# combined model, p53 (Carole) and NHEJ # parameters begin parameters kp53mRNAsyn 0.06 # Rate of p53 mRNA Synthesis kp53mRNAdeg 0.006 # Rate of p53 mRNA Degradation kp53syn 0.36 # Rate of p53 Synthesis kp53deg 4.95e-5 # Rate of p53 Degradation kp53degMDM2dep 0.0495 # Rate of p53 Degradation-MDM2 Dependant kp53phos 0.36 # Rate of p53 Phosphorylation kp53dphos 30 # Rate of p53 Dephosphorylation kMDM2mRNAsyn 0.006 # Rate of MDM2 mRNA Synthesis kMDM2mRNAdeg 0.006 # Rate of MDM2 mRNA Degradation kMDM2syn 0.0297 # Rate of MDM2 Synthesis kMDM2deg 0.02598 # Rate of MDM2 Degradation kMDM2pdeg 0.024 # Rate of Phosphorylated MDM2 Degradation kMDM2phos 120 # Rate of MDM2 Phosphorylation kMDM2dphos 30 # Rate of p53 Dephosphorylation kp53MDM2bind 0.0693 # Rate of p53 MDM2 Binding kp53MDM2dis 0.0000693 # Rate of p53 MDM2 Dissociation kp21mRNAsyn 0.0000036 # Rate of p21 mRNA Synthesis (p53) kp21mRNAsynp 0.00036 # Rate of p21 mRNA Synthesis (Phosphorylated p53) kp21mRNAdeg 0.00144 # Rate of p21 mRNA Degradation kp21synstep1 0.024 # Rate of p21 Synthesis Step 1 kp21synstep2 0.0024 # Rate of p21 Synthesis Step 2 kp21synstep3 0.0024 # Rate of p21 Synthesis Step 3 kp21deg 0.0114 # Rate of p21 Degradation kGADD45act 0.00024 # Rate of GADD45 Activation/Production kGADD45deg 0.0006 # Rate of GADD45 Degradation kp38phos 0.48 # Rate of p38 Phosphorylation kp38dphos 6 # Rate of p38 Dephosphorylation kROSgen 1.5 # Rate of ROS Generation by p38 kIR 80 kROS 50 # Constant rate of ROS production kdROS 5 # ROS degradation rate kdam1 0.000006 # Rate of simple damage production by ROS kdam2 0.000006 # Rate of complex damage production by ROS kdku1 0.5 # Rate of Ku dissociation from a simple break kdku2 0.5 # Rate of Ku dissociation from a complex break kdku3 5 # Rate of oxidised Ku dissociation from a simple break kdku4 5 # Rate of oxidised Ku dissociation from a complex break kdnapk1 0.033 # Rate of DNAPK simple break complex formation kdnapk2 0.0017 # Rate of DNAPK complex break complex formation kddnapk1 0.02 # Rate of DNAPK simple break complex dissociation kddnapk2 0.02 # Rate of DNAPK complex break complex dissociation kdnapkphos1 0.28 # Rate pd DNAPK phosphorylation in a DNAPK complex of a simple break kdnapkphos2 0.28 # Rate pd DNAPK phosphorylation in a DNAPK complex of a complex break kliIV1 0.00071 # Rate of LigaseIV binding to a simple break complex kliIV2 0.00046 # Rate of LigaseIV binding to a complex break complex kdliIV1 0.0001 # Rate of LigaseIV dissociation from a simple break complex kdliIV2 0.0001 # Rate of LigaseIV dissociation from a complex break complex kfixIV1 0.0285 # Rate of DNA repair by LigaseIV of a simple break kfixIV2 0.0285 # Rate of DNA repair by LigaseIV of a complex break kPARP1 0.000077 # Rate of PARP binding to simple break kPARP2 0.000065 # Rate of PARP binding to complex break kdPARP1 0.02 # Rate of PARP dissociation from a simple break kdPARP2 0.02 # Rate of PARP dissociation from a complex break kliIII1 0.0015 # Rate of LigaseIII binding to a simple break kliIII2 0.00024 # Rate of LigaseIII binding to a complex break kdliIII1 0.0001 # Rate of LigaseIII dissociation from a simple break kdliIII2 0.0001 # Rate of LigaseIII dissociation from a complex break kfixIII1 0.0006 # Rate of DNA accurate repair by LigaseIII for a simple break kfixIII2 0.0006 # Rate of DNA accurate repair by LigaseIII for a complex break kfixIII3 0.0009 # Rate of DNA inaccurate repair by LigaseIII for a simple break kfixIII4 0.0009 # Rate of dna inaccurate repair by LigaseIII for a complex break kATMact 0.0012 # Rate of ATM Activation kATMinact 0.03 # Rate of ATM Inactivation kh2axp1 0.1 # Phosphorylation of h2ax via ATM kh2axp2 0.5 # Phosphorylation of h2ax via DNA-PKcs kh2axu 0.01 # Dephosphorylation of h2ax kh2axfoc 0.5 # Creation of damage foci kfocback 0.03 # Resolution of damage foci kh2axfull 0.1 # Creation of complete damage foci kfocfin 0.03 # Resolution of complete damage foci kox 0.000025 # Rate of oxidisation of Ku kred 0.002 # Rate of reduction of Ku ksen 100 # Activation of senescent state end parameters # molecules begin molecule types Time() T() P() E() IR() D() p53_mRNA() p53(Site1~u~p) MDM2(Site1~u~p) MDM2_mRNA() p21_mRNA() p21(step~1~2~3) p38(Site1~u~p) GADD45() Sink() ATM(state~0~1~2~3~4~5~6~7~8~9~10~11~12~13~14~15~16~17~18~19~20~21~22~23~24~25~26~27~28~29~30~31~32~33~34~35~36~37~38~39~40~41~42~43~44~45~46~47~48~49~50,h2ax) DNA1(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA2(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA3(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA4(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA5(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA6(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA7(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA8(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA9(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA10(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA11(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA12(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA13(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA14(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA15(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA16(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA17(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA18(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA19(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA20(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA21(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA22(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA23(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA24(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA25(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA26(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA27(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA28(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA29(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA30(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA31(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA32(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA33(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA34(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA35(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA36(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA37(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA38(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA39(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA40(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA41(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA42(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA43(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA44(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA45(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA46(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA47(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA48(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA49(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) DNA50(site~ok~sdsb~cdsb,h2ax~u~p~foc) ROS() Ku(dna,cs,cys~red~ox) DNAPKcs(ku,liIV,psite~u~p) LiIII(PARP) LiIV(cs) PARP(dna,liIII) I() Sen(int~1~10~PLUS~MINUS,State~normal~sen) end molecule types # species begin species Time() 0 P() 1 T() 1 E() 1 IR() 0 D() 10 p53_mRNA() 10 p53(Site1~u) 5 MDM2_mRNA() 10 MDM2(Site1~u) 5 p53(Site1!1~u).MDM2(Site1!1~u) 95 p21_mRNA() 1 p21(step~1) 0 p38(Site1~u) 100 $Sink() 0 ATM(state~0,h2ax) 200 DNA1(site~ok,h2ax~u) 1 DNA2(site~ok,h2ax~u) 1 DNA3(site~ok,h2ax~u) 1 DNA4(site~ok,h2ax~u) 1 DNA5(site~ok,h2ax~u) 1 DNA6(site~ok,h2ax~u) 1 DNA7(site~ok,h2ax~u) 1 DNA8(site~ok,h2ax~u) 1 DNA9(site~ok,h2ax~u) 1 DNA10(site~ok,h2ax~u) 1 DNA11(site~ok,h2ax~u) 1 DNA12(site~ok,h2ax~u) 1 DNA13(site~ok,h2ax~u) 1 DNA14(site~ok,h2ax~u) 1 DNA15(site~ok,h2ax~u) 1 DNA16(site~ok,h2ax~u) 1 DNA17(site~ok,h2ax~u) 1 DNA18(site~ok,h2ax~u) 1 DNA19(site~ok,h2ax~u) 1 DNA20(site~ok,h2ax~u) 1 DNA21(site~ok,h2ax~u) 1 DNA22(site~ok,h2ax~u) 1 DNA23(site~ok,h2ax~u) 1 DNA24(site~ok,h2ax~u) 1 DNA25(site~ok,h2ax~u) 1 DNA26(site~ok,h2ax~u) 1 DNA27(site~ok,h2ax~u) 1 DNA28(site~ok,h2ax~u) 1 DNA29(site~ok,h2ax~u) 1 DNA30(site~ok,h2ax~u) 1 DNA31(site~ok,h2ax~u) 1 DNA32(site~ok,h2ax~u) 1 DNA33(site~ok,h2ax~u) 1 DNA34(site~ok,h2ax~u) 1 DNA35(site~ok,h2ax~u) 1 DNA36(site~ok,h2ax~u) 1 DNA37(site~ok,h2ax~u) 1 DNA38(site~ok,h2ax~u) 1 DNA39(site~ok,h2ax~u) 1 DNA40(site~ok,h2ax~u) 1 DNA41(site~ok,h2ax~u) 1 DNA42(site~ok,h2ax~u) 1 DNA43(site~ok,h2ax~u) 1 DNA44(site~ok,h2ax~u) 1 DNA45(site~ok,h2ax~u) 1 DNA46(site~ok,h2ax~u) 1 DNA47(site~ok,h2ax~u) 1 DNA48(site~ok,h2ax~u) 1 DNA49(site~ok,h2ax~u) 1 DNA50(site~ok,h2ax~u) 1 ROS() 0 Ku(dna,cs,cys~red) 450 Ku(dna,cs,cys~ox) 50 DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) 250 LiIII(PARP) 300 LiIV(cs) 300 PARP(dna,liIII) 500 I() 1 Sen(int~1,State~normal) 1 end species # observables begin observables Molecules Time Time() Molecules p53 p53() Molecules p53_Bound p53(Site1!1~u).MDM2(Site1!1~u) Molecules p53_Phos p53(Site1~p) Molecules p53_Unphos p53(Site1~u) Molecules p21 p21(step~3) Molecules p38p p38(Site1~p) Molecules p38u p38(Site1~u) Molecules ROS ROS() Molecules p53_mRNA p53_mRNA() Molecules MDM2_Phos MDM2(Site1~p) Molecules MDM2_Unphos MDM2(Site1~u) Molecules MDM2_mRNA MDM2_mRNA() Molecules p21_mRNA p21_mRNA() Molecules GADD45 GADD45() Molecules ATM0 ATM(state~0) Molecules ATM1 ATM(state~1) Molecules ATM2 ATM(state~2) Molecules ATM3 ATM(state~3) Molecules ATM4 ATM(state~4) Molecules ATM5 ATM(state~5) Molecules ATM6 ATM(state~6) Molecules ATM7 ATM(state~7) Molecules ATM8 ATM(state~8) Molecules ATM9 ATM(state~9) Molecules ATM10 ATM(state~10) Molecules ATM11 ATM(state~11) Molecules ATM12 ATM(state~12) Molecules ATM13 ATM(state~13) Molecules ATM14 ATM(state~14) Molecules ATM15 ATM(state~15) Molecules ATM16 ATM(state~16) Molecules ATM17 ATM(state~17) Molecules ATM18 ATM(state~18) Molecules ATM19 ATM(state~19) Molecules ATM20 ATM(state~20) Molecules ATM21 ATM(state~21) Molecules ATM22 ATM(state~22) Molecules ATM23 ATM(state~23) Molecules ATM24 ATM(state~24) Molecules ATM25 ATM(state~25) Molecules ATM26 ATM(state~26) Molecules ATM27 ATM(state~27) Molecules ATM28 ATM(state~28) Molecules ATM29 ATM(state~29) Molecules ATM30 ATM(state~30) Molecules ATM31 ATM(state~31) Molecules ATM32 ATM(state~32) Molecules ATM33 ATM(state~33) Molecules ATM34 ATM(state~34) Molecules ATM35 ATM(state~35) Molecules ATM36 ATM(state~36) Molecules ATM37 ATM(state~37) Molecules ATM38 ATM(state~38) Molecules ATM39 ATM(state~39) Molecules ATM40 ATM(state~40) Molecules ATM41 ATM(state~41) Molecules ATM42 ATM(state~42) Molecules ATM43 ATM(state~43) Molecules ATM44 ATM(state~44) Molecules ATM45 ATM(state~45) Molecules ATM46 ATM(state~46) Molecules ATM47 ATM(state~47) Molecules ATM48 ATM(state~48) Molecules ATM49 ATM(state~49) Molecules ATM50 ATM(state~50) Molecules Damage_Foci_1 DNA1(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_1 DNA1(h2ax!1~foc).ATM(state~1,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_2 DNA2(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_2 DNA2(h2ax!1~foc).ATM(state~2,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_3 DNA3(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_3 DNA3(h2ax!1~foc).ATM(state~3,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_4 DNA4(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_4 DNA4(h2ax!1~foc).ATM(state~4,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_5 DNA5(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_5 DNA5(h2ax!1~foc).ATM(state~5,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_6 DNA6(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_6 DNA6(h2ax!1~foc).ATM(state~6,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_7 DNA7(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_7 DNA7(h2ax!1~foc).ATM(state~7,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_8 DNA8(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_8 DNA8(h2ax!1~foc).ATM(state~8,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_9 DNA9(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_9 DNA9(h2ax!1~foc).ATM(state~9,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_10 DNA10(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_10 DNA10(h2ax!1~foc).ATM(state~10,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_11 DNA11(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_11 DNA11(h2ax!1~foc).ATM(state~11,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_12 DNA12(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_12 DNA12(h2ax!1~foc).ATM(state~12,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_13 DNA13(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_13 DNA13(h2ax!1~foc).ATM(state~13,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_14 DNA14(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_14 DNA14(h2ax!1~foc).ATM(state~14,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_15 DNA15(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_15 DNA15(h2ax!1~foc).ATM(state~15,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_16 DNA16(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_16 DNA16(h2ax!1~foc).ATM(state~16,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_17 DNA17(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_17 DNA17(h2ax!1~foc).ATM(state~17,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_18 DNA18(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_18 DNA18(h2ax!1~foc).ATM(state~18,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_19 DNA19(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_19 DNA19(h2ax!1~foc).ATM(state~19,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_20 DNA20(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_20 DNA20(h2ax!1~foc).ATM(state~20,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_21 DNA21(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_21 DNA21(h2ax!1~foc).ATM(state~21,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_22 DNA22(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_22 DNA22(h2ax!1~foc).ATM(state~22,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_23 DNA23(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_23 DNA23(h2ax!1~foc).ATM(state~23,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_24 DNA24(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_24 DNA24(h2ax!1~foc).ATM(state~24,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_25 DNA25(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_25 DNA25(h2ax!1~foc).ATM(state~25,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_26 DNA26(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_26 DNA26(h2ax!1~foc).ATM(state~26,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_27 DNA27(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_27 DNA27(h2ax!1~foc).ATM(state~27,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_28 DNA28(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_28 DNA28(h2ax!1~foc).ATM(state~28,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_29 DNA29(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_29 DNA29(h2ax!1~foc).ATM(state~29,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_30 DNA30(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_30 DNA30(h2ax!1~foc).ATM(state~30,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_31 DNA31(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_31 DNA31(h2ax!1~foc).ATM(state~31,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_32 DNA32(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_32 DNA32(h2ax!1~foc).ATM(state~32,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_33 