0,121
19	13878482	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:73:73,0,121
19	13879163	.	C	T	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.714;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:42:42,0,548
19	13879344	.	G	A	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:242,0,153
19	13881056	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
19	13883099	.	A	G	1392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1421,102,0
19	13883381	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:118,0,31
19	13883848	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,344
19	13883892	.	A	G	505.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=-0.821;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.513;QD=19.45;ReadPosRankSum=3.128	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,13:26:99:534,0,477
19	13883938	.	A	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:99,0,221
19	13884006	.	A	G	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:103,0,235
19	13884259	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.142;DP=20;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.803	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:117,0,649
19	13884312	.	A	G	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.912	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:431,0,1280
19	13884321	.	C	T	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.664;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:431,0,1280
19	13884339	.	A	G	27.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.151;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:56:56,0,1960
19	13884346	.	A	G	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=10.67;ReadPosRankSum=2.039	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:199,0,1191
19	13884408	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=7.31;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:94:94,0,331
19	13884418	.	A	G	200.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:92:229,0,92
19	13884611	.	A	G	60.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:89:89,0,370
19	13884655	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.933	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,8:18:99:280,0,367
19	13884669	.	A	G	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.854;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=9.16;ReadPosRankSum=-0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:184,0,397
19	13884724	.	G	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=-0.303;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:108,0,468
19	13884742	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:117,0,440
19	13884800	.	T	C	246.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.433	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:275,0,327
19	13885309	.	C	T	902.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-1.666;DP=45;FS=1.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,26:45:99:931,0,667
19	13887178	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:80,0,36
19	13946886	.	T	C	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
19	13993457	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	13995801	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	14000400	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	14000870	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
19	14015711	.	C	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	14030689	.	T	C	393.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:422,0,209
19	14034599	.	G	C	241.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=-0.280;DP=28;FS=6.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,8:28:99:270,0,736
19	14038102	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:122,0,34
19	14072734	.	G	A	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:848,60,0
19	14083761	.	T	C	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-1.576;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=30.23;ReadPosRankSum=1.419	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:30:842,30,0
19	14110523	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	14112277	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	14185226	.	T	C	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
19	14525665	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:72,0,36
19	14525725	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,69
19	14561722	.	A	G	2153.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2182,154,0
19	14568935	.	A	T	396.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.184;DP=50;FS=9.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,14:50:99:425,0,1405
19	14574959	.	G	A	746.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-1.600;DP=50;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=14.94;ReadPosRankSum=2.723	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,21:48:99:775,0,998
19	14590315	.	G	A	1283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.525;DP=62;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.689	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,35:62:99:1312,0,963
19	14594025	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:117,0,72
19	14597095	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,113
19	14597455	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
19	14602107	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	14629150	.	G	A	830.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.307;DP=45;FS=23.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,24:45:99:859,0,745
19	14631710	.	T	C	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:78,0,25
19	14681494	.	T	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:103,0,69
19	14681932	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,157
19	14682779	.	C	T	737.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.596;DP=56;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.226	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,22:56:99:766,0,1230
19	14682804	.	G	C	563.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.127;DP=39;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.779	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,17:39:99:592,0,821
19	15225256	.	G	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
19	15225348	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	15225358	.	T	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	15226611	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	15226970	.	G	A	1061.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1090,78,0
19	15227030	.	G	A	1290.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.770;DP=36;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=29.22;ReadPosRankSum=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,35:36:64:1319,64,0
19	15227798	.	G	C	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
19	15228178	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	15230319	.	C	T	520.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.410;DP=46;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.199	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,17:45:99:549,0,1061
19	15233182	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	15233581	.	C	A	1945.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1974,138,0
19	15233631	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
19	15234635	.	T	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	15235137	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
19	15235147	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:259,18,0
19	15235192	.	A	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
19	15235932	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
19	15270583	.	G	A	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
19	15270665	.	C	T	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
19	15270805	.	C	A	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
19	15271256	.	G	C	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:91:91,0,405
19	15271771	.	G	A	765.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:794,60,0
19	15276919	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=0;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=0.00;MQ0=0	GT:GQ:PL	1/1:3:45,3,0
19	15276923	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	15277027	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
19	15278635	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	15281386	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	15285052	.	T	C	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
19	15289613	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	15292437	.	T	C	879.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:908,66,0
19	15295134	.	G	A	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:530,39,0
19	15296917	.	G	T	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
19	15302844	.	T	C	1198.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1227,87,0
19	15359259	.	G	A	659.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:688,48,0
19	15460113	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:68,0,30
19	15464920	.	G	C	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
19	15465211	.	A	T	842.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.473;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=31.33;ReadPosRankSum=-0.630	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,21:22:20:871,20,0
19	15469602	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	15479367	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	15484575	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:78,0,71
19	15485350	.	C	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	15485829	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	15486025	.	G	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	15492848	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	15494566	.	A	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	15497486	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	15508362	.	G	C	2199.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2228,156,0
19	15512931	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	15533821	.	A	G	1405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1434,99,0
19	15539439	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	15683091	.	A	G	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
19	15731128	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:32:123,0,32
19	15731133	.	C	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:123,0,32
19	15732070	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	15770784	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	15789098	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
19	15789140	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	15791729	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	15792546	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	15940045	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
19	15940075	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
19	15942120	.	T	C	318.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.87;ReadPosRankSum=-1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:10:6:346,6,0
19	15945614	.	T	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	16187370	.	C	T	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=1.816;DP=23;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.877	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,12:23:99:418,0,382
19	16188555	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	16188556	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	16189243	.	A	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,260
19	16234537	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	16244326	.	G	C	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
19	16308820	.	A	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,420
19	16308821	.	G	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,420
19	16308825	.	T	A	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.38;ReadPosRankSum=-1.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:192,0,420
19	16317204	.	C	T	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:317,0,171
19	16345386	.	C	T	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:50:50,0,401
19	16345822	.	G	A	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
19	16435717	.	T	C	424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:453,33,0
19	16436262	.	T	C	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
19	16438013	.	C	A	880.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:909,69,0
19	16468003	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	16483486	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	16485829	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	16512835	.	C	T	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
19	16611978	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	16628850	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
19	16629189	.	A	G	693.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:722,51,0
19	16630613	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	16631776	.	G	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
19	16633950	.	T	C	654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:683,51,0
19	16654444	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	16748996	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	16799493	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	16976286	.	A	G	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
19	17001551	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	17004049	.	T	C	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:325,24,0
19	17006110	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	17008578	.	G	C	241.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:270,21,0
19	17014718	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	17014871	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
19	17025292	.	G	A	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
19	17091368	.	T	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	17108135	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
19	17133726	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	17161418	.	T	A	52.70	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
19	17163661	.	C	T	522.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:551,39,0
19	17172934	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	17212992	.	C	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
19	17273893	.	G	T	864.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:893,63,0
19	17293208	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	17294954	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
19	17295023	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	17303774	.	T	G	869.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:898,63,0
19	17305440	.	T	C	1094.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:83:1123,83,0
19	17306031	.	T	C	469.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:498,39,0
19	17312992	.	C	T	752.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:781,54,0
19	17313833	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	17314483	.	G	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	17314874	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	17316782	.	T	C	865.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:894,66,0
19	17317955	.	A	G	1025.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1054,78,0
19	17320884	.	A	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
19	17321487	.	A	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
19	17323720	.	A	G	820.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:849,60,0
19	17326586	.	G	A	33.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:62,0,28
19	17330060	.	T	C	1732.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1761,129,0
19	17337344	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	17337447	.	C	T	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:115,0,29
19	17337555	.	C	A	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-1.410;DP=22;FS=9.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,5:22:99:147,0,624
19	17337733	.	C	T	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.186;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:198,0,377
19	17337871	.	A	G	429.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=-1.954;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=20.47;ReadPosRankSum=2.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,12:21:99:458,0,305
19	17337882	.	C	G	480.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=-1.123;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=22.89;ReadPosRankSum=1.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:509,0,268
19	17338099	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	17339112	.	G	A	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.452;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=20.30;ReadPosRankSum=-0.955	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:414,0,210
19	17345675	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	17347596	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	17347616	.	T	C	236.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,6:6:13:265,0,13
19	17349306	.	A	C	220.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:249,21,0
19	17350457	.	A	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
19	17351535	.	G	A	1609.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.784;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=25.15;ReadPosRankSum=1.053	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,42:64:99:1638,0,743
19	17366278	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	17378679	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:139,0,145
19	17379558	.	C	T	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:148,0,179
19	17388606	.	A	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
19	17388608	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,117
19	17403016	.	C	T	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:67,0,32
19	17412218	.	C	T	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:104,0,34
19	17417227	.	C	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.245;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=2.89;ReadPosRankSum=-0.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,7:46:99:161,0,1464
19	17417252	.	C	A	662.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.540;DP=45;FS=4.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,19:45:99:691,0,913
19	17430717	.	A	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=1.434;DP=18;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:68:68,0,520
19	17430915	.	G	A	569.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=1.878;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,16:31:99:598,0,564
19	17430955	.	C	T	588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.373;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.373	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,16:29:99:617,0,474
19	17430975	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:253,0,238
19	17431438	.	C	T	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:191,0,100
19	17431600	.	C	T	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,113
19	17432161	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,101
19	17434587	.	T	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	17435884	.	T	C	403.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,11:13:49:432,0,49
19	17438642	.	A	G	176.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,6:16:99:205,0,368
19	17439034	.	C	T	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-2.141;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.78;ReadPosRankSum=2.025	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:250,0,287
19	17440542	.	C	G	49.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:78,0,21
19	17448660	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,218
19	17448961	.	A	C	528.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.117;DP=21;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:557,0,163
19	17450016	.	T	C	435.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=1.331;DP=29;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,14:29:99:464,0,483
19	17450446	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:56:108,0,56
19	17535472	.	G	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:280,0,99
19	17535893	.	A	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,260
19	17595075	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	17612251	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	17616171	.	G	A	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
19	17621758	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	17622614	.	C	T	815.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:844,63,0
19	17623339	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
19	17624714	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	17627063	.	G	T	37.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.411;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.415	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:66:66,0,757
19	17628587	.	A	G	1319.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1348,93,0
19	17629167	.	C	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	17633415	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	17652319	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	17666636	.	C	T	285.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:314,24,0
19	17692324	.	T	G	666.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:695,51,0
19	17693206	.	T	C	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
19	17693680	.	G	A	847.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:876,60,0
19	17837425	.	C	G	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
19	17837981	.	A	G	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:475,36,0
19	18047283	.	T	G	1397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1426,102,0
19	18272190	.	A	C	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:599,45,0
19	18273047	.	T	C	696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:725,54,0
19	18279638	.	T	C	1499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1528,108,0
19	18371394	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	18390863	.	G	A	41.73	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=2.571;DP=33;FS=21.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=1.26;ReadPosRankSum=-2.571	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:81:81,0,774
19	18391074	.	T	G	481.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,14:27:99:510,0,929
19	18391079	.	A	G	481.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=2.355;DP=22;FS=7.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=21.90;ReadPosRankSum=-3.856	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:510,0,929
19	18391171	.	C	T	1360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1389,102,0
19	18418044	.	T	C	1977.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2006,141,0
19	18497024	.	G	C	327.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=29.80;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:50:356,0,50
19	18499422	.	C	G	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
19	18499780	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	18499784	.	C	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:77,6,0
19	18543526	.	C	T	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:86:86,0,333
19	18544864	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	18545140	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:56:56,0,357
19	18546717	.	C	T	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,364
19	18547855	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,116
19	18548687	.	C	T	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-2.219;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,128
19	18548732	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,77
19	18550830	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	18552181	.	C	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	18558329	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	18560174	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	18576699	.	G	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:136,0,192
19	18679379	.	C	G	802.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:831,60,0
19	18684910	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
19	18685964	.	G	T	1426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-0.866;DP=36;FS=5.563;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=31.06;ReadPosRankSum=0.674	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,35:36:74:1455,74,0
19	18687175	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	18699990	.	T	C	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
19	18700047	.	A	G	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
19	18701499	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	18703077	.	T	C	392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:421,30,0
19	18876309	.	A	G	180.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:13:209,0,13
19	18881023	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	18883838	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	18886431	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
19	18886763	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	18942888	.	C	G	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:419,33,0
19	18968817	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	18976985	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	18977937	.	G	C	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
19	18981235	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	18989270	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	18989320	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	19006648	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	19017862	.	G	A	2054.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2083,153,0
19	19018614	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
19	19019800	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	19021010	.	C	T	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
19	19035370	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	19039298	.	T	C	659.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:688,51,0
19	19040312	.	G	C	388.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.423;DP=11;FS=10.414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=29.10;ReadPosRankSum=1.107	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,10:11:23:417,23,0
19	19049198	.	G	A	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
19	19102590	.	A	T	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:581,45,0
19	19105773	.	G	A	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
19	19109646	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	19117933	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	19136541	.	C	T	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
19	19168183	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	19222070	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	19230482	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
19	19230868	.	A	G	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
19	19278340	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	19281672	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	19284920	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	19287802	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
19	19287901	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	19287928	.	A	G	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
19	19289830	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	19290115	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	19300682	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	19314169	.	G	C	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.010	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:269,0,349
19	19387356	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
19	19390185	.	G	A	488.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:517,36,0
19	19413092	.	C	T	558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:587,42,0
19	19416045	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	19457036	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	19516732	.	T	C	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	19606634	.	G	A	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
19	19616742	.	G	A	624.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:653,45,0
19	19616953	.	T	G	570.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:599,45,0
19	19617017	.	C	T	586.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:615,45,0
19	19617655	.	T	C	814.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:843,57,0
19	19619542	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	19625547	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	19626734	.	A	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
19	19643028	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	19643636	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	19643715	.	G	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
19	19645645	.	C	A	80.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
19	19646441	.	C	G	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
19	19647460	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	19734519	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
19	19735257	.	G	T	725.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:754,54,0
19	19772373	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	19792250	.	C	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	19793484	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	19793780	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
19	19793781	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,86
19	19821825	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	19868755	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
19	19871129	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	19872093	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	19903107	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	19906967	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	20116963	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	20133846	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	20150175	.	G	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	20150247	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	20155283	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	20722787	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	20726268	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	20803492	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	20803578	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	20803643	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	20805228	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	20805704	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	20805752	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	20806577	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	20806824	.	T	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
19	20808143	.	T	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:270,18,0
19	20808149	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
19	20808374	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	20821306	.	T	A	22.52	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
19	20824990	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	20824997	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	20825219	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
19	20825295	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	20825315	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	21268301	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	21268316	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	21300462	.	A	G	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
19	21301211	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	21302906	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	21303743	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	21305560	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	21305837	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	21306913	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
19	21307318	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	21308179	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	21308410	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	21308601	.	G	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
19	21309188	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	21374133	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
19	21375071	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	21375111	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	21377604	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	21477403	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	21492062	.	G	A	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
19	21541908	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
19	21560002	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,73
19	21560456	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	21560805	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	21740058	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	21909948	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	21989039	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,1:6:64:64,0,595
19	21989041	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,1:6:64:64,0,595
19	21989044	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:64:64,0,595
19	21990263	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	22256303	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	22272454	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	22272845	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	23286229	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	23296081	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	23296330	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	23438120	.	C	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:69,0,32
19	23545250	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
19	23834601	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	23835582	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
19	23835601	.	C	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	23837145	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	23837365	.	A	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	23840825	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	23869941	.	A	G	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
19	23923466	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	23924787	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	23927468	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
19	23928102	.	C	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
19	23945869	.	C	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
19	23955107	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	23958879	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	23959911	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	23960245	.	C	T	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
19	23961254	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	23970067	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	23991563	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
19	24006665	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	24009893	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	24009894	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	24014844	.	C	T	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
19	24015006	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	24015071	.	G	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
19	24016735	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	24016837	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	24016956	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	24016969	.	T	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	24017261	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
19	24017624	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	24017637	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	24019627	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	24022543	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	24022570	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	24022829	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	24047878	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	24047884	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	24047989	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
19	24048522	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	24051705	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	24051752	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	24052830	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	24053097	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	24053135	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	24053292	.	T	C	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
19	24053889	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	24121549	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	24125287	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	24183677	.	T	C	1820.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1849,126,0
19	24183696	.	T	C	2171.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2200,153,0
19	24183714	.	T	C	1123.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1152,78,0
19	24183723	.	T	G	1123.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:78:1152,78,0
19	24183727	.	A	G	1123.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:78:1152,78,0
19	24184114	.	A	G	2242.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2271,154,0
19	24184152	.	G	C	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:630,42,0
19	24184154	.	A	G	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:630,42,0
19	24184156	.	A	G	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:630,42,0
19	24184166	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	24184716	.	G	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
19	24184728	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:31:148,0,31
19	24184743	.	A	G	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:72:1080,72,0
19	24184746	.	A	G	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:72:1080,72,0
19	24184749	.	T	C	1051.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:72:1080,72,0
19	24184772	.	A	G	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:661,45,0
19	24184777	.	A	G	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:45:661,45,0
19	24184782	.	C	T	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:45:661,45,0
19	24184800	.	C	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
19	24184825	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	24184827	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	24184835	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	24184978	.	A	G	2221.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2250,151,0
19	24184980	.	T	C	2221.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2250,151,0
19	24184999	.	T	C	2336.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2365,163,0
19	24185007	.	A	G	2336.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:2365,163,0
19	24185020	.	C	T	342.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=34.24;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:8:370,0,8
19	24185022	.	T	C	342.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.71	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,9:9:8:370,0,8
19	24185475	.	T	C	623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:652,45,0
19	24185486	.	T	C	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:619,45,0
19	24185498	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
19	24185504	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:261,18,0
19	27732726	.	A	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.40;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:59:192,0,59
19	27784719	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	27832150	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	27854640	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	27887810	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	28118617	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	28213394	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	28213862	.	A	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	28220687	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	28220706	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	28220845	.	G	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	28221474	.	C	T	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	28223779	.	T	C	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
19	28228534	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	28243423	.	C	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	28287147	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	28290075	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	28291001	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
19	28291751	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	28291859	.	C	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	28293894	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	28293939	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	28296590	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	28296631	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	28297467	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
19	28297472	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	28300479	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	29696541	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	29696904	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	29696917	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	29704002	.	T	C	1161.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:81:1190,81,0
19	29704010	.	A	C	1161.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1190,81,0
19	30100661	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
19	30106659	.	G	A	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.81;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:302,0,132
19	30106873	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	30107621	.	C	T	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:156,0,61
19	30190658	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	30191933	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	30192475	.	G	A	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
19	30192505	.	G	C	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:358,24,0
19	30192738	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	30193182	.	G	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	30193721	.	G	A	545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:574,42,0
19	30504816	.	T	C	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
19	32849721	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	32867654	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	32873698	.	A	G	203.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:232,18,0
19	32874722	.	T	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
19	32874725	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
19	32877125	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
19	32930069	.	G	A	360.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=30.06;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:51:389,0,51
19	32957259	.	G	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:73,0,67
19	32959425	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	32959453	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	32974298	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:150,0,192
19	33076615	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
19	33076973	.	T	A	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
19	33091682	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	33098632	.	G	C	708.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:737,54,0
19	33102257	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	33106621	.	C	T	1351.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1380,99,0
19	33110204	.	T	C	961.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:990,69,0
19	33117666	.	T	C	609.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:638,45,0
19	33117884	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	33167455	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	33182320	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	33182425	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	33182802	.	C	T	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
19	33183352	.	G	C	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
19	33190263	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
19	33190285	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	33190422	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
19	33190796	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	33203675	.	A	G	602.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:631,45,0
19	33370070	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:55:118,0,55
19	33370084	.	T	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:114,0,68
19	33370161	.	A	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
19	33390796	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:68,0,37
19	33461109	.	C	T	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,276
19	33465089	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,76
19	33467357	.	G	A	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,148
19	33467620	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,104
19	33470874	.	A	G	703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:732,51,0
19	33487071	.	G	C	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
19	33490685	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	33498978	.	A	G	55.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:84:84,0,419
19	33605312	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:77,0,66
19	33694386	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	33695241	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	33695830	.	G	A	84.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:111,2,0
19	33696708	.	T	C	1436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1465,105,0
19	33698291	.	T	C	1534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1563,111,0
19	33793208	.	C	T	26.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.106;DP=20;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:55:55,0,575
19	33873435	.	T	G	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.58;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:60:304,0,60
19	33882222	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.215;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.972	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,7:55:99:142,0,1831
19	33885118	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	33887405	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
19	34287386	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
19	34303802	.	G	A	330.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.528;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,11:21:99:359,0,356
19	34304643	.	C	T	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:241,0,462
19	34304903	.	C	G	782.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:811,60,0
19	34306157	.	T	C	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:266,0,173
19	34395755	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	34694412	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	34710479	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	34710483	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	34715839	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	34719058	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,221
19	34842488	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:112,0,147
19	34843761	.	C	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
19	34881713	.	A	G	328.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:357,24,0
19	34882455	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:77,0,72
19	34883157	.	T	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.085;DP=16;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=1.05;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,557
19	34883445	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	34883477	.	G	A	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.156;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:93:93,0,441
19	34883482	.	G	T	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.156	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:93:93,0,1176
19	34883486	.	G	A	266.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=2.475;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:295,0,228
19	34885382	.	C	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:178,12,0
19	34891482	.	C	G	442.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:471,33,0
19	34931904	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	34951219	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	34959812	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	34959979	.	A	G	1063.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1092,75,0
19	34972892	.	A	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
19	35138432	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	35169411	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
19	35173545	.	T	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,183
19	35175208	.	A	G	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=1.096;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.643	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,10:20:99:381,0,378
19	35175775	.	C	T	504.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.853;DP=23;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.423;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.853	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,14:22:99:533,0,270
19	35176298	.	T	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:42:42,0,425
19	35233027	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
19	35233198	.	T	C	253.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.73;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:18:282,0,18
19	35422808	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:77,0,75
19	35434512	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:114,0,70
19	35435006	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,106
19	35450229	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	35607519	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	35615179	.	A	G	208.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:237,0,146
19	35660508	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	35741456	.	T	C	2484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2513,172,0
19	35749563	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	35751679	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	35752691	.	A	G	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
19	36066570	.	A	G	1300.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1329,90,0
19	36066577	.	A	G	1300.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:90:1329,90,0
19	36066634	.	A	G	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:32:826,32,0
19	36066642	.	A	G	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:32:826,32,0
19	36066645	.	A	G	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:32:826,32,0
19	36066661	.	A	G	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:32:826,32,0
19	36066744	.	C	T	1538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1567,108,0
19	36066754	.	A	G	1538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:99:1567,108,0
19	36066758	.	A	C	1538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:99:1567,108,0
19	36220997	.	C	T	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=1.588;DP=24;FS=10.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,7:24:99:227,0,655
19	36225281	.	C	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	36228954	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	36243089	.	T	C	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
19	36260924	.	A	G	19.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:48:48,0,195
19	36261453	.	G	C	233.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:262,0,248
19	36261570	.	A	G	116.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:144,12,0
19	36261612	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,104
19	36427742	.	G	C	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-2.072;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=2.072	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:144,0,218
19	36451909	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	36486445	.	G	C	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
19	36489963	.	G	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
19	36497358	.	C	G	1353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1382,101,0
19	36524282	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	36524291	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:84,6,0
19	36524362	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	36530332	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
19	36530343	.	C	T	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
19	36544765	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	36558712	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	36563126	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	36584602	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	36590329	.	T	C	352.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:381,30,0
19	36592752	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	36594659	.	A	T	684.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:713,54,0
19	36595436	.	A	C	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:529,39,0
19	36605647	.	T	C	478.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=-5.166;DP=37;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=12.94	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,16:37:99:507,0,2353
19	36605794	.	C	T	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
19	36609372	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	36610190	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	36611284	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
19	36612226	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	36612914	.	G	A	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
19	36637614	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	36640769	.	T	C	3028.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,70:70:99:3057,211,0
19	36727365	.	G	A	700.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=1.377;DP=28;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=25.03;ReadPosRankSum=-1.279	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,19:28:99:729,0,312
19	36752221	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	36753624	.	C	T	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
19	36757323	.	G	C	203.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:232,18,0
19	36757407	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	36801712	.	G	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,77
19	36808265	.	G	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
19	36810990	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	36811000	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	36811055	.	C	T	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:111,0,64
19	36811543	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:117,0,32
19	36811589	.	T	C	165.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:50:194,0,50
19	36811643	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,231
19	36812239	.	T	C	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:169,0,303
19	36813084	.	A	G	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:167,0,170
19	36816064	.	T	G	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.530;DP=35;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.452	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,8:35:99:232,0,1073
19	36816866	.	G	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:49:49,0,314
19	36828217	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,111
19	36938398	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	36940760	.	G	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
19	37003606	.	T	A	187.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=20.87;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:227,0,19
19	37014072	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	37022471	.	T	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	37036753	.	T	C	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,101
19	37068081	.	G	C	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
19	37096566	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:71,0,31
19	37117302	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	37162857	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	37163543	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	37168885	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	37173109	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
19	37173117	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:81:81,0,81
19	37173133	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:77,0,76
19	37210805	.	C	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	37235260	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	37238081	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	37285393	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	37832608	.	A	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	37837339	.	G	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:117,0,34
19	37838124	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.592;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.592	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:72:72,0,578
19	37854580	.	C	T	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:126,0,377
19	38030441	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	38031100	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	38077661	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
19	38123793	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	38123906	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:79,0,31
19	38124524	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:76:81,0,76
19	38124532	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:76:81,0,76
19	38129097	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	38188233	.	T	G	172.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:201,0,64
19	38188652	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	38189440	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	38189616	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	38189694	.	G	A	133.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:50:162,0,50
19	38210511	.	T	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
19	38572894	.	C	T	236.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=21.52;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:265,0,136
19	38590700	.	T	C	373.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=1.528;DP=19;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=19.67;ReadPosRankSum=-1.610	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:402,0,295
19	38610504	.	G	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:240,0,216
19	38670983	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	38670985	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	38670988	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	38877997	.	G	T	67.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:95,9,0
19	38888456	.	A	G	87.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:116,0,24
19	39121505	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:75,0,63
19	39174332	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	39196745	.	C	T	2028.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2057,147,0
19	39201488	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
19	39201781	.	C	T	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
19	39204846	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	39205613	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	39210961	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
19	39312346	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	39318006	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	39322087	.	T	G	2693.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-0.078;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=33.65;ReadPosRankSum=0.129	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,66:67:99:2722,156,0
19	39327856	.	A	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	39328145	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	39331296	.	C	A	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
19	39334830	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	39335274	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
19	39386314	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	39399293	.	G	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:94:94,0,322
19	39616493	.	G	A	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.119	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:556,0,305
19	39616521	.	T	C	288.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=-0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.236	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:317,0,285
19	39641869	.	C	T	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
19	39642007	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	39647284	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	39647356	.	G	C	473.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:502,36,0
19	39648322	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	39650830	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	39653917	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	39668401	.	G	C	461.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-1.620;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,14:43:99:490,0,1115
19	39669642	.	T	C	1672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1701,117,0
19	39684909	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	39852796	.	C	T	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:81,0,25
19	39875535	.	G	A	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,205
19	39875551	.	A	C	132.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:161,14,0
19	39889044	.	A	T	559.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=1.362;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=26.66;ReadPosRankSum=-1.285	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,15:21:99:588,0,186
19	39889691	.	G	A	607.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.863;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.598	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,17:19:31:636,0,31
19	39898667	.	C	T	514.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=-0.485;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.410	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:543,0,229
19	39913558	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	39924129	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:118,0,64
19	39925054	.	T	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,410
19	39925056	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:153,0,410
19	39925417	.	T	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
19	39925461	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	39925482	.	A	T	35.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:73:73,0,99
19	39926057	.	A	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:48:160,0,48
19	39926521	.	G	A	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.172;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.658;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,13:43:99:435,0,1172
19	39936502	.	G	A	782.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.671;DP=27;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.496	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,21:27:99:811,0,173
19	39944082	.	C	T	948.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.699;DP=44;FS=4.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,27:44:99:977,0,576
19	39948779	.	G	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:112,0,72
19	39965670	.	G	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:72:157,0,72
19	39974865	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	39976734	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	39981091	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:146,0,196
19	39981168	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:111,0,315
19	39981170	.	A	G	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,104
19	39981265	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,77
19	39982081	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
19	39982231	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=7.38;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,261
19	39982250	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:48:48,0,324
19	39982329	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,116
19	39982341	.	A	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,111
19	39982626	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,111
19	39984233	.	C	T	76.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:103,2,0
