Module Positions Affected Control p-value Accepted Accepted p-adj EEV 9,10,11 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEK 9,10,12 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEF 9,10,13 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEE 9,10,14 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEH 9,10,16 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EER 9,10,25 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEL 9,10,26 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEE 9,10,28 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EER 9,10,30 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEV 9,10,31 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEH 9,10,32 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEN 9,10,33 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEY 9,10,37 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEA 9,10,38 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEY 9,10,40 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEY 9,10,47 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEV 9,10,50 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EED 9,10,57 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEA 9,10,58 4 12 0.002233 1 0 0.3812 DRB1*10:01 EEY 9,10,60 4 12 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11,50,85 26 658 0.9109 0 0 1 DRB1*03:01 DRB1*08:01 DRB1*08:02 DRB1*08:03 DRB1*08:04 DRB1*11:01 DRB1*11:02 DRB1*11:03 DRB1*11:04 DRB1*13:01 DRB1*13:02 DRB1*13:03 DRB1*13:05 DRB1*14:01 DRB1*14:04 DRB1*14:06 LVV 11,50,86 1 21 0.5728 0 0 1 DRB1*01:02 GVG 11,50,86 14 260 0.1688 0 0 1 DRB1*07:01 PVV 11,50,86 11 272 0.89 0 0 1 DRB1*15:01 DRB1*15:03 SVG 11,50,86 13 277 0.4416 0 0 1 DRB1*08:01 DRB1*08:02 DRB1*08:03 DRB1*11:01 DRB1*13:02 DRB1*13:03 DRB1*13:05 SAA 11,57,58 3 55 0.475 0 0 1 DRB1*14:01 DRB1*14:04 SSA 11,57,58 4 73 0.5252 0 0 1 DRB1*08:01 DRB1*08:03 DRB1*13:03 LDA 11,57,58 8 202 1 0 0 1 DRB1*01:01 DRB1*01:02 DRB1*01:03 SDE 11,57,58 12 211 0.1491 0 0 1 DRB1*11:01 DRB1*11:02 DRB1*11:03 DRB1*11:04 GVA 11,57,58 14 260 0.1688 0 0 1 DRB1*07:01 SAH 11,57,60 3 55 0.475 0 0 1 DRB1*14:01 DRB1*14:04 SSY 11,57,60 4 73 0.5252 0 0 1 DRB1*08:01 DRB1*08:03 DRB1*13:03 LDY 11,57,60 8 202 1 0 0 1 DRB1*01:01 DRB1*01:02 DRB1*01:03 GVS 11,57,60 14 260 0.1688 0 0 1 DRB1*07:01 SDY 11,57,60 23 569 0.7974 0 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SSK 11,57,71 1 19 0.5381 0 0 1 DRB1*13:03 VDE 11,57,71 2 20 0.1984 0 0 1 DRB1*04:02 PDR 11,57,71 2 44 0.6895 0 0 1 DRB1*16:01 DRB1*16:02 SAR 11,57,71 3 55 0.475 0 0 1 DRB1*14:01 DRB1*14:04 SSR 11,57,71 3 55 0.475 0 0 1 DRB1*08:01 DRB1*08:03 VDR 11,57,71 6 104 0.2918 0 0 1 DRB1*04:03 DRB1*04:04 DRB1*04:06 DRB1*04:07 DRB1*04:08 DRB1*10:01 SDR 11,57,71 10 189 0.2939 0 0 1 DRB1*08:02 DRB1*08:04 DRB1*11:01 DRB1*11:04 DRB1*13:05 DRB1*14:06 LDR 11,57,71 8 189 0.8348 0 0 1 DRB1*01:01 DRB1*01:02 SDE 11,57,71 11 245 0.5983 0 0 1 DRB1*11:02 DRB1*11:03 DRB1*13:01 DRB1*13:02 GVR 11,57,71 14 260 0.1688 0 0 1 DRB1*07:01 SAA 11,57,73 3 55 0.475 0 0 1 DRB1*14:01 DRB1*14:04 SSA 11,57,73 4 73 0.5252 0 0 1 DRB1*08:01 DRB1*08:03 DRB1*13:03 LDA 11,57,73 8 202 1 0 0 1 DRB1*01:01 DRB1*01:02 DRB1*01:03 GVG 11,57,73 14 260 0.1688 0 0 1 DRB1*07:01 SDA 11,57,73 21 413 0.1191 0 0 1 DRB1*08:02 DRB1*08:04 DRB1*11:01 DRB1*11:02 DRB1*11:03 DRB1*11:04 DRB1*13:01 DRB1*13:02 DRB1*13:05 DRB1*14:06 SDL 11,57,74 1 4 0.1744 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