DNA33(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_33 DNA33(h2ax!1~foc).ATM(state~33,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_34 DNA34(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_34 DNA34(h2ax!1~foc).ATM(state~34,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_35 DNA35(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_35 DNA35(h2ax!1~foc).ATM(state~35,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_36 DNA36(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_36 DNA36(h2ax!1~foc).ATM(state~36,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_37 DNA37(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_37 DNA37(h2ax!1~foc).ATM(state~37,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_38 DNA38(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_38 DNA38(h2ax!1~foc).ATM(state~38,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_39 DNA39(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_39 DNA39(h2ax!1~foc).ATM(state~39,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_40 DNA40(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_40 DNA40(h2ax!1~foc).ATM(state~40,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_41 DNA41(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_41 DNA41(h2ax!1~foc).ATM(state~41,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_42 DNA42(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_42 DNA42(h2ax!1~foc).ATM(state~42,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_43 DNA43(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_43 DNA43(h2ax!1~foc).ATM(state~43,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_44 DNA44(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_44 DNA44(h2ax!1~foc).ATM(state~44,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_45 DNA45(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_45 DNA45(h2ax!1~foc).ATM(state~45,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_46 DNA46(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_46 DNA46(h2ax!1~foc).ATM(state~46,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_47 DNA47(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_47 DNA47(h2ax!1~foc).ATM(state~47,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_48 DNA48(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_48 DNA48(h2ax!1~foc).ATM(state~48,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_49 DNA49(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_49 DNA49(h2ax!1~foc).ATM(state~49,h2ax!1) Molecules Damage_Foci_50 DNA50(site!?~?,h2ax~foc) Molecules Complete_Damage_Foci_50 DNA50(h2ax!1~foc).ATM(state~50,h2ax!1) Molecules Ku Ku(dna,cs,cys~?) Molecules PARP PARP(dna,liIII) Molecules Ku_Red Ku(dna,cs,cys~red) Molecules Ku_Ox Ku(dna,cs,cys~ox) Molecules DNA_PKcs DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) Molecules LiIII LiIII(PARP) Molecules LiIV LiIV(cs) Molecules Senescent_Counter Sen(int~?,State~sen) Molecules Sen_Min Sen(int~1,State~?) Molecules Sink Sink() end observables # functions begin functions kku1() = if(Senescent_Counter>0,0.000000034,0.00034) kku2() = if(Senescent_Counter>0,0.000000021,0.00021) kplus() = if(p21>15,0.04,0) kminus() = if(p21<=15&&Sen_Min<1,0.5,0) kKuDown() = if(Senescent_Counter==1,0.01,0) kKustop() = if(Ku<=250,0,1) kParpDown() = if(Senescent_Counter==1,0.01,0) kParpstop() = if(PARP<=5,0,1) #Irrad()= if(Time<180&&Time>174,2000,0) #IRoff()= if(Time>=180,1000,0) #Timeoff()= if(Time>=200,0,1) kDelete()= if(Sink<=5,0,10000) end functions # reaction rules begin reaction rules # Time #T()-> T() + Time() Timeoff() # Irradiation Event #E() -> E() + IR() Irrad() # Irradiation Off #IR() -> Sink() IRoff() #Empty the Sink D() + Sink() -> D() kDelete() DeleteMolecules # p53 mRNA Synthesis P() -> p53_mRNA() + P() kp53mRNAsyn # p53 mRNA degredation p53_mRNA() -> Sink() kp53mRNAdeg # p53 Synthesis p53_mRNA() -> p53_mRNA() + p53(Site1~u) kp53syn # p53 Degradation p53(Site1~u) -> Sink() kp53deg p53(Site1~p) -> Sink() kp53deg p53(Site1!1~u).MDM2(Site1!1~u) -> MDM2(Site1~u) kp53degMDM2dep DeleteMolecules # p53 Phosporylation p53(Site1~u) + ATM(state~1,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~1,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~2,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~2,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~3,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~3,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~4,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~4,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~5,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~5,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~6,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~6,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~7,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~7,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~8,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~8,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~9,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~9,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~10,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~10,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~11,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~11,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~12,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~12,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~13,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~13,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~14,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~14,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~15,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~15,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~16,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~16,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~17,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~17,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~18,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~18,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~19,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~19,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~20,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~20,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~21,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~21,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~22,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~22,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~23,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~23,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~24,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~24,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~25,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~25,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~26,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~26,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~27,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~27,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~28,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~28,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~29,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~29,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~30,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~30,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~31,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~31,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~32,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~32,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~33,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~33,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~34,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~34,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~35,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~35,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~36,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~36,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~37,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~37,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~38,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~38,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~39,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~39,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~40,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~40,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~41,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~41,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~42,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~42,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~43,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~43,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~44,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~44,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~45,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~45,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~46,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~46,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~47,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~47,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~48,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~48,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~49,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~49,h2ax!?) kp53phos p53(Site1~u) + ATM(state~50,h2ax!?) -> p53(Site1~p) + ATM(state~50,h2ax!?) kp53phos # p53 Dehosporylation p53(Site1~p) -> p53(Site1~u) kp53dphos # MDM2 mRNA Synthesis p53(Site1~u) -> MDM2_mRNA() + p53(Site1~u) kMDM2mRNAsyn p53(Site1~p) -> MDM2_mRNA() + p53(Site1~p) kMDM2mRNAsyn # MDM2 mRNA degredation MDM2_mRNA() -> Sink() kMDM2mRNAdeg # MDM2 Synthesis MDM2_mRNA() -> MDM2_mRNA() + MDM2(Site1~u) kMDM2syn # MDM2 Degradation MDM2(Site1~u) -> Sink() kMDM2deg MDM2(Site1~p) -> Sink() kMDM2pdeg # MDM2 Phosporylation MDM2(Site1~u) + ATM(state~1,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~1,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~2,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~2,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~3,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~3,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~4,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~4,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~5,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~5,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~6,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~6,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~7,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~7,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~8,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~8,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~9,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~9,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~10,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~10,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~11,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~11,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~12,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~12,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~13,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~13,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~14,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~14,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~15,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~15,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~16,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~16,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~17,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~17,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~18,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~18,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~19,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~19,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~20,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~20,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~21,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~21,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~22,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~22,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~23,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~23,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~24,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~24,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~25,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~25,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~26,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~26,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~27,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~27,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~28,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~28,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~29,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~29,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~30,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~30,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~31,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~31,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~32,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~32,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~33,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~33,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~34,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~34,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~35,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~35,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~36,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~36,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~37,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~37,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~38,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~38,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~39,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~39,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~40,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~40,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~41,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~41,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~42,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~42,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~43,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~43,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~44,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~44,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~45,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~45,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~46,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~46,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~47,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~47,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~48,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~48,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~49,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~49,h2ax!?) kMDM2phos MDM2(Site1~u) + ATM(state~50,h2ax!?) -> MDM2(Site1~p) + ATM(state~50,h2ax!?) kMDM2phos # MDM2 Dehosporylation MDM2(Site1~p) -> MDM2(Site1~u) kMDM2dphos # p53-MDM2 Binding and Disociation p53(Site1~u) + MDM2(Site1~u) -> p53(Site1!1~u).MDM2(Site1!1~u) kp53MDM2bind p53(Site1!1~u).MDM2(Site1!1~u) -> p53(Site1~u) + MDM2(Site1~u) kp53MDM2dis # p21 mRNA Synthesis p53(Site1~u) -> p21_mRNA() + p53(Site1~u) kp21mRNAsyn p53(Site1~p) -> p21_mRNA() + p53(Site1~p) kp21mRNAsynp # p21 mRNA degredation p21_mRNA() -> Sink() kp21mRNAdeg # p21 Synthesis p21_mRNA() -> p21(step~1) + p21_mRNA() kp21synstep1 p21(step~1) -> p21(step~2) kp21synstep2 p21(step~2) -> p21(step~3) kp21synstep3 # p21 Degradation p21(step~3) -> Sink() kp21deg # GADD45 Activation p21(step~3) -> p21(step~3) + GADD45() kGADD45act # GADD45 Degradation GADD45() -> Sink() kGADD45deg # p38 Phosphorylation p38(Site1~u) + GADD45() -> p38(Site1~p) + GADD45() kp38phos # p38 Dephosphorylation p38(Site1~p) -> p38(Site1~u) kp38dphos # p38 ROS Generation p38(Site1~p) -> ROS() + p38(Site1~p) kROSgen #*kpROSp38 # NHEJ Strts here # Ku binding # simple DNA1(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA2(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA3(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA4(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA5(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA6(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA7(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA8(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA9(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA10(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA11(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA12(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA13(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA14(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA15(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA16(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA17(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA18(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA19(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA20(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA21(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA22(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA23(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA24(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA25(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA26(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA27(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA28(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA29(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA30(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA31(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA32(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA33(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA34(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA35(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA36(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA37(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA38(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA39(site~sdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) kku1() DNA40(site~sdsb) + 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DNA4(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA5(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA6(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA7(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA8(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA9(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA10(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA11(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA12(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA13(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA14(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA15(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA16(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA17(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA17(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() 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DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA46(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA47(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA48(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA49(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() DNA50(site~cdsb) + Ku(dna,cs) -> DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) kku2() # Ku dissociating # simple DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA1(site~sdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku1 DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA2(site~sdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku1 DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA3(site~sdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku1 DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA4(site~sdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku1 DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA5(site~sdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku1 DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA6(site~sdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku1 DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA7(site~sdsb) + 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DNA37(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA38(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA39(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA40(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA41(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA42(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA43(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA44(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA45(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA46(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA47(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA48(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA49(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs,cys~red) -> DNA50(site~cdsb) + Ku(dna,cs,cys~red) kdku2 # DNAPKcs complex # simple DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA42(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA42(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA43(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA43(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA44(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA44(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA45(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA45(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA46(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA46(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA47(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA47(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA48(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA48(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk1 # complex DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 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DNA24(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) -> DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) kdnapk2 # dissociation #simple DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA1(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA2(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA3(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA4(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA5(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA6(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA7(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA8(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA9(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA10(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA11(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA12(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA13(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA14(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA15(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA16(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA17(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA18(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA19(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA20(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA21(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA22(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA23(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA24(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA25(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA26(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA27(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA28(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA29(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA30(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA31(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA32(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA33(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA34(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA35(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA36(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA37(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA38(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA39(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA40(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA41(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA42(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA42(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA43(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA43(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA44(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA44(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA45(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA45(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA46(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA46(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA47(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA47(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA48(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA48(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA49(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA50(site~sdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk1 #complex DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA1(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA2(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA3(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA4(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA5(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA6(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA7(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA8(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA9(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA10(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA11(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA12(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA13(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA14(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA15(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA16(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA17(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA17(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA18(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA18(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA19(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA19(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA20(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA20(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA21(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA21(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA22(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA22(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA23(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA23(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA24(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA24(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA25(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA26(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA27(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA28(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA29(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA30(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA31(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA32(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA33(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA34(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA35(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA36(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA37(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA38(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA39(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA40(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA41(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA42(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA43(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA44(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA45(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA46(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA47(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA48(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA49(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~?) -> DNA50(site~cdsb) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) kddnapk2 # DNAPKcs phosphorylation # simple DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA42(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA42(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA43(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA43(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA44(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA44(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA45(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA45(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA46(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA46(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA47(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA47(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA48(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA48(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos1 # complex DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA17(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA17(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA18(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA18(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA19(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA19(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA20(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA20(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA21(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA21(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA22(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA22(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA23(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA23(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA24(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA24(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~u) -> DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kdnapkphos2 # Ligase IV complex formation #simple DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA16(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA17(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA18(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA19(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA20(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA21(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA22(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA23(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA24(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA25(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA26(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA27(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA28(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA29(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA30(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA31(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA32(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA33(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA34(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA35(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA36(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA37(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA38(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA39(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA40(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA41(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA42(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> 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DNA48(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA49(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA50(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV1 #complex DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA1(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA2(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA3(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA4(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA5(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA6(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA7(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA8(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA9(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA10(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA11(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA12(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA13(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA14(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA15(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA16(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA17(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA17(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA18(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA18(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA19(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA19(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA20(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA20(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA21(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA21(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA22(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA22(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA23(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA23(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA24(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA24(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA25(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA26(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA27(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA28(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA29(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA30(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA31(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA44(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA45(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA46(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA47(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA48(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA49(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) -> DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) kliIV2 # LiIV dissociation #simple DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA1(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA2(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA3(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA4(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA5(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA6(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA7(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA8(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA9(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA10(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA11(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA12(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA13(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA14(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA15(site!1~sdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV1 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DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA32(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA33(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA34(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA35(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA36(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA37(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA38(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA39(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA40(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA41(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA42(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA43(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 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DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3) -> DNA50(site!1~cdsb).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) + LiIV(cs) kdliIV2 # repair #simple DNA1(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA1(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA2(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA2(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA3(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA3(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA4(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA4(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA5(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA5(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA6(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA6(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA7(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA7(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA8(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA8(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA9(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA9(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA10(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA10(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA11(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA11(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA12(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA12(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA13(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA13(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA14(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA14(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA15(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA15(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA16(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA16(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA17(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA17(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA18(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA18(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA19(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA19(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA20(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA20(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA21(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA21(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA22(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA22(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA23(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA23(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA24(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA24(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA25(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA25(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA26(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA26(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA27(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA27(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA28(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA28(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA29(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA29(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA30(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA30(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA31(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA31(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA32(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA32(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA33(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA33(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA34(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA34(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 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DNA40(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA40(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA41(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA41(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA42(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA42(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA43(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA43(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 DNA44(site!1~sdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA44(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV1 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DNA25(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA25(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA26(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA26(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA27(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA27(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA28(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA28(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA29(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA29(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 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DNA45(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA45(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA46(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA46(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA47(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA47(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA48(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA48(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA49(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA49(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 DNA50(site!1~cdsb,h2ax!4~foc).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV!3,psite~p).LiIV(cs!3).ATM(h2ax!4) -> DNA50(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + Ku(dna,cs) + DNAPKcs(ku,liIV,psite~u) + LiIV(cs) kfixIV2 # PARP binding # simple DNA1(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA1(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA2(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA2(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA3(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA3(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA4(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA4(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA5(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA5(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA6(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA6(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA7(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA7(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA8(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA8(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA9(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA9(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA10(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA10(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA11(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA11(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA12(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA12(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA13(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA13(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA14(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA14(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA15(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA15(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA16(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA16(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA17(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA17(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA18(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA18(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA19(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA19(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA20(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA20(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA21(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA21(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA22(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA22(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA23(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA23(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA24(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA24(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA25(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA25(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA26(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA26(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA27(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA27(