## PPV and sensitivity for loops predicted without the use of coaxial stacking nearest neighbor parameters
# Family: the RNA family
# Looptype: the type of loop being benchmarked. In this table, only multibranch loops are considered.
# Datatype: Positive Predictive Value (PPV) or sensitivity. (mfe) means this is the PPV or sensitivity for loops found in a minimum-free-energy structure prediction
# 0.xx: The remaining columns are probability thresholds. For example, the column 0.20 is the PPV or sensitivity for loops with probability>=0.2.
Family	Looptype	Datatype	0.01	0.10	0.20	0.30	0.40	0.50	0.60	0.70	0.80	0.85	0.90	0.95	0.99
RNaseP	Multibranch	PPV	0.0150	0.0317	0.0548	0.0806	0.1074	0.1778	0.2586	0.3333	0.3000	0.3333	0.5000	0.7500	nan
RNaseP	Multibranch(mfe)	PPV	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228	0.0228
RNaseP	Multibranch	Sensitivity	0.0274	0.0231	0.0181	0.0144	0.0116	0.0116	0.0108	0.0087	0.0065	0.0058	0.0036	0.0022	0.0000
RNaseP	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173	0.0173
tmRNA	Multibranch	PPV	0.0438	0.0976	0.1151	0.1825	0.2025	0.1807	0.2667	0.2143	0.1667	0.0000	0.0000	nan	nan
tmRNA	Multibranch(mfe)	PPV	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660	0.0660
tmRNA	Multibranch	Sensitivity	0.1046	0.0870	0.0569	0.0518	0.0331	0.0155	0.0083	0.0031	0.0010	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
tmRNA	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704	0.0704
telomerase	Multibranch	PPV	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	nan	nan	nan	nan
telomerase	Multibranch(mfe)	PPV	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
telomerase	Multibranch	Sensitivity	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
telomerase	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
tRNA	Multibranch	PPV	0.1842	0.2399	0.3486	0.4148	0.4623	0.5614	0.5455	0.7000	0.6667	1.0000	nan	nan	nan
tRNA	Multibranch(mfe)	PPV	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810	0.1810
tRNA	Multibranch	Sensitivity	0.2896	0.2554	0.2050	0.1313	0.0881	0.0576	0.0216	0.0126	0.0036	0.0036	0.0000	0.0000	0.0000
tRNA	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061	0.1061
5s	Multibranch	PPV	0.1195	0.1632	0.2311	0.3249	0.3735	0.2594	0.0684	0.0755	0.0000	0.0000	0.0000	nan	nan
5s	Multibranch(mfe)	PPV	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174	0.1174
5s	Multibranch	Sensitivity	0.2502	0.2284	0.1855	0.1496	0.1255	0.0483	0.0062	0.0031	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
5s	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076	0.1076
srp	Multibranch	PPV	0.0223	0.0345	0.0568	0.0924	0.0930	0.1000	0.1212	0.1860	0.4000	0.6000	0.8333	1.0000	nan
srp	Multibranch(mfe)	PPV	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453	0.0453
srp	Multibranch	Sensitivity	0.0344	0.0283	0.0283	0.0271	0.0148	0.0111	0.0098	0.0098	0.0074	0.0074	0.0062	0.0049	0.0000
srp	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295	0.0295
grp1	Multibranch	PPV	0.0195	0.0407	0.0596	0.0723	0.0816	0.0741	0.1333	0.1429	0.0000	0.0000	0.0000	nan	nan
grp1	Multibranch(mfe)	PPV	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277	0.0277
grp1	Multibranch	Sensitivity	0.0710	0.0651	0.0533	0.0355	0.0237	0.0118	0.0118	0.0059	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
grp1	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414	0.0414
16s	Multibranch	PPV	0.0286	0.0625	0.1134	0.1667	0.2162	0.2069	0.2500	0.3000	0.2000	0.3333	0.5000	nan	nan
16s	Multibranch(mfe)	PPV	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559	0.0559
16s	Multibranch	Sensitivity	0.0385	0.0355	0.0325	0.0266	0.0237	0.0178	0.0118	0.0089	0.0030	0.0030	0.0030	0.0000	0.0000
16s	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296	0.0296
23s	Multibranch	PPV	0.0565	0.1172	0.1818	0.2619	0.2800	0.3846	0.4000	0.3333	0.2500	0.0000	0.0000	nan	nan
23s	Multibranch(mfe)	PPV	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028	0.1028
23s	Multibranch	Sensitivity	0.1060	0.0993	0.0795	0.0728	0.0464	0.0331	0.0265	0.0132	0.0066	0.0000	0.0000	0.0000	0.0000
23s	Multibranch(mfe)	Sensitivity	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728	0.0728