19	39985024	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	39985025	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	40030541	.	T	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:156,0,266
19	40312748	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	40313214	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
19	40313436	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	40328615	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	40472765	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
19	40480501	.	C	T	987.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-0.901;DP=36;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,26:36:99:1016,0,312
19	40483810	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	40519935	.	C	T	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
19	40529556	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	40541039	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
19	40551446	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	40574929	.	T	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
19	40575507	.	T	C	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:93:93,0,219
19	40576729	.	T	C	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
19	40578010	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:158,0,30
19	40578253	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	40579354	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	40579842	.	C	G	178.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:24:207,0,24
19	40591027	.	T	A	78.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
19	40591182	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	40591209	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	40591280	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	40592298	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	40592364	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	40593137	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	40593254	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	40593640	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	40594545	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	40594634	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	40594660	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	40594848	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	40595028	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	40595220	.	A	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	40595281	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	40595290	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	40720079	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
19	40728417	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	40737242	.	T	C	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
19	40739513	.	A	G	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.198;DP=43;FS=4.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.225	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,13:43:99:408,0,1160
19	40739721	.	G	T	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-2.245;DP=38;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,12:38:99:396,0,928
19	40743269	.	A	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
19	40776408	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
19	40789926	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	40823971	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
19	40855255	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
19	40865858	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
19	40866907	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,105
19	40867117	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
19	40869182	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:119,0,30
19	40871790	.	C	G	1018.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1047,72,0
19	40871801	.	T	A	1112.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1141,81,0
19	40884160	.	G	A	958.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:987,81,0
19	40929234	.	G	A	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.611;DP=24;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=0.91;ReadPosRankSum=-0.524	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:50:50,0,825
19	40929363	.	T	C	504.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=21.03;ReadPosRankSum=-1.014	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,15:24:99:533,0,283
19	40931865	.	T	C	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
19	40948403	.	G	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	40949241	.	C	G	10.90	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:37,3,0
19	40950433	.	A	C	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
19	40959077	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	41096189	.	A	G	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.976	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,9:23:99:304,0,520
19	41097276	.	C	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:140,0,151
19	41125386	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:121,0,33
19	41172145	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,75
19	41172730	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	41173880	.	C	T	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:44:44,0,327
19	41211056	.	T	C	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:140,0,212
19	41220529	.	C	T	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=1.36;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:43:43,0,355
19	41244887	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	41245742	.	C	T	549.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.742;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=23.90;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:578,0,260
19	41246378	.	G	C	385.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.380;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:414,0,327
19	41255500	.	C	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	41256131	.	G	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,117
19	41257176	.	G	C	1003.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1032,72,0
19	41262687	.	C	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
19	41289397	.	G	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	41292404	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	41301115	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	41302706	.	C	T	856.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:885,63,0
19	41306362	.	G	A	1515.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=-1.921;DP=56;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=27.07;ReadPosRankSum=1.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,43:56:99:1544,0,387
19	41307778	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:71,0,30
19	41308983	.	G	A	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:122,0,261
19	41309211	.	T	C	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
19	41309240	.	C	T	180.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.766;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:209,0,349
19	41310571	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=1.098;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:186,0,173
19	41310609	.	A	G	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
19	41311963	.	G	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:197,0,106
19	41313202	.	C	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
19	41314001	.	G	A	611.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.487;DP=49;FS=11.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.384	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,18:49:99:640,0,1154
19	41322135	.	G	T	171.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.64;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:200,0,17
19	41332648	.	C	T	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:43:43,0,307
19	41333761	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,280
19	41334371	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	41334505	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	41335451	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:63,0,37
19	41335548	.	A	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:56:56,0,110
19	41336219	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,108
19	41336245	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,121
19	41336795	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,115
19	41338190	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,304
19	41338191	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,304
19	41338244	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:61:61,0,156
19	41340573	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:72,0,35
19	41341011	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	41341589	.	A	G	142.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:171,0,25
19	41343404	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:61:81,0,61
19	41343409	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:61:81,0,61
19	41345224	.	C	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:109,0,30
19	41351400	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:78,0,66
19	41354712	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	41360356	.	T	C	52.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:16:81,0,16
19	41361787	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,111
19	41362229	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
19	41362898	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
19	41394336	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	41395755	.	G	A	34.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:63,0,26
19	41397661	.	C	A	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
19	41397806	.	C	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
19	41405962	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	41408469	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	41700493	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	41808762	.	A	G	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=2.675;DP=60;FS=12.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=0.17;ReadPosRankSum=-2.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,5:60:38:38,0,4307
19	41808764	.	C	G	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=2.648;DP=60;FS=12.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=0.17;ReadPosRankSum=-2.889	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,5:60:38:38,0,4307
19	41811730	.	T	C	1747.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1776,123,0
19	41813013	.	C	T	820.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=1.147;DP=29;FS=26.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=28.30;ReadPosRankSum=2.064	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,22:29:99:849,0,199
19	41903220	.	G	A	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.791	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:158,0,443
19	41928652	.	C	T	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.130;DP=27;FS=12.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.778	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,10:27:99:327,0,607
19	41930396	.	A	G	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=-0.361;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.416	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,10:25:99:362,0,505
19	41938684	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	41939297	.	C	G	730.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-1.552;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=28.11;ReadPosRankSum=1.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,20:26:99:759,0,140
19	41944237	.	T	C	654.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.697;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,18:29:99:683,0,368
19	42006655	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	42006658	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:132,9,0
19	42200301	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	42221607	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
19	42265889	.	G	T	1133.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-1.016;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.060	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,28:29:77:1162,77,0
19	42274895	.	G	T	1750.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-1.270;DP=45;FS=4.491;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=29.31;ReadPosRankSum=1.193	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,44:45:99:1779,103,0
19	42275099	.	A	G	1687.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1716,120,0
19	42275422	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.640;DP=36;FS=20.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,5:36:99:113,0,1230
19	42364395	.	T	C	365.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:394,30,0
19	42365964	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	42366232	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	42366247	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	42368629	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	42368738	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
19	42369393	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	42372457	.	C	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	42373893	.	C	T	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
19	42374836	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	42375584	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:140,0,184
19	42375624	.	A	G	257.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:286,0,414
19	42375627	.	A	G	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=1.746;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:109,0,1117
19	42376842	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-0.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:106,0,554
19	42376843	.	A	G	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:106,0,554
19	42376919	.	A	G	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.268	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:85:85,0,353
19	42394876	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	42410639	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=1.212;DP=17;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,5:17:99:152,0,453
19	42461454	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	42463447	.	C	T	1667.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1696,117,0
19	42736267	.	A	G	1651.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1680,120,0
19	42738506	.	G	A	698.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.131;DP=36;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,21:33:99:727,0,419
19	42752689	.	G	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:99,0,325
19	42753020	.	G	A	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:135,0,208
19	42798827	.	C	G	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-1.004;DP=14;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.822	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:46:46,0,415
19	43969757	.	A	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:88:88,0,233
19	43998282	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
19	44008848	.	G	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:111,0,34
19	44030763	.	C	G	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.431;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.431	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:315,0,639
19	44047550	.	T	C	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
19	44047826	.	T	A	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:770,54,0
19	44056412	.	C	T	56.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-2.093;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:85:85,0,463
19	44079687	.	G	A	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
19	44090195	.	A	C	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:109,0,30
19	44095077	.	A	G	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:234,0,110
19	44126279	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	44251470	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	44259077	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
19	44270925	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.54;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:55:193,0,55
19	44271066	.	A	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:186,0,210
19	44286473	.	G	A	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
19	44344515	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:111,0,34
19	44353242	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,75
19	44353454	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	44354631	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	44356627	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	44356887	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	44362272	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	44374716	.	A	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	44393257	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	44398940	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	44416436	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	44417295	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
19	44417575	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
19	44418077	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
19	44418343	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	44418544	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	44418680	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:72:72,0,146
19	44418693	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
19	44418824	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,105
19	44419030	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
19	44439099	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	44439355	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:75,0,28
19	44439396	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	44470189	.	T	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	44470548	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	44471252	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:76,0,35
19	44475650	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	44494054	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	44495145	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
19	44496070	.	A	G	198.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:17:227,0,17
19	44500478	.	A	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
19	44500701	.	C	T	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:60,0,78
19	44501227	.	A	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
19	44598868	.	T	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:72,0,33
19	44610843	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,199
19	44611066	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,371
19	44611420	.	A	G	179.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-1.743;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:208,0,277
19	44612231	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,155
19	44613661	.	A	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,155
19	44669319	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
19	44677233	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:80,0,30
19	44739303	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:148,0,69
19	44739399	.	T	C	125.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:154,0,27
19	44778405	.	A	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:147,0,156
19	44832684	.	T	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	44832875	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:55:153,0,55
19	44833506	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
19	44833851	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	44840789	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
19	44959559	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	44959568	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	44959577	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:180,12,0
19	44959578	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:12:180,12,0
19	44973969	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	44979734	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	44981375	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
19	44981883	.	C	G	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
19	44983567	.	C	G	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
19	45001346	.	G	A	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
19	45003843	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	45162038	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
19	45165571	.	A	G	158.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:187,0,258
19	45165576	.	A	G	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:88:88,0,627
19	45165662	.	A	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,285
19	45165912	.	C	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-1.273;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:113,0,456
19	45166466	.	G	A	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.274;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:46:504,0,46
19	45167091	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
19	45167122	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,101
19	45167531	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	45168210	.	T	C	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:85:190,0,85
19	45168497	.	A	G	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
19	45168642	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
19	45172580	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
19	45172624	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
19	45253946	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
19	45253960	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
19	45253961	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:68:81,0,68
19	45323073	.	T	C	459.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,13:21:99:488,0,272
19	45324516	.	C	T	596.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.493;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=28.42;ReadPosRankSum=-0.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,17:21:95:625,0,95
19	45377842	.	G	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:107,0,72
19	45379060	.	A	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
19	45379336	.	C	T	120.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:149,14,0
19	45379638	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	45379682	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	45380545	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	45380970	.	G	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
19	45382034	.	A	G	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.429	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:382,0,174
19	45389224	.	A	G	791.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:820,60,0
19	45404691	.	A	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:90:90,0,364
19	45404874	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,66
19	45404876	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,66
19	45405539	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
19	45476422	.	T	C	1364.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1393,108,0
19	45487519	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	45490285	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	45490636	.	T	C	1584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1613,114,0
19	45491174	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	45491945	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	45492559	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	45493133	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	45493635	.	C	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	45496303	.	T	C	1390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1419,102,0
19	45561063	.	A	G	1335.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1364,96,0
19	45567678	.	C	G	302.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-0.618;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.442	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,9:18:99:331,0,337
19	45589595	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,79
19	45591771	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	45615479	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	45650253	.	A	G	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.653;DP=36;FS=6.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,10:36:99:307,0,951
19	45672699	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	45767997	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
19	45801018	.	T	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
19	45806609	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
19	45912736	.	C	A	735.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.227;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.310	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,20:31:99:764,0,372
19	45913093	.	T	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:192,0,28
19	45913737	.	T	G	240.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.08;ReadPosRankSum=1.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:92:269,0,92
19	45923653	.	A	G	770.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=1.632;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=28.55;ReadPosRankSum=-0.581	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,20:27:99:799,0,221
19	46029981	.	T	C	382.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:35:411,35,0
19	46030154	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	46050760	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	46052454	.	A	G	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
19	46053232	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:106,0,160
19	46053316	.	T	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:92:92,0,171
19	46053329	.	T	C	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:97:97,0,142
19	46053340	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,76
19	46053385	.	C	T	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:441,30,0
19	46054822	.	C	T	110.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:138,12,0
19	46056620	.	C	T	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:441,33,0
19	46057081	.	A	G	361.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:390,30,0
19	46124531	.	G	A	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:251,0,269
19	46206262	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,107
19	46214291	.	G	T	152.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:181,0,65
19	46219145	.	G	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
19	46268902	.	C	T	877.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:906,66,0
19	46269313	.	G	C	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
19	46270082	.	C	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,274
19	46284947	.	T	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
19	46288706	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	46289392	.	G	C	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:521,42,0
19	46289503	.	C	T	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:693,54,0
19	46319415	.	G	C	777.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:806,60,0
19	46323942	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	46324023	.	T	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	46327053	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.249;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,4:26:99:101,0,877
19	46327166	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	46327185	.	G	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	46327297	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
19	46327367	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	46327422	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
19	46328228	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	46332194	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	46332286	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=1.295;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:184,0,607
19	46364013	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	46387941	.	G	A	645.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.345;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,19:27:99:674,0,250
19	46394187	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	46404579	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	46511548	.	T	C	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
19	46520026	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	46524471	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	46526298	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	46538983	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	46878989	.	G	A	226.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.283	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,9:27:99:255,0,689
19	46882834	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,155
19	46883306	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,74
19	46883352	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,90
19	46884094	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	46884101	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	46885932	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	46885977	.	C	T	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:62:109,0,62
19	46886234	.	G	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,316
19	46887007	.	G	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
19	46887199	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:72,0,37
19	46887567	.	C	T	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:121,0,24
19	46893465	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	47062321	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
19	47106634	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	47109011	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	47113138	.	A	G	1861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1890,135,0
19	47177913	.	A	G	661.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:690,48,0
19	47223294	.	C	T	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.707;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.859	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,11:33:99:381,0,858
19	47223543	.	T	C	1140.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1169,81,0
19	47224607	.	C	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
19	47230113	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	47244530	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	47245792	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	47248979	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	47278938	.	G	A	1142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.411;DP=51;FS=1.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=22.41;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,30:51:99:1171,0,764
19	47282162	.	G	A	416.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-2.066;DP=31;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.973	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,12:28:99:445,0,618
19	47341494	.	G	A	678.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.213;DP=42;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=16.16;ReadPosRankSum=1.238	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,19:42:99:707,0,861
19	47497878	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	47506352	.	A	G	147.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=1.225;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:176,0,637
19	47506363	.	C	T	511.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-1.805;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=26.94;ReadPosRankSum=1.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,14:19:99:540,0,151
19	47506769	.	C	T	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=-0.482;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:173,0,476
19	47507175	.	G	A	694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:55:723,55,0
19	47507434	.	C	T	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.102	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:253,0,330
19	47507468	.	G	A	666.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.933;DP=23;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=28.99;ReadPosRankSum=2.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,19:23:73:695,0,73
19	47507604	.	G	A	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=-0.044;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=23.46;ReadPosRankSum=-0.132	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:474,0,207
19	47548678	.	G	A	79.94	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:14:108,14,0
19	47549454	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.774;DP=35;FS=6.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,9:35:99:267,0,968
19	47569003	.	G	A	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:124,0,278
19	47585517	.	G	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:127,0,295
19	47646817	.	C	A	383.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-0.465;DP=52;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.338	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,13:52:99:412,0,1547
19	47724564	.	C	T	384.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.151;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.261;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,11:17:99:413,0,211
19	47731115	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	47742310	.	C	T	164.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:23:193,0,23
19	47761646	.	G	C	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:307,0,176
19	47768128	.	G	C	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:282,0,233
19	47770015	.	A	C	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=20.59;ReadPosRankSum=0.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,13:20:99:440,0,236
19	47774572	.	C	T	530.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=1.133;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=22.12;ReadPosRankSum=-1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,16:24:99:559,0,266
19	47774772	.	T	C	323.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.533;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=23.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:352,0,163
19	47777661	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
19	47777872	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	47778221	.	A	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:58,0,59
19	47778412	.	G	T	187.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:216,0,21
19	47793185	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	47852979	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:107,0,137
19	47853576	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
19	47856336	.	C	T	462.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.673;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,13:16:86:491,0,86
19	47883086	.	T	G	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-0.352;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:177,0,361
19	47885965	.	G	A	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:70,0,32
19	47894352	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,109
19	47978671	.	G	A	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:129,0,383
19	47980153	.	G	A	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.144	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:285,0,312
19	47991441	.	C	G	1705.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1734,120,0
19	47991451	.	A	G	459.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.204;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.016	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,14:37:99:488,0,881
19	47992277	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,111
19	47992516	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,150
19	48017334	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	48017416	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	48183771	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,115
19	48255804	.	A	G	312.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.064;DP=20;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,11:20:99:341,0,274
19	48258717	.	A	G	508.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-2.359;DP=33;FS=28.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=15.42;ReadPosRankSum=-0.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,16:33:99:537,0,564
19	48258772	.	G	A	435.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=22.94;ReadPosRankSum=1.858	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,14:18:99:464,0,99
19	48280954	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	48282316	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:190,0,102
19	48282495	.	C	T	475.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=1.197;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=27.99;ReadPosRankSum=-1.323	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,14:17:80:504,0,80
19	48283094	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:119,0,66
19	48286163	.	A	C	33.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:61,6,0
19	48565087	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	48598823	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	48621036	.	C	G	717.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.300;DP=24;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=29.91;ReadPosRankSum=-0.060	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,19:21:15:746,0,15
19	48622427	.	A	G	499.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-1.228;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=21.73;ReadPosRankSum=1.417	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:528,0,323
19	48627262	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	48630018	.	T	G	12.73	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=6.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
19	48637585	.	G	T	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
19	48638359	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	48641574	.	A	G	445.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=1.083;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=29.72;ReadPosRankSum=-1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:89:474,0,89
19	48642266	.	T	C	284.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.65;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:313,0,18
19	48642811	.	G	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:98,0,57
19	48654553	.	G	T	671.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.999;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=26.87;ReadPosRankSum=0.999	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,18:25:99:700,0,220
19	48656571	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	48664720	.	G	C	379.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.630;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:408,0,494
19	48674356	.	T	C	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:112,0,72
19	48689042	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	48697961	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:59:59,0,259
19	48709127	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	48711789	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	48713615	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	48715153	.	T	C	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
19	48722180	.	C	T	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,272
19	48836082	.	A	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
19	48836208	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	48836236	.	G	A	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
19	48836673	.	G	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	48837988	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	48863386	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	48949286	.	G	T	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:873,63,0
19	48957577	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	48972539	.	A	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	48984060	.	A	G	584.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=32.95;ReadPosRankSum=1.519	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:11:612,11,0
19	48984178	.	G	C	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:720,51,0
19	49077026	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49077057	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49077064	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:90,6,0
19	49103447	.	C	T	1242.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1271,90,0
19	49104008	.	A	G	761.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:790,54,0
19	49104308	.	C	T	1210.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1239,87,0
19	49116500	.	C	T	298.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:327,0,416
19	49118093	.	C	G	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.163;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.991	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:173,0,285
19	49120285	.	T	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:103,0,187
19	49217261	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	49300605	.	T	C	104.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:132,12,0
19	49302323	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.95;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:153,0,30
19	49303070	.	G	C	181.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=-2.385;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.35;ReadPosRankSum=3.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,7:34:99:210,0,1039
19	49310617	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	49311530	.	C	G	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
19	49312779	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,140
19	49375900	.	T	C	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:128,0,333
19	49377319	.	A	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:179,0,268
19	49377424	.	G	A	259.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.372;DP=19;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:288,0,418
19	49377436	.	G	C	187.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.854;DP=17;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.759	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,6:17:99:216,0,412
19	49377873	.	G	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,306
19	49377918	.	G	T	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.90;ReadPosRankSum=2.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:87:87,0,308
19	49379182	.	G	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,195
19	49425838	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	49464655	.	C	G	548.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.420	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:577,0,272
19	49469087	.	T	C	3409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:3438,235,0
19	49482204	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	49482205	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	49482522	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
19	49483706	.	T	C	42.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
19	49484169	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	49485548	.	G	A	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-1.410;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.352	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:232,0,594
19	49491294	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49513273	.	C	T	1966.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:1995,144,0
19	49588746	.	C	T	630.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-0.198;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,20:30:99:659,0,322
19	49605530	.	A	G	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:810,63,0
19	49610389	.	T	C	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:98:98,0,148
19	49610413	.	C	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:99,0,150
19	49621905	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:79,0,33
19	49631698	.	G	A	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.300;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,151
19	49640002	.	G	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:141,0,157
19	49641651	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
19	49653388	.	C	G	328.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.237;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.079	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,10:26:99:357,0,597
19	49654006	.	T	G	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:396,0,141
19	49661582	.	T	C	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
19	49661678	.	G	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,66
19	49665451	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	49671281	.	G	A	578.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.164;DP=20;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=28.94;ReadPosRankSum=1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,17:20:31:607,0,31
19	49675017	.	G	T	554.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=24.12;ReadPosRankSum=-1.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:583,0,261
19	49677762	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49677763	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49678047	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	49682991	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49696869	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	49697020	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	49699866	.	C	T	687.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.410;DP=23;FS=8.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,18:23:99:716,0,145
19	49716716	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
19	49744538	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49763352	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	49812403	.	G	T	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
19	49839015	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:73,0,37
19	49863709	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	49949589	.	A	T	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	49950298	.	C	T	1898.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.774;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=31.37;ReadPosRankSum=1.659	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,46:47:99:1927,103,0
19	49951632	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
19	49954803	.	C	T	2353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2382,163,0
19	49954807	.	T	G	2353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2382,163,0
19	49955016	.	G	T	1197.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1226,84,0
19	49956274	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	49964977	.	C	G	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:770,57,0
19	49965173	.	A	T	872.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:78:901,78,0
19	49969310	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	49973784	.	A	G	261.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.627	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:290,0,208
19	50087956	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	50093876	.	T	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:225,0,137
19	50094186	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	50097784	.	T	C	432.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=33.27;ReadPosRankSum=-0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:3:459,0,3
19	50099359	.	C	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=25.80;ReadPosRankSum=-1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:312,0,104
19	50100295	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:56:94,0,56
19	50100484	.	G	A	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.295	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:334,0,183
19	50136131	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	50140092	.	G	A	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
19	50140246	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=3.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	50154451	.	G	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.124;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:145,0,608
19	50154904	.	A	C	553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:582,45,0
19	50156896	.	T	C	1121.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1150,87,0
19	50161091	.	A	G	566.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.786;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,17:47:99:595,0,1140
19	50162909	.	C	G	305.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.722	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:334,0,285
19	50164390	.	T	C	216.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:245,0,22
19	50189156	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:118,0,32
19	50190529	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	50192640	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	50270328	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:119,0,303
19	50299408	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50306864	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,108
19	50308134	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
19	50308191	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	50342111	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
19	50343129	.	T	C	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
19	50358133	.	T	G	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.076;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.911	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,7:29:99:217,0,874
19	50359404	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-1.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:112,0,501
19	50360046	.	C	A	137.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-1.709;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.355	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,6:15:99:166,0,332
19	50362201	.	T	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:148,0,238
19	50363175	.	A	G	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
19	50370066	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,306
19	50370106	.	T	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,117
19	50372762	.	G	A	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.348;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.149	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,10:38:99:313,0,1091
19	50377757	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,139
19	50379193	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50383591	.	A	G	1014.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1043,72,0
19	50383636	.	T	C	170.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.995;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:199,0,602
19	50389000	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,99
19	50410363	.	C	T	238.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.566;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,8:27:99:267,0,730
19	50410550	.	G	A	769.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-1.754;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.697	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,21:31:99:798,0,316
19	50410577	.	G	A	352.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=1.752;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.173	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,11:27:99:381,0,589
19	50411132	.	T	C	653.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-0.455;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.015	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,17:23:99:682,0,177
19	50411742	.	A	G	1280.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1309,93,0
19	50412217	.	C	G	267.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.732;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=9.56;ReadPosRankSum=2.489	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,12:24:99:441,0,437
19	50412417	.	G	A	1220.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1249,93,0
19	50414717	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50415394	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	50418735	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
19	50419399	.	A	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
19	50420671	.	C	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	50423666	.	T	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:75,0,71
19	50427631	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,120
19	50431388	.	G	A	50.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:79,0,22
19	50431879	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
19	50435086	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	50435139	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	50435747	.	T	C	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:234,0,220
19	50435862	.	C	T	218.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:23:247,23,0
19	50436115	.	C	T	245.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.061;DP=33;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,9:33:99:274,0,895
19	50436371	.	G	A	584.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.094;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.141	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,17:28:99:613,0,368
19	50436715	.	G	A	1096.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=1.153;DP=43;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,29:43:99:1125,0,486
19	50436758	.	G	A	1073.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-2.108;DP=48;FS=2.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=22.37;ReadPosRankSum=1.792	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,29:48:99:1102,0,663
19	50436980	.	G	A	1039.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.154;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.042	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,28:41:99:1068,0,426
19	50477700	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50477710	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50479999	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:58:120,0,58
19	50480960	.	G	A	112.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:141,0,23
19	50492860	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:78,0,33
19	50726570	.	G	A	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-1.519;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:330,0,403
19	50762418	.	A	G	944.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:973,69,0
19	50771609	.	G	A	1187.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1216,84,0
19	50796905	.	G	A	143.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=-0.493;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.700	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,6:30:99:172,0,932
19	50813169	.	A	C	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=-0.706;DP=28;FS=12.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.894	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,11:28:99:380,0,592
19	50813263	.	T	G	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-1.273;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,8:20:99:278,0,395
19	50820457	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50822736	.	T	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	50825252	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	50881054	.	G	A	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.401;DP=31;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.570	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,10:31:99:326,0,752
19	50970992	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:67:67,0,155
19	50983930	.	C	T	1588.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.707;DP=50;FS=9.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=31.78;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,42:50:99:1617,0,182
19	50986074	.	G	A	561.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.097;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,20:32:99:590,0,398
19	50986092	.	C	T	660.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.717;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,20:34:99:689,0,494
19	50987694	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	50987775	.	T	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:123,0,31
19	51018664	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	51228746	.	C	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:56:56,0,116
19	51228802	.	T	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,213
19	51301230	.	G	A	783.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.883;DP=56;FS=3.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,23:56:99:812,0,1252
19	51301395	.	C	T	945.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.738;DP=59;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,27:59:99:974,0,1223
19	51301456	.	G	A	940.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.588;DP=61;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.169	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,27:61:99:969,0,1304
19	51302066	.	A	G	450.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.154;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.027	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,15:57:99:479,0,1600
19	51302154	.	G	A	344.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=-1.587;DP=56;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,16:56:99:373,0,1544
19	51302202	.	T	A	659.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-2.028;DP=53;FS=8.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.486	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,20:53:99:688,0,1222
19	51306302	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
19	51528041	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	51538116	.	T	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:113,0,34
19	51538154	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	51601063	.	G	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	51601490	.	C	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
19	51850290	.	G	A	1103.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-0.060;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.494	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,30:45:99:1132,0,520
19	51863849	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
19	51866324	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	51868112	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	52085520	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	52089484	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	52089724	.	G	A	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
19	52089806	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	52092821	.	C	G	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
19	52094962	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	52095526	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,99
19	52095560	.	G	T	197.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:226,0,21
19	52095577	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	52104560	.	T	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
19	52104713	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	52204942	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	52375424	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
19	52376507	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	52376952	.	T	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	52403516	.	T	C	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:234,0,142
19	52430739	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	52451900	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:74,0,68
19	52452116	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	52452529	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:118,0,30
19	52455249	.	G	A	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
19	52468034	.	G	A	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:149,0,103
19	52472295	.	A	G	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:56:56,0,161
19	52495380	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	52495684	.	A	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,207
19	52495803	.	A	G	371.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:400,27,0
19	52496149	.	C	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,238
19	52497250	.	G	A	325.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:354,0,142
19	52504920	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	52517243	.	C	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:66:66,0,192
19	52519005	.	G	C	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.40;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:64:185,0,64
19	52519608	.	C	T	368.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:397,27,0
19	52520372	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	52520518	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:104,0,269
19	52536117	.	C	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
19	52537576	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	52538278	.	A	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:114,0,32
19	52563493	.	C	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:123,0,30
19	52563784	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	52568422	.	T	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:76,0,30
19	52570714	.	C	G	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=18.64;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:196,0,152
19	52570783	.	A	G	281.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.18;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:59:310,0,59
19	52592219	.	C	T	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	52593423	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	52597910	.	A	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,228
19	52714670	.	C	T	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.432;DP=49;FS=2.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.454	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,14:49:99:418,0,1230
19	52825032	.	C	T	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:58:161,0,58
19	52825235	.	A	G	282.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:89:311,0,89
19	52828640	.	A	C	371.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.626;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:400,0,133
19	52856955	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	52869022	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	52869278	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	52869534	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	52887904	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
19	52888048	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
19	52894445	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	52895885	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	52897950	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	52916988	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	52917198	.	C	A	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
19	52917590	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	52917723	.	G	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	52917907	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	52921057	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
19	52955102	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	53057479	.	G	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:159,0,31
19	53065075	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
19	53065661	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:63,0,37
19	53071155	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	53085659	.	C	T	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=21.83;ReadPosRankSum=1.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:312,0,156
19	53086918	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,240
19	53086954	.	C	T	202.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:98:231,0,98
19	53087024	.	A	G	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.365	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:214,0,147
19	53087149	.	T	A	271.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=24.71;ReadPosRankSum=0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,8:11:99:300,0,104
19	53087622	.	T	C	225.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.23;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:254,0,20
19	53088058	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	53088116	.	A	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:152,0,31
19	53088433	.	A	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:110,0,33
19	53090157	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
19	53095416	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	53095766	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53095771	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53098186	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	53098934	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.42;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,218
19	53099069	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
19	53099100	.	T	C	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:200,0,26