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA28(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA28(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA29(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA29(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA30(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA30(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA31(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA31(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA32(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA32(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA33(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA33(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA34(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA34(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA35(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA35(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA36(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA36(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA37(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA37(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA38(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA38(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA39(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA39(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA40(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA40(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA41(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA41(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA42(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA42(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA43(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA43(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA44(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA44(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA45(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA45(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA46(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA46(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA47(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA47(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA48(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA48(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA49(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA49(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 DNA50(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA50(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP1 # complex DNA1(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA1(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA2(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA2(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA3(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA3(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA4(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA4(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA5(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA5(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA6(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA6(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA7(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA7(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA8(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA8(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA9(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA9(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA10(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA10(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA11(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA11(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA12(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA12(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA13(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA13(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA14(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA14(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA15(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA15(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA16(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA16(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA17(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA17(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA18(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA18(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA19(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA19(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA20(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA20(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA21(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA21(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA22(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA22(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA23(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA23(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA24(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA24(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA25(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA25(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA26(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA26(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA27(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA27(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA28(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA28(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA29(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA29(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA30(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA30(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA31(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA31(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA32(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA32(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA33(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA33(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA34(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA34(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA35(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA35(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA36(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA36(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA37(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA37(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA38(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA38(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA39(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA39(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA40(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA40(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA41(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA41(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA42(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA42(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA43(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA43(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA44(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA44(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA45(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA45(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA46(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA46(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA47(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA47(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA48(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA48(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA49(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA49(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 DNA50(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) -> DNA50(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) kPARP2 # PARP dissociating # simple DNA1(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA1(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA2(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA2(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA3(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA3(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA4(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA4(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA5(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA5(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA6(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA6(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA7(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA7(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA8(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA8(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA9(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA9(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA10(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA10(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA11(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA11(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA12(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA12(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA13(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA13(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA14(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA14(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA15(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA15(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA16(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA16(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA17(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA17(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA18(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA18(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA19(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA19(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA20(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA20(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA21(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA21(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA22(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA22(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA23(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA23(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA24(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA24(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA25(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA25(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA26(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA26(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA27(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA27(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA28(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA28(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA29(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA29(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 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DNA42(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA42(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA43(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA43(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA44(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA44(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA45(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA45(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA46(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA46(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA47(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA47(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA48(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA48(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA49(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA49(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 DNA50(site!1~sdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA50(site~sdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP1 # complex DNA1(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA1(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP2 DNA2(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA2(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP2 DNA3(site!1~cdsb).PARP(dna!1,liIII) -> DNA3(site~cdsb) + PARP(dna,liIII) kdPARP2 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DNA8(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA8(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 DNA9(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA9(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 DNA10(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA10(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 DNA11(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA11(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 DNA12(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA12(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 DNA13(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA13(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 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DNA50(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA50(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII2 # inaccurate repairsimple DNA1(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA1(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA2(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA2(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA3(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA3(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA4(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA4(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA5(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA5(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA6(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA6(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA7(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA7(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA8(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA8(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA9(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA9(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA10(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA10(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA11(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA11(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 