Supporting Information Notes S2. Promoter sequences used for GUS fusions. Promoter fragments, listed in Note S2, were cloned from cassava variety TME419 into a pCAMBIA vector upstream of GUS.

>Manes.09G138100_promoter
TTCGCTATGGTATCGGCAATTATGGCGACAGCAACGGTTACTCTACCCATCAGAATCACCATATCCAAATTTAGATATTAAATATCAATTTCGAACTCAATTAAAATTTACCCCATCAGAATCACCATATCCAAACTTAGATATTAAATATCAATTTCGAACTCAATTAAAATTTACTTTAAATAATTAAATTAATTAATATTATTATTTATAAGACATTCACACTCATTTACTTTTATGAATTTTATTAATTTATCAAAAAACTTTAAAAATAAATATTGAAATAAGGGATAAATGAAATTTTTACAAAATTATATATAATTTTAATTTTTAAATAAATTATTTAAATTAAAAAATTAATCCTTTTCTTTTAATTAAAAATTAATTAAATTATATTTTTATAAAATTCTCAATTTCAAAAAATATGAAATGATTTGACAGTTGCTCCATATAAAATCAAAGTTATTTTTATCACTATTAACCAAATTCTATCCTTCGTTGTTAGAAGAACAGAGAGGACAATGACCTTTCTGGCACCACAAAGCCACTCTCCATTTCGCCACAACATTTGGCATCACAATATCCTCTTATTTTTGCTTTCTTTTAAAGAGAATATATACATACAATGAATAATCAAGACCTATATAAAATTATACAAGTTTAATAAATATCAGCCTCTAATTTTTAGGTTTATTTTAAACAGCTGTGGGCTAATTCTCAAATAGTAAATCTAATGTTAGTGGTTTTGCTGTAACCATGGAGAAATTAATTACCCTAATCTAATAACCAAATACATTGGATCTGACCATCATCTTTATTTAATGAATTTTATGCCTATATTTGTGCCTGTAAATGGGGACGTAAAGAACTTTCTATGTCCCTTCAAATCTGACATATCCAAATGCATTTTTTAATTAAAAAAATTACTATTTAATCTCAAATTTTTATTAATTTCTAAATATTTTTTAAATTTTAAAAAATTTAATTAATCGGGTCGTTAACAAAAGTTAACCGTTCTAATCAAATGAGACTTTAATATTTAAAATTAATAAAATAATTAATTAGTATATTTTTAAAATTTTCGTGTAGAATCCGTGTAAAAGGGGGGGCATTTATGTGATTTCAATTCATCGGATAACTGTATACACACATATTTTTTATAAATGGGAAAATTTCTTTATTCTCCTCCTCTTTATACTGATTGGCCTATAAATAAACAAGTTCTCCACCCGCTTTTTCTCATCTCATCTCATCAGATCAGAGTCACAGAAGCAAAAGCTTTGATTTCAGAAGAAAGAGAAA

>Manes.11G159600_promoter
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>Manes.17G035300_promoter
TACTTTGCTGCACACACCATGATCGATGTTGTCTACGCTAGAGGTGATATTCTTATATTTTAAAATATTATTATTAATTATAATTATAAACTTTATTTACAATATTATCAAACTAATTTTTTAGATAATTGATATAGCTGTATATTTGATAAGGGCATAAAATATAAACAATTTAATTATAAATTTTAAATTAAATTAATATATGGATAAAAAATAAATAAAGTAGGAAAAAGCACATGGCAATTAGGGTATTTTTAGAAATATTATTAATGAAATTCTTAAATTTTAACAATAAAAATATATTTATTACTTCGATACAGGGCCCAAGTCCCATTTCAACCTGTCCGAAACTGGACCGCGCGCACCACACAGAGCCACTGAATTTGGGTGTTGGAGTCTTTGGACTACCCAAAGGCCCGTAAGAGGAGCAACTTCCGCCGCCCAACCCCAAGTTTTCCCACAAAGTGATGGCCCTACTTTTTAAGGAATCATTTTAACTCGTCAGTAGAGAAAATTTTTTATAATATAACATTTTATGACATAAGGTTTATAATTTCAAATTTGATCATTTTTTTATTGTTTGAAAAAGCTAAATTTTTTAATTTTTTATTGTTTGAAAAAAATAAAATTCTTAAAAGTATTTAAAGATCTTCTTAGCATTTGAATTTTAAATCTTAAAAAACCTTAATATAAATTTTAGTGTGTGTATATAAATTTTAATTCTGCAAGCCTTGATAGTCCTTTTTTTTTCTTTTGCCATGTAAAAAATGCATTTATAAGACAGAAAATAAAATAAAAATATTGGAGAAAAAAATTAAAAAATGAAAATTTATTCAAAAATATACATAAAATAGATATGTTACTAATTTTATAATATTTTATCTTTTTTTTCGTATAACAAGAAAGGAAAATAATATCTATTTTACCATTAAAAAAACATATCTTATTTTACTTTTTTAATTAAGGCGTAATCATCTCAAAGTCACGCCAAAAACAATGATTAGATTCCCACCCAAACATAAAAGTAAAAATAAAAATAAAGAAAAGCCCACAGATTGAGACCTAATCCTAATAAAAATAAACTGAAAAAGAAGTCCCACTTGCAATGTGGGATCCACCTCAAAAACCTAATAATATCCCAATTCCACTTTGCAAACTCCGTCAACCTATCCATCTGTCCACATCGGATTCCAATTTCCAACGGCTACCAGACGCTATTCTTTACCGTCTCAAATAAGGCACGACACCTCAATCGTACACGTGTCTAAAACCCATTGCGTGAATTACTCCGTTGCCGTTACGAAGTCGGCCATCTCTTTCTATAAATTAAACGCCAAAATTGCCTTTGCTCTCCGCCTTAGTTTGTTACATTATCTTCTCTCGTGAAGTTCTAAGAAATCAATCAGAAAAGCTCCTTCAAGGTAAAATTGATTTCTTTTTTATGTATTTTGTGGTGGGTTTTTATTTTTGTTAGTTCTGTTTTGCTAAATGATGTTCTGTCATAATACAG

>Manes.11G090400_promoter
TAATAGCTTTGTGTCCTGGTCTAAAGGCATTGATGGGTCCCTGCAAAAGAGGATTTCATTGCGTAGTTTTTGAAAGATAGGCAAAGTGGTAGAGATTTATATGGAATAATGACTATTTTTTAATCCATATACTTTTTTTTTTATATTTGAATCCATTATATATTTTGTCTTTTTATAATTTAATAGTTGAATTGTTCAAAGTTGAATTTGACTCTGGTGACTAGTATCCTAATTTTATGCAGTATGGTGCAAGGACAAGTTGGAGCAGATATTCATAAATCAGTTAAATACATCTATGTTGTTTTAATGAGGCTAGGATACTTTGATGAAACTCCTTTCAATTCATTGGGCAAGAAAGATATTAGCACCAATGAGAATTTTGAGTTGGCTGCTGAAACAACATAAGAATAAGGGTGTAAATGAATCAAATCATTCGTGAACTACTTGAGGTTTGGTTCGATAAAACTCGACCAAGCTTGACTTGATTTCTAAACGAGTCAAGCTCGAGCTTACCAAACGAGCCAAACTTGAACTCTATAGTATTCGGCTCGTTAAGACTCGTGAGCTCAGCTCGTTAAGAATCGTGAGCTCCGCTCATTTATGAGTTTATGAGCAGGCTCGCAAATAAGCTCGTGAACAGTCTCATTAAGCAAACTGAGATTATTATTTTAAGAGAAATAAACTCAAACTCTGCATATACTTTCATGAGCTAAACTTAAATTTTCTAAAATTCAGCTTTATACAGTTTAGTTACACTTTTTAACTTGCATATATTTAGATCATTAAGATTTAAAAACTCTTATTTATAAGTTTACGAACTAATTTATAAATATACTTATTTAACTAAAATTATTTTAATTTTAAACTTATTAGTTTTAAACTAAAACTTATTATACATGTAAATAAATTGAACTACTCGTGAACTATTCGAGACTAAACTCGATAAAACTTCGACTCGTCTAAGTTTGTTTGCTAAACGAGCCAAATTTGAATTTCTTAATACTAGGCTCGAGTTCGAAATGAGTAAAGTTCGAATTCGACTAGAACTCAAAAAAATTTAATGAACCAAGTTTGAATTCTTCAAAACTCGGCTCGACTTGATTCATTTACCCCTACATAAGAAGGAATTGTTCTTTTTAAAAATGACAATTATTTTCAATTACAAGAAACTTACTCTAATTGGACGACATGACAATACTACAAAAGCAACAATCAGAAATTATGGAAGCTTCAATTACTTAATTATCCCAGAAATATAAATATATTGTTTAAGTGTTCCTTGTCGTTATGTTTCACCAATTGACCGATCCAAAGTAACGTATGAAATAGGATGTGGAGATGTAGCTTGTAAAAATGACGGTTTAACCTTTGCACTGAATTGTAAAAATGACAGTAAATATAACGGTCAACGGAACCGAGTGCAACATTCAGCTGCCTGCTTGTGGGAATTGTCCCACATTGGCGGATTCAGAATGGGAATCGTTCCACATCGGCGGATTATGGCAATTCCGAATTGTATATAATAGCTAGCACGAAATTATTAAACAACTTGGGTTAACCATTTTGGTCCAAGTGGAAAGTGGATTCAAAAGTTATTTGAGCCAGTTTGGGCCGGGCTGCTTCAGTAAAAGTTCACTTATCTTATAGTTTTGGATGTTATAAAATAGAGTACTCTCCTTCCATAAAAAGCCGAATATGTTTATACCACTCATATGATAAGGCCCAATACGTTGATATGATACCCCCATTTGGTATGGACTCACTTAGGAACTTCAATTGTCCTTTTTGTTGACAACTTGAATTGTGATTAATAATCTGAGATTTAGGAGAGAGCAGAGATTAGAGTATGTGTGTGTAAATTTAGTCTGAATAGTTTAGGCTATTTTTCTTTATTTTTTCCCTTTAATTTTTTTCTTTTGTCCTCTGTCAACCGCCATCTTGTTACATTGTCGCATGTCGCCATCATGCAAAATCATACATATGGACGTACTGCTCCTTTCTTCATTGTAAGGTGGGTATTTAATAACCTCCGACGCCGCCTGACATGGTTTTGGATGTAAAGAGGTTTATTTTCCGCTGATCCATCAAGTCAAGTGAGTTAGATCCTTCTCTATTGAACCCAAGTCCTGTTCTCGGCTGCCTGAGCATGGCCTGGACTGCGTGGTAGAGGATAGATTTGCGTATTGAGTTCTGATGGGATTACGCTGGACTTTTCTACGTGAATTCGATTGCTGCTCGGATGGCAAAAACCCAGCGGTTATTAGTGATCATGAAGAAACCCAGTGGTCATCAAGAAATGGAAAAAAATTAAATGCAAGTAAAGCAATAATTATTTACTCTAAGCCTCCAAGATGGATTATTGATAACTTTTACATAACAATGAAAAGTTCTCTTCCTGTTATAAAATAAAAAATATGGTAATTATGTATAATTATTACTTTGTTTGAGTATATATACCATATTATTTATTTTATATTAAATTATAATTAATAATTTATTATGAAATTTAAAATATAATTTTATTAGATAATTTATAAATATATAAAAATAATTTAGCAAAAAAAATTTATAATTATTAAATATAAAAATAATATGATGTAAATAAAAAAATCTTAATAATCACCTAAAAGAAAATATAGTTATGGAGTACATATTAGCTACCAATTTTTTTGTCCAATAGCTACCAATTGTCATTTTAATTTATTAAATAAATAAATAAATAAATTATTTCAAAGTTTATCGATTATTGATTGTATGATTAAATAAACTAAATCATCTTAATCTTATGTCTTATATGGATTTCAAGCCGGAACAAATTTAATAAATATGATGTAATGTTACTTGATCTAAATGTTTAGACAACTAGATTTTAGTAGTGAATATAAAATTATTATCTTTAGTAATTTAAAATTATTAAAAACATTATTTTTATTTTATAATATGATAATTTACAGTGTAATTATTAAAATTTAATAAAATTCATAATTTATTCTCTGCTTATTTAATAATAAATAATTTAATCTTTAATTTTTTATTTTATTAATAAAATAATTTTTTTATAATTTTATCATTATTCGATTATTAATTGAATAAATTAAATCAAATTAAAAAATTAATTTATTATAAATATTTTTTTACATAGTAAGGAGGGTATTAAACCTTTAAGCAAAGTCACGAAACCATATAATTTCAACAGTATCAGCTTGCAAGTAGTACCGAGACTTCATAGAAGGCGTTTCCAAAATTTGCATCTCAAGAGAGCCTTTAACTGACGATTTCGCTAAGCAATCCGCCACAGCGTTAGCCTCACGAAAGATGTGTTTGAAATAAACTTTTCATGCATAACCCACCAAAGTCGTAATCTCAGAAACTAGATTTCTAATCCGGCCCGCTCCATCTAAACTTTATTATAAAAATTAAATAATTCTATTGTCTTTATAGATAAATTGATAATTTTAAGAATTATTTGATATAAATAATCCTTATTCTTTTACATATTTAAAATTGTATTTAAATTTTAAACTGATGATAATTTTACTACTCAAACTAATGGTAGAATTATCAAAATATCTAATATACAATTTATAGAAAAGTGCTAATTAATTTTAATATTTTAAAATTATAAATATTAAAGATAATATTTGAATCATATTATTTAGAATACTGAGTTTAAATTTGAAATTTGTTTTAACTTATCTGGTACACCATTATTGTAATAAAATTAAAATGTGAAATTTGTTTAATGTTTTTAATATTTAATTAACTTAAATATCACCTTATCTTGCTTCTAATTGATTGTAACAAACTTTGGTATTTATCCTTTTTACTAAATCTTTTTATAAGTTATGTTGTTTACTATTATCTATACAATAACAAAAATTTCCTTCAAAATCAATTCTTGTTATATCATTAATTGTTTTAATAAAGCTACAATTTTCATGATTTTCTTTCTAATCTTGGAAATTCAAAGAACAAATTTCCCTTTATACCCTTCTGGTATGAGTAGTGGTCTCAGATGCTTGTAAGGCTATGAATGACACTTGTACGTTTTACCGTTTCATCATAAATAAATCCATTAAATACATCCACTTTCTACAAGAAGACAAAACCTCGAAACCCGACATGAAACGGCGTCATTTCCTCTCAAATGAGGCAAAAAGCATATACCACCACGGATCCCAAACTTAACCCAAGTCAAAACTCAACCTAATCATGGGTAATTCCTGCTCCCTCAAGATTTCTACACGTGTCCGCATCCAACGGCACCCATCCACCTTGCACAGATATTCACCGCCTCATCTTCCTATATAACTACTCATCAGACCAGCCAAAAACCCTACCCTGTTCTCTTTATCCTCTAAAGATTTTCCGTCTATAAATCGACTTCCTCTCTTCTA

>Manes.17G101400_promoter
CACTACAATTACGTGTTGTGTAGCATAAATGGGGCATATTTGATTATATATAATTTCATAAATCTCAAATACAATAAAACTATTCACAGTACTGATAAAAATAAGAATAATTCATTTATTTTTTGAATAACTTTTAATTATGAGTATTTGATTTTGAGTTCTATTTCATTTATATTGCTCAGTTTTTATTTATTTTAATAAAGTTACTTAATTTTTATTTTTATTTTAAATAAAATTATTTTAACTTGTTACGACGAAATTTTAGATTAATAACCACTATATTCATTCTCCTTTTTAGTATAATATTTTATTTTTAAGTAATTGATAGTTATTTATTAATAATATCAATTGATTTTTAATATATTTATTATTAGATTTTATAATCAATTAAAGAAATTAAATTAATGTCTTCTTTTCTTCTATTTTTTCTAAAAAATAATTTTTTATATATATTAACTAATAAAAAAAAGACAAGATTTTCTGAAAGGCATTCTAAATAATTGAATTTTATTAATATAATTTTTTTTAATTAGATTCTATTTGTTTATGGAAAATAATTTTTTTAATAAAATAATTTATTTTTAATTATTTAATTTAAAAATAAATATATTAATATAAAATTTTAATAAAAATTTTAAAGTCTAAAAAATAATTTAATTTTTTAATTAAAAAAATATTTTTATTTAAATATAAAAAATTATAAAAAAAAAATATTTTCATTTTCCTAAAAGAAATGAAGATTTAATTTAGACAAATTGGAGAAAAAAATTTAGACAATTAAGGAATTCCATAAACTCAGAGGGACAAAATTGTACTTGCACCTATCAAGATATTTTCGAAGACTATAAAATATCAGCAACTTTCATCCCTATCTATCCACCCACCTGGCCACTATCAGCGTGATTGTGGACCCCACTTGACTCGGGTCACCGCTTTTGTTAACCATGGTTTACCATTCCACAAATACTGACCACTTGCCTTCGGATTTTATTCGAATATACTCGCGGCACCTTTCGCTATTCCCCTAATCCCTGTTCTGAATAATCACATCTTTTGAACCAAAAACCAGGTTAAGTTTATCGCTGTAACCAAACATCCTTCACATTCAATTAACCATAGTTAATTTCCTCCCTCTATAAAACCATGGTTTAGCCTTGCTTTGTTTCTCACAATCTCCTCTCTTGGCTTGTGTTCTCTCTTATTTTTCAGAG

>35S_promoter
CATGGAGTCAAAGATTCAAATAGAGGACCTAACAGAACTCGCCGTAAAGACTGGCGAACAGTTCATACAGAGTCTCTTACGACTCAATGACAAGAAGAAAATCTTCGTCAACATGGTGGAGCACGACACACTTGTCTACTCCAAAAATATCAAAGATACAGTCTCAGAAGACCAAAGGGCAATTGAGACTTTTCAACAAAGGGTAATATCCGGAAACCTCCTCGGATTCCATTGCCCAGCTATCTGTCACTTTATTGTGAAGATAGTGGAAAAGGAAGGTGGCTCCTACAAATGCCATCATTGCGATAAAGGAAAGGCCATCGTTGAAGATGCCTCTGCCGACAGTGGTCCCAAAGATGGACCCCCACCCACGAGGAGCATCGTGGAAAAAGAAGACGTTCCAACCACGTCTTCAAAGCAAGTGGATTGATGTGATATCTCCACTGACGTAAGGGATGACGCACAATCCCACTATCCTTCGCAAGACCCTTCCTCTATATAAGGAAGTTCATTTCATTTGGAGAGAACACGGGGGACT