19	53099297	.	G	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
19	53099308	.	A	G	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:119,0,34
19	53099409	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
19	53099608	.	T	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
19	53099796	.	C	T	282.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.42;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:311,0,19
19	53099965	.	A	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=23.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:191,0,198
19	53099975	.	C	G	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=27.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:191,0,198
19	53101207	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,120
19	53102350	.	G	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:95:139,0,95
19	53105547	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
19	53115842	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,322
19	53116060	.	G	A	59.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:88:88,0,388
19	53117531	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.910	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:108,0,470
19	53117809	.	C	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-1.221;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.009	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:118,0,544
19	53120249	.	T	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,228
19	53121171	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,112
19	53121193	.	C	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
19	53121441	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:195,0,476
19	53121442	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.851;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:195,0,476
19	53121455	.	T	C	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=27.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:99:195,0,476
19	53121569	.	G	A	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.092;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.696	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:169,0,298
19	53121899	.	T	C	285.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.58;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:50:314,0,50
19	53121900	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,301
19	53122002	.	T	C	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:92:92,0,295
19	53122030	.	G	C	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:149,0,201
19	53149553	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
19	53150794	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:35:39,0,35
19	53150962	.	G	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,171
19	53151775	.	T	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,159
19	53152564	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,120
19	53157096	.	C	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,153
19	53203806	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:25:81,0,25
19	53203810	.	T	C	52.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:25:81,0,25
19	53206633	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:75,0,35
19	53207182	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
19	53233196	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	53289975	.	A	G	159.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:188,15,0
19	53300984	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
19	53301194	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
19	53301245	.	T	C	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
19	53301677	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.708;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.531	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:95:95,0,317
19	53302057	.	C	A	713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:742,51,0
19	53302453	.	A	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
19	53302481	.	A	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
19	53302622	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	53302737	.	T	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
19	53303527	.	A	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
19	53303705	.	T	G	316.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=28.80;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:37:345,0,37
19	53304627	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,677
19	53304632	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,677
19	53342152	.	T	C	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
19	53343779	.	A	G	501.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:530,36,0
19	53344426	.	T	C	519.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:548,39,0
19	53344701	.	A	G	492.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:521,36,0
19	53345060	.	G	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	53345076	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	53345176	.	C	T	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:482,36,0
19	53348505	.	G	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,322
19	53348534	.	A	G	326.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-2.239;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=29.71;ReadPosRankSum=1.768	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:34:355,0,34
19	53352359	.	A	G	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.555	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:89:333,0,89
19	53357149	.	G	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:62:62,0,159
19	53366165	.	T	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,199
19	53366233	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:75,0,70
19	53379888	.	T	C	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:56:56,0,310
19	53382381	.	T	C	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
19	53395834	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:76,0,32
19	53396485	.	T	C	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=34.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:75:165,0,75
19	53396490	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:75:165,0,75
19	53398942	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:66,0,36
19	53399016	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:74:74,0,241
19	53399019	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:74:74,0,241
19	53399505	.	T	C	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:38:38,0,239
19	53399509	.	T	C	10.20	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:38:38,0,239
19	53399838	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:138,0,102
19	53399862	.	T	C	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
19	53400760	.	C	A	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,116
19	53407797	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.11;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:155,0,114
19	53408069	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
19	53408165	.	G	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:114,0,69
19	53408207	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	53408223	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:99:118,0,122
19	53408229	.	A	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:118,0,122
19	53408783	.	G	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,117
19	53408833	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,102
19	53408870	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,115
19	53408899	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:117,0,69
19	53409135	.	C	T	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,121
19	53410373	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:115,0,113
19	53410482	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:94:101,0,94
19	53410828	.	T	C	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:192,0,131
19	53411347	.	C	A	251.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:280,0,104
19	53411368	.	G	A	329.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=29.98;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:52:358,0,52
19	53422155	.	A	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	53425492	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	53425499	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	53426826	.	T	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
19	53426847	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	53429652	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	53431000	.	G	C	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,110
19	53431048	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,229
19	53431263	.	C	T	56.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:84,9,0
19	53431977	.	T	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:99:150,0,426
19	53431978	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:99:150,0,426
19	53431994	.	C	T	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:150,0,426
19	53452856	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:102,0,70
19	53452878	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,155
19	53453777	.	C	T	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:91:91,0,302
19	53454789	.	A	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,325
19	53472089	.	A	T	173.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:202,0,28
19	53473390	.	G	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	53475630	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53475636	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53541112	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	53569527	.	A	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	53570867	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
19	53571306	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.694;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:133,0,322
19	53572059	.	T	C	188.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:217,0,64
19	53572494	.	G	T	362.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=27.91;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:83:391,0,83
19	53572917	.	G	A	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:227,0,100
19	53573236	.	C	T	162.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:191,0,108
19	53577419	.	G	C	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
19	53586630	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	53590676	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	53593229	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	53593932	.	G	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	53601798	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	53602056	.	C	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
19	53611187	.	T	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:122,0,31
19	53611473	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	53632994	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	53636016	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,151
19	53639735	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,108
19	53645291	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,76
19	53666745	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	53667351	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53667357	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53667913	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	53695587	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	53707289	.	C	T	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
19	53708301	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,119
19	53716190	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:100,0,136
19	53719087	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,107
19	53719100	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:75,0,62
19	53719250	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	53856349	.	A	T	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
19	53856730	.	G	A	161.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.668;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=16.18;ReadPosRankSum=1.951	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:190,0,184
19	53858694	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	53859182	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
19	53884412	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53885026	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:119,0,32
19	53887021	.	C	T	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
19	53887035	.	C	A	108.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
19	53888388	.	T	A	36.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
19	53888626	.	T	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	53889551	.	C	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:211,0,104
19	53909673	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	53910034	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	53912242	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	53912521	.	G	A	170.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:199,0,27
19	53912548	.	T	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
19	53912770	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	53913555	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	53914411	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:114,0,96
19	53914425	.	C	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
19	53915224	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:70,0,37
19	53915309	.	A	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
19	53915435	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	53916115	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	53920183	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53922287	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	53925685	.	G	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:78,0,37
19	53935766	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	53935948	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	53939538	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	53940022	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	53940457	.	C	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	53941622	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53941947	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	53943153	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	53943214	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:72,0,29
19	53943312	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	53944243	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:78,0,67
19	53945215	.	G	A	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
19	53945504	.	C	T	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:112,0,70
19	53945679	.	T	G	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
19	53945701	.	C	T	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
19	53946263	.	A	T	185.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:214,21,0
19	53946527	.	T	C	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
19	53947020	.	A	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:56:230,0,56
19	53947066	.	C	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:120,0,74
19	53947377	.	C	T	234.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:263,0,225
19	53947775	.	C	A	93.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:122,0,24
19	53947802	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,110
19	53947818	.	G	A	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
19	53948000	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	53950475	.	G	T	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:380,0,208
19	53958126	.	T	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
19	53973047	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	53973049	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	53973483	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53973514	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53973517	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53992397	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53992400	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53992405	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53992406	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	53997114	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,79
19	53997179	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:77,0,76
19	53997611	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	54016512	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	54024979	.	C	T	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,140
19	54025053	.	G	A	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,103
19	54025194	.	C	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=10.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:178,0,555
19	54025201	.	A	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:178,0,555
19	54025288	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,107
19	54025918	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,152
19	54040861	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	54080144	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.849;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.962	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:110,0,450
19	54378029	.	T	C	247.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:276,27,0
19	54378082	.	T	C	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
19	54378627	.	T	A	341.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:370,27,0
19	54378789	.	C	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
19	54379573	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	54612628	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
19	54613420	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	54626055	.	C	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
19	54626286	.	C	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	54627097	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	54630208	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	54630757	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	54631911	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	54631936	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	54632253	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	54632352	.	C	G	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
19	54643387	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	54644277	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:75,0,71
19	54644288	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	54644494	.	T	C	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
19	54644550	.	C	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	54644879	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	54645150	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:111,0,72
19	54645821	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
19	54649671	.	T	C	905.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:934,66,0
19	54650940	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:74,0,28
19	54651345	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	54652203	.	T	C	1014.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1043,75,0
19	54657069	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
19	54657877	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	54658001	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	54677167	.	G	T	231.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.678;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.174	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:260,0,304
19	54677189	.	C	T	741.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:770,60,0
19	54677759	.	T	C	1529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1558,108,0
19	54677897	.	G	A	350.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.592;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.172	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,11:33:99:379,0,841
19	54679479	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,112
19	54682975	.	A	G	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
19	54688378	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	54695163	.	T	C	873.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:902,63,0
19	54697079	.	C	T	1944.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.184;DP=47;FS=3.104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=32.19;ReadPosRankSum=0.111	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,46:47:99:1973,99,0
19	54697602	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	54697714	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
19	54705619	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	54705641	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,67
19	54706042	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:81,0,36
19	54706088	.	C	T	211.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:24:240,0,24
19	54706104	.	G	A	211.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.99	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:24:240,0,24
19	54706127	.	C	A	211.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:240,0,24
19	54706157	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
19	54706279	.	T	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	54706680	.	C	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
19	54709930	.	C	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:77,0,35
19	54711258	.	T	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:133,0,67
19	54966579	.	C	G	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=1.132;DP=32;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,9:32:99:292,0,890
19	54970369	.	G	C	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.373;DP=30;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=0.56;ReadPosRankSum=-1.556	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:45:45,0,1053
19	54971229	.	T	C	210.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=-2.238;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.171	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:239,0,573
19	55485899	.	G	A	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.996;DP=38;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.687	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,9:38:99:272,0,1121
19	55502660	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:58:58,0,264
19	55505208	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,156
19	55505271	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,143
19	55505557	.	C	T	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,201
19	55512232	.	C	A	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.996;DP=38;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.069	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,9:38:99:252,0,1115
19	55512316	.	T	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.756	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,11:36:99:342,0,970
19	55512347	.	G	C	294.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.393;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=7.97;ReadPosRankSum=2.240	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,10:37:99:323,0,1028
19	55512431	.	A	G	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.408	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:186,0,190
19	55525596	.	T	C	69.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
19	55525894	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	55526345	.	T	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
19	55527081	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	55527276	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	55529642	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	55529836	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	55530035	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	55537462	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	55538980	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	55551567	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:78,0,32
19	55551755	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
19	55551790	.	T	C	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:102,0,99
19	55552144	.	G	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
19	55552823	.	A	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,269
19	55553019	.	C	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:109,0,73
19	55553200	.	C	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	55553206	.	C	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
19	55553647	.	T	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
19	55554076	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	55554138	.	G	A	207.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.70;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:15:236,0,15
19	55554232	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	55554399	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,120
19	55558233	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	55559740	.	G	A	634.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.961;DP=25;FS=10.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.786	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,17:25:99:663,0,243
19	55563757	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	55563765	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	55570574	.	A	G	634.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:663,48,0
19	55574403	.	C	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:117,0,64
19	55574412	.	G	T	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
19	55574512	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
19	55574907	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	55584358	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	55587822	.	G	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:139,0,263
19	55588491	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	55588651	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	55590771	.	A	G	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
19	55590808	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,115
19	55594996	.	C	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.250;DP=19;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.850	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:107,0,574
19	55598724	.	A	G	275.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,9:20:99:304,0,399
19	55609588	.	C	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:67,0,32
19	55738634	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
19	55739340	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	55743925	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	55784797	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	55856083	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	55856851	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	55859325	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:101,0,249
19	55859439	.	C	A	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
19	55895588	.	G	A	1149.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1178,87,0
19	55895763	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	55896082	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
19	55896709	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	55897170	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	55897327	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=-0.689;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.755	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:95:95,0,952
19	55900103	.	G	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:104,0,222
19	55900417	.	C	G	131.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:17:160,0,17
19	55900533	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	55900869	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
19	55901653	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
19	55901714	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,130
19	55972950	.	T	G	1304.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1333,96,0
19	55993790	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	55994240	.	C	T	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:113,0,104
19	56089353	.	C	T	268.28	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.81;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:9:296,0,9
19	56090493	.	A	C	306.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.164;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=20.45;ReadPosRankSum=1.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:335,0,153
19	56091294	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,70
19	56091437	.	A	C	93.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:122,0,29
19	56091475	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
19	56104136	.	T	C	220.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:249,21,0
19	56104560	.	C	G	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=21.88;ReadPosRankSum=1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:93:247,0,93
19	56109801	.	C	G	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
19	56109916	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
19	56110172	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,77
19	56110754	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	56112994	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	56113021	.	C	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	56114237	.	G	A	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
19	56118771	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	56120708	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	56125944	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,108
19	56127597	.	G	A	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.336	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:169,0,169
19	56132487	.	A	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:148,0,61
19	56132661	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,195
19	56146469	.	G	A	158.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:187,0,26
19	56149077	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	56150729	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	56153868	.	G	A	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
19	56154339	.	C	T	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=25.15;ReadPosRankSum=1.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:80:330,0,80
19	56154718	.	G	A	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.025;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,10:17:99:366,0,229
19	56165544	.	T	C	975.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1004,72,0
19	56166879	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	56168448	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	56170771	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
19	56171778	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	56173551	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
19	56175414	.	G	T	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
19	56175515	.	G	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
19	56176272	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	56178559	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	56180281	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	56180307	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	56180732	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	56180968	.	C	T	2928.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2957,208,0
19	56181048	.	G	A	284.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.849;DP=63;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.252	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:51,12:63:99:313,0,1903
19	56185763	.	T	A	2569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2598,192,0
19	56598829	.	G	C	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,11:18:99:418,0,231
19	56599063	.	A	G	455.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.409;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.472	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:484,0,298
19	56616261	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	56621440	.	G	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
19	56623139	.	G	A	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
19	56624712	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	56626448	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
19	56666802	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	57066013	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
19	57068039	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57068836	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
19	57068986	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	57071901	.	C	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	57075629	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	57075911	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	57077674	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	57078424	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
19	57089375	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	57090343	.	A	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
19	57092308	.	T	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
19	57107327	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57132968	.	G	A	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:51:348,0,51
19	57135023	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57323016	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	57325083	.	C	T	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
19	57702924	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
19	57703209	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
19	57723007	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57723013	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57729733	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	57732996	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	57832089	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	57838018	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	57840547	.	A	G	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
19	57841461	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	57845448	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57845449	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	57867621	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,122
19	57868336	.	A	G	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
19	57868879	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
19	57869881	.	C	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,113
19	57871141	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	57874954	.	C	G	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:178,0,142
19	57902481	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:152,0,28
19	57909827	.	G	T	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:73:141,0,73
19	57909872	.	G	A	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:509,36,0
19	57933003	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
19	57949536	.	T	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
19	57953909	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	57971398	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	57982983	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:74:74,0,112
19	57983078	.	A	G	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:179,0,117
19	57983293	.	G	A	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
19	57983457	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:74,0,66
19	57983794	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:75,0,73
19	57983805	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
19	57983911	.	C	A	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:197,0,28
19	57984190	.	C	A	130.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:159,0,30
19	57984254	.	C	T	122.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:151,0,23
19	57985460	.	T	A	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,112
19	58004158	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:78,0,66
19	58038964	.	T	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	58058739	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:69,0,78
19	58083467	.	C	T	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:108,0,198
19	58112844	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58115503	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
19	58117083	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	58117223	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	58117399	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
19	58122017	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
19	58125644	.	A	G	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:206,0,28
19	58131623	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:156,0,145
19	58133243	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:70:157,0,70
19	58144715	.	A	G	123.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:152,0,25
19	58147898	.	G	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	58151123	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58151286	.	T	C	210.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:23:239,0,23
19	58152361	.	T	A	313.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.39;ReadPosRankSum=-1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:15:342,0,15
19	58152795	.	C	T	195.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:22:224,0,22
19	58152817	.	G	C	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:136,0,146
19	58152933	.	G	A	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:473,36,0
19	58153000	.	T	C	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=34.40;ReadPosRankSum=-1.246	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:436,0,259
19	58153009	.	C	T	407.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=31.37;ReadPosRankSum=-1.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:99:436,0,259
19	58153577	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:76,0,73
19	58153596	.	G	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,114
19	58153656	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,117
19	58153756	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
19	58154259	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	58154825	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	58200099	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58206283	.	G	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	58245831	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	58248722	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58266192	.	C	T	168.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
19	58269173	.	G	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
19	58291228	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	58292416	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	58297596	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58297689	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
19	58298736	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	58299928	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
19	58301275	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	58301410	.	T	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
19	58303091	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
19	58303795	.	A	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
19	58303850	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
19	58310895	.	A	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	58311108	.	T	C	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:116,0,34
19	58318682	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,313
19	58354536	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,74
19	58354558	.	A	G	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:57:156,0,57
19	58355689	.	A	G	21.99	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:49,5,0
19	58355699	.	T	C	21.99	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:49,5,0
19	58355748	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	58356471	.	A	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
19	58371749	.	A	G	115.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:144,0,180
19	58372048	.	A	G	246.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:275,0,20
19	58372069	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:95:95,0,193
19	58372355	.	A	G	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:59:59,0,301
19	58372763	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:55:55,0,438
19	58372768	.	A	G	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:48:48,0,527
19	58373377	.	A	G	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,198
19	58373508	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:92:92,0,369
19	58374149	.	G	A	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:182,0,269
19	58374953	.	T	C	310.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=28.25;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:42:339,0,42
19	58375222	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
19	58375264	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,121
19	58375663	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
19	58375743	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:92:92,0,214
19	58375761	.	A	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:47:47,0,462
19	58376008	.	C	T	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.708	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:97:97,0,312
19	58376976	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,119
19	58376988	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,184
19	58377548	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,142
19	58378231	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,376
19	58378232	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,376
19	58378286	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,385
19	58378337	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:60:60,0,301
19	58378349	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:81:81,0,243
19	58378360	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:60:60,0,223
19	58378516	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,79
19	58378924	.	A	G	13.95	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=2.32;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:42:42,0,152
19	58379089	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:75,0,37
19	58380337	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:73,0,64
19	58383921	.	C	T	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
19	58414368	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,148
19	58418320	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58418416	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,152
19	58419193	.	T	A	83.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:112,0,31
19	58455381	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	58479684	.	T	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:81,0,30
19	58491382	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,75
19	58491627	.	T	C	176.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:205,0,26
19	58511150	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	58513807	.	A	C	232.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:261,21,0
19	58516230	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
19	58516988	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58572959	.	G	A	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
19	58572979	.	G	A	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
19	58575800	.	C	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
19	58579927	.	A	C	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:658,45,0
19	58580277	.	C	T	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:349,24,0
19	58584251	.	C	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	58584434	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
19	58584525	.	C	T	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
19	58593174	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58598784	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
19	58604114	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
19	58604666	.	T	C	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
19	58638293	.	T	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,151
19	58638399	.	G	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
19	58693697	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58720360	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	58720717	.	A	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
19	58720992	.	G	A	116.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:11:144,11,0
19	58740490	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:72,0,29
19	58761585	.	A	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
19	58766874	.	A	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
19	58767168	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
19	58768177	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58770883	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:67:67,0,189
19	58774071	.	A	G	496.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:525,36,0
19	58774581	.	G	C	399.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:428,30,0
19	58774762	.	G	T	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
19	58775182	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
19	58775192	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58776480	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58776483	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58776484	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58776630	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58778070	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	58779369	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
19	58780503	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
19	58784732	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
19	58785739	.	G	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	58785900	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
19	58790095	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
19	58790359	.	C	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
19	58805842	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,75
19	58806083	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,108
19	58807827	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
19	58812301	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
19	58865857	.	G	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
19	58872853	.	G	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
19	58879965	.	A	G	208.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:237,18,0
19	58879976	.	C	T	235.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:264,21,0
19	58880300	.	G	A	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,115
19	58906163	.	T	C	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:138,0,163
19	58917990	.	G	A	532.31	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.504;DP=15;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=31.17;ReadPosRankSum=1.042	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:1:558,1,0
19	58918337	.	G	A	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:161,0,67
19	58918405	.	A	G	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:64:230,0,64
19	58918705	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
19	58918748	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:75,0,34
19	58918764	.	A	G	123.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
19	58919066	.	A	T	257.90	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:15:286,0,15
19	58919320	.	A	G	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
19	58919557	.	G	A	296.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.98;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:17:325,0,17
19	58919570	.	G	A	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=1.32;ReadPosRankSum=2.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:44:44,0,384
19	58928299	.	A	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=23.38;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:75:75,0,202
19	58928302	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,1:3:75:75,0,202
19	58928309	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,202
19	58929136	.	G	A	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,114
19	58930043	.	G	C	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:59:64,0,59
19	58978517	.	G	A	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:113,0,34
19	58982384	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
19	58983558	.	T	G	191.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:220,0,234
19	58985866	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	58986260	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
19	58986799	.	G	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
19	58989495	.	A	C	274.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:61:303,0,61
19	58992220	.	T	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:117,0,69
19	59028585	.	G	A	224.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:95:253,0,95
19	59029306	.	G	A	93.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:122,0,27
19	59030580	.	G	T	171.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.64;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:19:200,0,19
19	59031473	.	G	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
19	59056752	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
19	59058083	.	G	T	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,103
19	59058693	.	G	A	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:148,0,109
19	59066391	.	C	G	482.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-2.240;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=12.70;ReadPosRankSum=2.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,15:38:99:511,0,852
19	59074653	.	T	C	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:169,0,142
19	59078073	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
19	59079096	.	C	T	120.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:149,0,110
19	59083594	.	T	A	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:151,0,29
19	59085045	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:115,0,66
19	59093239	.	T	C	311.56	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=31.16;ReadPosRankSum=-1.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:7:339,0,7
19	59093464	.	C	T	167.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:196,0,63
19	59093484	.	G	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:29:157,0,29
19	59094453	.	A	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
19	59094709	.	C	G	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=12.68;ReadPosRankSum=-1.098	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:155,0,191
19	59095126	.	G	T	173.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.96;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:202,0,25
20	251604	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	278515	.	T	C	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
20	292418	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	292435	.	G	T	22.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:50,6,0
20	299498	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	307821	.	C	G	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=19.92;ReadPosRankSum=1.473	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:347,0,144
20	349306	.	G	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
20	357632	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	367825	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	391170	.	C	T	1157.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1186,87,0
20	400872	.	A	C	424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:453,33,0
20	401205	.	A	T	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
20	402053	.	G	A	183.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,6:7:11:211,11,0
20	402171	.	T	C	446.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:475,33,0
20	402710	.	A	G	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
20	411842	.	G	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
20	417142	.	G	C	557.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.290	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,15:23:99:586,0,283
20	418051	.	G	C	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.638;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.582	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:556,0,355
20	418199	.	T	A	972.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1001,75,0
20	419067	.	C	T	632.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:661,45,0
20	462008	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
20	463926	.	T	C	847.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:876,60,0
20	463995	.	T	C	1722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1751,120,0
20	628742	.	G	A	850.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:879,60,0
20	629213	.	T	C	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
20	632504	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	633682	.	T	C	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.217;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=31.94;ReadPosRankSum=-0.434	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:38:597,38,0
20	633910	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	732295	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	740919	.	G	T	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
20	741847	.	A	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
20	742217	.	C	G	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
20	743018	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	744050	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	744450	.	G	A	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
20	746952	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	748974	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
20	825678	.	T	C	1285.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1314,93,0
20	826666	.	G	T	1278.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1307,99,0
20	1099329	.	A	G	1002.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1031,72,0
20	1099523	.	T	G	1477.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1506,105,0
20	1108122	.	C	T	1904.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1933,135,0
20	1126745	.	C	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
20	1286711	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	1288223	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	1289787	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	1293008	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	1308706	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	1337254	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	1340390	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	1359238	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	1392603	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	1423533	.	A	T	296.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.98;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:18:325,0,18
20	1423779	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
20	1423848	.	G	T	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
20	1423909	.	C	T	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
20	1424303	.	G	A	1171.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-1.733;DP=30;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=30.33;ReadPosRankSum=1.617	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,29:30:56:1200,56,0
20	1426393	.	C	T	1902.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1931,135,0
20	1430550	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	1438230	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	1447580	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	1447583	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	1447585	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	1592265	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	2083577	.	G	A	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:92:92,0,244
20	2106355	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	2125837	.	A	G	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
20	2126089	.	A	G	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:48:692,48,0
20	2126096	.	A	G	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:692,48,0
20	2126180	.	G	C	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:641,51,0
20	2126567	.	T	C	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
20	2126584	.	A	C	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
20	2449725	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	2462905	.	C	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	2463592	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
20	2631075	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	2633380	.	G	A	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
20	2633936	.	T	C	1673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1702,120,0
20	2637071	.	T	C	2765.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2794,193,0
20	2734619	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	2821067	.	T	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:472,36,0
20	3028714	.	C	A	2360.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2389,166,0
20	3088816	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	3090124	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	3090942	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
20	3128578	.	A	C	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
20	3143752	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
20	3144664	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	3147762	.	A	G	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
20	3161010	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	3164686	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	3164751	.	C	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
20	3169729	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	3170172	.	T	C	167.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:196,15,0
20	3171628	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	3172246	.	A	C	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
20	3173589	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	3174781	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	3174894	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	3183972	.	C	T	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-1.425;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,8:48:99:206,0,1529
20	3185285	.	C	T	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.736;DP=34;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.552	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,11:34:99:372,0,867
20	3451901	.	C	T	256.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.588	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,8:17:99:285,0,316
20	3564672	.	C	T	502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:531,39,0
20	3624830	.	G	A	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:685,51,0
20	3626989	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	3628312	.	T	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
20	3628918	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
20	3629254	.	A	G	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
20	3629450	.	C	T	289.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:318,24,0
20	3630107	.	G	A	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
20	3630249	.	T	C	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
20	3630563	.	A	G	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
20	3630681	.	A	C	518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:547,39,0
20	3631558	.	C	T	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:610,42,0
20	3737495	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	3758898	.	G	C	51.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:80,0,27
20	3765402	.	C	G	908.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=-2.625;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=24.56;ReadPosRankSum=2.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,24:37:99:937,0,421
20	3776968	.	T	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
20	3777946	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
20	3778042	.	T	A	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
20	3779629	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	3781681	.	G	A	1070.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.505;DP=43;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,29:43:99:1099,0,444
20	3790596	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	3791192	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	3791494	.	A	C	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
20	3792226	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	3805459	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-1.868;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.557	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:92:92,0,424
20	3846843	.	C	T	861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:890,63,0
20	3848171	.	A	G	10.20	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:38:38,0,443
20	3848225	.	A	G	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-1.207;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.117	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:198,0,597
20	3849161	.	A	G	64.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:93:93,0,225
20	3849179	.	G	A	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
20	3849401	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,313
20	3849403	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,313
20	3849774	.	A	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.623	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:90:90,0,658
20	3849777	.	A	G	318.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,9:14:99:347,0,179
20	3850134	.	A	G	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:185,0,144
20	3850321	.	A	G	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:108,0,57
20	3850432	.	A	G	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-1.883;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.404	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:82:82,0,522
20	3850487	.	A	G	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.482;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.241	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,3:26:54:54,0,917
20	3850513	.	A	G	28.77	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=1.222;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:57:57,0,902
20	3851209	.	A	G	292.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:59:321,0,59
20	3851645	.	A	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:102,0,193
20	3851951	.	T	C	935.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:964,66,0
20	3852829	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=2.404;DP=19;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=2.57;ReadPosRankSum=-1.174	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:77:77,0,653
20	3852978	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.346;DP=28;FS=5.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.624	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,4:28:99:165,0,1363
20	3853000	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.372;DP=18;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:165,0,1363
20	3853956	.	A	G	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-1.006;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.857	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:140,0,709
20	3854982	.	C	T	738.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-1.734;DP=20;FS=8.239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.561;QD=32.48;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:25:767,25,0
20	3855398	.	C	T	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
20	3870124	.	G	C	509.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:538,42,0
20	3905941	.	G	T	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
20	3906010	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,196
20	3906020	.	A	G	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,117
20	3907425	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	3907496	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,158
20	3909309	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:114,0,59
20	3909607	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,294
20	3910024	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:44:44,0,330
20	3910035	.	T	C	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,145
20	3910406	.	T	C	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:358,24,0
20	3911270	.	T	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
20	3911290	.	A	T	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
20	3912359	.	C	T	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
20	3912426	.	G	A	765.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:794,54,0
20	3912637	.	G	T	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
20	3912638	.	C	G	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
20	3913123	.	G	T	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
20	4163302	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
20	4164283	.	A	G	250.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:20:279,0,20
20	4835338	.	C	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
20	4836440	.	C	T	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
20	4837063	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	4837321	.	G	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