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DNA18(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA18(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA19(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA19(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA20(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA20(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA21(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA21(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA22(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA22(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA23(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA23(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA24(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA24(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA25(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA25(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA26(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA26(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA27(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA27(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA28(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA28(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA29(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA29(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA30(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA30(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA31(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA31(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA32(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA32(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA33(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA33(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA34(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA34(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA35(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA35(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA36(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA36(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA37(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA37(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA38(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA38(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA39(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA39(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA40(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA40(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA41(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA41(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 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DNA48(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA48(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA49(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA49(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 DNA50(site!1~sdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA50(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII3 # inaccurate repair complex DNA1(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA1(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA2(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA2(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA3(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA3(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA4(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA4(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA5(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA5(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA6(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA6(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA7(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA7(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA8(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA8(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA9(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA9(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA10(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA10(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA11(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA11(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA12(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA12(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA13(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA13(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA14(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA14(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA15(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA15(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA16(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA16(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA17(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA17(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA18(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA18(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA19(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA19(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA20(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA20(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA21(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA21(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA22(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA22(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA23(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA23(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA24(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA24(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA25(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA25(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA26(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA26(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA27(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA27(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA28(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA28(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA29(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA29(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA30(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA30(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA31(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA31(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA32(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA32(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA33(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA33(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA34(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA34(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA35(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA35(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA36(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA36(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA37(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA37(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA38(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA38(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA39(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA39(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA40(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA40(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA41(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA41(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA42(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA42(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA43(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA43(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA44(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA44(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA45(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA45(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA46(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA46(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA47(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA47(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA48(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA48(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA49(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA49(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 DNA50(site!1~cdsb,h2ax!3~foc).PARP(dna!1,liIII!2).LiIII(PARP!2).ATM(h2ax!3) -> DNA50(site~ok,h2ax!1~foc).ATM(h2ax!1) + PARP(dna,liIII) + LiIII(PARP) kfixIII4 # ATM Activation DNA1(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA1(site!?~sdsb) + ATM(state~1,h2ax) kATMact DNA2(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA2(site!?~sdsb) + ATM(state~2,h2ax) kATMact DNA3(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA3(site!?~sdsb) + ATM(state~3,h2ax) kATMact DNA4(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA4(site!?~sdsb) + ATM(state~4,h2ax) kATMact DNA5(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA5(site!?~sdsb) + ATM(state~5,h2ax) kATMact DNA6(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA6(site!?~sdsb) + ATM(state~6,h2ax) kATMact DNA7(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA7(site!?~sdsb) + ATM(state~7,h2ax) kATMact DNA8(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA8(site!?~sdsb) + ATM(state~8,h2ax) kATMact DNA9(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA9(site!?~sdsb) + ATM(state~9,h2ax) kATMact DNA10(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA10(site!?~sdsb) + ATM(state~10,h2ax) kATMact DNA11(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA11(site!?~sdsb) + ATM(state~11,h2ax) kATMact DNA12(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA12(site!?~sdsb) + ATM(state~12,h2ax) kATMact DNA13(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA13(site!?~sdsb) + ATM(state~13,h2ax) kATMact DNA14(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA14(site!?~sdsb) + ATM(state~14,h2ax) kATMact DNA15(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA15(site!?~sdsb) + ATM(state~15,h2ax) kATMact DNA16(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA16(site!?~sdsb) + ATM(state~16,h2ax) kATMact DNA17(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA17(site!?~sdsb) + ATM(state~17,h2ax) kATMact DNA18(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA18(site!?~sdsb) + ATM(state~18,h2ax) kATMact DNA19(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA19(site!?~sdsb) + ATM(state~19,h2ax) kATMact DNA20(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA20(site!?~sdsb) + ATM(state~20,h2ax) kATMact DNA21(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA21(site!?~sdsb) + ATM(state~21,h2ax) kATMact DNA22(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA22(site!?~sdsb) + ATM(state~22,h2ax) kATMact DNA23(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA23(site!?~sdsb) + ATM(state~23,h2ax) kATMact DNA24(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA24(site!?~sdsb) + ATM(state~24,h2ax) kATMact DNA25(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA25(site!?~sdsb) + ATM(state~25,h2ax) kATMact DNA26(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA26(site!?~sdsb) + ATM(state~26,h2ax) kATMact DNA27(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA27(site!?~sdsb) + ATM(state~27,h2ax) kATMact DNA28(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA28(site!?~sdsb) + ATM(state~28,h2ax) kATMact DNA29(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA29(site!?~sdsb) + ATM(state~29,h2ax) kATMact DNA30(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA30(site!?~sdsb) + ATM(state~30,h2ax) kATMact DNA31(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA31(site!?~sdsb) + ATM(state~31,h2ax) kATMact DNA32(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA32(site!?~sdsb) + ATM(state~32,h2ax) kATMact DNA33(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA33(site!?~sdsb) + ATM(state~33,h2ax) kATMact DNA34(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA34(site!?~sdsb) + ATM(state~34,h2ax) kATMact DNA35(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA35(site!?~sdsb) + ATM(state~35,h2ax) kATMact DNA36(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA36(site!?~sdsb) + ATM(state~36,h2ax) kATMact DNA37(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA37(site!?~sdsb) + ATM(state~37,h2ax) kATMact DNA38(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA38(site!?~sdsb) + ATM(state~38,h2ax) kATMact DNA39(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA39(site!?~sdsb) + ATM(state~39,h2ax) kATMact DNA40(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA40(site!?~sdsb) + ATM(state~40,h2ax) kATMact DNA41(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA41(site!?~sdsb) + ATM(state~41,h2ax) kATMact DNA42(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA42(site!?~sdsb) + ATM(state~42,h2ax) kATMact DNA43(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA43(site!?~sdsb) + ATM(state~43,h2ax) kATMact DNA44(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA44(site!?~sdsb) + ATM(state~44,h2ax) kATMact DNA45(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA45(site!?~sdsb) + ATM(state~45,h2ax) kATMact DNA46(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA46(site!?~sdsb) + ATM(state~46,h2ax) kATMact DNA47(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA47(site!?~sdsb) + ATM(state~47,h2ax) kATMact DNA48(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA48(site!?~sdsb) + ATM(state~48,h2ax) kATMact DNA49(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA49(site!?~sdsb) + ATM(state~49,h2ax) kATMact DNA50(site!?~sdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA50(site!?~sdsb) + ATM(state~50,h2ax) kATMact DNA1(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA1(site!?~cdsb) + ATM(state~1,h2ax) kATMact DNA2(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA2(site!?~cdsb) + ATM(state~2,h2ax) kATMact DNA3(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA3(site!?~cdsb) + ATM(state~3,h2ax) kATMact DNA4(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA4(site!?~cdsb) + ATM(state~4,h2ax) kATMact DNA5(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA5(site!?~cdsb) + ATM(state~5,h2ax) kATMact DNA6(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA6(site!?~cdsb) + ATM(state~6,h2ax) kATMact DNA7(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA7(site!?~cdsb) + ATM(state~7,h2ax) kATMact DNA8(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA8(site!?~cdsb) + ATM(state~8,h2ax) kATMact DNA9(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA9(site!?~cdsb) + ATM(state~9,h2ax) kATMact DNA10(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA10(site!?~cdsb) + ATM(state~10,h2ax) kATMact DNA11(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA11(site!?~cdsb) + ATM(state~12,h2ax) kATMact DNA12(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA12(site!?~cdsb) + ATM(state~13,h2ax) kATMact DNA13(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA13(site!?~cdsb) + ATM(state~13,h2ax) kATMact DNA14(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA14(site!?~cdsb) + ATM(state~14,h2ax) kATMact DNA15(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA15(site!?~cdsb) + ATM(state~15,h2ax) kATMact DNA16(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA16(site!?~cdsb) + ATM(state~16,h2ax) kATMact DNA17(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA17(site!?~cdsb) + ATM(state~17,h2ax) kATMact DNA18(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA18(site!?~cdsb) + ATM(state~18,h2ax) kATMact DNA19(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA19(site!?~cdsb) + ATM(state~19,h2ax) kATMact DNA20(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA20(site!?