The file contains SNP genotypes of mapping parents. The SNP IDs are: 1858342 1858561 1965093 2020439 2300280 2302908 2340831 2376099 2386326 2386765 2397641 2397898 2423820 2777591 3208349 3230375 3267388 3304230 3453153 3457314 3460451 3484220 3588294 3604981 3605009 3605225 3682224 3687892 3712198 3734203 3741049 3753542 3753894 3755454 3755455 3755490 3755491 3756720 3757075 3757155 3778719 3801166 3811868 3831920 3859563 4083913 4090027 4188262 4248358 4254803 4264476 4266129 4287965 4288035 4288106 4288312 4289225 4289405 4293189 4293285 4295148 4295389 4313673 4316079 4332549 4332708 4334267 4334790 4334844 4367831 4378582 4401904 4402382 4405618 4420303 4423489 4424449 4425630 4427009 4428058 4491377 4492195 4502882 4507994 4508760 4513099 4513297 4529064 4531649 4541240 4547132 4548193 4556007 4559793 4569504 4569838 4570861 4574707 4582115 4585261 4587193 4601037 4612444 4668064 4668463 4720819 4726086 4730933 4737151 4768217 4772946 4822761 4839419 4876229 4901776 4913271 4993751 4995198 4998371 5039457 5121259 5215536 5273948 5336221 5450593 5499672 5501185 5501401 5501524 5501780 5502262 5504497 5530407 5533344 5604193 5605285 5656516 5665423 5749550 5751149 5843278 6027228 6034772 6036346 6057485 6057880 6058828 6068704 6074004 6074948 6075927 6077667 6092254 6093488 6097218 6100375 6104355 6110645 6111231 6119410 6130018 6136366 6159620 6163983 6219066 6240083 6242129 6245886 6262673 Here comes the phased genotypes (in same order as the SNP IDs). for each animal there are two haplotypes for each haplotype this information is given: id, then allele at IPN QTL (R = high-resistance, A = low-resistance), then 3-microsatellite haplotype, then SNP alleles (on next line) >006_1 R 238_168_242 ATGCGAAGGCTAGCGCATGCAACDTTCCGGAGGTTTTGGCACCACCATTGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCACGTTGTAAIATTGACCTATIACTTCTACATTDAGTAGGAAAAACAACCTGGTTACAAACGATGCAD >006_2 A 226_174_273 GTACAATGGTCCGCGCTTCCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCACCATTATTGTTAICCTICGGTTAICACICTATTTGCAITCACGATCTTTTTCACAACCCCTACGTGTTAAITCCTGATTACDACTACTACATTITGATGGAACCGTGATTGGGTTGCAGCCGACGCAD >010_1 A 230_176_211 ATGTGTAAATCCGCGCACGCGTCDTTCCTGAGGTTGGGAACCCATCAATGTTAICCTITACTTTICCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACCCCTACGTGTGAAITCCTAACAGTDACTTCTAAATTITCAAGGCACAACAACCTGGTTACAGCCGATACAI >010_2 R 230_168_230 GCACAATGGCTAGCGCACGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >011_1 A 230_176_211 ATGTGTAAATCCACGCACGCGTCDTTCCTGAGGTTGGGAACCCATCAATGTTAICCTITACTTTICCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACCCCTACGTGTGAAITCCTAACAGTDACTTCTAAATTITCAAGGCACAACAACCTGGTTACAGCCGATACAI >011_2 R 230_168_230 GCACAATGGCTAGCGCACGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >013_1 A 230_176_211 ATGTGTTAATCCACGCACGCGTCDTTCCTGAGGTTGGGAACCCATCAATGTTAICCTITACTTTICCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACCCCTACGTGTGAAITCCTAACAGTDACTTCTAAATTITCAAGGCACAACAACCTGGTTACAGCCGATACAI >013_2 R 230_168_230 GCACAATGGCTAGCGCACGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >014_1 A 226_176_211 ACATGTAGGCCCACGCTTCCAAAIGCCATGAGGTTGGGAACCCATCAATGTTAICCTITACTTTICCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACCCCTACGTGTGAAITCCTAACAGTDACTTCTAAATTITCAAGGCACAACAACCTGGTTACAGCCGATACAI >014_2 R 230_168_230 GCACAATGGCTAGCGCACGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >017_1 A 222_176_227 ACGCGAAGGTCCACGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACATTATTGAGAICCTITACTTTICCCIAGATAAAACDGCTGACAACATGCCACAACCCTTACGTGTTAAIACCTACCAATDGCTTCTAAATTITCATGGAACCGTGATTGGGTTACAGCTCACGAGD >017_2 R 230_168_230 GCACAATGACTAGCGCACGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >019_1 R 230_168_269 ATACGAAGGCCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCAAACGATGCAD >019_2 A 226_176_238 GTGCAATGATCCGCGCACGCGAAIGCTCGGAGATTTTGGCCCCACTATTGAGAICCTITACTTTDCCADCTATTTAACDGCTGACAACATTCCGCAACTCTTACGTTGTAAIACCTAACAGTDACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTCACAAGI >021_1 A 222_176_227 ACGCGAAGGTCCACGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACATTATTGAGAICCTITACTTTICCCIAGATAAAACDGCTGACAACATGCCACAACCCTTACGTGTTAAIACCTACCAATDGCTTCTAAATTITCATGGAACCGTGATTGGGTTACAGCTCACGAGD >021_2 R 232_168_230 GCACAATGACTCGCGCTCGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >022_1 R 230_168_261 ATACGAAGACCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCGAACGATGCAD >022_2 A 222_168_222 GTACATTAGTCCGCGCTTCCAAAIGCCATTAGATTTTGGCCACACCATTGATAICCTICGCTTAICCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATDATTACTACATTDAGAAGGATACGTAGTTGCTCTGTGGACGACAAGD >023_1 R 230_168_269 ATACGAAGGCCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCAAACGATGCAD >023_2 A 230_168_261 GTACAATGGCCCGTGCTTGCGTCIGCCCTGAGATTTTGGCCCCACCATTGAGAICCTITGCTTAICCAICTATTAAACITTACGATCTTCGCCACTACCCCTACGTGTGAAIATTGACCTATIACCTTCCCGGADAGTAGGATACGTGGTTTGGTTGCGAACGATGCAD >024_1 A 226_176_238 ACACGTAAGTCCACGCATGCGAAIGCTCGGAGATTTTGGCCCCACTATTGAGAICCTITACTTTDCCADCTATTTAACDGCTGACAACATTCCGCAACTCTTACGTTGTAAIACCTAACAGTDACTACTACATTITGATGTCACAACAACCTGGTGGCAGCTCACAAGI >024_2 R 230_168_261 ATACGAAGACCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCGAACGATGCAD >025_1 R 230_168_269 ATACGAAGGCCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCAAACGATGCAD >025_2 A 230_168_261 GTACAATGGCCCATGCTTGCGTCIGCCCTGAGATTTTGGCCCCACCATTGAGAICCTITGCTTAICCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCACTACCCCTACGTGTGAAIATTGACCTATIACCTTCCCGGADAGTAGGATACGTGGTTGGGTTGCGAATCATGCAD >026_1 A 222_174_242 ATACAAAGGCCCATGCTTGCGTCDTTCCGTAGATTTTGGCCACACTCTTGAGAICCTICGGTTAICACICTATTTAACDGCTGAAAACTTGCAGTTGTTTTCACGTGTTAAITCCTGATTACDACTACTACATTITGATGGAACCGTGGTCGGGTTGCGGCTGGCAAGD >026_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGTGGACCATGCAD >031_1 A 222_168_286 ATGTGAAGATCCACGCTTGCGTAIGCCCGGACATTTTGGCCACATTCTTGAGAICCTICGGTTADGACICTATTTAACDGCTGAAAACTTGCAGTTGTTTTCACGTGTTAAIATTGACCTATIGCTTCTACATTDAGTAGGCACAACAACCTGGTGGTAGCCGACAAGI >031_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGCGGACCATGCAD >032_1 A 222_176_227 ACGCGAAGGTCCACGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACATTATTGAGAICCTITACTTTICCCIAGATAAAACDGCTGACAACATGCCACAACCCTTACGTGTTAAIACCTACCAATDGCTTCTAAATTITCATGGAACCGTGATTGGGTTACAGCTCACGAGD >032_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGTGGACCATGCAD >035_1 A 226_176_238 ACACGTAAGTCCACGCATGCGAAIGCTCGGAGATTTTGGCCCCACTATTGAGAICCTITACTTTDCCADCTATTTAACDGCTGACAACATTCCGCAACTCTTACGTTGTAAIACCTAACAGTDACTACTACATTITGATGTCACAACAACCTGGTGGCAGCTCACAAGI >035_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGTGGACCATGCAD >036_1 A 230_176_211 