20	4854682	.	A	G	422.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:451,33,0
20	5175241	.	C	A	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
20	5177979	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:68,0,36
20	5525635	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
20	5525986	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
20	5529626	.	A	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	5530767	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	5798780	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	5799408	.	C	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
20	5918693	.	G	A	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
20	5931575	.	G	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
20	5931577	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
20	5939214	.	A	C	535.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:564,39,0
20	5951265	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	5951674	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	5953833	.	A	G	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
20	5976824	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
20	5976840	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,40
20	5977333	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
20	5977679	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
20	5978141	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	5978428	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,118
20	5979536	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	5979615	.	T	A	79.14	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:116,12,0
20	5979709	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	5986749	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	6055762	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
20	7967980	.	G	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
20	8632826	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	8737734	.	G	A	154.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:183,15,0
20	8755243	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	8864203	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	9076942	.	A	G	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
20	9349033	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
20	9351150	.	T	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
20	9385132	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	10603326	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
20	10603750	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
20	10604466	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	10604841	.	G	A	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
20	11888480	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	11894002	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	11904685	.	G	T	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
20	11905642	.	G	A	359.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:388,30,0
20	11906180	.	G	A	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
20	11906471	.	T	C	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:44:44,0,471
20	11906553	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	11907058	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	13029764	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	13032643	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	13053018	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	13053035	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	13146314	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	13147154	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	13694585	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	13798549	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	13798776	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	13799484	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	14318174	.	C	T	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:121,0,33
20	14562346	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	16271601	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	16338561	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	16349671	.	C	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
20	16359567	.	A	G	913.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:942,66,0
20	16379756	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	16730522	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	17474690	.	T	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
20	17474791	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
20	17474968	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
20	17547932	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	17596731	.	C	T	102.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:130,12,0
20	17597045	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	17597331	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
20	17599752	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	17600357	.	G	A	1468.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1497,105,0
20	17600564	.	C	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
20	17605240	.	A	T	1277.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:98:1306,98,0
20	17607358	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	17640009	.	A	C	1017.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1046,75,0
20	17924214	.	C	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
20	17925853	.	G	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
20	17925870	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	17927421	.	C	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
20	17927703	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	17939861	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
20	17942398	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
20	17943119	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:63:81,0,63
20	17943121	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:63:81,0,63
20	17955038	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	17968923	.	T	C	430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:459,33,0
20	17971273	.	C	T	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
20	17971553	.	T	G	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
20	17999058	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
20	18002595	.	A	G	142.98	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:13:171,13,0
20	18002982	.	G	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
20	18003879	.	T	C	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
20	18005113	.	C	T	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:426,30,0
20	18119044	.	G	T	208.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:237,18,0
20	18143117	.	T	G	397.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:426,33,0
20	18167977	.	T	C	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
20	18168353	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
20	18296072	.	T	A	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
20	18448079	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	18460641	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	18462421	.	A	G	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
20	18464673	.	G	T	332.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:361,27,0
20	18465001	.	C	A	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:487,33,0
20	18465004	.	C	G	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:487,33,0
20	18465244	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	18467765	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	18468511	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,496
20	18468512	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,496
20	18468843	.	G	T	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
20	18469182	.	T	C	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:114,0,153
20	18485381	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
20	18488924	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,103
20	18611987	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	19188427	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	19188977	.	G	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
20	19190024	.	G	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
20	19190466	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	19560664	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
20	19701943	.	A	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
20	19702049	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
20	19702171	.	G	A	329.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:358,24,0
20	19702694	.	C	G	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:630,45,0
20	20001483	.	G	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	20032998	.	T	C	608.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:637,45,0
20	20257958	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	20348962	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	20350516	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	20372082	.	C	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
20	20372452	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
20	20493528	.	C	G	163.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:192,0,28
20	21142523	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	21142813	.	T	C	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
20	21147009	.	A	G	76.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:103,2,0
20	21147019	.	T	C	46.41	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:8:74,0,8
20	21329780	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	23028724	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	23608980	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	23618395	.	T	C	2858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,67:67:99:2887,202,0
20	23760903	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	24073113	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	24912107	.	T	C	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
20	24912938	.	A	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
20	24913034	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	24913551	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	24944166	.	C	T	1630.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.866;DP=40;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=29.04;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,39:40:88:1659,88,0
20	24944447	.	G	A	1843.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1872,135,0
20	24944933	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
20	24946372	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	24946855	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	24946861	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	24947476	.	C	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	24948945	.	A	T	88.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:116,12,0
20	24949144	.	G	A	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
20	24950373	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	24973247	.	C	A	2010.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2039,141,0
20	24973363	.	A	G	693.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:722,51,0
20	24987438	.	C	T	1643.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1672,114,0
20	24988048	.	C	T	1430.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1459,99,0
20	24988082	.	C	T	1132.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1161,81,0
20	24991289	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
20	24993220	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	24993414	.	T	C	400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:429,30,0
20	24994275	.	G	A	1580.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1609,114,0
20	24997137	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	24998907	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	25000516	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	25000519	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:85,6,0
20	25000734	.	G	A	1362.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1391,104,0
20	25001712	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	25007089	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	25011423	.	T	C	1367.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1396,96,0
20	25200583	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,111
20	25288632	.	G	A	1240.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1269,90,0
20	25371383	.	G	C	95.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:124,0,158
20	25390284	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
20	25391369	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,39
20	25391804	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:27:39,0,27
20	25398790	.	G	A	581.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:610,42,0
20	25405469	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
20	25428294	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.454;DP=21;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:99:153,0,612
20	25428308	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.639	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,428
20	25428587	.	A	G	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.736;DP=18;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.170	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:128,0,999
20	25428588	.	A	G	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.396;DP=18;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:128,0,999
20	25428646	.	A	G	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.866;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.763;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,6:20:99:204,0,547
20	25428724	.	A	G	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:44:44,0,470
20	25438783	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	25594783	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	26188912	.	A	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
20	26188923	.	A	C	77.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:106,0,23
20	26188930	.	A	G	77.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:23:106,0,23
20	26189125	.	C	G	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:15:186,15,0
20	26189132	.	C	G	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:15:186,15,0
20	26189142	.	G	A	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:186,15,0
20	26189153	.	A	C	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:420,33,0
20	26189171	.	T	C	370.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:399,30,0
20	26189287	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:12:159,12,0
20	26189288	.	T	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:12:159,12,0
20	26189297	.	A	G	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
20	26189308	.	C	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
20	26189332	.	G	A	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:495,42,0
20	26189453	.	A	G	771.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:800,54,0
20	26189454	.	G	C	771.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:800,54,0
20	26189470	.	A	G	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
20	26189472	.	G	C	376.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:405,27,0
20	26189824	.	T	C	831.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:860,63,0
20	26189886	.	G	C	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:380,27,0
20	26189893	.	T	C	351.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:380,27,0
20	26189917	.	C	G	388.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:417,30,0
20	26189930	.	G	A	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:41:575,41,0
20	26189936	.	C	G	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:41:575,41,0
20	26190040	.	A	C	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:60:842,60,0
20	26190045	.	C	G	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:60:842,60,0
20	26190065	.	T	C	939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:67:968,67,0
20	26190071	.	T	C	939.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:67:968,67,0
20	26190090	.	C	T	1128.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1157,84,0
20	26190102	.	A	C	1078.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1107,84,0
20	26190142	.	A	G	1338.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:93:1367,93,0
20	26190151	.	G	C	1338.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:93:1367,93,0
20	26190158	.	A	G	1338.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:93:1367,93,0
20	26190173	.	T	C	1338.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:93:1367,93,0
20	26190179	.	G	A	1338.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:93:1367,93,0
20	26190207	.	A	G	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:45:590,45,0
20	26190221	.	T	C	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:45:590,45,0
20	26190255	.	A	T	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:57:842,57,0
20	26190264	.	G	C	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:57:842,57,0
20	26190273	.	G	C	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:57:842,57,0
20	26190276	.	C	T	813.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:57:842,57,0
20	26190455	.	T	C	174.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:203,18,0
20	26190485	.	A	C	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:528,36,0
20	26190491	.	A	C	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:36:528,36,0
20	26190501	.	T	C	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:36:528,36,0
20	26190505	.	A	G	499.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:36:528,36,0
20	29633236	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	29633238	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	29633425	.	T	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	29633431	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	30128108	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	30381758	.	G	C	151.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=1.181;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.979	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,7:42:99:180,0,1418
20	30533883	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	30753270	.	T	C	875.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.785;DP=30;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.981	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,23:30:99:904,0,194
20	30782113	.	A	G	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:60:60,0,149
20	30782543	.	C	G	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:184,0,100
20	30783919	.	A	G	170.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:26:199,0,26
20	30795819	.	T	C	150.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:88:179,0,88
20	30812779	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	30915461	.	T	C	321.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.849	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:350,0,136
20	30919183	.	A	G	274.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:303,0,19
20	30919945	.	T	C	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-0.546;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=27.92;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:475,0,122
20	30921846	.	A	G	225.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.276	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:254,0,267
20	31016119	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:78,0,35
20	31019024	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,118
20	31022959	.	T	C	575.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:604,42,0
20	31035129	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	31040783	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	31291161	.	C	T	1713.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1742,123,0
20	31291483	.	C	A	237.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:266,21,0
20	31331330	.	A	G	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.093	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:215,0,176
20	31380309	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	31386347	.	T	C	458.96	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=33.41;ReadPosRankSum=-1.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:5:486,0,5
20	31390840	.	C	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,154
20	31391229	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	31391360	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,78
20	31392366	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	31393803	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	31396536	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:105,0,111
20	31427635	.	C	T	1320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.051;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=25.90;ReadPosRankSum=-1.208	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,35:51:99:1349,0,546
20	31435620	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	31436747	.	C	T	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.060;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.258	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,14:31:99:494,0,654
20	31600217	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
20	31608250	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	31609581	.	C	T	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
20	31611438	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	31793004	.	C	T	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=11;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:236,0,148
20	31876681	.	A	G	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:171,0,228
20	31877713	.	A	T	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:133,0,298
20	31981849	.	T	C	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:436,30,0
20	32245546	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
20	32581570	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
20	32667298	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	32803351	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
20	32880762	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	32890337	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33018008	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	33070159	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	33075810	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	33076333	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	33095891	.	G	A	1400.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1429,99,0
20	33103521	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
20	33104592	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	33107278	.	G	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,378
20	33122525	.	G	A	98.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.646;DP=90;FS=5.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:81,9:90:99:127,0,3281
20	33139409	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	33139411	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	33139691	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	33140472	.	G	A	272.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:301,24,0
20	33142823	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	33142873	.	G	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
20	33143288	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	33144652	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:73,0,66
20	33145404	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	33145868	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
20	33147737	.	C	G	685.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:714,51,0
20	33148861	.	T	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	33149637	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,183
20	33150503	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
20	33151545	.	G	T	42.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:71,0,27
20	33155841	.	C	T	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
20	33156742	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
20	33161127	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
20	33164804	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	33167075	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	33167349	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	33292893	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	33294945	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	33298924	.	G	C	13.95	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=1.273;DP=27;FS=5.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=0.52;ReadPosRankSum=-1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:42:42,0,934
20	33317662	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33320571	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	33326876	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	33328024	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33333208	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	33337751	.	T	C	1806.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1835,129,0
20	33350987	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	33443866	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
20	33448496	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	33470694	.	C	T	2001.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2030,141,0
20	33488079	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	33490330	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
20	33496169	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33508588	.	G	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
20	33509275	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
20	33509523	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	33510120	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
20	33510662	.	A	G	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
20	33512236	.	T	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	33512466	.	T	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	33514465	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33517014	.	A	G	369.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:398,27,0
20	33518353	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	33520321	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	33522869	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	33527838	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	33538999	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33565480	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	33576989	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	33710551	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	33729147	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	33734905	.	G	C	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
20	33866028	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	33866029	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	33934301	.	T	C	112.10	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:11:140,0,11
20	33939973	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	33971914	.	C	T	1883.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=-1.080;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=28.92;ReadPosRankSum=1.660	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,45:47:59:1912,59,0
20	33997917	.	C	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
20	34028077	.	C	T	52.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:19:81,0,19
20	34028079	.	C	A	52.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:19:81,0,19
20	34239008	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
20	34328274	.	G	A	534.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:563,39,0
20	34537180	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.895	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:101,0,267
20	34537235	.	G	A	12.05	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:40:40,0,388
20	34541636	.	G	A	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:49:49,0,386
20	35090820	.	C	G	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
20	35156142	.	G	A	521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:550,39,0
20	35156746	.	G	C	367.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:396,30,0
20	35156848	.	G	A	111.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:140,15,0
20	35156849	.	A	C	111.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:140,15,0
20	35221158	.	G	A	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
20	35407640	.	C	T	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
20	35409887	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,119
20	35410515	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	35412834	.	G	A	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
20	35414768	.	C	T	478.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:507,36,0
20	35422704	.	G	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
20	35467713	.	G	A	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
20	35491551	.	A	G	106.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:134,12,0
20	35857457	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:302,21,0
20	35857466	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:302,21,0
20	35865054	.	C	T	1617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1646,114,0
20	35866267	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	35927179	.	G	A	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
20	35945238	.	C	G	538.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:567,39,0
20	35945343	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
20	35945396	.	A	G	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
20	36030939	.	G	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	36121721	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	36146148	.	T	C	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:597,45,0
20	36499238	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
20	36611647	.	C	A	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
20	36611664	.	C	T	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
20	36613778	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
20	36616694	.	C	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
20	36701012	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	37050753	.	A	G	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
20	37050817	.	T	C	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
20	37059749	.	T	G	563.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:592,42,0
20	37079237	.	T	C	308.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:337,24,0
20	37203813	.	C	T	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
20	37402365	.	T	G	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
20	39794885	.	G	A	687.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:716,51,0
20	39796161	.	A	G	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
20	40032029	.	T	G	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
20	42087454	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
20	42089511	.	T	C	1498.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1527,108,0
20	42091357	.	T	C	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
20	42328519	.	C	T	1135.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1164,81,0
20	42933642	.	T	C	31.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.727;DP=19;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=1.67;ReadPosRankSum=-0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:60:60,0,619
20	42939750	.	T	C	435.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:464,36,0
20	43121857	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	43257744	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
20	43280227	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	43379454	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	43382112	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
20	43383832	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
20	43559648	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:61,0,60
20	43588189	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	43603698	.	G	A	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
20	43604003	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	43626263	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	43629512	.	T	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	43704937	.	A	G	955.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:66:984,66,0
20	43704943	.	T	C	955.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:66:984,66,0
20	43704963	.	C	G	967.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:996,69,0
20	43705551	.	C	G	708.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=33.75;ReadPosRankSum=-0.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,18:21:71:737,0,71
20	43706559	.	G	A	609.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:638,45,0
20	43707709	.	A	G	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:98:98,0,308
20	43707759	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.567	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,4:21:99:101,0,637
20	43707776	.	A	G	286.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:99:315,0,131
20	43707790	.	A	G	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:49:49,0,432
20	43708297	.	T	G	686.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:715,51,0
20	43708872	.	G	A	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
20	43741803	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	43765658	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	43773168	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	43955141	.	G	A	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.826;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.901	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,5:23:99:152,0,699
20	43995880	.	T	G	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:503,39,0
20	43996012	.	G	T	406.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.938	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:51:435,0,51
20	43996132	.	C	T	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=2.037;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:268,0,127
20	43996189	.	G	A	259.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:288,21,0
20	43996454	.	G	T	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:183,0,209
20	43996466	.	C	T	142.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.676;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.103	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:171,0,168
20	43996807	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
20	43997240	.	A	G	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
20	43997502	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
20	43997646	.	C	A	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
20	43999636	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	44045880	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	44050342	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
20	44052992	.	G	A	877.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-2.633;DP=32;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=27.43;ReadPosRankSum=2.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,24:32:99:906,0,228
20	44054349	.	T	C	808.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.633;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.990	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,22:36:99:837,0,506
20	44420637	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
20	44420682	.	T	C	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:62,0,34
20	44466270	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	44469290	.	G	A	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:71:224,0,71
20	44471016	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
20	44477173	.	G	A	354.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=1.011;DP=29;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.056	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,11:29:99:383,0,673
20	44512431	.	G	T	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,610
20	44512432	.	C	G	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.925	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:99:99,0,610
20	44513024	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	44513357	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:74,0,34
20	44517360	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	44560401	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	44560440	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	44582836	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	44585793	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
20	44596207	.	C	G	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:720,51,0
20	44596262	.	C	T	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:247,0,173
20	44596545	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:58:58,0,227
20	44699991	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	44701287	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	44702086	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
20	44702120	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	44702167	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	44707364	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	44709539	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	44716532	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	44984224	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
20	44985307	.	T	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	44985865	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	44987318	.	C	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.933;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.800	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:152,0,339
20	44988054	.	C	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:74,0,76
20	44990714	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	44991482	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
20	44992719	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	44996182	.	A	G	629.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:658,48,0
20	45006333	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	45035232	.	G	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
20	45315786	.	C	T	370.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.796	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,10:15:99:399,0,173
20	45339337	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	45343237	.	T	A	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
20	45351336	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	45352958	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	45353009	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	45357878	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
20	45358223	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	45358995	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	45359040	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	45361455	.	T	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
20	45363766	.	T	C	1596.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1625,111,0
20	45364649	.	T	C	1202.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1231,84,0
20	45364758	.	T	G	384.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:413,30,0
20	45364838	.	T	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
20	45839078	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,84
20	45844576	.	T	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
20	45853037	.	A	G	1635.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1664,117,0
20	45865978	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,77
20	45873571	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,151
20	45874155	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	45878118	.	C	G	1105.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=-0.417;DP=39;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,30:39:99:1134,0,258
20	46078925	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	46078931	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	46078933	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	46130666	.	A	G	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
20	46284584	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=-2.504;DP=20;FS=9.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=4.44;ReadPosRankSum=2.599	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,4:20:99:117,0,604
20	46287012	.	C	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,200
20	46580634	.	C	T	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
20	46581116	.	C	G	679.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=-1.735;DP=18;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=32.15;ReadPosRankSum=1.542	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,17:18:21:708,21,0
20	46581600	.	A	T	697.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:726,51,0
20	46582944	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.638;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.638	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,144
20	46584632	.	C	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:138,0,321
20	46585736	.	A	G	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
20	46586630	.	C	T	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
20	46586666	.	A	T	319.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:10:20:348,20,0
20	46594660	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	46597397	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:29:75,0,29
20	46597400	.	C	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=23.39;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:29:75,0,29
20	47248885	.	C	A	1718.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.603;DP=54;FS=5.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=31.83;ReadPosRankSum=-0.789	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,45:54:99:1747,0,228
20	47253150	.	T	C	1404.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-0.870;DP=55;FS=6.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=25.54;ReadPosRankSum=0.816	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,37:55:99:1433,0,625
20	47361610	.	G	A	1287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.938;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=31.41;ReadPosRankSum=1.201	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,33:41:99:1316,0,221
20	47713063	.	C	T	2355.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2384,163,0
20	47717405	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	47718431	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	47721092	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	47721385	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
20	47725570	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
20	47725607	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	47727341	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
20	47731158	.	T	C	2512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2541,178,0
20	47731228	.	A	C	1883.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1912,135,0
20	47750377	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	47760070	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	47760856	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	47760857	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	47785229	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	47789301	.	T	C	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
20	47795069	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	47839515	.	G	A	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.697;DP=52;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:44,8:52:99:177,0,1736
20	47850182	.	C	T	2056.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,48:48:99:2085,144,0
20	47850614	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	47850757	.	T	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	47858922	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	47859217	.	G	A	1015.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1044,81,0
20	47864595	.	C	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-1.845;DP=19;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:72:72,0,600
20	47865372	.	G	A	704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:733,51,0
20	47865509	.	G	A	745.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-0.639;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.456	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,18:19:47:774,47,0
20	47866411	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
20	47867028	.	A	T	35.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
20	47872377	.	C	G	737.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:766,54,0
20	47886684	.	G	A	420.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:449,33,0
20	47895197	.	C	T	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
20	47898217	.	G	A	755.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:784,54,0
20	47899486	.	C	T	944.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:973,69,0
20	47899889	.	T	C	781.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=1.041;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=26.06;ReadPosRankSum=-1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:37:810,37,0
20	47900164	.	G	A	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
20	47900336	.	G	C	731.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:760,54,0
20	47902776	.	T	C	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
20	47903344	.	T	C	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:822,57,0
20	47903784	.	T	C	601.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:630,45,0
20	47903826	.	T	G	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
20	47904143	.	C	T	416.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:445,30,0
20	47904298	.	C	T	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:646,48,0
20	47904734	.	G	T	517.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:546,39,0
20	47904920	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
20	47905008	.	G	A	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
20	47905508	.	G	A	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
20	47909111	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	48249839	.	A	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,133
20	48250747	.	C	A	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=21.18;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:240,0,142
20	48251231	.	T	C	154.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.333	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:183,0,319
20	48252338	.	T	A	156.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:54:194,0,54
20	48252914	.	C	T	376.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.066;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.328	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,11:22:99:405,0,385
20	48257149	.	C	T	640.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-1.254;DP=22;FS=5.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.783	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,17:22:99:669,0,148
20	48259034	.	A	G	367.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.030	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:396,0,192
20	48480254	.	A	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:76,0,56
20	48489341	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	48491258	.	T	G	320.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=1.620;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=24.67;ReadPosRankSum=-1.312	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:349,0,134
20	48498704	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	48498719	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	48499259	.	G	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:156,0,67
20	48501351	.	C	T	83.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:24:112,0,24
20	48501606	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:114,0,64
20	48520610	.	A	G	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
20	48522330	.	G	A	249.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:278,0,218
20	48522585	.	G	A	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-0.328;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.328	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:431,0,198
20	48524827	.	A	G	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:62:197,0,62
20	48527423	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	48556248	.	A	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
20	48559240	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,114
20	48559339	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	48560184	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	48561280	.	T	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
20	48568929	.	G	T	1114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-2.890;DP=43;FS=2.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=25.92;ReadPosRankSum=2.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,29:43:99:1143,0,471
20	48569127	.	G	A	1032.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.381;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.613	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,28:38:99:1061,0,325
20	48569278	.	T	C	913.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.789;DP=36;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.252	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,24:36:99:942,0,433
20	48713049	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
20	48729677	.	C	G	762.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=1.146;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=33.17;ReadPosRankSum=-0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,21:23:19:791,0,19
20	48732264	.	C	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:73,0,71
20	48770159	.	T	C	808.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:837,66,0
20	48801958	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:79:123,0,79
20	48801959	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:79:123,0,79
20	49194096	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	49194607	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	49194615	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:81,6,0
20	49196599	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	49196602	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	49196998	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	49197203	.	C	T	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
20	49198327	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	49211643	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
20	49211747	.	C	G	313.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:88:342,0,88
20	49213986	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:74:116,0,74
20	49214055	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	49214156	.	A	G	506.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:535,39,0
20	49214188	.	C	T	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.661;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.220	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:529,0,303
20	49214383	.	G	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
20	49216966	.	C	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
20	49217503	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,281
20	49217859	.	T	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:80,0,33
20	49225610	.	G	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:80,0,31
20	49226911	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:76:117,0,76
20	49226921	.	C	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:76:117,0,76
20	49227500	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
20	49367076	.	T	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:78,0,70
20	49369006	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	49369447	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
20	49449929	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	49456822	.	C	A	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
20	49456825	.	G	A	421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:450,30,0
20	49497647	.	A	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
20	49507009	.	G	T	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.004;DP=14;FS=5.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=1.42;ReadPosRankSum=-1.187	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,489
20	49575021	.	G	T	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-2.622;DP=31;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.528	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,7:31:99:215,0,935
20	49620271	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	49620783	.	G	T	604.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:633,45,0
20	49620909	.	G	T	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.101	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:222,0,250
20	49621149	.	T	C	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
20	49622761	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	49626843	.	G	A	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.072;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.650	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:82:82,0,468
20	49628716	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	49630618	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	49639367	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	49639463	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:346,27,0
20	49870811	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	49879313	.	T	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
20	49985350	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
20	50017995	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	50020202	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	50022149	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
20	50023571	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	50024737	.	C	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	50025652	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	50026139	.	C	T	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
20	50026364	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	50035745	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	50040086	.	A	G	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
20	50040640	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	50043140	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	50044453	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
20	50045137	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	50045637	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
20	50045862	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
20	50046576	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	50048133	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	50049559	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	50055350	.	G	A	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
20	50213549	.	A	G	182.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.024;DP=31;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,7:31:99:211,0,957
20	50215820	.	T	C	1350.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-1.733;DP=33;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=28.07;ReadPosRankSum=1.628	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,32:33:61:1379,61,0
20	50225235	.	G	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	50225899	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	50226218	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
20	50227227	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	50228310	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	50287736	.	C	T	1930.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1959,138,0
20	50287790	.	A	G	1509.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1538,108,0
20	50407162	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	50408482	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:31:81,0,31
20	50692997	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	51405111	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:78,0,77
20	51408579	.	A	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	51703009	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	52105972	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52183705	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
20	52184384	.	T	A	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-0.858;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.306	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,14:21:99:316,0,145
20	52184502	.	C	T	992.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1021,72,0
20	52184944	.	C	T	887.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=3.617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=30.84;ReadPosRankSum=0.528	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,22:23:25:916,25,0
20	52186984	.	G	A	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:28:142,0,28
20	52192512	.	G	C	898.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.149;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=32.10;ReadPosRankSum=-1.083	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,24:28:87:927,0,87
20	52560126	.	A	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
20	52560504	.	A	T	901.06	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-1.238;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=24.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,27:29:11:938,11,0
20	52560506	.	T	A	903.41	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=1.850;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=24.42;ReadPosRankSum=2.281	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,27:29:8:931,8,0
20	52560784	.	A	G	2359.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=1.651;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=30.44;ReadPosRankSum=0.559	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,51:57:99:2388,0,338
20	52560792	.	A	G	2359.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-0.776;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=28.23;ReadPosRankSum=-1.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,54:60:99:2388,0,338
20	52561923	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	52562342	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	52563459	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:9:133,9,0
20	52563469	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	52564368	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
20	52564499	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	52564692	.	C	T	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:123,0,34
20	52564897	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52565854	.	G	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
20	52566271	.	G	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
20	52566977	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52567896	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	52572283	.	G	A	167.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:196,0,27
20	52573971	.	T	G	202.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:18:231,0,18
20	52574579	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:81,0,37
20	52574739	.	C	T	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:58:200,0,58
20	52575046	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
20	52575455	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
20	52577607	.	T	C	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
20	52578116	.	C	G	454.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:483,33,0
20	52578368	.	C	G	205.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:19:234,0,19
20	52578414	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	52579974	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52579976	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52580515	.	T	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
20	52580549	.	G	A	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
20	52580883	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	52580946	.	G	A	246.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:275,0,22
20	52581515	.	A	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
20	52582802	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	52583181	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	52586281	.	A	T	136.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:20:165,0,20
20	52588033	.	G	A	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,276
20	52590770	.	G	A	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
20	52590976	.	T	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
20	52609868	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	52610006	.	G	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	52617009	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52679327	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52680585	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	52681083	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	52684627	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	52825731	.	G	A	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
20	52826759	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
20	52827268	.	T	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
20	52827293	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	52828384	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	52830519	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	52833417	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:158,0,30
20	52834988	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	52835168	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	52836074	.	T	C	829.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,22:23:24:858,24,0
20	52956235	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	53267582	.	G	A	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
20	53267593	.	G	A	221.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:250,18,0
20	53267627	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:215,15,0
20	53267635	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	54941585	.	G	A	59.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.966;DP=43;FS=7.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.890	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,5:43:88:88,0,1488
20	54947143	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	54948841	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	54961463	.	T	C	2611.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,61:61:99:2640,183,0
20	54961541	.	A	T	1939.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.746;DP=54;FS=12.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,49:54:65:1968,0,65
20	54967565	.	A	G	844.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:873,60,0
20	54967893	.	C	T	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
20	54968159	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
20	54968394	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:73:73,0,245
20	54968401	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,245
20	54968457	.	A	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:68,0,31
20	54968468	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:71:81,0,71
20	54968471	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:71:81,0,71
20	54968735	.	G	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	54970269	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	54971386	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	54971815	.	T	A	12.99	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=4.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:8:71,8,0
20	54974424	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	54974708	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	54974993	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55062564	.	G	A	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
20	55070268	.	A	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	55079036	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55079272	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	55081162	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	55084295	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	55087875	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	55088404	.	A	G	2968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:2997,208,0
20	55093901	.	A	G	793.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:822,57,0
20	55097072	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
20	55111371	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	55312778	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	55315971	.	G	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	55316138	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
20	55316442	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	55316506	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	55743905	.	T	C	673.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:702,48,0
20	55744311	.	A	C	1135.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1164,84,0
20	55744387	.	G	C	950.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:979,69,0
20	55744412	.	T	G	1310.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1339,96,0
20	55744499	.	C	T	1221.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1250,90,0
20	55745073	.	A	G	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
20	55745681	.	A	G	2366.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2395,175,0