~cdsb) + ATM(state~20,h2ax) kATMact DNA21(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA21(site!?~cdsb) + ATM(state~21,h2ax) kATMact DNA22(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA22(site!?~cdsb) + ATM(state~22,h2ax) kATMact DNA23(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA23(site!?~cdsb) + ATM(state~23,h2ax) kATMact DNA24(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA24(site!?~cdsb) + ATM(state~24,h2ax) kATMact DNA25(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA25(site!?~cdsb) + ATM(state~25,h2ax) kATMact DNA26(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA26(site!?~cdsb) + ATM(state~26,h2ax) kATMact DNA27(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA27(site!?~cdsb) + ATM(state~27,h2ax) kATMact DNA28(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA28(site!?~cdsb) + ATM(state~28,h2ax) kATMact DNA29(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA29(site!?~cdsb) + ATM(state~29,h2ax) kATMact DNA30(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA30(site!?~cdsb) + ATM(state~30,h2ax) kATMact DNA31(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA31(site!?~cdsb) + ATM(state~31,h2ax) kATMact DNA32(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA32(site!?~cdsb) + ATM(state~32,h2ax) kATMact DNA33(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA33(site!?~cdsb) + ATM(state~33,h2ax) kATMact DNA34(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA34(site!?~cdsb) + ATM(state~34,h2ax) kATMact DNA35(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA35(site!?~cdsb) + ATM(state~35,h2ax) kATMact DNA36(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA36(site!?~cdsb) + ATM(state~36,h2ax) kATMact DNA37(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA37(site!?~cdsb) + ATM(state~37,h2ax) kATMact DNA38(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA38(site!?~cdsb) + ATM(state~38,h2ax) kATMact DNA39(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA39(site!?~cdsb) + ATM(state~39,h2ax) kATMact DNA40(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA40(site!?~cdsb) + ATM(state~40,h2ax) kATMact DNA41(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA41(site!?~cdsb) + ATM(state~41,h2ax) kATMact DNA42(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA42(site!?~cdsb) + ATM(state~42,h2ax) kATMact DNA43(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA43(site!?~cdsb) + ATM(state~43,h2ax) kATMact DNA44(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA44(site!?~cdsb) + ATM(state~44,h2ax) kATMact DNA45(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA45(site!?~cdsb) + ATM(state~45,h2ax) kATMact DNA46(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA46(site!?~cdsb) + ATM(state~46,h2ax) kATMact DNA47(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA47(site!?~cdsb) + ATM(state~47,h2ax) kATMact DNA48(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA48(site!?~cdsb) + ATM(state~48,h2ax) kATMact DNA49(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA49(site!?~cdsb) + ATM(state~49,h2ax) kATMact DNA50(site!?~cdsb) + ATM(state~0,h2ax) -> DNA50(site!?~cdsb) + ATM(state~50,h2ax) kATMact # ATM Inactivation ATM(state~1,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~2,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~3,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~4,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~5,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~6,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~7,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~8,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~9,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~10,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~11,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~12,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~13,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~14,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~15,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~16,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~17,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~18,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~19,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~20,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~21,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~22,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~23,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~24,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~25,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~26,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~27,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~28,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~29,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~30,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~31,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~32,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~33,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~34,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~35,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~36,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~37,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~38,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~39,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~40,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~41,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~42,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~43,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~44,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~45,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~46,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~47,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~48,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~49,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact ATM(state~50,h2ax) -> ATM(state~0,h2ax) kATMinact # histone2ax # histone phosphorylation # simple DNA1(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~1,h2ax) -> DNA1(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~1,h2ax) kh2axp1 DNA2(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~2,h2ax) -> DNA2(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~2,h2ax) kh2axp1 DNA3(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~3,h2ax) -> DNA3(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~3,h2ax) kh2axp1 DNA4(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~4,h2ax) -> DNA4(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~4,h2ax) kh2axp1 DNA5(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~5,h2ax) -> DNA5(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~5,h2ax) kh2axp1 DNA6(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~6,h2ax) -> DNA6(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~6,h2ax) kh2axp1 DNA7(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~7,h2ax) -> DNA7(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~7,h2ax) kh2axp1 DNA8(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~8,h2ax) -> DNA8(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~8,h2ax) kh2axp1 DNA9(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~9,h2ax) -> DNA9(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~9,h2ax) kh2axp1 DNA10(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~10,h2ax) -> DNA10(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~10,h2ax) kh2axp1 DNA11(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~11,h2ax) -> DNA11(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~11,h2ax) kh2axp1 DNA12(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~12,h2ax) -> DNA12(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~12,h2ax) kh2axp1 DNA13(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~13,h2ax) -> DNA13(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~13,h2ax) kh2axp1 DNA14(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~14,h2ax) -> DNA14(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~14,h2ax) kh2axp1 DNA15(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~15,h2ax) -> DNA15(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~15,h2ax) kh2axp1 DNA16(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~16,h2ax) -> DNA16(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~16,h2ax) kh2axp1 DNA17(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~17,h2ax) -> DNA17(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~17,h2ax) kh2axp1 DNA18(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~18,h2ax) -> DNA18(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~18,h2ax) kh2axp1 DNA19(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~19,h2ax) -> DNA19(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~19,h2ax) kh2axp1 DNA20(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~20,h2ax) -> DNA20(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~20,h2ax) kh2axp1 DNA21(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~21,h2ax) -> DNA21(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~21,h2ax) kh2axp1 DNA22(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~22,h2ax) -> DNA22(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~22,h2ax) kh2axp1 DNA23(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~23,h2ax) -> DNA23(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~23,h2ax) kh2axp1 DNA24(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~24,h2ax) -> DNA24(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~24,h2ax) kh2axp1 DNA25(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~25,h2ax) -> DNA25(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~25,h2ax) kh2axp1 DNA26(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~26,h2ax) -> DNA26(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~26,h2ax) kh2axp1 DNA27(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~27,h2ax) -> DNA27(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~27,h2ax) kh2axp1 DNA28(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~28,h2ax) -> DNA28(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~28,h2ax) kh2axp1 DNA29(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~29,h2ax) -> DNA29(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~29,h2ax) kh2axp1 DNA30(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~30,h2ax) -> DNA30(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~30,h2ax) kh2axp1 DNA31(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~31,h2ax) -> DNA31(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~31,h2ax) kh2axp1 DNA32(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~32,h2ax) -> DNA32(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~32,h2ax) kh2axp1 DNA33(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~33,h2ax) -> DNA33(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~33,h2ax) kh2axp1 DNA34(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~34,h2ax) -> DNA34(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~34,h2ax) kh2axp1 DNA35(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~35,h2ax) -> DNA35(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~35,h2ax) kh2axp1 DNA36(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~36,h2ax) -> DNA36(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~36,h2ax) kh2axp1 DNA37(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~37,h2ax) -> DNA37(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~37,h2ax) kh2axp1 DNA38(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~38,h2ax) -> DNA38(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~38,h2ax) kh2axp1 DNA39(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~39,h2ax) -> DNA39(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~39,h2ax) kh2axp1 DNA40(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~40,h2ax) -> DNA40(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~40,h2ax) kh2axp1 DNA41(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~41,h2ax) -> DNA41(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~41,h2ax) kh2axp1 DNA42(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~42,h2ax) -> DNA42(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~42,h2ax) kh2axp1 DNA43(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~43,h2ax) -> DNA43(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~43,h2ax) kh2axp1 DNA44(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~44,h2ax) -> DNA44(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~44,h2ax) kh2axp1 DNA45(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~45,h2ax) -> DNA45(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~45,h2ax) kh2axp1 DNA46(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~46,h2ax) -> DNA46(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~46,h2ax) kh2axp1 DNA47(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~47,h2ax) -> DNA47(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~47,h2ax) kh2axp1 DNA48(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~48,h2ax) -> DNA48(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~48,h2ax) kh2axp1 DNA49(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~49,h2ax) -> DNA49(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~49,h2ax) kh2axp1 DNA50(site!?~sdsb,h2ax~u) + ATM(state~50,h2ax) -> DNA50(site!?~sdsb,h2ax~p) + ATM(state~50,h2ax) kh2axp1 # complex DNA1(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~1,h2ax) -> DNA1(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~1,h2ax) kh2axp1 DNA2(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~2,h2ax) -> DNA2(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~2,h2ax) kh2axp1 DNA3(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~3,h2ax) -> DNA3(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~3,h2ax) kh2axp1 DNA4(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~4,h2ax) -> DNA4(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~4,h2ax) kh2axp1 DNA5(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~5,h2ax) -> DNA5(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~5,h2ax) kh2axp1 DNA6(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~6,h2ax) -> DNA6(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~6,h2ax) kh2axp1 DNA7(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~7,h2ax) -> DNA7(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~7,h2ax) kh2axp1 DNA8(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~8,h2ax) -> DNA8(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~8,h2ax) kh2axp1 DNA9(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~9,h2ax) -> DNA9(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~9,h2ax) kh2axp1 DNA10(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~10,h2ax) -> DNA10(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~10,h2ax) kh2axp1 DNA11(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~11,h2ax) -> DNA11(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~11,h2ax) kh2axp1 DNA12(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~12,h2ax) -> DNA12(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~12,h2ax) kh2axp1 DNA13(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~13,h2ax) -> DNA13(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~13,h2ax) kh2axp1 DNA14(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~14,h2ax) -> DNA14(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~14,h2ax) kh2axp1 DNA15(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~15,h2ax) -> DNA15(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~15,h2ax) kh2axp1 DNA16(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~16,h2ax) -> DNA16(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~16,h2ax) kh2axp1 