ATGTGTAAATCCACGCACGCGTCDTTCCTGAGGTTGGGAACCCATCAATGTTAICCTITACTTTICCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACCCCTACGTGTGAAITCCTAACAGTDACTTCTAAATTITCAAGGCACAACAACCTGGTTACAGCCGATACAI >036_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGTGGACCATGCAD >037_1 A 222_168_286 ACGCGAAGGTCCACGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCATTGAGAICCTICGGTTAIGACICTATTTAACDGCTGAAAACTTGCAGTTGTTTTCACGTGTTAAIATTGACCTATIGCTTCTACATTDAGTAGGCACAACAACCTGGTGGCAGCCGACAAGI >037_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGTGGACCATGCAD >039_1 R 230_168_269 ATACGAAGACCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCGAACGATGCAD >039_2 A 222_168_222 GTACATTAGTCCGCGCTTCCAAAIGCCATTAGATTTTGGCCACACCATTGATAICCTICGCTTAICCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATDATTACTACATTDAGAAGGATACGTAGTTGCTCTGTGGACGACAAGD >040_1 A 222_170_207 ACGCGTTAGTCCACGCACGCATAIGCTCGGACATTTTGGCCACACTATTGTTAICCTITGCTTADCCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACTTTCACGTGTTAAITCCTGATTATIACTTCTAAATTITCTAGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTCACAAGI >040_2 R 232_168_230 GCACAATGACTAGCGCACGTGTCDTTCCTTACAAAGGTAACCCATCCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTAGTTGTTTTTGAAATGTTGIATTGAACTATIACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTGGCGCAD >044_1 R 230_168_269 ATACGAAGGCCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTICCCIAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCGAACGATGCAD >044_2 A 222_168_222 GTACATTAGTCCGCGCTTCCAAAIGCCATTAGATTTTGGCCACACCATTGATAICCTICGCTTAICCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATDATTACTACATTDAGAAGGATACGTAGTTGCTCTGTGGACGACAAGD >046_1 A 230_176_211 ATGTGTAAATCCACGCACGCGTCDTTCCTGAGGTTGGGAACCCATCAATGTTAICCTITACTTTICCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACCCCTACGTGTGAAITCCTAACAGTDACTTCTAAATTITCAAGGCACAACAACCTGGTTACAGCCGATACAI >046_2 R 222_170_238 GCGCAATGGTCCGCGCACGCGTCDTTCCGGAGGTTTTGGCCACGTCAATGTGTDTTADTACCCTDCCCICTATTAAACITTACGATCTTCGCCGCTGCCCCCAAGTGTGAAITCCTGATTATIATTTCTACATTITCAAGGCTACGTAGTTGCTCTGTGGACCATGCAD >047_1 A 230_176_227 ACGCGTTAGTCCACGCACGCGTCIGCCCGGACAAAGGGAACACACTATTGAGAICCTITACTTTDCCADCTATAAAACDGCTGACAACATGCCACTGCCCCCAAATGGTTGITCCTACCTGTIACTACTACATTITGTAGGCACAACAACCTGGTGGCAGCCGACGCAD >047_2 R 230_168_269 GTACAAAGGCCCGCGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGCTTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCAAACGATGCAD >049_1 A 230_176_227 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ATACGAAGGCCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCAAACGATGCAD >057_2 A 226_176_238 GTGCAATGATCCGCGCACGCGAAIGCTCGGAGATTTTGGCCCCACTATTGAGAICCTITACTTTDCCADCTATTTAACDGCTGACAACATTCCGCAACTCTTACGTTGTAAIACCTAACAGTDACTACTACATTITGATGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTCACAAGI >058_1 A 222_170_207 ACGCGTTAGTCCACGCACGCATAIGCTCGGACATTTTGGCCACACTATTGTTAICCTITGCTTADCCCICTATTAAACDGCACGCAACACGCCACTACTTTCACGTGTTAAITCCTGATTATIACTTCTAAATTITCTAGGCACAACAACCTGGTGGCAGCTCACAAGI >058_2 R 230_168_269 GTACAAAGGCCCGCGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGCTTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCAAACGATGCAD >061_1 R 230_168_269 ATACGAAGACCCACGCACGCGTCIGCCCGGAGGTTTTGGCCACATTCTTGAGTDTTADTACCCTDCCADAGAGATGCAITCACGATCTTTTTCGCAACTCTTACGTTGTAAITCCTGATTATDACCTTCCCGGADAGTAGTATACGTGGTTGGGTTGCGAACGATGCAD >061_2 A 222_174_242 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