20	55750438	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	55751749	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	55751806	.	T	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	55752680	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55752836	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55757329	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	55757341	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	55757974	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
20	55758243	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	55758655	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
20	55759157	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	55761285	.	C	A	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
20	55762529	.	T	C	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	55762810	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55762947	.	G	A	386.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:415,30,0
20	55764065	.	T	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
20	55765046	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
20	55765775	.	G	A	132.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:161,15,0
20	55766071	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	55768403	.	T	C	125.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:154,0,26
20	55789914	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55791458	.	T	C	94.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:123,0,27
20	55791708	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	55793559	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
20	55794749	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	55800386	.	T	C	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:77:77,0,78
20	55951474	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
20	55952187	.	A	G	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
20	55952591	.	G	A	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:41:512,41,0
20	55952702	.	T	A	279.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.03;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:1:305,0,1
20	55953553	.	C	T	494.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-2.143;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=30.92;ReadPosRankSum=1.985	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,14:16:27:523,0,27
20	55953682	.	C	T	276.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:305,24,0
20	55966494	.	C	G	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
20	55966495	.	G	C	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:720,48,0
20	55968113	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	55969270	.	A	G	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
20	55969276	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
20	55969492	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	55969697	.	C	G	200.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:229,18,0
20	55970139	.	A	G	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
20	55970689	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	55971050	.	T	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
20	55972765	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
20	55973784	.	G	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
20	55974779	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
20	55978159	.	A	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
20	55979488	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	55980715	.	T	C	186.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:215,18,0
20	56042442	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	56224579	.	C	T	47.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.684;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,4:34:76:76,0,1195
20	56227532	.	T	C	2213.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,53:53:99:2242,160,0
20	56232583	.	C	A	75.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:103,9,0
20	56239763	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
20	56240718	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	56242364	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	56242563	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	56245841	.	C	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	56248688	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	56250608	.	G	A	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
20	56260787	.	G	A	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
20	56272769	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	56273172	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
20	56282491	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	56286834	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
20	56297824	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
20	56298691	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
20	56299156	.	C	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	56300897	.	T	C	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
20	56301509	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	56302388	.	C	G	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
20	56560032	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	56820880	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	56821127	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	56822536	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
20	56922350	.	C	T	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:77,0,74
20	56922472	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	56923428	.	C	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:77,0,65
20	56925917	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	56927901	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:64:64,0,241
20	56928297	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
20	56928391	.	C	T	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.048;DP=52;FS=5.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.919	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,9:52:99:230,0,1708
20	57020556	.	G	C	17.84	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.656;DP=27;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:46:46,0,950
20	57023811	.	T	C	31.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:60:60,0,282
20	57177555	.	C	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
20	57235374	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
20	57236830	.	C	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
20	57240274	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	57240842	.	C	T	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-1.754;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:154,0,101
20	57244201	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	57245425	.	G	A	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
20	57249246	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	57249771	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	57250784	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,81
20	57250986	.	G	C	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
20	57253132	.	A	G	2145.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2174,151,0
20	57253296	.	A	G	990.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.683;DP=33;FS=7.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=30.02;ReadPosRankSum=-0.683	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,26:33:99:1019,0,192
20	57253712	.	A	T	57.73	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.741;DP=31;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,27:31:33:776,0,33
20	57268569	.	G	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	57270487	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	57272617	.	T	C	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:78,0,26
20	57272722	.	A	G	214.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:19:243,0,19
20	57273664	.	T	G	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:79,0,37
20	57277353	.	G	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	57278244	.	C	T	428.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=32.98;ReadPosRankSum=-1.737	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:0:454,0,0
20	57278529	.	G	A	395.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-0.425;DP=15;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.255	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,13:15:34:424,0,34
20	57279854	.	C	T	253.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,7:8:22:282,0,22
20	57280471	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
20	57280575	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
20	57282381	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	57282659	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:107,0,28
20	57283828	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	57283897	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	57284759	.	G	C	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:110,0,70
20	57285380	.	G	C	46.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:75,0,23
20	57285847	.	G	T	90.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.72;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:117,2,0
20	57285889	.	C	G	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
20	57289017	.	C	T	68.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.288;DP=46;FS=4.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.321	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,6:46:97:97,0,1507
20	57290347	.	C	G	1644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1673,117,0
20	57290705	.	T	C	963.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:992,69,0
20	57290846	.	C	T	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
20	57291983	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
20	57292888	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
20	57293477	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:73,0,29
20	57293988	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
20	57415110	.	A	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
20	57475191	.	A	G	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.133;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=10.68;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:135,0,221
20	57478939	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	57481148	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	57481587	.	C	G	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
20	57483655	.	T	C	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:119,0,68
20	57483948	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	57485611	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	57563765	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	57565943	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	57566414	.	A	G	1732.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1761,125,0
20	57566637	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	57569816	.	G	T	1062.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1091,75,0
20	57570456	.	C	T	827.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:856,60,0
20	57570568	.	G	A	1392.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1421,102,0
20	57571763	.	A	G	1086.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1115,78,0
20	57572675	.	A	G	1221.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1250,87,0
20	57573855	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	57574463	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
20	57609590	.	A	G	567.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.434;DP=16;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.217	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:11:595,11,0
20	57612757	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	58409495	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	58409496	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	58424285	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	58520926	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,105
20	60562725	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	60572663	.	C	A	565.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:594,42,0
20	60703707	.	C	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
20	60704185	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	60706922	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	60708734	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	60712347	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	60712511	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	60713038	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	60713311	.	G	A	2654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2683,190,0
20	60713332	.	A	G	2678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,63:63:99:2707,190,0
20	60713571	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	60714525	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	60718420	.	C	T	1005.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:86:1034,86,0
20	60725926	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
20	60726411	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
20	60727032	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
20	60727317	.	G	A	158.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:187,15,0
20	60727525	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
20	60727876	.	A	G	94.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:121,2,0
20	60727898	.	C	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
20	60727907	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
20	60728038	.	T	C	342.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:371,27,0
20	60728767	.	T	C	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:427,30,0
20	60728815	.	T	C	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
20	60729040	.	T	C	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
20	60729178	.	A	G	301.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:330,24,0
20	60729676	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	60763443	.	T	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	60768497	.	C	T	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
20	60777070	.	A	G	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
20	60777155	.	G	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
20	60777232	.	C	T	346.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:375,27,0
20	60777929	.	C	T	69.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
20	60778725	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
20	60781095	.	A	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
20	60781155	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	60782593	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	60805500	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	60839741	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	60860799	.	T	C	256.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:285,21,0
20	60860944	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
20	60861195	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	60869680	.	C	T	613.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:642,45,0
20	60881330	.	G	A	1963.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:1992,147,0
20	60881643	.	T	C	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
20	60881780	.	T	C	1361.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1390,99,0
20	60882091	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	60882277	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
20	60883273	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	60884073	.	T	C	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
20	60885448	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
20	60891288	.	A	G	169.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:198,15,0
20	60892526	.	A	G	610.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:639,45,0
20	60893506	.	T	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	60894278	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
20	60894436	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
20	60894470	.	C	T	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
20	60895738	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-2.774;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=4.60	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:111,0,732
20	60897487	.	C	T	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:692,51,0
20	60899206	.	C	T	377.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:406,30,0
20	60899907	.	A	G	341.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:370,30,0
20	60900174	.	C	T	30.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:59:59,0,109
20	60900234	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	60900481	.	A	G	530.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:559,42,0
20	60900579	.	C	A	556.56	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=34.78;ReadPosRankSum=1.085	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:7:584,7,0
20	60903749	.	G	A	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
20	60904853	.	T	C	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
20	60905878	.	A	G	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
20	60907446	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
20	60907675	.	G	A	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
20	60909060	.	A	G	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:782,57,0
20	60912683	.	T	C	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
20	60920887	.	G	A	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
20	60921643	.	T	C	393.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:422,30,0
20	60927349	.	C	T	540.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:569,42,0
20	60927412	.	G	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
20	60937597	.	A	G	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
20	60961769	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	60963055	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	60963188	.	G	C	122.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:150,12,0
20	60964122	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
20	60964301	.	C	T	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
20	60966318	.	G	T	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
20	60969457	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	60969603	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	60972433	.	T	G	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
20	60975550	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
20	60977864	.	T	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
20	60978361	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
20	60985627	.	T	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
20	60985721	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
20	60987737	.	C	T	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
20	60989185	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
20	61088819	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	61089110	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	61089674	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
20	61199023	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	61275064	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	61284739	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	61287237	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	61287238	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	61287239	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	61287727	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
20	61303566	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
20	61303579	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	61312116	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:71,0,36
20	61315002	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:76,0,33
20	61321422	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
20	61444624	.	G	A	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:91:91,0,310
20	61445312	.	A	G	170.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:199,0,22
20	61468571	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
20	61472808	.	G	C	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,112
20	61475563	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:76,0,75
20	61488785	.	T	C	97.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:126,0,458
20	61492227	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
20	61512606	.	T	C	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
20	61515227	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
20	61519042	.	T	C	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
20	61519618	.	T	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
20	61519866	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
20	61519988	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
20	61521183	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
20	61521515	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	61522019	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	61528074	.	T	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
20	61528271	.	C	T	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.549;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=21.67;ReadPosRankSum=1.310	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:440,0,230
20	61528306	.	A	G	671.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:700,51,0
20	61530582	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	61536938	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:123,0,32
20	61541028	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	61565255	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,77
20	61565485	.	G	A	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:141,0,149
20	61569523	.	G	C	425.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=1.634;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=25.05;ReadPosRankSum=-1.950	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,12:17:99:454,0,171
20	61576777	.	A	G	283.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-0.255;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=11.35;ReadPosRankSum=2.293	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,9:25:99:312,0,615
20	61577275	.	T	C	218.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.244	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:247,0,362
20	61577629	.	C	T	216.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.634;DP=19;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:245,0,456
20	61578193	.	C	T	377.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-1.615;DP=25;FS=10.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.560	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:406,0,504
20	61578610	.	G	A	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.626	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,12:22:99:447,0,335
20	61834092	.	G	A	545.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.803;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=21.83;ReadPosRankSum=1.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,15:25:99:574,0,345
20	61834695	.	G	A	1062.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-1.609;DP=40;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=26.57;ReadPosRankSum=1.668	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,28:40:99:1091,0,396
20	61837559	.	C	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:116,0,32
20	61840663	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	61846539	.	C	A	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
20	61847357	.	G	A	331.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.586;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=20.74;ReadPosRankSum=1.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,11:16:99:360,0,156
20	61848623	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
20	61908155	.	A	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,113
20	61909041	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
20	61914465	.	A	G	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
20	61917241	.	A	G	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
20	61919755	.	C	T	24.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=-0.126;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.076	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,4:36:53:53,0,1173
20	62119121	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	62119559	.	C	G	897.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:926,69,0
20	62121314	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	62121726	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	62122936	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	62123648	.	T	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	62125233	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,106
20	62127521	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:96:96,0,103
20	62128433	.	A	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.034	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:146,0,255
20	62128580	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.368	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:142,0,140
20	62128621	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.09;ReadPosRankSum=-1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,227
20	62129566	.	C	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:119,0,29
20	62129808	.	G	A	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:96:96,0,151
20	62153786	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
20	62157646	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
20	62159496	.	A	T	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:195,0,145
20	62159746	.	T	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:58:58,0,104
20	62162340	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:81,0,34
20	62167704	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.35;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:145,0,31
20	62167839	.	C	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
20	62171507	.	G	A	66.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=-0.816;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.437	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,5:42:95:95,0,1390
20	62171556	.	T	C	1334.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1363,96,0
20	62172219	.	G	A	1272.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.572;DP=36;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.114	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,33:36:13:1301,0,13
20	62173029	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
20	62173562	.	G	T	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:116,0,61
20	62174724	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
20	62180117	.	G	A	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:77,0,32
20	62190180	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:77,0,37
20	62190345	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
20	62190412	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
20	62191321	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
20	62191558	.	G	A	80.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:109,0,20
20	62193019	.	C	T	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
20	62193445	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	62194030	.	G	C	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
20	62194103	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	62195220	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
20	62196033	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
20	62196182	.	G	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
20	62196807	.	T	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
20	62196884	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
20	62198348	.	C	T	225.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:254,21,0
20	62200575	.	T	C	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
20	62200576	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
20	62200860	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
20	62203748	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
20	62219269	.	G	C	178.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:207,0,229
20	62219679	.	C	T	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:585,42,0
20	62219740	.	G	A	480.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:509,39,0
20	62219837	.	A	G	748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:777,54,0
20	62221364	.	G	A	353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:382,30,0
20	62221610	.	T	C	704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:733,54,0
20	62221766	.	C	T	596.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:625,45,0
20	62225368	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	62225508	.	G	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
20	62227081	.	A	G	539.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:568,39,0
20	62228699	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
20	62236148	.	T	C	617.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:646,45,0
20	62252044	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	62271380	.	A	G	841.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:870,60,0
20	62272658	.	T	C	474.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.132;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.044	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,13:19:99:503,0,189
20	62299814	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	62303622	.	T	G	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
20	62307761	.	C	T	45.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:74,0,26
20	62309839	.	A	G	53.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:82:82,0,103
20	62310517	.	C	T	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
20	62312299	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
20	62312497	.	A	G	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:117,0,73
20	62312755	.	G	A	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:115,0,69
20	62316447	.	C	T	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
20	62316630	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
20	62316634	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
20	62318220	.	T	C	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.633	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:235,0,150
20	62318856	.	G	C	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.729;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:147,0,182
20	62320242	.	G	A	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:154,0,61
20	62320469	.	C	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,6:18:99:137,0,426
20	62320968	.	T	C	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.191;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.191	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:226,0,215
20	62322288	.	T	C	197.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:226,0,132
20	62322699	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:40:72,0,40
20	62323006	.	G	C	164.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:193,0,22
20	62326110	.	A	C	797.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:826,57,0
20	62326579	.	G	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
20	62327199	.	A	G	961.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:990,69,0
20	62327582	.	G	A	288.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:317,24,0
20	62328375	.	A	G	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:443,33,0
20	62330417	.	T	C	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
20	62330586	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:66,0,77
20	62332436	.	A	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
20	62332537	.	C	T	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
20	62336258	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
20	62336334	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	62337622	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
20	62340115	.	C	G	716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:745,54,0
20	62367377	.	A	G	558.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:587,42,0
20	62368606	.	T	C	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
20	62369300	.	C	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-2.589;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.83	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:65:65,0,1043
20	62370349	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
20	62372148	.	G	C	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
20	62372706	.	G	A	333.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:362,27,0
20	62372813	.	G	A	2834.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2863,199,0
20	62373707	.	G	T	3281.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:3310,229,0
20	62374389	.	C	T	1100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.012;DP=47;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,33:47:99:1129,0,448
20	62374441	.	T	C	1990.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2019,141,0
20	62376939	.	A	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
20	62378349	.	C	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
20	62378364	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
20	62472757	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
20	62492772	.	C	G	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:146,0,154
20	62495349	.	C	T	144.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:173,0,313
20	62505892	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
20	62518729	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
20	62518766	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
20	62520360	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
20	62522315	.	A	G	825.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=1.737;DP=53;FS=12.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=15.58;ReadPosRankSum=-1.595	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,25:53:99:854,0,997
20	62522466	.	A	G	797.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.256;DP=43;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.012	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,23:43:99:826,0,692
20	62565646	.	G	A	538.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.348;DP=28;FS=9.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.812	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,16:28:99:567,0,439
20	62573064	.	T	C	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:95:95,0,219
20	62573697	.	A	G	21.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,347
20	62576472	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	62580642	.	C	G	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:47:47,0,293
20	62580728	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:61:61,0,234
20	62580879	.	G	A	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:143,0,168
20	62581453	.	G	A	201.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:230,0,141
20	62583838	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:111,0,31
20	62595169	.	A	G	287.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.024;DP=28;FS=9.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.120	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:316,0,670
20	62595547	.	C	T	239.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=1.584;DP=30;FS=6.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.724	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,9:30:99:268,0,815
20	62595990	.	T	C	371.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.783;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.080	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,12:30:99:400,0,663
20	62597666	.	C	T	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.043;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=7.63;ReadPosRankSum=1.043	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,8:28:99:242,0,733
20	62597694	.	T	G	463.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.185;DP=35;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:492,0,772
20	62598815	.	C	T	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=-1.184;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=10.16;ReadPosRankSum=1.346	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:404,0,924
20	62599141	.	C	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:157,0,104
20	62600044	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.143	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:120,0,207
20	62664365	.	C	T	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,7:19:99:233,0,408
20	62664408	.	G	C	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.493	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:242,0,210
20	62697751	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
20	62709274	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
20	62711050	.	C	A	190.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:219,18,0
21	9825531	.	A	G	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:704,54,0
21	9825735	.	T	C	38.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
21	9825769	.	C	A	351.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.156;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.467	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:74:380,0,74
21	9825838	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:146,0,271
21	9826033	.	C	T	22.79	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.524;DP=24;FS=2.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.349	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:51:51,0,772
21	9826047	.	C	A	25.78	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.087;DP=24;FS=2.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.087	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:54:54,0,797
21	9826301	.	T	C	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
21	9827315	.	T	C	2946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-1.363;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=31.82;ReadPosRankSum=1.409	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,74:75:99:2975,184,0
21	9907419	.	A	G	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:73:123,0,73
21	9907422	.	G	A	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:73:123,0,73
21	9907625	.	T	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:63,0,36
21	9908292	.	A	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
21	9908366	.	C	T	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,113
21	9909078	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
21	9909080	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
21	9909099	.	C	T	197.03	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:12:225,0,12
21	9909176	.	C	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:118,0,34
21	9909701	.	G	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
21	9909708	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
21	9909725	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
21	9910598	.	C	A	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
21	9912194	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
21	9913829	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	9914023	.	T	C	282.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:311,21,0
21	9916283	.	C	A	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:104,0,108
21	9917269	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	9919399	.	C	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,79
21	9919477	.	A	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:105,0,30
21	9920733	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	9921231	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
21	9922225	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	9922243	.	C	A	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:69,0,31
21	9922264	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:81,0,28
21	9922415	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	9922419	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	9923150	.	A	G	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:95,0,34
21	9925539	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
21	9925846	.	G	A	211.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:240,0,21
21	9926112	.	T	C	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:36:39,0,36
21	9927421	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	9929618	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
21	9958580	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	14343847	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
21	14365296	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	14366910	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
21	14751456	.	C	T	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
21	15229345	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	15231271	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	15449004	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	15457374	.	G	C	789.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=1.073;DP=21;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=32.33;ReadPosRankSum=1.569	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,20:21:21:818,21,0
21	15457399	.	G	C	554.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.735	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:2:581,2,0
21	15472048	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	15594465	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
21	15745106	.	C	T	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,138
21	15745269	.	T	C	205.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:98:234,0,98
21	16335515	.	C	T	106.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.929;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:135,0,305
21	16336804	.	T	C	98.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:127,0,305
21	16339172	.	G	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.741;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:146,0,218
21	16340289	.	C	T	135.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:164,0,27
21	17993890	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	17995286	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	17999949	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
21	18003265	.	G	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
21	18003284	.	G	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,99
21	18013920	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	18018438	.	A	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
21	18939939	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:71:115,0,71
21	18939956	.	T	C	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:158,0,71
21	19161689	.	C	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,68
21	20230158	.	C	T	437.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.083;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=29.18;ReadPosRankSum=-1.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,12:15:84:466,0,84
21	22053936	.	G	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
21	26965148	.	G	A	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:623,45,0
21	26965205	.	T	C	658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:687,48,0
21	26969703	.	T	C	748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:777,54,0
21	26978950	.	A	G	712.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:741,54,0
21	27106656	.	A	G	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:68:137,0,68
21	27143162	.	T	A	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
21	28217446	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
21	30244895	.	T	C	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
21	30245239	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,121
21	30245288	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	30245340	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
21	30245466	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
21	30245824	.	T	C	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:66:120,0,66
21	30245894	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:79,0,29
21	30246881	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	30247458	.	C	T	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
21	30247533	.	C	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,100
21	30247960	.	A	G	160.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
21	30248108	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
21	30248353	.	C	T	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
21	30250615	.	T	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
21	30257560	.	C	G	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:343,24,0
21	30257568	.	T	C	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:343,24,0
21	30312630	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	30341891	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,155
21	30408670	.	A	T	402.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.934;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=28.77;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,11:14:88:431,0,88
21	30416824	.	A	G	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
21	30427862	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:73,0,35
21	30427889	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:71,0,37
21	30445961	.	G	A	107.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:136,0,317
21	30536886	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	30714776	.	T	C	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
21	30715275	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
21	30717151	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
21	30717441	.	C	T	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:65:184,0,65
21	30717737	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
21	30718201	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
21	30737095	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	30969901	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	32494610	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	32649178	.	G	A	80.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:109,0,33
21	33056573	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	33068937	.	C	A	484.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:513,36,0
21	33368188	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
21	33370900	.	T	C	299.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:328,24,0
21	33371123	.	C	T	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,73
21	33371540	.	T	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
21	33371655	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	33372446	.	C	T	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,151
21	33372749	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
21	33372977	.	A	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
21	33373123	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
21	33373128	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	33373172	.	G	C	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
21	33373930	.	A	C	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
21	33374102	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
21	33641152	.	A	G	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:540,39,0
21	33688865	.	A	G	141.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:170,0,130
21	33693681	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	33693682	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	33694224	.	C	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:479,36,0
21	33694257	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
21	33717877	.	G	A	273.82	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=24.89;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:19:302,0,19
21	33719400	.	A	G	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:147,0,107
21	33719695	.	C	T	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
21	33755763	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:31:120,0,31
21	33757947	.	A	T	205.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:234,0,24
21	33961041	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
21	34001496	.	G	A	156.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:185,0,28
21	34128717	.	G	A	111.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:140,0,115
21	34130671	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:106,0,190
21	34433051	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	34602246	.	T	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:68,0,31
21	34614255	.	T	G	122.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:151,0,143
21	34660901	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	34660980	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	34660987	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	34661145	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	34664968	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	34669154	.	G	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,148
21	34696867	.	C	T	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
21	34728056	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,146
21	34730954	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
21	34804966	.	T	C	82.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
21	34809693	.	C	T	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
21	34821570	.	G	A	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
21	34821691	.	G	C	796.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:825,57,0
21	34822150	.	T	A	900.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:929,66,0
21	34822452	.	T	C	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:765,54,0
21	34822582	.	A	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
21	34822933	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:99,0,181
21	34871281	.	A	G	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
21	34873875	.	T	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
21	34897113	.	C	T	733.79	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.214;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=30.13;ReadPosRankSum=1.561	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:22:762,22,0
21	34901423	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
21	34925142	.	C	T	900.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:929,66,0
21	34925659	.	T	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=-0.595;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.805	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,6:23:99:155,0,1393
21	34926260	.	C	T	1188.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1217,87,0
21	34943543	.	G	T	240.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:269,18,0
21	34959776	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
21	34964201	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:75,0,65
21	34965114	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	34965327	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	35190655	.	G	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:113,0,108
21	35210012	.	C	T	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,149
21	35210252	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,79
21	35279362	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
21	35467645	.	A	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
21	35469193	.	C	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
21	35470042	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
21	35955544	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	35955545	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	35955546	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	36163071	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:60:78,0,60
21	36163294	.	G	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.495;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,190
21	36731491	.	A	C	50.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:79,0,27
21	37259622	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	37259632	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	37507745	.	C	T	258.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=18.48;ReadPosRankSum=1.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,8:14:99:287,0,204
21	37514317	.	C	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:79,0,36
21	37518706	.	G	A	222.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.201	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:251,0,256
21	37521843	.	C	T	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
21	37529112	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
21	37529180	.	C	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:148,0,149
21	37617630	.	T	G	980.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1009,72,0
21	37617724	.	C	A	389.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-1.758;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=24.36;ReadPosRankSum=1.637	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,12:16:99:418,0,117
21	37638920	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
21	37640964	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	37642196	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	37661405	.	G	A	469.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=20.42;ReadPosRankSum=1.457	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:498,0,341
21	37664501	.	G	A	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.718	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:128,0,420
21	37748580	.	G	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,78
21	38010192	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	38012090	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	38013006	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
21	38014612	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
21	38014652	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
21	38014687	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
21	38014854	.	C	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
21	38015009	.	A	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
21	38071665	.	G	A	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
21	38073286	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	38083575	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	38092039	.	A	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
21	38104738	.	C	T	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
21	38107747	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
21	38117308	.	C	A	676.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:705,51,0
21	38118940	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	38121537	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
21	38337404	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	38340866	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:69,0,37
21	38444863	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
21	38512956	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
21	38525356	.	T	C	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:608,42,0
21	38529482	.	G	A	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:118,0,68
21	38531548	.	A	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	38568009	.	G	C	869.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:898,63,0
21	38568308	.	C	T	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:504,36,0
21	38574018	.	C	T	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
21	38574674	.	C	G	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
21	38574675	.	T	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
21	38574680	.	T	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:24:360,24,0
21	38596677	.	G	A	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
21	38635848	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	38739632	.	C	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,213
21	38885442	.	A	G	377.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-2.415;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=25.18;ReadPosRankSum=2.154	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:406,0,123
21	40191638	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
21	40195059	.	A	G	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:115,0,66
21	40549466	.	T	C	725.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-1.173;DP=37;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=19.62;ReadPosRankSum=1.661	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,20:37:99:754,0,621
21	40552307	.	A	G	485.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=-1.465;DP=35;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,14:35:99:514,0,765
21	40555351	.	G	C	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=1.482	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:257,0,290
21	40556595	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
21	40560262	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,117
21	40560436	.	C	T	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
21	40560678	.	T	G	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:152,0,112
21	40562165	.	A	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
21	40563315	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:57:142,0,57
21	40564202	.	C	G	173.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:25:202,0,25
21	40564464	.	T	C	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
21	40566067	.	A	G	87.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:116,0,30
21	40567716	.	C	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,277
21	40571246	.	A	G	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
21	40574305	.	A	G	124.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:153,0,139
21	40582823	.	C	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,270
21	40652142	.	G	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,111
21	40669083	.	G	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
21	40669305	.	C	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
21	40690537	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
21	40693490	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:70,0,33
21	40714478	.	C	T	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.44	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:99:138,0,300
21	40714483	.	C	G	109.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,1:9:99:138,0,300
21	40716885	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	40717478	.	C	A	175.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:204,18,0
21	40717500	.	T	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
21	40718161	.	C	T	547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:576,39,0
21	40718440	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
21	40718518	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
21	40719027	.	A	G	333.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.81;ReadPosRankSum=-0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:83:362,0,83
21	40719241	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
21	40720081	.	G	C	219.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.780;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.663	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:248,0,252
21	40793911	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	40823902	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	40823981	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
21	42622786	.	C	T	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:101,0,140
21	42688931	.	C	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
21	42690424	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
21	42691622	.	G	A	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.876;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,193
21	42694633	.	A	T	69.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
21	42713371	.	C	T	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:33:119,0,33
21	42717662	.	T	C	454.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.651;DP=27;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.837	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,13:23:99:483,0,290
21	42718567	.	C	G	55.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:81,0,1
21	42729837	.	G	T	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:30:157,0,30
21	42742212	.	C	A	350.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:379,27,0
21	42742529	.	A	G	357.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:386,27,0
21	42780610	.	T	C	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
21	42824733	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
21	42836729	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
21	42836751	.	T	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
21	42840580	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
21	42879909	.	C	A	150.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:179,15,0
21	43160438	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.937;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:108,0,150
21	43160908	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,151
21	43161022	.	C	T	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,98
21	43161357	.	T	C	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
21	43161805	.	G	A	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.988;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.988	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:101,0,113
21	43161877	.	C	T	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,115
21	43164232	.	C	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:74,0,37
21	43218520	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	43218807	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
21	43219728	.	A	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
21	43220380	.	C	A	157.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:186,15,0
21	43220724	.	G	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
21	43221483	.	A	G	211.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
21	43221826	.	T	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
21	43229270	.	T	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	43236176	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:73:120,0,73
21	43239972	.	A	G	215.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:244,18,0
21	43256252	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
21	43256629	.	G	A	100.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:129,0,27
21	43258062	.	C	T	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:186,0,185
21	43258138	.	C	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:178,0,113
21	43267260	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
21	43305435	.	C	T	525.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:554,39,0
21	43305463	.	G	A	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
21	43305937	.	G	A	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
21	43307329	.	A	G	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
21	43309191	.	A	G	546.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:575,42,0
21	43310472	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	43310797	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	43313056	.	C	T	57.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:85,9,0
21	43314506	.	G	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	43317151	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	43327856	.	A	G	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:437,30,0
21	43386061	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	43408035	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
21	43413731	.	C	T	252.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:281,21,0
21	43422525	.	C	T	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
21	43427492	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	43547873	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
21	43556801	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	43557559	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	43562531	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	43716901	.	A	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
21	43718792	.	A	G	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
21	43719965	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
21	43732954	.	A	G	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
21	43733931	.	G	A	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
21	43734984	.	A	G	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
21	43783055	.	G	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	43784482	.	G	A	123.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
21	43786313	.	C	T	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
21	43786512	.	C	T	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
21	43938465	.	C	T	211.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.342	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:240,0,396
21	43966144	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	43981239	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	43981654	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:73,0,77
21	43985955	.	G	A	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:257,0,133
21	43988437	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:73,0,36
21	43989267	.	C	G	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:68,0,34
21	43989391	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:75,0,67
21	43990798	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	43991942	.	A	G	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:69:148,0,69
21	43995923	.	G	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:56:114,0,56
21	43995954	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:78,0,29
21	43998296	.	A	G	114.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:143,0,56