DNA17(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~17,h2ax) -> DNA17(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~17,h2ax) kh2axp1 DNA18(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~18,h2ax) -> DNA18(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~18,h2ax) kh2axp1 DNA19(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~19,h2ax) -> DNA19(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~19,h2ax) kh2axp1 DNA20(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~20,h2ax) -> DNA20(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~20,h2ax) kh2axp1 DNA21(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~21,h2ax) -> DNA21(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~21,h2ax) kh2axp1 DNA22(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~22,h2ax) -> DNA22(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~22,h2ax) kh2axp1 DNA23(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~23,h2ax) -> DNA23(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~23,h2ax) kh2axp1 DNA24(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~24,h2ax) -> DNA24(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~24,h2ax) kh2axp1 DNA25(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~25,h2ax) -> DNA25(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~25,h2ax) kh2axp1 DNA26(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~26,h2ax) -> DNA26(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~26,h2ax) kh2axp1 DNA27(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~27,h2ax) -> DNA27(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~27,h2ax) kh2axp1 DNA28(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~28,h2ax) -> DNA28(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~28,h2ax) kh2axp1 DNA29(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~29,h2ax) -> DNA29(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~29,h2ax) kh2axp1 DNA30(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~30,h2ax) -> DNA30(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~30,h2ax) kh2axp1 DNA31(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~31,h2ax) -> DNA31(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~31,h2ax) kh2axp1 DNA32(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~32,h2ax) -> DNA32(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~32,h2ax) kh2axp1 DNA33(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~33,h2ax) -> DNA33(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~33,h2ax) kh2axp1 DNA34(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~34,h2ax) -> DNA34(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~34,h2ax) kh2axp1 DNA35(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~35,h2ax) -> DNA35(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~35,h2ax) kh2axp1 DNA36(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~36,h2ax) -> DNA36(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~36,h2ax) kh2axp1 DNA37(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~37,h2ax) -> DNA37(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~37,h2ax) kh2axp1 DNA38(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~38,h2ax) -> DNA38(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~38,h2ax) kh2axp1 DNA39(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~39,h2ax) -> DNA39(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~39,h2ax) kh2axp1 DNA40(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~40,h2ax) -> DNA40(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~40,h2ax) kh2axp1 DNA41(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~41,h2ax) -> DNA41(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~41,h2ax) kh2axp1 DNA42(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~42,h2ax) -> DNA42(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~42,h2ax) kh2axp1 DNA43(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~43,h2ax) -> DNA43(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~43,h2ax) kh2axp1 DNA44(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~44,h2ax) -> DNA44(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~44,h2ax) kh2axp1 DNA45(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~45,h2ax) -> DNA45(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~45,h2ax) kh2axp1 DNA46(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~46,h2ax) -> DNA46(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~46,h2ax) kh2axp1 DNA47(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~47,h2ax) -> DNA47(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~47,h2ax) kh2axp1 DNA48(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~48,h2ax) -> DNA48(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~48,h2ax) kh2axp1 DNA49(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~49,h2ax) -> DNA49(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~49,h2ax) kh2axp1 DNA50(site!?~cdsb,h2ax~u) + ATM(state~50,h2ax) -> DNA50(site!?~cdsb,h2ax~p) + ATM(state~50,h2ax) kh2axp1 #DNA-PKcs Phos DNA1(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA1(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA2(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA2(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA3(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA3(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA4(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA4(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA5(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA5(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA6(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA6(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA7(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA7(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA8(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA8(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA9(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA9(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA10(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA10(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA11(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA11(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA12(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA12(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA13(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA13(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA14(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA14(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA15(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA15(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA16(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA16(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA17(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA17(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA18(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA18(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA19(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA19(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA20(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA20(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA21(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA21(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA22(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA22(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA23(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA23(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA24(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA24(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA25(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA25(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA26(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA26(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA27(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA27(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA28(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA28(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA29(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA29(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA30(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA30(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA31(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA31(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA32(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA32(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA33(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA33(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA34(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA34(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA35(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA35(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA36(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA36(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA37(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA37(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA38(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA38(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA39(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA39(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA40(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA40(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA41(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA41(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA42(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA42(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA43(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA43(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA44(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA44(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA45(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA45(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA46(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA46(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA47(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA47(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA48(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA48(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA49(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA49(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA50(site!1~sdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA50(site!1~sdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA1(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA1(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA2(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA2(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA3(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA3(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA4(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA4(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA5(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA5(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA6(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA6(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA7(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA7(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA8(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA8(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA9(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA9(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA10(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA10(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA11(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA11(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA12(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA12(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA13(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA13(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA14(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA14(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA15(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA15(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA16(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA16(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA17(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA17(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA18(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA18(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA19(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA19(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA20(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA20(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA21(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA21(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA22(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA22(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA23(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA23(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA24(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA24(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA25(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA25(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA26(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA26(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA27(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA27(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA28(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA28(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA29(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> 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DNA36(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA36(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA37(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA37(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA38(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA38(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA39(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA39(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA40(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA40(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA41(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> DNA41(site!1~cdsb,h2ax~p).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) kh2axp2 DNA42(site!1~cdsb,h2ax~u).Ku(dna!1,cs!2).DNAPKcs(ku!2,liIV,psite~p) -> 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Sen(int~?,State~normal) -> Sen(int~MINUS,State~normal) kminus() Sen(int~10,State~normal) -> Sen(int~10,State~sen) ksen Ku(dna,cs,cys~?) -> Sink() kKuDown() * kKustop() PARP(dna,liIII) -> Sink() kParpDown() * kParpstop() end reaction rules # actions # generate_network({overwrite=>1}); # simulate_ode({t_end=>5460,n_steps=>10,sparse=>1}); simulate_nf({suffix=>nf_run1,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); simulate_nf({suffix=>nf_run2,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); simulate_nf({suffix=>nf_run3,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); simulate_nf({suffix=>nf_run4,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); simulate_nf({suffix=>nf_run5,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); simulate_nf({suffix=>nf_run6,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); simulate_nf({suffix=>nf_run7,t_end=>2400,n_steps=>2400,param=> "-v -gml 1000000000"}); 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