21	43998582	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
21	44000901	.	A	G	433.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=22.83;ReadPosRankSum=-0.127	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,12:19:99:462,0,247
21	44001064	.	T	C	527.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.539;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.498	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,15:30:99:556,0,554
21	44001164	.	A	G	314.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-1.266;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.164;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,10:19:99:343,0,323
21	44001199	.	T	C	424.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=1.967;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=21.24;ReadPosRankSum=-1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,12:20:99:453,0,280
21	44001218	.	A	G	185.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.634;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.397;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,7:22:99:214,0,548
21	44006007	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	44019323	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	44019550	.	T	C	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:141,0,66
21	44020047	.	A	G	219.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:248,0,25
21	44020069	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	44020146	.	T	C	119.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:98:148,0,98
21	44020651	.	T	C	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:113,0,29
21	44257388	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	44260825	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	44261313	.	C	T	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
21	44263594	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:74:75,0,74
21	44264056	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,116
21	44264336	.	A	T	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:137,0,103
21	44264468	.	A	T	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
21	44264597	.	G	A	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
21	44265602	.	C	T	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,225
21	44266500	.	C	A	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
21	44267360	.	G	A	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
21	44269355	.	C	A	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:438,30,0
21	44269654	.	C	T	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=23.54;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:69:193,0,69
21	44269681	.	T	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
21	44269825	.	G	C	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:40:198,0,40
21	44273858	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
21	44293744	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:81:81,0,277
21	44326317	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	44331003	.	G	A	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:64,0,37
21	44346591	.	A	G	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
21	44395730	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	44395754	.	G	C	83.81	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:112,0,20
21	44430325	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
21	44450938	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:117,0,116
21	44451912	.	G	A	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,119
21	44452838	.	C	A	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,108
21	44452948	.	G	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,111
21	44453277	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,201
21	44453278	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,201
21	44453285	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:78:78,0,201
21	44453372	.	G	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:145,0,105
21	44473691	.	C	T	232.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:58:261,0,58
21	44473867	.	G	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
21	44473980	.	G	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	44480616	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.369	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:264,0,211
21	44513500	.	C	T	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:155,0,71
21	44514488	.	G	A	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.300;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.300	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,108
21	44515346	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	44517914	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
21	44518028	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	44524006	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
21	44525219	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	44527669	.	T	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
21	44757288	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	44835301	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	45096206	.	G	A	203.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=18.52;ReadPosRankSum=2.359	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:232,0,189
21	45107518	.	A	G	438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:467,33,0
21	45107562	.	T	C	386.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=25.78;ReadPosRankSum=-1.371	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,11:15:99:415,0,117
21	45113629	.	C	G	243.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:57:272,0,57
21	45132882	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	45164854	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	45166979	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
21	45175958	.	T	C	531.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.230;DP=28;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.092	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,15:28:99:560,0,455
21	45176304	.	T	C	529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:558,42,0
21	45177255	.	C	A	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=10.07;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:139,0,240
21	45178438	.	C	A	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
21	45178995	.	C	T	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,133
21	45179113	.	C	G	224.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:253,18,0
21	45179932	.	T	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
21	45180064	.	T	C	53.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:81,9,0
21	45180079	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
21	45180338	.	A	G	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
21	45180422	.	G	A	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
21	45181311	.	G	A	18.82	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:47:47,0,417
21	45181446	.	G	A	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,149
21	45181492	.	T	C	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:66:66,0,240
21	45182001	.	T	C	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
21	45220787	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	45503121	.	G	A	339.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.27;ReadPosRankSum=0.354	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,10:14:99:368,0,113
21	45506819	.	T	C	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:107,0,151
21	45525899	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
21	45526076	.	C	T	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
21	45528919	.	G	A	77.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.683;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:106,0,207
21	45540919	.	A	G	368.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.958;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.505	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,11:25:99:397,0,540
21	45544594	.	T	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.254	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:94:94,0,389
21	45550959	.	C	T	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,156
21	45552817	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	45553596	.	T	C	190.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=-0.167;DP=23;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.167	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:219,0,472
21	45559565	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	45559569	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	45560755	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
21	45563826	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:74,0,69
21	45565473	.	C	T	101.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.071	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:130,0,353
21	45583937	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	45643396	.	G	C	168.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:66:197,0,66
21	45643801	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:78,0,61
21	45644330	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:76,0,69
21	45644504	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
21	45644724	.	C	T	311.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:47:340,0,47
21	45645307	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	45645308	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	45646010	.	G	T	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,114
21	45646256	.	C	A	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=19.68;ReadPosRankSum=2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:225,0,138
21	45646698	.	A	G	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
21	45647202	.	C	T	263.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:55:292,0,55
21	45647421	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
21	45647646	.	C	T	149.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=15.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:178,0,272
21	45648488	.	G	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:146,0,153
21	45648992	.	T	C	141.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:170,15,0
21	45649666	.	G	A	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
21	45726790	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
21	45732116	.	C	T	253.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-1.202;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.202	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,9:29:99:282,0,770
21	45732466	.	A	T	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:77,0,27
21	45733617	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:74,0,73
21	45746913	.	G	C	171.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-2.101;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=7.81;ReadPosRankSum=2.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,6:22:99:200,0,624
21	45747404	.	C	T	53.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:79,0,1
21	45759045	.	C	T	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:103,0,144
21	45828841	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	45829938	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
21	45834324	.	G	A	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
21	45836472	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	45840473	.	C	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
21	45840494	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
21	45843131	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
21	45844601	.	C	T	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
21	45844751	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
21	45861943	.	G	A	90.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.979;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.110	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:119,0,385
21	45862093	.	G	A	438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:467,36,0
21	45937635	.	A	C	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:80,0,37
21	46170754	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
21	46189230	.	A	T	209.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:238,0,214
21	46189651	.	A	C	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,268
21	46189652	.	G	A	127.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:156,0,268
21	46190182	.	A	T	80.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:54:202,0,54
21	46190410	.	G	A	214.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:243,18,0
21	46190842	.	A	G	57.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:86,0,34
21	46191174	.	A	G	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=1.331;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,7:15:99:223,0,243
21	46191256	.	C	A	359.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.784	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,11:19:99:388,0,264
21	46191270	.	C	T	199.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.635;DP=19;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.106	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:228,0,332
21	46194281	.	A	T	166.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.920;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:195,0,106
21	46195108	.	C	A	223.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.278	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:252,0,146
21	46195243	.	A	G	273.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=27.38;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,8:10:42:302,0,42
21	46196103	.	A	G	92.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:34:121,0,34
21	46196270	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	46196631	.	C	T	237.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.780	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:266,0,249
21	46220610	.	T	C	50.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:76,0,1
21	46226566	.	T	G	1065.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.341;DP=34;FS=7.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.554	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,27:34:99:1094,0,202
21	46226786	.	A	G	1018.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-0.228;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.364	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,29:46:99:1047,0,525
21	46269753	.	A	G	418.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=-0.952;DP=27;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.854	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,12:27:99:447,0,491
21	46270196	.	A	G	446.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.507;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.507	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,13:28:99:475,0,575
21	46270376	.	G	C	662.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.528;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.820	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,19:33:99:691,0,501
21	46271452	.	C	T	842.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=1.268;DP=35;FS=11.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=24.08;ReadPosRankSum=-1.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,23:35:99:871,0,364
21	46284932	.	G	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:78,0,76
21	46285042	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
21	46285074	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	46353985	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	46396659	.	G	C	254.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,7:10:99:283,0,107
21	46396906	.	T	C	172.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:22:201,0,22
21	46397181	.	C	T	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:78,0,72
21	46397933	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
21	46510938	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	46510955	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	46534191	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	46538491	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	46644454	.	G	A	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
21	46684756	.	G	A	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:95:95,0,236
21	46697614	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
21	46715545	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
21	46715682	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	46715873	.	G	A	113.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:141,12,0
21	46875564	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	46908355	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,115
21	46929467	.	G	A	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
21	46931727	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
21	46932328	.	G	A	126.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:155,0,27
21	46932652	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
21	46934518	.	T	C	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:73:73,0,108
21	46934826	.	G	A	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
21	46934861	.	A	C	204.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:67:233,0,67
21	46951556	.	A	G	145.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.470;DP=10;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.470	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:174,0,185
21	46957794	.	T	C	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:133,0,300
21	47322411	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
21	47410931	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,153
21	47423636	.	C	T	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:69,0,30
21	47424221	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:111,0,61
21	47424346	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
21	47538960	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
21	47552582	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47552585	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47609510	.	T	C	1107.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1136,78,0
21	47609677	.	A	G	1667.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,40:40:99:1696,120,0
21	47610066	.	T	C	1086.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1115,81,0
21	47612166	.	A	C	236.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:265,18,0
21	47612466	.	A	G	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:376,27,0
21	47612471	.	T	C	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:27:376,27,0
21	47614443	.	A	G	337.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.906;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.622	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,11:35:99:366,0,914
21	47614469	.	A	C	1840.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,43:43:99:1869,129,0
21	47616913	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
21	47619784	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	47628711	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
21	47631245	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	47635176	.	T	C	464.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.752;DP=28;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,14:27:99:493,0,444
21	47635627	.	C	G	854.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.350;DP=29;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.665;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.458	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,23:29:99:883,0,175
21	47641794	.	C	T	908.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.132;DP=34;FS=8.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=26.73;ReadPosRankSum=-0.586	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,24:34:99:937,0,314
21	47642609	.	G	A	890.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.897;DP=40;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=22.27;ReadPosRankSum=0.621	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,24:40:99:919,0,590
21	47642914	.	A	T	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,121
21	47643382	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
21	47645970	.	G	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:72,0,37
21	47653704	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47655027	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
21	47661615	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
21	47669103	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47670633	.	C	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:73:78,0,73
21	47671844	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
21	47686152	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	47689734	.	G	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
21	47703649	.	G	A	206.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:63:235,0,63
21	47704896	.	G	A	164.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.470;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.676	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:193,0,171
21	47706297	.	C	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
21	47731442	.	G	A	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,69
21	47734842	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47734844	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47738213	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
21	47773103	.	C	A	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:62:236,0,62
21	47773177	.	C	T	110.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.361;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=12.31;ReadPosRankSum=-2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:139,0,198
21	47777063	.	G	A	235.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.896	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:264,0,142
21	47786524	.	A	G	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:62:62,0,230
21	47787002	.	T	C	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.740	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,9:12:87:333,0,87
21	47808679	.	C	T	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,77
21	47811272	.	C	T	260.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:289,21,0
21	47819644	.	G	A	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:65:65,0,228
21	47836653	.	C	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:55:55,0,111
21	47843004	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
21	47843102	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
21	47843923	.	T	C	50.84	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:18:79,0,18
21	47850484	.	G	C	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
21	47851753	.	A	G	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
21	47851796	.	G	A	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,245
21	47855876	.	A	G	194.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=14.98;ReadPosRankSum=-0.377	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,6:13:99:223,0,259
21	47918662	.	C	G	74.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:103,0,25
21	47961711	.	G	A	213.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:66:242,0,66
21	47970581	.	G	A	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,152
21	47974582	.	A	G	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
21	47982363	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
21	47982652	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
21	47987547	.	C	T	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:75:114,0,75
21	48004284	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
21	48063476	.	C	G	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:675,51,0
21	48071530	.	C	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
21	48073310	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
21	48078611	.	G	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
21	48079463	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
21	48084628	.	A	G	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
21	48084747	.	T	C	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
22	16159060	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	16159553	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	17593685	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
22	17619716	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	17622618	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	17624425	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	17627366	.	C	T	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
22	17628648	.	C	T	131.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:21:160,0,21
22	17630389	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	17630486	.	C	A	1533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1562,111,0
22	17631691	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	17634838	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	17635858	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	17638294	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	18209613	.	A	G	662.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:691,48,0
22	18211205	.	T	C	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:623,45,0
22	18213057	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	18216262	.	G	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	18217384	.	A	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
22	18290207	.	G	A	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
22	18484205	.	G	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
22	18571008	.	G	A	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
22	18571419	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,1:5:67:67,0,331
22	18571431	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:67:67,0,331
22	18571670	.	A	G	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:619,42,0
22	18571828	.	T	C	389.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:418,30,0
22	18572106	.	T	A	412.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:441,33,0
22	18572675	.	A	G	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:101,0,155
22	18572892	.	A	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
22	18573122	.	T	C	822.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:851,60,0
22	18579647	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	18579761	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
22	18579824	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
22	18894600	.	G	C	46.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:2:73,2,0
22	18895875	.	A	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	18896087	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	18896709	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	18897228	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	18898064	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
22	18898289	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	18899484	.	G	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
22	18899487	.	C	T	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
22	18900669	.	A	G	1653.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1682,123,0
22	18901004	.	C	T	1510.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1539,105,0
22	18901090	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	18901878	.	C	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
22	18904144	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	18904414	.	A	G	525.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=27.11;ReadPosRankSum=1.504	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:10:553,10,0
22	18905117	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	18905978	.	G	A	1298.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1327,93,0
22	18907405	.	G	T	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:345,27,0
22	18907855	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	18908684	.	C	T	407.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:35:436,35,0
22	18908875	.	A	G	1120.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.495;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=35.44;ReadPosRankSum=1.609	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,27:28:48:1149,48,0
22	18909151	.	T	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
22	18910545	.	C	T	371.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:400,27,0
22	18910756	.	C	G	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
22	18910828	.	T	G	108.18	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:10:136,10,0
22	18911503	.	T	C	186.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.872;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.839	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:215,0,299
22	18911553	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:73:123,0,73
22	18911555	.	T	C	94.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:73:123,0,73
22	18911586	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,106
22	18911599	.	T	C	206.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:16:235,0,16
22	18911850	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:78,0,75
22	18912119	.	T	C	618.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:647,45,0
22	18912678	.	A	G	1722.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1751,123,0
22	18915816	.	T	C	109.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:137,12,0
22	18917621	.	A	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
22	18917748	.	C	T	282.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:311,24,0
22	18917886	.	T	C	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
22	18918005	.	G	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:315,21,0
22	18918008	.	G	C	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:315,21,0
22	18918014	.	A	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:315,21,0
22	18918080	.	G	C	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:340,27,0
22	18918208	.	T	C	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:360,24,0
22	18918218	.	G	A	331.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:360,24,0
22	18918267	.	C	T	495.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:524,36,0
22	18918430	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	18920516	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	18923373	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	18923713	.	G	A	780.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:809,63,0
22	18980031	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	19024651	.	C	T	1217.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1246,87,0
22	19025381	.	C	T	1168.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1197,90,0
22	19026025	.	A	G	1016.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1045,72,0
22	19026613	.	A	G	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:854,63,0
22	19035697	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	19047776	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	19048413	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	19048436	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	19049602	.	T	G	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
22	19050007	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	19050010	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	19050110	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	19083552	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	19083557	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	19109753	.	A	G	551.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:580,45,0
22	19109764	.	A	G	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:581,45,0
22	19109812	.	A	G	762.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:791,57,0
22	19128757	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	19279167	.	C	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:73,0,28
22	19318622	.	T	C	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:38:465,38,0
22	19420109	.	T	C	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
22	19423250	.	G	A	969.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:998,69,0
22	19431038	.	A	G	291.98	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.44;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:13:320,0,13
22	19431396	.	T	C	409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:438,33,0
22	19441224	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	19441569	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	19441742	.	T	C	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
22	19467462	.	G	T	349.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:378,27,0
22	19490853	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	19507152	.	C	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	19711765	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	19712094	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	19750773	.	T	C	229.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:258,21,0
22	19753449	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	19754091	.	A	C	72.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
22	19757372	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	19765181	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	19808769	.	C	T	170.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
22	19836895	.	G	T	16.98	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=5.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:2:43,2,0
22	19868218	.	A	G	567.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:596,42,0
22	19933778	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	19948337	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	19949952	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
22	19951207	.	C	G	2850.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,68:68:99:2879,205,0
22	19953176	.	C	T	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:349,24,0
22	19953188	.	A	C	320.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:349,24,0
22	19953832	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	19953882	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	19954243	.	T	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,533
22	19954244	.	G	A	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,533
22	19954458	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	19955692	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
22	19957023	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	19957787	.	C	T	491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:520,36,0
22	19958022	.	G	A	337.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=33.78;ReadPosRankSum=1.393	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:10:20:366,20,0
22	19959366	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	19959473	.	C	T	433.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:462,33,0
22	19961955	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	19968597	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	19971391	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	20046344	.	A	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
22	20049697	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	20054801	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	20054802	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	20054862	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:67:81,0,67
22	20054863	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:67:81,0,67
22	20070729	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	20081852	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
22	20093126	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	20098359	.	T	G	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:512,36,0
22	20098882	.	T	C	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
22	20133888	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
22	20137322	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	20291866	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	20292012	.	A	C	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
22	20704319	.	A	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
22	20708685	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	20754506	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	20754689	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	20761384	.	C	A	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:529,36,0
22	20761899	.	C	T	62.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:90,9,0
22	20810054	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
22	20811231	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
22	20811645	.	G	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	20811674	.	G	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	20811930	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	20843885	.	T	G	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
22	20846641	.	A	G	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
22	20848663	.	T	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
22	20848861	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	20926295	.	G	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	20927517	.	A	G	37.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,152
22	20927529	.	A	G	173.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
22	21051994	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	21213380	.	C	T	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:444,33,0
22	21213416	.	A	G	355.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:384,27,0
22	21244235	.	G	T	186.75	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:224,24,0
22	21265442	.	A	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
22	21265448	.	A	G	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
22	21304408	.	A	G	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
22	21304463	.	T	C	745.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:774,54,0
22	21306400	.	A	G	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:786,57,0
22	21306743	.	A	G	626.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:655,45,0
22	21307058	.	C	T	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
22	21309934	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	21311531	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	21311721	.	T	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
22	21331043	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	21331918	.	C	G	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
22	21354970	.	C	G	800.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:829,57,0
22	21356566	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
22	21800444	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	21801588	.	T	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	21976407	.	A	G	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
22	21983853	.	G	A	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:480,36,0
22	21984205	.	A	G	590.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:619,45,0
22	22015019	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	22039199	.	C	T	809.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:838,57,0
22	22045603	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	22046318	.	C	T	179.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
22	22046738	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	22047255	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	22049369	.	G	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
22	22050065	.	C	T	361.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:390,30,0
22	22050769	.	A	G	512.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:541,39,0
22	22051583	.	G	T	1096.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1125,87,0
22	22055280	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
22	22115004	.	C	G	1036.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1065,75,0
22	22115353	.	G	A	669.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:698,48,0
22	22115498	.	T	C	804.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:833,57,0
22	22115886	.	C	T	1037.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1066,75,0
22	22116202	.	C	G	766.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:795,54,0
22	22116467	.	C	T	1140.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1169,84,0
22	22162072	.	G	C	634.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.033;ClippingRankSum=-0.642;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.288	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,17:29:99:663,0,367
22	22275524	.	C	T	275.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:304,21,0
22	22280917	.	C	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	22287862	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
22	22312502	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	22313829	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	22330082	.	T	C	383.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:412,30,0
22	22333062	.	G	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	22333218	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	22648281	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	22649144	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	22661173	.	T	C	74.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:102,9,0
22	22661181	.	C	G	86.06	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
22	22661318	.	T	C	576.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:605,42,0
22	23523630	.	C	A	365.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:394,30,0
22	23627369	.	A	G	720.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:749,51,0
22	23631792	.	G	T	343.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.163	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,10:16:99:372,0,195
22	23631801	.	T	C	707.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:51:736,51,0
22	23657966	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
22	23657970	.	T	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
22	23657980	.	G	A	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:177,12,0
22	23658006	.	G	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
22	23720631	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
22	23721063	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	23731836	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	23733392	.	A	G	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
22	23733799	.	T	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
22	23735649	.	C	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
22	23736646	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	23738491	.	A	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	23738649	.	C	T	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
22	23739316	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
22	23739533	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
22	23740096	.	C	T	250.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:279,21,0
22	23740753	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
22	23741096	.	G	A	172.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:201,15,0
22	23741450	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	23741792	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	23741810	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	23742049	.	G	A	240.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:269,21,0
22	23742538	.	C	T	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
22	23742709	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
22	23744699	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	23801430	.	G	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
22	23804670	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	23983422	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
22	23993186	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	23996567	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
22	23997984	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:78,0,36
22	23999627	.	T	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
22	24001281	.	G	C	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
22	24001643	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	24001975	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	24028412	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	24034288	.	A	G	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
22	24035970	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
22	24052031	.	C	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
22	24108412	.	G	A	1264.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1293,90,0
22	24108756	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	24109550	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	24109774	.	T	G	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:495,36,0
22	24143502	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	24164150	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	24166788	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	24171028	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	24171201	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	24172449	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24174007	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	24221471	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	24228125	.	T	C	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
22	24235198	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	24235303	.	G	C	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
22	24235306	.	G	A	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:167,12,0
22	24236392	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	24236588	.	A	T	1006.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1035,72,0
22	24236819	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	24237221	.	C	G	253.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:282,21,0
22	24237862	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	24238823	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24238830	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24240138	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24241101	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	24241533	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	24248314	.	A	G	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
22	24248414	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	24252668	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24254113	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	24254363	.	C	T	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
22	24255208	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	24274119	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	24311364	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	24373548	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
22	24375989	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24375993	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24376322	.	G	A	790.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:819,57,0
22	24381083	.	C	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
22	24381406	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24459438	.	T	C	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
22	24489649	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	24497624	.	C	G	120.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
22	24499563	.	T	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
22	24582093	.	G	A	287.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:316,24,0
22	24717850	.	A	G	800.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:829,57,0
22	24761467	.	G	A	694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:723,51,0
22	24936970	.	A	G	1754.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1783,123,0
22	24937487	.	A	G	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=40.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:644,45,0
22	24938330	.	C	G	1074.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1103,84,0
22	24938908	.	A	G	1344.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1373,96,0
22	24940959	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	24943658	.	T	C	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	24947452	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	24951086	.	A	G	223.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:252,18,0
22	24964128	.	T	C	1774.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1803,126,0
22	24968614	.	A	G	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.959;DP=23;FS=8.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.502	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:99:105,0,697
22	24968971	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=2.152;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.906	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,5:16:99:169,0,420
22	24968989	.	A	G	63.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-1.517;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.221	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:92:92,0,192
22	24969016	.	C	T	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:300,21,0
22	24969025	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,149
22	24969061	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:107,0,315
22	24969092	.	A	G	301.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.766	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,9:15:99:330,0,206
22	24969160	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=-0.819;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=2.87;ReadPosRankSum=-1.953	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:77:77,0,546
22	24969629	.	A	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-1.250;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.050	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:110,0,545
22	24969691	.	A	G	12.99	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=1.274;DP=15;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:41:41,0,598
22	24969693	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.187;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.274	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:45:45,0,941
22	24969694	.	A	G	16.86	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.764;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:45:45,0,941
22	24970107	.	A	G	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
22	24970542	.	A	G	44.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.942	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:73:73,0,710
22	24970565	.	A	G	307.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=23.67;ReadPosRankSum=-0.660	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,7:13:99:336,0,198
22	24970609	.	A	G	278.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,8:13:99:307,0,187
22	24970675	.	A	G	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,122
22	24976045	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	25402166	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
22	25425340	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	25425439	.	A	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	25436904	.	T	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
22	25574507	.	C	G	646.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:675,54,0
22	25577688	.	G	A	909.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:938,66,0
22	25577733	.	T	C	789.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:818,57,0
22	25589256	.	G	A	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
22	25589383	.	C	T	199.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:228,18,0
22	25589542	.	T	C	678.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:707,51,0
22	25589570	.	G	A	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
22	25589792	.	T	C	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:719,51,0
22	25589948	.	C	T	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
22	25591200	.	A	G	396.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:425,30,0
22	25591278	.	T	C	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
22	25591847	.	C	T	744.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:773,54,0
22	25591883	.	A	G	729.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:758,54,0
22	25757268	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	25758473	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	25760254	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	25761309	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	25844095	.	G	T	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
22	25844116	.	C	T	404.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:433,30,0
22	25844147	.	C	T	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:442,33,0
22	26046547	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	26849666	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	26853905	.	C	A	343.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:372,27,0
22	26854441	.	G	A	352.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:381,27,0
22	26859942	.	C	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
22	26860269	.	G	C	441.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:470,33,0
22	26861545	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	26862153	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	26862212	.	T	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
22	26863639	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	26877981	.	G	A	476.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:505,36,0
22	26878024	.	A	G	431.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:460,33,0
22	26884039	.	G	A	256.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:285,24,0
22	26887829	.	A	G	373.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:402,27,0
22	26888725	.	T	C	65.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:93,9,0
22	26889564	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	26895337	.	G	A	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:595,42,0
22	26895418	.	G	A	227.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:256,0,345
22	28252047	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	29133678	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	29133747	.	T	C	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
22	29539546	.	T	C	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
22	29544164	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	29548079	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	29659715	.	G	A	178.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:207,15,0
22	29685711	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
22	29685752	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
22	29691382	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	29703409	.	G	C	166.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
22	29727866	.	C	T	1623.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1652,126,0
22	29727886	.	T	C	1502.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,38:38:99:1531,114,0
22	29755888	.	T	C	1510.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1539,108,0
22	29895654	.	T	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	29913272	.	C	T	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
22	29951650	.	A	T	1702.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1731,117,0
22	29957570	.	G	A	2156.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2185,150,0
22	29999878	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	30091765	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
22	30093259	.	C	G	163.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:192,15,0
22	30200696	.	G	A	1155.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:88:1184,88,0
22	30422107	.	C	G	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
22	30422865	.	T	C	408.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:28:437,28,0
22	30423460	.	C	T	518.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:547,39,0
22	30426069	.	C	T	18.80	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:46,6,0
22	30681257	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	30689133	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	30728356	.	A	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
22	30738161	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	30771554	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	30938949	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	30938950	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	30938957	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	30987861	.	G	C	612.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:641,45,0
22	31032309	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
22	31060029	.	G	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	31266546	.	T	C	411.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:440,30,0
22	31362733	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:74,0,30
22	31365688	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	31365855	.	G	C	207.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.543	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,8:21:99:236,0,434
22	31366675	.	G	T	1081.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1110,78,0
22	31477361	.	G	C	505.10	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=33.67;ReadPosRankSum=-1.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,14:15:11:533,11,0
22	31487701	.	C	T	285.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:314,24,0
22	31491332	.	C	T	216.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:245,18,0
22	31492482	.	C	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
22	31492517	.	A	C	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
22	31497663	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	31502062	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	31521850	.	A	C	843.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:872,60,0
22	31601051	.	C	G	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
22	31602641	.	G	C	1185.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1214,84,0
22	31644429	.	G	A	475.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:504,36,0
22	31655196	.	G	A	946.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:975,69,0
22	31657167	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
22	31657449	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	31658205	.	C	T	727.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:756,54,0
22	31663842	.	C	G	1076.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1105,78,0
22	31669267	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	31675185	.	A	C	968.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:997,69,0
22	31678958	.	C	G	444.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:473,33,0
22	31679110	.	G	C	363.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:392,33,0
22	31687142	.	G	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
22	31723539	.	T	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	31725634	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	31726471	.	C	T	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	31727988	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	31728333	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	31730045	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	31738424	.	A	G	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
22	31739222	.	G	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
22	31744072	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:120,0,28
22	31745274	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	31745401	.	C	T	174.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:203,15,0
22	31830351	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	31830421	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	31831589	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	31833759	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	31836378	.	G	T	148.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:176,12,0
22	31892976	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	31893025	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
22	31908147	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	31942898	.	G	A	362.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:391,27,0
22	31971258	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
22	31973124	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	31976299	.	T	C	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
22	31979911	.	G	T	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
22	31998739	.	C	T	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
22	32008039	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	32009948	.	G	A	132.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
22	32010042	.	A	G	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
22	32010152	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	32010229	.	A	C	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
22	32010307	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	32011225	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
22	32011929	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	32015030	.	C	T	708.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:737,54,0
22	32015406	.	T	C	664.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:693,48,0
22	32015417	.	G	A	615.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:644,48,0
22	32015450	.	T	G	547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:576,42,0
22	32016092	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	32016159	.	G	A	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	32017296	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	32020413	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	32022709	.	A	G	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
22	32022848	.	T	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
22	32026131	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
22	32026961	.	C	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	32029126	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	32079303	.	T	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
22	32080244	.	G	A	316.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:345,24,0
22	32110163	.	G	A	257.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:286,21,0
22	32111553	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
22	32112461	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
22	32136607	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	32145840	.	C	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	32200161	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
22	32234797	.	G	A	58.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:86,9,0
22	32238386	.	A	G	12.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:39,3,0
22	32266603	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
22	32435488	.	T	C	92.94	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:14:121,0,14
22	32778254	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	32783904	.	T	C	1092.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1121,78,0
22	32795641	.	C	T	1941.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1970,135,0
22	32870769	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	32871365	.	G	A	71.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
22	32875190	.	G	A	1109.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1138,78,0
22	32886998	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	32887150	.	C	T	1106.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1135,78,0
22	32887949	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	32888084	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
22	32888970	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	33669492	.	G	C	699.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:728,54,0
22	33670584	.	G	A	533.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:562,39,0
22	34022284	.	G	A	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:431,33,0
22	34316297	.	G	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
22	35660875	.	G	T	336.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:365,27,0
22	35682444	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	35690179	.	T	C	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:479,33,0
22	35690183	.	A	G	450.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:479,33,0
22	35690532	.	A	G	551.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:580,42,0
22	35708790	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:131,9,0
22	35708799	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:131,9,0
22	35737461	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	35833142	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	36136744	.	C	G	255.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.512;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.058	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,8:22:99:284,0,543
22	36136945	.	T	C	204.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:233,18,0
22	36137531	.	C	T	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
22	36140130	.	T	G	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:16:257,16,0
22	36424450	.	A	C	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
22	36622906	.	T	C	172.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:201,18,0
22	36623148	.	T	C	198.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:227,18,0
22	36623731	.	T	C	696.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:725,51,0
22	36630533	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	36635444	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	36677914	.	A	G	1620.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,39:39:99:1649,117,0
22	36682707	.	G	A	59.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:87,9,0
22	36684354	.	T	C	2421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2450,166,0
22	36684358	.	C	A	2421.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,50:50:99:2450,166,0
22	36691607	.	A	C	2072.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2101,147,0
22	36717561	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	36883917	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,118
22	36883922	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,106
22	36884095	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.15;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:31:154,0,31
22	36884470	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,608
22	36884476	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.747	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,1:8:52:52,0,608
22	36884489	.	T	C	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:61:61,0,254
22	36885599	.	A	G	636.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:665,45,0
22	36888066	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	36888451	.	C	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,73
22	36900271	.	T	C	547.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:576,42,0
22	36900806	.	A	G	782.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:811,57,0
22	36903046	.	A	G	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
22	36907001	.	T	C	1078.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1107,78,0
22	36914522	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:54:54,0,72
22	37155457	.	A	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	37157165	.	A	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	37157572	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	37157846	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	37157847	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	37159350	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	37159751	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	37159819	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
22	37163329	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	37163341	.	A	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	37165903	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	37168638	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	37333657	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	37408230	.	A	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	37408399	.	C	T	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
22	37408719	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	37409226	.	G	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	37409319	.	T	C	44.50	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	37411582	.	A	G	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	37421603	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	37421604	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	37421702	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	37424848	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
22	37424991	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
22	37425031	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	37453452	.	C	T	654.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:683,48,0
22	37580442	.	A	T	150.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:179,15,0
22	37580627	.	C	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
22	37594920	.	A	C	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
22	37595156	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	37764894	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	37766067	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	37767604	.	T	C	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	37770630	.	G	A	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
22	37961353	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
22	37964299	.	C	G	838.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:867,66,0
22	38013809	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	38046695	.	C	A	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
22	38158876	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	38169020	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
22	38170026	.	G	A	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:477,36,0
22	38202552	.	T	C	1826.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1855,126,0
22	38202642	.	G	T	1410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1439,111,0
22	38202734	.	G	C	1364.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,32:32:96:1393,96,0
22	38204089	.	C	T	925.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:954,66,0
22	38205060	.	A	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	38211954	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
22	38212762	.	A	G	824.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:853,63,0
22	38227821	.	C	G	451.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:480,33,0
22	38285016	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:81,0,33
22	38343143	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	38463652	.	T	G	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	38463968	.	A	G	315.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:344,24,0
22	38467784	.	G	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
22	38474696	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	38474952	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	38476579	.	C	T	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
22	38477930	.	G	A	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
22	38507818	.	G	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
22	38523065	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	38523246	.	C	G	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
22	38615536	.	A	T	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.932;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.289	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,8:12:72:186,0,72
22	38640841	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	38689984	.	T	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
22	38712782	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	38878758	.	C	A	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
22	38880687	.	C	T	2026.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,47:47:99:2055,141,0
22	38881454	.	A	C	1073.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1102,75,0
22	38885627	.	T	C	924.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:953,69,0
22	38886708	.	C	A	651.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.079;DP=36;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.206	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,18:36:99:680,0,653
22	38886893	.	C	G	632.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.025;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.176	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,17:27:99:661,0,358
22	38898971	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	38899701	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	38899863	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	39082498	.	A	T	1089.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1118,81,0
22	39175267	.	G	A	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
22	39178701	.	A	G	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
22	39190096	.	G	T	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
22	39216301	.	T	C	347.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:376,27,0
22	39222652	.	G	A	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:223,15,0
22	39258078	.	C	T	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
22	39260001	.	G	A	766.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:795,57,0
22	39260032	.	C	T	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
22	39261135	.	C	G	505.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:534,36,0
22	39264425	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	39265072	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	39267312	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
22	39382079	.	C	A	1091.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1120,78,0
22	39527583	.	C	T	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
22	39527935	.	C	T	69.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
22	39528506	.	C	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	39529029	.	A	G	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
22	39529133	.	G	A	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
22	39529651	.	C	T	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
22	39535208	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	39639853	.	G	T	70.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:22:99,0,22
22	39640703	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
22	39642577	.	A	T	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
22	39642654	.	G	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	39642694	.	G	A	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
22	39642740	.	A	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	39647240	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	39711351	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	39712981	.	A	G	592.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:621,45,0
22	39713105	.	C	T	380.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:409,30,0
22	39713128	.	A	G	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
22	39714704	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	39714908	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	39778167	.	A	G	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
22	39778327	.	T	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
22	39778419	.	T	C	345.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:374,27,0
22	39779300	.	G	A	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
22	39781429	.	C	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
22	39824450	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	39825492	.	A	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	39826788	.	G	A	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
22	39827553	.	G	A	394.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:423,30,0
22	39916990	.	G	C	86.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:93:115,0,93
22	40763280	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	40763282	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	41135282	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,244
22	41136548	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
22	41138255	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	41138946	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:72:72,0,120
22	41139280	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,118
22	41139499	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:68:68,0,161
22	41139580	.	T	C	113.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=1.307;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:142,0,187
22	41139645	.	T	C	91.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:23:120,0,23
22	41139969	.	T	C	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
22	41140007	.	T	C	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,151
22	41166135	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
22	41325068	.	G	A	64.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:92,9,0
22	41488232	.	C	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	41551039	.	T	A	537.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:566,39,0
22	41575702	.	G	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:99:105,0,197
22	41575882	.	A	C	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
22	41575884	.	T	A	237.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:266,18,0
22	41678006	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:58:76,0,58
22	41678620	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:78,0,69
22	41678621	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:69:78,0,69
22	41740877	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	41753569	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
22	41830212	.	G	A	481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:510,36,0
22	41833116	.	C	T	830.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:859,60,0
22	41840158	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
22	41856137	.	T	A	1091.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1120,78,0
22	42059768	.	G	T	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
22	42070276	.	T	C	1391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-1.535;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.46;ReadPosRankSum=1.535	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,34:35:67:1420,67,0
22	42070793	.	C	T	1222.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1251,87,0
22	42089623	.	T	C	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
22	42090069	.	A	C	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
22	42092225	.	C	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
22	42225018	.	T	G	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
22	42226950	.	C	T	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
22	42229562	.	C	T	197.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:226,18,0
22	42236337	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	42326687	.	T	C	49.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:21:78,0,21
22	42329984	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	42391176	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	42392560	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	42395242	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	42396150	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	42423110	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	42448238	.	C	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	42454950	.	A	G	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
22	42463814	.	C	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
22	42466509	.	C	G	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:431,33,0
22	42528568	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
22	42529407	.	G	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	42531210	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	42534126	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	42534148	.	C	T	43.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
22	42534276	.	C	G	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
22	42534682	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	42537404	.	G	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
22	42538029	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	42541349	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	42607033	.	C	A	198.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:227,0,179
22	42670740	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	42671567	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	42674239	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	42674281	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	42907182	.	A	C	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
22	42907619	.	T	C	1256.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1285,90,0
22	42908186	.	G	C	222.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:251,18,0
22	42908262	.	G	A	71.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:100,0,265
22	42908575	.	G	A	319.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=-1.876;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.299	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,9:17:99:348,0,293
22	42908743	.	G	A	1350.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,34:34:99:1379,102,0
22	42908870	.	T	G	887.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:916,66,0
22	42908897	.	T	C	1146.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1175,81,0
22	42910769	.	G	A	683.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:712,48,0
22	42912097	.	C	T	1090.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1119,81,0
22	42912501	.	A	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	42912802	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	42914107	.	G	A	467.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.232	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,13:24:99:496,0,425
22	42955518	.	T	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
22	42958054	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	42958685	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	42961860	.	G	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	42964791	.	T	C	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
22	42965667	.	T	C	233.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:262,18,0
22	42966103	.	A	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	42967235	.	C	T	151.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:180,15,0
22	42969130	.	G	A	364.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:393,27,0
22	42969919	.	C	T	177.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=22.22;ReadPosRankSum=0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,6:8:57:206,0,57
22	42970263	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	42970515	.	A	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	42970705	.	T	C	353.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.085	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:89:382,0,89
22	42972590	.	A	G	310.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:339,24,0
22	42986333	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	43032742	.	C	T	1711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DP=44;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=30.75;ReadPosRankSum=1.654	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,43:44:97:1740,97,0
22	43392417	.	A	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	43509617	.	C	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	43509866	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	43513301	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	43516745	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	43518108	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	43525176	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	43528793	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	43529029	.	C	T	552.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:581,42,0
22	43529314	.	G	C	777.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:806,57,0
22	43530982	.	A	G	128.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
22	43583051	.	G	A	1120.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1149,90,0
22	44324727	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	44324730	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	44331943	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	44342116	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	44370428	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	44379838	.	A	G	1190.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1219,84,0
22	44420015	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	44489868	.	T	C	810.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:839,60,0
22	44525091	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	44547401	.	G	A	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.468	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:133,0,314
22	44565334	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
22	44566434	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	44567644	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
22	44567740	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
22	44568469	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	44889997	.	G	A	560.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:589,42,0
22	44890192	.	T	G	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
22	44890604	.	T	C	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
22	44890618	.	A	G	453.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:482,33,0
22	44890651	.	T	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:27:392,27,0
22	44890658	.	T	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:27:392,27,0
22	44890672	.	C	T	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
22	44890685	.	C	G	414.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:443,30,0
22	44890845	.	C	G	594.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:623,42,0
22	44891247	.	A	G	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:529,39,0
22	44891370	.	T	C	556.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:585,42,0
22	44891399	.	C	G	347.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:376,30,0
22	44891722	.	A	G	587.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:616,42,0
22	44891873	.	A	G	655.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:684,48,0
22	44891940	.	C	T	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
22	44892049	.	G	A	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:57:846,57,0
22	44892050	.	A	T	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:57:846,57,0
22	44892058	.	G	A	817.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:57:846,57,0
22	44892135	.	A	G	440.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:469,33,0
22	44892445	.	A	C	195.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:98:224,0,98
22	44893491	.	G	T	19.81	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-1.552;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.187	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,2:14:48:48,0,475
22	45128596	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
22	45128763	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
22	45129099	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	45131533	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45132359	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	45132491	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	45134197	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
22	45158036	.	A	G	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
22	45175371	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	45181545	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	45207620	.	A	G	136.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:37:165,0,37
22	45207621	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,213
22	45207626	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,256
22	45207689	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,156
22	45207690	.	A	G	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,156
22	45207822	.	A	G	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:71:71,0,118
22	45208497	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,190
22	45243780	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	45245359	.	C	T	322.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:351,24,0
22	45245850	.	C	G	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
22	45247215	.	C	T	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
22	45247792	.	C	T	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:18:267,18,0
22	45247796	.	T	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
22	45247816	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,121
22	45247997	.	A	G	58.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:86:87,0,86
22	45248214	.	C	T	313.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:342,24,0
22	45248241	.	A	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
22	45250194	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:57,0,37
22	45250327	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45250421	.	G	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
22	45251318	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	45251423	.	G	A	283.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:312,21,0
22	45251713	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	45251743	.	A	G	139.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.95	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:23:168,0,23
22	45251747	.	A	G	139.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.96;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:23:168,0,23
22	45251813	.	A	G	132.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:71:161,0,71
22	45251828	.	A	G	128.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.368;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:157,0,130
22	45251842	.	A	G	99.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:128,0,172
22	45251871	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:58:58,0,285
22	45251875	.	A	G	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=-1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.715	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:96:96,0,324
22	45252232	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	45253079	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45253233	.	A	G	507.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:536,39,0
22	45253376	.	C	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
22	45253530	.	C	T	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
22	45253710	.	G	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
22	45253772	.	C	T	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
22	45253838	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
22	45253839	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
22	45253872	.	G	T	434.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:463,33,0
22	45254083	.	G	T	314.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:343,24,0
22	45254493	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	45255043	.	G	A	449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:478,33,0
22	45255137	.	A	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:80:80,0,379
22	45255301	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,365
22	45255302	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:69:69,0,365
22	45255327	.	A	G	129.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:158,0,109
22	45255385	.	A	G	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
22	45255436	.	C	G	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
22	45255460	.	G	A	600.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:629,45,0
22	45255484	.	A	C	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
22	45255727	.	G	C	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
22	45255902	.	T	C	194.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:223,15,0
22	45256002	.	A	T	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
22	45256142	.	C	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:109,9,0
22	45256150	.	C	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
22	45256153	.	T	G	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
22	45256212	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	45256223	.	C	T	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
22	45256619	.	C	T	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:21:293,21,0
22	45256624	.	A	G	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
22	45256635	.	C	A	196.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:225,15,0
22	45256681	.	C	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
22	45256731	.	G	A	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
22	45256762	.	A	G	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
22	45256954	.	G	C	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
22	45257026	.	T	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	45257199	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	45257245	.	C	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
22	45257334	.	T	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
22	45257371	.	C	T	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
22	45257617	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	45257747	.	T	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	45257808	.	C	G	186.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:215,18,0
22	45257828	.	G	C	303.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:332,24,0
22	45258495	.	A	G	803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:832,57,0
22	45259817	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	45277664	.	G	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
22	45277702	.	A	G	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
22	45277826	.	G	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
22	45277909	.	A	G	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
22	45278109	.	G	A	230.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:259,18,0
22	45278187	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	45278499	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	45330235	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	45345833	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	45346339	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	45356694	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	45367385	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
22	45375259	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
22	45376525	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
22	45377143	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	45380243	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	45382610	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
22	45382785	.	G	A	155.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:184,15,0
22	45383230	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
22	45383755	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
22	45383939	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45386739	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45390276	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	45395282	.	A	G	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
22	45395770	.	C	T	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	45397074	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	45398243	.	G	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	45398758	.	G	A	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	45400119	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45476236	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	45476237	.	A	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	45476244	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	45530119	.	C	A	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
22	45545400	.	T	C	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
22	45554363	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	45559631	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	45559908	.	C	T	294.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:323,24,0
22	45559997	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
22	45570105	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	45572675	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	45573154	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	45573847	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,1:3:67:67,0,167
22	45573856	.	A	G	38.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,167
22	45580836	.	G	C	819.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:848,57,0
22	45580899	.	G	C	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
22	45581521	.	C	T	324.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:353,24,0
22	45582860	.	G	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
22	45583606	.	G	T	489.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:518,36,0
22	45583803	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	45588377	.	A	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	45589490	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	45589817	.	T	C	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
22	45590289	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:74:74,0,139
22	45590294	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:74:74,0,139
22	45592511	.	T	C	662.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:691,48,0
22	45592580	.	T	C	566.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:595,45,0
22	45593399	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	45723854	.	C	G	198.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:227,18,0
22	45724855	.	T	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
22	45726345	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	45728978	.	G	C	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
22	45729287	.	A	G	48.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:77,0,36
22	45732328	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	45736485	.	C	T	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
22	45736767	.	A	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	45737290	.	G	A	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
22	45737487	.	G	A	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
22	45740096	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	45923827	.	A	G	410.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=39.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:439,30,0
22	45953057	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	46389353	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	46389356	.	G	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	46452972	.	G	C	196.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:99:225,0,104
22	46499120	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	46500973	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	46509402	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
22	46677607	.	T	C	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
22	46687467	.	C	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	46689151	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	46722400	.	T	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
22	46773120	.	G	A	573.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:602,42,0
22	46791289	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	46929692	.	A	G	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:515,39,0
22	46930043	.	C	G	228.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.927	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,7:17:99:257,0,379
22	46931077	.	G	C	398.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:427,36,0
22	46931793	.	G	C	679.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:708,51,0
22	46931838	.	G	A	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
22	46934303	.	G	T	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
22	46934334	.	C	A	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
22	46934813	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	46936790	.	T	C	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
22	46943831	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	46971863	.	G	A	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
22	46971907	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	47013510	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	47058992	.	T	C	644.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:673,48,0
22	47073801	.	G	A	561.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:590,48,0
22	47073861	.	C	T	670.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:699,51,0
22	47119687	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	47119688	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	48244263	.	G	A	47.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
22	48262109	.	T	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
22	49146899	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	49441358	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	49444399	.	C	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
22	49444540	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
22	49446616	.	T	C	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
22	49446998	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	49448164	.	G	T	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
22	49767325	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	50167652	.	T	C	346.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:375,30,0
22	50169157	.	A	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	50171906	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	50172226	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	50174290	.	C	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
22	50174665	.	C	T	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
22	50176105	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	50177970	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
22	50178082	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
22	50178442	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
22	50180951	.	C	G	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
22	50181960	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50182946	.	G	C	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	50183605	.	G	A	11.83	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:38,3,0
22	50184484	.	T	G	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	50187374	.	A	T	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
22	50187853	.	C	T	351.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:380,30,0
22	50214021	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50217387	.	G	A	448.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:477,33,0
22	50277835	.	T	C	272.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:301,21,0
22	50277883	.	A	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
22	50278438	.	A	G	288.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:317,24,0
22	50282986	.	C	T	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
22	50283348	.	C	G	263.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:292,21,0
22	50284020	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50285348	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
22	50294378	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	50294469	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50294470	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50297435	.	T	C	468.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:497,36,0
22	50301476	.	T	C	426.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:455,33,0
22	50302850	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50311973	.	A	G	325.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:354,24,0
22	50312035	.	C	T	286.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:315,24,0
22	50312382	.	G	A	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:540,39,0
22	50313438	.	T	C	1097.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1126,78,0
22	50314573	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50317049	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50317187	.	C	T	162.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
22	50317401	.	G	A	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
22	50317569	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
22	50317676	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	50317687	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
22	50317714	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50317803	.	A	G	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
22	50317825	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	50317851	.	T	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	50317857	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
22	50317989	.	C	T	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
22	50319351	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	50320029	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50320943	.	C	T	509.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:538,39,0
22	50345509	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50356693	.	T	C	1409.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1438,105,0
22	50356850	.	C	T	1463.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,35:35:99:1492,105,0
22	50357416	.	C	T	875.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:904,69,0
22	50455595	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	50617968	.	T	C	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
22	50627253	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50628451	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	50630670	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
22	50631226	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	50637193	.	A	G	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:512,36,0
22	50637597	.	G	C	296.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:325,27,0
22	50638502	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	50639473	.	T	C	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
22	50639528	.	T	C	86.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
22	50639636	.	C	G	190.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:219,18,0
22	50639778	.	T	C	217.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
22	50639965	.	C	A	226.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:255,21,0
22	50641351	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
22	50642359	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	50642777	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	50642793	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	50644480	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
22	50645219	.	G	A	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
22	50646318	.	G	A	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
22	50647966	.	A	G	276.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:305,21,0
22	50648223	.	G	T	152.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:181,15,0
22	50649545	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50651190	.	G	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:55:55,0,272
22	50655676	.	G	A	474.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:503,36,0
22	50657010	.	C	G	584.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.22	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:613,42,0
22	50658053	.	A	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
22	50658501	.	A	G	220.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:249,18,0
22	50661869	.	T	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	50682865	.	G	A	413.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:442,30,0
22	50684171	.	G	T	69.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.214	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:98:98,0,280
22	50684296	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.75	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,1120
22	50685508	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50688348	.	A	G	306.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:335,27,0
22	50689030	.	A	G	68.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:96,9,0
22	50692562	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
22	50693340	.	A	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
22	50693765	.	G	A	148.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:177,0,237
22	50694297	.	A	G	424.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:453,33,0
22	50695270	.	A	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
22	50705466	.	A	G	212.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:241,18,0
22	50713866	.	G	C	1011.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1040,72,0
22	50717547	.	T	C	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
22	50717833	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
22	50718397	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
22	50719251	.	A	G	1270.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1299,99,0
22	50720181	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
22	50720622	.	C	T	1192.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1221,93,0
22	50722134	.	T	C	957.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:986,69,0
22	50739989	.	T	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
22	50874352	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
22	50874893	.	C	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
22	50877166	.	G	C	1012.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1041,78,0
22	50878196	.	G	A	951.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:980,69,0
22	50879651	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
22	50881796	.	C	G	88.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
22	50881954	.	G	C	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
22	50883359	.	A	G	213.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:242,18,0
22	50883961	.	G	A	254.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:283,21,0
22	50884075	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
22	50885775	.	A	G	932.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:961,66,0
22	50886557	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	50895020	.	C	T	569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:598,45,0
22	50913429	.	T	C	260.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:289,24,0
22	50944128	.	G	A	1054.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1083,78,0
22	50945799	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
22	51009953	.	C	T	493.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:522,36,0
22	51015481	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
22	51017082	.	T	A	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
22	51020668	.	C	A	283.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:312,24,0
22	51021579	.	A	C	63.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:91,9,0
22	51021599	.	C	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
22	51022117	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
22	51023424	.	T	C	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
22	51024308	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
22	51043278	.	G	A	443.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:472,33,0
22	51045190	.	C	T	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:597,45,0
22	51045433	.	C	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
22	51046091	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
22	51046096	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
22	51117766	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
22	51117787	.	T	C	153.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:28:182,0,28
22	51117800	.	G	A	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,253
22	51117802	.	G	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,253
22	51117811	.	C	T	91.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:120,0,253
22	51161019	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
22	51206252	.	G	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:49,0,37
X	200424	.	C	T	135.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:164,15,0
X	200860	.	T	C	395.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:424,30,0
X	207362	.	C	T	723.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:752,51,0
X	208434	.	G	A	151.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:180,15,0
X	216177	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:69:69,0,154
X	216473	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:70:70,0,161
X	217757	.	A	G	104.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:133,0,155
X	217852	.	A	G	140.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,5:12:99:169,0,257
X	217911	.	C	G	286.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:315,24,0
X	218671	.	G	C	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:33:495,33,0
X	218674	.	A	G	466.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:495,33,0
X	219020	.	A	G	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.104;DP=15;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.104	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,2:15:43:43,0,508
X	219978	.	G	A	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	220116	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	220770	.	A	G	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
X	221431	.	T	A	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
X	228329	.	T	C	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
X	229137	.	A	G	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
X	229645	.	T	A	52.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:80,9,0
X	230313	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	285176	.	A	G	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,79
X	290709	.	A	G	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:74,0,67
X	291225	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:9:135,9,0
X	291234	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	291263	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
X	291515	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	291791	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	293258	.	C	T	83.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
X	293440	.	G	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	293564	.	T	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
X	294017	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	294018	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	294123	.	G	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
X	294201	.	C	T	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
X	294303	.	C	G	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:221,15,0
X	294309	.	G	A	192.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:221,15,0
X	294440	.	C	T	31.29	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.64	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:9:59,0,9
X	294504	.	G	A	123.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:3:150,0,3
X	294585	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	294604	.	T	C	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
X	294800	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
X	294838	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	294856	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	294859	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	294860	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	294915	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	294923	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	295069	.	A	G	201.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:230,18,0
X	295097	.	C	T	362.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:391,33,0
X	295132	.	T	C	672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:701,51,0
X	295231	.	A	G	1109.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1138,87,0
X	295534	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	296098	.	G	C	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
X	296441	.	G	A	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
X	296629	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:174,12,0
X	296639	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:174,12,0
X	296985	.	C	A	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
X	297021	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	297157	.	G	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	297283	.	A	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
X	297314	.	A	G	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
X	297502	.	A	G	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
X	297504	.	C	T	286.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:315,21,0
X	298120	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	298124	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	298211	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
X	298295	.	A	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
X	298440	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	298595	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
X	298619	.	G	A	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
X	298670	.	A	G	183.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:212,15,0
X	298878	.	G	C	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	299014	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
X	299047	.	G	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	299360	.	G	A	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
X	299362	.	A	G	871.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:900,60,0
X	299481	.	C	A	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-2.140;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=3.43	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,5:25:99:114,0,2476
X	299591	.	A	G	785.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:814,57,0
X	299793	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	299866	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	302139	.	G	C	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
X	302423	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	302533	.	A	G	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
X	305769	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	305809	.	C	T	201.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:230,18,0
X	306056	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	306152	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	307377	.	C	T	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
X	309434	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	309672	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	310193	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	311316	.	T	C	81.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
X	311371	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	311623	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	312029	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	322161	.	A	G	464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:493,39,0
X	322257	.	G	A	815.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:844,60,0
X	1458672	.	T	C	158.80	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:21:187,0,21
X	1459600	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
X	1459735	.	C	T	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	1460439	.	G	C	151.98	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:13:180,13,0
X	1460441	.	G	A	151.98	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:13:180,13,0
X	1460554	.	A	G	319.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:348,24,0
X	1460617	.	G	C	757.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:786,54,0
X	1460740	.	A	G	390.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:419,30,0
X	1460828	.	C	T	360.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:389,27,0
X	1460918	.	C	T	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
X	1460992	.	C	T	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:306,21,0
X	1461059	.	C	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
X	1461546	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,199
X	1461559	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:63:63,0,234
X	1462853	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	1463227	.	T	C	66.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:95:95,0,337
X	1463771	.	G	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
X	1464184	.	G	T	278.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:307,21,0
X	1464664	.	C	T	175.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:204,15,0
X	1465188	.	T	C	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	1465537	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	1466067	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
X	1466480	.	C	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
X	1467184	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,74
X	1467290	.	G	C	363.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:392,27,0
X	1468137	.	C	T	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:80,0,35
X	1468404	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:57:57,0,283
X	1468519	.	T	G	177.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:20:206,20,0
X	1469093	.	A	G	125.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
X	1469542	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	1469972	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	1470075	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	1470802	.	C	T	87.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
X	1470937	.	C	T	115.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
X	1471138	.	G	T	524.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:553,39,0
X	1471542	.	C	G	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:444,33,0
X	1471714	.	C	T	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
X	1473286	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	1474549	.	G	T	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
X	1475321	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
X	1475890	.	A	G	138.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
X	1475904	.	G	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
X	1476572	.	G	A	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
X	1476806	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	1477430	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	1481527	.	T	C	274.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:303,21,0
X	1481583	.	G	A	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
X	1482019	.	T	C	205.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:234,18,0
X	1482698	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:104,0,132
X	1483456	.	T	C	160.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=17.86;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:189,0,145
X	1483570	.	T	C	36.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:65:65,0,202
X	1495955	.	G	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	1496651	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	1496967	.	T	C	94.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
X	1499835	.	T	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	1499878	.	T	G	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	1501168	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	1502221	.	T	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
X	1502460	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=8.86;ReadPosRankSum=-1.422	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,232
X	1502582	.	C	T	432.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:461,33,0
X	1502765	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	1502812	.	T	C	65.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:94:94,0,205
X	1503037	.	A	C	290.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:319,24,0
X	1504117	.	T	C	39.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:68:68,0,193
X	1504278	.	A	G	406.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:435,30,0
X	1512021	.	G	C	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
X	1512912	.	T	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	1513416	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	1514446	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	1514911	.	A	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	1515635	.	G	C	234.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:263,18,0
X	1515701	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	1516045	.	G	A	30.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
X	1516114	.	A	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	1516697	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	1516746	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
X	1516770	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	1516963	.	C	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	1517287	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	1517407	.	T	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	1517426	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
X	1517485	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	1517488	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	1517639	.	G	C	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
X	1517701	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	1517765	.	C	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
X	1517857	.	T	C	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:215,15,0
X	1517858	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:215,15,0
X	1517862	.	G	A	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
X	1518177	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	1518926	.	T	C	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
X	1519007	.	G	A	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
X	1519024	.	G	C	305.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:334,24,0
X	1519154	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	1519178	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
X	1519324	.	T	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	1519587	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	1519614	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,79
X	1519620	.	A	G	11.12	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:39:39,0,79
X	1520130	.	G	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
X	1520568	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
X	1520995	.	C	T	164.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:193,15,0
X	1524277	.	G	A	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:51:81,0,51
X	1524278	.	T	C	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:51:81,0,51
X	1524528	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	1530313	.	C	T	181.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
X	1532533	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	1533165	.	C	T	227.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:256,18,0
X	1533613	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	1533616	.	C	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	1533696	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	1533697	.	C	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	1534320	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	1534322	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	1534893	.	G	C	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	1535312	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
X	1536236	.	G	A	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:306,21,0
X	1536251	.	A	C	277.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:21:306,21,0
X	1536375	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	1536581	.	C	T	190.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.25;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:25:219,0,25
X	1536728	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
X	1538171	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	1539730	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
X	1542377	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	1543429	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	1546792	.	G	A	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:50:540,50,0
X	1546876	.	A	G	436.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:465,33,0
X	1550714	.	A	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	2161129	.	C	G	1044.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1073,75,0
X	2178224	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	2179473	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	2308877	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	2310493	.	G	A	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
X	2343343	.	A	G	192.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-0.263;DP=22;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=8.76;ReadPosRankSum=2.153	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:221,0,280
X	2404619	.	G	A	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
X	2405042	.	T	C	1048.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,25:25:75:1077,75,0
X	2405396	.	C	A	391.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:420,30,0
X	2406530	.	A	G	470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:499,36,0
X	2523113	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	2533881	.	C	G	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
X	2540943	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
X	2541003	.	T	C	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	2546148	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	2563339	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	2563340	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	2576400	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	2581198	.	A	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:81,0,32
X	2609717	.	G	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	2632482	.	C	T	631.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.983;DP=73;FS=3.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:53,20:73:99:660,0,2077
X	2824246	.	T	C	102.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.929	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:131,0,436
X	2824254	.	T	C	70.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.566	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:99:99,0,472
X	2824311	.	T	C	108.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.37;ReadPosRankSum=-0.694	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:137,0,525
X	2824317	.	T	C	363.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.077	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,9:13:99:392,0,129
X	2824377	.	T	C	75.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-0.284;DP=23;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.041	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,4:23:99:104,0,740
X	2824385	.	T	C	157.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.859;DP=25;FS=1.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.304	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,6:25:99:186,0,754
X	2824433	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.988;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:118,0,116
X	2824434	.	T	C	89.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:99:118,0,116
X	2824985	.	T	C	88.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:72:117,0,72
X	2830091	.	G	T	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	2832001	.	A	G	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
X	2836037	.	G	C	126.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.267	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,5:14:99:155,0,335
X	2951434	.	C	G	52.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:81,0,35
X	2951931	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	3224257	.	A	G	13.72	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:40,3,0
X	3228411	.	G	A	136.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
X	3228891	.	A	G	438.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:467,33,0
X	3235724	.	C	T	836.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:865,60,0
X	3238167	.	T	G	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
X	3238733	.	G	A	732.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:761,54,0
X	3239545	.	C	T	579.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:608,45,0
X	3240343	.	G	A	858.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:887,63,0
X	3241050	.	G	A	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:617,42,0
X	3241256	.	T	C	663.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:692,51,0
X	3241284	.	A	G	803.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:832,57,0
X	3241317	.	T	C	460.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:33:489,33,0
X	3241791	.	G	A	574.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:603,42,0
X	3523831	.	A	G	177.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
X	3524309	.	T	C	365.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:394,30,0
X	3525766	.	G	A	48.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:26:77,0,26
X	3526369	.	A	C	242.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.398	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:271,0,129
X	3631167	.	A	G	366.74	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=33.34;ReadPosRankSum=-0.158	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:6:394,0,6
X	3631523	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:78,0,31
X	3631620	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	3631622	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	3729943	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	3730344	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
X	3732834	.	C	T	66.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:94,9,0
X	3736489	.	C	T	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
X	3738048	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	3738155	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
X	3738504	.	C	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
X	3739077	.	A	G	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
X	3739586	.	G	A	213.88	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:16:242,0,16
X	3740953	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
X	3743601	.	T	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	3746558	.	C	T	700.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:729,51,0
X	3747372	.	C	T	656.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:53:685,53,0
X	6967175	.	G	A	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.267;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.334	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:333,0,516
X	6967806	.	T	C	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-1.323;DP=17;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.819	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:78:78,0,557
X	6968011	.	A	G	846.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:875,60,0
X	6968275	.	C	A	465.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.220	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,14:23:99:494,0,329
X	6975782	.	C	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	6995315	.	C	T	703.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:732,51,0
X	6995417	.	C	T	422.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=23.49;ReadPosRankSum=0.515	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,12:18:99:451,0,196
X	6995438	.	C	T	787.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-0.532;DP=28;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=28.13;ReadPosRankSum=0.476	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,22:28:99:816,0,166
X	7023678	.	G	A	306.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.222	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,10:18:99:335,0,295
X	7066051	.	A	C	133.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
X	7270996	.	A	G	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=12.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,78
X	7272225	.	G	A	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:74,0,31
X	8498979	.	G	A	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	8503641	.	G	A	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
X	8699900	.	G	C	131.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=21.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:41:160,0,41
X	8700168	.	A	C	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
X	9623839	.	C	A	185.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:214,15,0
X	9624952	.	G	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	9625927	.	C	G	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
X	9636900	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	9643103	.	C	T	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	9643332	.	G	A	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
X	9643469	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	9647154	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	9648220	.	C	T	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	9651839	.	T	A	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
X	9859098	.	A	G	186.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:215,15,0
X	10085674	.	T	C	798.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:65:827,65,0
X	10088835	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	10093298	.	T	C	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
X	10093465	.	A	G	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	10093478	.	C	T	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
X	10093633	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	10098825	.	A	G	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
X	10099283	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	10099392	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	10100252	.	C	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	10104606	.	C	T	45.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
X	10108960	.	G	A	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
X	12810554	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	12994250	.	A	G	368.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:397,30,0
X	13730787	.	G	C	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
X	13731696	.	C	G	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.04	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
X	13734539	.	T	C	126.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
X	13752895	.	G	T	188.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:217,15,0
X	13772998	.	A	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	13787939	.	C	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
X	14026517	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	14044242	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	14044458	.	G	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	14590132	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	14858594	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	14859655	.	A	C	33.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:61,6,0
X	14877404	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	15259440	.	A	G	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	15262372	.	T	A	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
X	15262432	.	A	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
X	15415583	.	C	T	1139.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1168,81,0
X	15431033	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	15801330	.	A	C	358.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:387,27,0
X	15801643	.	A	G	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
X	15801922	.	A	G	24.97	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:52,5,0
X	15801923	.	A	G	24.97	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:5:52,5,0
X	15802800	.	C	G	372.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:401,27,0
X	15804984	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	15805571	.	G	A	90.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
X	15805791	.	A	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	15838366	.	C	T	85.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
X	15850365	.	A	G	281.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:310,21,0
X	15854519	.	A	G	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
X	15854534	.	G	A	261.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:290,21,0
X	15854821	.	T	C	41.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:70:70,0,113
X	15860834	.	T	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
X	16606271	.	C	T	269.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:298,21,0
X	16608793	.	G	A	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
X	16610522	.	T	C	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
X	16613842	.	C	T	311.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:340,24,0
X	16614182	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	16621507	.	C	G	51.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:34:80,0,34
X	16781275	.	A	G	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:37:76,0,37
X	16784940	.	C	T	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
X	16785127	.	C	T	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
X	16862188	.	G	T	15.88	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:44:44,0,361
X	16871145	.	C	T	531.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:560,39,0
X	16887655	.	C	T	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
X	17171300	.	A	G	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
X	17819377	.	T	C	715.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:744,51,0
X	18650572	.	C	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	20181137	.	C	T	62.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=4.48;ReadPosRankSum=-1.713	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:91:91,0,435
X	23398214	.	T	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	23718098	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	23719553	.	G	T	527.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.02	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:556,39,0
X	23719788	.	T	C	72.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=2.054;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=8.09;ReadPosRankSum=-2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:101,0,233
X	23719813	.	G	A	231.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:260,18,0
X	23719946	.	T	C	49.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:78,0,27
X	23720176	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	23721572	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	23721578	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	23725863	.	C	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	23758011	.	C	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	23801593	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	23801775	.	G	A	322.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-2.239;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=29.34;ReadPosRankSum=1.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,9:11:41:351,0,41
X	24073761	.	C	T	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
X	24091974	.	A	G	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
X	24092704	.	T	A	806.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,19:19:57:835,57,0
X	24092733	.	G	A	764.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:793,54,0
X	24093873	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,352
X	24094004	.	A	G	78.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.894;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.213	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:107,0,693
X	24094467	.	A	G	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.086	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,2:13:43:43,0,425
X	24095043	.	C	T	62.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=4.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:9:90,9,0
X	24235316	.	G	T	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	24558171	.	A	T	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
X	24558261	.	C	G	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
X	24558750	.	G	A	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
X	24559271	.	A	G	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
X	24561434	.	T	C	304.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:333,24,0
X	24564100	.	T	C	486.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:515,36,0
X	24565129	.	G	A	229.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:258,18,0
X	24566424	.	C	A	335.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:364,27,0
X	24566835	.	G	A	513.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:542,39,0
X	24567719	.	G	C	583.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:612,42,0
X	24568553	.	A	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
X	25014784	.	A	G	690.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:719,51,0
X	25663792	.	T	A	112	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:153,15,0
X	30648774	.	T	C	14.68	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:41,3,0
X	30849176	.	G	A	346.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,9:10:20:375,20,0
X	30850283	.	A	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	30854777	.	T	C	123.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:152,0,148
X	30862159	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	30872602	.	A	G	758.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.387	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,19:20:21:787,21,0
X	30889857	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	36229919	.	C	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:84,6,0
X	36229922	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	36229972	.	T	A	84.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
X	38123988	.	A	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	38663104	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	39933229	.	T	G	353.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:382,27,0
X	39933339	.	A	G	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
X	40487350	.	T	C	500.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:529,36,0
X	40506697	.	A	G	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	40795461	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	41208541	.	T	A	380.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:409,30,0
X	41602950	.	G	A	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	44508460	.	A	C	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	44508506	.	G	C	135.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
X	44508938	.	G	A	97.89	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:2:124,2,0
X	44508950	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	44508952	.	A	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	44508953	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	44929077	.	C	A	554.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:583,39,0
X	45491348	.	A	C	77.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:105,12,0
X	46299826	.	G	A	55.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:1:81,0,1
X	46299833	.	A	C	55.31	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,2:2:1:81,0,1
X	46312623	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	46322656	.	G	A	169.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.307;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:198,0,149
X	46329887	.	G	A	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
X	46331860	.	G	A	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
X	46462246	.	T	C	273.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:302,21,0
X	46464041	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:75:75,0,76
X	46740032	.	G	A	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	47036468	.	C	G	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	47040634	.	T	C	588.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:617,45,0
X	47057647	.	A	G	225.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:254,18,0
X	47066250	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	47080994	.	A	C	96.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
X	47088740	.	C	G	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.937;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:150,0,230
X	47088744	.	A	C	121.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:150,0,230
X	47088878	.	C	T	559.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.450;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,16:33:99:588,0,622
X	47104819	.	G	A	500.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.383;DP=37;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,16:37:99:529,0,776
X	47327111	.	T	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.96	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
X	47515668	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:75,0,31
X	47778655	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	47783274	.	G	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	47818739	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	47917686	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	47917687	.	G	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	47918205	.	G	A	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
X	48382174	.	G	T	2209.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2238,157,0
X	48398114	.	G	A	50.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
X	48418659	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
X	48435402	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	48435405	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	48435928	.	C	T	2001.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2030,138,0
X	48436507	.	C	G	1514.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,36:36:99:1543,108,0
X	48437762	.	C	G	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
X	48437902	.	A	G	748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:777,54,0
X	48438924	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:75,0,30
X	48438979	.	A	G	35.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:64:64,0,197
X	48439427	.	A	G	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	48456223	.	G	T	314.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:343,30,0
X	48459503	.	A	G	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:173,12,0
X	48459510	.	T	A	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:12:173,12,0
X	48459751	.	G	T	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
X	48459962	.	G	A	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
X	48460314	.	A	G	1163.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1192,84,0
X	48462972	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	48464413	.	C	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	48465135	.	C	T	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
X	48537987	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	48537991	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	48567295	.	A	G	353.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:382,30,0
X	48676839	.	G	A	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	48690416	.	G	T	938.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:967,72,0
X	48751471	.	A	G	1543.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.666;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=25.78;ReadPosRankSum=-0.666	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,38:39:73:1572,73,0
X	48759204	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
X	48763481	.	A	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
X	48900900	.	T	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	48922068	.	C	T	118.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:147,0,56
X	48933890	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	48941422	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	48946303	.	A	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	49021256	.	A	G	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
X	49021537	.	G	C	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
X	49022700	.	T	C	403.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:432,30,0
X	49103224	.	G	A	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
X	50648955	.	T	G	187.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:216,15,0
X	51643018	.	C	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	53113899	.	G	C	28.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:56,6,0
X	53173319	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	53180610	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	53181981	.	T	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	53187670	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
X	53190639	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
X	53191756	.	C	G	142.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:170,12,0
X	53194043	.	C	G	16.63	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:43,3,0
X	53194128	.	A	C	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	53194729	.	G	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
X	53195742	.	G	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	53196486	.	G	A	91.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
X	53197952	.	C	A	92.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
X	53262303	.	G	A	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	53297928	.	C	T	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	53299420	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	53302495	.	A	G	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	53401318	.	C	G	68.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,225
X	53405696	.	C	G	375.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.352;DP=36;FS=5.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.386	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,12:36:99:404,0,957
X	53449568	.	G	A	691.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:720,51,0
X	53563589	.	A	G	997.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-1.733;DP=26;FS=5.699;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.17;ReadPosRankSum=1.600	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,25:26:43:1026,43,0
X	53641647	.	T	C	1264.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1293,90,0
X	53655497	.	C	T	341.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.154;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,10:22:99:370,0,463
X	53957463	.	C	G	141.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:169,12,0
X	53960327	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	53961154	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	53963624	.	T	C	704.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:733,51,0
X	53964588	.	T	C	572.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:601,42,0
X	53966984	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	54209387	.	A	G	70.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:98,9,0
X	54472506	.	G	A	753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:782,54,0
X	54478321	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	54589141	.	A	G	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:111,0,116
X	54589183	.	A	G	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,195
X	54589297	.	G	C	221.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,7:12:99:250,0,177
X	54589730	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:36:75,0,36
X	54590033	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.118	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:57:57,0,366
X	54590066	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,73
X	54590184	.	T	A	377.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:406,30,0
X	54591228	.	G	A	82.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:111,0,115
X	54591347	.	A	G	84.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:57:113,0,57
X	54591370	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,235
X	54591377	.	A	G	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,1:4:61:61,0,235
X	54641365	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	54760587	.	A	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	54765913	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	54836361	.	A	G	2449.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2478,175,0
X	54836505	.	A	G	2694.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2723,187,0
X	54837340	.	C	T	1981.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:2010,138,0
X	54838077	.	C	T	2847.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,66:66:99:2876,199,0
X	54838352	.	C	A	144.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:172,12,0
X	54838437	.	G	A	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
X	54841457	.	G	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	54841793	.	G	C	681.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=-0.672;DP=54;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,20:54:99:710,0,1295
X	55033378	.	C	T	548.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-2.684;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=18.92;ReadPosRankSum=2.553	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,15:29:99:577,0,519
X	55785007	.	C	G	81.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:110,0,140
X	56292912	.	G	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
X	56314747	.	C	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	57019862	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	57020115	.	C	T	149.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.92	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:177,12,0
X	57109236	.	C	G	130.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:158,12,0
X	57109486	.	G	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	57109827	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	57116139	.	T	G	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	57147944	.	G	T	243.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:272,21,0
X	57250578	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	57271293	.	T	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	57313357	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	57405163	.	T	C	326.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:355,24,0
X	57491132	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	57514636	.	G	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	57619648	.	G	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	57622607	.	G	A	271.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:300,21,0
X	57936478	.	T	C	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
X	64754486	.	G	A	411.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.299;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.190	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,12:25:99:440,0,468
X	66945740	.	T	C	312.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.49	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:341,24,0
X	66946851	.	T	C	405.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:434,30,0
X	66949722	.	C	T	549.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:578,39,0
X	66950105	.	C	T	122.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:150,12,0
X	67733784	.	G	A	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	68394429	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	68394437	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	68394442	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	70279492	.	A	C	699.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:728,51,0
X	70287389	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	70287683	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	70349947	.	A	C	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:39:555,39,0
X	70358276	.	A	G	49.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
X	70469182	.	G	A	140.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
X	70519679	.	A	G	115.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
X	71349753	.	G	A	127.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
X	71349774	.	T	C	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	71372190	.	T	C	15.65	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:42,3,0
X	71493691	.	C	T	1276.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1305,90,0
X	71494019	.	A	G	235.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:264,18,0
X	71549512	.	G	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	73416925	.	T	C	20.80	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.967	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:49:49,0,387
X	73416984	.	T	C	100.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.283;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:129,0,498
X	73417059	.	T	C	67.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:96:96,0,405
X	73417079	.	T	C	76.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:105,0,266
X	73419961	.	T	C	125.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.421;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:154,0,148
X	73421607	.	T	C	34.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:63:63,0,282
X	73421663	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:108,0,464
X	73421672	.	T	C	79.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:99:108,0,464
X	73421795	.	T	C	138.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.670;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.670	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:167,0,294
X	73428129	.	T	C	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,109
X	73428531	.	T	C	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:49:49,0,228
X	73434114	.	T	C	42.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:71:71,0,148
X	73435386	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	73436932	.	G	C	184.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:213,15,0
X	73438641	.	T	G	121.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
X	73442084	.	T	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	73442329	.	T	C	92.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:121,0,25
X	73462520	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	73481093	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	73494781	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	73811586	.	C	T	279.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:308,21,0
X	74494470	.	T	G	134.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
X	74523367	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	74523871	.	G	A	267.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:296,21,0
X	74524280	.	C	A	151.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:179,12,0
X	74959569	.	G	C	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:63:333,0,63
X	74959575	.	A	G	304.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.86;ReadPosRankSum=-0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:63:333,0,63
X	74961633	.	T	G	432.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.36	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,11:11:3:459,0,3
X	74961635	.	C	T	432.53	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=32.10;ReadPosRankSum=1.448	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,11:12:3:459,0,3
X	74961648	.	G	A	201.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:230,0,24
X	74961968	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	75398498	.	A	G	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:72,0,33
X	75403652	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	76930578	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	76937963	.	G	C	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
X	77083891	.	T	C	117.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.050;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:146,0,1183
X	77083897	.	T	C	212.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-2.453;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:241,0,882
X	77083915	.	T	C	183.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.132;DP=19;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.184	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,6:19:99:212,0,502
X	77083981	.	T	C	35.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.957;DP=22;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.765	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:64:64,0,736
X	77084001	.	T	C	50.77	my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-0.598;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=1.59;ReadPosRankSum=0.484	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:79:79,0,1058
X	77108374	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	77166333	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	77166335	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	77268502	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	77298857	.	G	A	232.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:261,18,0
X	77304027	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	77381002	.	A	G	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	77381109	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	77383236	.	G	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	77385748	.	C	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
X	79826527	.	C	T	401.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:430,30,0
X	79826582	.	A	G	309.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:338,24,0
X	79928258	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	80553229	.	C	T	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:51:740,51,0
X	81752809	.	T	C	258.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:287,21,0
X	83314090	.	A	C	40.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
X	83315966	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
X	83316454	.	C	A	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	83317595	.	A	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	83320017	.	C	T	266.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:295,21,0
X	84344249	.	A	G	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	84345851	.	A	G	40.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,121
X	84345873	.	A	G	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,110
X	84346925	.	T	G	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
X	84346943	.	A	G	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:52:52,0,276
X	84346959	.	A	G	61.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:90:90,0,221
X	84534383	.	A	C	240.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:20:269,20,0
X	85219021	.	T	C	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	93130599	.	A	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	93130603	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	93806522	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	93806524	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	93806536	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	94698897	.	G	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	94698898	.	G	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	94698900	.	C	A	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	94698908	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	99941705	.	T	C	190.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:219,15,0
X	100059148	.	A	G	736.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:54:765,54,0
X	100059188	.	A	G	415.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:444,30,0
X	100264658	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:74:74,0,79
X	100264668	.	T	C	45.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:74:74,0,79
X	100265289	.	T	C	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,107
X	100265552	.	T	A	189.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:218,15,0
X	100419261	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	100420277	.	C	G	44.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
X	100503973	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	100505881	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
X	100517057	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	100598395	.	T	C	47.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:76:76,0,78
X	100753863	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	100880857	.	G	A	239.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:268,18,0
X	101138551	.	C	T	102.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:130,9,0
X	102842041	.	T	C	1795.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,42:42:99:1824,126,0
X	103375026	.	T	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
X	103433757	.	C	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	103437789	.	A	G	354.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:383,27,0
X	103438266	.	A	G	132.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.20	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:24:161,0,24
X	105153001	.	A	G	485.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:514,36,0
X	106847198	.	C	T	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
X	108297375	.	T	C	74.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=1.754;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:39:103,0,39
X	108297445	.	A	G	139.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
X	108297641	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
X	108297699	.	T	C	2672.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2701,187,0
X	108297702	.	A	G	1910.85	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.014;DP=57;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=33.52;ReadPosRankSum=-1.199	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,52:57:17:1939,0,17
X	108297713	.	T	C	2330.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2359,178,0
X	108297794	.	T	C	2157.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,55:55:99:2186,165,0
X	108297832	.	A	G	526.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:555,42,0
X	108786314	.	G	A	228.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:257,18,0
X	108787014	.	T	C	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	109419165	.	G	A	627.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:656,45,0
X	112020692	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	112021296	.	T	C	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
X	114952890	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=1.231;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,128
X	114952893	.	G	T	46.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:75:75,0,128
X	114952896	.	G	T	52.73	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=6;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:114,0,125
X	117566818	.	A	G	262.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:291,21,0
X	118603550	.	A	G	103.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:131,9,0
X	118603844	.	T	G	2186.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,51:51:99:2215,154,0
X	118604436	.	T	C	3102.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,74:74:99:3131,223,0
X	118672437	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	118672646	.	G	A	39.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
X	118672671	.	T	C	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=25.11;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:99:204,0,156
X	118672672	.	T	C	175.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.495;DP=7;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:99:204,0,156
X	118673238	.	T	C	116.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.159;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.652	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:145,0,194
X	118673250	.	T	C	43.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:72:72,0,145
X	118678364	.	G	A	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
X	118699320	.	A	G	195.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:224,15,0
X	118713476	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	118715929	.	C	A	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	118722495	.	C	T	106.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:134,9,0
X	119005705	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	121106746	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	121106767	.	T	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	122648790	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	122648800	.	A	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	122735221	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	123042424	.	G	A	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	123042707	.	T	C	245.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:274,21,0
X	123043705	.	A	C	270.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:299,21,0
X	123043876	.	C	T	171.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:27:200,0,27
X	123044414	.	T	C	226.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:255,18,0
X	123045046	.	A	G	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	123045109	.	C	A	46.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
X	123045641	.	C	T	182.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:211,15,0
X	123045915	.	C	T	93.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
X	123046272	.	A	T	265.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:294,21,0
X	123046536	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	123046591	.	A	G	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:67:163,0,67
X	123046599	.	A	G	134.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=22.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:67:163,0,67
X	123046923	.	T	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
X	123047048	.	A	G	155.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=1.186;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.532	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:184,0,218
X	123047093	.	A	G	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.396	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,2:12:54:54,0,384
X	123047112	.	A	G	112.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-1.652;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.159	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:141,0,183
X	123047282	.	C	T	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	123338768	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	125606278	.	T	C	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	125606279	.	G	A	18.59	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:45,3,0
X	128566098	.	G	A	51.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
X	128938958	.	T	C	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
X	129265394	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	129283520	.	A	G	1330.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,31:31:93:1359,93,0
X	129337831	.	C	T	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
X	130518552	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	130555442	.	T	C	48.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
X	130555456	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	130555457	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	130555469	.	C	T	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	130780827	.	G	A	89.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
X	133678852	.	G	A	171.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:200,15,0
X	133679612	.	T	C	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
X	134022552	.	A	T	61.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:89,9,0
X	134022913	.	A	C	147.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:175,12,0
X	134155904	.	G	T	605.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:634,45,0
X	134156121	.	G	C	340.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:369,27,0
X	134185997	.	T	A	53.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
X	134421168	.	C	T	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
X	134477613	.	A	C	180.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.68	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:209,15,0
X	134478028	.	C	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	134481578	.	C	G	105.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:133,9,0
X	135129010	.	A	T	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	135593912	.	G	A	297.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.200	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,9:22:99:326,0,455
X	135638823	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	135956506	.	C	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
X	136520536	.	A	C	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
X	138141507	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	138809002	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	138811003	.	G	A	219.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
X	143075727	.	G	A	50.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:35:79,0,35
X	144519388	.	A	T	28.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:56,6,0
X	147133691	.	G	C	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	148603298	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	148604889	.	C	A	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	148622730	.	G	A	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
X	148622745	.	T	A	568.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:42:597,42,0
X	149642019	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	149681925	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
X	149931106	.	C	T	298.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:327,24,0
X	149931772	.	C	T	479.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:508,36,0
X	149932703	.	G	A	361.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:390,27,0
X	149932722	.	A	T	33.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:62:62,0,246
X	149935100	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	149936269	.	G	A	104.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:132,9,0
X	149936971	.	C	T	101.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:129,9,0
X	149937404	.	T	C	359.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:388,27,0
X	150151835	.	T	A	367.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:396,27,0
X	150156029	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	150159145	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	150162018	.	T	C	36.78	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:26:65,0,26
X	150575385	.	A	G	280.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:309,21,0
X	151995906	.	C	A	146.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:174,12,0
X	152018832	.	T	G	902.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,22:22:66:931,66,0
X	152038869	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	152609450	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
X	152613112	.	C	T	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	152613702	.	A	G	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
X	152616741	.	A	T	150.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:178,12,0
X	152616952	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
X	152727446	.	T	A	98.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
X	152865003	.	T	G	41.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
X	152954025	.	A	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
X	152989830	.	A	C	915.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,23:23:69:944,69,0
X	153062772	.	T	C	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
X	153214589	.	C	G	869.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:898,63,0
X	153215839	.	G	A	458.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:487,36,0
X	153277507	.	A	G	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
X	153278829	.	G	A	1084.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1113,84,0
X	153280475	.	G	A	100.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:128,9,0
X	153284192	.	A	G	897.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.578	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,23:24:27:926,27,0
X	153284483	.	G	A	1481.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.14	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,37:37:99:1510,110,0
X	153292180	.	T	C	137.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
X	153294542	.	T	C	317.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:346,24,0
X	153583866	.	G	C	52.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
X	153594155	.	C	T	131.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
X	153630255	.	G	C	238.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:267,18,0
X	153630293	.	C	T	268.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.03	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:297,21,0
X	153633359	.	G	C	218.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:247,18,0
X	153633953	.	T	C	300.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:329,24,0
X	153638662	.	G	A	143.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:171,12,0
X	153649813	.	G	C	387.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:416,30,0
X	153657083	.	A	G	825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:854,63,0
X	153659164	.	T	G	191.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.39	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:220,15,0
X	153660041	.	C	T	97.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
X	153668172	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
X	153689893	.	G	A	861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:63:890,63,0
X	153696805	.	C	A	321.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:350,24,0
X	153713158	.	C	G	1062.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.835;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=31.94;ReadPosRankSum=0.835	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,26:27:38:1091,38,0
X	153714540	.	C	T	145.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:173,12,0
X	153716632	.	C	G	307.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:336,24,0
X	153718872	.	G	A	146.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:175,15,0
X	153994596	.	G	T	1949.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,46:46:99:1978,138,0
X	154351334	.	G	A	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
X	154456747	.	A	G	1108.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,27:27:81:1137,81,0
X	154467457	.	C	T	494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.63	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:523,36,0
X	155252104	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
X	155252868	.	T	A	95.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
X	155254016	.	T	C	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
X	155254781	.	G	A	17.61	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.61	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:3:44,3,0
X	155255062	.	C	G	73.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:99:102,0,280
Y	6818280	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	6818285	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	6818292	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	6818313	.	C	T	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
Y	10019950	.	T	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	10023944	.	G	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	10023947	.	T	C	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	10023949	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	10026697	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
Y	10026698	.	T	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:87,6,0
Y	10026708	.	A	G	59.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:87,6,0
Y	10027372	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
Y	10027375	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
Y	10027378	.	T	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
Y	10031414	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:85,6,0
Y	10031423	.	T	C	57.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:85,6,0
Y	10033081	.	T	G	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:15:205,15,0
Y	10033085	.	T	C	176.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.60	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
Y	10033106	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.15	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
Y	10033113	.	A	C	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.13	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:270,18,0
Y	10033116	.	C	T	241.84	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:18:270,18,0
Y	10033508	.	A	G	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:24:352,24,0
Y	10033516	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:24:352,24,0
Y	10033521	.	T	C	323.78	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:24:352,24,0
Y	10033558	.	G	T	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
Y	10033559	.	A	G	152.03	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:180,12,0
Y	10035487	.	A	G	94.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:22:123,0,22
Y	10035489	.	A	G	94.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.60	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,3:3:22:123,0,22
Y	10035915	.	T	A	483.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.73	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:512,36,0
Y	10035937	.	A	G	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
Y	10035940	.	T	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
Y	10035943	.	T	C	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:36:540,36,0
Y	10035949	.	A	G	511.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:36:540,36,0
Y	10036088	.	A	G	1098.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1127,78,0
Y	10036101	.	T	C	357.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.049;DP=41;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.146	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,12:37:99:417,0,996
Y	10036105	.	T	C	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.95	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1845,123,0
Y	10036107	.	T	C	1816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.46	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,41:41:99:1845,123,0
Y	10036132	.	T	C	960.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:989,72,0
Y	10036269	.	A	G	10.21	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=2;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.804	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,1:2:32:38,0,32
Y	10036413	.	T	C	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
Y	10036419	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
Y	10036431	.	T	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.434;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=32.12;ReadPosRankSum=1.302	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,15:16:29:740,29,0
Y	10036439	.	A	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:29:740,29,0
Y	10036445	.	G	C	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:29:740,29,0
Y	10036453	.	T	G	711.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,17:17:29:740,29,0
Y	10036483	.	T	C	133.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=22.30;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:22:162,0,22
Y	10036486	.	C	G	133.79	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.45	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:0,4:4:22:162,0,22
Y	10036503	.	T	C	58.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:86,6,0
Y	10036545	.	T	C	1033.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,18:18:72:1062,72,0
Y	10036549	.	A	C	1033.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1062,72,0
Y	10036561	.	T	C	1464.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.481;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=32.41;ReadPosRankSum=-1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,35:36:98:1493,98,0
Y	10036586	.	T	C	1224.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,29:29:87:1253,87,0
Y	10037791	.	C	G	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:48:704,48,0
Y	10037797	.	T	C	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,12:12:48:704,48,0
Y	10037807	.	T	C	675.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.08	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,16:16:48:704,48,0
Y	10037819	.	T	C	1010.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,24:24:72:1039,72,0
Y	10037892	.	A	G	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
Y	10037899	.	T	C	107.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:135,9,0
Y	13310610	.	A	G	85.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:32:114,0,32
Y	13310646	.	G	T	243.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:20:272,20,0
Y	13310650	.	C	T	243.81	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:20:272,20,0
Y	13313874	.	C	A	99.28	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
Y	13315180	.	C	T	32.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,166
Y	13315181	.	G	A	49.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:78:78,0,142
Y	13315932	.	C	G	54.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Y	13317683	.	A	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
Y	13319344	.	A	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Y	13325496	.	C	T	60.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:88,6,0
Y	13327812	.	A	G	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	13327816	.	C	T	62.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:90,6,0
Y	13331669	.	T	C	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,1:1:6:84,6,0
Y	13331676	.	T	G	56.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Y	15053288	.	G	T	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:15:222,15,0
Y	15053296	.	T	C	193.90	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:222,15,0
Y	15053335	.	C	G	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
Y	21152701	.	G	T	2545.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2574,177,0
Y	21152719	.	T	C	2074.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,49:49:99:2103,147,0
Y	21152731	.	G	C	1936.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1965,135,0
Y	21152862	.	C	A	855.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.24	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,20:20:60:884,60,0
Y	21152868	.	T	G	855.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.52	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:60:884,60,0
Y	21152967	.	A	G	2748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,56:56:99:2777,187,0
Y	21152971	.	C	T	2748.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,62:62:99:2777,187,0
Y	21153096	.	G	A	1206.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.45	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,28:28:84:1235,84,0
Y	21153166	.	T	A	2553.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,60:60:99:2582,181,0
Y	21153174	.	T	A	1837.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-2.397;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.182;QD=36.28;ReadPosRankSum=2.289	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,44:46:78:1866,78,0
Y	21153459	.	A	G	2494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2523,175,0
Y	21153474	.	A	G	2457.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,57:57:99:2486,172,0
Y	21153540	.	C	T	616.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,15:15:45:645,45,0
Y	21153609	.	T	C	3242.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,75:75:99:3271,226,0
Y	21153667	.	C	A	3658.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,85:85:99:3687,255,0
Y	21153740	.	C	T	1379.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,33:33:99:1408,99,0
Y	21153846	.	A	T	402.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.50	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:10:30:431,30,0
Y	21154004	.	A	C	2825.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,65:65:99:2854,196,0
Y	21154323	.	G	A	3099.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.74	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3128,214,0
Y	21154466	.	T	A	3052.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,71:71:99:3081,214,0
Y	21154569	.	A	G	2217.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,52:52:99:2246,157,0
Y	21154603	.	A	C	2716.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,64:64:99:2745,193,0
Y	21154779	.	C	G	55.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Y	21154904	.	C	T	61.74	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:89,6,0
MT	73	.	A	G	3491.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,88:88:99:3520,264,0
MT	150	.	C	T	3569.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:3598,247,0
MT	263	.	A	G	3753.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,86:86:99:3782,259,0
MT	279	.	T	C	3706.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:3735,262,0
MT	513	.	G	A	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:21:293,21,0
MT	517	.	A	T	264.80	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:293,21,0
MT	750	.	A	G	3816.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.11	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:3845,262,0
MT	1438	.	A	G	1098.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,26:26:78:1127,78,0
MT	1721	.	C	T	3875.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-1.732;DP=90;FS=3.108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=29.96;ReadPosRankSum=1.694	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,89:90:99:3904,237,0
MT	2617	.	A	T	517.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.023;DP=75;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.008	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,27:59:99:1012,0,1255
MT	2706	.	A	G	3470.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.34	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,84:84:99:3499,252,0
MT	2755	.	A	G	4047.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.16	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:4076,277,0
MT	3197	.	T	C	3437.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,79:79:99:3466,238,0
MT	3338	.	T	C	3521.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,82:82:99:3550,247,0
MT	3887	.	A	G	2801.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=1.462;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=26.60;ReadPosRankSum=-1.218	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,71:80:99:2830,0,142
MT	5513	.	G	A	193.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=3.241;DP=23;FS=15.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=8.42;ReadPosRankSum=-3.307	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,7:23:99:222,0,626
MT	8581	.	G	A	14.91	LowQual;my_snp_filter	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.116;DP=27;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.193	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,3:27:43:43,0,958
MT	9494	.	A	G	1273.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,30:30:90:1302,90,0
MT	10256	.	T	C	4054.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:4083,277,0
MT	11467	.	A	G	4035.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:4064,277,0
MT	11653	.	A	G	3370.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,77:77:99:3399,232,0
MT	12308	.	A	G	2529.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,59:59:99:2558,178,0
MT	12372	.	G	A	3182.76	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,76:76:99:3211,229,0
MT	12618	.	G	A	3918.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:3947,268,0
MT	12634	.	A	G	3914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,89:89:99:3943,268,0
MT	13617	.	T	C	3144.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=-1.639;DP=74;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.358	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,73:74:99:3173,181,0
MT	13630	.	A	G	3849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,73:73:99:3878,262,0
MT	13637	.	A	G	3849.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,87:87:99:3878,262,0
MT	13759	.	G	A	968.77	PASS	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.636;ClippingRankSum=-3.053;DP=78;FS=22.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=12.42;ReadPosRankSum=3.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:47,31:78:99:997,0,1795
MT	14182	.	T	C	2861.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-0.018;DP=70;FS=3.059;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=33.89;ReadPosRankSum=0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,68:70:99:2890,125,0
MT	14766	.	C	T	2288.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,54:54:99:2317,163,0
MT	15326	.	A	G	4031.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,92:92:99:4060,277,0
MT	15598	.	C	T	4083.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,93:93:99:4112,280,0
MT	15905	.	T	C	1914.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,45:45:99:1943,135,0
MT	16223	.	C	T	3059.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:3088,208,0
MT	16224	.	T	C	3059.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,69:69:99:3088,208,0
MT	16270	.	C	T	2494.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,58:58:99:2523,175,0
MT	16519	.	T	C	3427.77	PASS	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.66	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,78:78:99:3456,235,0